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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-08-31 |
iFLinkC-EZ: A scalable and automatable method for the assembly of complex fusion proteins and multi-gene expression constructs based on the iFLinkC framework
2026-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2026.03.008
PMID:42006855
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研究论文 | 本文介绍了iFLinkC-EZ,一种基于iFLinkC框架的可扩展且自动化的方法,用于组装复杂融合蛋白和多基因表达构建体 | 通过遗传手段纯化DNA组装产物,简化了组装过程并使其兼容机器人自动化 | 未明确提及具体局限性 | 开发一种简化且自动化的DNA组装方法,用于复杂融合蛋白和多基因表达构建体的高效构建 | 多色荧光融合蛋白、多顺反子表达构建体、酵母表面展示重组结合蛋白 | 合成生物学 | NA | iFLinkC克隆技术 | NA | DNA序列 | 未明确说明样本数量,但涉及超过80代的稳定性实验 | iFLinkC-EZ | 酵母 | 多顺反子表达构建体、融合蛋白表达构建体 | 生物技术、基础研究 |
| 2 | 2026-08-31 |
Engineered bacterial therapeutics from synthetic biology to clinical translation: A multi-database scientometric analysis, 2000-2026
2026-Dec, Human vaccines & immunotherapeutics
IF:4.1Q2
DOI:10.1080/21645515.2026.2720162
PMID:42641146
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研究论文 | 该研究通过多数据库科学计量分析,描绘了工程化细菌治疗领域从合成生物学到临床转化的知识结构、合作模式和转化方向 | 首次采用多数据库科学计量学方法对工程化细菌治疗领域2000至2026年的研究进行全面图谱分析,揭示了从基础构建向临床转化的主题演变 | 仅纳入英语文献,且2026年为部分检索年份,可能影响全面性 | 绘制工程化细菌治疗领域的知识结构、协作模式和转化方向 | 工程化细菌治疗相关的出版物 | 科学计量学 | NA | 文献计量分析 | NA | 文献数据 | 1730篇英文文章和综述 | NA | NA | 细菌底盘构建和电路设计 | 医学 |
| 3 | 2026-08-31 |
Methylotrophic yeast engineering for secreted protein production via precision fermentation: food ingredient proteins and synthetic biology strategies
2026-Aug-29, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2026.102532
PMID:42668082
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综述 | 本文综述了甲基营养型酵母在精准发酵中用于生产食品蛋白成分的研究进展,重点介绍了Komagataella phaffii的工程化策略及未来潜力。 | 系统总结了甲基营养型酵母在生产食品蛋白方面的最新进展,并强调了合成生物学与代谢工程策略的结合,特别是在基因组工程、分泌途径工程和糖工程方面。 | 未提及具体局限性。 | 探讨通过精准发酵利用甲基营养型酵母生产食品蛋白成分的可行性和未来发展方向。 | 甲基营养型酵母(特别是Komagataella phaffii)及其分泌的重组蛋白。 | 合成生物学、代谢工程 | NA | 基因工程、分泌途径工程、糖工程 | NA | 文献数据 | NA | NA | 甲基营养型酵母(Komagataella phaffii) | 合成生物学和代谢工程策略,如基因组工程、基因表达工具、分泌途径工程和糖工程 | 食品工业、工业生物技术 |
| 4 | 2026-08-31 |
Navigating regulatory fragmentation in the convergence of synthetic biology, artificial intelligence, and automation
2026-Aug-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-77338-x
PMID:42668325
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研究论文 | 本文对合成生物学、人工智能与自动化融合(SynBioxAI)的监管碎片化进行了跨司法管辖区分析,并提出一个实用的制度框架来解决监管分歧。 | 首次提出SynBioxAI监管互操作工具包(RIOT),这是一个七镜头制度框架,旨在帮助研究机构高效透明地应对监管分歧,并揭示监管摩擦的乘数效应而非加性效应。 | 未在摘要中提及具体局限性。 | 分析SynBioxAI融合领域的监管碎片化问题,并提出解决方案以提升监管互操作性。 | 十六个国家的监管框架及七个现实合作场景。 | 机器学习 | NA | NA | NA | 文本 | 十六个国家、七个场景 | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 5 | 2026-08-31 |
