本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['synthetic biology']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价9.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2026-04-25 |
Engineered Bacteriophages: A Next-Generation Platform for Precision Antimicrobials and Therapeutics
2026-Mar-13, Viruses
DOI:10.3390/v18030355
PMID:41902263
|
综述 | 系统总结了工程化噬菌体在制备技术、抗菌应用和癌症治疗中的进展,并分析了临床转化的挑战 | 提出工程化噬菌体作为可定制的精准生物工具,融合合成生物学、医学和环境科学,为抗菌药物耐药性危机提供变革性解决方案 | 监管审批、大规模生产和长期安全性验证等关键挑战尚未解决 | 总结工程化噬菌体的制备技术及其在精准抗菌和医疗中的应用前景 | 工程化噬菌体 | 合成生物学 | 抗菌药物耐药性感染、胃肠道疾病、癌症 | NA | NA | NA | NA | 基因修饰、化学偶联、物理封装 | 噬菌体 | 工程化噬菌体作为精准抗菌剂、靶向递送载体、免疫佐剂 | 医学、环境科学 |
| 62 | 2026-04-24 |
On-Demand Droplet Routing and Splitting Using Independently Addressable Interdigitated Electrodes
2026-Mar-20, Micromachines
IF:3.0Q2
DOI:10.3390/mi17030375
PMID:41900261
|
研究论文 | 提出一种利用独立寻址叉指电极实现按需液滴路由和分裂的低电压微流控平台 | 将倾斜叉指电极与非对称Y型结点集成,在单一器件中实现电可调液滴分裂与分选,并通过低电压介电泳实现液滴动态路由和实时确定性分裂 | NA(摘要未明确提及局限性) | 开发低电压微流控平台,实现液滴的按需路由和分裂,用于生物化学分析 | 微流控芯片中的液滴 | 微流控 | NA | 微流控、介电泳 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 药物发现、单细胞分析、分子诊断、合成生物学 |
| 63 | 2026-04-24 |
Unintended Creation or Insertion of Antisense Promoter Motifs During Codon Optimization: A Cyber-Biosecurity Risk
2026-Mar-12, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms14030638
PMID:41900397
|
研究论文 | 本研究探究密码子优化过程中无意引入或有意插入反义启动子基序(如“TATAAT”)的网络安全风险,并开发了计算管道进行检测和防御 | 首次揭示密码子优化工具中双向DNA链筛查的缺失可能导致潜在生物网络安全漏洞,并提出计算防御策略 | 研究主要基于计算机模拟分析和公共数据集,缺乏湿实验验证插入反义基序后的实际生物效应 | 评估密码子优化过程中反义启动子基序的无意引入或有意插入风险,并提出防御方法 | 484741个蛋白质编码序列及其密码子优化后的反义链基序 | 合成生物学 | NA | 密码子优化 | NA | 基因组序列 | 484,741个蛋白质编码序列 | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 64 | 2026-04-24 |
A Scaffoldomics Platform for Modular In Vivo Enzyme Colocalisation and Its Application to Naringenin Biosynthesis
2026-Mar, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.70328
PMID:41814496
|
研究论文 | 开发了一种‘支架组学’平台,用于模块化体内酶共定位,并应用于柚皮素生物合成 | 提出了一种通用的‘支架组学’合成框架,能够实现多达四种途径酶在蛋白支架上的组合组装,并通过大肠杆菌中染色体编码的生物传感器实现实时检测和途径评估 | 当前方法仍可能劳动密集且效率不足,但该平台展示了显著改善 | 提高微生物细胞工厂的代谢效率,增强精细化学品的产量 | 微生物细胞工厂中的酶共定位系统 | 合成生物学 | NA | 蛋白支架组装、生物传感器 | NA | 实验数据 | 多种酶组合的支架组装和柚皮素生物合成实验 | 蛋白质工程、生物传感器 | 大肠杆菌 | 蛋白支架用于多酶复合物组装和代谢途径优化 | 工业生物技术、医药 |
