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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2026-06-18 |
Modular Scalable Synthetic Gene Circuits for Complex Functions Within Minimal Computational Layers in Human Cells
2026-Jun-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-74408-y
PMID:42303993
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研究论文 | 提出一种模块化设计框架,在人类细胞中以较少的计算层实现复杂功能的基因电路 | 通过集成正交转剪接AND门、天然-合成杂合启动子和合成microRNA,在最小化计算层的同时实现复杂逻辑功能,克服了传统级联架构的可扩展性障碍 | 可能仍存在负载效应和长期稳定性问题,且适用范围可能受限于特定细胞类型 | 开发可扩展的合成基因电路设计框架,用于人类细胞中的复杂遗传编程 | 人类细胞中的合成基因电路 | 合成生物学 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 正交转剪接、天然-合成杂合启动子、合成microRNA | 人类细胞 | 三输入组合逻辑门、半加器、全加器、动态3对1多路复用器(含专用选择器过载状态输出) | 生物医学, 生物技术, 基础生物学 |
| 102 | 2026-06-18 |
Assembling a True "Olympic Gel" From over 16 000 Combinatorial DNA Rings
2026-Jun, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202520549
PMID:41789447
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研究论文 | 报告从超过16 000个组合DNA环成功组装真正的奥运凝胶,并表征其遗传、机械和结构特性 | 首次从大规模组合DNA环库成功组装具有独特力学和溶胀特性的奥运凝胶,结合聚合物物理、合成生物学和DNA纳米技术创建新型材料平台 | 未明确提及,但可能涉及奥运凝胶的实际应用规模化挑战 | 实现从DNA环组装真正的奥运凝胶并研究其网络拓扑对宏观材料性质的影响 | 超过16 000个不同序列的DNA环 | 合成生物学 | NA | 下一代测序, 振荡流变学, 原子力显微镜, 冷冻电子显微镜, 大规模计算模拟 | NA | 序列数据, 图像, 机械特性数据 | 超过16 000个独特DNA环分子 | 酶促活化, 分子内环化 | NA | DNA环库, 网络拓扑设计 | 生物材料, 仿生系统, 软物质物理 |
| 103 | 2026-06-18 |
Butyrate-Producing Bacteria in Intestinal Disease Therapy: Potential and Challenges
2026-Jun, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.70260
PMID:42307077
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综述 | 综述丁酸盐产生菌在肠道疾病治疗中的潜力与挑战 | 整合机制理解与转化实践,评估新兴策略如精准益生元、噬菌体介导的生态位工程和AI个性化治疗 | 转化治疗面临瓶颈:丁酸盐产生菌对氧气高度敏感,交叉喂养网络需要生态学方法而非单菌株策略,宿主环境决定丁酸盐的保护或促进作用 | 总结丁酸盐产生菌在肠道健康中的作用机制,评估其在肠道疾病治疗中的转化现状和未来方向 | 丁酸盐产生菌(包括Faecalibacterium prausnitzii、Roseburia spp.、Eubacterium rectale等厌氧厚壁菌门细菌)及其在炎症性肠病、结直肠癌、放射损伤、感染和移植物抗宿主病中的作用 | NA | 炎症性肠病, 结直肠癌, 放射损伤, 感染, 移植物抗宿主病 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学方法 | 人类肠道微生物群 | 丁酸盐产生菌的代谢通路与交叉喂养网络 | 医学 |
| 104 | 2026-06-17 |
Penetrating the cell wall: a review on delivering exogenous materials into plant and fungal cells via micro/nanoinjection
2026-Jun-16, Nanoscale
IF:5.8Q1
DOI:10.1039/d6nr00509h
PMID:42301729
|
综述 | 系统综述微纳注射技术用于穿透植物和真菌细胞壁递送外源材料的研究进展 | 首次系统性地从探针设计与制造、自动化力反馈策略、壁穿透机制等角度整合分析微纳注射技术,并提出了标准化协议与集成系统的发展路线图 | 现有技术操作通量低、重复性差,缺乏标准化协议和集成系统,且对细胞壁穿透机制的理解尚不完善 | 全面总结微纳注射技术在穿透细胞壁递送外源材料方面的现状与挑战,并为未来发展提供路线图 | 植物细胞和真菌细胞 | 合成生物学 | NA | 微纳注射 | NA | NA | NA | 微纳注射技术 | 植物细胞, 真菌细胞 | NA | 植物科学, 微生物学, 合成生物学 |
