合成生物学相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['synthetic biology']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价9.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 4154 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-01-01 |
Trends in Customizable Single-Cell Protein Production Enabled by Synthetic Biology: Carbon-Negative Biomanufacturing and Engineered Functionalities
2025-Dec-31, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c08537
PMID:41330641
|
综述 | 本文综述了合成生物学如何推动可定制单细胞蛋白生产的趋势，包括碳负生物制造和工程化功能的发展 | 探讨了从糖类到废物衍生流和C1化合物的底物演变，以及通过合成生物学实现营养定制和感官属性编程的新兴策略 | NA | 分析合成生物学在解决单细胞蛋白生产可持续性、效率和可扩展性挑战中的应用 | 单细胞蛋白生产价值链，包括底物、菌株开发、发酵过程和营养定制 | 合成生物学 | NA | 模型驱动代谢工程、数字精准控制发酵 | NA | NA | NA | NA | 工程微生物 | 优化蛋白质生物合成的代谢途径 | 农业, 食品 |
| 2 | 2026-01-01 |
Psilocybin: clinical potential, mechanistic insights, and biotechnological advances for scalable production
2025-Dec-31, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-025-04758-0
PMID:41474478
|
综述 | 本文综述了裸盖菇素的临床潜力、机制见解以及用于可扩展生产的生物技术进展 | 整合了临床研究、机制洞察和生物技术生产方法，强调了微生物平台在工业规模生物合成中的前景，并探讨了生物技术与文化背景的融合 | 未提及具体临床研究的样本量限制或生物技术方法的经济成本详细分析 | 探讨裸盖菇素作为生物制药候选物的临床潜力和可扩展生产方法 | 裸盖菇素及其生物合成 | 生物技术 | 心理健康疾病 | 异源表达、代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 酿酒酵母, 构巢曲霉, 大肠杆菌 | 裸盖菇素生物合成途径 | 医药 |
| 3 | 2026-01-01 |
Neutral theory of cooperative dynamics
2025-Dec-23, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2515423122
PMID:41417606
|
研究论文 | 本文提出了一种基于随机中性理论的合作物种模型，探讨了合作互动在生态系统中的作用 | 模型在经典中性理论基础上引入物种间合作复制的假设，揭示了低迁移率下物种丰度分布的双峰模式及核心合作物种的作用 | NA | 研究合作物种的随机中性理论，以理解合作互动对生物多样性和生态系统稳定性的影响 | 合作物种的动力学行为，包括物种丰度分布、多样性和停留时间 | 生态学 | NA | 随机中性理论建模 | 中性理论模型 | 理论模型数据 | NA | NA | NA | NA | 微生物组研究、合成生物学、生命起源 |
| 4 | 2026-01-01 |
A Review of Receptor Recognition Mechanisms in Coronaviruses
2025-Dec-16, Viruses
DOI:10.3390/v17121628
PMID:41472297
|
综述 | 本文综述了冠状病毒家族中不同属的宿主受体识别机制，并回顾了鉴定和阐明病毒受体的多种方法学 | 整合了结构生物学、多组学、计算预测、合成生物学和人工工程化病毒受体等多种方法，为阐明冠状病毒-受体相互作用提供了强大的研究框架 | NA | 阐明冠状病毒受体识别的调控机制，以更好地理解病毒感染、传播和发病机制，预测潜在宿主和病毒免疫逃逸，预防感染或开发治疗策略 | 冠状病毒家族的宿主受体识别机制 | NA | 冠状病毒感染 | 结构生物学、多组学、计算预测、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 5 | 2026-01-01 |
CRISPR Treatments for AI-Designed Synthetic Viruses: Rapid Programmable Countermeasures for Emerging and Engineered Viruses
2025-Dec-05, Viruses
