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当前共找到 5869 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-10-19 |
Microalgae-based removal and biodegradation of antibiotics: mechanisms, synergistic consortia, and engineering prospects
2026-Oct-17, Biodegradation
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s10532-026-10393-9
PMID:42891879
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综述 | 综述微藻去除与生物降解抗生素的机制、藻菌协同 Consortium 及工程化前景 | 将藻菌颗粒污泥协同、藻际界面耐药基因调控与合成生物学、机器学习等工程工具整合为系统框架 | 固定化、合成生物学与机器学习等新兴工具的可扩展性与长期性能尚未验证 | 总结微藻去除抗生素的机制并探索可持续低碳生物修复技术路线 | 微藻、藻际共生细菌、藻菌颗粒污泥系统及抗生素污染物 | 环境生物技术 | NA | 生物吸附、酶介导转化、共代谢、固定化、合成生物学、机器学习 | 机器学习 | 文本 | NA | 固定化, 合成生物学, 机器学习 | 微藻, 细菌 | NA | 环境, 医学 |
| 2 | 2026-10-19 |
Smart carrier-engineered microbial consortia for precision nutrient delivery in next- generation biofertilizers
2026-Oct-17, Folia microbiologica
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12223-026-01613-z
PMID:42891916
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综述 | 本文综述了工程化微生物联合体与智能载体系统在下一代生物肥料中的最新进展，重点讨论封装技术和控释系统以提高养分利用效率 | 将合成生物学工程化的微生物联合体与先进智能载体技术（如生物聚合物水凝胶、纳米材料、响应性封装基质）相结合，实现微生物的保护、控释和土壤持久性 | 传统微生物接种剂田间表现不稳定，微生物在田间条件下存活率有限，环境因素影响大，养分释放控制不佳 | 探讨工程化微生物联合体、先进封装技术和控释系统在提高下一代生物肥料养分利用效率方面的应用 | 工程化微生物联合体、智能载体系统、生物肥料 | 合成生物学, 农业生物技术 | NA | 合成生物学, 微生物工程, 生物材料, 封装技术（喷雾干燥、离子凝胶化、挤出、微流控封装） | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 农业 |
| 3 | 2026-10-19 |
From oleaginous microalga to marine chassis: synthetic biology and process-aware biomanufacturing in Nannochloropsis
2026-Oct-17, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.109079
PMID:42892548
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综述 | 本文综述了海洋微藻Nannochloropsis从产油微藻向海洋光合生物制造底盘发展的合成生物学工具与工艺感知生物制造进展 | 系统评估Nannochloropsis作为可预测、可复用、工艺感知海洋底盘是否成熟，强调按产品定制底盘配置而非通用菌株的策略 | 目标产物水平仍受基因组位点、菌株背景、细胞内区室、生理状态和培养条件强烈影响，缺乏可复用基因组架构、可靠的细胞器靶向规则、动态调控及适配DBTL流程的表型分析 | 评估Nannochloropsis合成生物学进展是否足以支撑其成为可预测、可复用且工艺感知的海洋光合生物制造底盘 | 海洋微藻Nannochloropsis属 | 合成生物学, 代谢工程, 生物制造 | NA | CRISPR/Cas基因编辑, 同源重组, 核转化, 标记回收, 模块化多基因组装 | NA | 文献与基因组资源 | NA | CRISPR-Cas9, 同源重组, 标记回收 | Nannochloropsis | 代谢途径改造（碳分配、三酰甘油积累、EPA合成、类胡萝卜素代谢、重组蛋白生产、特色代谢物合成）与模块化多基因组装 | 工业生物技术, 食品, 医药, 材料 |
