合成生物学相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['synthetic biology']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价9.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 5387 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-07-20 |
Engineering Auronidin Production in Marchantia polymorpha Enables a New Class of Plant-Derived Textile Pigments
2026-Jul-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00118
PMID:42470384
|
研究论文 | 通过在地钱中工程化合成罕见的类黄酮色素奥罗尼丁，开发新型植物源纺织染料 | 首次将地钱作为合成生物学底盘，通过控制R2R3-MYB转录因子表达增强奥罗尼丁产量，并系统比较组成型与诱导型表达系统，实现生物质积累与次生代谢产物生产的解耦 | 未提及 | 开发可持续的植物源纺织染料，验证地钱作为合成生物学底盘的可行性 | 地钱（Marchantia polymorpha） | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 地钱（Marchantia polymorpha） | 热休克、糖皮质激素受体和β-雌二醇诱导型基因表达系统 | 纺织、工业生物技术 |
| 2 | 2026-07-20 |
Artificial Intelligence and Protein Design: A retrospective study on 20-year emerging trends and core research areas from bibliometric perspectives
2026-Jul-18, Probiotics and antimicrobial proteins
IF:4.4Q2
DOI:10.1007/s12602-026-11131-6
PMID:42470596
|
回顾性研究 | 对人工智能与蛋白质设计领域二十年来研究趋势与核心领域进行文献计量分析 | 通过文献计量方法系统揭示AI驱动蛋白质设计的发展轨迹、国家影响力差异及三大知识聚类，并指出未被充分讨论的局限性 | 模型对稳定可结晶结构的依赖性、静态预测忽略构象动态变化、计算机模拟置信度与湿实验结果脱节，且需要双向耦合高通量实验反馈 | 从文献计量视角分析AI与蛋白质设计交叉领域的发展趋势和核心研究方向 | 2006-2025年间Web of Science数据库中的蛋白质设计相关文献 | 人工智能，文献计量学 | NA | 文献计量分析 | 深度学习模型（如AlphaFold2, RoseTTAFold, ProteinMPNN, RFdiffusion） | 文献元数据（引用、共被引、关键词等） | Web of Science数据集（2006-2025年） | NA | NA | NA | 合成生物学，药物发现，生物工程 |
| 3 | 2026-07-20 |
State-of-the-art lignin depolymerization and its routes to microbial valorization
2026-Jul-18, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.135444
PMID:42471147
|
综述 | 系统评估木质素解聚的先进策略及其与下游微生物转化相结合的途径 | 提出从解聚到增值一体化设计的概念转变，强调化学与生物解聚途径与微生物细胞工厂构建的协同整合 | 物理方法通常需与其他方法联用才能实现有效键断裂，生物解聚在反应速率、底物异质性和可扩展性方面仍存在挑战 | 探索木质素高效解聚并实现微生物增值转化的集成策略，支撑循环生物经济发展 | 木质素及其解聚产生的酚类单体和低聚物，以及用于增值转化的微生物细胞工厂 | 合成生物学 | NA | 物理解聚、化学解聚、生物解聚、途径工程、合成生物学、系统代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | 木质素降解与微生物碳漏斗途径及产物选择性生物合成代谢通路 | 工业生物技术, 环境 |
| 4 | 2026-07-20 |
Synthetic developmental engineering of human liver organogenesis
2026-07-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.205040
PMID:42440359
|
