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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-03-09 |
Versatile 2-Oxoglutarate-Dependent Dioxygenases Catalyze Radical-Mediated Multifunctional Skeleton Reconstructions and Oxidation Modifications of Taxoids
2026-Feb-26, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.6c01169
PMID:41746272
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研究论文 | 本研究鉴定并表征了两种新型2-氧戊二酸依赖性双加氧酶TcOGD1和TcOGD2,它们能够催化紫杉烷类化合物的骨架重构和氧化修饰,揭示了紫杉烷结构多样性的形成机制 | 首次报道了具有催化多功能性的2-氧戊二酸依赖性双加氧酶,能够通过自由基介导的C-C键断裂实现紫杉烷骨架从6/8/6到5/7/6、-5/7/6和6/12框架的重构,并完成多个位点的氧化修饰 | NA | 探索5/7/6框架紫杉烷类化合物的化学多样性和生物合成途径 | 紫杉烷二萜类化合物及其生物合成酶 | 合成生物学 | 癌症 | 酶促反应、NMR光谱分析、酶工程 | NA | 化学结构数据、酶活性数据 | 从植物中分离得到五种新型-5/7/6紫杉烷化合物 | 酶工程 | NA | NA | 医药 |
| 22 | 2026-03-09 |
Editing and synthetic engineering of chloroplast genomes
2026-Feb-26, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2026.101783
PMID:41761616
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综述 | 本文综述了叶绿体基因组编辑与合成工程的最新进展,包括基因组最小化、高效编辑和代谢途径重设计 | 整合了叶绿体基因组最小化、高效编辑工具和代谢途径动态调控,为下一代叶绿体工程铺平道路 | NA | 优化叶绿体功能,推动生物技术和农业应用 | 叶绿体基因组 | 合成生物学 | NA | 基因敲除、敲入、碱基替换、多重修饰 | NA | NA | NA | NA | 植物、藻类 | 代谢途径重设计 | 农业、生物技术 |
| 23 | 2026-03-09 |
Strategies for Metabolic Engineering of Escherichia coli for β-Carotene Biosynthesis
2026-Feb-10, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules31040611
PMID:41752388
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综述 | 本文总结了在大肠杆菌中通过代谢工程策略生产β-胡萝卜素的方法 | 系统综述了在大肠杆菌中生产β-胡萝卜素的多种代谢工程策略,包括内源MEP途径操作、杂合MVA途径引入、中心碳代谢调控、细胞膜修饰及发酵过程优化 | NA | 为设计高效的β-胡萝卜素生产菌株提供理论见解,并为有价值的类胡萝卜素和类胡萝卜素衍生物的可持续生产奠定基础 | 大肠杆菌(Escherichia coli) | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌 | β-胡萝卜素生物合成途径,包括内源MEP途径和引入的杂合MVA途径 | 食品, 制药, 化妆品 |
| 24 | 2026-03-09 |
Beyond CRISPR: next-gen precision engineering of CAR-NK cells for enhanced persistence, trafficking, and tumor eradication
2026-Feb-05, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-026-04219-0
PMID:41645252
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综述 | 本文综述了超越传统CRISPR技术的下一代精准工程工具,用于增强CAR-NK细胞的持久性、迁移能力和肿瘤清除效果 | 探讨了超越DSB依赖型CRISPR-Cas9的下一代工具(如碱基编辑器、表观遗传重编程、靶向转座子系统、合成生物学回路)的协同整合,以解决CAR-NK细胞临床转化中的关键挑战 | NA | 开发能够持久、强效且安全地对抗血液肿瘤和实体瘤的下一代CAR-NK细胞疗法 | CAR-NK(嵌合抗原受体自然杀伤)细胞 | 合成生物学 | 肿瘤 | 碱基编辑、表观遗传重编程、靶向转座子系统、合成生物学回路 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 碱基编辑器, 表观遗传编辑器, CRISPR相关转座酶 | NK细胞 | 逻辑门控靶向、免疫调节载荷、双特异性衔接器、合成/表观遗传回路 | 医学 |
