合成生物学相关文章
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当前共找到 4412 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-02-13 |
Multichannel genomic recording of biological information with ENGRAM
2026-Feb-11, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-025-01322-w
PMID:41673323
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研究论文 | 本文详细介绍了ENGRAM实验的操作步骤和数据分析方法，这是一种用于记录生物信息的多通道基因组记录技术 | 利用prime editing介导的插入实现CRE活动的稳定基因组记录，具有固有的多重化能力（如4个碱基对插入可代表多达256个不同CRE的活动），并与DNA Typewriter兼容以捕获信号顺序 | 需要用户具备分子生物学、哺乳动物细胞培养和DNA测序分析的基本技能，实验周期通常需要5-6周 | 开发和应用多通道基因组记录技术来测量生物学随时间的变化 | 顺式调控元件（CREs）的瞬时活动 | 合成生物学 | NA | DNA测序，prime editing | NA | 基因组数据 | NA | prime editing, DNA Typewriter | 哺乳动物细胞 | 增强子介导的基因组记录电路，可将CRE的瞬时活动转换为稳定的基因组记录 | 医学，工业生物技术 |
| 2 | 2026-02-13 |
Machine learning-optimized long single-stranded DNA synthesis technology empowers high-precision diagnostic-therapeutic integration in living cells
2026-Feb-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag131
PMID:41674382
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研究论文 | 本研究开发了一种名为Ouroborosyn-ssDNA的NEAR平台，结合酶工程与计算优化，实现了长单链DNA的高纯度合成，并应用于构建DNA折纸-CRISPR复合体进行靶向基因组编辑 | 通过整合phi29 DNA聚合酶和Nb.BbvCI切口酶于甲酸盐缓冲液中，结合机器学习优化参数，显著提升了长ssDNA的合成长度（达15000 nt）与产率（提升4.73倍），并实现了固相合成与自动化纯化 | NA | 解决长单链DNA合成中纯度与均一性的技术瓶颈，推动DNA纳米技术在生物医学与信息存储中的应用 | 长单链DNA的合成技术、DNA折纸-CRISPR复合体 | 合成生物学 | 宫颈癌 | 切口酶辅助复制（NEAR）、固相合成、机器学习优化 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 宫颈癌细胞 | 六螺旋束DNA折纸-CRISPR复合体，用于核仁素靶向的基因组编辑与E7癌基因破坏 | 医学, 合成生物学, 分子数据存储 |
| 3 | 2026-02-13 |
Synthetic germ granules reveal a direct role of Vasa/DDX4 in RNA localization and translational activation
2026-Feb-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.01.703065
PMID:41676510
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研究论文 | 本研究通过合成方法从头生成生殖颗粒，揭示了Vasa/DDX4在RNA定位和翻译激活中的直接作用 | 开发了一种合成方法从头生成生殖颗粒，首次证明Vasa/DDX4是连接RNA招募与局部翻译激活的核心因子，且其他DEAD-box解旋酶无法替代 | NA | 探究生殖颗粒中RNA定位和翻译激活的分子机制 | 生殖颗粒、Vasa/DDX4蛋白、内源性生殖颗粒mRNA（如Nanos） | 合成生物学 | NA | 合成方法、正交RNA锚定方法、急性耗竭实验 | NA | NA | NA | PopTag-based scaffold、Gibson Assembly | Caulobacter（衍生）、活体生物 | 合成生殖颗粒、基于Oskar的RNA结合域与Vasa解旋酶的两组分模块 | 医学、基础生物学研究 |
| 4 | 2026-02-13 |
Synthetic biology for phytohormone production
2026-Feb, Current opinion in chemical biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.cbpa.2025.102649
PMID:41456574
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综述 | 本文批判性地评估了合成生物学方法在植物激素生产中的应用，重点关注生长素、赤霉素和水杨酸这三种对农业至关重要的化合物 | 利用合成生物学方法为植物激素生产提供可持续的替代方案，克服传统生产中的优化和提取难题 | NA | 探索合成生物学在植物激素可持续生产中的应用，以替代农用化学品 | 植物激素，特别是生长素、赤霉素和水杨酸 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业 |