| 4 | 2026-10-19 |
Immuno-metabolic crosstalk in osteoarthritis: from mechanisms to therapies
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1946261
PMID:42889420
|
综述 | 本文综述了骨关节炎中免疫与代谢过程之间的双向交互作用及其机制，并探讨了针对该交互的新兴治疗策略 | 系统整合了免疫细胞激活与代谢功能障碍在骨关节炎中的双向串扰，并提出了结合多组学、人工智能和个性化医学的免疫代谢治疗新框架 | 为叙述性综述，未进行系统性文献检索与定量分析；免疫代谢过程的因果相关性及相对贡献在不同骨关节炎表型间存在差异，相关证据仍不充分 | 总结骨关节炎进展过程中免疫与代谢过程的双向串扰，并探讨靶向免疫代谢通路的治疗策略 | 骨关节炎及其炎症型和代谢失调型亚型 | 医学 | 骨关节炎 | 多组学技术 | NA | 文本 | NA | 基因编辑 | NA | NA | 医学 |
| 5 | 2026-10-19 |
Emerging ultrafast technologies in biotechnology
2025-May, 3 Biotech
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s13205-025-04309-2
PMID:40292246
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综述 | 本文综述了超快技术在生物技术中的变革性应用，包括飞秒激光基因编辑、超快光谱研究蛋白质折叠和酶催化、以及泵浦-探测显微镜和CARS成像等 | 系统整合了飞秒激光、超快光谱、泵浦-探测显微镜、CARS和阿秒光谱等超快技术在基因编辑、蛋白质折叠、酶催化、细胞动力学和电子动力学中的前沿应用，并强调与AI和纳米技术的融合 | 存在光损伤、与复杂生物系统整合困难以及伦理问题等挑战 | 总结超快技术在生物技术领域的应用进展与潜力 | 生物分子过程、蛋白质折叠、酶催化、CRISPR基因编辑、细胞动力学、神经活动和电子动力学 | 生物技术 | NA | 飞秒激光、超快光谱、泵浦-探测显微镜、相干反斯托克斯拉曼散射、阿秒光谱 | NA | 图像、光谱数据 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 医学、合成生物学、个性化医疗、药物发现、再生医学 |
| 6 | 2026-10-19 |
Prevention of ribozyme catalysis through cDNA synthesis enables accurate RT-qPCR measurements of context-dependent ribozyme activity
2025-04-16, RNA (New York, N.Y.)
DOI:10.1261/rna.080243.124
PMID:40050070
|
研究论文 | 本文开发并验证了一种RT-qPCR方法，通过抑制核酶活性来准确测量依赖上下文的自切割核酶活性。 | 发现在RNA提取和逆转录过程中核酶切割会导致测量偏差，并引入寡核苷酸抑制核酶活性以恢复RT-qPCR测量的准确性。 | 摘要未明确说明该方法在更广泛上下文或体内应用中的局限性。 | 开发一种准确测量依赖上下文的核酶活性的RT-qPCR方法。 | 自切割核酶RNA。 | 合成生物学 | NA | RT-qPCR | NA | RNA序列数据 | NA | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 7 | 2026-10-19 |
DNA/RNA hybrids avoid channel gating that leads to the continued packaging of numerous hybrids into the phi29 protein shell
2025-03-20, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf242
PMID:40193705