| 25 | 2026-03-09 |
Repurposing nuclear receptors for ligand-responsive liquid condensate formation and gene regulation
2026-Jan-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69099-4
PMID:41620421
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研究论文 | 本研究通过重新利用核受体配体结合域和共激活因子,开发了响应激素或临床批准药物的化学诱导二聚化系统,并设计了配体响应的液-液相分离凝聚物,用于基因调控和转录放大 | 利用核受体配体结合域和共激活因子构建响应内源性激素或药物的化学诱导二聚化系统,并首次设计出配体控制的液-液相分离凝聚物以增强转录激活 | NA | 开发与内源性信号整合的配体响应系统,用于合成生物学和基因调控应用 | 核受体配体结合域(TRβ、VDR、RARγ、ERβ、GR2)和TIF2共激活因子肽 | 合成生物学 | NA | 化学诱导二聚化、液-液相分离 | NA | NA | NA | NA | NA | 两输入转录开关、配体响应的液-液相分离凝聚物 | 基因电路、生物传感、治疗学 |
| 26 | 2026-03-09 |
Evolutionary repurposing of a metabolic thiolase complex enables antibiotic biosynthesis
2026-Jan-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68910-6
PMID:41617701
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研究论文 | 本研究报道了一种来自口腔链球菌的三组分酶复合体,通过不寻常的Friedel-Crafts C-乙酰化反应完成抗生素reutericyclin A的生物合成 | 揭示了硫解酶复合体通过关键催化残基重编程实现底物特异性改变,从HMG-CoA合成转向Friedel-Crafts C-酰化,提供了酶功能多样化的罕见案例 | NA | 探究初级代谢酶如何进化获得次级代谢中的专门功能,以理解天然产物化学丰富性的基础 | 口腔链球菌物种中的三组分酶复合体(包括HMGS、ACAT和DUF35蛋白) | NA | NA | 冷冻电镜、生化表征、分子建模、进化分析 | NA | 结构数据、生化数据、进化数据 | NA | NA | 口腔链球菌物种(如S. macacae) | NA | 合成生物学(为工程化C-C键形成催化剂提供模板) |
| 27 | 2026-03-09 |
Plant non-canonical peptides: From identification to mechanisms
2026-Jan-23, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2026.101739
PMID:41580897
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综述 | 本文全面概述了植物肽的分类、生物合成及其在调节多种生物过程中的功能机制,并系统总结了植物肽鉴定的历史发展和最新进展 | 整合肽组学、质谱和基因组学技术,系统总结了植物非经典肽的鉴定策略,并提出了结合高通量技术、功能基因组学和合成生物学以挖掘植物肽潜力的新方向 | 肽的发现和功能注释仍面临挑战,需要进一步技术整合以克服这些限制 | 探索植物肽在作物改良和跨学科创新中的潜力 | 植物肽,特别是非经典肽 | NA | NA | 肽组学、质谱、高通量技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业 |
| 28 | 2026-03-09 |
Strategies for Improving Aptamer Screening Efficiency: Library Design, Awareness Innovation, and Instrument Assistance
2026, Critical reviews in analytical chemistry
IF:4.2Q1
DOI:10.1080/10408347.2024.2411244
PMID:39378058
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综述 | 本文综述了提高适配体筛选效率的策略,包括库设计、筛选意识创新和仪器辅助,旨在优化SELEX方法 | 通过整合理性库设计、新颖筛选意识和先进筛选设备,显著减少筛选轮数至<8轮,部分方法实现单轮筛选,整体时间缩短至<3周,同时提升适配体性能 | NA | 优化适配体筛选方法,提高SELEX效率,以应对初始库盲目、过程耗时和适配体性能不足等挑战 | 适配体(短单链核酸)及其筛选方法SELEX | 合成生物学 | NA | SELEX(配体指数富集系统进化) | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物传感器、疾病治疗、合成生物学 |
