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当前共找到 5674 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
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| 1 | 2026-09-13 |
Bacterial R-bodies with common morphologies and unrolling dynamics are phylogenetically scattered, indicating extensive lateral gene transfer and wide application potential
2026-Sep-11, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.00864-26
PMID:42725757
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研究论文 | 该研究比较了六种假单胞菌门细菌的R-body的形态学、遗传学及展开动力学，揭示了广泛的水平基因转移，并首次根据酸诱导延伸动力学将R-body分为快速爆发和慢速两类 | 首次利用高帧率光学显微镜视频记录研究R-body的延伸与回缩动力学，发现R-body可分为快速爆发和慢速两种酸诱导延伸类型，并提出该动力学标准可能是选择生物技术用R-body工具的最有用依据 | 研究仅涵盖六种假单胞菌门的R-body，样本量有限，且广泛的水平基因转移使得基于遗传数据的统一分类框架变得复杂 | 整合不同物种R-body的遗传学、形态学和展开动力学数据，为构建R-body生物技术工具箱提供分类依据 | 来自六种假单胞菌门的R-body，包括系统发育多样的内共生菌和非内共生菌 | 合成生物学 | NA | 电子显微镜，高帧率光学显微镜视频记录 | NA | 图像，视频，遗传数据 | 六种假单胞菌门的R-body | NA | NA | NA | 医学，材料 |
| 2 | 2026-09-13 |
Research progress on metabolic engineering for efficient squalene synthesis in yeast cell factories
2026-Sep-11, Biotechnology letters
IF:2.0Q3
DOI:10.1007/s10529-026-03785-7
PMID:42726309
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综述 | 本文综述了酵母细胞工厂中角鲨烯生物合成途径及代谢工程策略，重点介绍了多细胞器协同工程和证据来源区分。 | 系统总结了通过增强甲羟戊酸途径、调控竞争代谢途径、亚细胞区室化工程、优化辅因子平衡和产物外排策略等提高角鲨烯产量的方法，并强调了多细胞器协同工程的重要性，特别是解脂耶氏酵母和酿酒酵母中的细胞器工程。 | 本文为综述，未进行原始实验研究，可能受限于现有文献的覆盖范围和证据质量。 | 综述酵母中角鲨烯的生物合成途径和代谢工程策略，为未来提高角鲨烯产量和促进相关萜类化合物合成提供基础。 | 酵母细胞工厂，特别是解脂耶氏酵母和酿酒酵母。 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | 解脂耶氏酵母, 酿酒酵母 | 角鲨烯生物合成途径 | 食品, 医药, 疫苗佐剂 |
| 3 | 2026-09-13 |
Evolving conservation: The role of unconventional approaches to restore contemporary vertebrate populations and genomic biodiversity
2026-Sep-03, The Journal of heredity
IF:3.0Q2
DOI:10.1093/jhered/esag040
PMID:42166210
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综述 | 本文探讨了非常规生物技术手段（如基因救援、合成生物学和基因编辑）在恢复当代脊椎动物种群和基因组生物多样性中的作用，并分析了其机遇、伦理争议与监管挑战 | 提出将生物技术与保护生物学和恢复生态学进行审慎、透明整合的观点，强调在生态学知识和利益相关者参与的基础上协调保护与恢复目标 | 生物技术整合面临生态不可预测性和公众对野生种群基因干预的抵制等伦理、生态和监管问题 | 审视生物技术在保护和恢复中的应用现状，探讨如何通过生物技术手段应对生物多样性丧失的挑战 | 脊椎动物种群、基因组生物多样性、濒危物种、入侵物种 | 保护生物学、恢复生态学 | NA | 基因救援、合成生物学、基因编辑 | NA | NA | NA | 基因编辑 | NA | NA | 环境、农业 |
| 4 | 2026-09-13 |
