合成生物学相关文章
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当前共找到 250 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2026-01-03 |
Alternating Cellular Functions by Optogenetic Control of Organelles
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4047-0_13
PMID:39724352
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研究论文 | 本文介绍了一种通过光遗传学调控线粒体-溶酶体接触（MLCs）的方法，以动态控制细胞器功能 | 利用光遗传学技术实现对活细胞中细胞器功能的动态调控，为细胞工程和合成生物学提供创新范式 | NA | 开发一种光遗传学方法来调控细胞器功能，特别是线粒体-溶酶体接触 | 真核细胞中的细胞器，特别是线粒体和溶酶体 | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | NA | NA | 光遗传学 | 真核细胞 | 光遗传学调控的线粒体-溶酶体接触（MLCs） | 医学 |
| 42 | 2026-01-03 |
Artificial miRNAs and target-mimics as potential tools for crop improvement
2025-Jan, Physiology and molecular biology of plants : an international journal of functional plant biology
IF:3.4Q1
DOI:10.1007/s12298-025-01550-0
PMID:39901962
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综述 | 本文综述了人工miRNA和靶标模拟物作为作物改良潜在工具的最新进展 | 系统总结了利用合成生物学方法设计人工miRNA和靶标模拟物调控基因表达以增强作物抗逆性和抗病性的生物技术策略 | NA | 探讨人工miRNA和靶标模拟物在作物改良中的应用潜力 | 植物中的microRNA及其人工调控工具 | NA | NA | 人工miRNA设计、靶标模拟物技术、短串联靶标模拟物 | NA | NA | NA | 合成生物学方法 | 植物 | 利用miRNA生物合成途径编程合成回路 | 农业 |
| 43 | 2026-01-02 |
Matrine and Its Derivatives: Multi-Pathway Regulation in Cancer Therapy
2025, Cancer management and research
IF:2.5Q3
DOI:10.2147/CMAR.S563211
PMID:41467103
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综述 | 本文综述了苦参碱及其衍生物通过多通路调控在癌症治疗中的作用、挑战及未来发展方向 | 系统阐述了第三代衍生物（如MT-26, YF-18）通过靶向双重抑制和激活NLRP3/caspase-1细胞焦亡通路，在胰腺癌和肝癌模型中实现60-78%的抑瘤率，并克服化疗耐药性 | 临床转化面临生物利用度低、脱靶毒性（如通过激活导致的肝毒性）以及肿瘤异质性驱动的耐药机制（如介导的铁死亡逃逸）等挑战，且迄今为止尚无针对苦参碱或其衍生物在癌症治疗中的I/II期临床试验注册 | 探讨苦参碱及其衍生物作为多靶点天然生物碱在癌症治疗中的协同抗肿瘤效应及其转化前景 | 苦参碱及其衍生物 | NA | 癌症 | 多组学（空间代谢组学、单细胞表观药物组学）、合成生物学、器官芯片技术 | NA | NA | NA | DNA折纸纳米机器人、磁性引导微/纳米游泳器、AI辅助晶体筛选 | NA | NA | 医学 |
| 44 | 2026-01-01 |
Deep learning-based investigation of chloroplast translation regulatory sequences
2025, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2025.1698951
PMID:41459449
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研究论文 | 本研究开发了一种结合CNN、LSTM、Attention和Residual架构的混合深度学习模型，用于分类和分析植物与藻类叶绿体翻译调控序列，特别是5'非翻译区序列及SD基序的存在与否 | 首次应用深度学习模型分析叶绿体翻译调控序列，并提出了在藻类质体工程中引入异源前导序列的两种潜在策略 | 模型性能虽强，但存在一小部分植物和藻类序列表现出跨组模式，可能影响分类准确性 | 研究叶绿体翻译调控序列的架构，以促进合成生物学和基因工程的发展 | 植物和藻类的叶绿体5'非翻译区序列，包括含与不含SD基序的序列 | 机器学习 | NA | 深度学习 | CNN, LSTM, Attention, Residual | 序列数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 基因工程 |
