本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['synthetic biology']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价9.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-07-21 |
An Easy-To-Use and Field-Deployable Cell-Free Bioreporter for Environmental Detection of Tetracyclines and Macrolides
2026-03-03, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.5c04800
PMID:41693084
|
研究论文 | 报告一种基于合成生物学的无细胞生物报告器,用于环境中的四环素和大环内酯类抗生素检测 | 开发了一种无需活细胞的无细胞生物报告系统,消除了生物安全问题,具有高灵敏度、特异性和准确性,且可通过冻干长期保存,适用于现场部署 | 未提及具体局限性 | 开发一种便携、易用且适合现场部署的抗生素检测工具,用于环境监测 | 四环素和大环内酯类抗生素 | 合成生物学 | NA | 无细胞转录反应,抗生素响应转录因子,RNA聚合酶,工程DNA转录模板 | NA | 荧光信号 | 真实水样(具体数量未提及) | NA | NA | 抗生素响应转录因子、RNA聚合酶和工程DNA转录模板组成的无细胞生物报告电路 | 环境 |
| 22 | 2026-07-19 |
Self-assembled cell-scale containers made from DNA origami membranes
2026-03, Nature materials
IF:37.2Q1
DOI:10.1038/s41563-025-02418-0
PMID:41315785
|
研究论文 | 利用DNA折纸膜自组装形成细胞尺度的容器 | 模仿脂质结构和相互作用,设计径向对称的DNA折纸亚基,形成可编程的DNA折纸单层膜,并能自组装成囊泡或中空管,尺寸范围从100纳米到1微米以上 | 未提及具体局限性 | 在自下而上的合成生物学中实现新型的区室化方法 | DNA折纸亚基及其自组装形成的膜结构 | 合成生物学 | NA | DNA折纸技术 | NA | NA | NA | DNA折纸 | NA | DNA折纸单层膜 | 生物学、软体机器人 |
| 23 | 2026-07-14 |
Versatile 2-Oxoglutarate-Dependent Dioxygenases Catalyze Radical-Mediated Multifunctional Skeleton Reconstructions and Oxidation Modifications of Taxoids
2026-03-18, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.6c01169
PMID:41746272
|
研究论文 | 本研究鉴定了两种新型2-酮戊二酸依赖性双加氧酶,它们能够催化紫杉烷类化合物从6/8/6骨架到5/7/6等骨架的重排及氧化修饰,并揭示了其自由基介导的催化机制 | 发现并表征了两种具有高度催化多样性的双加氧酶(TcOGD1和TcOGD2),它们能催化多种骨架重排和氧化反应,包括首次阐明5/7/6紫杉烷骨架形成的自由基介导C-C键断裂机制 | 紫杉烷类化合物在植物中的产量有限,且部分新骨架化合物的生物合成途径尚未完全阐明 | 探索紫杉烷二萜类化合物结构多样性的形成机制,并开发用于构建独特紫杉烷骨架的生物催化工具 | 两种新型2-酮戊二酸依赖性双加氧酶(TcOGD1和TcOGD2)及紫杉烷类底物 | 合成生物学 | 癌症 | NMR波谱学 | NA | NA | 5种新型-5/7/6紫杉烷化合物从中国红豆杉植物中分离 | NA | NA | NA | 药物 |
| 24 | 2026-07-14 |
Next generation CAR-T cells to tackle solid tumors
2026-03-10, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society
IF:10.5Q1
DOI:10.1016/j.jconrel.2026.114650
PMID:41570863
|
综述 | 本文综述了新一代CAR-T细胞疗法应对实体瘤的挑战和创新设计 | 系统性比较了克服实体瘤障碍的先进合成生物学策略,包括逻辑门控系统、多输入CAR设计、共表达细胞因子受体和耐药性改造 | 仅讨论了体外和临床前研究,缺乏大规模临床试验验证 | 探讨提高CAR-T细胞在实体瘤中疗效的结构性和生物学障碍及创新解决方案 | CAR-T细胞设计及其在实体瘤微环境中的相互作用 | NA | 实体瘤 | NA | NA | NA | NA | 逻辑门控系统、嵌合开关受体、显性负受体 | 人类T细胞 | 逻辑门控CAR、多输入CAR、装甲CAR、共表达细胞因子受体 | 医学 |
| 25 | 2026-07-12 |
