合成生物学相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['synthetic biology']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价9.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 4876 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-05-02 |
Toward life with a 19-amino acid alphabet through generative artificial intelligence design
2026-Apr-30, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aeb5171
PMID:42060756
|
研究论文 | 通过计算设计与合成生物学探索构建仅使用19种氨基酸的生命体 | 首次证明异亮氨酸在生命中的非必要性，并利用蛋白质语言模型和结构模型成功设计出功能性无异亮氨酸蛋白质，构建出首个19种氨基酸的稳定存活细胞 | 主要依赖异亮氨酸替换策略，其他氨基酸的省略可行性有待验证；细胞适应性可能受限于简化字母表 | 验证生命能否用少于20种氨基酸的字母表构建 | 核糖体中所有382个异亮氨酸残基及其替换后的大肠杆菌细胞 | 合成生物学 | NA | 蛋白质语言模型、结构建模、基因组编辑 | 蛋白质语言模型, 结构模型 | 蛋白质序列和结构数据 | 1个大肠杆菌菌株（含21个重新设计的核糖体亚基） | CRISPR-Cas9 | E. coli（大肠杆菌） | NA | 合成生物学, 基础生物学 |
| 2 | 2026-05-02 |
STRAIGHT-IN Dual: a platform for dual single-copy integrations of DNA payloads and gene circuits into human induced pluripotent stem cells
2026-Apr-30, Nature biomedical engineering
IF:26.8Q1
DOI:10.1038/s41551-026-01677-9
PMID:42062565
|
研究论文 | 该论文介绍了一种名为STRAIGHT-IN Dual的平台，能够高效地将两个DNA构建体同时、等位基因特异性地单拷贝整合到人类诱导多能干细胞中 | STRAIGHT-IN Dual平台实现了在一周内对两个DNA构建体进行高效、同时、等位基因特异性单拷贝整合，并支持组件回收用于后续修饰 | NA | 开发一种高效、快速的双重DNA整合平台，用于在人类诱导多能干细胞中进行基因电路和细胞命运编程的测试 | 人类诱导多能干细胞 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 人类诱导多能干细胞 | 可诱导合成基因开关 | 医学 |
| 3 | 2026-05-02 |
Engineering AraC L9K for Inducer-Independent pBAD Activation in Salmonella Gallinarum
2026-Apr-28, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2026.04.019
PMID:42061758
|
研究论文 | 通过在肠炎沙门氏菌鸡伤寒变种中结合宿主基因组修饰和定点诱变，生成不依赖诱导剂的AraC变体，实现pBAD启动子的组成型激活 | 首次在沙门氏菌中通过L9K突变实现无需阿拉伯糖诱导的pBAD系统组成型表达，且活性水平达到或超过完全诱导的野生型系统 | 研究仅在Salmonella Gallinarum中进行，未在其它细菌宿主中验证该系统的通用性和稳定性 | 开发一种不依赖外源诱导剂的AraC-pBAD表达系统，以克服工业规模化和治疗应用中诱导剂依赖的限制 | 肠炎沙门氏菌鸡伤寒变种（Salmonella enterica serovar Gallinarum） | 合成生物学 | NA | 定点诱变 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9（或定点诱变） | 肠炎沙门氏菌鸡伤寒变种 | pBAD启动子系统（AraC变体） | 微生物制造, 合成生物学, 治疗生物技术 |
| 4 | 2026-05-02 |
Engineering Plant-Derived P450 Enables the Efficient Production of Berberine through a Concise and Modular Enzymatic Cascade in E. coli
