合成生物学相关文章
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当前共找到 4537 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-03-04 |
Adenosine Triphosphate-Producing Artificial Cells: Biomimetic Construction Strategies and Applications
2026-Mar-13, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202500934
PMID:41773731
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综述 | 本文综述了ATP生产人工细胞的仿生构建策略及其应用的最新进展 | 系统整合了三种ATP生产人工细胞的构建策略，并探讨了其在CO₂固定和代谢调控等仿生应用中的催化效能与分子隔离能力，为合成生物学等领域的工程应用提供关键指导 | NA | 推动ATP生产人工细胞领域从基础研究向实际应用转化 | ATP生产人工细胞 | 合成生物学 | NA | 自下而上构建策略（脂质体、聚合物体、融合液滴、油包水胶束、金属有机框架等） | NA | NA | NA | NA | NA | 模拟氧化/光合磷酸化途径的ATP合成系统 | 合成生物学、靶向药物递送、再生疗法、生物混合能量转换装置 |
| 2 | 2026-03-04 |
An Easy-To-Use and Field-Deployable Cell-Free Bioreporter for Environmental Detection of Tetracyclines and Macrolides
2026-Mar-03, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.5c04800
PMID:41693084
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研究论文 | 本文介绍了一种基于合成生物学的无细胞生物报告系统，用于环境中的四环素和大环内酯类抗生素检测 | 该系统整合了抗生素响应转录因子、RNA聚合酶和工程化DNA转录模板，通过体外转录反应产生可见荧光信号，消除了全细胞生物传感器的生物安全顾虑，并支持冻干长期储存 | NA | 开发一种便携、快速的环境抗生素监测工具 | 四环素和大环内酯类抗生素 | 合成生物学 | NA | 体外转录反应 | NA | 荧光信号 | 真实水样 | 合成生物学设计 | 无细胞系统 | 抗生素响应生物传感器，包含转录因子、RNA聚合酶和DNA模板 | 环境监测 |
| 3 | 2026-03-04 |
High-performance bioimaging and biosensing via nucleobase-editing enzymes
2026-Mar-03, Chemical Society reviews
IF:40.4Q1
DOI:10.1039/d5cs00678c
PMID:41773995
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综述 | 本文综述了核苷碱基编辑酶在生物成像和生物传感中的应用，包括其催化原理、集成模式及未来发展方向 | 将核苷碱基编辑酶重新用作可编程执行器，实现高特异性、高效扩增和生理条件兼容的生物传感与成像系统 | NA | 探讨核苷碱基编辑酶在生物传感和生物成像中的新兴应用，以提升诊断、治疗监测和合成生物学的平台性能 | 核苷碱基编辑酶（如脱氨酶、甲基转移酶/去甲基酶、DNA糖基化酶）及其在核酸、蛋白质和细胞过程监测中的应用 | NA | NA | 核苷碱基编辑技术，包括脱氨、甲基化/去甲基化、碱基切除等反应 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学、合成生物学 |
| 4 | 2026-03-04 |
Building AuxInYeast Synthetic Biology Strains for Biochemical Characterization of Maize Auxin Hormone Signaling Components
2026-Mar-02, Cold Spring Harbor protocols
DOI:10.1101/pdb.prot108634
PMID:40074300
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研究论文 | 本文介绍了一种名为AuxInYeast的合成生物学工具，用于在酵母中构建玉米生长素信号通路组件，以进行生化表征 | 开发了AuxInYeast系统，作为植物合成生物学底盘，首次在酵母中重建玉米生长素信号通路，实现高通量定量分析 | 系统基于酵母环境，可能不完全模拟植物体内复杂调控网络，且仅针对玉米组件，通用性需进一步验证 | 构建合成生物学菌株，以生化表征玉米生长素激素信号通路组件 | 玉米生长素信号通路组件，包括受体、阻遏物、辅阻遏物、转录因子和响应元件 | 合成生物学 | NA | 流式细胞术、荧光蛋白标记 | NA | 生化数据、荧光信号数据 | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 酵母 | 生长素信号通路，包括受体-阻遏物复合物、转录激活级联和响应元件 | 农业, 工业生物技术 |
