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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2026-06-26 |
The Gut Microbiome Dependency Continuum in Drug Discovery: A Unified Pharmacology Framework Linking Clinical Drugs, Natural Products, and Engineered Microbial Therapeutics
2026-Jun-10, Biotech (Basel (Switzerland))
DOI:10.3390/biotech15020043
PMID:42346015
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综述 | 提出肠道微生物组依赖性连续谱框架,整合临床药物、天然产物和工程微生物疗法,揭示微生物组在药理学中的关键作用 | 首次提出四层肠道微生物组依赖性连续谱框架,将微生物组从被动调节剂重新定义为可编程治疗平台,系统整合药物发现中的微生物组依赖性层次 | NA | 构建统一药理学框架,阐述肠道微生物组在药物发现和治疗功能中不同深度依赖性,推动微生物组感知的药物发现和精准工程微生物疗法开发 | 肠道微生物组及其与药物的相互作用(包括粪便微生物移植、微生态制剂、代谢调节药物、天然产物和工程微生物疗法) | NA | NA | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 肠道微生物组 | 可编程微生物系统、工程益生菌、微生物组响应药物递送系统、合成微生物群落 | 医学 |
| 62 | 2026-06-26 |
Advances in UDP-Glycosyltransferases from Medicinal Plants: Discovery, Catalytic Mechanism, Engineering and Biosynthetic Application
2026-Jun-10, Metabolites
IF:3.4Q2
DOI:10.3390/metabo16060402
PMID:42346382
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综述 | 系统总结了药用植物UDP-糖基转移酶的最新全球研究进展,涵盖发现、催化机制、工程改造及生物合成应用 | 首次系统整合多组学、人工智能辅助基因挖掘与蛋白质工程优化策略,构建了包括体外多酶级联、微生物细胞工厂和植物悬浮细胞培养的全谱生物制造体系框架 | 工业化放大、监管合规和临床转化是核心挑战 | 为药用植物UDP-糖基转移酶的工程应用提供完整技术框架,支持稀有天然治疗性糖苷的绿色规模化生产 | 药用植物UDP-糖基转移酶 | 机器学习 | NA | 多组学, 人工智能, 蛋白质工程 | NA | NA | NA | NA | 微生物、植物悬浮细胞 | 体外多酶级联、微生物细胞工厂、植物悬浮细胞培养系统 | 医学, 工业生物技术 |
| 63 | 2026-06-26 |
Pharmaco-microdynamics (PMD): Redefining dose, exposure, and control for living drug carriers
2026-Jun-09, Annales pharmaceutiques francaises
IF:1.0Q4
DOI:10.1016/j.pharma.2026.06.002
PMID:42264080
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综述 | 提出药效微动力学(PMD)框架,用于量化活体药物载体的剂量、暴露与控制 | 首次将药代动力学/药效学(PK/PD)框架扩展到活体药物系统,定义了功能暴露积分、定植效率等新指标,并整合药理学、微生物生态学、合成生物学等多学科原理 | 框架尚处于理论阶段,需大量实验验证;边界条件(如非复制型微生物干预)下经典PK/PD仍适用,PMD的适用范围存在局限 | 建立定量递送科学体系,重新定义活体治疗药物的暴露与控制 | 活体药物载体(如益生菌、工程微生物治疗剂、活体生物治疗产品) | 机器学习 | 苯丙酮尿症、复发性艰难梭菌感染 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 64 | 2026-06-26 |
Synthetic Mirror Bacteria as a Frontier for Chiral Synthetic Biology and Biocontainment
2026-Jun, MicrobiologyOpen
IF:3.9Q2
DOI:10.1002/mbo3.70356
PMID:42338029
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综述 | 本文综述了镜像细菌作为手性合成生物学与生物防护前沿领域的理论基础、工程策略、生物安全考量和生态影响 | 系统探讨了镜像生物学系统中分子手性反转带来的立体化学约束及工程挑战,并评估了其在生物安全与生态影响方面的独特问题 | 镜像细菌仍处于理论构建阶段,集成手性反转生物分子到自我复制细胞系统是尚未解决的重大科学挑战 | 探讨镜像细菌的分子基础、工程策略、生物安全问题及生态影响 | 镜像细菌(mirror bacteria) | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 镜像生物系统 | 生物安全, 合成生物学 |
