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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2026-06-29 |
Bioorthogonal chemistry-driven multi-enzyme strategy for efficient terpenoid biosynthesis
2026-Jun-24, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.135232
PMID:42341954
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研究论文 | 开发了一种基于生物正交化学的体外多酶级联策略,用于高效合成萜类化合物 | 利用生物正交蛋白质配对技术将六个缩短的甲羟戊酸途径酶组装成有序交联酶复合物,实现了空间有序组织,并展示出模块化设计和通用适用性 | 目前仅测试了β-法尼烯和紫杉二烯两种产物,且仍存在一定酶活性损失(保留62±9%) | 开发一种高效、可重复使用的体外萜类生物合成平台 | β-法尼烯合酶和紫杉二烯合酶相关的多酶级联系统 | 合成生物学 | 不适用 | 生物正交化学、多层荧光标记技术 | 不适用 | 不适用 | 单个实验重复测量8次(n=8) | 生物正交蛋白质配对 | 大肠杆菌 | 有序交联酶复合物(甲羟戊酸途径级联) | 工业生物技术, 医药 |
| 42 | 2026-06-29 |
Recent advances in protein engineering and synthetic applications of amino acid oxidases
2026-Jun-23, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.135229
PMID:42336113
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综述 | 系统综述了氨基酸氧化酶的催化机制、蛋白质工程改造策略及合成应用进展 | 首次全面整合定向进化、理性/半理性设计及AI引导等蛋白质工程策略在氨基酸氧化酶改造中的应用,并系统总结其在化学酶级联反应、多酶级联去消旋化和动力学拆分等拓展合成应用 | 部分新兴蛋白质工程策略(如AI引导方法)的实际应用案例有限,缺乏大规模工业应用验证 | 总结氨基酸氧化酶的催化机制和活性测定方法,阐述蛋白质工程改造策略(包括定向进化、理性/半理性和AI引导方法)及其在合成生物学中的应用进展 | 氨基酸氧化酶(D型和L型) | 蛋白质工程 | NA | 蛋白质工程, 定向进化, 理性设计, AI引导方法 | NA | NA | NA | NA | NA | 化学酶级联反应, 多酶级送去消旋化, 动力学拆分 | 制药, 农用化学品, 工业生物技术 |
| 43 | 2026-06-29 |
Nanofluidics for Pioneering Synthetic Biology of Bottom-Up Cell-Free Molecular Systems
2026-Jun-12, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00178
PMID:42284545
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perspective | 提出纳米流体学作为变革性平台,推动自下而上无细胞分子系统合成生物学的发展 | 利用纳米限域效应和精准质量传输,实现分子构建块的有序时空组装,突破传统无细胞系统随机性限制 | NA | 探索纳米流体学在自下而上无细胞分子系统合成生物学中的应用前景 | 纳米流体装置及分子构建块 | 合成生物学 | NA | 纳米流体技术 | NA | NA | NA | NA | NA | 无细胞分子系统 | 合成生物学 |
| 44 | 2026-06-28 |
Better synthetic biology outcomes through balanced push-pull engineering
2026-Jun-26, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiag437
PMID:42361298
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 45 | 2026-06-28 |
Enzyme fusion-based enhancement of ene-reductase activity for chiral α-substituted carboxylic acid production
2026-Jun-25, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.153204
PMID:42349580
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研究论文 | 通过酶融合策略构建烯还原酶与醛脱氢酶的融合酶,提高手性α-取代羧酸的生物合成效率 | 首次采用刚性连结肽(EAAAK)₂将烯还原酶与醛脱氢酶进行正向融合,显著提升底物还原活性及级联催化的产率 | 仅针对一种底物和融合配置进行了验证,未探索不同连接肽和酶组合在其他底物合成中的普适性 | 优化多酶级联反应动力学不平衡,实现高效生物合成手性α-取代羧酸 | 烯还原酶与醛脱氢酶融合蛋白构建及其在α-甲基氢肉桂酸合成中的应用 | 合成生物学 | NA | 融合蛋白构建、分子动力学模拟、动力学分析 | NA | 序列数据、动力学参数、模拟结果 | 未明确说明样本数量,但涉及多种融合酶变体及自由酶的比较 | 酶融合技术、连接肽设计 | 大肠杆菌 | 多酶级联反应(烯还原酶-醛脱氢酶融合) | 制药、农业 |
| 46 | 2026-06-28 |
Editorial for the Special Issue "Advances in Metabolic Engineering of Industrial Microorganisms"
2026-Jun-20, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms14061368
PMID:42354992
