合成生物学相关文章
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当前共找到 4268 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-01-22 |
A growth-coupled progesterone-responsive biosensor for high-throughput microfluidic screening in Saccharomyces cerevisiae
2026-Jun, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.12.004
PMID:41551738
|
研究论文 | 本研究开发了一种在酿酒酵母中基于生长耦合的孕酮响应生物传感器，结合微流控高通量筛选平台，用于筛选能高效转化孕烯诺龙为孕酮的酵母菌株 | 开发了首个将孕酮形成与细胞生长和荧光直接耦合的生物传感器，并整合了羟丙基-β-环糊精系统以提高细胞内类固醇的可利用性，同时利用IPTG诱导型lac操纵子和3-氨基三唑精确调控筛选严格性 | 研究主要针对孕烯诺龙到孕酮的转化，尚未验证其对其他类固醇前体或更复杂生物合成途径的普适性 | 解决类固醇前体水溶性差导致的微生物生物转化效率低和高通量菌株筛选困难的问题，以促进菌株改良和工业应用 | 酿酒酵母菌株及其对孕烯诺龙到孕酮的生物转化能力 | 合成生物学 | NA | 大气室温等离子体诱变、微流控液滴封装、荧光检测 | NA | 荧光信号、生长曲线、产物浓度数据 | 通过ARTP诱变和筛选获得5个酵母变异株 | CRISPR-Cas9, iGEM | 酿酒酵母 | 生长耦合型生物传感器，包含孕酮响应元件、荧光报告基因和与细胞生长关联的筛选标记 | 工业生物技术, 医药 |
| 2 | 2026-01-22 |
Engineering a broad-spectrum glucose oxidase via substrate channel and linker design for enhanced lignocellulose bioconversion
2026-Jun, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.11.016
PMID:41551740
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研究论文 | 本研究通过合成生物学和蛋白质工程策略，设计了一种广谱葡萄糖氧化酶，用于增强木质纤维素生物转化 | 通过底物通道和连接子设计，工程化广谱葡萄糖氧化酶，显著扩展了酶的底物谱，并增强了与纤维素酶的协同作用 | NA | 工程化广谱葡萄糖氧化酶以提升复杂生物转化过程（如农业废弃物增值）中的应用潜力 | 来自 sp. 的葡萄糖氧化酶（AreGOD） | 合成生物学 | NA | 定点诱变、连接子工程 | NA | NA | NA | 合成生物学、蛋白质工程 | NA | NA | 农业、环境、工业生物技术 |
| 3 | 2026-01-22 |
Development of a suite of activatable plant synthetic promoter systems using a bacterial LysR-type transcriptional regulator FdeR
2026-Jun, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.12.005
PMID:41551741
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研究论文 | 本文开发了一套基于细菌LysR型转录调节因子FdeR的可激活植物合成启动子系统，旨在丰富植物合成生物学工具包 | 利用细菌LysR型转录因子FdeR开发了52个合成启动子系统，这些系统在配体非依赖性方式下被激活，表达活性范围广泛，并建立了模块化工作流程加速合成转录平台开发 | NA | 开发正交且可调的遗传部件以同时表达多个基因，推动植物合成生物学发展 | 植物合成启动子系统，基于细菌LysR型转录调节因子FdeR | 合成生物学 | NA | MoClo-based plug-and-play组装系统，酵母预筛选平台 | NA | NA | NA | MoClo | 植物，酵母 | 合成启动子系统，包括52个由FdeR衍生合成激活剂调控的启动子 | 农业 |
| 4 | 2026-01-22 |
Regulating protein glycosylation modification enhances the synthesis of taxadiene in Saccharomyces cerevisiae
2026-Jun, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.12.012
PMID:41551745
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研究论文 | 本研究通过调控酿酒酵母中的蛋白质糖基化修饰，显著提高了紫杉二烯的合成产量 | 首次发现敲除内源蛋白质糖基化基因（特别是糖基转移酶基因）可显著提升异源蛋白表达效率，并将该策略应用于紫杉二烯合成途径的优化 | 研究主要集中于酿酒酵母体系，未在其他真核系统中验证普适性；发酵条件优化可能受限于特定实验设备 | 提高紫杉醇关键前体紫杉二烯在微生物细胞工厂中的合成效率 | 酿酒酵母工程菌株及其紫杉二烯合成途径 | 合成生物学 | 癌症（通过紫杉醇前体合成间接关联） | 基因敲除、多拷贝整合、分批补料发酵 | NA | 代谢产物产量数据、基因表达数据 | 系列工程菌株（具体数量未明确说明） | CRISPR-Cas9（基于合成生物学方法推断） | 酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae） | 紫杉二烯合成代谢途径（包含紫杉二烯合酶、香叶基香叶基二磷酸合成模块） | 医药（紫杉醇前体生产） |
