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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-07-08 |
Bioactive Peptides for Oral Diseases: Biomaterial-Assisted Therapeutics and Translational Applications
2026-Jul-07, ACS applied bio materials
IF:4.6Q2
DOI:10.1021/acsabm.6c00571
PMID:42411007
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综述 | 总结生物活性肽在口腔疾病中结合生物材料辅助治疗的研究进展及转化应用 | 系统整合了生物材料平台(如纳米颗粒、水凝胶、涂层与黏膜黏附系统)提升生物活性肽在口腔环境中稳定性和靶向递送的方法,并讨论了人工智能引导设计和合成生物学驱动的创新解决方案 | 临床转化受限于酶解不稳定性、短滞留时间、复杂口腔微环境中的渗透力不足,以及规模化制造和安全性评估的挑战 | 评估生物活性肽在口腔疾病治疗中的潜力,并探讨通过生物材料辅助策略克服其应用瓶颈的路径 | 生物活性肽及其与生物材料系统(纳米颗粒、水凝胶、涂层与黏膜黏附系统)的结合 | 数字病理学 | 口腔疾病(包括龋齿、牙周炎、口腔黏膜炎症、种植体周围感染和口腔组织缺损) | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 2 | 2026-07-08 |
Clocked stepping of an artificial protein walker along a DNA track
2026-Jul-06, Nature nanotechnology
IF:38.1Q1
DOI:10.1038/s41565-026-02211-3
PMID:42410215
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研究论文 | 本文报道了一种名为Tumbleweed的人工蛋白马达的构建,该马达能够在DNA轨道上实现可控的定向步进 | 首次实现人工蛋白马达的设计与构建,通过模块化组合配体门控DNA结合域,赋予马达方向性和外部可控性 | 马达运动依赖外部配体序列控制,可能限制其自主性和在复杂环境中的应用 | 构建外部可控的人工蛋白马达,实现沿DNA轨道的定向步进运动 | Tumbleweed人工蛋白马达 | 合成生物学 | NA | 单分子荧光检测,微流控装置 | NA | 单分子荧光数据 | NA | 模块化蛋白设计 | NA | 配体门控DNA结合域构成的步进马达 | 纳米技术,合成生物学 |
| 3 | 2026-07-08 |
Exploring Neurological Disorder Therapeutics: The Progress and Future Prospects of Proteins and Peptides Derived from Blue Foods
2026-Jul-06, Current protein & peptide science
IF:1.9Q4
|
综述 | 探讨蓝色食物来源的蛋白质和肽在神经疾病治疗中的进展与未来前景 | 综述了蓝色食物生物活性分子在神经保护中的多机制作用,并展望了纳米制剂、合成生物学和人工智能在肽发现中的新方法 | 临床转化面临提取标准化、生物利用度、批次差异、过敏原性和复杂监管要求等挑战 | 总结蓝色食物来源蛋白质和肽在神经疾病治疗中的研究进展,并评估其临床应用潜力 | 海洋鱼类、藻类和无脊椎动物等蓝色食物中的生物活性蛋白质和肽 | 数字病理学 | 神经系统疾病 | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 4 | 2026-07-08 |
A self-replicating artificial module-genome that generates bacterial chromosome replication system in vitro
2026-Jul-03, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag663
PMID:42406626
|
研究论文 | 展示了一个能自我复制的53 kb人工模块基因组,该基因组编码所有26种大肠杆菌染色体复制系统蛋白,在体外实现自我复制 | 首次实现由遗传信息生成自我编码复制机制的染色体复制系统,构建了名为PRIMES的体外自我复制系统,支持超过28代递归自我复制 | NA | 构建能自主自我复制的人工细胞,实现自下而上的合成生物学目标 | 大肠杆菌染色体复制系统和人工模块基因组 | 合成生物学 | NA | Replication-Cycle Reaction (RCR) 系统、蛋白质合成系统 (PURE) | NA | NA | NA | NA | NA | 模块基因组 (RCR module-genome) | 合成生物学、人工细胞构建 |
| 5 | 2026-07-08 |
