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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-02-12 |
Over-Expression of a Phycocyanin-Interferon Fusion and Differential Cleaving Efficiency in Cyanobacteria (Synechocystis sp. PCC 6803)
2026-Mar, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.70126
PMID:41388596
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研究论文 | 本研究利用蓝藻Synechocystis sp. PCC 6803作为宿主,过表达藻蓝蛋白-人干扰素α-2融合蛋白,并比较TEV和HRV蛋白酶在切割融合蛋白中的效率 | 首次在蓝藻中稳定过表达功能性人干扰素α-2作为藻蓝蛋白融合体,并系统比较TEV和HRV蛋白酶在蓝藻系统中的切割效率,发现HRV蛋白酶优于TEV及其他近期测试的蛋白酶 | 研究仅针对特定蓝藻宿主和融合蛋白设计,未评估其他光合生物或不同融合策略的适用性,且切割效率可能受表达条件影响 | 开发蓝藻作为低成本重组蛋白生产平台,优化融合蛋白切割技术以提高蛋白分离效率 | 蓝藻Synechocystis sp. PCC 6803、藻蓝蛋白-人干扰素α-2融合蛋白、TEV和HRV蛋白酶切割位点 | 合成生物学 | NA | 重组蛋白表达、融合蛋白构建、蛋白酶切割分析 | NA | 实验数据 | 使用蓝藻Synechocystis sp. PCC 6803作为宿主,涉及不同蛋白酶切割位点的构建体 | 融合蛋白构建、蛋白酶切割系统 | 蓝藻Synechocystis sp. PCC 6803 | 藻蓝蛋白CpcB β-亚基与人干扰素α-2的融合蛋白,包含TEV或HRV蛋白酶切割位点 | 工业生物技术、医药 |
| 2 | 2026-02-12 |
Advances in site-specific knock-in techniques for gene editing
2026-Feb-20, Yi chuan = Hereditas
DOI:10.16288/j.yczz.25-076
PMID:41669806
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综述 | 本文系统总结了位点特异性敲入基因编辑技术的最新进展,包括重组酶和核酸酶系统,并讨论了其在疾病建模和基因治疗中的应用 | 综述了Cas9-Bxb1整合酶系统在实现大片段DNA靶向整合方面的突破,并比较了twinPE+Bxb1和PASTE系统的优缺点 | 当前技术仍存在脱靶活性和编辑效率低的问题,且跨物种基因组安全港数据库尚未完善 | 提高基因靶向敲入技术的精确性和效率,以推动精准医学和合成生物学应用 | 位点特异性重组酶系统(如Bxb1整合酶)和可编程核酸酶系统(如CRISPR/Cas9) | NA | NA | 位点特异性重组酶系统,可编程核酸酶系统,CRISPR/Cas9,多组学数据分析 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Bxb1整合酶 | NA | NA | 医学, 合成生物学 |
| 3 | 2026-02-12 |
Enhancing Stress Tolerance of Probiotics: Mechanisms, Strategies, and Translational Challenges
2026-Feb-11, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c12872
PMID:41614565
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综述 | 本文系统总结了益生菌应激耐受性的分子机制,并评估了包括菌株筛选、适应性进化、基因工程和封装技术在内的现有增强策略 | 强调了基于CRISPR的基因组编辑、合成生物学和纳米材料辅助递送等新兴方法作为克服转化瓶颈的有前景的解决方案 | 与监管批准和大规模制造相关的挑战仍有待解决 | 增强益生菌的应激耐受性,以提高其在生产、储存和应用过程中的存活率和功效 | 益生菌 | NA | NA | CRISPR-based genome editing, synthetic biology, nanomaterial-assisted delivery | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 益生菌(未指定具体物种) | NA | 食品, 制药, 农业 |
| 4 | 2026-02-12 |
Classification, Pharmacological Properties, and Applications of Bioactive Constituents in Mentha Species
2026-Feb-11, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c13261
PMID:41614637