| 5 | 2026-01-22 |
Metabolic reprogramming of abscisic acid-producing strain Botrytis cinerea TB-31 toward terpenoid biosynthesis using a CRISPR/Cas9 ribonucleoprotein system
2026-Jun, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.12.002
PMID:41551747
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研究论文 | 本研究在丝状真菌TB-31中建立了基于CRISPR/Cas9的基因编辑系统，并利用该系统对菌株进行代谢重编程，以促进萜类化合物的生物合成 | 首次在ABA生产菌株TB-31中建立了高效的CRISPR/Cas9基因编辑系统，实现了单基因/多基因敲除、大片段删除和异源蛋白表达，并通过完全敲除ABA生物合成基因簇成功将代谢流重定向至萜类前体合成 | 研究主要针对特定工业菌株TB-31，其策略在其他丝状真菌中的普适性尚未验证 | 开发丝状真菌的合成生物学工具，并将其改造为萜类化合物生产底盘菌株 | ABA生产菌株Botrytis cinerea TB-31 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9基因编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | Botrytis cinerea TB-31 | 通过敲除ABA生物合成基因簇实现代谢通路重编程，将代谢流转向萜类前体合成 | 工业生物技术 |
| 6 | 2026-01-22 |
Bacterial synthesis of personalized biomimetic biological cornea
2026-May, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2025.12.047
PMID:41551761
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研究论文 | 本研究利用细菌合成生物学技术，结合曲率定制模型和醛基修饰系统，开发了一种具有纳米纤维网络结构、曲率和形态可定制的个性化仿生生物角膜（DBC@L-Cel） | 首次将细菌合成生物学与曲率定制模型、醛基修饰系统相结合，制备出光学和机械性能与天然角膜匹配、且具有抗瘢痕和促进修复功能的个性化仿生角膜 | 研究目前仅在大规模兔角膜缺损模型中进行验证，尚未进入人体临床试验 | 开发一种可用于角膜盲个性化移植治疗的仿生生物角膜 | 个性化仿生生物角膜（DBC@L-Cel） | 合成生物学 | 角膜盲 | 细菌合成生物学、醛基修饰系统 | NA | NA | 大规模兔角膜缺损模型 | 细菌合成生物学 | 细菌 | 醛基修饰系统 | 医学 |
| 7 | 2026-01-22 |
From aroma to off-flavor: Metabolomics unveils the metabolic double-sided nature of traditional Chinese fermented foods
2026-Feb-15, Food chemistry
IF:8.5Q1
DOI:10.1016/j.foodchem.2025.147635
PMID:41447972
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综述 | 本文系统综述了代谢组学在揭示中国传统发酵食品风味形成机制中的应用，并提出了精准调控风味的系统性策略 | 首次系统性地将代谢组学应用于六大类中国传统发酵食品的风味研究，并提出整合多组学、先进工程、智能监控和合成生物学的数据驱动智能生产策略 | 综述性文章，未进行原始实验研究；异味的感知具有主观性，受消费者背景和文化差异影响 | 阐明中国传统发酵食品风味（香气与异味）形成的代谢机制，并提出精准调控策略 | 中国传统发酵食品，包括谷物、豆类、乳制品、蔬菜、肉类和茶叶六大类 | NA | NA | 代谢组学，多组学分析 | NA | 代谢组学数据 | NA | 合成生物学 | NA | NA | 食品，工业生物技术 |
| 8 | 2026-01-22 |
High-throughput mechanical characterization of giant unilamellar vesicles by real-time deformability cytometry
2026-Jan-21, Soft matter
IF:2.9Q2
DOI:10.1039/d5sm01140j
PMID:41416886
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研究论文 | 本研究将实时变形流式细胞术应用于巨单层囊泡的高通量力学表征，并开发了基于模拟的模型和拟合策略来提取囊泡的面积膨胀模量 | 首次将实时变形流式细胞术应用于巨单层囊泡的力学表征，开发了两种互补的拟合策略和一种组合拟合方法，实现了无接触、高通量的囊泡群体力学分析 | NA | 开发一种高通量、无接触的方法来表征巨单层囊泡的力学性质 | 巨单层囊泡 | 软物质研究 | NA | 实时变形流式细胞术、相场模拟 | 基于模拟的力学模型 | 变形数据、模拟数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、软物质研究 |
