合成生物学相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
1	2025-04-02	Cryo-EM structure of cyanopodophage A4 reveals a pentameric pre-ejectosome in the double-stabilized capsid 2025-Apr-08, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1 DOI:10.1073/pnas.2423403122 PMID:40163721	研究论文	本文报道了蓝藻噬菌体A4的完整结构，揭示了其双稳定衣壳中的五聚体预喷射体结构	首次发现蓝藻噬菌体A4衣壳核心存在由四个喷射蛋白组成的五聚体预喷射体结构，并提出了噬菌体的DNA包装和喷射机制	研究主要基于结构观察，具体的分子机制仍需进一步实验验证	探究蓝藻噬菌体A4的结构特征及其基因组喷射机制	蓝藻噬菌体A4	结构生物学	NA	冷冻电镜(Cryo-EM)	NA	冷冻电镜图像	单个蓝藻噬菌体A4颗粒
2	2025-04-02	Scaling Up Synthetic Cell Production Using Robotics and Machine Learning Toward Therapeutic Applications 2025-Mar-31, Advanced biology IF:3.2Q3 DOI:10.1002/adbi.202400671 PMID:40162738	research paper	本研究开发了一种自动化方法，用于大规模生产具有治疗应用潜力的合成细胞（SCs），并通过机器学习和机器人技术优化了生产过程	结合机器人液体处理系统和自动化组织解离器，显著提高了合成细胞的生产效率和规模，同时利用AI图像分析实现了高质量、高通量的SC表征	研究主要聚焦于蛋白质表达的SCs，可能不适用于其他类型的合成细胞	开发自动化方法以提高合成细胞的生产效率和规模，用于治疗应用	合成细胞（SCs）	synthetic biology	NA	robotic liquid handling system, automated tissue dissociator, AI-based image analysis	AI-based image analysis	image	mice administered with large-scale luciferase-expressing SCs
3	2025-04-02	Unraveling the potential of bioengineered microbiome-based strategies to enhance cancer immunotherapy 2025-Mar-28, Microbiological research IF:6.1Q1 DOI:10.1016/j.micres.2025.128156 PMID:40158322	综述	本文综述了生物工程微生物组策略在增强癌症免疫治疗中的潜力	探讨了通过合成生物学方法改造微生物以增强抗肿瘤活性和免疫治疗效果的创新策略	存在遗传稳定性、有效肿瘤定植和潜在安全性问题等挑战	探索微生物组在癌症免疫治疗中的作用及其工程化应用的潜力	胃肠道和肿瘤内的微生物群落	合成生物学	癌症	合成生物学技术	NA	NA	NA
4	2025-04-02	Regulatory and Catalytic Domains of Poly(ADP-ribose) Polymerases Cross-Complement for DNA-Break-Dependent Allosteric Stimulation of Catalytic Activity 2025-03-21, ACS chemical biology IF:3.5Q2 DOI:10.1021/acschembio.4c00582 PMID:39935093	research paper	该研究探讨了不同来源的PARPs（聚ADP-核糖聚合酶）的调节域（REG）和催化域（CAT）是否可以交叉互补组装成功能性嵌合体，并研究了这些嵌合体的酶活性和结合特性	首次展示了不同PARPs的REG和CAT可以跨物种交叉互补组装成功能性嵌合体，并揭示了atPARP2的CAT具有独特的互补能力	研究仅限于体外实验，尚未在活细胞中验证这些嵌合体的功能	探究PARPs调节域和催化域的交叉互补性及其分子机制	来自哺乳动物（hPARP1和hPARP2）、植物（atPARP2）和细菌（haPARP）的PARPs蛋白	分子生物学	NA	酶活性测定、结合研究	NA	生化实验数据	多种PARP蛋白的REG和CAT结构域
