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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-09-07 |
Photoperiod-dependent regulation of secondary growth by auxin flux: how it occurs and how to benefit from it
2026-Oct, Biological reviews of the Cambridge Philosophical Society
DOI:10.1002/brv.70175
PMID:42046427
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综述 | 本文综述了光周期通过生长素通量调控树木次生生长的机制,并探讨了利用该机制增强树木生长和抗旱性的合成生物学策略 | 提出光周期通过生长素通量独立于顶端生长调节次生生长的假说,并探讨利用合成生物学工程光周期不敏感的生长素生物合成来优化树木性能的新策略 | 关于FT/TFL1样和CCA1/LHY样因子在光周期调控生长素通量中的作用尚不明确,且缺乏直接实验证据 | 阐明光周期调控次生生长的机制,并探索通过合成生物学方法提高树木在气候变化下的生长和抗旱性 | 温带林木(特别是杨树)的次生生长期(木质部分化阶段) | 植物生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | 杨树 | 光周期不敏感的生长素生物合成通路 | 农业, 环境 |
| 2 | 2026-09-07 |
Protein modification: convergence of artificial intelligence, synthetic biology, and nano-assembly
2026-Oct-01, Food chemistry
IF:8.5Q1
DOI:10.1016/j.foodchem.2026.150606
PMID:42546624
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综述 | 本文批判性审视了生物合成蛋白质功能增强的最新进展,重点介绍人工智能、合成生物学和纳米组装交叉融合的策略 | 强调计算设计、人工智能引导的蛋白质工程和遗传密码扩展的整合,以及化学、酶和物理场辅助修饰技术与多组分自组装和纳米制造等宏观方法的协同效应 | 未具体说明局限性 | 探讨通过跨学科合成方法提升生物合成蛋白质功能,以实现可持续高性能蛋白质配料 | 生物合成蛋白质 | 合成生物学、人工智能、纳米技术 | NA | 人工智能引导的蛋白质工程、遗传密码扩展、化学修饰、酶修饰、物理场辅助修饰、纳米制造 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 食品、生物技术 |
| 3 | 2026-09-07 |
Engineering extracellular vesicles for targeted siRNA delivery: Advances, therapeutic applications, and clinical translation
2026-Sep-05, Nanomedicine : nanotechnology, biology, and medicine
IF:4.7Q2
DOI:10.1016/j.nano.2026.103020
PMID:42700828
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综述 | 本文全面综述了工程化细胞外囊泡用于靶向小干扰RNA递送的研究进展、治疗应用和临床转化前景 | 系统总结了包括电穿孔、超声处理、挤出、母细胞工程和微流控等多种货物装载策略,以及利用肽、抗体、适配体和混合纳米平台进行表面功能化的最新进展,并探讨了合成生物学、基因组工程和人工智能等新兴技术的潜在应用 | 细胞外囊泡的大规模生产、货物装载效率、标准化、质量控制、监管审批和临床转化仍面临重大挑战 | 探讨工程化细胞外囊泡作为小干扰RNA递送平台的潜力,推动下一代精准RNA疗法的发展 | 工程化细胞外囊泡及其靶向小干扰RNA递送系统 | 纳米医学 | 癌症、神经系统疾病、肝脏疾病、心血管疾病、炎症性疾病和传染病 | 电穿孔、超声处理、挤出、微流控、细胞工程、表面功能化 | NA | 文献资料 | NA | 合成生物学、基因组工程、细胞工程 | NA | NA | 医学 |
| 4 | 2026-09-07 |
Application of Emerging Technologies in the Antiviral Field
2026-Sep-05, Antiviral research
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.antiviral.2026.106529
PMID:42700916
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综述 | 本文综述了类器官模型、基因编辑、人工智能驱动的分子设计和合成生物学四种前沿技术在抗病毒研究中的应用,强调其协同作用并推动抗病毒策略向智能化发展 | 提出了将四种前沿技术(类器官、基因编辑、AI、合成生物学)整合为一种协同工作流的观点,涵盖疾病建模、靶点发现、分子设计、构建、测试和迭代优化,推动抗病毒研究从经验方法转向精准智能策略 | 技术整合和可扩展性方面仍存在挑战,需要高质量生物数据集和更强跨学科合作以发挥转化潜力 | 探讨新兴技术如何重塑抗病毒研究,构建一个框架以指导人类和动物健康中抗病毒策略的智能演进 | 病毒性疾病及其相关技术平台,包括类器官、基因编辑、人工智能和合成生物学工具 | 人工智能 | 病毒性疾病 | 基因编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 合成生物学Design-Build-Test-Learn循环 | 医学 |
