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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-08-30 |
Autoinducer 2 as a universal language in microbial consortia: decoding molecular mechanisms, ecological impacts, and application
2026-12-31, Gut microbes
IF:12.2Q1
DOI:10.1080/19490976.2026.2615494
PMID:41574816
|
综述 | 本文系统综述了自诱导物2(AI-2)在微生物群落中的分子机制、生态影响及应用,涵盖其结构动态、受体多样性、信号转导、代谢调控和多种应用领域 | 首次系统整合AI-2的双重结构动态(S-THMF-硼酸/R-THMF互变)及其环境依赖角色,并详细探讨了影响AI-2产生的内外部因素,为微生物通信在化学工程和环境可持续性中的应用提供了路线图 | 文章指出了AI-2介导的空间异质性和多群体感应系统协调方面的知识空白,未提供实验验证 | 解码AI-2在微生物群落中的分子机制、生态影响及应用,为利用微生物通信提供指导 | 自诱导物2(AI-2)及其介导的微生物群落交互 | 微生物学,合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 宿主健康,农业,工业,环境生态 |
| 2 | 2026-08-30 |
Engineered bacterial therapeutics from synthetic biology to clinical translation: A multi-database scientometric analysis, 2000-2026
2026-Dec, Human vaccines & immunotherapeutics
IF:4.1Q2
DOI:10.1080/21645515.2026.2720162
PMID:42641146
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综述 | 利用多数据库科学计量分析方法,梳理2000至2026年间工程细菌治疗领域的研究结构、合作模式及转化方向。 | 采用多数据库联合计量分析,并引入双图叠加引文轨迹和引文突现等指标,系统揭示工程细菌治疗从基础构建到临床转化的主题演变。 | 受限于检索数据库和语言筛选,可能遗漏部分非英语文献;2026年为部分检索年份,数据完整性和时效性存在局限。 | 绘制工程细菌治疗领域的知识图谱,评估研究趋势、合作模式及未来发展重点。 | 工程细菌治疗相关的中英文文献资料。 | 合成生物学、临床转化 | 癌症、肠道疾病 | NA | NA | 文献计量数据(包含摘要、引文、关键词等) | 1,730篇英文文章和综述 | NA | NA | NA | 医学 |
| 3 | 2026-08-30 |
Miniaturized CRISPR: Ultra Compact Systems for In Vivo Delivery and Portable Diagnostics
2026-Sep, Annals of biomedical engineering
IF:3.0Q3
DOI:10.1007/s10439-026-04046-4
PMID:41712125
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综述 | 本文总结了小型化CRISPR系统(如Cas12f、CasX和迷你Cas9)在体内递送和便携式诊断中的应用进展,并讨论了相关挑战与未来机遇。 | 强调了超紧凑CRISPR系统相比传统SpCas9在分子量小、结构简单方面的优势,并探讨了AI辅助蛋白设计和合成生物学在该领域的应用潜力。 | 综述性文章,未包含原始实验数据;讨论了脱靶效应、递送障碍和监管要求等未解决的挑战。 | 总结小型化CRISPR系统在治疗性基因编辑和便携式诊断平台中的应用进展及未来发展方向。 | 小型化CRISPR系统(Cas12f、CasX、迷你Cas9)及其在体内基因编辑和诊断中的应用。 | 合成生物学 | NA | CRISPR基因编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, CRISPR-Cas12f, CRISPR-CasX | NA | NA | 医学, 诊断 |
| 4 | 2026-08-30 |
Advances in prime editing: Molecular innovations, Large-fragment engineering, and AI-driven design
2026-Sep, Biodesign research
DOI:10.1016/j.bidere.2026.100104
PMID:42662231