| 5 | 2026-03-04 |
Testing AuxInYeast Synthetic Biology Strains via Fluorescence Flow Cytometry
2026-Mar-02, Cold Spring Harbor protocols
DOI:10.1101/pdb.prot108635
PMID:40074301
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研究论文 | 本文介绍了一种使用荧光流式细胞术测试AuxInYeast合成生物学菌株的协议，用于分析玉米生长素信号通路 | 开发了基于酵母异源表达平台的AuxInYeast系统，结合荧光流式细胞术实现高通量定量测量植物生长素信号通路组件 | NA | 工程化玉米生长和发育，通过合成生物学工具分析生长素激素信号通路 | 玉米生长素感知受体和荧光标记的阻遏蛋白 | 合成生物学 | NA | 荧光流式细胞术 | NA | 荧光数据 | 多个AuxInYeast菌株，具体数量未指定 | AuxInYeast系统 | 酵母 | 生长素感知和阻遏蛋白降解的生物传感器通路 | 农业 |
| 6 | 2026-03-04 |
Synthetic Biology Approaches to Study Maize Signaling Pathways
2026-Mar-02, Cold Spring Harbor protocols
DOI:10.1101/pdb.top108450
PMID:40074299
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综述 | 本文综述了如何应用合成生物学方法研究玉米信号通路，并以酵母异源表达系统为例展示了该方法的潜力 | 提出将合成生物学设计-构建-测试-迭代的工程原则系统应用于玉米研究，并建立了酵母异源表达平台（AuxInYeast）来模拟玉米信号通路 | NA | 为玉米研究提供合成生物学方法指南，以解决植物体内难以检测的信号通路基础问题 | 玉米信号通路（特别是生长素信号通路）及其异源表达系统 | 合成生物学 | NA | 异源表达、荧光流式细胞术 | NA | NA | NA | NA | 酵母 | 玉米核生长素响应信号通路在酵母中的重构（AuxInYeast系统） | 农业 |
| 7 | 2026-03-04 |
BOTany methods: accessible automation for plant synthetic biology
2026-Mar-02, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiag066
PMID:41715940
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研究论文 | 本文开发了一套基于Opentrons OT-2机器人的模块化BOTany方法，旨在为植物合成生物学提供可访问的自动化实验方案 | 为缺乏液体处理机器人的植物合成生物学研究者提供了低成本、易修改的自动化实验方案，支持从简单重复任务到复杂分子克隆操作的全流程自动化 | 依赖特定型号的Opentrons OT-2机器人，且自动化方案可能仍需一定设备投入 | 降低植物合成生物学实验自动化的门槛，提高实验通量和可重复性 | 植物合成生物学实验流程 | 合成生物学 | NA | 植物模块化克隆、细菌转化、质粒提取、PCR | NA | 实验操作流程 | NA | Opentrons OT-2 | 植物, 细菌 | 植物模块化克隆系统 | 农业, 工业生物技术 |
| 8 | 2026-03-04 |
Genomic perplexity and the evolution of context-dependent function
2026-Mar-02, Molecular biology and evolution
IF:11.0Q1
DOI:10.1093/molbev/msag041
PMID:41739546
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研究论文 | 本文提出基因组像大型语言模型一样不编码固定功能，而是编码功能和表型结果的概率分布，并引入“基因组困惑度”概念来量化基因在宿主背景中的统计意外性和不兼容性 | 将基因组功能与大型语言模型进行概念类比，提出基因组编码的是概率分布而非固定功能，并首次引入“基因组困惑度”作为量化基因流动适应成本的指标 | 提出的框架主要是概念性和理论性的，需要更多实证研究来验证其预测能力 | 建立理解基因组功能背景依赖性的新理论框架 | 基因组功能、基因流动（水平基因转移和基因渗入）、基因背景依赖性 | NA | NA | NA | transformer（类比）、大型语言模型（概念类比） | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 9 | 2026-03-04 |
