合成生物学相关文章
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当前共找到 1239 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2026-07-10 |
Cell-free systems for production of therapeutics
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.10.004
PMID:41688141
|
综述 | 探讨无细胞系统（CFS）在治疗性生物分子生产中的概念、技术、工程和应用 | 通过合成生物学、代谢工程、冻干制剂和系统优化等进展，显著提升了无细胞平台的性能和适用性，使其适用于高通量筛选、快速原型设计和按需生物制造 | 可扩展性、成本效益和翻译后修饰问题仍需解决 | 评估无细胞系统在治疗性生物分子生产中的潜力及其未来发展方向 | 无细胞系统（CFS），包括大肠杆菌、小麦胚芽和哺乳动物细胞来源的系统 | 合成生物学 | NA | 无细胞表达系统 | NA | NA | NA | 合成生物学、代谢工程、冻干制剂 | 大肠杆菌、小麦胚芽、哺乳动物细胞 | 无细胞生物合成系统 | 医学 |
| 62 | 2026-07-10 |
Live biotherapeutics: Emerging trends and future directions in microbial therapy
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.12.001
PMID:41714074
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综述 | 综述活体生物治疗产品的研究现状、作用机制、临床进展及未来发展方向 | 系统分析活体生物治疗产品从单菌株到工程菌群、天然制剂的新兴趋势，并整合精准医学、合成生物学、CRISPR基因组编辑和多组学技术对其设计的影响 | 临床开发面临菌株筛选、复杂制造、易感人群安全性问题及监管框架不确定等挑战 | 全面概述活体生物治疗产品的当前应用、作用模式、监管差异及未来在代谢、神经和免疫介导疾病中的拓展潜力 | 活体生物治疗产品（包括单菌株、工程微生物群落及天然制剂） | NA | 胃肠道疾病、代谢性疾病、神经系统疾病、免疫介导疾病 | CRISPR基因组编辑，多组学技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 医药 |
| 63 | 2026-07-10 |
Advancements in technology for developing recombinant live biotherapeutics
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2026.01.006
PMID:41714076
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综述 | 综述用于开发重组活体生物治疗剂的技术进展 | 整合合成生物学、基因工程、多组学和人工智能/机器学习方法设计重组活体生物治疗剂，以提升疗效、监管接受度和临床转化 | 规模化生产、安全性和临床应用方面仍面临重大挑战 | 概述重组活体生物治疗剂的发展现状、挑战与机遇，推动其作为下一代治疗剂的转化 | 重组活体生物治疗剂，包括基因和代谢工程改造的微生物物种 | NA | NA | 合成生物学、基因工程、多组学、人工智能/机器学习 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 64 | 2026-07-10 |
The human reproductive tract microbiome: A novel source of live biotherapeutics
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2026.01.027
PMID:41714081
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综述 | 探讨人类生殖道微生物组作为新型活体生物治疗剂的来源，分析其组成、功能及治疗潜力 | 首次系统性地将人类生殖道微生物组作为活体生物治疗剂的新型来源进行探索，突破传统益生菌仅维持健康的概念 | 未提及具体局限性 | 研究人类生殖道微生物组作为活体生物治疗剂候选源的潜力及其治疗方法 | 人类生殖道微生物群落，特别是阴道微生物组 | 微生物组学 | 细菌性阴道病、性传播感染、不孕症、早产 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、基因工程 | 人类阴道微生物组 | NA | 医学 |
| 65 | 2026-07-10 |
Recent advances of microbial medicine to prevent and treat cardiovascular disease
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2026.01.028
PMID:41714082
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综述文章 | 综述微生物医学在心血管疾病预防和治疗中的最新进展，重点阐述肠道微生物群作为关键调节因子的作用及相关干预策略 | 系统整合了益生菌、益生元、后生元、粪菌移植及合成生物学工程菌等多种微生物干预策略，并强调其向精准、整体和个体化治疗范式的转变 | 面临菌株特异性、递送系统和监管框架等挑战，且多数干预仍处于临床前或早期临床阶段 | 探索微生物医学在心血管疾病管理和治疗中的应用前景 | 肠道微生物群及其代谢物（短链脂肪酸、TMAO、吲哚衍生物）与心血管健康的关系 | 微生物组学 | 心血管疾病 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | 人体肠道微生物 | 工程菌递送治疗分子 | 医学 |
| 66 | 2026-07-10 |
