合成生物学相关文章
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当前共找到 117 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2025-10-05 |
Bioengineering Outer-Membrane Vesicles for Vaccine Development: Strategies, Advances, and Perspectives
2025-Jul-20, Vaccines
IF:5.2Q1
DOI:10.3390/vaccines13070767
PMID:40733744
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综述 | 本文综述了外膜囊泡在疫苗开发中的工程化策略、研究进展和未来前景 | 系统总结了包括表面抗原基因工程、表面偶联、糖工程、纳米颗粒工程、杂交OMV和原位生产在内的新兴工程策略，并提出了合成生物学技术的整合潜力 | NA | 探索外膜囊泡作为新一代疫苗开发平台的潜力 | 革兰氏阴性菌自然分泌的外膜囊泡 | 合成生物学 | 传染病和癌症 | 基因工程、生物技术、糖工程、纳米技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 革兰氏阴性菌 | 表面抗原展示系统、生物传感器、代谢通路 | 医学 |
| 42 | 2025-10-05 |
Soilless Cultivation: Precise Nutrient Provision and Growth Environment Regulation Under Different Substrates
2025-Jul-16, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants14142203
PMID:40733440
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综述 | 系统回顾无土栽培技术体系及其在精准调控作物根际环境方面的创新潜力 | 系统整合无土栽培技术体系与根际微生物互作机制，提出通过合成生物学方法优化微生物群落结构 | 有机体系中根际微生物群落结构和功能稳定性易失衡，技术成本与基质可持续性亟待解决 | 揭示无土栽培技术优势并推动其向低碳化、精准化和空间化方向发展 | 无土栽培技术体系、营养液管理策略、根际微生物互作机制 | 现代农业技术 | NA | 合成生物学方法、智能环境控制系统 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业, 环境 |
| 43 | 2025-10-05 |
Integrated Approach for Improving Lutein Production of Chlorella sp. via Adaptive Evolution and Casein Acid Hydrolysate
2025-Jul, Applied biochemistry and biotechnology
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s12010-025-05279-0
PMID:40358910
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研究论文 | 本研究通过适应性进化和酪蛋白酸水解物调控开发了提高小球藻叶黄素产量的综合方法 | 结合适应性进化（苯酚胁迫）和代谢调控（NaCl与酪蛋白酸水解物）的集成策略显著提升微藻叶黄素产量 | 未探讨其他环境胁迫因子或代谢调控物质的协同效应 | 提高小球藻的叶黄素生产能力 | 小球藻（Chlorella sp.）及其进化菌株P30 | 合成生物学 | NA | 适应性进化、代谢调控 | NA | 生物化学分析数据 | 经过30代适应性进化的P30菌株及原始菌株 | 适应性进化 | 小球藻（Chlorella sp.） | NA | 工业生物技术 |
| 44 | 2025-10-05 |
How many plasmids can bacteria carry? A synthetic biology perspective
2025-Jul, Open biology
IF:4.5Q1
DOI:10.1098/rsob.240378
PMID:40730232
|
综述 | 从合成生物学视角探讨细菌携带多重质粒的能力及其应用 | 首次系统探讨单个微生物携带独特质粒的最大数量问题 | NA | 研究细菌维持多重独特质粒的理论与实践可能性 | 细菌质粒系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 质粒载体 | 细菌 | 多质粒系统 | 代谢工程, 合成生物学 |
| 45 | 2025-10-05 |
Monodisperse Giant Unilamellar Niosomes as Minimal Synthetic Cells
2025-Jul-30, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c09950
PMID:40670353
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研究论文 | 本文介绍了一种基于非离子表面活性剂的巨型单层尼奥体（GUNs）作为合成细胞模型 | 首次利用液滴微流控技术制备单分散Span 80基GUNs，具有优异膜流动性和对小分子及质子的固有选择性渗透性 | NA | 开发更稳定、经济且具有良好渗透性的合成细胞模型 | 巨型单层尼奥体（GUNs） | 合成生物学 | NA | 液滴微流控技术 | NA | NA | NA | NA | NA | 糖酵解-线粒体级联反应系统 | 仿生微系统,合成生物学,药物递送 |