综述 | 基于合成发育工程原理，综述人类肝脏类器官的体外构建方法、局限及未来整合合成生物学与计算分析的发展方向 | 提出将合成生物学与计算分析整合至肝脏类器官工程，以促进血管化、建立分区、优化命运特化并实现对外部信号响应 | 当前类器官在重现性和成人水平成熟度方面仍存在挑战 | 探讨如何利用发育分子机制和干细胞技术，在体外合成重建类器官系统，并推动其在疾病建模与再生医学中的应用 | 人类胚胎肝脏发育过程及多种体外肝脏类器官模型 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 人类多能干细胞 | NA | 医学 |
| 5 | 2026-07-20 |
The marine diatom Phaeodactylum tricornutum as a versatile bioproduction chassis: Current progress, challenges, and perspectives
2025-11-10, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2025.101519
PMID:40994005
|
综述 | 综述了海洋硅藻三角褐指藻作为多功能生物生产底盘的研究进展、挑战和前景 | 系统总结了三角褐指藻在合成生物学领域的最新遗传工具开发和底盘优化策略，包括叶绿体基因表达、DNA位点特异性整合和营养改造等新兴方法 | 面临产品产量不理想、生物量限制和成本高等关键挑战，阻碍工业转化 | 促进三角褐指藻从模式硅藻向可扩展的环保生物制造平台转型 | 三角褐指藻 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas基因组编辑, 遗传转化 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 三角褐指藻 | 代谢途径工程用于生产岩藻黄素、脂肪酸、三酰甘油及萜类肽类等异源化合物 | 工业生物技术, 环境, 材料 |
| 6 | 2026-07-20 |
The biosynthesis and diversity of taxanes: From pathway elucidation to engineering and synthetic biology
2025-10-13, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2025.101460
PMID:40696759
|
综述 | 该文章综述了紫杉烷类化合物的生物合成途径、多样性及其在合成生物学和工程化生产方面的研究进展 | 提出了通过人工智能引导的定向进化改造细胞色素P450酶、利用植物或微生物底盘以及基因回路技术来扩大紫杉烷类化合物库和可持续生产的策略 | 论文未提供实验验证，仅为策略性综述，缺乏具体实施结果和实际产率数据 | 阐明紫杉烷类化合物的生物合成途径并开发可持续生产方法 | 紫杉烷类化合物及其生物合成途径中的关键酶，如二萜合酶、细胞色素P450酶、乙酰转移酶和BAHD酰基转移酶 | 合成生物学 | 癌症 | CRISPRi-dCas9基因调控、人工智能引导的定向进化、代谢工程 | NA | NA | NA | CRISPRi-dCas9基因回路、代谢分区化技术 | 本氏烟草、大肠杆菌、酿酒酵母 | 代谢通量调控回路、代谢分区化酶复合体 | 医学 |
| 7 | 2026-07-19 |
Genome position does not impact transgene expression efficiency in the ancient red alga Cyanidioschyzon merolae
2026-Sep-25, New biotechnology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.nbt.2026.05.004
PMID:42107704
|
研究论文 | 研究了古红藻Cyanidioschyzon merolae中基因组位置对转基因表达效率的影响 | 首次在C. merolae中建立并验证了一组中性整合位点，发现基因组位置对转基因表达无显著影响 | 仅针对单一宿主和特定转基因进行分析，可能不适用于其他基因或物种 | 探究基因组位置对转基因表达的影响并建立可重复的核基因组工程框架 | Cyanidioschyzon merolae的40个基因间位点 | 合成生物学 | NA | 同源重组, 自动化转化, 报告基因分析 | NA | 基因表达数据, 代谢物产量数据 | 38个经验证的整合位点，涵盖16条染色体 | 同源重组, 机器人辅助转化 | Cyanidioschyzon merolae | 异源异戊二烯合酶表达回路 | 工业生物技术 |
| 8 | 2026-07-19 |
Evaluation of Ogataea polymorpha DUR31 TPP riboswitch as a tool to downregulate gene expression in the yeast Komagataella phaffii
2026-Sep-25, New biotechnology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.nbt.2026.06.009
