合成生物学相关文章
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当前共找到 2939 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-04-03 |
Phase Separation-Mediated Multienzyme Assembly In Vivo
2025-Apr-02, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c09585
PMID:40107849
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研究论文 | 本研究通过整合相分离蛋白RGGRGG与ReverseTag/ReverseCatcher标记系统，探讨了其在多酶复合物形成中的潜力 | 利用相分离蛋白RGGRGG与ReverseTag/ReverseCatcher系统的结合，实现了多酶复合物的自组装，显著提高了番茄红素的产量 | 研究主要聚焦于番茄红素生物合成途径中的六种酶，其他酶系统的适用性尚未验证 | 探索相分离介导的多酶组装在合成生物学中的应用 | 多酶复合物 | 合成生物学 | NA | 粗粒度模拟、ReverseTag/ReverseCatcher标记系统 | NA | NA | 六种参与番茄红素生物合成的酶 |
| 2 | 2025-04-03 |
Long-Term Yeast Cultivation Coupled with In Situ Extraction for High Triterpenoid Production
2025-Apr-02, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c00273
PMID:40129278
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research paper | 该研究通过结合长期酵母培养与原位提取技术，提高了工程酵母细胞内人参皂苷的生产和输出效率 | 结合长期酵母培养与原位提取技术，显著提高人参皂苷的生产效率，并实现酵母的多次重复利用 | 研究未提及大规模工业化生产中的潜在挑战或成本效益分析 | 提高人参皂苷的生产效率，支持其工业化生产 | 工程酵母细胞内的人参皂苷 | 合成生物学 | NA | 酵母培养与原位提取技术 | NA | NA | 单次摇瓶培养 |
| 3 | 2025-04-03 |
Establishing a Serine Integrase-Based Genetic Memory System In Vitro
2025-Apr-02, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.28986
PMID:40171936
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研究论文 | 本研究开发了一种基于丝氨酸整合酶的体外遗传记忆系统，用于DNA信息存储和处理 | 利用三种正交丝氨酸整合酶构建模块化、正交且可量化的体外遗传记忆系统，并成功应用于级联生物转化过程 | 研究仅限于体外环境，尚未在活体生物中进行验证 | 开发先进的体外遗传记忆系统以存储和处理遗传信息 | 基于DNA的遗传记忆系统 | 合成生物学 | NA | 丝氨酸整合酶技术 | NA | DNA序列数据 | NA |
| 4 | 2025-04-03 |
Evolution and Impact of Imine Reductases (IREDs) Research: A Knowledge Mapping Approach
2025-Apr-02, Molecular biotechnology
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12033-025-01421-9
PMID:40172741
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研究论文 | 本研究通过文献计量和知识图谱方法，探索了亚胺还原酶（IREDs）的研究格局和演变 | 首次通过文献计量分析提供了IRED研究的可视化表示，揭示了当前趋势和新兴主题 | 研究仅基于Web of Science Core Collection的数据，可能存在遗漏 | 评估IRED研究的现状和发展趋势，为学者提供研究方向和潜在合作者信息 | 239篇关于IREDs的研究文章和综述 | 生物催化 | NA | 文献计量分析、知识图谱方法（CiteSpace, VOSviewer, Pajek, Scimago Graphica） | NA | 文献数据 | 239篇研究文章和综述（2010-2024年） |
| 5 | 2025-04-03 |
TTLOC: A Tn5 transposase-based approach to localize T-DNA integration sites
2025-Mar-28, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiaf102
PMID:40131780
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研究论文 | 本文介绍了一种基于Tn5转座酶的T-DNA整合位点定位方法TTLOC，用于快速、低成本、高通量地检测转基因植物的T-DNA整合位点 | 开发了一种新型的T-DNA整合位点定位方法TTLOC，该方法利用Tn5转座酶进行基因组DNA片段化，具有操作简单、耗时短、高通量且成本低的特点 | 未提及具体的局限性 | 开发一种快速、低成本、高通量的T-DNA整合位点定位方法，以促进转基因植物的鉴定和作物育种 | 转基因拟南芥、水稻、大豆、番茄、马铃薯和小麦 | 植物合成生物学 | NA | Tn5转座酶介导的基因组DNA片段化，NGS测序 | NA | 基因组DNA序列数据 | 65个转基因拟南芥株系和多个转基因作物（水稻、大豆、番茄、马铃薯和小麦） |
| 6 | 2025-04-03 |
Understanding, inhibiting, and engineering membrane transporters with high-throughput mutational screens
2025-Mar-25, Cell chemical biology
IF:6.6Q1
DOI:10.1016/j.chembiol.2025.03.003
PMID:40168989
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研究论文 | 本文探讨了利用高通量突变筛选技术理解、抑制和设计膜转运蛋白的方法 | 提出了高通量筛选方法在膜转运蛋白研究中的应用潜力，特别是在理解多特异性转运的分子基础和设计抑制剂方面的创新 | 高通量筛选方法在膜转运蛋白领域的应用仍不广泛，影响力有限 | 研究膜转运蛋白的功能和多特异性转运的分子基础，以及如何利用这些知识设计抑制剂和工程化转运蛋白 | 多特异性膜转运蛋白 | 合成生物学与生物技术 | NA | 高通量突变筛选 | NA | 遗传变异数据 | NA |
| 7 | 2025-04-03 |
[Databases, knowledge bases, and large models for biomanufacturing]
2025-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240653
PMID:40170304
|
综述 | 本文综述了生物制造领域中数据库、知识库和大语言模型的最新研究进展 | 探讨了生物制造领域与人工智能、大模型和高性能计算等信息技术融合的发展方向与新兴技术方法 | 未具体说明所涵盖研究的样本量或数据规模 | 为相关领域的科学研究提供指导和启发 | 生物制造领域的信息技术应用 | 生物信息学 | NA | 人工智能、大模型、高性能计算 | 大语言模型 | 生物信息学数据 | NA |
| 8 | 2025-04-03 |
[Intelligent design of nucleic acid elements in biomanufacturing]
2025-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240599
PMID:40170308
|
综述 | 本文综述了人工智能在生物制造中核酸元件设计与优化中的应用及其进展 | 总结了AI在生物制造中核酸元件设计方面的最新工具和应用案例 | 生物系统的复杂性及缺乏高度量化的训练数据限制了AI在生物制造中的应用 | 探讨AI如何加速生物制造中核酸元件的设计与优化 | 生物制造中的核酸元件（如启动子、核糖体结合位点、终止子等） | 合成生物学 | NA | 高通量技术 | AI算法 | 序列数据 | NA |
| 9 | 2025-04-03 |
[Artificial intelligence-assisted design, mining, and modification of CRISPR-Cas systems]
2025-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240865
PMID:40170307
|
综述 | 本文全面总结了人工智能技术在CRISPR-Cas系统设计、挖掘和修饰中的应用进展 | 人工智能技术，尤其是机器学习，通过分析高通量测序数据，革新了sgRNA设计，提高了编辑效率并高精度预测脱靶效应 | NA | 探讨人工智能在CRISPR-Cas系统设计、挖掘和修饰中的应用 | CRISPR-Cas系统 | 合成生物学 | NA | 高通量测序 | 机器学习 | 测序数据 | NA |
| 10 | 2025-04-03 |
[Machine learning-aided design of synthetic biological parts and circuits]
2025-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240605
PMID:40170311
|
review | 本文回顾了机器学习在合成生物学部件和遗传电路设计中的应用，并讨论了当前挑战及未来趋势 | 探讨了机器学习如何从传统试错方法转向标准化、智能化的工程设计，为合成生物学提供创新支持 | 未具体说明机器学习模型在复杂遗传电路设计中的实际效果及数据需求 | 推动合成生物学从经验驱动向智能工程设计的范式转变 | 合成生物学部件（如启动子、RNA调控元件、转录因子）及简单遗传电路 | machine learning | NA | 机器学习算法 | NA | 生物数据 | NA |
| 11 | 2025-04-03 |
[Advances in the regulation of microbial cell metabolism and environmental adaptation]
2025-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240937
PMID:40170316
|
review | 本文全面综述了细胞代谢和环境适应的调控机制及其在合成生物学中的应用 | 首次从跨膜蛋白和传感器蛋白、自然细胞的适应调控机制以及应用场景三个方面系统性地综述了细胞代谢和环境适应的调控 | 缺乏对具体实验数据和案例的深入分析 | 探讨细胞感知代谢和环境变化的机制及其在合成生物学中的应用 | 细胞的代谢和环境适应调控机制 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 12 | 2025-04-03 |
[Advances in reconstruction and optimization of cellular physiological metabolic network models]
2025-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240966
PMID:40170315
|
综述 | 本文系统介绍了细胞生理代谢网络模型重建与优化的最新研究进展 | 总结了人工智能在动力学模型和酶约束模型开发中的应用，为高精度构建细胞生理代谢网络模型提供了新机遇 | 未提及具体模型在实际应用中的性能局限或验证不足 | 为定量合成生物学和系统生物学研究提供计算生物学工具支持 | 细胞生理代谢网络模型（包括GEMs、动力学模型和ecGEMs） | 计算生物学 | NA | 基因组尺度代谢模型构建技术、人工智能技术 | GEMs、动力学模型、ecGEMs | 代谢网络数据 | NA |
| 13 | 2025-04-03 |
[Intelligent design of transcription factor-based biosensors]
2025-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240603
PMID:40170310
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review | 本文综述了转录因子(TF)基生物传感器在计算模拟和人工智能辅助下的工程与优化最新进展 | 结合计算模拟和人工智能技术优化转录因子基生物传感器，相比传统工具更准确快速 | NA | 总结转录因子基生物传感器的工程与优化方法，促进新型生物传感器的发展 | 转录因子基生物传感器 | 合成生物学 | NA | 计算模拟、人工智能、蛋白质结构预测、配体结合模拟、机器学习 | 机器学习模型 | 突变数据 | NA |
| 14 | 2025-04-03 |
[Optimization of fermentation processes in intelligent biomanufacturing: on online monitoring, artificial intelligence, and digital twin technologies]
2025-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.250032
PMID:40170318
|
综述 | 本文综述了智能生物制造中发酵过程的实时监测、人工智能优化策略和数字孪生技术的进展 | 整合了在线监测技术、人工智能驱动的动态优化和数字孪生技术，为发酵过程的精确优化和高效放大提供了新范式 | 未提及具体实验验证或案例研究的局限性 | 实现发酵过程的精确优化和高效放大，推动生物制造向更高效率、智能化和可持续发展方向发展 | 发酵过程的实时监测、智能控制和优化策略 | 智能生物制造 | NA | 在线监测技术、人工智能、数字孪生 | 人工神经网络、支持向量机、遗传算法 | 实时传感数据 | NA |
| 15 | 2025-04-03 |
[Preface for special issue on AI-driven biomanufacturing]
2025-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.250197
PMID:40170303
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评论 | 本期特刊探讨了人工智能驱动的生物制造的机遇、挑战和发展现状 | 综述了人工智能在生物制造领域的创新应用，包括智能设计、构建生物部件、电路和人工细胞，以及智能生物过程控制与优化 | NA | 把握人工智能驱动的生物制造的创新与发展 | 生物制造领域的技术创新和产业发展 | 生物制造 | NA | 人工智能 | NA | 生物大数据 | NA |
| 16 | 2025-04-03 |
Synthetic biology routes to new and extinct natural products
2025-Mar-21, RSC chemical biology
IF:4.2Q2
DOI:10.1039/d5cb00047e
PMID:40171247
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research paper | 该研究通过合成生物学方法探索了新型和已灭绝天然产物的生物合成途径 | 利用基因敲除和基因交换技术，成功分离出多种新代谢物，并优化了生产菌株以提高特定代谢物的产量和稳定性 | 研究主要集中在细菌和真菌的特定代谢途径，可能不适用于其他生物系统 | 探索和优化天然产物的生物合成途径，以生产新型和改进的代谢物 | 细菌和真菌中的生物合成途径及其代谢产物 | 合成生物学 | NA | 基因敲除、基因交换、异源表达 | NA | 基因组数据、代谢物数据 | 多种细菌和真菌菌株 |
| 17 | 2025-04-03 |
Robust and highly efficient transformation method for a minimal mycoplasma cell
2025-Mar-20, Journal of bacteriology
IF:2.7Q3
DOI:10.1128/jb.00415-24
PMID:39903184
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研究论文 | 本文报道了一种针对最小细胞JCVI-syn3B的稳健且高效的转化方法 | 该方法在早期指数生长期观察到最高转化效率，转化效率高达每细胞每微克质粒DNA 4.4×10转化体，并开发了使用少量培养物和质粒DNA获得大量转化体的方法 | NA | 开发一种高效且稳健的最小细胞转化方法，以促进最小细胞的遗传工程和生物学研究 | 最小细胞JCVI-syn3B | 合成生物学 | NA | 转化方法 | NA | NA | 少于0.2 mL培养物，约1×10-10细胞和10 ng质粒DNA |
| 18 | 2025-04-03 |
Artificial intelligence driven innovations in biochemistry: A review of emerging research frontiers
2025-Mar-07, Biomolecules & biomedicine
DOI:10.17305/bb.2024.11537
PMID:39819459
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综述 | 本文综述了人工智能在生物化学领域的应用及其对研究能力的提升 | 探讨了AI在生物化学中的新兴应用领域，如个性化医疗和合成生物学，并评估了如AlphaFold等AI工具在蛋白质结构预测中的重要作用 | 面临数据质量、模型可解释性和伦理问题等挑战 | 探索人工智能在生物化学中的当前和潜在应用，推动理论和应用研究的革命 | 生物化学领域的数据分析、分子建模、酶工程和代谢途径研究 | 生物化学 | NA | 机器学习算法、自然语言处理、AI分子建模 | NA | 复杂数据集 | NA |
| 19 | 2025-04-03 |
Engineering Material Properties of Transcription Factor Condensates to Control Gene Expression in Mammalian Cells and Mice
2024-09, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202311834
PMID:38573961
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research paper | 该研究通过调节转录因子凝聚物的材料特性，探索其对基因表达调控的影响 | 首次系统性地调节光遗传诱导的转录因子凝聚物的材料特性，并揭示其对基因表达激活的影响 | 研究主要关注转录因子凝聚物的物理性质对基因表达的影响，未深入探讨具体的分子机制 | 探索生物分子凝聚物材料特性对基因表达调控的影响 | 哺乳动物细胞和小鼠中的转录因子凝聚物 | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | 基因表达数据 | 哺乳动物细胞和小鼠模型，使用不同合成和天然转录因子 |
| 20 | 2025-04-03 |
Targeting solid tumor antigens with chimeric receptors: cancer biology meets synthetic immunology
2024-Apr, Trends in cancer
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.trecan.2024.01.003
PMID:38355356
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review | 本文回顾了针对实体瘤抗原的嵌合抗原受体（CAR）T细胞疗法的研究现状和临床应用 | 从癌症生物学和基因调控的角度探讨实体瘤靶抗原，并结合新兴临床数据讨论CAR-T细胞疗法 | 主要关注早期临床试验数据，尚未涉及大规模临床验证 | 探讨CAR-T细胞疗法在实体瘤治疗中的应用和发展 | 实体瘤靶抗原和CAR-T细胞疗法 | 合成免疫学 | 实体瘤 | CAR-T细胞疗法 | NA | 临床数据 | NA |