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当前共找到 5522 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-08-13 |
ROS-responsive bio-hybrid probiotics for synergistic acute lung injury therapy
2026-Nov, Colloids and surfaces. B, Biointerfaces
DOI:10.1016/j.colsurfb.2026.115903
PMID:42314510
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研究论文 | 本文报道了一种双功能工程化副干酪乳杆菌，通过合成生物学分泌白介素-4并结合材料表面修饰以清除活性氧，用于急性肺损伤的协同治疗。 | 将合成生物学与响应性材料工程相结合，构建了兼具细胞因子免疫调节和微环境响应抗氧化功能的双功能工程益生菌，实现了在炎症肺组织中的靶向递送和疗效累积。 | 摘要未提及具体局限性。 | 开发一种工程化益生菌平台，通过免疫调节和抗氧化应激协同作用，实现对急性肺损伤的有效治疗。 | 工程化副干酪乳杆菌、LPS和铜绿假单胞菌诱导的急性肺损伤小鼠模型。 | 合成生物学 | 急性肺损伤 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 副干酪乳杆菌 | 分泌白介素-4的基因回路，耦合材料表面修饰的活性氧清除功能。 | 医学 |
| 2 | 2026-08-13 |
Chemical Synthesis of Mirror-Image Proteins Reveals Chirality-Dependent Cellular Uptake Mediated by a Cell-Penetrating Peptide
2026-Aug-12, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.6c03792
PMID:42307060
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研究论文 | 本文通过化学合成镜像蛋白质，研究细胞穿透肽介导的细胞摄取过程中手性依赖性，发现L型货物比D型更有效被内化 | 首次在保持递送载体恒定的条件下系统研究货物手性对细胞摄取效率的影响 | 未探讨不同细胞类型或体内环境对手性摄取的影响，且主要基于体外细胞实验 | 探究镜像蛋白质在细胞摄取过程中的手性效应，为设计治疗性或合成生物学应用提供基础 | L型和D型构型的模型货物（不同大小和结构复杂性）及环状十精氨酸（cR10）细胞穿透肽 | 合成生物学 | NA | 化学合成 | NA | 细胞图像、流式细胞术数据 | 多种哺乳动物细胞系 | NA | 哺乳动物细胞 | NA | 医学、合成生物学 |
| 3 | 2026-08-13 |
Light-directed biofilm formation reveals the functional contributions of periplasmic cytochromes to the electrochemical activity of Shewanella oneidensis
2026-Aug-12, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.01264-26
PMID:42461042
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研究论文 | 本研究采用合成生物学方法，通过光诱导生物膜图案化，研究希瓦氏菌MR-1周质细胞色素在胞外电子转移和生物膜导电性中的功能贡献 | 将光诱导生物膜图案化与基因靶向敲除相结合，生成均匀几何定义的生物膜，克服了周质细胞色素网络复杂性和原生生物膜变异性带来的挑战，实现了电化学比较的稳健性 | 未明确提及局限性，可能包括周质细胞色素网络的部分冗余性以及光图案化技术内在的限制 | 阐明周质细胞色素在希瓦氏菌胞外电子转移向外路由和生物膜横向导电性中的具体功能作用 | 希瓦氏菌MR-1及其周质细胞色素基因敲除突变体 | 合成生物学 | NA | 基因敲除、光诱导生物膜图案化、伏安测量、电化学门控测量 | NA | 电化学数据、生物膜图像 | 多种基因敲除突变体菌株，具体数量未提供 | CRISPR-Cas9 | 希瓦氏菌MR-1 | 周质细胞色素基因敲除电路 | 环境生物技术、生物电化学 |
| 4 | 2026-08-13 |
Regulatory cascade of NdpR and NdpR2 in controlling nicotine degradation operons in Sphingomonas melonis TY
2026-Aug-12, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.01130-26
PMID:42584087