Machine learning-guided discovery of poly(ethylene terephthalate)-binding modules to enhance durable whole-cell degradation
2026-Jul-01, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.135279
PMID:42385911
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研究论文 | 利用机器学习引导发现聚对苯二甲酸乙二醇酯结合模块,以增强耐用全细胞降解 | 提出机器学习辅助管道,结合隐马尔可夫模型同源性搜索和监督式PET水解酶机器学习模型(PETML),从天然蛋白质架构中发现了新型PET结合模块,并展示了其在全细胞催化降解PET中的优越性能 | 未明确说明局限性,但研究主要基于计算预测和体外实验,可能缺乏体内实际环境验证 | 开发可增强PET酶降解效率的结合模块,实现耐用全细胞催化系统 | PET结合模块候选物,特别是tCBM13-1,以及大肠杆菌表面展示系统 | 机器学习,合成生物学 | NA | 机器学习,分子对接,分子动力学模拟,表面展示 | 隐马尔可夫模型,PETML | 蛋白质序列数据,分子对接数据,实验测量数据 | 197个非冗余候选模块,重点研究tCBM13-1 | CRISPR-Cas9(可能用于展示系统建设) | Escherichia coli | 双锚定系统(OmpA和EhaA)用于表面共展示FAST-PETase和tCBM13-1 | 环境,工业生物技术 |
| 6 | 2026-07-08 |
Rapid and Continuous Directed Evolution in Vibrio natriegens Utilizing an In Vivo Hypermutation System
2026-Jun-26, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00936
PMID:42362483
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研究论文 | 在Vibrio natriegens中利用体内超突变系统实现快速连续定向进化 | 首次在生长最快的非致病菌Vibrio natriegens中建立MutaT7系统(VnMutaT7),实现模型蛋白TEM-1的快速进化,36小时内获得高水平的头孢他啶抗性 | NA | 建立Vibrio natriegens中的快速连续定向进化方法 | Vibrio natriegens、MutaT7系统、TEM-1蛋白 | 合成生物学 | NA | MutaT7体内超突变系统 | NA | NA | NA | MutaT7 | Vibrio natriegens | 体内超突变系统 | 蛋白质工程、合成生物学 |
| 7 | 2026-07-08 |
Genome-Scale Metabolic Modeling of Terpenoid Biosynthesis: Advances and Perspectives
2026-Jun-26, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.6c03926
PMID:42362489
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综述 | 系统综述了基因组尺度代谢模型在四种典型萜类生产微生物中的进展及应用 | 整合了四种典型微生物的GSMM应用,并探讨了多约束模型及机器学习与合成生物学融合的未来方向 | 未具体说明实际实验验证或模型预测的准确性限制 | 提供萜类化合物细胞工厂智能设计和高效构建的理论参考 | 萜类化合物微生物生产 | 系统生物学 | NA | 基因组尺度代谢模型 | NA | 基因组数据 | NA | NA | 大肠杆菌, 酵母, 蓝细菌, 其他 | 代谢途径优化 | 医药, 农业, 能源, 食品 |
| 8 | 2026-07-08 |
In Vivo Tracking Modalities for Oncolytic Reovirus: Principles, Clinical Applications, and Translational Integration
2026-Jun, Molecular imaging and biology
IF:3.0Q2
DOI:10.1007/s11307-026-02092-x
PMID:41963749
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综述 | 系统评估用于溶瘤呼肠孤病毒(特别是Pelareorep)的体内追踪策略,重点强调临床转化及应用 | 整合光学成像、核成像、MRI、超声/光声技术、分子报告基因及纳米平台等多种追踪方法,并引入合成生物学报告系统、AI驱动图像分析和液体活检等新兴策略,提出个体化追踪框架 | 病毒基因组容量有限、免疫介导的清除作用以及信号穿透力不足等持续挑战 | 批判性评估现有和新兴的体内追踪技术,促进溶瘤呼肠孤病毒疗法的临床转化与个性化监测 | 溶瘤呼肠孤病毒(特别是Pelareorep)及相关的追踪技术 | 数字病理学 | 肿瘤 | 光学成像, 核成像, MRI, 超声/光声技术, 纳米技术平台, 分子报告基因, CRISPR驱动电路, 病毒条形码 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 合成生物学报告电路, 病毒条形码 | 医学 |
