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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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1 | 2025-05-19 |
Biosourced Functional Hydroxybenzoate-co-Lactide Polymers with Antimicrobial Activity
2025-May-17, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c04624
PMID:40380948
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research paper | 该研究设计并研究了一种具有抗菌活性的生物源功能性羟基苯甲酸-丙交酯共聚物 | 利用合成生物学和化学相结合的方法,生产出具有抗菌活性和可降解性的功能性聚合物 | 仅针对革兰氏阳性菌进行了测试,未涉及其他类型的病原体 | 开发具有抗菌活性和可降解性的生物源聚合物 | 4-(甲基/烯丙基/苄基)氧基-6-(H/烷基)-2-氧基-苯甲酸-丙交酯基聚合物 | 合成生物学与化学 | NA | 异源生产、化学修饰、开环聚合 | NA | NA | 不同聚合度的聚合物([单体]/[引发剂] = 5-30) |
2 | 2025-05-19 |
Self-authenticating genomic materials in Escherichia coli via advanced genome signatures
2025-May-16, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08171-z
PMID:40379889
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research paper | 介绍了一种名为'基因组签名'的生物化学稳定且防篡改的DNA标记系统,用于创建自认证基因组 | 利用Golomb-ruler衍生的Genome-Comb,将广泛的核苷酸序列映射到内源基因的有限密码子上,显著提高了错误校正和数据编码能力 | NA | 提高合成基因组材料的真实性和完整性,以促进科学知识和生物安全的发展 | 大肠杆菌中的基因组材料 | 合成生物学 | NA | 基因组签名技术 | NA | 基因组数据 | 成功记录了450万个核苷酸的基因组 |
3 | 2025-05-19 |
Unlocking hidden bioactive compounds: from indolocarbazole and RiPP biosynthesis to the activation of cryptic secondary metabolism via microbial interactions
2025-May-16, The Journal of antibiotics
IF:2.1Q3
DOI:10.1038/s41429-025-00828-5
PMID:40379949
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综述 | 本文综述了放线菌次级代谢的三个方面:吲哚咔唑的生物合成、RiPPs的生物合成以及通过微生物相互作用激活次级代谢 | 强调了微生物相互作用在天然产物生物合成中的重要性,并提出了通过合成生物学和微生物生态学进行药物发现的新方向 | NA | 探索放线菌次级代谢的生物合成途径及其在药物发现中的应用 | 放线菌,特别是链霉菌,及其次级代谢产物 | 微生物学与药物发现 | NA | 细胞游离一锅合成平台、组合培养策略 | NA | NA | NA |
4 | 2025-05-19 |
Combinatorial metabolic engineering of Yarrowia lipolytica for high-level production of the plant-derived diterpenoid sclareol
2025-May-16, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-025-02744-7
PMID:40380140
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研究论文 | 通过组合代谢工程改造Yarrowia lipolytica,实现植物来源的二萜醇sclareol的高水平生产 | 通过融合SsSCS和SsLPPS蛋白、多拷贝基因整合、优化甲羟戊酸途径以及调节脂质合成与降解,显著提高了sclareol的产量 | 研究仅在摇瓶中进行,未进行大规模发酵验证 | 开发一种可持续的sclareol生产方法,替代传统的植物提取法 | Yarrowia lipolytica | 合成生物学 | NA | 代谢工程、基因整合与过表达 | NA | NA | NA |
5 | 2025-05-19 |
Excavation of acoustic nanostructures biosynthesis gene clusters by combinatorial strategy
2025-May-15, Advanced biotechnology
DOI:10.1007/s44307-025-00069-5
PMID:40372536
