合成生物学相关文章
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当前共找到 87 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-07-10 |
The human microbiome as a source of novel bioactive natural products: structures, bioactivities, and biosynthetic insights
2026-Jul, Journal of natural medicines
IF:2.5Q3
DOI:10.1007/s11418-026-02044-3
PMID:42251226
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综述 | 综述人类微生物组作为新型生物活性天然产物来源的结构、生物活性及生物合成见解 | 从共进化视角系统总结人类微生物组中生物活性天然产物的结构多样性、生物合成途径及治疗潜力，并整合宏基因组学、单细胞基因组学、合成生物学等多组学策略以加速发现 | 未提及具体局限性，可能包括微生物组中大量不可培养微生物的限制及临床转化的挑战 | 概述人类微生物组中发现的关键代谢物的结构特征、生物合成途径和生物活性，以及发现策略和治疗应用前景 | 人类微生物组中的微生物及其产生的生物活性天然产物 | 机器学习和深度学习 | 免疫相关疾病、感染性疾病、神经系统疾病 | 宏基因组学、单细胞基因组学、合成生物学、组学整合分析、基因组挖掘 | NA | 基因组数据、代谢组数据 | NA | 合成生物学 | 人类微生物组（肠道、口腔、皮肤、阴道） | NA | 医学、药物开发 |
| 22 | 2026-07-10 |
Salt as a Master Regulator of Microbial Assembly and Metabolic Pathways in Fermented Fish: From Preservation to Flavor Innovation
2026-Jul, Comprehensive reviews in food science and food safety
IF:12.0Q1
DOI:10.1111/1541-4337.70561
PMID:42415276
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综述 | 本文综述了盐度作为发酵鱼中微生物组装和代谢途径的主调控因子的作用，探讨了从传统防腐到风味创新的转变 | 提出从经验加工转向精准代谢调控的范式转变，通过整合多组学与合成生物学重建微生物网络，以解决减盐带来的安全与风味挑战 | 未提供具体实验数据或案例验证，仅基于现有文献提出概念框架 | 分析盐度调控发酵鱼中微生物群落组装和代谢轨迹的机制，并探索减盐条件下的安全与风味创新策略 | 发酵鱼中的微生物群落（如嗜盐菌、乳酸菌、酵母）及其代谢产物 | 食品生物技术 | NA | 多组学、合成生物学 | NA | 文献综述数据 | NA | NA | NA | 微生物代谢网络重建 | 食品工业 |
| 23 | 2026-07-10 |
Next-Generation Cyanobacterial Biocontrol Agents for Crop Fungal Diseases: Molecular Mechanisms, Omics Insights, Applications, and Biosafety Considerations
2026-Jul, Journal of basic microbiology
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/jobm.70181
PMID:42423136
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综述 | 综述蓝细菌作为作物真菌病害生物防治剂的研究进展、分子机制及生物安全性考虑 | 系统整合蓝细菌抗真菌代谢物的分子机制、组学见解及合成生物学应用前景，为开发可持续作物保护方案提供新视角 | 田间应用受环境多变性和制剂限制，综述未提供具体实验验证数据 | 总结蓝细菌在真菌病害管理中应用的最新进展，讨论生物安全性问题，展望未来研究方向 | 蓝细菌及其抗真菌代谢物（如VOC、EPS、裂解酶） | NA | 作物真菌病害 | 多组学方法（基因组挖掘）、合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 蓝细菌 | 生物控制剂（抗真菌代谢物通路） | 农业 |
| 24 | 2026-07-09 |
Engineered Biocatalytic Strategies for Pesticide Degradation in Food Systems: From Catalytic Performance to Practical Applications
2026-Jul-08, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.6c01905
PMID:42133536
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综述 | 综述了食品中农药残留酶降解策略的最新进展，重点讨论工程化手段提升催化性能与应用转化 | 系统整合天然酶、纳米酶、多酶/杂化级联体系，并引入人工智能辅助设计与合成生物学新兴方法 | 实际食品基质中酶稳定性、可重复使用性及规模化应用存在障碍，监管不确定性尚未解决 | 探讨酶催化降解农药的工程化策略及其在食品体系中的实际应用潜力 | 农药残留物及相关酶类（天然酶、纳米酶、级联系统） | 机器学习 | NA | 生物催化、纳米技术、人工智能设计、合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 人工智能辅助设计, 合成生物学工具 | NA | 多酶或杂化级联系统 | 食品, 农业 |
