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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-03-28 |
Remote Sensing of Endogenous Pigmentation by Inducible Synthetic Circuits in Grasses
2026-Apr, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70480
PMID:41351300
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研究论文 | 本研究成功在C4单子叶植物模型狗尾草中构建了配体诱导型合成回路,以激活内源性花青素通路,并利用高光谱成像技术实现非破坏性远程检测 | 首次在单子叶植物中成功适配配体诱导型传感器来操纵内源性色素通路,并开发了结合高光谱成像与判别性目标表征方法的近远程检测系统 | 研究主要基于模式植物狗尾草,尚未在主要粮食作物中进行验证;配体吸收的物理屏障问题仅部分通过筛选高效诱导剂解决 | 开发适用于单子叶植物的可诱导合成生物学系统,实现植物对环境污染或有害化学物质的传感报告功能 | 狗尾草(Setaria viridis)的原生质体和整株植物 | 合成生物学 | NA | 遗传回路设计、配体诱导表达系统、高光谱成像、判别性目标表征方法 | NA | 高光谱图像、植物表型数据 | 未明确说明具体样本数量,但涉及原生质体和整株植物实验 | 配体诱导型传感器、合成遗传回路 | 狗尾草(Setaria viridis) | 配体诱导型传感器回路,可激活内源性花青素生物合成通路 | 农业,环境 |
| 2 | 2026-03-28 |
Machine learning-directed massively parallel programmable nucleic acid amplification
2026-Mar-27, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aec9175
PMID:41880514
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研究论文 | 本文提出了一种基于热力学的可编程核酸扩增方法,通过机器学习优化,实现了对扩增效率的连续精确调控,并在DNA数据存储和临床诊断中展示了应用潜力 | 通过引物标签补偿策略将序列特异性与杂交能量调控解耦,实现了高分辨率(33% vs 81%)的可编程扩增;利用机器学习模型将预测精度从R²=0.62提升至0.86 | 未明确说明方法在单细胞测序和空间转录组学中的具体验证结果,临床验证样本规模未详细说明 | 开发可动态调控扩增效率的技术,用于分子诊断和DNA数据存储 | 核酸扩增过程、DNA数据存储系统、宫颈癌RNA变异 | 机器学习 | 宫颈癌 | 可编程核酸扩增技术、机器学习建模 | 机器学习模型(未指定具体类型) | 实验数据(2483个数据点)、RNA序列数据 | 2483个实验数据点,临床验证中涉及宫颈癌RNA样本(具体数量未说明) | NA | NA | NA | 医学诊断、数据存储 |
| 3 | 2026-03-28 |
Valorization of ligustrum species: biosynthesis, metabolic engineering, and pharmacology of bioactive compounds
2026-Mar-27, Bioresources and bioprocessing
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s40643-026-01042-3
PMID:41888324
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综述 | 本文综述了女贞属植物的生物活性化合物、药理特性、组学分析和生物合成研究进展,并提出了整合多组学、合成生物学及绿色制造以实现其全植物价值化和种质资源保护的综合策略 | 提出整合多组学、合成生物学和绿色制造工艺的综合方法论,以推动女贞属植物的全植物价值化和种质资源保护策略 | NA | 建立女贞属植物作为药用资源的全面开发和可持续利用的理论框架与技术范式 | 女贞属植物及其生物活性化合物(如三萜类、苯乙醇苷类、黄酮类等) | 合成生物学 | NA | 多组学分析、代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药, 农业, 环境 |
| 4 | 2026-03-28 |
Advances in Biomolecular Condensates: From Disease Therapy to Synthetic Biology
2026-Mar-27, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202500931
PMID:41889100