Self-sufficient killing of malignant tumors by an engineered cancer-selective gene circuit
2026-Aug-18, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2026.102936
PMID:42492518
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研究论文 | 该论文介绍了一种通过工程化基因电路选择性杀死恶性肿瘤细胞的方法,该电路利用机器学习指导的随机森林框架开发出癌症选择性启动子,并在腺病毒载体中实现肿瘤限制性复制和长期肿瘤抑制。 | 创新点在于利用机器学习指导的随机森林框架设计癌症选择性启动子,该启动子仅在ETS转录因子过表达或基因融合事件中激活,而在正常组织中保持沉默,实现了严格意义上的癌症特异性。 | 论文摘要未明确提及研究局限性。 | 开发一种能够选择性消除肿瘤细胞的基因治疗策略,克服合成生物学和溶瘤病毒疗法的关键障碍。 | ETS转录因子过表达或基因融合的癌细胞,以及携带转移性肺肿瘤的小鼠模型。 | 合成生物学、机器学习、肿瘤学 | 肺癌 | 基因电路工程、腺病毒载体递送 | 随机森林 | 基因组数据、实验数据 | 小鼠模型(具体数量未提及) | 未提及 | 小鼠 | 癌症选择性基因电路,包含癌症选择性启动子P,用于驱动腺病毒复制。 | 医学、肿瘤治疗 |
| 6 | 2026-08-31 |
Synthetically engineered probiotic suppresses colorectal cancer via inhibition of Wnt/β-catenin signaling
2026-Aug-18, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2026.102913
PMID:42612617
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研究论文 | 该论文开发了一种合成生物学改造的益生菌,通过抑制Wnt/β-catenin信号通路来治疗结直肠癌,并实现了非侵入性诊断和靶向治疗的结合 | 首次利用鸟氨酸响应性生物发光报告系统和局部释放DKK3的工程益生菌,将诊断与治疗功能整合于单一平台,并在多种临床前模型及患者来源类器官和异种移植模型中验证了其抗癌疗效 | 摘要未提及具体的局限性,如潜在的安全性、长期疗效或临床转化障碍 | 开发一种基于工程益生菌的结直肠癌诊断和治疗平台,通过抑制Wnt/β-catenin信号通路以减缓肿瘤生长,并改善患者预后 | 结直肠癌小鼠模型、结直肠癌患者、工程化大肠杆菌Nissle 1917(EcN) | 合成生物学、肿瘤学 | 结直肠癌 | 粪便代谢组学分析、基因工程改造细菌 | 生物发光报告系统、基因表达系统 | 代谢组学数据、临床前模型数据(小鼠模型、患者来源类器官和异种移植模型) | 涉及结直肠癌小鼠模型和患者样本,具体数量未提及 | 基因工程技术 | 大肠杆菌Nissle 1917(EcN) | 鸟氨酸响应性生物发光报告系统;局部释放Dickkopf 3(DKK3)的基因回路 | 医学、预防肿瘤学 |
| 7 | 2026-08-31 |
Chemical Synthesis of Mirror-Image Proteins Reveals Chirality-Dependent Cellular Uptake Mediated by a Cell-Penetrating Peptide
2026-08-12, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.6c03792
PMID:42307060
|
研究论文 | 通过化学合成镜像蛋白,揭示了细胞穿透肽介导的细胞摄取具有手性依赖性 | 首次系统性地研究货物手性对细胞摄取的影响,同时保持递送载体恒定,发现天然L型货物比镜像D型货物更易被细胞摄取 | 未明确提及研究的局限性 | 探究镜像肽和蛋白质的细胞内摄取效率与天然L-形式相比的情况 | 三种不同大小和结构复杂性的模型货物,包括L型和D型构型,以及环状十精氨酸细胞穿透肽 | 化学生物学 | 不适用 | 化学合成、流式细胞术、凝胶分析、共聚焦显微镜 | 不适用 | 细胞图像、流式细胞术数据 | 多种哺乳动物细胞系 | 化学合成 | 哺乳动物细胞 | 不适用 | 医学、合成生物学 |
| 8 | 2026-06-28 |
Better synthetic biology outcomes through balanced push-pull engineering
2026-Aug-04, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiag437
PMID:42361298
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 9 | 2026-08-31 |
A hybrid system enables plasmid copy number control in yeast
2026-Jul-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-75973-y
PMID:42660886
