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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-03-06 |
In vivo self-assembled siRNAs ameliorate neurological pathology in TDP-43-associated neurodegenerative disease
2026-Mar-05, Brain : a journal of neurology
IF:10.6Q1
DOI:10.1093/brain/awaf330
PMID:40916343
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研究论文 | 本文提出了一种基于合成生物学的方法,利用体内自组装siRNA靶向TDP-43蛋白,通过小细胞外囊泡递送至中枢神经系统,改善TDP-43相关神经退行性疾病的病理症状 | 利用内源性小RNA处理机制自组装siRNA封装的小细胞外囊泡,并借助宿主自然循环系统运输siRNA,实现高效、微创的基因治疗 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化效果和长期安全性仍需进一步验证 | 开发针对TDP-43蛋白异常积累的基因治疗策略,以治疗肌萎缩侧索硬化和额颞叶变性等神经退行性疾病 | TDP-43蛋白、siRNA、小细胞外囊泡、小鼠模型中的神经病理学变化 | 合成生物学 | 神经退行性疾病 | siRNA技术、小细胞外囊泡递送、立体定向注射、腺相关病毒递送系统 | NA | NA | 小鼠模型 | CRISPR-Cas9(可能用于工程化肝细胞,但未明确提及,故输出NA) | 小鼠 | 工程化肝细胞表达并包装靶向TDP-43的siRNA到狂犬病毒糖蛋白标记的小细胞外囊泡中,形成自组装递送系统 | 医学 |
| 2 | 2026-03-06 |
In vivo self-assembled SOD1-siRNAs mitigate muscle atrophy and denervation in amyotrophic lateral sclerosis
2026-Mar-05, Brain : a journal of neurology
IF:10.6Q1
DOI:10.1093/brain/awaf291
PMID:40795306
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研究论文 | 本研究开发了一种合成生物学策略,通过重编程肝脏在体内自组装封装SOD1-siRNA的小细胞外囊泡,以靶向脊髓神经元并特异性沉默突变SOD1基因,从而缓解肌萎缩侧索硬化症小鼠模型的肌肉萎缩和去神经支配症状 | 利用合成生物学策略将肝脏重编程为组织底盘,实现体内自组装靶向神经元的小细胞外囊泡封装siRNA,并设计了基于AAV的长期自组装策略,单次注射即可实现持续抑制突变蛋白 | 研究目前仅在Tg(SOD1G93A)转基因小鼠模型中进行,尚未在人类患者中验证 | 开发针对家族性ALS中SOD1基因突变的特异性基因沉默治疗策略 | Tg(SOD1G93A)转基因小鼠(ALS动物模型) | 合成生物学 | 肌萎缩侧索硬化症 | siRNA基因沉默技术、小细胞外囊泡递送技术、AAV载体技术 | NA | 动物实验数据、蛋白质水平检测、行为学评估 | Tg(SOD1G93A)转基因小鼠 | 合成生物学构建、AAV载体 | 小鼠(肝脏细胞) | CMV启动子驱动的合成构建体,编码SOD1-siRNA及sEV表面RVG靶向肽 | 医学 |
| 3 | 2026-03-06 |
Seizing the key nodes in glabridin biosynthesis network: identification of enzymes for producing licorice hairy roots with high levels of glabridin
2026-Mar-05, Molecular horticulture
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s43897-025-00202-x
PMID:41782076
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研究论文 | 本研究通过多组学分析和体外酶实验,阐明了光甘草定生物合成的两条互连途径,并鉴定出关键酶,构建了高产光甘草定的转基因毛状根平台 | 首次揭示了光甘草定生物合成中依赖与不依赖OMT/ODMT的两条互连途径,并通过过表达关键酶GgIFR使毛状根中光甘草定含量提高44倍,达到与4年生野生根相当的水平 | NA | 阐明光甘草定生物合成网络并建立可持续的工业化生产平台 | 光甘草定生物合成途径及其关键酶 | 合成生物学 | NA | 多组学分析、体外酶活性测定、农杆菌介导的转化系统 | NA | 多组学数据、酶活性数据 | NA | 农杆菌介导的转化 | 甘草毛状根 | 光甘草定生物合成途径(包括OMT/ODMT依赖的甲基化-去甲基化循环途径和OMT/ODMT非依赖途径) | 医药、化妆品 |
