合成生物学相关文章
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当前共找到 129 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-06-06 |
The Coli Toolkit (CTK): An Extension of the Modular Yeast Toolkit for Use in E. coli
2026-Feb-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00489
PMID:41581077
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研究论文 | 本文介绍了Coli Toolkit（CTK），一个基于Golden Gate的模块化克隆系统，扩展了Yeast Toolkit用于大肠杆菌的遗传电路构建 | 通过将启动子细分为子部件（启动子、绝缘核酶和核糖体结合位点），增强了对转录和翻译的灵活控制，并提供预组装的NOT门基本部件以加快大型遗传电路的克隆 | 未明确讨论该工具包在大规模复杂电路设计中的潜在挑战或与其他系统的直接性能比较 | 为大肠杆菌提供一个快速高效的遗传电路组装模块化工具包，填补细菌合成生物学基础设施的关键空白 | 大肠杆菌中的遗传电路 | 合成生物学 | NA | Golden Gate组装 | 校准模型 | 表征数据 | NA | Golden Gate Assembly | 大肠杆菌 | 遗传电路，NOT门，可诱导和组成型启动子 | 健康、可持续性、生物技术 |
| 22 | 2026-06-05 |
Advances in site-specific knock-in techniques for gene editing
2026-Feb-20, Yi chuan = Hereditas
DOI:10.16288/j.yczz.25-076
PMID:41669806
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综述 | 系统总结了定点敲入技术在基因编辑中的最新进展 | 整合了位点特异性重组酶（如Bxb1整合酶）和可编程核酸酶系统（如CRISPR/Cas9）的最新进展，并比较了twinPE+Bxb1和PASTE系统的优缺点 | 实际应用中仍受脱靶活性和低效率的限制 | 提高基因敲入的精确性和效率，推动精准医学和合成生物学应用 | 位点特异性重组酶系统和可编程核酸酶系统 | 基因编辑 | NA | 位点特异性重组酶系统（Bxb1整合酶）、CRISPR/Cas9、Cas9-Bxb1整合酶系统、twinPE+Bxb1、PASTE | NA | 多组学数据 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 精准医学、合成生物学 |
| 23 | 2026-06-05 |
Development of a Tool for High-Efficiency, Markerless and Iterative Genome Editing in Shouchella clausii
2026-Feb, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.70287
PMID:41662148
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研究论文 | 开发了一种高效、无标记、可迭代的Shouchella clausii基因组编辑工具 | 首次在Shouchella clausii中建立基于温度敏感型穿梭载体和Golden Gate组装的基因编辑系统，实现无疤痕、可迭代的基因组修改 | 尚未在更多难操作菌株中验证，且高渗电转化协议可能对部分菌株无效 | 开发适用于Shouchella clausii的高效基因组编辑工具，推动其作为微生物底盘的应用 | Shouchella clausii DSM 8716和Bacillus subtilis 168菌株 | 合成生物学 | NA | 高渗电转化、Golden Gate组装 | NA | NA | S. clausii DSM 8716和B. subtilis 168菌株，多次实验 | Golden Gate Assembly | Shouchella clausii, Bacillus subtilis | 温度敏感型穿梭载体（pM4B522），采用pop-in/pop-out整合策略，包含壮观霉素抗性标记和红色荧光蛋白报告基因 | 医学, 工业生物技术, 环境 |
| 24 | 2026-06-03 |
Multilayer Host Engineering of Saccharomyces cerevisiae to Enhance Cricket Paralysis Virus (CrPV) Internal Ribosome Entry Site Mediated Translation
2026-Feb-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00744
PMID:41546634
