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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2024-08-14 |
Towards a Yersinia pestis lipid A recreated in an Escherichia coli scaffold genome
2024, Access microbiology
DOI:10.1099/acmi.0.000723.v3
PMID:39130741
|
研究论文 | 本文利用CRISPR/Cas9重组技术将脂多糖A生物合成基因插入到表达脂多糖IV亚单位的菌株基因组中 | 成功插入三个基因并通过RT-PCR验证其表达,但通过MALDI-TOF质谱分析发现脂多糖A结构未在背景中重现 | 尽管基因表达,但脂多糖A结构未能在背景中重现 | 探索在Escherichia coli基因组中重现Yersinia pestis脂多糖A的可能性 | 脂多糖A生物合成基因及其在Escherichia coli中的表达 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9重组技术,MALDI-TOF质谱分析 | NA | 基因组 | 一个菌株 | NA | NA | NA | NA |
| 82 | 2024-08-11 |
Insights into the synthesis, engineering, and functions of microbial pigments in Deinococcus bacteria
2024, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2024.1447785
PMID:39119139
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综述 | 本文综述了Deinococcus细菌中微生物色素的合成、工程化及其功能 | 探讨了通过代谢工程和合成生物学提高色素产量和扩展其应用前景的策略 | NA | 探讨微生物色素的生产优化及其在多个领域的应用前景 | Deinococcus细菌中的微生物色素及其相关酶和基因 | 合成生物学 | NA | 基因编辑 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 83 | 2024-08-11 |
Some remarks on the argument appealing to nature against synthetic biology
2024, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2024.1428832
PMID:39119275
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评论 | 本文主要分析了以自然为名反对合成生物学的论点,并通过展示自然概念的模糊性、否认自然与非自然之间道德上显著的界限,以及反驳该论点对合成生物学的指控,提出了反驳 | 本文通过分析自然概念的模糊性和否认自然与非自然之间的道德界限,提出了对以自然为名反对合成生物学论点的反驳 | NA | 分析并反驳以自然为名反对合成生物学的论点 | 合成生物学及其相关论点 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 84 | 2024-08-10 |
A synthetic microbial consortium protects against obesity by regulating vitamin B6 metabolism
2024 Jan-Dec, Gut microbes
IF:12.2Q1
DOI:10.1080/19490976.2024.2304901
PMID:38269591
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研究论文 | 本文通过构建合成微生物群落,研究其对肥胖的保护作用及对维生素B6代谢的调控 | 利用微流控技术分离出能利用工程菌BsS-RS06551代谢物的细菌,并发现其与JJ3菌株的共培养能显著缓解肥胖及相关疾病 | NA | 探索合成微生物群落在肥胖治疗中的应用 | 合成微生物群落、肥胖及相关疾病 | 合成生物学 | 肥胖 | 微流控技术 | NA | 微生物数据 | 小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 85 | 2024-08-05 |
Gene synthesis design: a pythonic approach
2024, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.17750
PMID:39076781
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研究论文 | 本文提出了一种Python程序用于设计基因合成的DNA片段 | 提供了一种新的算法,通过Python程序设计DNA片段,且源代码可供所有用户免费使用 | 尚未提及具体的限制条件 | 旨在开发一种实用的基因合成片段设计工具 | DNA片段的合成和设计 | 合成生物学 | NA | PCR组装 | NA | NA | 通过实验验证算法的可行性 | NA | NA | NA | NA |
| 86 | 2024-08-05 |
Novel Biocatalysts from Specialized Metabolism
2024-01-22, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202309284
PMID:37737720
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研究论文 | 该文章概述了从生物合成驱动的发现中获取的新型生物催化剂 | 介绍了一些在合成挑战中表现出色的酶 | 实验室使用的生物转化范围有限 | 探讨新型生物催化剂的发现及其在合成中的应用 | 重点研究了包括羧基保护自由的酰胺形成和修饰在内的酶 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 87 | 2024-08-05 |
A Standardized Set of MoClo-Compatible Inducible Promoter Systems for Tunable Gene Expression in Yeast
2024-01-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00184
PMID:38079574