| 25 | 2026-07-09 |
Genome-Scale Metabolic Modeling of Terpenoid Biosynthesis: Advances and Perspectives
2026-Jul-08, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.6c03926
PMID:42362489
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综述 | 系统回顾基因组规模代谢模型在萜类化合物生物合成中的进展 | 综述了GSMM在典型萜类生产微生物（包括模式和非模式微生物）中的应用，并讨论了多约束模型及机器学习与合成生物学整合等未来方向 | 主要关注四种微生物，可能未覆盖所有萜类生产宿主 | 为萜类细胞工厂的智能设计和高效构建提供理论参考 | 四种典型萜类生产微生物：大肠杆菌、酿酒酵母、蓝细菌和另一种非模式微生物 | 机器学习, 系统生物学 | NA | NA | 基因组规模代谢模型 | NA | NA | NA | 大肠杆菌, 酿酒酵母, 蓝细菌 | 萜类生物合成途径 | 医学, 农业, 能源, 食品 |
| 26 | 2026-07-09 |
Complete remediation of a mixture of 5 acetophenone derivatives by multi-modular engineered Escherichia coli: Avoiding intermediate toxicity from incomplete degradation
2026-Jul-07, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2026.120464
PMID:42413334
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研究论文 | 通过构建多模块工程大肠杆菌，实现5种苯乙酮衍生物混合物的完全降解，避免不完全降解产生的中间体毒性 | 首次利用合成生物学方法将14个结构优化基因整合为4个分解代谢模块，构建了可完全降解5种苯乙酮衍生物及其混合物的工程菌株，并验证了其有效解毒能力和广泛底物范围 | 未详细评估工程菌株在复杂自然环境中的长期稳定性和生态影响，以及降解产物对土壤微生物群落的影响 | 解决微生物不完全降解苯乙酮衍生物产生有毒中间体积累的环境污染问题 | 5种苯乙酮衍生物（苯乙酮、对羟基苯乙酮、对羟基苯丙酮、对羟基苯甲醛和邻羟基苯乙酮）及其混合物 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、同位素标记追踪、斑马鱼毒性测试 | NA | 降解动力学数据、同位素标记数据、毒性测试数据 | 5种苯乙酮衍生物，每种1 mM浓度，混合降解实验 | 合成生物学 | 大肠杆菌 | 多模块分解代谢通路（4个模块，整合14个结构优化基因） | 环境修复 |
| 27 | 2026-07-09 |
From tumor targeting to tumor accessibility: surface-engineered bacteria as precision living therapeutics for translational medicine
2026-Jul-07, Journal of hematology & oncology
IF:29.5Q1
DOI:10.1186/s13045-026-01827-1
PMID:42415153
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综述 | 该文章以临床转化视角审视细菌疗法，提出“精准活体治疗”新范式，并系统综述细菌表面工程策略以提高肿瘤可及性 | 首次提出“肿瘤可及性”概念，强调其在当前治疗应用中的关键瓶颈，并从临床转化角度借鉴抗体药物偶联物成功经验，提出从局部修饰设计转向系统性可及性整体考虑的新范式 | 未详细讨论细菌表面工程策略在人体临床试验中的实际效果及潜在安全性问题 | 探讨细菌疗法从实验室到临床转化的关键障碍，特别是肿瘤可及性不足的问题，并综述表面工程策略以推动精准活体治疗发展 | 细菌表面工程策略及其在肿瘤、炎症性疾病和代谢疾病中的应用 | 数字病理学 | 癌症 | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 细菌 | 细菌表面工程（包括共价偶联、细胞膜封装、生物素-链霉亲和素系统等） | 医学 |
| 28 | 2026-07-09 |
Double-edged sword: Aspergillus flavus as a threat to food safety and a resource for biotechnology
2026 Jul-Aug, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108848
PMID:41730464
