本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['synthetic biology']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价9.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-04-04 |
Reset-free DNA logic circuits for real-time input processing and memory
2026-Apr-03, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aeb1699
PMID:41921006
|
研究论文 | 本研究提出了一种基于趾介导链反应的无复位DNA逻辑电路,实现了实时输入处理和记忆功能 | 采用无复位方法,通过趾介导链反应实现双轨单元内的连续可逆链迁移,并利用二维DNA折纸模板定位组件,构建了组合逻辑门和记忆元件 | NA | 开发无复位的DNA逻辑电路,以支持实时数据处理和记忆功能 | DNA逻辑电路,包括组合逻辑门(如AND和OR门)和记忆元件(如置位复位和数据锁存器) | 合成生物学 | NA | 趾介导链反应,DNA折纸技术 | NA | NA | NA | NA | NA | 双轨单元、组合逻辑门(AND和OR门)、记忆元件(置位复位和数据锁存器)、级联寄存器 | 生物传感、诊断、合成生物学 |
| 2 | 2026-04-04 |
Current Progress of Natural Product Export by Yeast
2026-Apr-02, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c08982
PMID:41926336
|
综述 | 本文综述了利用酵母缓解天然产物胞内积累所致代谢负担、从而提高其合成效率的最新进展 | 聚焦于通过缓解代谢负担(而非传统代谢工程)来增强酵母天然产物合成的策略,并系统总结了三种具体方法 | NA | 增强微生物细胞工厂中天然产物的合成效率 | 酵母(酿酒酵母等)及其合成的天然产物(重点关注萜类) | 合成生物学 | NA | 代谢工程、转运蛋白过表达与改造、膜结构改造、原位提取 | NA | NA | NA | NA | 酵母(酿酒酵母等) | NA | 工业生物技术 |
| 3 | 2026-04-04 |
NUPACK: Computational Nucleic Acid Analysis and Design
2026-Apr-02, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00817
PMID:41926704
|
研究论文 | 介绍NUPACK软件套件,用于核酸结构、设备和系统的分析与设计 | NUPACK 4引入了增强的物理模型、显著的速度提升、大规模复合物处理能力以及混合材料和序列约束设计 | NA | 开发计算工具以支持核酸纳米技术、分子编程和合成生物学领域的研究 | 核酸结构、设备和系统 | 合成生物学 | NA | 计算分析 | NA | 核酸序列数据 | NA | NA | NA | 动态杂交级联反应路径工程和结构工程,包括假结可能性 | 医学, 工业生物技术 |
| 4 | 2026-04-04 |
Food production from air: gas precision fermentation with hydrogen-oxidising bacteria
2026-Apr, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.08.003
PMID:40930898
|
研究论文 | 本文探讨了利用氢氧化细菌通过气体发酵从空气中生产食物的技术路径 | 提出将氢氧化细菌工程化为细胞工厂,用于精密发酵,超越单一细胞蛋白生产,并以重组乳蛋白分泌为案例研究 | NA | 开发可持续、独立于农业的食物生产方式,实现碳中和与碳捕获 | 氢氧化细菌(HOBs) | 合成生物学 | NA | 气体发酵、合成生物学、代谢工程、计算建模 | NA | NA | NA | 合成生物学、代谢工程 | 氢氧化细菌 | 细胞工厂设计,用于精密发酵与重组蛋白分泌 | 食品、工业生物技术 |
| 5 | 2026-04-04 |
Are amyloid-based materials conducive to tissue engineering?