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研究论文 | 通过多层次的宿主工程改造酿酒酵母，增强蟋蟀麻痹病毒内部核糖体进入位点介导的翻译活性 | 首次结合翻译起始、tRNA修饰和mRNA稳定性三个机制层面的宿主改造，实现了CrPV IRES介导翻译活性数量级的提升 | 仅建立了概念验证框架，未具体量化各改造步骤对翻译效率的独立贡献，且可能存在工程菌株生长适应性代价 | 通过宿主工程策略提高CrPV IRES在酿酒酵母中的翻译效率，以扩展其在合成生物学中的RNA调控应用 | 酿酒酵母宿主菌株及CrPV IRES报告系统 | 合成生物学 | NA | 报告基因筛选、基因工程改造 | NA | 报告基因表达数据 | 多个改造菌株（具体数量未明示） | CRISPR-Cas9 | 酿酒酵母 | CrPV IRES介导的非经典翻译调控元件 | 合成生物学 |
| 25 | 2026-06-03 |
Phage-mediated delivery of CRISPR payloads
2026-Feb, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2025.102704
PMID:41547318
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综述 | 综述利用噬菌体递送CRISPR有效载荷以工程改造微生物群落的最新进展 | 系统总结了利用噬菌体递送各种CRISPR-Cas效应器进行精准基因组编辑和原位扰动的方法 | 部署的系统发育广度仍存在挑战 | 讨论利用噬菌体递送CRISPR有效载荷以工程改造微生物群落 | 微生物群落和噬菌体 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas, 噬菌体递送 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas, 噬菌体工程 | 细菌, 宿主环境 | CRISPR有效载荷, 精准基因组编辑 | 医学, 食品, 农业 |
| 26 | 2026-05-27 |
Mind Everywhere: A Framework for Conceptualizing Goal-Directedness in Biology and Other Domains-Part Two
2026-Feb-25, Biological theory
IF:1.9Q1
DOI:10.1007/s13752-025-00524-5
PMID:42183020
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评论文章 | 提出一个基于心智概念的框架来概念化生物学及其他领域的目标导向性 | 从新兴领域“多元智能”出发，强调经验可检验性、新能力发现的丰产性、术语的操作化以及人类目标导向性与单细胞起源的连续性，为生物学的目的论提供新的心智化方法 | 文章未明确讨论其框架在具体实验中可能遇到的实践挑战或局限性 | 发展一种受心智概念启发的生物学目的论方法，以更好地理解系统如何工作并指导实验和应用 | 生物系统（包括进化、工程或混合系统）的目标导向性、智能、认知和意向性 | 机器学习 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学、生物工程 |
| 27 | 2026-05-27 |
Mind Everywhere: A Framework for Conceptualizing Goal-Directedness in Biology and Other Domains-Part One
2026-Feb-01, Biological theory
IF:1.9Q1
DOI:10.1007/s13752-025-00523-6
PMID:42183019
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研究论文 | 提出一个框架来概念化生物及其他领域中的目标导向性，强调经验可检验性、新能力的发现、术语操作化以及人类目标导向性与单细胞起源的连续性 | 从多元智能领域出发，反对生物学中对目标导向性的最小化倾向，倡导用心理概念如智能、认知和意向性来理解生物学中的目的论，并强调经验可检验性和研究工具的操作化 | 可能面临传统还原论者的反对，且框架的经验验证和实际应用仍需进一步证据 | 建立一种基于心理概念的目标导向性框架，以更好地理解生命系统中的智能和目标导向行为，推动哲学思考及生物医学和生物工程应用 | 生物系统中的目标导向性，包括形态发生、合成生物学和生物电网络等领域中细胞行为的协调 | 生物信息学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物医学, 生物工程 |
| 28 | 2026-05-26 |
Arboviral Diseases in a Changing World: Evolutionary Dynamics, Host-Vector Interactions, and Novel Control Strategies
2026-Feb, Vector borne and zoonotic diseases (Larchmont, N.Y.)