5	2025-04-02	Poplar transformation with variable explant sources to maximize transformation efficiency 2025-01-08, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-81235-y PMID:39779752	研究论文	本研究通过比较杨树不同外植体来源的再生和转化效率，探索了提高植物转化效率的新方法	发现根外植体具有显著的再生能力和转化适应性，并揭示了与高再生和转化效率相关的候选基因	研究仅针对杨树这一种生物能源作物，未涉及其他重要作物物种	提高植物转化效率，优化合成生物学中的设计-构建-测试-学习循环	杨树的不同外植体（叶、茎、叶柄和根）	植物生物技术	NA	农杆菌介导的植物转化技术	NA	转录组数据	多种杨树外植体类型（叶、茎、叶柄和根）
6	2025-04-02	Digital switching in a biosensor circuit via programmable timing of gene availability 2014-Dec, Nature chemical biology IF:12.9Q1 DOI:10.1038/nchembio.1680 PMID:25306443	研究论文	该研究展示了通过基因可用性的可编程时序控制，利用位点特异性重组酶纠正多基因电路中的不良效应，显著提高了内源性microRNA比例传感器的性能	通过可编程时序控制基因可用性，显著降低了传感器的基底泄漏，并实现了高达1000倍的动态范围提升	NA	提高合成生物学中基因电路的稳健性和性能	内源性microRNA比例传感器和多基因电路	合成生物学	NA	位点特异性重组酶技术	NA	基因表达数据	NA
7	2025-04-01	Advances in synthesizing plant-derived isoflavones and their precursors with multiple pharmacological activities using engineered yeasts 2025-Mar-29, Microbial cell factories IF:4.3Q1 DOI:10.1186/s12934-025-02692-2 PMID:40155940	综述	本文总结了特定异黄酮的药理特性、其生物合成途径以及在工程酵母中生产异黄酮的技术策略	利用合成生物学和先进的生物技术策略，实现生物活性异黄酮的环保生产	NA	探讨异黄酮及其前体的生物合成及其在食品、制药和化妆品工业中的应用	植物源性异黄酮及其前体	合成生物学	NA	工程酵母生物合成	NA	NA	NA
8	2025-04-01	Scaling-up molecular logic to meso-systems via self-assembly 2025-Mar-28, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-025-58379-0 PMID:40148329	research paper	该研究展示了通过自组装系统实现分子逻辑计算向介观系统的扩展	首次展示了自组装系统（由环芳烃八羧酸酯和阳离子表面活性剂组成）能够执行逻辑操作，其中膜本身表现为一个Reset-Set Flip-Flop，并集成了7个以上的逻辑元件	人工分子基介观系统在逻辑操作方面的应用仍然非常罕见	探索分子逻辑计算在介观系统中的应用	自组装系统（环芳烃八羧酸酯和阳离子表面活性剂）	合成生物学	NA	自组装技术	NA	NA	NA
9	2025-04-01	Protein-derived cofactors: chemical innovations expanding enzyme catalysis 2025-Mar-28, Chemical Society reviews IF:40.4Q1 DOI:10.1039/d4cs00981a PMID:40151987	综述	本文综述了蛋白质衍生辅因子的化学创新及其在扩展酶催化功能方面的作用	揭示了蛋白质衍生辅因子的多样性和其生物合成途径，以及它们在酶催化中的新功能和应用	对辅因子生物合成和功能的机制理解仍显不足，传统诱变方法可能干扰辅因子组装	探讨蛋白质衍生辅因子的化学创新及其在酶催化、生物催化和生物技术中的应用	蛋白质衍生辅因子及其在酶催化中的作用	生物化学	NA	非经典氨基酸位点特异性掺入、结构生物学、质谱、生物物理光谱学	NA	NA	NA
10	2025-04-01	CAR-T therapy dilemma and innovative design strategies for next generation 2025-Mar-27, Cell death & disease IF:8.1Q1 DOI:10.1038/s41419-025-07454-x PMID:40148310	综述	本文综述了CAR-T细胞疗法在血液肿瘤治疗中的显著效果及其面临的挑战，并介绍了跨学科创新技术以克服当前CAR-T细胞疗法的主要障碍	提出了基于合成生物学的ON/OFF开关、生物指导支架、纳米材料、溶瘤病毒、CRISPR筛选、肠道微生物群及其代谢物等跨学科策略，以设计下一代CAR-T细胞	未提及具体的临床试验数据或样本量，可能缺乏实证支持	克服当前CAR-T细胞疗法在肿瘤免疫治疗中的主要障碍，设计下一代CAR-T细胞	CAR-T细胞疗法及其在肿瘤免疫治疗中的应用	肿瘤免疫治疗	血液肿瘤	合成生物学、CRISPR筛选、纳米材料、溶瘤病毒等	NA	NA	NA
