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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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61 | 2025-07-17 |
A digital plating platform for robust and versatile microbial detection and analysis
2025-Jul-13, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-11525-6
PMID:40653544
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research paper | 介绍了一种数字平板(DP)平台,该平台结合了传统平板培养和数字生物检测技术,用于微生物的快速分离、定量和表型特征分析 | 提出了一个结合传统平板培养和数字生物检测技术的数字平板平台,实现了微生物的快速检测和分析,显著缩短了检测时间并提高了单细胞分辨率 | 未提及具体的技术限制或潜在问题 | 开发一种快速、高效的微生物检测和分析平台 | 微生物(如大肠杆菌)及其在混合微生物群落中的行为 | microbiology | NA | digital bioassay technology, high-density picoliter microwell array chip | NA | microbial data | 未提及具体样本数量,但涉及多种微生物实验(如大肠杆菌) |
62 | 2025-07-17 |
Synthetic biology for space exploration
2025-Jul-12, NPJ microgravity
IF:4.4Q1
DOI:10.1038/s41526-025-00488-7
PMID:40651964
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research paper | 本文探讨了合成生物学在太空探索中的潜在应用,包括资源利用、生命支持系统、辐射防护和人类健康等关键主题 | 提出合成生物学作为推动人类太空和行星探索的有力工具,并为短期、中期和长期发展提供建议 | NA | 探索合成生物学在解决太空探索挑战中的应用 | 太空探索中的资源利用、生命支持系统、辐射防护和人类健康 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
63 | 2025-07-17 |
Yeast as C1 cell factory: Transforming methanol and Formate into high-value compounds
2025-Jul-09, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108641
PMID:40645511
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综述 | 本文综述了酵母作为C1细胞工厂,将甲醇和甲酸盐转化为高价值化合物的研究进展、挑战及未来展望 | 探讨了合成甲基营养在非甲基营养酵母中的应用,以及通过非理性基因组工程和理性设计揭示C1途径和底物耐受机制 | C1气体生物转化技术尚未解决的技术限制仍阻碍其工业应用 | 研究如何利用酵母将温室气体转化为高价值生化产品,以实现可持续的工业脱碳 | 工业酵母及其对甲醇和甲酸盐的耐受和同化能力 | 合成生物学 | NA | 合成甲基营养、非理性基因组工程、理性设计、模块化共培养工程、过氧化物酶体耦合 | NA | NA | NA |
64 | 2025-07-17 |
The XNA alphabet
2025-Jul-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf635
PMID:40650979
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综述 | 本文综述了50年来化学家设计和合成的糖修饰核酸(XNA)系统,探讨了其在生物技术和合成生物学中的应用 | 系统总结了XNA的构象行为及其与天然核酸的正交性,为XNA复制和进化提供了更理性的方法 | 未提及具体实验数据或样本量,主要为基础性综述 | 探讨糖修饰核酸(XNA)的构象特性及其在合成生物学等领域的应用潜力 | 糖修饰核酸(XNA)系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
65 | 2025-07-17 |
Expanding genetic engineering capabilities in Vibrio natriegens with the Vnat Collection
2025-Jul-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf580
PMID:40650977
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研究论文 | 本文介绍了Vnat Collection,一个专为Vibrio natriegens设计的模块化工具包,旨在克服其遗传工程工具的不足 | 通过优化的Golden Gate克隆策略和改进的连接序列,实现了组装效率的300倍提升,并引入了新型操作子连接器和精确的基因调控系统 | NA | 扩展Vibrio natriegens的遗传工程能力,以充分发挥其在合成生物学中的潜力 | Vibrio natriegens | 合成生物学 | NA | Golden Gate克隆策略、NT-CRISPR方法 | NA | NA | 超过220个经过严格验证的模块化组件 |
