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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-02-06 |
Sustainable production of glutaric acid in microbial cell factories: Current advances and future prospects
2026-Sep, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2026.01.003
PMID:41631191
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综述 | 本文综述了微生物细胞工厂可持续生产戊二酸的当前进展与未来前景 | 系统总结了戊二酸生物合成的最新进展,重点关注生物合成途径的设计和代谢工程策略,并探讨了系统生物学技术在该途径开发中的应用 | NA | 为戊二酸及相关精细化学品的可持续生产提供理论见解和技术指导 | 戊二酸的微生物生物合成 | 合成生物学 | NA | 代谢工程,系统生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物细胞工厂 | 戊二酸生物合成途径 | 化学工业,医药,生物材料 |
| 2 | 2026-02-06 |
A novel LPS-dependent outer membrane-anchoring mechanism for T9SS substrates enables engineered enzyme display and whole-cell PET degradation in Cytophaga hutchinsonii
2026-Sep, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2026.01.011
PMID:41631190
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研究论文 | 本研究在Cytophaga hutchinsonii中发现了一种新型的LPS依赖性T9SS底物外膜锚定机制,并基于此开发了用于革兰氏阴性菌的酶表面展示平台,成功实现了PET降解 | 首次揭示了T9SS底物通过LPS依赖性机制锚定于外膜,并利用此机制构建了可编程的酶表面展示平台 | NA | 阐明T9SS底物在Cytophaga hutchinsonii中的外膜锚定机制,并开发基于此机制的酶表面展示平台 | Cytophaga hutchinsonii及其T9SS分泌的纤维素酶,以及异源表达的PET水解酶 | 合成生物学 | NA | 生物信息学分析、基因敲除、LC-MS/MS蛋白质组学 | NA | 蛋白质组学数据、基因序列数据 | NA | 基因融合、表面展示平台 | Cytophaga hutchinsonii | 将异源酶与T9SS底物的CTD结构域融合,构建表面展示系统 | 环境、工业生物技术 |
| 3 | 2026-02-06 |
Adaptive laboratory evolution optimizes an engineered phosphite utilization pathway in Synechococcus elongatus PCC 7942
2026-Mar, Journal of bioscience and bioengineering
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.jbiosc.2025.11.006
PMID:41390308
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研究论文 | 本研究通过长期传代培养优化了在Synechococcus elongatus PCC 7942中构建的磷酸盐利用途径,提高了工程菌株的生长和磷酸盐消耗速率 | 发现长期传代培养可诱导htxBCDE转运蛋白基因发生点突变,从而增强磷酸盐转运活性,优化工程代谢途径而不改变其底物特异性 | 研究仅针对单一菌株和特定代谢系统,未评估在其他宿主或代谢途径中的普适性 | 优化工程微生物的磷酸盐依赖代谢系统,以平衡代谢负担与生物安全控制能力 | Synechococcus elongatus PCC 7942工程菌株RH714及其传代演化群体 | 合成生物学 | NA | 适应性实验室演化、长期传代培养、基因序列分析、基因敲除 | NA | 生长曲线数据、磷酸盐消耗速率数据、基因序列数据 | 原始工程菌株RH714及其传代演化群体 | CRISPR-Cas9 | Synechococcus elongatus PCC 7942 | 磷酸盐依赖代谢系统,包含htxBCDE转运蛋白基因和ptxD基因簇 | 环境、工业生物技术 |
| 4 | 2026-02-06 |
Automated strain-to-peptide conversion: a high-throughput proteome analysis platform empowering rational design of microbial cell factories
2026-Mar, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.134010
PMID:41539624