| 29 | 2026-03-09 |
Digital switching in a biosensor circuit via programmable timing of gene availability
2014-Dec, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/nchembio.1680
PMID:25306443
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研究论文 | 本研究通过可编程的基因可用性时序控制,利用位点特异性重组酶改善合成生物传感器电路在瞬时递送中的性能 | 首次利用位点特异性重组酶实现多基因电路中基因可用性的可编程时序控制,显著降低传感器本底泄漏并提升动态范围 | NA | 开发通过时序控制改善合成基因电路性能的新方法 | 基于microRNA的内源性生物传感器基因电路 | 合成生物学 | NA | 位点特异性重组技术 | NA | 基因表达数据 | NA | 位点特异性重组酶 | 哺乳动物细胞 | 比例式生物传感器电路,包含阻遏蛋白组件及其靶标的去同步化设计 | 医学 |
| 30 | 2026-03-08 |
Natural products as modulators of ferroptosis: Therapeutic implications and molecular mechanisms in disease treatment
2026-May, The Journal of nutritional biochemistry
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jnutbio.2026.110259
PMID:41490559
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综述 | 本文综述了天然产物作为铁死亡调节剂在疾病治疗中的分子机制与治疗潜力 | 系统性地基于结构类别和作用机制对天然产物进行分类,并强调纳米递送系统和合成生物学作为克服其应用限制的前沿策略 | 天然产物的应用受到来源受限、成分复杂和药代动力学不稳定的限制 | 探讨天然产物作为铁死亡调节剂在疾病治疗中的治疗意义和分子机制 | 天然产物(如萜类、黄酮类、生物碱、皂苷和多酚)及其对铁死亡的调节作用 | NA | 癌症、神经退行性疾病、糖尿病、心血管疾病 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 31 | 2026-03-08 |
Modulation of Clostridioides difficile virulence by metabolites derived from probiotic consortia and genetically edited strains
2026 May-Jun, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108818
PMID:41638450
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综述 | 本文综述了通过代谢物调节艰难梭菌毒力的策略,重点探讨了恢复次级胆汁酸代谢、增加短链脂肪酸产量和破坏群体感应系统如何协同抑制毒素表达、生物膜形成和孢子萌发 | 提出了一种协同多靶点(胆汁酸代谢、短链脂肪酸、群体感应)抑制艰难梭菌毒力的策略,并展望了合成生物学和代谢工程在开发下一代工程益生菌和活体生物治疗产品中的应用 | NA | 探讨通过调节肠道代谢网络来抑制艰难梭菌毒力、控制感染复发的策略 | 艰难梭菌及其毒力因子(毒素、生物膜、孢子) | 合成生物学 | 艰难梭菌感染 | 多组学(基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学)、计算建模 | NA | 多组学数据 | NA | 代谢工程 | 益生菌、工程微生物群落 | 具有可编程群体淬灭能力和优化代谢输出的活体生物治疗产品 | 医学 |
| 32 | 2026-03-08 |
Genetic toolbox development for engineering Bacteroides and other bacterial species
2026-Apr, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2026.102709
PMID:41643388
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综述 | 本文综述了为非模型细菌菌株开发合成生物学工具箱的策略,以 Bacteroides 属为例,探讨如何建立分子生物学框架 | 强调为非模型共生和益生菌菌株开发定制化遗传工具,以支持原位工程化活体治疗或诊断机器的构建 | NA | 开发合成生物学工具箱,以促进非模型细菌菌株的遗传和代谢操作 | Bacteroides 属及其他非模型细菌物种 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | Bacteroides, E. coli | 逻辑门、生物传感器、代谢途径 | 医学 |
