合成生物学相关文章
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当前共找到 4379 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-02-07 |
Engineering strategies for microbial synthesis, customized modification, and application of hemoglobin
2026 Mar-Apr, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108752
PMID:41242508
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综述 | 本文综述了血红蛋白的微生物合成、定制化功能修饰及其在多个领域的应用策略与前景 | 重点探讨了利用人工智能算法定制血红蛋白功能修饰，并整合帕累托最优与迭代生物工程框架、深度学习及合成生物学等先进技术以克服应用挑战 | NA | 探讨血红蛋白的微生物合成、功能优化及多领域应用所面临的关键挑战与解决方案 | 血红蛋白 | 合成生物学 | NA | 微生物合成、人工智能算法、深度学习、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | NA | 医学, 生物技术, 农业, 食品, 工业生物技术 |
| 2 | 2026-02-07 |
Biosynthesis of high-value chorismate derivatives in Escherichia coli: Recent advances and perspectives
2026 Mar-Apr, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108762
PMID:41274425
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综述 | 本文综述了利用代谢工程和合成生物学策略在大肠杆菌中生物合成高价值分支酸衍生物的最新进展与前景 | 系统总结了大肠杆菌作为微生物平台生产分支酸衍生物的代谢工程与合成生物学最新策略，并讨论了工业化规模生产的挑战与机遇 | NA | 实现分支酸衍生物的绿色高效生物合成，替代传统植物提取和化学合成方法 | 分支酸衍生物（芳香族化合物） | 合成生物学 | NA | 系统代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌 | 分支酸生物合成途径 | 医药、化妆品、特种化学品 |
| 3 | 2026-02-07 |
Microbial computing: Review and Perspectives
2026 Mar-Apr, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108766
PMID:41317976
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综述 | 本文回顾了微生物计算领域的发展历程，总结了现有策略的局限性，并提出了基于储层计算的新视角 | 引入了自上而下的储层计算框架，利用生物系统固有的动态计算能力来解决更复杂多样的任务 | 现有的自下而上策略仍不足以模拟细胞信号处理系统的计算复杂性 | 回顾微生物计算的发展并展望未来方向，旨在推动下一代微生物计算机的工程设计 | 微生物计算机（生物计算机） | 合成生物学 | NA | NA | 储层计算、模拟计算架构、神经形态架构 | NA | NA | NA | NA | 数字逻辑门、可预测电路、多细胞计算系统 | 生物生产、生物修复、生物医学 |
| 4 | 2026-02-07 |
Optogenetic tools for optimizing key signalling nodes in synthetic biology
2026 Mar-Apr, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108770
PMID:41317977
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综述 | 本文综述了光遗传学工具在合成生物学中优化关键信号节点的应用，包括微生物代谢、植物科学和疾病治疗等领域 | 将光遗传学工具分为五类，基于不同应用场景，提供时空调控酶活性或基因表达的新策略，超越传统化学诱导方法 | NA | 探讨光遗传学工具在合成生物学中调控关键信号节点的潜力，以促进基础研究和生物产业发展 | 光遗传学工具及其在微生物、植物和动物系统中的调控应用 | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | NA | NA | 光遗传学工具 | 微生物, 植物, 动物 | 光诱导基因表达调度、光触发液-液相分离模块、光诱导亚细胞定位光感受器、光调控酶、光门控离子通道和泵 | 医学, 农业, 工业生物技术 |
| 5 | 2026-02-07 |
Engineering lignin pathway, plant cell wall modification, and genome editing for advanced renewable bioenergy and material applications
2026 Mar-Apr, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108772
PMID:41325824
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综述 | 本文综述了木质素生物合成、调控与工程化研究的最新进展，重点关注其在可再生生物能源和可持续生物材料应用中的潜力 | 整合了CRISPR/Cas基因组编辑、合成启动子、代谢重布线等新兴工具，并提出了结合多组学、单细胞技术、机器学习和田间验证的未来研究方向 | 从实验室到田间的转化应用仍然有限，且存在单木质醇运输、代谢通量控制和物种特异性调控差异等未解决的挑战 | 通过工程化木质素途径和植物细胞壁修饰，开发先进的生物能源和生物材料，推动循环生物经济发展 | 木质素生物合成途径、植物细胞壁、相关遗传与代谢网络 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas基因组编辑、合成启动子、代谢工程、多组学分析、单细胞技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 合成启动子 | 植物 | 木质素生物合成途径工程、代谢重布线 | 能源, 材料, 医药, 环境 |
