合成生物学相关文章
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当前共找到 4725 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-04-09 |
Analysis and engineering of quorum sensing-based communications between bacteria and fungi
2026-Apr-08, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.03838-25
PMID:41801051
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综述 | 本文综述了细菌与真菌之间基于群体感应的通讯机制，分析了其在微生物网络组装和生态系统功能中的作用，并探讨了合成生物学策略在重编程细菌-真菌相互作用中的应用 | 首次系统性地总结和分析了细菌与真菌之间基于群体感应的跨界通讯机制，并对比了自然范式与合成设计，为在多样化环境中实现细菌-真菌群落的模块化控制提供了蓝图 | NA | 全面分析和总结细菌与真菌之间基于群体感应的通讯机制，并探讨其工程化应用前景 | 细菌与真菌之间的跨界通讯，特别是基于群体感应的相互作用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 启动子工程，定向进化 | 细菌，真菌 | 群体感应系统，生物传感器 | 工业生物技术，环境 |
| 2 | 2026-04-09 |
Beyond the Sequence: Chemical and Topological Design and Innovations in mRNA Therapeutics
2026-Apr-08, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.5c00347
PMID:41875901
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综述 | 本文综述了mRNA治疗中化学和拓扑工程的最新进展，包括修饰方法、拓扑结构合成、结构-活性关系及对下一代治疗的影响 | 引入了拓扑工程作为mRNA设计的新维度，如环状RNA、分支结构和合成套索架构，以重塑RNA稳定性、免疫原性和翻译 | NA | 探索mRNA的化学和拓扑工程，以解锁其全部治疗潜力 | mRNA分子，包括其化学修饰和拓扑结构 | 合成生物学 | 传染病、肿瘤学、遗传性疾病 | 化学合成、合成生物学、RNA结构设计 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 3 | 2026-04-09 |
Protein coacervation-driven active forces power protocell dynamics
2026-Apr-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71593-8
PMID:41946707
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研究论文 | 本文通过工程化温度响应性弹性蛋白基原型细胞模型，探索了蛋白质凝聚体作为主动力生成器的机制及其在合成生物学中的应用潜力 | 首次展示了蛋白质凝聚体如何通过温度调控的收缩性放大皮牛顿级力，实现大规模机械功，并建立了数学模型框架 | 研究主要基于工程化原型细胞模型，实际生物系统中的协调性和力缩放机制仍需进一步探索 | 研究蛋白质凝聚体驱动的主动力生成机制及其在合成生物学和软机器人领域的应用 | 温度响应性弹性蛋白基原型细胞模型及其蛋白质凝聚体 | 合成生物学 | NA | 蛋白质液-液相分离（LLPS）、温度调控实验 | 数学模型 | 实验数据、模型模拟数据 | NA | 工程化原型细胞设计 | 原型细胞（非自然生物体） | 温度响应性弹性蛋白膜系统，用于调控收缩和膜出芽动态 | 合成生物学、生物材料、软机器人 |
| 4 | 2026-04-09 |
Coevolution of plant-microbe interactions, friend-foe continuum, and microbiome engineering for a sustainable future
2026-Apr-06, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2026.01.010
PMID:41618562
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综述 | 本文综述了植物与微生物在约4.5亿年间的协同进化关系，提出了一个基于深度时间、三大支柱的框架，并探讨了如何利用协同进化原理指导作物改良与可持续农业 | 提出了一个整合深度时间（器官发生、根系进化、免疫守门）与当代全息组表型的协同进化框架，并围绕成本效益与临界点框架组织“友敌连续体”，将协同进化原理转化为可操作的微生物组工程设计规则 | NA | 理解植物-微生物协同进化关系，并利用这些原理指导作物改良与可持续农业发展 | 植物-微生物互作关系，包括共生、共栖与致病关系 | NA | NA | 基因组编辑，合成生物学，人工智能，微生物组工程 | NA | NA | NA | NA | 植物 | NA | 农业 |
