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当前共找到 6032 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-11-12 |
Natural and engineered bacteriophages against multidrug-resistant ESKAPE pathogens: current landscape and clinical translation
2026-Dec, Future microbiology
IF:2.5Q3
DOI:10.1080/17460913.2026.2752147
PMID:42953984
|
综述 | 本文综述了针对多重耐药ESKAPE病原体的天然和工程化噬菌体的研究现状及其临床转化面临的挑战 | 系统总结了通过合成生物学手段（如尾部纤维修饰、解聚酶和内溶素增强、CRISPR基因组编辑及计算设计的噬菌体鸡尾酒）改造噬菌体以克服天然噬菌体局限性的最新进展 | 未涉及具体实验数据或荟萃分析，主要基于文献综述；工程化噬菌体的临床转化仍受法规不明确、缺乏GMP级生产、药代动力学变异大及临床试验数据有限等制约 | 批判性审视提高噬菌体抗ESKAPE病原体活性的工程化方法，识别限制临床使用的科学和监管障碍，并概述促进广泛采用的关键步骤 | 多重耐药ESKAPE病原体（屎肠球菌、金黄色葡萄球菌、肺炎克雷伯菌、鲍曼不动杆菌、铜绿假单胞菌和肠杆菌属）及针对这些病原体的天然和工程化噬菌体 | 合成生物学、医学微生物学、抗感染治疗 | 多重耐药细菌感染、医院获得性感染 | 合成生物学、CRISPR基因组编辑、尾部纤维修饰、解聚酶和内溶素增强、计算设计的噬菌体鸡尾酒 | NA | 文本 | NA | CRISPR-Cas | 噬菌体、细菌 | NA | 医学、生物技术 |
| 2 | 2026-11-12 |
Intellectual property rights and the global exchange of molecular plant technologies
2026-Dec, GM crops & food
DOI:10.1080/21645698.2026.2740254
PMID:43007855
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研究论文 | 文章分析了全球植物知识产权制度与分子育种技术之间的结构性错位，并探讨了其对气候适应性农业的影响 | 提出'法律韧性'概念，揭示'市场力量效应'，并构建多中心改革方案，包括气候效用模型层级、DSI惠益共享基金、人道主义专利池等 | 采用法律学说分析、专利景观回顾和产品级案例研究，缺乏大规模实证数据验证，且主要关注制度层面而可能忽略其他影响因素 | 探讨全球知识产权制度如何影响分子植物技术的传播与气候适应性农业的发展，并提出改革建议 | 全球植物知识产权制度、分子植物技术（基因编辑、合成生物学、数字序列信息）、育种企业及公共育种机构 | 农业生物技术 | NA | 基因编辑、合成生物学、数字序列信息（DSI） | NA | 文本 | NA | CRISPR-Cas9 | 植物 | NA | 农业 |
| 3 | 2026-11-12 |
A generalizable framework for genetic code expansion in bacterial systems beyond E. coli
2026-Nov-11, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.01273-26
PMID:42803582
|
研究论文 | 本文介绍了一个模块化、可扩展的平台，用于在系统发育多样的细菌中实现和优化遗传密码扩展 | 基于宿主无关的丝氨酸重组酶辅助基因组工程工具包，开发了通用且可扩展的GCE平台，并在五种细菌中成功应用，实现了结构多样的非天然氨基酸的稳健掺入 | 未明确提及 | 解决GCE在大肠杆菌以外细菌中缺乏通用高效方法的问题，实现遗传密码扩展在多样细菌中的通用实施和优化 | 五种系统发育多样的细菌物种 | 合成生物学 | NA | 丝氨酸重组酶辅助基因组工程 | NA | NA | 五种细菌物种 | 丝氨酸重组酶辅助基因组工程工具包 | 五种细菌物种 | 染色体整合的遗传密码扩展系统 | 生物技术, 环境应用, 合成生物学 |
| 4 | 2026-11-12 |
In-field crop disease surveillance: from phenotypes to molecules
2026-Nov-11, Chemical Society reviews
IF:40.4Q1
DOI:10.1039/d5cs01551k
PMID:43012344