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研究论文 | 本文揭示了Sphingomonas melonis TY中NdpR和NdpR2调控尼古丁降解操纵子的多层级联调控网络，并基于此构建了可编程的多因子基因回路 | 首次阐明NdpR与NdpR2之间的层级调控关系及直接物理相互作用，提出双锁调控机制，并利用结构分析和分子模拟揭示NdpR的宽HTH跨度形成强空间位阻的分子机制 | 研究主要基于TY菌株和异源假单胞菌宿主，未在多种环境条件下验证系统的稳定性和可扩展性 | 理解微生物适应策略中尼古丁降解的复杂调控逻辑，并开发可编程、可调谐的合成生物学调控工具 | Sphingomonas melonis TY中的NdpR和NdpR2调控蛋白及其靶标启动子 | 合成生物学 | NA | 结构分析、突变分析、分子模拟 | NA | 蛋白质结构数据、分子模拟数据 | NA | NA | Sphingomonas melonis TY、假单胞菌属JY-Q | 多因子基因回路，对尼古丁、2,5-DHP和IPTG具有双向可逆响应 | 工业生物技术、合成生物学 |
| 5 | 2026-08-13 |
The iModulon framework: how x-AI reveals microbial regulatory logic
2026-Aug-12, mSystems
IF:5.0Q1
DOI:10.1128/msystems.00228-26
PMID:42584158
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综述 | 本文综述了基于独立成分分析（ICA）的iModulon框架，用于分解大型原核转录组数据，并介绍了iModulonDB 3.0及其跨物种比较结果 | 提出了iModulonDB 3.0，包含53个物种和71个ICA分解，并识别出13个跨远缘细菌保守的共享调控模块 | 文章讨论了iModulon重建和计算的设计原则与局限性，但具体限制未在摘要中详细说明 | 推动iModulon框架作为可访问的社区驱动方法，用于解读公共转录组数据并支持合成生物学中的模块级设计 | 原核生物的转录组数据，特别是来自53个物种的33,062个RNA-seq样本 | 机器学习 | NA | RNA-seq, ICA（独立成分分析） | 独立成分分析（ICA） | 转录组数据（RNA-seq） | 33,062个RNA-seq样本，涉及53个物种 | NA | 原核生物（多种细菌物种） | NA | 合成生物学 |
| 6 | 2026-08-13 |
Reprogramming Plant Salt Tolerance: A Systems Biology Perspective on Algae-Derived Elicitors and Biostimulants
2026-Aug-11, Plant, cell & environment
DOI:10.1111/pce.70813
PMID:42579745
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综述 | 本文综合评述了藻类及其生物活性提取物作为外源激发子，通过系统生物学视角重编程植物耐盐性的机制与应用。 | 首次从系统生物学角度整合藻类与植物防御系统的多维交互，提出通过合成生物学、纳米递送和多组学整合来增强植物耐盐性的未来路径。 | 从实验室条件到田间规模的转化效率仍是主要瓶颈。 | 探讨藻类衍生激发子如何重编程植物耐盐性，并评估其在农业中的应用潜力。 | 藻类及其提取物（如多糖、植物激素和多元醇）与植物防御系统。 | 系统生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 农业 |
| 7 | 2026-08-13 |
Metabolic engineering of Candida yeasts for biotechnological applications
2026-Aug-11, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2026.102522
PMID:42580625
|
综述 | 系统综述了念珠菌属酵母作为微生物细胞工厂在代谢工程方面的最新进展，涵盖遗传工具扩展、非常规碳源利用及高价值化合物合成，并提出生物安全分类框架 | 提出生物安全导向的分类框架以支持念珠菌的安全工业应用，并强调合成生物学与人工智能驱动设计的协同作用 | 未详细讨论具体菌株的遗传操作细节或定量比较各工具效率，且对未来挑战的探讨较为概览性 | 总结念珠菌代谢工程在工业生物技术中的应用进展，并探讨其安全利用和未来发展方向 | 念珠菌属酵母（Candida species） | 代谢工程、合成生物学 | NA | 功能基因组学、基因组编辑、系统代谢工程 | NA | 文献综述数据 | NA | 基因组编辑工具（如CRISPR-Cas9等，具体未指定） | 念珠菌属酵母（Candida species） | 代谢通路设计（用于生产化学品、燃料和蛋白质） | 工业生物技术 |
| 8 | 2026-08-13 |
The Expanding Reactivity of Cobamide-Containing Proteins: From Mechanistic Understanding to Non-native Biocatalysis
2026-Jul-03, ACS catalysis
IF:11.3Q1
DOI:10.1021/acscatal.6c03394
PMID:42577960
|
perspective | 本文概述了含钴酰胺蛋白的机制基础及其在天然和非天然生物催化中的应用进展，探讨了利用这些蛋白进行非天然反应的新兴策略。 | 首次系统探讨了钴酰胺依赖酶在非天然生物催化中的潜力，结合蛋白质工程和合成生物学策略，拓展了其反应性应用。 | 由于是观点性文章，未提供具体的实验数据，且对非天然反应的案例讨论可能不够深入。 | 总结含钴酰胺蛋白的关键机制，并展望其在天然和非天然生物催化中的应用前景。 | 含钴酰胺的蛋白质，包括异构酶、甲基转移酶和还原性脱卤酶等。 | 生物催化、蛋白质工程、合成生物学 | NA | 蛋白质工程、合成生物学 | NA | NA | NA | 蛋白质工程工具（未具体指明） | 未具体指明 | 钴酰胺辅因子相关的酶促反应，如自由基重排、甲基转移和还原性键断裂 | 工业生物技术 |
