合成生物学相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
1	2025-07-19	Development and application of a highly specific whole-cell biosensor for supersulfide detection in environmental samples 2025-Nov-01, Biosensors & bioelectronics IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.bios.2025.117731 PMID:40592263	研究论文	开发并应用了一种高特异性的全细胞生物传感器，用于环境样品中超硫化物的检测	首次报道了使用Agrobacterium tumefaciens的超硫化物感应抑制子BigR（AtBigR）开发的全细胞生物传感器，具有对超硫化物的高选择性	未提及具体的技术限制或样本限制	开发一种高特异性、高灵敏度的超硫化物检测方法，以促进对超硫化物在生物学、环境和锂硫电池中作用的理解	超硫化物（如元素硫、无机多硫化物和有机多硫化物）	合成生物学	NA	全细胞生物传感器技术	NA	环境样品数据（如海洋沉积物和锂硫电池电解质）	多种海底地形的海洋沉积物样品和锂硫电池电解质样品
2	2025-07-19	Bioinformatics analysis and molecular cloning of squalene synthase from Simaroubaceae 2025-Oct, Protein expression and purification IF:1.4Q4 DOI:10.1016/j.pep.2025.106751 PMID:40451315	研究论文	本研究通过生物信息学分析和分子克隆技术，研究了苦木科植物中角鲨烯合酶（SQS）的功能及其在苦木素生物合成途径中的作用	首次从苦木科植物的转录组数据中筛选并分析了多种SQS，克隆了AaSQS并鉴定了其功能及关键催化残基	研究仅针对苦木科植物中的SQS，未涉及其他植物家族中的SQS比较	研究苦木科植物中角鲨烯合酶的功能及其在苦木素生物合成途径中的作用	苦木科植物中的角鲨烯合酶（SQS）	生物信息学	NA	转录组分析、分子克隆、分子对接、突变分析	NA	序列数据	6种苦木科植物的SQS（AaSQS, BjSQS, AeSQS, QaSQS, ElSQS, SaSQS）
3	2025-07-19	An enzyme-based approach for highly efficient self-replication of DNA origami dimers 2025-Jul-22, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1 DOI:10.1073/pnas.2500160122 PMID:40674426	研究论文	本研究提出了一种基于酶的高效DNA origami二聚体自复制方法	使用耐热T4 DNA连接酶替代化学光交联步骤，实现了更快的循环时间和更高的扩增效率	未明确说明系统在复杂环境中的稳定性和长期运行效果	探索DNA origami二聚体的高效自复制系统及其在合成生物学和智能材料中的应用	DNA origami二聚体	合成生物学	NA	T4 DNA连接酶催化	NA	分子结构数据	NA
4	2025-07-19	Extracellular Peptide-Ligand Dimerization Actuator Receptor Design for Reversible and Spatially Dosed 3D Cell-Material Communication 2025-Jul-18, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00482 PMID:39705005	研究论文	本文介绍了一种名为EPDA的合成受体平台，用于可逆和空间剂量控制的3D细胞-材料通讯	开发了EPDA受体平台，能够通过肽配体识别可逆激活细胞反应，并应用于3D材料中的细胞通讯	研究中仅测试了30种预测结合亲和力最高的单抗体，可能存在未被发现的更优配体-受体对	桥接合成生物学和生物材料领域，开发可感知和响应生物材料结合配体的跨膜受体	哺乳动物细胞和生物材料结合的配体	合成生物学	NA	PETEI计算算法、硫醇-降冰片烯化学	EPDA受体平台	荧光蛋白数据	超过2000种候选单抗体，实验测试了前30种
5	2025-07-19	Efficient De Novo Assembly of 100 kb-Scale Human Functional Immunoglobulin Heavy Variable (IGHV) Gene Fragments In Vitro 2025-Jul-18, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.5c00011 PMID:40135783	研究论文	该研究提出了一种高效的体外组装方法，用于构建功能性人类免疫球蛋白重链可变区（IGHV）基因片段	首次实现了百kb级别的人类功能性IGHV基因片段的体外无痕组装	仅针对IGHV基因片段，未验证其他复杂基因组区域的适用性	开发大规模人类基因组体外组装技术	人类免疫球蛋白重链可变区（IGHV）基因	合成生物学	NA	Gibson等温组装	NA	DNA序列	NA