Next-generation strategies for PLA degradation: microbial consortia, metagenomics, enzyme engineering and AI-guided approaches
2026-Mar-21, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-026-04726-8
PMID:41863619
|
综述 | 本文综述了增强聚乳酸(PLA)在多种生态系统中生物降解的微生物和生物技术策略的最新进展,包括昆虫肠道微生物群筛选、真菌分离、宏基因组学及人工智能辅助酶工程等方法 | 首次系统整合了合成生物学、定向进化和人工智能在PLA降解酶工程中的应用,提出了多学科策略加速工业堆肥、废水处理和生物修复中PLA降解的路线图 | 未涵盖具体实验验证数据或定量比较不同策略的效率,且对实际应用中的经济性和规模化挑战讨论有限 | 探索并总结利用微生物群、宏基因组学、酶工程和人工智能技术加速PLA生物降解的策略 | PLA降解相关的微生物群落、真菌物种、降解酶(如解聚酶)以及AI模型 | 机器学习 | NA | 宏基因组学、环境DNA(eDNA)、人工智能、机器学习、定向进化 | 机器学习模型 | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 大肠杆菌, 酿酒酵母, 枯草芽孢杆菌, 哺乳动物细胞, 植物 | 合成生物回路(如切换开关、振荡器、逻辑门、生物传感器、代谢通路) | 环境, 工业生物技术 |
| 26 | 2026-07-12 |
Engineering and Evaluation of Sinorhizobium meliloti Nodulation (nod) Gene Reporter Systems in Rhizobia and Non-Rhizobia
2026-Mar, Environmental microbiology
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/1462-2920.70284
PMID:41858307
|
研究论文 | 开发并评估了一种基于结瘤基因报告系统,用于筛选能够表达苜蓿中华根瘤菌结瘤基因的根瘤菌和非根瘤菌 | 构建了基于超折叠GFP和mScarlet-I的双荧光报告系统,可高通量筛选能响应植物信号并表达结瘤基因的新型细菌 | 未明确说明局限性 | 开发有效工具以识别可工程化的相容微生物伙伴,增强非豆科植物的生物固氮能力 | 苜蓿中华根瘤菌结瘤基因报告系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 生物荧光图像 | 多种根瘤菌和非根瘤菌菌株 | NA | 根瘤菌和非根瘤菌 | nod基因报告系统(包含nodD1-PnodA和nodD2-PnodA双荧光标记) | 农业, 环境 |
| 27 | 2026-07-10 |
Context-aware synthetic promoter design using neural networks enables rewiring of eukaryotic transcriptional networks
2026-03-17, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-026-00684-5
PMID:41844670
|
研究论文 | 提出一种基于人工神经网络的框架,用于在酿酒酵母中实现上下文感知的合成启动子设计,从而重编程真核转录网络 | 首次开发了可预测最优转录因子结合位点插入位置及启动子重写程度的神经网络工具,无需前期实验表征即可实现高达98.4%的抑制率 | 研究仅在本模式生物酿酒酵母中验证,且依赖已知转录因子结合位点数据,通用性及跨物种应用需进一步探索 | 开发可扩展的计算方法用于人工启动子工程,实现转录网络的精确重编程 | 酿酒酵母 (Saccharomyces cerevisiae) 的天然启动子及TetR、Mig1转录因子结合位点 | 合成生物学 | NA | 人工神经网络、启动子工程、转录因子结合位点重组 | ANN (人工神经网络) | DNA序列数据 | 分析6,011个天然酵母启动子,实验验证了部分设计启动子 | NA | 酿酒酵母 | 合成启动子-转录因子结合位点重组电路,包含TetR和Mig1响应元件 | 生物技术 |
| 28 | 2026-07-09 |
Decoding Cdk1 control: from mitotic thresholds to meiotic specificity
2026-03-12, Chromosome research : an international journal on the molecular, supramolecular and evolutionary aspects of chromosome biology
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s10577-026-09796-4
PMID:41817770
|