| 45 | 2026-01-01 |
Macrophage polarization: molecular mechanisms, disease implications, and targeted therapeutic strategies
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1732718
PMID:41459510
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综述 | 本文综述了巨噬细胞极化的分子机制、在疾病中的作用以及靶向极化的治疗策略 | 超越了传统的M1/M2二分法，强调了极化状态的连续性和动态性，并系统阐述了信号通路、代谢重编程和表观遗传机制之间的互作网络 | 临床转化面临脱靶效应、递送效率低、微环境依赖性等挑战 | 阐明巨噬细胞极化的分子机制及其在疾病中的作用，并探讨靶向极化的治疗策略 | 巨噬细胞（包括组织驻留巨噬细胞和单核细胞来源的巨噬细胞）及其极化状态 | 免疫学 | NA | 单细胞组学、空间转录组学、计算建模、合成生物学 | NA | NA | NA | 基因编辑 | NA | NA | 医学 |
| 46 | 2025-12-25 |
An alternative view on the ethics of synthetic biology: an Indian Hindu perspective
2025, Global bioethics = Problemi di bioetica
DOI:10.1080/11287462.2025.2518798
PMID:41425232
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评论 | 本文从印度教哲学的非二元世界观出发，重新审视合成生物学的伦理问题，提出一种强调互联性、责任感和对所有生命形式尊重的伦理框架 | 首次将印度教哲学的非二元世界观应用于合成生物学的伦理讨论，突破了传统二元对立（如自然/人工、人类/机器）的伦理框架限制 | NA | 为合成生物学的伦理讨论提供一种非二元、更全面包容的哲学视角 | 合成生物学的伦理框架 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 农业, 环境 |
| 47 | 2025-12-24 |
Biological Switches: Past and Future Milestones of Transcription Factor-Based Biosensors
2025-01-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00689
PMID:39709556
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综述 | 本文回顾了转录因子生物传感器从1960年代至今的发展历程，包括基础研究和工程策略的关键里程碑，并探讨了未来前景、挑战和未开发机遇 | 系统分析了转录因子生物传感器在基础知识和工程策略上的历史演变，并整合了多学科方法如高通量工具和计算学习来扩展其应用 | NA | 回顾转录因子生物传感器的发展历史，分析其工程策略，并讨论未来研究方向 | 转录因子生物传感器，包括其DNA和蛋白质层面的设计与应用 | 合成生物学 | NA | 高通量分析工具、DNA随机化策略、正向工程、高级蛋白质工程工作流程 | NA | NA | NA | NA | NA | 转录因子生物传感器，基于原核生物转录调控机制 | 生物技术 |
| 48 | 2025-12-22 |
Yeast-secreted compounds with antifungal activity-screening, genetic parts, biosynthetic pathways, and regulation
2025-Jan-30, FEMS yeast research
IF:2.4Q3
DOI:10.1093/femsyr/foaf068
PMID:41258858
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综述 | 本文综述了酵母分泌的具有抗真菌活性的化合物，包括筛选方法、遗传元件、生物合成途径和调控机制 | 整合了当前关于酵母抗真菌化合物的分子知识，并提出了筛选和工程化这些化合物以应用于生物防治、食品保存和人类健康的新方法 | NA | 探索酵母分泌的抗真菌化合物，以开发新型抗真菌剂，应对抗真菌耐药性问题 | 酵母分泌的化合物，如铁螯合剂、生物表面活性剂、挥发性有机化合物、霉菌素和水解酶 | 合成生物学 | 真菌感染 | 合成生物学工具 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 酵母 | NA | 农业, 食品安全, 生物防治, 人类健康 |
| 49 | 2025-12-22 |
From bark to bench: innovations in QS-21 adjuvant characterization and manufacturing
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1677995
PMID:41409277