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研究论文 | 本文研究了phi29病毒包装马达对双链DNA和RNA/DNA杂合体的包装效率差异，发现RNA/DNA杂合体由于缺乏通道门控而能以更高拷贝数被包装进入蛋白外壳 | 首次揭示dsDNA与RNA/DNA杂合体在phi29蛋白外壳包装中的效率差异，发现通道门控仅由dsDNA触发，RNA/DNA杂合体可避免门控从而实现持续包装，并鉴定了马达通道中三个柔性环在门控中的作用 | 研究主要基于体外单通道电生理和蔗糖梯度超离心实验，尚未在活体病毒包装或体内递送场景中验证；门控机制的结构细节仍需更高分辨率的结构生物学数据支持 | 探究phi29 DNA包装马达中通道门控的触发机制，以及不同核酸类型（dsDNA与RNA/DNA杂合体）对包装效率和门控行为的影响 | phi29病毒DNA包装马达、dsDNA、RNA/DNA杂合体、dsRNA、phi29蛋白外壳 | 分子生物学、病毒学、合成生物学 | NA | 单通道电生理、蔗糖梯度超离心、单孔电导测定 | NA | 电生理信号、生化实验数据 | NA | NA | NA | NA | 医学、合成生物学、纳米技术 |
| 8 | 2026-10-18 |
Synthetic Biology Tools and Strategies for Microbial Cell Factory Construction
2027-Aug-02, Advances in biochemical engineering/biotechnology
DOI:10.1007/10_2026_363
PMID:42888301
|
综述 | 本章系统总结了构建和优化微生物细胞工厂的合成生物学工具与策略，涵盖基因编辑、代谢途径设计、系统生物学建模、计算工具与自动化筛选等 | 整合了从标准化生物元件、模块化设计到Design-Build-Test-Learn循环的系统工程框架，并强调了机器学习、人工智能、高通量筛选和实验室自动化在加速菌株开发与闭环DBTL循环中的作用 | 作为综述性章节，未提供原始实验数据或新的实验验证，主要基于已有文献进行归纳总结 | 总结构建微生物细胞工厂用于可持续生产燃料、化学品、药物及高附加值生物产品的主要工具和策略 | 微生物细胞工厂及代表性微生物底盘细胞 | 合成生物学 | NA | CRISPR基因组编辑、转录和翻译调控、模块化DNA组装、多组学分析、高通量筛选 | 基因组尺度代谢模型、机器学习、人工智能 | 多组学数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 微生物底盘细胞 | 代谢途径、动态调控、模块化基因线路 | 医药, 能源, 工业生物技术, 材料, 食品 |
| 9 | 2026-10-18 |
Targeted immune modulation through smart biomaterials and programmable biopharmaceuticals: A review
2026-Oct-16, Journal of biomaterials applications
IF:2.3Q4
DOI:10.1177/08853282261483961
PMID:42886884
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综述 | 本文综述了通过智能生物材料和可编程生物制药实现靶向免疫调节的最新进展，包括混合生物材料-生物制剂系统 | 系统总结了能响应疾病微环境信号（如pH变化、缺氧、氧化应激和炎症酶）的智能生物材料，以及通过工程化生物机制指导免疫细胞行为和分子信号的可编程生物制药，并强调了混合平台将环境响应性与生物治疗效力相结合的优势 | 存在生物复杂性、制造可扩展性、长期安全性评估和监管转化等挑战 | 探讨通过智能生物材料、可编程生物制药及混合系统实现靶向免疫调节，推动从传统全身免疫调节向自适应和位点特异性免疫控制转变 | 免疫介导疾病相关的免疫调节疗法、智能生物材料、可编程生物制药及混合生物材料-生物制剂系统 | 免疫工程 | 免疫介导疾病 | NA | NA | 文本 | 2022年至2026年间发表的同行评议研究 | NA | NA | NA | 医学 |
| 10 | 2026-10-18 |
Intratumoral microbiota in cancer immunotherapy: metabolic-epigenetic crosstalk and engineered bacterial therapeutics
2026-Oct-16, Experimental hematology & oncology
IF:9.4Q1
DOI:10.1186/s40164-026-00840-x
PMID:42888465