| 5 | 2026-04-09 |
seq2ribo: Structure-aware integration of machine learning and simulation to predict ribosome location profiles from RNA sequences
2026-Apr-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.08.700508
PMID:41726975
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研究论文 | 本文介绍了一种名为seq2ribo的混合模拟与机器学习框架，用于仅基于mRNA序列预测核糖体A位点位置 | 首次提出结合结构感知TASEP模拟与机器学习抛光模型，实现仅从序列预测核糖体分布，无需表达数据或基因组背景 | 未明确说明模型在非测试细胞类型或极端序列条件下的泛化能力 | 开发一种仅依赖mRNA序列预测核糖体位置和翻译效率的工具，以支持合成生物学中的理性设计 | mRNA序列及其对应的核糖体分布、翻译效率和蛋白质表达 | 机器学习 | NA | 核糖体测序、RNA测序、结构感知TASEP模拟 | 混合模拟与机器学习框架（包括sTASEP和抛光模型） | 序列数据（mRNA序列） | 多种细胞类型（iPSC、HEK293、LCL、RPE-1） | NA | NA | NA | 合成生物学、医学（如mRNA疫苗设计） |
| 6 | 2026-04-09 |
Microbial lipases: Catalyzing sustainable solutions for industrial innovations
2026-Apr-03, Enzyme and microbial technology
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.enzmictec.2026.110869
PMID:41946009
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综述 | 本文综述了微生物脂肪酶作为多功能生物催化剂在工业创新中的关键作用，涵盖其来源、筛选、生产、表征及工业应用 | 强调了合成生物学、宏基因组学、CRISPR-Cas技术、酶工程和AI辅助建模相结合的革命性策略，用于识别和定制具有特定特性的脂肪酶 | NA | 探讨微生物脂肪酶在可持续工业解决方案和绿色化学中的应用潜力 | 微生物脂肪酶（来自细菌、真菌和酵母） | NA | NA | 合成生物学、宏基因组学、CRISPR-Cas技术、酶工程、AI辅助建模 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | 细菌（如芽孢杆菌属、无色杆菌属、产碱杆菌属、节杆菌属、假单胞菌属）、真菌（如青霉菌属） | NA | 生物燃料、食品饮料、洗涤剂、纺织、皮革、制药、医疗 |
| 7 | 2026-04-09 |
NUPACK: Computational Nucleic Acid Analysis and Design
2026-Apr-02, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00817
PMID:41926704
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研究论文 | 本文介绍了NUPACK软件套件，用于核酸结构、设备和系统的分析与设计，服务于核酸纳米技术、分子编程和合成生物学等领域的研究人员 | NUPACK 4引入了增强的物理模型（如共轴和悬挂堆叠子系综）、显著加速（试管分析速度提升20-120倍）、支持大规模复合物（如30,000 nt）、混合材料（核苷酸分辨率）以及多样化的序列约束设计 | NA | 开发用于核酸分析与设计的计算工具，以支持核酸纳米技术、分子编程和合成生物学等领域的研究 | 核酸结构、设备和系统 | 合成生物学 | NA | 计算分析与设计算法 | NA | 核酸序列数据 | NA | NA | NA | 动态杂交级联反应路径工程和结构工程，包括假结可能性 | 医学、工业生物技术 |
| 8 | 2026-04-09 |
Exploring Azotobacter: a nitrogen-fixing microorganism as a powerhouse for sustainable and green ammonia synthesis
2026-Apr-02, Journal of applied microbiology
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/jambio/lxag083
PMID:41880483
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综述 | 本文全面综述了利用固氮微生物Azotobacter vinelandii进行可持续绿色氨合成的潜力、生化机制及工程化策略 | 系统阐述了A. vinelandii在有氧条件下固氮的独特生理遗传适应机制，并探讨了通过合成生物学、代谢工程及新兴生物技术（如光生物催化、生物电化学）将其工程化为工业级氨合成平台的创新方向 | NA | 探索利用固氮微生物实现可持续、绿色氨合成的替代方案，以替代高能耗、高排放的哈伯-博世工艺 | 固氮微生物Azotobacter vinelandii及其氮酶系统 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、代谢工程、光生物催化、生物电化学 | NA | NA | NA | NA | Azotobacter vinelandii | NA | 农业, 工业, 能源 |