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research paper | 该研究通过合成生物学策略构建了一种新型基因编码的气囊纳米结构,可用于临床超声成像和药物递送 | 通过组合不同微生物的基因簇,合成了一种新型气囊纳米结构(ARG),其尺寸适合临床超声成像,并可通过点饱和突变调整大小 | NA | 开发适用于临床超声成像和药物递送的新型气囊纳米结构 | 气囊纳米结构(GVs)的生物合成基因簇 | 合成生物学 | NA | 合成生物学策略、点饱和突变 | NA | NA | NA |
6 | 2025-05-19 |
Catalytic mechanism and engineering of aromatic prenyltransferase: A review
2025-May-14, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.144214
PMID:40379159
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综述 | 本文系统总结了芳香族异戊二烯基转移酶的催化机制和工程化研究进展 | 提出了整合人工智能和深度学习的创新工程方法以开发高性能生物催化剂 | 当前存在的挑战包括催化活性不足、底物特异性窄以及多酶级联系统和固定化技术的限制 | 指导芳香族异戊二烯基转移酶在合成生物学和药物创新中的工程化及规模化应用 | 芳香族异戊二烯基转移酶 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、人工智能、深度学习 | NA | NA | NA |
7 | 2025-05-19 |
Emerging ultrafast technologies in biotechnology
2025-May, 3 Biotech
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s13205-025-04309-2
PMID:40292246
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综述 | 本文综述了超快技术在生物技术中的变革性应用,重点介绍了其在实时可视化和精确操控生物分子过程中的能力 | 飞秒激光提高了基因编辑的精确度,减少了脱靶效应;超快光谱学增进了对蛋白质折叠路径、酶活性和能量转移机制的理解;阿秒光谱学为超快电子动力学和电荷迁移提供了前所未有的见解 | 光损伤、与复杂生物系统的整合以及伦理问题 | 探讨超快技术在生物技术中的应用及其潜力 | 生物分子过程、基因编辑、蛋白质折叠、酶活性、能量转移、细胞动力学、细胞内信号传导、神经活动 | 生物技术 | NA | 飞秒激光、超快光谱学、泵浦探测显微镜、相干反斯托克斯拉曼散射(CARS)、阿秒光谱学 | NA | NA | NA |
8 | 2025-05-19 |
The Future of Microbiome Therapeutics
2025-Feb, Drugs
IF:13.0Q1
DOI:10.1007/s40265-024-02107-3
PMID:39843757
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综述 | 本文概述了当前处于后期开发阶段的最新技术,探讨了它们在微生物组治疗领域的优势和局限性 | 涵盖了从粪便衍生产品到活体生物治疗、噬菌体疗法和合成生物学等多种技术,为微生物组治疗的未来发展指明了方向 | 现有商业微生物组定向产品往往表现出低效性 | 探讨微生物组治疗的未来发展方向 | 人类微生物组 | 微生物组学 | NA | 粪便衍生产品、活体生物治疗、噬菌体疗法、合成生物学 | NA | NA | NA |
9 | 2025-05-19 |
A massively parallel reporter assay library to screen short synthetic promoters in mammalian cells
2024-11-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54502-9
PMID:39609378
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research paper | 介绍了一个包含6144个短合成启动子的库,用于在哺乳动物细胞中大规模并行报告分析 | 设计了一个短于250bp的合成启动子库,能够精确检测和放大转录活性,适用于多种细胞系和刺激 | 未提及具体的技术限制或样本量的局限性 | 开发可调谐的报告基因,用于药物开发、合成生物学和生命科学研究 | 哺乳动物细胞中的合成启动子 | 合成生物学 | NA | 大规模并行报告分析 | NA | 转录活性数据 | 6144个合成启动子 |
10 | 2025-05-18 |
Dynamic Analysis and Robust Strategy for the Delayed Paradoxical Cell Population Control Circuit
2025-Jun, IEEE transactions on cybernetics
IF:9.4Q1
DOI:10.1109/TCYB.2025.3556585
PMID:40198292
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研究论文 | 本文提出了一种通过分析延迟悖论细胞群体控制电路中的双稳态切换和振荡行为来实现稳健群体控制的策略 | 揭示了两种双稳态切换机制,并提出通过调节初始细胞群体密度和blasticidin浓度来实现稳健控制的新策略 | NA | 研究延迟悖论细胞群体控制电路的动态特性并开发稳健的控制策略 | 合成悖论控制电路中的细胞群体 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