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综述 | 文章综述了肿瘤内微生物群通过代谢-表观遗传互作影响免疫治疗疗效的机制，以及工程化细菌作为可编程活体疗法在癌症免疫治疗中的应用 | 系统整合了肿瘤内微生物群代谢产物（短链脂肪酸、次级胆汁酸、氧化三甲胺、色氨酸衍生物）通过DNA甲基化、组蛋白修饰和非编码RNA重塑宿主表观遗传并调控抗肿瘤免疫的机制；同时总结了合成生物学工程菌实现肿瘤特异性定植、可控药物释放及多模式功能（细胞因子分泌、免疫检查点阻断、STING通路激活、代谢重编程）的治疗策略 | 存在异质性、抗载体免疫和制造复杂性等临床转化挑战 | 阐明肿瘤内微生物群在癌症免疫治疗中的代谢-表观遗传串扰机制，并探讨靶向肿瘤内微生物群的工程化细菌治疗策略 | 肿瘤内微生物群、微生物代谢产物、宿主免疫微环境、表观遗传景观、工程化细菌 | 肿瘤免疫学, 微生物组学, 合成生物学 | 癌症 | NA | NA | 文本 | NA | NA | 工程化细菌 | 工程化细菌活体治疗系统（肿瘤特异性定植、可控药物释放、细胞因子分泌、免疫检查点阻断、STING通路激活、代谢重编程） | 医学 |
| 11 | 2026-10-18 |
AI empowers scalable and programmable RNA design
2026-Oct-15, Molecular cell
IF:14.5Q1
DOI:10.1016/j.molcel.2026.09.025
PMID:42880215
|
综述 | 探讨人工智能如何利用三级结构来指导功能RNA的序列设计与生成，从而替代传统试错流程 | 强调以三级结构为基础、由AI驱动序列生成的可扩展、可编程RNA设计新范式 | 未具体说明模型性能、数据规模及实验验证范围 | 总结AI在功能RNA设计中的应用，并展望可扩展、可编程的RNA设计路径 | 功能性RNA分子及其三级结构 | 合成生物学，RNA治疗 | NA | 人工智能辅助的RNA设计，实验结构测定 | NA | RNA结构数据，序列数据 | NA | NA | NA | NA | 医学，工业生物技术 |
| 12 | 2026-10-18 |
The Potential of Self-Maintainable Living Materials
2026-Oct-14, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.78082
PMID:42873924
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综述 | 本文综述了工程活体材料（ELMs）的设计原理、当前挑战及转化路径，探讨其作为自维持自主系统的潜力 | 将自主性定位为下一代活体材料的定义性能力，系统整合合成生物学中的可编程基因电路、群体感应通信和代谢工程，实现闭环决策与最小外部输入下的功能维持 | 在进化稳定性、生物防护、长期存活性和可规模化制造方面仍存在关键挑战 | 考察自维持自主活体材料的设计原理、当前挑战和转化路径，以实现其在真实环境中的持续运行 | 工程活体材料（ELMs），包括整合了微生物、真菌、藻类和哺乳动物细胞的結構支架系统 | 合成生物学 | NA | 可编程基因电路，群体感应通信，代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 微生物，真菌，藻类，哺乳动物细胞 | 可编程基因电路，群体感应通信，闭环决策系统 | 建筑，农业，环境修复，生物能源，生物医学 |
| 13 | 2026-10-18 |
Synthetic Approaches as Empirical Tools for Testing Evolutionary Theory
2026-Oct-01, Genome biology and evolution
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/gbe/evag245
PMID:42817818
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综述 | 综述合成方法（如深度突变扫描、祖先序列重建、受控进化和合成生物学）如何作为实证工具检验进化理论的基本问题 | 系统梳理高通量图谱、重建实验、受控进化和合成生物学等方法在检验突变效应分布、适应度地形、可进化性、发育约束、历史偶然性等进化理论问题中的新发现 | 作为综述，未提供原始实验数据，且合成方法在模拟自然进化复杂性方面仍存在局限 | 探讨合成方法如何重塑和扩展进化生物学的基础理论问题 | 进化理论中的核心问题，包括突变效应分布、适应度地形结构、可进化性、发育约束、历史偶然性和进化系统工程 | 进化生物学 | NA | 深度突变扫描、祖先序列重建、受控进化、合成生物学 | NA | 序列、表型 | NA | NA | NA | NA | 基础研究 |
| 14 | 2026-10-18 |
Evolutionary chemical learning in dimerization networks
2026-Sep, Physical review. E
DOI:10.1103/bszq-gftl
PMID:42888651