2026-Apr-27, JACS Au
IF:8.5Q1
DOI:10.1021/jacsau.6c00169
PMID:42063854
|
研究论文 | 通过工程化植物来源的P450酶，设计模块化酶促级联反应在大肠杆菌中高效生产小檗碱 | 优化设计了绕过多个天然步骤的简明模块化途径，并结合表达优化、结构指导设计、共识突变和机器学习综合工程化CYP719A1，获得活性提高8.9倍且热稳定性改善的变体 | NA | 解决植物膜结合细胞色素P450酶催化瓶颈，实现植物天然产物小檗碱的可持续高效生产 | 植物来源的CYP719A1酶及其工程化变体 | 合成生物学、代谢工程 | NA | 蛋白质工程、机器学习、酶级联反应 | 机器学习模型 | 序列和结构数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 模块化酶促级联途径（包含P450依赖步骤） | 医药、工业生物技术 |
| 5 | 2026-05-02 |
Engineered commensal Bacteroides thetaiotaomicron enables targeted drug delivery to colorectal tumors
2026-Apr-24, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society
IF:10.5Q1
DOI:10.1016/j.jconrel.2026.114945
PMID:42036032
|
研究论文 | 工程化肠道共生菌多形拟杆菌实现结直肠肿瘤靶向药物递送 | 基于天然肠道共生菌多形拟杆菌构建新型细菌递送系统，通过筛选表面锚定蛋白实现肿瘤靶向蛋白展示，并整合治疗模块实现双重抗肿瘤效果 | 尚需进一步评估临床安全性和长期免疫反应 | 开发基于肠道共生菌的靶向肿瘤治疗新策略 | 多形拟杆菌 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 微生物工程 | NA | NA | AOM/DSS诱导的结直肠癌小鼠模型 | NA | 多形拟杆菌 | 肿瘤靶向蛋白展示系统及溶血素E治疗模块 | 医学 |
| 6 | 2026-05-02 |
A standardized workflow for kinetic metabolic model curation and dissemination
2026-Apr, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1014227
PMID:42008579
|
研究论文 | 提出一种用于动力学代谢模型构建、注释、可视化和共享的标准化工作流程 | 整合社区标准和开源工具，确保模型的可重复性、互操作性和用户可访问性 | 未明确说明本方法的局限性 | 促进动力学代谢模型的标准化构建和传播，提高其在代谢研究中的实用性 | 动力学代谢模型 | 机器学习 | NA | NA | 动力学代谢模型 | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、代谢工程、系统生物学 |
| 7 | 2026-05-02 |
Ornithine lipids and other acyloxyacyl amino lipids: the coming-of-age story of a group of non-canonical membrane lipids
2026-Mar-08, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-026-13777-2
PMID:41794944
|
综述 | 本文综述了鸟氨酸脂及其他酰氧基酰基氨基脂的研究进展，包括其合成途径、功能及其在合成生物学中的潜在应用 | 首次系统分析了编码鸟氨酸脂合酶的基因在细菌分类中的分布，并讨论了鸟氨酸脂修饰对膜性质的生物物理影响及其与Toll样受体4的相互作用 | 未提供实验数据验证预测，且综述范围限于已发表研究，可能遗漏未报道的数据 | 总结鸟氨酸脂的生物合成、修饰、功能及应用进展，促进其在合成生物学中的利用 | 细菌中的鸟氨酸脂及类似脂类 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 基因序列数据 | NA | NA | 大肠杆菌（E. coli） | 代谢通路：鸟氨酸脂生物合成与修饰 | 合成生物学 |
| 8 | 2026-05-02 |
Mass spectrometry integrates protein design into structural biology method development
2026, QRB discovery
DOI:10.1017/qrd.2025.10018
PMID:42063620
|