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综述 | 本文综述了从表型到分子层面的田间作物病害监测技术，包括病原体生物标志物、可现场部署的分子检测方法及其应用前景。 | 系统整合了传感技术、柔性电子和合成生物学，提出从表型到分子的作物病害监测范式转变。 | 文章为综述性质，未提供原始实验数据，且未深入探讨技术成本与实际推广障碍。 | 总结作物病害监测从表型到分子的技术进展，评估其技术成熟度与应用前景。 | 作物病原体、害虫及其相关病害生物标志物 | 农业科学, 合成生物学, 传感器技术 | 作物病害 | 现场分子检测、传感技术、柔性电子、合成生物学 | NA | 文献数据 | NA | NA | 植物（哨兵植物） | NA | 农业, 环境 |
| 5 | 2026-11-12 |
SecAntiGami: A Secondary-Antibody-Inspired RNA Origami for Qualitative Aptamer Validation
2026-Nov-11, Nano letters
IF:9.6Q1
DOI:10.1021/acs.nanolett.6c03022
PMID:43012600
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研究论文 | 本文介绍了一种受二抗启发的RNA折纸结构SecAntiGami，用于信号增强和适配体表征 | 受二抗启发设计模块化RNA折纸工具，通过可编程吻环相互作用结合适配体并携带荧光适配体实现可视化，可放大适配体依赖性粒径变化并实现荧光定位 | 仅提供定性验证，未涉及定量分析；未在复杂生物样本中广泛测试 | 开发适配体验证工具，用于信号增强和适配体表征 | RNA适配体（生物素结合适配体）及其设计的三种变体 | 合成生物学、RNA纳米技术 | NA | RNA折纸技术、动态光散射、荧光成像 | NA | 荧光信号、光散射数据 | 三种生物素结合适配体变体 | RNA折纸 | NA | RNA折纸结构（通过吻环相互作用结合适配体） | 医学、诊断、合成生物学 |
| 6 | 2026-11-12 |
Targeting bacterial signaling pathways: a paradigm shift in antimicrobial strategies for food safety
2026-Nov-11, Critical reviews in food science and nutrition
IF:7.3Q1
DOI:10.1080/10408398.2026.2754574
PMID:43012873
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综述 | 系统综述了靶向细菌信号通路（特别是群体感应等三大通路）作为食品抗菌新策略的研究进展与应用平台 | 提出以抗毒力而非杀菌为核心范式转变，系统整合计算生物学、纳米技术、合成生物学、天然QS抑制剂和酶降解等多平台干预策略 | 信号分子在食品基质中的稳定性问题及生物利用度优化仍待解决，多靶点干预策略尚需进一步验证 | 探讨靶向细菌信号通路作为食品安全抗菌新策略的可行性、技术平台与实际应用 | 食源性致病菌和腐败菌及其细菌信号通路 | 食品安全微生物学 | 食源性疾病 | 计算生物学、纳米技术、合成生物学、天然QS抑制剂、酶降解 | NA | 文献 | NA | NA | NA | NA | 食品, 医学 |
| 7 | 2026-11-12 |
Synthetic biology for sustainable abundance: biomining, electromicrobial production, and hyper-engineerable microbes
2026-Nov-10, Chemical communications (Cambridge, England)
DOI:10.1039/d6cc01792d
PMID:43006193
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综述 | 综述了作者实验室过去十年在生物采矿、电驱动代谢和超可工程化微生物三个关键领域的突破 | 整合了生物采矿、电微生物生产和超可工程化微生物三个方向的原创性突破，提出了利用合成生物学实现可持续能源基础设施的新范式 | 作为综述文章，未提供新的实验数据，且指出对支撑可持续性和能源的生物系统基础科学理解仍不充分 | 总结实验室在合成生物学可持续性领域的突破，探讨如何通过合成生物学构建可持续能源基础设施以替代化石燃料系统 | 生物采矿系统、电驱动微生物代谢系统、可工程化微生物 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | 微生物 | NA | 能源, 环境 |
