合成生物学相关文章
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当前共找到 5006 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-05-24 |
Unveiling the adaptive structure-function synergy in thermophilic translation initiation factor 1: A molecular dynamics framework
2026-Aug, Biophysical chemistry
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.bpc.2026.107644
PMID:42085878
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研究论文 | 通过分子动力学模拟揭示嗜热翻译起始因子1的结构-功能协同适应性机制 | 首次通过全原子分子动力学模拟系统比较嗜热与中温翻译起始因子1的动态特性，揭示嗜热因子通过扩展氢键和盐桥网络增强结构刚性的分子机制 | 仅基于计算机模拟，缺乏体外实验验证；仅研究了单一嗜热菌株的IF1蛋白 | 阐明嗜热细菌翻译起始因子1的热稳定性分子机制，为工程化耐热蛋白建立框架 | 嗜热菌Thermoanaerobacterium thermosaccharolyticum的IF1蛋白（TT_IF1）与中温菌Flavobacterium kingsejongi的IF1蛋白（FK_IF1） | 分子生物学 | 不适用 | 分子动力学模拟，主成分分析 | 不适用 | 模拟轨迹数据 | 每种IF1蛋白3次独立模拟，每次1000纳秒 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 合成生物学，工业生物技术 |
| 2 | 2026-05-24 |
Membrane-Spanning Nanopores Formed from Nucleic Acids
2026-May-22, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.5c00905
PMID:42173496
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综述 | 本文综述了基于核酸（尤其是DNA）构建的跨膜纳米孔的最新进展 | 系统总结了从亚纳米通道到可定制大分子传输几何结构的设计原则，并强调RNA折纸技术用于创建基因可编码纳米孔的独特机遇 | NA（摘要未明确提及局限性） | 探讨合成核酸纳米孔的设计原理、优势及在单分子传感和合成生物学中的应用前景 | 基于核酸（DNA和RNA）的自组装跨膜纳米孔 | 合成生物学, 生物物理学 | NA | DNA纳米技术, RNA折纸, 单分子传感 | NA | NA | NA | DNA折纸, RNA折纸 | NA（未指定宿主生物） | 跨膜纳米孔通道 | 医学, 合成生物学, 生物技术 |
| 3 | 2026-05-24 |
PURE makes PURE: reconstitution of the PURE cell-free system from self-synthesized proteins
2026-May-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-73337-0
PMID:42173857
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研究论文 | 本研究展示了PURE无细胞系统可以从其自身合成的蛋白质中重建，实现非核糖体蛋白质组分的自我再生 | 首次证明PURE系统中的36种非核糖体蛋白质可以完全通过该系统自身合成，并重建出功能完整的PURE系统，标志着向通用生化构建器迈出关键一步 | 尚未完全实现整个系统（包括核糖体和其他复杂组分）的自主复制，未提及长期稳定性和实际应用中的瓶颈 | 探索无细胞系统自我再生能力，推动通用生化构建器的实现 | PURE无细胞系统中36种非核糖体蛋白质 | 合成生物学 | NA | PURE无细胞系统，蛋白质纯化 | NA | NA | 36种非核糖体蛋白质及其组合 | NA | E. coli（用于制备PURE系统组分） | 自我再生回路（PURE系统组分自我合成与重建） | 合成生物学，生物技术 |
| 4 | 2026-05-24 |
The interaction between the RNA aptamer Dap1 and DasR mirrors DNA operator site recognition in GntR repressors
2026-May-20, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag489
PMID:42165134
