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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-05-22 |
Breaking boundaries for PFAS surveillance in water reservoirs: CRISPR-electrochemical synergies from MXene to microfluidics- A review
2026-Sep-01, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2026.118756
PMID:42070443
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综述 | 本文提出了一个基于MXene、CRISPR-Cas12a和微流控协同融合的下一代全氟和多氟烷基物质(PFAS)监测框架 | 首次提出将磺酸基功能化MXene、CRISPR-Cas12a和微流控自动化三者协同结合,实现PFAS的超高灵敏度、特异性和便携式检测 | 作为综述,缺乏实验验证数据和实际环境样本测试结果,且框架的实际可行性尚待进一步实验证明 | 开发超越现有方法局限的下一代PFAS监测技术,实现超灵敏、特异性强、便携且低成本的检测方法 | PFAS(全氟和多氟烷基物质) | 环境监测 | NA | CRISPR-Cas12a, 核酸适配体技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas12a | NA | PFAS特异性适配体引导的CRISPR-Cas12a检测系统 | 环境, 水处理 |
| 2 | 2026-05-22 |
Extended Dissipative Analysis for Uncertain Delayed Genetic Regulatory Networks via Interval Type-2 T-S Fuzzy Framework
2026-Jun, IEEE transactions on cybernetics
IF:9.4Q1
DOI:10.1109/TCYB.2026.3652172
PMID:41553905
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研究论文 | 本文在区间二型T-S模糊框架下研究不确定时滞基因调控网络的扩展耗散性分析 | 首次利用区间二型模糊集捕获基因调控网络的复杂动态和参数不确定性,通过构建新Lyapunov-Krasovskii泛函导出最大允许时滞界限,并开发隶属函数依赖的稳定性准则以降低保守性 | 数值示例显示了优于现有方法的性能,但未提及其他实际约束或实验验证 | 发展不确定时滞基因调控网络的鲁棒控制策略理论分析和设计 | 不确定时滞基因调控网络 | 机器学习 | NA | NA | 区间二型T-S模糊模型 | 数值仿真数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 3 | 2026-05-22 |
Strategies for enhancing specificity and efficacy of oncolytic viruses in cancer treatment
2026-Jun, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2026.110708
PMID:41999961
|
综述 | 系统回顾了增强溶瘤病毒在癌症治疗中特异性和疗效的最新工程化策略 | 整合转录靶向、microRNA去靶向、逻辑门调控系统等多层次特异性增强方法,以及免疫调节、纳米包裹、代谢重编程和智能溶瘤病毒等创新技术 | 未详细讨论具体临床转化障碍和安全性评估数据,缺乏定量比较不同策略的效果 | 提高溶瘤病毒肿瘤选择性和治疗效果,推动临床广泛应用 | 溶瘤病毒 | NA | 癌症 | NA | NA | NA | NA | NA | 病毒 | 逻辑门调控系统 | 医学 |
| 4 | 2026-05-22 |
Metabolic Engineering Strategies for Flavonoid Biosynthesis in Saccharomyces cerevisiae: Current Advances and Future Perspectives
2026-May-21, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.70248
PMID:42163627
|
综述 | 系统总结了酿酒酵母中黄酮类化合物生物合成的代谢工程策略,涵盖途径重建、定量比较及未来展望 | 首次对酿酒酵母中黄酮类化合物代谢工程策略进行定量比较,提出结合智能调控系统、代谢网络合理设计和微生物联合体的未来研究方向 | 未讨论工业规模放大过程中具体的技术挑战,且缺乏对不同策略在不同黄酮类化合物生产中的适用性分析 | 回顾酿酒酵母中黄酮类生物合成途径重建进展,指出从实验室到工业生物反应器放大的关键瓶颈,并展望智能工程策略 | 酿酒酵母中的黄酮类化合物生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 酿酒酵母 | 黄酮类化合物生物合成途径重建 | 工业生物技术 |