2026-Apr, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.08.009
PMID:40975651
|
综述 | 本文综述了基于淀粉样蛋白的生物材料在组织工程中的应用潜力,包括其作为细胞培养支架、伤口愈合和类器官开发的材料 | 强调了淀粉样蛋白的独特性质(如稳定性、机械强度和结构多样性)与结构及合成生物学进展的结合,使其成为创新生物材料的有前景候选者 | NA | 探讨淀粉样蛋白基材料在组织工程中的适用性和应用前景 | 淀粉样蛋白原纤维及其作为生物材料的特性 | NA | 阿尔茨海默病, 帕金森病 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 生物技术 |
| 6 | 2026-04-04 |
Fighting citrus Huanglongbing with evolutionary principles
2026-Apr, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2025.11.004
PMID:41330792
|
综述 | 本文综述了基于进化原理的害虫管理策略,并结合人工智能和合成生物学技术,以柑橘黄龙病为例,探讨了可持续农业解决方案 | 提出了进化信息害虫管理(EIPM)框架,将进化原理与人工智能、合成生物学相结合,用于设计持久的生物防治工具 | NA | 开发可持续的农业害虫管理策略,特别是针对柑橘黄龙病 | 柑橘黄龙病(HLB)及其防治 | 农业生物技术 | 柑橘黄龙病 | 人工智能、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业 |
| 7 | 2026-04-04 |
Discovery, characterization, and application of chromosomal integration sites in the hyperthermophilic archaeon Sulfolobus islandicus
2026-Apr, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.11.003
PMID:41330849
|
研究论文 | 本研究系统性地鉴定并表征了嗜热古菌Sulfolobus islandicus中的染色体整合位点,并利用CRISPR-Cas系统实现了外源基因的整合与表达 | 首次系统性地鉴定并表征了S. islandicus中的8个染色体整合位点,利用CRISPR-COPIES流程和多组学计算工作流程开发了13个人工CRISPR RNAs,并利用内源性CRISPR-Cas系统实现了基因整合 | 研究中发现整合位点存在显著的位置效应,可能影响外源基因的表达效率 | 扩展S. islandicus的遗传工具,推动其作为古菌合成生物学和工业生物技术平台的潜力 | 嗜热古菌Sulfolobus islandicus | 合成生物学 | NA | CRISPR-COPIES流程、多组学计算工作流程、β-半乳糖苷酶测定 | NA | 多组学数据 | NA | CRISPR-Cas | Sulfolobus islandicus | 基因整合系统 | 工业生物技术 |
| 8 | 2026-04-04 |
Techno-economic assessment-guided biofoundry for microbial strain development
2026-Apr, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.11.002
PMID:41330850
|
研究论文 | 本文提出了一种基于实验价格指数(EPI)和机器人辅助模块(RAM)的标准化方法,用于评估和优化生物铸造厂中的自动化工作流程,以提高微生物菌株开发的经济效率 | 引入了实验价格指数(EPI)作为结合时间和成本的标准化指标来量化自动化工作流程效率,并提出了机器人辅助模块(RAM)作为即插即用单元来构建工作流程 | 未明确说明该方法在不同类型生物技术应用中的普适性验证程度,也未详细讨论实际部署中可能遇到的技术或操作挑战 | 开发一种标准化方法来评估和优化生物铸造厂中自动化工作流程的经济效率,以加速微生物菌株开发 | 生物铸造厂中的自动化工作流程,特别是用于微生物菌株开发的四个工作流程:gRNA克隆、基因组编辑、DNA组装和样品分析 | 合成生物学 | NA | 设计-构建-测试-学习(DBTL)工作流程、机器人辅助自动化 | NA | 实验时间和成本数据 | NA | CRISPR-Cas9(用于基因组编辑)、DNA组装技术 | 微生物(具体种类未指定) | NA | 工业生物技术 |
| 9 | 2026-04-04 |
Molecular approaches to increasing plant root carbon
2026-Apr, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2025.11.006
PMID:41353042
|
综述 | 本文综述了通过分子途径和合成生物学方法增加植物根系碳储存以应对温室气体问题的策略 | 探讨利用合成生物学工程化作物根系以增强地下碳储存的创新分子途径 | 增加根系碳分配可能面临产量降低的挑战,且根系碳储存效果需进一步测试验证 | 研究如何通过分子和合成生物学方法提高植物根系碳含量,以促进碳封存 | 植物根系,特别是作物植物 | 合成生物学 | NA | 分子途径工程,合成生物学方法 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 作物植物 | NA | 环境,农业 |
| 10 | 2026-04-04 |
Yeast-based green nanoparticle synthesis: past, present and future in nanomedicine
2026-Apr, Nanomedicine (London, England)
DOI:10.1080/17435889.2026.2642296
PMID:41797356
|