Recombinant live biotherapeutics and synthetic biology: Recent advancement and perspective
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2026.01.004
PMID:41714087
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综述 | 综述合成生物学在重组活体生物治疗产品开发中的应用进展与前景 | 系统阐述了活体生物治疗产品（LBPs）的设计原理、宿主-微生物互作机制及合成生物学在精准调控中的应用 | 未提及具体实验验证数据或临床转化中的技术瓶颈 | 探讨合成生物学在活体生物治疗产品开发中的关键作用及未来发展方向 | 活体生物治疗产品（LBPs）及肠道微生物群落 | 合成生物学 | 代谢疾病、感染性疾病、炎症性肠病、癌症 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学基因工程工具（未具体指定工具） | 工程微生物（未具体指定宿主） | 基于合成生物学的遗传回路设计 | 医学 |
| 67 | 2026-07-10 |
Live biotherapeutics in cancer therapy
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2026.01.002
PMID:41714084
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综述 | 综述活体生物治疗药物在癌症治疗中的应用、优势与挑战 | 系统阐述了整合微生物学、免疫学、合成生物学和肿瘤学的跨学科方法，以及工程化细菌和病毒作为下一代癌症治疗策略的潜力 | 安全性、制造工艺、监管及个性化方面仍存在挑战 | 探讨活体生物治疗药物在癌症治疗中的机制、应用现状及未来发展 | 活体生物治疗产品（包括天然和工程化细菌及病毒） | 合成生物学 | 癌症（结肠癌、胃癌、胰腺癌、肝癌） | 合成生物学、组学技术 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 细菌、病毒 | 抗肿瘤载荷递送系统（如免疫调节剂、毒素、癌症抗原） | 医学 |
| 68 | 2026-07-10 |
Design of Conditional Guide RNAs for the Logical Regulation of Gene Expression
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-5304-3_5
PMID:42420725
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研究论文 | 本文介绍条件向导RNA（cgRNA）的设计方法，用于逻辑调控基因表达 | 通过设计强发夹结构阻断gRNA活性，直到特定触发RNA存在时才激活，实现逻辑门控信号处理和大动态范围调控 | 主要在大肠杆菌中进行体内表征，未提及在其他宿主或体内的广泛验证 | 描述cgRNA的设计并提供体内表征的详细方案 | 条件向导RNA及触发RNA | 合成生物学 | NA | CRISPR干扰 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 条件向导RNA逻辑门控电路 | 工业生物技术 |
| 69 | 2026-07-10 |
Reimagining the Synthetic Biology DBTL Cycle with Machine Learning
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-5304-3_1
PMID:42420721
|
研究论文 | 探讨机器学习在合成生物学DBTL循环中的应用，并介绍CLASSIC平台构建电路库和训练模型的方法 | 提出通过高通量建库和测序生成高质量数据集，结合机器学习/人工智能加速合成电路工程，并定义将ML/AI整合到设计/构建/测试/学习循环中的通用原则 | 目前缺乏高质量训练数据集是限制ML/AI用于电路设计的主要瓶颈 | 阐述如何利用机器学习克服合成生物学中电路工程的不可预测性，并推进数据驱动设计 | 合成生物电路工程中的设计-构建-测试-学习循环 | 机器学习 | NA | 下一代测序, ONT, RNA-seq | 机器学习模型 | 文本 | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick | NA | 合成调控电路 | 工业生物技术, 医学 |
| 70 | 2026-07-10 |
A Golden Gate-Compatible CRISPR-Associated Transposon Tool for Multiplexed Bacterial Genome Editing
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-5304-3_2
PMID:42420722
|
研究论文 | 提出一种名为pSPIN-GG的改进型CRISPR相关转座子工具，用于简化细菌基因组的多重编辑 | 包含Golden Gate兼容的启动子、引导和负载模块，以及用于快速验证引导替换的绿色荧光蛋白剔除盒，并测试了大肠杆菌BL21染色体上的多个位点以支持基因剂量调控 | NA | 简化基于CAST系统的细菌基因组工程，提高多重编辑的可及性 | 大肠杆菌BL21菌株 | 合成生物学 | NA | CRISPR相关转座酶（CAST）、Golden Gate组装 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas12, Golden Gate Assembly | 大肠杆菌（E. coli） | RNA引导的DNA插入工具（pSPIN-GG系统），包含启动子、引导和负载模块 | 工业生物技术 |
| 71 | 2026-07-10 |
Synthetic Biomolecular Condensates: Design Principles and Applications
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-5304-3_6
