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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-03-23 |
Modular metabolic engineering of Yarrowia lipolytica and semi-rational design of CYP716A520 for enhanced betulinic acid biosynthesis
2026-Jun, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.134364
PMID:41802472
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研究论文 | 本研究通过模块化代谢工程改造Yarrowia lipolytica,并结合半理性设计优化CYP716A520酶,以增强桦木酸(betulinic acid)的生物合成 | 首次在Yarrowia lipolytica中通过模块化代谢工程将角鲨烯产量提升813倍,并采用结合计算工具与进化信息的半理性设计策略,成功优化植物来源的P450酶CYP716A520,其L359V变体活性和特异性分别提高4倍和3倍 | 未在摘要中明确提及具体局限性,但可能涉及微生物宿主中植物P450酶的适应性挑战或规模化生产的潜在问题 | 开发可持续且成本效益高的桦木酸微生物生产方法,以替代传统的植物提取 | Yarrowia lipolytica酵母和植物来源的P450酶CYP716A520 | 合成生物学 | NA | 模块化代谢工程、半理性设计、分子动力学模拟 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9(可能涉及,但未在摘要中明确指定,因此输出NA) | Yarrowia lipolytica | 代谢途径工程,包括角鲨烯前体供应路径和P450酶催化系统 | 医药 |
| 2 | 2026-03-23 |
Vacuum and Sonication Treatment Enable Efficient Transient Gene Expression in Various Monocot and Eudicot Plant Seedlings
2026-Mar-22, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00855
PMID:41865287
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研究论文 | 本文介绍了一种名为VAST(真空和超声辅助瞬时转化)的瞬时基因表达方法,通过优化植物生长条件并结合真空渗透和超声预处理,显著提高了多种单子叶和双子叶植物幼苗的基因表达效率 | VAST方法结合了真空和超声处理,相比现有方法,在提高瞬时基因表达效率的同时减少了组织损伤,并扩展了适用的植物物种范围 | NA | 开发一种高效、通用的瞬时基因表达方法,以促进功能基因组学、合成生物学和生物技术研究 | 多种单子叶和双子叶植物幼苗,包括番茄、谷子、柳枝稷、玉米和小麦等关键作物物种 | 合成生物学 | NA | 瞬时基因表达、真空渗透、超声处理 | NA | NA | NA | NA | 番茄、谷子、柳枝稷、玉米、小麦等植物幼苗 | NA | 农业、生物技术 |
| 3 | 2026-03-23 |
Membrane-Based Assembly and Interactions in Immune Receptors
2026-Mar-22, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.5c00993
PMID:41865294
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综述 | 本文综述了免疫受体在脂质双层中的分子组装原理和结构基序,重点关注其跨膜域相互作用和模块化设计 | 系统总结了免疫受体跨膜域特异性相互作用的分子机制,并指出这些原理可应用于合成生物学 | NA | 理解免疫受体的组装机制及其跨膜相互作用在结构和功能中的作用 | 免疫受体及其跨膜蛋白复合物 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 4 | 2026-03-23 |
Next-generation strategies for PLA degradation: microbial consortia, metagenomics, enzyme engineering and AI-guided approaches
2026-Mar-21, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-026-04726-8
PMID:41863619
|
综述 | 本文综述了增强聚乳酸(PLA)生物降解的微生物和生物技术策略的最新进展,包括微生物群落筛选、宏基因组学、酶工程和人工智能引导方法 | 强调了将生态筛选与计算酶工程相结合的多学科策略,特别是利用人工智能进行结构预测和机器学习平台设计高性能PLA降解酶 | NA | 加速聚乳酸在工业堆肥、废水处理和生物修复中的降解,推动可持续的PLA废物管理 | 聚乳酸(PLA)及其在各种生态系统中的生物降解过程 | NA | NA | 宏基因组学、环境DNA(eDNA)工具、定向进化、人工智能(AI)结构预测、机器学习 | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 环境, 工业生物技术 |