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研究论文 | 揭示了RNA适配体Dap1与细菌阻遏蛋白DasR的相互作用机制，类似于GntR阻遏物中的DNA操纵子位点识别 | 首次解析了SELEX衍生的RNA适配体Dap1与GntR/HutC家族阻遏蛋白DasR的复合物晶体结构，发现其识别模式与DNA双链结合高度相似，并基于结构设计出新型适配体Dap1m1，实现了对同源蛋白NagR的调控 | 未提及实验的局限性，如适配体设计仅针对少数位点随机化，或对其他GntR家族成员的通用性有待验证 | 研究RNA适配体与细菌阻遏蛋白的相互作用，并探索设计新型适配体-蛋白相互作用对 | RNA适配体Dap1及其靶标GntR/HutC家族阻遏蛋白DasR，以及同源蛋白NagR | 合成生物学 | NA | X射线晶体学、SELEX | NA | 三维结构数据 | NA | SELEX | NA | RNA适配体调控回路（适配体-阻遏蛋白相互作用对） | 合成生物学、医学（基因调控应用） |
| 5 | 2026-05-24 |
Quantitative Measurement of Synthetic Repression Curves Reveals Design Challenges for Genetic Circuit Engineering under Growth Arrest
2026-May-13, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00123
PMID:42125829
|
研究论文 | 在生长停滞条件下定量测量合成抑制曲线，揭示基因电路工程的设计挑战 | 首次系统性研究生长停滞对遗传NOT门电路行为的影响，发现非抑制表达水平下降超过100倍是主导因素，并指出只需解决单一性能参数即可改善电路功能 | 仅关注生长停滞对抑制曲线的影响，未涉及其他生理状态或更复杂电路；样本量有限，仅使用单细胞分辨率测量 | 探究生长停滞对工程化遗传电路性能的影响 | 基因NOT门文库 | 合成生物学 | NA | 单细胞分辨率测量 | NA | 基因表达数据 | 基因NOT门文库（具体数量未提及） | NA | 细菌 | 遗传NOT门 | 工业生物技术，环境 |
| 6 | 2026-05-24 |
Repurposing the Diatom Periplastidial Compartment for Heterologous Terpenoid Production
2026-May-08, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00919
PMID:42101919
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研究论文 | 系统剖析了硅藻周质体区室用于异源萜类化合物生产的潜力，并提出了该区室作为可工程化细胞内空间的策略 | 首次系统评估了硅藻中周质体区室（PPC）用于萜类生物合成的能力，揭示了所有主要异戊二烯磷酸前体在各区室中的可及性，并提出PPC作为与质体整合的可工程化空间 | 未明确说明本研究的局限性，但可能包括各区间产率差异及生理负担的未完全评估 | 探索硅藻周质体区室在异源萜类生产中的工程化潜力，并建立区室特异性工程策略 | 硅藻（三角褐指藻等）及其亚细胞区室（细胞质、叶绿体、周质体区室） | 合成生物学 | NA | 靶向异源合成酶表达、代谢工程 | NA | 代谢产物分析数据 | NA（涉及代表性半萜、单萜、倍半萜和四萜合成酶的多区室靶向实验） | NA | 硅藻 | 异源萜类生物合成通路（涉及DMAPP、GPP、FPP、GGPP前体的通路） | 工业生物技术、可持续生产 |
| 7 | 2026-05-24 |
Modeling the cost and benefit of proteome regulation in a growing bacterial cell
2018-05-09, Physical biology
IF:2.0Q3
DOI:10.1088/1478-3975/aabe43
PMID:29658492
|
研究论文 | 构建了一个描述生长分裂细菌细胞中蛋白质组调控成本与收益的数学模型 | 通过内部动态机制内源性决定细胞生长速率，并利用模型研究调控的生态位边界 | 模型基于简化假设，可能未涵盖真实细胞中所有调控复杂性 | 研究细菌细胞中蛋白质组调控的成本与收益平衡，确定有利于调控进化的环境条件 | 大肠杆菌细胞中的代谢蛋白和核糖体蛋白分配调控 | 合成生物学 | NA | NA | 数学模型 | 模拟数据 | NA | NA | 大肠杆菌 | 蛋白质组资源分配调控回路 | 工业生物技术, 合成生物学 |
| 8 | 2026-05-24 |
Template mediated protein self-assembly as a valuable tool in regenerative therapy
2018-04-11, Biomedical materials (Bristol, England)
DOI:10.1088/1748-605X/aab2fe
PMID:29489458
|
研究论文 | 利用硅表面通过扩散限制聚集法自组装多种蛋白质，形成树枝状结构，用于再生治疗 | 提出一种无需电解质的扩散限制聚集方法，实现多种蛋白质在硅表面的自组装，并通过分形分析解释不同蛋白质的聚集路径差异 | 未讨论自组装结构在体内的长期稳定性和免疫原性 | 开发一种模板介导的蛋白质自组装平台，用于再生治疗中的表面修饰和细胞行为调控 | I型胶原蛋白、牛血清白蛋白、细胞色素C等蛋白质及大鼠骨髓干细胞 | 生物材料、再生医学 | NA | 扩散限制聚集法、分形分析 | NA | 图像 | 3种实验蛋白质和1种细胞模型（大鼠骨髓干细胞） | NA | NA | NA | 医学 |
