本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['synthetic biology']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价9.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-09-05 |
From ultra-processed to biointelligent foods: The role of food biotechnology in the transition toward functional and health-oriented nutrition
2026-Nov-01, Food research international (Ottawa, Ont.)
DOI:10.1016/j.foodres.2026.120321
PMID:42692715
|
综述 | 本文综述了食品生物技术在从超加工食品向功能性和健康导向营养转型中的作用,提出了“生物智能食品”框架,整合发酵、酶解、下一代益生菌等多技术以支持代谢和肠道稳态。 | 提出将超加工食品转型为“生物智能食品”的新概念框架,融合合成生物学、AI辅助营养设计和地中海饮食2.0等新兴方法,强调食品基质的生物工程化以靶向生物互动。 | 基于综述性质,缺乏实证数据验证该框架的实际可行性和临床效果,且具体机制和应用细节尚需深入研究。 | 探讨食品生物技术如何克服超加工食品引起的不良影响,并将现代营养学推向功能性、预防性和精准化方向。 | 超加工食品、生物技术(发酵、酶转化)、肠道微生物、功能性食品基质,以及AI、纳米技术和合成生物学工具。 | 生物技术、营养科学、合成生物学 | 慢性非传染性疾病(如代谢紊乱和炎症相关疾病) | 多重组学技术、代谢工程、合成生物学、人工智辅助设计 | NA | NA;文献综述和概念性框架 | NA;无实验样本,基于文献证据 | CRISPR-Cas9、TALEN、ZFN、Gibson Assembly、Golden Gate Assembly(推测用于代谢工程,但具体未详述) | NA;基于文献综述,涉及微生物(如益生菌)但未指定具体物种 | 生物智能食品框架相关的发酵过程、代谢活动、稳态调控和生物合成途径 | 医学、食品工业、健康营养、精准营养 |
| 2 | 2026-09-05 |
Engineering therapeutic super-competitor cells for educative cancer treatment and ecological replacement
2026-Oct-10, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2026.218765
PMID:42508749
|
综述 | 提出治疗性超级竞争者细胞(TSCs)作为一种可编程、进化感知的教育性癌症治疗框架,强调通过生态竞争而非直接杀伤来控制肿瘤 | 将癌症生态学、进化生物学和合成生物学结合,提出以生态竞争替代最大细胞毒性杀伤的TSC概念,定义可测量的生态替代终点和安全机制 | TSC框架仍处于假说阶段,尚未有临床验证,且依赖推测性工程应用,缺乏实际数据支持 | 探索一种进化感知的癌症治疗新范式,通过生态竞争实现教育性治疗和生态替代 | 肿瘤相关微环境中的癌细胞及工程化TSC | 合成生物学 | 癌症 | NA | NA | NA | NA | NA | 哺乳动物细胞 | 生态竞争回路,包括感知恶性生态信号、获取竞争适应性、限制癌细胞资源获取、清除或良性分化机制 | 医学 |
| 3 | 2026-09-05 |
Photoperiod-dependent regulation of secondary growth by auxin flux: how it occurs and how to benefit from it
2026-Oct, Biological reviews of the Cambridge Philosophical Society
DOI:10.1002/brv.70175
PMID:42046427
|
综述 | 本文综述了光周期通过生长素通量调控树木次生生长的机制,并探讨了利用合成生物学手段优化树木性能的潜力 | 提出生长素通量是光周期调控次生生长的重要机制,并首次系统阐述其独立于初级生长的调控关系 | 部分分子机制如FT/TFL1样和CCA1/LHY样因子的作用尚不明确,缺乏详细实验验证 | 阐明光周期通过生长素通量调控次生生长的机制,并探讨增强树木晚期生长和抗旱性的策略 | 温带林木,特别是杨树 | 植物生物学 | NA | 综述分析 | NA | 文献数据 | NA | 合成生物学 | 杨树 | 光周期不敏感的生长素生物合成途径 | 环境, 工业生物技术 |
| 4 | 2026-09-05 |
Beyond the parasite: reframing cutaneous leishmaniasis as a host-microbiome-vector ecosystem
2026-Sep-05, International journal of pharmaceutics
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.ijpharm.2026.127250
