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当前共找到 5665 篇文献,本页显示第 1 - 20 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 工程工具 宿主生物 回路设计 应用领域
1 2026-09-11
Multi-Omics Analyses Reveal the Red and Far-Red Light Combination Enhancing Heterologous Protein and Metabolite Production in Nicotiana benthamiana
2026-Oct, Plant, cell & environment
研究论文 该研究通过多组学分析揭示红光与远红光组合(LED-red)可通过抑制植物防御通路、促进农杆菌增殖,从而提高本氏烟草中异源蛋白和代谢物的瞬时报导表达效率 首次系统探究光质(尤其是红光与远红光组合)对农杆菌介导的本氏烟草瞬时表达效率的影响,并结合转录组、蛋白质组和代谢组多组学手段阐明其分子机制 研究仅在本氏烟草中验证,未在其他植物宿主中测试;光质影响机制的多组学关联仍需进一步功能验证;田间或规模化应用可行性尚未评估 探究不同光质对本氏烟草生长及农杆菌介导的瞬时表达效率的影响,并阐明其分子机制,以提升异源蛋白和代谢物的生产效率 本氏烟草(Nicotiana benthamiana)植株、农杆菌(Agrobacterium)、绿色荧光蛋白(GFP)、紫杉二烯(taxadiene) 合成生物学、植物生物技术 NA 农杆菌介导的瞬时转化(agroinfiltration)、转录组测序、蛋白质组学、代谢组学 NA 转录组数据、蛋白质组数据、代谢组数据、荧光蛋白表达定量数据 NA 农杆菌介导的瞬时转化(agroinfiltration) 本氏烟草(Nicotiana benthamiana) NA 医药、工业生物技术
2 2026-09-11
Mitochondria as programmable redox rheostats: Advancing from transplantation to bioengineered organelle therapeutics
2026-Oct, Redox biology IF:10.7Q1
综述 本文综述了线粒体移植向线粒体工程转变的趋势,将线粒体视为可编程的治疗单元,并评估了表面功能化、遗传调控和先进递送平台等策略 提出了将线粒体从静态移植载荷转变为可编程氧化还原变阻器的概念,强调了合成生物学、纳米医学和生物材料的整合应用 线粒体移植面临靶向特异性差、递送动力学低和分离后功能衰退等转化障碍 探讨线粒体工程作为精准、可扩展临床治疗手段的发展方向和转化挑战 线粒体及其在缺血再灌注损伤、神经退行性疾病和代谢综合征等病理中的作用 合成生物学、纳米医学、生物材料 缺血再灌注损伤、神经退行性疾病、代谢综合征 线粒体移植、线粒体工程、表面功能化、遗传调控、纳米医学递送 NA 文本 NA NA NA NA 医学
3 2026-09-11
Artificial metalloenzymes in whole-cell catalysis: Toward hybrid metabolic systems
2026-Oct, Current opinion in chemical biology IF:6.9Q1
综述 本文综述了人工金属酶(ArMs)在全细胞催化中的最新进展,并探讨了将其整合到合成生物学和代谢工程中所面临的挑战与潜在策略 系统性地总结了全细胞ArMs催化领域的最新进展,并首次提出了从简单全细胞生物转化向含ArMs的代谢工程过渡时所面临的额外复杂性,同时讨论了实现ArMs与生物合成途径高效整合的潜在策略 全细胞ArMs催化仍处于基础研究阶段,将ArMs整合到混合代谢系统中的设想尚未在规模化层面实现 总结全细胞ArMs催化的最新进展,概述体内ArMs整合所面临的挑战,并探讨将ArMs有效整合到生物合成途径中的潜在策略 人工金属酶(ArMs)及全细胞催化系统 合成生物学 NA 全细胞催化, 人工金属酶, 代谢工程 NA 文本 NA NA NA 混合代谢系统 工业生物技术
4 2026-09-11
Recent discovery of new enzymes in plant natural product biosynthesis
2026-Oct, Current opinion in chemical biology IF:6.9Q1
综述 本文综述了近年来在植物天然产物生物合成中新酶发现的主要进展,重点关注新催化机制、途径解析策略及进化关系 系统总结了催化挑战性化学转化的植物来源酶,包括氧化碳-碳键重排、非典型环加成、自由基介导的偶联反应及迭代骨架重塑等 作为综述文章,未提供原始实验数据或新酶的具体验证结果 总结植物天然产物生物合成中酶发现的最新进展,并探讨其对合成生物学和代谢工程的意义 植物天然产物生物合成途径中的新酶 合成生物学 NA 基因组学、代谢组学、蛋白质结构预测、异源途径重构 NA 文本 NA NA NA NA 医药,工业生物技术