| 4 | 2026-03-06 |
Exploration of diverse glycosyltransferases in Dracocephalum moldavica and engineering the production of bioactive flavonoid glycosides
2026-Mar-04, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.70212
PMID:41782194
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研究论文 | 本研究系统探索了香青兰中参与黄酮类化合物糖基化的UDP-糖基转移酶,并通过工程化大肠杆菌实现了两种生物活性黄酮苷的高效合成 | 首次在香青兰中鉴定出五种功能多样的UGTs,包括双功能糖基转移酶DmUGT1,并通过定点突变揭示了其糖供体特异性的关键氨基酸位点 | 研究主要聚焦于已鉴定的五种UGTs,可能还有其他未发现的糖基转移酶参与香青兰黄酮苷的生物合成 | 阐明香青兰中黄酮类化合物糖基化的分子机制,并为合成生物学方法生产生物活性糖苷提供候选基因和方法 | 香青兰中的UDP-糖基转移酶及其催化的黄酮苷生物合成途径 | 合成生物学 | 心血管疾病 | 同源建模、定点诱变、代谢工程 | NA | 基因序列、酶活性数据 | 五种鉴定出的UGT基因 | 质粒设计、代谢工程 | 大肠杆菌 | 通过工程化大肠杆菌菌株,利用DmUGT1和DmCGT1,并增强细胞内UDP-葡萄糖醛酸和UDP-葡萄糖的供应,以生产目标黄酮苷 | 医药 |
| 5 | 2026-03-06 |
Unlocking plant abiotic stress resilience through biostimulants and omics-driven innovations
2026-Mar-04, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.70205
PMID:41782210
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综述 | 本文综述了生物刺激剂在增强植物非生物胁迫抗性方面的最新进展,并探讨了基于多组学和人工智能的创新策略 | 整合了生物刺激剂、小RNA、肽和激素等分子调控机制,结合AI驱动的预警系统和合成生物学方法,提出理性设计生物刺激剂的路线图 | NA | 探索生物刺激剂技术以增强植物对非生物胁迫的抗性,促进气候适应性农业和可持续粮食系统 | 植物(作物)及其对干旱、温度、盐分、涝渍和重金属等非生物胁迫的响应 | NA | NA | 多组学(omics)、AI驱动系统、代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业 |
| 6 | 2026-03-05 |
Correction for Ipoutcha et al., "A synthetic biology approach to assemble and reboot clinically relevant Pseudomonas aeruginosa tailed phages"
2026-Mar-03, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.00322-25
PMID:41609359
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7 | 2026-03-06 |
Advances in biocontainment strategies of engineered microbes for use in humans
2026-Mar-03, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2026.102727
PMID:41780106
|
综述 | 本文综述了用于人类医疗应用的基因工程微生物的生物安全策略进展 | 系统总结了多种生物安全策略的单独与联合应用,并强调了标准化测试的重要性 | NA | 探讨基因工程微生物在医疗应用中的生物安全策略 | 基因工程微生物 | 合成生物学 | NA | CRISPR, 毒素-抗毒素系统, 杀灭开关, 营养缺陷型设计 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 非标准氨基酸技术 | 微生物 | 毒素-抗毒素系统, 杀灭开关, 逻辑门, 生物传感器 | 医学 |
| 8 | 2026-03-06 |
Repurposing bacterial secretion systems for the design of living therapeutics
2026-Mar-03, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2026.102726
PMID:41780105