| 105 | 2026-06-17 |
Recognition of non-standard base pairs by triplex-forming oligonucleotides containing an expanded genetic alphabet
2026-Jun-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-74375-4
PMID:42286010
|
研究论文 | 利用扩展遗传字母表中的碱基,实现了三链形成寡核苷酸对非标准碱基对的序列特异性识别 | 通过人工扩展遗传信息系统中的碱基,将三链识别空间扩展到标准、受损或合成碱基对,在中性pH下实现纳摩尔级亲和力,突破了天然碱基对目标序列的限制和酸性条件要求 | 未提及 | 探索利用扩展遗传字母表增强三链形成寡核苷酸识别双链DNA的能力 | 三链形成寡核苷酸与含标准、受损或合成碱基对的双链DNA形成的三链复合体 | 分子生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 合成生物学 |
| 106 | 2026-06-17 |
Empirical evaluation of all unique Cas9 protospacers in E. coli reveal widespread functionality and rules for gRNA design
2026-Jun-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag548
PMID:42258532
|
研究论文 | 系统评估大肠杆菌中463,000个独特gRNA的Cas9活性,发现93%以上功能正常,仅0.3%无效 | 首次大规模实证验证大肠杆菌中几乎所有独特gRNA均具有功能性,并揭示无效gRNA的间隔区自相互作用规律,提出简单设计规则和修复方法 | 研究仅限于大肠杆菌K12 MG1655菌株,未扩展至其他细菌种类 | 评估大肠杆菌中Cas9 gRNA的特异性与功能性,解决现有研究中关于无效gRNA比例的争议 | 463,000个独特gRNA在大肠杆菌K12 MG1655基因组上的活性 | 计算生物学 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 序列数据 | 463,000个独特gRNA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | NA | 合成生物学 |
| 107 | 2026-06-17 |
Rare functional groups and unique scaffolds in Streptomyces natural products
2026-Jun-08, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d6np00012f
PMID:42300430
|
综述 | 综述链霉菌天然产物中罕见官能团、独特骨架和非典型修饰的结构特征及其生物合成机制 | 将稀有结构特征(如罕见官能团、独特分子骨架、非典型修饰)与合成生物学应用及高效细胞工厂设计相联系 | 仅涵盖截至2025年12月的数据,可能遗漏近期文献 | 探讨链霉菌天然产物的结构多样性如何为合成生物学和药物发现提供灵感 | 链霉菌天然产物及其生物合成酶 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 链霉菌 | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 108 | 2026-06-17 |
Synthetic biology as a game-changer for endangered medicinal orchids: biosynthesis, engineering and conservation
2026-Jun-02, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d6np00027d
PMID:42300065
|
综述 | 本文综述了合成生物学如何通过模块化设计、异源重构和代谢工程等手段,推动濒危药用兰花的可持续利用与保护 | 创新性地将合成生物学引入濒危药用兰花保护领域,通过解耦供应与生态提取实现可持续生产,并整合多组学、人工智能和基因编辑加速工程化循环 | 未明确讨论合成生物学应用的潜在生态风险或大规模生产的经济可行性 | 探讨合成生物学在濒危药用兰花生物合成、工程化及保护中的变革性作用 | 濒危药用兰花及其高价值代谢物(如天麻素、石斛碱) | 合成生物学 | NA | 代谢工程、异源表达、定向进化、多组学、基因编辑、人工智能 | NA | 多组学数据 | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick | 微生物(如大肠杆菌、酿酒酵母)、植物底盘 | 生物合成途径模块化设计、振荡器、生物传感器、代谢途径 | 医药、农业、工业生物技术 |
| 109 | 2026-06-17 |
The division of vesicles requires the fission of closed membrane necks but does not require active processes