综述 | 综述了Cdk1在细胞周期控制中的定量与定性模型,以及通过Shokat系统和磷酸化蛋白质组学等工具解析有丝分裂阈值和减数分裂特异性的研究进展 | 结合化学生物学、合成生物学和磷酸化蛋白质组学方法,系统阐述了Cdk1活性调控的定量与定性机制,并拓展到减数分裂的特异性调控 | 主要基于酵母模型(芽殖酵母和裂殖酵母)的研究,对脊椎动物等更复杂体系的整合有限,且未涉及哺乳动物中的细节机制 | 阐明Cdk1活性调控的定量阈值与定性功能在细胞周期进程(有丝分裂和减数分裂)中的作用机制 | 酵母模型(芽殖酵母和裂殖酵母)以及脊椎动物相关研究 | 细胞生物学 | NA | Shokat系统(类似物敏感性等位基因)、质谱分析、合成生物学、磷酸化蛋白质组学 | NA | 蛋白质组学数据 | NA | NA | 芽殖酵母、裂殖酵母、脊椎动物细胞 | NA | 基础生物学 |
| 29 | 2026-07-07 |
Vanadium-dependent haloperoxidases: Recent advances and perspectives
2026 Mar-Apr, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108797
PMID:41506498
|
综述 | 本文综述了钒依赖卤过氧化物酶(VHPOs)在发现、结构功能关系、机制阐明及各种合成应用方面的最新进展 | 重点介绍了对VHPOs卤离子和底物特异性的最新突破,包括底物通道识别和酶结合卤化机制,这些发现挑战了传统的扩散性HOX模型并实现了理性酶工程 | NA | 总结VHPOs在有机合成中的快速进展,并展望其在合成生物学、材料科学和环境生物技术中的应用前景 | 钒依赖卤过氧化物酶(VHPOs) | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 酶工程 | NA | NA | 合成生物学, 材料科学, 环境生物技术 |
| 30 | 2026-07-02 |
Stable Coacervate Microdroplets as Robust Microreactors for Enhanced Enzymatic Catalysis
2026-Mar, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202514871
PMID:41615238
|
研究论文 | 开发了由聚乙烯亚胺和硫辛酸钠构成的高稳定凝聚层微滴,作为增强酶催化反应的微反应器 | 通过静电和疏水相互作用构建具有动态分子招募能力的高稳定凝聚层微滴,无需额外稳定剂即可保持结构完整性超过35天,并实现高达53倍的酶催化反应加速 | 未提及具体限制,但可能包括对特定酶或反应条件的依赖性及长期应用中的潜在问题 | 研究凝聚层微滴的稳定机制及其作为高效酶微反应器的应用 | 凝聚层微滴的稳定性、分子招募效率和酶催化反应增强效果 | 合成生物学 | 不适用 | 液-液相分离 | 不适用 | 实验数据 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 合成生物学, 生物催化 |
| 31 | 2026-06-29 |
Advances in metabolic engineering of Bacillus subtilis towards high-efficiency cytidine biosynthesis
2026-Mar-30, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-026-04924-y
PMID:41910824
|
综述 | 综述了通过代谢工程改造枯草芽孢杆菌高效合成胞苷的进展 | 提出了宿主特异性动态热力学平衡的新概念框架,强调从单一遗传编辑转向系统性整合枯草芽孢杆菌特有的调控逻辑 | 未详述具体实验验证,仅提出概念性框架 | 提高枯草芽孢杆菌合成胞苷的效率 | 枯草芽孢杆菌的代谢工程 | 合成生物学 | NA | 代谢工程,合成生物学,基因组编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 枯草芽孢杆菌 | 嘧啶生物合成途径,中心碳代谢途径 | 医药,食品 |
| 32 | 2026-06-29 |
From hidden allies to precision symbionts: unleashing endophytes for sustainable agroecosystems
2026-Mar-30, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-026-04896-z
PMID:41910822
|
综述 | 本文综述了十个交叉领域如何重塑对内生菌的研究与应用,旨在将其从隐蔽的盟友转变为精准的共生体,以构建可持续的农业生态系统 | 提出了一个前瞻性框架,强调标准菌株基准测试、因果多组学工作流、合成群落设计和多地点田间试验的重要性,将内生菌定位为可扩展且气候适应性的生物技术平台 | 主要挑战包括多数内生菌尚未被培养、共生与致病性之间的背景依赖性转变、有限的田间验证以及不断演变的生物安全框架 | 探讨利用内生菌促进可持续农业和生态修复的方法 | 内生菌(植物内生微生物) | 机器学习 | NA | 基因组学、宏基因组学、功能基因组学、系统生物学、合成生物学、CRISPR、多组学整合、生物信息学 | NA | 基因组、转录组、蛋白质组、代谢组数据 | NA | CRISPR | 植物 | 合成微生物群落 | 农业, 环境 |