5 2026-09-11
Design of programmable molecular interfaces for synthetic biology and therapeutic applications
2026-Oct, Current opinion in chemical biology IF:6.9Q1
综述 本文综述了从头蛋白质设计在合成生物学和治疗应用中的进展,重点关注生成建模、序列设计和结构预测方法如何实现可编程分子界面的设计 系统总结了从头蛋白质设计的最新方法学进展,包括生成建模、序列设计和结构预测,并强调了这些方法在创建紧凑稳定的结合蛋白、可编程相互作用模块和高级组装体方面的能力,减少了对天然解决方案和大量实验筛选的依赖 在复杂环境中预测蛋白质行为以及平衡多个设计目标方面仍存在挑战 探讨从头蛋白质设计如何重塑合成生物学指定和控制分子功能的方式,并推动治疗应用的发展 从头设计的蛋白质、结合蛋白、相互作用模块和高级组装体 合成生物学 NA 生成建模、序列设计、结构预测 NA NA NA NA NA NA 医学、工业生物技术
6 2026-09-11
Systematic mapping of insertion-tolerant regions enables capsid engineering of an infectious RNA phage
2026-Sep-09, mBio IF:5.1Q1
研究论文 该研究结合MuA转座酶插入诱变与反向遗传学系统,系统鉴定了RNA噬菌体MS2和PP7中可耐受序列插入的区域,并基于此实现了PP7衣壳蛋白的工程化改造 首次系统绘制了RNA噬菌体MS2和PP7的插入耐受区域图谱;首次在感染性RNA噬菌体中实现了衣壳蛋白工程化,成功展示了RGD基序的衣壳展示 研究主要基于MS2和PP7两种RNA噬菌体,普适性有待验证;仅在一个ITR位点进行了功能验证;体内清除实验的具体模型和体内稳定性数据未在摘要中详述 系统鉴定RNA噬菌体基因组中可耐受序列插入的区域,并利用这些区域实现感染性RNA噬菌体的衣壳工程化 RNA噬菌体MS2和PP7 合成生物学 NA MuA转座酶介导的插入诱变、反向遗传学、cDNA克隆技术 NA 序列数据、克隆筛选数据、结构数据 4,555个MS2和2,228个PP7随机插入克隆 MuA转座酶 NA NA 医学、工业生物技术
7 2026-09-11
Harnessing Probiotic LAB and Bacteriocins for Clean-Label Food Processing and Biopreservation: Omics, Molecular Innovations and Industrial Applications
2026-Sep-09, Probiotics and antimicrobial proteins IF:4.4Q2
综述 本综述总结了利用益生乳酸菌及其细菌素抑制食品中持久性腐败微生物、生物膜形成病原菌和产芽孢菌的最新研究进展,涵盖分离鉴定、作用机制、组学解析及工业应用 系统整合了组学与分子方法在细菌素生物合成、基因调控及宿主-微生物互作解析中的应用,并探讨了细菌素与包埋、纳米生物技术等栅栏技术的协同作用,以及合成生物学和预测建模在拓展细菌素应用潜力中的前景 更广泛的转化仍受限于监管要求、生产与配方成本、在复杂食品基质中功效不稳定,以及许多候选细菌素缺乏实验室和模型食品系统之外的验证 探讨乳酸菌和细菌素在清洁标签食品加工与生物保鲜中的应用潜力,包括其抑菌机制、分子创新及工业化面临的挑战 乳酸菌(LAB)、细菌素、食品中持久性微生物腐败污染物、生物膜形成病原菌及产芽孢菌(如芽孢杆菌属、李斯特菌属、葡萄球菌属、梭菌属、大肠杆菌等) 食品科学与生物保鲜 食源性疾病 组学技术( genomics、转录组学等)、分子生物学方法、纳米生物技术、包埋技术 NA 文本 NA NA 乳酸菌 NA 食品, 医学
8 2026-09-11
Microbial Extracellular Polymeric Substance: A Pioneer in Ensuring Soil Health and Sustainable Development of Agriculture
2026-Sep-09, Journal of agricultural and food chemistry IF:5.7Q1
