合成生物学相关文章
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当前共找到 2531 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2024-12-21 |
Modeling ncRNA-Mediated Circuits in Cell Fate Decision: From Systems Biology to Synthetic Biology
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4290-0_6
PMID:39702707
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综述 | 本文综述了非编码RNA在细胞命运决定中的作用，并探讨了其在系统生物学和合成生物学中的数学建模框架 | 本文总结了非编码RNA介导的细胞命运决定过程的数学建模框架，并探讨了其在真实生物过程中的应用 | 本文主要为综述性质，未提供新的实验数据或模型 | 探讨非编码RNA在细胞命运决定中的分子机制及其在系统生物学和合成生物学中的应用 | 非编码RNA、mRNA、miRNA、竞争性内源RNA（ceRNA）及其相互作用 | 系统生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2 | 2024-12-21 |
Regulatory Components for Bacterial Cell-Free Systems Engineering
2024-Dec-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00574
PMID:39509282
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综述 | 本文综述了细菌无细胞系统中天然和工程化调控组件及其应用 | 本文系统性地总结了调控组件在细菌无细胞系统中的应用，为合成生物学的发展提供了新的视角 | NA | 探讨调控组件在细菌无细胞系统中的应用及其对合成生物学发展的推动作用 | 细菌无细胞系统中的调控组件 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3 | 2024-12-21 |
Modulating Microbial Materials - Engineering Bacterial Cellulose with Synthetic Biology
2024-Dec-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00615
PMID:39509658
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研究论文 | 本文探讨了合成生物学如何推动细菌纤维素（BC）基生物材料的发展，并强调了其在工程化活性材料（ELMs）中的应用潜力 | 本文创新性地将合成生物学与材料科学结合，探索了细菌纤维素在工程化活性材料中的应用，并讨论了3D生物打印在这一领域的潜力 | 本文主要讨论了合成生物学在细菌纤维素领域的应用前景，但未详细探讨具体的技术挑战和实现细节 | 探讨合成生物学如何推动细菌纤维素基材料的发展，并研究其在工程化活性材料中的应用 | 细菌纤维素（BC）及其在工程化活性材料（ELMs）中的应用 | 材料科学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 4 | 2024-12-21 |
Engineering an αCD206-synNotch Receptor: Insights into the Development of Novel Synthetic Receptors
2024-Dec-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00149
PMID:39555579
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研究论文 | 本文开发了一种新型αCD206-synNotch受体，用于研究肿瘤微环境中癌细胞与巨噬细胞之间的相互作用 | 本文首次开发了针对CD206巨噬细胞的αCD206-synNotch受体，为研究癌细胞与巨噬细胞的相互作用提供了新的工具 | 本文讨论了该受体在应用中的一些意外问题，表明其在实际应用中可能存在局限性 | 开发一种新型合成受体，用于研究肿瘤微环境中癌细胞与巨噬细胞的相互作用 | CD206巨噬细胞和癌细胞 | NA | NA | 合成生物学 | synNotch受体 | NA | 小鼠转移模型 |
| 5 | 2024-12-21 |
Red Light Responsive Cre Recombinase for Bacterial Optogenetics
2024-Dec-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00388
PMID:39558834
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研究论文 | 本文介绍了一种红光响应的Cre重组酶系统OptoCre-REDMAP，用于细菌的光遗传学研究 | 该系统利用植物光受体PhyA和FHY1以及Cre重组酶的分裂版本，实现了对基因表达和DNA切除的精确控制，并展示了红光在多色控制和穿透性方面的优势 | NA | 开发一种红光响应的Cre重组酶系统，以实现细菌中基因表达和DNA切除的精确控制 | 红光响应的Cre重组酶系统OptoCre-REDMAP及其在细菌中的应用 | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | NA | NA |