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综述 | 本文综述了薄荷属植物的分类、药理特性及其生物活性成分的应用 | 探讨了利用合成生物学生产薄荷醇以应对资源环境限制和市场需求的创新方向 | NA | 综述薄荷属植物的生物活性成分及其在食品、医药和现代农业等领域的应用 | 薄荷属植物及其生物活性成分,如薄荷醇和类黄酮 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 食品, 医药, 现代农业 |
| 5 | 2026-02-12 |
Characterization of the Key Enzymes and a Gene Pair in Triterpenoid Biosynthesis of Ficus microcarpa
2026-Feb-11, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c12253
PMID:41615816
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研究论文 | 本研究功能表征了榕树中的八个氧化角鲨烯环化酶,揭示了它们在生成八种不同三萜醇骨架中的作用,并鉴定了一个罕见的ψ-蒲公英甾醇合酶及关键残基差异 | 首次在桑科植物中鉴定出罕见的ψ-蒲公英甾醇合酶,揭示了染色体连锁基因对在羽扇豆烷型衍生物合成中的顺序作用,并发现CYP716A亚家族酶具有保守的催化多功能性 | NA | 阐明榕树中三萜类化合物生物合成的关键酶和基因对 | 榕树中的氧化角鲨烯环化酶和细胞色素P450酶 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 6 | 2026-02-12 |
Engineering Basal Cognition: Minimal Genetic Circuits for Habituation, Sensitization, and Massed-Spaced Learning
2026-Feb-10, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00766
PMID:41666326
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研究论文 | 本文采用合成生物学方法,设计并模拟了能够实现单细胞系统中非关联性学习(如习惯化、敏感化和集中-分散学习效应)的最小遗传电路 | 通过合成生物学方法,首次构建并模拟了能够实现习惯化、敏感化和集中-分散学习效应的最小遗传电路,为实验验证提供了平台 | 研究基于理论模型和模拟,尚未进行实验验证,且电路设计可能受限于基因系统的时空动态特性 | 探索最小遗传电路如何在单细胞系统中实现非关联性学习,以理解基础认知功能的进化与工程挑战 | 单细胞系统和非关联性学习(如习惯化、敏感化和集中-分散学习效应) | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法,包括电路设计和模拟 | NA | 模拟数据 | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 单细胞系统(如原生生物和黏菌) | 设计包含激活子、抑制子、荧光报告基因和群体感应分子的合成电路,用于实现习惯化、敏感化和集中-分散学习效应 | 工业生物技术 |
| 7 | 2026-02-12 |
Developmentally inspired synthetic kidney engineering
2026-Feb-10, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-026-03011-9
PMID:41667710
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研究论文 | 本文提出了一种受发育启发的合成肾脏工程策略,利用合成生物学和空间模式工具指导体外多尺度组织结构形成 | 提出'发育工程'新范式,将胚胎肾脏发育的时空线索应用于体外组织构建,通过引导和组织基序的链式组装实现可扩展的工程化组织 | 策略仍处于概念阶段,临床转化面临功能成熟度、细胞类型缺失和可扩展性等挑战 | 开发可用于临床移植的肾脏替代组织 | 干细胞衍生的肾脏组织 | 组织工程 | 肾脏疾病 | 合成生物学、空间模式控制、组织微环境调控 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 干细胞 | 组织基序引导与链式组装系统 | 医学 |
| 8 | 2026-02-12 |
Preparation strategies and biomedical applications of DNA hydrogels
2026-Feb-06, Chemical science
IF:7.6Q1
DOI:10.1039/d5sc08190d
PMID:41657654
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综述 | 本文总结了DNA水凝胶的制备策略及其在生物医学应用中的最新进展 | 利用DNA作为结构框架或交联剂,DNA水凝胶展现出高生物相容性、可编程响应性和特异性识别功能 | 讨论了DNA水凝胶发展中的当前挑战 | 总结DNA水凝胶的制备策略并分析其在生物医学领域的应用优势 | DNA水凝胶 | 材料科学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 9 | 2026-02-12 |
STRAIGHT-IN: a platform for rapidly generating panels of genetically modified human pluripotent stem cell lines
2026-Feb, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-024-01039-2
PMID:39179886
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研究论文 | 本文介绍了一种名为STRAIGHT-IN的平台,用于快速生成基因修饰的人类多能干细胞系 | 开发了一种结合丝氨酸/酪氨酸重组酶的高通量基因整合平台,能够实现>50 kb大片段DNA的精准整合,并通过选择标记优化实现100%的靶向效率 | 平台建立后仍需1.5-3个月完成整个流程,且需要研究人员具备分子生物学和标准细胞培养技能 | 解决哺乳动物细胞中大片段DNA靶向整合的技术难题 | 人类多能干细胞(hPS细胞) | 合成生物学 | NA | Bxb1整合酶介导的位点特异性整合,Cre重组酶介导的辅助序列切除 | NA | NA | NA | Bxb1, Cre recombinase | 人类多能干细胞 | 包含选择标记表达条件的基因回路设计,用于确保供体质粒的正确靶向 | 医学, 药物发现 |
| 10 | 2026-02-12 |
Development of a Tool for High-Efficiency, Markerless and Iterative Genome Editing in Shouchella clausii
2026-Feb, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.70287
PMID:41662148
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研究论文 | 开发了一种用于Shouchella clausii的高效、无标记和迭代基因组编辑工具,基于温度敏感型穿梭载体pM4B522 | 优化了高渗电穿孔协议,并设计了兼容Golden Gate组装的穿梭载体,实现了在S. clausii和Bacillus subtilis中的高效、无疤痕基因组编辑 | 未明确提及编辑效率在所有菌株中的普适性或长期稳定性 | 促进S. clausii作为微生物底盘的发展,用于生物治疗、工业生物技术和环境应用 | Shouchella clausii DSM 8716和Bacillus subtilis 168 | 合成生物学 | NA | 高渗电穿孔、Golden Gate组装、基因组编辑 | NA | NA | 涉及S. clausii和B. subtilis菌株,具体样本数量未明确 | Golden Gate Assembly | Shouchella clausii, Bacillus subtilis, E. coli | 温度敏感型E. coli-S. clausii穿梭载体pM4B522,包含壮观霉素抗性标记和红色荧光蛋白报告基因,用于两步pop-in/pop-out整合策略 | 生物治疗, 工业生物技术, 环境 |
| 11 | 2026-02-12 |
Light force-powered cellular medical micromachines
2026, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2026.1746261
PMID:41658983
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综述 | 本文系统综述了光力驱动的细胞微机器(包括趋化细菌、光合微藻、红细胞、免疫细胞和亚细胞结构)的设计策略及其在靶向药物递送、微创手术和免疫治疗中的应用 | 提出将天然生物细胞与可编程光镊技术相结合,克服传统人工合成材料微机器在生物安全性和深部组织疗效方面的限制 | 存在组织穿透深度有限、光毒性管理以及操作智能化不足等关键挑战 | 探讨光力驱动的细胞微机器在精准医疗中的应用潜力与发展方向 | 趋化细菌、光合微藻、红细胞、免疫细胞和亚细胞结构 | 生物医学工程 | NA | 光镊技术、光子技术 | NA | NA | NA | NA | 细菌、微藻、人类红细胞、免疫细胞 | NA | 医学 |
| 12 | 2026-02-11 |
Advances in synthetic biology for engineering methylotrophic microbial cell factories
2026-Feb-10, Journal of bacteriology
IF:2.7Q3
DOI:10.1128/jb.00383-25
PMID:41665342
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综述 | 本文综述了合成生物学在工程化甲基营养型微生物细胞工厂方面的最新进展,包括构建高效甲醇利用途径、优化氧化效率和氧化还原平衡等策略 | 总结了通过合成生物学和代谢工程策略提升甲醇同化效率的创新方法,如工程化甲醇脱氢酶和优化辅因子利用 | NA | 促进工业甲醇利用和可持续发展,通过设计高性能微生物平台 | 甲基营养型微生物细胞工厂 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、代谢工程、适应性实验室进化 | NA | NA | NA | NA | 甲基营养型微生物 | 高效甲醇利用途径、甲醇脱氢酶工程、氧化还原平衡优化 | 工业生物技术、能源、环境 |
| 13 | 2026-02-11 |