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研究论文 | 本研究创建了一个标准化的酵母可调基因表达诱导启动子系统。 | 开发了用于酵母的可调基因表达系统yTEST,结合了多种小分子调控的诱导启动子。 | 在现有系统中,针对酵母的诱导启动子系统仍较少。 | 构建一个用于合成生物学的可调基因表达系统。 | 研究对象为酵母的基因表达系统。 | 合成生物学 | NA | 小分子诱导 | NA | 实验数据 | 包含五种诱导启动子的系统 | NA | NA | NA | NA |
| 88 | 2024-08-05 |
A review of the botany, phytochemistry, pharmacology, synthetic biology and comprehensive utilization of Silybum marianum
2024, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2024.1417655
PMID:39055491
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review | 本文系统总结了关于牛奶蓟的植物学、植物化学、药理学及综合利用的研究进展 | 综述了牛奶蓟的合成生物学及其在食品、保健品和化妆品等方面的广泛应用前景 | 需要进一步研究其化学成分、药理机制和合成生物学 | 探讨牛奶蓟在肝胆疾病治疗中的应用及其综合利用 | 牛奶蓟及其各种成分,包括黄酮木脂素成分及其药理作用 | NA | NA | 酶催化合成 | NA | 化学成分、药理作用 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 89 | 2024-08-07 |
Engineering Native Biological Complexity from the Inside-out and Outside-in
2024-Jan, Nature chemical engineering
DOI:10.1038/s44286-023-00013-1
PMID:39015819
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研究论文 | 本文探讨了在组织发育和再生中,通过'由外而内'和'由内而外'信号的平衡来控制细胞功能和命运的工程化方法 | 强调了新兴策略,如生物材料设计和合成生物学,以影响这一微妙的平衡并微调细胞反应 | NA | 研究如何通过工程化方法控制细胞功能和命运 | 细胞功能和命运的控制 | 合成生物学 | NA | 生物材料设计,合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 90 | 2024-08-07 |
Editorial: Advanced microfluidics for synthetic biology and/or biomedical applications
2024, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2024.1440206
PMID:39007054
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 91 | 2024-08-07 |
Recent advances in the therapeutic potential of cathelicidins
2024, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2024.1405760
PMID:38989014
|
综述 | 本文综述了抗菌肽cathelicidins在医学领域的最新进展,探讨了其在治疗病毒和细菌感染、炎症疾病及肿瘤中的应用潜力 | 结合纳米材料与天然活性抗菌肽,创造出具有显著临床前景的创新纳米剂 | 许多cathelicidins对健康宿主细胞具有毒性且稳定性较低 | 探索cathelicidins作为新型抗菌剂的医学应用 | cathelicidins及其在疾病治疗中的应用 | NA | NA | 纳米材料 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 92 | 2024-08-07 |
Use of CRISPRoff and synthetic Notch to modulate and relay endogenous gene expression programs in engineered cells
2024, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2024.1346810
PMID:38957576
|
研究论文 | 本文结合CRISPR技术与合成Notch受体平台,实现对人类细胞间交互的记录与定向调控,以促进细胞疗法和组织替代品的生产。 | 利用CRISPRoff和合成Notch技术,不仅记录细胞间的交互,还能通过调控特定基因表达来影响交互结果。 | NA | 探索细胞命运和行为的刺激-反应历史,以及如何通过细胞集体决策过程驱动可预测的细胞疗法或组织替代品的生产。 | 人类细胞间的交互记录与定向调控,以及人类胚胎干细胞的分化。 | 再生医学 | NA | CRISPR-Cas9 | 合成Notch受体平台 | 基因表达 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 93 | 2024-08-07 |
From beer to breadboards: yeast as a force for biological innovation
2024-01-04, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-023-03156-9
PMID:38178179
|
综述 | 本文综述了酵母Saccharomyces cerevisiae在功能基因组学、基因编辑、基因与环境相互作用研究、蛋白质组学和生物信息学等领域作为创新催化剂的作用 | 强调了酵母在这些领域中的创新催化作用,并展望了其在合成生物学、药物个性化和多组学研究中的未来应用 | NA | 探讨酵母在多个生物学领域中的创新作用及其未来潜力 | 酵母Saccharomyces cerevisiae及其在生物学多个子领域中的应用 | 生物信息学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 94 | 2024-08-07 |
Accelerating Genetic Sensor Development, Scale-up, and Deployment Using Synthetic Biology
2024, Biodesign research
DOI:10.34133/bdr.0037
PMID:38919711