2026-Jun-02, Soft matter
IF:2.9Q2
DOI:10.1039/d6sm00283h
PMID:42300069
|
研究论文 | 通过理论、实验和模拟分析,证明囊泡分裂需要闭合膜颈的裂变,但不需要主动过程 | 首次明确表明囊泡分裂不需要化学机械耦合的主动过程(如核苷酸水解),仅需闭合膜颈的形成与裂变,并提出了由自发曲率或应力不对称控制收缩力的机制 | 主要基于作者团队的研究结果,可能未涵盖所有类型的囊泡分裂机制;主动过程在自然界中的角色未被完全排除 | 阐明囊泡分裂的物理机制,并验证其是否依赖于主动过程 | 巨型囊泡和纳米囊泡的膜分裂过程 | 软物质科学、合成生物学 | NA | NA | 理论模型、计算机模拟 | 实验数据、模拟数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、软物质工程 |
| 110 | 2026-06-16 |
Bioconjugation Strategies for Revealing the Roles of Glycerophospholipids in Cells
2026-Jun-15, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.70428
PMID:42287618
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综述 | 综述了用于揭示甘油磷脂在细胞中作用的生物共轭策略 | 整合了化学全合成、生物正交化学、活细胞成像等多种跨学科方法,为脂质功能研究和治疗创新提供新路径 | 仅总结现有方法,未提出新的实验设计或突破性技术 | 探索甘油磷脂在细胞中的复杂功能及代谢机制 | 甘油磷脂及其类似物 | 合成生物学 | NA | 生物正交化学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 111 | 2026-06-16 |
Adaptive evolution of oxidosqualene cyclases driving triterpene scaffold diversification for limonoid biosynthesis in Melia toosendan
2026-Jun-15, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2026.101965
PMID:42289993
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研究论文 | 本研究通过染色体级别基因组组装和功能分析,揭示了川楝中氧化角鲨烯环化酶的适应性进化驱动柠檬苦素生物合成三萜骨架多样化的分子机制 | 首次发现川楝中OSC基因家族通过新功能化产生11种不同三萜骨架,并鉴定出4个关键氨基酸残基替换足以切换产物特异性,揭示了正向选择驱动代谢创新的分子基础 | 研究主要基于瞬时表达和系统发育分析,尚需更全面的体内功能验证和晶体结构解析,且替代途径的生理意义仍需进一步阐明 | 阐明植物中三萜骨架多样化的适应性进化分子机制 | 川楝(Melia toosendan)中的氧化角鲨烯环化酶基因家族 | 生物信息学 | NA | 染色体级别基因组组装, NGS, 瞬时表达 | NA | 基因组序列, 代谢物谱 | 1个川楝品种的基因组和14个OSC基因 | NA | 本氏烟草(Nicotiana benthamiana) | NA | 合成生物学,农业(植物源杀虫剂) |
| 112 | 2026-06-16 |
Substrate Specificity of B12-Depedent Ribonucleotide Reductases: Biotechnology and Metabolic Implications
2026-Jun-15, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202500344
PMID:42290402
|
研究论文 | 研究了两类热稳定性核糖核苷酸还原酶对多种天然和非天然核苷酸的底物特异性,评估其生物技术应用潜力 | 首次系统性地研究了核糖核苷酸还原酶对非经典核苷酸的底物特异性,发现酶倾向于转化带有修饰官能团的核苷碱基底物,揭示了生物技术和合成生物学应用中的潜力与限制 | 仅聚焦于两种热稳定性RNR,未涵盖其他来源或类型的RNR;对非天然核苷酸的转化效率及体内应用验证不足 | 探索核糖核苷酸还原酶的底物混杂性及其在生物技术中的应用潜力,同时增进对天然核苷酸代谢的理解 | 两种热稳定性核糖核苷酸还原酶及其对多种天然和非天然核苷酸的转化 | 合成生物学 | NA | 酶活性测定、底物特异性分析 | NA | 实验数据(酶动力学参数) | 两种热稳定性核糖核苷酸还原酶,测试了多种核苷酸底物 | NA | NA | NA | 生物技术、合成生物学 |
| 113 | 2026-06-16 |
Harnessing natural variation for photosynthetic improvement in next-generation crop breeding
2026-Jun-15, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.70317
PMID:42290551