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研究论文 | 开发了一种基于内源2μ质粒的可编程质粒拷贝数控制平台,用于酵母中基因剂量调控 | 首次在真核生物中实现动态质粒拷贝数调控,通过添加CEN元件和Leu2d选择实现拷贝数可切换,并构建了定量工具包 | 未提及具体局限性,但可能受限于酵母宿主和特定应用场景 | 建立酵母中可调节质粒拷贝数的合成生物学工具,实现基因剂量控制 | 酿酒酵母(S. cerevisiae)及其内源2μ质粒 | 合成生物学 | NA | 质粒工程、基因表达分析、代谢产物定量 | NA | 基因表达数据、代谢产物数据 | NA(具体样本数量未给出) | NA(未明确提及,但可能涉及分子克隆工具) | 酿酒酵母(S. cerevisiae) | p2μ-Cir系统,结合CEN元件和Leu2d选择实现拷贝数调控 | 工业生物技术、医学(GLP-1前体)、食品(2-苯乙醇、β-胡萝卜素、麦角硫因生产) |
| 10 | 2026-08-31 |
Toward life with a 19-amino acid alphabet through generative artificial intelligence design
2026-Apr-30, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aeb5171
PMID:42060756
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研究论文 | 本研究通过计算设计与合成生物学探索构建仅使用19种氨基酸的生命体,证明异亮氨酸可能为非必需,并通过替换核糖体所有382个异亮氨酸残基创建可行且进化稳定的细胞 | 首次通过蛋白质语言模型和结构模型结合合成生物学,系统性地将核糖体中所有异亮氨酸残基替换,创建了可行的19种氨基酸生命体,为简化遗传密码提供了新路径 | 仅针对细菌(可能为大肠杆菌)中的核糖体进行了替换,未涉及其他必需蛋白或非原核生物,且长期进化稳定性仅在特定条件下验证 | 探索构建一个使用19种氨基酸字母表(去除异亮氨酸)的简化生命体,并评估其可行性 | 大肠杆菌细胞及其核糖体中的异亮氨酸残基 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、蛋白质语言模型、结构基模型 | 蛋白质语言模型、结构基模型 | 蛋白质序列和结构数据 | 382个异亮氨酸残基被系统性替换在核糖体中,涉及21个重新设计的亚基 | NA | 大肠杆菌 | NA | 基础生物学 |
| 11 | 2026-08-31 |
Engineering Motile Coacervate Droplets via Nanomotor Stabilization
2025-09-03, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c09366
PMID:40834351
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研究论文 | 本研究通过将金纳米颗粒包被的纳米马达锚定在凝聚液滴界面,并结合三元共聚物膜实现稳定,成功构建了具有运动能力的人工细胞模型,展示了光驱动的微马达平台。 | 首次将纳米马达与三元共聚物膜结合,稳定凝聚液滴并赋予其运动能力,实现光驱动的运动控制,填补了凝聚液滴人工细胞在运动功能上的空白。 | 运动性能依赖于激光刺激和纳米马达密度,且凝聚液滴的长期稳定性仍需进一步验证。 | 开发具有运动功能的凝聚液滴人工细胞,模拟自然细胞的运动特性。 | 凝聚液滴人工细胞系统,包含金纳米颗粒包被的纳米马达和三元共聚物膜。 | 合成生物学 | 不适用 | 纳米马达物理锚定、静电相互作用、表面等离激元热效应 | 不适用 | 图像、实验数据 | 不同浓度的纳米马达、不同尺寸的凝聚液滴 | 不适用 | 不适用 | 光驱动微马达平台(利用金纳米颗粒的等离激元热效应) | 生物医学、材料科学 |
| 12 | 2026-08-30 |
Autoinducer 2 as a universal language in microbial consortia: decoding molecular mechanisms, ecological impacts, and application
2026-12-31, Gut microbes
IF:12.2Q1
DOI:10.1080/19490976.2026.2615494
PMID:41574816
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综述 | 本文系统综述了自诱导物2(AI-2)在微生物群落中的分子机制、生态影响及应用,涵盖其结构动态、受体多样性、信号转导、代谢调控和多种应用领域 | 首次系统整合AI-2的双重结构动态(S-THMF-硼酸/R-THMF互变)及其环境依赖角色,并详细探讨了影响AI-2产生的内外部因素,为微生物通信在化学工程和环境可持续性中的应用提供了路线图 | 文章指出了AI-2介导的空间异质性和多群体感应系统协调方面的知识空白,未提供实验验证 | 解码AI-2在微生物群落中的分子机制、生态影响及应用,为利用微生物通信提供指导 | 自诱导物2(AI-2)及其介导的微生物群落交互 | 微生物学,合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 宿主健康,农业,工业,环境生态 |
| 13 | 2026-08-30 |
Miniaturized CRISPR: Ultra Compact Systems for In Vivo Delivery and Portable Diagnostics