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综述 | 本文综述了引物编辑技术的最新进展,包括核心组件的分子创新、大片段编辑策略和人工智能驱动的设计工具,并探讨其在医学、农业和合成生物学中的广泛应用。 | 全面总结了引物编辑在Cas蛋白变体、逆转录酶工程和pegRNA设计上的迭代创新,并重点介绍了TwinPE、PASTE和PrimeRoot等大片段编辑平台以及AI驱动的设计工具对编辑效率和可预测性的提升。 | 未明确讨论引物编辑技术当前的局限性,如脱靶效应、递送挑战或临床应用中的障碍。 | 综述引物编辑技术的分子创新、大片段工程和AI设计方法,展示其作为可编程和可扩展基因组编辑平台的潜力。 | 引物编辑技术及其核心组件,包括Cas蛋白、逆转录酶、pegRNA和大片段编辑平台。 | 基因组编辑 | NA | 引物编辑 | NA | NA | NA | NA | 多种生物系统 | NA | 医学, 农业, 合成生物学 |
| 5 | 2026-08-30 |
Application and progress of synthetic biology technology in amino acid production
2026-Aug-28, Bioprocess and biosystems engineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1007/s00449-026-03389-5
PMID:42663654
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综述 | 本文综述了合成生物学技术在氨基酸生产中的应用与进展,涵盖代谢途径设计、基因回路、动态调控及高通量筛选平台,并探讨了生产策略和关键瓶颈 | 系统整合了合成生物学在氨基酸生产中的多种技术,包括非天然氨基酸生产策略,并讨论了宿主细胞适应性进化和代谢通量平衡等瓶颈解决方案 | 未提供具体实验数据或案例深入分析,主要基于现有文献的整合与评论 | 探索合成生物学策略以推进生物合成氨基酸的生产,解决传统生产方法的局限 | 天然氨基酸、支链氨基酸及非天然氨基酸的生产系统 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、基因回路设计、动态调控、高通量筛选 | NA | 文献资料 | NA | NA | NA | 代谢途径重建、遗传电路、动态调控系统 | 食品、动物饲料、医药、化妆品 |
| 6 | 2026-08-30 |
Revisiting plant-microbe interaction mechanisms for developing efficient biostimulants
2026-Aug-28, Folia microbiologica
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12223-026-01575-2
PMID:42663807
|
综述 | 本文综述了根际通讯和根系分泌物介导的信号机制,探讨了促进有益植物-微生物互作的策略,并分析了影响其田间应用的技术挑战,旨在开发高效微生物生物刺激素。 | 重新审视植物-微生物互作的基本机制,整合微生物群落、多组学技术、合成生物学和制剂技术等新兴策略,以开发可规模化田间验证的微生物生物刺激素。 | 当前对植物如何与微生物通讯、建立根系定殖和适应田间环境的机制理解不足,导致微生物生物肥料应用效果不稳定。 | 通过深入理解根际通讯和根系分泌物介导的信号机制,开发高效、可持续的微生物生物刺激素,促进可持续农业发展。 | 植物根际微生物互作,包括根际微生物群落、根系分泌物和信号分子。 | 微生物组学 | NA | 多组学技术 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 植物(根际微生物) | 微生物群落信号通路 | 农业 |
| 7 | 2026-08-30 |
Integrating Machine Learning and Transcriptomics to Enhance β‑Carotene Production in Saccharomyces cerevisiae
2026-Aug-25, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.6c06012
PMID:42662202
|
研究论文 | 本研究利用机器学习指导的组合菌株工程和转录组分析,在酿酒酵母中增强β-胡萝卜素的产量 | 将XGBoost机器学习模型应用于DBTL循环以预测复杂的组合设计,并结合转录组洞察指导铁补充策略,从而显著提高β-胡萝卜素产量 | 未明确说明局限性 | 通过合成生物学和机器学习优化微生物生产,增强β-胡萝卜素在酿酒酵母中的产量 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)及其甲羟戊酸(MVA)途径 | 合成生物学、机器学习 | NA | 转录组学(RNA-seq) | XGBoost | 转录组数据、产量数据 | 涉及多个菌株变体及培养条件(未提供具体样本数) | 启动子和终止子组合工程 | 酿酒酵母 | MVA途径的限速酶表达微调(通过启动子和终止子组合) | 工业生物技术 |
| 8 | 2026-08-30 |
Closing the Loop with Gates: A Scale-up-Gated Design-Build-Test-Learn Framework for Industrial Fermentation
2026-Aug-19, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms14081830
PMID:42655176
|