| 5 | 2026-03-23 |
CRISPR-enhanced microalgae biosynthesis: a promising approach for future functional feed ingredients
2026-Mar-20, Journal of animal science and biotechnology
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s40104-026-01367-1
PMID:41857689
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综述 | 本文综述了利用CRISPR系统增强微藻生物合成以生产功能性饲料成分的当前应用、构建策略及未来展望 | 重点探讨了基于CRISPR的基因组编辑技术在优化微藻营养特性方面的突破性进展 | NA | 通过合成生物学策略提升微藻细胞工厂的生产力,以满足日益增长的功能性饲料原料市场需求 | 微藻及其合成的高价值生物活性化合物(如优质蛋白质、多不饱和脂肪酸、色素和维生素) | 合成生物学 | NA | CRISPR系统、基因组编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 微藻 | 微藻细胞工厂中的关键通路节点优化 | 农业, 食品 |
| 6 | 2026-03-23 |
Synthetic biology-engineered immunotherapies: Precision control of immune responses
2026-Mar-19, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108871
PMID:41864375
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综述 | 本文综述了合成生物学在精准免疫治疗中的应用,通过工程化可编程细胞系统来克服传统免疫疗法的局限性 | 利用合成生物学设计可编程的免疫回路,实现逻辑门控激活和反馈控制的细胞因子分泌等上下文依赖功能,提高治疗的特异性和可调性 | 临床转化仍面临特异性不足、信号失调和异质性反应等挑战,可能导致毒性和耐药性 | 探讨合成生物学如何通过工程化细胞系统来推进精准免疫治疗,以最大化疗效并最小化脱靶效应 | 免疫疗法在癌症、感染和自身免疫性疾病中的应用,特别是合成生物学设计的免疫回路 | 合成生物学 | 癌症、自身免疫性疾病 | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 哺乳动物细胞 | 合成免疫回路,包括设计的受体、模块化信号电路和逻辑门控激活、反馈控制的细胞因子分泌 | 医学 |
| 7 | 2026-03-23 |
Repositioning the Leader Peptide in Graspetide Biosynthesis
2026-Mar-18, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c21135
PMID:41789461
|
研究论文 | 本研究通过重新定位前导肽序列在graspetide生物合成中的位置,探索了合成生物学中组合酶法生成非天然产物的策略 | 通过将前导肽序列从N端重新定位到C端,保留了graspetide合成酶ThfB的底物选择性修饰能力,并实现了两种不同家族酶(套索肽和graspetide)对嵌合RiPP产物的共同修饰 | 前导肽重新定位后,酶修饰速率降低了约2倍,可能影响合成效率 | 旨在通过工程化前导肽序列,扩展核糖体合成和翻译后修饰肽(RiPPs)的结构多样性,生成自然界中未见的机械互锁肽产物 | 以fuscimiditide前体肽为研究对象,聚焦其前导肽序列的重新定位及其对graspetide合成酶ThfB功能的影响 | 合成生物学 | NA | 酶法重组、前导肽工程、翻译后修饰分析 | NA | 生化实验数据 | NA | 前导肽工程策略 | NA | 通过重新定位前导肽序列,设计嵌合RiPP生物合成途径,实现套索肽和graspetide家族酶的共同修饰 | 工业生物技术 |
| 8 | 2026-03-23 |
A review on microbial lipids conversion from organic wastes: Adaptive laboratory evolution-driven strategies for enhanced biofuel precursor synthesis
2026-Mar-18, Environmental research
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.envres.2026.124312
PMID:41856232
|
