合成生物学相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['synthetic biology']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价9.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 4582 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-03-13 |
Programmable AND-gate strategy to reduce false positives in rolling circle amplification
2026-Jun-15, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2026.118515
PMID:41707426
|
研究论文 | 本文提出了一种基于AND门布尔逻辑的多键滚环扩增策略，用于降低核酸检测生物传感器中的假阳性率 | 引入AND门布尔逻辑创建Multi-Key RCA，通过检测多个核酸序列作为扩增前提，显著减少假阳性，并实现高特异性单核苷酸多态性检测 | NA | 提高生物传感器的特异性，减少假阳性，特别针对即时诊断应用 | 滚环扩增技术及其在核酸检测生物传感器中的应用 | 合成生物学 | NA | 滚环扩增，等温扩增，侧向层析检测 | NA | 核酸序列 | NA | NA | NA | AND门逻辑电路，多输入生物传感器 | 医学 |
| 2 | 2026-03-13 |
Molecular Dialogue Across Kingdoms: The Role of Trans-Kingdom Peptides in Plant-Associated Interactions
2026-Apr, Plant, cell & environment
DOI:10.1111/pce.70378
PMID:41527218
|
综述 | 本文提出并定义了跨界肽（TKPs）的概念，总结了其在植物与微生物相互作用中的功能，并探讨了其在农业和生物医学等领域的应用潜力 | 首次提出并系统定义跨界肽（TKPs）作为跨物种生物活性肽的新概念，整合了植物、微生物、病毒和昆虫来源的肽在多种生态互作中的作用 | NA | 探讨跨界肽在植物相关相互作用中的生物学功能和跨物种通讯机制 | 植物、微生物、病毒和昆虫来源的跨界肽及其在共生、寄生和免疫调控中的作用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业, 生物医学, 合成生物学, 环境可持续性 |
| 3 | 2026-03-13 |
From sequence to structure: A comprehensive review of deep learning models for RNA structure prediction
2026-Apr, Current opinion in structural biology
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.sbi.2025.103216
PMID:41650708
|
综述 | 本文全面回顾了从传统物理方法到当前深度学习模型在RNA二级和三级结构预测中的演变 | 系统梳理了三种深度学习范式：基于语言模型的方法、端到端结构预测器以及几何距离预测方法，并提出了针对数据稀缺和模型可解释性的未来研究方向 | RNA结构预测仍面临训练数据有限、复杂非规范相互作用和构象灵活性等独特挑战 | RNA结构预测，以理解基因调控、药物设计和合成生物学 | RNA的二级和三级结构 | 计算生物学 | NA | 深度学习 | 语言模型、端到端结构预测器、几何距离预测模型 | RNA序列和结构数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4 | 2026-03-13 |
Adenosine Triphosphate-Producing Artificial Cells: Biomimetic Construction Strategies and Applications
2026-Mar-13, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202500934
PMID:41773731
|
综述 | 本文综述了ATP生产人工细胞的仿生构建策略及其应用，重点关注模型膜、质子泵和ATP酶的协同整合 | 系统整合了三种构建策略的最新进展，包括绕过膜蛋白组装挑战的直接封装完整细胞器或构建非经典系统，为从基础研究转向实际应用提供指导 | NA | 探索ATP生产人工细胞的构建策略及其在合成生物学、靶向药物递送、再生疗法和生物混合能量转换设备等工程应用中的潜力 | 人工细胞，特别是基于脂质体、聚合物体、融合液滴、油包水胶束和金属有机框架等自下而上模型构建的ATP生产系统 | 合成生物学 | NA | 自下而上构建策略，包括封装完整线粒体、类囊体或构建非经典系统如精氨酸降解途径 | NA | NA | NA | NA | NA | 模拟氧化/光合磷酸化以维持ATP合成的仿生能量转换系统，包括质子泵和ATP酶的级联能量转换 | 医学, 农业, 环境, 能源, 材料, 工业生物技术 |
| 5 | 2026-03-13 |
