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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-03-24 |
Advances in the combined treatment of solid tumors with nanodelivery systems based on engineered bacteria-TME modulation
2026-Jun, Colloids and surfaces. B, Biointerfaces
DOI:10.1016/j.colsurfb.2026.115558
PMID:41707370
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综述 | 本文综述了基于工程化细菌-TME调控与纳米递送系统的联合疗法在实体瘤治疗中的最新研究进展 | 聚焦于工程化细菌与纳米载体系统的联合应用,通过协同反馈机制实现精准递送、可控释放和多模式治疗,为克服传统疗法疗效有限、副作用大和耐药性等问题提供了新思路 | NA | 总结并探讨工程化细菌与纳米递送系统联合治疗实体瘤的研究进展与未来前景 | 实体瘤 | 合成生物学与纳米技术交叉领域 | 实体瘤 | 合成生物学、纳米技术 | NA | NA | NA | 合成生物学工具(文中未具体指定) | 工程化细菌(文中未具体指定菌种) | 具有原位定植、可编程修饰和靶向特性的工程化细菌,用于重塑肿瘤微环境、穿透屏障并激活免疫反应 | 医学 |
| 2 | 2026-03-24 |
Biomimetic Construction of Abiotic Membranes Through Acylation of Cationic Diamino Acids
2026-Mar-27, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202500978
PMID:41869751
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研究论文 | 本文提出了一种通过阳离子二氨基氨基酸的酰化来构建仿生非生物膜的简单模块化策略 | 利用二氨基氨基酸作为最小支架,通过单步羧酸盐与吉拉德试剂T的共轭引入三甲基铵头基,生成永久性胆碱样阳离子,随后在温和水条件下与益生元相关的硫酯进行N-酰化,产生具有经典磷脂拓扑结构的二酰化氨基酸GRT两亲物,这些非生物磷脂类似物能自发组装成明确的囊泡结构,并允许系统调节头基电荷和组成 | NA | 开发一种化学上多样化、功能可调的人工膜构建方法,以扩展合成生物学、原始细胞研究和分子传递的工具包 | 非生物磷脂类似物(APAs)及其自组装形成的囊泡结构 | 合成生物学 | NA | 羧酸盐共轭、N-酰化、自组装 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 原始细胞研究, 分子传递 |
| 3 | 2026-03-24 |
Tunable low-rate genomic recombination with Cre-lox in Escherichia coli: a versatile tool for anoxic environmental biosensing and synthetic biology
2026-Mar-23, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.01768-25
PMID:41870091
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研究论文 | 本文开发了一种在Escherichia coli中可调控的低速率Cre-lox基因组重组系统,用于环境生物传感和合成生物学应用 | 开发了紧密调控、可滴定剂量的Cre重组酶系统,实现低重组率和最小基础活性,并在质粒和染色体上实施,后者显示出跨代遗传记忆的优越保留 | NA | 开发一种用于环境生物传感和合成生物学的可调控基因组重组工具 | Escherichia coli细菌 | 合成生物学 | NA | Cre-lox重组系统 | NA | NA | NA | Cre-lox | Escherichia coli | 可调控的Cre重组酶系统,用于低速率基因组重组和遗传记忆记录 | 环境, 工业生物技术 |
| 4 | 2026-03-24 |
A century of vitamin E research: The innovative journey from basic biology to synthetic bio-manufacturing
2026-Mar-22, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.70235
PMID:41866783
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综述 | 本文回顾了维生素E研究一个世纪以来的进展,涵盖其化学组成、功能、生物合成途径及调控网络,并探讨了化学合成与生物技术合成策略 | 揭示了种子特异性酯酶VTE7在连接叶绿素降解与生育酚合成的直接植醇回收途径中的新发现,为代谢工程开辟了新可能性 | NA | 总结维生素E研究的百年历程,并展望未来研究方向,包括催化酶的智能进化、跨膜前体运输的阐明及稀有同系物的探索 | 维生素E的化学、生物学特性及其在植物生理和人类健康中的作用 | NA | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物平台 | NA | 医药、工业生物技术 |