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研究论文 | 本文提出了基于竞争性二聚化网络（CDN）的化学学习框架，通过定向进化在体外训练网络，实现多类分类等学习任务 | 利用分子物种间的可逆二聚化作为可调突触权重，通过定向进化（突变、选择、扩增）在无数字硬件和无需预知所有微观结合常数的情况下训练网络完成学习任务，并引入对比增强损失函数提升性能 | 研究基于数值模拟，尚未进行实际体外实验验证；依赖定向进化过程可能耗时且受实验条件限制 | 探索竞争性二聚化网络作为化学学习平台的可行性，实现模拟物理计算并连接合成生物学与机器学习 | 竞争性二聚化网络（CDN），由蛋白质或DNA-RNA寡聚体等分子物种组成 | 机器学习, 合成生物学 | NA | 定向进化, 数值模拟 | 竞争性二聚化网络（CDN） | 数值模拟数据, 分子结合亲和力数据 | NA | 定向进化, 突变, 选择, 扩增 | NA | 竞争性二聚化网络（CDN），分子物种类似神经元，结合亲和力作为可调突触权重 | 医学, 工业生物技术 |
| 15 | 2026-10-18 |
The plant Golden Gate toolkit: compatibility, interoperability, and harmonized assembly in plant synthetic biology
2026-Jul-21, Plant methods
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s13007-026-01563-0
PMID:42482144
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综述 | 该综述全面概述了超过25种成熟的植物特异性Golden Gate克隆试剂盒，深入探讨了其模块的兼容性，并提出了提高系统协调性的关键方法 | 系统梳理了植物特异性Golden Gate克隆试剂盒的兼容性与互操作性，提出了包括驯化策略、甲基化酶辅助的分级DNA组装以及多克隆位点在内的系统协调化方法 | 作为综述文章，未提供新的实验数据验证所提出的协调化策略 | 改善植物合成生物学中Golden Gate克隆试剂盒之间的兼容性与互操作性，简化克隆工作流程并降低新技术门槛 | 超过25种植物特异性Golden Gate克隆试剂盒及其模块 | 合成生物学 | NA | Golden Gate克隆 | NA | 文本 | 超过25种植物特异性Golden Gate克隆试剂盒 | Golden Gate Assembly | 植物 | 遗传模块和转录单元的标准化组装 | 农业 |
| 16 | 2026-10-18 |
Epigenetic landscape of Leishmania-host interactions
2025-12, Epigenomics
IF:3.0Q2
DOI:10.1080/17501911.2025.2574836
PMID:41099169
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综述 | 本文综述了利什曼原虫与宿主相互作用的表观遗传景观，包括物种特异性表观遗传变化、宿主免疫信号调控机制以及基于表观遗传和合成生物学的治疗策略 | 系统总结了利什曼原虫与宿主互作中的表观遗传修饰（如染色质重塑、组蛋白PTMs、ncRNAs），并首次提出合成基因电路可调控宿主和寄生虫表观基因组，将合成生物学与表观遗传学结合用于利什曼病控制 | 作为综述文章，未提供原始实验数据验证；合成基因电路调控表观基因组的策略仍处于概念阶段，缺乏体内验证 | 阐明利什曼原虫与宿主相互作用的表观遗传机制，并探讨表观遗传学和合成生物学策略在控制利什曼病中的未来潜力 | 利什曼原虫（不同物种）及其宿主（包括共感染和共病模型） | 表观遗传学, 合成生物学, 感染免疫学 | 利什曼病 | 结构化文献综述（Web of Science, PubMed, Scopus），涉及表观遗传修饰分析（染色质重塑、组蛋白翻译后修饰、非编码RNA） | NA | 文本 | NA | 合成基因电路 | 利什曼原虫, 哺乳动物宿主细胞 | 合成基因电路用于调控宿主和寄生虫表观基因组 | 医学 |
| 17 | 2026-10-18 |
Decoding and reengineering the promoter specificity of T7-like RNA polymerases based on phage genome sequences
2025-02-27, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf140
PMID:40042813
|