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综述 | 综述了黄曲霉在食品安全威胁与生物技术资源方面的双重角色，重点探讨其次级代谢多样性及调控机制 | 将黄曲霉重新定义为双用途生物体，既关注生物安全风险又突显其可开发的化学多样性，并系统概述了CRISPR等新兴生物技术策略在激活隐秘代谢产物方面的应用 | 未提及具体实验验证或定量比较不同调控机制的效果，可能缺乏对实际应用挑战的深入分析 | 总结黄曲霉次级代谢组的知识，探索其生物技术潜力以促进制药和农业创新 | 黄曲霉的次级代谢产物，包括黄曲霉毒素、环匹阿尼酸、曲酸、黄曲霉震颤素及隐秘代谢产物 | 机器学习 | NA | 基因组挖掘、CRISPR、异源表达、合成生物学 | NA | 基因组数据、代谢组数据 | NA | CRISPR-Cas9, 合成生物学平台 | 黄曲霉 | 生物合成基因簇激活、异源表达途径 | 农业, 制药, 食品, 工业生物技术 |
| 29 | 2026-07-09 |
One Yeast, Sixteen Synthetic Chromosomes, Infinite Possibilities
2026-Jul, Yeast (Chichester, England)
DOI:10.1002/yea.70026
PMID:42152749
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评论文章 | 本文回顾了合成酵母基因组计划（Sc2.0）的进展，该计划已构建所有16条酵母染色体的合成版本，并探讨了未来新染色体的潜力 | 通过设计-构建-测试-学习循环重新定义了对真核生物基因组的理解，并将酵母基因组视为动态可修改系统，而非静态蓝图；同时提出了正交于天然基因组的模块化合成染色体（新染色体）的概念 | 作为一篇短评，未深入讨论技术挑战或潜在局限性 | 庆祝《酵母》期刊40周年，概述酵母遗传学在Sc2.0项目及后续工作中的关键概念和技术进步 | 酿酒酵母及其合成染色体 | 合成生物学 | NA | 合成基因组组装, 设计-构建-测试-学习循环 | NA | 基因组序列 | 所有16条酵母染色体的合成版本 | NA | 酿酒酵母 | 新染色体 | NA |
| 30 | 2026-07-09 |
EL222-Based Optogenetic Gene Regulation in Methylotrophic Yeasts: Mechanisms, Applications, and Future Directions
2026-Jul, Yeast (Chichester, England)
DOI:10.1002/yea.70025
PMID:42126106
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综述 | 综述了基于EL222的光遗传学基因调控在甲基营养酵母中的机制、应用和未来方向 | 聚焦EL222系统在毕赤酵母中的光控异源蛋白生产，及其在酿酒酵母合成生物学和代谢工程中的广泛应用，展示了光遗传学作为无化学诱导剂替代方案的潜力 | 文中未明确指出具体局限性，但可能包括光穿透深度、光敏蛋白稳定性或大规模发酵中的光传递效率等实际问题 | 总结酵母光遗传学领域的关键进展，特别是EL222系统在甲基营养酵母中实现光控基因调控，推动更安全、可控和节能的基因调控策略 | 甲基营养酵母如毕赤酵母，以及酿酒酵母 | 合成生物学 | 不适用 | 光遗传学 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 毕赤酵母, 酿酒酵母 | 基于EL222的光控基因调控回路 | 工业生物技术, 合成生物学, 代谢工程 |
| 31 | 2026-07-09 |
seq2ribo: structure-aware integration of machine learning and simulation to predict ribosome location profiles from RNA sequences
2026-Jul-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag296
PMID:42412804
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研究论文 | 提出seq2ribo框架，结合结构感知TASEP模拟与机器学习，仅从RNA序列预测核糖体A位点位置谱，实现高保真度预测 | 首次实现仅从序列信息预测核糖体位置与实验谱的有意义位置相关性，在转录本水平Pearson相关系数达0.920，并整合RNA结构特征（局部角度、碱基配对等）改进模拟 | 可能受限于sTASEP模型中拟合参数的假设，且对复杂细胞类型或极端序列的泛化能力未充分验证 | 开发仅依赖mRNA序列预测核糖体分布的方法，以支持合成生物学中mRNA序列的理性设计与优化 | 核糖体A位点位置谱，mRNA序列，翻译效率与蛋白质表达水平 | 机器学习 | NA | RNA-seq, Ribo-seq | TASEP, 机器学习的抛光模型（polisher model） | 序列 | 涉及iPSC、HEK293、LCL和RPE-1等四种不同细胞类型的数据 | NA | 人源细胞系（iPSC, HEK293, LCL, RPE-1） | NA | 医学（mRNA疫苗设计）、合成生物学 |
| 32 | 2026-07-08 |
Bioactive Peptides for Oral Diseases: Biomaterial-Assisted Therapeutics and Translational Applications
2026-Jul-07, ACS applied bio materials
IF:4.6Q2
DOI:10.1021/acsabm.6c00571
PMID:42411007