| 5 | 2026-03-24 |
Magneto-Photonic Gene Circuit for Minimally Invasive Control of Gene Expression in Mammalian Cells
2026-Mar-17, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.5c13335
PMID:41867604
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研究论文 | 本文开发了一种结合磁和光刺激的基因电路,用于在哺乳动物细胞中实现微创控制基因表达 | 利用生物发光酶在细胞内直接产生光,并结合磁敏感蛋白设计分裂蛋白版本,实现由光和磁双重刺激激活的基因电路 | 未在深层组织或活体动物中验证其有效性,且磁刺激强度(50 mT)可能限制其在某些应用中的穿透性 | 开发一种无需外部光源的基因表达控制系统,以克服光遗传学系统中光传递效率低的限制 | 哺乳动物细胞 | 合成生物学 | NA | 蛋白工程、分子生物学、光遗传学、磁刺激技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 哺乳动物细胞 | 结合生物发光酶和光敏感转录因子的基因电路,以及由磁刺激驱动的分裂蛋白重构系统 | 医学、基因治疗 |
| 6 | 2026-03-24 |
Amodiaquine Enhances Anti-Melanoma Efficacy of Attenuated Salmonella via Targeting Glutathione Reductase in Neutrophils
2026-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202515009
PMID:41588921
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研究论文 | 本研究揭示了阿莫地喹通过靶向中性粒细胞中的谷胱甘肽还原酶,增强减毒沙门氏菌VNP20009的抗黑色素瘤疗效 | 首次发现VNP20009招募的中性粒细胞主要为促肿瘤N2亚型,并鉴定谷胱甘肽还原酶为关键靶点,开发了结合药物重定位与合成生物学的微环境智能治疗策略 | 研究主要聚焦于黑色素瘤模型,在其他肿瘤类型中的普适性有待验证 | 探究中性粒细胞在减毒沙门氏菌抗肿瘤治疗中的作用机制,并开发增强疗效的联合治疗策略 | 黑色素瘤小鼠模型、减毒沙门氏菌VNP20009、中性粒细胞 | 肿瘤免疫治疗 | 黑色素瘤 | 化学生物学方法、shRNA基因工程 | NA | 实验数据 | NA | shRNA载体构建 | 减毒沙门氏菌VNP20009 | 负载GR-shRNA的工程菌株 | 医学 |
| 7 | 2026-03-24 |
Engineering class I terpene synthases for skeletal diversity: strategies and applications
2026-01-28, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00066a
PMID:41369946
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综述 | 本文综述了工程化I类萜烯合酶以生成多样化萜烯骨架的策略与应用 | 整合了结构引导设计、进化方法、机制聚焦工程及活性位点外修饰等多种策略,并展望了机器学习与代谢工程等未来方向 | 萜烯合酶催化复杂性及序列-功能相关性弱带来了显著的工程挑战 | 工程化I类萜烯合酶以实现萜烯骨架的多样性,这是合成生物学的关键目标 | I类萜烯合酶 | 合成生物学 | NA | 结构引导设计、进化方法、机制聚焦工程、半理性与随机方法(如丙氨酸扫描、饱和诱变、定向进化)、计算建模、高通量筛选 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | NA | NA | 医药、农业、香料工业 |
| 8 | 2026-03-24 |
Automated workflow for genotyping individual transposon library variants
2026-Jan-12, BMC methods
DOI:10.1186/s44330-025-00054-3
PMID:41869086
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研究论文 | 本文介绍了一种用于转座子插入库中个体变异基因分型的自动化工作流程,利用开源OT-2液体处理器和自定义Python包进行测序结果注释 | 开发了模块化、标准化的自动化协议,结合开源液体处理器和自定义软件,提高了基因分型的可靠性和可重复性,同时减少了人工操作时间和错误 | 工作流程的吞吐量受液体处理器平台容量限制,可通过多次运行或多台设备并行处理来扩展 | 旨在简化转座子库中个体克隆的基因分型过程,提高基因组工程和合成生物学研究的高通量筛选效率和可重复性 | 转座子插入库中的个体变异,以恶臭假单胞菌KT2440为例 | 合成生物学 | NA | 转座子插入库构建、PCR检测、测序分析 | NA | 测序数据 | 46个变异体,其中40个成功鉴定 | OT-2液体处理器、自定义Python包 | 恶臭假单胞菌KT2440 | NA | 工业生物技术 |
| 9 | 2026-03-24 |