综述 | 本文综述了酵母基绿色纳米颗粒合成的历史进展、当前生物医学应用及未来在纳米医学中的潜力 | 强调酵母作为生物平台在纳米颗粒生产中的优势,包括其稳健性、遗传可操作性、可扩展性和安全性,并展望合成生物学和生物过程工程的未来发展方向 | 临床转化仍受限于标准化、GMP合规生产的需求,以及毒性、免疫原性评估和明确监管框架的缺乏 | 探讨酵母基绿色纳米颗粒合成在纳米医学中的应用和潜力 | 酵母衍生的纳米颗粒,特别是银、金和硒纳米颗粒 | NA | 癌症 | 绿色合成、遗传工程、生物合成 | NA | NA | NA | 遗传工程 | 酵母 | NA | 医学 |
| 11 | 2026-04-04 |
A reversible small-molecule-switchable self-amplifying RNA expression platform
2026-Apr, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.151436
PMID:41839281
|
研究论文 | 本研究开发了一种可逆的小分子开关自扩增RNA表达平台,用于精确调控基因表达 | 首次将自扩增RNA设计为可编程基因电路,实现小分子控制的基因表达开关,并整合多重调控模块实现独立可逆调控 | NA | 开发可控的RNA治疗和合成生物学应用平台 | 自扩增RNA构建体及其在基因表达调控中的应用 | 合成生物学 | NA | RNA工程、脂质纳米颗粒封装 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 哺乳动物细胞 | 可编程RNA基因电路,包含多重调控模块如去稳定化结构域、RNA结合蛋白、四环素响应阻遏蛋白和k-turn RNA基序 | 医学 |
| 12 | 2026-04-04 |
Enzymatic and microbial routes to bioplastics: The green chemistry frontier of biopolymers
2026-Apr, FEBS open bio
IF:2.8Q3
DOI:10.1002/2211-5463.70241
PMID:41891232
|
综述 | 本文全面综述了通过微生物和酶法生产生物塑料(特别是聚羟基脂肪酸酯)的代谢途径、结构特性及新兴技术创新 | 重点探讨了体外酶法合成PHA的最新进展,包括PHA合酶工程、无细胞代谢工程平台、酶固定化和表面展示策略,以实现完全可编程和模块化的聚合 | NA | 为在循环生物经济框架内实现可扩展、可定制且环境友好的酶法生物塑料提供战略方向 | 生物塑料,特别是聚羟基脂肪酸酯(PHA) | NA | NA | 体外酶法合成、无细胞代谢工程、酶固定化 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 细菌 | PHA生物合成途径 | 环境, 工业生物技术 |
| 13 | 2026-04-04 |
Structures of pentatricopeptide repeat proteins
2026-Apr-01, Acta crystallographica. Section F, Structural biology communications
DOI:10.1107/S2053230X26002311
PMID:41919993
|
综述 | 本文系统综述了已解析的pentatricopeptide repeat (PPR)蛋白晶体结构,分析了其结晶学特性、结构特征及其对理解PPR功能的作用 | 首次对PPR蛋白的所有晶体结构进行全面编目和综合分析,揭示了PPR识别密码、RNA结合时的构象变化以及模块化结构基础 | NA | 系统整理和分析PPR蛋白的晶体结构数据,以促进对其结构和功能的理解 | PPR蛋白的晶体结构(包括天然和设计蛋白) | 结构生物学 | NA | 晶体学、冷冻电镜 | NA | 结构数据 | 113个PPR蛋白结构(30个PPR和83个核糖体PPR结构) | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 14 | 2026-04-04 |
Microbial and synthetic biology solutions for waste management and biomanufacturing off Earth
2026-Mar-31, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103491
PMID:41930789
|
综述 | 本文探讨了利用微生物和合成生物学技术将太空任务中的废物转化为有价值资源,以支持可持续性和减少对地球依赖的生物技术策略 | 提出了在微重力、有限空间条件下,利用工程化极端微生物和生物制造平台将废物转化为营养素、生物气体、金属和药品的创新解决方案,为建立自给自足的太空栖息地提供可扩展模型 | NA | 开发用于太空废物管理和资源回收的生物技术策略,以支持长期太空任务和地外定居的可持续性 | 国际空间站及未来火星任务中的废物处理与资源转化 | 合成生物学 | NA | 生物废物分解、生物采矿、工程化极端微生物、生物制造平台 | NA | NA | NA | NA | 工程化极端微生物 | 再生生命支持系统、物质闭环生物再生生命支持系统 | 环境, 工业生物技术 |
| 15 | 2026-04-04 |
Engineering cis- and trans-acting RNA regulators for next-generation prokaryotic synthetic biology
2026-Mar-30, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108882
PMID:41921585
|
综述 | 本文综述了顺式和反式RNA调控元件在下一代原核合成生物学中的应用,旨在使RNA调控成为可工程化的常规层 | 提出了以工程师为导向的框架,围绕转录终止、翻译起始和mRNA稳定性三个可操作控制旋钮,并整合计算和AI辅助建模以提升可预测性和可移植性 | 主要基于大肠杆菌为中心的实施,可移植性可能受限,且未详细讨论所有细菌系统中的具体应用挑战 | 推动RNA调控作为原核合成生物学中复杂和响应性细菌系统构建的常规工程化层 | 顺式和反式RNA调控元件,包括5' UTR、RBS、核糖开关、核酶、合成小RNA和基于CRISPR的RNA靶向工具 | 合成生物学 | NA | RNA调控技术,包括CRISPR-based RNA-targeting | AI-assisted modeling | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 核糖开关、核酶、合成小RNA、基于CRISPR的RNA靶向工具,用于构建多基因网络中的逻辑门和生物传感器 | 工业生物技术 |