11 | 2025-05-18 |
Ultrasound-responsive mammalian cell synthetic biology
2025-May-16, IEEE transactions on ultrasonics, ferroelectrics, and frequency control
DOI:10.1109/TUFFC.2025.3570813
PMID:40378033
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综述 | 本文综述了超声波响应性哺乳动物细胞合成生物学的最新进展和挑战 | 结合超声波与基因工程效应器,实现了对细胞和分子过程的非侵入性精确控制,克服了组织穿透性和侵入性的限制 | 参数标准化和基础机制理解方面的挑战 | 探讨超声波在合成生物学中的应用及其未来发展方向 | 哺乳动物细胞 | 合成生物学 | NA | 超声波、基因工程 | NA | NA | NA |
12 | 2025-05-18 |
Bioremediation of complex organic pollutants by engineered Vibrio natriegens
2025-May-07, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-08947-7
PMID:40335686
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研究论文 | 本研究利用合成生物学技术改造Vibrio natriegens,使其能够在含盐废水和土壤中生物修复复杂的有机污染物 | 通过插入和过表达tfoX基因增强DNA摄取和整合能力,并开发了一种基因组工程方法,成功将五个降解基因簇转入Vmax菌株,使其能够修复多种有机污染物 | 研究仅针对五种有机污染物进行了测试,未涵盖所有可能的复杂污染物 | 开发一种能够在高盐环境中有效生物修复复杂有机污染物的微生物 | 工业废水、石油污染和塑料污染中的有机污染物 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、基因组工程 | NA | NA | 来自氯碱厂和石油精炼厂的工业废水样品 |
13 | 2025-05-18 |
Characterization and Optimization of Vesicle Properties in bioPISA: from Size Distribution to Post-Assembly Loading
2025-May, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202400483
PMID:39692631
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研究论文 | 本研究探讨了通过生物催化聚合诱导自组装(bioPISA)制备的囊泡作为人工细胞的形成和性质 | 探索了实现囊泡尺寸均匀性的方法,并研究了搅拌速度对囊泡形态的影响,同时展示了将大分子加载到预形成囊泡中的可行性 | NA | 开发具有可控形态的酶合成聚合物囊泡,用于合成生物学等应用 | 通过bioPISA制备的囊泡 | 合成生物学 | NA | 生物催化聚合诱导自组装(bioPISA)、荧光相关光谱(FCS)、电穿孔 | NA | NA | NA |
14 | 2025-05-18 |
Regulating Protein Immobilization During Cell-Free Protein Synthesis in Hyaluronan Microgels
2025-May, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202400668
PMID:39957478
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研究论文 | 研究利用透明质酸微凝胶作为实验平台,探索无细胞蛋白质合成(CFPS)与微凝胶内蛋白质原位积累的相互作用 | 首次提出利用双功能微凝胶平台研究蛋白质合成的时间-空间调控,通过定制蛋白质结合或释放来调控反应环境 | 研究仍处于初步阶段,尚未展示该平台在复杂生物系统中的应用效果 | 开发一种用于研究蛋白质合成时空调控的实验平台 | 透明质酸微凝胶及其修饰后的蛋白质结合能力 | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白质合成(CFPS),线性DNA模板技术 | NA | 实验数据 | NA |
15 | 2025-05-18 |
Distinct Network Morphologies from In Situ Polymerization of Microtubules in Giant Polymer-Lipid Hybrid Vesicles
2025-May, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202400601
PMID:40071650
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research paper | 研究展示了在巨型聚合物-脂质杂化囊泡中原位聚合微管,模拟活细胞中的动态细胞骨架 | 首次在由特定两亲性嵌段共聚物和脂质组成的杂化囊泡中实现微管原位聚合,并观察到不同形态的微管网络 | 未探讨不同膜组成对微管形态影响的具体分子机制 | 模拟活细胞中的动态细胞骨架,探索膜组成对微管形态的影响 | 巨型聚合物-脂质杂化囊泡和微管 | 合成生物学 | NA | 原位聚合技术 | NA | 显微镜图像 | NA |