PMID:42420726
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综述 | 本文综述了合成生物分子凝聚体的设计原理及其在细胞控制中的应用 | 提出利用合成内在无序蛋白构建可编程凝聚系统，为合成生物学提供新的细胞调控层级 | 未涉及在哺乳动物等复杂宿主中的应用验证及长期稳定性评估 | 设计可调控的合成生物分子凝聚体以实现细胞过程的空间组织与调控 | 合成内在无序蛋白和基于合成基因回路的大肠杆菌系统 | 合成生物学 | NA | 基因合成、蛋白质表达纯化、生物物理表征 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌 | 合成基因回路（调控转录和翻译） | 合成生物学 |
| 72 | 2026-07-10 |
Cell-Free Genetic Circuits: Extract and Template Preparation
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-5304-3_9
PMID:42420729
|
综述 | 详细描述无细胞基因回路的细胞提取物和DNA模板制备方法 | 系统总结了无细胞系统在合成生物学中的方法学优化，特别是标准化提取物和模板制备策略 | 未提及具体实验数据验证或跨实验室比较的局限性 | 优化无细胞合成基因回路的可靠性和效率 | 无细胞系统、细胞提取物、DNA模板 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 实验方法 | NA | NA | NA | 无细胞合成基因回路 | 合成生物学 |
| 73 | 2026-07-10 |
Characterization of Synthetic Gene Circuits with Absolute Quantification in Continuous Culture
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-5304-3_8
PMID:42420728
|
研究论文 | 提出一种结合数学建模、连续培养和绝对定量方法，用于表征合成基因回路行为的方法 | 通过绝对定量技术结合连续培养和数学模型，解决了合成基因回路表征中缺乏标准化方法和长期行为难以复现的问题 | 未详细讨论该方法在不同细胞背景或复杂回路中的通用性及潜在局限性 | 开发标准化方法以可重复地表征合成基因回路在复杂细胞环境和长时间尺度上的行为 | Chi.Bio生物反应器平台上的简单小RNA回路 | 合成生物学 | NA | 绝对定量、数学建模、连续培养 | 数学模型 | 蛋白质和细胞数量的绝对定量数据 | 未明确提及样本数量 | Chi.Bio生物反应器 | 未明确提及宿主生物 | 小RNA合成基因回路 | 工业生物技术 |
| 74 | 2026-07-10 |
Programming RNA Trans-Splicing for Versatile Gene Regulation and Complex Cellular Logic Computation
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-5304-3_10
PMID:42420730
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研究论文 | 介绍利用分割内含子介导的反式剪接核糖调节器进行基因调控和复杂细胞逻辑计算的方法与策略 | SENTR具有低泄漏表达、宽动态范围、高可预测性和正交性，并可与分割内含子等调控模态组合，实现单个调控基因处理多达六个输入的复杂细胞逻辑计算 | 文中未明确提及限制，但可能受限于对多种基因和应用的验证范围 | 实现高效基因调控和复杂细胞逻辑计算 | 十种基因，包括荧光蛋白、转录因子和ncRNA | 合成生物学 | NA | 反式剪接核糖调节器、分割内含子、机器学习预测 | NA | NA | 十种基因 | NA | NA | 反式剪接核糖调节器遗传电路 | 医学、生物传感 |
| 75 | 2026-07-10 |
From Negative Feedback to Integrated Control: Recombinase-Based Strategies for Mitigating Resource Competition
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-5304-3_14
PMID:42420734
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综述 | 本文讨论了基于重组酶的调控策略，包括负反馈控制器和集成了负反馈与前馈的双重控制器，以应对合成生物学中由资源竞争导致的模块间干扰 | 提出利用重组酶介导的启动子翻转实现负反馈和前馈联合调控，平衡资源分配并提高系统可预测性 | 未涉及具体实验验证或实际应用中的局限性，如控制器的复杂性和宿主细胞代谢负担 | 开发基于重组酶的调控策略以减轻合成生物学中的资源竞争问题 | 重组酶控制器及合成基因电路 | 合成生物学 | NA | 重组酶介导的启动子翻转 | NA | NA | NA | 重组酶 | 宿主细胞（未具体指定） | 负反馈控制器（Re-NF控制器）和集成了负反馈与前馈的控制器（Re-NF-FF控制器） | 合成生物学，生物工程 |
| 76 | 2026-07-10 |
Coupled Perturbations of Gene Circuit Dynamics by Resource Competition and Growth Dilution
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-5304-3_19
PMID:42420739