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社论 | 该社论总结了工业微生物代谢工程领域的最新进展,涵盖合成生物学、CRISPR基因组编辑、系统生物学和高通量组学技术的融合 | 强调了合成生物学与CRISPR技术的结合对代谢工程的变革性推动作用,但未提出具体创新点 | 作为社论,内容为概述性总结,缺乏具体研究细节和实验验证 | 回顾和展望工业微生物代谢工程领域的技术进展与应用前景 | 工业微生物 | 合成生物学 | NA | CRISPR基因组编辑, 高通量组学技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 工业微生物 | 代谢途径 | 工业生物技术 |
| 47 | 2026-06-28 |
Metabolic Pathways and Molecular Regulatory Mechanisms of Nervonic Acid Biosynthesis in Malania oleifera
2026-Jun-18, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27125507
PMID:42353223
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综述 | 系统总结了蒜头果中神经酸生物合成的代谢途径及分子调控机制 | 综合多组学数据分析了关键酶KCS基因家族的进化关系和共线性分布,并探讨了转录调控网络和表观遗传调控 | 未涉及实验验证,主要基于已有文献和数据分析 | 为蒜头果的保护、分子育种和生物技术利用提供理论基础,推动可持续神经酸生产 | 蒜头果中的神经酸生物合成途径 | 分子生物学、合成生物学 | NA | 多组学分析 | NA | 多组学数据 | NA | NA | 蒜头果 | 神经酸生物合成代谢途径 | 医学, 农业, 工业生物技术 |
| 48 | 2026-06-28 |
Microbial α-L-Rhamnosidases: Regioselective Biocatalysts for Flavonoid Biotransformation and Nutraceutical Applications
2026-Jun-16, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb48060625
PMID:42353629
|
综述 | 本文概述了微生物α-L-鼠李糖苷酶在食品生物技术和营养保健品生产中的选择性催化作用 | 首次系统区分α-(1→2)和α-(1→6)连接底物,总结重组酶平台、固定化生物催化剂及宏基因组学、合成生物学和AI辅助蛋白质工程的新机遇 | 未提供实验数据验证,主要依赖文献综述,缺乏对工业应用经济性和规模化挑战的深入分析 | 总结微生物α-L-鼠李糖苷酶的来源、催化机制、底物特异性、结构功能关系及在功能食品和靶向营养保健品中的应用 | 微生物α-L-鼠李糖苷酶及其催化的类黄酮生物转化 | NA | NA | 重组酶平台、固定化生物催化剂、宏基因组学、AI辅助蛋白质工程 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 微生物 | NA | 食品, 营养保健品 |
| 49 | 2026-06-28 |
Next-Generation Bionic Sensors for Small Molecule Detection: Integrating Synthetic Biology, Nanomaterials, and Artificial Intelligence
2026-Jun-15, Micromachines
IF:3.0Q2
DOI:10.3390/mi17060725
PMID:42354756
|
综述 | 综述了整合合成生物学、纳米材料和人工智能的下一代仿生传感器在小分子检测中的最新进展 | 提出了通过合成生物学、纳米材料和人工智能的集成来解决小分子检测中准确性和选择性挑战的新视角 | 讨论了AI驱动系统的可扩展性、成本、数据可靠性和伦理问题等关键挑战 | 提供一个以问题为导向的视角,展示下一代仿生传感器如何克服当前限制,实现实际应用中的小分子检测 | 小分子检测、仿生传感器技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 环境监测, 食品安全 |
| 50 | 2026-06-28 |
Global Probiotic Markets Meet Synthetic Biology: Translational Challenges and Escherichia coli Nissle 1917 as a Model Chassis
2026-Jun-11, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms14061306
PMID:42354930
|
综述 | 探讨全球益生菌市场与合成生物学的交叉,以大肠杆菌Nissle 1917作为模型底盘分析转化挑战 | 首次将全球益生菌市场扩张与活体生物治疗产品开发联系起来,并以大肠杆菌Nissle 1917为范例讨论工程化策略 | 仅关注单一菌株模型,未涵盖其他潜在益生菌底盘;市场分析缺乏定量数据支持 | 分析益生菌市场与合成生物学结合中的转化障碍与治疗机遇 | 大肠杆菌Nissle 1917工程化益生菌 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | Escherichia coli Nissle 1917 | 可编程微生物平台(感应疾病信号并产生治疗输出) | 医学, 工业生物技术 |
| 51 | 2026-06-28 |
Design and Implementation of a Blue-Light-Controlled Gene-Switch System
2026-Jun-10, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules31122032
PMID:42357431