| 6 | 2026-02-07 |
Geminivirus vectors: From gene silencing to synthetic biology
2026 Mar-Apr, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108771
PMID:41325825
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综述 | 本文综述了双生病毒作为载体在基因沉默和合成生物学中的应用，包括其基因组结构、复制蛋白功能、历史应用及未来展望 | 强调双生病毒载体在病毒诱导基因沉默（VIGS）和合成生物学中的突出作用，如通过自主复制促进高水平蛋白表达和增强CRISPR/Cas基因组编辑效率，并展望其跨王国应用潜力 | NA | 探讨双生病毒载体在植物基因工程、作物改良和生物制造中的实用创新 | 双生病毒（双生病毒科植物DNA病毒）及其衍生的功能复制子（GVRs） | 合成生物学 | NA | 病毒诱导基因沉默（VIGS）、CRISPR/Cas基因组编辑、基因工程 | NA | NA | NA | CRISPR/Cas | 植物 | 双生病毒复制子（GVRs）作为类质粒DNA，支持植物合成生物学中的多样化设计，包括组织特异性启动子和基因表达增强序列 | 农业, 工业生物技术 |
| 7 | 2026-02-07 |
Building an expanded bio-based economy through synthetic biology
2026 Mar-Apr, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108775
PMID:41360191
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综述 | 本文探讨了合成生物学在扩展生物基经济中的作用，包括资源利用、底盘生物开发以及相关技术挑战与机遇 | 系统性地提出了构建未来生物基经济的综合框架，整合了微生物与植物合成生物学的协同发展路径 | NA | 探讨如何通过合成生物学技术推动生物基经济的扩展与发展 | 生物基经济的资源、底盘生物及合成生物学技术 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物, 植物 | NA | 能源, 工业生物技术, 环境 |
| 8 | 2026-02-07 |
Designing prokaryotic gene expression regulatory elements: From genomic mining to artificial intelligence-driven generation
2026 Mar-Apr, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108781
PMID:41419171
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综述 | 本文系统回顾了原核基因表达调控元件的设计策略，从基因组挖掘到人工智能驱动生成 | 整合了从经验性序列挖掘到基于生物物理模型和人工智能的理性设计策略，并强调了深度生成模型在功能调控元件开发中的应用 | NA | 优化微生物细胞工厂的生物生产，通过精细调控基因表达 | 原核基因表达调控元件 | 合成生物学 | NA | 基因组挖掘、随机诱变、靶向诱变、深度生成建模 | 深度生成模型 | 序列数据 | NA | NA | 原核生物 | 基因表达调控元件 | 工业生物技术 |
| 9 | 2026-02-07 |
Synthetic biology strategies for engineering probiotics and commensal bacteria for diagnostics and therapeutics
2026 Mar-Apr, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108782
PMID:41421426
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综述 | 本文综述了利用合成生物学工具和策略改造益生菌和共生细菌，用于人类疾病诊断和治疗的最新进展 | 系统总结了合成遗传回路如何显著提高疾病诊断和治疗的精确性与可靠性，实现实时监测、治疗甚至预防性干预 | NA | 开发用于人类疾病诊断和治疗的工程化益生菌和共生细菌 | 益生菌和共生细菌 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 益生菌, 共生细菌 | 生物传感器, 逻辑门, 振荡器, 切换开关 | 医学 |
| 10 | 2026-02-07 |
Geometric deep learning assists protein engineering. Opportunities and Challenges
2026 Mar-Apr, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108790
PMID:41456696
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综述 | 本文全面评述了几何深度学习在蛋白质工程中的应用、机遇与挑战 | 系统整合了GDL在蛋白质工程中的方法论原理、架构多样性和性能趋势，强调了其在增强可解释性和泛化能力方面的作用，并提出了将可解释AI与结构验证结合的统一框架 | NA | 探讨几何深度学习如何变革蛋白质工程的计算设计流程 | 蛋白质工程中的稳定性预测、功能注释、分子相互作用建模及从头设计 | 机器学习 | NA | 几何深度学习 | 几何深度学习模型 | 非欧几里得域数据（空间、拓扑、物理化学特征） | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 11 | 2026-02-07 |
A review on squalene production by engineered yeasts: Current advances and perspectives