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研究论文 | 开发了一种名为'菌株到肽段转换'的高通量蛋白质组分析平台,用于微生物细胞工厂的理性设计 | 通过自动化工作流程整合细菌裂解、磁性固相烷基化蛋白富集、污染物去除和快速消化,将96个样本处理时间缩短至1小时,相比SP3方法减少94%处理时间,并提高膜蛋白定量28% | NA | 克服微生物工程菌株蛋白质组分析中的样本制备瓶颈,实现高通量蛋白质组分析 | 工程化微生物菌株(如大肠杆菌)的蛋白质组 | 合成生物学 | NA | 质谱蛋白质组学、磁性固相烷基化 | NA | 蛋白质组数据 | 96个大肠杆菌样本 | NA | 大肠杆菌 | NA | 工业生物技术 |
| 5 | 2026-02-06 |
Enhancement of Nitrogenase Activity in Recombinant Escherichia coli by Replacing Upstream Region of nif Operon from Paenibacillus Species
2026-Feb-12, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202500711
PMID:41640351
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研究论文 | 本研究通过替换来自Paenibacillus物种的nif操纵子上游区域,增强了重组大肠杆菌的固氮酶活性,并探讨了异源大规模生产固氮酶的限制因素 | 发现某些nif操纵子上游区域在大肠杆菌中作为组成型σ依赖性启动子发挥作用,并通过结合启动子替换与合成生物学方法优化电子转移和金属簇组装,显著提高了固氮酶活性 | 尽管亲本菌株表现出高固氮酶活性,但相应的nif操纵子在大肠杆菌中并非总能稳定功能化,存在异源表达限制 | 增强重组大肠杆菌的固氮酶活性,以支持可持续固氮 | 来自Paenibacillus物种的nif操纵子及其上游区域,以及重组大肠杆菌 | 合成生物学 | NA | 基因克隆、启动子替换、合成生物学方法 | NA | NA | NA | Gibson Assembly, BioBrick | E. coli | 固氮酶生物合成途径,包括电子转移和金属簇组装的优化 | 农业, 环境 |
| 6 | 2026-02-06 |
[Design and synthesis of molecularly imprinted polymers and their applications in medical diagnosis and biocatalysis]
2026-Feb-08, Se pu = Chinese journal of chromatography
DOI:10.3724/SP.J.1123.2025.06013
PMID:41641521
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综述 | 本文综述了分子印迹聚合物(MIPs)的理性设计、功能化制备及其在生物传感、生物催化和生物医学诊疗等交叉领域的应用,并展望了下一代分子印迹技术(MIT)的战略研究方向 | 提出了一个涵盖高通量单体筛选、分子识别机制阐明和功能单元定向组装的三维策略,开发了具有刺激响应特性的智能MIPs,并建立了用于蛋白质分离纯化、超灵敏生物传感和集成诊疗的跨学科应用平台 | 指出了当前MIT面临的挑战,如印迹层不均匀、模板残留、大分子印迹的水相相容性有限、工业可扩展性问题、识别机制不明确以及与微流控和人工智能等新兴领域融合不足 | 推动分子印迹技术(MIT)的发展,使其从‘静态识别材料’演变为智能、自适应、系统化的生物医学平台,加速从实验室到临床和工业的转化 | 分子印迹聚合物(MIPs) | NA | 心力衰竭,癌症 | 分子印迹技术(MIT),分子动力学模拟,固相表面印迹法 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学,环境,制药,食品 |
| 7 | 2026-02-06 |
Revitalizing actinobacteria research: an urgent response to the antimicrobial resistance crisis
2026-Feb-05, Natural products and bioprospecting
IF:4.8Q1
DOI:10.1007/s13659-025-00587-8
PMID:41639343
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评论 | 本文通过文献计量分析,强调在抗菌素耐药性危机加剧的背景下,需重新投资于放线菌的基础研究,以利用现代技术如基因组学、人工智能和合成生物学来振兴抗生素发现 | 结合文献计量分析揭示研究失衡,并提出将传统放线菌资源与现代技术(如基因组学、人工智能和合成生物学)相结合的战略性再投资,以高效解锁其生物合成潜力 | NA | 呼吁重新平衡研究重点,通过投资放线菌的自然产物发现来应对抗菌素耐药性危机 | 放线菌(Actinomycetota)作为临床抗生素的主要来源 | NA | 抗菌素耐药性 | 基因组学、人工智能、合成生物学 | NA | 文献数据 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 8 | 2026-02-06 |
Lipid composition effects on the number and size of liposomes formed by the inverted emulsion method
