合成生物学相关文章
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当前共找到 157 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
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| 61 | 2026-05-12 |
Leveraging pre-trained AI models for robust promoter sequence design in synthetic biology
2026-Apr-30, Biophysics reports
DOI:10.52601/bpr.2025.240033
PMID:42109830
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研究论文 | 利用预训练AI模型实现合成生物学中稳健启动子序列的设计 | 首次将预训练模型概念应用于启动子序列分析，通过创新的预训练与微调范式，结合基础突变模型，实现高效筛选高表达且抗突变的启动子 | 依赖预训练模型（如DNABERT）的性能，可能受限于训练数据质量和模型泛化能力 | 探索预训练AI模型在合成生物学启动子设计中的应用，减少对传统实验方法的依赖 | 酵母启动子序列及其表达水平 | 机器学习 | NA | DNABERT预训练模型，基础突变模拟 | DNABERT, Pymaker | 序列数据 | 多种数据集规模下的启动子样本 | NA | 酿酒酵母 | NA | 生物制药 |
| 62 | 2026-05-12 |
Rhodo-Box: A Synthetic Biology Toolbox to Facilitate Metabolic Engineering of Rhodobacter sphaeroides
2026-04-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00808
PMID:41832780
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研究论文 | 介绍了一种针对荚膜红细菌的合成生物学工具箱Rhodo-Box，旨在促进其代谢工程改造 | 通过适应和扩展Zymo-Parts模块化克隆框架，开发了首个针对荚膜红细菌的标准化基因元件工具集，包括多种复制起点、启动子、诱导系统、核糖体结合位点和转录终止子，并引入了半自动化的克隆方法 | 未对工具在复杂代谢途径中的应用效果进行验证，也未评估长期稳定性 | 开发标准化遗传工具以推进荚膜红细菌在可持续生物制造中的应用 | 荚膜红细菌及其遗传元件 | 合成生物学 | NA | 模块化克隆框架、半自动化克隆方法 | NA | NA | NA | Zymo-Parts模块化克隆框架 | 荚膜红细菌 | 基因表达调控线路（启动子、RBS、终止子等） | 工业生物技术 |
| 63 | 2026-05-12 |
Vibrio natriegens, a Promising Chassis from Strain Property to Protein Expression: A Review
2026-04-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00761
PMID:41886740
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综述 | 系统介绍Vibrio natriegens的基本生物学特性及其在蛋白质表达中的应用进展 | 重点关注Vibrio natriegens在蛋白质表达中的最新研究与应用成就，弥补了以往综述中对该方面的关注不足 | 未明确提及具体限制 | 为研究人员提供使用Vibrio natriegens进行蛋白质表达的综合概述，突出其优势和应用前景，并提出挑战和未来展望 | Vibrio natriegens菌株及其工程化底盘 | 合成生物学 | NA | 蛋白质表达技术 | NA | NA | NA | NA | Vibrio natriegens | NA | 合成生物学 |
| 64 | 2026-05-12 |
Multifunctional Roles and Microbial Production Bottlenecks of Ergothioneine
2026-04-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00735
PMID:41919719
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综述 | 综述麦角硫因的多功能角色及其微生物生产瓶颈 | 总结了麦角硫因生物合成和分解代谢途径中关键酶的发现与鉴定进展，以及代谢工程策略的最新成果，并介绍了化学酶促级联合成路径实现最高产量 | 未明确提及研究限制，但可能包括异源生产中的代谢负担和产量优化挑战 | 探讨麦角硫因的多功能角色及其微生物生产瓶颈 | 麦角硫因及其关键酶 | 机器学 | NA | 代谢工程 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 食品, 化妆品, 医药 |