| 9 | 2026-05-24 |
Bottom-up synthetic biology: modular design for making artificial platelets
2017-12-06, Physical biology
IF:2.0Q3
DOI:10.1088/1478-3975/aa9768
PMID:29091050
|
研究论文 | 本文提出了利用自下而上的合成生物学构建人工血小板的模块化设计方案 | 首次提出利用自下而上合成生物学概念构建人工血小板，并定义了四个功能模块以实现这一目标 | 未提供具体的实验验证或模块实现的详细技术细节 | 探索利用合成生物学构建人工血小板的可行性 | 人工血小板的模块化设计功能 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 人工血小板功能模块，包括凝血、黏附、释放等 | 医学 |
| 10 | 2026-05-23 |
Enhancing CRISPR/Cas-Mediated Gene Knockout With Short Non-Homologous Oligonucleotides
2026-Jun, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70548
PMID:41725298
|
研究论文 | 报告了一种通过共递送短双链非同源寡核苷酸（dsNHO）大幅提高莱茵衣藻中CRISPR/Cas介导的基因敲除效率的方法 | 首次发现非同源寡核苷酸增强（NOE）现象，能提升基因敲除效率高达100倍，并揭示其通过KU70/80异二聚体介导的DSB传感通路干扰机制，将DNA修复从c-NHEJ转向MMEJ | 研究主要基于莱茵衣藻，未广泛验证于其他物种；dsNHO的长度、结构和化学修饰的影响需进一步优化 | 提高莱茵衣藻中CRISPR/Cas基因敲除效率，以促进合成生物学和功能基因组学研究 | 莱茵衣藻（Chlamydomonas reinhardtii） | 基因组编辑 | NA | CRISPR-Cas9、非同源寡核苷酸增强（NOE） | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 莱茵衣藻（Chlamydomonas reinhardtii） | NA | 工业生物技术、合成生物学 |
| 11 | 2026-05-23 |
The BAHD Acyltransferase Gene Family: Evolutionary Dynamics, Biochemical Mechanisms, and Roles in Plant Stress Adaptation
2026-Jun, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70597
PMID:41810805
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综述 | 系统综述了BAHD酰基转移酶基因家族的进化动态、生化机制及其在植物逆境适应中的作用 | 整合了进化、结构和调控层面的见解，揭示了BAHD酶作为植物适应性核心介导物及可持续农业和生物技术创新工具的新视角 | 功能冗余、底物混杂性及生物安全考虑等挑战 | 阐明BAHD酰基转移酶在植物次生代谢和逆境适应中的功能，探索其在代谢工程和作物改良中的应用潜力 | 植物中的BAHD酰基转移酶基因家族 | 机器学习 | NA | 比较基因组分析、组学研究、结构生物学、生物化学 | NA | 基因组序列、转录组数据、蛋白结构数据 | NA | NA | 植物 | 苯丙烷代谢流调控、角质和木栓质聚合、挥发性酯合成、酰化黄酮类化合物稳定化 | 农业, 工业生物技术 |
| 12 | 2026-05-23 |
Chromosome-Level Genome Assembly of the Allotetraploid Gynostemma pentaphyllum Provides Novel Insights Into the Biosynthesis of Ginsenoside and Gypenoside LVI
2026-Jun, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70598
PMID:41821502
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研究论文 | 组装了四倍体绞股蓝的染色体级别基因组，揭示了人参皂苷和绞股蓝皂苷LVI生物合成的机制 | 首次组装了四倍体绞股蓝的染色体级别基因组，发现其是异源四倍体，并鉴定出GpCYP88AB3为双功能酶，证明该酶在绞股蓝和五加科植物中通过趋同进化实现功能 | 未明确说明研究局限性 | 阐明绞股蓝中人参皂苷和绞股蓝皂苷LVI差异积累的机制 | 四倍体绞股蓝（遂宁种群）和二倍体绞股蓝（南宁种群） | 数字病理学 | NA | 基因组组装、多组学分析、体内体外实验 | NA | 基因组、多组学数据 | 两个绞股蓝种群样品（遂宁和南宁） | NA | NA | NA | 医学、农业、工业生物技术 |