| 5 | 2026-09-07 |
De novo coassembly of functional chlorophyll- and carotenoid-protein complexes in Saccharomyces cerevisiae
2026-Sep-04, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aeg6969
PMID:42696591
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研究论文 | 在酿酒酵母中通过整合13个异源基因和删除3个内源基因,重建了完整的叶绿素生物合成途径,并成功实现了叶绿素a的生产,同时扩展了类胡萝卜素模块,实现了两种色素-蛋白复合物的体内共组装 | 首次在非光合真核生物酿酒酵母中完成完整的叶绿素生物合成途径的异源重建,并实现了功能性的叶绿素和类胡萝卜素-蛋白复合物的共组装,展示了高保真的色素结合和天然功能 | 摘要中未明确提及局限性,但可能包括叶绿素生产滴度相对较低以及途径复杂性导致的资源竞争问题 | 在非光合真核生物中建立异源生产叶绿素及色素-蛋白复合物的平台,为研究光合复合物的组装和工程化光驱动代谢提供基础 | 酿酒酵母中的叶绿素生物合成途径及植物和蓝藻来源的色素-蛋白复合物 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 酿酒酵母 | 叶绿素生物合成途径和酮类胡萝卜素生物合成模块 | 工业生物技术 |
| 6 | 2026-09-07 |
Functional, structural and taxonomical diversity of glycoside transporters in bacteria
2026-Sep-02, FEMS microbiology reviews
IF:10.1Q1
DOI:10.1093/femsre/fuag040
PMID:42685310
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综述 | 本文综述了细菌中糖苷转运蛋白的功能、结构和分类多样性,并介绍了识别和表征这些转运蛋白的现有方法和技术 | 整合了不同家族(包括TBDTs、ABCs、PTS和MFS)的实验验证糖苷转运蛋白的知识,强调其分类、功能、机制和结构多样性 | 未提及具体局限性,但指出功能表征的转运蛋白数量与大量序列数据之间存在差距 | 总结现有方法和技术,以改进细菌糖苷转运蛋白的鉴定和表征,增进对其分子机制的理解 | 细菌中的糖苷转运蛋白 | 微生物学 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 序列数据 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 合成生物学、工业生物技术 |
| 7 | 2026-09-07 |
Engineered microorganisms and nanomaterials in cancer therapy: Emerging hybrid systems and translational challenges
2026-Sep, Nanomedicine : nanotechnology, biology, and medicine
IF:4.7Q2
DOI:10.1016/j.nano.2026.103002
PMID:42551774
|
综述 | 本文综述了工程微生物与纳米材料在癌症治疗中的应用进展,重点关注其作用机制、治疗潜力及转化挑战 | 强调微生物-纳米材料混合平台,结合两者优势以增强疗效并调节肿瘤微环境 | 讨论了生物安全、生物相容性、监管审批和临床转化方面的关键挑战 | 总结工程微生物与纳米材料在肿瘤学中的最新进展,推动下一代精准肿瘤治疗的发展 | 工程微生物和纳米材料及其在癌症治疗中的混合系统 | 纳米医学、合成生物学 | 癌症 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工程微生物用于肿瘤靶向和免疫调节 | 医学 |
| 8 | 2026-09-07 |
A genetic manipulation tool based on the GP35 recombinase for targeted gene editing in mycoplasmas of ruminants
2026-06, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2026.113096
PMID:42055338
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研究论文 | 本文介绍了一种基于GP35重组酶的质粒介导基因编辑工具,用于在牛支原体中实现精确的基因插入和缺失 | 首次将SPP1噬菌体的GP35重组酶应用于支原体基因组编辑,实现长单链DNA重组工程,阳性编辑率达77.78%-100%,且避免随机脱氨风险 | 未明确提及局限性,但可能限于支原体特定菌株及编辑窗口选择等 | 开发针对反刍动物支原体的高效基因编辑工具,以促进病原研究和疫苗开发 | 牛支原体(Mycoplasma bovis)及其他反刍动物支原体 | 合成生物学 | 牛支原体病 | 长单链DNA重组工程(recombineering) | NA | 基因序列数据 | 多个牛支原体突变体(具体数量未详) | GP35重组酶 | 牛支原体(Mycoplasma bovis) | NA | 医学、农业 |
