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当前共找到 4685 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-04-01 |
Molecular kinetics dictate population dynamics in CRISPR-based plasmid defense
2026-Apr-07, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2525424123
PMID:41911458
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研究论文 | 本研究采用延时成像方法，从分子、单细胞和群体水平分析CRISPR-Cas系统对质粒RP4动态的防御机制 | 通过荧光标记质粒和CRISPR-Cascade复合物，量化了群体动态与间隔序列数量、Cascade表达水平及质粒成瘾模块的关系，并首次结合单细胞追踪和基于代理的空间模型预测质粒动态 | 研究可能受限于特定实验条件（如RP4质粒和细菌模型），且未全面探索所有CRISPR-Cas变体或环境因素对质粒传播的影响 | 理解和操纵移动遗传元件（如质粒）的传播，以应用于合成生物学、农业和医学领域 | CRISPR-Cas防御系统、质粒RP4、细菌群体动态 | 合成生物学 | NA | 延时成像、荧光标记、单细胞追踪、基于代理的建模 | 基于代理的空间模型 | 图像、时间序列数据 | NA | CRISPR-Cas | 细菌 | CRISPR-Cascade防御系统 | 合成生物学, 农业, 医学 |
| 2 | 2026-04-01 |
Benchmarking genetic elements for high-level protein expression using a novel Marchantia polymorpha transient expression system
2026-Mar-28, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.151715
PMID:41911994
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研究论文 | 本研究开发了一种基于农杆菌介导的Marchantia polymorpha瞬时表达系统，用于快速评估和筛选高效的遗传元件 | 首次在Marchantia polymorpha中建立了农杆菌介导的瞬时表达系统，可在8天内完成高通量遗传元件筛选，并鉴定出性能显著提升的启动子变体 | 研究主要聚焦于启动子、终止子和信号肽的筛选，尚未涉及更复杂的调控元件或代谢通路设计 | 开发高效遗传元件筛选平台，提升Marchantia polymorpha中蛋白质表达水平 | Marchantia polymorpha（地钱）植物模型 | 合成生物学 | NA | 农杆菌介导的瞬时表达、稳定转化 | NA | 蛋白质表达量数据 | 21个启动子、15个终止子、7个信号肽的筛选 | 农杆菌转化 | Marchantia polymorpha（地钱） | 遗传元件（启动子、终止子、信号肽）的筛选与优化 | 农业、工业生物技术 |
| 3 | 2026-04-01 |
Tunable low-rate genomic recombination with Cre-lox in Escherichia coli: a versatile tool for anoxic environmental biosensing and synthetic biology
2026-Mar-23, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.01768-25
PMID:41870091
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研究论文 | 本文开发了一种在E. coli中可调控的低速率Cre-lox基因组重组系统，用于缺氧环境生物传感和合成生物学应用 | 开发了紧密调控、可滴定的Cre重组酶系统，实现低重组率和最小基础活性，并在质粒和染色体上实施，后者显示出跨代遗传记忆的优越保留 | NA | 开发一种用于环境生物传感和合成生物学的可调控基因组重组工具 | Escherichia coli（大肠杆菌） | 合成生物学 | NA | Cre-lox重组技术 | NA | NA | NA | Cre-lox | Escherichia coli | 基于Cre重组酶的遗传记忆系统，用于生物传感 | 环境, 医学, 工业生物技术 |
| 4 | 2026-04-01 |
A general strategy to enhance aptamer affinity by suppressing dissociation through symmetric assembly
2026-Mar-19, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag268
PMID:41873762
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研究论文 | 本文提出了一种通过对称组装抑制解离来增强适体亲和力的通用策略 | 采用对称引导的组装方法，通过快速再结合实现动力学协同性，显著降低解离速率常数 | NA | 增强适体亲和力以克服快速靶标解离的限制 | 针对SARS-CoV-2刺突蛋白、VEGF165和心脏肌钙蛋白I的适体 | 合成生物学 | NA | 对称组装方法 | NA | NA | NA | NA | NA | 三价柔性组装体 | 诊断、治疗、合成生物学 |
| 5 | 2026-04-01 |
Aptamer- and Ribozyme-Engineered sgRNAs for Conditional Control of CRISPR/Cas9 Function
2026-Mar-09, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
DOI:10.31083/FBL47300
PMID:41914300