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综述 | 总结生物活性肽在口腔疾病中结合生物材料辅助治疗的研究进展及转化应用 | 系统整合了生物材料平台（如纳米颗粒、水凝胶、涂层与黏膜黏附系统）提升生物活性肽在口腔环境中稳定性和靶向递送的方法，并讨论了人工智能引导设计和合成生物学驱动的创新解决方案 | 临床转化受限于酶解不稳定性、短滞留时间、复杂口腔微环境中的渗透力不足，以及规模化制造和安全性评估的挑战 | 评估生物活性肽在口腔疾病治疗中的潜力，并探讨通过生物材料辅助策略克服其应用瓶颈的路径 | 生物活性肽及其与生物材料系统（纳米颗粒、水凝胶、涂层与黏膜黏附系统）的结合 | 数字病理学 | 口腔疾病（包括龋齿、牙周炎、口腔黏膜炎症、种植体周围感染和口腔组织缺损） | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 33 | 2026-07-08 |
Clocked stepping of an artificial protein walker along a DNA track
2026-Jul-06, Nature nanotechnology
IF:38.1Q1
DOI:10.1038/s41565-026-02211-3
PMID:42410215
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研究论文 | 本文报道了一种名为Tumbleweed的人工蛋白马达的构建，该马达能够在DNA轨道上实现可控的定向步进 | 首次实现人工蛋白马达的设计与构建，通过模块化组合配体门控DNA结合域，赋予马达方向性和外部可控性 | 马达运动依赖外部配体序列控制，可能限制其自主性和在复杂环境中的应用 | 构建外部可控的人工蛋白马达，实现沿DNA轨道的定向步进运动 | Tumbleweed人工蛋白马达 | 合成生物学 | NA | 单分子荧光检测，微流控装置 | NA | 单分子荧光数据 | NA | 模块化蛋白设计 | NA | 配体门控DNA结合域构成的步进马达 | 纳米技术，合成生物学 |
| 34 | 2026-07-08 |
Exploring Neurological Disorder Therapeutics: The Progress and Future Prospects of Proteins and Peptides Derived from Blue Foods
2026-Jul-06, Current protein & peptide science
IF:1.9Q4
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综述 | 探讨蓝色食物来源的蛋白质和肽在神经疾病治疗中的进展与未来前景 | 综述了蓝色食物生物活性分子在神经保护中的多机制作用，并展望了纳米制剂、合成生物学和人工智能在肽发现中的新方法 | 临床转化面临提取标准化、生物利用度、批次差异、过敏原性和复杂监管要求等挑战 | 总结蓝色食物来源蛋白质和肽在神经疾病治疗中的研究进展，并评估其临床应用潜力 | 海洋鱼类、藻类和无脊椎动物等蓝色食物中的生物活性蛋白质和肽 | 数字病理学 | 神经系统疾病 | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 35 | 2026-07-08 |
A self-replicating artificial module-genome that generates bacterial chromosome replication system in vitro
2026-Jul-03, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag663
PMID:42406626
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研究论文 | 展示了一个能自我复制的53 kb人工模块基因组，该基因组编码所有26种大肠杆菌染色体复制系统蛋白，在体外实现自我复制 | 首次实现由遗传信息生成自我编码复制机制的染色体复制系统，构建了名为PRIMES的体外自我复制系统，支持超过28代递归自我复制 | NA | 构建能自主自我复制的人工细胞，实现自下而上的合成生物学目标 | 大肠杆菌染色体复制系统和人工模块基因组 | 合成生物学 | NA | Replication-Cycle Reaction (RCR) 系统、蛋白质合成系统 (PURE) | NA | NA | NA | NA | NA | 模块基因组 (RCR module-genome) | 合成生物学、人工细胞构建 |
| 36 | 2026-07-08 |
Machine learning-guided discovery of poly(ethylene terephthalate)-binding modules to enhance durable whole-cell degradation
2026-Jul-01, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.135279
PMID:42385911