2026-Feb-03, Biophysical journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.bpj.2025.12.013
PMID:41383017
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研究论文 | 本研究系统探究了磷脂组成对倒置乳化法制备的脂质体产量和尺寸分布的影响 | 首次系统研究脂质组成对倒置乳化法制备脂质体产量和尺寸的影响,发现带电磷脂替代可显著提高产量约10倍 | 研究主要基于鸡蛋卵磷脂体系,未涵盖所有可能的脂质组合;离心沉降法中强离心力可能掩盖某些脂质效应 | 探究脂质组成对倒置乳化法制备脂质体产量和尺寸分布的影响,为优化最小细胞模型制备提供指导 | 脂质体(特别是巨脂质体) | 合成生物学 | NA | 倒置乳化法 | NA | 实验数据 | 基于鸡蛋卵磷脂体系,测试多种替代磷脂(不同净电荷和亲水头基分子量) | NA | NA | NA | 合成生物学/最小细胞模型构建 |
| 9 | 2026-02-06 |
Modulation of Clostridioides difficile virulence by metabolites derived from probiotic consortia and genetically edited strains
2026-Feb-02, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108818
PMID:41638450
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综述 | 本文综述了通过益生菌联合体和基因编辑菌株产生的代谢物调控艰难梭菌毒力的策略,探讨了从根除病原体转向抑制毒力的治疗新范式 | 提出了一种协同调控策略,结合恢复次级胆汁酸代谢、增强短链脂肪酸产生和破坏群体感应系统,以多靶点抑制艰难梭菌的毒力表达 | NA | 探索通过代谢调控和合成生物学手段抑制艰难梭菌感染(CDI)毒力、防止复发的精准治疗策略 | 艰难梭菌(Clostridioides difficile)及其毒力因子(毒素表达、生物膜形成、孢子萌发) | 合成生物学 | 艰难梭菌感染 | 多组学(基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学)、计算建模 | NA | 多组学数据 | NA | CRISPR-Cas9, 代谢工程 | 益生菌、工程菌株、微生物联合体 | 可编程群体淬灭系统、优化代谢输出通路 | 医学 |
| 10 | 2026-02-06 |
Late Stage Mannan Metabolism in Cellvibrio japonicus Requires the Combined Action of a Mannosyl-Glucose Phosphorylase and a Mannobiose Epimerase
2026-Feb, Molecular microbiology
IF:2.6Q3
DOI:10.1111/mmi.70043
PMID:41525168
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研究论文 | 本研究通过生理和生化方法,表征了Cellvibrio japonicus中的甘露二糖差向异构酶和甘露糖苷磷酸化酶,揭示了它们在甘露聚糖代谢后期阶段的关键作用 | 首次在C. japonicus中功能性地表征了甘露糖基-葡萄糖磷酸化酶(Mgp130A)和甘露二糖差向异构酶(EpiA),并发现EpiA缺失会导致半乳糖取代的甘露寡糖产生毒性效应 | 研究主要基于体外酶活性和突变分析,未涉及体内代谢通路的全面调控机制或更广泛的底物特异性测试 | 探究C. japonicus中甘露聚糖代谢后期阶段的酶学机制及其在合成生物学中的应用潜力 | Cellvibrio japonicus细菌及其甘露糖基-葡萄糖磷酸化酶(Mgp130A)和甘露二糖差向异构酶(EpiA) | 合成生物学 | NA | 生理学表征、生化分析、功能突变分析、酶活性测定 | NA | 生化数据 | NA | 质粒构建(pJKN5) | Cellvibrio japonicus(革兰氏阴性腐生菌) | 甘露聚糖代谢途径,涉及甘露糖基-葡萄糖磷酸化酶和甘露二糖差向异构酶的协同作用 | 工业生物技术、可再生化学品生产 |
| 11 | 2026-02-06 |
Corrigendum to "Precise control of transcriptional stoichiometry in bacteria: From mechanisms to synthetic biology applications" [Biotechnology Advances 86 (2026) 108748]
2026-Jan-27, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108816
PMID:41611037
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 12 | 2026-02-06 |
Engineered probiotics platform for oral delivery of antibody as a high-compliance alternative for immune-mediated inflammatory diseases
2026-Jan-20, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102523
PMID:41421354