Engineering Bacillus Subtilis for Efficient Biosynthesis of Riboflavin: Current Knowledge and Future Perspectives
2026-Sep, Applied biochemistry and biotechnology
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s12010-026-05755-1
PMID:42207417
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综述 | 该综述系统总结了代谢工程改造枯草芽孢杆菌高效生物合成核黄素的研究进展与未来展望 | 系统整合了核黄素生物合成中代谢工程策略与合成生物学工具的最新进展，并提出了多组学数据、合成调控设计与机器学习驱动预测建模相结合构建智能枯草芽孢杆菌细胞工厂的未来方向 | 系统实现仍受限于过量生产的代谢负担，且缺乏能够预测不同工业规模下菌株性能的通用调控模型 | 综述如何通过代谢工程和合成生物学策略提升枯草芽孢杆菌中核黄素的生物合成效率，并展望未来发展方向 | 枯草芽孢杆菌（Bacillus subtilis）及其核黄素生物合成途径 | 代谢工程 | NA | 代谢工程, 合成生物学, 适应性实验室进化, 组学分析, 13C代谢通量分析, 核糖开关工程, 高通量筛选 | 机器学习驱动预测模型 | 多组学数据 | NA | 核糖开关工程, 调控元件设计 | 枯草芽孢杆菌（Bacillus subtilis） | 核黄素生物合成途径强化、前体途径增强、反馈抑制解除、代谢通量与细胞生长平衡 | 医药, 工业生物技术, 食品 |
| 5 | 2026-09-13 |
From Circuits to Symphonies: A Systems-Engineering Blueprint for Multimicrobial Synthetic Biology
2026-Sep, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.76981
PMID:42536811
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综述 | 本文提出一个受交响乐启发的系统工程框架，用于多微生物合成生物学，将联合体设计组织为通信、时间调控、生态构建和预测建模四个协调层，并提供模块化工程蓝图以指导合成微生物群落的构建、稳定和优化 | 首次提出受交响乐启发的系统工程框架，将多微生物合成生物学从孤立遗传控制重新定位为协调系统设计问题；提出四个应用依赖的协调层（通信、时间调控、生态构建、预测建模）和模块化工程蓝图 | 框架是模块化而非规定性的，未提供具体实验验证；涉及代谢物运输、种群漂移、参数不确定性和过程规模实施等约束 | 为多微生物合成生物学提供一个结构化的系统工程基础，指导合成微生物群落在工业、环境和治疗应用中的开发 | 合成微生物联合体（多物种微生物群落） | 合成生物学 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | 多微生物联合体协调层设计（通信、时间调控、生态构建、预测建模） | 工业生物技术, 环境, 医学 |
| 6 | 2026-09-13 |
Predictive design of tissue-specific mammalian enhancers that function in the mouse embryo
2026-Sep, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-026-02729-1
PMID:42642514
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研究论文 | 该文章提出了一种利用深度学习设计在小鼠胚胎中具有组织特异性的合成增强子的通用策略 | 首次证明深度学习可以在哺乳动物基因组的体内调控复杂性中可靠地设计组织特异性增强子，仅需适度训练集即可实现 | 研究仅在小鼠胚胎中测试了15个增强子，样本量有限，且未涉及其他哺乳动物或成体组织 | 开发能够可靠设计在哺乳动物体内发挥功能的组织特异性增强子的通用方法 | 小鼠胚胎中的心脏、肢体和中枢神经系统组织特异性增强子 | 机器学习 | NA | 染色质可及性测序 | CNN | 序列 | 15个合成增强子 | NA | 小鼠 | NA | 医学, 合成生物学, 基因治疗 |
| 7 | 2026-09-13 |
Integrated multi-omics analysis reveals a pH-driven metabolic and translational switch in Ureaplasma parvum
2026-08-04, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.03463-25
PMID:42429378