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综述 | 本文综述了通过将功能性核酸元件（如适配体、核酶和适配酶）整合到sgRNA特定结构区域中，开发条件响应性CRISPR/Cas9系统的设计策略与应用 | 通过工程化sgRNA实现CRISPR/Cas9系统的条件响应性控制，使其能响应小分子、蛋白质和内源性代谢物等多种分子信号 | 当前系统在特异性、效率和适用性方面仍面临挑战，需要进一步改进 | 开发条件响应性CRISPR/Cas9系统，用于合成生物学、疾病建模和治疗开发 | 工程化的单导RNA（sgRNA）和CRISPR/Cas9系统 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9系统，功能性核酸元件整合 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 原核细胞，真核细胞 | 条件响应性基因编辑、激活、抑制和成像系统 | 医学 |
| 6 | 2026-04-01 |
Tunable Low-Rate Genomic Recombination with Cre-lox in Escherichia coli : A Versatile Tool for Environmental Biosensing and Synthetic Biology
2025-Sep-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.02.616356
PMID:40949998
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研究论文 | 本文开发了一种基于Cre-lox系统的可调控低速率基因组重组工具，用于环境生物传感和合成生物学应用 | 开发了紧密调控、可滴定Cre重组酶系统，实现低重组率和最小基础活性，并应用于染色体以增强遗传记忆跨代保留 | NA | 开发一种可调控低速率基因组重组工具，用于环境生物传感和合成生物学 | 大肠杆菌（Escherichia coli） | 合成生物学 | NA | Cre-lox重组系统 | NA | NA | NA | Cre-lox | 大肠杆菌 | 基于Cre-lox的遗传记忆系统，用于环境生物传感 | 环境, 工业生物技术 |
| 7 | 2026-03-31 |
From CRISPR functional genomics to synthetic interventions: engineering antiviral strategies
2026-Mar-30, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.00057-26
PMID:41910274
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综述 | 本文综述了CRISPR功能基因组学与合成生物学在抗病毒策略设计中的结合应用 | 将CRISPR筛选从静态命中列表转向基于单细胞读数、成像、空间表型分析和类器官模型的上下文映射，并转化为可编程干预策略 | 讨论了从筛选机制转化为有效且安全抗病毒策略的约束条件 | 连接CRISPR功能基因组学与合成抗病毒设计，总结跨病毒家族的通用原则 | 病毒-宿主相互作用、宿主依赖性和限制性因子 | 合成生物学 | 病毒感染 | CRISPR扰动筛选、单细胞读数、成像、空间表型分析、类器官模型 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 哺乳动物细胞 | 基因回路，将感染感知与定制响应耦合 | 医学 |
| 8 | 2026-03-31 |
Plant oil body engineering: A roadmap from multiscale structures to next-generation food systems
2026-Mar-25, Food chemistry
IF:8.5Q1
DOI:10.1016/j.foodchem.2026.149010
PMID:41905230
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综述 | 本文构建了一个全面的植物油体多尺度工程框架，旨在通过跨学科策略将其转化为可编程功能单元，以推动下一代智能食品系统的发展 | 提出了一个整合物理场、界面工程和合成生物学的多尺度工程框架，建立了清晰的“分子结构-界面性质-宏观功能”关系，用于理性设计植物油体 | 成功转化依赖于克服规模化挑战以及解决技术经济和监管障碍 | 通过系统工程方法将植物油体转化为可编程功能单元，以应用于下一代智能食品系统 | 植物油体 | NA | NA | 物理场、界面工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 食品 |
| 9 | 2026-03-31 |
Single Molecule Force Measurements Reveal Energy Stabilization of Theophylline Aptamer RNA Switch Required for Gene Control
2026-Mar-25, ACS physical chemistry Au
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsphyschemau.5c00109
PMID:41909145
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研究论文 | 本研究利用光镊单分子力谱技术，测量了茶碱适配体RNA开关在有无配体存在时的折叠动力学，揭示了其通过能量稳定而非结构重塑实现基因调控的机制 | 首次通过单分子力测量揭示了茶碱适配体RNA开关的能量稳定机制（约2.1 kcal/mol），并支持构象选择模型，否定了配体结合引发大结构重排的假设 | 研究仅聚焦于茶碱适配体这一特定RNA开关，未验证其他RNA适配体是否遵循相同机制；单分子实验条件可能与体内生理环境存在差异 | 探究茶碱适配体RNA开关在合成基因网络中实现配体响应调控的热力学与动力学基础 | 茶碱适配体RNA分子及其与茶碱小分子配体的相互作用 | 合成生物学 | NA | 光镊单分子力谱 | NA | 单分子力学数据 | NA | NA | NA | 配体响应型RNA开关（用于合成基因网络调控） | 合成生物学、基因治疗 |
| 10 | 2026-03-31 |
Beyond the Sequence: Chemical and Topological Design and Innovations in mRNA Therapeutics
2026-Mar-24, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.5c00347
PMID:41875901