| 8 | 2026-11-12 |
Decoupling cellular complexity: Comparative mass transport analysis of wild-type and mutant PhoE in nanoreactors
2026-Nov-10, Protein engineering, design & selection : PEDS
DOI:10.1093/protein/gzag034
PMID:43007411
|
研究论文 | 该论文利用酶负载的纳米反应器作为最小化平台，直接量化野生型和突变型PhoE孔蛋白的底物运输通量，并设计了一种新型缺失突变体PhoEΔ102-107，其运输速率比野生型高2.4倍 | 采用自下而上的合成生物学纳米反应器平台，将PhoE介导的底物运输与细胞复杂性解耦，实现特异性运输速率的直接定量比较；设计并表征了新型缺失突变体PhoEΔ102-107，其运输速率显著高于野生型；结合分子动力学模拟揭示了突变体运输行为的结构基础 | 研究仅比较了有限数量的PhoE变体（野生型、F111C和PhoEΔ102-107），未全面覆盖所有已报道的突变体；纳米反应器系统虽然简化了复杂性，但仍可能无法完全模拟天然外膜的复杂环境；分子动力学模拟的时间尺度和力场精度可能限制对运输机制的全面理解 | 克服全细胞 assay 的局限性，利用纳米反应器平台直接定量比较野生型和突变型PhoE的底物运输特性，并设计新型突变体以调控运输通量 | 大肠杆菌（Escherichia coli）的外膜孔蛋白PhoE的野生型和突变体（F111C、PhoEΔ102-107） | 合成生物学 | NA | 纳米反应器技术、分子动力学模拟 | NA | 实验测量数据、模拟数据 | NA | 蛋白质工程（定点突变、缺失突变） | 大肠杆菌（Escherichia coli） | 酶负载纳米反应器（封装酶的囊泡系统） | 医学、工业生物技术 |
| 9 | 2026-11-12 |
NanoBlocks: Creating Genetically Encoded Protein Switches Using Competitive Binding
2026-Nov-10, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.6c10102
PMID:43007788
|
研究论文 | 该文章提出了一种名为NanoBlocks的策略，通过引入竞争性结合肽将简单亲和结合蛋白转化为响应特定靶标的蛋白质开关，并开发了荧光生物传感器和刺激响应酶 | 利用竞争性结合机制将纳米抗体等简单亲和结合蛋白转化为具有明显构象变化的蛋白质开关，并证明了该设计在两种不同结合框架中的通用性 | 文中未明确说明该策略在复杂体内环境中的长期稳定性及潜在脱靶效应 | 开发一种通用策略，将简单亲和结合蛋白改造为响应特定分子刺激的蛋白质开关 | ALFA纳米抗体和Erbin的PDZ结构域 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程 | 理论模型 | 荧光信号、生物发光信号 | NA | NA | 哺乳动物细胞 | 基于竞争性结合的蛋白质开关（生物传感器） | 医学，工业生物技术 |
| 10 | 2026-11-12 |
Reprogramming flavonoid glycosylation by bridging advanced biocatalysis and systems synthetic biology
2026-Nov-10, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.109096
PMID:43009074
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综述 | 系统探讨黄酮糖苷生物制造中的范式转变，涵盖UGT发现方法、多维酶工程、系统代谢工程及无细胞合成 | 提出桥接先进生物催化与系统合成生物学的整合框架，强调AI驱动的从头酶设计、自主单细胞动态调控及木质纤维素生物质 valorization | 作为综述文章，未提供原始实验数据验证所提框架的可行性 | 为高价值黄酮糖苷的可持续绿色生物制造提供可扩展的多维蓝图 | 黄酮糖苷、植物UDP-依赖糖基转移酶（UGTs）、微生物细胞工厂 | 合成生物学 | NA | 多组学、AI驱动预测模型、计算设计、代谢工程、无细胞合成 | AI预测模型 | NA | NA | NA | 微生物细胞 | 代谢途径、时空解耦微生物 consortium | 医药，工业生物技术 |
| 11 | 2026-11-12 |
