合成生物学相关文章
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当前共找到 5346 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2026-07-10 |
Scarless one-tube genome assembly via computationally optimized uracil-DNA glycosylase reactions
2026-Jul-08, RSC chemical biology
IF:4.2Q2
DOI:10.1039/d5cb00317b
PMID:42238783
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研究论文 | 本研究提出了一种利用尿嘧啶-DNA糖基化酶的单管无疤痕基因组组装平台，用于高效构建工程噬菌体 | 无需长同源臂、限制性酶切位点、Cas系统或同源重组，通过尿嘧啶-DNA糖基化酶实现模块化基因组组装，并减少二级结构形成风险 | NA | 开发一种快速、灵活的噬菌体基因组组装和编辑方法 | T7噬菌体基因组 | 合成生物学 | NA | 尿嘧啶-DNA糖基化酶反应 | NA | NA | NA | 尿嘧啶-DNA糖基化酶 | T7噬菌体 | NanoLuc荧光素酶报告基因整合入T7基因组 | 医学、环境监测、工业生物技术 |
| 42 | 2026-07-10 |
Tangled Tail of Mechanically Interlocked Peptides
2026-07-08, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.6c05395
PMID:42334221
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综述 | 本文系统回顾了天然存在的机械互锁肽和化学合成肽基互锁分子，旨在建立统一命名法并促进跨学科研究 | 首次统一天然与人工合成机械互锁肽的命名体系，通过比较两者的化学特性架起分子生物学与超分子化学的桥梁 | 未详细讨论机械互锁肽在合成生物学中的具体工程化应用案例 | 建立机械互锁肽的统一分类命名体系，促进跨学科研究合作 | 天然存在的机械互锁肽和化学合成的肽基机械互锁分子 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 机械互锁肽（包括串联环、链甲结构等拓扑结构） | 合成生物学基础研究 |
| 43 | 2026-07-10 |
The structural chemistry and biosynthesis of chlorophylls
2026-Jul-08, RSC chemical biology
IF:4.2Q2
DOI:10.1039/d6cb00082g
PMID:42370298
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研究论文 | 综述叶绿素的结构化学与生物合成途径，涵盖从原卟啉IX到叶绿素a的七步反应及多种叶绿素和细菌叶绿素的合成机制，并利用AlphaFold 3建模预测酶结构 | 利用AlphaFold 3建模完整叶绿素生物合成酶体系，揭示亚基关联、辅因子排列及催化机制，提出底物结合与产物转移新模型，为合成生物学构建杂合途径扩展光谱范围提供见解 | 未提及具体实验验证或实际应用案例 | 阐明叶绿素和细菌叶绿素的生物合成途径及结构化学特征，探索利用合成生物学扩展太阳光谱利用范围的潜力 | 叶绿素a、b、c、d、f以及细菌叶绿素a、b、e等 | 结构生物学 | NA | AlphaFold 3 | AlphaFold 3 | NA | NA | 合成生物学方法 | NA | 杂合叶绿素和细菌叶绿素合成途径 | 能源、农业 |
| 44 | 2026-07-10 |
pH-Tolerant Tripeptide Coacervates as Biomimetic Catalytic Microreactors
2026-Jul-08, Chemistry (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/chem.71406
PMID:42417505
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研究论文 | 构建基于三肽的凝聚液滴作为仿生催化微反应器，具备广泛的pH和盐浓度耐受性 | 通过将芳香族残基和低聚乙二醇基团整合到最小肽序列中，设计出环境耐受性强的三肽凝聚液滴，实现高效催化和多功能应用 | 未提及具体局限性 | 开发环境稳定且功能多样的仿生催化微反应器，用于增强化学反应效率 | 三肽凝聚液滴及其在催化反应中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 凝聚液滴微反应器 | 合成生物学，前生物化学 |
| 45 | 2026-07-10 |
Protein Turnover in Plants - Cost of Synthesis, Repair and Crop Engineering Opportunities
2026-Jul-08, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiag481
PMID:42418770
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综述 | 本文探讨植物蛋白质周转的代价，包括合成、修复及作物工程机会 | 强调化学损伤作为蛋白质周转的重要原因，并系统分析其呼吸成本对作物产量的影响，提出利用修复机制改善作物性能的新策略 | 未详细讨论不同植物物种中蛋白质修复机制的差异，以及实际田间应用面临的挑战 | 理解蛋白质损伤的原因、能量后果及修复机制，为提高作物产量提供工程策略 | 植物中的蛋白质周转过程，包括损伤、修复和合成 | 植物生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | 植物 | 蛋白质修复机制及代谢途径优化 | 农业 |
| 46 | 2026-07-10 |
Engineering commensal microbes for host health
2026-Jul-08, Cell host & microbe
IF:20.6Q1