2026-Sep, Annals of biomedical engineering
IF:3.0Q3
DOI:10.1007/s10439-026-04046-4
PMID:41712125
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综述 | 本文总结了小型化CRISPR系统(如Cas12f、CasX和迷你Cas9)在体内递送和便携式诊断中的应用进展,并讨论了相关挑战与未来机遇。 | 强调了超紧凑CRISPR系统相比传统SpCas9在分子量小、结构简单方面的优势,并探讨了AI辅助蛋白设计和合成生物学在该领域的应用潜力。 | 综述性文章,未包含原始实验数据;讨论了脱靶效应、递送障碍和监管要求等未解决的挑战。 | 总结小型化CRISPR系统在治疗性基因编辑和便携式诊断平台中的应用进展及未来发展方向。 | 小型化CRISPR系统(Cas12f、CasX、迷你Cas9)及其在体内基因编辑和诊断中的应用。 | 合成生物学 | NA | CRISPR基因编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, CRISPR-Cas12f, CRISPR-CasX | NA | NA | 医学, 诊断 |
| 14 | 2026-08-30 |
Advances in prime editing: Molecular innovations, Large-fragment engineering, and AI-driven design
2026-Sep, Biodesign research
DOI:10.1016/j.bidere.2026.100104
PMID:42662231
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综述 | 本文综述了引物编辑技术的最新进展,包括核心组件的分子创新、大片段编辑策略和人工智能驱动的设计工具,并探讨其在医学、农业和合成生物学中的广泛应用。 | 全面总结了引物编辑在Cas蛋白变体、逆转录酶工程和pegRNA设计上的迭代创新,并重点介绍了TwinPE、PASTE和PrimeRoot等大片段编辑平台以及AI驱动的设计工具对编辑效率和可预测性的提升。 | 未明确讨论引物编辑技术当前的局限性,如脱靶效应、递送挑战或临床应用中的障碍。 | 综述引物编辑技术的分子创新、大片段工程和AI设计方法,展示其作为可编程和可扩展基因组编辑平台的潜力。 | 引物编辑技术及其核心组件,包括Cas蛋白、逆转录酶、pegRNA和大片段编辑平台。 | 基因组编辑 | NA | 引物编辑 | NA | NA | NA | NA | 多种生物系统 | NA | 医学, 农业, 合成生物学 |
| 15 | 2026-08-30 |
Application and progress of synthetic biology technology in amino acid production
2026-Aug-28, Bioprocess and biosystems engineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1007/s00449-026-03389-5
PMID:42663654
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综述 | 本文综述了合成生物学技术在氨基酸生产中的应用与进展,涵盖代谢途径设计、基因回路、动态调控及高通量筛选平台,并探讨了生产策略和关键瓶颈 | 系统整合了合成生物学在氨基酸生产中的多种技术,包括非天然氨基酸生产策略,并讨论了宿主细胞适应性进化和代谢通量平衡等瓶颈解决方案 | 未提供具体实验数据或案例深入分析,主要基于现有文献的整合与评论 | 探索合成生物学策略以推进生物合成氨基酸的生产,解决传统生产方法的局限 | 天然氨基酸、支链氨基酸及非天然氨基酸的生产系统 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、基因回路设计、动态调控、高通量筛选 | NA | 文献资料 | NA | NA | NA | 代谢途径重建、遗传电路、动态调控系统 | 食品、动物饲料、医药、化妆品 |
| 16 | 2026-08-30 |
Revisiting plant-microbe interaction mechanisms for developing efficient biostimulants
2026-Aug-28, Folia microbiologica
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12223-026-01575-2
PMID:42663807
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综述 | 本文综述了根际通讯和根系分泌物介导的信号机制,探讨了促进有益植物-微生物互作的策略,并分析了影响其田间应用的技术挑战,旨在开发高效微生物生物刺激素。 | 重新审视植物-微生物互作的基本机制,整合微生物群落、多组学技术、合成生物学和制剂技术等新兴策略,以开发可规模化田间验证的微生物生物刺激素。 | 当前对植物如何与微生物通讯、建立根系定殖和适应田间环境的机制理解不足,导致微生物生物肥料应用效果不稳定。 | 通过深入理解根际通讯和根系分泌物介导的信号机制,开发高效、可持续的微生物生物刺激素,促进可持续农业发展。 | 植物根际微生物互作,包括根际微生物群落、根系分泌物和信号分子。 | 微生物组学 | NA | 多组学技术 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 植物(根际微生物) | 微生物群落信号通路 | 农业 |