| 9 | 2026-04-09 |
Yeast-based green nanoparticle synthesis: past, present and future in nanomedicine
2026-Apr, Nanomedicine (London, England)
DOI:10.1080/17435889.2026.2642296
PMID:41797356
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综述 | 本文综述了酵母作为生物平台在绿色合成纳米颗粒方面的历史进展、当前生物医学应用及未来在纳米医学中的潜力 | 系统阐述了酵母合成纳米颗粒的独特优势（如稳健性、遗传可操作性、可扩展性和安全性），并展望了合成生物学和生物过程工程在未来推动其成为生产医疗级纳米材料可行策略中的作用 | 临床转化仍受限于缺乏标准化的GMP合规生产、全面的毒性和免疫原性评估以及明确的监管框架 | 探讨酵母衍生纳米颗粒在纳米医学中的应用潜力与挑战 | 酵母合成的纳米颗粒（如银、金、硒纳米颗粒） | NA | 癌症 | 遗传工程、生物合成 | NA | NA | NA | NA | 酵母 | NA | 医学 |
| 10 | 2026-04-09 |
Protein-free membrane fusion: A refined view of the delicate fusogenic properties of calcium
2026-Mar-19, Biophysical journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.bpj.2026.03.040
PMID:41863074
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研究论文 | 本文通过微流控捕获平台和共聚焦显微镜，量化了钙离子介导的巨型单层囊泡融合，揭示了其无蛋白质条件下的精细融合特性 | 首次直接量化钙离子诱导的巨型单层囊泡融合，系统映射融合效率与钙浓度、膜组成和机械张力的关系，澄清了基于不同囊泡尺寸的钙融合测定之间的长期差异 | 钙诱导的融合在无蛋白质条件下极其不稳定且对组成敏感，需要囊泡在稳定性和不稳定性之间达到微妙平衡，限制了其广泛应用 | 研究钙离子作为独立融合剂在细胞尺寸膜中的融合能力，为合成生物学和膜重构研究提供定量设计规则 | 巨型单层囊泡（GUVs），特别是含高比例DOPE的带负电荷囊泡 | 合成生物学 | NA | 微流控捕获平台、共聚焦显微镜 | NA | 图像数据（来自显微镜） | 数百个单囊泡 | NA | NA | NA | 合成生物学、膜重构研究 |
| 11 | 2026-04-09 |
CO2-driven biosurfactant synthesis by bacteria within CCUS
2026-Feb-25, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-026-13761-w
PMID:41741775
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综述 | 本文综述了微生物在CCUS框架内通过CO2捕获驱动生物表面活性剂合成的代谢与工程方面，探讨了其工业应用及合成生物学进展 | 整合了CO2利用、生物技术和数字创新，提出了通过合成生物学将碳固定模块与生物表面活性剂途径连接的新策略 | 面临技术和经济挑战，具体实施细节和规模化可行性未详细讨论 | 探讨微生物CO2捕获与生物表面活性剂生产相结合的策略，以实现温室气体减排和可持续生物制造 | 微生物（细菌）在CCUS系统中的代谢过程及生物表面活性剂合成 | 合成生物学 | NA | 基因工程、合成生物学、系统级建模、人工智能 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 细菌（具体种类未指定） | 碳固定模块与生物表面活性剂生物合成途径的连接 | 环境, 工业生物技术 |
| 12 | 2026-04-09 |
Causes and consequences of experimental variation in Nicotiana benthamiana transient expression
2026-Feb-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69458-1
PMID:41690913
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研究论文 | 本研究系统分析了本氏烟草瞬时表达实验中的变异来源，并建立了变异模型以指导实验设计 | 首次对本氏烟草农杆菌浸润瞬时表达系统的实验变异进行全面建模分析，并基于三年纵向数据提出降低变异性的实用指南 | 研究主要针对本氏烟草系统，结论可能不完全适用于其他植物瞬时表达体系 | 探究本氏烟草瞬时表达实验中的变异来源及其影响，建立减少变异性的实验设计框架 | 本氏烟草（Nicotiana benthamiana）农杆菌浸润瞬时表达系统 | 合成生物学 | NA | 农杆菌浸润瞬时表达技术 | 变异统计模型 | 植物基因表达数据 | 1915株植物（三年纵向数据） | 农杆菌介导的基因递送 | 本氏烟草 | 瞬时基因表达系统 | 农业, 工业生物技术 |