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综述 | 本文综述了mRNA治疗中化学和拓扑工程的最新进展，涵盖修饰方法、合成策略、结构-活性关系及下一代治疗应用 | 引入了拓扑工程作为mRNA设计的新维度，包括环状RNA、分支结构和合成套索架构，以调控稳定性、免疫原性和翻译效率 | NA | 探讨mRNA的化学和拓扑工程，以提升其治疗潜力 | mRNA分子，包括其化学修饰和拓扑结构 | 合成生物学 | 传染病、肿瘤、遗传病 | 化学修饰、拓扑工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 11 | 2026-03-31 |
On-Demand Droplet Routing and Splitting Using Independently Addressable Interdigitated Electrodes
2026-Mar-20, Micromachines
IF:3.0Q2
DOI:10.3390/mi17030375
PMID:41900261
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研究论文 | 本文介绍了一种低电压微流控平台，通过集成倾斜叉指电极和非对称Y型结，实现电可调液滴分裂与分选 | 采用独立寻址的倾斜叉指电极阵列，在中等电压下产生局部电场梯度，实现动态液滴路由和确定性分裂，结构简单且控制灵活 | NA | 开发一种低电压微流控平台，用于精确控制液滴的分裂和分选操作 | 皮升至纳升级液滴的操纵 | 微流控技术 | NA | 介电泳 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 药物发现、单细胞分析、分子诊断、合成生物学 |
| 12 | 2026-03-31 |
Dynamic Coordination: How ERF Transcription Factors Coordinate Plant Development and Adaptive Stress Responses
2026-03-19, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom16030466
PMID:41897400
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综述 | 本文综述了乙烯响应因子（ERF）转录因子在协调植物生长发育与逆境适应性响应中的核心调控作用 | 强调了ERF-VII等特定亚群在整合发育程序与胁迫响应中的双重功能，并探讨了利用CRISPR和合成生物学工具精准调控ERF网络以改良作物的新策略 | NA | 阐明ERF转录因子如何动态协调植物资源在生长与抗逆之间的分配机制 | 植物乙烯响应因子（ERF）转录因子家族 | NA | NA | CRISPR基因组编辑、合成生物学工具 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 作物（植物） | ERF调控网络 | 农业 |
| 13 | 2026-03-31 |
Decoding nucleic acid contributions to phase separation and ordering in biomolecular condensates
2026-Mar-19, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag253
PMID:41909948
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研究论文 | 本文通过实验和分子动力学模拟，探讨了核酸在生物分子凝聚体相分离和有序化中的作用 | 提出了一种用于评估生物凝聚体稳定性的指标，并揭示了液滴中液晶有序形成的条件及其对寡核苷酸动力学的显著影响 | 研究基于模型系统，可能无法完全反映自然生物系统中的复杂相互作用 | 填补核酸在液-液相分离（LLPS）中作用的研究空白 | 寡核苷酸和带中等电荷的无序肽的混合物 | 合成生物学 | NA | 分子动力学模拟 | NA | 实验数据和模拟数据 | NA | NA | NA | NA | 生物医学应用 |
| 14 | 2026-03-31 |
Programmable, target-induced fluorogenic CRISPR-tDeg platform for live-cell RNA visualization
2026-Mar-19, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag279
PMID:41909946
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研究论文 | 开发了一种名为CtDeg的模块化RNA成像平台，通过将荧光激活与靶RNA识别直接关联，并利用降解子介导的降解来抑制背景信号，实现活细胞中RNA的可视化 | 通过工程化crRNA支架嵌入Pepper RNA基序，确保荧光仅在结合原生RNA靶标时出现，并优化C端tDeg变体以最大化信噪比，相比传统荧光蛋白-CRISPR方法具有更低背景和更高特异性 | NA | 开发一种精确可视化活细胞中RNA的平台，以克服现有CRISPR成像系统的高背景荧光问题 | RNA分子，包括NEAT1_2 lncRNA和SARS-CoV-2基因组RNA | 合成生物学 | NA | CRISPR-dCas13-tDeg技术 | NA | 图像数据 | NA | CRISPR-Cas13 | 哺乳动物细胞 | 靶诱导的荧光激活生物传感器 | 医学, 合成生物学 |
| 15 | 2026-03-31 |
Rhodo-Box: A Synthetic Biology Toolbox to Facilitate Metabolic Engineering of Rhodobacter sphaeroides
2026-Mar-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00808
PMID:41832780
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研究论文 | 本研究开发了一个名为Rhodo-Box的合成生物学工具箱，旨在促进Rhodobacter sphaeroides的代谢工程 | 通过调整和扩展Zymo-Parts模块化克隆框架，创建了首个针对Rhodobacter sphaeroides的标准化、自动化兼容的遗传元件工具箱 | 未在摘要中明确说明 | 开发标准化遗传工具以促进Rhodobacter sphaeroides的代谢工程和可持续生物制造 | Rhodobacter sphaeroides（一种紫色非硫α-变形菌） | 合成生物学 | NA | 模块化克隆 | NA | NA | NA | Zymo-Parts, Gibson Assembly | Rhodobacter sphaeroides | 包含复制起点、启动子、诱导表达系统、核糖体结合位点和转录终止子的标准化遗传元件库 | 工业生物技术 |
| 16 | 2026-03-31 |
Photo-Oxidative Stress in Plants: ROS Signaling, Damage Propagation, and Systems-Level Resilience
2026-Mar-15, Antioxidants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/antiox15030371
PMID:41897517
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综述 | 本文综述了植物光氧化应激中活性氧信号传导、损伤传播和系统水平恢复力的最新进展，并提出了一个整合框架 | 超越将ROS视为有毒副产物的传统观点，将其定位为复杂互连网络中的中心枢纽，并强调从增强单一组分转向“优化网络”的未来策略 | NA | 阐明植物光氧化应激的机制，并提出作物改良的整合策略 | 植物（特别是作物）的光氧化应激反应系统 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | 植物（作物） | NA | 农业 |
| 17 | 2026-03-31 |
From Gene Knockouts to Genome Remodeling: Large DNA Fragment Deletion Technologies in Plants
2026-Mar-15, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants15060909
PMID:41901428
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综述 | 本文系统比较了植物中应用的主要大片段DNA缺失技术，并讨论了其机制、效率、优势、局限及未来发展方向 | 系统性地比较了多种植物大片段DNA缺失技术，并强调了植物特异性染色质组织和DNA修复机制对缺失效率的限制，同时提出了AI辅助设计、蛋白质定向进化等未来发展方向 | 当前技术在不同作物基因组中实现高效、精确、可预测的大片段缺失仍存在瓶颈 | 探讨植物中大片段DNA缺失技术的机制、应用及未来发展方向，以推动其在功能基因组学、性状工程和理性基因组设计中的应用 | 植物基因组 | 合成生物学 | NA | 大片段DNA缺失技术 | NA | NA | NA | ZFNs, TALENs, CRISPR/Cas systems (Cas9, Cas12a, Cas3), 位点特异性重组酶, 转座子系统, 先导编辑衍生策略 | 植物 | NA | 农业 |
| 18 | 2026-03-31 |
Engineered Bacteriophages: A Next-Generation Platform for Precision Antimicrobials and Therapeutics
2026-Mar-13, Viruses
DOI:10.3390/v18030355
PMID:41902263
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综述 | 本文综述了工程化噬菌体作为下一代精准抗菌和治疗平台的进展、应用与挑战 | 系统总结了工程化噬菌体的制备技术（基因修饰、化学偶联、物理封装）及其在多重耐药感染、肠道疾病和癌症治疗中的创新应用，提出了精准噬菌体医学的概念 | 面临监管审批、大规模生产和长期安全性等关键挑战 | 探讨工程化噬菌体作为应对抗菌素耐药性和开发新型疗法的平台 | 工程化噬菌体 | 合成生物学 | 多重耐药感染、胃肠道疾病、癌症 | 基因修饰、化学偶联、物理封装 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 细菌（作为噬菌体宿主） | 生物传感器、靶向递送载体、免疫佐剂 | 医学 |
| 19 | 2026-03-31 |
Unintended Creation or Insertion of Antisense Promoter Motifs During Codon Optimization: A Cyber-Biosecurity Risk
2026-Mar-12, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms14030638
PMID:41900397
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研究论文 | 本研究探讨了密码子优化过程中可能无意引入反义启动子基序的风险，并开发了相应的计算工具进行检测和防御 | 首次系统揭示了密码子优化可能意外引入反义启动子基序的网络安全风险，并开发了可保留氨基酸序列的沉默插入算法 | 研究主要基于计算分析，需要后续实验验证反义启动子的实际生物学影响 | 评估密码子优化过程中的网络安全风险，开发预防性计算工具 | 密码子优化序列、反义启动子基序 | 合成生物学 | NA | 密码子优化、计算分析 | 计算分析流程 | DNA序列数据 | 484,741个蛋白质编码序列 | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 20 | 2026-03-31 |
Evolution and Impact of Imine Reductases (IREDs) Research: A Knowledge Mapping Approach
2026-Mar, Molecular biotechnology
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12033-025-01421-9
PMID:40172741
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研究论文 | 本研究使用文献计量和知识图谱方法，探索了亚胺还原酶（IREDs）的研究格局和演变历程 | 首次通过文献计量分析提供了IRED研究的可视化表示，揭示了研究趋势和新兴主题 | 研究基于已发表的文献数据，可能未涵盖所有未发表或正在进行的研究，且分析范围限于2010年至2024年 | 探索IREDs的研究景观和演变，以提供对该领域的全面评估 | 亚胺还原酶（IREDs）及其在合成手性胺中的应用 | 合成生物学 | NA | 文献计量分析、知识图谱方法（如CiteSpace、VOSviewer、Pajek、Scimago Graphica） | NA | 文本数据（研究文章和综述） | 239篇研究文章和综述 | NA | NA | NA | 医药 |