| 65 | 2026-04-21 |
Dynamic Coordination: How ERF Transcription Factors Coordinate Plant Development and Adaptive Stress Responses
2026-03-19, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom16030466
PMID:41897400
|
综述 | 本文综述了乙烯响应因子(ERF)转录因子在植物生长与胁迫适应平衡中的核心调控作用 | 强调了ERF-VII亚组在协调发育程序与胁迫响应中的双重角色,并探讨了利用CRISPR和合成生物学工具精准调控ERF网络以改良作物的新策略 | NA | 探讨ERF转录因子如何动态协调植物发育与适应性胁迫响应,以支持可持续农业 | 乙烯响应因子(ERF)转录因子家族,特别是ERF-VII亚组 | 植物生物学 | NA | CRISPR基因组编辑、合成生物学工具 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 植物 | NA | 农业 |
| 66 | 2026-04-21 |
Photo-Oxidative Stress in Plants: ROS Signaling, Damage Propagation, and Systems-Level Resilience
2026-Mar-15, Antioxidants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/antiox15030371
PMID:41897517
|
综述 | 本文综述了植物光氧化应激中活性氧信号、损伤传播及系统级恢复力的综合框架 | 超越将ROS视为单纯毒性副产物的传统观点,将其定位为复杂互连网络中的核心枢纽,并提出了“优化网络”而非增强单一组分的未来策略 | 作为综述文章,未提供原始实验数据或具体技术验证 | 阐明植物光氧化应激的机制,并提出培育气候适应性作物的策略 | 植物(特别是农作物)的光氧化应激响应系统 | 植物生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | 植物(农作物) | NA | 农业 |
| 67 | 2026-04-16 |
Heterologous expression of Vibrio natriegens transporters enhances the growth of Escherichia coli and Bacillus subtilis on glutamate
2026-Mar, Engineering microbiology
DOI:10.1016/j.engmic.2026.100264
PMID:41982386
|
研究论文 | 本研究通过异源表达Vibrio natriegens的谷氨酸转运蛋白,有效提升了Escherichia coli和Bacillus subtilis在谷氨酸碳源上的生长速率 | 首次发现跨物种底物转运蛋白可改变细菌细胞资源分配,为调控微生物生物量生长提供了新的遗传策略 | NA | 探索通过异源表达转运蛋白改善细菌在特定碳源上生长性能的方法 | Escherichia coli和Bacillus subtilis两种细菌 | 合成生物学 | NA | 异源表达技术 | NA | 生长实验数据 | NA | 异源表达系统 | Escherichia coli, Bacillus subtilis | 谷氨酸转运蛋白表达系统 | 工业生物技术 |
| 68 | 2026-04-16 |
Advances in polyethylene biodegradation and bioconversion: Microbial, enzymatic, and biotechnological insights
2026-Mar, Engineering microbiology
DOI:10.1016/j.engmic.2025.100255
PMID:41982382
|
综述 | 本文系统总结了聚乙烯(PE)生物降解与生物转化的最新进展,包括降解效率评估方法、微生物与酶的降解机制、已鉴定的微生物与酶资源,以及增强降解效率的物理化学策略与生物方法的整合 | 将合成生物学和机器学习等前沿生物技术工具与传统生物降解方法相结合,以加速PE降解速率并实现更可持续的塑料废物管理 | NA | 开发可持续的解决方案以缓解顽固性聚烯烃(如聚乙烯)对环境造成的负担 | 聚乙烯(PE)塑料 | NA | NA | 生物降解、生物转化、合成生物学、机器学习 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 环境 |
| 69 | 2026-04-16 |
Genetically encoded biosensors enabled high-throughput screening of microbial cell factories