| 65 | 2026-06-26 |
Metabolic and Synthetic Biology Strategies for Enhancing Single-Cell Protein Production in Saccharomyces cerevisiae
2026-Jun, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.70273
PMID:42345366
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综述 | 本文综述了利用代谢工程和合成生物学策略提高酿酒酵母单细胞蛋白产量的最新进展 | 系统总结了通过代谢和合成生物学方法增强酵母蛋白质含量和细胞生物量的策略,并强调其在可持续大规模蛋白质生产中的潜力 | 未明确指出具体研究的局限性 | 探讨如何通过代谢和合成生物学策略提高酿酒酵母单细胞蛋白产量,以应对全球粮食安全和碳中和目标 | 酿酒酵母单细胞蛋白 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 酿酒酵母 | NA | 食品、饲料、工业生物技术 |
| 66 | 2026-06-25 |
Genetically engineered outer membrane vesicles as next-generation bionanomaterials for therapeutic and diagnostic applications
2026-Jun-23, Journal of materials chemistry. B
DOI:10.1039/d6tb00650g
PMID:42300204
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综述 | 本文系统综述了基因工程外膜囊泡作为下一代生物纳米材料在治疗和诊断应用中的设计策略与转化前景 | 整合合成生物学与基因工程技术将天然外膜囊泡转化为可编程智能生物纳米平台,并系统阐述表面展示、货物装载及膜调控三大工程策略 | 临床转化面临规模化生产、安全性评估和监管路径等关键挑战 | 探讨基因工程外膜囊泡在精准治疗与诊断中的设计原则及未来发展方向 | 基因工程外膜囊泡(geOMVs) | 合成生物学 | 癌症 | 基因工程 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 革兰氏阴性菌 | 表面展示、货物封装、膜调控 | 医学 |
| 67 | 2026-06-24 |
A plug-and-play cytochrome P450 system enables de novo biosynthesis of 2-phenylethanol derivatives
2026-Jun-19, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2026.102493
PMID:42314827
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研究论文 | 开发了一种基于细胞色素P450的即插即用系统,实现了2-苯乙醇衍生物的从头生物合成 | 首次将定向酶进化与系统代谢工程整合,构建了区域发散性和对映选择性的P450BM3变体,并在解脂耶氏酵母中实现了高滴度的(R)-苯乙醇二醇和红景天苷的生物合成 | 文章未明确提及局限性 | 实现高价值芳香族化合物的可持续生物制造 | 2-苯乙醇衍生物,如(R)-苯乙醇二醇、酪醇、红景天苷和2-苯乙基-β-D-葡萄糖苷 | 合成生物学 | NA | 定向酶进化, 系统代谢工程, 结构导向设计 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 解脂耶氏酵母 (Yarrowia lipolytica) | 即插即用的细胞色素P450系统,包括脂肪酸羟化酶P450BM3变体及其底物通路 | 工业生物技术, 医药 |
| 68 | 2026-06-24 |
Common γ-chain cytokines in brain tumor immunotherapy: Biological barriers and advances in macromolecular delivery systems
2026-Jun, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.152288
PMID:42092664
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综述 | 探讨常见γ链细胞因子在脑肿瘤免疫治疗中的应用,重点关注生物屏障和递送系统的进展 | 系统总结了基于纳米颗粒、外泌体和细胞载体的递送平台如何克服脑肿瘤免疫治疗中细胞因子面临的生物屏障、半衰期短和毒性等挑战 | 缺乏具体的临床试验数据支持,多数讨论仍基于体外和动物模型结果,临床转化前景尚不明确 | 研究常见γ链细胞因子在脑肿瘤免疫治疗中的潜力和递送策略 | 常见γ链细胞因子(如IL-2、IL-7、IL-15等)以及脑肿瘤微环境 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 69 | 2026-06-23 |
Emerging porous materials for cell encapsulation