2026 Mar-Apr, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108792
PMID:41475586
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综述 | 本文综述了工程酵母生产角鲨烯的当前进展与前景，包括生物合成途径、代谢策略、基因工程工具及新兴酵母潜力 | 首次系统总结工程酵母生产角鲨烯的综合策略，涵盖代谢工程、先进遗传工具和新兴酵母宿主 | NA | 探索通过合成生物学策略利用工程酵母生产角鲨烯的替代方法 | 工程酵母 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、基因工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 酵母 | 角鲨烯生物合成途径 | 工业生物技术 |
| 12 | 2026-02-07 |
Spatial engineering for biocatalytic cascade control through biomolecular compartmentalization
2026 Mar-Apr, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108786
PMID:41475588
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综述 | 本文系统评估了通过生物分子区室化实现生物催化级联控制的空间工程平台，包括支架化区室和无支架组装体 | 提出了一个理解不同空间控制原则的框架，用于调控途径效率和通量再分配，并展望了多功能空间组织工具和仿生平台的未来发展 | 当前在机制阐明、动态调控和跨系统兼容性方面存在局限性 | 探讨空间工程在生物催化过程控制中的应用，以优化代谢通量和途径效率 | 支架化区室（如脂质体、DNA折纸、聚合物囊泡和细菌微区室）和无支架组装体（如无膜细胞器和凝聚层） | 合成生物学 | NA | 生物分子区室化、空间工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、细胞工程 |
| 13 | 2026-02-07 |
Vanadium-dependent haloperoxidases: Recent advances and perspectives
2026 Mar-Apr, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108797
PMID:41506498
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综述 | 本文综述了钒依赖性卤过氧化物酶（VHPOs）的最新进展与前景，涵盖其发现、结构功能、机制阐明及合成应用 | 挑战了长期存在的可扩散HOX模型，并实现了理性酶工程，推动选择性卤化和可持续合成 | NA | 综述VHPOs在合成化学和生物技术领域的最新研究进展与未来应用潜力 | 钒依赖性卤过氧化物酶（VHPOs） | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 材料科学, 环境生物技术 |
| 14 | 2026-02-07 |
Bioremediation of ether PFAS alternatives: A structure-reactivity-partitioning framework for hybrid treatment design
2026-Feb-10, The Science of the total environment
DOI:10.1016/j.scitotenv.2026.181367
PMID:41570765
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综述 | 本文综述了醚类PFAS替代物的生物修复研究，提出了一个结合结构-反应性-分配性的混合处理设计框架 | 提出了一个结合分子结构、反应活性和分配特性的框架，用于指导混合处理设计，并明确了α-C-H/α-CHF或CCl“手柄”促进转化、全氟化和空间屏蔽导致持久性的结构-反应性规则 | NA | 评估醚类PFAS替代物的生物修复潜力，并提出混合处理策略以提高其矿化效率 | 醚类PFAS替代物，如HFPO-DA (GenX)、ADONA和氯化PFESAs (F-53B) | 环境科学 | NA | 生物修复、物理化学预活化（UV/亚硫酸盐、电芬顿、等离子体、维生素B12/硫化物还原） | NA | NA | NA | 合成生物学 | 工程微生物、转基因植物 | 表达加氧酶、脱卤酶或氟化物输出模块的工程微生物，以及携带氧化酶的转基因植物 | 环境 |
| 15 | 2026-02-07 |
Synthetic overlapping genes stabilize genetic systems
2026-Feb-06, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.02725-25
PMID:41649272
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研究论文 | 本文提出了一种名为OAFI的新方法，用于创建合成重叠基因，以稳定遗传系统并限制抗生素抗性基因的水平转移 | 开发了OAFI方法，通过将内层基因插入外层基因的灵活区域来创建合成重叠基因，从而稳定基因并增强生物控制 | NA | 开发一种工具来稳定工程基因并限制抗生素抗性基因的水平转移 | 合成重叠基因对，包括遗传报告基因和细菌毒素 | 合成生物学 | NA | OAFI方法 | NA | NA | NA | OAFI | 细菌 | 重叠基因对设计，其中内层基因编码于替代阅读框并插入外层基因的灵活区域 | 医学, 环境 |
| 16 | 2026-02-07 |
Natural pigments: recent advances and challenges in production and application
2026-Feb-05, Preparative biochemistry & biotechnology
IF:2.0Q3
DOI:10.1080/10826068.2026.2625199
PMID:41641740