66 | 2025-07-17 |
Analysis of Poly-3-Hydroxybutyrate Production with Different Microorganisms Using the Dynamic Simulations for Evaluation of Economic Potential Approach
2025-Jul-08, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.4c11178
PMID:40657095
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研究论文 | 本文提出了一种名为DySEEP的方法,用于评估工业生物产品的生产潜力,并以PHB生产为例进行了分析 | 提出了一种结合动态通量平衡分析和经济指标的DySEEP方法,用于评估生物产品的生产潜力,并提出了提高PHB产量的基因改造目标 | 由于DFBA模拟的性质,无法预测某些关键聚合物特性 | 优化生物塑料PHB的生产过程,降低生产成本 | 重组微生物的PHB生产潜力 | 生物工程 | NA | 动态通量平衡分析(DFBA) | NA | 模拟数据 | NA |
67 | 2025-07-17 |
Deciphering plasmid replication dynamics: a computational approach to predict ColE1-like plasmid copy number
2025-Jul, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2024.0783
PMID:40664234
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research paper | 开发了一种新型软件工具,通过计算模型预测ColE1样质粒的拷贝数,旨在简化质粒拷贝数设计 | 首次提出了一个能够从复制起点(ORI)序列计算预测质粒拷贝数的机器学习模型,强调了启动子强度和RNA折叠动力学的重要性 | NA | 开发计算工具预测质粒拷贝数,优化合成生物学中的质粒工程工作流程 | ColE1样质粒的复制起点(ORI)序列 | synthetic biology | NA | machine learning | machine learning model | sequence data | NA |
68 | 2025-07-17 |
Pattern recognition in living cells through the lens of machine learning
2025-Jul, Open biology
IF:4.5Q1
DOI:10.1098/rsob.240377
PMID:40664239
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research paper | 本文探讨了机器学习概念在生物框架中的应用,以探索人工神经网络、信号通路和基因调控网络之间的结构和功能相似性(及差异) | 将机器学习概念应用于生物系统,探索人工神经网络与生物信号通路、基因调控网络的相似性,并提出适合生物分类任务的神经网络架构 | 研究尚处于初步阶段,未涉及具体实验验证 | 探索生物系统中信号通路和基因调控网络的固有计算能力 | 细胞内的信号通路和基因调控网络 | machine learning | NA | NA | artificial neural networks | NA | NA |
69 | 2025-07-17 |
Light-orchestrated multi-step solid-phase picodroplet reactors
2025-Jun-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.23.660884
PMID:40666841
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研究论文 | 介绍了一种光控固相皮升液滴反应器,用于实现复杂的多步生化反应 | 利用光电子镊子操控单个皮升液滴和微珠,实现了八步点击化学为基础的DNA连接合成循环,并实时原位荧光检测反应产物 | 当前皮升液滴微流控技术缺乏试剂交换和洗涤能力,无法执行多步过程 | 开发一种能够执行复杂多步生化反应的皮升液滴反应器平台 | 皮升液滴反应器和微珠 | 合成生物学 | NA | 光电子镊子、荧光检测 | NA | 荧光信号 | NA |
70 | 2025-07-17 |
Pepper RNA variants reveal decoupling of HBC530 binding thermodynamics and fluorescence activation
2025-Jun-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.24.660466
PMID:40667133