综述 | 本文提出了一种“放大门控的DBTL”框架,通过在每个迭代阶段设置明确的决策门,以缩小实验室创新与工业发酵生产之间的差距。 | 在DBTL循环的每个阶段强制加入“决策门”,利用规模缩小模拟、下游加工兼容性、工业稳健性、技术经济分析和生命周期评估等指标作为评估和收敛标准,弥补了传统DBTL框架仅追求实验室最优而忽视工业可行性的缺陷。 | 分析基于定性跨部门研究,缺乏定量数据支撑,且所提框架的实际应用效果尚需进一步验证。 | 提出一种“放大门控的DBTL”框架,以促进合成生物学和人工智能在工业发酵中的整合,并从战略层面提出实现自主、规模感知生物制造的前提条件。 | 食品、制药、农业和能源行业的发酵过程。 | 合成生物学、人工智能 | NA | 规模缩小模拟、技术经济分析、生命周期评估 | NA | 定性数据 | NA | NA | NA | NA | 食品、医药、农业、能源 |
| 9 | 2026-08-30 |
Flax Lignans: From Biosynthetic Regulation to Biological Activities
2026-Aug-11, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27167162
PMID:42653167
|
综述 | 本文综述了亚麻木酚素的生物合成途径、关键酶、调控机制及其多种生物活性,并讨论了工业应用中的限制和未来策略。 | 系统总结了亚麻木酚素的生物合成调控和生物活性,并提出合成生物学、分子育种和绿色提取技术等前沿解决方案,以促进其工业转化。 | 工业应用中存在提取工艺复杂、生产成本高、质量标准不统一和临床证据不足等限制。 | 为亚麻木酚素在食品、制药和化妆品领域的机制研究、产品开发和工业转化提供概念参考。 | 亚麻木酚素,特别是开环异落叶松脂素二葡萄糖苷。 | 植物生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 亚麻 | NA | 食品、制药、化妆品 |
| 10 | 2026-08-30 |
Recombinant Thermostable DNA Polymerases: Current Approaches to Production, Molecular Engineering, and Applications in Biotechnology and Diagnostics
2026-Aug-11, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27167188
PMID:42653192
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综述 | 本文综述了重组热稳定DNA聚合酶的生产方法、分子工程策略及其在生物技术和诊断学中的应用 | 全面总结了热稳定DNA聚合酶的分子工程方法,包括理性设计、定点突变、定向进化和结构域工程,以及热启动聚合酶和嵌合多功能聚合酶的开发技术 | 未提及具体实验数据或深入比较不同工程方法的优劣 | 总结重组热稳定DNA聚合酶的生产、分子工程和应用的当前进展,并展望未来发展方向 | 热稳定DNA聚合酶(A家族和B家族) | 合成生物学 | NA | 重组DNA技术、蛋白质工程、定点突变、定向进化、结构域工程、高通量筛选 | NA | 文献数据 | NA | NA | 异源表达系统 | NA | 生物技术、诊断学、合成生物学 |
| 11 | 2026-08-30 |
Phage Therapy Enhanced by Using Engineered Bacteriophages: A Powerful Antibacterial Tool to Address the Dilemma Posed by Multidrug-Resistant Bacterial Infections
2026-Aug-08, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27167103
PMID:42653108
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综述 | 本文综述了如何利用合成生物学改造噬菌体以构建下一代抗菌疗法,应对多重耐药菌感染问题 | 系统阐述了通过CRISPR-Cas基因编辑、受体结合蛋白重编程、功能负荷递送和免疫原性调控等合成生物学工具克服天然噬菌体临床应用瓶颈的方法,并总结了最新临床进展和个性化治疗流程 | 文中提及临床应用的瓶颈包括生产标准化、监管框架构建和联合治疗方案开发等方面的挑战,但未详细展开具体限制 | 探讨利用合成生物学改造噬菌体以增强其抗菌能力,解决多重耐药菌感染带来的全球公共卫生危机 | 工程化噬菌体及多重耐药菌感染 | 合成生物学 | 多重耐药菌感染 | CRISPR-Cas基因编辑、受体结合蛋白重编程、功能负荷递送、免疫原性调控 | NA | 文献资料 | NA | CRISPR-Cas9 | 噬菌体 | NA | 医学 |
| 12 | 2026-08-30 |
The Female Reproductive Microbiome: Mechanistic Insights and Bioengineering Perspectives
2026-Aug-07, Biology
DOI:10.3390/biology15161337
PMID:42651642
|