综述 | 概述了质谱如何通过验证多种设计目标来补充蛋白质设计，并探讨了工程蛋白作为方法开发测试平台的价值 | 提出将机器学习与原生质谱整合形成反馈循环的新观点，即新设计挑战分析技术，改进的方法提供更丰富数据以指导未来预测 | 未提及具体实验数据或量化分析，缺乏对整合方法实际效能的评估 | 阐述质谱在蛋白质设计验证中的作用及其与机器学习的协同关系 | 人工设计蛋白质及其结构特征（寡聚化、折叠、配体结合、动态构象变化） | 机器学习 | NA | 质谱 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 人工原细胞开发 |
| 9 | 2026-05-02 |
PSMA-directed CAR-T cell therapy for metastatic castration-resistant prostate cancer: a next-generation engineering perspective on stem cell-derived immune effectors
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1819701
PMID:42064077
|
综述 | 这篇综述回顾了针对转移性去势抵抗性前列腺癌（mCRPC）的PSMA导向CAR-T细胞疗法的临床翻译现状，并提出了一种三重协同框架来克服TME免疫抑制、抗原异质性和T细胞适应性等核心挑战 | 提出了三重协同框架系统解构实体瘤障碍，并聚焦于干细胞衍生免疫效应器（如iPSC衍生CAR-T、CAR-NK、CAR-巨噬细胞）作为新一代细胞产品范式，同时纳入基于证据的等级评估提升学术严谨性 | NA | 为PSMA-CAR-T疗法提供战略蓝图，以将其推进至mCRPC的治愈性治疗，并广泛适用于新一代干细胞衍生免疫疗法 | PSMA导向CAR-T细胞疗法及其在mCRPC中的临床应用 | 数字病理学 | 前列腺癌 | CAR-T细胞疗法 | NA | NA | NA | NA | 人 | 嵌合抗原受体 | 医学 |
| 10 | 2026-05-01 |
Combining model-based and data-driven models: An application to synthetic biology resource competition
2026-Jun, Mathematical biosciences
IF:1.9Q3
DOI:10.1016/j.mbs.2026.109649
PMID:41791590
|
研究论文 | 该研究探索了机器学习和机理模型的整合方法，并应用于合成生物学资源竞争问题 | 提出了部分不确定模型结构（PUMS）概念和嵌入式物理信息神经网络（ePINNs），通过两个共享损失函数神经网络无缝融合ML和MM组件，并防止ML忽视机理约束 | 机理模型构建耗时且依赖简化假设，可能无法完全捕捉现实复杂性 | 结合机器学习和机理模型以实现更鲁棒的预测和增强的系统洞察 | 机器学习模型与机理模型的整合方法 | 机器学习 | NA | NA | 嵌入式物理信息神经网络（ePINNs） | NA | NA | NA | 活细胞 | 基因网络模型 | 合成生物学 |
| 11 | 2026-05-01 |
Advances and opportunities for computational interrogation of plant proteins
2026-May, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.70899
PMID:42055456
|
综述 | 综述计算工具在植物蛋白质分析中的应用，强调计算与实验结合加速发现植物蛋白质功能 | 系统总结了计算工具在植物蛋白质结构、动力学、相互作用及进化历史预测中的新兴应用，并展示了整合计算与实验克服研究局限的潜力 | 植物体内研究仍受限于遗传转化方法的可用性和效率，计算预测结果需实验验证 | 推动计算与实验结合，克服植物蛋白质研究瓶颈，促进农业、生态和气候适应性研究 | 植物蛋白质 | 机器学习 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业、生态、气候适应性 |
| 12 | 2026-05-01 |
Harnessing synthetic circuits to illuminate microbial electron transfer: a perspective on engineered metabolism
2026-Apr-30, Journal of microbiology & biology education
IF:1.6Q2
DOI:10.1128/jmbe.00290-25
PMID:41627025
|