| 9 | 2026-09-07 |
Toward life with a 19-amino acid alphabet through generative artificial intelligence design
2026-Apr-30, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aeb5171
PMID:42060756
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研究论文 | 本研究利用计算设计和合成生物学探索构建使用19种氨基酸字母表的细胞,通过替换必需蛋白质中的异亮氨酸残基,结合蛋白质语言模型和结构模型,成功制造出可行的进化稳定细胞 | 首次通过生成式人工智能设计实现将生命体氨基酸字母表从20种减少到19种,并验证了异亮氨酸的缺失可行性 | 未在标题和摘要中明确说明局限性 | 探索使用简化氨基酸字母表构建生命体的可行性 | 必需蛋白质中的异亮氨酸残基及核糖体 | 合成生物学 | NA | 计算设计、合成生物学 | 蛋白质语言模型、结构模型 | 蛋白质序列和结构数据 | 382个异亮氨酸残基、21个重新设计的核糖体亚基 | NA | 未明确指定,但可能为细菌 | NA | 工业生物技术 |
| 10 | 2026-09-07 |
Kinetically Programmed Signaling Cascades for Molecular Detection
2025-10-29, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c12059
PMID:41094711
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于DNA化学的动力学编程信号级联系统,用于分子检测,并展示了其在提高检测速率、增益和灵敏度方面的优势。 | 首次系统探索了编程信号级联动力学对检测性能的影响,并开发了适用于多种分子检测和即时医疗诊断的模块化系统。 | 未提及明显的局限性,但可能对非专业用户的操作或特定环境下的稳定性存在挑战。 | 开发并优化基于DNA的信号级联系统,实现快速、灵敏的分子检测,并展示其在治疗药物监测中的潜在应用。 | DNA信号级联系统,包括四种不同的目标分子(小分子和蛋白质)和血液样本。 | 合成生物学 | NA | DNA化学,电化学传感 | 动力学模型(基于速率常数) | 模拟和实验数据 | 四种分子,血液样本(具体数量未提及) | DNA化学 | NA | 信号级联,包括输入、受体、处理器和输出模块 | 生物传感,医疗诊断,药物监测 |
| 11 | 2026-09-07 |
Ultrafast Conversion of CO2 into C3-C4 Diols in a Synergistic Electrochemical and AI-Assisted Biosynthesis System
2025-10-29, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c14039
PMID:41100764
|
研究论文 | 本文介绍了一种结合电化学和人工智能辅助生物合成的协同系统,将二氧化碳超快速转化为C3-C4二醇,实现了高产量合成1,3-丙二醇和1,3-丁二醇 | 创新点在于将铜锌催化电化学还原与工程化DERA酶生物催化模块集成,并通过人工智能辅助理性设计提升酶活性,实现二氧化碳到C3-C4二醇的高效转化 | 摘要中未提及明确局限性,可能包括系统放大和实际应用中的挑战 | 实现从二氧化碳到高价值C3-C4二醇(如1,3-丙二醇和1,3-丁二醇)的可持续、高效合成 | 二氧化碳、乙醇、1,3-丙二醇、1,3-丁二醇、DERA酶变体(S233D/F43T) | 合成生物学 | NA | 电化学还原、生物催化、分子动力学模拟、原位光谱 | NA | 光谱数据、分子动力学模拟数据 | NA | 人工智能辅助设计 | NA | 电化学-生物合成级联系统 | 能源、工业生物技术 |
| 12 | 2026-09-07 |
Strategies in engineering sustainable biochemical synthesis through microbial systems
2024-08, Current opinion in chemical biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.cbpa.2024.102493
PMID:38971129
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综述 | 本文综述了通过系统和合成生物学耦合,结合人工智能和代谢工程,实现微生物系统可持续生化合成,以替代化石燃料衍生化学品并推动绿色生物技术的发展 | 强调人工智能与代谢工程的集成,以实现数据驱动的生物合成途径精确设计,并讨论了当前限制及优化策略 | 未指明具体实验数据或案例验证,仅基于现有文献总结,可能缺乏定量评估 | 探讨战略性地工程化微生物系统,以促进可持续化学品的生产,并推动绿色生物技术领域发展 | 微生物系统及其生物合成能力 | 合成生物学、系统生物学、代谢工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 环境、能源、工业生物技术 |
| 13 | 2026-09-07 |
Biosynthesis and recruitment of reactive amino acids in nonribosomal peptide assembly lines
