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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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41 | 2025-07-19 |
Expression of Fluorescence Reporters and Natural Products in Native Gut Escherichia coli
2025-05-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00835
PMID:40138712
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研究论文 | 本研究利用CRAGE技术对肠道天然大肠杆菌菌株EcAZ-1和益生菌株Nissle 1917进行基因工程改造,成功表达了多种异源基因并优化了荧光蛋白的表达条件 | 首次在天然肠道大肠杆菌中成功表达多种荧光报告基因和生物活性化合物,展示了其作为合成生物学平台的潜力 | 仅测试了两种大肠杆菌菌株,结果可能无法推广到其他肠道菌株 | 开发基于天然肠道细菌的治疗应用平台 | 肠道天然大肠杆菌菌株EcAZ-1和益生菌株Nissle 1917 | 合成生物学 | NA | CRAGE技术 | NA | 基因表达数据 | 2种大肠杆菌菌株 |
42 | 2025-07-19 |
Next-generation probiotics and engineered BEVs for precision therapeutics in osteoporosis
2025, Frontiers in nutrition
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fnut.2025.1581971
PMID:40667443
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综述 | 本文综述了利用下一代益生菌和工程化细菌外膜囊泡(BEVs)进行骨质疏松精准治疗的潜力 | 提出结合工程化益生菌和BEV技术的新型治疗策略,通过靶向肠道-骨骼轴提供骨保护作用 | 标准化和安全性方面仍存在挑战 | 探索基于微生物组的干预措施在骨质疏松治疗中的应用 | 骨质疏松患者 | 精准医疗 | 骨质疏松症 | 合成生物学、工程化BEVs | NA | NA | NA |
43 | 2025-07-19 |
Iterative deep learning-design of human enhancers exploits condensed sequence grammar to achieve cell type-specificity
2024-Jun-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.14.599076
PMID:38915713
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研究论文 | 本文应用迭代深度学习设计具有特定细胞类型活性的合成增强子 | 利用迭代深度学习方法设计合成增强子,实现细胞类型特异性,并通过实验验证和优化提高了增强子的特异性 | 研究仅针对两种人类细胞系,可能不适用于其他细胞类型 | 解决合成生物学中如何靶向特定细胞类型基因表达的问题 | 人类细胞系中的合成增强子 | 合成生物学 | NA | 深度学习 | NA | 基因组序列数据 | 两种人类细胞系 |
44 | 2025-07-18 |
Improved biosynthesis of C4 derivatives by engineered thiolase
2025-Sep, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2025.05.001
PMID:40320002
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研究论文 | 本研究通过工程化改造硫解酶,开发了一种利用大肠杆菌从乙二醇等二碳底物生物合成四碳化合物的新代谢途径 | 通过定向进化改造Cupriavidus necator的β-酮酰基硫解酶B(CnBktB),显著提高了其对glycolyl-CoA和acetyl-CoA的催化效率,并开发了可直接利用PET衍生的乙二醇的上游模块 | NA | 开发可持续的生物制造路线,将PET衍生的乙二醇转化为高价值的四碳化合物 | 大肠杆菌(Escherichia coli)和Cupriavidus necator的β-酮酰基硫解酶B(CnBktB) | 合成生物学 | NA | 定向进化、代谢工程 | NA | NA | NA |
45 | 2025-07-18 |
Engineering genetic circuits for dynamic control of central metabolism
2025-Sep, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2025.06.007
PMID:40532756
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研究论文 | 本研究开发了一种响应丙酮酸的PdhR生物传感器系统,用于动态调控微生物细胞工厂中中心代谢的代谢流分布,以提高有价值化合物的生产性能 | 建立了PdhR生物传感器系统,能够动态调控中心代谢的代谢流分布,并通过筛选多种PdhR同源物和计算分析优化了生物传感器性能 | 大多数遗传工具具有途径或中间体特异性,限制了其在合成生物学中的广泛应用,且其在平衡细胞生长和产物形成之间的代谢流潜力尚未充分探索 | 开发能够动态调控中心代谢的遗传调控工具,以提高微生物细胞工厂中有价值化合物的生产性能 | 微生物细胞工厂中的中心代谢 | 合成生物学 | NA | 生物传感器系统、定点诱变 | NA | NA | NA |