| 33 | 2026-03-08 |
Metabolic Engineering and Synthetic Biology-Driven Strategies to Harness Microbial Production of Adipic Acid: Current Status and Future Direction
2026-Mar-06, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00869
PMID:41790735
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综述 | 本文综述了利用代谢工程和合成生物学策略驱动微生物生产己二酸的当前进展与未来方向 | 批判性地讨论了生物合成路径、先进的代谢工程策略和工具,以构建高转化效率的细胞工厂,并全面回顾了发酵过程和下游分离技术的基本原理 | 工业上可行的己二酸生物合成技术仍面临原料利用不完全、菌株转化效率低、发酵过程复杂和下游分离成本高等挑战 | 开发可持续的生物合成技术以生产己二酸,满足市场需求并解决环境问题 | 己二酸(AA)作为尼龙-6,6的前体 | NA | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | E. coli, S. cerevisiae, B. subtilis | 生物传感器、代谢途径 | 工业生物技术、材料 |
| 34 | 2026-03-08 |
Seizing the key nodes in glabridin biosynthesis network: identification of enzymes for producing licorice hairy roots with high levels of glabridin
2026-Mar-05, Molecular horticulture
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s43897-025-00202-x
PMID:41782076
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研究论文 | 本研究通过多组学分析和体外酶活验证,阐明了光甘草定生物合成的两条关键途径,并利用转基因毛状根体系实现了光甘草定的高效生产 | 首次系统解析了光甘草定生物合成网络中的关键酶与两条互作途径,并建立了44倍产量提升的转基因毛状根生产平台 | 未在田间或大规模发酵体系中验证生产平台的稳定性与经济效益 | 解析光甘草定生物合成途径并建立高效生物生产体系 | 甘草(Glycyrrhiza glabra)及其光甘草定生物合成相关酶 | 合成生物学 | NA | 多组学分析、体外酶活测定、农杆菌介导的遗传转化 | NA | 组学数据、酶活数据、代谢物含量数据 | 转基因毛状根系及4年生野生根对照 | 农杆菌介导转化 | 甘草毛状根 | 光甘草定生物合成途径(OMT/ODMT依赖与非依赖双途径) | 医药、化妆品 |
| 35 | 2026-03-08 |
Combining model-based and data-driven models: an application to synthetic biology resource competition
2026-Mar-04, Mathematical biosciences
IF:1.9Q3
DOI:10.1016/j.mbs.2026.109649
PMID:41791590
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研究论文 | 本文提出了一种结合机理模型与机器学习的方法(ePINNs),用于解决合成生物学中基因电路因资源竞争而产生的意外行为问题 | 提出了部分不确定模型结构(PUMS)的概念和嵌入式物理信息神经网络(ePINNs),通过两个共享损失的神经网络无缝融合机理模型与数据驱动模型 | NA | 探索机器学习与机理模型的集成方法,以增强模型预测鲁棒性、系统洞察力和对稀疏/噪声数据的处理能力 | 合成生物学中的基因网络模型(受资源竞争影响) | 机器学习 | NA | 机器学习,物理信息神经网络 | 嵌入式物理信息神经网络(ePINNs) | NA | NA | NA | 活细胞 | 基因电路(受资源竞争影响) | 合成生物学 |
| 36 | 2026-03-08 |
Engineering microbial cell factories for succinic acid biomanufacturing: Challenges and perspectives
2026-Mar-04, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108861
PMID:41791685