| 13 | 2026-04-09 |
Bacteriophage research in India and its implications for human health: A scoping review
2026-Feb, The Indian journal of medical research
DOI:10.25259/IJMR_2923_2025
PMID:41949138
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综述 | 本文通过范围综述系统调查和分类了印度开展的噬菌体研究，重点关注其对人类健康的明确意义 | 首次对印度噬菌体研究进行全面范围综述，系统识别了研究现状、应用领域及关键差距 | 纳入研究以实验室环境为主，临床和转化研究极少，缺乏人类受试者或临床试验设计的研究 | 系统调查印度噬菌体研究的现状，评估其对人类健康的潜在影响及转化差距 | 印度开展的噬菌体或噬菌体疗法相关原始研究（涉及人类、动物或环境） | NA | NA | NA | NA | NA | 从4756项研究中最终纳入111项研究 | NA | NA | NA | 医学 |
| 14 | 2026-04-09 |
Leveraging a synthetic biology approach to enhance BCG-mediated expansion of Vγ9Vδ2 T cells
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0343925
PMID:41941447
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研究论文 | 本研究利用合成生物学方法改造BCG疫苗，以增强其产生HMBPP的能力，从而激活和扩增Vγ9Vδ2 T细胞，以应对结核病疫苗的不足 | 首次通过合成生物学策略，利用HMBPP感知机制，通过自-非我识别来增强BCG疫苗的免疫效果，这是之前未尝试过的方法 | 研究主要基于体外实验，未涉及体内或临床试验，且仅针对人类Vγ9Vδ2 T细胞，未评估其他免疫反应 | 开发更有效的抗结核病疫苗，通过增强BCG疫苗激活Vγ9Vδ2 T细胞的能力 | BCG疫苗菌株、Vγ9Vδ2 T细胞、HMBPP代谢中间体 | 合成生物学 | 结核病 | 合成生物学工程、同线性分析、体外刺激实验 | NA | 基因组数据、实验数据 | 超过63种分枝杆菌物种的356个基因组 | 合成生物学方法 | BCG（牛分枝杆菌） | 合成MEP基因座设计，以过表达HMBPP合成酶GcpE，积累HMBPP并克服MEP途径的反馈抑制 | 医学 |
| 15 | 2026-04-09 |
Engineered bacteria for cancer therapy: Advancements, challenges, and future directions
2025-Dec-20, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000003807
PMID:41243447
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综述 | 本文综述了工程化细菌在癌症治疗中的最新进展、挑战和未来方向，重点探讨了其作为新型治疗平台的潜力 | 利用工程化细菌选择性定植肿瘤微环境，作为局部递送治疗剂和激发抗肿瘤免疫反应的创新平台 | NA | 探讨工程化细菌在癌症治疗中的应用，以克服传统疗法的局限性 | 工程化细菌及其在癌症治疗中的设计和应用 | 合成生物学 | 癌症 | 基因工程和合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 可编程生产抗癌有效载荷的合成生物电路 | 医学 |
| 16 | 2026-04-09 |
Plasmid Stability Analysis with Open-Source Droplet Microfluidics
2024-12-27, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/67659
PMID:39803963
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研究论文 | 本研究介绍了一种基于开源硬件的微流控工作流程，用于分析质粒保留，通过培养单细胞于凝胶微滴中并使用荧光显微镜量化微菌落 | 采用开源硬件微流控技术，结合荧光蛋白表达和非特异性DNA染色，实现高通量质粒稳定性分析，相比传统平板计数具有更高统计能力 | 研究主要聚焦于大肠杆菌作为实验模型，方法虽具通用性但需进一步验证于其他生物体 | 开发一种开源微流控工作流程，用于分析质粒在无抗生素选择下的保留情况 | 质粒在单细胞中的表达和保留，以及微菌落的量化 | 合成生物学 | NA | 微流控技术、荧光显微镜、DNA染色 | NA | 图像数据 | NA | 开源硬件 | 大肠杆菌 | 质粒表达荧光蛋白，用于构建生物传感器或标记系统 | 工业生物技术、环境、医学 |
| 17 | 2026-04-09 |