46 | 2025-07-18 |
Codes across (life)sciences
2025-Aug, Bio Systems
DOI:10.1016/j.biosystems.2025.105515
PMID:40490067
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综述 | 本文探讨了“代码”在不同学科中的概念、意图和形式化,特别是在生物学中的多样性和作用 | 跨学科的代码科学家团队试图捕捉代码研究的大图景,为基于代码的统一生命理论铺平道路 | 代码的概念在不同学科中形式化和含义的多样性可能导致理解上的模糊性 | 探索代码在生命科学中的角色及其跨学科影响 | 代码在生物学、心理学、文化等领域的应用和影响 | 跨学科研究 | NA | NA | NA | NA | NA |
47 | 2025-07-18 |
Integrating metagenomics and high-throughput screening for bioprospecting marine producers of Polyhydroxyalkanoates
2025-Jul-17, Letters in applied microbiology
IF:2.0Q4
DOI:10.1093/lambio/ovaf096
PMID:40674061
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研究论文 | 本研究通过宏基因组分析和高通量筛选技术,探索海洋环境中生产聚羟基脂肪酸酯(PHAs)的微生物资源 | 开发了结合微孔板技术和荧光定量分析的高通量筛选平台,并发现了一株具有高PHA生产潜力的新菌株Halomonas olivaria | 研究中仅从特定海洋环境中分离了102株PHA生产菌株,可能未涵盖所有潜在的高产菌种 | 推动生物可降解生物聚合物的工业化生产 | 海洋环境中的微生物群落及其PHA生物合成功能 | 生物技术 | NA | 宏基因组分析、高通量筛选、气相色谱(GC)定量 | NA | 宏基因组数据、荧光定量数据 | 102株PHA生产菌株,来自不同海洋生境 |
48 | 2025-07-18 |
Progress in the Biosynthesis of Cosmetic Ingredients through Engineering of Saccharomyces cerevisiae
2025-Jul-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00199
PMID:40670299
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综述 | 本文综述了通过工程化酿酒酵母生物合成化妆品成分的最新进展 | 探讨了人工智能和机器学习在菌株设计和过程控制中的应用,以克服代谢瓶颈和扩大生产规模 | 面临代谢负担等挑战 | 推动化妆品行业向天然和可持续成分发展 | 酿酒酵母 | 合成生物学 | NA | 遗传和代谢工程、途径模块化、发酵优化 | NA | NA | NA |
49 | 2025-07-18 |
Monodisperse Giant Unilamellar Niosomes as Minimal Synthetic Cells
2025-Jul-16, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c09950
PMID:40670353
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研究论文 | 本文介绍了一种基于非离子表面活性剂的巨型单层囊泡(GUNs),作为合成细胞的稳健、经济平台 | 提出巨型单层囊泡(GUNs)作为新型合成细胞模型,具有优异的膜流动性和对小分子及质子的选择性通透性,无需嵌入转运蛋白 | 未提及长期稳定性或在复杂生物环境中的表现 | 开发一种更稳定、经济且具有优异膜特性的合成细胞模型 | 巨型单层囊泡(GUNs) | 合成生物学 | NA | 微流控技术 | NA | NA | NA |
50 | 2025-07-18 |
Microbial strategies on polyhydroxyalkanoates production from food waste to support the circular bioeconomy
2025-Jul-14, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.146023
PMID:40669653
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研究论文 | 本文探讨了利用微生物策略从食物垃圾中生产聚羟基脂肪酸酯以支持循环生物经济的方法 | 强调了代谢工程和合成生物学在聚羟基脂肪酸酯生产中的应用 | 需要进一步深入研究微生物策略 | 探索食物垃圾的高效利用以支持循环生物经济 | 食物垃圾和聚羟基脂肪酸酯 | 生物工程 | NA | 代谢工程和合成生物学 | NA | NA | NA |
51 | 2025-07-18 |
Polymer sailing on rafts within lipid membranes
2025-Jul-08, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2503203122