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综述 | 本文以皂苷类佐剂QS-21为核心案例，综述了佐剂开发中的关键挑战及新兴技术解决方案，并提出了整合合成生物学、人工智能和系统免疫分析的佐剂开发新愿景 | 提出了“从树皮到实验室”的整合佐剂开发管线，结合合成生物学、人工智能和系统免疫分析，以加速新一代佐剂的发现与应用 | 本文为综述性文章，未报告原始实验数据，主要基于现有文献进行分析和展望 | 探讨佐剂开发中的挑战与技术创新，特别是针对QS-21佐剂的特性改进与可持续生产 | 皂苷类佐剂QS-21及其类似物 | 生物医学工程 | NA | 合成生物学、生物工程、纳米颗粒制剂技术 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 微生物、植物平台 | NA | 医药 |
| 50 | 2025-12-20 |
Engineering artificial 5' regulatory sequences for thermostable protein expression in the extremophile Thermus thermophilus
2025, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysaf016
PMID:41404420
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研究论文 | 本研究通过开发新型人工5'调控序列（ARES），扩展了嗜热菌Thermus thermophilus的遗传工具包，用于热稳定蛋白的高水平异源表达 | 首次在Thermus thermophilus中应用基因表达工程平台，设计了53个人工ARES，这些序列包含启动子和5'非翻译区，并显示出宿主特异性表达模式，且GC含量显著低于天然启动子 | NA | 扩展嗜热菌Thermus thermophilus的标准化遗传工具，以优化热稳定蛋白的异源表达 | 嗜热菌Thermus thermophilus和Escherichia coli中的人工5'调控序列（ARES）及其对热稳定蛋白表达的影响 | 合成生物学 | NA | 基因表达工程平台、生物信息学分析 | NA | 序列数据、表达数据 | 53个人工ARES序列，涉及β-半乳糖苷酶、超折叠柠檬荧光蛋白和八氢番茄红素合酶等热稳定蛋白 | Gene Expression Engineering平台 | Thermus thermophilus, Escherichia coli | 人工5'调控序列（ARES），包含启动子和5'非翻译区，用于调控基因表达 | 工业生物技术 |
| 51 | 2025-12-18 |
Synthetic biology approaches to enhance cancer immune responses
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1698158
PMID:41394856
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综述 | 本文综述了合成生物学在增强癌症免疫应答方面的应用进展，重点介绍了基于微生物的疗法和CAR-T细胞工程的最新发展 | 整合了微生物疗法与CAR-T细胞工程，通过可编程基因电路实现布尔逻辑运算，仅在肿瘤特异性生物标志物存在时激活治疗，提供了前所未有的精准性、安全性和效力 | 临床转化面临重大障碍，包括安全性问题、免疫清除和制造复杂性 | 利用合成生物学方法增强癌症免疫应答，开发精准工程化免疫疗法 | 肿瘤免疫疗法，包括微生物疗法和CAR-T细胞 | 合成生物学 | 癌症 | 合成基因电路构建、CAR-T细胞工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 细菌、T细胞 | 逻辑门电路、布尔逻辑运算电路、生物传感器 | 医学 |
| 52 | 2025-12-16 |
Engineered Bacteriophages: Advances in Phage Genome Redesign Strategies for Therapeutic and Environmental Applications
2025, Protein and peptide letters
IF:1.0Q4
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综述 | 本文综述了噬菌体基因组重设计策略在治疗和环境应用中的进展 | 整合了CRISPR-Cas系统、噬菌体展示、逆转录子等多种前沿技术，展示了定制化噬菌体在扩展宿主范围、生物膜降解和靶向治疗方面的创新潜力 | 面临噬菌体抗性、免疫反应和当前工程方法的局限性等挑战 | 探索噬菌体工程化策略以应对治疗和环境可持续性挑战 | 噬菌体及其基因组重设计技术 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas系统、噬菌体展示、随机和定点诱变、逆转录子、同源重组 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas, TALEN, ZFN | 噬菌体 | 生物传感器、逻辑门 | 医药, 环境 |
| 53 | 2025-12-15 |
From pandemics to preparedness: harnessing AI, CRISPR, and synthetic biology to counter biosecurity threats