DOI:10.1016/j.chom.2026.05.025
PMID:42419270
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综述 | 总结工程化活体生物治疗产品（eLBPs）在多种疾病中的应用进展 | 提出了下一代eLBPs理性设计的框架，综合了底盘选择、DNA递送、治疗表达调控和生物遏制系统的进展 | 在实现可预测定植、持久治疗活性和体内稳健生物遏制方面仍存在挑战 | 综述工程共生微生物在宿主健康中的应用，并推动eLBPs从实验系统向临床应用的转化 | 工程化活体生物治疗产品（eLBPs）及其在炎症性疾病、代谢疾病、癌症和感染性疾病中的应用 | 合成生物学 | 炎症性疾病、代谢疾病、癌症、感染性疾病 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 共生微生物 | 感知和响应宿主生理信号的微生物疗法 | 医学 |
| 47 | 2026-07-10 |
A portable Cas6f-based system for multiplex translational repression in bacteria
2026-Jul-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-75135-0
PMID:42420316
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研究论文 | 提出了一种基于Cas6f的紧凑型系统MORTISE，用于革兰氏阴性菌中可编程、可调谐的多重翻译抑制 | 该系统不依赖宿主Hfq或RNase因子，能在不同细菌物种中稳健运行，同时实现单启动子多重敲低和一步法组装多达九个引导序列 | NA | 开发一种紧凑、正交且可移植的多重翻译抑制系统，以解决合成生物学中精准调控的挑战 | 革兰氏阴性菌中的翻译抑制 | 合成生物学 | NA | Cas6f系统 | NA | NA | NA | Cas6f | 大肠杆菌, 恶臭假单胞菌 | 多重翻译抑制系统MORTISE | 工业生物技术, 代谢工程 |
| 48 | 2026-07-10 |
A Minimal Four-Enzyme Suite Enables Biosynthesis of the C20 Diterpenoid Alkaloid Atisinium
2026-Jul-08, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2026.07.004
PMID:42421322
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研究论文 | 本研究揭示了一种由四个酶组成的紧凑模块，能够将ent-atiserene转化为C20二萜生物碱atisinium，阐明了二萜生物碱核心骨架组装的最小分子基础 | 首次定义了由三个细胞色素P450单加氧酶和一个新功能化短链脱氢酶/还原酶组成的最小四酶模块，实现了二萜生物碱核心骨架的完整合成途径解析，并在烟草和酵母中异源重建 | NA | 阐明二萜生物碱核心骨架组装的分子机制，并为合成生物学途径重建提供基础 | 毛茛科植物露蕊乌头中的二萜生物碱生物合成途径相关酶 | 合成生物学 | NA | 病毒诱导基因沉默, 异源表达, 酶活性分析 | NA | NA | NA | NA | 烟草, 酵母 | 二萜生物碱生物合成途径 | 医药 |
| 49 | 2026-07-10 |
The human microbiome as a source of novel bioactive natural products: structures, bioactivities, and biosynthetic insights
2026-Jul, Journal of natural medicines
IF:2.5Q3
DOI:10.1007/s11418-026-02044-3
PMID:42251226
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综述 | 综述人类微生物组作为新型生物活性天然产物来源的结构、生物活性及生物合成见解 | 从共进化视角系统总结人类微生物组中生物活性天然产物的结构多样性、生物合成途径及治疗潜力，并整合宏基因组学、单细胞基因组学、合成生物学等多组学策略以加速发现 | 未提及具体局限性，可能包括微生物组中大量不可培养微生物的限制及临床转化的挑战 | 概述人类微生物组中发现的关键代谢物的结构特征、生物合成途径和生物活性，以及发现策略和治疗应用前景 | 人类微生物组中的微生物及其产生的生物活性天然产物 | 机器学习和深度学习 | 免疫相关疾病、感染性疾病、神经系统疾病 | 宏基因组学、单细胞基因组学、合成生物学、组学整合分析、基因组挖掘 | NA | 基因组数据、代谢组数据 | NA | 合成生物学 | 人类微生物组（肠道、口腔、皮肤、阴道） | NA | 医学、药物开发 |
| 50 | 2026-07-10 |
Salt as a Master Regulator of Microbial Assembly and Metabolic Pathways in Fermented Fish: From Preservation to Flavor Innovation
2026-Jul, Comprehensive reviews in food science and food safety
IF:12.0Q1
DOI:10.1111/1541-4337.70561
PMID:42415276
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综述 | 本文综述了盐度作为发酵鱼中微生物组装和代谢途径的主调控因子的作用，探讨了从传统防腐到风味创新的转变 | 提出从经验加工转向精准代谢调控的范式转变，通过整合多组学与合成生物学重建微生物网络，以解决减盐带来的安全与风味挑战 | 未提供具体实验数据或案例验证，仅基于现有文献提出概念框架 | 分析盐度调控发酵鱼中微生物群落组装和代谢轨迹的机制，并探索减盐条件下的安全与风味创新策略 | 发酵鱼中的微生物群落（如嗜盐菌、乳酸菌、酵母）及其代谢产物 | 食品生物技术 | NA | 多组学、合成生物学 | NA | 文献综述数据 | NA | NA | NA | 微生物代谢网络重建 | 食品工业 |
| 51 | 2026-07-10 |