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综述 | 本文综述了如何重新利用细菌分泌系统来设计活体疗法,以在疾病部位直接分泌治疗性蛋白质 | 通过工程化共生和益生性大肠杆菌,利用病原体来源的分泌系统来分泌治疗性蛋白质,以解决药物靶向递送的挑战 | 讨论了每种分泌系统的潜在优势和局限性,以及需要进一步研究的领域 | 设计基于合成生物学的活体疗法,用于靶向递送治疗性蛋白质到疾病部位 | 共生和益生性大肠杆菌,以及其分泌系统 | 合成生物学 | 炎症性肠病 | 细菌分泌系统工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly | 大肠杆菌 | 分泌系统设计,包括来自病原体的系统,用于分泌治疗性蛋白质载荷 | 医学 |
| 9 | 2026-03-04 |
Publisher Correction: Engineering modular and orthogonal genetic logic gates for robust digital-like synthetic biology
2026-Mar-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69313-3
PMID:41771868
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 10 | 2026-03-06 |
Self-assembled cell-scale containers made from DNA origami membranes
2026-Mar, Nature materials
IF:37.2Q1
DOI:10.1038/s41563-025-02418-0
PMID:41315785
|
研究论文 | 本文报道了一种受脂质结构启发的DNA折纸单层膜的自组装,可形成囊泡或空心管状结构 | 首次利用DNA折纸技术构建了可编程的细胞尺度容器,突破了传统脂质膜与刚性蛋白笼的局限 | 未明确讨论结构的长期稳定性、生物相容性及在复杂生物环境中的功能表现 | 开发一种基于DNA纳米技术的仿生隔室化方法 | DNA折纸单层膜自组装形成的囊泡与空心管状结构 | 合成生物学 | NA | DNA折纸技术 | NA | NA | NA | DNA折纸 | NA | 仿脂质结构的径向对称DNA折纸亚基自组装膜 | 自下而上生物学、细胞尺度软体机器人 |
| 11 | 2026-03-06 |
Designing prokaryotic gene expression regulatory elements: From genomic mining to artificial intelligence-driven generation
2026 Mar-Apr, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108781
PMID:41419171
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综述 | 本文系统回顾了原核生物基因表达调控元件的设计策略,从基因组挖掘到人工智能驱动生成 | 整合了生物物理模型和人工智能指导的理性设计方法,强调了深度生成模型在功能调控元件开发中的应用 | 未具体说明实验验证的局限性或数据可用性问题 | 优化微生物细胞工厂的生物生产,通过精细调控基因表达 | 原核生物基因表达调控元件 | 合成生物学 | NA | 基因组挖掘、随机诱变、靶向诱变、深度生成建模 | 深度生成模型 | 序列数据 | NA | NA | 原核生物 | 基因表达调控元件,如启动子、核糖体结合位点等 | 工业生物技术 |
| 12 | 2026-03-06 |
Engineering Escherichia coli for high-level poly(3-hydroxybutyrate) production: Recent advances and future perspective
2026-Feb-28, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108858
PMID:41765153
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综述 | 本文综述了近年来在大肠杆菌中高效生产聚(3-羟基丁酸酯) (PHB) 的关键进展,并强调了使其成为可持续生物塑料生产有前景底盘的新兴策略 | 总结了通过优化前体供应、增强还原力、微调途径表达,特别是工程化糖酵解途径、引入合成途径(如还原甘氨酸和苏氨酸旁路途径)、删除竞争途径、表达phasin蛋白、优化启动子和辅因子再生策略等综合方法,显著提高了重组大肠杆菌中PHB的积累 | NA | 提高聚(3-羟基丁酸酯) (PHB) 的生产效率,以支持对可生物降解塑料日益增长的需求 | 大肠杆菌 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 大肠杆菌 | 代谢途径(如还原甘氨酸和苏氨酸旁路途径) | 材料, 工业生物技术 |
| 13 | 2026-03-06 |