综述 | 本文综述了利用适应性实验室进化(ALE)技术驱动策略,将有机废物转化为微生物油脂以增强生物燃料前体合成的研究。 | 提出了将ALE技术与合成生物学、精准代谢工程、基因组编辑和机器学习相结合的新型整合策略,以拓展ALE技术在有机废物资源化利用中的应用边界。 | NA | 探讨如何利用ALE技术增强产油微生物对复杂发酵液中抑制成分的耐受性,从而提高从有机废物到微生物油脂的生物转化效率。 | 产油微生物及其在有机废物(发酵液)资源化转化过程中的适应性进化。 | NA | NA | 适应性实验室进化(ALE),合成生物学,精准代谢工程,基因组编辑,机器学习 | NA | NA | NA | NA | 产油微生物 | NA | 能源,环境 |
| 9 | 2026-03-23 |
Microplastic biodegradation and environmental safety: From microbial mechanisms to engineered systems and circular bio-based implementation
2026-Mar-15, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2026.120016
PMID:41833249
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综述 | 本文综述了微塑料生物降解的微生物机制、工程系统及环境安全,并探讨了其在循环生物基实施中的可行性 | 对微塑料生物降解过程进行了机制整合分析,明确区分了表面改性、解聚、生物转化和完全矿化,并重点关注了环境安全考虑和循环生物基回收框架的整合 | 可控条件下解聚效率虽已提升,但规模化、法规遵从性及生态系统层面的风险评估仍是核心挑战 | 评估微塑料生物降解策略的环境安全性与循环生物基实施的可行性 | 微塑料(合成聚合物颗粒,尺寸小于5毫米) | 环境生物技术 | NA | 微生物降解、酶工程、合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 环境 |
| 10 | 2026-03-23 |
GENETTA: a Network-Based Tool for the Analysis of Complex Genetic Designs
2023-12-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00333
PMID:37963232
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研究论文 | 介绍GENETTA软件工具,该工具利用图论将合成生物学设计转化为网络进行分析和操作 | 通过图论方法将复杂合成生物学设计表示为网络,支持动态可视化定制和多数据库数据整合 | NA | 开发用于分析和操作复杂合成生物学设计的网络工具 | 合成生物学设计 | 合成生物学 | NA | 图论 | NA | 设计数据 | NA | NA | NA | 交互网络和部件层次结构 | 工业生物技术 |
| 11 | 2026-03-22 |
Precision modulation of the gut microbiota-immune axis by natural products: a structure-activity relationship perspective in cancer immunotherapy
2026-Mar-20, Journal of Asian natural products research
IF:1.3Q3
DOI:10.1080/10286020.2026.2644307
PMID:41860786
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综述 | 本文从构效关系视角综述了天然产物如何通过精确调控肠道菌群-免疫轴来增强癌症免疫治疗效果 | 首次从多糖、萜类、多酚和生物碱等天然产物的特定结构决定簇出发,系统解构其如何驱动特定的微生物重塑和免疫调节结果,并提出未来结合人工智能多组学和合成生物学进行理性设计 | NA | 探讨天然产物通过调控肠道菌群-免疫轴来克服癌症免疫治疗耐药性的机制与策略 | 天然产物(多糖、萜类、多酚、生物碱)及其对肠道微生物群和宿主免疫系统的影响 | NA | 癌症 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 12 | 2026-03-22 |
Advances in synthetic biology for engineering methylotrophic microbial cell factories
2026-Mar-19, Journal of bacteriology
IF:2.7Q3
DOI:10.1128/jb.00383-25
PMID:41665342
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综述 | 本文综述了合成生物学在工程化甲基营养型微生物细胞工厂方面的最新进展,包括构建高效甲醇利用途径、优化氧化效率和氧化还原平衡等策略 | 总结了通过合成生物学和代谢工程策略提升甲醇同化效率的创新方法,如工程化甲醇脱氢酶和优化辅因子利用 | NA | 促进工业甲醇利用和可持续发展,通过理性设计高性能微生物平台 | 甲基营养型微生物细胞工厂 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、代谢工程、适应性实验室进化 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 大肠杆菌、酿酒酵母、枯草芽孢杆菌、哺乳动物细胞、植物 | 切换开关、振荡器、逻辑门、生物传感器、代谢途径 | 工业生物技术、环境、能源 |