| 5 | 2026-02-13 |
Small RNAs, big potential: Engineering microRNA-based synthetic gene circuits
2026-Feb, Current opinion in chemical biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.cbpa.2026.102652
PMID:41621146
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综述 | 本文综述了基于microRNA的合成基因电路工程，探讨了其在疾病诊断和治疗中的应用潜力 | 介绍了CRISPR关联的miRNA响应系统和iFFL架构等最新创新，将应用从被动传感转向治疗干预 | 存在泄漏、细胞资源限制和递送挑战等局限性 | 工程化基于miRNA的合成基因电路，用于传感和解释内源性miRNA水平 | microRNA及其在合成生物学中的工程应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | CRISPR | NA | miR-OFF系统、miR-ON架构、基于逻辑的分类器、分层调控策略、iFFL架构 | 医学 |
| 6 | 2026-02-13 |
Development of a Tool for High-Efficiency, Markerless and Iterative Genome Editing in Shouchella clausii
2026-Feb, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.70287
PMID:41662148
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研究论文 | 本研究开发了一种用于Shouchella clausii的高效、无标记、可迭代基因组编辑工具，并验证了其在枯草芽孢杆菌中的适用性 | 开发了首个针对Shouchella clausii的温度敏感型穿梭载体系统，结合Golden Gate组装和两步整合策略，实现了超过60%成功率的无标记基因编辑 | 研究主要针对模式菌株DSM 8716，在其他Shouchella clausii菌株中的适用性尚未验证 | 克服Shouchella clausii的遗传操作障碍，建立高效的基因组编辑平台 | Shouchella clausii DSM 8716和枯草芽孢杆菌168 | 合成生物学 | NA | 基因组编辑、电穿孔转化、Golden Gate组装 | NA | NA | 使用Shouchella clausii DSM 8716和枯草芽孢杆菌168两种细菌菌株 | Golden Gate Assembly | Shouchella clausii, Bacillus subtilis | 温度敏感型E. coli-S. clausii穿梭载体系统，包含抗性标记和荧光报告基因 | 工业生物技术, 环境, 医药 |
| 7 | 2026-02-13 |
"Microbial metabolites in cardioprotection: an immune-engineered framework for heart failure and post-ischemic remodeling: a narrative review"
2026-Feb, Annals of medicine and surgery (2012)
DOI:10.1097/MS9.0000000000004529
PMID:41675890
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综述 | 本文通过叙事性综述探讨了肠道微生物代谢物在心血管保护中的作用，特别是针对心力衰竭和缺血后重塑的免疫工程框架 | 提出了一个基于免疫工程的框架，用于利用微生物代谢物进行心脏保护，并强调了合成生物学和精准靶向干预的创新方法 | 存在药代动力学、监管和微生物群异质性等重大转化障碍，且临床验证和监管标准化仍需完善 | 客观评估肠道微生物代谢物的心脏保护潜力，并探讨其在心血管疾病治疗中的应用 | 肠道微生物代谢物（如短链脂肪酸、尿石素和吲哚）及其对心血管系统的影响 | NA | 心血管疾病 | 系统文献检索（使用PubMed、Scopus和Web of Science数据库） | NA | 文本（文献数据） | NA | 合成生物学 | NA | NA | 医学 |
| 8 | 2026-02-13 |
Engineered probiotics that sequester arsenite in a mouse gastrointestinal system
2026-Jan-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.16.699961
PMID:41648437
