合成生物学相关文章
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当前共找到 156 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2026-06-06 |
Mistletoe- and Mussel-Inspired Fabrication of Hierarchically Structured Protein-Cellulose Scaffolds From Biomolecular Condensates
2026-Mar, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202520827
PMID:41603494
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研究论文 | 受槲寄生和贻贝启发，利用生物分子凝聚体制造具有层次结构的蛋白质-纤维素支架 | 首次结合动物和植物系统中可变形生物分子相的研究成果，开发了一种受贻贝和槲寄生启发的协同方法，用于制造具有可调层次结构的蛋白质-纤维素复合支架 | 文中未明确提及局限性 | 开发一种生物启发的方法，利用生物分子凝聚体制造具有层次结构的蛋白质-纤维素复合支架，并探究其在组织工程中的应用潜力 | 重组贻贝足蛋白-1 (rMfp-1) 和表面功能化的阴离子纤维素纳米棒 | 生物材料 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 材料 |
| 42 | 2026-06-05 |
Advances in synthetic biology for engineering methylotrophic microbial cell factories
2026-Mar-19, Journal of bacteriology
IF:2.7Q3
DOI:10.1128/jb.00383-25
PMID:41665342
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综述 | 综述了合成生物学在构建甲基营养微生物细胞工厂方面的最新进展 | 系统总结了通过构建高效甲醇利用途径、工程化甲醇脱氢酶提高氧化效率、优化辅因子利用平衡氧化还原等策略，以及缓解有毒代谢物积累和适应性实验室进化等方法，为合理设计高性能微生物平台提供了蓝图 | 未提及当前合成甲基营养菌在实际工业应用中的具体挑战和局限性 | 推动甲醇作为可持续生物制造和碳中和生产的工业应用 | 甲基营养微生物细胞工厂 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | 甲醇利用途径、氧化还原平衡优化 | 工业生物技术、环境 |
| 43 | 2026-06-05 |
Refactoring two-component systems for tunable gene expression regulation and upgraded bacterial sensing
2026-Mar-18, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101504
PMID:41653915
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研究论文 | 重构双组分系统以实现可调控的基因表达调控和升级的细菌传感 | 解耦组氨酸激酶与天然反馈回路，实现可调检测阈值的超灵敏TCS传感器；利用响应调控因子作为转导器创建协同传感系统，兼具低检测限和高动态范围；证明响应调控因子可作为生物低噪声放大器，显著提升多种基因编码生物传感器的性能 | 未明确提及，但基于重构系统的稳定性、在复杂环境中的适应性等可能存在的限制 | 探索双组分系统的可编程性，开发模块化的生物传感器优化工具包 | 双组分系统中的响应调控因子和组氨酸激酶 | 合成生物学 | NA | 基因重构、生物传感 | NA | NA | NA | NA | 原核生物 | 协同传感系统、生物低噪声放大器 | 合成生物学、生物传感 |
| 44 | 2026-06-05 |
Blue food proteins-derived immunomodulatory peptides: sources, preparation, identification techniques, mechanisms, and critical challenges of commercial application
2026-Mar-01, Food research international (Ottawa, Ont.)