2024-08, Current opinion in chemical biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.cbpa.2024.102494
PMID:38936328
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综述 | 本文综述了非核糖体肽组装线中反应性氨基酸的生物合成及招募机制,并探讨了其在药物开发中的应用 | 系统总结了反应性氨基酸的多种生物合成途径及其整合到非核糖体肽中的不同机制,并结合蛋白质工程提出了合成生物学和生物正交化学的新机遇 | 未提供实验数据或具体案例分析,主要基于已有文献总结 | 探讨非核糖体肽中反应性氨基酸的生物合成与招募机制,以促进药物候选物的开发 | 反应性氨基酸及其在非核糖体肽合成中的生物合成酶和整合机制 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 文献数据 | NA | 蛋白质工程 | NA | 非核糖体肽合成途径 | 医学 |
| 14 | 2026-09-06 |
Evolving conservation: The role of unconventional approaches to restore contemporary vertebrate populations and genomic biodiversity
2026-Sep-03, The Journal of heredity
IF:3.0Q2
DOI:10.1093/jhered/esag040
PMID:42166210
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观点文章 | 探讨生物技术在保护生物学和恢复生态学中的应用,以应对生物多样性丧失的进化与基因组危机 | 提出将生物技术(如遗传拯救、合成生物学和基因编辑)整合到保护与恢复实践中,以解决传统方法不足的问题,并强调基于生态知识和利益相关者参与的透明整合 | 文章仅提供观点和案例概述,未提供具体实验数据或定量分析,且未深入探讨所有伦理和监管细节 | 评估生物技术在保护与恢复中的应用现状,并论证其作为增强生态系统韧性和长期可持续性策略的必要性 | 受威胁和濒危物种的种群及基因组生物多样性 | 保护生物学、恢复生态学 | NA | 遗传拯救、合成生物学、基因编辑 | NA | 案例研究、文献综述 | NA | 基因编辑(如CRISPR) | 野生脊椎动物种群 | 未涉及具体电路设计 | 环境保护、生物多样性保护 |
| 15 | 2026-09-06 |
Multichannel genomic recording of biological information with ENGRAM
2026-Sep, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-025-01322-w
PMID:41673323
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研究论文 | 本文提供了ENGRAM技术的详细实验方案和数据分析指南,涵盖设计考虑、优缺点及应用场景。 | ENGRAM是一种基于增强子介导的基因组记录系统,利用prime editing介导的插入来记录顺式调控元件的活性,实现多路复用信号记录和高通量CRE筛选,并兼容DNA Typewriter以捕捉信号顺序。 | ENGRAM依赖prime editing,可能具有编辑效率限制,且实验周期较长(5-6周)。 | 提供ENGRAM实验和数据分析的标准化协议,指导用户设计和执行分子记录实验。 | ENGRAM记录器及其在哺乳动物细胞中的应用。 | 合成生物学 | NA | prime editing, DNA测序 | NA | 基因组序列数据 | NA | prime editing | 哺乳动物细胞 | 增强子介导的基因组记录电路(ENGRAM) | 医学, 生物技术 |
| 16 | 2026-09-06 |
Molecular mechanisms of plant thermal response: from signal transduction and epigenetic regulation to signaling integration
2026-Sep, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2026.03.018
PMID:41903742
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综述 | 本文综述了植物响应温和及急性热应激的分子机制,重点整合了表观遗传调控和信号网络,并讨论了PIF4和HSFA1s转录因子在热形态建成和热激反应中的作用,以及H2A.Z组蛋白变体和siRNA依赖的跨代热记忆机制。 | 该综述创新性地整合了信号转导、表观遗传调控和多组学视角,提出了合成生物学在解析植物热适应机制中的潜在应用,并强调了HSFA2介导的染色质重塑和siRNA在跨代热记忆中的核心作用。 | 尽管综述了多种机制,但植物热感知机制、HSFA1s激活动态及应激信号整合的细节仍不清楚。 | 旨在总结植物热应激响应的分子机制,为培育气候智能型作物提供理论依据和分子育种策略。 | 植物,特别是模式植物和作物,其热应激响应机制。 | 分子生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 植物 | NA | 农业 |
| 17 | 2026-09-06 |
Devising a divisome for synthetic cells