| 65 | 2026-05-12 |
NUPACK: Computational Nucleic Acid Analysis and Design
2026-04-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00817
PMID:41926704
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研究论文 | 介绍NUPACK 4软件套件，用于核酸结构、装置和系统的分析与设计 | NUPACK 4在物理模型、计算速度、可扩展性、材料混合和序列约束方面实现了全面升级 | NA | 为核酸纳米技术、分子编程、合成生物学和生命科学领域提供计算工具 | 核酸结构和装置 | 分子编程 | NA | NUPACK算法，核酸设计 | NA | NA | NA | NA | NA | 动态杂交级联反应通路，结构工程（含假结） | 合成生物学，纳米技术 |
| 66 | 2026-05-12 |
Coevolution of plant-microbe interactions, friend-foe continuum, and microbiome engineering for a sustainable future
2026-04-06, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2026.01.010
PMID:41618562
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综述 | 本文综述了植物-微生物共进化在约4.5亿年间的历程，并提出了一个基于共进化原理的工程框架，用于可持续农业发展 | 该文创新性地构建了一个基于深层时间、三支柱框架（细胞器发生、根系进化和免疫门控）的植物-微生物共进化整合框架，并提出了从共进化原则转化为功能蓝图的预测性、进化知情的策略 | NA | 将植物-微生物共进化原理转化为可持续农业的工程策略，以改善作物性能 | 植物-微生物互作关系及其共进化机制 | 机器学习,合成生物学,基因组编辑 | NA | 基因组编辑,合成生物学,AI,微生物组工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9,基因组编辑工具 | 植物,微生物 | 合成微生物群落,免疫受体工程,代谢开关 | 农业,可持续农业 |
| 67 | 2026-05-08 |
Functional Characterization and Mutagenesis Studies of a Microbial-like Diterpene Synthase from Huperzia serrata
2026-Apr-17, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules31081329
PMID:42076007
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research paper | 首次鉴定并表征了蛇足石杉中的微生物样二萜合酶MTPSL1，揭示其多产物特性和关键氨基酸残基对骨架多样性的调控机制 | 首次报道蛇足石杉中的微生物样萜类合酶，通过结构导向的诱变研究揭示了酶功能多样性的分子基础，并发现S224A突变使特定二萜产量提升11.6倍 | 未明确说明该酶的底物特异性和体内代谢网络，以及突变体对其他底物和产物的影响未全面评估 | 探究蛇足石杉中微生物样二萜合酶的存在及其功能，并验证突变工程对产物产量的调控潜力 | 蛇足石杉（Huperzia serrata）中的微生物样二萜合酶MTPSL1及其诱变突变体 | 植物功能基因组学、酶工程、天然产物生物合成 | NA | 转录组分析、异源表达、分子克隆、定点诱变、质谱分析、核磁共振 | NA | 转录组数据、化合物结构数据 | 1个MTPSL1酶及其S224A突变体 | 定点诱变、异源表达 | 大肠杆菌（E. coli） | 二萜生物合成途径（针对spatane、prenylkelsoene型和biflorane三类骨架） | 天然产物生物合成、蛋白质工程、合成生物学 |
| 68 | 2026-05-08 |
Identification and characterization of two novel Acinetobacter species capable of degrading polyester
2026-Apr-09, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.02491-25
PMID:41954411
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研究论文 | 本研究鉴定并表征了两株能够降解多种聚酯塑料的新型不动杆菌菌株 | 发现并描述了两个新型不动杆菌分类单元（新种CAAS 2-6和新亚种CAAS 2-13），它们能利用五种主要商品聚酯作为唯一碳源，并鉴定了关键解聚酶多铜氧化酶和烷烃羟化酶 | NA | 鉴定和表征具有聚酯降解能力的新型不动杆菌菌株，扩展其降解塑料的代谢能力并提供生物修复候选菌 | 两株从垃圾渗滤液和草莓农田分离的不动杆菌菌株CAAS 2-6和CAAS 2-13 | 微生物学 | NA | 系统发育分析,基因组比较,酶解聚合实验 | NA | 基因组序列数据 | 两株细菌菌株 | NA | 不动杆菌 | NA | 环境生物修复,工业生物技术 |