DOI:10.3390/v17121588
PMID:41472258
|
综述 | 本文综述了利用可编程CRISPR技术（Cas9和Cas13）作为应对新兴病毒和人工合成病毒的快速反应对策，并提出了从实时测序到AI辅助gRNA设计的全流程框架 | 提出了结合AI辅助gRNA选择、多重gRNA鸡尾酒疗法和自适应gRNA轮换的快速响应管道，以应对AI设计的合成病毒威胁 | NA | 开发针对新兴病毒和工程病毒的快速可编程CRISPR抗病毒对策 | DNA病毒（如正痘病毒、HSV-1、非洲猪瘟病毒）和RNA病毒（如甲型流感、登革热、呼吸道合胞病毒） | 合成生物学 | 病毒性疾病 | CRISPR-Cas9, CRISPR-Cas13, 实时测序, AI辅助设计 | NA | 基因组序列数据 | NA | CRISPR-Cas9, CRISPR-Cas13 | NA | NA | 医学, 生物防御 |
| 6 | 2026-01-01 |
Microbial Valorization of Agricultural and Agro-Industrial Waste into Bacterial Cellulose: Innovations for Circular Bioeconomy Integration
2025-Nov-25, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms13122686
PMID:41471891
|
综述 | 本文综述了利用农业和农业工业废弃物通过微生物转化生产细菌纤维素（BC）的最新进展，强调其在循环生物经济中的整合潜力 | 通过优化发酵过程（如静态和搅拌培养、共培养、分步营养供给）以及基因工程和合成生物学方法，提高BC产量和功能化，推动其在食品包装、生物医学等领域的应用 | NA | 探索农业和农业工业废弃物的微生物转化，以生产高价值细菌纤维素，促进循环生物经济发展 | 农业和农业工业废弃物（如果皮、甘蔗渣、谷物秸秆、玉米秸秆）作为碳源，以及细菌纤维素的生产过程 | NA | NA | 发酵过程优化（静态和搅拌培养、共培养、分步营养供给）、基因工程、合成生物学、组学指导优化 | NA | NA | NA | 基因工程、合成生物学 | 细菌（未指定具体种类） | NA | 食品包装、生物医学、化妆品、先进生物复合材料 |
| 7 | 2026-01-01 |
Deep learning-based investigation of chloroplast translation regulatory sequences
2025, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2025.1698951
PMID:41459449
|
研究论文 | 本研究开发了一种结合CNN、LSTM、Attention和Residual架构的混合深度学习模型，用于分类和分析植物与藻类叶绿体翻译调控序列，特别是5'非翻译区序列及SD基序的存在与否 | 首次应用深度学习模型分析叶绿体翻译调控序列，并提出了在藻类质体工程中引入异源前导序列的两种潜在策略 | 模型性能虽强，但存在一小部分植物和藻类序列表现出跨组模式，可能影响分类准确性 | 研究叶绿体翻译调控序列的架构，以促进合成生物学和基因工程的发展 | 植物和藻类的叶绿体5'非翻译区序列，包括含与不含SD基序的序列 | 机器学习 | NA | 深度学习 | CNN, LSTM, Attention, Residual | 序列数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 基因工程 |
| 8 | 2026-01-01 |
Macrophage polarization: molecular mechanisms, disease implications, and targeted therapeutic strategies
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1732718
PMID:41459510
|
综述 | 本文综述了巨噬细胞极化的分子机制、在疾病中的作用以及靶向极化的治疗策略 | 超越了传统的M1/M2二分法，强调了极化状态的连续性和动态性，并系统阐述了信号通路、代谢重编程和表观遗传机制之间的互作网络 | 临床转化面临脱靶效应、递送效率低、微环境依赖性等挑战 | 阐明巨噬细胞极化的分子机制及其在疾病中的作用，并探讨靶向极化的治疗策略 | 巨噬细胞（包括组织驻留巨噬细胞和单核细胞来源的巨噬细胞）及其极化状态 | 免疫学 | NA | 单细胞组学、空间转录组学、计算建模、合成生物学 | NA | NA | NA | 基因编辑 | NA | NA | 医学 |
| 9 | 2025-12-31 |
Molecular engineering and in-silico biotechnological innovations for microbial degradation of persistent pesticides