| 33 | 2026-06-29 |
Overcoming prokaryotic toxicity: a SUMO-fused secretory platform in Komagataella phaffii for high-yield production of phage holin Hol41
2026-Mar-27, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-026-02983-2
PMID:41896934
|
研究论文 | 本文构建了一个基于SUMO融合技术和α-mating因子分泌途径的毕赤酵母表达平台,用于高效生产噬菌体穿孔素Hol41,克服其原核表达毒性及溶解性差的问题 | 首次在毕赤酵母中成功实现噬菌体穿孔素Hol41的高产功能性表达,利用真核细胞膜结构差异规避原核毒性,并结合SUMO标签与分泌途径提高蛋白溶解性并抑制聚集 | 仅测试了七种标准菌株,抗菌活性数据有限;产量可能仍需优化以实现更大规模应用 | 开发一种避免原核毒性、可规模化生产具有抗菌活性的噬菌体穿孔素Hol41的平台 | 噬菌体穿孔素Hol41蛋白及其在毕赤酵母中的表达与抗菌活性 | 合成生物学 | 细菌感染性疾病 | NA | NA | NA | 七种标准菌株(包括革兰氏阳性菌和阴性菌) | NA | 毕赤酵母 | SUMO融合表达与α-mating因子分泌途径 | 医药 |
| 34 | 2026-06-29 |
Enhancer-based gene therapy: a new path for precision medicine
2026-Mar-21, Hereditas
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s41065-026-00655-0
PMID:41862973
|
综述 | 总结了基于增强子的基因疗法在精准医学中的应用、挑战与前景 | 首次系统综述利用增强子而非传统启动子调控治疗性基因表达的策略,强调其在细胞类型或疾病状态特异性表达中的优势,并整合了功能基因组学、合成生物学和递送技术的最新进展 | 增强子功能受染色质动态和上下文依赖性调控,验证细胞类型特异性增强子面临技术困难;非靶向激活风险及长期疗效需要严格的监管监督 | 期望增强子驱动型基因疗法成为下一代精准医学的关键组成部分 | 增强子元件、基因表达调控、基因治疗载体(AAV等)、疾病模型(神经退行性疾病、癌症、心血管疾病等) | 数字病理学 | 阿尔茨海默病、帕金森病、癌症、心血管疾病 | 单细胞表观基因组技术(ATAC-seq、ChIP-seq、多组学整合)、非病毒递送方法、AAV衣壳工程 | NA | 表观基因组数据、单细胞数据 | NA | AAV载体工程 | 人类细胞 | 基于增强子的表达盒,包含星形胶质细胞或小胶质细胞特异性增强子等 | 医学 |
| 35 | 2026-06-29 |
Overexpression of msnA reprograms metabolism to enhance recombinant protein secretion across Aspergillus species
2026-Mar-02, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-026-02975-2
PMID:41772602
|
研究论文 | 利用多组学和合成生物学方法鉴定msnA为调节重组蛋白生产的关键基因,并证明其过表达能增强曲霉属物种中重组蛋白分泌 | 首次发现msnA作为跨曲霉属物种功能保守的关键调控因子,通过重编程细胞资源分配(上调囊泡运输和脂肪酸降解,下调次生代谢)来增强重组蛋白分泌,且能在转录表达较低时提高分泌效率 | 未详细探讨msnA过表达对总分泌蛋白减少的物种的具体机制,且仅检测了三种曲霉,可能在其他曲霉物种中效果不同 | 优化真菌细胞工厂以提高重组蛋白产量 | 构巢曲霉、黑曲霉、米曲霉及msnA基因 | 合成生物学 | NA | 多组学分析、合成生物学、转录组学 | NA | 组学数据 | 三种曲霉物种(构巢曲霉、黑曲霉、米曲霉) | 合成生物学 | 构巢曲霉、黑曲霉、米曲霉 | msnA基因过表达 | 工业生物技术 |
| 36 | 2026-06-19 |
Genetically engineered pig-to-human liver xenotransplantation
2026-Mar, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2025.08.044
PMID:41076089
|
研究论文 | 本文报道了全球首例基因编辑猪肝向活体人类进行辅助异种移植并存活171天的病例 | 首次在活体人类中进行10基因编辑猪肝辅助异种移植,实现171天存活,并详细记录了异种移植相关血栓性微血管病的免疫学和组织病理学分析 | 患者最终因反复上消化道出血死亡,且移植后38天因xTMA移除辅助肝,长期成功率尚待改进 | 探索基因编辑猪肝作为人类肝移植桥接策略的可行性 | 接受10基因编辑猪肝辅助异种移植的右叶大肝细胞癌患者 | 合成生物学与临床移植 | 肝细胞癌,肝衰竭 | 基因编辑(10个靶向基因编辑) | NA | 临床监测数据 | 1例患者 | CRISPR-Cas9(基于10基因编辑平台) | 猪 | 基因敲除(异种抗原基因)和基因敲入(7个人类免疫和凝血相容性基因) | 医学 |