DOI:10.1016/j.foodres.2025.118136
PMID:41652731
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综述 | 系统梳理蓝色食物蛋白源免疫调节肽的来源、制备技术、鉴定方法、作用机制及商业化应用挑战 | 首次全面整合免疫调节肽的海洋来源、提取纯化技术、非特异性和特异性免疫通路（如NF-κB和MAPK信号级联）及体内外免疫调节活性证据 | 面临胃肠道稳定性不足、长期安全性验证缺失及工业规模化生产障碍 | 推动免疫调节肽从功能性生物活性物质向临床免疫营养和治疗制剂转化 | 蓝色食物蛋白源免疫调节肽 | 数字病理学 | NA | 合成生物学、精密发酵、人工智能辅助肽设计 | NA | NA | NA | 合成生物学, 精密发酵 | NA | NA | 医学, 食品 |
| 45 | 2026-06-05 |
Programming Next-Generation Synthetic Biosensors by Genetic Circuit Design
2026-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202524172
PMID:41655251
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综述 | 本文综述了通过基因电路设计实现下一代合成生物传感器的研究进展，重点探讨了其传感机制、设计、应用及面临的挑战 | 系统分析了构建高性能合成生物传感器的设计原则、使能工具和工程策略，特别是全面审视了剂量-响应曲线的调谐方法，包括检测限、检测阈值、操作范围、动态范围和泄漏特性 | 合成生物传感器在实际部署和现场应用中仍面临灵敏度、特异性、速度、稳定性和生物安全性等方面的挑战 | 总结基因电路驱动的合成生物传感器的最新进展，并探索其从实验室走向实际应用的路径 | 合成生物传感器及其基因电路设计 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 基因电路 | 环境监测、疾病诊断、食品安全控制、生物生产优化 |
| 46 | 2026-06-04 |
Development of microbial chassis for production of fungal natural products
2026-Mar, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2025.2608895
PMID:41592899
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综述 | 综述了用于真菌天然产物生产的微生物底盘开发 | 系统评估了多种微生物底盘的特征和途径重构策略，以提高异源表达效率 | 未提供具体实验数据，仅基于现有文献进行分析 | 优化微生物底盘以更有效地生产真菌天然产物 | 真菌天然产物及其生物合成基因簇 | 合成生物学 | NA | 异源表达 | NA | NA | NA | NA | 微生物底盘 | 代谢途径重构 | 医药 |
| 47 | 2026-05-28 |
Assetizing Diversity: Microbial Culture Collections in an Age of Biotechnology, Biodiversity, and Speculative Value Generation (1972-2022)
2026-Mar, Journal of the history of biology
IF:0.7Q2
DOI:10.1007/s10739-026-09853-y
PMID:42118395
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综述 | 追溯1972至2022年微生物资源保藏中心的历史，探讨微生物多样性保护与生物技术价值化的演变 | 将微生物价值资产化进程与全球微生物公地圈占联系起来，分析保藏中心在生物技术产业全球化中的双重角色 | 未解决全球异地保护基础设施分布不均及微生物价值生成的不对称问题，遗漏2010年名古屋议定书后的实质性进展 | 揭示微生物资源从公共物品向资产化转变的过程及其对保护、商业和全球治理的影响 | 欧洲、美洲、亚洲的微生物培养物保藏中心及世界培养物保藏联合会 | 数字病理学 | NA | 测序技术、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | NA | 工业生物技术、农业、环境 |
| 48 | 2026-05-27 |
Molecular mechanisms of plant thermal response: from signal transduction and epigenetic regulation to signaling integration
2026-Mar-27, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2026.03.018
PMID:41903742
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综述 | 综述植物对中度和急性热胁迫响应分子机制的最新进展，重点关注表观遗传调控与信号网络的整合 | 整合了光信号、昼夜节律和激素信号通路交叉调控的转录因子PIF4与HSFA1s，以及组蛋白变体H2A.Z动力学和siRNA依赖的跨代表观遗传热记忆机制 | 温度感知、HSFA1s激活动态及胁迫信号整合等根本问题尚未解决 | 揭示植物热适应机制，为气候智能型作物提供理论基础和分子育种策略 | 植物热响应信号转导与表观遗传调控 | 数字病理学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 植物 | NA | 农业 |
| 49 | 2026-05-17 |
Engineering ligands for theophylline riboswitches expands its regulatory dynamic range in prokaryotic and eukaryotic systems
2026-Mar-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70870-w
PMID:41872214
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研究论文 | 通过结构设计合成4-喹唑啉酮衍生物，显著提升茶碱核糖开关在原核和真核系统中的调控动态范围 | 首次通过结构导向方法设计合成4-喹唑啉酮衍生物，使茶碱适配体结合亲和力提升30倍，基因表达动态范围在细菌中达到380倍 | 未说明 | 提升茶碱核糖开关的调控动态范围，以增强生物技术应用中基因调控的精确性 | 茶碱核糖开关及其在细菌、分枝杆菌和真核系统中的调控性能 | 合成生物学 | 未适用 | 结构导向配体设计、核糖开关调控 | 未适用 | 未适用 | 未适用 | CRISPR-Cas9 | 细菌、分枝杆菌、真核细胞 | 核糖开关介导的条件性基因表达 | 生物医学工程 |
| 50 | 2026-05-16 |
Jumping Over Hurdles: Challenges and Solutions in Phage Therapy
2026-Mar, PHAGE (New Rochelle, N.Y.)