2026-Feb, Pesticide biochemistry and physiology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.pestbp.2025.106833
PMID:41461407
|
综述 | 本文综述了利用分子工程和生物技术创新促进微生物降解持久性农药的最新进展 | 整合了下一代测序、多组学平台、CRISPR-Cas编辑、合成生物学和AI驱动的代谢工程等多种前沿技术，并强调从实验室到田间应用的转化潜力 | NA | 推动微生物降解持久性农药，实现可持续的农药管理和环境修复 | 持久性农药、降解微生物、相关基因与酶途径 | 合成生物学 | NA | 下一代测序、多组学平台、CRISPR-Cas编辑、合成生物学、AI驱动的代谢工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | 微生物 | NA | 环境、农业 |
| 10 | 2025-12-31 |
Wetting-Mediated Remodeling of the Cytoskeletal Cortex by Phase-Separated Condensates in Cell-Free Reactions
2025-Dec-29, Biomacromolecules
IF:5.5Q1
DOI:10.1021/acs.biomac.5c01410
PMID:41461602
|
研究论文 | 本研究开发了一个整合无细胞转录翻译反应与相分离蛋白凝聚物的合成生物学平台，用于精确研究凝聚物与细胞骨架元素的相互作用 | 首次在无细胞系统中展示了细菌肌动蛋白同源物MreB形成的支架能促进蛋白凝聚物的润湿，并触发细胞骨架网络的毛细驱动收缩 | 研究基于无细胞反应体系，可能无法完全模拟真实细胞内的复杂环境 | 探究无膜细胞器如何与细胞骨架网络相互作用并重塑类细胞结构 | 细菌肌动蛋白同源物MreB、相分离蛋白凝聚物、水-油液滴界面 | 合成生物学 | NA | 无细胞转录翻译反应 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 基础生物学研究 |
| 11 | 2025-12-31 |
Microbial Systems Enhancing CAR-Based Therapies: A Synthetic Biology Paradigm for Next-Generation Cancer Immunotherapy
2025-Dec-27, Current microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00284-025-04679-z
PMID:41454921
|
综述 | 本文系统综述了利用合成生物学方法改造微生物系统以增强CAR免疫疗法在实体瘤治疗中的应用，旨在解决制造可扩展性、肿瘤靶向特异性和抗原异质性等挑战 | 提出将工程化益生菌株作为可编程工厂，用于合成抗原生产、scFv表达、共刺激结构域递送以及肿瘤微环境调节，并利用CRISPR/Cas工程化遗传电路实现治疗载荷的精确时空控制 | 临床转化的关键障碍包括生物防护挑战、对肿瘤归巢特异性的机制理解不完整以及安全性验证要求 | 评估微生物系统作为创新平台，通过合成生物学方法解决CAR免疫疗法在实体瘤应用中的局限性，并弥合临床前进展与临床实施之间的差距 | 工程化益生菌株（如大肠杆菌Nissle 1917）及其在CAR-T细胞疗法中的应用 | 合成生物学 | 癌症 | CRISPR/Cas | NA | NA | 389项同行评议研究（2015-2025年） | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 遗传电路，用于精确时空控制治疗载荷 | 医学 |
| 12 | 2025-12-31 |
Identification of a Group of UDP-Glycosyltransferases Catalyze emodin Glycosylation in Rheum officinale With Substrates Promiscuity
2025-Dec-27, Phytochemistry
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.phytochem.2025.114763
PMID:41461342
|
研究论文 | 本研究从药用植物掌叶大黄中鉴定并功能表征了六个UDP-糖基转移酶，这些酶催化大黄素糖基化形成大黄素-6-O-葡萄糖苷，为蒽醌苷的生物合成途径提供了新见解 | 首次在掌叶大黄中鉴定出催化大黄素糖基化的UGTs，并通过分子对接和定点突变揭示了底物识别与催化的关键氨基酸残基 | NA | 阐明掌叶大黄中蒽醌苷生物合成的关键酶及其功能 | 掌叶大黄中的UDP-糖基转移酶及其催化的大黄素糖基化反应 | 合成生物学 | NA | 生化测定、分子对接分析、定点诱变 | NA | NA | 六个UGTs（RoUGT1,2,4,5,6,8） | NA | NA | NA | 医药 |
| 13 | 2025-12-31 |
Geometric deep learning assists protein engineering. Opportunities and Challenges