6	2025-07-19	In Vivo Multicellular Feedback Control in Synthetic Microbial Consortia 2025-Jul-18, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00862 PMID:40499137	研究论文	本文提出了一种能够在合成微生物群落中实现稳定和精确基因表达调控的生物分子控制架构	通过在两株菌株之间采用分布式多细胞反馈回路，克服了传统单细胞生物分子控制策略的局限性，实现了分工合作	NA	开发一种能够在合成微生物群落中实现稳定和精确基因表达调控的生物分子控制架构	合成微生物群落中的基因表达调控	合成生物学	NA	生物分子控制架构	分布式多细胞反馈回路	NA	NA
7	2025-07-19	Investigating the Potential of Division of Labor in Synthetic Bacterial Communities for the Production of Violacein 2025-Jul-18, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.5c00120 PMID:40525226	研究论文	本研究探讨了在合成细菌群落中分工合作对紫罗兰素生产的潜在益处	通过将复杂的紫罗兰素生物合成途径分配到两个亚群中，减少了单个细胞的资源竞争和代谢负担，从而提高了生产效率	研究仅基于特定条件下的实验结果，可能无法推广到所有微生物群落或代谢途径	探索分工合作在合成微生物群落中提高代谢效率和生物生产能力的潜力	合成细菌群落和紫罗兰素生物合成途径	合成生物学	NA	代谢工程	NA	实验数据	未明确提及具体样本数量，但涉及多个亚群组合的测试
8	2025-07-19	A Tn5 Transposase-Based System for High-Efficiency Genome-Wide Gene Activation in Escherichia coli 2025-Jul-18, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.5c00170 PMID:40527878	研究论文	开发了一种基于Tn5转座酶的系统，用于在大肠杆菌中高效实现全基因组基因激活	利用Tn5转座酶构建了一个高效的基因激活系统，能够实现近乎随机的全基因组插入，并通过四环素诱导启动子实现条件性基因激活	未提及系统的特异性或脱靶效应的详细评估	开发高效工具以进行细菌工程中的基因功能研究和表型优化	大肠杆菌	合成生物学	NA	Tn5转座酶系统	NA	基因序列数据	未明确提及具体样本数量，但系统插入频率约为2.83×10 cfu/μg DNA
9	2025-07-19	Strategy for Generating Giant Unilamellar Vesicles with Tunable Size Using the Modified cDICE Method 2025-Jul-18, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.5c00026 PMID:40536055	研究论文	本研究探讨了一种优化策略，通过使用改良的连续液滴界面交叉封装方法，从水包油乳滴中生成具有可调大小的巨型单层囊泡（GUVs）	通过系统性地改变关键参数（如腔室旋转时间、角频率和内溶液密度）来优化GUVs的大小分布，并提出了一个物理模型来解释观察到的尺寸选择现象	该方法虽然快速且成本效益高，但囊泡的大小分布广泛且难以控制，这是构建人工细胞的一个显著缺点	优化巨型单层囊泡（GUVs）的大小分布，以便于合成生物学应用中创建具有生物学相关特性的细胞大小隔室	巨型单层囊泡（GUVs）	合成生物学	NA	改良的连续液滴界面交叉封装方法（modified cDICE）	物理模型	实验数据	NA
10	2025-07-19	Establishment of a Visible Reporter System in Zymomonas mobilis through Random Mutagenesis and Rational Design of a Chromoprotein eforRed 2025-Jul-18, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00872 PMID:40590208	研究论文	本研究通过随机诱变和理性设计，在非模式细菌Zymomonas mobilis中建立了一个可见的报告基因系统	通过随机诱变和理性设计增强eforRed色蛋白的光谱特性，成功在非模式细菌中建立了可见的报告基因系统	研究仅针对Zymomonas mobilis这一特定非模式细菌，可能不适用于其他微生物	开发适用于非模式微生物的可见报告基因系统，以促进生物制造和合成生物学的发展	Zymomonas mobilis细菌和eforRed色蛋白	合成生物学	NA	随机错误倾向PCR和蛋白质理性设计	NA	蛋白质光学特性数据	NA