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研究论文 | 本研究开发了一种基于合成生物学的工程化益生菌，用于在小鼠胃肠道中检测并隔离砷，以减少其进入血液循环 | 首次设计了一种基于砷响应性基因切换开关的活体砷拦截系统，结合了改造的砷结合蛋白，实现了在胃肠道内主动、可控地隔离砷 | 研究目前仅在小鼠模型中进行，尚未在人体中验证；长期使用的安全性和稳定性有待进一步评估 | 开发一种预防膳食砷通过胃肠道吸收进入人体的生物治疗策略 | 工程化益生菌（Escherichia coli Nissle 1917）及其在体外和小鼠胃肠道中对砷的隔离效果 | 合成生物学 | 砷中毒及相关慢性疾病（如癌症、器官功能障碍、神经系统疾病） | 合成生物学、基因工程、质粒构建、体外和小鼠体内实验 | NA | 实验数据（体外砷去除效率、细胞活力、生长曲线、小鼠血砷水平） | 小鼠模型（具体数量未明确说明） | CRISPR-Cas9（推测，基于基因工程改造），基因切换开关设计 | Escherichia coli Nissle 1917（益生菌株） | 砷响应性基因切换开关：在砷暴露时激活螯合剂表达，在生物静态条件下维持生产，在细胞活跃分裂时自动关闭以减少代谢负担并增强生物安全性 | 医学（预防性治疗、环境毒物清除） |
| 9 | 2026-02-13 |
Stem cells in organogenesis and regeneration
2026-Jan-18, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-025-04889-z
PMID:41549301
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综述 | 本文综述了干细胞在器官发生和再生中的作用，包括主要干细胞类型、关键信号通路、在器官形成和修复中的功能，以及基于干细胞的疗法和新兴技术的应用前景 | 系统整合了胚胎干细胞、诱导多能干细胞和间充质干细胞在器官发生与再生中的最新研究进展，并探讨了CRISPR、3D生物打印和合成生物学等先进技术的引入 | 作为一篇综述，未报告原始实验数据，主要基于现有文献进行总结和展望 | 概述干细胞生物学及其在器官发生、组织再生和临床治疗中的应用潜力 | 干细胞（包括胚胎干细胞、诱导多能干细胞、间充质干细胞）、器官类器官、信号通路（Wnt、Notch、Hedgehog、BMP） | NA | NA | CRISPR、3D生物打印、合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR | NA | NA | 医学 |
| 10 | 2026-02-13 |
Digital Twins are a Key Enabling Technology for Personalized Medicine
2026-Jan-14, Bulletin of mathematical biology
IF:2.0Q3
DOI:10.1007/s11538-025-01589-w
PMID:41530522
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观点文章 | 本文探讨了数字孪生作为个性化医疗的关键使能技术，强调其在健康管理中的潜力 | 从学术和商业视角分析数字孪生技术，并扩展到生态、生物技术等跨领域应用 | NA | 强调数字孪生技术对数学建模社区的机遇及其在个性化医疗中的作用 | 数字孪生技术及其在人类生物学和健康管理中的应用 | NA | NA | NA | 计算模型 | NA | NA | NA | NA | NA | 医疗, 生态, 生物技术, 农业, 合成生物学 |
| 11 | 2026-02-13 |
AistSeq: An in-house easy-to-purify Tn5-based plasmid sequencing platform using a compact benchtop sequencer
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2025.1673510
PMID:41676073
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研究论文 | 本研究开发了一种基于Tn5转座酶的简易纯化质粒测序平台AistSeq，利用紧凑型台式测序仪进行质粒序列验证 | 发现添加大分子可溶性标签对Tn5纯化非必需，仅需His10标签和蛋白A融合即可获得活性Tn5转座酶，并整合外切酶消化和iSeq100数据分析流程 | NA | 开发实验室规模的简化质粒测序工作流程 | 质粒DNA | 合成生物学 | NA | 下一代测序（NGS）、Tn5转座酶纯化、外切酶消化、Illumina iSeq100测序 | NA | DNA序列数据 | NA | Tn5转座酶、His10标签、蛋白A融合 | NA | NA | 工业生物技术 |
| 12 | 2026-02-13 |
Functional predictability of universal gene circuits in diverse microbial hosts
2024-Jun, Quantitative biology (Beijing, China)
DOI:10.1002/qub2.41
PMID:41676371
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研究论文 | 本研究系统表征了两种转录调控模块在三种非模式微生物中的跨物种通用性，并基于宿主非特异性参数成功预测了遗传电路行为 | 发现不同生物间电路活性存在显著线性关系，通过参数化模型拟合揭示了定义模块通用性的宿主非特异性参数，并首次在非模式微生物中验证了通用生物部件的预测建模潜力 | 仅测试了三种非模式微生物和两种基础调控模块，尚未验证更复杂电路或更多样化宿主体系的普适性 | 探索合成生物学设计电路在不同微生物宿主中功能可靠性与可预测性的扩展 | T7 RNA聚合酶激活模块和阻遏蛋白模块在非模式微生物中的跨物种通用性 | 合成生物学 | NA | 转录调控模块表征、参数化模型拟合、遗传电路构建 | 参数化数学模型 | 基因电路活性数据 | 三种非模式微生物（具体种类未说明） | 遗传电路设计 | 非模式微生物（未指定具体物种） | T7 RNA聚合酶激活模块、阻遏蛋白模块、遗传NOT门、带通滤波器电路 | 工业生物技术 |