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研究论文 | 本文通过整合蛋白质组学、代谢组学和RNA修饰图谱，构建了微小脲原体pH适应的系统级模型 | 揭示了微小基因组细菌通过预先存在的共调控功能模块的分岔式激活来实现pH适应，并强调了表观转录组动态重组在适应性中的重要性 | 未明确说明样本量，且研究结果可能受限于单一物种，需进一步验证是否可推广至其他基因组缩减微生物 | 构建微小脲原体pH适应的系统级模型，探究其适应机制 | 微小脲原体（Ureaplasma parvum） | 多组学 | NA | 蛋白质组学, 代谢组学, RNA修饰图谱 | NA | 组学数据 | NA | NA | NA | NA | 医学, 合成生物学 |
| 8 | 2026-09-13 |
Engineering plasmids with synthetic origins of replication
2026-Feb-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68907-1
PMID:41629321
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研究论文 | 该文章通过重构天然pMB1复制起点，创建了具有可定制拷贝数的质粒，并进一步开发了使用合成RNA调控因子的兼容性SynORI系统，实现独立拷贝控制、信号响应和多重复制报告。 | 首次系统性重构天然pMB1复制起点以创建可调拷贝数的合成复制起点SynORI，并利用合成RNA调控因子实现兼容性独立拷贝控制、模块化信号响应以及多重复制报告功能；构建了包含6个兼容SynORI质粒的文库并在一周内于大肠杆菌中共同维持。 | 摘要未明确说明该SynORI系统在不同宿主或工业条件下的长期稳定性、脱靶效应及与天然质粒的相互作用等潜在限制。 | 建立创建具有合成复制起点质粒的可行性，并开发可用于合成生物学的SynORI技术。 | 质粒复制起点（天然pMB1起点）及合成复制起点SynORI系统。 | 合成生物学 | NA | 质粒工程、合成RNA调控因子、合成复制起点工程 | NA | NA | 6个兼容SynORI质粒文库，在大肠杆菌中共同维持一周。 | NA | E. coli | 合成复制起点（SynORI）系统、合成RNA调控因子、多重复制报告系统 | 合成生物学、生物技术 |
| 9 | 2026-09-13 |
The Landscape of Synthetic Biology and Bioengineering in Spain
2026 Jan-Dec, Engineering biology
DOI:10.1049/enb2.70011
PMID:42724222
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综述 | 本文是一篇观点文章，系统梳理了西班牙合成生物学与生物工程过去二十年的发展轨迹、核心贡献、当前优势与新兴机遇，并讨论了该领域面临的技术、监管、概念与转化挑战 | 首次以国家视角全面描绘西班牙合成生物学共同体的发展图景，突出其在欧洲合成细胞计划、全球生物铸造网络、SEVA标准化平台以及MISB硕士和SYNBIO-CSIC COFUND博士网络等高级培训项目中的角色，并聚焦物质-生命界面、生物制造和可持续生物技术等新兴方向 | 作为观点文章，未提供原始实验数据或系统性定量分析，对西班牙合成生物学发展水平的评估主要基于作者视角，可能缺乏全面的文献计量或产业调研支撑 | 梳理并评述西班牙合成生物学与生物工程的发展历程、现状与未来方向，为政策制定、科研布局和人才培养提供参考 | 西班牙合成生物学与生物工程研究共同体、相关机构、平台、培训项目及政策环境 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医药, 工业生物技术, 环境, 材料 |
| 10 | 2026-09-13 |
A Modular T7 RNA Polymerase Toolbox Linking Selective miRNA Detection to Signal Amplification and Protein Expression
2025-12-03, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c16214
PMID:41258773