| 9 | 2026-01-22 |
Glassy Dynamics as a Predictive Framework for Lipid Exchange Across Membranes
2026-Jan-21, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202512844
PMID:41562888
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研究论文 | 本文提出了一种受玻璃态动力学启发的热力学-动力学框架，用于定量预测跨膜脂质交换的活化能和转移时间尺度 | 利用脂质囊泡的热膨胀系数这一单一实验可测参数，应用集体小位移模型实现了无调节参数的预测，并将脂质交换过程与无定形材料中的协同分子事件联系起来 | NA | 建立跨膜脂质交换的定量预测框架 | 脂质囊泡和跨膜脂质交换过程 | 软物质物理 | NA | 无标记石英晶体微天平实验 | 集体小位移模型 | 实验数据 | 多种脂质系统 | NA | NA | NA | 药物递送、生物仿生材料设计、纳米生物技术 |
| 10 | 2026-01-22 |
KSHV and cancer: understanding the oncogenic machinery for next-generation diagnostic tools and therapies
2026-Jan-21, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-025-04706-4
PMID:41563473
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综述 | 本文综述了卡波西肉瘤相关疱疹病毒（KSHV）的致癌机制，并探讨了下一代诊断工具和疗法的前景 | 整合了新兴诊断生物标志物（如病毒microRNAs）与下一代治疗策略（包括基因编辑和合成生物学方法），强调精准医学在改善疾病检测和治疗特异性方面的机遇 | 当前KS诊断仍主要依赖组织病理学和LANA免疫染色，这些方法存在重要局限性，尤其在早期或不典型病变以及区分潜伏与裂解感染方面 | 理解KSHV驱动的致癌机制，并为未来诊断和治疗创新提供关键方向 | 卡波西肉瘤相关疱疹病毒（KSHV）及其相关的癌症，如卡波西肉瘤（KS）、原发性渗出性淋巴瘤（PEL）和多中心性Castleman病（MCD） | NA | 卡波西肉瘤、淋巴增生性疾病 | 组织病理学、LANA染色、先进成像、分子生物标志物检测、CRISPR-Cas9、治疗性适配体 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 人类细胞 | NA | 医学 |
| 11 | 2026-01-22 |
From edits to insights: precision microbial engineering for systems biology
2026-Jan-19, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2025.102705
PMID:41558158
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综述 | 本文综述了精准微生物工程在系统生物学中的应用，重点探讨了从基因编辑到系统洞察的技术进展 | 强调了精准扰动策略（如序列变异分析）在揭示基因水平扰动无法触及的生物学原理方面的创新，包括蛋白质序列-功能图谱和途径变异影响 | NA | 通过精准工程方法提升对生物功能的理解，并加速生物技术和合成生物学的进展 | 微生物系统，包括其基因组和细胞机制 | 系统生物学 | NA | 基因敲除文库、CRISPRi/a文库、精准扰动策略 | NA | 基因组序列数据、变异数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 微生物（如细菌、酵母） | NA | 生物技术、合成生物学 |
| 12 | 2026-01-22 |
InSillyClo, a User-Friendly Web Application to Assist Large-Scale Golden Gate Cloning and MoClo Workflows
2026-Jan-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00553
PMID:41404662
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研究论文 | 本文介绍了InSillyClo，一个开源网络应用程序，用于辅助大规模Golden Gate克隆和MoClo工作流程 | InSillyClo是首个专门处理大规模克隆工作流程中耗时且易错任务的软件工具，提供用户友好的界面和自动化数据生成 | NA | 开发一个工具来简化和自动化大规模克隆工作流程中的计算任务 | Golden Gate克隆和MoClo工作流程 | 合成生物学 | NA | Golden Gate克隆，Modular Cloning (MoClo) | NA | NA | NA | Golden Gate Assembly, MoClo | NA | 支持用户定义的遗传设计和工作流程生成 | 工业生物技术 |
| 13 | 2026-01-22 |
Force Transmission by Minimal Focal Adhesion Complexes Induces Synthetic Cell Deformation