2026-Jun-22, Chemical Society reviews
IF:40.4Q1
DOI:10.1039/d4cs00071d
PMID:42132741
|
综述 | 从合成生物学和材料科学角度综述细胞@MOF、细胞@COF和细胞@HOF复合材料的最新进展 | 系统总结多孔框架材料封装细胞的合成策略,并整合细胞表面化学与活性评估方法 | 未深入讨论不同框架材料在长期稳定性与免疫原性方面的比较 | 探讨框架材料在合成细胞工程和增强细胞功能中的应用前景与挑战 | 细胞@MOF、细胞@COF、细胞@HOF复合材料 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 多孔框架封装系统(MOF、COF、HOF) | 医学, 工业生物技术, 环境 |
| 70 | 2026-06-23 |
Overcoming cellular secretion bottlenecks: advanced secretion engineering and molecular tailoring for next-generation microbial α-amylases with enhanced industrial performance
2026-Jun-22, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-026-05053-2
PMID:42329468
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综述 | 本文综述了克服微生物α-淀粉酶细胞分泌瓶颈的策略,包括信号肽优化、分子伴侣共表达和CRISPR-Cas基因编辑等技术 | 将传统克隆范式转向设计参数框架,结合人工智能和分子动力学模拟进行理性设计,并采用CRISPR-Cas技术实现精确基因组编辑以提升酶产量 | 未提及具体实验验证或比较不同策略的实际效果,缺乏定量分析 | 分析并解决微生物α-淀粉酶生产中的分泌瓶颈,提升其工业性能 | 微生物α-淀粉酶 | 机器学习 | NA | CRISPR-Cas | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 枯草芽孢杆菌, 毕赤酵母, 黑曲霉, 大肠杆菌 | 信号肽优化, 分子伴侣共表达, 碳水化合物结合模块融合 | 工业生物技术, 医药, 食品 |
| 71 | 2026-06-23 |
Heterologous production of a plant biostimulant in Streptomyces albidoflavus
2026-Jun-20, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-026-13915-w
PMID:42322407
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研究论文 | 本研究通过异源生产平台在Streptomyces albidoflavus中生产植物生物刺激素pteridic acids F和H,并显著提高了产量 | 首次建立pteridic acids (PTA)的功能性异源生产平台,结合Cas12a辅助的精确靶向克隆、CRISPR-Cas9基因组整合和启动子工程,以及基因组规模代谢模型指导的培养基优化,实现超过20倍的产量提升 | 初始异源表达仅产生可检测的elaophylin而非PTA,且经过启动子工程后PTA产量仍低于定量限 | 建立Pteridic acids (PTA)的异源生产平台并优化产量,以开发植物生长促进剂应对非生物胁迫 | Pteridic acids F和H(植物生长促进聚酮化合物) | 合成生物学 | NA | Cas12a辅助精确靶向克隆(CAPTURE), CRISPR-Cas9, 基因组规模代谢模型 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Cas12a, Cre-lox重组 | Streptomyces albidoflavus J1074, NBC1270 | PTA生物合成基因簇异源表达系统,包括kasOp*启动子工程 | 农业, 生物技术 |
| 72 | 2026-06-23 |
Strategies for enhancing specificity and efficacy of oncolytic viruses in cancer treatment
2026-Jun, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2026.110708
PMID:41999961
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综述 | 综述了增强溶瘤病毒在癌症治疗中特异性和功效的策略 | 系统总结了转录靶向、微小RNA去靶向、病毒进入重定向等多层次逻辑门调控系统,以及免疫调节、纳米包裹、载体细胞运输等最新工程技术进展 | 虽然综述了多种策略,但未讨论这些方法在临床试验中的实际转化障碍或长期安全性数据 | 分析当前溶瘤病毒工程化进展,以解决肿瘤选择性不足和治疗效果有限的问题 | 溶瘤病毒及其工程化改造策略 | 机器学, 合成生物学 | 癌症 | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick | 哺乳动物细胞 | 逻辑门调控系统, 开关, 代谢通路 | 医学 |
| 73 | 2026-06-23 |
