合成生物学相关文章
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当前共找到 4543 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-03-05 |
Green Biosynthesis of Terpenoid-Derived Flavor and Fragrance Compounds: Advances and Strategic Perspectives
2026-Mar-04, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c08719
PMID:41718042
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综述 | 本文综述了萜类香料化合物的绿色生物合成进展，重点讨论了低成本底物利用、宿主菌株选择及关键工程策略 | 系统总结了合成生物学在萜类生物合成中的最新应用，强调酶修饰、动态通路调控和细胞区室化等创新策略 | NA | 探讨萜类香料化合物的可持续生物合成方法，以替代传统植物提取和化学合成 | 萜类及其衍生物，特别是用于香料和香精工业的化合物 | 合成生物学 | NA | 微生物细胞工厂、酶工程、动态通路调控 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 大肠杆菌, 酿酒酵母, 枯草芽孢杆菌 | 生物传感器、代谢通路、逻辑门 | 工业生物技术, 食品 |
| 2 | 2026-03-05 |
Correction for Ipoutcha et al., "A synthetic biology approach to assemble and reboot clinically relevant Pseudomonas aeruginosa tailed phages"
2026-Mar-03, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.00322-25
PMID:41609359
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3 | 2026-03-05 |
Molecular recruitment and release using DNA host condensates
2026-Mar-03, Nanoscale horizons
IF:8.0Q1
DOI:10.1039/d5nh00586h
PMID:41774821
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研究论文 | 本文研究了利用DNA纳米星构建的人工生物分子凝聚体，通过整合适配体实现对目标生物分子的招募与释放 | 首次在DNA纳米星凝聚体中引入适配体实现靶向分子招募，并开发了通过互补寡核苷酸（kleptamer）控制分子释放的新机制 | 研究仅聚焦于链霉亲和素单一样本，未验证对其他生物分子的普适性；体内应用潜力尚未探索 | 开发可编程的人工生物分子凝聚体系统，实现靶向分子的可控空间组织与释放 | DNA纳米星构建的凝聚体、链霉亲和素蛋白、适配体与kleptamer寡核苷酸 | 合成生物学 | NA | DNA纳米技术、适配体工程、相分离表征 | NA | 生物分子相互作用数据、相图数据、荧光成像数据 | 基于DNA纳米星构建的多种凝聚体构型（适配体位于不同位置） | DNA纳米星自组装、适配体设计 | 无细胞体系 | 基于适配体-kleptamer互补作用的分子捕获与释放开关 | 合成生物学、活性材料、合成细胞 |
| 4 | 2026-03-05 |
PANoptosis as a drug discovery framework: integrating cell death architecture with clinical translation
2026-Mar-03, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-026-00388-0
PMID:41776350
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综述 | 本文综述了PANoptosis（一种整合了凋亡、焦亡和坏死性凋亡的统一性炎症性细胞死亡程序）的分子架构、调控机制及其作为药物发现框架的临床转化潜力 | 提出了PANoptosis作为一个统一的细胞死亡程序的概念，并系统性地将其分子架构与临床转化策略（包括药物干预框架、生物标志物和临床极性-时机模型）相结合，为靶向细胞死亡通路治疗多种疾病提供了新范式 | NA | 阐明PANoptosis的分子机制，并构建一个整合了基础研究与临床转化的药物发现框架，以指导针对感染性、炎症性、肿瘤性和神经退行性疾病的治疗策略开发 | PANoptosis的分子架构（包括上游传感器、支架适配器和效应器）、其调控机制、以及在多种疾病（如感染、脓毒症、癌症、神经退行性疾病）中的作用 | NA | 感染性疾病， 脓毒症， 癌症， 神经退行性疾病 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 5 | 2026-03-05 |
Genomic perplexity and the evolution of context-dependent function
2026-Mar-02, Molecular biology and evolution
IF:11.0Q1
DOI:10.1093/molbev/msag041
PMID:41739546
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研究论文 | 本文提出基因组功能具有高度上下文依赖性的观点，并引入“基因组困惑度”作为量化基因在宿主背景下适应性的信息论度量 | 将基因组功能类比于大型语言模型的概率分布，提出“基因组困惑度”概念，并将上位效应与Transformer注意力机制进行概念类比 | 理论框架尚未经过大规模实验验证，概念类比需要进一步实证支持 | 建立解释基因组功能上下文依赖性的理论框架，并为基因水平转移和合成生物学研究提供预测工具 | 基因组功能、基因水平转移、上位效应 | 计算生物学 | NA | 泛基因组学、GWAS、合成生物学 | Transformer、大型语言模型 | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、进化建模 |
| 6 | 2026-03-05 |
Biosynthesis of benzylisoquinoline alkaloids and its evolution in plants
2026-Mar-02, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2026.101786
PMID:41776991
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综述 | 本文系统综述了植物中苄基异喹啉生物碱（BIAs）的生物合成途径、关键酶及其进化机制，并展望了未来研究方向 | 整合了BIAs结构多样化的酶学机制与进化驱动因素（如谱系特异性基因复制、新功能化、生物合成基因簇组装），并提出了多组学与合成生物学结合的可持续生产策略 | 部分途径仍存在空白，酶的多功能性及调控网络尚未完全解析 | 阐明BIAs的生物合成途径、结构多样化机制及其在植物中的进化规律 | 苄基异喹啉生物碱（BIAs）及其生物合成酶与基因 | NA | NA | 多组学分析、蛋白工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药、农业 |
| 7 | 2026-03-05 |
Mistletoe- and Mussel-Inspired Fabrication of Hierarchically Structured Protein-Cellulose Scaffolds From Biomolecular Condensates
2026-Mar, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202520827
PMID:41603494
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研究论文 | 本文提出了一种受槲寄生和贻贝启发的协同方法，通过生物分子凝聚相分离制备具有可调层次结构的蛋白质-纤维素复合支架 | 利用动物和植物系统中的可塑性生物分子相，开发了一种多组分相分离策略，用于制造具有核心-壳形态的生物材料，为生物启发材料制造提供了新框架 | NA | 开发一种生物启发方法，利用生物可再生组分和水作为溶剂，制造具有可调层次结构的蛋白质-纤维素复合支架，用于组织工程 | 重组贻贝足蛋白-1（rMfp-1）和表面功能化的阴离子纤维素纳米棒 | NA | NA | 多组分相分离、冷冻干燥、光谱和成像模态 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 8 | 2026-03-05 |
Integrating synthetic biology to understand and engineer the heart, lung, blood, and sleep systems
2025-Dec-17, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101446
PMID:41412113
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综述 | 本文综述了合成生物学在心脏、肺、血液和睡眠系统中的应用，强调通过整合基因组工程、动态基因电路和高维生物传感器来理解和工程化这些系统 | 将合成生物学从微生物扩展到人类系统，实现基因表达、细胞命运和组织组织的精确控制，并结合组学数据和AI指导的电路设计，构建高分辨率细胞和组织尺度模型 | 仍面临递送、转基因稳定性和在生理相关模型中实现稳健时空控制等关键挑战 | 理解并工程化心脏、肺、血液和睡眠系统，以支持可扩展的定量多细胞生物学模型 | 心脏、肺、血液和睡眠系统 | 合成生物学 | NA | 基因组工程、动态基因电路、高维生物传感器、组学数据、AI指导的电路设计 | 系统级模型、高分辨率细胞和组织尺度模型 | 组学数据 | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN | 人类细胞、组织 | 可调转录调节器、合成组织器、反馈电路、逻辑门、生物传感器 | 医学、药物开发、基因治疗 |
| 9 | 2026-03-05 |
Transforming Crowded Coacervates into Multi-Compartmental Hybrid Microreactors for Practical Enzymatic Catalysis
2025-Oct-20, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202502479
PMID:40884011
|
研究论文 | 本文提出了一种基于Pickering乳液的封装方法，将无膜凝聚层转化为多室杂化微反应器，用于高效酶催化 | 创新点包括将拥挤凝聚层转化为具有层次化分隔结构、分子拥挤环境、选择性渗透能力和机械增强稳定性的多室杂化微反应器 | NA | 研究目的是设计和构建具有组织复杂性、多样功能性和实际应用性的人工原细胞，以推动体外合成生物学和生物工程发展 | 研究对象为杂化微反应器，涉及生物和非生物催化物种的空间隔离 | 合成生物学 | NA | Pickering乳液封装 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 10 | 2026-03-05 |
Quantitative Characterization of Gene Regulatory Circuits Associated With Fungal Secondary Metabolism to Discover Novel Natural Products
2024-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202407195
PMID:39467708
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研究论文 | 本研究开发了一种结合微流体平台与数学模型的系统，用于在单细胞水平上定量表征真菌基因调控回路，并利用该平台成功重构了生物活性分子的生物合成途径 | 首次将先进微流体平台与数学模型结合，实现了对多细胞真菌基因调控回路在单细胞水平的精确表征与定量分析 | 研究主要基于模式真菌构巢曲霉，尚未广泛验证于其他真菌物种 | 定量表征真菌次级代谢相关基因调控回路，以发现新型天然产物 | 真菌基因调控回路（GRCs）及其调控的次级代谢生物合成基因簇（BGCs） | 合成生物学 | NA | 微流体平台、数学模型、基因回路重构 | 数学模型 | 单细胞表达数据 | 30个转录因子-启动子组合（源自两个代表性真菌GRCs） | 基因回路重构 | 构巢曲霉（Aspergillus nidulans） | 基因调控回路（GRCs）、生物合成基因簇（BGCs）重构 | 医药、工业生物技术 |
| 11 | 2026-03-05 |
Regulostat Inferelator: a novel network biology platform to uncover molecular devices that predetermine cellular response phenotypes
2019-08-22, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkz417
PMID:31114928
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研究论文 | 本文提出了一种名为Regulostat Inferelator（RSI）的新型网络生物学算法，用于识别能够预先决定和微调细胞表型响应的基因调控网络 | 首次开发了能够从基础转录组数据中识别具有“调节器”功能的基因对的算法，并首次提供了癌症细胞中药物-调节器相互作用的证据 | 目前仅为概念验证研究，需要进一步的实验验证 | 开发识别预先决定细胞表型响应的分子调控网络的工具 | 基因表达模式、细胞表型响应、癌症细胞 | 网络生物学 | 癌症 | 转录组数据分析 | RSI算法 | 转录组数据 | NA | NA | NA | 调节器网络（具有类似变阻器合作模式的基因对） | 医学、生物工程 |
| 12 | 2026-03-04 |
Adenosine Triphosphate-Producing Artificial Cells: Biomimetic Construction Strategies and Applications
2026-Mar-13, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202500934
PMID:41773731
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综述 | 本文综述了ATP生产人工细胞的仿生构建策略及其应用的最新进展 | 系统整合了三种ATP生产人工细胞的构建策略，并探讨了其在CO₂固定和代谢调控等仿生应用中的催化效能与分子隔离能力，为合成生物学等领域的工程应用提供关键指导 | NA | 推动ATP生产人工细胞领域从基础研究向实际应用转化 | ATP生产人工细胞 | 合成生物学 | NA | 自下而上构建策略（脂质体、聚合物体、融合液滴、油包水胶束、金属有机框架等） | NA | NA | NA | NA | NA | 模拟氧化/光合磷酸化途径的ATP合成系统 | 合成生物学、靶向药物递送、再生疗法、生物混合能量转换装置 |
| 13 | 2026-03-04 |
An Easy-To-Use and Field-Deployable Cell-Free Bioreporter for Environmental Detection of Tetracyclines and Macrolides
2026-Mar-03, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.5c04800
PMID:41693084
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研究论文 | 本文介绍了一种基于合成生物学的无细胞生物报告系统，用于环境中的四环素和大环内酯类抗生素检测 | 该系统整合了抗生素响应转录因子、RNA聚合酶和工程化DNA转录模板，通过体外转录反应产生可见荧光信号，消除了全细胞生物传感器的生物安全顾虑，并支持冻干长期储存 | NA | 开发一种便携、快速的环境抗生素监测工具 | 四环素和大环内酯类抗生素 | 合成生物学 | NA | 体外转录反应 | NA | 荧光信号 | 真实水样 | 合成生物学设计 | 无细胞系统 | 抗生素响应生物传感器，包含转录因子、RNA聚合酶和DNA模板 | 环境监测 |
| 14 | 2026-03-04 |
High-performance bioimaging and biosensing via nucleobase-editing enzymes
2026-Mar-03, Chemical Society reviews
IF:40.4Q1
DOI:10.1039/d5cs00678c
PMID:41773995
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综述 | 本文综述了核苷碱基编辑酶在生物成像和生物传感中的应用，包括其催化原理、集成模式及未来发展方向 | 将核苷碱基编辑酶重新用作可编程执行器，实现高特异性、高效扩增和生理条件兼容的生物传感与成像系统 | NA | 探讨核苷碱基编辑酶在生物传感和生物成像中的新兴应用，以提升诊断、治疗监测和合成生物学的平台性能 | 核苷碱基编辑酶（如脱氨酶、甲基转移酶/去甲基酶、DNA糖基化酶）及其在核酸、蛋白质和细胞过程监测中的应用 | NA | NA | 核苷碱基编辑技术，包括脱氨、甲基化/去甲基化、碱基切除等反应 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学、合成生物学 |
| 15 | 2026-03-04 |
Building AuxInYeast Synthetic Biology Strains for Biochemical Characterization of Maize Auxin Hormone Signaling Components
2026-Mar-02, Cold Spring Harbor protocols
DOI:10.1101/pdb.prot108634
PMID:40074300
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研究论文 | 本文介绍了一种名为AuxInYeast的合成生物学工具，用于在酵母中构建玉米生长素信号通路组件，以进行生化表征 | 开发了AuxInYeast系统，作为植物合成生物学底盘，首次在酵母中重建玉米生长素信号通路，实现高通量定量分析 | 系统基于酵母环境，可能不完全模拟植物体内复杂调控网络，且仅针对玉米组件，通用性需进一步验证 | 构建合成生物学菌株，以生化表征玉米生长素激素信号通路组件 | 玉米生长素信号通路组件，包括受体、阻遏物、辅阻遏物、转录因子和响应元件 | 合成生物学 | NA | 流式细胞术、荧光蛋白标记 | NA | 生化数据、荧光信号数据 | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 酵母 | 生长素信号通路，包括受体-阻遏物复合物、转录激活级联和响应元件 | 农业, 工业生物技术 |
| 16 | 2026-03-04 |
Testing AuxInYeast Synthetic Biology Strains via Fluorescence Flow Cytometry
2026-Mar-02, Cold Spring Harbor protocols
DOI:10.1101/pdb.prot108635
PMID:40074301
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研究论文 | 本文介绍了一种使用荧光流式细胞术测试AuxInYeast合成生物学菌株的协议，用于分析玉米生长素信号通路 | 开发了基于酵母异源表达平台的AuxInYeast系统，结合荧光流式细胞术实现高通量定量测量植物生长素信号通路组件 | NA | 工程化玉米生长和发育，通过合成生物学工具分析生长素激素信号通路 | 玉米生长素感知受体和荧光标记的阻遏蛋白 | 合成生物学 | NA | 荧光流式细胞术 | NA | 荧光数据 | 多个AuxInYeast菌株，具体数量未指定 | AuxInYeast系统 | 酵母 | 生长素感知和阻遏蛋白降解的生物传感器通路 | 农业 |
| 17 | 2026-03-04 |
Synthetic Biology Approaches to Study Maize Signaling Pathways
2026-Mar-02, Cold Spring Harbor protocols
DOI:10.1101/pdb.top108450
PMID:40074299
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综述 | 本文综述了如何应用合成生物学方法研究玉米信号通路，并以酵母异源表达系统为例展示了该方法的潜力 | 提出将合成生物学设计-构建-测试-迭代的工程原则系统应用于玉米研究，并建立了酵母异源表达平台（AuxInYeast）来模拟玉米信号通路 | NA | 为玉米研究提供合成生物学方法指南，以解决植物体内难以检测的信号通路基础问题 | 玉米信号通路（特别是生长素信号通路）及其异源表达系统 | 合成生物学 | NA | 异源表达、荧光流式细胞术 | NA | NA | NA | NA | 酵母 | 玉米核生长素响应信号通路在酵母中的重构（AuxInYeast系统） | 农业 |
| 18 | 2026-03-04 |
BOTany methods: accessible automation for plant synthetic biology
2026-Mar-02, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiag066
PMID:41715940
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研究论文 | 本文开发了一套基于Opentrons OT-2机器人的模块化BOTany方法，旨在为植物合成生物学提供可访问的自动化实验方案 | 为缺乏液体处理机器人的植物合成生物学研究者提供了低成本、易修改的自动化实验方案，支持从简单重复任务到复杂分子克隆操作的全流程自动化 | 依赖特定型号的Opentrons OT-2机器人，且自动化方案可能仍需一定设备投入 | 降低植物合成生物学实验自动化的门槛，提高实验通量和可重复性 | 植物合成生物学实验流程 | 合成生物学 | NA | 植物模块化克隆、细菌转化、质粒提取、PCR | NA | 实验操作流程 | NA | Opentrons OT-2 | 植物, 细菌 | 植物模块化克隆系统 | 农业, 工业生物技术 |
| 19 | 2026-03-04 |
Advancing Genetic Code Expansion in Live Cells Through Metabolic Engineering
2026-Mar-02, Annual review of chemical and biomolecular engineering
IF:7.6Q1
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综述 | 本文综述了通过代谢工程在活细胞中推进遗传密码扩展（GCE）的进展，重点关注非标准氨基酸（nsAAs）的生物合成及其在合成生物学中的应用 | 整合代谢工程与GCE，实现nsAAs的生物合成，减少对化学合成补充的依赖，拓展蛋白质化学功能 | 现有GCE方法通常依赖细胞培养基中化学合成nsAAs的补充，这限制了其应用范围 | 克服GCE中nsAAs来源的限制，通过代谢工程实现nsAAs的生物合成，以促进合成生物学应用 | 遗传密码扩展（GCE）、非标准氨基酸（nsAAs）、活细胞中的蛋白质翻译 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、遗传密码扩展（GCE） | NA | NA | NA | NA | 活细胞（未指定具体宿主） | 生物合成途径设计，用于生产非标准氨基酸（nsAAs） | 医学、工业生物技术 |
| 20 | 2026-03-04 |
Engineering non-ribosomal peptide synthesis: tuning the antibiotics engine of the microbial world
2026-Mar-02, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2026.2615819
PMID:41771683
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综述 | 本文综述了通过合成生物学方法工程化非核糖体肽合成以优化抗生素生产的进展 | 聚焦于通过工程化前体代谢物、改变代谢流、引入强启动子和调控因子以及重定向代谢至生物合成基因簇，以提高非核糖体肽的产量和生物活性 | NA | 利用合成生物学优化非核糖体肽的合成，以增强其作为抗生素的医药应用 | 非核糖体肽合成酶及其产生的肽类抗生素 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | 生物合成基因簇的工程化表达 | 医药 |