11	2025-07-19	Engineered Membrane Vesicle Production via oprF or oprI Deletion Has Distinct Phenotypic Effects in Pseudomonas putida 2025-Jul-18, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.5c00171 PMID:40607986	研究论文	研究通过删除oprF或oprI基因在Pseudomonas putida KT2440中诱导膜囊泡（MV）高产的遗传工程策略及其表型效应	首次系统比较了删除oprF和oprI基因对膜囊泡产量、大小、蛋白组成及菌株适应性的不同影响，并发现通过过表达plsB基因可改善膜完整性	研究仅针对Pseudomonas putida KT2440菌株，未在其他工业菌株中验证策略的普适性	开发用于工业生物过程的膜囊泡合成生物学工具	Pseudomonas putida KT2440菌株的膜囊泡	合成生物学	NA	基因敲除、膜囊泡表征	NA	生物分子数据	使用Pseudomonas putida KT2440野生型和基因工程菌株进行实验
12	2025-07-19	Biofortified Bacteria: The Role of Selenium-Enriched Microorganisms in Enhancing Animal Selenium Uptake-A Review 2025-Jul-17, Journal of animal physiology and animal nutrition IF:2.2Q1 DOI:10.1111/jpn.70001 PMID:40674621	综述	本文综述了富硒微生物，特别是细菌，作为牲畜营养中有机硒补充的新颖和可持续策略的潜力	探讨了通过基因工程和合成生物学开发的工程细菌菌株，能够增强硒的吸收、转化和积累，并生物合成多种生物可利用的硒化合物	关键挑战包括优化菌株选择、发酵过程、生物安全性、法规遵从性，以及通过长期饲养试验在不同条件下证明其有效性	探索富硒细菌在动物农业、生物医学和环境修复中的潜在应用	牲畜（家禽和反刍动物）	生物技术	NA	基因工程、合成生物学	NA	NA	NA
13	2025-07-19	Engineering bi-directional chemically-modulated synthetic condensates for cellular control 2025-Jul-17, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-025-61877-w PMID:40675979	研究论文	本文提出了一种基于雄激素受体（AR）及其临床药物的化学遗传平台ARDrop，用于创建可逆的生物分子凝聚体，以实现细胞功能的精确操控	开发了一种新型化学遗传平台ARDrop，能够可逆地操控生物分子凝聚体的形成与溶解，并应用于多种蛋白质以实现特定细胞功能	未明确提及具体的技术限制或应用范围限制	开发可逆操控生物分子凝聚体的工具，用于解析复杂细胞信号传导和合成生物学应用	雄激素受体（AR）及其临床药物，以及多种蛋白质	合成生物学	NA	化学遗传学方法	NA	NA	NA
14	2025-07-19	De novo designed protein guiding targeted protein degradation 2025-Jul-17, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-025-62050-z PMID:40676011	研究论文	开发了一种名为GPlad的引导蛋白标记和降解系统，用于精确降解多种蛋白质	使用从头设计的引导蛋白和精氨酸激酶（McsB）实现精确蛋白质降解，无需预先融合降解标签或化学降解剂	目前仅在Escherichia coli中验证，尚未在其他生物系统中测试	开发一种可调谐、即插即用的蛋白质降解策略，用于合成生物学和代谢工程	荧光蛋白、代谢酶和人类蛋白质	合成生物学	NA	蛋白质从头设计	NA	NA	NA
15	2025-07-19	Metabolic Engineering of Yarrowia lipolytica with Massive Gene Assembly and Genomic Integration 2025-Jul-17, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.5c00333 PMID:40676857	研究论文	本文开发了一种在解脂耶氏酵母中进行大规模基因组装和基因组整合的策略，显著提高了基因操作和代谢工程的能力	实现了超过30 kb的十多个基因的稳定组装和整合，构建了含有35个外源基因（总计93.5 kb）的底盘细胞	未提及具体的技术限制或应用范围限制	提升解脂耶氏酵母的基因操作和代谢工程能力	解脂耶氏酵母	合成生物学	NA	大规模基因组装和基因组整合	NA	NA	构建了含有35个外源基因的底盘细胞，并在5 L生物反应器中进行了优化菌株的测试