| 9 | 2026-08-13 |
Modular Assembly of Higher-Order DNA Nanotube Tile Nanostructures Using DNA Annular Scaffolds
2026-06-03, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.6c04434
PMID:42139459
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研究论文 | 本文提出一种基于可编程DNA纳米管瓦片作为构建模块的模块化组装策略，通过多个DNA环形支架与短DNA基序互连构建高阶、模块化系统，实现了超过99%的组装产率，并构建了多种超结构和布尔逻辑门及电路 | 整合了DNA瓦片和DNA origami的优点，利用DNA环形支架连接DNA纳米管瓦片，实现了稳定、可预测且逻辑可控的高阶纳米结构模块化组装，并展示了快速拆卸和组件可重用性 | 摘要中未明确提及局限性，可能包括组装过程的复杂性和对特定条件的依赖性等未说明内容 | 开发一种模块化组装策略，以DNA纳米管瓦片为构建模块，构建可预测、稳定且逻辑可控的高阶DNA纳米结构，并扩展DNA纳米技术的应用空间 | DNA纳米管瓦片、DNA环形支架、短DNA基序、DNA纳米结构聚合物和超结构 | 纳米技术、合成生物学 | NA | DNA纳米技术、DNA瓦片组装、DNA origami | NA | 结构数据（DNA纳米结构） | 未提供具体样本数量，涉及多种不同直径的DNA环形支架和多种组装结构 | DNA纳米技术 | NA | 布尔逻辑门和电路，基于DNA纳米管瓦片的模块化组件 | 纳米技术、合成生物学 |
| 10 | 2026-08-13 |
Transcriptional regulation: efficient genetic engineering tools for non-conventional yeasts
2026-Jan-05, FEMS yeast research
IF:2.4Q3
DOI:10.1093/femsyr/foag032
PMID:42545751
|
综述 | 本文综述了非传统酵母的转录调控工具，包括经典启动子、转录因子以及CRISPR/Cas等创新技术，旨在优化代谢工程以提高生物燃料等产物的产量 | 重点介绍了新型可编程技术如CRISPR/Cas介导的转录激活与抑制，以及动态调控系统，为精细调节代谢途径和平衡细胞资源提供新策略 | 未详细讨论具体实验数据或案例，可能缺乏实际应用效果的深入分析 | 探讨非传统酵母中用于代谢工程的转录调控工具，以促进可持续生物产品开发 | 非传统酵母 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 非传统酵母 | 动态调控系统 | 工业生物技术 |
| 11 | 2026-08-13 |
Life beyond 6000 genes: from sequence to synthesis in a post-genomics era
2026-Jan-05, FEMS yeast research
IF:2.4Q3
DOI:10.1093/femsyr/foag034
PMID:42556387
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综述 | 本文回顾了酿酒酵母基因组测序项目三十年来的成就，并探讨了基因组学如何从描述性资源发展为工程生物学的核心基础设施，展望了人工智能和生物电子学对未来酵母基因组学和工程生物学的影响 | 强调从基因组解码到合成基因组学的转变，特别是Sc2.0项目作为合成基因组学的典范，并整合了人工智能和生物电子学等新兴趋势展望未来三十年 | 未提及具体局限性 | 庆祝酵母测序项目成就，展示基因组学在工程生物学中的核心作用，并预测未来发展方向 | 酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae） | 基因组学、合成生物学 | NA | 基因组测序、合成基因组学 | NA | 基因组序列数据 | NA | Sc2.0项目相关合成工具（未具体提及CRISPR等） | 酿酒酵母（S. cerevisiae） | NA | 生物技术、工业生物技术 |
| 12 | 2026-08-13 |
Strengthening global biosecurity for synthetic nucleic acid technology: from sequence screening to risk-based governance in the AI era
2026, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2026.1820001
PMID:42582258
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综述 | 本文回顾了合成核酸技术的生物安全治理现状，指出基于序列筛查的现有措施在AI辅助生物设计时代存在结构性局限，并提出一个基于风险的、四维度系统性治理框架和四级升级模型 | 提出将AI辅助设计能力纳入生物安全评估的系统性风险框架，并引入四级治理升级模型，强调公平性和比例原则 | 框架是诊断性和半结构化的，而非定量，可能缺乏精确性 | 加强合成核酸技术的全球生物安全治理，以应对AI时代的挑战 | 合成核酸技术、生物安全治理框架、AI辅助设计工具 | 自然语言处理 | NA | NA | 蛋白质语言模型 | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 13 | 2026-08-13 |
From Mechanism to Clinic: Engineered Bacteria-Nanomaterial Hybrid Systems for Cancer Immunotherapy
2026, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.1390
PMID:42582682
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综述 | 本文综述了工程细菌-纳米材料混合系统在癌症免疫治疗中的应用，涵盖机制、设计策略及临床转化前景 | 系统性地探讨了细菌-纳米材料混合系统如何利用肿瘤相关细菌和物理刺激（如光热、光动力、声动力和磁热效应）增强肿瘤靶向性和抗肿瘤免疫，并总结了从机制到临床的转化路径 | 临床转化需更多关于安全性、可控性、制造一致性和疗效的证据 | 探讨工程细菌-纳米材料混合系统在癌症免疫治疗中的应用机制、设计策略及临床转化的挑战和前景 | 工程细菌-纳米材料混合系统、肿瘤相关细菌、纳米材料及物理刺激 | 纳米医学、合成生物学 | 癌症 | NA | NA | NA | NA | NA | 细菌（如肿瘤靶向细菌） | NA | 医学 |
| 14 | 2026-08-13 |
Molecular mechanisms of bacteria-mediated cancer immunotherapy: from intratumoral microbiota to engineered therapeutics
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1878878
PMID:42582890
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综述 | 本文综合探讨了细菌介导的癌症免疫疗法（BCIT）的分子机制，包括瘤内菌群对肿瘤的增强或抑制作用，以及通过合成生物学等工程手段将细菌改造为精准递送平台，并评估了临床转化中的障碍和未来方向 | 系统整合了瘤内菌群在癌症免疫中的双重作用机制，并概述了包括群体感应电路、热诱导开关、分子模拟和生物混合微型机器人在内的先进工程策略，提出了AI引导的微生物组整合框架以加速临床转化 | 综述中提到临床转化存在安全性、药代动力学、监管科学和患者间异质性等瓶颈，但未提供解决这些问题的具体实验数据或案例 | 为利用活体细菌疗法将免疫学上“冷”肿瘤转化为“热”肿瘤提供概念框架，并讨论未来微生物组驱动的肿瘤学试验的关键方向 | 瘤内细菌、工程细菌菌株及其在癌症免疫治疗中的应用 | 合成生物学、免疫学、微生物组学 | 癌症 | 合成生物学、单细胞测序、无菌动物建模 | NA | 文献数据、概念数据 | NA | CRISPR-Cas9（提及可编程平台，但未具体指明工具，常涉及）、其他合成生物学工具 | 细菌（共生或减毒病原体） | 群体感应电路、热诱导开关、分子模拟、生物混合微型机器人 | 医学 |
| 15 | 2026-08-13 |
Recent innovations in cannabinoid chemistry, biology, and biosynthesis
2025-Dec, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103378
PMID:41205317
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综述 | 本文综述了大麻素化学、生物学和生物合成的最新进展，重点关注次要大麻素的新型生物活性、不对称合成方法以及合成生物学策略 | 整合了药理学、合成化学和工程化生产策略的跨学科反馈，扩展了次要大麻素的获取途径和理解 | 未提及 | 总结大麻素药理学、合成化学创新和工程化生产策略的最新见解，强调跨学科反馈对次要大麻素研究的影响 | 次要大麻素及其类似物 | 合成生物学 | NA | 不对称合成、异源途径重建、功能类似酶发现 | NA | 文献数据 | NA | NA | NA | 异源途径重建 | 医药 |
| 16 | 2026-08-13 |
ChronoSort: Revealing Hidden Dynamics in AlphaFold3 Structure Predictions
2025-Dec, SynBio
DOI:10.3390/synbio3040018
PMID:42583324
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研究论文 | 本文介绍ChronoSort算法，从AlphaFold3结构预测集合中提取动态信息，生成时间一致的轨迹，并与分子动力学模拟结果高度相关 | 首次证明AlphaFold3结构集合包含与分子动力学模拟相关的动态信息，并开发了ChronoSort算法将这些静态预测组织成时间连贯的轨迹 | 仅对四个蛋白质靶点进行了验证，样本量较小，可能限制结论的普遍性 | 探索从AI结构预测工具中提取蛋白质动态信息的潜力，以加速功能研究 | 四个不同的蛋白质靶点 | 结构生物学，人工智能 | NA | AlphaFold3结构预测，分子动力学模拟，主成分分析 | AlphaFold3 | 蛋白质结构预测集合 | 四个蛋白质靶点 | NA | NA | NA | 合成生物学，蛋白质工程，药物发现，结构功能研究 |