2026-Mar, Engineering microbiology
DOI:10.1016/j.engmic.2025.100258
PMID:41982388
|
综述 | 本文综述了基因编码生物传感器在高通量筛选微生物细胞工厂中的应用、关键特征、工程策略及优化挑战 | 系统总结了生物传感器在高通量筛选中的关键性能特征,并详细阐述了通过合成生物学策略对生物传感器进行工程改造的最新进展 | NA | 为开发用于高通量筛选的基因编码生物传感器及其在微生物细胞工厂优化中的应用提供全面指导 | 基因编码生物传感器及其在微生物细胞工厂高通量筛选中的应用 | 合成生物学 | NA | 高通量筛选(HTS)、合成生物学策略 | NA | NA | NA | 合成生物学策略 | 微生物细胞工厂 | 生物传感器(用于检测天然与非天然产物) | 工业生物技术 |
| 70 | 2026-04-15 |
Valorization of ligustrum species: biosynthesis, metabolic engineering, and pharmacology of bioactive compounds
2026-Mar-27, Bioresources and bioprocessing
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s40643-026-01042-3
PMID:41888324
|
综述 | 本文综述了女贞属植物的生物活性化合物、药理特性、组学分析及生物合成研究进展,并提出整合多组学、合成生物学和绿色制造以实现其全植物价值化和种质资源保护的策略 | 提出整合多组学、合成生物学和绿色制造的综合性方法,以促进女贞属植物的全植物价值化和可持续利用,为药用资源开发提供新的理论框架和技术范式 | NA | 建立女贞属植物作为药用资源的全面开发和可持续利用的理论框架与技术范式 | 女贞属植物及其生物活性化合物(如三萜类、苯乙醇苷类、黄酮类等) | NA | NA | 多组学分析、代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药、农业、环境、食品 |
| 71 | 2026-04-15 |
Label-Free Microfluidic Modulation Spectroscopy Monitors RNA Origami Structure and Stability
2026-Mar-16, Biosensors
DOI:10.3390/bios16030166
PMID:41892058
|
研究论文 | 本研究采用微流控调制光谱技术,作为无标记的结构生物传感器,用于监测RNA折纸的结构与稳定性 | 首次将微流控调制光谱技术应用于RNA折纸的结构分析,实现了对RNA碱基和碱基对在1760-1600 cm⁻¹振动指纹区的无标记、高通量检测 | NA | 开发一种可扩展的、溶液相的RNA折纸结构监测方法,以评估其设计架构、成熟过程及稳定性分布 | RNA折纸结构,特别是六螺旋束带扣的RNA折纸模型 | 合成生物学 | NA | 微流控调制光谱 | NA | 光谱数据 | NA | NA | NA | RNA折纸作为支架用于生物传感、合成生物学和纳米医学 | 生物传感, 合成生物学, 纳米医学 |
| 72 | 2026-04-14 |
Incoherent feedforward loop dominates the robustness and tunability of necroptosis biphasic, emergent, and coexistent dynamics
2026-Mar, Fundamental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.fmre.2024.02.009
PMID:41971832
|
研究论文 | 本研究通过建模分析,揭示了坏死性凋亡信号通路中RIP1-RIP3-Caspase-8非相干前馈环作为核心拓扑结构,主导双相、涌现和共存动力学的鲁棒性与可调性 | 首次引入潜在景观和香农熵量化坏死性凋亡共存动力学的不确定性,并系统筛选出实现BEC动力学的最小电路拓扑,确认非相干前馈环的核心作用 | 研究基于电路建模和理论分析,实验验证可能有限,且主要关注三节点电路,可能未涵盖更复杂网络 | 探究坏死性凋亡信号通路中双相、涌现和共存动力学的电路结构基础与调控机制 | 坏死性凋亡信号通路中的RIP1、RIP3和Caspase-8蛋白及其相互作用网络 | 合成生物学 | 细胞死亡相关疾病 | 电路建模、网络拓扑分析、随机电路分析、潜在景观和香农熵计算 | NA | 理论模型数据 | NA | NA | NA | 非相干前馈环嵌入RIP3对RIP1的正反馈,以及RIP3自磷酸化的钟形调节 | 医学 |
| 73 | 2026-04-10 |
Advancing the frontier of plant-based therapeutics: critical innovations in molecular farming and bioprocess Integration