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综述 | 本文全面综述了源自植物、动物和微生物的天然色素，重点关注可持续提取技术和代谢工程、CRISPR/Cas9及合成生物学等生物技术创新 | 系统比较了不同生物来源色素的优缺点，并评估了其在食品、制药、营养保健品和生物医学领域不断扩展的应用，同时提出了规模化生产的关键挑战和未来研究方向 | NA | 提供天然色素的全面且批判性综述，重点关注可持续提取技术和生物技术创新，以促进从实验室发现向工业应用的转化 | 源自植物、动物和微生物的天然色素 | NA | NA | 代谢工程、组学技术、CRISPR/Cas9基因组编辑、合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 食品, 化妆品, 制药, 纺织品, 营养保健品, 生物医学 |
| 17 | 2026-02-07 |
Slowpoke: An Automated Golden Gate Cloning Workflow for Opentrons OT-2 and Flex
2026-Feb-05, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00629
PMID:41642882
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研究论文 | 本文介绍了一个名为Slowpoke的自动化Golden Gate克隆工作流程，专为Opentrons OT-2和Flex液体处理平台设计 | 开发了用户友好且灵活的自动化工作流程，包含免费图形用户界面，简化了Golden Gate克隆过程 | 用户仍需手动进行菌落挑选和平板转移 | 开发合成生物学中DNA组装的自动化解决方案 | Golden Gate克隆工作流程 | 合成生物学 | NA | Golden Gate克隆 | NA | NA | 使用两个工具包验证：MoClo酵母工具包和SubtiToolKit | Golden Gate Assembly | 酵母, 枯草芽孢杆菌 | 基本转录单元构建, 多部件组装 | 工业生物技术 |
| 18 | 2026-02-07 |
APMSR: an intelligent QA system for synthetic biology empowered by adaptive prompting and multi-source knowledge retrieval
2026-Feb-05, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-38006-8
PMID:41644613
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研究论文 | 本文提出了一种名为APMSR的优化策略，通过自适应提示生成与多源知识检索相结合，构建了面向合成生物学领域的智能问答系统 | 提出基于问题特征的自适应提示生成与动态多源知识检索相结合的优化策略，并采用LinUCB算法平衡探索与利用，有效提升了领域特定信息检索的相关性和准确性 | 未明确说明系统在开放性问题或更复杂推理任务上的性能表现，也未讨论对非结构化知识源的适应能力 | 解决大型语言模型在合成生物学等专业领域问答中存在的知识鸿沟和幻觉问题，提升领域特定问答的准确性和鲁棒性 | 合成生物学领域的专业级复杂查询 | 自然语言处理 | NA | 大型语言模型（LLMs）、LinUCB算法 | LLM（未指定具体模型） | 文本（领域知识库与问题） | 未明确说明 | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 19 | 2026-02-07 |
Beyond CRISPR: next-gen precision engineering of CAR-NK cells for enhanced persistence, trafficking, and tumor eradication
2026-Feb-05, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-026-04219-0
PMID:41645252
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综述 | 本文综述了超越传统CRISPR技术，利用下一代精准工程工具（如碱基编辑、表观遗传重编程、靶向转座子系统及合成生物学回路）来增强CAR-NK细胞的持久性、迁移能力和肿瘤清除效果，以克服临床挑战 | 提出了整合碱基编辑、表观遗传重编程、靶向转座子系统和合成生物学回路等下一代精准工程工具，以协同增强CAR-NK细胞的三个关键疗效支柱：持久性、迁移和肿瘤清除，超越传统CRISPR的局限性 | NA | 探索超越传统CRISPR的下一代精准工程工具，以提升CAR-NK细胞疗法的安全性和疗效，克服临床挑战 | CAR-NK（嵌合抗原受体自然杀伤）细胞 | 合成生物学 | 肿瘤（包括血液恶性肿瘤和实体瘤） | 碱基编辑、表观遗传重编程、靶向转座子系统、合成生物学回路 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 碱基编辑器, 引物编辑器, CRISPR相关转座酶 | 自然杀伤细胞（NK细胞） | 逻辑门控靶向、免疫调节载荷、双特异性衔接器、合成/表观遗传回路（用于动态、上下文依赖的转基因控制） | 医学（细胞免疫疗法） |
| 20 | 2026-02-07 |
Recent advances of engineered bacteria for therapeutic applications
2026-Feb-04, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2025.11.013
PMID:41234015
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综述 | 本文系统回顾了工程化细菌在治疗应用中的最新进展，特别是在疾病干预中的多功能生物治疗平台 | 通过合成生物学方法，结合理性计算建模和模块化基因电路设计，克服了细菌固有功能限制，提升了时空精度、生物安全性和可扩展生产 | NA | 探讨工程化细菌作为治疗策略的发展、测试及其在肿瘤治疗和代谢紊乱管理中的应用 | 工程化细菌系统 | 合成生物学 | 肿瘤、代谢紊乱 | 合成生物学、基因工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 细菌 | 模块化基因电路设计，如生物传感器、逻辑门 | 医学 |