SeekRBP: Leveraging Sequence-Structure Integration with Reinforcement Learning for Receptor-Binding Protein Identification
2026-Nov-10, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag813
PMID:43009207
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研究论文 | 该文提出SeekRBP，一个结合序列与结构信息并利用强化学习进行受体结合蛋白识别的新型框架 | 将负采样建模为序列决策问题，采用多臂老虎机策略动态优先选择信息量大的非RBP序列，并融合蛋白质语言模型与结构嵌入的多模态信息 | 摘要中未明确说明具体局限性，但可能依赖于结构预测的准确性及计算资源需求 | 提高受体结合蛋白（RBP）的识别性能，以促进噬菌体工程和宿主预测 | 病毒受体结合蛋白（RBPs）及非RBP尾蛋白序列 | 生物信息学 | NA | 蛋白质语言模型、结构嵌入、强化学习（多臂老虎机） | 多模态融合模型结合多臂老虎机策略 | 蛋白质序列与结构数据 | NA | NA | NA | NA | 医学, 合成生物学 |
| 12 | 2026-11-12 |
The road ahead for stem cell therapies in type 1 diabetes
2026-Nov-10, Diabetic medicine : a journal of the British Diabetic Association
IF:3.2Q2
DOI:10.1111/dme.70511
PMID:43010164
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综述 | 本文综述了干细胞疗法治疗1型糖尿病的最新进展，重点讨论了生物工程微环境和合成生物学等新兴技术如何克服移植β细胞面临的血管化不足和免疫排斥两大挑战 | 系统整合了生物工程微环境（多谱系类器官、功能化水凝胶、脱细胞基质、生物打印）与合成生物学策略（低免疫原性基因编辑、CRISPR转录控制、刺激响应生存回路）以及计算和单细胞方法（基因调控网络分析、数字孪生框架）来提升β细胞移植的持久性和功能性 | 综述未涉及具体临床试验的详细数据，缺乏对各项技术成熟度和转化可行性的定量评估，且未讨论成本效益和规模化生产等实际问题 | 探讨克服干细胞衍生β细胞移植中移植物存活和功能持久性障碍的新兴技术路径 | 1型糖尿病及干细胞衍生的胰岛β细胞移植疗法 | 再生医学 | 1型糖尿病 | 人多能干细胞分化、CRISPR基因编辑、单细胞分析、基因调控网络分析、生物打印、水凝胶功能化、脱细胞基质、类器官培养 | NA | 文本 | NA | CRISPR-Cas9 | 人类细胞 | 刺激响应生存回路、CRISPR转录控制回路 | 医学 |
| 13 | 2026-11-12 |
A parts list of promoters and gRNA scaffolds for mammalian genome engineering and molecular recording
2026-Nov, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-025-02896-2
PMID:41219485
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研究论文 | 该研究设计了Pol III启动子和gRNA支架的现有、祖先、诱变或小型化变体文库，并通过多重prime editing量化其在哺乳动物基因组编辑中的活性，鉴定出数千个可重复编辑的部件 | 首次在哺乳动物系统中建立类似微生物的标准化启动子和gRNA支架部件清单；通过饱和诱变筛选获得增强序列多样性的耐受变体；设计了'ten key'阵列实现pegRNA活性的平衡预测 | 研究主要在人源和鼠源细胞系中进行验证，尚未在体内或更多哺乳动物物种中广泛测试；部件清单的普适性和长期稳定性有待进一步评估 | 为哺乳动物基因组工程和分子记录建立标准化的启动子和gRNA支架部件清单，并验证其在多重prime editing中的编辑效率和可预测性 | 聚合酶III启动子和gRNA支架的现有、祖先、诱变或小型化变体；人类和小鼠细胞系 | 合成生物学 | NA | 多重prime editing、饱和诱变筛选、NGS | NA | 序列数据、编辑活性定量数据 | 数千个启动子和gRNA支架部件；人类和小鼠细胞系 | prime editing | 人类细胞、小鼠细胞 | ten key阵列（pegRNA阵列） | 医学、工业生物技术 |
| 14 | 2026-11-12 |