| 5 | 2026-05-22 |
The role of fungal G protein-coupled receptors in interspecies cell-cell communication
2026-May-21, FEMS microbiology reviews
IF:10.1Q1
DOI:10.1093/femsre/fuag024
PMID:42166155
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综述 | 总结真菌G蛋白偶联受体在非自身信号感知中的角色,并提出改进的分类系统 | 提出区分已表征、假定和未表征GPCRs的细化分类系统,并强调合成生物学工具在解析真菌GPCRs生理作用中的潜力 | 多数真菌GPCRs仍是孤儿受体,配体和功能未知,限制了对其在跨物种细胞间通讯中作用的全面理解 | 阐明真菌G蛋白偶联受体在跨物种细胞间通讯中的作用 | 真菌G蛋白偶联受体及与其相互作用的非自身信号 | 机器学习 | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 真菌 | NA | 农业, 环境, 工业生物技术 |
| 6 | 2026-05-22 |
Evolving conservation: The role of unconventional approaches to restore contemporary vertebrate populations and genomic biodiversity
2026-May-21, The Journal of heredity
IF:3.0Q2
DOI:10.1093/jhered/esag040
PMID:42166210
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综述 | 探讨生物技术在保护和恢复当代脊椎动物种群及基因组生物多样性中的非常规方法 | 提出将进化与基因组视角整合进传统生态保护与恢复,强调生物技术作为创新工具应对气候加速变化下常规方法不足的问题 | 生物技术应用引发生态不可预测性、公众对野生种群基因干预的阻力等伦理、生态和监管争议 | 分析生物技术在保护和恢复领域的现状、案例、争议及未来潜力,推动其与传统生态知识的透明整合 | 受威胁脊椎动物种群及基因组生物多样性 | 生物保护与恢复生态学 | NA | 基因拯救、合成生物学、基因编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 脊椎动物 | NA | 环境 |
| 7 | 2026-05-22 |
Recurrent neural chemical reaction networks that approximate arbitrary dynamics
2026-May-20, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2026.101572
PMID:42025162
|
研究论文 | 提出一种名为“递归神经化学反应网络”(RNCRN)的模块化分子架构,用于逼近任意动力学行为 | 首次将递归人工神经网络的概念引入化学反应网络,并证明其可以系统训练以模拟任意动力学,且具有DNA链置换技术的实验可行性 | 需要足够多的化学神经元和快速反应才能实现精确逼近,且实际训练中只能使用少量神经元和中等反应速率范围 | 解决合成生物学和分子纳米技术中构建具有丰富动力学特性的新型化学系统的难题 | 递归神经化学反应网络的分子实现和动力学近似能力 | 机器学习 | NA | DNA链置换技术 | 递归神经网络 | NA | NA | DNA链置换技术 | NA | 递归神经化学反应网络(类似合成神经电路) | 合成生物学, 分子纳米技术 |
| 8 | 2026-05-22 |
Bottom-Up Creation of Virus-like Particles via Post-Insertion of Protein-Lipid Conjugates
2026-May-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00172
PMID:42160665
|
研究论文 | 通过后插入蛋白-脂质偶联物自下而上构建病毒样颗粒 | 提出了一种基于SNAP-tag/BG生物正交反应的后插入方法,无需去垢剂即可将蛋白-脂质偶联物插入预成型脂质体,实现病毒样颗粒的模块化构建 | 未评估该方法的长期稳定性及体内应用效果 | 开发一种自下而上的病毒样颗粒构建策略,用于疫苗、药物递送和合成生物学研究 | SARS-CoV-2 Spike蛋白和GFP蛋白 | 合成生物学 | COVID-19 | SNAP-tag/BG反应、流式细胞术、负染透射电子显微镜、ACE2结合实验 | NA | 蛋白质、脂质体 | NA | SNAP-tag/BG生物正交反应 | Expi293F细胞 | 蛋白-脂质偶联物后插入脂质体形成病毒样颗粒 | 医学 |
| 9 | 2026-05-22 |