| 13 | 2026-05-23 |
Common γ-chain cytokines in brain tumor immunotherapy: Biological barriers and advances in macromolecular delivery systems
2026-Jun, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.152288
PMID:42092664
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综述 | 本文综述了常见γ链细胞因子在脑肿瘤免疫治疗中的应用，重点讨论了生物屏障和基于大分子的递送系统的进展 | 系统阐述了血脑屏障和血液肿瘤屏障对免疫治疗的阻碍，并总结了纳米颗粒、外泌体和细胞载体等递送平台在增强细胞因子稳定性、肿瘤选择性和降低系统毒性方面的创新应用 | 未明确提及具体局限性，但暗示细胞因子疗法仍面临生物屏障、半衰期短和脱靶毒性等挑战 | 探讨常见γ链细胞因子在脑肿瘤免疫治疗中的潜力，并分析递送系统如何克服生物屏障以改善治疗效果 | 脑肿瘤（尤其是胶质瘤）及其免疫抑制微环境 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 纳米颗粒、外泌体、细胞载体 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 14 | 2026-05-23 |
Coarse-grained modeling of hydrodynamic behavior in DNA synthesis monomers
2026-May-28, The Journal of chemical physics
IF:3.1Q1
DOI:10.1063/5.0325256
PMID:42170875
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研究论文 | 提出了一种用于DNA合成单体粗粒化建模的方法，并研究了其流体动力学行为 | 首次提出DMT保护核苷酸单体的四珠粗粒化模型，并通过玻尔兹曼反演验证，计算效率提升20倍以上 | 未涉及实验验证或实际合成场景中的多因素影响 | 理解DNA合成中单体的微观动力学，优化合成参数 | DMT保护的核苷酸单体（腺嘌呤、胸腺嘧啶、胞嘧啶、鸟嘌呤） | 机器学习 | NA | 粗粒化建模、随机欧拉-拉格朗日方法 | 粗粒化模型 | 模拟数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学，DNA数据存储 |
| 15 | 2026-05-23 |
Gene expression and metabolic regulation of carotenoid and withanolide biosynthetic pathways in Withania somnifera with emphasis on FPPS-mediated regulation
2026-May-22, Protoplasma
IF:2.5Q2
DOI:10.1007/s00709-026-02212-y
PMID:42171742
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研究论文 | 研究了睡茄中类胡萝卜素和睡茄内酯生物合成途径的基因表达与代谢调控，重点分析了法尼基焦磷酸合酶介导的调控作用 | 首次系统揭示了FPPS作为睡茄内酯生物合成关键通量调控酶的作用，并通过瞬时过表达验证了WsFPPS2对睡茄内酯含量的提升效果 | NA | 解析睡茄中类胡萝卜素和睡茄内酯生物合成途径的基因表达与代谢调控机制，探究FPPS作为代谢工程靶点的可行性 | 睡茄的营养组织和生殖组织，以及其22个相关基因的表达谱 | 植物生物学 | NA | 转录谱分析、瞬时过表达、系统发育分析 | NA | 基因表达数据、系统发育树 | NA | 瞬时过表达 | 睡茄 | NA | 医学、农业 |
| 16 | 2026-05-23 |
Programmable living therapeutics for cancer immunotherapy
2026-May-21, Cell chemical biology
IF:6.6Q1
DOI:10.1016/j.chembiol.2026.04.007
PMID:42119557
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综述 | 本文综述了合成生物学在癌症免疫治疗中可编程活体疗法的进展 | 系统总结了基于合成生物学电路的三类活体治疗手段（工程化CAR-T细胞、溶瘤细菌和溶瘤病毒）的设计策略与调控机制 | 临床转化面临电路复杂性、靶向精度、底盘优化及跨平台协同等关键挑战 | 探讨合成生物学驱动的精准、安全癌症免疫治疗活体疗法的当前进展与未来方向 | 工程化CAR-T细胞、溶瘤细菌、溶瘤病毒 | 合成生物学 | 癌症 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | T细胞, 细菌, 病毒 | 小分子响应开关、物理信号响应开关、肿瘤标志物响应开关、群体感应电路、肿瘤微环境响应逻辑、肿瘤选择性启动子、miRNA靶向模块、重定向衣壳/配体 | 医学 |