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综述 | 本文综述了生物分子凝聚体的最新突破、技术挑战和未来方向,重点关注其在疾病治疗和合成生物学中的应用 | 将生物分子凝聚体作为创新靶点,用于新药研发、疾病治疗、生物反应器构建和智能生物材料开发,为不可成药靶点提供新的干预策略 | NA | 探讨生物分子凝聚体在生物医学和工程生物学中的应用潜力 | 生物分子凝聚体(BMCs),包括蛋白质和核酸等生物分子 | 合成生物学 | NA | 液体-液相分离(LLPS) | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 5 | 2026-03-28 |
Vibrio natriegens, a Promising Chassis from Strain Property to Protein Expression: A Review
2026-Mar-26, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00761
PMID:41886740
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综述 | 本文系统介绍了Vibrio natriegens作为蛋白质表达底盘生物的基本生物学特性、工程化改造进展及其在蛋白质表达中的应用 | 重点关注了Vibrio natriegens在蛋白质表达领域的最新研究与应用成果,这是以往综述中较少涉及的内容 | NA | 为研究人员提供使用Vibrio natriegens进行蛋白质表达的全面概述,并推动合成生物学领域的更广泛研究 | Vibrio natriegens菌株及其作为蛋白质表达底盘的应用 | 合成生物学 | NA | 分子生物学工具、基因组注释、代谢途径分析 | NA | NA | NA | NA | Vibrio natriegens | NA | 工业生物技术 |
| 6 | 2026-03-28 |
Biosilicification across Biological Hierarchies
2026-Mar-26, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.5c22206
PMID:41888096
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综述 | 本文综述了生物硅化作用在分子、细胞和组织层面的最新进展,探讨了其在增强生物材料性能、保护生命系统及整合合成与生物物质方面的策略、挑战与机遇 | 挑战了硅在生物学中惰性的传统观点,并利用合成生物学、诱变和材料科学的进展,在进化时间尺度之外实现硅化作用的快速、可编程调控 | NA | 探索生物硅化作用作为增强生物材料性能、保护生命系统及整合合成与生物物质的平台 | 海洋生物(特别是硅藻)的硅化机制,以及哺乳动物骨骼和结缔组织中的硅作用 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、诱变、材料科学 | NA | NA | NA | NA | 硅藻、哺乳动物 | 硅酸受控摄取、转运和聚合的途径 | 材料、工业生物技术 |
| 7 | 2026-03-28 |
Bioconversion of carotenoids into high-value crocins using a marine sponge carotenoid cleavage dioxygenase
2026-Mar-26, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.71118
PMID:41889127
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研究论文 | 本研究评估了一种来自海洋海绵的类胡萝卜素裂解双加氧酶(SdCDO)的功能,发现其可将类胡萝卜素转化为高价值的藏花素前体,并在番茄果实中成功实现了藏花素的生物合成 | 首次发现海绵来源的CCD酶具有将类胡萝卜素转化为藏花素前体的意外功能,揭示了CCD酶在跨界的酶学可塑性,并成功在植物中重编程类胡萝卜素代谢途径 | 研究主要基于异源表达系统(大肠杆菌和番茄),在天然海绵宿主中的生理功能仍需进一步验证 | 探究海洋动物中类胡萝卜素裂解双加氧酶的功能,并开发其在合成生物学和作物生物强化中的应用潜力 | 海洋海绵Suberites domuncula的类胡萝卜素裂解双加氧酶(SdCDO) | 合成生物学 | NA | 异源表达、代谢分析、超微结构分析、转录组学分析 | NA | 代谢组数据、转录组数据、显微图像 | 使用大肠杆菌和番茄(Solanum lycopersicum)作为异源表达系统 | 异源表达 | 大肠杆菌, 番茄 | 将海绵CCD酶引入植物类胡萝卜素代谢途径,重编程为藏花素生物合成途径 | 农业, 工业生物技术 |
| 8 | 2026-03-28 |
Advancing Africa's bioeconomy and biosolutions through microbial natural product discovery: unlocking indigenous microbe potential for sustainability
2026-Mar-25, Microbiology and molecular biology reviews : MMBR
IF:8.0Q1
DOI:10.1128/mmbr.00174-25
PMID:41384918