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综述 | 本文综述了当前可用的生物传感器及其开发、规模化和部署的方法,重点讨论了影响基因表达的活细胞中的遗传传感器。 | 结合高通量实验方法、进化策略以及先进的生物信息学和机器学习技术,建立了一套生产遗传传感器的流程,能够针对几乎任何小分子、蛋白质或核酸。 | 基于多种刺激分类的更复杂传感任务以及这些系统在现实世界中的可靠部署仍面临挑战。 | 探讨如何通过精确修改非模式生物和整合控制工程原理(如反馈)来克服遗传传感器开发的障碍,实现合成生物学领域的巨大潜力。 | 遗传传感器在活细胞中的应用及其开发、规模化和部署的方法。 | 合成生物学 | NA | 高通量实验方法、进化策略、生物信息学、机器学习 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 95 | 2024-08-07 |
Fostering student authorship skills in synthetic biology
2024, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2024.1409763
PMID:38911549
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研究论文 | 本文描述了在合成生物学课程中教授本科生科学写作和出版的方法 | 采用基于项目的学习方法,让学生成为合成生物学特定应用领域的专家,并测量与学习成果相关的学习增益 | NA | 探讨如何通过科学写作和出版活动促进本科生在合成生物学领域的学术身份发展 | 本科生在合成生物学课程中的科学写作和出版能力 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 96 | 2024-08-07 |
Advances in biosynthesis and metabolic engineering strategies of cordycepin
2024, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2024.1386855
PMID:38903790
|
综述 | 本文综述了虫草素(cordycepin)的生物合成及代谢工程策略 | 介绍了通过合成生物学方法开发的一种可持续生产虫草素的新方法 | NA | 探讨虫草素的代谢工程和异源生物合成策略 | 虫草素及其生物合成途径 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 97 | 2024-08-07 |
Polyextremophile engineering: a review of organisms that push the limits of life
2024, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2024.1341701
PMID:38903795
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综述 | 本文综述了极端微生物的生物工程研究,探讨了极端环境下的生命适应机制及其在合成生物学中的应用 | 总结了极端微生物的基本适应机制,并探讨了如何通过合成生物学手段增强、组合或转移这些极端特性到新生物体中 | NA | 探讨极端微生物的适应机制及其在生物制造中的应用潜力 | 极端微生物及其适应极端环境的机制 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 98 | 2024-08-07 |
RNAi-based Boolean gates in the yeast Saccharomyces cerevisiae
2024, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2024.1392967
PMID:38895554
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研究论文 | 本研究设计并构建了基于RNA干扰途径的布尔逻辑门,主要在酵母细胞中进行实验 | 首次在天然缺乏RNAi途径的酵母细胞中构建基于RNAi的布尔逻辑门 | RNAi基逻辑门对启动子泄漏高度敏感,实施难度较大 | 设计并构建布尔逻辑门以促进合成生物学中的生物传感器和生物计算 | 酵母细胞中的RNA干扰途径 | 合成生物学 | NA | RNA干扰 | 布尔逻辑门 | DNA片段 | 不同表达盒的siRNA前体 | NA | NA | NA | NA |
| 99 | 2024-08-07 |
RNA Aptamer-Mediated Gene Activation Systems for Inducible Transgene Expression in Animal Cells
2024-01-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00472
PMID:38073086
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研究论文 | 本文开发了一种基于RNA适配体的基因激活系统RAMGA,用于在动物细胞中诱导RNA触发的基因表达激活 | 该系统利用合成生物学策略,通过目标RNA连接DNA结合域和转录激活因子,实现对目标mRNA水平的检测和报告基因表达的调控,不影响原始mRNA编码基因的表达 | NA | 开发新的RNA触发基因表达系统,用于建立基因电路、评估内源基因表达和开发新型RNA检测器 | 动物细胞中的RNA表达分析 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | RNA | 重组CHO细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 100 | 2024-08-07 |
A Sirtuin-Dependent T7 RNA Polymerase Variant
2024-01-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00607
PMID:38117980
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研究论文 | 本文通过遗传密码扩展技术,将T7 RNA聚合酶催化核心中的赖氨酸(K631)替换为N-乙酰-L-赖氨酸(AcK),设计了一种依赖于NAD依赖性去乙酰化酶(sirtuins)的T7 RNA聚合酶变体。 | 该变体需要sirtuins的去乙酰化酶活性来恢复其酶活性,从而在活细胞(包括细菌和哺乳动物细胞)以及体外系统中维持sirtuin依赖的基因转录。 | NA | 探索通过转录调控控制合成生物学和生物工程中的生物过程的新方法。 | T7 RNA聚合酶变体及其在细胞中的转录调控作用。 | 生物工程 | NA | 遗传密码扩展 | NA | NA | 包括细菌和哺乳动物细胞以及体外系统 | NA | NA | NA | NA |