Functional diversity, evolution, and translational potential of isoprenoids in eukaryotic membranes
2026-May-20, Trends in biochemical sciences
IF:11.6Q1
DOI:10.1016/j.tibs.2026.04.014
PMID:42161681
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综述 | 本文综述了真核生物膜中类异戊二烯的功能多样性、进化及合成生物学应用潜力 | 系统总结了类异戊二烯在真核生物膜中的结构多样性及其对膜流动性、稳定性、渗透性和组织性的调控作用,并探讨了合成生物学在相关化合物生产中的最新进展与挑战 | 合成生物学方法生产膜相关类异戊二烯仍存在产率低、调控复杂等限制 | 探讨类异戊二烯在真核生物膜中的进化、多样性及其在合成生物学中的应用前景 | 真核生物膜中的类异戊二烯及其衍生化合物 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学相关技术 | 植物、真菌、动物 | 膜相关类异戊二烯的代谢通路设计 | 工业生物技术, 医学, 农业 |
| 10 | 2026-05-22 |
The interaction between the RNA aptamer Dap1 and DasR mirrors DNA operator site recognition in GntR repressors
2026-May-20, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag489
PMID:42165134
|
研究论文 | 本研究解析了RNA适配体Dap1与GntR/HutC家族阻遏蛋白DasR复合物的晶体结构,揭示了其模拟DNA操作子位点识别机制,并基于此设计了新型适配体 | 首次阐明RNA适配体Dap1与细菌阻遏蛋白DasR的相互作用结构,发现其结合模式高度模仿DNA操作子识别过程,并利用结构信息快速重编程适配体靶向其他同源蛋白NagR | 研究仅针对GntR/HutC家族,未验证该方法在其他阻遏蛋白家族中的通用性 | 解析RNA适配体与细菌阻遏蛋白的相互作用机制,并开发可重编程的适配体设计策略 | SELEX衍生RNA适配体Dap1及其靶标——GntR/HutC家族阻遏蛋白DasR | 合成生物学 | NA | X射线晶体学, SELEX, 适配体工程 | NA | 结构数据 | NA | NA | 大肠杆菌 | RNA适配体-阻遏蛋白相互作用对 | 合成生物学, 生物技术 |
| 11 | 2026-05-22 |
Xeno nucleic acids (XNAs): advances in synthesis, diagnostics, and therapeutics
2026-May-17, Bioorganic chemistry
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.bioorg.2026.110000
PMID:42160832
|
综述 | 全面综述异源核酸(XNA)的合成方法、结构特性及生物医学应用 | 系统归纳了XNA的化学修饰类型、合成策略及表征技术,强调其超越DNA/RNA的稳定性和功能多样性,并展望AI引导设计与合成生物学应用 | 当前面临的挑战包括可规模化合成、高效递送系统及完善的结构-功能关系理解 | 总结XNA在诊断和治疗领域的研究进展,推动精准医学和生物技术发展 | 异源核酸(XNA),包括锁核酸(LNA)、肽核酸(PNA)、己糖醇核酸(HNA)、氟阿拉伯糖核酸(FANA)和吗啉代寡聚体(MO) | 分子生物学、生物医学工程 | NA | 磷酰胺化学法、工程聚合酶酶法、热熔解分析、圆二色光谱、核磁共振、质谱、测序方法 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学、生物技术 |
| 12 | 2026-05-22 |
PHYCUT: Scalable Multiplex CRISPR/Cas9 Editing for Genome Engineering in the Diatom Phaeodactylum tricornutum
2026-05-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00843
PMID:41979903
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研究论文 | 开发了一种名为PHYCUT的多重CRISPR/Cas9编辑工具,用于硅藻基因工程,特别是减少免疫原性岩藻糖基化 | 首次在硅藻中实现基于质粒的多重CRISPR/Cas9编辑系统,利用Csy4核糖核酸酶处理多导向RNA阵列,可同时编辑多个基因 | 文章未明确讨论长期遗传稳定性或脱靶效应,且系统在非模式硅藻中的适用性尚未验证 | 解决硅藻多重基因组编辑效率低的问题,并实现人源化糖基化修饰以支持生物制药应用 | 三角褐指藻(Phaeodactylum tricornutum)及其α(1,3)-岩藻糖基转移酶基因 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9, Csy4核糖核酸酶处理, 多重基因编辑 | NA | NA | 三个α(1,3)-岩藻糖基转移酶基因的编辑, 多个菌株获得低岩藻糖基化 | CRISPR-Cas9 | 三角褐指藻(Phaeodactylum tricornutum) | 多导向RNA阵列处理系统,基于Csy4核糖核酸酶 | 生物制药, 藻类生物技术 |