| 69 | 2026-05-08 |
A Clozapine-Responsive GPCR-Based Gene Switch for Pharmacological Control of Gene Expression in Mammalian Cells and In Vivo
2026-Apr-09, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27083381
PMID:42074026
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研究论文 | 报道一种基于氯氮平响应性GPCR的基因开关，用于在哺乳动物细胞和体内实现药物可控的基因表达 | 首次将设计药物特异性激活受体与信号依赖性转录控制耦合，构建出临床相关的人源GPCR基因调控平台，并利用口服氯氮平实现体内低剂量有效调控 | 该基因开关的长期稳定性、免疫原性及在复杂疾病模型中的治疗效果尚需进一步验证 | 开发一种安全、临床兼容的药物调控基因表达系统，用于哺乳动物合成生物学和细胞治疗 | 哺乳动物细胞及C57BL/6J小鼠体内的工程化报告细胞 | 合成生物学 | NA | GPCR信号通路、cAMP/钙响应合成启动子 | NA | 基因表达数据 | C57BL/6J小鼠体内植入的藻酸盐包封报告细胞 | NA | 哺乳动物细胞、C57BL/6J小鼠 | 氯氮平响应性基因开关，耦合GPCR与cAMP或钙响应合成启动子 | 医学 |
| 70 | 2026-05-08 |
Remote Sensing of Endogenous Pigmentation by Inducible Synthetic Circuits in Grasses
2026-Apr, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70480
PMID:41351300
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研究论文 | 本研究成功在C4单子叶植物狗尾草中构建了配体诱导合成电路，通过远程传感技术检测内源性色素生成 | 首次在单子叶植物中实现配体诱导的内源性花青素通路激活，并结合高光谱成像与判别性目标表征方法进行非破坏性远程检测 | 尚未在更大范围单子叶作物或田间环境中验证系统稳定性和普适性，配体渗透效率可能受物理屏障影响 | 探索单子叶植物中诱导型合成电路的应用，实现内源性色素生成的可控诱导与远程传感 | 狗尾草（Setaria viridis）原生质体及整株植物 | 合成生物学 | NA | 高光谱成像，判别性目标表征 | NA | 高光谱图像 | 狗尾草原生质体及整株植物样本 | 传感器电路构建 | 狗尾草（Setaria viridis） | 配体诱导型传感器电路，激活内源性花青素通路 | 农业 |
| 71 | 2026-05-08 |
Bioorthogonal and synthetic biology-engineered bacterial outer membrane vesicles for enhanced photo-immunotherapy
2026-04, Acta biomaterialia
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.actbio.2026.02.044
PMID:41740694
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研究论文 | 工程化细菌外膜囊泡用于增强光免疫治疗 | 结合合成生物学与生物正交化学，双重改造细菌外膜囊泡，同时实现基因工程表达IL-2、载光敏剂ICG及生物正交靶向，形成协同抗肿瘤免疫平台 | 未提及长期安全性评估、大规模制备工艺及临床转化可行性验证 | 开发兼具免疫激活、光热治疗与精准肿瘤靶向的多功能OMV纳米载体，用于增强乳腺癌的光免疫治疗 | 细菌外膜囊泡（OMVs） | 合成生物学 | 乳腺癌 | 电穿孔、代谢糖工程 | NA | NA | NA | 合成生物学、生物正交化学 | 细菌 | IL-2表达模块、N3/DBCO生物正交标记系统 | 医学 |
| 72 | 2026-05-07 |
STRAIGHT-IN Dual: a platform for dual single-copy integrations of DNA payloads and gene circuits into human induced pluripotent stem cells
2026-Apr-30, Nature biomedical engineering
IF:26.8Q1
DOI:10.1038/s41551-026-01677-9
PMID:42062565