| 13 | 2026-03-22 |
Protein-free membrane fusion: a refined view of the delicate fusogenic properties of calcium
2026-Mar-19, Biophysical journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.bpj.2026.03.040
PMID:41863074
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研究论文 | 本研究通过微流控捕获平台结合共聚焦显微镜,定量研究了钙离子介导的巨型单层囊泡(GUVs)膜融合过程,揭示了钙离子作为无蛋白融合剂的精细作用机制 | 首次在细胞尺度膜上系统量化钙介导的膜融合,同时测量脂质混合、内容物混合和融合结果,揭示了钙融合作用的狭窄参数空间 | 研究仅限于合成膜系统,未涉及生物膜中的天然蛋白环境 | 阐明钙离子作为无蛋白融合剂在细胞尺度膜上的融合机制与条件 | 带负电荷的巨型单层囊泡(GUVs) | 合成生物学 | NA | 微流控捕获平台、共聚焦显微镜 | NA | 显微镜图像、定量测量数据 | 数百个单囊泡 | NA | NA | NA | 合成生物学、膜重建研究 |
| 14 | 2026-03-22 |
A reversible small-molecule-switchable self-amplifying RNA expression platform
2026-Mar-14, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.151436
PMID:41839281
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研究论文 | 本研究开发了一种可逆小分子开关控制的自扩增RNA表达平台,用于精确调控基因表达 | 首次将自扩增RNA设计为可编程基因电路,实现小分子配体对多个下游基因的独立可逆调控 | NA | 开发可控的RNA治疗和合成生物学应用平台 | 自扩增RNA构建体及其在基因表达调控中的应用 | 合成生物学 | NA | RNA工程、脂质纳米颗粒封装 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 哺乳动物细胞 | 包含去稳定化结构域、RNA结合蛋白L7Ae、四环素响应阻遏蛋白和k-turn RNA基序的可编程RNA基因电路 | 医学 |
| 15 | 2026-03-22 |
Repurposing nuclear receptors for ligand-responsive liquid condensate formation and gene regulation
2026-01-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69099-4
PMID:41620421
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研究论文 | 本文通过重新利用核受体配体结合域和共激活因子,开发了响应激素或临床批准药物的化学诱导二聚化系统,并设计了配体响应的液-液相分离凝聚物,用于基因调控和转录放大 | 创新点包括利用内源性信号分子(如激素和药物)构建化学诱导二聚化系统,以及设计配体控制的液-液相分离凝聚物以实现可调谐的转录控制,实现高达数百倍的激活效果 | NA | 研究目的是开发与内源性生理信号整合的合成生物学工具,用于基因调控和转录控制 | 研究对象包括核受体(如TRβ、VDR、RARγ、ERβ、GR2)的配体结合域、TIF2共激活因子肽,以及相关的激素和药物配体 | 合成生物学 | NA | 化学诱导二聚化、液-液相分离 | NA | NA | NA | NA | NA | 双输入转录开关、配体响应的液-液相分离凝聚物 | 医学、基因电路、生物传感、治疗学 |
| 16 | 2026-03-22 |
Evolutionary repurposing of a metabolic thiolase complex enables antibiotic biosynthesis
2026-01-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68910-6
PMID:41617701