Challenges and opportunities beyond antibody-drug conjugates: Toward a new era of programmable therapeutic proteins
2026-01-01, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.153018
PMID:41297517
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综述 | 本文综述了抗体-药物偶联物(ADCs)的当前成就与未解决问题,并强调了基于全基因编码蛋白质构建体的创新方向,特别是双功能嵌合蛋白,为下一代蛋白质治疗药物奠定基础 | 强调双功能嵌合蛋白作为ADCs的替代方案,结合支架靶向域和肽衍生细胞毒性模块,具有高选择性、紧凑结构、低免疫原性和细菌表达兼容性,并利用合成生物学、展示系统和机器学习加速优化 | NA | 探索超越ADCs的可编程治疗蛋白质,以解决其成本高、生产系统依赖、分子异质性、系统毒性和治疗窗口窄等局限性 | 抗体-药物偶联物(ADCs)及其替代方案,特别是双功能嵌合蛋白质构建体 | 个性化医疗 | 肿瘤学 | 合成生物学、展示系统、机器学习 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | NA | 医学 |
| 10 | 2026-03-24 |
Using Embodied Artificial Intelligence Agents to Automate Biorisk Management Tasks in High-Containment Laboratories
2025-Dec, Applied biosafety : journal of the American Biological Safety Association
IF:0.5Q4
DOI:10.1089/apb.2024.0068
PMID:41868755
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研究论文 | 本文探讨了在高级别生物安全实验室中,利用人工智能代理自动化生物风险管理任务,以提升安全性和效率 | 提出了一种结合机器学习风险预测模型与具身AI代理的集成系统,用于自动化物理防护任务,减少人为错误和暴露风险 | NA | 通过AI技术增强高级别生物安全实验室的生物风险管理框架,实现安全与效率的优化 | 高级别生物安全实验室中的生物风险管理任务 | 机器学习 | NA | 机器学习、预测风险建模、异常检测 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 11 | 2026-03-24 |
Biomimetic nanovaccines with self-adjuvant effects induced broad-spectrum neutralizing antibodies against SARS-CoV-2 infection in rodents
2025-11-25, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.00315-25
PMID:41070969
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研究论文 | 本研究利用合成生物学技术开发了一种具有自佐剂效应的仿生纳米疫苗,旨在诱导广谱中和抗体以预防SARS-CoV-2感染 | 采用负载SARS-CoV-2 RBD蛋白的树枝状介孔有机硅纳米颗粒(DMOSN)构建仿生纳米疫苗,该疫苗能显著促进树突状细胞向次级淋巴器官募集,并同时诱导强大的体液免疫和Th1/Th2偏向的细胞免疫应答 | 研究仅在啮齿动物模型中进行,尚未在人体中验证其安全性和有效性 | 开发能够应对当前和未来SARS-CoV-2变体的下一代广谱疫苗平台 | SARS-CoV-2病毒及其变体 | 合成生物学 | COVID-19 | 合成生物学技术、纳米颗粒制备技术 | NA | NA | 啮齿动物模型 | NA | NA | NA | 医学 |
| 12 | 2026-03-24 |
Decoding the Minimal Translation System of the Plasmodium falciparum Apicoplast: Essential tRNA-modifying Enzymes and Their Roles in Organelle Maintenance
2025-Aug-15, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2025.169156
PMID:40335414
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研究论文 | 本研究通过鉴定恶性疟原虫顶质体中tRNA修饰酶的最小集合,揭示了其在顶质体维持和寄生虫生存中的关键作用 | 首次系统性地鉴定了恶性疟原虫顶质体中tRNA修饰酶的最小必需集合,并发现所有必需酶均集中在tRNA反密码子环的修饰上 | 有两个基因无法被敲除,其中一个可能具有顶质体外的必需功能,另一个可能具有代谢旁路无法替代的关键作用 | 研究恶性疟原虫顶质体最小翻译系统中tRNA修饰酶的作用及其在细胞器维持中的功能 | 恶性疟原虫顶质体中的tRNA修饰酶 | 合成生物学 | 疟疾 | 比较基因组学、蛋白质定位预测、基因敲除技术 | NA | 基因组数据、蛋白质定位数据 | NA | 基因敲除工具 | 恶性疟原虫 | NA | 医学 |