Advances in the construction and biological applications of DNA condensates
2026-Feb-27, Nanoscale
IF:5.8Q1
DOI:10.1039/d5nr05322f
PMID:41758048
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综述 | 本文综述了通过液-液相分离构建DNA凝聚物的策略及其在模拟无膜细胞器、生物传感、细胞调控和药物递送等领域的生物应用 | 利用DNA序列可编程性、多样相互作用模式和易化学修饰特性,构建多刺激响应的人工凝聚物,并展望了智能多组分系统、光遗传学整合及机器学习辅助序列设计等未来方向 | 时空控制有限、核酸酶降解和免疫原性等挑战需解决以推进其在活体系统中的转化 | 概述DNA凝聚物的构建策略及其生物应用,并讨论当前挑战与未来发展方向 | DNA凝聚物,包括通过序列驱动自组装、聚合物或蛋白质介导的凝聚以及环境调控形成的系统 | 合成生物学 | NA | 液-液相分离(LLPS)、光遗传学、单分子技术、机器学习辅助序列设计 | NA | NA | NA | NA | NA | 模拟无膜细胞器、可编程生化微环境 | 医学、合成生物学 |
| 14 | 2026-03-06 |
Evolutionary repurposing of a metabolic thiolase complex enables antibiotic biosynthesis
2026-Jan-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68910-6
PMID:41617701
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研究论文 | 本研究报道了一种来自口腔链球菌的三组分酶复合体,通过不寻常的Friedel-Crafts C-乙酰化反应完成抗生素reutericyclin A的生物合成 | 揭示了硫解酶复合体通过关键催化残基重编程实现底物特异性转变,从HMG-CoA合成功能进化至Friedel-Crafts C-酰化功能,为酶进化提供了新范例 | NA | 探究初级代谢酶如何进化获得次级代谢中的特化功能,以理解天然产物的化学多样性 | 口腔链球菌物种中的三组分酶复合体(HMGS、ACAT和DUF35蛋白) | 合成生物学 | NA | 冷冻电子显微镜、生化表征、分子建模、进化分析 | NA | 结构数据、生化数据 | NA | NA | 口腔链球菌物种(如S. macacae) | NA | 医药 |
| 15 | 2026-03-06 |
Designing synthetic regulatory elements using the generative AI framework DNA-Diffusion
2026-Jan, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-025-02441-6
PMID:41437153
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研究论文 | 本文介绍了一种名为DNA-Diffusion的生成式人工智能框架,用于设计具有细胞类型特异性的紧凑调控元件 | 利用机器学习训练DNA可及性数据,生成能重现内源转录因子结合语法并增强细胞类型特异性的合成调控元件 | NA | 系统设计调控元件以实现精确的基因表达控制 | 合成调控元件及其在基因调控中的应用 | 合成生物学 | 白血病 | STARR-seq, EXTRA-seq | 生成式人工智能框架 | DNA可及性数据 | 5,850个元件库在三种细胞系中验证 | NA | 多种细胞系 | 紧凑调控元件设计 | 医学 |
| 16 | 2026-03-06 |
Integrating synthetic biology to understand and engineer the heart, lung, blood, and sleep systems
2025-Dec-17, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101446
PMID:41412113
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综述 | 本文探讨了合成生物学在心脏、肺、血液和睡眠系统中的整合应用,旨在通过工程化细胞和组织功能来理解和调控这些系统 | 将合成生物学从微生物扩展到人类系统,通过整合基因组工程、动态基因回路和高维生物传感器,实现对基因表达、细胞命运和组织结构的精确控制,并利用组学数据与人工智能指导的回路设计构建高分辨率细胞和组织尺度模型 | 仍面临递送系统、转基因稳定性以及在生理相关模型中实现稳健时空控制等关键挑战 | 通过合成生物学方法理解和工程化心脏、肺、血液及睡眠系统,推动多器官动态环境中细胞与组织的可靠功能设计 | 心脏、肺、血液和睡眠系统的细胞与组织 | 合成生物学 | NA | 基因组工程、动态基因回路、高维生物传感器、组学数据整合、人工智能指导的回路设计 | 系统级模型、高分辨率细胞与组织尺度模型 | 组学数据 | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 人类细胞与组织 | 可调转录调节因子、合成组织器、反馈回路、逻辑门、生物传感器 | 医学、药物开发、基因治疗 |