The disputed identity of Pseudomonas putida KT2440: when taxonomists rename your favorite microbe
2026-Mar-11, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.03390-25
PMID:41589905
|
评论 | 本文讨论了微生物菌株KT2440因分类学重命名引发的争议，强调命名应兼顾科学传统与社区实践 | 以具体菌株为例，系统批判了脱离社区实践的强制性分类学重命名机制，并提出基于广泛协商的替代解决方案 | 主要聚焦于单一菌株案例，未全面探讨微生物命名体系的系统性改革方案 | 探讨微生物分类学命名与科学社区实践之间的冲突及协调机制 | 假单胞菌菌株KT2440及其分类学重命名争议 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | Pseudomonas putida KT2440（假单胞菌） | NA | 环境微生物学、生物技术、合成生物学 |
| 6 | 2026-03-13 |
Synthetic overlapping genes stabilize genetic systems
2026-Mar-11, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.02725-25
PMID:41649272
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为OAFI的新方法，用于创建合成重叠基因以稳定遗传系统 | 提出OAFI方法，通过将内层基因插入外层基因的灵活区域来创建合成重叠基因，从而稳定基因并限制水平基因转移 | NA | 开发一种工具来稳定工程化基因并增强生物防护 | 遗传报告基因和细菌毒素，特别是抗生素抗性基因 | 合成生物学 | NA | OAFI（重叠交替框架插入）方法 | NA | NA | NA | OAFI | 细菌 | 重叠基因对，包括遗传报告基因和毒素基因插入抗生素抗性基因中 | 工业生物技术 |
| 7 | 2026-03-13 |
Hybrid seed production: new paradigms and challenges in the twenty-first century
2026-Mar-11, Planta
IF:3.6Q1
DOI:10.1007/s00425-026-04959-3
PMID:41811507
|
综述 | 本文综述了二十一世纪杂交种子生产的新范式与挑战，重点探讨了先进基因组学、人工智能育种与政策整合对可持续生产气候适应性杂交种子的影响 | 系统整合了CRISPR/Cas、基因组选择等现代基因组工具与人工智能/机器学习、表观遗传学等新兴技术，提出通过多领域协作解决杂交技术可扩展性与可及性瓶颈的创新框架 | 未提供具体作物的量化对比数据，对小型农户采纳障碍的解决方案探讨较为宏观，缺乏区域性政策差异的深度分析 | 探讨整合先进技术与政策以可持续生产气候适应性杂交种子的路径 | 杂交种子生产技术体系及其相关作物案例 | 农业生物技术 | NA | CRISPR/Cas, 标记辅助选择, 基因组选择, 人工智能/机器学习, 表观遗传学 | NA | 基因组数据, 表型数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 作物植物 | NA | 农业 |
| 8 | 2026-03-13 |
Exploring the chemical diversity of Dictyostelium secondary metabolites and their biological implications
2026-Mar-10, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-026-04742-8
PMID:41805866
|
综述 | 本文详细综述了盘基网柄菌次级代谢产物的化学多样性、生物合成途径、分离鉴定方法及其生物学功能与药理潜力 | 系统梳理了盘基网柄菌中罕见骨架的次级代谢产物（如聚酮、萜类、生物碱等），并展望了多组学技术与合成生物学结合在天然药物发现中的前沿应用 | NA | 探索盘基网柄菌次级代谢产物的化学多样性及其生物学与药理学意义 | 盘基网柄菌（Dictyostelium）产生的次级代谢产物 | NA | NA | 色谱分离技术、光谱学方法、化学合成、基因组挖掘、多组学技术 | NA | 化学结构数据、基因组数据、生物活性数据 | NA | 合成生物学 | 盘基网柄菌（Dictyostelium） | NA | 医药（天然药物发现） |
| 9 | 2026-03-13 |
Sustainable bioenergy manufacturing in plants
2026-Mar-09, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2026.101711
PMID:41517869
|
综述 | 本文综述了通过合成生物学、基因组学、人工智能和化学等多学科融合来克服传统生物质转化在效率、成本和多功能性方面的限制，以推动可持续生物能源制造的最新进展 | 提出了多学科融合（合成生物学、基因组学、AI、化学）的协同策略来优化生物质工程，并以真菌生物发光途径（FBP）构建自发光植物作为前沿应用案例，展示了将光合作用能量转化为可见光发射的可持续自主生物照明平台 | NA | 探讨如何通过多学科交叉方法克服传统生物质转化的局限性，推动可持续植物基生物能源的制造 | 能源作物、生物质、自发光植物（利用真菌生物发光途径） | NA | NA | 基因组编辑、组学技术、人工智能 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 植物 | 真菌生物发光途径（FBP），利用内源性代谢物咖啡酸将光合作用能量转化为可见光发射 | 能源 |