Engineering Lactobacillus for therapeutic delivery and biosensing: lessons from niche adaptation
2026-Jun, Future microbiology
IF:2.5Q3
DOI:10.1080/17460913.2026.2686558
PMID:42288957
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review | 综述了乳酸杆菌的工程化改造及其在治疗递送和生物传感中的应用,重点讨论了其生态位适应机制带来的启示 | 系统总结了乳酸杆菌通过合成生物学工具(如CRISPR-Cas系统)从传统益生菌向多功能治疗递送和生物传感平台转化的最新进展 | 工程化乳酸杆菌的稳定性和法规监管方面仍存在挑战 | 探讨乳酸杆菌作为活体生物治疗产品和生物传感器的工程化应用潜力 | 乳酸杆菌及其工程化改造产物 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas, 基因工程, 包囊技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | 乳酸杆菌 | 治疗递送系统(重组蛋白、疫苗、细胞因子、靶向酶、多肽),生物传感器(全细胞或无细胞平台检测病原体、毒素、临床生物标志物) | 医学, 食品安全, 环境监测, 诊断 |
| 74 | 2026-06-22 |
Multilevel Metabolic Engineering of Probiotic Escherichia coli Nissle 1917 for Antibiotic-Free Production of β-Alanine
2026-Jun-10, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00228
PMID:42270566
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研究论文 | 通过对益生菌大肠杆菌Nissle 1917进行多层次的代谢工程改造,实现无抗生素条件下β-丙氨酸的高效生产 | 首次系统研究了TdcC、SstT、SdaC和RhaT四种转运蛋白在β-丙氨酸积累中的作用,并构建了无抗生素菌株,在5升生物反应器中达到60.55 g/L的产量,是目前益生菌生产β-丙氨酸的最高水平 | 尚未提及在工业放大或不同碳源条件下的性能评估 | 通过多层次代谢工程策略,实现益生菌大肠杆菌Nissle 1917无抗生素生产β-丙氨酸 | 益生菌大肠杆菌Nissle 1917中的代谢途径和转运系统 | 代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 单一菌株在5升生物反应器中多次发酵 | NA | 大肠杆菌Nissle 1917 | 异源关键酶引入、前体L-天冬氨酸双途径强化、竞争途径动态调控、中心代谢重编程、转运系统工程 | 工业生物技术 |
| 75 | 2026-06-21 |
Efficient site-specific gene addition using R2 retrotransposons in tobacco and rice
2026-Jun-19, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-026-03181-6
PMID:42321491
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研究论文 | 本文介绍了一种利用R2逆转录转座子在烟草和水稻中进行高效位点特异性基因添加的方法 | 首次在植物中重建非长末端重复R2逆转录转座子活性,实现无双链断裂的RNA模板化多位点基因整合,效率高达75% | 仅针对rDNA位点进行整合,可能存在位置效应,且转化效率在愈伤组织中最高仅为17% | 开发一种高效、精确的植物基因整合技术,用于作物改良和合成生物学 | 烟草(Nicotiana benthamiana)和水稻(Oryza sativa) | 合成生物学 | NA | R2逆转录转座子、重组RNA病毒介导的供体递送 | NA | NA | 烟草和水稻细胞及愈伤组织,具体数量未明确 | R2逆转录转座子 | 烟草(Nicotiana benthamiana),水稻(Oryza sativa) | 位点特异性基因整合系统(含R2逆转录转座酶和重组酶兼容着陆垫) | 农业, 合成生物学 |
| 76 | 2026-06-21 |
Synergistic dual ring-cleavage pathways enable efficient degradation of chlorobenzenes by Pseudomonas putida BS-1 in groundwater
2026-Jun-15, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2026.142676
PMID:42320103
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研究论文 | 发现恶臭假单胞菌BS-1中一种新型协同双环裂解途径,可有效降解地下水中的氯苯类污染物 | 首次揭示一种由质粒携带的tod-clc基因簇介导的邻位和间位裂解途径协同作用机制,能够快速解毒中间代谢产物氯代儿茶酚 | 研究主要基于单一菌株和实验室条件,未评估长期现场应用中的稳定性和生态影响 | 阐明氯苯类化合物生物降解过程中氯代儿茶酚解毒的新机制,并提供用于地下水修复的微生物资源 | 恶臭假单胞菌BS-1菌株及其降解对二氯苯、氯苯和苯的代谢途径 | 环境微生物学 | NA | 基因敲除、异源表达、代谢产物分析 | NA | 实验数据 | 单一菌株BS-1,以及实际受污染地下水样本(含p-DCB 6.83 mg·L⁻¹和o-DCB 13.31 mg·L⁻¹) | NA | 恶臭假单胞菌 | 由tod-clc基因簇编码的邻位和间位双环裂解途径 | 环境修复 |