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研究论文 | 提出一个实验流程，研究大肠杆菌中基因电路动力学如何受资源竞争和生长稀释的耦合影响 | 通过实验解耦并定量分析资源竞争与生长介导稀释对抑制性基因级联电路动力学的联合效应 | 仅限于抑制性级联电路，未涵盖其他电路类型，且实验在E. coli中完成，可能无法直接推广到其他宿主 | 探究合成基因电路中资源竞争和生长稀释两种上下文因素的耦合效应对电路行为的影响 | 抑制性级联电路 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 荧光强度数据 | 未明确提及 | Golden Gate Assembly, Gibson Assembly | E. coli | 抑制性级联电路（含可调启动子强度、核糖体结合位点强度和质粒拷贝数） | 工业生物技术 |
| 77 | 2026-07-09 |
Gene expression in synthetic biology: Going with the light
2026-Sep, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2026.06.010
PMID:42276281
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综述 | 本文综述了利用光诱导基因表达在合成生物学中的应用，重点探讨了光遗传学方法与基因回路设计的结合 | 系统总结了光敏启动子、光调节转录因子和光笼诱导剂等光诱导基因表达元件，并首次将光作为二进制输入函数与逻辑门设计相结合，阐明了光遗传学与合成生物学之间的关联 | 主要聚焦于原核生物，对真核系统仅作简要比较，可能限制了在高等生物中的应用推广 | 综述光诱导基因表达在合成生物学中的关键元件和逻辑门设计，促进光遗传学与合成生物学的融合 | 原核生物为主，兼与真核基因表达系统比较 | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | NA | NA | NA | 原核生物, 真核生物 | 光诱导基因表达回路, 逻辑门 | 生物技术, 医学 |
| 78 | 2026-07-09 |
Engineered Biocatalytic Strategies for Pesticide Degradation in Food Systems: From Catalytic Performance to Practical Applications
2026-Jul-08, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.6c01905
PMID:42133536
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综述 | 综述了食品中农药残留酶降解策略的最新进展，重点讨论工程化手段提升催化性能与应用转化 | 系统整合天然酶、纳米酶、多酶/杂化级联体系，并引入人工智能辅助设计与合成生物学新兴方法 | 实际食品基质中酶稳定性、可重复使用性及规模化应用存在障碍，监管不确定性尚未解决 | 探讨酶催化降解农药的工程化策略及其在食品体系中的实际应用潜力 | 农药残留物及相关酶类（天然酶、纳米酶、级联系统） | 机器学习 | NA | 生物催化、纳米技术、人工智能设计、合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 人工智能辅助设计, 合成生物学工具 | NA | 多酶或杂化级联系统 | 食品, 农业 |
| 79 | 2026-07-09 |
Genome-Scale Metabolic Modeling of Terpenoid Biosynthesis: Advances and Perspectives
2026-Jul-08, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.6c03926
PMID:42362489
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综述 | 系统回顾基因组规模代谢模型在萜类化合物生物合成中的进展 | 综述了GSMM在典型萜类生产微生物（包括模式和非模式微生物）中的应用，并讨论了多约束模型及机器学习与合成生物学整合等未来方向 | 主要关注四种微生物，可能未覆盖所有萜类生产宿主 | 为萜类细胞工厂的智能设计和高效构建提供理论参考 | 四种典型萜类生产微生物：大肠杆菌、酿酒酵母、蓝细菌和另一种非模式微生物 | 机器学习, 系统生物学 | NA | NA | 基因组规模代谢模型 | NA | NA | NA | 大肠杆菌, 酿酒酵母, 蓝细菌 | 萜类生物合成途径 | 医学, 农业, 能源, 食品 |
| 80 | 2026-07-09 |
Complete remediation of a mixture of 5 acetophenone derivatives by multi-modular engineered Escherichia coli: Avoiding intermediate toxicity from incomplete degradation
2026-Jul-07, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2026.120464
PMID:42413334
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研究论文 | 通过构建多模块工程大肠杆菌，实现5种苯乙酮衍生物混合物的完全降解，避免不完全降解产生的中间体毒性 | 首次利用合成生物学方法将14个结构优化基因整合为4个分解代谢模块，构建了可完全降解5种苯乙酮衍生物及其混合物的工程菌株，并验证了其有效解毒能力和广泛底物范围 | 未详细评估工程菌株在复杂自然环境中的长期稳定性和生态影响，以及降解产物对土壤微生物群落的影响 | 解决微生物不完全降解苯乙酮衍生物产生有毒中间体积累的环境污染问题 | 5种苯乙酮衍生物（苯乙酮、对羟基苯乙酮、对羟基苯丙酮、对羟基苯甲醛和邻羟基苯乙酮）及其混合物 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、同位素标记追踪、斑马鱼毒性测试 | NA | 降解动力学数据、同位素标记数据、毒性测试数据 | 5种苯乙酮衍生物，每种1 mM浓度，混合降解实验 | 合成生物学 | 大肠杆菌 | 多模块分解代谢通路（4个模块，整合14个结构优化基因） | 环境修复 |