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研究论文 | STRAIGHT-IN Dual平台能够在人诱导多能干细胞中高效同时进行两个DNA构建体的等位基因特异性单拷贝整合 | 开发了STRAIGHT-IN Dual平台，实现一周内同时进行两个DNA构建体的等位基因特异性单拷贝整合，并支持近无疤痕载荷整合和组件循环利用 | NA | 开发高效的双基因整合平台，加速干细胞中合成生物学的设计-构建-测试循环 | 人诱导多能干细胞(hiPSCs)及其分化产生的神经元、运动神经元和内皮细胞 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 人诱导多能干细胞, 神经元, 运动神经元, 内皮细胞 | 四环素诱导型控制与格拉佐普瑞韦诱导型合成基因开关 | 医学, 生物技术 |
| 73 | 2026-05-07 |
An in vitro approach for simulating divergent Golgi O-glycosylation of tumor-associated MUC1 from normal MUC1
2026-04-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-72151-y
PMID:42020444
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研究论文 | 通过体外合成生物学方法模拟肿瘤相关MUC1与正常MUC1的差异性高尔基体O-糖基化 | 首次采用体外一锅合成生物学方法模拟癌症相关的糖基化通路差异，结合动力学和计算机反应动态模拟解析酶定位和底物特异性 | NA | 解析肿瘤相关MUC1异常糖基化的分子机制 | MUC1黏蛋白及其糖基化过程 | 合成生物学 | 肿瘤 | 体外一锅合成生物学方法，动力学模拟，计算机反应动态模拟 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 74 | 2026-05-05 |
Osmotic signaling governs sunscreen biosynthesis to safeguard desert cyanobacteria against desiccation
2026-Apr, mLife
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/mlf2.70075
PMID:42079446
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研究论文 | 揭示了渗透信号通过调控防晒霜类菌胞素样氨基酸的生物合成来保护沙漠蓝细菌免受干燥胁迫 | 首次发现类菌胞素样氨基酸在干旱条件下作为渗透保护剂的双重功能，并鉴定出Dsp1-OrrA信号通路介导渗透诱导的MAA生物合成 | 未详细探讨MAA在其他胁迫条件下的具体功能，以及该信号通路在其他生物中的保守性 | 研究类菌胞素样氨基酸在沙漠蓝细菌应对干燥胁迫中的作用及其调控机制 | 沙漠蓝细菌（一种沙漠适应性的蓝细菌） | 合成生物学, 微生物学 | 不适用 | 基因破坏、生化分析、系统发育基因组分析 | 不适用 | 基因组数据、生化实验数据 | 不适用 | 不适用 | 沙漠蓝细菌 | 不适用 | 环境生物技术, 合成生物学 |
| 75 | 2026-05-04 |
RNA sensors and actuators for dynamic cellular regulation
2026-Apr-30, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2026.04.005
PMID:42067429
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综述 | 本文综述了用于动态细胞调控的RNA传感器和致动器的工程化进展 | 从RNA结构动力学角度强调其与蛋白质系统相比的优势，并整合了合成生物学、RNA治疗学的最新进展 | 未提及具体实验验证或量化比较与蛋白质系统的性能差异 | 推动RNA在合成细胞控制方案中的应用，提升微生物生物合成和靶向基因治疗 | RNA传感器和致动器 | 合成生物学 | NA | RNA工程 | NA | NA | NA | NA | NA | RNA传感器与致动器 | 医学, 工业生物技术 |
| 76 | 2026-05-04 |
Synthetic Biology Approaches to Enzymology in Food and Agriculture Systems
2026-Apr-29, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c16525
PMID:41962132
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综述 | 探讨合成生物学方法在食品与农业系统中酶学应用的研究进展 | 系统综述了合成生物学在酶工程领域的最新进展，重点讨论了如何将其他行业的技术改造应用于食品与农业系统 | 当前存在的局限性及监管问题，需要进一步探索合成生物学在全球食品系统中的整合方向 | 探索合成生物学在食品与农业系统中通过酶介导解决方案应对全球粮食不安全问题的应用 | 食品与农业系统中的酶及其工程化改造方法 | 合成生物学 | NA | 酶工程、生物催化、计算设计 | NA | NA | NA | NA | NA | 酶介导的代谢途径和生物催化通路 | 食品, 农业 |