Digital switching in a biosensor circuit via programmable timing of gene availability
2014-Dec, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/nchembio.1680
PMID:25306443
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研究论文 | 本文介绍了一种通过可编程基因可用性时序控制，利用位点特异性重组酶在合成生物传感器电路中实现数字切换的方法，显著降低了泄漏并提高了动态范围 | 利用位点特异性重组酶对多基因电路中的基因可用性进行可编程时序控制，以纠正瞬态传递中的非稳态过程，从而减少泄漏并增强电路性能 | NA | 开发一种通过时序控制基因可用性来改善合成生物传感器电路性能的方法 | 内源性microRNA（miRNA）的比例传感器和细胞类型分类 | 合成生物学 | NA | 位点特异性重组酶技术 | NA | 基因表达数据 | NA | 位点特异性重组酶 | NA | 比例传感器电路，涉及抑制器组件及其抑制目标的去同步化设计 | 医学 |
| 18 | 2026-04-08 |
Precision-engineered starch: Integrating metabolic engineering and cell-free synthetic biology for sustainable bioplastics and functional foods
2026-Jun-01, Carbohydrate polymers
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.carbpol.2026.125146
PMID:41943368
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综述 | 本文综述了通过代谢工程和无细胞合成生物学技术，从下游修饰转向精确生物合成设计，以开发可持续生物塑料和功能性食品用淀粉的最新进展 | 整合了植物代谢工程（特别是CRISPR-Cas基因组编辑）和无细胞合成生物学平台，将淀粉开发从传统下游修饰转向精确的生物合成工程，实现结构可控、高纯度、可重复生产的淀粉设计 | NA | 开发具有特定营养品质、技术功能和可持续性目标的下一代生物基材料——工程化淀粉 | 淀粉生物合成途径、淀粉颗粒结构（直链淀粉-支链淀粉比例、链长分布、磷酸酯化等）及其与理化性质、消化性、血糖反应和抗性淀粉形成的关系 | NA | NA | 代谢工程、CRISPR-Cas基因组编辑、无细胞合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | 植物（主要作物） | 淀粉生物合成途径（涉及颗粒结合淀粉合酶、可溶性淀粉合酶、淀粉分支酶和脱支酶的协调作用） | 农业, 食品, 材料, 工业生物技术 |
| 19 | 2026-04-08 |
Biosilicification across Biological Hierarchies
2026-Apr-07, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.5c22206
PMID:41888096
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综述 | 本文探讨了生物硅化作用在分子、细胞和组织层面的进展，强调了其在增强生物材料性能、保护生命系统以及整合合成与生物物质方面的潜力 | 挑战了硅在生物学中惰性的传统观点，并提供了工程化硅-生物界面的分子蓝图，利用合成生物学和材料科学实现超越进化时间尺度的可编程硅化调控 | NA | 研究生物硅化作用作为平台，以提升生物材料性能、保护生命系统并整合合成与生物物质 | 硅在生物系统中的化学形式、海洋生物（如硅藻）的硅化途径，以及硅在骨骼和结缔组织生物学中的作用 | 材料科学 | NA | 合成生物学、诱变、材料科学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学、材料、工业生物技术 |
| 20 | 2026-04-08 |
Dynamic, autonomous gene expression system for self-adaptation and self-regulation in microbial production
2026-Apr-04, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108889
PMID:41942052
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综述 | 本文综述了微生物生产中动态、自主基因表达系统的最新进展，旨在实现自我适应和自我调节 | 总结了自主单细胞和群体水平调控策略，包括代谢物响应、细胞负担响应、群体感应响应和pH响应系统，并强调反馈和前馈控制架构 | NA | 开发能够自主优化性能的下一代细胞工厂，以应对动态发酵环境 | 微生物细胞工厂 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | E. coli, S. cerevisiae, B. subtilis, 哺乳动物细胞, 植物 | 切换开关, 振荡器, 逻辑门, 生物传感器, 代谢通路 | 工业生物技术 |