16 | 2025-05-18 |
Scaling Up Synthetic Cell Production Using Robotics and Machine Learning Toward Therapeutic Applications
2025-May, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202400671
PMID:40162738
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研究论文 | 本研究开发了一种自动化方法,用于大规模生产蛋白质合成细胞(SCs),以应用于治疗领域 | 结合机器人液体处理系统和AI图像分析,实现了SCs的大规模自动化生产和质量控制 | 研究主要关注蛋白质表达SCs,可能不适用于其他类型SCs的生产 | 提高合成细胞的生产效率和质量控制,以促进其治疗应用 | 蛋白质合成细胞(SCs) | 合成生物学 | NA | 机器人液体处理系统(LiHa)、AI图像分析 | AI | 图像 | 小鼠实验 |
17 | 2025-05-18 |
Integration of therapeutic cargo into the human genome with programmable type V-K CAST
2025-Mar-13, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-57416-2
PMID:40082411
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研究论文 | 该研究展示了如何将紧凑型V-K CAST系统重新用于人类细胞基因组中的可编程DNA整合 | 利用来自未培养微生物的紧凑型V-K CAST系统,实现了人类细胞基因组中治疗相关转基因的安全整合 | 脱靶事件虽罕见但可重复出现在特定基因组区域 | 开发一种无需双链断裂即可实现大片段DNA可编程整合的基因组编辑工具 | 人类细胞基因组 | 基因组编辑 | NA | CRISPR-associated (Cas) transposases (CAST) | type V-K CAST | DNA序列数据 | 多种人类细胞类型 |
18 | 2025-05-18 |
A tunable affinity fusion tag for protein self-assembly
2025-Jan-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.14.633037
PMID:39868245
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research paper | 介绍了一种基于可调淀粉样蛋白的基因编码工具,用于精确控制细胞内蛋白质浓度阈值 | 发现了聚苏氨酸丙氨酸(poly-TA)因其独特的形成淀粉样组装的能力,可在任意选择的浓度阈值下形成组装体,且具有可忽略的成核障碍 | 未提及具体应用中的潜在限制或挑战 | 研究蛋白质浓度与活性之间的关系,开发实验工具以操纵蛋白质浓度阈值 | 蛋白质浓度阈值及其对细胞功能的影响 | 合成生物学 | NA | 基因编码工具,系统筛选二肽重复序列 | NA | NA | NA |
19 | 2025-05-18 |
Digital switching in a biosensor circuit via programmable timing of gene availability
2014-Dec, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/nchembio.1680
PMID:25306443
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研究论文 | 本文介绍了一种通过编程控制基因可用性时间来实现生物传感器电路中数字切换的新方法 | 利用位点特异性重组酶通过编程控制基因可用性时间,显著提高了多基因电路的稳健性 | NA | 开发更稳健的合成生物学基因电路 | 内源性microRNA的比例传感器 | 合成生物学 | NA | 位点特异性重组酶技术 | NA | 基因表达数据 | NA |
20 | 2025-05-17 |
Expression of Fluorescence Reporters and Natural Products in Native Gut Escherichia coli
2025-May-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00835
PMID:40138712
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研究论文 | 本研究利用CRAGE技术对天然肠道大肠杆菌EcAZ-1和益生菌株EcN进行基因工程改造,成功表达了多种异源基因并优化了荧光蛋白的表达条件 | 首次在天然肠道大肠杆菌中成功表达生物发光操纵子、GFP和氧不依赖荧光蛋白IFP2.0,并优化了其表达条件,同时实现了生物活性化合物的生物合成 | 研究仅针对两种大肠杆菌菌株,未涉及其他肠道微生物 | 开发基于天然肠道大肠杆菌的合成生物学平台 | 肠道大肠杆菌EcAZ-1和益生菌株Nissle 1917 (EcN) | 合成生物学 | NA | CRAGE技术 | NA | NA | 两种大肠杆菌菌株(EcAZ-1和EcN) |