| 10 | 2026-03-13 |
Plant non-canonical peptides: From identification to mechanisms
2026-Mar-09, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2026.101739
PMID:41580897
|
综述 | 本文全面概述了植物肽的分类、生物合成及其在调控多种生物过程中的功能机制，并系统总结了植物肽鉴定的历史发展与最新策略 | 系统总结了植物非经典肽的鉴定策略发展，并提出了整合高通量技术、功能基因组学和合成生物学以挖掘植物肽潜力的新方向 | 肽的发现和功能注释仍然面临挑战 | 探讨植物肽的分类、生物合成、功能机制及鉴定策略，以挖掘其在作物改良和跨学科创新中的潜力 | 植物肽，特别是非经典肽 | NA | NA | 肽组学、质谱分析 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业 |
| 11 | 2026-03-13 |
Editing and synthetic engineering of chloroplast genomes
2026-Mar-09, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2026.101783
PMID:41761616
|
综述 | 本文综述了叶绿体基因组编辑与合成工程的最新进展，包括基因组精简、高效编辑和代谢途径重设计 | 整合了叶绿体基因组精简、高效编辑工具和代谢途径动态调控等前沿技术，为下一代叶绿体工程提供综合方案 | NA | 优化叶绿体功能，实现高价值化合物的从头生物合成和作物性状改良 | 植物和藻类的叶绿体基因组 | 合成生物学 | NA | 基因敲除、基因敲入、碱基替换、多重修饰 | NA | NA | NA | NA | 植物, 藻类 | 代谢途径重设计 | 生物技术, 农业 |
| 12 | 2026-03-13 |
Friedelane-type oxidosqualene cyclases in friedelin production: Advances in biosynthesis, functional characterization, structure-function relationships, and engineering strategies
2026-Mar-09, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.151349
PMID:41812943
|
综述 | 本文综述了friedelane型氧化角鲨烯环化酶在friedelin生物合成中的研究进展，包括功能表征、结构-功能关系及合成生物学策略 | 首次报道了植物OSC的冷冻电镜结构，揭示了独特的“阳离子穿梭运行”机制，并整合了多组学技术识别friedelane型OSCs | NA | 探讨friedelin的生物合成、功能表征、结构-功能关系及工程策略，以实现其可持续生产 | friedelane型氧化角鲨烯环化酶及friedelin生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 多组学整合技术、冷冻电镜、代谢途径工程、蛋白质工程 | NA | NA | NA | 代谢途径工程、蛋白质工程、亚细胞区室化 | 酿酒酵母 | friedelin生物合成途径的重建 | 医药 |
| 13 | 2026-03-13 |
Ornithine lipids and other acyloxyacyl amino lipids: the coming-of-age story of a group of non-canonical membrane lipids
2026-Mar-08, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-026-13777-2
PMID:41794944
|
综述 | 本文全面回顾了鸟氨酸脂及其他酰氧酰基氨基酸脂这类非典型膜脂的研究进展，包括其合成途径、调控条件、修饰方式及其在细菌应激抵抗和宿主互作中的作用 | 系统分析了鸟氨酸脂合成酶基因的分类分布，预测了具备合成能力的细菌，并探讨了其在合成生物学中的潜在应用 | NA | 综述鸟氨酸脂及其他酰氧酰基氨基酸脂的结构、合成、功能及其在合成生物学中的应用潜力 | 鸟氨酸脂及其他酰氧酰基氨基酸脂 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 14 | 2026-03-13 |
Microbial computing: Review and Perspectives
2026 Mar-Apr, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108766
PMID:41317976
|