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综述 | 本文综述了如何通过挖掘非洲本土微生物资源来发展生物经济,并提出了利用微生物生物技术推动可持续生物解决方案的路线图 | 整合了BV-BRC数据库分析与文献证据,首次系统梳理了非洲本土传统模型及新兴非模型细菌底盘菌的基因组分布,为基于组学的生物解决方案开发提供了资源快照 | 调查仅基于BV-BRC数据库数据,可能未能涵盖非洲全部微生物资源 | 推动非洲生物经济发展,通过微生物天然产物发现促进医疗、农业和工业生物技术创新 | 非洲本土微生物资源,特别是细菌和病毒 | NA | NA | 基因组测序、功能组学、合成生物学 | NA | 基因组数据、文献数据 | NA | NA | 细菌(传统模型及新兴非模型底盘菌) | NA | 医疗, 农业, 工业生物技术 |
| 9 | 2026-03-28 |
Metabolic engineering of microbial pathways for 5-aminolevulinic acid biosynthesis: Recent advances and biotechnological applications
2026-Mar-23, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2026.03.012
PMID:41881187
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综述 | 本文综述了5-氨基乙酰丙酸(5-ALA)微生物生物合成途径的代谢工程最新进展及其生物技术应用 | 整合了代谢工程与合成生物学策略,如优化前体供应、改造C4和C5途径、设计生物传感器动态调控,以提升5-ALA生产的效率和可持续性 | NA | 探讨微生物生产5-ALA的代谢工程策略,以替代传统化学方法,实现高效、可持续的生物合成 | 5-氨基乙酰丙酸(5-ALA)及其在农业、医药、化妆品和饲料等领域的应用 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学、生物传感器 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 大肠杆菌(E. coli)、酿酒酵母(S. cerevisiae)、枯草芽孢杆菌(B. subtilis) | C4和C5生物合成途径、生物传感器动态调控系统、代谢通路优化 | 农业、医药、化妆品、动物饲料、工业生物技术 |
| 10 | 2026-03-28 |
Vacuum and Sonication Treatment Enable Efficient Transient Gene Expression in Various Monocot and Eudicot Plant Seedlings
2026-Mar-22, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00855
PMID:41865287
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研究论文 | 介绍了一种名为VAST的真空与超声辅助瞬时转化方法,显著提高了多种单子叶和双子叶植物幼苗的基因表达效率和适用性 | 开发了一种结合真空渗透和超声预处理的瞬时转化方法,在提高基因表达效率的同时减少组织损伤,并成功应用于多种重要作物 | NA | 开发一种高效、通用的植物瞬时基因表达方法 | 多种单子叶和双子叶植物幼苗,包括番茄、谷子、柳枝稷、玉米和小麦等作物 | 合成生物学 | NA | 瞬时基因表达、真空渗透、超声处理 | NA | NA | NA | NA | 番茄、谷子、柳枝稷、玉米、小麦等植物幼苗 | NA | 农业、生物技术 |
| 11 | 2026-03-28 |
Membrane-Based Assembly and Interactions in Immune Receptors
2026-Mar-22, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.5c00993
PMID:41865294
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综述 | 本文综述了免疫受体在脂质双层中的组装和分子相互作用原理,重点关注其模块化结构和跨膜域的作用 | 系统总结了免疫受体跨膜域特异性相互作用的结构基序,并探讨其在合成生物学中的应用潜力 | NA | 理解免疫受体的组装机制及其跨膜相互作用在结构和功能中的作用 | 免疫受体及其跨膜蛋白模块 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 12 | 2026-03-28 |
Plant non-canonical peptides: From identification to mechanisms
2026-Mar-09, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2026.101739
PMID:41580897
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综述 | 本文全面概述了植物肽的分类、生物合成及其在调控多种生物过程中的功能机制,并系统总结了植物肽鉴定的历史发展和最新进展 | 整合高通量技术、功能基因组学和合成生物学,以挖掘植物肽在作物改良和跨学科创新中的潜力 | 肽的发现和功能注释仍然具有挑战性 | 探索植物肽在植物生长、发育、免疫和环境适应中的调控作用及其应用潜力 | 植物肽,包括典型肽、非典型肽和非核糖体肽 | NA | NA | 肽组基因组学和质谱分析 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业 |