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综述 | 本文综述了利用自然遗传变异改善光合作用的策略,以支持下一代作物育种 | 整合自然遗传变异与合成生物学和光合遗传工程的互补方法,提出优化光合作用以提升作物产量和抗逆性的战略框架 | 未详细讨论具体田间验证结果和长期环境适应性挑战 | 探索通过自然变异和现代生物技术优化光合作用,提升作物产量潜力和气候适应性的策略 | 作物光合性状的自然遗传变异及其分子调控机制 | 农业生物技术 | NA | 光合遗传工程、合成生物学 | NA | 综述文献数据 | NA | 合成生物学 | 作物 | 光合代谢通路优化 | 农业 |
| 114 | 2026-06-16 |
A Modular PLUG-IN Photosynthetic Chassis With Tunable Thermal Control for Mammalian Systems
2026-Jun-15, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.76102
PMID:42294635
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研究论文 | 开发一种热调控的模块化“即插即用”光合底盘,实现微藻代谢输出与细胞完整性的可编程控制 | 首次实现跨真核生物界的热调控模块化合成生物学底盘,在微藻和哺乳动物宿主中均保持功能,并耦合代谢工程与细胞壁工程实现无研磨脂质回收 | 未明确讨论热诱导系统在长期培养中的稳定性及可能的代谢负担,未评估大规模工业应用中的热控制成本 | 开发一种与哺乳动物系统兼容的热调控光合底盘,同步控制生长、生产与细胞壁重构 | 海洋微藻(Nannochloropsis oceanica)和哺乳动物宿主 | 合成生物学 | NA | 转录组学比较分析、热诱导启动子工程、基因沉默 | NA | 转录组数据 | NA | 热激活基因扩增系统、基因沉默 | Nannochloropsis oceanica, 哺乳动物细胞 | 热调控代谢模块(AtWRI1表达增强三酰甘油和EPA积累)与细胞壁模块(CesA1沉默导致细胞壁弱化)耦合 | 工业生物技术, 医药 |
| 115 | 2026-06-16 |
From fermentation to pharmabiotics: engineering kefir-derived Lactobacillus for targeted intratumoral immunotherapy in colorectal Cancer
2026-Jun-14, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.117032
PMID:42289150
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综述 | 探讨将开菲尔中乳酸菌转化为工程活生物治疗药物,用于结直肠癌的靶向瘤内免疫治疗 | 提出从发酵到药物的流程,利用合成生物学改造开菲尔乳酸菌,使其能够靶向肿瘤缺氧区域并原位释放纳米抗体和细胞因子,将冷肿瘤转化为热肿瘤以增强免疫治疗 | 面临生物遏制、生产和监管等转化挑战 | 开发工程化活生物治疗药物用于结直肠癌的靶向免疫治疗 | 开菲尔中的乳酸菌菌株 | 合成生物学 | 结直肠癌 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 乳酸菌(开菲尔来源) | 靶向肿瘤缺氧区域的生物传感器及纳米抗体和细胞因子释放电路 | 医学 |
| 116 | 2026-06-16 |
SynBio-DSP: an integrated synthetic biology platform with fed-batch fermentation and continuous downstream processing for sustainable production of thermostable cellulases
2026-Jun-14, Biotechnology for biofuels and bioproducts
IF:3.3Q3
DOI:10.1186/s13068-026-02783-1
PMID:42289753
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研究论文 | 开发了一种整合合成生物学、机器学习引导的生物过程优化和连续下游处理的平台,用于可持续生产耐热纤维素酶 | 首次提出了QLM自诱导系统和CRISPRi介导的细胞壁弱化策略,并结合高斯过程回归和高通量微型生物反应器优化发酵,以及新型脉冲电场辅助协同裂解系统实现高效酶回收 | sfGFP融合导致比活性降低8.3%,可能需要进一步优化融合标签设计 | 通过协同优化细胞设计和工艺配置,实现可持续且经济可行的生物催化剂生产 | 枯草芽孢杆菌底盘细胞以及超耐热纤维素酶CtCel9A | 合成生物学 | NA | 合成生物学、CRISPRi、高通量发酵、响应面法、多目标优化 | 高斯过程回归、响应面法、NSGA-III算法 | 实验数据和过程参数 | NA | CRISPR-Cas9, 脉冲电场 | 枯草芽孢杆菌 | 群体感应裂解调制自诱导系统和CRISPRi介导的细胞壁弱化回路 | 工业生物技术, 能源 |
| 117 | 2026-06-16 |
Global research trends and hotspots of plant physiologically active substances: quantitative visualization analysis based on CiteSpace