| 77 | 2026-05-03 |
Harnessing synthetic circuits to illuminate microbial electron transfer: a perspective on engineered metabolism
2026-Apr-30, Journal of microbiology & biology education
IF:1.6Q2
DOI:10.1128/jmbe.00290-25
PMID:41627025
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研究论文 | 该视角文章聚焦于一项利用合成基因电路促进微生物电子传递的研究，展示了通过工程化代谢生产氧化还原活性代谢物增强胞外电子传递和发电的能力 | 创新点在于通过合成生物电路控制氧化还原介质的产生，为理解微生物电子流和生物电子设计提供新视角，并作为教育案例整合多学科知识 | NA | 探讨合成电路在微生物电子传递中的应用，并强调其在教育中促进跨学科学习的潜力 | 微生物电子传递和工程化代谢 | 合成生物学 | NA | 合成基因电路 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | 合成基因电路用于生产并释放吩嗪-1-羧酸（一种氧化还原活性代谢物） | 生物技术, 教育 |
| 78 | 2026-05-03 |
From CRISPR functional genomics to synthetic interventions: engineering antiviral strategies
2026-04-21, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.00057-26
PMID:41910274
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综述 | 本文综述了从CRISPR功能基因组学到合成生物学干预的进展，旨在工程化抗病毒策略 | 将CRISPR功能基因组学筛选与合成生物学设计相结合，提出可编程干预手段（如受体诱饵、基因电路和工程化免疫细胞） | 讨论从筛选机制转化为安全有效抗病毒策略时面临的约束条件 | 连接CRISPR功能基因组学与合成抗病毒设计，总结跨病毒家族通用原则 | 病毒与宿主相互作用中的宿主依赖性因子和限制因子 | 功能基因组学, 合成生物学 | 病毒相关疾病 | CRISPR扰动筛选, 单细胞测序, 成像技术, 空间表型分析, 类器官模型 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 人类细胞 | 受体诱饵及结合分子、条件性蛋白降解系统、感染感应基因电路、可调抗病毒功能免疫细胞 | 医学 |
| 79 | 2026-05-02 |
Engineering Plant-Derived P450 Enables the Efficient Production of Berberine through a Concise and Modular Enzymatic Cascade in E. coli
2026-Apr-27, JACS Au
IF:8.5Q1
DOI:10.1021/jacsau.6c00169
PMID:42063854
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研究论文 | 通过工程化植物来源的P450酶，设计模块化酶促级联反应在大肠杆菌中高效生产小檗碱 | 优化设计了绕过多个天然步骤的简明模块化途径，并结合表达优化、结构指导设计、共识突变和机器学习综合工程化CYP719A1，获得活性提高8.9倍且热稳定性改善的变体 | NA | 解决植物膜结合细胞色素P450酶催化瓶颈，实现植物天然产物小檗碱的可持续高效生产 | 植物来源的CYP719A1酶及其工程化变体 | 合成生物学、代谢工程 | NA | 蛋白质工程、机器学习、酶级联反应 | 机器学习模型 | 序列和结构数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 模块化酶促级联途径（包含P450依赖步骤） | 医药、工业生物技术 |
| 80 | 2026-05-01 |
LinkCraft: An interactive tool for the design of flexible linkers
2026-Apr-17, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2026.169814
PMID:42001978
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研究论文 | LinkCraft是一个用于设计多结构域蛋白质中柔性连接子的交互式计算工具 | 将连接子视为可调节的分子功能决定因素，支持基于理化性质的序列生成和系综建模评估 | 未明确讨论实验验证结果或与其他设计工具的性能比较 | 为多结构域蛋白质的柔性连接子提供理性设计工具 | 多结构域蛋白质中的固有结构无序连接子 | 合成生物学 | NA | 计算建模 | 系综模型 | 蛋白质序列 | NA | NA | NA | 多结构域蛋白质连接子设计 | 合成生物学, 生物技术 |