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研究论文 | 利用机器学习引导发现聚对苯二甲酸乙二醇酯结合模块，以增强耐用全细胞降解 | 提出机器学习辅助管道，结合隐马尔可夫模型同源性搜索和监督式PET水解酶机器学习模型（PETML），从天然蛋白质架构中发现了新型PET结合模块，并展示了其在全细胞催化降解PET中的优越性能 | 未明确说明局限性，但研究主要基于计算预测和体外实验，可能缺乏体内实际环境验证 | 开发可增强PET酶降解效率的结合模块，实现耐用全细胞催化系统 | PET结合模块候选物，特别是tCBM13-1，以及大肠杆菌表面展示系统 | 机器学习，合成生物学 | NA | 机器学习，分子对接，分子动力学模拟，表面展示 | 隐马尔可夫模型，PETML | 蛋白质序列数据，分子对接数据，实验测量数据 | 197个非冗余候选模块，重点研究tCBM13-1 | CRISPR-Cas9（可能用于展示系统建设） | Escherichia coli | 双锚定系统（OmpA和EhaA）用于表面共展示FAST-PETase和tCBM13-1 | 环境，工业生物技术 |
| 37 | 2026-07-07 |
Improving cell-free metabolism through direct integration of artificial respiratory chains
2026-Jul-07, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2613483123
PMID:42391401
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研究论文 | 开发人工呼吸链直接整合到无细胞代谢网络中，以改善能量保存和系统功能 | 设计了定制的人工呼吸链，结合CO固定酶循环实现快速电子传递并利用电子流合成ATP，同时展示了人工呼吸链的多样性和与其他生物功能的耦合 | 构建自维持/自供能人工生命系统的挑战依然存在，可能涉及能量耦合的复杂性和稳定性问题 | 通过直接整合能量保存机制，构建具有生命样特性的复杂无细胞代谢系统 | 无细胞代谢网络和人工呼吸链 | 合成生物学 | NA | 人工呼吸链构建、酶催化循环、无细胞转录翻译网络 | NA | NA | NA | NA | 无细胞系统 | 人工呼吸链、CO固定酶循环（crotonyl-CoA/ethylmalonyl-CoA/hydroxybutyryl-CoA）、ATP合成耦合系统 | 合成生物学、生物技术 |
| 38 | 2026-07-07 |
Stable, micron-scale lipocondensates achieving prolonged circulation without PEGlyated lipids
2026-Jul-06, Biomaterials science
IF:5.8Q1
DOI:10.1039/d6bm00335d
PMID:42405635
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研究论文 | 该论文报道了稳定的微米级脂质凝聚体，无需聚乙二醇化脂质即可实现长效循环 | 首次发现仅由天然脂质组成的凝聚体可形成细胞尺寸的稳定结构，其循环半衰期远超现有脂质涂层凝聚体系统，且与纳米级聚乙二醇化系统相当 | 未提及长期稳定性及体内递送效率的具体验证 | 探索脂质凝聚体的分子组成对脂质组织和界面行为的影响，开发新型递送平台 | 脂质凝聚体（LipCons）的结构与功能特性 | 合成生物学 | NA | SAXS, FRAP | NA | 图像 | NA | NA | NA | 脂质凝聚体（LipCon）结构 | 医学, 合成生物学 |
| 39 | 2026-07-07 |
Applications of Recombinant DNA Technology in Medicine: A Comprehensive Review
2026-Jul-05, Molecular biotechnology
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12033-026-01595-w
PMID:42402538
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综述 | 综述重组DNA技术在医学领域的应用，涵盖治疗、诊断和预防 | 系统总结rDNA技术在生物制药、重组疫苗、基因治疗、分子诊断及个性化医学中的最新进展，并探讨伦理与未来技术方向 | NA | 总结重组DNA技术在医学中的应用及未来潜力 | 重组DNA技术及其在医学中的应用 | 机器学习 | NA | 重组DNA技术，基因克隆，载体设计，CRISPR，PCR，qPCR | NA | NA | NA | CRISPR | NA | NA | 医学 |
| 40 | 2026-07-07 |
Recombinant Protein Drugs: A 2025 Update
2026-Jul, BioDrugs : clinical immunotherapeutics, biopharmaceuticals and gene therapy
IF:5.4Q1
DOI:10.1007/s40259-026-00783-z
PMID:42129013
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综述 | 综述2025年重组蛋白药物的进展，涵盖生产平台、蛋白质工程和监管科学 | 综合了合成生物学、宿主工程和工艺优化的创新，以及模块化蛋白质工程带来的下一代格式如双特异性抗体和纳米抗体 | 未提及具体局限性 | 提供重组蛋白药物领域的最新更新，概述技术如何塑造下一代生物制剂 | 重组蛋白药物及其生产平台、工程技术和监管框架 | NA | 肿瘤、炎症、代谢性疾病等 | NA | NA | NA | NA | NA | 微生物菌株、哺乳动物细胞、植物平台 | 模块化蛋白质工程，如双特异性抗体、纳米抗体、融合蛋白、自组装生物材料 | 医学 |