PMID:40608678
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研究论文 | 研究了线性聚合物在二元脂质膜上的动力学,揭示了聚合物吸附对脂质筏的诱导和稳定作用 | 发现纳米尺寸聚合物优先吸附于膜筏形成组分,诱导并稳定单个脂质筏,同时聚合物受到动态限制,表现出独特的扩散行为 | 研究主要基于模拟和单分子追踪实验,可能无法完全反映真实细胞膜的复杂性 | 阐明细胞膜上大分子吸附动力学及其在生物技术中的应用 | 线性聚合物和二元脂质膜 | 生物物理学 | NA | 流体动力学模拟和单分子追踪实验 | Zimm模型和Saffman-Delbrück模型 | 模拟数据和实验数据 | 未明确说明具体样本数量 |
52 | 2025-07-18 |
A Pipeline for Screening Small Molecule-Enhanced Protein Stability in A Bacterial Orphan Receptor
2025-Jul-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.03.663076
PMID:40631274
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研究论文 | 本研究开发了一种筛选小分子增强蛋白质稳定性的流程,应用于细菌孤儿受体 | 通过生物信息学和结构分析预测PAS域,利用片段库筛选出三种能显著提高CU228热稳定性的配体,并采用多种技术验证其结合特性 | 研究仅针对CU228这一特定蛋白质,未验证其在更广泛PAS蛋白中的适用性 | 开发一种筛选小分子配体的方法,用于增强孤儿PAS蛋白的稳定性 | 细菌孤儿受体CU228(一种PAS-HTH转录因子) | 合成生物学 | NA | 差示扫描荧光法(DSF)、微流控调制光谱(MMS)、饱和转移差示NMR | NA | 蛋白质结构数据、光谱数据 | 约760种化合物的片段库 |
53 | 2025-07-18 |
Microbial Biosensor for Sensing and Treatment of Intestinal Inflammation
2025-Jul, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202504364
PMID:40323169
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研究论文 | 本文介绍了一种优化的钙卫蛋白生物传感器,用于检测和治疗肠道炎症 | 该生物传感器结合了锌摄取调节器(Zur)控制的启动子和记忆电路,能够在体内检测和记录肠道炎症,并具有诊断和治疗功能 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人体中验证 | 开发用于肠道炎症诊断和治疗的合成生物传感器 | 肠道炎症及其生物标志物钙卫蛋白 | 合成生物学 | 肠道炎症 | 合成生物学技术,生物传感器技术 | NA | 生物标志物数据 | 两种独立的小鼠结肠炎模型 |
54 | 2025-07-18 |
Living Biotherapeutics Using Nanoparticles-Armed Cyanobacteria for Boosting Photodynamic-Immunotherapy of Cancer
2025-Jul, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202502746
PMID:40344505
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research paper | 该研究开发了一种结合蓝藻与多功能前药纳米颗粒的生物治疗平台,用于增强光动力免疫治疗癌症的效果 | 创新点在于将氧气自供应的蓝藻与多功能前药纳米颗粒结合,形成活体纳米治疗剂,实现了光动力治疗与免疫治疗的协同作用 | NA | 开发新型生物治疗平台以增强癌症的光动力免疫治疗效果 | 蓝藻与多功能前药纳米颗粒 | 合成生物学与材料科学 | 癌症 | 光动力治疗、免疫治疗 | NA | NA | NA |
55 | 2025-07-17 |
Combining synthetic biology with synthetic electrochemistry to expand the chemical space of the indolocarbazole family
2025-Jul-16, Organic & biomolecular chemistry
IF:2.9Q1
DOI:10.1039/d5ob00766f
PMID:40576641
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研究论文 | 本研究通过结合合成生物学与合成电化学,开发了一种环境友好的方法来合成吲哚咔唑类化合物,并扩展了其化学空间 | 首次将合成生物学与合成电化学结合,实现了吲哚咔唑类化合物的绿色合成,并发现了N-N同源二聚化的新结构 | 未明确提及实验规模或工业化应用的可行性 | 开发绿色合成方法以扩展吲哚咔唑类化合物的化学多样性 | 吲哚咔唑类化合物及其衍生物 | 合成化学 | NA | 合成生物学、合成电化学、酶促糖基化 | NA | 化学合成数据 | 17种化合物在20种人类肿瘤细胞系中测试 |
56 | 2025-07-17 |
Application of the Pipeline Metabolic Model in Food Synthetic Biology
