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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2026-04-10 |
Genetic Engineering Approaches for the Microbial Production of Vanillin
2024-11-06, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14111413
PMID:39595589
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综述 | 本文综述了利用基因工程和合成生物学方法提高微生物生产香兰素的研究进展 | 总结了通过基因工程和合成生物学在微生物中增强或构建香兰素生物合成途径的创新策略 | NA | 开发生物技术方法以替代化学合成,满足对天然香兰素的需求 | 香兰素生物合成途径、相关基因与酶、微生物底盘 | 合成生物学 | NA | 基因工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 天然产香兰素微生物、微生物底盘 | 香兰素生物合成途径 | 食品、工业生物技术 |
| 62 | 2026-04-10 |
Identification, Design, and Application of Noncoding Cis-Regulatory Elements
2024-08-05, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14080945
PMID:39199333
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综述 | 本文综述了非编码顺式调控元件的识别、设计与应用,强调了其在生物功能调控中的核心作用及技术进展 | 整合了ENCODE项目、高通量检测技术(如大规模并行报告基因分析)和深度学习算法(特别是大型语言模型),用于顺式调控元件的预测与从头设计 | NA | 探讨顺式调控元件的识别、功能解析及其在基因治疗、育种和合成生物学中的应用 | 顺式调控元件及其与转录因子、RNA结合蛋白和非编码RNA的相互作用 | 计算生物学 | NA | 大规模并行报告基因分析、深度学习算法、大型语言模型 | 大型语言模型 | 功能基因组数据、核苷酸序列 | NA | NA | NA | NA | 医学、农业、工业生物技术 |
| 63 | 2026-04-09 |
Plasmid Stability Analysis with Open-Source Droplet Microfluidics
2024-12-27, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/67659
PMID:39803963
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研究论文 | 本研究介绍了一种基于开源硬件的微流控工作流程,用于分析质粒保留,通过培养单细胞于凝胶微滴中并使用荧光显微镜量化微菌落 | 采用开源硬件微流控技术,结合荧光蛋白表达和非特异性DNA染色,实现高通量质粒稳定性分析,相比传统平板计数具有更高统计能力 | 研究主要聚焦于大肠杆菌作为实验模型,方法虽具通用性但需进一步验证于其他生物体 | 开发一种开源微流控工作流程,用于分析质粒在无抗生素选择下的保留情况 | 质粒在单细胞中的表达和保留,以及微菌落的量化 | 合成生物学 | NA | 微流控技术、荧光显微镜、DNA染色 | NA | 图像数据 | NA | 开源硬件 | 大肠杆菌 | 质粒表达荧光蛋白,用于构建生物传感器或标记系统 | 工业生物技术、环境、医学 |
| 64 | 2026-04-08 |
Route to Measure Exact Parameters of Bio-Nanostructures Self-Assembly
2024-10-31, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14111388
PMID:39595566
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研究论文 | 本文介绍了一种新方法,用于测量生物纳米结构自组装的关键参数,首次实现了对自催化与自抑制参数的精确计算 | 首次提出一种能够精确计算生物纳米结构自组装过程中自催化与自抑制参数的方法 | NA | 研究生物纳米结构自组装机制,以优化其在纳米技术和合成生物学中的应用 | 蛋白质基生物纳米涂层 | NA | NA | 数学模型 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 药物递送, 生物传感, 生物活性表面制造 |
| 65 | 2026-04-07 |
Transitions in development - an interview with Nika Shakiba
2024-03-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.202748
PMID:38421607
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访谈 | 本文是对加拿大英属哥伦比亚大学研究组长Nika Shakiba的访谈,探讨其如何运用合成生物学技术研究干细胞竞争的基础 | 通过工程学视角将干细胞视为可编程单元的研究方法,以及将合成生物学与干细胞生物学交叉融合的研究方向 | NA | 探索干细胞竞争的基础机制 | 干细胞 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 66 | 2026-04-06 |
Immunometabolic Circuits in Infection for Advancing Host Directed Therapies
2024-09-13, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/66980
PMID:39345111