| 13 | 2026-05-22 |
Yeast MoClo Secretion and Surface Display Toolkit 2.0: Improvements and Applications for Analysis of protein-protein Interactions and Whole-Cell Biocatalysis
2026-05-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00085
PMID:42025218
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研究论文 | 介绍了酵母MoClo分泌和表面展示工具包2.0的改进及其在蛋白质相互作用分析和全细胞生物催化中的应用 | 通过添加基于截短Aga1的N端融合和Aga2的C端融合的锚蛋白新部件,以及GFP荧光互补检测和分泌增强蛋白部件,实现了高通量检测和表达优化 | 未提及具体局限性 | 改进和扩展酵母MoClo分泌和表面展示工具包,用于蛋白质相互作用分析和全细胞生物催化 | 酵母细胞、异源蛋白、抗GFP纳米抗体、PET降解酶、疏水蛋白1、MHETase | 合成生物学 | NA | 模块化克隆(MoClo)、流式细胞术、酵母免疫共沉淀 | NA | 蛋白质相互作用数据、酶活性数据 | NA | MoClo | 酿酒酵母 | 分泌和表面展示系统、荧光互补系统 | 工业生物技术、环境科学 |
| 14 | 2026-05-22 |
Systematic Evaluation of Different Ribonucleoprotein Complexes as Posttranscriptional Biosensors in Cell-Free TX-TL Systems
2026-05-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00170
PMID:42086502
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研究论文 | 系统评估了三种不同核糖核蛋白复合物在无细胞转录翻译系统中作为转录后生物传感器的性能 | 首次系统比较了三种RNP电路(RISC、MS2-CNOT7和L7Ae)在不同无细胞平台(真核、原核和重组)中的表现,并展示了L7Ae电路在蛋白酶响应性病毒检测中的潜力 | IVT RNA基miRNA传感器中报告基因基线表达水平的可靠量化存在瓶颈;MS2-CNOT7电路在真核裂解液中受裂解液依赖性限制,降低了其可编程性 | 评估RNP复合物作为无细胞转录后生物传感器的可行性及平台通用性 | 三种核糖核蛋白电路(RISC、MS2-CNOT7和L7Ae)在不同无细胞转录翻译系统(真核、原核和重组)中的性能 | 合成生物学 | NA | 无细胞转录翻译系统 | NA | NA | NA | NA | NA | 转录后生物传感器电路(RISC、MS2-CNOT7和L7Ae) | 医学, 环境 |
| 15 | 2026-05-22 |
Modular Assembly of Higher-Order DNA Nanotube Tile Nanostructures Using DNA Annular Scaffolds
2026-May-15, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.6c04434
PMID:42139459
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研究论文 | 提出一种基于DNA环形支架的模块化组装策略,用于构建高阶DNA纳米管瓦片纳米结构 | 通过整合DNA瓦片和DNA折纸的优点,利用DNA环形支架连接短DNA基序,实现了超过99%的组装产率,并构建了从均质/异质聚合物到布尔逻辑门和电路的多样化模块化系统 | 当前策略在更复杂高阶结构制造方面的模块化潜力尚未完全实现 | 开发一种可预测、稳定且逻辑可控的模块化组装策略,用于构建高阶DNA纳米结构 | DNA纳米管瓦片(DNT)及其通过环形支架构建的模块化纳米结构 | 合成生物学 | NA | DNA纳米技术,DNA瓦片,DNA折纸 | NA | NA | NA | DNA瓦片、DNA折纸 | 无细胞系统 | 布尔逻辑门和电路(包括Y形、十字形超结构、线性低聚物) | 纳米技术,合成生物学 |
| 16 | 2026-05-22 |
AHR: The Overlooked Mediator in SkincareBridging Environmental Sensing and Skin Physiology
2026-May-15, Environment & health (Washington, D.C.)