综述 | 本文回顾了微生物计算领域的发展历程，概述了现有策略及其局限性，并提出了基于储层计算的新视角 | 引入了基于储层计算的自上而下新框架，利用生物系统固有的动态计算能力解决复杂任务 | 现有的自下而上策略仍不足以模拟细胞信号处理系统的计算复杂性 | 探讨微生物计算的发展策略与未来方向 | 微生物计算机（生物计算机） | 合成生物学 | NA | NA | 储层计算、模拟计算、神经形态架构 | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 大肠杆菌（E. coli）、酿酒酵母（S. cerevisiae）、枯草芽孢杆菌（B. subtilis）、哺乳动物细胞、植物 | 数字逻辑门、切换开关、振荡器、生物传感器、代谢通路 | 生物生产、生物修复、生物医学 |
| 15 | 2026-03-13 |
Microbial electrochemical synergy: A mechanistic framework for enhanced bioelectrochemical remediation of halogenated organic pollutant in soil-water matrices
2026-Mar-01, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2026.141415
PMID:41690271
|
综述 | 本文提出了一个名为“微生物电化学协同作用”的概念框架，用于系统解析生物电化学系统在土壤-水基质中修复卤代有机污染物的性能，并探讨了通过整合机器学习、多组学和合成生物学工具来设计和调控下一代BES技术的潜力 | 提出了一个整合性的“微生物电化学协同作用”机制框架，该框架从电子流效率、功能微生物生态位分配和界面微环境特征三个维度系统解析BES性能，并首次倡导协同利用机器学习、多组学和合成生物学工具进行理性设计 | 本文是一篇综述，未提供具体的实验数据或案例验证所提框架的有效性 | 旨在通过提出一个整合性机制框架，提升基于生物电化学系统的卤代有机污染物修复策略的可扩展性和可持续性 | 生物电化学系统及其在土壤-水基质中修复卤代有机污染物的应用 | 环境生物技术 | NA | 机器学习， 多组学， 合成生物学工具 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 环境 |
| 16 | 2026-03-13 |
A Scaffoldomics Platform for Modular In Vivo Enzyme Colocalisation and Its Application to Naringenin Biosynthesis
2026-Mar, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.70328
PMID:41814496
|
研究论文 | 本文开发了一个名为'支架组学'的平台，用于在体内模块化地共定位酶，并将其应用于柚皮素的生物合成 | 开发了一个通用的合成框架（支架组学平台），能够组合式地将生物合成途径的酶组装到蛋白质支架上，形成多样的多酶复合体，并通过整合染色体编码的生物传感器实现实时检测和途径评估 | NA | 提高微生物细胞工厂生产精细化学品的产量，通过酶共定位策略增强代谢效率 | 柚皮素（一种关键的类黄酮中间体）的生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 体内酶共定位、组合式支架组装、染色体编码生物传感器 | NA | NA | NA | 合成支架、染色体编码生物传感器 | 大肠杆菌 | 多酶复合体组装系统（最多可将四种途径酶组装到蛋白质支架上），用于柚皮素生物合成的代谢途径 | 工业生物技术 |
| 17 | 2026-03-13 |
Versatile 2-Oxoglutarate-Dependent Dioxygenases Catalyze Radical-Mediated Multifunctional Skeleton Reconstructions and Oxidation Modifications of Taxoids
2026-Feb-26, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.6c01169
PMID:41746272
|
研究论文 | 本研究鉴定了两种新型2-氧戊二酸依赖性双加氧酶TcOGD1和TcOGD2，它们催化紫杉烷类化合物的骨架重构和氧化修饰，揭示了紫杉烷结构多样性的形成机制 | 首次报道了具有催化多功能性的2-氧戊二酸依赖性双加氧酶，能够实现从6/8/6到5/7/6、-5/7/6和6/12框架的骨架重构，以及多个位点的氧化修饰 | NA | 探索5/7/6紫杉烷类化合物的化学多样性和生物合成途径 | 紫杉烷二萜类化合物，特别是5/7/6框架的紫杉烷如taxuspine J | 合成生物学 | NA | 酶促反应、NMR光谱学 | NA | 化学结构数据、光谱数据 | 通过放大酶促反应鉴定了一系列化合物，包括taxuspine J和15种-5/7/6紫杉烷，并从植物中分离出五种新型-5/7/6紫杉烷 | 酶工程、合成生物学 | NA | NA | 医药 |
| 18 | 2026-03-13 |
Arboviral Diseases in a Changing World: Evolutionary Dynamics, Host-Vector Interactions, and Novel Control Strategies
2026-Feb-19, Vector borne and zoonotic diseases (Larchmont, N.Y.)