| 6 | 2024-12-21 |
Effect of Translation-Enhancing Nascent SKIK Peptide on the Arrest Peptides Containing Consecutive Proline
2024-Dec-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00221
PMID:39573840
|
研究论文 | 本文研究了SKIK肽标签对含有连续脯氨酸的终止肽的翻译抑制效应的缓解作用 | 首次展示了SKIK肽标签能够有效缓解WPPP引起的翻译停滞，并揭示了SKIK肽标签与翻译延伸因子P（EF-P）协同促进富含连续脯氨酸蛋白的翻译 | NA | 研究SKIK肽标签对终止肽翻译抑制效应的缓解作用及其机制 | 含有连续脯氨酸的终止肽（如SecM AP和WPPP） | NA | NA | 体外翻译反应 | NA | 蛋白质 | NA |
| 7 | 2024-12-21 |
Genetically Modifying the Protein Matrix of Macroscopic Living Materials to Control Their Structure and Rheological Properties
2024-Dec-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00336
PMID:39601053
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研究论文 | 研究通过改变弹性蛋白样多肽（ELP）长度来调控宏观活体材料的蛋白质基质结构和流变学特性 | 揭示了序列-结构-性质关系，并展示了通过微调基因序列显著改变流变学特性的新设计原则 | 尚未完全阐明序列、结构和流变学特性之间的复杂关系 | 探索如何通过改变弹性蛋白样多肽（ELP）长度来影响活体材料的微结构和粘弹性行为 | 宏观活体材料及其蛋白质基质中的弹性蛋白样多肽（ELP） | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 8 | 2024-12-21 |
Engineered Stop and Go T7 RNA Polymerases
2024-Dec-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00627
PMID:39610115
|
研究论文 | 本文展示了通过理性设计和定向进化改造的T7 RNA聚合酶，能够在吲哚的生理相关浓度下被激活 | 开发了一种新的化学诱导“停止和启动”平台，称为LARPs，可立即用于合成生物学应用 | NA | 模拟天然酶的特性，开发一种可控的RNA聚合酶用于合成生物学应用 | T7 RNA聚合酶及其在不同细菌中的应用 | 合成生物学 | NA | 理性设计 定向进化 | NA | NA | NA |
| 9 | 2024-12-21 |
Biosynthesis of Antimicrobial Ornithine-Containing Lacticin 481 Analogues by Use of a Combinatorial Biosynthetic Pathway in Escherichia coli
2024-Dec-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00650
PMID:39660664
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研究论文 | 本研究通过在Escherichia coli中利用组合生物合成途径，合成了含有鸟氨酸的乳酸素481类似物 | 本研究首次展示了SyncM酶能够通过识别设计的混合前导肽，催化生成含有鸟氨酸和（甲基）羊毛硫氨酸的活性乳酸素481类似物 | 本研究未详细探讨鸟氨酸在乳酸素481特定位点上的结合限制机制 | 研究旨在通过合成生物学途径，探索OspR和SyncM的底物偏好，并为未来的乳酸素生物工程提供指导 | 乳酸素481及其含有鸟氨酸的类似物的合成与抗菌活性 | NA | NA | 组合生物合成 | NA | NA | NA |
| 10 | 2024-12-21 |
De Novo Production of the Bioactive Phenylpropanoid Artepillin C Using Membrane-Bound Prenyltransferase in Komagataella phaffii
2024-Dec-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00472
PMID:39530514
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研究论文 | 本研究通过在Komagataella phaffii中使用膜结合的香豆酸特异性二戊烯转移酶AcPT1，实现了生物活性酚丙烷类化合物Artepillin C的从头合成 | 通过增强戊基二磷酸供应途径，显著提高了Artepillin C的产量，并实现了在批次培养条件下创纪录的合成量 | 研究中仍存在香豆酸供应的瓶颈，限制了Artepillin C的进一步产量提升 | 开发一种稳定的合成生物学方法，用于生产具有多种药理益处的Artepillin C | Komagataella phaffii细胞中的Artepillin C合成 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 11 | 2024-12-21 |