PMID:42537823
|
综述 | 本文综述了皮肤利什曼病(CL)的治疗策略,从单一寄生虫感染模型转向宿主-微生物组-寄生虫-媒介生态系统的综合模型,并探讨了工程学、合成生物学及人工智能驱动的下一代疗法 | 将CL治疗重新定义为宿主-微生物组-载体生态系统,并整合工程学、合成生物学和AI驱动框架,提出系统级策略 | 未提及具体临床试验数据或验证结果 | 提出系统级策略,开发下一代针对皮肤利什曼病的新疗法,以减轻全球疾病负担 | 皮肤利什曼病及其宿主、利什曼原虫、微生物组和沙蝇媒介 | 计算生物学、人工智能 | 皮肤利什曼病 | 合成生物学、人工智能 | NA | NA | NA | 工程生物学方法 | 人类、沙蝇 | NA | 医学 |
| 5 | 2026-09-05 |
Functional mapping and engineering of the Sec translocon unlocked by a cell-free system
2026-Sep-04, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aej0987
PMID:42685219
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为ProSecCO的细胞-free蛋白质合成平台,用于功能映射和工程改造Sec转位子,实现高通量、实时检测,并发现多个超活性变体。 | 通过细胞-free系统在合成囊泡中插入SecYEG,绕过了传统生存限制,实现在单次实验中筛选300个Sec变体,大幅扩展突变多样性,并揭示数十个超活性转位变体。 | 未明确提及局限性。 | 开发细胞-free平台以研究Sec转位子的功能,并探索其应用以提高膜蛋白质量和纳米抗体输出。 | Sec转位子的变体,特别是SecYEG复合体。 | 合成生物学 | NA | 细胞-free蛋白质合成 | NA | 蛋白质表达和功能数据 | 300个Sec变体,在单个实验中筛选。 | 合成操纵子 | 体外系统(合成囊泡) | 合成操纵子用于SecYEG表达 | 合成生物学, 生物技术 |
| 6 | 2026-09-05 |
Evolving conservation: The role of unconventional approaches to restore contemporary vertebrate populations and genomic biodiversity
2026-Sep-03, The Journal of heredity
IF:3.0Q2
DOI:10.1093/jhered/esag040
PMID:42166210
|
观点文章 | 本文探讨了在保护生物学和恢复生态学中应用非常规方法(如生物技术)以恢复当代脊椎动物种群和基因组生物多样性的作用与争议 | 提出将保护生物学与恢复生态学重新定义为进化与基因组层面的危机应对,倡导将生物技术整合到传统保护实践中,并强调透明整合和利益相关者参与 | 主要基于观点论述,缺乏实证数据支持,且未深入分析具体技术实施细节或长期生态影响 | 分析生物技术在保护与恢复中的应用现状,讨论其潜力与争议,并提出整合建议以增强生态系统韧性 | 当代脊椎动物种群及基因组生物多样性 | 保护生物学 | NA | 基因救援、合成生物学、基因编辑 | NA | 案例研究 | NA | 基因编辑 | 脊椎动物 | NA | 环境保护 |
| 7 | 2026-09-05 |
Engineering post-transcriptional regulation via synthetic membraneless organelles
2026-Sep-03, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2026.102546
PMID:42692139
|
研究论文 | 该论文设计了合成无膜细胞器作为模块化枢纽,通过靶向mRNA隔离实现大肠杆菌中的可编程转录后调控,并展示了其在细胞分裂救援和代谢产物生产中的应用。 | 创新点在于将合成MLOs的应用从翻译后调控拓展到RNA为中心的调控,通过正交RNA结合蛋白-适体相互作用实现mRNA的靶向隔离,从而增强或抑制翻译。 | 摘要中未明确提及局限性。 | 旨在扩展合成MLOs的功能,实现RNA为中心的转录后调控,以重编程细胞功能并改善生物制造。 | 大肠杆菌中的合成无膜细胞器(MLOs)及其调控的mRNA和代谢通路。 | 合成生物学 | NA | RNA结合蛋白-适体相互作用 | NA | 文本 | NA | NA | E. coli | 合成无膜细胞器作为模块化枢纽,包含正交RNA结合蛋白-适体相互作用,用于mRNA靶向隔离 | 合成生物学、生物制造 |
| 8 | 2026-09-05 |
Synthetic Biology of Prenylated Stilbenoids: Biosynthetic Pathway, Prenyltransferases, and Biomanufacturing Strategies
2026-Sep-02, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.6c03585
PMID:42690779
|
综述 | 系统综述了异戊烯化二苯乙烯类化合物的生物合成途径、催化异戊烯基转移酶及微生物异源生产的生物制造策略。 | 从结构多样性及构效关系、异戊烯基转移酶催化机制与区域选择性、代谢工程策略三个方面对异戊烯化二苯乙烯类化合物的生物合成进行系统梳理,并提出AI辅助酶工程与自主动态控制系统等未来方向。 | 面临异戊烯基转移酶表达不足、前体竞争和产物细胞毒性等挑战。 | 为异戊烯化二苯乙烯类高价值营养保健品可持续工业生产提供路线图。 | 异戊烯化二苯乙烯类化合物、相关异戊烯基转移酶及微生物宿主工程。 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 微生物宿主 | 代谢通道及生物合成途径 | 食品、工业生物技术 |
| 9 | 2026-09-05 |
Multichannel genomic recording of biological information with ENGRAM
2026-Sep, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-025-01322-w
PMID:41673323
|
综述 | 本文提供了ENGRAM合成生物学电路的逐步实验方案和数据分析指南,并总结了其设计考虑、优缺点及应用前景。 | ENGRAM通过prime editing介导的插入记录顺式调控元件活性,实现了高度多重化的信号记录,且与DNA Typewriter兼容以捕获信号顺序。 | ENGRAM实验周期较长(5-6周),需要分子生物学、哺乳动物细胞培养和DNA测序分析的专业技能。 | 介绍ENGRAM电路架构的实验方法和分析流程,并探讨其应用领域。 | ENGRAM记录器(基于cis-regulatory elements的活性记录系统) | 合成生物学 | NA | prime editing | NA | DNA序列 | NA | prime editing | 哺乳动物细胞 | ENGRAM(增强子介导的多重基因组记录)电路 | 医学、生物技术 |
| 10 | 2026-09-05 |
TALEs, TALENs, and TALE Base Editors: From Plant Pathology to Biotechnology
2026-Sep, Annual review of phytopathology
IF:9.1Q1
|
综述 | 本文综述了TALEs、TALENs和TALE碱基编辑器的研究进展,从植物病理学中的病原-宿主相互作用到它们在基因组编辑和合成生物学中的应用。 | 综述了TALEs从天然效应子到基因组编辑工具的演化,特别强调了TALE碱基编辑器在编辑叶绿体和线粒体基因组中的最新应用。 | 未提及具体局限性。 | 总结自然发生的TALEs的现状,并强调它们在基因组编辑和合成生物学中的当前角色。 | TALEs、TALENs和TALE碱基编辑器。 | 生物技术 | NA | 基因组编辑、碱基编辑 | NA | 基因组数据 | NA | TALEN, TALE碱基编辑器 | 植物 | NA | 农业, 工业生物技术 |
| 11 | 2026-09-05 |
From Circuits to Symphonies: A Systems-Engineering Blueprint for Multimicrobial Synthetic Biology
2026-Sep, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.76981
PMID:42536811
|
观点文章 | 提出一个受交响乐启发的系统工程框架,用于多微生物合成生物学,将群落设计组织在四个协调层面,并提供一个模块化工程蓝图来指导合成微生物群落的构建、稳定和优化 | 将多微生物工程重新定位为协调系统设计问题而非孤立的遗传控制,提出基于应用的四个协调层(通讯、时间调控、生态结构、预测建模)及模块化而非规定性的工程蓝图 | 框架是概念性的而非规定性的,实际应用面临代谢物运输、种群漂移、参数不确定性和工艺规模实施的限制 | 为多微生物合成生物学提供一个结构化框架,以支持工业、环境和治疗应用中的合成微生物群落开发 | 合成微生物群落 | 合成生物学 | NA | NA | 混合建模 | NA | NA | NA | NA | 控制振荡器 | 工业生物技术, 环境, 医学 |
| 12 | 2026-09-05 |
Polyhydroxybutyrate (PHB) production from halophiles: a comprehensive review
2026-Sep-01, Bioresources and bioprocessing
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s40643-026-01119-z
PMID:42678461
|
综述 | 本文全面综述了嗜盐菌生产聚羟基丁酸酯(PHB)的研究进展,涵盖生理适应、代谢途径、底物利用、发酵技术、生物反应器优化及下游处理等方面 | 强调利用农业工业残余物和废料作为可持续碳源,并批判性评价了绿色提取技术、代谢工程、CRISPR基因编辑及合成生物学在提高PHB产量中的应用,同时整合循环生物经济理念 | 面临工艺经济性、含盐废水处理、聚合物脆性及大规模商业化等挑战 | 探讨嗜盐菌生产PHB的可持续策略,以替代石油基塑料并促进循环生物经济发展 | 嗜盐细菌及其PHB生产过程 | 生物技术 | NA | 代谢工程, CRISPR基因编辑, 合成生物学, 绿色提取技术 | NA | 文本 | NA | CRISPR-Cas9 | 嗜盐菌 | 代谢通路(PHB合成途径) | 包装, 农业, 生物医学工程, 环境 |
| 13 | 2026-09-05 |
Metabolic engineering of Taxus chinensis suspension cell lines for overproduction of paclitaxel reveals insights into pathway regulation
2026-Aug-22, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2026.102524
PMID:42628595
|
研究论文 | 本文通过代谢工程改造红豆杉悬浮细胞系,过表达紫杉醇生物合成途径中的四个关键基因,显著提高紫杉醇产量,并揭示了途径调控机制 | 首次在红豆杉植物细胞培养中通过遗传工程方法过表达多个紫杉醇合成途径基因,发现DBAT是调控紫杉醇及其他紫杉烷类化合物合成的关键限速步骤,并揭示了途径基因的协同激活模式 | 研究主要集中于特定细胞系和所选基因,可能未涵盖全部调控因素,且过表达DBAT导致紫杉烷杂质增加,需进一步优化以降低杂质 | 通过代谢工程和合成生物学手段优化红豆杉植物细胞培养,以提高紫杉醇产量并理解途径调控机制 | 红豆杉(Taxus chinensis)悬浮细胞系 | 代谢工程 | 癌症 | 基因过表达 | NA | 基因表达数据 | 四种转基因红豆杉细胞系 | 农杆菌介导转化 | 红豆杉(Taxus chinensis) | 紫杉醇生物合成途径的基因过表达 | 医药 |
| 14 | 2026-09-05 |
Scientometric analysis of mycosporine-like amino acids from 1989 to 2025: Current trends and applications
2026-Aug-22, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.135690
PMID:42632472
|
研究论文 | 对1989年至2025年间类菌孢素氨基酸研究的科学计量分析,揭示其发展趋势、研究主题和应用前景 | 首次对类菌孢素氨基酸研究进行全面的科学计量分析,覆盖1989至2025年,识别出四个研究主题并指出合成生物学和组学方法的新兴趋势 | 数据仅来源于Web of Science核心合集,可能遗漏其他数据库中的相关文献 | 评估类菌孢素氨基酸研究的全球发展态势,绘制知识结构图,并为其商业化发展提供路线图 | 类菌孢素氨基酸相关的研究文献 | 科学计量学 | NA | 科学计量分析 | NA | 文献数据 | 859篇文献 | NA | NA | NA | 海洋生物学, 生物化学, 环境科学, 生物技术, 医学 |
| 15 | 2026-09-05 |
Autonomous intranasal delivery systems for central nervous system therapeutics
2026-Aug, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-026-01781-5
PMID:42543397
|
综述 | 本文综述了用于中枢神经系统治疗的自主鼻内递送系统的最新进展,包括合成纳米颗粒、细胞外囊泡和活体治疗剂,以克服鼻腔解剖限制并实现高效药物递送 | 强调递送系统的自主性和可编程性,整合纳米技术与合成生物学,实现模块化设计、宿主响应相互作用和精确货物生产 | 未提及具体局限性 | 探讨自主鼻内递送系统在中枢神经系统疾病治疗中的应用潜力,为未来转化发展提供基础 | 鼻内药物递送载体,包括合成纳米颗粒、细胞外囊泡和活体治疗剂 | 纳米医学, 合成生物学 | 神经系统疾病 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 16 | 2026-09-05 |
[Pharmacological effects, biosynthesis, and production of coumarin compounds: a review]
2026-Aug, Zhongguo Zhong yao za zhi = Zhongguo zhongyao zazhi = China journal of Chinese materia medica
|
综述 | 本文综述了香豆素类化合物的药理作用、生物合成途径及生物制造方法,并重点介绍了提高香豆素产量的策略。 | 系统总结了基于定向进化的酶工程、代谢工程和发酵工程在提高香豆素产量中的应用策略。 | 未提及具体限制。 | 为香豆素的绿色、高效和可持续生产提供重要参考,促进新型香豆素类药物开发。 | 香豆素类化合物 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 药物开发 |
| 17 | 2026-09-05 |
Tumor-specific antibodies elicited by engineered bacteria promote bladder cancer immunotherapy in preclinical mouse models
2026-Jul-22, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adv7600
PMID:42485436
|
研究论文 | 本文研究了工程化细菌Nissle 1917表达趋化因子CXCL13,通过诱导生发中心反应增强膀胱癌免疫检查点阻断疗法的效果 | 首次利用工程化益生菌EcN表达CXCL13,增强肿瘤特异性体液免疫反应,与PD-1阻断联用显著改善膀胱癌免疫治疗疗效 | 研究仅在临床前小鼠模型中进行,尚需进一步验证其在人类膀胱癌中的有效性和安全性 | 评估工程化表达CXCL13的EcN对膀胱癌免疫治疗效果的增强作用及其机制 | 表达CXCL13的工程化EcN细菌,以及两种侵袭性、生长快速、免疫学上冷肿瘤的膀胱癌原位小鼠模型 | 合成生物学、肿瘤免疫学 | 膀胱癌 | 合成生物学工程化细菌、原位膀胱癌小鼠模型、流式细胞术、抗体响应分析 | 原位肿瘤小鼠模型 | 实验数据(包括肿瘤生长、生存率、免疫细胞分析) | 两种不同的小鼠膀胱癌原位模型 | NA | Nissle 1917 (EcN) | 表达人CXCL13的基因电路 | 医学 |
| 18 | 2026-09-05 |
Engineered Biocatalytic Strategies for Pesticide Degradation in Food Systems: From Catalytic Performance to Practical Applications
2026-Jul-08, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.6c01905
PMID:42133536
|
综述 | 综述了食品系统中农药降解的工程化生物催化策略,从催化性能到实际应用进行了全面概述。 | 强调工程策略提升酶性能与稳定性,并探讨人工智能辅助设计和合成生物学等新兴方法。 | 实际应用中存在酶催化效率有限、稳定性不足、可重复使用性差、规模化受限以及监管不确定性等障碍。 | 为食品系统中农药酶促降解提供应用导向的综述,重点介绍工程化策略并分析转化瓶颈。 | 食品系统中的农药残留及降解用酶(天然酶、纳米酶、多酶或混合级联系统)。 | 合成生物学 | NA | 人工智能辅助设计、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 多酶级联系统、纳米酶和混合级联系统 | 食品加工、食品保鲜、食品安全 |
| 19 | 2026-09-05 |
From tumor targeting to tumor accessibility: surface-engineered bacteria as precision living therapeutics for translational medicine
2026-Jul-07, Journal of hematology & oncology
IF:29.5Q1
DOI:10.1186/s13045-026-01827-1
PMID:42415153
|
综述 | 本文从临床视角探讨细菌疗法在转化医学中的瓶颈,提出“肿瘤可及性”概念,并系统总结细菌表面工程策略及联合治疗应用。 | 首次提出“肿瘤可及性”概念,指出其不足是当前细菌疗法临床应用的关键瓶颈,并借鉴抗体药物偶联物精确递送经验,提出“精准活体治疗”新范式。 | 摘要未明确提及具体局限性,但从全文推断可能包括缺乏临床数据支持、技术转化难度大等。 | 从临床导向角度分析细菌疗法转化鸿沟,强调表面工程在提升肿瘤可及性、免疫逃逸和治疗效果中的作用,并提出未来应注重系统可及性。 | 表面工程细菌,包括化学偶联(如SpyTag/SpyCatcher)、物理包被(如细胞膜封装)、生物策略(如基因调控表面结构)。 | 合成生物学 | 癌症 | 基因工程 | NA | NA | NA | SpyTag/SpyCatcher系统 | 细菌 | 细菌表面工程 | 医学 |
| 20 | 2026-09-05 |
Fluoride-Triggered Protein Activation via a Genetically Encoded Tyrosine Analogue
2025-12-10, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c13604
PMID:41296558
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于遗传编码的非天然氨基酸二甲基硫代膦酰酪氨酸(DTPY)的氟化物触发蛋白激活平台,通过位点特异性掺入实现蛋白质活性的条件控制 | 首次利用氟化物响应性非天然氨基酸实现蛋白质活性的时空控制,提供了一种正交于细胞代谢的通用激活策略 | 未明确提及具体局限性 | 开发一种氟化物触发蛋白激活的通用策略,用于合成生物学和细胞工程中的蛋白质活性时空调控 | 超折叠绿色荧光蛋白(sfGFP)和Cre重组酶 | 合成生物学 | NA | 非天然氨基酸掺入、定点突变 | NA | 蛋白质序列、荧光和重组数据 | 包括两种蛋白质(sfGFP和Cre重组酶)的多个变体 | 遗传密码扩展 | 大肠杆菌、哺乳动物细胞 | 氟化物响应型蛋白质激活开关 | 合成生物学、细胞工程、生物技术 |