| 77 | 2026-06-20 |
Repurposing the Diatom Periplastidial Compartment for Heterologous Terpenoid Production
2026-Jun-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00919
PMID:42101919
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研究论文 | 通过系统分析硅藻中不同细胞区室的萜类合成能力,提出周质体腔(PPC)作为可工程化的细胞内空间用于异源萜类生产 | 首次系统评估硅藻周质体腔(PPC)作为工程化细胞区室的萜类合成潜力,揭示其与MVA和MEP途径的代谢交换界面 | 未提及大规模生产或工业应用验证,需进一步优化工程策略 | 探索硅藻周质体腔(PPC)用于异源萜类生产的可行性与工程化潜力 | 硅藻周质体腔(PPC)、细胞质、叶绿体中的萜类合酶靶向表达 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 代谢物定量数据 | 未明确样本数量 | NA | 硅藻 | 萜类合成代谢途径(包括半萜、单萜、倍半萜和四萜的合酶靶向表达) | 工业生物技术 |
| 78 | 2026-06-20 |
A Linear Mixed Effects Model for Evaluating Synthetic Gene Circuits
2026-Jun-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00171
PMID:42112575
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research paper | 提出了一种用于评估合成基因电路性能的线性混合效应模型 | 首次应用线性混合效应模型来统计评估布尔逻辑门性能,并提供可量化的固定效应点估计β̂作为门行为的统一描述符 | 对多输入多输出逻辑的扩展验证尚需更多实验数据支撑 | 标准化合成基因电路统计评估方法 | 合成基因电路中的布尔逻辑门 | 合成生物学 | NA | 线性混合效应模型, 蒙特卡洛模拟, k-means聚类 | 线性混合效应模型, k-means | 模拟数据与实验数据 | 144个已发表布尔逻辑门 | NA | NA | 布尔逻辑门(OR、AND等) | 合成生物学应用(计算、生物传感、人类健康) |
| 79 | 2026-06-20 |
Temporal Programming of Cell-Free Transcription Using Orthogonal Enzyme-Responsive DNA Blockers
2026-Jun-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00147
PMID:42137991
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研究论文 | 设计正交的酶驱动DNA转录定时器,实现无细胞转录的时间延迟精确编程 | 利用正交酶响应性DNA阻断链,通过选择性酶切实现多个转录模板的独立时间控制,并展示下游Cas12a活性的时序调控 | 未明确提及,但可能涉及阻断链设计与酶特异性的进一步优化 | 建立无细胞合成生物学中时间分辨转录和基因表达的通用框架 | 正交酶响应性DNA阻断链、RNase H、尿嘧啶DNA糖基化酶(UDG)和甲酰胺嘧啶DNA糖基化酶(Fpg)等酶 | 合成生物学 | NA | 无细胞转录、酶切动力学调控 | NA | 转录时间曲线数据 | NA | DNA阻断链设计、酶驱动定时器 | 无细胞系统 | 基于DNA阻断链的转录定时器、Cas12a酶切活性调控回路 | 合成生物学、生物技术 |
| 80 | 2026-06-20 |
Streptomyces Autoregulator Biosensors from Natural Product Cluster-Situated Regulators
2026-Jun-19, ACS chemical biology
IF:3.5Q2
DOI:10.1021/acschembio.6c00061
PMID:42117380
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研究论文 | 开发了八种基于簇定位调节因子的自诱导物生物传感器,并探索其在合成生物学中的应用 | 首次将多个预测的群体感应自诱导物回路工程化为可诱导表达系统,并验证了生物传感器间的正交性和共培养能力 | 未提及 | 开发基于链霉菌自诱导物的生物传感器,用于天然产物调控机制研究和合成生物学应用 | 链霉菌中的簇定位调节因子及其自诱导物配体 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 八种生物传感器,多种配体浓度测试 | NA | 链霉菌属 | 群体感应调控回路、正交信号系统、多输入遗传电路 | 工业生物技术 |