| 9 | 2026-07-08 |
Rare-codon-tuned fluorescent biosensor for high-throughput selection of Escherichia coli strain capable of L-arginine overproduction
2026-May-12, BMC microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.1186/s12866-026-05154-w
PMID:42121024
|
研究论文 | 开发了一种稀有密码子调控的荧光生物传感器,用于高通量筛选能够过量生产L-精氨酸的大肠杆菌菌株 | 该生物传感器平台不依赖正交翻译系统,可应用于野生型菌株,通过稀有密码子工程实现荧光强度与胞内L-精氨酸水平的严格关联,结合紫外诱变和荧光激活细胞分选实现高效筛选 | 未明确提及,但可能包括对特定代谢产物(L-精氨酸)的专一性以及筛选效率在更大规模应用中的可扩展性 | 开发一种通用且强大的高通量表型分析工具,以加速微生物菌株优化,用于可扩展的生物制造 | 大肠杆菌菌株,特别是工程化的E. coli ARG文库和分离出的E. coli ARG-B10及衍生物E. coli B10 | 合成生物学和代谢工程 | NA | 荧光激活细胞分选,紫外诱变,基因组分析 | NA | 荧光强度数据,基因组序列数据 | 从一个工程化的大肠杆菌ARG文库中分离出顶级生产菌株,具体细胞数量未明确说明 | NA | 大肠杆菌 | 稀有密码子依赖的荧光生物传感器,使用富含L-精氨酸的肽模块与AGG稀有密码子和StayGold荧光蛋白融合 | 工业生物技术 |
| 10 | 2026-07-08 |
Machine learning-optimized long single-stranded DNA synthesis technology empowers high-precision diagnostic-therapeutic integration in living cells
2026-Feb-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag131
PMID:41674382
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研究文章 | 开发了一种结合机器学习优化的长单链DNA合成技术,实现了活细胞中高精度诊疗一体化 | 通过Phi29 DNA聚合酶和Nb.BbvCI切口酶在甲酸盐缓冲液中的协同作用,实现了长达15000 nt的高保真单链DNA合成,并结合机器学习优化镁离子动力学和热调节参数,以及硫醇-金固定模板的固相纯化方法,显著提升了产率和纯化回收率 | 主要局限在于酶促反应随机性和产物异质性,但通过缓冲液工程和计算优化已克服这些挑战 | 发展并验证一种高纯度、高产率的长单链DNA合成技术,用于精准纳米医学的诊疗应用 | 宫颈癌细胞及其基因组编辑 | 合成生物学, 机器学习 | 宫颈癌 | 酶促复制(NEAR), 固相合成, 机器学习优化 | 机器学习模型 | 序列数据, 实验参数 | NA | CRISPR, 切口酶Nb.BbvCI, Phi29 DNA聚合酶 | 宫颈癌细胞 | 六螺旋束DNA折纸-CRISPR复合物用于靶向核仁素的基因组编辑和诊断治疗偶联 | 医学, 合成生物学, 分子数据存储 |
| 11 | 2026-07-07 |
Advancing our understanding of photosynthesis: discoveries and insights from aquatic plants
2027-Jan, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2026.04.036
PMID:42405274
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综述 | 综述了水生植物光合作用可塑性的最新研究进展 | 系统揭示了水生植物特有的单细胞C4光合作用、二态叶绿体和异形叶性等进化创新,并提出了新型模式生物体系 | 未涉及分子机制的具体验证实验 | 通过对比陆生模式植物与水生植物,解析环境压力塑造的不同光合策略 | 高等水生植物及其碳浓缩机制 | 植物学 | NA | 比较基因组学 | NA | 文献数据 | NA | NA | NA | NA | 碳中和, 淡水生态系统管理, 作物改良, 合成生物学 |
| 12 | 2026-07-07 |
Improving cell-free metabolism through direct integration of artificial respiratory chains
2026-Jul-07, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2613483123
PMID:42391401