2025, Frontiers in public health
IF:3.0Q2
DOI:10.3389/fpubh.2025.1711344
PMID:41383331
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综述 | 本文综述了如何整合人工智能、CRISPR和合成生物学等新兴技术，以应对生物安全威胁并增强全球卫生安全准备 | 提出了一个整合多种前沿技术（AI、CRISPR、合成生物学、数字流行病学等）与公平政策、国际合作相结合的综合框架，以构建面向未来的弹性生物安全防御系统 | 文中提及的创新技术存在伦理、法律和公平性方面的挑战，且其大规模应用和可及性仍需解决 | 探讨如何利用新兴科技提升对生物安全威胁（包括自然暴发、实验室事故和生物恐怖主义）的预防、检测和响应能力 | 生物安全威胁及其应对技术 | NA | NA | 人工智能、下一代测序、CRISPR诊断、数字流行病学、mRNA/DNA疫苗平台、单克隆抗体、纳米抗体疗法 | NA | NA | NA | CRISPR | NA | NA | 医学 |
| 54 | 2025-12-14 |
Investigating DNA words and their distributions across the tree of life
2025, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2025.11.040
PMID:41377119
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研究论文 | 本研究系统分析了超过22.5万个跨越生命三域及病毒基因组的k-mer频率分布，发现Zipf定律在建模k-mer分布时表现不佳，并提出截断幂律和Zipf-Mandelbrot分布作为更优的替代模型 | 首次在大规模跨物种基因组数据中系统验证Zipf定律的适用性，并提出更优的统计分布模型；开发了基于k-mer分布评估人工基因组生物学合理性的新方法 | 未深入探讨特定生物过程（如选择压力、突变偏好）对k-mer分布的具体影响机制 | 探究DNA k-mer在生命之树中的分布规律及其演化意义 | 225,000+个涵盖生命三域（细菌、古菌、真核生物）及病毒的基因组组装 | 计算生物学 | NA | k-mer频谱分析、统计建模、基因组模拟 | 截断幂律分布、Zipf-Mandelbrot分布、Heaps定律、深度生成语言模型 | 基因组序列数据 | 超过225,000个基因组组装 | NA | NA | NA | 合成生物学、进化序列分析 |
| 55 | 2025-12-08 |
Designing novel peptides with amyloid-β binding and clearance potential using BiLSTM and molecular dynamics
2025, Frontiers in artificial intelligence
IF:3.0Q2
DOI:10.3389/frai.2025.1709505
PMID:41346856
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研究论文 | 本研究提出了一种基于双向长短期记忆网络（BiLSTM）和分子动力学的两阶段框架，用于设计具有与淀粉样蛋白-β结合和清除潜力的新型肽段 | 开发了一种新颖的两阶段BiLSTM框架，该框架在具有特定基因本体（GO）注释的全长蛋白质上进行训练，并在实验验证的肽段片段上进行微调，以生成针对特定靶点（如Aβ42）的功能性短肽 | 训练数据包含了与Aβ清除相关的蛋白质，但计算验证仅涉及结合相互作用；清除潜力仍是一个有待未来实验验证的假设 | 开发一种可推广的、人工智能驱动的功能性肽段设计流程，用于治疗发现和合成生物学 | 针对阿尔茨海默病关键病理因子Aβ42的新型肽段 | 自然语言处理 | 阿尔茨海默病 | 分子动力学模拟，AlphaFold2结构建模，pyDockWEB对接 | BiLSTM | 序列数据（蛋白质和肽段序列） | 从1000个AI生成的序列中筛选出25个候选，最终优先考虑11个（ADNP1-ADNP11） | NA | NA | NA | 医学 |
| 56 | 2025-12-07 |
Genome-based exploration of volatile flavor diversity from food yeast species
2025-Jan-30, FEMS yeast research
IF:2.4Q3
DOI:10.1093/femsyr/foaf067
PMID:41269214
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综述 | 本文综述了基于基因组技术探索食品酵母物种中挥发性风味多样性的最新进展，重点关注酯类、苯类、硫化合物和酚类衍生物的形成途径，并展望了通过共发酵和合成生物学推动食品发酵创新的未来方向 | 利用基因组尺度技术重新定义风味多样性研究，结合共发酵策略和组学分析，为下一代食品发酵创新提供新视角 | 作为一篇小型综述，可能未全面覆盖所有相关研究或实验细节 | 探索食品酵母物种中挥发性风味化合物的遗传和进化驱动因素，以促进食品发酵创新 | 各种酵母物种，特别是酿酒酵母与非传统酵母物种 | 合成生物学 | NA | 基因组尺度技术、组学分析 | NA | 基因组数据 | NA | NA | 酿酒酵母、非传统酵母物种 | 酯类、苯类、硫化合物和酚类衍生物的生物合成途径 | 食品、工业生物技术 |