16	2025-07-19	Iterative deep learning design of human enhancers exploits condensed sequence grammar to achieve cell-type specificity 2025-Jul-16, Cell systems IF:9.0Q1 DOI:10.1016/j.cels.2025.101302 PMID:40472848	研究论文	本文应用迭代深度学习设计具有强细胞类型特异性的合成增强子	利用迭代深度学习设计合成增强子，实现细胞类型特异性，并通过实验验证和模型优化提高特异性	仅在两株人类细胞系中验证，未扩展到更多细胞类型或体内环境	解决合成生物学中如何靶向特定细胞类型进行基因表达的问题	人类细胞系中的合成增强子	合成生物学	NA	迭代深度学习	深度学习模型	增强子活性和染色质可及性数据	两株人类细胞系
17	2025-07-19	Synthetic biology-driven optoelectronic biosensor for rapid and highly sensitive norovirus detection in fecal samples 2025-Jul-15, Biosensors & bioelectronics IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.bios.2025.117787 PMID:40674850	研究论文	介绍了一种基于合成生物学的光电生物传感器，用于快速、高灵敏度检测临床粪便样本中的人类诺如病毒	整合了诺如病毒样颗粒和高亲和力单链可变片段抗体作为生物受体，实现了无需核酸扩增的多重分析，检测灵敏度比传统比色生物传感器提高了10至100倍	研究样本量较小（20份人类粪便样本），可能需要更大规模的临床验证	开发一种快速、高灵敏度的诺如病毒检测平台	人类诺如病毒	生物传感器	诺如病毒感染	合成生物学、噬菌体展示、光电传感	NA	生物分子数据	20份人类粪便样本
18	2025-07-19	Advances in production and application technologies of minicells: A review 2025-Jul-14, Biotechnology advances IF:12.1Q1 DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108648 PMID:40669734	review	本文综述了微型细胞的生产和应用技术进展，包括其形成机制、分离方法、生产现状以及在合成生物学、农业和医学中的多样化应用	重点介绍了微型细胞在传统药物递送之外的四大功能：解毒与耐受、富集与微反应器、分子封装与递送以及原生结构表征	讨论了微型细胞在生物技术应用中面临的挑战和未来前景	综述微型细胞的生产技术及其在多个领域的应用	微型细胞	合成生物学	NA	NA	NA	NA	NA
19	2025-07-19	Computational Strategies to Enhance Vitamin B12 Biosynthesis Potential of Microbes 2025-Jul-04, Current microbiology IF:2.3Q3 DOI:10.1007/s00284-025-04325-8 PMID:40615742	review	本文综述了利用计算策略增强微生物维生素B12生物合成潜力的各种方法	讨论了CRISPR-Cas9基因组编辑、人工智能驱动的途径优化和多组学数据整合等最新进展	未提及具体实验验证或实际应用中的挑战	提高微生物维生素B12的生物合成以满足全球营养和治疗需求	微生物及其代谢途径	合成生物学	NA	代谢工程、合成生物学、比较基因组学、分子对接、CRISPR-Cas9、人工智能	NA	多组学数据	NA
20	2025-07-19	Regulation and induction of fungal secondary metabolites: a comprehensive review 2025-Jul-01, Archives of microbiology IF:2.3Q3 DOI:10.1007/s00203-025-04386-0 PMID:40590991	综述	本文全面分析了真菌次级代谢产物的调控机制、鉴定方法及提高产量的策略	强调了合成生物学和AI驱动的代谢工程在可持续利用真菌生物多样性中的创新应用	未提及具体实验验证或案例研究的局限性	探讨真菌次级代谢产物的调控机制及其在医药、农业和化妆品等领域的应用	真菌次级代谢产物及其生物合成基因簇	合成生物学	NA	OMICS技术、响应面方法、人工神经网络	人工神经网络	NA	NA