DOI:10.1177/15303667251376450
PMID:40955762
|
综述 | 本文系统综述了虫媒病毒病的进化机制、宿主-媒介相互作用及新兴控制策略，以应对其在全球变化背景下的公共卫生挑战 | 整合了基因组分析、元流行病学综合和预测建模，并重点评估了CRISPR基因驱动、沃尔巴克氏体干预和RNAi抗病毒药物等新型控制策略的潜力 | 纳入的研究数量有限（仅12篇），且涉及基因编辑和微生物干预的伦理、生态和监管问题仍需审慎考量 | 理解虫媒病毒的进化机制、传播动力学并评估新兴控制策略，以有效缓解疾病负担 | 登革热病毒、寨卡病毒、基孔肯雅病毒和西尼罗河病毒等虫媒病毒及其传播媒介（如蚊、蜱） | NA | 虫媒病毒病 | 基因组分析、元流行病学综合、预测建模 | NA | NA | NA | CRISPR | NA | NA | 医学 |
| 19 | 2026-03-13 |
Multichannel genomic recording of biological information with ENGRAM
2026-Feb-11, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-025-01322-w
PMID:41673323
|
研究论文 | 本文提供了进行ENGRAM实验和分析数据的逐步协议，并讨论了该系统的设计考虑、优势、局限性和应用 | 利用prime editing介导的插入实现多路复用信号记录，并与DNA Typewriter兼容以捕获信号顺序 | 需要基本的分子生物学、哺乳动物细胞培养和DNA测序分析技能，实验周期为5-6周 | 开发用于测量生物学时间动态的分子记录系统 | 顺式调控元件（CREs）的活性记录 | 合成生物学 | NA | DNA测序，prime editing | NA | 基因组数据 | NA | CRISPR-Cas9（prime editing） | 哺乳动物细胞 | 增强子介导的基因组记录电路（ENGRAM），可将瞬时CRE活性转换为稳定的基因组记录 | 医学，工业生物技术 |
| 20 | 2026-03-13 |
Protein-inducible ribosomal frameshifting enables programmable translational control for genetic circuit design in Escherichia coli
2026-Feb-07, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-026-00629-w
PMID:41654819
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为蛋白质诱导核糖体移码（PIRF）的合成翻译调控平台，通过整合适配体-蛋白质相互作用与-1 PRF基序，在大肠杆菌中实现可调控的翻译 | PIRF平台通过结合适配体-蛋白质相互作用和-1 PRF基序，实现了可编程的翻译控制，扩展了合成生物学在翻译调控、生物传感和生物治疗方面的工具包 | PIRF设计中常观察到可测量的基础移码水平，未来可能需要额外策略进行进一步优化 | 开发一种可编程的翻译控制机制，用于遗传电路设计 | 大肠杆菌中的蛋白质表达调控 | 合成生物学 | NA | 蛋白质诱导核糖体移码（PIRF） | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 大肠杆菌 | 逻辑门操作、多层调控、融合蛋白表达控制、蛋白质聚集和膜周定位 | 医学, 工业生物技术 |