DOI:10.1177/15303667251376450
PMID:40955762
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综述 | 系统综述虫媒病毒在气候变化背景下的进化动态、宿主-媒介互作及新型防控策略 | 整合基因组分析、元流行病学综合与预测建模的多学科框架，系统阐述CRISPR基因驱动、沃尔巴克氏体干预及mRNA疫苗等新型防控策略 | 伦理、生态和监管问题（如基因编辑和微生物干预）需进一步考量 | 理解虫媒病毒进化机制、宿主-媒介互作及新型控制策略以有效缓解疾病 | 登革病毒、寨卡病毒、基孔肯雅病毒、西尼罗病毒等虫媒病毒及其媒介（蚊、蜱） | NA | 虫媒病毒病 | 基因组分析、元流行病学综合、预测建模 | NA | 文献数据 | 从16320篇初始文献中筛选出12项高质量同行评审研究 | CRISPR基因驱动 | 蚊、蜱 | 基因驱动回路、基于RNAi的抗病毒回路 | 医学 |
| 29 | 2026-05-25 |
Amalgamation of Biofilms and Synthetic Biology: A Paradigm Shift in Biotechnology
2026-Feb-17, Medical principles and practice : international journal of the Kuwait University, Health Science Centre
IF:2.9Q1
DOI:10.1159/000550994
PMID:41701651
|
综述 | 本文综述了生物膜工程与合成生物学交叉领域的最新进展，重点介绍了调控生物膜行为以用于生物技术应用和解决相关挑战的策略 | 整合了噬菌体疗法、电遗传系统、微生物联合体设计、群体感应调控、遗传电路、胞外聚合物修饰和抗菌肽涂层表面等多种策略，实现了对生物膜结构、组成和代谢输出的精确调控 | 存在生物安全性、异质性、可扩展性和监管合规性等挑战 | 探讨合成生物学工具在生物膜工程中的应用，以优化生物膜在废水处理、生物修复、生物能源和诊断等领域的性能，并控制致病性生物膜 | 生物膜及其工程化系统 | 机器学习 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 遗传电路 | 环境, 能源, 医学 |
| 30 | 2026-05-22 |
Flavonoids in Medicine and Food Homology Substances: Structure-Activity Relationship, Application Challenges, and Cutting-Edge Technological Breakthroughs
2026-02-11, Foods (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/foods15040658
PMID:41750850
|
综述 | 本文综述了药食同源物质中黄酮类化合物的构效关系、应用挑战及前沿技术突破 | 整合人工智能、合成生物学和材料科学，提出黄酮类化合物在精准营养和个性化医疗中的应用方向 | 未具体探讨不同黄酮类化合物的定量比较及实际临床转化案例 | 为药食同源物质中黄酮类化合物的基础研究和应用开发提供参考 | 药食同源物质中的黄酮类化合物 | NA | NA | 超声/微波辅助提取、超临界CO2萃取、UHPLC-MS | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学、食品 |
| 31 | 2026-05-09 |
Multichannel genomic recording of biological information with ENGRAM
2026-Feb-11, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-025-01322-w
PMID:41673323
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protocol | 提供ENGRAM实验的逐步操作协议及数据分析方法，阐述其设计要点、优势与局限，并展示在多路信号记录和高通量CRE筛选中的应用 | ENGRAM利用引物编辑介导的插入记录顺式调控元件活性，支持高多重性（如4碱基对插入可代表多达256种不同CRE），并与DNA Typewriter兼容以捕获信号顺序 | 未明确提及自身局限，但可能包括对分子生物学和细胞培养技能的要求，以及实验周期约5-6周 | 通过ENGRAM实现生物信息的多通道基因组记录，为研究时间动态生物学提供新范式 | 顺式调控元件及其在哺乳动物细胞中的活性 | 合成生物学 | NA | 引物编辑、DNA测序 | NA | 基因组序列数据 | NA | 引物编辑 | 哺乳动物细胞 | ENGRAM记录电路（增强子介导的多路活动基因组记录） | 分子记录、高通量筛药 |
| 32 | 2026-04-30 |
Minor groove tetrads: a potent and versatile capping interaction for i-motif structures
2026-Feb, Biophysical reviews
IF:4.9Q1
DOI:10.1007/s12551-026-01406-1
PMID:41909615