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研究论文 | 开发人工呼吸链直接整合到无细胞代谢网络中,以改善能量保存和系统功能 | 设计了定制的人工呼吸链,结合CO固定酶循环实现快速电子传递并利用电子流合成ATP,同时展示了人工呼吸链的多样性和与其他生物功能的耦合 | 构建自维持/自供能人工生命系统的挑战依然存在,可能涉及能量耦合的复杂性和稳定性问题 | 通过直接整合能量保存机制,构建具有生命样特性的复杂无细胞代谢系统 | 无细胞代谢网络和人工呼吸链 | 合成生物学 | NA | 人工呼吸链构建、酶催化循环、无细胞转录翻译网络 | NA | NA | NA | NA | 无细胞系统 | 人工呼吸链、CO固定酶循环(crotonyl-CoA/ethylmalonyl-CoA/hydroxybutyryl-CoA)、ATP合成耦合系统 | 合成生物学、生物技术 |
| 13 | 2026-07-07 |
Stable, micron-scale lipocondensates achieving prolonged circulation without PEGlyated lipids
2026-Jul-06, Biomaterials science
IF:5.8Q1
DOI:10.1039/d6bm00335d
PMID:42405635
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研究论文 | 该论文报道了稳定的微米级脂质凝聚体,无需聚乙二醇化脂质即可实现长效循环 | 首次发现仅由天然脂质组成的凝聚体可形成细胞尺寸的稳定结构,其循环半衰期远超现有脂质涂层凝聚体系统,且与纳米级聚乙二醇化系统相当 | 未提及长期稳定性及体内递送效率的具体验证 | 探索脂质凝聚体的分子组成对脂质组织和界面行为的影响,开发新型递送平台 | 脂质凝聚体(LipCons)的结构与功能特性 | 合成生物学 | NA | SAXS, FRAP | NA | 图像 | NA | NA | NA | 脂质凝聚体(LipCon)结构 | 医学, 合成生物学 |
| 14 | 2026-07-07 |
Applications of Recombinant DNA Technology in Medicine: A Comprehensive Review
2026-Jul-05, Molecular biotechnology
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12033-026-01595-w
PMID:42402538
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综述 | 综述重组DNA技术在医学领域的应用,涵盖治疗、诊断和预防 | 系统总结rDNA技术在生物制药、重组疫苗、基因治疗、分子诊断及个性化医学中的最新进展,并探讨伦理与未来技术方向 | NA | 总结重组DNA技术在医学中的应用及未来潜力 | 重组DNA技术及其在医学中的应用 | 机器学习 | NA | 重组DNA技术,基因克隆,载体设计,CRISPR,PCR,qPCR | NA | NA | NA | CRISPR | NA | NA | 医学 |
| 15 | 2026-07-07 |
Heterologous Expression of an Abandoned Termite Mound Fungus Gene Cluster Reveals a Protective Aldehyde-Alcohol Cycle and a Candidate Termiticidal Metabolite
2026-Jul-05, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00101
PMID:42402854
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研究论文 | 通过异源表达废弃白蚁巢真菌基因簇,揭示了保护性醛-醇循环及候选杀白蚁代谢物 | 首次利用合成生物学方法从野生样本中挖掘并重构了废弃白蚁巢真菌的保守生物合成基因簇,鉴定了α-吡喃酮代谢物家族,并解析了空间分离的醛-醇循环自保护系统 | 未明确说明本文的局限性 | 探索废弃白蚁巢真菌(乌灵参)生态适应性的分子基础 | 废弃白蚁巢真菌(乌灵参)及其生态互作 | 合成生物学 | NA | 宏基因组、转录组挖掘,异源重建 | NA | 基因序列、转录组数据 | 多个野生乌灵参标本 | NA | 真菌宿主 | 醛-醇循环(包含外源氧化酶WlsA和内源还原酶WlsE) | 农业、生态学 |
| 16 | 2026-07-07 |
Recombinant Protein Drugs: A 2025 Update
2026-Jul, BioDrugs : clinical immunotherapeutics, biopharmaceuticals and gene therapy
IF:5.4Q1
DOI:10.1007/s40259-026-00783-z
PMID:42129013