Advancing Genetic Code Expansion in Live Cells Through Metabolic Engineering
2026-Mar-02, Annual review of chemical and biomolecular engineering
IF:7.6Q1
|
综述 | 本文综述了通过代谢工程在活细胞中推进遗传密码扩展（GCE）的进展，重点关注非标准氨基酸（nsAAs）的生物合成及其在合成生物学中的应用 | 整合代谢工程与GCE，实现nsAAs的生物合成，减少对化学合成补充的依赖，拓展蛋白质化学功能 | 现有GCE方法通常依赖细胞培养基中化学合成nsAAs的补充，这限制了其应用范围 | 克服GCE中nsAAs来源的限制，通过代谢工程实现nsAAs的生物合成，以促进合成生物学应用 | 遗传密码扩展（GCE）、非标准氨基酸（nsAAs）、活细胞中的蛋白质翻译 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、遗传密码扩展（GCE） | NA | NA | NA | NA | 活细胞（未指定具体宿主） | 生物合成途径设计，用于生产非标准氨基酸（nsAAs） | 医学、工业生物技术 |
| 10 | 2026-03-04 |
Engineering non-ribosomal peptide synthesis: tuning the antibiotics engine of the microbial world
2026-Mar-02, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2026.2615819
PMID:41771683
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综述 | 本文综述了通过合成生物学方法工程化非核糖体肽合成以优化抗生素生产的进展 | 聚焦于通过工程化前体代谢物、改变代谢流、引入强启动子和调控因子以及重定向代谢至生物合成基因簇，以提高非核糖体肽的产量和生物活性 | NA | 利用合成生物学优化非核糖体肽的合成，以增强其作为抗生素的医药应用 | 非核糖体肽合成酶及其产生的肽类抗生素 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | 生物合成基因簇的工程化表达 | 医药 |
| 11 | 2026-03-04 |
Publisher Correction: Engineering modular and orthogonal genetic logic gates for robust digital-like synthetic biology
2026-Mar-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69313-3
PMID:41771868
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 12 | 2026-03-04 |
Versatile 2-Oxoglutarate-Dependent Dioxygenases Catalyze Radical-Mediated Multifunctional Skeleton Reconstructions and Oxidation Modifications of Taxoids
2026-Feb-26, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.6c01169
PMID:41746272
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研究论文 | 本研究鉴定了两种新型2-氧戊二酸依赖性双加氧酶TcOGD1和TcOGD2，揭示了其在紫杉烷类化合物骨架重构和氧化修饰中的多功能催化作用 | 首次发现并表征了能够催化紫杉烷从6/8/6骨架向5/7/6、-5/7/6及6/12等多种骨架重构的多功能双加氧酶，揭示了自由基介导的C-C键断裂新机制 | 研究主要基于酶学反应和体外鉴定，体内生物合成途径和调控机制仍需进一步探索 | 探究紫杉烷类二萜化合物的结构多样性形成机制及其生物合成途径 | 紫杉烷类二萜化合物（特别是5/7/6骨架化合物）及其生物合成酶 | 合成生物学 | 癌症 | 酶学反应、NMR光谱分析、化合物分离鉴定 | NA | 化学结构数据、光谱数据 | 从植物中分离得到5种新型-5/7/6紫杉烷化合物 | 酶工程 | NA | NA | 医药 |
| 13 | 2026-03-04 |
Structure, Mutation, Functional Domain Roles and Medical Implications of Glycerol Kinase
2026-Feb, The protein journal
DOI:10.1007/s10930-025-10316-2
PMID:41537922