| 13 | 2026-03-28 |
In vivo self-assembled SOD1-siRNAs mitigate muscle atrophy and denervation in amyotrophic lateral sclerosis
2026-Mar-05, Brain : a journal of neurology
IF:10.6Q1
DOI:10.1093/brain/awaf291
PMID:40795306
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研究论文 | 本研究开发了一种合成生物学策略,通过肝脏在体内自组装封装SOD1-siRNA的小细胞外囊泡,以靶向脊髓神经元并沉默突变SOD1基因,从而缓解肌萎缩侧索硬化症小鼠模型的肌肉萎缩和去神经支配症状 | 利用合成生物学方法将肝脏重编程为组织底盘,实现体内自组装靶向神经元的siRNA递送系统,并设计了基于AAV的长期表达策略 | 研究仅在Tg(SOD1G93A)转基因小鼠模型中进行,尚未在人类患者中验证 | 开发针对家族性ALS中突变SOD1基因的特异性基因沉默治疗策略 | Tg(SOD1G93A)转基因小鼠(ALS动物模型) | 合成生物学 | 肌萎缩侧索硬化症 | siRNA基因沉默、小细胞外囊泡递送、AAV载体技术 | NA | 动物实验数据、蛋白质水平检测、行为学评估 | Tg(SOD1G93A)转基因小鼠(具体数量未在摘要中说明) | AAV载体 | 小鼠(肝脏细胞) | CMV启动子驱动的合成构建体,编码SOD1-siRNA及sEV表面展示的RVG靶向肽 | 医学 |
| 14 | 2026-03-28 |
Solvent-Mediated Dewetting Principles for Cell-Sized Liposome Formation
2026-Mar, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202512610
PMID:41622818
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研究论文 | 本文研究了溶剂介导的去润湿原理,用于细胞尺寸脂质体的形成 | 揭示了溶剂介导的去润湿过程中溶剂去除和机械刺激的双重作用机制,并建立了预测性高通量方法 | 未明确提及 | 阐明溶剂介导的去润湿原理,以促进合成细胞重建 | 细胞尺寸脂质体 | 合成生物学 | NA | 微流控双乳液模板法、光镊技术 | NA | 实验数据 | 未明确提及 | NA | NA | NA | 生物制造、治疗学 |
| 15 | 2026-03-28 |
Liposome array on a power-free microfluidic device for analysis of nanopore formation
2026-Jan-19, The Analyst
DOI:10.1039/d5an01113b
PMID:41358853
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研究论文 | 本文提出了一种基于脂质体阵列的无动力微流控设备,用于分析纳米孔形成特性,并评估了增强剂shodoamide C对两性霉素B活性的影响 | 首次开发了一种分析系统,通过浓度依赖的释放曲线测量两性霉素B及其增强剂或抑制剂的活性,为膜活性治疗剂的开发提供了新工具 | NA | 研究纳米孔在脂质体膜上的形成特性,并开发一种用于分析膜活性化合物(如两性霉素B及其增强剂)的新系统 | 脂质体膜、两性霉素B、麦角固醇、shodoamide C | 合成生物学 | NA | 水包油包水乳液法、无动力泵送微流控技术、荧光观察 | NA | 荧光图像 | NA | NA | NA | NA | 医药、药物发现、合成生物学 |
| 16 | 2026-03-28 |
RNA triplet repeats: improved algorithms for structure prediction and interactions
2025-Dec-10, Algorithms for molecular biology : AMB
IF:1.5Q3
DOI:10.1186/s13015-025-00292-8
PMID:41372930
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研究论文 | 本文研究了由三核苷酸重复序列组成的RNA的最小自由能二级结构预测及其相互作用,提出了改进的计算算法 | 针对三核苷酸重复RNA,改进了最小自由能和配分函数的计算算法,并设计了新的RNA-RNA相互作用算法,将阶乘运行时间优化为指数时间 | NA | 开发更高效的算法来预测三核苷酸重复RNA的结构和相互作用 | 三核苷酸重复序列RNA及其相互作用 | 计算生物学 | NA | RNA结构预测算法 | NA | 序列数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 17 | 2026-03-28 |