Next-Generation Cyanobacterial Biocontrol Agents for Crop Fungal Diseases: Molecular Mechanisms, Omics Insights, Applications, and Biosafety Considerations
2026-Jul, Journal of basic microbiology
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/jobm.70181
PMID:42423136
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综述 | 综述蓝细菌作为作物真菌病害生物防治剂的研究进展、分子机制及生物安全性考虑 | 系统整合蓝细菌抗真菌代谢物的分子机制、组学见解及合成生物学应用前景，为开发可持续作物保护方案提供新视角 | 田间应用受环境多变性和制剂限制，综述未提供具体实验验证数据 | 总结蓝细菌在真菌病害管理中应用的最新进展，讨论生物安全性问题，展望未来研究方向 | 蓝细菌及其抗真菌代谢物（如VOC、EPS、裂解酶） | NA | 作物真菌病害 | 多组学方法（基因组挖掘）、合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 蓝细菌 | 生物控制剂（抗真菌代谢物通路） | 农业 |
| 52 | 2026-07-10 |
To Biotic or Abiotic: Biohybrid Systems for Artificial Photosynthesis
2026-Jun-29, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.5c00963
PMID:42371621
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综述 | 综述生物-非生物界面杂合系统在人工光合作用中的进展 | 探讨合成生物学、计算与可视化技术以及高分辨率表征方法在提升电子传递过程和设计架构方面的综合应用，为超越自然系统提供新途径 | NA | 推动人工光合作用及生物-非生物杂合系统的实际应用发展 | 自然光合蛋白质、无机光催化剂和高级生物杂合材料 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 可再生能源、人工光合作用 |
| 53 | 2026-07-10 |
Metabolic Engineering of Microbial Cell Factories for Sustainable Production of Glycolic Acid: Pathways, Chassis, and Strategies toward Poly(glycolic acid) Bioplastics
2026-Jun-24, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00078
PMID:42340804
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综述 | 系统总结利用微生物细胞工厂可持续生产乙醇酸的最新进展，包括关键生物合成途径、底盘生物和策略，并探讨其在聚乙醇酸生物塑料中的应用 | 全面比较了多种生物合成途径（乙醛酸支路、C5-糖裂解途径和新路线）及底盘生物，并强调了代谢工程与合成生物学方法（如酶优化、动态调控）以及工业化关键方面（如下游处理、技术经济分析和生命周期评估） | 文中未明确提及具体局限，但综述性质可能缺乏实验验证和定量比较 | 总结微生物合成乙醇酸的可持续生产路径和策略，推动聚乙醇酸生物塑料的工业化发展 | 微生物细胞工厂及其代谢途径和底盘生物 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、系统代谢工程、AI辅助设计 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 代谢工程工具 | 多种微生物底盘（如大肠杆菌、酵母等） | 乙醛酸支路、C5-糖裂解途径、新型代谢途径、动态调节回路（基于生物传感器） | 工业生物技术, 材料 |
| 54 | 2026-07-10 |
Advances in biotechnological methods for genetic and metabolic engineering in Methylomonas sp. DH-1
2026-May-16, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-026-00700-6
PMID:42143386
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综述 | 综述了甲基单胞菌DH-1菌株遗传和代谢工程生物技术方法的最新进展 | 系统总结了针对DH-1菌株的分子工具开发，包括优化转化方法、无质粒基因组工程、可调启动子库和合成小调控RNA平台 | 未明确提及局限性 | 促进甲基单胞菌DH-1菌株作为甲烷利用底盘细胞的代谢工程和合成生物学研究 | 甲基单胞菌DH-1菌株 | 机器学习 | NA | NA | NA | NA | NA | Cre重组酶 | 甲基单胞菌DH-1 | 可调启动子库、合成小调控RNA平台 | 工业生物技术, 环境 |
| 55 | 2026-07-10 |
The Origin of Life in the Light of Evolution
2026-May-08, ArXiv
PMID:42389247
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综述 | 从演化视角重新审视生命起源问题，强调需要将研究从单纯探讨生命如何开始扩展为探索生命如何从生物前系统演化而来 | 提出将群体遗传学框架纳入生命起源研究，强调LUCA之前的深层演化历史，并整合比较基因组学、系统发育学、生物化学和地球科学等多领域证据 | NA | 推动生命起源研究从化学问题转向演化问题，建立可检验的演化驱动假说 | 生命起源、最后普适共同祖先（LUCA）、生物前系统、原始代谢网络、原始细胞 | 演化生物学、合成生物学 | NA | 比较基因组学、系统发育学、合成生物学 | NA | 基因组数据、地球化学数据 | NA | 合成细胞 | NA | 原始代谢网络、自催化网络 | 基础科学 |