DOI:10.1177/26416549251409584
PMID:42130959
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综述 | 综述了噬菌体疗法在应对抗生素耐药性中的潜力、现有进展及面临挑战 | 总结了基因组学、合成生物学和CRISPR技术对噬菌体工程的推动作用，以及个性化噬菌体疗法基于微生物组特征的应用前景 | 存在监管障碍、安全性问题及噬菌体耐药性出现等挑战，且缺乏标准化临床试验验证疗效 | 评估噬菌体疗法作为抗生素替代方案的现状、进展与未来发展路径 | 噬菌体及其在抗感染治疗中的应用 | NA | 慢性多药耐药感染 | CRISPR相关蛋白9、合成生物学、基因组学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 工程化噬菌体（广宿主范围、改良安全性）、噬菌体文库 | 医学 |
| 51 | 2026-05-15 |
Functional organization and regulatory logic of the ped gene cluster in Pseudomonas species
2026-03-18, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.00046-26
PMID:41705821
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综述 | 综述了假单胞菌属中ped基因簇的功能组织与调控逻辑 | 首次系统整合假单胞菌属中ped基因簇的遗传组织、酶学功能和多层调控机制，并比较了不同物种间的进化保守性与适应性差异 | 未涉及实验验证，主要基于现有文献的总结与分析 | 建立ped基因簇作为模块化平台在应用微生物学中的参考框架 | 假单胞菌属中的ped基因簇及其编码的PQQ依赖性脱氢酶 | 合成生物学, 环境微生物学 | NA | 比较基因组学, 信号转导网络分析 | NA | 基因序列, 调控元件 | NA | NA | 假单胞菌属（KT2440和PAO1） | 基于PQQ依赖性脱氢酶的氧化途径，包含调节组件（如Fe依赖的YiaY脱氢酶和PP_2683组氨酸激酶） | 合成生物学, 环境修复, 生物生产 |
| 52 | 2026-05-12 |
Research Progress and Prospects of Open-Chain Flavonoid Biosynthesis
2026-03-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00926
PMID:41810537
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综述 | 本文综述了开链黄酮类化合物的结构特征、分类、生物合成途径及催化机制，并探讨了代谢工程和微生物生产策略的研究进展与未来展望 | 系统总结了开链黄酮类化合物的生物合成逻辑、催化机制及调控特征，并强调了新兴的代谢工程和合成生物学方法在该领域的应用 | 未提及具体实验验证或定量分析结果，对开链黄酮类化合物的药理活性及应用潜力仅作简要提及 | 总结开链黄酮类化合物的生物合成研究进展，并展望其未来在代谢工程和生物技术中的应用 | 开链黄酮类化合物及其生物合成途径中的酶与调控元件 | NA | NA | 代谢组学、结构酶学、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 药物开发、生物技术 |
| 53 | 2026-05-08 |
3D Expansion-PALM (PhotoActivated Localization Microscopy) Dissects Protein-Protein Interactions Down to the Molecular Scale in Bacteria
2026-Mar-28, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms14040772
PMID:42075168
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研究论文 | 通过结合膨胀显微镜和光激活定位显微镜，在细菌中实现约3纳米空间分辨率的双色三维单分子定位，用于研究蛋白质-蛋白质相互作用 | 优化细菌中的膨胀显微镜方案实现4倍各向同性膨胀，最小化色差和信号串扰，通过高选择性斜入射照明提高单分子灵敏度 | NA | 发展一种有效方法，用于原核生物和高密度样品中分子组织的研究 | 参与组氨酸生物合成的HisF和HisH蛋白质 | 计算机视觉 | NA | 三维膨胀光激活定位显微镜 | NA | 图像 | 细菌细胞中的HisF和HisH蛋白质 | NA | 细菌 | NA | 微生物学, 合成生物学, 细胞生物物理学 |
| 54 | 2026-05-04 |