研究论文 | 该论文通过合成基因电路控制氧化还原介质的产生，增强了微生物的胞外电子传递及产电能力，为理解微生物代谢和生物电子设计提供了新视角 | 设计与构建了一种合成基因电路，使微生物能够产生并释放吩嗪-1-羧酸，这是一种增强胞外电子传递和发电的氧化还原活性代谢物，同时该电路可作为教学案例整合氧化还原平衡、基因调控和代谢工程原理 | NA | 探讨如何通过控制氧化还原介质的产生来理解微生物电子流和生物电子设计，并促进跨学科学习 | 微生物电子传递和产电能力 | 机器学习 | NA | 合成基因电路 | NA | NA | NA | 合成基因电路 | 微生物（未具体说明宿主） | 生产吩嗪-1-羧酸的合成基因电路 | 工业生物技术, 环境, 能源 |
| 13 | 2026-05-01 |
Engineered live bacteria for liver diseases and gut-liver axis disorders: from genetic modification to advanced delivery systems
2026-Apr-29, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-026-04483-2
PMID:42057131
|
综述 | 本文综述了工程化活菌在肝脏疾病及肠肝轴疾病中的应用，从基因修饰到先进递送系统的进展 | 系统总结了工程化活菌在肝脏疾病治疗中的内部基因修饰与外部共价连接策略，并讨论了多种递送系统（胶囊、微囊、纳米制剂）和给药方式 | 面临挑战包括工程化活菌的临床转化难度、安全性及稳定性问题 | 探讨工程化活菌在肝脏疾病治疗中的潜力，推动其临床应用并减轻肝脏疾病的全球负担 | 双歧杆菌、大肠杆菌Nissle 1917、枯草芽孢杆菌、布拉酵母菌、罗伊氏乳杆菌等工程化活菌 | 数字病理学 | 肝细胞癌、非酒精性脂肪性肝病、酒精性肝病 | 基因工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick | 大肠杆菌, 枯草芽孢杆菌, 酿酒酵母 | 生物传感器, 代谢通路 | 医学 |
| 14 | 2026-05-01 |
Bacillus methanolicus as an emerging platform for energy-efficient biomanufacturing from one-carbon and marine resources
2026-Apr-28, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103500
PMID:42056785
|
综述 | 本文强调枯草芽孢杆菌甲醇利用菌作为新兴生物制造平台，能够高效利用甲醇和甘露醇 | 首次系统阐述该菌在利用一碳和海洋资源方面的能量高效特性及合成生物学工具进展 | 讨论甲醇和甘露醇生物制造面临的挑战，需进一步优化菌株 | 建立枯草芽孢杆菌甲醇利用菌作为联接一碳和海洋衍生底物与可持续化学合成的多功能平台 | 枯草芽孢杆菌甲醇利用菌的甲醇和甘露醇代谢途径 | 合成生物学 | NA | 合成生物学工具 | NA | NA | NA | NA | 枯草芽孢杆菌甲醇利用菌 | NA | 工业生物技术 |
| 15 | 2026-04-28 |
Ultra-rapid and high-titer biomanufacturing of trehalose 6-phosphate by an in vitro synthetic biology platform
2026-Apr-27, Bioresources and bioprocessing
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s40643-026-01057-w
PMID:42043645
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 16 | 2026-05-01 |
Opportunities for artificial intelligence and synthetic biology in designing living drug delivery systems
2026-Apr-27, Advanced drug delivery reviews
IF:15.2Q1
DOI:10.1016/j.addr.2026.115883
PMID:42055250
|
综述 | 综述了人工智能和合成生物学在设计活体药物递送系统方面的机遇 | 首次系统阐述了AI和合成生物学协同设计活体药物递送系统的潜力，重点解析了从受体设计到基因电路组成的序列-功能和组成-功能原理 | 传统设计-构建-测试-学习方法在解析受体、信号处理和基因调控元件方面存在困难且通量低 | 探讨如何利用AI和合成生物学克服活体药物递送系统设计中的挑战 | AI和合成生物学在工程化人类细胞和细菌作为活体药物递送载体中的应用 | 机器学习,合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 人类细胞,细菌 | 合成受体、信号蛋白、基因调控元件、基因电路 | 医学 |