| 46 | 2025-10-05 |
Advances and obstacles of T cell-based immunotherapy in gynecological malignancies
2025-Jul-26, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-025-02411-w
PMID:40713697
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综述 | 全面分析CAR-T细胞疗法在妇科肿瘤中的进展、挑战及未来策略 | 整合临床前见解与转化临床数据，建立妇科肿瘤过继性T细胞疗法的战略框架，强调CAR-T技术与个性化新抗原疫苗及微环境重编程剂的协同潜力 | 治疗持久性和制造一致性仍存在持续限制 | 推进妇科恶性肿瘤中基于T细胞的免疫治疗 | 妇科恶性肿瘤（卵巢癌、宫颈癌、子宫内膜癌） | NA | 妇科肿瘤 | CAR-T细胞疗法、合成生物学方法、多组学引导的抗原选择 | NA | 临床数据、临床前数据 | NA | CAR-T | T淋巴细胞 | 嵌合抗原受体（CAR）设计 | 医学 |
| 47 | 2025-10-05 |
Advancements in understanding tumor-resident bacteria and their application in cancer therapy
2025-Jul-25, Military Medical Research
IF:16.7Q1
DOI:10.1186/s40779-025-00623-1
PMID:40713785
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综述 | 探讨肿瘤内微生物群（特别是胞内细菌）在肿瘤演进中的作用及其在癌症治疗中的应用前景 | 系统阐述胞内细菌在肿瘤进展中的新机制，并提出基于合成生物学和工程化药物递送系统的靶向治疗新策略 | NA | 解析肿瘤内微生物群在癌症发生发展中的作用机制并探索其治疗应用 | 肿瘤内微生物群（特别是胞内细菌）及其与肿瘤细胞、免疫细胞的相互作用 | 肿瘤微生物组学 | 癌症 | 二代测序、生物信息学分析 | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 医学 |
| 48 | 2025-10-05 |
Protein design of two-component tubular assemblies similar to cytoskeletons
2025-Jul-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-62076-3
PMID:40695817
|
研究论文 | 开发了一种受自然启发的蛋白质设计方法，利用两种不同蛋白质单元构建类似细胞骨架的动态管状结构 | 首次实现了两种不同蛋白质单元在精心设计条件下组装成具有动态柔性的管状结构，能够响应环境刺激可逆组装 | NA | 探索蛋白质高级结构组装的设计原理，模拟天然细胞骨架系统的动态行为 | 两种不同蛋白质单元及其组装形成的管状结构 | 合成生物学 | NA | 冷冻电子显微镜 | NA | 结构图像数据 | NA | 蛋白质理性设计 | NA | 仿肌动蛋白丝和微管的管状组装结构 | 材料科学, 合成生物学 |
| 49 | 2025-10-05 |
Identification of cognate recombination directionality factors for large serine recombinases by virtual pulldown
2025-Jul-19, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf691
PMID:40701553
|
研究论文 | 本研究利用AlphaFold2-multimer预测并实验验证了大丝氨酸重组酶的匹配重组方向性因子 | 首次使用AlphaFold2-multimer系统性地预测RDFs，成功识别了超过半数测试重组酶的潜在RDFs | RDFs缺乏序列保守性且与噬菌体整合酶基因缺乏同线性，增加了识别难度 | 开发识别大丝氨酸重组酶匹配重组方向性因子的计算方法 | 98个大丝氨酸重组酶及其重组方向性因子 | 合成生物学 | NA | AlphaFold2-multimer预测、实验验证 | AlphaFold2-multimer | 蛋白质序列和结构数据 | 98个大丝氨酸重组酶测试集，其中9个作为测试案例 | 大丝氨酸重组酶系统 | NA | 整合型重组系统（噬菌体或移动元件插入模拟） | 合成生物学、基因组编辑 |
| 50 | 2025-10-05 |
Genetic "expiry-date" circuits control lifespan of synthetic scavenger bacteria for safe bioremediation
2025-Jul-19, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf703
PMID:40705927
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研究论文 | 本研究开发了基因'保质期'电路来控制合成细菌的寿命，用于安全的环境修复应用 | 设计了可调节寿命的前馈激活网络电路，结合合成小调控RNA和基于asd的营养缺陷系统，实现了细菌程序化自毁 | NA | 开发合成细菌的生物安全控制策略，确保其在环境应用中的安全部署 | 工程化大肠杆菌及其基因调控电路 | 合成生物学 | NA | 基因电路设计、合成生物学工程 | NA | 实验数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 前馈激活网络、细胞裂解电路、营养缺陷系统 | 环境 |