| 17 | 2026-03-06 |
Repurposing the bacterial surface display technology for drug delivery
2025-Dec, Advanced drug delivery reviews
IF:15.2Q1
DOI:10.1016/j.addr.2025.115701
PMID:41046872
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综述 | 本文综述了细菌表面展示技术在药物递送领域的应用进展与未来前景 | 提出利用AlphaFold等计算工具理性设计最优外膜锚定蛋白,以加速下一代表面展示平台的开发 | 面临监管障碍和微生物稳定性等挑战 | 探索细菌工程在医学应用中的演变,重点研究细菌表面展示技术实现的药物递送策略 | 革兰氏阴性菌和革兰氏阳性菌的表面展示系统 | 合成生物学 | 癌症 | 细菌表面展示技术 | NA | NA | NA | NA | 革兰氏阴性菌, 革兰氏阳性菌 | 外膜蛋白系统、分选酶介导的锚定系统、基于孢子的系统 | 医学 |
| 18 | 2026-03-06 |
A parts list of promoters and gRNA scaffolds for mammalian genome engineering and molecular recording
2025-Nov-11, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-025-02896-2
PMID:41219485
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研究论文 | 本文设计并量化了用于哺乳动物基因组工程和分子记录的启动子和gRNA支架变体库,以促进精确编辑和合成生物学应用 | 首次为哺乳动物系统开发了标准化的启动子和gRNA支架'部件列表',包括数千个变体,其中数百个比常用序列活性更高,并通过饱和诱变筛选增强了序列多样性 | NA | 开发用于哺乳动物基因组工程和分子记录的标准化遗传部件库,以提高编辑效率和可预测性 | 哺乳动物细胞系(人类和小鼠)中的启动子和gRNA支架变体 | 合成生物学 | NA | 多重prime editing、饱和诱变筛选 | NA | 序列数据、编辑活性数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 哺乳动物细胞 | gRNA阵列、'十键'阵列用于平衡pegRNA活性,适用于合成基因座、生物记录器和复杂遗传电路 | 医学、工业生物技术 |
| 19 | 2026-03-06 |
Plants against cancer: towards green Taxol production through pathway discovery and metabolic engineering
2024-Sep, aBIOTECH
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s42994-024-00170-8
PMID:39279861
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综述 | 本文综述了植物天然产物发现与工程中的挑战与进展,以抗癌药物紫杉醇生物合成途径中缺失酶的突破性发现为例 | 通过高通量测序和合成生物学方法,成功鉴定了紫杉醇生物合成途径中的关键缺失酶,为绿色生产提供了新途径 | NA | 加速药物发现并解决人类健康问题,特别是通过植物天然产物的工程化生产抗癌药物 | 植物天然产物,尤其是紫杉醇的生物合成途径 | 合成生物学 | 癌症 | 高通量测序、基因组组装、基因合成、分析技术 | NA | NA | NA | 合成生物学方法 | 植物 | 紫杉醇的生物合成途径 | 医药 |
| 20 | 2026-03-06 |
Enabling neighbour labelling: using synthetic biology to explore how cells influence their neighbours
2024-01-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.201955
PMID:38165174
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综述 | 本文综述了合成生物学和图像分析技术的最新进展,以探索细胞如何影响其邻近细胞 | 整合合成生物学工具与图像分析方法,以解决细胞间相互作用研究中的技术挑战 | 在发育模型系统中应用这些技术时存在机会和限制 | 探索细胞间相互作用在发育过程中的机制 | 细胞及其邻近细胞 | 合成生物学 | NA | 图像分析 | NA | 图像 | NA | NA | NA | NA | 医学 |