| 13 | 2026-02-13 |
Constructing efficient bacterial cell factories to enable one-carbon utilization based on quantitative biology: A review
2024-Mar, Quantitative biology (Beijing, China)
DOI:10.1002/qub2.31
PMID:41676019
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综述 | 本文综述了基于定量生物学方法，特别是同位素代谢通量分析，在理解和改造天然及合成C1利用细菌代谢网络中的应用，以构建高效利用一碳原料的细胞工厂 | 整合定量生物学与合成生物学，通过迭代的“理解-设计-构建-测试-学习”循环，优化C1原料的生物制造过程 | NA | 构建高效利用一碳原料的细菌细胞工厂，以支持碳中性和可持续的经济工业体系 | 天然C1利用细菌（如利用甲烷、甲醇或甲酸盐的细菌）及合成的非C1利用细菌 | 合成生物学 | NA | RNA测序技术、质谱分析、同位素代谢通量分析 | NA | NA | NA | NA | 天然C1利用细菌、非C1利用细菌 | 重连中心甲基营养代谢途径，改造细菌以C1原料为唯一碳源和能源 | 能源, 工业生物技术 |
| 14 | 2026-02-13 |
Application of synthetic biology strategies to promote biosynthesis of fatty acids and their derivatives
2024, Advances in applied microbiology
DOI:10.1016/bs.aambs.2024.05.002
PMID:39059844
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综述 | 本文综述了合成生物学策略在促进脂肪酸及其衍生物生物合成中的应用，包括代谢途径、酶工程及生产优化策略 | 系统总结了通过酶理性设计、碳代谢通量调控、辅因子平衡和代谢途径设计等合成生物学策略提升脂肪酸及其衍生物产量的最新研究进展 | NA | 探讨利用合成生物学策略提高脂肪酸及其衍生物的生物合成效率，以满足工业生产和应用需求 | 脂肪酸及其衍生物，包括饱和脂肪酸（中链和长链脂肪酸）、生物活性脂肪酸（多不饱和脂肪酸、氧脂素、醚脂）及其衍生物 | NA | NA | 微生物催化、酶催化、代谢工程、酶工程 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | 代谢途径设计 | 医药、生物燃料、农药、工业生物技术 |
| 15 | 2026-02-13 |
Theoretical perspective on synthetic man-made life: Learning from the origin of life
2023-Dec, Quantitative biology (Beijing, China)
DOI:10.1002/qub2.22
PMID:41675531
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综述 | 本文回顾了人工生命领域的主要研究方法，并提出了基于生命起源过程的“自下而上从生命起源出发”的新研究路径 | 提出了“自下而上从生命起源出发”的研究方法，该方法模拟生命起源过程，通过建立自催化化学反应网络和设计定向进化系统来创造人工生命 | 文中提到该领域尚缺乏定量数学模型和工具的应用，且所提出的新方法仍处于理论探讨阶段 | 探讨人工生命创造的理论基础和方法论，促进合成生物学与生命起源研究领域的交流 | 人工生命创造的理论模型和研究方法 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 自催化化学反应网络 | NA |
| 16 | 2026-02-13 |
From qualitative to quantitative: the state of the art and challenges for plant synthetic biology
2023-Sep, Quantitative biology (Beijing, China)
DOI:10.15302/J-QB-022-0326
PMID:41675245
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综述 | 本文综述了植物合成生物学的现状、挑战以及从定性到定量研究的转变 | 强调了植物合成生物学从定性研究向定量和可预测性研究的转变，并指出了该领域在早期阶段的挑战与机遇 | 植物合成生物学仍处于早期阶段，定量和可预测性研究不足，且主要局限于模式植物 | 探讨植物合成生物学的当前状态、挑战以及未来发展方向 | 植物合成生物学领域，特别是模式植物中的研究 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 模式植物 | NA | 农业 |
| 17 | 2026-02-13 |