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研究论文 | 开发了一种具有双输入调控的蓝光诱导T7RNAP系统,实现精准时空基因控制 | 通过RBS序列替换、串联T7启动子和split-T7RNAP变体优化,并结合苯甲酸响应模块实现化学关闭开关,实现了蓝光精准调控与环境响应性的结合 | 苯甲酸浓度较高(3 mM)才能实现有效关闭,可能限制实际应用 | 开发非侵入性、按需激活的基因开关系统,用于抗菌治疗及空间生物生产 | 蓝光诱导T7RNAP系统及其变体 | 合成生物学 | NA | 蓝光诱导, 荧光输出, 实时生长曲线 | NA | 荧光输出数据, 生长曲线数据 | RBS变体、串联T7启动子、split-T7RNAP变体及苯甲酸响应模块的实验组合 | RBS序列替换, 串联T7启动子, split-T7RNAP, 苯甲酸响应模块 | 大肠杆菌 | 蓝光诱导基因开关系统,包含T7RNAP、串联T7启动子、苯甲酸响应关闭模块 | 医学, 环境, 工业生物技术 |
| 52 | 2026-06-26 |
Toward synthetic biology in mushroom-forming Agaricomycete fungi: from tools to applications
2026-Jun-25, Microbiology and molecular biology reviews : MMBR
IF:8.0Q1
DOI:10.1128/mmbr.00178-25
PMID:42233661
|
综述 | 回顾了蘑菇形成型伞菌纲真菌合成生物学的研究进展,并概述了限制可预测基因工程的主要障碍 | 强调了蘑菇生物学特有的工程限制,包括复杂的有性周期、异核现象以及转化和生长过程中的菌株不稳定性,并提出了该领域优先发展方向 | 尚未全面解决基因表达瓶颈,如启动子和终止子表征不足、基因组致密性导致的基因整合挑战以及内含子和特定序列基序的影响 | 推动伞菌纲真菌作为可持续生物制造、设计生物材料、气候解决方案和真菌生物学机制研究的可编程平台 | 蘑菇形成型伞菌纲真菌 | 合成生物学 | NA | 基因编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 伞菌纲真菌 | NA | 可持续生物制造, 设计生物材料, 气候解决方案, 真菌生物学 |
| 53 | 2026-06-26 |
[Research progress in inducible expression regulation systems in photosynthetic cyanobacteria]
2026-Jun-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.260030
PMID:42343792
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综述 | 综述了光合蓝细菌中诱导型表达调控系统的研究进展 | 系统比较了化学诱导系统和光遗传控制系统在多种蓝细菌菌株中的适用性及调控特性,并展望了通过合成生物学构建新型诱导表达系统、模块化调控电路和环境响应表达系统的未来趋势 | 未提供实验数据验证各系统性能差异的定量比较 | 总结并分析蓝细菌中诱导型基因表达调控系统的研究现状,为构建更高效、可控且环境友好的基因表达调控系统提供参考 | 光合蓝细菌中的诱导型表达调控系统,包括化学诱导系统和光遗传控制系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学方法 | 光合蓝细菌 | 诱导型表达系统、光遗传控制系统、模块化调控电路、环境响应表达系统 | 绿色生物制造 |
| 54 | 2026-06-26 |
[Advances in genome editing technologies in Komagataella phaffii and their applications in biomanufacturing]
2026-Jun-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.250908
PMID:42343789
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综述 | 系统总结了Komagataella phaffii中基因组编辑技术的发展历程及其在生物制造中的应用 | 全面梳理了从传统重组方法到下一代精确编辑工具的演变,重点介绍了CRISPR/Cas系统的最新进展、优化策略和工程实践 | 未明确提及具体局限性,但指出了提高编辑效率、快速组装复杂代谢途径和加速工业转化等方面的挑战与机遇 | 为Komagataella phaffii的理性工程改造及其在合成生物学和生物制造中的广泛应用提供参考 | Komagataella phaffii | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas,基因组编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | Komagataella phaffii | NA | 工业生物技术,生物制造 |
| 55 | 2026-06-26 |
[Neo-chemical industry: a new perspective for understanding biomanufacturing industry]
2026-Jun-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.260154
PMID:42343785
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评论文章 | 引入‘新化工’视角重新理解生物制造产业,分析其工业化挑战与战略路径 | 将生物制造重新定义为合成生物学驱动的化工产业范式重构,构建了涵盖原料、工艺和技术的三维分析框架 | 基于单一案例(l-丙氨酸厌氧发酵)进行理论推导,缺乏对不同类型生物制造过程的系统验证 | 澄清生物制造产业性质,提供理解其本质和价值的直观框架 | 生物制造产业及其工业化过程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术, 环境, 材料 |
| 56 | 2026-06-26 |
Engineering growth independent production: programmable control loops for high-titer rhamnolipids for improved green surfactant sustainability