| 51 | 2025-10-05 |
A Novel Linear Machine Learning Method Based on DNA Hybridization Reaction Circuit
2025-07, IEEE transactions on nanobioscience
IF:3.7Q3
DOI:10.1109/TNB.2025.3559480
PMID:40232911
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研究论文 | 提出了一种基于DNA杂交反应电路的新型线性机器学习方法 | 利用DNA杂交反应实现完整的合成生物学计算系统，采用'双轨'机制实现学习算法的DNA编译，支持权重更新为负值 | NA | 开发基于DNA杂交反应电路的机器学习模型 | DNA杂交反应电路 | 机器学习 | NA | DNA杂交反应 | 线性机器学习模型 | NA | NA | NA | NA | 包含计算训练组件、测试组件和学习算法的DNA杂交反应电路 | 生物计算 |
| 52 | 2025-10-05 |
Computational biology meets oncology: designing custom protein and peptide binders to outsmart cancer
2025-Jul-22, Medical oncology (Northwood, London, England)
DOI:10.1007/s12032-025-02936-6
PMID:40694144
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综述 | 本文探讨计算生物学在癌症治疗中的应用，重点介绍从头设计蛋白质和多肽结合剂的方法与前景 | 整合计算设计、定向进化和人工智能技术，突破天然蛋白质支架限制，开发高特异性癌症靶向分子 | 计算工具（如Rosetta和AlphaFold）对无序区域和构象动力学的预测准确性仍存在局限 | 开发新型蛋白质和多肽结合剂以改善癌症精准治疗 | 从头设计的蛋白质和多肽结合剂（如DARPins、PD-1/PD-L1微型蛋白抑制剂） | 计算生物学 | 癌症 | 计算设计、定向进化、人工智能 | Rosetta、AlphaFold | 蛋白质结构数据 | NA | NA | NA | 合成生物学回路 | 医学 |
| 53 | 2025-10-05 |
A phage transcription factor displaces the host σ factor and stabilizes its own σ factor
2025-Jul-19, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf683
PMID:40682819
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研究论文 | 本研究通过冷冻电镜结构揭示了噬菌体蛋白gp79如何取代宿主σ因子并稳定自身σ因子gp36的转录调控机制 | 首次解析了gp79通过N端侵入RNA通道取代σ4，并在遇到gp36时改变构象稳定RNAP-启动子开放复合物的分子机制 | NA | 阐明噬菌体phiEco32蛋白gp79同时抑制宿主转录和激活自身转录的双重调控机制 | 大肠杆菌RNA聚合酶、噬菌体phiEco32蛋白gp79和gp36、同源启动子 | 结构生物学 | NA | 冷冻电镜(cryo-EM)、结构分析、生化分析 | NA | 结构数据、生化数据 | NA | NA | 大肠杆菌 | NA | 合成生物学 |
| 54 | 2025-10-05 |
Deciphering plasmid replication dynamics: a computational approach to predict ColE1-like plasmid copy number
2025-Jul, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2024.0783
PMID:40664234
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研究论文 | 开发了一种基于机器学习的计算工具，用于从复制起点序列预测ColE1类质粒的拷贝数 | 首个能够从复制起点序列计算预测质粒拷贝数的软件工具，强调了启动子强度和RNA折叠动力学的重要性 | NA | 简化质粒拷贝数设计，重新定义质粒工程工作流程 | ColE1类质粒的复制起点序列 | 机器学习 | NA | 机器学习 | 机器学习模型 | DNA序列数据 | NA | 质粒工程 | NA | 质粒复制起点设计 | 工业生物技术,医学 |
| 55 | 2025-10-05 |
Pattern recognition in living cells through the lens of machine learning
2025-Jul, Open biology
IF:4.5Q1
DOI:10.1098/rsob.240377
PMID:40664239
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综述 | 本文通过机器学习视角探讨细胞内的模式识别机制，分析人工神经网络与生物信号通路之间的相似性 | 将机器学习概念框架应用于生物学系统，提出信号通路和基因调控网络具有内在计算能力的新观点 | NA | 探索人工神经网络与生物信号通路在结构和功能上的相似性与差异 | 细胞信号通路、基因调控网络、人工神经网络 | 机器学习 | NA | NA | 神经网络 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 56 | 2025-10-05 |