综述 | 本文综述了女性生殖道微生物组在生殖健康中的作用,并探讨了微生物工程和合成生物学在生殖医学中的潜在应用 | 将微生物组知识与合成生物学和工程化活体生物治疗相结合,提出改善生殖医学的新策略 | 非系统性综述,缺乏标准化搜索协议,可能引入选择偏差;现有证据受限于小队列规模和方法学异质性 | 总结微生物组在女性生殖健康中的作用,并探讨工程化活体生物治疗在生殖医学中的前景 | 阴道、子宫和肠道微生物组 | 微生物组学 | 不孕症、植入失败、妊娠丢失 | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 13 | 2026-08-30 |
Microbial Synthesis of Precious Metal Nanoparticles and Their Applications: A Review
2026-Aug-06, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms14081726
PMID:42655071
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综述 | 本文综述了微生物合成贵金属纳米颗粒的研究进展,涵盖生物合成机制、应用及面临的挑战 | 系统总结了细菌、藻类和真菌中贵金属纳米颗粒的生物合成机制,并强调了合成生物学和代谢工程在提高生产可控性方面的潜在应用 | 存在控制纳米颗粒尺寸和形态、阐明生物合成机制以及实现大规模生产的挑战 | 综述微生物合成贵金属纳米颗粒的生物合成机制、应用以及未来发展方向 | 银、金、钯和铂等贵金属纳米颗粒,以及细菌、藻类和真菌等微生物 | 合成生物学 | 癌症 | NA | NA | 文献数据 | NA | NA | 细菌、藻类、真菌 | NA | 催化、环境修复、生物医学 |
| 14 | 2026-06-28 |
Better synthetic biology outcomes through balanced push-pull engineering
2026-Aug-04, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiag437
PMID:42361298
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 15 | 2026-08-30 |
Next-Generation Probiotics in Poultry: From Conventional Strains to Engineered and Synbiotic Approaches
2026-Jul-31, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms14081680
PMID:42655025
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综述 | 本文全面综述了下一代益生菌在家禽生产中的作用机制、技术进展及其在改善生产性能和健康方面的应用,并探讨了其面临的挑战和未来发展方向 | 系统整合了多组学驱动的菌株鉴定、工程化微生物系统、合成生物学、微胶囊化和合生元配方等先进技术,提出下一代益生菌相比传统益生菌具有更优的肠道定植、靶向抗菌和宿主免疫调节能力 | 存在菌株特异性差异、监管限制和现场验证不足等挑战,且目前缺乏大规模实际应用数据 | 评估下一代益生菌作为抗生素生长促进剂替代品的潜力,以维持家禽生产效率、动物健康和食品安全 | 家禽及其肠道微生物群,涉及传统益生菌和下一代益生菌菌株 | 微生物学 | 肠道感染性疾病 | 多组学、合成生物学、微胶囊化 | NA | 文献数据 | NA | CRISPR-Cas9, 合成生物学工具 | 家禽 | 工程化微生物系统 | 农业, 食品, 工业生物技术 |
| 16 | 2026-08-30 |
Microbiome Engineering in Dairy Cattle: A Critical Review of Strategies for Disease Resistance, Productivity, and Sustainable Farming
2026-Jul-31, Veterinary sciences
IF:2.0Q2
DOI:10.3390/vetsci13080766
PMID:42655786
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综述 | 本文评估了益生菌、益生元、粪便微生物群移植、宏基因组工具和基于CRISPR的合成生物学在奶牛微生物组工程中的应用,并利用技术就绪水平框架评估其转化成熟度 | 采用技术就绪水平1-9框架系统评估奶牛微生物组工程策略的转化成熟度,并强调从群体水平向精准个体化给药转变的关键转化缺口 | 干预失败主要源于宿主-微生物组错配而非微生物产品设计,且缺乏标准化数据基础设施和监管框架 | 解决奶牛生产中的抗微生物耐药性、全球食品需求和减少肠道甲烷排放的监管要求三大挑战 | 奶牛微生物组工程策略,包括益生菌、益生元、粪便微生物群移植、宏基因组工具和CRISPR合成生物学 | 微生物组工程 | 抗微生物耐药性 | 宏基因组、CRISPR | NA | 文献数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 奶牛 | 工程化瘤胃细菌 | 农业、环境 |
| 17 | 2026-08-30 |
Engineering Plant-Associated Soil Microbiomes for Sustainable and Climate-Resilient Agriculture: Mechanisms, Technologies, and Applications