Accurate phenotype-to-genotype mapping of high-diversity yeast libraries by heat-shock-electroporation (HEEL)
2024-Dec-20, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.03197-24
PMID:39704499
|
研究论文 | 本文介绍了一种创新的酵母库转化方法HEEL，通过热休克和电穿孔结合的方式，提高了单转化酵母细胞的比例，从而实现了精确的表型到基因型的映射 | HEEL方法通过提高单转化酵母细胞的比例，解决了传统高多样性酵母库转化方法中多重转化的问题，实现了高质量的表型到基因型关联 | NA | 开发一种高效的酵母库转化方法，以提高表型到基因型测量的准确性，支持分子生物学和蛋白质工程领域的研究 | 酵母细胞的高多样性突变库 | 分子生物学 | NA | 热休克-电穿孔(HEEL) | NA | DNA | 每个反应超过10个酵母细胞 |
| 12 | 2024-12-21 |
Extracellular Peptide-Ligand Dimerization Actuator Receptor Design for Reversible and Spatially Dosed 3D Cell-Material Communication
2024-Dec-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00482
PMID:39705005
|
研究论文 | 本文报道了一种名为EPDA的合成受体平台，通过理性设计实现基于肽配体识别的可逆细胞反应 | 开发了一种新的计算算法PETEI用于构建候选单体，并设计了EPDA受体平台，能够实现可逆和空间剂量控制的3D细胞-材料通信 | 实验中仅测试了30个单体，可能未涵盖所有潜在的有效配体 | 旨在设计一种能够实现可逆和空间剂量控制的3D细胞-材料通信的合成受体 | 研究对象为基于肽配体识别的合成受体EPDA及其在细胞反应中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 超过2000个候选单体，最终测试了30个单体 |
| 13 | 2024-12-21 |
Strategies and tools to construct stable and efficient artificial coculture systems as biosynthetic platforms for biomass conversion
2024-Dec-19, Biotechnology for biofuels and bioproducts
IF:3.3Q3
DOI:10.1186/s13068-024-02594-2
PMID:39702246
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综述 | 本文综述了利用合成生物学工具构建稳定高效的人工共培养系统作为生物质转化生物合成平台的策略和方法 | 本文重点介绍了近期在生物质转化方面的进展，并提供了未来研究方向的见解 | 维持系统长期的最优种群比例和平衡合成代谢与分解代谢仍然存在挑战 | 探讨如何改进人工共培养系统的稳定性和生产力，以促进生物质转化 | 人工共培养系统及其在生物质转化中的应用 | 合成生物学 | NA | 合成生物学工具 | NA | NA | NA |
| 14 | 2024-12-21 |
Unlocking lignin valorization and harnessing lignin-based raw materials for bio-manufacturing
2024-Dec-18, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-024-2792-x
PMID:39704933
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综述 | 本文综述了利用生物酶和代谢工程技术进行木质素增值的最新策略，并探讨了通过数字系统和合成生物学解锁木质素基原材料商业潜力的创新方法 | 本文提出了利用生物酶和代谢工程技术进行木质素增值的新途径，并强调了人工智能驱动的技术在克服当前挑战和推动木质素增值广泛应用中的潜力 | 本文主要为综述性质，未提供具体的实验数据或模型验证 | 探讨木质素增值的最新技术和创新方法，以推动其在生物制造中的应用 | 木质素及其衍生物的增值和利用 | NA | NA | 代谢工程，合成生物学，人工智能 | NA | NA | NA |
| 15 | 2024-12-21 |
RH2Fusion: A universal tool for precise DNA fragment assembly
2024-Dec-14, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2024.138788
PMID:39675608
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研究论文 | 本文介绍了一种名为RH2Fusion的新系统，用于精确的DNA片段组装，支持用户定义的粘性末端，并能同时进行多位点的定点突变 | 首次报道了大肠杆菌外切酶IX（YgdG）具有特异性切割核糖核苷酸的活性，并通过融合RNase HII和YgdG生成了具有双重酶功能的新型构建体RNase RY和RNase YR | NA | 开发一种高效、通用的DNA片段组装工具，以推动合成生物学和遗传工程领域的研究 | DNA片段的精确组装和多位点定点突变 | 分子生物学 | NA | RNase HII和YgdG酶的融合技术 | NA | DNA序列 | NA |
| 16 | 2024-12-21 |
Development of a base editor for convenient and multiplex genome editing in cyanobacteria
2024-08-14, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06696-3
PMID:39143188
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研究论文 | 本文开发了一种高效的胞嘧啶碱基编辑系统，用于在蓝藻中进行快速、精确的C→T点突变和基因失活 | 开发了一种高效的胞嘧啶碱基编辑系统，能够实现快速、精确的C→T点突变和基因失活，并支持多重编辑 | NA | 开发高效的基因编辑工具，以促进蓝藻的遗传解剖和代谢工程研究 | 蓝藻中的基因编辑 | 合成生物学 | NA | 碱基编辑 | NA | 基因组 | 涉及Synechocystis和Anabaena两种蓝藻 |
| 17 | 2024-12-20 |
Engineering bacteria for cancer immunotherapy by inhibiting IDO activity and reprogramming CD8+ T cell response
2024-Dec-24, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2412070121
PMID:39693352
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研究论文 | 本文通过基因工程改造细菌，抑制IDO活性并重编程CD8+ T细胞反应，用于癌症免疫治疗 | 开发了一种高色氨酸表达的细菌菌株L-Trp CB，能够在系统给药后严格定植于肿瘤，通过产生丁酸抑制IDO活性，并释放大量色氨酸支持CD8+ T细胞的激活和能量代谢 | NA | 开发一种增强肿瘤免疫治疗的新策略 | IDO抑制剂在癌症治疗中的应用及CD8+ T细胞反应的重编程 | NA | NA | 基因工程 | NA | NA | 小鼠和兔子的多种肿瘤模型 |
| 18 | 2024-12-20 |
Modifications of Prenyl Side Chains in Natural Product Biosynthesis
2024-Dec-20, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202415279
PMID:39363683
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综述 | 本文综述了近年来对天然产物生物合成中异戊烯侧链修饰的酶学机制及其在天然产物多样性和复杂性中的作用 | 本文总结了几种新颖的生物合成机制，如环氧化、脱氢、甲基氧化为羧基、不寻常的C-C键断裂和氧化环化 | NA | 揭示异戊烯侧链修饰在天然产物生物合成中的化学和酶学机制，指导未来在发现、表征和应用这些修饰方面的努力 | 天然产物生物合成中的异戊烯侧链修饰 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 19 | 2024-12-20 |
Constructing High-Yielding Serratia marcescens for (-)-α-Bisabolol Production Based on the Exogenous Haloarchaeal MVA Pathway and Endogenous Molecular Chaperones
2024-Dec-19, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c10135
PMID:39699554
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研究论文 | 本研究通过合成生物学和代谢工程策略，构建了一种高产(-)-α-Bisabolol的Serratia marcescens菌株 | 引入了Haloarchaea类型的甲羟戊酸(MVA)途径和(-)-α-Bisabolol生物合成途径，并成功构建了能够生产(-)-α-Bisabolol的菌株，同时通过敲除基因减少了副产物法尼醇(FOH)的生成，最终在5 L生物反应器中实现了30.2 g/L的(-)-α-Bisabolol产量，创下了最高纪录 | NA | 提高(-)-α-Bisabolol的微生物生产效率 | (-)-α-Bisabolol的生物合成 | 代谢工程 | NA | 合成生物学、代谢工程 | NA | NA | NA |
| 20 | 2024-12-20 |
Engineered Bacteria Manipulate Cysteine Metabolism to Boost Ferroptosis-Based Pancreatic Ductal Adenocarcinoma Therapy
2024-Dec-18, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202412982
PMID:39696900
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研究论文 | 本文研究了通过工程化细菌调控半胱氨酸代谢以增强胰腺导管腺癌的铁死亡疗法 | 本文利用合成生物学开发了一种工程化细菌，能够直接消耗半胱氨酸以阻断其代谢，从而触发胰腺导管腺癌细胞的铁死亡 | NA | 研究如何通过调控半胱氨酸代谢来增强胰腺导管腺癌的铁死亡疗法 | 胰腺导管腺癌细胞的半胱氨酸代谢 | NA | 胰腺癌 | 合成生物学 | NA | NA | NA |