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review | 综述了小沟四联体（MGTs）作为i-motif结构封盖相互作用的强效多功能机制 | 揭示了MGT能稳定i-motif结构，使其在中性pH下折叠，并仅用两个C:C⁺对形成紧凑构型，同时可逆pH响应且不扭曲B-DNA几何结构 | 尚未提供体内应用的长期稳定性数据或在复杂生物环境中的直接验证 | 探索小沟四联体在i-motif工程中的稳定机制及其在纳米技术和合成生物学中的应用潜力 | 小沟四联体与i-motif DNA结构的相互作用 | 合成生物学 | NA | 荧光光谱、化学修饰（2'-氟取代、荧光胞苷类似物） | NA | NA | NA | NA | NA | i-motif纳米结构（含MGT封盖） | 生物传感, 纳米技术, 合成生物学 |
| 33 | 2026-04-19 |
Model-guided design of regulatable promoters for synthetic biology
2026-Feb, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2025.102701
PMID:41485423
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综述 | 本文综述了在大肠杆菌中通过模型引导设计可调控启动子的方法，结合简单实验与热力学框架优化启动子功能 | 提出了一种基于上下文最小化和测量优先的方法，将简单实验与单一转录因子的热力学模型结合，以优化启动子的动态范围、泄漏性和敏感性 | NA | 设计具有特定功能输出的可调控启动子，以应用于合成生物学 | 大肠杆菌中的启动子序列设计，特别是以LacI为例的转录因子调控机制 | 合成生物学 | NA | 热力学模型、序列-占据测量、拷贝数竞争分析 | 热力学框架模型 | 序列数据、实验测量数据 | NA | NA | 大肠杆菌 | 可调控启动子设计，涉及转录因子占据、功能调控和诱导剂变构 | 工业生物技术 |
| 34 | 2026-04-17 |
Chemical Signaling and Metabolomic Crosstalk in Endophytic Fungi-Medicinal Plant Symbioses for Natural Product Discovery and Sustainable Bioproduction
2026-Feb-28, Metabolites
IF:3.4Q2
DOI:10.3390/metabo16030164
PMID:41893315
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综述 | 本文综述了药用植物内生真菌之间通过化学信号传导和代谢组学串扰驱动天然产物生物合成的多层机制，并探讨了利用这种共生智能进行可持续生物生产的策略 | 系统总结了宿主来源的化学信号（如根系分泌物和氧脂素）作为唤醒真菌沉默生物合成基因簇（BGCs）的主要触发因素，并批判性地评估了空间代谢组学（如MALDI-MSI）在揭示植物-真菌界面局部化代谢交换方面的应用 | 本文是一篇综述，未报告原始实验数据，其结论基于对过去十年文献的系统调查，可能受限于现有研究的覆盖范围和深度 | 旨在总结药用植物与内生真菌之间代谢串扰的机制，并评估利用这种共生关系进行天然产物发现和可持续生物生产的策略 | 药用植物及其相关的内生真菌 | NA | NA | 空间代谢组学（MALDI-MSI）、共培养模型、植物体内模型、结构解析 | NA | NA | NA | NA | 药用植物，内生真菌 | NA | 医药，工业生物技术 |
| 35 | 2026-04-10 |
Expression of nano-engineered RNA organelles in bacteria
2026-Feb-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69336-w
PMID:41688461
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研究论文 | 本文利用RNA纳米技术在E. coli中设计并表达非天然的无膜细胞器，通过分支RNA基序的共转录组装实现正交、非混合的凝聚体，并嵌入蛋白质结合适体实现选择性蛋白质招募 | 采用RNA纳米技术设计合成生物分子凝聚体，实现算法控制相互作用、客户亲和力及凝聚体微结构，相比基于肽构建块或重复RNA序列的现有方案更具创新性 | NA | 设计合成生物分子凝聚体以模拟天然无膜细胞器功能，并应用于细胞和代谢工程 | E. coli中的合成无膜细胞器 | 合成生物学 | NA | RNA纳米技术 | NA | NA | NA | NA | E. coli | 基于分支RNA基序通过碱基配对相互作用组装的无膜细胞器，具有蛋白质结合适体嵌入功能 | 工业生物技术 |
| 36 | 2026-04-09 |
CO2-driven biosurfactant synthesis by bacteria within CCUS
2026-Feb-25, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-026-13761-w
PMID:41741775
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综述 | 本文综述了微生物在CCUS框架内通过CO2捕获驱动生物表面活性剂合成的代谢与工程方面，探讨了其工业应用及合成生物学进展 | 整合了CO2利用、生物技术和数字创新，提出了通过合成生物学将碳固定模块与生物表面活性剂途径连接的新策略 | 面临技术和经济挑战，具体实施细节和规模化可行性未详细讨论 | 探讨微生物CO2捕获与生物表面活性剂生产相结合的策略，以实现温室气体减排和可持续生物制造 | 微生物（细菌）在CCUS系统中的代谢过程及生物表面活性剂合成 | 合成生物学 | NA | 基因工程、合成生物学、系统级建模、人工智能 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 细菌（具体种类未指定） | 碳固定模块与生物表面活性剂生物合成途径的连接 | 环境, 工业生物技术 |