Decoding nucleic acid contributions to phase separation and ordering in biomolecular condensates
2026-Mar-19, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag253
PMID:41909948
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研究论文 | 研究核酸在生物分子凝聚体中调控相分离和有序化的作用 | 系统揭示了核酸长度和杂交程度对相变行为的影响，并提出生物凝聚体稳定性的评价指标，同时表征液晶有序形成的条件 | 仅关注模型系统（寡核苷酸与中度电荷无序肽的混合），未涉及天然复杂环境中的多组分相互作用 | 填补核酸在液-液相分离中作用的研究空白，指导合成含核酸凝聚体的设计 | 具有不同长度和杂交程度的寡核苷酸与中度电荷无序肽的混合体系 | 计算生物学 | NA | 分子动力学模拟 | NA | 实验数据与模拟轨迹 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 生物医学 |
| 55 | 2026-05-04 |
Programmable, target-induced fluorogenic CRISPR-tDeg platform for live-cell RNA visualization
2026-Mar-19, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag279
PMID:41909946
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研究论文 | 开发了一种名为CtDeg的模块化RNA成像平台，通过目标诱导荧光和degron介导的降解机制实现活细胞RNA的高特异性可视化 | 首次将Pepper RNA基序嵌入crRNA支架，利用degron介导的降解有效抑制背景信号，实现目标RNA识别驱动的荧光激活，显著提高信噪比 | 未提及具体的局限性 | 开发一种低背景、高特异性的活细胞RNA成像平台 | 活细胞中的RNA分子，包括paraspeckle装配动态和SARS-CoV-2基因组RNA | 合成生物学 | NA | CRISPR-dCas13, 荧光成像 | NA | 图像 | NA | CRISPR-Cas13, degron | 哺乳动物细胞 | 目标诱导荧光CRISPR-tDeg电路 | 合成生物学, RNA生物学 |
| 56 | 2026-04-30 |
Radiation-Responsive Promoters: Molecular Mechanisms, Screening Strategies, and Translational Applications as Radiation Biomarkers
2026-Mar-26, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb48040348
PMID:42042008
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综述 | 系统分析了辐射响应启动子的分子机制、筛选策略及其作为辐射生物标志物的转化应用 | 首次将辐射响应启动子分为五大类并系统比较其调控逻辑、剂量响应特征及临床部署证据，提出了区分生物标志物导向与工具导向的报告基因系统的双轨框架 | 缺乏临床级验证、标准化剂量响应曲线缺失、可重复性不足 | 系统梳理辐射响应启动子的分子机制与筛选策略，评估其在辐射生物标志物开发中的转化潜力 | 辐射响应启动子 | 数字病理学 | NA | 功能基因组学与转录组学、表观遗传修饰分析、合成生物学启动子工程 | NA | 文本 | NA | 合成生物学启动子工程 | NA | 辐射响应启动子回路 | 医学 |
| 57 | 2026-04-29 |
Single Molecule Force Measurements Reveal Energy Stabilization of Theophylline Aptamer RNA Switch Required for Gene Control
2026-Mar-25, ACS physical chemistry Au
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsphyschemau.5c00109
PMID:41909145