| 13 | 2026-03-24 |
Biocomputation: Moving Beyond Turing with Living Cellular Computers
2024-Jun, Communications of the ACM
IF:11.1Q1
DOI:10.1145/3635470
PMID:41867488
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综述 | 本文探讨了利用合成生物学技术构建具有计算能力的活细胞计算机,并倡导结合理论计算机科学来拓展超越传统图灵计算的可能性 | 提出将理论计算机科学与合成生物学相结合,探索活细胞系统的完整计算潜力,超越当前以组合功能为主的编程范式 | 活细胞计算机的计算极限仍在探索中,尚未完全解决状态计算处理、问题解决类别和基因调控复杂性等非平凡问题 | 推动活细胞计算机的发展,超越传统图灵计算,探索合成生物系统的计算边界 | 经过基因工程改造的活细胞(如细菌)及其计算能力 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、基因工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 细菌 | 逻辑门、生物传感器、代谢通路 | 医学, 环境 |
| 14 | 2026-03-23 |
Modular metabolic engineering of Yarrowia lipolytica and semi-rational design of CYP716A520 for enhanced betulinic acid biosynthesis
2026-Jun, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.134364
PMID:41802472
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研究论文 | 本研究通过模块化代谢工程改造Yarrowia lipolytica,并结合半理性设计优化CYP716A520酶,以增强桦木酸(betulinic acid)的生物合成 | 首次在Yarrowia lipolytica中通过模块化代谢工程将角鲨烯产量提升813倍,并采用结合计算工具与进化信息的半理性设计策略,成功优化植物来源的P450酶CYP716A520,其L359V变体活性和特异性分别提高4倍和3倍 | 未在摘要中明确提及具体局限性,但可能涉及微生物宿主中植物P450酶的适应性挑战或规模化生产的潜在问题 | 开发可持续且成本效益高的桦木酸微生物生产方法,以替代传统的植物提取 | Yarrowia lipolytica酵母和植物来源的P450酶CYP716A520 | 合成生物学 | NA | 模块化代谢工程、半理性设计、分子动力学模拟 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9(可能涉及,但未在摘要中明确指定,因此输出NA) | Yarrowia lipolytica | 代谢途径工程,包括角鲨烯前体供应路径和P450酶催化系统 | 医药 |
| 15 | 2026-03-23 |
Vacuum and Sonication Treatment Enable Efficient Transient Gene Expression in Various Monocot and Eudicot Plant Seedlings
2026-Mar-22, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00855
PMID:41865287
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研究论文 | 本文介绍了一种名为VAST(真空和超声辅助瞬时转化)的瞬时基因表达方法,通过优化植物生长条件并结合真空渗透和超声预处理,显著提高了多种单子叶和双子叶植物幼苗的基因表达效率 | VAST方法结合了真空和超声处理,相比现有方法,在提高瞬时基因表达效率的同时减少了组织损伤,并扩展了适用的植物物种范围 | NA | 开发一种高效、通用的瞬时基因表达方法,以促进功能基因组学、合成生物学和生物技术研究 | 多种单子叶和双子叶植物幼苗,包括番茄、谷子、柳枝稷、玉米和小麦等关键作物物种 | 合成生物学 | NA | 瞬时基因表达、真空渗透、超声处理 | NA | NA | NA | NA | 番茄、谷子、柳枝稷、玉米、小麦等植物幼苗 | NA | 农业、生物技术 |
| 16 | 2026-03-23 |
Membrane-Based Assembly and Interactions in Immune Receptors
2026-Mar-22, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.5c00993
PMID:41865294
|
综述 | 本文综述了免疫受体在脂质双层中的分子组装原理和结构基序,重点关注其跨膜域相互作用和模块化设计 | 系统总结了免疫受体跨膜域特异性相互作用的分子机制,并指出这些原理可应用于合成生物学 | NA | 理解免疫受体的组装机制及其跨膜相互作用在结构和功能中的作用 | 免疫受体及其跨膜蛋白复合物 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 17 | 2026-03-23 |