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综述 | 本文系统评述了用于琥珀酸生物制造的微生物细胞工厂的工程化策略、挑战与未来展望 | 提供了关于菌株开发和生物过程整合的多学科视角,为设计高效微生物细胞工厂和加速生物基琥珀酸的商业化提供了战略框架 | NA | 评述微生物细胞工厂用于琥珀酸生物制造的工程化策略,以推动其商业化进程 | 用于琥珀酸生产的微生物平台,包括某些细菌和酵母 | 合成生物学 | NA | 系统生物学、代谢建模、过程工程、合成生物学工具 | NA | NA | NA | NA | 细菌, 酵母 | 天然和异源生物合成途径的理性设计 | 工业生物技术 |
| 37 | 2026-03-08 |
An Easy-To-Use and Field-Deployable Cell-Free Bioreporter for Environmental Detection of Tetracyclines and Macrolides
2026-Mar-03, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.5c04800
PMID:41693084
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研究论文 | 本文开发了一种基于合成生物学的无细胞生物报告系统,用于环境中四环素和大环内酯类抗生素的检测 | 该系统整合了抗生素响应转录因子、RNA聚合酶和工程化DNA转录模板,通过体外转录反应产生可见荧光信号,无需生物安全防护,可冻干保存并适用于现场部署 | NA | 开发一种便携、快速且无需复杂仪器的环境抗生素检测方法 | 四环素和大环内酯类抗生素在环境水样中的检测 | 合成生物学 | NA | 体外转录反应 | NA | 荧光信号 | 真实水样 | 合成生物学 | 无细胞系统 | 抗生素响应生物传感器 | 环境 |
| 38 | 2026-03-08 |
Genomic perplexity and the evolution of context-dependent function
2026-Mar-02, Molecular biology and evolution
IF:11.0Q1
DOI:10.1093/molbev/msag041
PMID:41739546
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研究论文 | 本文提出基因组像大型语言模型一样不编码固定功能,而是编码功能和表型结果的概率分布,并引入“基因组困惑度”概念来量化基因流动的适应度成本 | 将基因组功能与大型语言模型进行概念类比,提出基因组编码概率分布而非固定功能的新框架,并首次引入“基因组困惑度”作为量化基因流动适应度成本的信息论度量 | 提出的框架目前主要是概念性的,需要更多实证研究来验证其预测能力,且对基因组复杂性的简化可能忽略某些生物学细节 | 探讨基因组功能的上下文依赖性及其进化意义,为理解基因流动和合成生物学提供新框架 | 基因组功能、基因流动(水平基因转移和基因渗入)、表型结果 | 计算生物学 | NA | 泛基因组学、合成生物学、全基因组关联研究(GWAS) | Transformer、大型语言模型(LLM) | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、进化建模 |
| 39 | 2026-03-08 |
Self-assembled cell-scale containers made from DNA origami membranes
2026-Mar, Nature materials
IF:37.2Q1
DOI:10.1038/s41563-025-02418-0
PMID:41315785
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研究论文 | 本文报道了一种受脂质结构启发的DNA折纸单层膜自组装方法,可形成囊泡或中空管状结构 | 首次利用DNA折纸技术构建细胞尺度的动态膜结构,突破了传统蛋白质/脂质膜的限制 | 未明确说明结构的长期稳定性及在复杂生物环境中的功能表现 | 开发新型仿生隔室化技术用于合成生物学和细胞尺度软机器人 | DNA折纸膜自组装结构(囊泡/中空管) | 合成生物学 | NA | DNA折纸技术 | NA | 结构成像数据 | NA | DNA折纸 | NA | 仿脂质结构的径向对称DNA折纸亚基自组装膜 | 生物技术, 软体机器人 |
| 40 | 2026-03-08 |
Glassy Dynamics as a Predictive Framework for Lipid Exchange Across Membranes
2026-Mar, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202512844
PMID:41562888
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研究论文 | 本文提出了一种受玻璃态动力学启发的热力学-动力学框架,用于预测跨膜脂质交换的活化能和转移时间尺度 | 利用脂质囊泡的热膨胀系数这一单一实验可测参数,应用集体小位移模型进行无调整参数的预测,将脂质交换过程与无定形材料中的协同分子事件联系起来 | NA | 建立脂质跨膜交换的定量预测框架 | 脂质囊泡和跨膜脂质交换过程 | 软物质物理 | NA | 无标记石英晶体微天平实验 | 集体小位移模型 | 实验数据 | 多个脂质系统 | NA | NA | NA | 药物递送、生物仿生材料设计、纳米生物技术 |