2026-Sep, Nature reviews. Chemistry
DOI:10.1038/s41570-026-00848-1
PMID:42443379
|
综述 | 本文综述了构建合成细胞分裂装置(divisome)的当前研究进展,重点讨论了模拟分裂关键阶段的策略,包括对称性破缺、膜变形和最终切割事件,并分析了这些方法的成功与局限性。 | 系统性地回顾并批判性评估了体外重建分裂装置的各种模块化策略,提出了整合多个模块以实现合成细胞最小功能分裂系统的可能性。 | 当前的重建方法尚未能完全实现合成细胞的自主分裂,各模块整合面临挑战,且体外系统与体内过程仍有差距。 | 旨在构建一个用于合成细胞的最小化、功能性分裂系统,通过模拟细胞分裂的关键步骤。 | 合成细胞(synthetic cells)及其分裂装置(divisome) | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 分裂装置(divisome),包括对称性破缺、膜变形和切割模块 | 合成生物学、生物技术 |
| 18 | 2026-09-06 |
Plant growth regulating compounds from microbial resources: Structural diversity, biological activities, and applications in sustainable agriculture
2026-Sep, Pesticide biochemistry and physiology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.pestbp.2026.107285
PMID:42697654
|
综述 | 本文综述了微生物来源的内源性和非内源性植物生长调节化合物的结构多样性、生物活性及其在可持续农业中的应用 | 系统梳理了微生物产生的非内源性次级代谢物(如氨基酸衍生物、肽、核苷、醇、酮、醛、有机酸、酯、内酯和大环内酯、胺等)的植物生长调节活性,并强调了利用基因编辑和合成生物学提高产量以加速商业化 | 仅基于标题和摘要,无法具体指出局限性,但可能缺乏对具体化合物作用机制的深入分析 | 探讨微生物来源的植物生长调节化合物在可持续农业中的潜在应用,以促进新型植物生长调节剂或生物刺激素的发现 | 微生物产生的植物生长调节化合物,包括内源性植物激素(如生长素、细胞分裂素、赤霉素等)及其类似物,以及非内源性次级代谢物 | 微生物学 | NA | NA | NA | 文献数据 | NA | 基因编辑、合成生物学 | 微生物(具体种类未在标题和摘要中提及) | NA | 农业 |
| 19 | 2026-09-06 |
Autonomous intranasal delivery systems for central nervous system therapeutics
2026-Aug, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-026-01781-5
PMID:42543397
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综述 | 本文综述了用于中枢神经系统治疗的自控式鼻内给药系统的最新进展,重点介绍了合成纳米颗粒、细胞外囊泡和活体治疗药物等载体如何通过模块化设计和宿主响应互动实现自主的鼻脑通路药物递送 | 提出了结合纳米技术和合成生物学构建自主可编程的鼻内给药载体,并强调了模块化功能组件、宿主响应互动与编程功能的整合,以实现递送自主性和治疗效力 | 摘要中未提及具体局限性 | 总结并分析现有鼻内给药载体策略,以推动中枢神经系统疾病的治疗平台发展 | 自控式鼻内给药载体,包括合成纳米颗粒、细胞外囊泡和活体治疗药物(如工程微生物、病毒或干细胞) | 纳米医学、合成生物学 | 神经系统疾病 | 基因工程、纳米技术 | NA | NA | NA | 基因工程技术(未具体说明工具,如CRISPR) | 微生物、病毒、干细胞 | 用于精确货物生产的基因编程闭环 | 医学、药物治疗 |
| 20 | 2026-09-06 |
Semi-automated workflow for high-throughput Agrobacterium-mediated plant transformation
2025-04, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.70118
PMID:40220013
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研究论文 | 本文介绍了一种半自动化的农杆菌介导植物转化工作流程,旨在提高植物高通量实验的效率并降低成本。 | 该研究提出了一种优化的冻融农杆菌转化方法,可在六孔板中进行并可适应机器人自动化,同时简化了地钱(Marchantia polymorpha)的稳定转化和选择流程,减少了成本、时间和劳动力却保持转化效率。 | 文章中未明确说明局限性,但可能包括对特定植物物种(如地钱)的依赖以及需要特定组织培养设施。 | 开发一种可扩展且成本有效的半自动化植物转化协议,以加速植物合成生物学和其他应用中的高通量实验。 | 农杆菌(Agrobacterium tumefaciens)和地钱(Marchantia polymorpha)植物。 | 植物合成生物学 | NA | 农杆菌介导转化 | NA | 实验数据 | 每月约可测试100个构建体 | Opentrons自动化平台 | 农杆菌(Agrobacterium tumefaciens),地钱(Marchantia polymorpha) | NA | 农业,生物技术,植物科学 |