11	2025-04-01	Current advances in microalgae-based fucoxanthin production and downstream processes 2025-Mar-27, Bioresource technology IF:9.7Q1 DOI:10.1016/j.biortech.2025.132455 PMID:40157580	综述	本文综述了微藻基岩藻黄素生产的当前进展及其下游工艺	探讨了包括自养、异养和混合营养方法在内的不同培养系统，以及超临界流体提取、超声波辅助提取和微波辅助提取等提取方法的效率和环境影响，同时提出了合成生物学和CRISPR基因修饰在增强岩藻黄素生物合成中的潜力	面临成本、可扩展性和监管限制等挑战	探讨微藻基岩藻黄素生产的可持续性和成本效益	微藻（如三角褐指藻）和岩藻黄素	生物技术	NA	超临界流体提取、超声波辅助提取、微波辅助提取、CRISPR基因修饰	NA	NA	NA
12	2025-04-01	A review of MicroRNAs and flavonoids: New insights into plant secondary metabolism 2025-Mar-27, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1 DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.142518 PMID:40157676	综述	本文综述了MicroRNAs与黄酮类化合物在植物次生代谢中的新见解	提出了'miRNA-多因素协同网络'概念，并探讨了利用人工miRNA设计、CRISPR/Cas技术及人工智能优化黄酮类代谢的新策略	NA	理解和改善黄酮类代谢，为代谢工程提供理论框架和技术路线	MicroRNAs与黄酮类化合物	植物代谢工程	NA	CRISPR/Cas, 合成生物学, 多组学技术, 人工智能	NA	NA	NA
13	2025-04-01	The Transformation Experiment of Frederick Griffith I: Its Narrowing and Potential for the Creation of Novel Microorganisms 2025-Mar-20, Bioengineering (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/bioengineering12030324 PMID:40150788	research paper	本文探讨了弗雷德里克·格里菲斯的转化实验的局限性及其在创造新型微生物中的潜力	揭示了经典转化实验在创造新型微生物中的局限性，并探讨了其潜在应用	转化实验依赖于非常相近的微生物，限制了其创造潜力	研究转化实验在合成生物学中的应用及其局限性	微生物的基因组转移和转化实验	合成生物学	NA	基因组转移	NA	NA	NA
14	2025-04-01	Comparative transcriptome analyses of different orthosiphon aristatus tissues reveal differentially expressed genes associated with flavonoid biosynthesis 2025-01-07, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-85266-x PMID:39775135	研究论文	通过比较分析猫须草不同组织的转录组，揭示了与黄酮类生物合成相关的差异表达基因	首次全面比较猫须草各组织中黄酮类化合物的合成机制，并鉴定出与根部黄酮积累相关的212个差异表达基因	研究仅关注转录组水平，未涉及蛋白质或代谢物水平的验证	探究猫须草各组织中黄酮类化合物的生物合成机制	猫须草的不同组织（根、茎、叶）	合成生物学	肾脏疾病	HPLC分析、转录组分析、qRT-PCR	NA	转录组数据	猫须草的根、茎、叶组织样本
15	2025-03-30	Exploration and mutagenesis of the germacrene A synthase from Solidago canadensis to enhance germacrene A production in E. coli 2025-Jun, Synthetic and systems biotechnology IF:4.4Q1 DOI:10.1016/j.synbio.2025.02.015 PMID:40151792	研究论文	本研究通过探索和诱变加拿大一枝黄花中的germacrene A合酶（GAS），以增强大肠杆菌中germacrene A的生产	结合分子对接和系统发育分析，对ScGAS进行关键残基诱变，显著提高了germacrene A的产量	研究依赖于大肠杆菌作为宿主，可能不适用于其他生产系统	提高germacrene A的产量，以满足β-榄香烯的临床需求	加拿大一枝黄花中的germacrene A合酶（ScGAS）	合成生物学	癌症	分子对接、系统发育分析、诱变	NA	NA	NA