IgY as a versatile antibody platform for precision diagnostics and targeted biotherapeutics: a review
2026-Aug-14, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08807-6
PMID:43010032
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综述 | 本文综述了源自蛋黄的免疫球蛋白Y（IgY）作为多功能抗体平台，在精准诊断和靶向生物治疗中的应用，并重点讨论了纳米偶联、表面固定化和封装三种工程策略 | 系统总结了IgY相较于哺乳动物IgG在热稳定性和蛋白水解稳定性、低非特异性结合及低成本方面的优势，并提出了三种扩展其诊断与治疗应用的工程化策略 | 仍需要进一步的临床验证和生产标准化 | 探讨IgY作为通用生物识别平台在诊断和治疗领域的应用潜力及其工程化改造策略 | 免疫球蛋白Y（IgY）及其在诊断和治疗中的应用 | 生物医学工程，诊断学，治疗学 | NA | 纳米偶联，表面固定化，封装 | NA | 文本 | NA | NA | 鸡（蛋黄来源） | NA | 医学，诊断，治疗 |
| 15 | 2026-11-12 |
Scanning the horizon: deep mutational scanning approaches in virology
2026-07-21, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.01784-25
PMID:42267826
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综述 | 该综述总结了深度突变扫描（DMS）技术在病毒学中的最新技术和概念进展、所获得的见解以及未来研究的机会。 | 系统梳理了DMS在病毒学中应用的技术和概念进展，强调了合成生物学对突变文库工程的改造，并指出了未来研究方向。 | 作为综述文章，未提供原始实验数据，可能未涵盖所有相关研究或存在选择偏差。 | 总结DMS方法在病毒学中的最新进展，阐述其产生的见解并展望未来研究机会。 | 病毒基因组、病毒蛋白、突变文库。 | 病毒学 | NA | 深度突变扫描（DMS）、高通量突变、深度测序。 | NA | 序列数据。 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 16 | 2026-11-12 |
Artificial Intelligence as a Multifaceted Toolkit for Antibacterial Drug Discovery against Resistance
2026, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.1457
PMID:43011525
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综述 | 系统综述人工智能在抗菌药物发现与开发中应对耐药性的应用策略与进展 | 提出一个务实综合工具，从应用目标、数据属性、验证深度、生物可解释性和转化可行性等维度评估AI的增值空间与局限 | 数据异质性、克隆偏倚、外部验证有限、体外活性与体内疗效不一致，且尚无AI发现或设计的抗菌药物获得监管批准 | 明确AI如何合理应用于抗菌药物发现与开发以克服抗菌药物耐药性 | 抗菌药物耐药性及耐药细菌 | 机器学习 | 细菌感染 | 多组学整合, 复杂模式识别, 结构导向分子设计 | NA | 多组学数据, 分子结构数据, 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 17 | 2026-11-12 |
Regulatory review and governance gaps for genetically engineered microbes
2026, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2026.2008399
PMID:43012018
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综述 | 本文通过三个消费者和环境应用的案例，审视了美国对活体基因工程微生物的监管情况，指出联邦上市前审查非常有限或缺失，并提出了监管建议 | 通过案例研究系统揭示了美国对活体基因工程微生物监管中的空白，特别是基于修饰类型、产品分类或营销声明的区分导致审查缺失的问题 | 文章为监管政策分析，未涉及具体的实验数据或定量风险评估，主要基于案例和法规文本进行分析 | 评估美国对活体基因工程微生物的监管框架，识别治理空白并提出改进建议 | 活体基因工程微生物（GEMs）及其消费者和环境应用产品 | 合成生物学政策与监管 | NA | NA | NA | 文本 | 3个案例研究 | NA | NA | NA | 医学, 环境, 工业生物技术 |