2025-Jul-16, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c04173
PMID:40600973
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研究论文 | 本文提出了一种名为管道代谢模型的概念和操作框架,旨在通过将代谢抽象为管道和阀门的网络,简化食品合成生物学中的设计和工程过程 | 提出了管道代谢模型,将代谢网络抽象为管道和阀门,分离酶水平控制和途径水平优化,简化设计逻辑 | 模型的实际应用效果和广泛适用性尚未经过大规模验证 | 降低合成生物学研究的障碍,促进可持续食品生产的创新 | 功能性食品分子(如碳水化合物、蛋白质和脂肪)的生产 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | 管道代谢模型 | NA | NA |
57 | 2025-07-17 |
Membrane-Anchored Polyproline Provides Controlled Microdomain Formation and Permeability in Lipid Vesicles
2025-Jul-16, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c06134
PMID:40605254
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研究论文 | 本研究介绍了一种由l-脯氨酸单体单元和磷脂引发剂组成的新型脂质聚合物的合成 | 通过将聚脯氨酸链锚定在膜上,实现了可逆的相分离,高温形成簇,冷却后分散,动态控制局部膜组成 | NA | 探索新型脂质聚合物在膜微区形成和渗透性控制方面的应用 | 由l-脯氨酸单体单元和磷脂引发剂组成的脂质聚合物 | 合成生物学 | NA | 共聚焦显微镜和FRAP分析 | NA | NA | NA |
58 | 2025-07-17 |
Structurally Tunable Cell-Free System: to Expand the Synthetic Biology Toolkit for Studies on Extracellular Polysaccharide
2025-Jul-16, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c04053
PMID:40611812
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研究论文 | 本研究开发了一种灵活的无细胞(膜)蛋白质合成系统(CF(M)PS),用于研究与膜蛋白相关的糖生物学,并成功应用于糖缀合物的生产 | 开发了结合纳米脂质体作为膜模拟物的CF(M)PS系统,用于膜蛋白的转录翻译耦合和溶解,成功表达了膜结合的磷酸糖基转移酶并启动了EPS合成 | 研究未提及该系统在大规模生产中的效率或成本效益 | 扩展合成生物学工具包,研究细胞外多糖的合成途径 | 微生物细胞外多糖(EPS)及其合成途径中的关键酶和膜相关生化反应 | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白质合成系统(CF(M)PS),纳米脂质体膜模拟物 | NA | 生化反应数据 | 未明确提及具体样本数量,但使用了CGMCC 2876的膜结合磷酸糖基转移酶 |
59 | 2025-07-17 |
Metabolic engineering of Saccharomyces cerevisiae for de novo biosynthesis of hydroxytyrosol and salidroside
2025-Jul-16, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.00712-25
PMID:40668011
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研究论文 | 通过代谢工程改造酿酒酵母,实现羟基酪醇和红景天苷的从头生物合成 | 优化了酿酒酵母菌株,实现了羟基酪醇和红景天苷的高效生物合成,并通过增强UDP-葡萄糖供应显著提高了红景天苷的产量 | 研究中未提及菌株的长期稳定性或大规模生产中的潜在问题 | 开发高效生物合成羟基酪醇和红景天苷的方法,以解决其自然提取产量低和化学合成复杂的问题 | 酿酒酵母菌株及其代谢途径 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、发酵技术 | NA | NA | 使用了优化的酿酒酵母菌株(ZYT1、ZYHT1、ZYSAL1、ZYSAL9+3),并在摇瓶和15 L生物反应器中进行发酵 |
60 | 2025-07-17 |
Structural modification strategies for ferritin nanoparticles and their applications in biomedicine: a narrative review
2025-Jul-16, Nanoscale
IF:5.8Q1
DOI:10.1039/d5nr01369k
PMID:40668604
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综述 | 本文综述了铁蛋白纳米颗粒的结构修饰策略及其在生物医学中的应用 | 系统总结了铁蛋白纳米颗粒的结构修饰策略及其多功能应用,特别是在精准医学、神经退行性疾病治疗和生物催化中的潜力 | 面临生物安全性、规模化制备和临床转化等挑战 | 探讨铁蛋白纳米颗粒的结构修饰策略及其在生物医学领域的应用 | 铁蛋白纳米颗粒 | 生物医学 | 神经退行性疾病 | 化学修饰、基因工程、仿生矿化 | NA | NA | NA |