High-Throughput 19F NMR Chiral Analysis for Screening and Directed Evolution of Imine Reductases
2025-Jul-23, ACS central science
IF:12.7Q1
DOI:10.1021/acscentsci.5c00498
PMID:40726787
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研究论文 | 开发了一种基于19F NMR的高通量手性分析方法，用于亚胺还原酶的筛选和定向进化 | 首次将19F NMR技术应用于高通量手性分析，能够同时评估对映选择性、立体偏好性和反应产率 | NA | 开发高效快速的手性分析方法以推动生物催化和合成生物学发展 | 亚胺还原酶及其在合成抗帕金森药物罗替戈汀中间体中的应用 | 合成生物学 | 帕金森病 | 19F NMR | NA | NMR光谱数据 | NA | 定向进化 | NA | NA | 医药 |
| 57 | 2025-10-05 |
Unraveling the Complexity of Plant Trichomes: Models, Mechanisms, and Bioengineering Strategies
2025-Jul-21, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26147008
PMID:40725255
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综述 | 本文综述了植物表皮毛的发育、结构和功能研究进展，重点探讨腺毛在植物合成生物学中的应用潜力 | 整合分子机制与新兴技术，提出了利用表皮毛进行可持续农业和生物制造的前瞻性框架 | NA | 探讨植物表皮毛的发育机制及其在合成生物学中的应用策略 | 植物表皮毛，特别是关键物种的腺毛分泌毛(GSTs) | 植物合成生物学 | NA | 模块化基因工程、代谢通道策略 | NA | NA | NA | NA | 植物 | NA | 可持续农业,天然产物发现,生物制造 |
| 58 | 2025-10-05 |
The V5-Epitope Tag for Cell Engineering and Its Use in Immunohistochemistry and Quantitative Flow Cytometry
2025-Jul-20, Biology
DOI:10.3390/biology14070890
PMID:40723447
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研究论文 | 系统评估V5表位标签及其抗体在细胞工程中的应用，包括免疫组织化学和定量流式细胞术 | 首次系统评估鼠源和人源化抗V5标签抗体在不同实验条件下的性能，并优化免疫组织化学方法以减少非特异性信号 | V5标签信号受特定固定剂和分离试剂影响，可能限制其在某些实验条件下的应用 | 开发用于合成生物学应用的V5标签检测工具箱 | V5标签融合蛋白、鼠源和人源化抗V5抗体、体外和体内实验样本 | 合成生物学 | NA | 免疫组织化学、流式细胞术、抗体人源化 | NA | 组织样本图像、流式细胞数据 | 46种人类正常或癌组织样本 | 表位标签技术 | 哺乳动物细胞 | 异源融合蛋白组装 | 医学 |
| 59 | 2025-10-05 |
Natural CCD2 Variants and RNA Interference for Boosting Crocin Biosynthesis in Tomato
2025-Jul-12, Biology
DOI:10.3390/biology14070850
PMID:40723408
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研究论文 | 本研究通过引入不同来源的CCD2酶等位基因和RNA干扰技术，成功提高了番茄中藏花素的生物合成水平 | 首次在番茄中同时表达藏红花和雄黄兰来源的CCD2等位基因，并结合RNA干扰技术调控类胡萝卜素代谢通路 | 研究仅针对番茄模型，未在其他作物中验证；转基因作物的生物安全性需要进一步评估 | 通过合成生物学方法提高番茄中藏花素的生物合成效率 | 番茄果实及其类胡萝卜素代谢途径 | 合成生物学 | NA | RNA干扰，基因工程，转基因技术 | NA | 生物化学数据，基因表达数据 | 转基因番茄植株 | RNA干扰，基因导入 | 番茄 | 藏花素生物合成途径，包括CCD2酶催化的玉米黄质转化为藏红花酸，以及后续的醛脱氢酶和葡萄糖基转移酶修饰步骤 | 农业，食品，医药 |
| 60 | 2025-10-05 |
Enhancing ELISA Sensitivity: From Surface Engineering to Synthetic Biology
2025-Jul-06, Biosensors
DOI:10.3390/bios15070434
PMID:40710084
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综述 | 本综述系统总结了提升ELISA检测灵敏度的策略，重点介绍了合成生物学在改进传统免疫检测方法中的应用 | 强调无细胞合成生物学技术在ELISA灵敏度提升中的新兴作用，包括表达免疫分析、CRISPR联用免疫分析(CLISA)和T7 RNA聚合酶联用免疫传感分析(TLISA)等创新方法 | NA | 提升酶联免疫吸附测定(ELISA)的检测灵敏度，缩小与核酸检测方法之间的灵敏度差距 | 蛋白质生物标志物检测技术 | 合成生物学 | NA | ELISA, 无细胞合成生物学, CRISPR, T7 RNA聚合酶系统 | NA | NA | NA | CRISPR, T7 RNA聚合酶系统 | 无细胞系统 | 可编程核酸和蛋白质合成系统 | 医学诊断 |