| 18 | 2026-11-12 |
A phage transcription factor displaces the host σ factor and stabilizes its own σ factor
2025-07-19, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf683
PMID:40682819
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研究论文 | 本文通过冷冻电镜结构解析了噬菌体蛋白gp79与大肠杆菌RNA聚合酶及噬菌体σ因子gp36的复合物，揭示了gp79通过替换宿主σ70并稳定自身σ因子gp36来调控转录的双重机制 | 首次解析了gp79与RNAP以及gp79-gp36-启动子复合物的冷冻电镜结构，阐明了gp79 N端侵入RNA通道置换σ4的分子基础，以及gp79在遇到gp36后构象变化并稳定开放复合物的新机制 | 摘要未明确提及研究局限性 | 揭示噬菌体phiEco32蛋白gp79抑制宿主σ70转录同时激活自身σ因子gp36转录的双重调控分子机制 | 大肠杆菌RNA聚合酶、噬菌体phiEco32蛋白gp79、噬菌体σ因子gp36、宿主σ70因子及启动子DNA | 分子生物学, 结构生物学 | NA | 冷冻电镜(cryo-EM), 生化分析 | NA | 结构数据, 生化数据 | NA | NA | E. coli | NA | 合成生物学 |
| 19 | 2026-11-12 |
A quorum sensing-controlled type I CRISPRi toolkit for dynamically regulating metabolic flux
2025-07-19, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf693
PMID:40682826
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研究论文 | 开发了受群体感应控制的I型CRISPRi工具包（QICi），通过细胞密度动态调控基因表达，并应用于枯草芽孢杆菌中D-泛酸和核黄素的生物合成 | 将群体感应系统与I型CRISPRi系统整合，实现了基于细胞密度的动态代谢调控；通过优化crRNA载体构建和QS关键组件PhrQ/RapQ，使QICi效率提升了两倍 | 仅在枯草芽孢杆菌中验证，未在其他宿主中测试；动态调控的精确性和响应范围可能有限；未详细讨论长期进化稳定性 | 开发群体感应控制的I型CRISPRi工具包，用于动态调控代谢通量，并验证其在微生物代谢工程中的应用潜力 | 枯草芽孢杆菌（Bacillus subtilis）及其代谢途径 | 合成生物学 | NA | 群体感应（QS）、I型CRISPRi、crRNA载体构建、代谢工程 | NA | NA | NA | CRISPRi | 枯草芽孢杆菌 | QICi工具包：QS控制的CRISPRi系统，包含PhrQ/RapQ信号组件和crRNA表达盒，用于动态抑制靶基因（如citZ） | 工业生物技术、医药 |
| 20 | 2026-11-12 |
Enzyme-assisted high throughput sequencing of an expanded genetic alphabet at single base resolution
2024-05-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-48408-9
PMID:38744910
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研究论文 | 本文报道了一种酶辅助扩展遗传字母表测序（ESEGA）方法，能够以单碱基分辨率对六字母AEGIS DNA进行测序。 | 开发了ESEGA方法，首次实现对扩展遗传字母表（AEGIS）DNA的单碱基分辨率测序，并将其应用于优化六核苷酸PCR条件、评估不同DNA聚合酶的保真度以及扩展带有官能团的AEGIS组件。 | 摘要中未明确提及研究局限性。 | 为扩展DNA开发与天然DNA相同的分析工具，实现对六字母AEGIS DNA的高通量测序。 | 扩展遗传信息系统的DNA（六字母AEGIS DNA） | 合成生物学 | NA | 酶辅助高通量测序（ESEGA），六核苷酸PCR | NA | 序列数据 | NA | NA | NA | NA | 生物技术 |