| 37 | 2026-06-17 |
p-Benzoyl-l-phenylalanine as a Multifunctional Noncanonical Amino Acid in Synthetic Biology: Photoprobing, Photocatalysis, and Structural Programming for Biocontainment
2026-03-16, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202525502
PMID:41664298
|
综述 | 系统总结p-苯甲酰-L-苯丙氨酸作为多功能非经典氨基酸在合成生物学中用于光探测、光催化和生物防护结构编程的研究进展 | 首次全面阐述pBzF的三重态光化学特性及其在蛋白质工程中的多功能应用,包括光交联、光催化及构建人工光合系统 | 未提及实际应用中可能存在的细胞毒性、光损伤或体内转化效率限制 | 综述pBzF在合成生物学中作为光化学和结构基序的多样化应用,为构建非天然光响应催化功能蛋白提供框架 | p-苯甲酰-L-苯丙氨酸及其在蛋白质工程中的应用案例 | 合成生物学 | NA | 非经典氨基酸定向进化、遗传密码扩展 | NA | NA | NA | 非经典氨基酸定向进化 | NA | 光响应蛋白、光催化系统、人工光合系统 | 医学, 工业生物技术 |
| 38 | 2026-06-15 |
Biofilm engineering through c-di-GMP tuning boosts bioleaching efficiency and arsenic tolerance in Acidithiobacillus ferrooxidans
2026-Mar-18, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.02288-25
PMID:41705824
|
研究论文 | 通过调节c-di-GMP信号增强氧化亚铁硫杆菌的生物膜形成、生物浸出效率和砷耐受性 | 通过调控全局调控分子c-di-GMP同时增强生物浸出效率和重金属耐受性,克服了传统单性状改造的局限性 | NA | 探索通过工程化c-di-GMP信号通路来优化生物浸出微生物的多个关键性状 | 氧化亚铁硫杆菌(Acidithiobacillus ferrooxidans) | 合成生物学 | NA | c-di-GMP调控技术 | NA | 转录组数据 | 三种工程菌株S-222、S-306和S-651 | NA | 氧化亚铁硫杆菌(Acidithiobacillus ferrooxidans) | 通过过表达鸟苷酸环化酶基因调控c-di-GMP信号通路 | 工业生物技术, 环境 |
| 39 | 2026-06-15 |
Adenosine Triphosphate-Producing Artificial Cells: Biomimetic Construction Strategies and Applications
2026-Mar-13, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202500934
PMID:41773731
|
综述 | 该论文系统综述了通过仿生构建策略生产三磷酸腺苷的人工细胞的三种方法及其在生物医学和能源领域的应用 | 创新性地系统整合了三种构建能量自给人工细胞的策略,包括基于质子泵和ATP酶的组装、直接封装细胞器以及非经典系统,并探讨了其催化效率和生物分子封装能力 | 未明确提及当前构建策略在稳定性、可扩展性和成本效益方面的具体挑战 | 探索人工细胞中三磷酸腺苷合成的三种构建策略的最新进展,并推动从基础研究向实际应用的转化 | 人工细胞中的三磷酸腺苷合成系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | ATP合成途径模拟 | 医学, 环境, 材料 |
| 40 | 2026-06-15 |
BOTany methods: accessible automation for plant synthetic biology
2026-Mar-02, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiag066
PMID:41715940
|
研究论文 | 开发了一套基于Opentrons OT-2机器人的模块化BOTany方法,用于实现植物合成生物学常见实验操作的自动化 | 通过表格化输入无需编程经验即可操作,降低了自动化门槛,并提供了从简单到复杂操作的端到端分子克隆流程 | 依赖于Opentrons OT-2机器人平台,且验证方案可能仍需针对特定实验条件进行微调 | 提高植物合成生物学实验中自动化技术的可及性和易用性 | 植物分子生物学和合成生物学相关的实验流程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |