合成生物学相关文章
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当前共找到 4498 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-02-27 |
Versatile 2-Oxoglutarate-Dependent Dioxygenases Catalyze Radical-Mediated Multifunctional Skeleton Reconstructions and Oxidation Modifications of Taxoids
2026-Feb-26, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.6c01169
PMID:41746272
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研究论文 | 本研究鉴定并表征了两种新型2-氧戊二酸依赖性双加氧酶TcOGD1和TcOGD2，它们能够催化紫杉烷类化合物的骨架重构和氧化修饰，揭示了紫杉烷结构多样性的形成机制 | 首次报道了具有催化多功能性的2-氧戊二酸依赖性双加氧酶，能够实现从6/8/6到5/7/6、-5/7/6和6/12框架的骨架重构，以及多个位点的氧化修饰，扩展了紫杉烷二萜的化学空间 | NA | 探索紫杉烷二萜类化合物的化学多样性和生物合成途径，特别是5/7/6框架紫杉烷的形成机制 | 紫杉烷二萜类化合物，特别是以taxuspine J为代表的5/7/6框架紫杉烷 | 合成生物学 | 癌症 | 酶促反应、NMR光谱学、酶工程 | NA | 化学结构数据、光谱数据 | 从植物中分离出五种新型-5/7/6紫杉烷，并通过放大酶反应鉴定了包括taxuspine J在内的多种化合物 | 酶工程、合成生物学 | NA | NA | 医药 |
| 2 | 2026-02-27 |
Preparation strategies and biomedical applications of DNA hydrogels
2026-Feb-25, Chemical science
IF:7.6Q1
DOI:10.1039/d5sc08190d
PMID:41657654
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综述 | 本文总结了DNA水凝胶的制备策略、应用优势及其在细胞培养、药物递送和组织工程等生物医学领域的最新进展 | 系统性地将DNA纳米技术与合成生物学结合，利用DNA作为结构框架或交联剂构建具有生物组织相似性的三维网络结构，并突出其可编程响应性和特异性识别功能 | 讨论了DNA水凝胶发展当前面临的挑战，但未具体说明实验验证的局限性 | 总结DNA水凝胶的制备策略，分析其应用优势，并探讨在生物医学领域的应用前景 | DNA水凝胶 | 材料科学 | NA | DNA纳米技术，合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 3 | 2026-02-27 |
CO2-driven biosurfactant synthesis by bacteria within CCUS
2026-Feb-25, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-026-13761-w
PMID:41741775
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综述 | 本文综述了微生物在CCUS框架内利用CO2驱动生物表面活性剂合成的代谢与工程方面，探讨了其结构多样性、物理化学性质及工业应用 | 聚焦于厌氧和CO2富集系统中微生物碳捕获与生物表面活性剂合成的结合，并整合人工智能与代谢工程以优化生产 | 存在技术和经济挑战，未详细说明具体实验数据或案例 | 探讨微生物CO2捕获与生物表面活性剂生产在温室气体减排和可持续生物制造中的策略 | 微生物（细菌）及其在CCUS系统中的代谢过程 | 合成生物学 | NA | 遗传与合成生物学、途径模块化、系统级建模 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 碳固定模块与生物表面活性剂途径的连接 | 环境、工业生物技术 |
| 4 | 2026-02-27 |
InsiliCoil: An Integrated Software Suite for Coiled Coil Design, Prediction, and Therapeutic Engineering
2026-Feb-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00678
PMID:41370672
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研究论文 | 本文介绍了一个名为InsiliCoil的集成软件套件，用于卷曲螺旋的设计、预测和治疗性工程 | 将预测建模、选择性肽抑制剂发现和正交相互作用组设计统一到一个单一的可访问框架中，提供比基于结构的方法快几个数量级的通量 | NA | 开发一个用于控制螺旋介导的蛋白质-蛋白质相互作用的综合平台，以加速治疗发现和可编程生物系统的理性工程 | 卷曲螺旋（CCs）作为合成生物学中的模块化、可编程构建块以及治疗靶点 | 合成生物学 | NA | 预测建模、高通量筛选、计算设计 | NA | 蛋白质序列和结构数据 | NA | InsiliCoil软件套件 | NA | 正交卷曲螺旋网络，用于合成生物电路和生物材料 | 医学, 工业生物技术 |
| 5 | 2026-02-27 |
Multilayer Host Engineering of Saccharomyces cerevisiae to Enhance Cricket Paralysis Virus (CrPV) Internal Ribosome Entry Site Mediated Translation
2026-Feb-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00744
PMID:41546634
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研究论文 | 本文通过多层宿主工程改造酿酒酵母，以增强蟋蟀麻痹病毒内部核糖体进入位点介导的翻译 | 提出了一种结合翻译起始、tRNA修饰和mRNA稳定性三个机制层面的宿主工程策略，显著提升CrPV IRES活性 | NA | 增强非典型翻译系统中的IRES活性，以扩展合成生物学中的RNA调控工具 | 酿酒酵母和蟋蟀麻痹病毒内部核糖体进入位点 | 合成生物学 | NA | 报告基因筛选、宿主工程改造 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 酿酒酵母 | 内部核糖体进入位点介导的翻译系统 | 工业生物技术 |
| 6 | 2026-02-27 |
The Coli Toolkit (CTK): An Extension of the Modular Yeast Toolkit for Use in E. coli
2026-Feb-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00489
PMID:41581077
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研究论文 | 本文介绍了Coli Toolkit (CTK)，一个基于Golden Gate的模块化克隆系统，适用于大肠杆菌，旨在加速遗传电路的组装 | CTK通过将启动子部分细分为启动子、绝缘核酶和核糖体结合位点，提供了更灵活的转录和翻译控制，并整合了Cello库的20个NOT门作为预组装基本部件 | NA | 开发一个用于大肠杆菌的模块化克隆系统，以优化遗传电路的设计-构建-测试-学习循环 | 遗传电路和DNA组装工具 | 合成生物学 | NA | Golden Gate克隆 | NA | NA | NA | Golden Gate Assembly | E. coli | 遗传电路，包括启动子、绝缘核酶、核糖体结合位点和NOT门 | 生物技术 |
| 7 | 2026-02-27 |
Slowpoke: An Automated Golden Gate Cloning Workflow for Opentrons OT-2 and Flex
2026-Feb-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00629
PMID:41642882
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研究论文 | 本文介绍了一个名为Slowpoke的自动化Golden Gate克隆工作流程，专为Opentrons OT-2和Flex液体处理平台设计 | 开发了一个用户友好、灵活且开源的自动化Golden Gate克隆工作流程，并配有免费的图形用户界面，简化了协议生成过程 | 工作流程仍需用户干预菌落挑取和平板转移步骤 | 开发一个标准化、高通量且无错误的DNA组装自动化解决方案 | Golden Gate克隆工作流程的自动化 | 合成生物学 | NA | Golden Gate克隆 | NA | NA | 使用MoClo酵母工具包和SubtiToolKit进行验证，涉及多个组装组合 | Golden Gate Assembly | 酵母, 枯草芽孢杆菌 | NA | 工业生物技术 |
| 8 | 2026-02-27 |
Engineering Basal Cognition: Minimal Genetic Circuits for Habituation, Sensitization, and Massed-Spaced Learning
2026-Feb-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00766
PMID:41666326
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研究论文 | 本文采用合成生物学方法，探索如何利用最小遗传电路在单细胞系统中实现非关联性学习，包括习惯化、敏感化和集中-分散学习效应 | 通过设计基于理论模型和已知调控元件的合成电路，首次在单细胞水平模拟了习惯化、敏感化及集中-分散学习效应，为实验验证提供了平台 | 研究基于模拟设计，尚未进行实验验证，且电路可能受限于结构和动力学约束，与神经学习系统存在差异 | 探索基础认知功能的遗传实现机制，以理解单细胞生物的学习行为及其进化优势 | 单细胞系统和非神经生物中的学习行为，如原生生物和黏菌 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法，包括遗传电路设计和模拟 | NA | 模拟数据 | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 单细胞系统（如大肠杆菌或酵母） | 包含激活子、抑制子、荧光报告基因和群体感应分子的合成电路，用于实现习惯化、敏感化和集中-分散学习效应 | 工业生物技术，医学 |
| 9 | 2026-02-27 |
Synthesis of Plant-Inspired O-Acetylated Hemicellulose Structures in the Yeast Yarrowia lipolytica
2026-Feb-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00595
PMID:41611228
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研究论文 | 本研究在解脂耶氏酵母中成功重建了植物来源的半纤维素（β-葡甘露聚糖和β-葡聚糖）的生物合成途径，并实现了其O-乙酰化修饰 | 首次在酵母系统中同时合成植物来源的半纤维素骨架结构及其O-乙酰化变体，创造了自然界不存在的结构更复杂的乙酰化变体 | 未明确说明产量、规模化生产可行性及与天然植物半纤维素在高级结构上的完全一致性 | 利用合成生物学方法在微生物工厂中生产具有特定理化性质的植物源半纤维素多糖 | 半纤维素多糖（β-葡甘露聚糖和β-葡聚糖）及其O-乙酰化衍生物 | 合成生物学 | NA | 糖基转移酶表达、寡糖质谱分析、组成分析、糖苷键分析 | NA | 质谱数据、化学分析数据 | NA | 基因表达（糖基转移酶、O-乙酰转移酶） | 解脂耶氏酵母 | 重建植物半纤维素生物合成途径（骨架合成与乙酰化修饰模块） | 生物材料、制药、工业生物技术 |
| 10 | 2026-02-27 |
Yeast Stress Response to Synthetic Constructs
2026-Feb-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00715
PMID:41615018
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综述 | 本文综述了工程化酵母中由异源构建体引发的应激反应，并提出了应激感知的设计原则以提高其生物技术应用中的稳健性和产量 | 提出了“应激组”概念以整合多种应激通路对合成构建体的响应，并系统总结了减轻细胞负担的多种策略及新兴方法 | NA | 理解合成构建体如何与酵母应激通路相互作用，并开发更稳健、高产的工程酵母系统 | 酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae）作为合成生物学底盘生物 | 合成生物学 | NA | CRISPR、适应性实验室进化、数据驱动的菌株工程 | NA | NA | NA | CRISPR | 酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae） | 合成细胞器构建、动态调控、通路区室化 | 工业生物技术 |
| 11 | 2026-02-27 |
Preclinical Evaluation of Synthetic Biology-Driven Engineered Escherichia coli Nissle 1917 as a Living Therapeutic for Sustained L-DOPA Delivery
2026-Feb-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00786
PMID:41628253
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研究论文 | 本研究利用合成生物学方法开发了一种基于工程化大肠杆菌Nissle 1917的活体生物治疗系统，用于持续递送L-DOPA以缓解帕金森病症状 | 首次构建了基于质粒的L-DOPA表达益生菌株，实现了在体内持续稳定递送L-DOPA，相比传统口服给药方式具有更好的药代动力学特性 | 研究仅在临床前小鼠模型中进行验证，尚未开展人体临床试验；工程菌的长期安全性、免疫原性和肠道定植稳定性仍需进一步评估 | 开发一种新型的帕金森病治疗方法，通过工程化益生菌实现L-DOPA的持续递送，以克服传统给药方式的局限性 | 工程化大肠杆菌Nissle 1917益生菌株及其在帕金森病小鼠模型中的治疗效果 | 合成生物学 | 帕金森病 | 合成生物学方法、质粒工程、动物模型行为学评估 | NA | 体外实验数据、体内药代动力学数据、行为学评估数据 | 小鼠模型系统（具体数量未明确说明） | 质粒工程 | 大肠杆菌Nissle 1917 | L-DOPA生物合成途径的工程化设计 | 医学 |
| 12 | 2026-02-27 |
Ultra-high-throughput mapping of genetic design space
2026-Feb, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09933-9
PMID:41535463
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研究论文 | 本研究介绍了一种名为CLASSIC的遗传筛选平台，通过结合长读长和短读长测序技术，能够高通量定量评估任意长度、包含多种遗传元件组合的构建体，从而加速合成生物学中基因电路的设计与优化 | 开发了CLASSIC平台，首次实现了对多kb长度尺度、包含多种遗传元件组合的构建体进行超高通量定量筛选，突破了传统方法只能分析短序列的限制 | NA | 建立高通量遗传筛选平台，揭示遗传元件的组合规则，实现复杂遗传系统的数据驱动设计 | 基因电路设计（长度5-20 kb） | 合成生物学 | NA | 长读长和短读长下一代测序（NGS） | 机器学习模型 | 测序数据 | 超过10^6种基因电路设计 | NA | 人类细胞 | 基因电路（包含多种遗传元件的组合） | 工业生物技术 |
| 13 | 2026-02-27 |
Synthetic Biology of Plants and Microbes for Agriculture, Environment, and Future Applications
2026-Jan-28, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.4c00687
PMID:41609588
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综述 | 本文综述了合成生物学在植物和微生物工程中的最新进展，旨在推动农业革命并拓展植物工程在制造、传感和修复等新领域的应用 | 提出将植物及其共生微生物视为整体系统进行工程化设计，并整合基因组构建工具、计算机辅助设计和人工智能等新技术 | NA | 探讨合成生物学如何通过先进基因工程技术驱动农业革命并拓展植物工程的新应用领域 | 植物及其共生微生物（真菌、细菌、古菌） | NA | NA | 基因组构建工具、计算机辅助设计、人工智能 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN | 植物、真菌、细菌、古菌 | 响应环境变化、改变形态或应对威胁的智能植物电路 | 农业, 环境, 制造业, 基础设施, 传感, 修复 |
| 14 | 2026-02-27 |
Advances and Future Perspectives of Synechocystis sp. as a Microbial Cell Factory for Biomanufacturing
2025-Nov, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.70162
PMID:41311002
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综述 | 本文综述了集胞藻作为微生物细胞工厂在生物制造中的最新进展、面临的挑战及未来研究方向 | 整合了生物信息学概述与合成生物学应用的最新进展，并提出了规模化、工业化及组学策略整合的未来方向 | NA | 推动蓝藻在工业生物技术中的应用，促进可持续、低碳、高效的生物生产系统发展 | 集胞藻 | 工业生物技术 | NA | 组学策略 | NA | NA | NA | 合成生物学设计 | 集胞藻 | NA | 工业生物技术 |
| 15 | 2026-02-27 |
Computation-driven redesign of an NRPS-like carboxylic acid reductase improves activity and selectivity
2024-11-29, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adp6775
PMID:39612335
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研究论文 | 本文通过计算驱动重新设计非核糖体肽合成酶样羧酸还原酶的腺苷化结构域，以提高其催化活性和选择性 | 采用基于近似机制的几何标准和Rosetta能量评分，对CARs的“守门员”腺苷化结构域进行重新设计，实现了高达101倍的催化效率提升和86倍的底物特异性增强 | NA | 提高非核糖体肽合成酶样羧酸还原酶的催化效率和底物选择性 | 羧酸还原酶（CARs）的腺苷化结构域 | 合成生物学 | NA | 计算重新设计、Rosetta能量评分 | NA | NA | NA | Rosetta | NA | NA | 工业生物技术 |
| 16 | 2026-02-27 |
Data-Driven Design of Triple-Targeted Protein Nanoprobes for Multiplexed Imaging of Cancer Lymphatic Metastasis
2024-09, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202405877
PMID:38889909
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研究论文 | 本文介绍了一种通过数据驱动设计和合成生物学组装策略开发的三靶向蛋白质纳米探针，用于癌症淋巴转移的多重成像 | 利用机器学习生物信息学分析结合患者组织检查，识别出CXCR4、TfR1和VEGFR3三个靶点组合，并设计出能特异性结合所有三个靶点的铁蛋白纳米笼探针，实现了对高度异质性淋巴转移的多重成像 | NA | 开发用于癌症淋巴转移成像的靶向纳米探针 | 癌症淋巴转移的异质性靶点及成像 | 数字病理学 | 胃癌 | 机器学习生物信息学分析、合成生物学组装 | NA | 组织样本数据、成像数据 | 19个新鲜切除的人类胃癌标本及患者淋巴组织 | 合成生物学方法 | NA | 基于基因工程铁蛋白亚基自组装的纳米笼探针 | 医学 |