PMID:42372865
|
研究论文 | 评估了Ogataea polymorpha DUR31 TPP核糖开关在Komagataella phaffii中作为基因表达下调工具的适用性 | 首次将来自多形汉逊酵母的TPP核糖开关应用于毕赤酵母Komagataella phaffii，补充了该宿主中有限的合成生物学调控工具 | 核糖开关存在显著的基础渗漏表达，不能作为严格的分子开关；剪接效率受局部序列上下文强烈影响 | 评估异源TPP核糖开关在K. phaffii中调控基因表达的可行性 | Komagataella phaffii酵母 | 工业生物技术 | NA | 流式细胞术、RT-PCR | NA | 荧光表达数据、转录本剪接数据 | NA | NA | Komagataella phaffii | TPP核糖开关，通过GAP启动子调控EGFP和UBIYΔkGFP*报告基因表达 | 工业生物技术 |
| 9 | 2026-07-19 |
Bioinspired organic materials for seamless neurohybrid interfaces: from material design to living electronics
2026-Jul-18, Materials horizons
IF:12.2Q1
DOI:10.1039/d6mh00280c
PMID:42468887
|
综述 | 本文聚焦于生物启发的有机材料在神经混合接口中的应用，探讨从材料设计到活体电子学的进展，以实现与神经组织的无缝集成和双向通信 | 提出了使用有机混合离子-电子导体、先进聚合物化学和可调软材料来模拟神经元结构和功能的创新方法，并探索了原位聚合和合成生物学在实现活体神经电子学中的潜力 | 未具体说明局限性 | 实现神经混合接口与神经组织的无缝集成，以理解和治疗神经系统疾病 | 生物启发的有机材料、神经混合接口、活体神经电子学 | 机器学习 | 神经系统疾病 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 医学, 神经科学, 生物工程, 临床医学 |
| 10 | 2026-07-19 |
Nanofluidics for Pioneering Synthetic Biology of Bottom-Up Cell-Free Molecular Systems
2026-Jul-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00178
PMID:42284545
|
观点文章 | 提出纳米流体学作为自下而上无细胞分子系统合成生物学的变革性平台 | 利用纳米限域效应和精准质量传输实现分子构建块的主动组装，构建有序时空结构 | 纳米流体技术构建下一代单分子分辨率无细胞分子系统仍面临关键挑战 | 推动自下而上无细胞分子系统的合成生物学发展 | 无细胞分子系统的分子构建块 | 合成生物学 | NA | 纳米流体学 | NA | NA | NA | NA | NA | 分子主动组装系统 | 合成生物学 |
| 11 | 2026-07-19 |
A Comprehensive Review on Metabolomics-Guided Metabolite Production in Plant Tissue Culture: Integrating Omics and Synthetic Biology for Enhanced Yields
2026-Jul-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00352
PMID:42301185
|
综述 | 回顾了将代谢组学与合成生物学及多组学框架相结合，推动植物组织培养中次生代谢产物生产的进展 | 将植物组织培养从试错实践转变为预测性系统工程领域，整合代谢组学作为决策层，连接代谢表型与理性途径设计 | 仍面临分析覆盖度、培养稳定性和代谢可预测性等挑战 | 探索代谢组学引导下植物组织培养中代谢产物生产的综合策略 | 植物组织培养体系中的次生代谢产物 | 合成生物学 | NA | 代谢组学, 合成生物学, 多组学整合 | NA | NA | NA | CRISPR, 合成启动子, 模块化基因电路 | 植物细胞 | 代谢途径编辑, 异源表达系统, 生物传感器 | 医药, 农业, 工业生物技术 |
| 12 | 2026-07-19 |
SARGE: Serine Integrase-Assisted Rapid Genome Integration through Cassette Exchange in Escherichia coli
2026-Jul-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00334
PMID:42319839
|