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研究论文 | 本研究开发了一种基于四环素诱导(TetON)的合成生物学回路,用于递送琥珀酸脱氢酶以消除细胞内利什曼原虫 | 首次将合成生物学回路设计与聚复合物纳米颗粒递送系统结合,靶向宿主免疫代谢通路治疗利什曼病 | 研究仅在鼠巨噬细胞系中进行验证,尚未开展体内动物模型实验 | 开发靶向宿主免疫代谢通路的合成生物学疗法以消除细胞内利什曼原虫 | 利什曼原虫感染的鼠巨噬细胞系 | 合成生物学 | 利什曼病 | 合成生物学回路设计、聚复合物纳米颗粒递送、四环素诱导系统 | TetON诱导表达系统 | 细胞实验数据、细胞因子表达数据 | 鼠巨噬细胞系(具体数量未明确说明) | TetON系统、质粒载体构建 | 鼠巨噬细胞系 | 四环素诱导的合成生物学回路,用于表达琥珀酸脱氢酶作为治疗剂 | 医学 |
| 67 | 2026-04-05 |
Engineering water exchange is a safe and effective method for magnetic resonance imaging in diverse cell types
2024-Apr-22, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-024-00424-5
PMID:38649904
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研究论文 | 本研究证明水通道蛋白Aqp1可作为安全的遗传报告基因,在不同细胞类型中产生强磁共振信号且不影响细胞生理功能 | 首次系统证明Aqp1过表达不会引起内质网应激,且不影响多种细胞固有生物学功能,解决了其作为深层组织报告基因的安全性质疑 | 研究主要基于体外细胞系实验,尚未在完整生物体内验证长期安全性 | 评估Aqp1作为遗传编码磁共振报告基因的安全性和有效性 | 小鼠和人类来源的多种细胞系 | 合成生物学 | NA | 磁共振成像 | NA | 影像数据 | 多种小鼠和人类细胞系 | 遗传编码 | 哺乳动物细胞 | 水通道蛋白生物传感器 | 医学 |
| 68 | 2026-03-31 |
Assembly of functional microbial ecosystems: from molecular circuits to communities
2024-11-23, FEMS microbiology reviews
IF:10.1Q1
DOI:10.1093/femsre/fuae026
PMID:39496507
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综述 | 本文综述了从分子电路到群落的功能性微生物生态系统组装,包括交叉通讯和正交调控模块,并提出了一个全面的设计-构建-测试-学习框架 | 系统总结了基于不同调控电路协调微生物生态系统的策略,提出了一个更全面的微生物群落组装框架,整合了遗传电路、通讯工具和工程应用 | NA | 解密、模拟或重建微生物群落,以促进基于联盟的应用 | 微生物生态系统,包括微生物群落及其相互作用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 交叉通讯和正交调控模块,涉及代谢物、转录、翻译和翻译后水平 | 工业生物技术, 环境, 农业, 医学 |
| 69 | 2026-03-29 |
Reconstitution of the Bacterial Glutamate Receptor Channel by Encapsulation of a Cell-Free Expression System
2024-03-08, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/66595
PMID:38526087
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研究论文 | 本文展示了一种基于细胞自由表达系统封装的方法,在巨型单层囊泡中重构细菌谷氨酸受体通道 | 提出了一种新方法,通过封装和孵育细胞自由表达反应,成功在合成细胞模型中重构膜蛋白,并探索了信号肽替换对蛋白共翻译易位的影响 | NA | 开发一种在合成细胞中重构膜蛋白的稳健方法 | 细菌谷氨酸受体(GluR0)和巨型单层囊泡(GUVs) | 合成生物学 | NA | 细胞自由表达系统、共翻译易位 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 70 | 2026-03-25 |
Biocomputation: Moving Beyond Turing with Living Cellular Computers
2024-Jun, Communications of the ACM
IF:11.1Q1
DOI:10.1145/3635470
PMID:41867488
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综述 | 本文探讨了利用合成生物学与理论计算机科学的协同作用,超越传统图灵计算,开发更强大的活细胞计算机 | 倡导将理论计算机科学与合成生物学结合,探索活细胞系统的完整计算潜力,包括状态计算和问题解决复杂性 | 活细胞计算机的计算极限仍在探索中,尚未完全解决状态计算和基因调控复杂性等非平凡问题 | 推动活细胞计算机的发展,超越传统图灵计算,探索生物系统的计算能力 | 活细胞系统,如经过基因工程改造的细菌 | 合成生物学 | NA | 基因工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, BioBrick, iGEM | 细菌 | 逻辑门、生物传感器、代谢途径 | 医学、环境 |
| 71 | 2026-03-25 |
Chromosome-level Alstonia scholaris genome unveils evolutionary insights into biosynthesis of monoterpenoid indole alkaloids
2024-May-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109599
PMID:38646178