| 37 | 2026-04-09 |
Causes and consequences of experimental variation in Nicotiana benthamiana transient expression
2026-Feb-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69458-1
PMID:41690913
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研究论文 | 本研究系统分析了本氏烟草瞬时表达实验中的变异来源，并建立了变异模型以指导实验设计 | 首次对本氏烟草农杆菌浸润瞬时表达系统的实验变异进行全面建模分析，并基于三年纵向数据提出降低变异性的实用指南 | 研究主要针对本氏烟草系统，结论可能不完全适用于其他植物瞬时表达体系 | 探究本氏烟草瞬时表达实验中的变异来源及其影响，建立减少变异性的实验设计框架 | 本氏烟草（Nicotiana benthamiana）农杆菌浸润瞬时表达系统 | 合成生物学 | NA | 农杆菌浸润瞬时表达技术 | 变异统计模型 | 植物基因表达数据 | 1915株植物（三年纵向数据） | 农杆菌介导的基因递送 | 本氏烟草 | 瞬时基因表达系统 | 农业, 工业生物技术 |
| 38 | 2026-03-29 |
Quorum sensing in bacteria: insights into communication and inhibition strategies-a review
2026-Feb-02, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-025-04610-x
PMID:41627464
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综述 | 本文全面综述了细菌群体感应机制及其抑制策略，涵盖不同细菌类型的信号系统、合成生物学进展和多种抑制剂的应用 | 系统整合了群体感应抑制剂的多样类别，包括天然、合成、抗体、酶、CRISPR介导及临床试验中的抑制剂，并强调其在抗微生物耐药性背景下的无耐药性潜力 | 作为综述文章，未提供原始实验数据，且可能未涵盖所有最新研究进展 | 探讨细菌群体感应机制及其抑制策略，以开发可持续的抗微生物控制工具 | 革兰氏阴性菌、革兰氏阳性菌及其群体感应信号分子（如AHLs、寡肽、AI-2） | NA | NA | 合成生物学、CRISPR技术 | NA | NA | NA | CRISPR | NA | 工程化群体感应电路 | 医疗保健, 农业, 水产养殖, 食品工业, 医疗器械生物膜管理 |
| 39 | 2026-03-29 |
Genomic assembly, rescue, and characterization of a functional pseudorabies virus
2026-Feb, Virologica Sinica
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.virs.2025.11.010
PMID:41319833
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研究论文 | 本研究利用基于酵母的转化相关重组技术，开发了一个伪狂犬病毒基因组组装平台，成功拯救并表征了功能性病毒 | 首次应用TAR技术组装伪狂犬病毒基因组，并结合CRISPR/Cas9编辑插入外源基因，实现了快速、灵活的基因组修饰 | 拯救的病毒PRV-GX-Syn1在病毒滴度和斑块大小上低于亲本株，且在小鼠中仍能引起致死性感染，表明毒力未完全减弱 | 开发伪狂犬病毒基因组编辑平台，以促进基础研究和疫苗载体开发 | 伪狂犬病毒PRV-GX-2011株 | 合成生物学 | 伪狂犬病 | 酵母转化相关重组技术、CRISPR/Cas9基因编辑 | NA | 基因组序列 | 使用Vero细胞进行病毒拯救，并在BALB/c小鼠中进行感染实验 | CRISPR-Cas9, TAR | 酵母, Vero细胞 | 在UL23和UL22基因间的非编码区插入egfp基因的合成生物电路 | 医学 |
| 40 | 2026-03-25 |
Streptomyces as a versatile host platform for heterologous production of microbial natural products
2026-02-25, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00036j
PMID:40923873
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综述 | 本文对2004年至2024年间发表的450多项研究进行了全面分析，总结了链霉菌作为异源表达平台在微生物天然产物生物合成基因簇表达中的应用趋势、关键成功因素和技术进展 | 首次提供了该领域二十年发展历程的定量视角，系统分析了表达趋势、宿主偏好及影响因素，并整合了合成生物学工具与基因组工程在克服表达障碍中的作用 | NA | 评估链霉菌作为异源表达平台在微生物天然产物生物合成基因簇表达中的应用潜力与技术进展 | 链霉菌宿主平台及异源表达的微生物生物合成基因簇 | 合成生物学 | NA | 异源表达、基因组工程、组合生物合成 | NA | 文献数据 | 超过450项同行评议研究 | 合成生物学工具 | 链霉菌 | 生物合成基因簇表达平台 | 药物发现 |