研究论文 | 本研究报道了SARGE，一种丝氨酸整合酶辅助的快速基因组整合平台，通过盒交换实现大肠杆菌中大型DNA片段的迭代插入 | 结合正交丝氨酸整合酶PhiC31和Bxb1与理性供体质粒设计，无需抗性标记切除即可实现快速可编程整合循环，并采用双荧光报告系统实现裸眼菌落筛选 | 未明确说明局限性 | 开发一种高效、可扩展的迭代基因组整合平台，简化大肠杆菌的基因组工程流程 | 大肠杆菌基因组整合过程 | 合成生物学 | NA | 丝氨酸整合酶介导的盒交换 | NA | NA | NA | PhiC31整合酶, Bxb1整合酶, 双荧光报告系统 | 大肠杆菌 | 双荧光报告系统（sfGFP和mKate） | 合成生物学, 基因组工程 |
| 13 | 2026-07-19 |
Metabolic Engineering of Microbial Cell Factories for Sustainable Production of Glycolic Acid: Pathways, Chassis, and Strategies toward Poly(glycolic acid) Bioplastics
2026-Jul-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00078
PMID:42340804
|
综述 | 系统总结了通过微生物细胞工厂可持续生产乙醇酸的最新进展，并探讨了生产聚乙醇酸生物塑料的策略 | 全面综述了乙醇酸生物合成的多种途径、底盘生物及代谢工程策略，并整合了系统代谢工程与AI辅助设计及过程优化的未来方向 | 未详细讨论具体实验验证数据，仅基于文献综述，可能缺乏实际工业应用中的技术细节和成本分析 | 探索通过微生物发酵可持续生产乙醇酸的途径和策略，以支持聚乙醇酸生物塑料的工业化和循环生物经济 | 微生物细胞工厂、乙醇酸生物合成途径、微生物底盘生物、基于乙醇酸的生物塑料 | 合成生物学, 代谢工程, 工业生物技术 | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | 文本和综述数据 | NA | NA | 微生物, 例如大肠杆菌、酵母等 | 乙醛酸旁路、C5-糖裂解途径、新型生物合成途径 | 材料, 工业生物技术, 环境 |
| 14 | 2026-07-19 |
Microfluidics-Based Engineering of Molecular Self-Assembly and Manufacturing for Artificial Cell Systems
2026-Jul-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00249
PMID:42358072
|
观点文章 | 探讨微流控技术与分子自组装协同构建人工细胞系统的工程策略 | 提出微流控不应仅替代生物调控，而应作为提供外在物理边界条件的平台，引导和放大分子自组装的潜力 | 仅停留在概念框架层面，未提供具体实验验证或量化分析 | 构建功能化、可规模化的人工细胞系统 | 人工细胞系统 | 合成生物学 | NA | 微流控 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术， 医学 |
| 15 | 2026-07-19 |
Rapid and Continuous Directed Evolution in Vibrio natriegens Utilizing an In Vivo Hypermutation System
2026-Jul-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00936
PMID:42362483
|
研究论文 | 在最快生长的非致病菌Vibrio natriegens中建立基于胞苷脱氨酶-T7 RNA聚合酶融合蛋白（MutaT7）的体内超突变系统，实现蛋白质的快速连续定向进化 | 首次在Vibrio natriegens中建立MutaT7系统（VnMutaT7），利用其极快生长速度（倍增时间仅为大肠杆菌一半），在36小时内实现TEM-1蛋白质对头孢他啶的高水平抗性进化 | 未明确说明系统的脱靶效应、突变谱局限性或对宿主基因组的潜在影响 | 在Vibrio natriegens中建立快速连续定向进化平台，加速蛋白质工程 | MutaT7系统、Vibrio natriegens宿主菌、TEM-1模型蛋白 | 合成生物学 | NA | 体内超突变系统、定向进化 | NA | NA | NA | MutaT7 | Vibrio natriegens | MutaT7系统（胞苷脱氨酶与T7 RNA聚合酶融合蛋白） | 工业生物技术 |
| 16 | 2026-07-19 |
Beyond Compartmentalization: Deciphering Reaction Kinetics in Liquid-Liquid Phase Separation for Rational Biotechnological Design
2026-Jul-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00259
PMID:42350320
|