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研究论文 | 利用单分子力谱测量茶碱适体RNA开关的能量稳定化机制及其在基因调控中的作用 | 首次通过光镊单分子力谱技术量化了茶碱结合对RNA适体折叠动力学的影响，发现茶碱通过稳定结构而非诱导构象重排来调控基因表达 | 未提及实验局限性或应用中的潜在挑战 | 揭示茶碱适体RNA开关的折叠动力学和能量稳定化机制，为合成生物学中适体工具的设计提供依据 | 茶碱适体RNA | 合成生物学 | NA | 光镊单分子力谱（optical tweezers single-molecule force spectroscopy） | NA | 单分子力曲线 | 单分子级别的RNA分子样本 | NA | NA | 茶碱适体RNA开关（theophylline aptamer RNA switch） | 合成生物学, 医学（治疗） |
| 58 | 2026-04-28 |
Exploring the chemical diversity of Dictyostelium secondary metabolites and their biological implications
2026-Mar-10, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-026-04742-8
PMID:41805866
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综述 | 详细介绍盘基网柄菌次级代谢产物的化学多样性及其生物学意义 | 首次全面总结了盘基网柄菌中独特的次级代谢产物化学多样性，包括其他微生物来源中未发现的稀有骨架化合物，并揭示了多酮合酶和萜烯合酶基因家族在代谢多样性中的作用 | 未提及具体的研究局限性，可能受限于现有基因组数据的不完整性和代谢产物产出量的优化问题 | 探索盘基网柄菌次级代谢产物的化学多样性及其在药物发现中的潜在应用 | 盘基网柄菌的次级代谢产物，包括多酮类、萜类、生物碱、酚类和肽类等 | 天然产物化学 | NA | 色谱法, 光谱法, 化学合成, 基因组挖掘 | NA | 文本, 化学结构数据 | NA | NA | 盘基网柄菌 | NA | 医学, 药学 |
| 59 | 2026-04-28 |
From machine learning to multimodal models: The AI revolution in enzyme engineering
2026-Mar, Biodesign research
DOI:10.1016/j.bidere.2025.100044
PMID:42038007
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综述 | 本文系统回顾了人工智能在酶工程中的发展，从传统机器学习到多模态模型，并提供了当前酶工程任务的指导图景 | 提出了AI在酶工程中演进的四个阶段（经典机器学习、深度神经网络、蛋白质语言模型和多模态架构），并总结了重塑该领域的四大趋势，包括从手工特征到统一嵌入、从单模态到多模态系统的转变等 | 作为综述，未提出新的实验方法或数据，可能未涵盖所有最新研究进展 | 提供AI在酶工程中应用的整合视角，包括模型类型、关键任务和数据资源 | 酶工程任务，包括功能注释、结构建模和性质预测 | 机器学习 | NA | NA | 经典机器学习算法、深度神经网络、蛋白质语言模型、多模态架构 | 蛋白质序列与结构数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、生物催化、药物发现 |
| 60 | 2026-04-25 |
From Gene Knockouts to Genome Remodeling: Large DNA Fragment Deletion Technologies in Plants
2026-Mar-15, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants15060909
PMID:41901428
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综述 | 系统比较植物中用于大DNA片段删除（LDFD）的主要技术，包括ZFNs、TALENs、CRISPR/Cas系统、位点特异性重组酶、转座子系统及引物编辑衍生策略，并讨论当前瓶颈与未来方向 | 首次全面比较植物中多种LDFD技术的机制与效率，强调植物特异性染色质组织和DNA修复对删除效果的约束，并展望AI辅助设计核酸酶与重组酶等新方向 | NA | 综述植物中大DNA片段删除技术的现状、瓶颈及未来发展方向，以推动功能基因组学与理性基因组设计 | 植物中已应用的大DNA片段删除技术 | NA | NA | ZFNs, TALENs, CRISPR/Cas系统（Cas9、Cas12a、Cas3），位点特异性重组酶，转座子系统，引物编辑衍生策略 | NA | NA | NA | ZFNs, TALENs, CRISPR-Cas9, CRISPR-Cas12a, CRISPR-Cas3, 位点特异性重组酶, 转座子系统, 引物编辑衍生策略 | 植物 | NA | 农业， 工业生物技术 |