Self-assembling protein cages: from coiled-coil module to machine learning-driven de novo design of next-generation biomaterials
2026-Feb-09, Materials advances
IF:5.2Q2
DOI:10.1039/d5ma00792e
PMID:41446439
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综述 | 本文综述了基于卷曲螺旋或其他模块化蛋白结构域的工程化蛋白笼设计策略、功能化及其定制化应用前景 | 结合模块化蛋白设计、相互作用表面计算设计及基于机器学习的生成式蛋白设计,推动蛋白笼设计的革命性进展 | NA | 探讨自组装蛋白纳米笼的理性设计及其在合成生物学、生物技术和生物医学中的应用 | 自组装蛋白纳米笼 | 机器学习 | NA | 机器学习驱动的生成式蛋白设计 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 生物技术, 生物医学 |
| 14 | 2026-02-11 |
p-Benzoyl-l-phenylalanine as a Multifunctional Noncanonical Amino Acid in Synthetic Biology: Photoprobing, Photocatalysis, and Structural Programming for Biocontainment
2026-Feb-09, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202525502
PMID:41664298
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综述 | 本文综述了对苯甲酰-L-苯丙氨酸(pBzF)作为一种多功能非经典氨基酸在合成生物学中的应用,涵盖光探针、光催化和结构编程等领域 | 确立pBzF作为一种多功能光化学和结构基序,用于构建具有非天然、光响应和催化功能的蛋白质,并展示其在光驱动转化和人工光合系统中的应用 | NA | 探讨pBzF在合成生物学中的多功能应用,包括光化学、结构编程和生物控制 | 对苯甲酰-L-苯丙氨酸(pBzF)及其在蛋白质工程中的应用 | 合成生物学 | NA | 遗传编码、定向进化 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学、工业生物技术 |
| 15 | 2026-02-11 |
Metabolomics-guided engineering of drought-resilient crops: Integrating multi-omics and AI for climate-smart agriculture
2026-Feb-07, Plant science : an international journal of experimental plant biology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.plantsci.2026.113025
PMID:41662977
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综述 | 本文综述了代谢组学在指导工程化培育抗旱作物中的应用,并探讨了其与多组学、CRISPR基因编辑、合成生物学及人工智能等技术整合的转化框架 | 强调将代谢组学与CRISPR基因编辑、通路工程、合成生物学及人工智能等前沿技术整合,构建从实验室发现到田间应用的转化框架,推动代谢组学从诊断工具发展为预测与指导平台 | NA | 为应对干旱胁迫对全球粮食安全的威胁,建立一个整合多组学与人工智能的转化框架,以工程化培育抗旱作物,实现气候智能型农业 | 作物(特别是面临干旱胁迫的作物)及其代谢组 | NA | NA | 代谢组学,多组学整合,CRISPR基因编辑,通路工程,合成生物学,人工智能预测建模 | 人工智能驱动预测模型 | 代谢组学数据,多组学数据 | NA | CRISPR | 作物(植物) | 通路工程 | 农业 |
| 16 | 2026-02-11 |
Biotechnological advances in key regulatory genes of phenylpropanoid and terpenoid biosynthesis pathways in Panax ginseng: Current insights and future prospects
2026-Feb-07, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108840
PMID:41663015
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综述 | 本文综述了人参中苯丙烷类和萜类生物合成途径关键调控基因的生物技术研究进展,包括基因发现、功能表征及代谢工程应用 | 整合了基因组编辑、CRISPR调控、代谢工程和合成生物学等前沿技术,以重编程代谢流并增强人参皂苷等代谢物生产 | NA | 阐明和操纵人参中苯丙烷类和萜类生物合成途径的关键基因,以开发具有改善生物活性化合物谱的优良人参品种 | 人参(Panax ginseng)及其次级代谢产物(如黄酮类、多酚和人参皂苷) | 合成生物学 | NA | 基因组编辑、CRISPR调控、代谢工程、合成生物学、组学策略、系统生物学模型 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 人参(Panax ginseng)细胞或组织 | 代谢途径重编程以增强苯丙烷类和萜类(特别是人参皂苷)生物合成 | 医药 |