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研究论文 | 本研究通过组装高质量的染色体级别基因组,揭示了Alstonia scholaris中单萜吲哚生物碱生物合成的进化机制 | 首次组装了Alstonia scholaris的染色体级别基因组,并识别了与MIA生物合成相关的基因簇,包括strictosidine合成酶和色氨酸脱羧酶的共线性区域 | NA | 探究单萜吲哚生物碱的生物合成途径及其进化起源 | Alstonia scholaris植物及其基因组 | 基因组学 | 癌症 | 纳米孔测序,Hi-C数据 | NA | 基因组数据,多组学数据 | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 72 | 2026-03-25 |
Light Color-Controlled pH-Adjustment of Aqueous Solutions Using Engineered Proteoliposomes
2024-04, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202307524
PMID:38342618
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研究论文 | 本文介绍了一种利用工程化蛋白脂质体通过光色控制微升尺度溶液pH值调整的系统 | 创新点在于结合两种反向定向的光驱动质子泵(细菌视紫红质和蓝光吸收蛋白视紫红质Med12),实现了通过光色精确控制pH变化,并采用计算机反馈环路自动调节 | NA | 研究目的是开发一种基于合成生物学的微升尺度pH控制技术,用于研究、医疗和工业应用 | 研究对象是工程化蛋白脂质体系统及其在溶液pH调节中的应用 | 合成生物学 | NA | 光驱动质子泵技术、计算机反馈控制 | NA | NA | NA | 蛋白脂质体工程 | NA | 基于细菌视紫红质和蓝光吸收蛋白视紫红质Med12的反向质子泵合成生物电路,实现光色控制的pH调节 | 医学, 工业生物技术 |
| 73 | 2026-03-19 |
Single-molecule force spectroscopy of toehold-mediated strand displacement
2024-08-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51813-9
PMID:39217165
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研究论文 | 本文通过单分子力谱技术结合微流控增强光阱和粗粒度模拟,研究了toehold介导的链置换过程的单分子动力学 | 首次在单分子水平上实时观察TMSD过程,实现了微秒和纳米级分辨率,并揭示了序列效应在链置换中的重要性 | NA | 探究toehold介导的链置换在单分子层面的动力学特性 | DNA和RNA链的toehold介导链置换过程 | NA | NA | 单分子力谱、微流控增强光阱、粗粒度模拟 | NA | 力谱数据、模拟数据 | NA | NA | NA | NA | 核酸纳米技术、合成生物学 |
| 74 | 2026-03-14 |
Expanding the synthetic biology toolbox of Cupriavidus necator for establishing fatty acid production
2024-Jan-09, Journal of industrial microbiology & biotechnology
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/jimb/kuae008
PMID:38366943
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研究论文 | 本研究扩展了Cupriavidus necator的合成生物学工具箱,通过验证启动子、设计RBS库和优化密码子,以促进脂肪酸生产 | 首次在C. necator中系统验证和表征诱导型和组成型启动子,设计并测试了RBS库实现50倍表达范围,并研究了密码子优化对基因表达的影响 | 文中提到仍需克服进一步障碍才能广泛用于生物合成过程,具体限制未详细说明 | 建立和优化Cupriavidus necator的合成生物学工具箱,以支持脂肪酸等化学品的高效生产 | Cupriavidus necator细菌及其基因表达元件(如启动子、RBS、密码子优化) | 合成生物学 | NA | 基因表达验证、RBS库设计、密码子优化、GFP和mCherry报告基因表达 | NA | 基因表达数据、荧光蛋白测量数据 | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | Cupriavidus necator | 生物传感器、代谢途径 | 工业生物技术 |
| 75 | 2026-03-06 |
Plants against cancer: towards green Taxol production through pathway discovery and metabolic engineering
2024-Sep, aBIOTECH
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s42994-024-00170-8
PMID:39279861
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综述 | 本文综述了植物天然产物发现与工程中的挑战与进展,以抗癌药物紫杉醇生物合成途径中缺失酶的突破性发现为例 | 通过高通量测序和合成生物学方法,成功鉴定了紫杉醇生物合成途径中的关键缺失酶,为绿色生产提供了新途径 | NA | 加速药物发现并解决人类健康问题,特别是通过植物天然产物的工程化生产抗癌药物 | 植物天然产物,尤其是紫杉醇的生物合成途径 | 合成生物学 | 癌症 | 高通量测序、基因组组装、基因合成、分析技术 | NA | NA | NA | 合成生物学方法 | 植物 | 紫杉醇的生物合成途径 | 医药 |
| 76 | 2026-03-06 |