2026-Jun-25, Bioprocess and biosystems engineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1007/s00449-026-03375-x
PMID:42347958
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综述 | 综合讨论了鼠李糖脂生物表面活性剂的工程化生产进展,重点关注生长非依赖型生产、高产策略及可持续性 | 将代谢途径优化与生长-生产解耦的动态调控系统相结合,并整合了过程强化技术,为工业部署提供技术经济与生命周期评估框架 | 识别了代谢图谱与规模放大实施之间的关键研究空白,但未提供具体实验验证数据 | 提高鼠李糖脂产量、速率和收益率(TRY),降低下游回收成本,解决生物安全性限制,推动绿色表面活性剂商业化 | 鼠李糖脂生物表面活性剂的生产工艺与工程化策略 | 合成生物学、工业生物技术 | NA | 代谢工程、高通量细胞培养、原位泡沫控制、膜分离 | NA | 文本综述数据 | NA | 代谢途径优化、辅因子再平衡、动态调控系统 | NA | 生长非依赖型生产调控回路(如动态开关、反馈控制系统) | 农业、个人护理、环境修复、医疗保健 |
| 57 | 2026-06-26 |
Transcription Factors: A Promising Third-Generation Core Sensing Element for Developing Low-Cost, On-Site Rapid Detection Technologies for Food Contaminants
2026-Jun-24, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c14507
PMID:42262033
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综述 | 综述了转录因子作为第三代核心传感元件在开发低成本、现场快速检测食品污染物技术中的应用 | 提出了近端诱变策略并整合人工智能辅助分析来优化转录因子及其DNA结合位点 | 仍面临优化和实际应用挑战,具体局限性未详细说明 | 总结转录因子在食品安全监测中的传感应用及其工程化进展 | 转录因子及其用于检测食品中小分子和重金属离子的传感器平台 | 机器学习(与合成生物学交叉) | NA | 转录因子工程, 人工辅助分析 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 微生物系统 | 生物传感器 | 食品安全 |
| 58 | 2026-06-26 |
Bioengineered bacteria in cancer immunotherapy: mechanistic advances, therapeutic strategies and clinical potential
2026-Jun-24, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-026-05030-1
PMID:42340392
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综述 | 综述工程化细菌在癌症免疫治疗中的机制进展、治疗策略和临床潜力 | 系统地总结了合成生物学、基因工程和物理化学修饰手段设计可编程细菌系统的最新进展,并阐述了化学、物理和生物修饰细菌与多种疗法的多模态协同效应 | 免疫清除、遗传稳定性、毒性风险和肿瘤微环境异质性限制了临床转化 | 综述工程化细菌在癌症免疫治疗中的进展,为下一代持久个性化活体治疗设计提供见解 | 工程化细菌 | 合成生物学 | 癌症 | 合成生物学、基因工程、物理化学修饰 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN | 细菌 | 群体感应电路、缺氧响应启动子、毒性减退、配体-受体靶向 | 医学 |
| 59 | 2026-06-26 |
Microbial Degradation of Plastics: Mechanisms, Pathways, and Multiomics Insights
2026-06-23, Environmental science & technology
IF:10.8Q1
DOI:10.1021/acs.est.6c02515
PMID:42258349
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review | 综述了微生物降解塑料的机制、途径及多组学见解 | 整合了微生物分类学、酶解聚和多组学功能分析,提出了连接微生物特性与塑料降解四个关键阶段的框架,并批判性评估了降解指标的稳健性和可比性 | 现有研究碎片化,降解效率、机制和实际应用报告不一致,聚合物特性、实验条件和评估方法的变异性严重阻碍了跨研究比较和实验室向实际应用的转化 | 梳理微生物降解塑料的最新进展,弥合实验室发现与实际生物降解策略之间的差距 | 塑料降解微生物及相关酶 | NA | NA | 多组学分析 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 合成微生物联合体 | 环境 |
| 60 | 2026-06-26 |
RATEX: A Scalable RNA-Based Platform for Logical and Multi-Layered Cellular Programming
2026-06-22, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202520600
PMID:42083989
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研究论文 | 介绍了一种可扩展的基于RNA的逻辑和多层细胞编程平台RATEX | 通过整合翻译到转录的转换器与合成RNA调控因子,实现了紧凑且可扩展的RNA编程电路架构,能够利用大型翻译调控因子库和核糖体介导的环境输入感知,实现多输入逻辑处理与信号放大 | 构建具有宽动态范围和多重调控级联的合成RNA电路仍然具有挑战性 | 开发可扩展的遗传电路以实现活细胞中的复杂功能 | RNA调控因子和核糖体介导的传感机制 | 合成生物学 | NA | RNA调控 | NA | NA | NA | RATEX平台 | 活细胞 | 逻辑门(6输入OR逻辑门、混合3输入逻辑门、3输入AND门),信号放大级联 | 合成生物学, 生物技术 |