16	2025-03-30	Examining interactions of animal cells with chloroplasts and their light-induced responses in in vitro cell culture systems 2025-Apr-12, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3 DOI:10.1016/j.bbrc.2025.151622 PMID:40117974	研究论文	本研究探讨了动物细胞与叶绿体的相互作用及其在体外细胞培养系统中的光诱导反应	揭示了人类宫颈癌HeLa细胞和小鼠巨噬细胞样J774.1细胞与叶绿体相互作用的三种不同模式，并强调了光诱导ROS生成在细胞毒性中的重要性	缺乏完善的体外实验系统来研究叶绿体-动物细胞相互作用	研究动物细胞与叶绿体的相互作用及其光诱导反应	人类宫颈癌HeLa细胞、小鼠巨噬细胞样J774.1细胞和Elysia marginata海蛞蝓的分离细胞	合成生物学	宫颈癌	体外细胞培养	NA	细胞反应数据	HeLa细胞、J774.1细胞和Elysia marginata海蛞蝓的分离细胞
17	2025-03-30	A novel geminivirus-derived 3' flanking sequence of terminator mediates the gene expression enhancement 2025-Apr, Plant biotechnology journal IF:10.1Q1 DOI:10.1111/pbi.14561 PMID:39723813	研究论文	本研究探讨了一种来自甜薯卷叶病毒的SBG51 deltasatellite DNA序列，该序列在终止子下游时能显著增强基因表达	发现SBG51序列能显著增强基因表达，并鉴定出一个123 bp的AT富集序列及其中的'ATAAA'/'TTAAA'元件具有增强效应	未明确说明该技术在更广泛宿主中的适用性及长期稳定性	探索合成生物学中基因表达元件的新设计	SBG51 deltasatellite DNA序列及其衍生的AT富集序列	合成生物学	NA	基因表达分析	NA	基因表达数据	本氏烟草叶片和转基因拟南芥植物
18	2025-03-30	Xenotopic synthetic biology: Prospective tools for delaying aging and age-related diseases 2025-Mar-28, Science advances IF:11.7Q1 DOI:10.1126/sciadv.adu1710 PMID:40153513	综述	本文探讨了利用来自低等生物的一组酶来逆转与年龄相关的代谢变化，以延缓衰老和年龄相关疾病	提出利用非哺乳动物酶作为延缓衰老和年龄相关疾病的未开发资源	NA	探讨通过异源合成生物学工具延缓衰老和年龄相关疾病的策略	来自低等生物的一组酶，包括氨基酸稳态调节剂、氧化还原电位调节剂等	合成生物学	老年病	NA	NA	NA	NA
19	2025-03-30	Multi-Layer Autocatalytic Feedback Enables Integral Control Amidst Resource Competition and Across Scales 2025-Mar-21, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00575 PMID:40116396	研究论文	本文提出了一种多层自催化反馈策略，用于在资源竞争和跨尺度环境下实现积分控制	利用多层反馈策略解决自催化积分反馈控制器在资源竞争和上下文依赖耦合中的局限性，实现了群体水平的积分反馈和多细胞积分器	未明确提及具体局限性，但暗示现有自催化控制器的潜力尚未完全开发	开发能够在资源竞争和跨尺度环境下实现稳健适应和稳态的控制策略	合成生物学中的基因表达调控和多细胞系统	合成生物学	NA	数学模型和合成生物学技术	多层自催化控制器	数学模型和实验数据	NA
20	2025-03-30	Anti-Cancer Strategies Using Anaerobic Spore-Forming Bacteria Clostridium: Advances and Synergistic Approaches 2025-Mar-14, Life (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/life15030465 PMID:40141809	综述	本文综述了利用厌氧孢子形成细菌梭菌（Clostridium）进行抗癌策略的最新进展及协同治疗方法	探讨了梭菌在癌症治疗中的直接肿瘤溶解、免疫调节及与现有癌症疗法的协同效应，并介绍了通过合成生物学进行的基因改造	尽管临床前和临床研究表明梭菌疗法与其他疗法结合具有潜力，但仍存在挑战	研究梭菌在癌症治疗中的应用及其与其他疗法的协同效应	厌氧孢子形成细菌梭菌（Clostridium）	癌症治疗	癌症	合成生物学、基因改造	NA	NA	NA