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研究论文 | 本文开发了一个无泄漏的T7 RNA聚合酶工具箱，通过模块化T7-Locks将选择性miRNA检测与信号放大和蛋白质表达相连接 | 设计了模块化T7-Locks，仅在特异性寡核苷酸结合时释放活性T7启动子，实现了ON/OFF比超过100的定量和正交miRNA检测；通过C12间隔区在T7模板中引入位点特异性转录终止子，利用正反馈实现可控信号放大；在无细胞TX-TL系统中利用工程化粘性末端基因实现了miRNA触发的蛋白质表达 | 仅在无细胞TX-TL系统中验证了蛋白质表达，尚未在活细胞内测试；信号放大依赖正反馈可能引入非特异性激活；系统的长期稳定性和通用性有待进一步验证 | 构建一个模块化、无泄漏的T7 RNA聚合酶工具箱，将输入传感、信号放大和输出合成相连接，为合成生物学中DNA或RNA驱动的信息处理提供通用策略 | miRNA、T7 RNA聚合酶、T7启动子、T7-Locks、无细胞TX-TL系统 | 合成生物学 | NA | 无细胞TX-TL系统、T7 RNA聚合酶转录、化学合成寡核苷酸 | NA | NA | NA | NA | 无细胞系统 | 模块化T7-Locks介导的miRNA传感级联、正反馈信号放大电路、转录门控蛋白质表达回路 | 医学、工业生物技术 |
| 11 | 2026-09-13 |
Turbo-charging crop improvement: harnessing multiplex editing for polygenic trait engineering and beyond
2025-10, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.70527
PMID:41092254
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综述 | 本文综述了多重CRISPR编辑技术在植物基因组工程中的应用，涵盖多基因靶向、多倍体作物改良、表观遗传调控、染色体工程及无转基因编辑，并讨论了载体构建、突变检测和计算流程等挑战与创新 | 系统整合了多重编辑在复杂基因组（多倍体、野生近缘种、长世代物种）中的应用策略，强调了启动子和支架工程等载体结构创新，以及长读长测序在解析结构重排中的价值，并提出了对用户友好、合成生物学兼容的计算流程的需求 | 多重编辑仍面临构建设计复杂、突变检测可扩展性不足、缺乏经过实验验证的诱导型或组织特异性启动子以实现时空控制等挑战 | 探讨多重CRISPR编辑技术在作物改良中的潜力、技术瓶颈及未来发展方向，以推动下一代作物改良应对农业、可持续性和气候韧性挑战 | 植物基因组，包括一年生物种、多倍体、未驯化野生近缘种及长世代物种 | 机器学习 | NA | 多重CRISPR编辑、高通量测序、长读长测序 | NA | 文本 | NA | CRISPR-Cas9 | 植物 | NA | 农业 |
| 12 | 2026-09-13 |
DNAdesign: feature-aware in silico design of synthetic DNA through mutation
2025-02-04, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf052
PMID:39891349
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研究论文 | DNAdesign是一个基于Web的工具，用于基于DNA序列和形状特征比较和设计突变 | 同时考虑DNA序列和形状读取模式，利用Deep DNAshape进行超快速DNA形状预测，并提供多种核苷酸序列编码方法 | 未明确提及 | 研究基因调控以及合成生物学应用，如设计合成增强子和转录因子结合位点 | DNA序列和形状特征 | 计算生物学 | NA | 深度学习 | Deep DNAshape | 序列数据 | NA | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 13 | 2026-09-13 |
MutaT7GDE: A Single Chimera for the Targeted, Balanced, Efficient, and Processive Installation of All Possible Transition Mutations In Vivo
2024-09-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00316
PMID:39190860
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研究论文 | 该研究通过改造底物宽泛的通用脱氨酶，构建了单一嵌合酶MutaT7GDE，可同时靶向脱氧腺苷和脱氧胞苷，实现体内所有可能转换突变的高效、均衡、靶向和持续安装 | 利用新工程的底物宽泛型通用脱氨酶（GDEs）建立了基于单一嵌合酶的简化系统，可同时靶向脱氧腺苷和脱氧胞苷，实现所有可能转换突变的高效安装，比现有更繁琐的MutaT7工具更高效 | 摘要中未明确提及该研究的局限性 | 开发一种简化、高效、均衡且持续的体内靶向基因多样化工具，用于定向进化过程中目标基因的多样化 | MutaT7嵌合蛋白、通用脱氨酶（GDEs）、T7 RNA聚合酶、目标基因 | 合成生物学 | NA | 脱氨酶-T7 RNA聚合酶融合技术、定向进化、体内诱变 | NA | NA | 四种不同的MutaT7构建体 | NA | NA | 脱氨酶-T7 RNA聚合酶融合嵌合酶（MutaT7GDE） | 医学、工业生物技术 |