研究论文 | 该文通过挖掘噬菌体基因组中的启动子，揭示了T7类RNA聚合酶与启动子特异性相互作用的规则，并基于此重新设计了正交的RNAP-启动子变体 | 首次对多种噬菌体单亚基RNA聚合酶及其启动子进行系统性基因组挖掘，利用直接耦合分析揭示了决定特异性的关键氨基酸和核苷酸位点，并构建了稀疏连接网络，设计出比现有更严格正交的T7 RNAP-启动子变体及具有新相互作用的变体 | 研究主要基于计算预测和有限实验验证，未全面覆盖所有ssRNAPs的多样性，且设计的变体在体内应用中的正交性和效率需进一步评估 | 揭示T7类RNA聚合酶与启动子序列共变异的规则，并用于工程化新型RNAP-启动子对 | 噬菌体单亚基RNA聚合酶（ssRNAPs）及其同源启动子，特别是T7类RNA聚合酶 | 合成生物学 | NA | 基因组挖掘、直接耦合分析、序列共变异分析 | NA | 序列 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 18 | 2026-10-18 |
The mutational landscape of Bacillus subtilis conditional hypermutators shows how proofreading skews DNA polymerase error rates
2025-02-27, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf147
PMID:40057377
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研究论文 | 该研究构建了枯草芽孢杆菌的条件性超突变体，以解析DNA聚合酶初始核苷酸选择性、校对和错配修复对突变率的贡献 | 构建了带有polC校对缺陷等位基因和/或mutL缺陷等位基因的条件性超突变体，丰富了定向进化的合成生物学工具箱，并使用数学模型分析了错误逃逸MMR和校对的表观概率 | 分析中面临处理可能异质性突变聚合计数的困难，以及对野生型中导致突变的途径未知的困难 | 解析DNA聚合酶初始核苷酸选择性、DNA聚合酶校对和错配修复对突变率的贡献 | 枯草芽孢杆菌（Bacillus subtilis） | 合成生物学 | NA | 突变累积实验 | 数学模型 | NA | NA | NA | 枯草芽孢杆菌 | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 19 | 2026-10-18 |
Molecular glues and induced proximity: An evolution of tools and discovery
2024-06-20, Cell chemical biology
IF:6.6Q1
DOI:10.1016/j.chembiol.2024.04.001
PMID:38688281
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综述 | 探讨分子胶和诱导邻近工具的发展与发现，强调分子胶作为探针和治疗药物的潜力及挑战 | 提出从合成生物学和生物物理学领域汲取灵感，挖掘化学文库中类胶分子 | 分子胶相比经典抑制剂在治疗开发中仍然罕见，其简单结构和重塑蛋白质相互作用的能力对广泛应用和设计构成挑战 | 综述分子胶和诱导邻近工具的发展与发现，探讨其作为治疗药物的潜力 | 小分子分子胶 | 化学生物学 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 20 | 2026-10-18 |
A universal molecular control for DNA, mRNA and protein expression
2024-03-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46456-9
PMID:38509097
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研究论文 | 本文利用合成生物学原理构建了一个多组学对照pREF，可作为DNA、mRNA和蛋白质表达的通用分子标准 | 首次开发出可跨基因组学、转录组学和蛋白质组学方法兼容的通用合成标准，包含21个合成基因，可体外转录为mRNA对照和体外翻译为匹配的蛋白质对照，且可独立繁殖和可持续制备 | 未明确提及 | 解决当前缺乏跨下一代测序和质谱方法兼容的参考标准的问题，提供基因表达的整合测量标准 | 合成基因pREF序列及其体外转录的mRNA和体外翻译的蛋白质 | 合成生物学, 多组学 | NA | 下一代测序, 质谱, 体外转录, 体外翻译 | NA | DNA序列, RNA序列, 蛋白质丰度数据 | NA | 合成生物学原理 | NA | 多组学控制序列pREF，编码21个合成基因 | 医学, 工业生物技术 |