2026-Jan-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00645
PMID:41407554
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研究论文 | 本研究通过重构最小黏着斑样复合物于巨型单层囊泡中，揭示了仅由特定蛋白质-膜相互作用即可实现肌动蛋白募集、力传递及结构稳定性，为探究机械传感和工程化力响应仿生系统提供了可控合成生物学平台 | 首次在合成系统中重构了包含kindlin-2、talin-1等核心蛋白的最小黏着斑复合物，并展示了其能独立介导肌动蛋白网络形成、力传递及囊泡变形，无需完整细胞环境 | 研究基于简化合成系统，可能未完全模拟天然细胞中黏着斑的复杂调控机制和动态相互作用 | 探究黏着斑复合物进行力传递和机械传感的最小物理要求 | 由kindlin-2、talin-1、FAK、paxillin、zyxin和VASP等蛋白质与含PIP和整合素β1尾的膜组成的合成黏着斑样复合物 | 合成生物学 | NA | 蛋白质重构与膜锚定技术 | NA | 实验观察数据 | NA | NA | 巨型单层囊泡（GUVs） | 黏着斑样复合物作为力传感与传递模块，结合肌动蛋白网络和非肌肉肌球蛋白IIa形成收缩系统 | 医学、工业生物技术 |
| 14 | 2026-01-22 |
Recoded Bacteriophage Genome for Bio-Orthogonal-Enabled Concentration and Detection of E. coli in Drinking Water
2026-Jan-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00665
PMID:41436063
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研究论文 | 本研究利用高复杂度Golden Gate组装技术重新编码噬菌体基因组，开发了一种基于噬菌体的生物传感器，用于饮用水样品中大肠杆菌的浓缩和检测 | 通过噬菌体基因组重编码实现非经典氨基酸掺入衣壳，结合生物正交环加成反应与磁性纳米颗粒，实现噬菌体磁化，从而高效捕获和浓缩宿主细菌 | 研究主要针对大肠杆菌作为指示生物，可能未广泛验证其他病原体或复杂环境样本中的应用 | 开发一种快速、低成本的方法，用于检测饮用水中的粪便污染指示生物，以应对公共卫生挑战 | 大肠杆菌作为饮用水中的粪便污染指示生物 | 合成生物学 | NA | 高复杂度Golden Gate组装技术 | NA | NA | 饮用水样品中浓度低于10 CFU每100 mL的大肠杆菌 | Golden Gate Assembly | 大肠杆菌 | 噬菌体基因组重编码以掺入炔基修饰的非经典氨基酸，结合生物正交反应构建磁性噬菌体生物传感器 | 环境监测, 公共卫生 |
| 15 | 2026-01-22 |
Artificial Multidomain Ribosomally Synthesized and Post-translationally Modified Peptide Enzymes for Farnesylated Peptide Library Generation
2026-Jan-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00613
PMID:41451912
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研究论文 | 本文设计了一种利用人工多结构域核糖体合成与翻译后修饰肽酶来生成法尼基化肽库的合成生物学方法 | 开发了一种简单而稳健的方法，通过将多个生物合成基因融合在可溶性表达载体中，实现大环肽的生成并选择性在酪氨酸侧链上添加C、C或C类异戊二烯基团 | NA | 创建具有药物特性（如N-C大环化和异戊二烯化）的大型肽基化学库 | 蓝藻素生物合成途径中的酶与肽库 | 合成生物学 | NA | 核糖体合成与翻译后修饰肽（RiPP）途径、异戊二烯化 | NA | NA | 估计最大规模为260万种肽衍生物的库 | 基因融合、合成生物学途径设计 | 活体生物（未具体说明） | 多酶融合表达系统，用于大环肽生成和选择性异戊二烯化 | 药物发现、工业生物技术 |
| 16 | 2026-01-22 |
Microbial and molecular approaches for PFAS transformation in soils: prospects and limitations
2026-Jan-16, RSC advances
IF:3.9Q2
DOI:10.1039/d5ra07508d
PMID:41561006
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综述 | 本文综述了土壤中全氟和多氟烷基物质（PFAS）转化的微生物和分子方法，评估了其前景与局限性 | 系统评估了微生物介导的PFAS转化、多组学研究提出的潜在酶，以及分子工程与合成生物学的前景与限制，并指出目前尚无实验验证的酶能高效催化全氟C-F键断裂 | 微生物策略目前处于早期发展阶段，存在环境因素影响、动力学缓慢、机制不明确等限制，且报道的生物转化主要涉及前体化合物而非终端PFAS | 评估微生物和分子方法在PFAS转化领域的应用潜力与限制 | 全氟和多氟烷基物质（PFAS） | NA | NA | 多组学（multi-omics）、计算建模（computational modelling）、分子工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 环境 |