2026-Mar-23, Biotechnology letters
IF:2.0Q3
DOI:10.1007/s10529-026-03723-7
PMID:41870756
|
综述 | 本文综述了植物分子农业在生物制药和高价值生物分子生产中的最新进展,包括遗传转化、蛋白质表达、糖基工程和下游加工的创新方法 | 介绍了CRISPR/Cas9介导的途径编辑、优化蛋白质产量和质量的合成生物学框架,以及提高纯化效率的集成生物加工解决方案等新方法 | NA | 指导研究人员开发更有效和可扩展的植物分子农业应用 | 植物分子农业中的生物制药和高价值生物分子生产 | NA | NA | CRISPR/Cas9, 合成生物学, 集成生物加工 | NA | NA | NA | CRISPR/Cas9 | 植物系统 | 合成生物学框架 | 医药 |
| 74 | 2026-04-07 |
Machine learning-directed massively parallel programmable nucleic acid amplification
2026-Mar-27, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aec9175
PMID:41880514
|
研究论文 | 本文开发了一种基于热力学的可编程核酸扩增方法,通过机器学习模型优化预测精度,应用于DNA数据存储和临床诊断 | 提出了一种通过引物标签补偿策略解耦序列特异性和杂交能量调控的方法,实现了高分辨率(33%对比81%)的可编程扩增,并利用机器学习模型将预测精度从0.62提升至0.86 | 未明确提及具体局限性,但暗示该方法可扩展至单细胞测序和空间转录组学,表明当前应用范围可能有限 | 开发一种可动态调控扩增效率的方法,以提升分子诊断和DNA数据存储的性能 | 核酸扩增过程,包括DNA数据存储和临床RNA变异分析 | 机器学习 | 宫颈癌 | 核酸扩增技术,机器学习建模 | 机器学习模型 | 实验数据(2483个数据点) | 2483个实验数据点,用于构建机器学习模型 | NA | NA | NA | 医学,数据存储 |
| 75 | 2026-04-05 |
Frontiers in polysaccharide biosynthesis: Decoding the catalytic logic of enzymes for future applications
2026-Mar-27, Carbohydrate research
IF:2.4Q2
DOI:10.1016/j.carres.2026.109907
PMID:41931921
|
综述 | 本文系统分析了不同生物来源中天然多糖生物合成的分子机制,并综述了利用合成生物学策略重建和优化这些天然网络的最新进展 | 聚焦于从底物前体激活、糖链聚合到组装后修饰的完整过程,并探讨了人工智能和系统生物学等新兴技术在该领域的整合应用前景 | NA | 理解多糖的生物合成机制,并为未来在工程化系统中可控生产结构明确的多糖提供理论基础 | 动物、植物和微生物中的多糖生物合成系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 76 | 2026-04-05 |
In vivo self-assembled SOD1-siRNAs mitigate muscle atrophy and denervation in amyotrophic lateral sclerosis
2026-Mar-05, Brain : a journal of neurology
IF:10.6Q1
DOI:10.1093/brain/awaf291
PMID:40795306
|
研究论文 | 本研究开发了一种合成生物学策略,通过重编程肝脏作为组织底盘,在体内自组装封装SOD1-siRNA的小细胞外囊泡,以靶向脊髓神经元并特异性沉默突变SOD1,从而缓解肌萎缩侧索硬化症小鼠模型的肌肉萎缩和去神经支配 | 提出了一种创新的合成生物学策略,利用肝脏作为组织底盘在体内自组装靶向性小细胞外囊泡,实现了突变SOD1基因的特异性沉默,并设计了基于AAV的长期自组装系统 | 研究仅在Tg(SOD1G93A)转基因小鼠模型中进行,尚未在人类患者中验证;长期安全性和潜在免疫原性未充分评估 | 开发针对肌萎缩侧索硬化症(ALS)的新型基因沉默治疗策略 | Tg(SOD1G93A)转基因小鼠模型(模拟家族性ALS) | 合成生物学 | 肌萎缩侧索硬化症 | siRNA基因沉默技术、小细胞外囊泡递送系统、AAV载体技术 | NA | 动物实验数据、蛋白质水平检测、行为学评估 | Tg(SOD1G93A)转基因小鼠(具体数量未在摘要中说明) | AAV(腺相关病毒)载体 | 小鼠(肝脏细胞) | CMV启动子驱动的合成构建体,编码SOD1-siRNA及sEV表面RVG靶向标签,形成靶向性基因沉默递送系统 | 医学(神经退行性疾病治疗) |