| 17 | 2026-05-23 |
Selective on-chip DNA synthesis using electric field-assisted PCR
2026-May-20, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d5lc01200g
PMID:42015792
|
研究论文 | 本研究提出了一种基于微电极阵列的电辅助聚合酶链反应（E-PCR）系统，用于选择性片上DNA合成 | 利用电场操控实现DNA选择性固定和酶介导的单链DNA合成，达到微尺度空间控制，并优化电场模式解决电化学稳定性和DNA完整性挑战 | NA | 开发一种稳健的选择性片上DNA合成平台，用于高通量酶促合成 | DNA合成过程中的电场操控和酶反应 | 合成生物学 | NA | E-PCR（电辅助聚合酶链反应） | NA | 核酸序列 | NA | NA | NA | NA | DNA数据存储，合成生物学，分子诊断 |
| 18 | 2026-05-23 |
Systematic investigation of double emulsion dewetting dynamics for the robust production of giant unilamellar vesicles
2026-May-20, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d6lc00098c
PMID:42018534
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研究论文 | 系统研究了双乳液去湿润动力学，以稳健制备巨单层囊泡 | 揭示了脂质组成、水相条件、液滴约束和流体动力学对去湿过程的影响，并提出了在生理盐存在下通过增加膜堆积饱和度克服盐诱导抑制的新见解 | NA | 提高基于液滴微流体的巨单层囊泡平台的可靠性和可及性，以推动生物物理学、合成生物学和药物发现领域的发展 | 双乳液去湿润动力学及巨单层囊泡的形成 | 合成生物学 | NA | 双乳液液滴微流控 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物物理学, 合成生物学, 药物发现 |
| 19 | 2026-05-23 |
A combinatorial screening platform for in situ gene delivery to adherent cells via digital microfluidics and flexible electrodes
2026-May-20, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d6lc00124f
PMID:42029944
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研究论文 | 开发了一种集成数字微流控与柔性电极的组合筛选平台，用于原位基因递送至贴壁细胞 | 通过数字微流控与柔性叉指电极阵列的集成，实现贴壁细胞低电压电穿孔及全自动试剂梯度生成，避免酶消化带来的生理应激 | NA | 解决传统电穿孔技术通量低、试剂消耗高及需细胞悬浮等问题，实现贴壁细胞原位高效基因递送 | 贴壁细胞（人真皮成纤维细胞） | 数字病理学 | NA | 数字微流控, 电穿孔 | NA | 图像 | NA | NA | 人真皮成纤维细胞 | NA | 再生医学, 合成生物学 |
| 20 | 2026-05-23 |
Marine bioactive compounds in the management of zoonotic parasitic diseases: public health ramifications, mechanisms, and translational prospects
2026-May-20, Microbial pathogenesis
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.micpath.2026.108574
PMID:42155906
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综述 | 本文综述了海洋来源的生物活性化合物在管理人兽共患寄生虫病中的应用，涵盖其作用机制、公共卫生影响及转化前景 | 系统总结了海洋生物活性物质抗寄生虫的多重机制，并引入AI辅助筛选、网络药理学和纳米技术等新型药物发现方法 | 海洋生物活性物的药代动力学、安全性和临床应用仍需进一步研究 | 探讨海洋生物活性化合物作为抗人兽共患寄生虫病创新药物的潜力 | 海洋来源的生物活性物质及人兽共患寄生虫病原体 | 机器学习 | 人兽共患寄生虫病 | AI辅助筛选， 网络药理学， 纳米技术 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |