合成生物学相关文章
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当前共找到 5922 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-10-27 |
Programmable Engineered Living Vehicles as Autonomous Biofactories for Synergistic Osteomyelitis Management and Bone Regeneration
2026-Oct-26, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.75118
PMID:42929733
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研究论文 | 该研究开发了一种可编程工程化活体载具（ELV），作为自主生物工厂用于耐药性骨髓炎的协同治疗与骨再生 | 利用AlphaFold 3引导的分子对接设计多尺度热响应遗传逻辑电路，实现温度依赖性精准生物制造（≥37°C产生溶葡萄球菌酶LYS和血管活性肠肽VIP，≥42°C触发热自毁安全机制）；表面工程化DSS肽赋予羟基磷灰石亲和力作为骨靶向导航模块；将合成生物学与微工程技术结合构建自主导航活体治疗平台 | 仅在耐甲氧西林金黄色葡萄球菌（MRSA）诱导的大鼠骨髓炎模型中验证，尚未开展人体临床试验；长期生物安全性、遗传电路稳定性及免疫原性有待进一步评估 | 开发可编程工程化活体载具作为自主生物工厂，实现对耐药性骨髓炎的精确定位、生物膜渗透、病原体清除及骨组织再生的协同治疗 | 耐甲氧西林金黄色葡萄球菌（MRSA）诱导的大鼠骨髓炎模型；工程化大肠杆菌Nissle 1917（E. coli Nissle 1917） | 合成生物学， 生物医学工程， 纳米医学 | 骨髓炎， 耐药菌感染， 骨缺损 | 合成生物学， AlphaFold 3引导分子对接， 遗传逻辑电路工程， 表面肽工程化修饰 | NA | NA | 大鼠骨髓炎模型（具体样本量未在摘要中说明） | NA | 大肠杆菌Nissle 1917（E. coli Nissle 1917） | 多尺度热响应遗传逻辑电路（环境生物传感器与逻辑门计算模块），温度依赖性生物制造电路（≥37°C表达LYS和VIP），热自毁安全机制（≥42°C触发），表面DSS肽骨靶向导航模块 | 医学， 生物技术 |
| 2 | 2026-10-27 |
The historical evolution of CHO cell line development for biologics production: 60 years and still counting
2026-Oct-25, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2026.2738418
PMID:42928002
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综述 | 该综述按时间顺序回顾了CHO细胞系开发用于生物制品生产的60年历史，从1950年代的初步分离到AI驱动的细胞系开发策略 | 以十年为单元系统梳理CHO细胞系开发的历史演进，突出关键里程碑、技术创新和使能步骤 | 作为综述文章，未提供原始实验数据，可能未涵盖所有相关技术细节 | 概述CHO细胞系开发过程的历史演变，总结关键创新和技术突破 | CHO细胞系及其在生物制品生产中的开发过程 | 生物制药 | NA | 合成生物学、基因工程、化学限定培养基、靶向转基因整合、AI驱动的细胞系开发策略 | NA | 文本 | NA | NA | 中国仓鼠卵巢（CHO）细胞 | NA | 医药 |
| 3 | 2026-10-27 |
Progress and perspectives in nitrogenase engineering in plants and yeast
2026-Oct-23, Journal of experimental botany
IF:5.6Q1
DOI:10.1093/jxb/erag540
PMID:42928634
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综述 | 总结固氮酶在酵母和植物中工程化改造的最新进展与未来展望 | 系统梳理了利用分步模块化方法和功能验证流程在真核细胞中重构固氮酶途径的进展，包括线粒体和叶绿体中NifH活性恢复、NifB及FeMo-co体外生物合成等里程碑 | 尚未在工程化酵母或植物中实现完整的固氮酶活性，仍面临NifDK组装、宿主代谢整合与协调调控等障碍 | 探讨将固氮酶途径工程化引入真核细胞以实现作物自主固氮的可行性与挑战 | 固氮酶途径、酵母和植物 | 合成生物学 | NA | 合成生物学工具、多基因途径组装 | NA | 文本 | NA | NA | 酵母, 植物 | 固氮酶生物合成途径（多基因途径） | 农业 |
| 4 | 2026-10-27 |
Anabaena, a multicellular model for cyanobacterial cell biology and biotechnology
2026-Oct-20, Journal of bacteriology
IF:2.7Q3
DOI:10.1128/jb.00376-26
PMID:42900180
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综述 | 综述了鱼腥藻作为念珠藻目蓝细菌细胞生物学和生物技术多细胞模型的研究进展 | 系统总结了鱼腥藻作为多细胞模型在细胞分化和细胞间通讯研究中的独特地位，并强调了其作为合成生物学工具开发平台的潜力 | 文章为综述性文章，未涉及原始实验数据，且主要聚焦于鱼腥藻属的少数菌株 | 总结鱼腥藻作为念珠藻目模式生物的研究历史与现状，并探讨其在合成生物学和生物技术中的应用前景 | 鱼腥藻（Anabaena）及念珠藻目丝状蓝细菌 | 合成生物学 | NA | 分子遗传学、基因组分析、现代细胞生物学方法 | NA | 文本 | NA | NA | 鱼腥藻 | NA | 工业生物技术 |
| 5 | 2026-10-27 |
The Role of Zinc and Junctional Adhesion Molecule A Protein in Platelet Plug Formation
2026-Sep-29, Medicines (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/medicines13040028
PMID:42924733
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研究论文 | 研究锌离子通过靶向JAM-A蛋白激活血小板聚集和血小板栓形成的机制 | 首次发现锌离子通过靶向JAM-A蛋白激活其细胞粘附和细胞骨架动力学功能，促进血小板聚集；并设计合成生物学小肽淬灭锌效应 | 未明确说明样本量，机制研究主要在体外进行，需进一步体内验证 | 探索锌离子在血小板栓形成中的靶点及分子机制，扩展参与血小板栓形成的蛋白谱 | 血小板、JAM-A蛋白、锌离子、ADP | 机器学习 | 心血管疾病 | 尺寸排阻色谱、表面等离子共振、透射电子显微镜、血小板聚集实验 | NA | 实验数据 | NA | 合成生物学小肽 | NA | NA | 医学 |
| 6 | 2026-10-27 |
Automated synthetic cell-based screening for designed proteins with emergent functions
2026-08-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-76787-8
PMID:42603823
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研究论文 | 本文提出了一种名为PUREdrop的自动化微流控平台，用于在皮升级合成细胞中表达和筛选蛋白质文库，并定量分析其表达动力学和涌现功能 | 开发了PUREdrop平台，能够将蛋白质文库封装在数千个皮升级合成细胞中并分配到96孔板的预定孔中进行延时成像，实现表达动力学和涌现功能的并行定量，弥补了传统筛选方法在时空分辨率和细胞样限制方面的不足 | 摘要中未明确提及研究的局限性 | 解决自下而上合成生物学中筛选复杂功能蛋白质文库的挑战，加速功能性蛋白质工程的设计-构建-测试-学习循环 | 细菌细胞分裂蛋白FtsZ的计算重设计变体以及FtsZ的通用蛋白质调节因子 | 合成生物学 | NA | 微流控技术，延时成像 | NA | 图像 | 每个构建体数千个皮升级合成细胞，分布在96孔板中 | NA | NA | NA | 医学，工业生物技术 |
| 7 | 2026-10-27 |
Host-aware Identification of Intrinsic Gene Expression Biopart Parameters using Combinatorial Libraries
2026-08-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-76332-7
PMID:42717201
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研究论文 | 该文章提出了一个宿主感知框架，利用质粒组合文库和数字孪生模型定量表征生物元件的内禀参数。 | 将大肠杆菌数字孪生与模型在环参数辨识相结合，从宿主效应中分离出生物元件相关的可迁移内禀参数，并定义了翻译起始能力。 | 揭示了模块化在局部序列上下文中的失效，参数化可能受限于所测试的质粒系统和生理条件范围。 | 实现合成生物学中生物元件的宿主感知定量表征与预测性设计。 | 质粒复制起点、启动子和核糖体结合位点等生物元件。 | 合成生物学 | NA | 组合文库构建、生长速率测量、模型在环参数辨识 | 数字孪生模型 | 生长速率和基因表达数据 | NA | NA | 大肠杆菌 | 组成型表达构建体 | 工业生物技术 |
| 8 | 2026-10-27 |
Microbial lipases: advances in metagenomics and artificial intelligence for enzyme discovery and engineering
2026-Aug-07, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-026-05074-3
PMID:42565866
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综述 | 本文综述了宏基因组学和人工智能技术在微生物脂肪酶发掘与工程改造中的最新进展，并概述了脂肪酶的来源、结构特征、理化性质及工业应用 | 强调宏基因组学与人工智能技术之间的协同作用，将广泛的序列数据库与预测性计算建模工具相结合，用于酶的鉴定与理性设计 | 仍存在异源表达水平低、高质量信息缺乏以及工业规模验证有限等挑战 | 总结微生物脂肪酶发掘与工程改造领域的最新进展，并展望未来发展方向 | 微生物脂肪酶 | 机器学习 | NA | 宏基因组学，人工智能 | 蛋白质语言模型，生成式人工智能 | 序列 | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术，医药 |
| 9 | 2026-10-27 |
Regulation of Escherichia coli fermentation processes: from molecular mechanisms to smart industrial practice
2026-Aug-07, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-026-05131-x
PMID:42565891
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综述 | 系统阐述大肠杆菌发酵调控从经验性调整向跨尺度智能控制框架的范式转变，涵盖分子机制、动态合成生物学回路、模型预测控制与数字孪生 | 提出跨尺度深度耦合的智能控制框架，将过程级模型预测控制与动态合成生物学回路（群体感应、代谢物响应反馈、光遗传开关）整合，并强调多尺度建模与数字孪生（CFD耦合基因组尺度代谢模型）使发酵黑箱透明化 | 作为综述未提供原始实验数据验证所提出的智能控制框架，跨尺度耦合与数字孪生的工业落地仍面临空间异质性、底物混合延迟等实际挑战 | 阐明大肠杆菌发酵调控的当代范式转变，为从实验室代谢成功向百吨级稳健制造转化提供跨尺度智能控制策略 | 大肠杆菌发酵过程及其跨尺度调控网络 | 工业生物技术, 合成生物学, 过程控制 | NA | NA | 模型预测控制, 计算流体动力学, 基因组尺度代谢模型, 数字孪生 | 文献 | NA | NA | 大肠杆菌 | 群体感应介导的生长-生产解耦回路, 代谢物响应反馈回路, 光遗传开关 | 工业生物技术, 医药, 绿色生物制造 |
| 10 | 2026-10-27 |
A hybrid system enables plasmid copy number control in yeast
2026-07-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-75973-y
PMID:42660886
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研究论文 | 本文开发了一个基于内源2μ质粒的酵母质粒拷贝数（PCN）可编程调控平台，可实现从1到约70拷贝的动态调控，并应用于多种代谢产物生产和tRNA表型分析 | 首次在真核系统（酿酒酵母）中实现了可编程的质粒拷贝数动态调控，通过p2μ-Cir系统、CEN元件和Leu2d筛选实现了从1到38拷贝的可切换调控以及约70拷贝的高拷贝数，表达水平提升达110倍，并解决了多拷贝不稳定性问题 | 研究仅针对酿酒酵母（S. cerevisiae）的内源2μ质粒系统，尚未验证在其他真核宿主中的适用性 | 在真核系统中建立可编程的质粒拷贝数调控平台，实现基因剂量在DNA、RNA和蛋白质水平的精确控制 | 酿酒酵母（S. cerevisiae）及基于内源2μ质粒的PCN调控系统 | 合成生物学 | NA | 质粒工程、2μ质粒改造、CEN元件整合、Leu2d筛选 | NA | NA | NA | CEN元件, Leu2d筛选标记 | 酿酒酵母（S. cerevisiae） | 基于内源2μ质粒的PCN调控平台（p2μ-Cir系统），结合CEN元件实现拷贝数可切换调控和Leu2d筛选提高拷贝数 | 医药, 工业生物技术, 食品 |
| 11 | 2026-10-27 |
[Engineering Rhodotorula toruloides based on exogenous targeting signal peptides]
2025-Nov-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.250498
PMID:41457588
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研究论文 | 本研究在解脂红酵母中研究三种靶向信号肽（内质网、线粒体、过氧化物酶体）的定位性能，并用于靶蛋白的亚细胞区室化 | 首次系统验证三种外源靶向信号肽在解脂红酵母中的亚细胞定位功能，并成功将FAP靶向定位实现蓝光下烷烃生产 | 信号肽在解脂红酵母中的研究仍然有限，仅验证了三种定位序列，烷烃产量未量化报道 | 研究外源靶向信号肽在解脂红酵母中的细胞器定位性能，拓展其在细胞区室化工程中的应用 | 解脂红酵母（Rhodotorula toruloides） | 合成生物学 | NA | 信号肽融合、荧光定位、发酵 | NA | 荧光图像 | NA | NA | 解脂红酵母 | 信号肽介导的亚细胞区室化定位通路 | 工业生物技术 |
| 12 | 2026-10-27 |
Synthetic microbial communities: A gateway to understanding resistance, resilience, and functionality in spontaneously fermented food microbiomes
2024-09, Food research international (Ottawa, Ont.)
DOI:10.1016/j.foodres.2024.114780
PMID:39147468
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综述 | 本综述探讨了自发发酵食品（SFF）中微生物群落的抗性、恢复力和功能驱动因素，并论述了合成微生物群落（SMCs）作为理解和改造这些微生物组工具的潜力 | 系统性地将合成微生物群落（SMCs）定位为解析自发发酵食品微生物组抗性、恢复力和功能性的门户，并提出通过标准化方案、先进监测工具和合成生物学应用来克服当前SMCs稳定性和可重复性挑战的未来方向 | SMCs在发酵食品中的应用仍存在改进空间，实现稳定性和可重复性面临挑战，主要源于非标准化的方法 | 总结SMCs在发酵食品中的当前应用，识别挑战并指出未来发展方向，以释放SMCs的全部潜力并促进发酵食品系统的可持续创新应用 | 自发发酵食品（SFF）中的微生物群落（微生物组） | 微生物组学, 食品微生物学, 合成生物学 | NA | NA | NA | 文献 | NA | NA | NA | NA | 食品, 工业生物技术 |
| 13 | 2026-10-27 |
Editorial: Secondary Metabolism. An Unlimited Foundation for Synthetic Biology
2015, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2015.01562
PMID:26793187
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 14 | 2026-10-26 |
Unveiling the Molecular Secrets of Seaweeds: A Comprehensive Review of Bioinformatics Applications in Algal Research
2026-Dec, Omics : a journal of integrative biology
IF:2.2Q3
DOI:10.1177/15578100261484211
PMID:42702999
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综述 | 综述海藻研究中生物信息学应用，涵盖基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学、微生物组和功能基因组学及多组学整合、基因编辑、人工智能和合成生物学等新兴策略 | 系统整合海藻多组学与生物信息学工具数据库，并聚焦人工智能、机器学习、基因编辑和合成生物学等新兴策略对海藻研究的重塑作用 | 基因组资源不完整、数据标准化不足，且计算预测缺乏实验验证 | 概述生物信息学在海藻研究中的应用，推动海藻生物学的系统层面理解及其向可持续生物技术和海洋生物经济应用的转化 | 海藻 | 生物信息学 | NA | 高通量测序, 生物信息学, 多组学, 基因组编辑, 人工智能, 机器学习, 合成生物学 | NA | 组学数据, 文本 | NA | 基因编辑 | 海藻 | NA | 医学, 农业, 能源, 食品, 工业生物技术 |
| 15 | 2026-10-26 |
Synthetic biology for heritable viral disease resistance in livestock
2026-Oct-24, Current opinion in chemical biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.cbpa.2026.102791
PMID:42925681
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综述 | 综述合成生物学在牲畜可遗传抗病毒病策略中的最新进展，涵盖宿主因子编辑、合成抗病毒系统及使能平台 | 系统整合宿主因子工程、合成抗病毒回路与精准编辑工具，并讨论商业化、监管与公众接受度等挑战 | 作为综述文章，未提供原始实验数据，且对商业化推广和公众接受度的讨论可能不够深入 | 总结并评估利用合成生物学实现牲畜可遗传病毒病抗性的策略与平台 | 猪、牛、鸡等牲畜及其病毒病（如PRRSV） | 合成生物学 | 牲畜病毒病 | 基因编辑、碱基编辑、先导编辑、类器官与干细胞衍生细胞培养 | NA | 文本 | NA | 碱基编辑器, 先导编辑器 | 猪, 牛, 鸡 | 合成抗病毒回路 | 医学, 农业 |
| 16 | 2026-10-26 |
PrimeStack editors enable efficient and site-specific integration of large multigene cargos in plants
2026-Oct, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3003778
PMID:42868167
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研究论文 | 本文提出PrimeStack平台，结合prime editing与定向大丝氨酸整合酶Bxb1，在水稻基因组安全港实现多基因大片段的高效定点整合 | 首次将prime editing与进化版Bxb1整合酶结合，构建不依赖双链断裂的定点大片段整合平台，整合效率高达45%，且整合不可逆 | 仅在水稻中验证，未在其他植物物种测试；长期遗传稳定性和脱靶效应未充分评估；仅测试一个基因安全港位点 | 开发高效、可编程的植物基因组大片段多基因定点整合平台，推动作物性状聚合与合成生物学应用 | 水稻（Oryza sativa）基因组及再生植株 | 合成生物学，植物基因工程 | NA | prime editing，Bxb1大丝氨酸整合酶介导重组，junction-specific PCR | NA | DNA序列，PCR分析数据，表型观察数据 | 再生水稻植株（具体数量未在摘要中说明） | prime editing，Bxb1整合酶 | 水稻（Oryza sativa） | attP着陆位点安装与Bxb1介导的不可逆定点整合通路（基因堆叠平台） | 农业，合成生物学，植物生物制造 |