| 17 | 2026-05-01 |
A genetic manipulation tool based on the GP35 recombinase for targeted gene editing in mycoplasmas of ruminants
2026-Apr-27, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2026.113096
PMID:42055338
|
研究论文 | 基于GP35重组酶的遗传操作工具，用于反刍动物支原体的靶向基因编辑 | 首次利用来自噬菌体SPP1的GP35重组酶在牛支原体中实现精准基因插入和缺失，避免随机脱氨风险，编辑效率高达77.78%-100% | 该工具当前仅针对牛支原体验证，对其他反刍动物病原体的适用性需进一步验证，且未探讨长期稳定性和潜在脱靶效应 | 开发一种有效的遗传工具以推进反刍动物支原体致病机制研究和疫苗开发 | 反刍动物支原体病原体，特别是牛支原体 | 合成生物学， | 反刍动物传染病， | GP35重组酶介导的长单链DNA重组工程 | NA | DNA序列， | 涉及牛支原体突变体，具体样本数未提及 | GP35重组酶， | 牛支原体 | 基于GP35重组酶的精准基因编辑系统 | 畜牧业，兽药 |
| 18 | 2026-05-01 |
From modular engineering to practical applications: Advances in GPCR-based yeast biosensors
2026-Apr-24, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108909
PMID:42035967
|
综述 | 系统剖析基于GPCR的酵母生物传感器的工程化进展及其模块化框架 | 通过模块化框架梳理传感、转导和输出三个核心模块的工程策略，并强调人工智能与合成生物学整合实现下一代生物传感器的预测性和可编程设计 | 未提及具体实验数据或定量性能比较，依赖已发表文献的综述性总结 | 综述GPCR酵母生物传感器的工程化进展及其在多种配体检测中的应用扩展 | GPCR、酵母信号网络、报告蛋白 | 合成生物学 | NA | GPCR工程、酵母信号通路改造 | NA | NA | NA | NA | 酿酒酵母 | 生物传感器（GPCR信号转导与报告基因输出） | 医学、农业、环境、工业生物技术 |
| 19 | 2026-05-01 |
Closing the loop: AI-driven integration of multi-omics and phenomics for systematic resilient crop engineering
2026-Apr-24, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108908
PMID:42035969
|
综述 | 本文综合阐述了边缘到云的闭环框架，该框架统一了多组学、实时表型组学和合成生物学，并由人工智能驱动，以实现系统性抗逆作物工程 | 提出从被动预测转向主动设计的范式转变，利用生成式人工智能和基础模型加速设计-构建-测试-学习循环，并提出了弥合计算机模拟与田间实际差距的路线图 | 未具体说明局限性，可能涉及当前框架在田间部署的挑战、数据可获取性或计算资源限制 | 将作物改良转化为能够为未来气候培育抗逆品种的预测性工程学科 | 作物及其与基因型-环境-管理相互作用的复杂系统 | 机器学习 | NA | 多组学、实时表型组学、合成生物学、深度学习、生成式人工智能 | Transformer架构、图神经网络、多模态融合算法、生成式人工智能、基础模型 | 多组学数据、表型数据 | NA | 合成生物学工具 | NA | 抗逆蛋白和基因回路 | 农业 |
| 20 | 2026-05-01 |
LinkCraft: An interactive tool for the design of flexible linkers
2026-Apr-17, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2026.169814
PMID:42001978
|
研究论文 | LinkCraft是一个用于设计多结构域蛋白质中柔性连接子的交互式计算工具 | 将连接子视为可调节的分子功能决定因素，支持基于理化性质的序列生成和系综建模评估 | 未明确讨论实验验证结果或与其他设计工具的性能比较 | 为多结构域蛋白质的柔性连接子提供理性设计工具 | 多结构域蛋白质中的固有结构无序连接子 | 合成生物学 | NA | 计算建模 | 系综模型 | 蛋白质序列 | NA | NA | NA | 多结构域蛋白质连接子设计 | 合成生物学, 生物技术 |