| 17 | 2026-08-30 |
Integrating Machine Learning and Transcriptomics to Enhance β‑Carotene Production in Saccharomyces cerevisiae
2026-Aug-25, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.6c06012
PMID:42662202
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研究论文 | 本研究利用机器学习指导的组合菌株工程和转录组分析,在酿酒酵母中增强β-胡萝卜素的产量 | 将XGBoost机器学习模型应用于DBTL循环以预测复杂的组合设计,并结合转录组洞察指导铁补充策略,从而显著提高β-胡萝卜素产量 | 未明确说明局限性 | 通过合成生物学和机器学习优化微生物生产,增强β-胡萝卜素在酿酒酵母中的产量 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)及其甲羟戊酸(MVA)途径 | 合成生物学、机器学习 | NA | 转录组学(RNA-seq) | XGBoost | 转录组数据、产量数据 | 涉及多个菌株变体及培养条件(未提供具体样本数) | 启动子和终止子组合工程 | 酿酒酵母 | MVA途径的限速酶表达微调(通过启动子和终止子组合) | 工业生物技术 |
| 18 | 2026-08-30 |
Closing the Loop with Gates: A Scale-up-Gated Design-Build-Test-Learn Framework for Industrial Fermentation
2026-Aug-19, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms14081830
PMID:42655176
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综述 | 本文提出了一种“放大门控的DBTL”框架,通过在每个迭代阶段设置明确的决策门,以缩小实验室创新与工业发酵生产之间的差距。 | 在DBTL循环的每个阶段强制加入“决策门”,利用规模缩小模拟、下游加工兼容性、工业稳健性、技术经济分析和生命周期评估等指标作为评估和收敛标准,弥补了传统DBTL框架仅追求实验室最优而忽视工业可行性的缺陷。 | 分析基于定性跨部门研究,缺乏定量数据支撑,且所提框架的实际应用效果尚需进一步验证。 | 提出一种“放大门控的DBTL”框架,以促进合成生物学和人工智能在工业发酵中的整合,并从战略层面提出实现自主、规模感知生物制造的前提条件。 | 食品、制药、农业和能源行业的发酵过程。 | 合成生物学、人工智能 | NA | 规模缩小模拟、技术经济分析、生命周期评估 | NA | 定性数据 | NA | NA | NA | NA | 食品、医药、农业、能源 |
| 19 | 2026-08-30 |
Flax Lignans: From Biosynthetic Regulation to Biological Activities
2026-Aug-11, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27167162
PMID:42653167
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综述 | 本文综述了亚麻木酚素的生物合成途径、关键酶、调控机制及其多种生物活性,并讨论了工业应用中的限制和未来策略。 | 系统总结了亚麻木酚素的生物合成调控和生物活性,并提出合成生物学、分子育种和绿色提取技术等前沿解决方案,以促进其工业转化。 | 工业应用中存在提取工艺复杂、生产成本高、质量标准不统一和临床证据不足等限制。 | 为亚麻木酚素在食品、制药和化妆品领域的机制研究、产品开发和工业转化提供概念参考。 | 亚麻木酚素,特别是开环异落叶松脂素二葡萄糖苷。 | 植物生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 亚麻 | NA | 食品、制药、化妆品 |
| 20 | 2026-08-30 |
Recombinant Thermostable DNA Polymerases: Current Approaches to Production, Molecular Engineering, and Applications in Biotechnology and Diagnostics
2026-Aug-11, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27167188
PMID:42653192
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综述 | 本文综述了重组热稳定DNA聚合酶的生产方法、分子工程策略及其在生物技术和诊断学中的应用 | 全面总结了热稳定DNA聚合酶的分子工程方法,包括理性设计、定点突变、定向进化和结构域工程,以及热启动聚合酶和嵌合多功能聚合酶的开发技术 | 未提及具体实验数据或深入比较不同工程方法的优劣 | 总结重组热稳定DNA聚合酶的生产、分子工程和应用的当前进展,并展望未来发展方向 | 热稳定DNA聚合酶(A家族和B家族) | 合成生物学 | NA | 重组DNA技术、蛋白质工程、定点突变、定向进化、结构域工程、高通量筛选 | NA | 文献数据 | NA | NA | 异源表达系统 | NA | 生物技术、诊断学、合成生物学 |