| 17 | 2026-10-26 |
Programmable Enhancement of IRES-Mediated Translation via RNA-Guided eIF4G Recruitment
2026-Sep-15, Biochemistry
IF:2.9Q3
DOI:10.1021/acs.biochem.6c00420
PMID:42915605
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研究论文 | 本文提出了一种通过RNA引导的eIF4G招募来可编程增强IRES介导翻译的策略 | 利用工程化的RNA结合蛋白融合体招募截短的eIF4G支架，选择性增强EMCV IRES介导的翻译而不影响帽依赖表达，最高实现7.7倍增强，并可通过效应物剂量和连接子设计在宽动态范围内调节翻译输出 | 未明确说明 | 开发一种可编程策略来增强IRES依赖的翻译，扩展合成生物学中转录后基因调控的工具箱 | IRES元件（特别是EMCV IRES）、eIF4G蛋白、λN融合蛋白、哺乳动物细胞系 | 合成生物学 | NA | RNA引导的翻译调控、蛋白质工程 | 计算模型 | 文本 | 多种哺乳动物细胞系及三顺反子构建体 | NA | 哺乳动物细胞 | 三顺反子构建体用于多顺反子表达的协调调控 | 医学, 工业生物技术 |
| 18 | 2026-10-25 |
Microbial Genetic Resource Conservation Techniques
2027, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-5623-5_2
PMID:42911324
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综述 | 本章综述了微生物遗传资源保护的主要原理、方法与局限，并探讨了冷冻生物学、材料科学与合成生物学结合的先进保护策略 | 强调将冷冻生物学、材料科学与合成生物学相结合以发展先进保护策略的必要性，并将微生物保护定位为可持续生物经济和全球健康体系的关键组成部分 | 文章为综述性章节，未提供原始实验数据；指出了维持微生物活力、遗传稳定性和功能完整性的挑战以及现有保护方法的局限 | 概述对生物医学和环境重要的微生物，审视其保护的主要原理、方法和局限，并指出先进保护策略的发展方向 | 对生物医学和环境具有重要意义的微生物遗传资源 | 合成生物学, 微生物学 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学, 环境, 工业生物技术 |
| 19 | 2026-10-25 |
Emerging Strategies for the Preservation of Microorganisms of Biomedical and Environmental Importance
2027, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-5623-5_11
PMID:42911333
|
综述 | 本文综述了具有生物医学和环境重要性的微生物保藏新兴策略，强调在多样分类群和微生物群落中保持活力、遗传稳定性和功能完整性 | 整合组学指导的保藏、干态技术和合成生物学，提出微生物组层面的保藏和工程化微生物系统等创新方案，并倡导从保藏分离菌株转向保藏功能性微生物群落 | 作为综述文章，未提供原始实验数据验证所提策略；对极端微生物、严格厌氧菌和复杂微生物组的保藏难题仍缺乏成熟的解决方案 | 评估生物医学和环境相关微生物保藏的新兴策略，应对微生物多样性未充分保藏的问题，支持公共卫生、科学可重复性和可持续生物经济发展 | 具有生物医学和环境重要性的微生物及其群落，包括极端微生物、严格厌氧菌和复杂微生物组 | 微生物学 | NA | 组学指导的保藏、新一代冷冻干燥、干态技术、合成生物学 | NA | 文本 | NA | NA | NA | 工程化微生物系统 | 医学, 环境, 农业 |
| 20 | 2026-10-25 |
CEM 2.0: Co-evolution-guided mining of superior extremophilic proteins via a curated proteome database and protein language model
2026-Dec, Engineering microbiology
DOI:10.1016/j.engmic.2026.100301
PMID:42910295
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研究论文 | 提出CEM 2.0框架，通过整合极端微生物蛋白质组数据库、基于ProteinBERT的多维评估器和交互式挖掘流程，实现不依赖模板的极端微生物蛋白质挖掘 | 不依赖预定义模板和领域知识，利用共进化引导和蛋白质语言模型实现全蛋白质宇宙的极端微生物蛋白质挖掘 | 仅通过湿实验和已发表研究的计算验证，未进行大规模实验筛选；数据库覆盖六种极端特征可能不全面 | 开发不依赖现有模板的极端微生物蛋白质挖掘方法，全面探索全蛋白质宇宙中的功能性极端微生物蛋白质 | 极端微生物蛋白质 | 机器学习 | NA | 蛋白质语言模型、共进化分析 | ProteinBERT | 蛋白质序列 | NA | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术, 合成生物学 |