| 14 | 2026-09-13 |
Edible mycelium bioengineered for enhanced nutritional value and sensory appeal using a modular synthetic biology toolkit
2024-03-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46314-8
PMID:38485948
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研究论文 | 本文开发了针对可食用米曲霉的模块化合成生物学工具包，包括CRISPR-Cas9基因整合方法、中性位点和可调启动子，并用于提高麦角硫因和血红素的产量 | 首次为可食用米曲霉开发模块化合成生物学工具包，并成功应用于提高食品营养价值和感官吸引力 | 文中未明确提及研究限制 | 开发适用于可食用真菌的合成生物学工具，并增强真菌食品的营养价值和感官吸引力 | 米曲霉（Aspergillus oryzae） | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9基因整合 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 米曲霉（Aspergillus oryzae） | 麦角硫因和血红素的代谢途径工程 | 食品 |
| 15 | 2026-09-12 |
The big kinship of proline: Counting saturated and unsaturated secondary amino acids of different ring size
2026-Oct, Biochimie
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.biochi.2026.06.010
PMID:42320729
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研究论文 | 本文提出了一种数学枚举方法，用于系统计数不同环大小的饱和与不饱和环状仲α-氨基酸和亚氨基酸，并给出了递推公式（修正的Lucas序列）及显式计数公式 | 首次针对所有可能的环状仲α-氨基酸和亚氨基酸，按环中原子数和饱和/不饱和类型进行系统数学枚举，推导出修正Lucas序列的递推公式及显式计数公式，为该类化合物的虚拟数据库构建和计算机辅助合成设计提供了数学基础 | 研究主要基于数学枚举和理论推导，缺乏实验验证；对已表征结构的综述可能不够全面；未涉及立体化学异构体的详细计数 | 建立环状仲α-氨基酸和亚氨基酸的数学枚举方法，统计不同环大小下饱和与不饱和化合物的数量，并为虚拟化合物数据库构建和化学合成计算辅助设计提供理论工具 | 环状仲α-氨基酸和亚氨基酸（包括脯氨酸及其非蛋白质源性同系物和衍生物） | 计算生物学 | NA | 数学枚举、递推公式推导、组合数学 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 16 | 2026-09-12 |
Bacterial surface layer - Properties, role, applications and challenges - A review of the next-generation nanotechnological tool
2026-Oct, Journal of microbiological methods
IF:1.7Q4
DOI:10.1016/j.mimet.2026.107648
PMID:42542137
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综述 | 本文综述了细菌表面层（S层）蛋白的结构特性、自组装机制及其在纳米生物技术、疫苗开发、生物传感、药物递送和超滤等领域的应用，并讨论了商业化面临的挑战与解决方案 | 首次将S层生物学机制与工程化制造、蛋白质设计工作流程及商业化路线图进行整合，提供了先前综述未涵盖的可操作方案和基准 | 高纯度蛋白生产的可扩展性、重组表达的成本效益、严苛工业条件下的稳定性以及生物衍生纳米材料的监管路径尚未解决；合成替代品也带来实际和经济竞争 | 系统总结S层蛋白的特性、功能与应用，分析其从理论潜力向功能原型转化的工程化与商业化瓶颈，并展望其在医学、工业与环境领域的变革前景 | 细菌和古菌的表面层（S层）蛋白及其自组装形成的二维晶体阵列 | 纳米生物技术 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | 细菌, 古菌 | NA | 医学, 工业生物技术, 环境 |
| 17 | 2026-09-12 |
Biosynthesis and Biotransformation of Plant Triterpenoids: Current Advances and Future Perspectives