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研究论文 | 本研究开发了一种名为AIDEN的工程化益生菌平台,用于口服递送治疗性抗体,以改善免疫介导炎症性疾病的治疗依从性 | 首次构建了能够口服递送单链可变片段抗体的工程化益生菌平台,实现了稳定的肠道定植和原位抗体生产 | 研究仅在鼠类模型中进行,尚未进行人体临床试验;系统IL-17A水平仅中度降低 | 开发口服抗体递送平台以替代频繁注射治疗,提高免疫介导炎症性疾病患者的治疗依从性 | 工程化大肠杆菌Nissle 1917(EcN)益生菌平台及其分泌抗IL-17A单链可变片段的变体AIDEN-IL17 | 合成生物学 | 银屑病,炎症性肠病 | 合成生物学技术 | NA | NA | 鼠类模型 | 合成生物学 | 大肠杆菌Nissle 1917(EcN) | 抗体分泌系统,可模块化适配多种抗体治疗 | 医学 |
| 13 | 2026-02-06 |
A universal polyphosphate kinase powers in vitro transcription
2026-Jan-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-68012-9
PMID:41507187
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研究论文 | 本文介绍了一种通用多磷酸激酶,能够高效磷酸化所有八种常见核糖核苷酸为三磷酸盐,并展示了其在体外转录中的应用潜力 | 开发了一种具有广泛底物谱的通用多磷酸激酶,突破了现有PPKs底物限制,实现了对嘌呤和嘧啶单磷酸及二磷酸的高效磷酸化 | NA | 探索多磷酸激酶在核苷酸生产及体外转录系统中的应用 | 多磷酸激酶及其催化的磷酸化反应 | 合成生物学 | NA | 体外转录、酶催化反应 | NA | NA | NA | NA | NA | 基于通用多磷酸激酶的一锅法体外转录系统 | 工业生物技术 |
| 14 | 2026-02-06 |
Role of CRISPR in bioremediation of heavy metal(loid): a breakthrough in environmental biotechnology
2026-Jan-07, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-025-04770-4
PMID:41498982
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综述 | 本文综述了CRISPR技术在重金属(类金属)生物修复中的应用,探讨了其在环境生物技术领域的突破性潜力 | 首次提出了一个整合CRISPR编辑、多组学、合成生物学和新兴CRISPR生物传感器的统一路线图,用于指导下一代生物修复技术的发展 | 讨论了当前面临的生态风险、技术难题、法规问题以及未来实地部署的挑战 | 探讨CRISPR技术如何提升生物修复的效率、特异性和可扩展性,以应对重金属污染 | 微生物和植物中的金属转运蛋白、解毒酶和应激反应通路 | 环境生物技术 | NA | CRISPR基因组工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 微生物, 植物 | 生物传感系统 | 环境 |
| 15 | 2026-02-06 |
Engineering delivery platforms for CRISPR-Cas and their applications in healthcare, agriculture and beyond
2026-Jan-05, Nanoscale advances
IF:4.6Q2
DOI:10.1039/d5na00535c
PMID:41640466
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综述 | 本文综述了CRISPR-Cas系统及其递送平台在医疗、农业等领域的应用与挑战 | 全面概述了CRISPR技术递送策略的当前与新兴方法,包括病毒载体、非病毒物理方法和纳米颗粒基模态 | 递送系统面临包装、稳定性、细胞摄取、组织特异性、编辑效率可变和脱靶风险等挑战 | 探讨CRISPR-Cas系统递送平台的关键挑战及其在医疗、农业等领域的应用 | CRISPR-Cas系统、递送策略(如病毒载体、非病毒物理方法、纳米颗粒) | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas系统、碱基编辑、引物编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 医疗, 农业, 环境, 工业生物技术 |
| 16 | 2026-02-06 |
Precise control of transcriptional stoichiometry in bacteria: From mechanisms to synthetic biology applications
2026 Jan-Feb, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108748
PMID:41187847