Enabling neighbour labelling: using synthetic biology to explore how cells influence their neighbours
2024-01-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.201955
PMID:38165174
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综述 | 本文综述了合成生物学和图像分析技术的最新进展,以探索细胞如何影响其邻近细胞 | 整合合成生物学工具与图像分析方法,以解决细胞间相互作用研究中的技术挑战 | 在发育模型系统中应用这些技术时存在机会和限制 | 探索细胞间相互作用在发育过程中的机制 | 细胞及其邻近细胞 | 合成生物学 | NA | 图像分析 | NA | 图像 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 77 | 2026-03-05 |
Quantitative Characterization of Gene Regulatory Circuits Associated With Fungal Secondary Metabolism to Discover Novel Natural Products
2024-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202407195
PMID:39467708
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研究论文 | 本研究开发了一种结合微流体平台与数学模型的系统,用于在单细胞水平上定量表征真菌基因调控回路,并利用该平台成功重构了生物活性分子的生物合成途径 | 首次将先进微流体平台与数学模型结合,实现了对多细胞真菌基因调控回路在单细胞水平的精确表征与定量分析 | 研究主要基于模式真菌构巢曲霉,尚未广泛验证于其他真菌物种 | 定量表征真菌次级代谢相关基因调控回路,以发现新型天然产物 | 真菌基因调控回路(GRCs)及其调控的次级代谢生物合成基因簇(BGCs) | 合成生物学 | NA | 微流体平台、数学模型、基因回路重构 | 数学模型 | 单细胞表达数据 | 30个转录因子-启动子组合(源自两个代表性真菌GRCs) | 基因回路重构 | 构巢曲霉(Aspergillus nidulans) | 基因调控回路(GRCs)、生物合成基因簇(BGCs)重构 | 医药、工业生物技术 |
| 78 | 2026-03-04 |
Recent advances in CAR T-cell engineering using synthetic biology: Paving the way for next-generation cancer treatment
2024, Advances in protein chemistry and structural biology
DOI:10.1016/bs.apcsb.2024.02.003
PMID:38762281
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综述 | 本章节全面探讨了合成生物学在CAR T细胞疗法中的创新应用,以推动下一代癌症治疗的发展 | 强调合成生物学通过基因编辑、合成基因电路和分子工程技术,优化CAR T细胞功能,提升治疗的安全性和有效性 | NA | 探索合成生物学如何增强CAR T细胞疗法的个性化和精准性,以改善癌症治疗效果 | CAR T细胞疗法及其在癌症免疫治疗中的应用 | 合成生物学 | 癌症 | 基因编辑、合成基因电路、分子工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN | T细胞 | 合成基因电路,用于优化CAR T细胞功能,如逻辑门或生物传感器设计 | 医学 |
| 79 | 2026-03-03 |
Intestinal Delivery of Probiotics: Materials, Strategies, and Applications
2024-08, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202310174
PMID:38245861
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综述 | 本文综述了用于肠道递送的益生菌类型、不同的益生菌封装策略(化学、物理、遗传策略及其组合)以及使用纳米涂层方法的新兴单细胞封装策略的最新进展 | 讨论了纳米技术如何提高益生菌在肠道递送中的存活率和抗逆性,并强调了合成生物学为高效、有目的地设计和操控益生菌创造的新机遇 | NA | 探讨益生菌的肠道递送材料、策略及其应用,以应对益生菌在加工、口服摄入和肠道递送过程中的存活与定植难题 | 用于肠道递送的益生菌 | NA | NA | 纳米技术,合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 益生菌 | NA | 医学 |
| 80 | 2026-03-02 |
Achievements and perspectives of synthetic biology in botanical insecticides
2024-10, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.30888
PMID:36183373
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综述 | 本文综述了合成生物学在植物源杀虫剂异源生产中的最新进展、当前挑战及可行策略 | 系统总结了植物源杀虫剂异源生产面临的挑战,并聚焦于阐明生物合成途径、酶工程、宿主工程和细胞毒性工程等策略进行深入讨论 | 许多植物源杀虫剂的生物合成途径尚未完全阐明,且其细胞毒性和在新宿主中酶的低效率仍是异源生产的挑战 | 探讨合成生物学在解决植物源杀虫剂生产问题中的应用前景 | 植物源杀虫剂 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、酶工程、宿主工程 | NA | NA | NA | NA | 新宿主(具体未指定) | 生物合成途径 | 农业 |