| 17 | 2026-01-22 |
Classification, catalytic mechanisms, and functional characterization of non-heme diiron oxygenases: A review
2026-Jan-14, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.150277
PMID:41544786
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综述 | 本文综述了非血红素双铁加氧酶（NDOs）的分类、催化机制和功能表征，并探讨了其在合成生物学和可持续生物制造中的应用前景 | 整合了结构生物学、光谱学、计算建模和动力学分析的最新进展，系统分析了NDOs多样化的金属配位环境和催化循环机制 | NA | 为非血红素双铁加氧酶（NDOs）的机制研究和蛋白质工程提供严谨的概念框架 | 非血红素双铁加氧酶（NDOs）家族 | NA | NA | 结构生物学、光谱学、计算建模、动力学分析 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、可持续生物制造 |
| 18 | 2026-01-22 |
YhfH functions as a tri-function RNA in Bacillus thuringiensis BMB171
2026-Jan-14, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1528
PMID:41562254
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研究论文 | 本研究揭示了枯草芽孢杆菌BMB171菌株中YhfH RNA作为三重功能RNA（sRNA、反义RNA和mRNA）调控基因表达的作用机制 | 首次发现单个RNA分子（YhfH）同时具备小RNA调控、反义RNA调控和信使RNA编码肽段的三重功能，并阐明其通过编码肽段实现自我转录抑制的新机制 | 研究局限于枯草芽孢杆菌BMB171菌株，尚未在其他细菌中验证YhfH的多重功能是否保守 | 探究细菌中调控RNA的多功能特性及其在基因表达调控中的作用机制 | 枯草芽孢杆菌BMB171菌株中的YhfH RNA及其编码肽段YhfH-P | 合成生物学 | NA | 分子生物学技术、基因表达调控分析 | NA | 基因表达数据、调控网络数据 | 枯草芽孢杆菌BMB171单一菌株研究 | NA | 枯草芽孢杆菌 | 三重功能RNA调控系统（包含自我抑制回路、嘧啶合成操纵子调控、支链氨基酸合成操纵子调控） | 合成生物学 |
| 19 | 2026-01-22 |
Synthetic Biology Strategies for Activating Cryptic BGCs in Streptomyces: Engineering Native and Synthetic Promoters for Antibiotic Discovery
2026-Jan-13, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.5c08473
PMID:41552574
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综述 | 本文综述了在链霉菌中利用天然和合成启动子工程激活隐性生物合成基因簇以发现新型抗生素的策略 | 系统整合了CRISPR激活系统和机器学习引导的启动子设计等前沿技术，用于激活隐性基因簇 | NA | 为天然产物发现提供启动子工具的系统级理解和转化应用指南 | 链霉菌中的隐性生物合成基因簇 | 合成生物学 | NA | 启动子工程、CRISPR激活系统、机器学习引导设计 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 链霉菌 | 启动子重构（组成型和诱导型）用于激活隐性生物合成基因簇 | 医药 |
| 20 | 2026-01-22 |
CRISPR/Cas9-Mediated Metabolic Engineering of Endophytic Pseudomonas loganensis sp. nov. for the Production of Nutritionally Valuable Carotenoids
2026-Jan-13, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.5c05877
PMID:41552580
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研究论文 | 本研究利用CRISPR/Cas9技术对内生细菌Pseudomonas loganensis sp. nov.进行代谢工程改造，以生产具有营养价值的类胡萝卜素 | 首次将内生细菌作为微生物底盘用于类胡萝卜素生产，并利用CRISPR-Cas9技术敲除关键基因构建了能生产多种类胡萝卜素的工程菌株 | 未提及大规模发酵的可行性及生产成本评估 | 开发可持续且环境友好的类胡萝卜素生物生产方法 | 内生细菌Pseudomonas loganensis sp. nov. | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9基因编辑、HPLC分析、响应面方法学 | NA | 实验数据 | NA | CRISPR-Cas9 | Pseudomonas loganensis sp. nov. | 代谢途径工程（敲除类胡萝卜素合成关键基因，引入过表达质粒） | 食品、饲料、制药、化妆品 |