| 17 | 2026-02-11 |
Recent advances of engineered bacteria for therapeutic applications
2026-Feb-04, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2025.11.013
PMID:41234015
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综述 | 本文系统回顾了工程化细菌在治疗应用中的最新进展,重点关注其在疾病干预中的多功能生物治疗平台作用 | 通过合成生物学方法,结合计算建模和模块化基因电路设计,克服了细菌固有的功能限制,提高了治疗的时空精度、生物安全性和可扩展性 | NA | 探讨工程化细菌作为治疗策略的发展、测试及其在肿瘤治疗和代谢紊乱管理中的应用 | 工程化细菌系统 | 合成生物学 | 肿瘤、代谢紊乱 | 合成生物学、基因工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 细菌 | 模块化基因电路设计,如生物传感器、逻辑门 | 医学 |
| 18 | 2026-02-11 |
Engineering plasmids with synthetic origins of replication
2026-Feb-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68907-1
PMID:41629321
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研究论文 | 本文通过重构天然pMB1复制起点,开发了具有可定制拷贝数的合成复制起点(SynORI)质粒,并展示了其在微生物中的兼容性和模块化应用 | 首次创建了基于合成RNA调控器的可兼容复制起点,实现了独立拷贝控制和对环境信号的多重响应报告 | NA | 开发可调谐、兼容且模块化的合成质粒复制起点,以克服天然质粒在工程应用中的限制 | 质粒复制起点(pMB1)及其合成版本(SynORI) | 合成生物学 | NA | 合成生物学工程 | NA | NA | NA | 合成RNA调控器 | E. coli | 可调谐复制起点、合成RNA调控器、信号响应模块 | 工业生物技术 |
| 19 | 2026-02-11 |
Microbial Systems Enhancing CAR-Based Therapies: A Synthetic Biology Paradigm for Next-Generation Cancer Immunotherapy
2025-Dec-27, Current microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00284-025-04679-z
PMID:41454921
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综述 | 本文系统综述了利用合成生物学方法改造微生物系统,以解决CAR免疫疗法在实体瘤应用中面临的挑战 | 提出将工程化益生菌株作为可编程工厂,用于合成抗原、递送共刺激域和调节肿瘤微环境,并通过CRISPR/Cas工程化遗传电路实现治疗载荷的精确时空控制 | 临床转化的主要障碍包括生物防护挑战、对肿瘤归巢特异性的机制理解不完整以及安全性验证要求 | 评估微生物系统作为创新平台,以解决CAR免疫疗法在实体瘤应用中的局限性,并推动临床转化 | 工程化微生物系统(如大肠杆菌Nissle 1917)及其在CAR-T细胞疗法中的应用 | 合成生物学 | 癌症 | CRISPR/Cas, 合成生物学方法 | NA | 文献数据(389篇同行评审研究) | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 遗传电路,用于精确时空控制治疗载荷 | 医学 |
| 20 | 2026-02-11 |
Application of Rational and Irrational Strategies in the Construction of Prokaryotic Cell Factories for the Bioproduction of Aromatic Amino Acid-Derived Chemicals
2025-Nov-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00711
PMID:41137187
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综述 | 本文综述了用于生物生产芳香族氨基酸衍生化学品的原核细胞工厂的挑战、构建策略及最新技术,特别关注了理性与非理性策略的应用 | 聚焦于原核细胞工厂在芳香族氨基酸衍生化学品生产中的独特优势,系统总结了结合理性与非理性策略的构建方法,并探讨了该领域的未来潜在方向 | 本文是一篇综述,不包含原始实验数据,主要基于现有文献进行总结和分析 | 为生产芳香族氨基酸衍生化学品的专用细胞工厂的构建与优化提供有价值的见解和指导 | 用于生物生产芳香族氨基酸衍生化学品的原核细胞工厂 | 合成生物学 | NA | 代谢工程,合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 原核细胞 | NA | 工业生物技术 |