| 17 | 2026-02-26 |
Streptomyces as a versatile host platform for heterologous production of microbial natural products
2026-Feb-25, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00036j
PMID:40923873
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综述 | 本文全面回顾了2004年至2024年间利用链霉菌作为异源表达平台生产微生物天然产物的研究进展 | 首次对过去20年超过450项相关研究进行了数据驱动的定量分析，总结了表达趋势、关键影响因素及技术进展 | 作为一篇综述文章，主要基于现有文献进行分析，未提出新的实验数据或技术突破 | 评估链霉菌作为异源表达平台在挖掘微生物天然产物生物合成基因簇方面的潜力和应用 | 链霉菌宿主及其异源表达的各类生物合成基因簇 | 合成生物学 | NA | 异源表达、基因组工程、合成生物学工具、组合生物合成 | NA | 文献数据 | 超过450项同行评审研究 | 基因组工程 | 链霉菌 | 生物合成基因簇的异源表达与调控 | 药物发现 |
| 18 | 2026-02-26 |
Toward a unified pipeline for natural product discovery: tools and strategies for NRPS and PKS pathway exploration and engineering
2026-Feb-25, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00041f
PMID:40719200
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综述 | 本文综述了将非核糖体肽合成酶和聚酮合酶系统转化为可理性设计平台的最新进展，涵盖基因组挖掘、高通量筛选、合成生物学工具及计算建模等方法 | 强调计算建模（如同源建模、分子对接、分子动力学模拟）与深度学习策略如何与传统技术互补，加速定制化天然产物类似物的发现与组装 | NA | 探索和改造NRPS与PKS生物合成途径，以发现和设计新型天然产物 | 非核糖体肽合成酶和聚酮合酶系统及其产生的天然产物 | 合成生物学 | NA | 基因组挖掘、高通量筛选、去重复分析、同源建模、分子对接、分子动力学模拟、深度学习 | 深度学习模型 | NA | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 19 | 2026-02-26 |
Lactic Acid Bacteria Bacteriocins: Classification, Biosynthesis, Health Benefits, and Strategies for Enhanced Efficacy
2026-Feb-25, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c14047
PMID:41700423
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综述 | 本文综述了乳酸菌细菌素的分类、生物合成、健康益处及增强效能的策略 | 提供了更新的细菌素分类（I-III类），并分析了产量影响因素和增强效能的策略，如代谢工程和合成生物学 | 产量优化和临床转化方面仍存在挑战 | 综述乳酸菌细菌素的研究进展，以指导其治疗开发和规模化生产 | 乳酸菌细菌素 | NA | 感染和癌症 | NA | NA | NA | NA | 代谢工程, 合成生物学 | 乳酸菌 | NA | 食品, 生物医学 |
| 20 | 2026-02-26 |
DNA Framework-Encoded Digital Recorder for Bacterial Discrimination
2026-Feb-25, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.6c01091
PMID:41738382
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研究论文 | 开发了一种基于DNA框架的位置编码系统（DFDR），用于同时区分多种核酸序列，并应用于细菌鉴别 | 利用三角形DNA框架实现位点特异性功能化，单单元可同时解析18个核酸靶标，比传统DNA自组装系统的复用能力提高6倍，并支持多重信号的顺序和可重写记录 | NA | 开发一种能够同时区分多种生物分子信号的技术，用于精确诊断共感染和评估医疗环境 | 核酸序列（包括16S rRNA混合物）和临床相关呼吸道病原体 | 合成生物学 | 呼吸道感染 | DNA框架自组装、核酸杂交 | NA | 核酸序列数据 | 医院环境和天然河水样本 | DNA自组装 | NA | 基于三角形DNA框架的位置编码系统，每条边用正交探针功能化以靶向不同DNA序列 | 医学诊断、环境监测、信息存储 |