2025-Dec-26, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108790
PMID:41456696
|
综述 | 本文全面评述了几何深度学习在蛋白质工程中的应用、机遇与挑战 | 系统整合了几何深度学习在蛋白质工程中的方法论原理、架构多样性和性能趋势，强调了其在提升可解释性和泛化能力方面的作用，并提出了将可解释人工智能与基于结构的验证相结合的统一概念框架 | NA | 探讨几何深度学习如何变革蛋白质工程的计算设计流程 | 蛋白质工程中的稳定性预测、功能注释、分子相互作用建模及从头蛋白质设计 | 机器学习 | NA | 几何深度学习 | 几何深度学习模型 | 非欧几里得域数据（空间、拓扑、物理化学特征） | NA | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 14 | 2025-12-31 |
Protein-Based Nanostructures: Column-free Biosynthesis of Bundlemer Peptides with Programmable, Orthogonally Reactive Handles for Nanomaterial Construction
2025-Dec-24, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.5c17204
PMID:41369150
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于重组表达的、可编程的束状肽（bundlemer）作为模块化构建单元，用于构建复杂的蛋白质纳米结构 | 通过融合pH可切割的intein-inclusion body实现无痕纯化，并整合SpyTag和sortase识别基序，实现了正交反应性连接和精确组装 | NA | 开发模块化生物合成平台，用于构建具有精确结构和功能的蛋白质纳米材料 | 重组表达的束状肽及其融合构建体 | 合成生物学 | NA | 重组表达、TEM、SEC-MALS、SDS-PAGE、DLS | NA | 蛋白质序列、结构图像 | NA | SpyCatcher-SpyTag连接、sortase介导连接 | NA | 模块化束状肽作为构建单元，通过正交连接化学组装成纤维结构和多层纳米笼结构 | 生物材料工程、靶向药物递送、合成生物学 |
| 15 | 2025-12-31 |
Real-Time Monitoring of Microbial Metabolic Dynamics through a Carbon Dot-Functionalized Whole-Cell Electrochemical Biosensor
2025-Dec-24, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.5c18617
PMID:41395934
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于碳点功能化全细胞电化学生物传感器的平台，用于实时监测微生物代谢动态 | 通过将碳点工程化微生物与先进循环伏安法相结合，利用量子增强电荷传输机制实现电化学信号近20倍放大，并采用模块化生物架构设计，可跨多种微生物系统无缝适配 | NA | 开发实时监测微生物代谢动态的新型生物传感平台 | 微生物代谢网络及其动态变化 | NA | NA | 碳点工程化、循环伏安法、电化学生物传感 | NA | 电化学信号、代谢物数据 | NA | 碳点功能化、合成生物学 | 微生物（具体种类未指定） | 全细胞生物传感器、模块化生物架构 | 工业生物技术、临床诊断、生物过程优化 |
| 16 | 2025-12-31 |
Computational design of allulose-responsive biosensor toolbox for auto-inducible protein expression and CRISPRi mediated dynamic metabolic regulation
2025-Dec-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-67669-6
PMID:41430049
|
研究论文 | 本文通过计算设计了一种基于转录因子的阿洛酮糖响应生物传感器工具箱，用于实现自动诱导蛋白表达和CRISPRi介导的动态代谢调控 | 成功实现了结构引导的计算设计，优化了阿洛酮糖响应PsiR的通道、配体结合和变构过程，使灵敏度提高20倍，并开发了检测范围广泛的PAB盒 | NA | 开发用于合成生物学的阿洛酮糖响应生物传感器工具箱，以支持自动诱导蛋白表达和动态代谢调控 | 转录因子（PsiR和LacI）、阿洛酮糖响应生物传感器、CRISPRi电路 | 合成生物学 | NA | 计算设计、CRISPR干扰 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 阿洛酮糖触发的CRISPR干扰电路、自动诱导蛋白表达系统 | 工业生物技术 |
| 17 | 2025-12-31 |
Temperature-Dependent Recombinase-Based Genetic Circuits
2025-Dec-15, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms262412055
PMID:41465482
|
研究论文 | 本文设计并表征了一套基于RNA温度计和位点特异性DNA重组酶的温度依赖性遗传电路，实现了对基因表达的精确、不可逆控制 | 将RNA温度计与位点特异性DNA重组酶（Bxb1）整合，构建了温度调控的遗传电路，实现了基因表达的不可逆、空间分辨控制，并展示了多种概念验证应用 | NA | 开发基于温度信号的遗传电路，以实现对细胞行为的可编程控制 | 遗传电路、重组酶Bxb1、RNA温度计（FourU）、基因表达 | 合成生物学 | NA | 遗传电路工程、重组酶技术 | NA | NA | NA | 重组酶Bxb1 | NA | 基于RNA温度计（FourU）调控重组酶Bxb1表达的遗传电路，包括温度触发裂解系统、记录温度梯度的纸基装置 | 合成生物学、生物传感、生物生产 |
| 18 | 2025-12-31 |
Synthetic Pentatricopeptide Repeat Proteins: Building a Toolkit for Precise RNA Control
2025-Dec-14, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms262412033
PMID:41465458
|
综述 | 本文综述了合成五肽重复蛋白作为可编程RNA工程工具的最新进展，包括其设计原理、应用及在合成生物学和生物医学中的潜力 | 利用可预测的氨基酸-核苷酸识别密码，理性设计具有可编程RNA结合特异性的合成PPR蛋白，并将其与催化结构域融合，开发出可在多种生物系统中实现精确碱基编辑的定制化酶 | NA | 总结PPR介导的RNA编辑的结构与机制原理，并强调合成PPR蛋白的设计与应用进展 | 合成五肽重复蛋白及其作为RNA工程工具的应用 | 合成生物学 | RNA介导的疾病 | 理性设计、蛋白质工程、结构域融合 | NA | NA | NA | 蛋白质工程 | 细菌, 植物, 人类细胞 | 可编程RNA结合蛋白、RNA稳定器、翻译调节器、靶向C-to-U或U-to-C编辑器 | 基础研究, 生物技术, 生物医学 |
| 19 | 2025-12-31 |
Development of the Efficient Electroporation Protocol for Leuconostoc mesenteroides
2025-Dec-11, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms262411933
PMID:41465360
|
研究论文 | 本研究开发并验证了一种针对肠膜明串珠菌H32-02 Ksu菌株的高效且可重复的电穿孔转化方案 | 首次为肠膜明串珠菌H32-02 Ksu菌株提供了稳定可重复的转化方案，通过优化细胞壁处理、电脉冲参数和质粒甲基化匹配，实现了约40倍的转化效率提升 | 该方案可能具有菌株特异性，对其他乳酸菌的适用性需进一步验证，且未涉及大规模应用测试 | 开发一种高效且可重复的电穿孔转化方案，以克服肠膜明串珠菌在遗传操作中的多重障碍 | 肠膜明串珠菌H32-02 Ksu菌株 | NA | NA | 电穿孔 | NA | NA | NA | 电穿孔 | 肠膜明串珠菌 | NA | 食品工业 |
| 20 | 2025-12-31 |
From Ancient Fermentations to Modern Biotechnology: Historical Evolution, Microbial Mechanisms, and the Role of Natural and Commercial Starter Cultures in Shaping Organic and Sustainable Food Systems
2025-Dec-10, Foods (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/foods14244240
PMID:41464947
|
综述 | 本文综述了天然发酵剂从古代到现代的历史演变、微生物机制，及其与商业发酵剂在塑造有机和可持续食品系统中的作用对比 | 系统性地将传统发酵知识与现代生物技术（如组学驱动的菌株筛选、合成生物学）相结合，为天然发酵剂在有机食品生产中的认证和应用提供了新的视角和路径 | 当前针对天然发酵剂（尤其是其复杂微生物群落）的监管框架主要集中于酵母，这对其更广泛的认证构成挑战 | 探讨天然发酵剂的历史发展、全球应用、微生物机制，以及其在现代有机和可持续食品系统中的角色与潜力 | 天然发酵剂（由乳酸菌、酵母和丝状真菌等组成的复杂微生物群落）及其在各类食品（谷物、豆类、乳制品、蔬菜、饮料、海鲜、肉类）发酵中的应用 | NA | NA | 组学技术、合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 食品, 农业, 工业生物技术 |