Next-generation strategies for PLA degradation: microbial consortia, metagenomics, enzyme engineering and AI-guided approaches
2026-Mar-21, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-026-04726-8
PMID:41863619
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综述 | 本文综述了增强聚乳酸(PLA)生物降解的微生物和生物技术策略的最新进展,包括微生物群落筛选、宏基因组学、酶工程和人工智能引导方法 | 强调了将生态筛选与计算酶工程相结合的多学科策略,特别是利用人工智能进行结构预测和机器学习平台设计高性能PLA降解酶 | NA | 加速聚乳酸在工业堆肥、废水处理和生物修复中的降解,推动可持续的PLA废物管理 | 聚乳酸(PLA)及其在各种生态系统中的生物降解过程 | NA | NA | 宏基因组学、环境DNA(eDNA)工具、定向进化、人工智能(AI)结构预测、机器学习 | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 环境, 工业生物技术 |
| 18 | 2026-03-23 |
CRISPR-enhanced microalgae biosynthesis: a promising approach for future functional feed ingredients
2026-Mar-20, Journal of animal science and biotechnology
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s40104-026-01367-1
PMID:41857689
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综述 | 本文综述了利用CRISPR系统增强微藻生物合成以生产功能性饲料成分的当前应用、构建策略及未来展望 | 重点探讨了基于CRISPR的基因组编辑技术在优化微藻营养特性方面的突破性进展 | NA | 通过合成生物学策略提升微藻细胞工厂的生产力,以满足日益增长的功能性饲料原料市场需求 | 微藻及其合成的高价值生物活性化合物(如优质蛋白质、多不饱和脂肪酸、色素和维生素) | 合成生物学 | NA | CRISPR系统、基因组编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 微藻 | 微藻细胞工厂中的关键通路节点优化 | 农业, 食品 |
| 19 | 2026-03-23 |
Synthetic biology-engineered immunotherapies: Precision control of immune responses
2026-Mar-19, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108871
PMID:41864375
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综述 | 本文综述了合成生物学在精准免疫治疗中的应用,通过工程化可编程细胞系统来克服传统免疫疗法的局限性 | 利用合成生物学设计可编程的免疫回路,实现逻辑门控激活和反馈控制的细胞因子分泌等上下文依赖功能,提高治疗的特异性和可调性 | 临床转化仍面临特异性不足、信号失调和异质性反应等挑战,可能导致毒性和耐药性 | 探讨合成生物学如何通过工程化细胞系统来推进精准免疫治疗,以最大化疗效并最小化脱靶效应 | 免疫疗法在癌症、感染和自身免疫性疾病中的应用,特别是合成生物学设计的免疫回路 | 合成生物学 | 癌症、自身免疫性疾病 | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 哺乳动物细胞 | 合成免疫回路,包括设计的受体、模块化信号电路和逻辑门控激活、反馈控制的细胞因子分泌 | 医学 |
| 20 | 2026-03-23 |
Repositioning the Leader Peptide in Graspetide Biosynthesis
2026-Mar-18, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c21135
PMID:41789461
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研究论文 | 本研究通过重新定位前导肽序列在graspetide生物合成中的位置,探索了合成生物学中组合酶法生成非天然产物的策略 | 通过将前导肽序列从N端重新定位到C端,保留了graspetide合成酶ThfB的底物选择性修饰能力,并实现了两种不同家族酶(套索肽和graspetide)对嵌合RiPP产物的共同修饰 | 前导肽重新定位后,酶修饰速率降低了约2倍,可能影响合成效率 | 旨在通过工程化前导肽序列,扩展核糖体合成和翻译后修饰肽(RiPPs)的结构多样性,生成自然界中未见的机械互锁肽产物 | 以fuscimiditide前体肽为研究对象,聚焦其前导肽序列的重新定位及其对graspetide合成酶ThfB功能的影响 | 合成生物学 | NA | 酶法重组、前导肽工程、翻译后修饰分析 | NA | 生化实验数据 | NA | 前导肽工程策略 | NA | 通过重新定位前导肽序列,设计嵌合RiPP生物合成途径,实现套索肽和graspetide家族酶的共同修饰 | 工业生物技术 |