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综述 | 综述2025年重组蛋白药物的进展,涵盖生产平台、蛋白质工程和监管科学 | 综合了合成生物学、宿主工程和工艺优化的创新,以及模块化蛋白质工程带来的下一代格式如双特异性抗体和纳米抗体 | 未提及具体局限性 | 提供重组蛋白药物领域的最新更新,概述技术如何塑造下一代生物制剂 | 重组蛋白药物及其生产平台、工程技术和监管框架 | NA | 肿瘤、炎症、代谢性疾病等 | NA | NA | NA | NA | NA | 微生物菌株、哺乳动物细胞、植物平台 | 模块化蛋白质工程,如双特异性抗体、纳米抗体、融合蛋白、自组装生物材料 | 医学 |
| 17 | 2026-07-07 |
Microfluidics-Based Engineering of Molecular Self-Assembly and Manufacturing for Artificial Cell Systems
2026-Jun-25, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00249
PMID:42358072
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研究论文 | 探讨微流控平台在分子自组装与人工细胞系统制造中的协同作用 | 提出通过微流控提供外部物理边界条件,协同内在自组装与确定性工程,以构建稳健的人工细胞系统 | 主要基于理论视角,缺乏实验验证和量化数据支持 | 论证微流控工程与分子自组装结合的必要性,推动人工细胞技术标准化和工业化 | 人工细胞系统及微流控平台 | 合成生物学 | NA | 微流控 | NA | NA | NA | 微流控芯片 | NA | 分子自组装系统 | 工业生物技术, 医学 |
| 18 | 2026-07-07 |
Beyond Compartmentalization: Deciphering Reaction Kinetics in Liquid-Liquid Phase Separation for Rational Biotechnological Design
2026-Jun-25, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00259
PMID:42350320
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综述 | 本文综合评述了液-液相分离如何通过调控反应动力学来推动合成生物学领域的发展 | 系统剖析了蛋白介导与非蛋白介导的液-液相分离对反应动力学的调控机制,并提供了理性设计指南 | 缺少实验验证,主要基于现有文献的总结和分析 | 阐明液-液相分离对反应动力学的精确调控机制,为理性设计下一代合成生物学应用提供基础 | 液-液相分离系统及其在合成生物学中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物技术, 医学, 生物催化, 代谢工程, 诊断, 治疗, 人工细胞构建 |
| 19 | 2026-07-07 |
Vanadium-dependent haloperoxidases: Recent advances and perspectives
2026 Mar-Apr, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108797
PMID:41506498
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综述 | 本文综述了钒依赖卤过氧化物酶(VHPOs)在发现、结构功能关系、机制阐明及各种合成应用方面的最新进展 | 重点介绍了对VHPOs卤离子和底物特异性的最新突破,包括底物通道识别和酶结合卤化机制,这些发现挑战了传统的扩散性HOX模型并实现了理性酶工程 | NA | 总结VHPOs在有机合成中的快速进展,并展望其在合成生物学、材料科学和环境生物技术中的应用前景 | 钒依赖卤过氧化物酶(VHPOs) | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 酶工程 | NA | NA | 合成生物学, 材料科学, 环境生物技术 |
| 20 | 2026-07-07 |
Rational engineering of combinatorial bacterial therapies for cancer
2026-Jan-28, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-03951-0
PMID:41606628
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综述 | 综述了合理工程化组合细菌疗法在癌症治疗中的应用 | 聚焦于通过合成生物学工具实现细菌的时空控制和群体行为编程,提升肿瘤特异性和免疫调节能力 | 当前临床转化的障碍尚待克服,如安全性、递送效率和免疫逃逸问题 | 探讨合理工程化如何指导下一代微生物疗法 | 工程化细菌作为癌症治疗载体 | 合成生物学 | 癌症 | NA | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 遗传电路(包括衰减、载荷释放、免疫调节) | 医学 |