综述 本文综述了微生物胞外聚合物(EPS)在细胞保护、土壤改良和污染修复三个层面的作用机制及其在保障土壤健康和农业可持续发展中的应用前景。 从细胞保护、土壤改良和污染修复三个层次系统阐明EPS的作用机制,将EPS的功能从细胞保护拓展至环境修复,并提出合成生物学与材料科学推动未来绿色应用的方向。 成本降低和机制阐明仍是挑战。 阐明微生物胞外聚合物在土壤生态系统中的多重功能机制,并探讨其在保障土壤健康和农业可持续发展中的应用前景。 微生物胞外聚合物(EPS),由微生物分泌的多糖、蛋白质和核酸组成的复合物。 农业微生物学、环境生物技术 NA NA NA 文本 NA NA NA NA 农业, 环境
9 2026-09-11
Engineered living materials: integration of living and nonliving systems
2026-Sep-09, Bioresource technology IF:9.7Q1
综述 本文综述了工程化活体材料(ELMs)的设计、制造和应用进展,强调底盘工程、智能基质、生物打印、原位生长以及其在医学、环境修复和生物制造中的转化潜力 系统整合了合成生物学的可编程性与聚合物、无机或复合支架的结构可调性,并提出了多细胞联合体、遗传生物防逃逸和人工智能引导逆向设计等新兴策略 机械鲁棒性与细胞活力之间的权衡、传质受限、长期功能不稳定、生物-非生物界面复杂性、生物安全风险以及可扩展制造难题 概述工程化活体材料的设计、制造和应用最新进展,并探讨开发可预测、安全且自适应活体材料的新兴策略 工程化活体材料(ELMs),即整合活细胞与非活体基质的生物杂合材料 合成生物学 NA 生物打印,原位生长,底盘工程,智能基质设计 NA 文本 NA NA NA 多细胞联合体,遗传生物防逃逸 医学,环境修复,生物制造
10 2026-09-11
A simplified and highly efficient cell-free protein synthesis system for prokaryotes
2026-Sep-08, eLife IF:6.4Q1
研究论文 本文优化了一种简化的高效大肠杆菌无细胞蛋白合成系统,将核心反应组分从35种减少到7种,并简化了细胞提取物制备流程 将无细胞蛋白合成系统的核心反应组分从35种精简至7种,同时开发了无需传统流加和透析步骤的快速裂解物制备方法,显著提高了系统的简便性和高效性 摘要中未明确提及该系统的具体局限性 开发一种简化且高效的原核生物无细胞蛋白合成系统,降低系统复杂度并提高可及性 大肠杆菌无细胞蛋白合成系统及其反应组分 合成生物学 NA 无细胞蛋白合成 NA NA NA NA 大肠杆菌 NA 医学, 工业生物技术
11 2026-09-11
Microbial partnerships and molecular mechanisms in plant stress physiology for climate-resilient and sustainable farming
2026-Sep-08, Planta IF:3.6Q1
综述 本文综述了植物-微生物伙伴关系及其分子机制在提高作物抗逆性和可持续农业中的作用,并探讨了多组学、人工智能和合成生物学在设计微生物接种剂和合成微生物群落中的应用 整合了生态学、生理学和分子生物学视角,提出将人工智能和大数据分析与多组学工具相结合,优化基于微生物组的策略,实现气候适应型和可持续农业 未涉及具体的实验验证,主要基于现有文献的综述,缺乏原始实验数据支持 探讨植物-微生物相互作用及其分子机制在植物胁迫生理中的作用,以推动气候适应型和可持续农业发展 植物相关的微生物群落、作物、根际微生物 机器学习, 合成生物学, 多组学 NA 多组学工具, 人工智能, 大数据分析, 合成生物学 NA 文本 NA NA 植物 合成微生物群落 农业, 环境
12 2026-09-11
Modular synthetic cross-kingdom promoters enable coordinated expression in Escherichia coli and Saccharomyces cerevisiae
2026-Sep-07, Nucleic acids research IF:16.6Q1
研究论文 该研究设计了一组模块化混合启动子,能够在Escherichia coli和Saccharomyces cerevisiae中实现可调控且定量一致的基因表达,并应用于prodeoxyviolacein生物合成途径 首次将细菌的-10/-35基序和Shine-Dalgarno序列与酵母的TATA盒和Kozak序列整合,构建出跨物种兼容的模块化混合启动子,实现跨界的可调控和定量一致表达 启动子组仅涵盖弱、中、强三个表达水平,未涉及更精细的梯度调控;仅验证了单一代谢途径,通用性有待更多途径和宿主验证 开发可跨物种使用的通用表达平台,解决不同物种间启动子结构和转录逻辑差异带来的瓶颈 大肠杆菌和酿酒酵母中的基因表达系统及prodeoxyviolacein生物合成途径 合成生物学 NA 合成生物学启动子工程 NA NA NA NA E. coli, S. cerevisiae 模块化混合启动子库,整合细菌-10/-35基序、Shine-Dalgarno序列与酵母TATA盒、Kozak序列 医学, 工业生物技术