The secret life of RNA and lipids
2025-12, RNA biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1080/15476286.2025.2526903
PMID:40613519
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综述 | 本文探讨了RNA与脂质之间的相互作用,包括其化学基础及其对合成生物学、RNA世界和现代细胞生物学的影响 | 综述了RNA与脂质相互作用的新兴领域,提出了利用这些相互作用设计合成系统中RNA传感器和调控元件的可能性 | NA | 探索RNA与脂质相互作用,以推动合成生物学、RNA治疗和细胞调控研究 | RNA和脂质 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | RNA传感器和调控元件 | 医学, 工业生物技术 |
| 18 | 2026-03-28 |
Protocol to develop a synthetic biology toolkit for the non-model bacterium R. palustris
2023-Jun-16, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102158
PMID:37104094
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研究论文 | 本文介绍了一种为非模式细菌Rhodopseudomonas palustris CGA009开发合成生物学工具包的协议 | 为非模式细菌开发合成生物学工具包,扩展了合成生物学工具在非模型生物中的应用 | 协议可能需针对其他非模型生物进行优化,具体执行细节需参考原始文献 | 开发适用于非模式细菌的合成生物学工具包,以促进其独特代谢特性的研究与应用 | 非模式细菌Rhodopseudomonas palustris CGA009 | 合成生物学 | NA | 荧光标记和RT-qPCR | NA | NA | NA | NA | Rhodopseudomonas palustris CGA009 | NA | 工业生物技术 |
| 19 | 2026-03-28 |
Design and Experimental Evaluation of a Minimal, Innocuous Watermarking Strategy to Distinguish Near-Identical DNA and RNA Sequences
2020-06-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.0c00045
PMID:32413257
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研究论文 | 本研究设计并实验验证了一种最小化、无害的水印策略,用于区分近似的DNA和RNA序列,以在合成生物学中区分合成与天然基因副本 | 开发了一种系统性的DNA水印策略,通过谨慎交换密码子实现,对酵母生理影响最小,并首次在糖利用途径的13个基因中同时应用水印,结合CRISPR/Cas技术实现选择性基因组编辑 | 研究仅针对酵母模型,水印策略对Gpm1基因有轻微影响,且未在其他生物系统中验证其普适性 | 旨在开发一种DNA水印策略,以区分合成与天然基因副本,支持合成生物学中的基因组改造 | 酵母(Saccharomyces cerevisiae)中的13个糖利用途径基因,包括糖酵解和酒精发酵相关蛋白 | 合成生物学 | NA | 密码子交换、CRISPR/Cas基因组编辑、转录组分析、蛋白质表达和活性检测 | NA | DNA序列、RNA转录本、蛋白质丰度和活性数据 | 酵母菌株,涉及13个水印基因 | CRISPR-Cas9, pathway swapping strategy | Saccharomyces cerevisiae | 水印策略应用于糖利用代谢途径,通过密码子修改设计合成基因变体 | 工业生物技术 |
| 20 | 2026-03-28 |
Digital switching in a biosensor circuit via programmable timing of gene availability
2014-Dec, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/nchembio.1680
PMID:25306443
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研究论文 | 本文提出了一种通过编程基因可用性时间来控制多基因电路的方法,以改善合成生物学中瞬态基因传递的稳健性 | 利用位点特异性重组酶实现基因可用性的可编程时序控制,显著减少传感器电路的基底泄漏并提高动态范围 | NA | 开发一种通过时序控制基因可用性来优化合成生物电路性能的方法 | 内源性microRNA的比例传感器和细胞类型分类 | 合成生物学 | NA | 位点特异性重组酶技术 | NA | 基因表达数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 哺乳动物细胞 | 比例传感器、逻辑门 | 医学 |