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综述 | 本文综述了细菌在转录水平精确控制蛋白质亚基化学计量的机制,并探讨了这些机制在合成生物学中的应用 | 超越经典的转录调控,重点阐述了转录后精细调控机制(如内部转录终止子和选择性RNA加工与稳定系统)在控制化学计量中的作用,并展示了如何利用这些机制设计可编程的合成基因电路 | NA | 探索细菌精确控制转录化学计量的机制及其在合成生物学中的应用 | 细菌的RNA水平调控机制及合成基因电路 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 细菌 | 启动子库、工程化终止子、基于RNase的加工模块、合成基因电路 | 生物技术、生物医学 |
| 17 | 2026-02-06 |
Psilocybin: clinical potential, mechanistic insights, and biotechnological advances for scalable production
2025-Dec-31, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-025-04758-0
PMID:41474478
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综述 | 本文综述了裸盖菇素的临床潜力、作用机制及生物技术进展,重点讨论了其作为精神健康治疗候选药物的前景以及通过微生物平台实现规模化生产的生物技术策略 | 整合了裸盖菇素的临床研究、作用机制和生物技术生产进展,强调了利用工程化微生物(如酿酒酵母、构巢曲霉和大肠杆菌)进行异源表达以提高产量(达2000 mg/L)的创新方法 | NA | 探讨裸盖菇素作为生物制药候选物的临床潜力、作用机制及通过生物技术实现可持续规模化生产的途径 | 裸盖菇素(一种来自裸盖菇属蘑菇的色胺衍生生物碱)及其生物合成 | NA | 精神健康疾病 | 异源表达、代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 酿酒酵母, 构巢曲霉, 大肠杆菌 | 裸盖菇素生物合成途径 | 医药 |
| 18 | 2026-02-06 |
Cellulase secretion by engineered Pseudomonas putida enables growth on cellulose oligomers
2025-Nov-25, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-025-13617-9
PMID:41291027
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研究论文 | 本研究通过工程化改造Pseudomonas putida,使其分泌纤维素酶,实现在纤维素寡聚物上的生长 | 首次在P. putida中实现非天然纤维素酶的功能性分泌,并识别出优选的双精氨酸转运酶分泌信号肽 | 研究仅针对纤维素寡聚物(如纤维三糖和纤维四糖),未涉及更复杂的纤维素聚合物 | 开发P. putida作为合成生物学平台,用于从低品位原料中合成化学品 | 工程化改造的Pseudomonas putida细菌 | 合成生物学 | NA | 分子工程、酶分泌技术 | NA | 实验数据 | NA | 合成生物学工具 | Pseudomonas putida | 纤维素酶分泌系统,包括外切和内切纤维素酶 | 工业生物技术、能源 |
| 19 | 2026-02-06 |
Human Synthetic Biology and Programmable Gene Regulation Control
2025-08, Annual review of genomics and human genetics
IF:7.7Q1
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综述 | 本文综述了人类合成生物学领域的最新进展,重点关注可编程基因调控工具的发展及其在治疗应用中的潜力 | 强调了高通量方法在开发多层次基因表达控制工具方面的应用,以及合成基因程序在操纵细胞行为中的创新 | NA | 回顾人类合成生物学中可编程基因调控系统的进展,并探讨其在治疗领域的应用 | 人类细胞中的合成基因系统和可编程遗传工具 | 合成生物学 | NA | 高通量合成生物学方法 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN | 人类细胞 | 合成基因电路、逻辑门、生物传感器 | 医学 |
| 20 | 2026-02-06 |
Bacterial DNA methylases as novel molecular and synthetic biology tools: recent developments
2025-Mar-06, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-025-13442-0
PMID:40047928
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综述 | 本文综述了细菌DNA甲基化酶的类型、靶向甲基化或去甲基化的主要技术,以及这些酶在分子和合成生物学中的最新作用 | 系统总结了利用融合蛋白(如锌指蛋白、TALE或CRISPR/dCas9与甲基化酶结合)实现靶向甲基化的新兴技术,并展望了通过鉴定更多细菌甲基化酶特性来开发新工具的潜力 | NA | 探讨细菌DNA甲基化酶作为分子和合成生物学工具的最新发展与应用 | 细菌DNA甲基化酶及其相关技术 | 合成生物学 | NA | 靶向甲基化技术、DNA组装技术 | NA | NA | NA | CRISPR/dCas9, TALEN, 锌指蛋白 | 细菌, 作物植物 | NA | 遗传工程, 细菌学, 生物技术, 农业 |