Following the organism to map synthetic genomics
2022, Biotechnology notes (Amsterdam, Netherlands)
DOI:10.1016/j.biotno.2022.07.001
PMID:39416453
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研究论文 | 本文提出了一种基于工程生物体角色的启发式标签系统，以理解合成基因组学领域的多样性和未来方向 | 通过关注工程生物体的角色，为合成基因组学项目提供了一种新的分类和组织方法，强调负责任的研究和创新 | NA | 探索合成基因组学领域的多样性，并促进负责任的研究和创新，以构建可持续的未来关系 | 合成基因组学项目和工程生物体 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 18 | 2026-02-12 |
Over-Expression of a Phycocyanin-Interferon Fusion and Differential Cleaving Efficiency in Cyanobacteria (Synechocystis sp. PCC 6803)
2026-Mar, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.70126
PMID:41388596
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研究论文 | 本研究利用蓝藻Synechocystis sp. PCC 6803作为宿主，过表达藻蓝蛋白-人干扰素α-2融合蛋白，并比较TEV和HRV蛋白酶在切割融合蛋白中的效率 | 首次在蓝藻中稳定过表达功能性人干扰素α-2作为藻蓝蛋白融合体，并系统比较TEV和HRV蛋白酶在蓝藻系统中的切割效率，发现HRV蛋白酶优于TEV及其他近期测试的蛋白酶 | 研究仅针对特定蓝藻宿主和融合蛋白设计，未评估其他光合生物或不同融合策略的适用性，且切割效率可能受表达条件影响 | 开发蓝藻作为低成本重组蛋白生产平台，优化融合蛋白切割技术以提高蛋白分离效率 | 蓝藻Synechocystis sp. PCC 6803、藻蓝蛋白-人干扰素α-2融合蛋白、TEV和HRV蛋白酶切割位点 | 合成生物学 | NA | 重组蛋白表达、融合蛋白构建、蛋白酶切割分析 | NA | 实验数据 | 使用蓝藻Synechocystis sp. PCC 6803作为宿主，涉及不同蛋白酶切割位点的构建体 | 融合蛋白构建、蛋白酶切割系统 | 蓝藻Synechocystis sp. PCC 6803 | 藻蓝蛋白CpcB β-亚基与人干扰素α-2的融合蛋白，包含TEV或HRV蛋白酶切割位点 | 工业生物技术、医药 |
| 19 | 2026-02-12 |
Advances in site-specific knock-in techniques for gene editing
2026-Feb-20, Yi chuan = Hereditas
DOI:10.16288/j.yczz.25-076
PMID:41669806
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综述 | 本文系统总结了位点特异性敲入基因编辑技术的最新进展，包括重组酶和核酸酶系统，并讨论了其在疾病建模和基因治疗中的应用 | 综述了Cas9-Bxb1整合酶系统在实现大片段DNA靶向整合方面的突破，并比较了twinPE+Bxb1和PASTE系统的优缺点 | 当前技术仍存在脱靶活性和编辑效率低的问题，且跨物种基因组安全港数据库尚未完善 | 提高基因靶向敲入技术的精确性和效率，以推动精准医学和合成生物学应用 | 位点特异性重组酶系统（如Bxb1整合酶）和可编程核酸酶系统（如CRISPR/Cas9） | NA | NA | 位点特异性重组酶系统，可编程核酸酶系统，CRISPR/Cas9，多组学数据分析 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Bxb1整合酶 | NA | NA | 医学, 合成生物学 |
| 20 | 2026-02-12 |
Enhancing Stress Tolerance of Probiotics: Mechanisms, Strategies, and Translational Challenges
2026-Feb-11, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c12872
PMID:41614565
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综述 | 本文系统总结了益生菌应激耐受性的分子机制，并评估了包括菌株筛选、适应性进化、基因工程和封装技术在内的现有增强策略 | 强调了基于CRISPR的基因组编辑、合成生物学和纳米材料辅助递送等新兴方法作为克服转化瓶颈的有前景的解决方案 | 与监管批准和大规模制造相关的挑战仍有待解决 | 增强益生菌的应激耐受性，以提高其在生产、储存和应用过程中的存活率和功效 | 益生菌 | NA | NA | CRISPR-based genome editing, synthetic biology, nanomaterial-assisted delivery | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 益生菌（未指定具体物种） | NA | 食品, 制药, 农业 |