2026-Jul-28, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms14081648
PMID:42654994
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综述 | 本文全面综述了植物相关土壤微生物组在可持续和气候适应性农业中的机制、技术及应用,包括微生物组组装、功能、植物-微生物互作、胁迫抗性以及多种工程策略。 | 整合了多组学技术、系统生物学和人工智能在微生物组工程中的应用,强调了精准微生物组工程和合成生物学方法的前景。 | 大规模实施仍面临田间变异性、定殖稳定性、生物安全、监管框架和数据集成等挑战。 | 探讨植物相关土壤微生物组的工程策略及其在可持续和气候适应性农业中的应用,以提升作物生产、养分管理和生物防治。 | 植物相关土壤微生物组及其在农业生态系统中的功能和互动。 | 微生物组学,人工智能 | NA | 高通量测序、多组学技术(包括宏基因组学、代谢组学、宏转录组学)、系统生物学、人工智能 | 机器学习 | 多组学数据(基因组、转录组、代谢组) | NA | 合成生物学 | 植物相关土壤微生物 | 合成微生物群落(SynComs),微生物接种剂,微生物组移植,根际引导,合成生物学干预 | 农业、环境 |
| 18 | 2026-08-30 |
Application of melanin and its engineered nanomaterials in tumor radiotherapy: a review
2026-04-16, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08133-x
PMID:41992285
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综述 | 系统综述了黑色素及其工程化纳米材料在肿瘤放射治疗中的双向作用,包括放射保护和放射增敏机制,并探讨了未来挑战与临床转化前景 | 首次系统分析黑色素及其工程化纳米材料在肿瘤放疗中的双向作用,提出通过合成生物学和纳米技术将放疗抵抗转化为放疗增敏的多功能纳米平台策略,并扩展到广谱增敏应用 | 主要挑战在于开发智能响应材料并系统评估其长期生物安全性,以推动个性化放疗增敏策略的临床转化 | 分析黑色素及其工程化纳米材料在肿瘤放疗中的双向作用机制,并探索实现双向精准放疗和广谱放疗增敏的策略 | 黑色素及工程化黑色素纳米材料(EMNMs),包括黑色素样物质如聚多巴胺(PDA),以及色素性肿瘤如黑色素瘤 | 纳米医学、合成生物学 | 肿瘤 | NA | NA | 文献数据 | NA | 合成生物学、纳米技术 | NA | 多功能纳米平台(通过原子掺杂、结构设计和功能负载构建) | 医学 |
| 19 | 2026-08-30 |
Thailand's Synthetic Biology Strategy
2026 Jan-Dec, Engineering biology
DOI:10.1049/enb2.70006
PMID:42662237
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评论 | 本文概述了泰国合成生物学的发展机遇、面临的挑战以及为期十年的工程与合成生物学战略,旨在通过构建支持性生态系统、加强知识基础和提升工业技术能力来促进可持续国家增长 | 提出了一个针对泰国国情的十年期综合战略,涵盖生态系统建设、知识强化和工业能力提升三个主要部分,以推动合成生物学在多个领域的应用 | 摘要中未提及具体实施细节或潜在风险,缺乏对战略可行性和效果的深入分析 | 制定并描述泰国工程与合成生物学战略,以促进创新和高价值产品与服务的发展,支持可持续增长 | 泰国的合成生物学研究体系、政策框架和工业应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业, 食品, 化学品, 生物材料, 能源, 制药, 医疗保健 |
| 20 | 2026-08-29 |
The role of gut microbiome in aging-associated diseases: where do we stand now and how technology will transform the future
2026-12-31, Gut microbes
IF:12.2Q1
DOI:10.1080/19490976.2025.2607076
PMID:41454672
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综述 | 本文综述了肠道微生物组在衰老相关疾病中的作用,并探讨了多组学、合成生物学和人工智能等技术如何推动该领域的未来发展和临床转化 | 提出了一个名为PRIME的五阶段路线图,整合了功能多组学、合成生物学、人工智能分析、生物样本库和自体粪便微生物移植等前沿技术,以促进精准医学和健康老龄化 | 未明确提及具体局限性 | 总结肠道微生物组与衰老相关疾病的关联,并探讨新兴技术如何改变研究格局和干预设计,最终促进精准医学和健康老龄化 | 肠道微生物组及其与衰老相关疾病(如感染性疾病、自身免疫病、神经退行性疾病、癌症、代谢性疾病等)的关联 | 微生物组学、合成生物学、人工智能 | 衰老相关疾病 | 多组学、合成生物学、人工智能分析、生物样本库、自体粪便微生物移植 | NA | 文本和概念性数据 | NA | 合成生物学 | 人类肠道微生物组 | NA | 医学 |