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综述 | 本文综述了甘油激酶（GK）的结构、突变、功能域作用及其在代谢和疾病中的意义，并探讨了GK抑制剂的研究现状与开发策略 | 系统整合了GK从基因调控到翻译后修饰的多层次调控机制，并探讨了其在合成生物学和肿瘤发展中的新兴研究领域 | 作为一篇综述文章，未提供新的实验数据或原创性发现，主要基于现有文献进行总结和分析 | 阐明甘油激酶在代谢中的核心作用及其与疾病的关联，并探索其作为药物靶点的潜力 | 甘油激酶（GK）及其在代谢通路和疾病中的作用 | NA | NA | 高通量筛选、基于结构的药物设计、计算建模 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 14 | 2026-03-04 |
A meta-analysis of the gut microbiome in inflammatory bowel disease patients identifies disease-associated small molecules
2025-Feb-12, Cell host & microbe
IF:20.6Q1
DOI:10.1016/j.chom.2025.01.002
PMID:39947133
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meta-analysis | 通过荟萃分析炎症性肠病患者肠道微生物组的小分子生物合成基因簇，鉴定出与克罗恩病相关的脂肪酸酰胺，并验证其破坏肠道通透性和加剧疾病的作用 | 首次通过合成生物学方法解析了克罗恩病相关基因簇产生的六种脂肪酸酰胺结构，并证实这些微生物来源小分子在疾病发生中的作用 | 研究主要基于小鼠模型验证，人类样本中的直接致病机制仍需进一步探究 | 探究肠道微生物组小分子代谢物在炎症性肠病发病机制中的作用 | 炎症性肠病患者和健康对照的肠道宏基因组样本、克罗恩病相关基因簇产物、结肠炎小鼠模型 | 宏基因组学 | 炎症性肠病（克罗恩病） | 宏基因组测序、合成生物学、结构解析 | NA | 宏基因组数据、质谱数据 | IBD患者与健康对照的粪便样本（具体数量未明确说明） | 合成生物学 | 梭菌属（Clostridia） | 小分子生物合成基因簇（BGCs） | 医学 |
| 15 | 2026-03-04 |
Recent advances in CAR T-cell engineering using synthetic biology: Paving the way for next-generation cancer treatment
2024, Advances in protein chemistry and structural biology
DOI:10.1016/bs.apcsb.2024.02.003
PMID:38762281
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综述 | 本章节全面探讨了合成生物学在CAR T细胞疗法中的创新应用，以推动下一代癌症治疗的发展 | 强调合成生物学通过基因编辑、合成基因电路和分子工程技术，优化CAR T细胞功能，提升治疗的安全性和有效性 | NA | 探索合成生物学如何增强CAR T细胞疗法的个性化和精准性，以改善癌症治疗效果 | CAR T细胞疗法及其在癌症免疫治疗中的应用 | 合成生物学 | 癌症 | 基因编辑、合成基因电路、分子工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN | T细胞 | 合成基因电路，用于优化CAR T细胞功能，如逻辑门或生物传感器设计 | 医学 |
| 16 | 2026-03-04 |
GroovDB: A Database of Ligand-Inducible Transcription Factors
2022-10-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.2c00382
PMID:36178800
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研究论文 | 本文介绍了GroovDB，一个用于配体诱导型转录因子的数据库，旨在支持合成生物学中的工程应用 | 开发了一个经过验证的、可访问的数据库，整合了配体诱导型转录因子的序列、配体和操作数据，并提供了自动化数据管理和可视化工具 | NA | 为合成生物学提供一个可靠的配体诱导型转录因子资源库，以促进遗传电路的设计和应用 | 配体诱导型原核转录因子及其相关数据 | 合成生物学 | NA | 自动化数据管理流程 | NA | 序列数据、配体数据、操作数据 | NA | NA | 原核生物 | 化学响应型遗传电路 | 工业生物技术、医学 |
| 17 | 2026-03-04 |
Engineering modular and orthogonal genetic logic gates for robust digital-like synthetic biology
2011-Oct-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/ncomms1516