| 56 | 2026-07-10 |
CellTarget: a convex optimisation approach to discover cellular objectives
2026-04-03, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-026-00700-8
PMID:41932911
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研究论文 | 提出一种名为CellTarget的凸优化算法，用于从实验通量数据中推断细胞目标 | CellTarget结合凸通量平衡分析模块和误差最小化模块，通过隐式微分实现目标系数的反向传播和联合优化，解决了哺乳动物细胞代谢模型中目标函数未知的难题 | 细胞目标存在显著的非可识别性，预测准确性更多地受网络约束而非目标特异性驱动 | 开发一种从实验通量数据中推断细胞目标的算法，提高哺乳动物细胞代谢模型的预测能力 | 中国仓鼠卵巢细胞系 | 数字病理学 | NA | 通量平衡分析 | 凸优化模型 | 通量数据 | 生产者与非生产者中国仓鼠卵巢细胞系，多个生长期 | NA | 中国仓鼠卵巢细胞 | NA | 医学 |
| 57 | 2026-07-10 |
PANoptosis as a drug discovery framework: integrating cell death architecture with clinical translation
2026-04, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-026-00388-0
PMID:41776350
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综述 | 本综述整合细胞死亡架构与临床转化，探讨PANoptosis作为药物发现框架的潜力 | 提出PANoptosis作为统一的炎症性死亡程序，整合上游传感器、支架衔接子和执行器，并构建临床极性-时间模型以区分诱导与抑制情境，同时探索新兴生物标志物和药物发现前沿 | PANoptosis的分子机制仍有待进一步阐明，其选择性调控的临床转化面临组织特异性和安全性挑战 | 将PANoptosis作为治疗靶点和辅助框架，推动感染性、炎症性、肿瘤性和神经退行性疾病管理的变革 | PANoptosis分子架构及其在病原体、致癌应激和无菌损伤中的作用 | 计算生物学、药物发现 | 感染性疾病、炎症性疾病、癌症、神经退行性疾病 | NA | NA | 文本、临床试验数据 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 58 | 2026-07-10 |
Context-aware synthetic promoter design using neural networks enables rewiring of eukaryotic transcriptional networks
2026-03-17, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-026-00684-5
PMID:41844670
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研究论文 | 提出一种基于人工神经网络的框架，用于在酿酒酵母中实现上下文感知的合成启动子设计，从而重编程真核转录网络 | 首次开发了可预测最优转录因子结合位点插入位置及启动子重写程度的神经网络工具，无需前期实验表征即可实现高达98.4%的抑制率 | 研究仅在本模式生物酿酒酵母中验证，且依赖已知转录因子结合位点数据，通用性及跨物种应用需进一步探索 | 开发可扩展的计算方法用于人工启动子工程，实现转录网络的精确重编程 | 酿酒酵母 (Saccharomyces cerevisiae) 的天然启动子及TetR、Mig1转录因子结合位点 | 合成生物学 | NA | 人工神经网络、启动子工程、转录因子结合位点重组 | ANN (人工神经网络) | DNA序列数据 | 分析6,011个天然酵母启动子，实验验证了部分设计启动子 | NA | 酿酒酵母 | 合成启动子-转录因子结合位点重组电路，包含TetR和Mig1响应元件 | 生物技术 |
| 59 | 2026-07-10 |
Generative AI for synthetic biology: Designing biological parts, circuits, and genomes
2026-Feb-18, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2026.101533
PMID:41713401
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综述 | 探讨生成式人工智能与合成生物学的融合，聚焦其在生物元件、基因线路和基因组设计中的创新应用 | 首次系统综述生成式AI在合成生物学中的前沿应用，提出从数据驱动设计到可预测、可编程生物系统的路线图 | 未深入涉及具体算法的实现细节或实验验证案例 | 评估生成式AI如何变革合成生物学的设计方法论并展望未来发展 | 合成生物学中的生物元件、基因线路和基因组 | 合成生物学 | NA | 生成式AI | NA | NA | NA | NA | NA | 基因线路、基因组 | 医药、工业生物技术 |
| 60 | 2026-07-10 |
Challenges and opportunities in cell-free systems
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.08.006
PMID:41688140
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综述 | 评估无细胞系统技术面临的挑战与机遇 | 全面评估CFS技术挑战，并突出其在合成生物学中的巨大潜力 | 未具体说明CFS的详细技术限制，仅概述宏观问题 | 探讨无细胞系统的技术挑战及未来应用机遇 | 无细胞系统（CFS） | 合成生物学 | NA | 无细胞系统 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医疗 |