| 17 | 2026-08-13 |
Smart closed-loop drug delivery systems
2025-Oct, Nature reviews bioengineering
DOI:10.1038/s44222-025-00328-z
PMID:42583055
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综述 | 本文综述了智能闭环药物递送系统的最新进展，探讨了可穿戴和可植入设备在连续生物标志物监测和响应性治疗中的应用，并强调了人工智能在优化控制算法中的作用 | 强调了将合成生物学和工程细胞整合到可植入设备中的前景，以及人工智能用于增强闭环系统自适应治疗的能力 | 未具体说明，可能受限于当前技术成熟度和临床转化挑战 | 探讨智能闭环药物递送系统的现状、挑战和未来发展方向，以改善慢性病管理的精准性和个性化 | 智能闭环药物递送系统，包括可穿戴和可植入技术，以及相关控制算法 | 生物医学工程 | 慢性疾病 | 实时生物传感 | NA | 生物标志物数据 | NA | NA | NA | 闭环控制回路 | 医学 |
| 18 | 2026-08-13 |
Incompatibility in cell adhesion constitutes a barrier to interspecies chimerism
2024-10-03, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2024.07.010
PMID:39181131
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研究论文 | 该研究揭示了细胞粘附不相容性是种间嵌合形成的障碍，并开发了基于纳米抗体-抗原相互作用的合成生物学策略来增强种间细胞粘附，从而提高了人类多能干细胞在小鼠胚胎中的嵌合率 | 首次揭示细胞粘附不相容性是种间嵌合的限制因素，并创新性地利用纳米抗体-抗原相互作用增强种间细胞粘附，显著提高了人类多能干细胞在小鼠胚胎中的嵌合率 | 仅限于小鼠胚胎模型，人类细胞在更远缘动物宿主中的嵌合效果可能仍受其他异种屏障影响 | 探究种间嵌合形成中细胞粘附的障碍及克服方法，以提高人类器官在动物体内生长的可行性 | 人类多能干细胞和小鼠多能干细胞 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术、细胞培养、嵌合体分析 | NA | 实验数据（细胞粘附分析、嵌合率统计） | 未明确说明样本量，涉及人类和小鼠多能干细胞系 | 纳米抗体-抗原表达系统 | 小鼠胚胎 | 增强种间细胞粘附的合成生物电路（表达纳米抗体和对应抗原） | 医学 |
| 19 | 2026-08-13 |
Promoters and Synthetic Promoters in Trichoderma reesei
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4063-0_3
PMID:39068331
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综述 | 本文综述了里氏木霉中天然启动子和合成启动子的研究进展，重点介绍了可调控和组成型启动子对蛋白表达的影响、新启动子的发现以及未来优化蛋白表达的策略 | 系统总结了将强诱导型启动子如Pcbh1通过替换转录抑制因子与激活因子进行改造，以及将组成型启动子Pcdna1转化为合成杂合启动子的方法，并整合了多种合成表达系统 | 本文仅为综述，未包含新的实验数据，且指出仍需进一步研究以发现新启动子和制定新表达策略来提升工业规模蛋白产量 | 阐述里氏木霉中可调控和组成型启动子的研究、不同启动子对天然和异源蛋白表达的影响、新启动子的发现，以及未来优化蛋白表达的策略 | 里氏木霉（Trichoderma reesei）的启动子及合成启动子 | 合成生物学 | NA | 基因组分析、转录组分析、合成生物学方法 | NA | 基因组和转录组数据 | NA | 合成启动子、基因表达系统 | 里氏木霉 | 可诱导表达系统（如光响应、铜诱导、L-甲硫氨酸诱导、Tet-On系统）及合成杂合启动子 | 工业生物技术 |
| 20 | 2026-08-13 |
Chemical Reaction Models in Synthetic Promoter Design in Bacteria
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4063-0_1
PMID:39068329
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研究论文 | 本文讨论化学反应网络（CRN）作为计算机辅助设计界面，用于在细菌合成启动子设计中应用形式化方法，并以大肠杆菌双组分系统为例展示模型如何调谐启动子强度 | 将化学反应网络模型作为合成启动子设计的计算机辅助接口，通过形式化方法扫描和探索不同检测阈值的表型区域，为微调启动子强度提供新途径 | 基于已发表结果，未涉及实际实验验证 | 利用化学反应网络模型辅助合成启动子设计，以匹配特定规格 | 大肠杆菌双组分系统及合成启动子 | 合成生物学 | NA | 化学反应网络建模 | 化学反应网络（CRN）模型 | 模型数据 | NA | NA | 大肠杆菌 | 合成启动子 | 工业生物技术 |