2026-Sep-11, Advances in biochemical engineering/biotechnology
DOI:10.1007/10_2026_355
PMID:42720748
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综述 | 本文综述了植物三萜类化合物的生物合成与生物转化，重点介绍了合成生物学和人工智能在微生物细胞工厂生产三萜类化合物中的应用。 | 首次系统总结了人工智能在加速植物三萜类化合物途径解析、异源酶和微生物底盘工程化以及工艺优化中的应用前景。 | 未涉及具体实验数据，主要基于现有文献的归纳总结。 | 综述植物三萜类化合物的生物合成途径、关键酶家族、结构多样性和生物活性，并探讨提高微生物细胞工厂生产效率的策略及未来方向。 | 植物三萜类化合物（包括四环和五环三萜皂苷）及其微生物细胞工厂（尤其是酿酒酵母）。 | 合成生物学 | 癌症, 炎症性疾病, 肝脏疾病, 免疫性疾病 | 合成生物学, 代谢工程, 人工智能 | NA | 文本 | NA | NA | 酿酒酵母 | 代谢途径（涉及OSCs、P450s、UGTs等酶） | 医药, 食品 |
| 18 | 2026-09-12 |
SCULPT-MCP: Systematic Chromosomal Upgrades for Locus-Driven Protein Topologies in Microcompartments
2026-Sep-11, ACS chemical biology
IF:3.5Q2
DOI:10.1021/acschembio.6c00504
PMID:42721414
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研究论文 | 本文展示了通过将关键结构基因pduN在操纵子中重新定位来塑造细菌微区室的形态和功能，从而建立操纵子架构作为纳米结构形态发生的可编程遗传框架。 | 发现基因顺序可以控制纳米级组装和区室化功能，尽管蛋白质序列相同；建立了操纵子架构作为纳米结构形态发生的可编程遗传框架。 | 未提及 | 探索基因顺序对蛋白质纳米机器组装和功能的影响，并开发定制几何形状和活性的自组装纳米器件的合成生物学策略。 | 细菌微区室（BMCs）及其关键结构基因pduN。 | 合成生物学 | NA | 基因重定位 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 操纵子 | 医学 |
| 19 | 2026-09-12 |
Sulfated polysaccharides and their utilization mechanisms by microorganisms: A review
2026-Sep-10, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.154431
PMID:42722257
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综述 | 本文综述了硫酸化多糖的来源、结构、生物活性以及微生物降解机制 | 系统讨论了肝素、硫酸软骨素、岩藻多糖和磺达肝癸钠四种典型硫酸化多糖的结构与生物活性，并重点分析了拟杆菌门、乳酸菌和微球菌的降解策略及活性酶的作用 | 未提及具体的研究局限性 | 总结硫酸化多糖的研究进展，探讨其微生物降解机制及应用潜力 | 硫酸化多糖（肝素、硫酸软骨素、岩藻多糖、磺达肝癸钠）及降解它们的微生物 | 糖生物学 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学，代谢工程，医疗保健 |
| 20 | 2026-09-12 |
De novo Genes in Plants: Origins, Mechanisms, and Functional Implications
2026-Sep-10, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2026.102098
PMID:42723285
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综述 | 该综述总结了植物新基因的起源机制、进化特征、功能作用及识别方法，并展望了其在作物改良和合成生物学中的应用前景 | 系统整合了植物新基因的转录优先、开放阅读框优先及并发模型等主要起源路径，并强调了长非编码RNA中的潜在编码能力、表观遗传激活及调控网络整合等未来关键问题 | 当前新基因识别方法受限于序列快速进化、基因组注释质量、多倍体及转座元件等因素，且每种方法均存在重要局限性 | 总结植物新基因研究的最新进展，阐明其如何塑造植物适应性并探讨其在精准育种和合成生物学中的应用潜力 | 植物新基因（从头基因） | 基因组学 | NA | 全基因组共线性比对，多组学证据，机器学习方法 | 机器学习 | 文本，基因组序列 | NA | NA | 植物 | NA | 农业，工业生物技术 |