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研究论文 | 本研究报道了口腔链球菌中的一种三重酶复合物,该复合物通过不寻常的Friedel-Crafts C-乙酰化反应完成抗生素reutericyclin A的生物合成 | 揭示了硫解酶复合物通过关键催化残基重编程实现底物特异性转变,从原始的HMG-CoA合成功能进化获得Friedel-Crafts C-酰化新功能的罕见案例 | NA | 探究初级代谢酶如何进化获得次级代谢中的特殊功能,阐明酶功能多样化的进化机制 | 口腔链球菌来源的三重酶复合物(SmaATase),包含HMGS、ACAT和DUF35蛋白 | NA | NA | 冷冻电镜、生化表征、分子建模、进化分析 | NA | 结构数据、生化数据、进化数据 | NA | NA | 口腔链球菌(Streptococcus macacae) | NA | 合成生物学(为C-C键形成催化剂工程提供模板) |
| 17 | 2026-03-22 |
Engineering yeast for sustainable bioproduction of tryptophan-derived aromatic compounds
2026-Jan-05, FEMS yeast research
IF:2.4Q3
DOI:10.1093/femsyr/foag012
PMID:41770028
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综述 | 本文总结了利用酵母工程化生产色氨酸衍生芳香化合物的最新进展 | 聚焦于色氨酸作为关键前体,综述了酵母代谢工程和合成生物学工具在可持续生产芳香化合物中的应用 | NA | 实现色氨酸衍生芳香化合物在酵母中的高效、可扩展且经济可行的生物合成 | 酵母细胞工厂 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学工具 | NA | NA | NA | NA | 酵母 | NA | 聚合物、食品、饲料、化妆品、制药 |
| 18 | 2026-03-22 |
Prospects for synthetic biology in 21st century agriculture
2025-08, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2024.12.016
PMID:39742963
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综述 | 本文综述了21世纪农业中合成生物学的前景,重点介绍了植物合成生物学在增强粮食安全、应对气候变化和促进可持续农业方面的创新应用 | 整合先进遗传工具、计算建模和系统生物学,精准修饰植物基因组以提升产量、胁迫耐受性和养分利用效率,并结合人工智能优化设计 | 面临监管审批和公众接受度方面的挑战,且需要严格的多领域测试以确保可重复性 | 探讨合成生物学在农业中的应用潜力,以解决全球粮食安全和环境可持续性问题 | 植物基因组及其在光合效率、固氮、耐旱、病原抗性、养分利用效率、生物强化、气候韧性等关键农业性状的工程化改造 | NA | NA | 合成生物学、遗传工程、计算建模、系统生物学、人工智能 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 植物 | 合成植物基因组、生物传感器、代谢途径、逻辑门、振荡器、切换开关 | 农业 |
| 19 | 2026-03-22 |
Genetic and molecular mechanisms underlying nitrogen use efficiency in maize
2025-03, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2024.10.007
PMID:39515641
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综述 | 本文全面综述了玉米氮素吸收、同化和再动员的遗传与分子调控机制,旨在提高氮素利用效率 | 整合了根际微生物组对氮素利用效率的影响以及植物-微生物互作机制,并倡导利用遗传多样性和合成生物学进行综合研究 | NA | 提高玉米氮素利用效率,促进可持续农业发展 | 玉米 | NA | NA | 高通量微生物组研究 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 玉米 | NA | 农业 |
| 20 | 2026-03-22 |
In-Depth Computational Analysis of Natural and Artificial Carbon Fixation Pathways
2021, Biodesign research
DOI:10.34133/2021/9898316
PMID:37849946
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研究论文 | 本文通过计算分析比较了天然和人工碳固定途径的性能,包括特定活性和产率 | 提出了两个全新的碳固定循环(还原性柠檬酰辅酶A循环和2-羟基戊二酸反向三羧酸循环),并采用综合动力学数据集和参数平衡算法进行预测 | 计算模型可能受限于数据可用性和假设,实际应用需实验验证 | 评估和比较天然与人工碳固定途径的性能,以优化工业生物技术和合成生物学应用 | 碳固定途径,包括天然和人工循环,如CBB循环、CETCH循环等 | NA | NA | 计算分析、参数平衡算法、酶成本最小化算法 | NA | 动力学和热力学数据 | NA | NA | NA | 碳固定代谢途径,包括还原性甘氨酸途径、CETCH循环等 | 工业生物技术, 合成生物学 |