| 57 | 2025-12-05 |
Strength in diversity: unlocking the full potential of engineered living materials with multistrain collaboration
2025-Jan-14, FEMS microbiology reviews
IF:10.1Q1
DOI:10.1093/femsre/fuaf055
PMID:41206547
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研究论文 | 本文探讨了工程活材料中多菌株协作的潜力，以提升其功能和适用性 | 提出利用多菌株协作来克服单菌株在代谢负担和工程化方面的限制，从而扩展ELMs的功能 | 多菌株ELMs技术尚处于早期阶段，具体应用和稳定性有待进一步研究 | 研究如何通过多菌株协作优化工程活材料的设计和性能 | 工程活材料，特别是包含细菌、真菌、植物或藻类等生物的材料 | 合成生物学与材料科学交叉领域 | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | NA | NA | 细菌、真菌、植物、藻类 | 多菌株协作系统，旨在实现自组装、驱动和动态交互等功能 | 医疗保健、建筑、农业 |
| 58 | 2025-12-04 |
Intergenerational justice, the impending sixth mass extinction, reproduction and advanced biotechnologies, and humanity's future
2025, Cambridge prisms. Extinction
DOI:10.1017/ext.2025.10005
PMID:41322091
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综述 | 本文探讨了代际正义、第六次大规模灭绝威胁以及生殖与先进生物技术在物种保护和生物圈可持续性中的作用 | 提出将生殖生物技术和合成生物学应用于物种复活、遗传多样性保存及生物圈管理，作为应对灭绝危机的新策略 | 伦理和法律框架仍在演变中，涉及基因工程、超人类主义和古代物种复活等问题 | 研究如何利用先进生物技术促进物种保护、遗传多样性维护和生物圈可持续性，以支持代际正义 | 濒危物种、遗传多样性、生物圈可持续性以及人类和动物健康 | NA | NA | 基因工程、合成生物学、野生动物生物库 | NA | NA | 超过3000种极度濒危的陆地/淡水物种 | NA | NA | NA | 环境、医学、农业 |
| 59 | 2025-12-04 |
Genetic engineering frontiers in cell manipulation-based tissue engineering: A comprehensive review
2025, BioImpacts : BI
IF:2.2Q3
DOI:10.34172/bi.30973
PMID:41322390
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综述 | 本文综述了基于细胞操作的基因工程前沿技术在组织工程中的应用，探讨了其变革潜力 | 整合CRISPR-Cas9、TALENs和合成生物学等先进基因工程技术，结合3D生物打印、微流控和智能生物材料，推动复杂组织构建 | 存在长期遗传稳定性、可扩展性和脱靶效应等挑战，以及伦理和监管问题 | 探索基因工程在细胞操作组织工程中的前沿应用，以应对功能性组织替代的需求 | 软骨、骨骼、心脏、神经、皮肤和血管等多种工程化组织 | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALENs, 合成生物学, 碱基编辑, 合成遗传电路 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 哺乳动物细胞 | 合成遗传电路 | 医学 |
| 60 | 2025-12-01 |
Optimizing nitrogen use efficiency in forest plantations: mechanistic insights from Arabidopsis, crops, and natural forestry ecosystems
2025, Forestry research
DOI:10.48130/forres-0025-0029
PMID:41312404
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综述 | 本文综述了森林人工林氮素利用效率的优化策略，通过整合拟南芥、作物和天然林生态系统的氮利用机制提出改进方案 | 首次系统整合三大系统的氮利用机制，并提出利用关键调控基因和合成生物学方法定向增强森林人工林氮素利用效率的创新思路 | 主要基于理论分析和现有研究综述，缺乏实际田间试验验证 | 提高森林人工林的氮素利用效率 | 森林人工林（如杨树和桉树）、拟南芥、作物和天然森林生态系统 | 植物生理学与林业科学 | NA | 合成生物学、基因调控 | NA | 文献资料与理论分析 | NA | NA | NA | NA | 农业、林业 |