| 77 | 2026-04-04 |
Bioactive Peptides: Production Strategies, Biological Activities, and Emerging Therapeutic Applications
2026-Mar-26, Protein and peptide letters
IF:1.0Q4
|
综述 | 本文综述了生物活性肽的生产策略、生物活性及其新兴治疗应用,并整合了分子、生物技术和信息学驱动的视角 | 独特整合了当前分子、生物技术和信息学驱动的视角,提供了2024-2025年在生产策略、生物测定优化和治疗转化方面的最新进展综述 | 存在纯化困难、稳定性问题和生物利用度限制等挑战,限制了其广泛应用 | 探讨生物活性肽的生产策略、生物活性及其在疾病预防和治疗中的应用潜力 | 源自动物、植物和海洋生物等天然来源的短链氨基酸(生物活性肽) | NA | NA | 酶水解、微生物发酵、化学合成、重组方法、超滤、色谱、质谱、电泳 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药, 食品, 农业 |
| 78 | 2026-04-04 |
Advancing Africa's bioeconomy and biosolutions through microbial natural product discovery: unlocking indigenous microbe potential for sustainability
2026-Mar-25, Microbiology and molecular biology reviews : MMBR
IF:8.0Q1
DOI:10.1128/mmbr.00174-25
PMID:41384918
|
综述 | 本文综述了如何通过微生物天然产物发现,利用非洲本土微生物资源推动其生物经济发展和可持续生物解决方案的开发 | 整合了BV-BRC数据库分析与文献证据,首次系统梳理了非洲本土传统模型及新兴非模型细菌底盘菌株的基因组分布,为基于组学的生物解决方案开发提供了资源图谱 | 调查仅基于BV-BRC数据库数据,未能涵盖所有非洲微生物资源,且受限于数据库的覆盖范围和更新程度 | 推动非洲生物经济发展,通过微生物生物技术解决医疗、农业和工业生物技术领域的可持续性问题 | 非洲本土微生物资源,特别是细菌和病毒资源 | 工业生物技术 | NA | 基因组测序、功能组学、合成生物学 | NA | 基因组数据、文献数据 | 基于BV-BRC数据库的微生物基因组数据 | NA | 细菌(传统模型及新兴非模型底盘菌株) | NA | 医疗, 农业, 工业生物技术 |
| 79 | 2026-04-04 |
Quantification of cholesterol incorporation in giant unilamellar vesicles produced by a modified cDICE method
2026-Mar-25, Soft matter
IF:2.9Q2
DOI:10.1039/d5sm01124h
PMID:41801146
|
研究论文 | 本文提出了一种改进的cDICE方法,用于在巨型单层囊泡中量化胆固醇的掺入,利用荧光膜生物传感器进行非破坏性评估 | 使用甲基-β-环糊精-胆固醇复合物在eDICE方法中高效掺入胆固醇,并开发了基于荧光膜生物传感器的定量分析技术 | NA | 改进模型膜中胆固醇的掺入方法,以更好地模拟真核细胞膜的性质 | 巨型单层囊泡(GUVs)及其胆固醇掺入效率 | 膜生物物理学 | NA | 甲基-β-环糊精-胆固醇复合物递送、荧光膜生物传感器(如NR12A和Flipper-TR)、光谱成像、荧光寿命成像 | NA | 荧光图像数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、生物物理学 |
| 80 | 2026-04-04 |
Pseudomonas putida JM37 as a novel bacterial chassis for ethylene glycol upcycling
2026-Mar, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2025.133884
PMID:41453527
|
研究论文 | 本文报道了恶臭假单胞菌JM37作为一种新型细菌底盘,用于乙二醇升级回收的代谢和生物技术潜力 | 首次将恶臭假单胞菌JM37鉴定为高效代谢乙二醇的细菌底盘,并揭示其乙醛酸同化途径的遗传冗余支持其稳健代谢 | NA | 探索乙二醇的微生物升级回收,以支持可持续生物生产和循环经济 | 恶臭假单胞菌JM37及其在乙二醇代谢和生物合成中的应用 | 合成生物学 | NA | 基因组测序、定向诱变、异源生物合成途径表达 | NA | NA | NA | 合成生物学底盘 | 恶臭假单胞菌JM37 | 乙醛酸同化途径、中链聚羟基脂肪酸酯生物合成途径、紫罗兰素生物合成操纵子、PET水解酶分泌系统 | 环境、工业生物技术 |