13 2026-09-11
Application of emerging technologies in the antiviral field
2026-Sep-05, Antiviral research IF:4.5Q1
综述 该综述探讨了类器官模型、基因编辑、人工智能驱动的分子设计和合成生物学四项前沿技术在抗病毒研究中的应用与协同作用 系统性地将类器官、基因编辑、AI分子设计和合成生物学四大技术前沿整合为一个协同工作流程,涵盖疾病建模、靶点发现、分子设计、构建、测试和迭代优化的完整管线,推动抗病毒开发从传统经验方法向精准智能化策略转变 技术在整合和规模化方面仍面临挑战,高质量生物数据集不足,跨学科协作有待加强 探讨四项前沿技术在抗病毒研究中的贡献,为人类和动物健康的抗病毒策略智能化发展提供框架 病毒感染与抗病毒策略 机器学习 NA 类器官技术, CRISPR基因编辑, AlphaFold结构预测, 从头蛋白质设计, 合成生物学 AlphaFold NA NA CRISPR-Cas9 NA 设计-构建-测试-学习循环 医学, 农业
14 2026-09-11
Predictive design of tissue-specific mammalian enhancers that function in the mouse embryo
2026-Sep, Nature genetics IF:31.7Q1
研究论文 本文提出了一种利用深度学习设计组织特异性哺乳动物增强子的通用策略,并在小鼠胚胎中验证了其功能 首次证明了仅从DNA序列即可可靠推断哺乳动物增强子功能,并能够从头预测性设计组织特异性合成增强子,在哺乳动物胚胎体内实现了可靠的增强子设计 仅设计了15个合成增强子,训练数据集规模有限,且仅在心脏、肢体和中枢神经系统三个组织类型中进行了验证 开发一种能够在哺乳动物基因组和组织的体内调控复杂性中可靠工作的组织特异性增强子设计策略 小鼠胚胎中的心脏、肢体和中枢神经系统组织特异性增强子 机器学习 NA 染色质可及性测序 CNN DNA序列 15个合成增强子,基于精选的染色质可及性数据及已验证的人类和小鼠增强子数据 NA 小鼠 NA 医学, 合成生物学
15 2026-09-11
Host-aware Identification of Intrinsic Gene Expression Biopart Parameters using Combinatorial Libraries
2026-Aug-11, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文提出了一个宿主感知框架,利用组合文库和数字孪生模型定量表征质粒型组成型表达构建体中生物元件的内在参数 将大肠杆菌数字孪生与模型在环参数识别相结合,分离生物元件固有属性与宿主依赖效应,定义了内在翻译起始容量这一可迁移参数 研究主要基于质粒型组成型表达系统,参数的可迁移性可能受限于其他表达系统或宿主,且揭示了模块化的局部失效 实现合成生物学中生物元件的定量表征和宿主感知的预测性设计 质粒复制起始位点、启动子和核糖体结合位点等生物元件 合成生物学 NA 组合文库构建、模型在环参数识别、数字孪生建模 数字孪生模型 生长速率测量数据、基因表达数据 NA NA 大肠杆菌 质粒型组成型表达构建体 工业生物技术、医学
16 2026-09-11
Tumor-specific antibodies elicited by engineered bacteria promote bladder cancer immunotherapy in preclinical mouse models
2026-Jul-22, Science translational medicine IF:15.8Q1
研究论文 该研究通过工程化益生菌Nissle 1917表达CXCL13,增强膀胱癌免疫检查点阻断疗法的疗效 利用合成生物学工程化细菌递送CXCL13至肿瘤微环境,促进生发中心形成和肿瘤特异性抗体应答,从而增强PD-1阻断免疫疗法 研究仅在临床前小鼠模型中进行,尚未在人体临床试验中验证安全性和有效性 探索工程化细菌表达CXCL13能否增强膀胱癌免疫检查点阻断疗法的抗肿瘤效果 膀胱癌原位小鼠模型 肿瘤免疫学 膀胱癌 合成生物学 NA NA NA NA Nissle 1917 表达CXCL13的工程化细菌 医学
17 2026-09-11
Tunable low-rate genomic recombination with Cre-lox in Escherichia coli: a versatile tool for anoxic environmental biosensing and synthetic biology
2026-Apr-22, Applied and environmental microbiology IF:3.9Q2
研究论文 本研究开发了一种在大肠杆菌中可严格调控、可滴定、低重组率的Cre-lox基因组重组系统,并将其应用于缺氧环境下的砷酸盐全细胞生物传感 开发了在大肠杆菌中严格调控、可滴定的Cre重组酶系统,实现了低重组率和极低的基底活性;将系统整合到染色体上显示出优于质粒的跨代遗传记忆保持能力;构建了基于重组记忆的砷酸盐全细胞生物传感器,可在缺氧条件下记录暴露并在好氧条件下进行延迟荧光读数,检测灵敏度与常规湿化学方法相当 现有砷酸盐全细胞生物传感器在厌氧条件下的灵敏度和工作流程存在局限性;该系统在缺氧环境中的检测仍需依赖延迟好氧读数,且未提及在其他环境污染物或复杂现场条件下的广泛验证 开发一种可严格调控、可滴定的低速率Cre-lox基因组重组系统,用于环境生物传感、合成生物学及微生物生态与进化研究,并验证其在缺氧砷酸盐检测中的应用 大肠杆菌中的Cre-lox位点特异性重组系统及砷酸盐全细胞生物传感器 合成生物学 NA 位点特异性重组(Cre-lox)、全细胞生物传感器、荧光报告基因 NA 荧光信号、遗传记忆记录 NA Cre-lox重组系统 大肠杆菌 基于Cre重组酶的遗传记忆线路(可诱导型重组开关),整合于质粒和染色体,用于砷酸盐响应型全细胞生物传感器 环境监测、生物生产、生物工程、医学
18 2026-09-11
Cell-in-Shell Metacells in Single-Cell Nanoencapsulation
2026-04, ChemPlusChem IF:3.0Q2
综述 本文提出“元细胞”这一概念,用以定义一类经单细胞纳米封装形成的、具有动态功能、环境响应性和可编程行为的工程化活细胞-壳层系统。 首次提出“元细胞”术语并建立统一概念框架,将元细胞与传统的单细胞纳米封装平台区分开来,归纳出其三大核心功能特征:可重构性、可负载性和运动性。 本文为概念性综述,未提供原始实验数据,所提出的元细胞框架尚需后续实验研究加以验证和拓展。 为材料科学、合成生物学与细胞工程交叉领域的元细胞研究建立基础定义和组织框架,并为未来研究提供路线图。 经单细胞纳米封装形成的细胞-壳层结构(元细胞) 合成生物学 NA 单细胞纳米封装 NA 文本 NA NA 哺乳动物细胞 NA 医学, 材料, 工业生物技术
19 2026-09-11
A modular biodevice assembly tool kit for combinatorial screening and benchmarking multiple cell surface display platforms in Escherichia coli
2026-Mar-14, Journal of biological engineering IF:5.7Q1
研究论文 本文设计并构建了一个模块化、组合式的大肠杆菌表面展示工具包,用于筛选和基准测试多种细胞表面展示平台 开发了模块化组合工具包,可同时筛选多种锚定支架与生物部件的组合,并基准测试多个表面展示平台;发现了两种先前未表征的锚定支架YdhQ和YcgV 研究主要局限于大肠杆菌宿主,未在其他细菌或真核系统中验证工具包的通用性 促进筛选最优的表面展示平台,并基准测试多种大肠杆菌表面展示平台的性能 大肠杆菌表面展示平台、锚定支架蛋白、信号肽、启动子和终止子 合成生物学 NA 表面展示技术、模块化组合组装 NA 荧光、酶活性、发光 20种全长或截短的锚定支架设计,结合多种信号肽、启动子和终止子,使用三种报告蛋白(sfGFP、琼脂酶、NanoLuc) NA 大肠杆菌 模块化组合表面展示工具包 医学、工业生物技术
20 2026-09-11
Engineering plasmids with synthetic origins of replication
2026-Feb-02, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 该论文重新设计了天然pMB1复制起点,创建了具有可定制拷贝数的质粒,并利用合成RNA调节子实现独立拷贝控制,还构建了响应多种信号的模块化合成复制起点,并展示了6个兼容质粒在大肠杆菌中的共维持 首次创建了具有合成复制起点的质粒,实现了可定制的拷贝数和独立拷贝控制,并展示了模块化响应环境信号和多重复制报告的能力 仅在大肠杆菌中验证了6个兼容质粒共维持一周,未在其他微生物中测试,未评估长期进化稳定性 重新设计质粒复制起点以克服天然复制机制在可调性、兼容性和模块化方面的限制 质粒复制起点、合成RNA调节子、大肠杆菌 合成生物学 NA 质粒工程、合成生物学 NA NA 6个兼容SynORI质粒 NA 大肠杆菌 合成复制起点 工业生物技术
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