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研究论文 | 本文通过生成Pepper RNA变体库,定量评估了单个核苷酸对HBC530结合亲和力、镁结合亲和力和荧光强度的贡献,揭示了配体识别与荧光强度之间的解耦现象 | 发现了HBC530结合亲和力与荧光强度之间的相关性较弱,并识别出多个结合亲和力与野生型Pepper相似但荧光强度显著降低的变体 | 研究仅针对Pepper RNA变体,未扩展到其他荧光RNA适体 | 探究荧光RNA适体的配体识别和荧光激活机制,为下一代荧光RNA适体的理性设计提供框架 | Pepper RNA变体及其与HBC530和镁离子的相互作用 | 合成生物学 | NA | RNA变体库生成与定量评估 | NA | RNA序列与荧光强度数据 | 53个Pepper变体 |
71 | 2025-07-17 |
Temporal gene regulation enables controlled expression of gas vesicles and preserves bacterial viability
2025-Jun-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.20.660610
PMID:40667317
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研究论文 | 本文报道了一种双诱导转录调控系统,用于控制气体囊泡(GVs)的时序表达,以保持细菌的活力 | 开发了一种双诱导转录调控系统,通过时序控制GV组装因子和外壳蛋白的表达,解决了GV异源表达导致的细胞生长受损问题 | 研究仅针对特定细菌宿主,未验证在其他宿主中的适用性 | 优化气体囊泡(GVs)在非原生宿主中的表达,以促进其在生物医学工程和合成生物学中的应用 | 气体囊泡(GVs)及其在细菌中的表达 | 合成生物学 | NA | 双诱导转录调控系统 | NA | NA | NA |
72 | 2025-07-17 |
Attaining the Promise of Geminivirus-Based Vectors in Plant Genome Editing
2025-04-27, Viruses
DOI:10.3390/v17050631
PMID:40431643
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综述 | 本文综述了基于双生病毒载体在植物基因组编辑中的应用及其潜力 | 讨论了双生病毒载体如何克服传统转基因技术的限制,并加速基因组编辑过程 | 虽然双生病毒载体具有潜力,但其应用仍面临一些技术障碍 | 探讨双生病毒载体在植物基因组编辑中的应用及其优势 | 植物基因组编辑技术及双生病毒载体 | 合成生物学 | NA | 病毒载体介导的基因组编辑 | NA | NA | NA |
73 | 2025-07-17 |
Microfluidic Production of Spatially Structured Biomimetic Microgels as Compartmentalized Artificial Cells
2025-Apr, Small science
IF:11.1Q1
DOI:10.1002/smsc.202400320
PMID:40657197
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research paper | 该研究开发了一种微流控策略,用于生产具有空间结构的仿生微凝胶,作为区室化人工细胞 | 通过微流控技术实现了微米级两室和三室仿生微凝胶的可控制备,并能在不同区室中引入多种合成细胞器,模拟生物细胞的区室化特征 | NA | 开发能模拟生物细胞区室化特征的人工细胞平台 | 仿生微凝胶人工细胞 | 合成生物学 | NA | 微流控技术 | NA | NA | NA |
74 | 2025-07-17 |
Integrated platform for structural and functional analysis of terpene synthases of Cannabis sativa
2025, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.19723
PMID:40656959
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研究论文 | 开发了一个集成平台,用于系统表达、纯化、酶学表征和大麻萜烯合成酶(TPS)的结晶 | 结合动力学、热稳定性和结构分析,开发了一个数据挖掘指导的结晶筛选方法,成功生产出衍射质量晶体 | 仅对大麻中的十种TPS酶进行了功能表征,样本量有限 | 优化萜烯生产,用于制药、害虫管理和合成生物学应用 | 大麻萜烯合成酶(TPS) | 合成生物学 | NA | 结晶筛选、数据挖掘、酶学表征 | NA | 酶学数据、晶体结构数据 | 十种大麻TPS酶 |
75 | 2025-07-16 |
Programmable DNA Hairpin Locker: Dual-Layer Encrypted Carrier Communication
2025-Jul-15, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.5c01802
PMID:40614219
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研究论文 | 本文介绍了一种基于DNA的双层加密载体通信系统,利用DNA的可编程性和分子信标架构实现精确的信号识别与处理 | 开发了DNA发夹锁(DHL)架构,具有Exo λ抗性,支持动态响应DNA信号并保持稳定运行,同时设计了三种变体支持九种不同的输入/输出配置 | 未提及具体实验规模或实际应用中的性能限制 | 开发一种安全可靠的分子通信系统,用于生物传感和合成生物学应用 | DNA分子及其在通信系统中的应用 | 合成生物学 | NA | 分子编程、lambda核酸外切酶(Exo λ) | NA | 分子信号 | NA |
76 | 2025-07-16 |
Bacterial Therapeutics: Addressing the Affordability Gap in Cancer Therapy
2025-Jul-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-0870
PMID:40660814
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研究论文 | 本文探讨了细菌疗法作为癌症治疗中经济高效替代方案的潜力 | 利用合成生物学和人工智能技术开发新一代细菌疗法,显著降低成本并提高安全性 | 未提及具体临床试验数据或疗效验证结果 | 解决癌症治疗中日益增长的经济负担问题 | 细菌免疫疗法 | 合成生物学 | 癌症 | 合成生物学, 人工智能 | NA | NA | NA |
77 | 2025-07-16 |
Advances in nanorobotics for gastrointestinal surgery: a new frontier in precision medicine and minimally invasive therapeutics
2025-Jul-14, Journal of robotic surgery
IF:2.2Q2
DOI:10.1007/s11701-025-02550-8
PMID:40660043
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综述 | 本文综述了纳米机器人技术在胃肠外科手术中的最新进展,探讨了其在精准医学和微创治疗中的潜在应用 | 纳米机器人技术通过结合纳米级工程、合成生物学和智能计算,开创了精准医学的新领域,从静态构造发展到能够动态导航胃肠环境的智能代理 | 讨论了自主性、脱靶控制和伦理法律框架等重大挑战 | 推动纳米机器人技术在胃肠外科手术中的临床转化和应用 | 胃肠外科手术中的纳米机器人技术 | 精准医学 | 胃肠疾病 | 纳米机器人技术、合成生物学、人工智能 | NA | NA | NA |
78 | 2025-07-16 |
Purification of post-transcriptionally modified tRNAs for enhanced cell-free translation systems
2025-Jun-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.10.658963
PMID:40661628
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研究论文 | 本文开发了一种纯化方法,用于生产具有天然转录后修饰的tRNA,以提高无细胞翻译系统的效率和保真度 | 开发了一种结合tRNA过表达和DNA杂交纯化的方法,首次提供了完整修饰谱,并展示了其在遗传密码扩展中的优越性能 | 未明确说明该方法是否适用于所有类型的tRNA或在不同生物系统中的普适性 | 解决传统转录方法产生的tRNA缺乏关键转录后修饰的问题,提高翻译产量和保真度 | 转移RNA(tRNA)及其转录后修饰 | RNA生物化学 | NA | DNA杂交纯化技术 | NA | NA | NA |
79 | 2025-07-16 |
Robust soybean leaf agroinfiltration
2024-Jun-05, Plant cell reports
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s00299-024-03245-4
PMID:38837057
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research paper | 开发了一种稳健的大豆叶片农杆菌浸润介导的瞬时基因表达方法 | 创新了一种针对大豆叶片的农杆菌浸润方法,确定了影响成功的关键因素,包括基因型、表面活性剂、发育阶段和农杆菌菌株及培养基 | 研究仅针对两种大豆品系进行了验证,可能不适用于所有大豆品种或其他作物 | 开发一种稳健的农杆菌浸润介导的瞬时基因表达方法,用于大豆叶片 | 大豆(Glycine max)叶片 | 植物生物技术 | NA | 农杆菌浸润 | NA | NA | 两种大豆品系(V17-0799DT和TN16-5004) |
80 | 2025-07-15 |
Insight into the eminent biotechnological applications of xylanolytic enzymes for sustainable bioprocessing
2025-Aug, 3 Biotech
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s13205-025-04415-1
PMID:40657403
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综述 | 本文全面综述了木聚糖的结构、木聚糖降解酶的作用及其在造纸、食品、纺织和制药等工业中的应用 | 讨论了利用纳米生物技术、基因工程(特别是CRISPR/CAS技术)提高木聚糖酶的热稳定性,并探讨了木聚糖酶研究的新趋势,如从宏基因组中生物勘探新型耐热木聚糖酶、蛋白质工程、合成生物学和生物精炼的整合 | NA | 探讨木聚糖酶在生物技术和工业生物加工中的多方面作用,并概述该领域未来的研究和创新方向 | 木聚糖及其降解酶 | 生物技术 | NA | 纳米生物技术、基因工程(CRISPR/CAS技术)、蛋白质工程、合成生物学 | NA | NA | NA |