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当前共找到 156 篇文献，本页显示第 121 - 140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2026-03-08 |
Genomic perplexity and the evolution of context-dependent function
2026-Mar-02, Molecular biology and evolution
IF:11.0Q1
DOI:10.1093/molbev/msag041
PMID:41739546
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研究论文 | 本文提出基因组像大型语言模型一样不编码固定功能，而是编码功能和表型结果的概率分布，并引入“基因组困惑度”概念来量化基因流动的适应度成本 | 将基因组功能与大型语言模型进行概念类比，提出基因组编码概率分布而非固定功能的新框架，并首次引入“基因组困惑度”作为量化基因流动适应度成本的信息论度量 | 提出的框架目前主要是概念性的，需要更多实证研究来验证其预测能力，且对基因组复杂性的简化可能忽略某些生物学细节 | 探讨基因组功能的上下文依赖性及其进化意义，为理解基因流动和合成生物学提供新框架 | 基因组功能、基因流动（水平基因转移和基因渗入）、表型结果 | 计算生物学 | NA | 泛基因组学、合成生物学、全基因组关联研究（GWAS） | Transformer、大型语言模型（LLM） | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、进化建模 |
| 122 | 2026-03-08 |
Self-assembled cell-scale containers made from DNA origami membranes
2026-Mar, Nature materials
IF:37.2Q1
DOI:10.1038/s41563-025-02418-0
PMID:41315785
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研究论文 | 本文报道了一种受脂质结构启发的DNA折纸单层膜自组装方法，可形成囊泡或中空管状结构 | 首次利用DNA折纸技术构建细胞尺度的动态膜结构，突破了传统蛋白质/脂质膜的限制 | 未明确说明结构的长期稳定性及在复杂生物环境中的功能表现 | 开发新型仿生隔室化技术用于合成生物学和细胞尺度软机器人 | DNA折纸膜自组装结构（囊泡/中空管） | 合成生物学 | NA | DNA折纸技术 | NA | 结构成像数据 | NA | DNA折纸 | NA | 仿脂质结构的径向对称DNA折纸亚基自组装膜 | 生物技术, 软体机器人 |
| 123 | 2026-03-08 |
Glassy Dynamics as a Predictive Framework for Lipid Exchange Across Membranes
2026-Mar, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202512844
PMID:41562888
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研究论文 | 本文提出了一种受玻璃态动力学启发的热力学-动力学框架，用于预测跨膜脂质交换的活化能和转移时间尺度 | 利用脂质囊泡的热膨胀系数这一单一实验可测参数，应用集体小位移模型进行无调整参数的预测，将脂质交换过程与无定形材料中的协同分子事件联系起来 | NA | 建立脂质跨膜交换的定量预测框架 | 脂质囊泡和跨膜脂质交换过程 | 软物质物理 | NA | 无标记石英晶体微天平实验 | 集体小位移模型 | 实验数据 | 多个脂质系统 | NA | NA | NA | 药物递送、生物仿生材料设计、纳米生物技术 |
| 124 | 2026-03-07 |
Recruiting orthogonal biological systems for engineering microorganisms
2026-Mar-04, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.12.023
PMID:41786536
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综述 | 本文综述了微生物合成生物学中正交策略的最新进展与应用，包括正交遗传系统、代谢途径、能量系统和调控系统的构建 | 总结了正交策略在微生物合成生物学中的创新应用，以解决工程过程对自然代谢的干扰问题 | NA | 探讨正交策略在微生物合成生物学中的应用，以增强工程微生物的功能和可预测性 | 微生物细胞及其正交工程系统 | 合成生物学 | NA | 正交工程策略 | NA | NA | NA | NA | 微生物细胞 | 正交遗传系统、代谢途径、能量系统、调控系统 | 工业生物技术 |
| 125 | 2026-03-06 |
In vivo self-assembled siRNAs ameliorate neurological pathology in TDP-43-associated neurodegenerative disease
2026-Mar-05, Brain : a journal of neurology
IF:10.6Q1
DOI:10.1093/brain/awaf330
PMID:40916343
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研究论文 | 本文提出了一种基于合成生物学的方法，利用体内自组装siRNA靶向TDP-43蛋白，通过小细胞外囊泡递送至中枢神经系统，改善TDP-43相关神经退行性疾病的病理症状 | 利用内源性小RNA处理机制自组装siRNA封装的小细胞外囊泡，并借助宿主自然循环系统运输siRNA，实现高效、微创的基因治疗 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化效果和长期安全性仍需进一步验证 | 开发针对TDP-43蛋白异常积累的基因治疗策略，以治疗肌萎缩侧索硬化和额颞叶变性等神经退行性疾病 | TDP-43蛋白、siRNA、小细胞外囊泡、小鼠模型中的神经病理学变化 | 合成生物学 | 神经退行性疾病 | siRNA技术、小细胞外囊泡递送、立体定向注射、腺相关病毒递送系统 | NA | NA | 小鼠模型 | CRISPR-Cas9（可能用于工程化肝细胞，但未明确提及，故输出NA） | 小鼠 | 工程化肝细胞表达并包装靶向TDP-43的siRNA到狂犬病毒糖蛋白标记的小细胞外囊泡中，形成自组装递送系统 | 医学 |
| 126 | 2026-03-06 |
Exploration of diverse glycosyltransferases in Dracocephalum moldavica and engineering the production of bioactive flavonoid glycosides
2026-Mar-04, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.70212
PMID:41782194
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研究论文 | 本研究系统探索了香青兰中参与黄酮类化合物糖基化的UDP-糖基转移酶，并通过工程化大肠杆菌实现了两种生物活性黄酮苷的高效合成 | 首次在香青兰中鉴定出五种功能多样的UGTs，包括双功能糖基转移酶DmUGT1，并通过定点突变揭示了其糖供体特异性的关键氨基酸位点 | 研究主要聚焦于已鉴定的五种UGTs，可能还有其他未发现的糖基转移酶参与香青兰黄酮苷的生物合成 | 阐明香青兰中黄酮类化合物糖基化的分子机制，并为合成生物学方法生产生物活性糖苷提供候选基因和方法 | 香青兰中的UDP-糖基转移酶及其催化的黄酮苷生物合成途径 | 合成生物学 | 心血管疾病 | 同源建模、定点诱变、代谢工程 | NA | 基因序列、酶活性数据 | 五种鉴定出的UGT基因 | 质粒设计、代谢工程 | 大肠杆菌 | 通过工程化大肠杆菌菌株，利用DmUGT1和DmCGT1，并增强细胞内UDP-葡萄糖醛酸和UDP-葡萄糖的供应，以生产目标黄酮苷 | 医药 |
| 127 | 2026-03-05 |
Correction for Ipoutcha et al., "A synthetic biology approach to assemble and reboot clinically relevant Pseudomonas aeruginosa tailed phages"
2026-Mar-03, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.00322-25
PMID:41609359
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 128 | 2026-03-04 |
Publisher Correction: Engineering modular and orthogonal genetic logic gates for robust digital-like synthetic biology
2026-Mar-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69313-3
PMID:41771868
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 129 | 2026-03-06 |
Designing prokaryotic gene expression regulatory elements: From genomic mining to artificial intelligence-driven generation
2026 Mar-Apr, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108781
PMID:41419171
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综述 | 本文系统回顾了原核生物基因表达调控元件的设计策略，从基因组挖掘到人工智能驱动生成 | 整合了生物物理模型和人工智能指导的理性设计方法，强调了深度生成模型在功能调控元件开发中的应用 | 未具体说明实验验证的局限性或数据可用性问题 | 优化微生物细胞工厂的生物生产，通过精细调控基因表达 | 原核生物基因表达调控元件 | 合成生物学 | NA | 基因组挖掘、随机诱变、靶向诱变、深度生成建模 | 深度生成模型 | 序列数据 | NA | NA | 原核生物 | 基因表达调控元件，如启动子、核糖体结合位点等 | 工业生物技术 |
| 130 | 2026-03-04 |
Building AuxInYeast Synthetic Biology Strains for Biochemical Characterization of Maize Auxin Hormone Signaling Components
2026-Mar-02, Cold Spring Harbor protocols
DOI:10.1101/pdb.prot108634
PMID:40074300
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研究论文 | 本文介绍了一种名为AuxInYeast的合成生物学工具，用于在酵母中构建玉米生长素信号通路组件，以进行生化表征 | 开发了AuxInYeast系统，作为植物合成生物学底盘，首次在酵母中重建玉米生长素信号通路，实现高通量定量分析 | 系统基于酵母环境，可能不完全模拟植物体内复杂调控网络，且仅针对玉米组件，通用性需进一步验证 | 构建合成生物学菌株，以生化表征玉米生长素激素信号通路组件 | 玉米生长素信号通路组件，包括受体、阻遏物、辅阻遏物、转录因子和响应元件 | 合成生物学 | NA | 流式细胞术、荧光蛋白标记 | NA | 生化数据、荧光信号数据 | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 酵母 | 生长素信号通路，包括受体-阻遏物复合物、转录激活级联和响应元件 | 农业, 工业生物技术 |
| 131 | 2026-03-04 |
Testing AuxInYeast Synthetic Biology Strains via Fluorescence Flow Cytometry
2026-Mar-02, Cold Spring Harbor protocols
DOI:10.1101/pdb.prot108635
PMID:40074301
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研究论文 | 本文介绍了一种使用荧光流式细胞术测试AuxInYeast合成生物学菌株的协议，用于分析玉米生长素信号通路 | 开发了基于酵母异源表达平台的AuxInYeast系统，结合荧光流式细胞术实现高通量定量测量植物生长素信号通路组件 | NA | 工程化玉米生长和发育，通过合成生物学工具分析生长素激素信号通路 | 玉米生长素感知受体和荧光标记的阻遏蛋白 | 合成生物学 | NA | 荧光流式细胞术 | NA | 荧光数据 | 多个AuxInYeast菌株，具体数量未指定 | AuxInYeast系统 | 酵母 | 生长素感知和阻遏蛋白降解的生物传感器通路 | 农业 |
| 132 | 2026-03-03 |
Molecular characterization following expression analysis of sugar transporters in passion fruit to explore their roles in fruit development and abiotic stress tolerance
2026-Mar, 3 Biotech
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s13205-026-04707-0
PMID:41768418
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研究论文 | 本研究通过全基因组分析鉴定百香果中的55个糖转运蛋白，探究其在果实发育和非生物胁迫耐受中的功能 | 首次在百香果中进行糖转运蛋白的全基因组鉴定，结合分子对接、动力学模拟和表达分析揭示其功能多样性及胁迫响应机制 | NA | 探索百香果糖转运蛋白在果实发育和非生物胁迫耐受中的潜在作用 | 百香果（Passiflora edulis）中的糖转运蛋白基因家族 | 植物分子生物学 | NA | 全基因组分析、RNA-seq、实时定量PCR、分子对接、分子动力学模拟 | NA | 基因组序列、RNA-seq数据、蛋白质序列 | NA | 合成生物学 | 百香果（植物） | 合成生物学指导的电路设计，用于开发多重非生物胁迫耐受的高糖百香果 | 农业 |
| 133 | 2026-03-02 |
Synthetic Biology and Metabolic Engineering of Microalgae for Sustainable Lipid and Terpenoid Production: An Updated Perspective
2026-Mar, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70405
PMID:41117552
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综述 | 本文是一篇关于微藻合成生物学与代谢工程用于可持续生产脂质和萜类化合物的最新进展的综述 | 整合并批判性评估了关键微藻模型（如莱茵衣藻、微拟球藻和三角褐指藻）的最新研究进展，重点介绍了加速设计-构建-测试-学习（DBTL）循环的新型遗传工具包、基因组规模代谢建模的突破，以及用于高价值化合物细胞器靶向生物合成的创新策略 | NA | 评估微藻合成生物学与代谢工程的最新进展，以推动其作为可持续生产脂质和萜类化合物的生物平台 | 微藻，特别是莱茵衣藻、微拟球藻和三角褐指藻等关键模型 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、代谢工程、基因组规模代谢建模 | NA | NA | NA | NA | Chlamydomonas reinhardtii, Nannochloropsis spp., Phaeodactylum tricornutum | 用于高价值化合物（如多不饱和脂肪酸和萜类）生物合成的代谢途径 | 食品, 燃料, 生物制造 |
| 134 | 2026-02-24 |
Construction and analysis of a cell factory for terpenoid biosynthesis in Pichia pastoris via metabolic engineering and metabolomics
2026-Mar, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.08.015
PMID:41725898
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研究论文 | 本研究通过代谢工程和代谢组学方法，在毕赤酵母中构建并分析了一个用于萜类化合物生物合成的通用细胞工厂 | 开发了一种“即插即用”的细胞工厂，通过增强MVA途径表达和减少分支途径分流策略，实现了多种萜类化合物的高效合成，并利用系统生物学分析揭示了关键蛋白拷贝数增加对精氨酸等代谢途径的影响 | 菌株的鲁棒性和紧密调控的代谢网络限制了理性代谢工程改造的潜力 | 构建高效的微生物细胞工厂以实现萜类化合物的大规模生产 | 毕赤酵母作为宿主细胞，用于生产β-榄香烯、β-法尼烯、(+)-瓦伦烯、(-)-α-红没药醇等萜类化合物 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、代谢组学、系统生物学分析 | NA | 代谢物数据 | 不同工程菌株 | 代谢工程 | 毕赤酵母 | 增强MVA途径表达和减少分支途径分流的通用萜类化合物生物合成细胞工厂 | 医药、保健品、香料 |
| 135 | 2026-02-20 |
Plant epidermis-derived secretory structures: from glandular trichomes to secretory cavities
2026-Mar, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.70892
PMID:41517861
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综述 | 本文比较了植物表皮衍生的分泌结构（如腺毛和分泌腔）的发育调控机制及次生代谢物合成 | 通过对比腺毛和分泌腔的发育与次生代谢调控，为合成生物学应用提供基础知识 | NA | 探讨植物表皮衍生分泌结构的发育和次生代谢物合成的调控机制 | 植物表皮衍生的分泌结构，包括腺毛和柑橘油腺等分泌腔 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 136 | 2026-02-15 |
Synergistic defense in cotton: Lignin-mediated barriers and JA/ET signaling pathways against Verticillium wilt
2026-Mar, Plant science : an international journal of experimental plant biology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.plantsci.2025.112943
PMID:41407016
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综述 | 本文综述了棉花通过木质素物理屏障与JA/ET信号通路协同防御黄萎病的机制 | 揭示了木质素介导的物理屏障与JA/ET信号通路的协同防御机制，并识别了关键调控因子GhBLH7-D06、GhKWL1和GbTCP20 | 不同棉花品种中通路的贡献度存在争议，且环境调控机制尚不明确 | 阐明棉花对黄萎病的协同防御机制，为开发持久广谱的抗病策略提供理论基础 | 棉花（Gossypium spp.）及其与黄萎病菌（Verticillium dahliae）的互作 | 植物病理学/合成生物学 | 植物病害（黄萎病） | 多组学分析（multi-omics） | NA | NA | NA | CRISPR | 棉花 | JA/ET信号通路与苯丙烷类代谢途径的协同调控网络 | 农业 |
| 137 | 2026-02-12 |
Over-Expression of a Phycocyanin-Interferon Fusion and Differential Cleaving Efficiency in Cyanobacteria (Synechocystis sp. PCC 6803)
2026-Mar, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.70126
PMID:41388596
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研究论文 | 本研究利用蓝藻Synechocystis sp. PCC 6803作为宿主，过表达藻蓝蛋白-人干扰素α-2融合蛋白，并比较TEV和HRV蛋白酶在切割融合蛋白中的效率 | 首次在蓝藻中稳定过表达功能性人干扰素α-2作为藻蓝蛋白融合体，并系统比较TEV和HRV蛋白酶在蓝藻系统中的切割效率，发现HRV蛋白酶优于TEV及其他近期测试的蛋白酶 | 研究仅针对特定蓝藻宿主和融合蛋白设计，未评估其他光合生物或不同融合策略的适用性，且切割效率可能受表达条件影响 | 开发蓝藻作为低成本重组蛋白生产平台，优化融合蛋白切割技术以提高蛋白分离效率 | 蓝藻Synechocystis sp. PCC 6803、藻蓝蛋白-人干扰素α-2融合蛋白、TEV和HRV蛋白酶切割位点 | 合成生物学 | NA | 重组蛋白表达、融合蛋白构建、蛋白酶切割分析 | NA | 实验数据 | 使用蓝藻Synechocystis sp. PCC 6803作为宿主，涉及不同蛋白酶切割位点的构建体 | 融合蛋白构建、蛋白酶切割系统 | 蓝藻Synechocystis sp. PCC 6803 | 藻蓝蛋白CpcB β-亚基与人干扰素α-2的融合蛋白，包含TEV或HRV蛋白酶切割位点 | 工业生物技术、医药 |
| 138 | 2026-02-07 |
Engineering strategies for microbial synthesis, customized modification, and application of hemoglobin
2026 Mar-Apr, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108752
PMID:41242508
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综述 | 本文综述了血红蛋白的微生物合成、定制化功能修饰及其在多个领域的应用策略与前景 | 重点探讨了利用人工智能算法定制血红蛋白功能修饰，并整合帕累托最优与迭代生物工程框架、深度学习及合成生物学等先进技术以克服应用挑战 | NA | 探讨血红蛋白的微生物合成、功能优化及多领域应用所面临的关键挑战与解决方案 | 血红蛋白 | 合成生物学 | NA | 微生物合成、人工智能算法、深度学习、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | NA | 医学, 生物技术, 农业, 食品, 工业生物技术 |
| 139 | 2026-02-07 |
Biosynthesis of high-value chorismate derivatives in Escherichia coli: Recent advances and perspectives
2026 Mar-Apr, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108762
PMID:41274425
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综述 | 本文综述了利用代谢工程和合成生物学策略在大肠杆菌中生物合成高价值分支酸衍生物的最新进展与前景 | 系统总结了大肠杆菌作为微生物平台生产分支酸衍生物的代谢工程与合成生物学最新策略，并讨论了工业化规模生产的挑战与机遇 | NA | 实现分支酸衍生物的绿色高效生物合成，替代传统植物提取和化学合成方法 | 分支酸衍生物（芳香族化合物） | 合成生物学 | NA | 系统代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌 | 分支酸生物合成途径 | 医药、化妆品、特种化学品 |
| 140 | 2026-02-07 |
Optogenetic tools for optimizing key signalling nodes in synthetic biology
2026 Mar-Apr, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108770
PMID:41317977
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综述 | 本文综述了光遗传学工具在合成生物学中优化关键信号节点的应用，包括微生物代谢、植物科学和疾病治疗等领域 | 将光遗传学工具分为五类，基于不同应用场景，提供时空调控酶活性或基因表达的新策略，超越传统化学诱导方法 | NA | 探讨光遗传学工具在合成生物学中调控关键信号节点的潜力，以促进基础研究和生物产业发展 | 光遗传学工具及其在微生物、植物和动物系统中的调控应用 | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | NA | NA | 光遗传学工具 | 微生物, 植物, 动物 | 光诱导基因表达调度、光触发液-液相分离模块、光诱导亚细胞定位光感受器、光调控酶、光门控离子通道和泵 | 医学, 农业, 工业生物技术 |