| 16 | 2026-04-04 |
Bioactive Peptides: Production Strategies, Biological Activities, and Emerging Therapeutic Applications
2026-Mar-26, Protein and peptide letters
IF:1.0Q4
|
综述 | 本文综述了生物活性肽的生产策略、生物活性及其新兴治疗应用,并整合了分子、生物技术和信息学驱动的视角 | 独特整合了当前分子、生物技术和信息学驱动的视角,提供了2024-2025年在生产策略、生物测定优化和治疗转化方面的最新进展综述 | 存在纯化困难、稳定性问题和生物利用度限制等挑战,限制了其广泛应用 | 探讨生物活性肽的生产策略、生物活性及其在疾病预防和治疗中的应用潜力 | 源自动物、植物和海洋生物等天然来源的短链氨基酸(生物活性肽) | NA | NA | 酶水解、微生物发酵、化学合成、重组方法、超滤、色谱、质谱、电泳 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药, 食品, 农业 |
| 17 | 2026-04-04 |
Advancing Africa's bioeconomy and biosolutions through microbial natural product discovery: unlocking indigenous microbe potential for sustainability
2026-Mar-25, Microbiology and molecular biology reviews : MMBR
IF:8.0Q1
DOI:10.1128/mmbr.00174-25
PMID:41384918
|
综述 | 本文综述了如何通过微生物天然产物发现,利用非洲本土微生物资源推动其生物经济发展和可持续生物解决方案的开发 | 整合了BV-BRC数据库分析与文献证据,首次系统梳理了非洲本土传统模型及新兴非模型细菌底盘菌株的基因组分布,为基于组学的生物解决方案开发提供了资源图谱 | 调查仅基于BV-BRC数据库数据,未能涵盖所有非洲微生物资源,且受限于数据库的覆盖范围和更新程度 | 推动非洲生物经济发展,通过微生物生物技术解决医疗、农业和工业生物技术领域的可持续性问题 | 非洲本土微生物资源,特别是细菌和病毒资源 | 工业生物技术 | NA | 基因组测序、功能组学、合成生物学 | NA | 基因组数据、文献数据 | 基于BV-BRC数据库的微生物基因组数据 | NA | 细菌(传统模型及新兴非模型底盘菌株) | NA | 医疗, 农业, 工业生物技术 |
| 18 | 2026-04-04 |
Quantification of cholesterol incorporation in giant unilamellar vesicles produced by a modified cDICE method
2026-Mar-25, Soft matter
IF:2.9Q2
DOI:10.1039/d5sm01124h
PMID:41801146
|
研究论文 | 本文提出了一种改进的cDICE方法,用于在巨型单层囊泡中量化胆固醇的掺入,利用荧光膜生物传感器进行非破坏性评估 | 使用甲基-β-环糊精-胆固醇复合物在eDICE方法中高效掺入胆固醇,并开发了基于荧光膜生物传感器的定量分析技术 | NA | 改进模型膜中胆固醇的掺入方法,以更好地模拟真核细胞膜的性质 | 巨型单层囊泡(GUVs)及其胆固醇掺入效率 | 膜生物物理学 | NA | 甲基-β-环糊精-胆固醇复合物递送、荧光膜生物传感器(如NR12A和Flipper-TR)、光谱成像、荧光寿命成像 | NA | 荧光图像数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、生物物理学 |
| 19 | 2026-04-04 |
Engineering sensor-based antithetic integral controllers for enhanced dynamic performance and noise attenuation
2026-Mar-18, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101512
PMID:41763220
|
研究论文 | 本文开发并分析了一种基于传感器的抗合成积分反馈控制器,通过将比例和积分作用嵌入最小遗传架构中,以增强动态性能和噪声衰减 | 在经典抗合成控制基序基础上进行单一修改,使sAIF架构固有地整合了比例反馈,无需额外电路,从而加快动态响应并抑制纯积分反馈典型的噪声放大 | NA | 设计高性能生物控制器,用于合成生物学、代谢工程和细胞疗法 | 传感器基抗合成积分反馈控制器 | 合成生物学 | NA | 内含肽介导的剪接 | NA | NA | NA | 内含肽介导的剪接 | 大肠杆菌 | 传感器基抗合成积分反馈控制器,整合比例和积分反馈 | 合成生物学, 代谢工程, 细胞疗法 |
| 20 | 2026-04-04 |
Advances in biocontainment strategies of engineered microbes for use in humans
2026-Mar-03, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2026.102727
PMID:41780106
|
综述 | 本文综述了用于人体应用的工程微生物的生物安全策略进展 | 全面讨论了多种生物安全策略的单独和组合应用,并强调了标准化测试的重要性 | NA | 评估和推进工程微生物在医学应用中的生物安全策略 | 基因工程微生物及其生物安全策略 | 合成生物学 | NA | CRISPR、毒素-抗毒素系统、非标准氨基酸等 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 工程微生物 | kill switches、auxotrophy、逻辑门、生物传感器 | 医学 |