综述 | 综合阐述液-液相分离如何通过反应物浓度、反应-扩散耦合、微环境工程和酶活性调控等机制影响反应动力学，并总结其在生物催化、代谢工程、诊断、治疗及人工细胞构建等领域的应用 | 首次系统整合蛋白质介导和非蛋白质介导的液-液相分离，深入解析其对反应动力学的精确调控机制，并提供理性设计下一代合成生物学应用的设计指南 | 当前对液-液相分离如何精确调控反应动力学尚缺乏完整的机制理解，阻碍了基于相分离的应用的理性设计和优化 | 填补液-液相分离在反应动力学调控机制方面的知识空白，为合成生物学应用提供设计原理 | 液-液相分离系统及其对生物反应过程的调控 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物催化, 代谢工程, 诊断, 治疗, 人工细胞构建, 生命起源研究 |
| 17 | 2026-07-19 |
Probiotics unveiled: bridging general health benefits to the era of precision medicine
2026-Jul-17, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-026-05143-1
PMID:42463603
|
综述 | 该文章综述了益生菌从一般健康增强剂向精准医疗中靶向疗法的转变过程 | 该文整合了精神生物学、下一代益生菌、改良菌株、人工智能和合成生物学技术，重新定义了益生菌在个性化医疗中的作用 | NA | 探讨益生菌从一般健康促进到精准医疗时代靶向疗法的转变及其机制 | 益生菌及其在精准医疗中的应用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | 医疗 |
| 18 | 2026-07-19 |
Protein engineering: Status report
2026-Jul-17, Protein engineering, design & selection : PEDS
DOI:10.1093/protein/gzag020
PMID:42466865
|
综述 | 提供蛋白质工程领域的及时概览，涵盖核心方法和主要应用领域 | 强调机器学习与人工智能方法的日益增长的影响，并指出蛋白质工程正迅速发展的黄金时代 | 尽管进展迅速，但设计、筛选和实际应用方面仍面临重大挑战 | 概述蛋白质工程领域的最新进展与未来方向 | 通过对蛋白质进行工程改造以创建新型或改进的蛋白质 | NA | NA | 计算生物学、分子生物学、结构引导、进化与合成方法 | 机器学习与人工智能模型 | NA | NA | NA | NA | NA | 制药、分子成像、诊断、塑料回收、工业化学 |
| 19 | 2026-07-19 |
γ-Class carbonic anhydrases: Ancient enzymes at the interface of early earth metabolism, microbial physiology, and modern biochemical innovation
2026-Jul-17, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.153551
PMID:42468588
|
综述 | 综述γ-类碳酸酐酶的进化、结构、机制及其在微生物生理和生物技术中的应用 | 强调了γ-类碳酸酐酶作为最古老碳酸酐酶谱系的地位，揭示了其催化可塑性和在工业CO₂捕获及合成生物学中的新应用 | 关于CamH亚类催化机制和催化混杂性的未解决问题仍然存在 | 系统总结γ-类碳酸酐酶的结构、机制和功能知识，勾勒未来研究方向 | γ-类碳酸酐酶及其在古菌和细菌中的生理功能 | 分子生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 原核生物（如古菌、霍乱弧菌等） | CO₂水合酶系统 | 医学、环境、工业生物技术 |
| 20 | 2026-07-19 |
Beyond direct pathway engineering: reprogramming Fusarium fujikuroi from a GA3 producer into a GA4+7 factory
2026-Jul-17, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.135439
PMID:42468703
|
研究论文 | 本研究提出双重干预范式，将藤仓赤霉菌从赤霉素GA3生产菌重编程为高产GA4+7的工厂 | 通过引入拟南芥转运蛋白创造热力学汇，并发现Sfp型磷酸泛酰巯基乙胺转移酶Ppt1介导的非经典转录后沉默机制，实现间接代谢重编程 | 未明确说明局限性 | 开发间接代谢重编程策略，高效生产高价值赤霉素GA4+7 | 藤仓赤霉菌Fusarium fujikuroi | 合成生物学 | NA | 代谢工程、基因工程、发酵优化 | NA | 代谢产物浓度数据 | 使用单一菌株及多种工程改造版本 | NA | 藤仓赤霉菌Fusarium fujikuroi | 双重干预系统：转运蛋白Sweet1驱动的空间拉动与Ppt1介导的转录后基因沉默 | 工业生物技术 |