2026-Jun-13, Plant biology (Stuttgart, Germany)
DOI:10.1111/plb.70219
PMID:42287740
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综述 | 基于CiteSpace的文献计量分析,系统回顾了2000至2024年间植物生理活性物质研究的全球趋势与热点 | 首次通过定量可视化分析揭示了植物生理活性物质研究从基础分离到机制研究、功能性食品及纳米递送系统的阶段性转变,并识别了新兴热点如植物免疫调控、肠道微生物互作和分子动力学模拟 | 仅依赖Web of Science核心合集数据库,可能遗漏其他语种或非索引文献,且分析周期截至2024年,后续研究趋势未覆盖 | 系统梳理植物生理活性物质研究的全球趋势、热点演变及未来方向,指导跨学科合作与可持续开发利用 | 植物来源的生理活性物质(如植物化合物、抗氧化剂等) | 文献计量学 | NA | 文献计量分析,CiteSpace可视化 | NA | 文献数据(文本) | 8096篇文献(2000-2024年Web of Science核心合集) | NA | NA | NA | 医学,农业,工业生物技术,功能性食品 |
| 118 | 2026-06-16 |
Transplantation of encapsulated fecal microbiota: research progress and future trends
2026-Jun-13, World journal of pediatrics : WJP
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s12519-026-01056-z
PMID:42288685
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综述 | 综述了封装粪便微生物群移植的研究进展与未来趋势,从经验性转移向工程化生物治疗转变 | 强调封装FMT作为活性生物治疗产品的关键制剂,推动从全群落微生物制剂向合成生物学创新的转变 | 缺乏大规模随机对照试验,尤其是儿科研究;监管定义不一致且国际指南尚未建立 | 总结封装FMT的研究进展和监管挑战,探索未来发展方向以提升标准化和个性化治疗 | 封装粪便微生物群移植的临床研究,包括成人和儿科患者 | NA | 肠道疾病,复发性艰难梭菌感染 | 封装技术 | NA | 文献和数据综合 | NA | NA | 人类肠道微生物群 | NA | 医学 |
| 119 | 2026-06-16 |
In silico identification and characterisation of putative biphenyl degradation mechanism in gut-derived Pediococcus pentosaceus
2026-Jun-11, Environmental research
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.envres.2026.125000
PMID:42276346
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研究论文 | 本研究利用计算生物学方法鉴定并表征了源自蟑螂肠道的戊糖片球菌QS-GN03_1中潜在的联苯降解机制 | 首次在戊糖片球菌中鉴定出通过水平基因转移获得且独立存在的bphC基因同源物,并通过分子对接和动力学模拟验证其功能潜力,同时发现其基因组中含有IS30家族插入序列,为合成生物学改造提供了机会 | 该菌株缺乏独立的PCB矿化能力,且预测的PPBPHCIII酶与功能验证的1EIR复合物相比结合亲和力较弱,主要是因为氢键形成较少 | 鉴定和表征戊糖片球菌中潜在的联苯降解能力,以开发用于PCB解毒的益生菌饲料添加剂 | 蟑螂肠道来源的戊糖片球菌QS-GN03_1菌株及其潜在联苯降解基因 | 机器学习 | NA | 全基因组测序,分子对接,分子动力学模拟 | NA | 基因组序列,蛋白质结构数据 | 一个戊糖片球菌菌株 | CRISPR-Cas9,合成生物学 | 戊糖片球菌 | Bph操纵子整合电路 | 农业,环境,食品 |
| 120 | 2026-06-16 |
Enhancing small-molecule-mediated translational control through multivalent RNA aptamers
2026-Jun-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag592
PMID:42273917
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研究论文 | 提出一种基于多价RNA适配体的通用平台,通过剪接调控显著增强小分子介导的翻译控制 | 通过多价适配体设计,将弱适配体(如茶碱或四环素适配体)的诱导水平从不足10倍提升至超过100倍,实现超过一个数量级的改进,并实现多路复用和正交控制 | 未明确说明局限性,可能依赖特定配体-适配体对的优化 | 开发一种通用且可适应的RNA平台,扩展小分子调控蛋白表达的工具箱 | 小分子RNA开关及多价适配体设计 | 合成生物学 | NA | RNA适配体设计、替代剪接调控 | NA | NA | NA | NA | NA | 多价适配体电路,增强配体响应性蛋白表达 | 合成生物学, 医学 |