PMID:22009040
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研究论文 | 本文构建了一个基于大肠杆菌的正交AND逻辑门，利用来自Pseudomonas syringae的新型异源调控模块，实现模块化和数字化的合成生物学设计 | 采用来自Pseudomonas syringae的新型异源调控模块构建正交AND逻辑门，展示了模块化设计和与NOT门组合形成NAND门的能力 | NA | 构建模块化和正交的遗传逻辑门，以定制细胞信号传导并实现稳健的数字化合成生物学设备 | 大肠杆菌中的遗传逻辑门电路 | 合成生物学 | NA | 定量表征、建模、构建和测试的基于部件的工程方法 | NA | NA | NA | 基于部件的工程方法 | 大肠杆菌 | 正交AND逻辑门，由两个共激活基因hrpR和hrpS控制输入，σ(54)依赖的hrpL启动子驱动输出，可模块化组合形成NAND门 | 工业生物技术 |
| 18 | 2026-03-03 |
Metabolomics-guided engineering of drought-resilient crops: Integrating multi-omics and AI for climate-smart agriculture
2026-Apr, Plant science : an international journal of experimental plant biology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.plantsci.2026.113025
PMID:41662977
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综述 | 本文综述了代谢组学在指导抗旱作物工程化中的应用，重点探讨了其与多组学、CRISPR基因编辑、合成生物学及人工智能等前沿技术的整合，旨在构建一个面向气候智能型农业的转化框架 | 强调将代谢组学从诊断工具发展为预测性和规范性平台，并系统整合了单细胞/空间代谢组学、生态代谢组学及AI驱动建模等新兴前沿方向，以连接实验室发现与田间应用 | NA | 构建一个整合多组学、基因编辑、合成生物学和人工智能的转化框架，以培育抗旱作物，应对全球粮食安全威胁 | 作物（特别是面临干旱胁迫的作物）及其在干旱响应中的代谢物 | NA | NA | 代谢组学，多组学整合，CRISPR基因编辑，通路工程，合成生物学，人工智能 | AI驱动的预测模型 | 代谢组学数据，多组学数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 作物（植物） | 通路工程 | 农业 |
| 19 | 2026-03-03 |
Engineering Yeast for Sustainable Bioproduction of Tryptophan-Derived Aromatic Compounds
2026-Mar-02, FEMS yeast research
IF:2.4Q3
DOI:10.1093/femsyr/foag012
PMID:41770028
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综述 | 本文综述了利用酵母工程化生产色氨酸衍生芳香化合物的最新进展、代谢工程策略、合成生物学工具及面临的挑战 | 系统总结了以酵母为细胞工厂、以L-色氨酸为关键前体生产高价值芳香化合物的工程化策略与合成生物学工具 | NA | 实现色氨酸衍生芳香化合物的高效、可扩展且经济可行的生物合成 | 酵母细胞工厂与色氨酸衍生芳香化合物 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学工具 | NA | NA | NA | NA | 酵母 | NA | 聚合物、食品、饲料、化妆品、制药 |
| 20 | 2026-03-03 |
Synthetic biology for heterologous expression and engineering of fungal polyketide synthases
2026-Mar-02, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00020c
PMID:41770117
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综述 | 本文综述了真菌聚酮合酶（PKS）的异源表达与工程化策略，包括宿主选择、工程策略及未来发展方向 | 系统总结了真菌PKS工程化的两大关键设计原则（宿主选择与工程策略），并提出了整合先进计算工具等未来方向 | NA | 探讨真菌聚酮合酶的异源表达与工程化方法，以拓展聚酮类天然产物的应用潜力 | 真菌聚酮合酶（PKS）及其产生的天然产物 | 合成生物学 | NA | 异源表达、点突变、结构域交换 | NA | NA | NA | NA | 酵母、丝状真菌 | 聚酮合酶工程化（包括起始单元选择、点突变、结构域交换） | 医药、农业、生物技术 |