DOI:10.1021/envhealth.5c00424
PMID:42164887
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综述 | 本文综述了芳香烃受体(AHR)在护肤品中作为环境传感与皮肤生理学桥梁的媒介作用,及其在化妆品生物活性物质效应中的新角色 | 挑战了AHR仅作为外源物传感器的传统观点,将其重新定义为整合环境与生物活性信号的转录因子,并探讨了AI驱动建模和合成生物学等新兴工具在AHR研究中的应用潜力 | 基于现有研究的综述性质,可能受限于已发表研究的范围;缺乏直接的实验验证;未详细讨论AHR激活的潜在副作用或个体差异 | 建立AHR在皮肤功能调节中的整合枢纽作用,并展望未来研究方向以制定更精准的护肤策略 | AHR及其在皮肤生理中的调控机制 | 数字病理学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 17 | 2026-05-22 |
Stimulus-responsive engineered oncolytic bacteria
2026-May-14, Biomaterials
IF:12.8Q1
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综述 | 总结刺激响应性工程化溶瘤细菌的最新进展,重点介绍可编程基因回路的设计原则与性能权衡 | 系统整合了合成生物学工具与肿瘤微环境特征,构建了受外源触发或内源肿瘤信号调控的基因回路,实现治疗基因的时空精准控制 | 未涵盖临床转化中的安全性评估、免疫原性及长期毒性数据,缺乏对多种细菌平台横向比较 | 推动溶瘤细菌发展为可编程的活体治疗剂用于精准癌症治疗 | 刺激响应性工程化溶瘤细菌及其基因回路设计 | 合成生物学, 癌症治疗 | 肿瘤 | NA | NA | NA | NA | NA | 溶瘤细菌 | 刺激响应性基因回路(包括外源触发因子或内源肿瘤相关信号调控的遗传程序) | 医药 |
| 18 | 2026-05-22 |
A Linear Mixed Effects Model for Evaluating Synthetic Gene Circuits
2026-May-11, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00171
PMID:42112575
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研究论文 | 提出一种应用线性混合效应模型来评估合成基因电路性能的统计方法 | 首次将线性混合效应模型应用于合成基因电路布尔逻辑门的性能评估,并推荐样本量以进行统计检验 | 未提及 | 标准化合成基因电路的统计评估方法 | 合成基因电路中的布尔逻辑门 | 机器学习 | NA | NA | 线性混合效应模型,k-means聚类 | 仿真数据和实验数据 | 144个已发布的布尔逻辑门 | NA | NA | 布尔逻辑门 | 医学,计算,生物传感 |
| 19 | 2026-05-22 |
Incorporation of Cryptic Plasmid Energetics Improves Genome-Scale Metabolic Predictions in Probiotic E. coli Nissle 1917
2026-May, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.70361
PMID:42152457
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研究论文 | 本研究将隐性质粒能量代谢整合进益生菌大肠杆菌Nissle 1917的基因组规模代谢模型,以提高代谢预测的准确性 | 首次在基因组规模代谢模型中考虑隐性质粒相关的能量成本,并系统比较不同模型细化深度与预测性能之间的权衡 | 未详细说明模型在复杂体外或体内环境下验证的局限性,且依赖单一菌株和特定实验条件 | 提高益生菌大肠杆菌Nissle 1917代谢预测的定量可靠性和生理相关性,支持益生菌工程和合成生物学 | 益生菌大肠杆菌Nissle 1917(EcN)及其隐性质粒 | 机器学习 | NA | 代谢组学分析 | 基因组规模代谢模型(GEM)、可能性代谢通量分析 | 代谢组学数据 | 一种菌株(EcN)在模拟肠道培养基和厌氧条件下的代谢组学分析 | NA | 大肠杆菌(E. coli Nissle 1917) | 隐性质粒能量代谢模块 | 医学、生物技术、合成生物学 |
| 20 | 2026-05-22 |
Transforming a fragile protein helix into an ultrastable scaffold via a hierarchical AI and chemistry framework
2026-Apr-02, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.109753
PMID:41925723
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研究论文 | 提出一种结合AI引导设计与基础化学原理的分层框架,将脆弱的α-螺旋结构域转化为超稳定支架 | 首次将AI工具(如AlphaFold3)与化学原理(盐桥、金属配位)系统结合,实现多层级稳定化设计,使α-螺旋蛋白在热、机械和化学应力下具有前所未有的多轴稳定性 | 未说明 | 设计在同时热、机械和化学应力下保持结构完整性的蛋白质 | α-螺旋结构域 | 蛋白质工程 | NA | AI引导设计、分子动力学模拟 | AlphaFold3 | NA | 数百万个设计被筛选至最小候选集,具体样本量未说明 | NA | NA | NA | 合成生物学 |