合成生物学相关文章

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当前共找到 5881 篇文献,本页显示第 1 - 20 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 工程工具 宿主生物 回路设计 应用领域
1 2026-10-22
Catalysis and allostery in bacterial ATP phosphoribosyltransferases
2026-Oct-20, The FEBS journal
综述 本文综述了细菌ATP磷酸核糖基转移酶(ATPPRT)的结构、催化机制和别构调控机制 系统总结了近期关于ATPPRT催化、别构调节、抑制和激活的发现,并讨论了该领域的开放性问题及可能的工业和生物医学应用 作为一篇综述,未提供新的实验数据,主要基于已有文献进行归纳总结 概述别构概念,综述细菌ATPPRT的结构、催化和别构机制,并探讨其作为药物靶点和合成生物学靶点的应用前景 细菌ATP磷酸核糖基转移酶(ATPPRT),包括长型和短型两种形式 合成生物学, 结构生物学, 酶学 结核病, 鲍曼不动杆菌感染 NA NA 文本 NA NA 细菌 NA 医学, 工业生物技术
2 2026-10-22
Anabaena, a multicellular model for cyanobacterial cell biology and biotechnology
2026-Oct-20, Journal of bacteriology IF:2.7Q3
综述 该综述总结了鱼腥藻(Anabaena)作为 Nostocales 目模式生物的研究历史,涵盖其异形胞分化、固氮机制以及细胞间通讯,并探讨了其在合成生物学和生物技术中的应用潜力 强调了现代细胞生物学方法带来的对细胞分化和独特细胞间通讯系统的新认识,并指出鱼腥藻可作为开发新型合成生物学工具的优良系统 文章为综述性质,未提供新的实验数据;主要基于对少数鱼腥藻菌株的研究,可能无法全面代表 Nostocales 目的多样性 回顾鱼腥藻作为 Nostocales 目模式生物的经典研究,展示分子遗传学、基因组学和现代细胞生物学如何深化对其生理和遗传的理解,并讨论其在生物技术中的应用前景 鱼腥藻(Anabaena)及形成异形胞的蓝细菌(Nostocales 目) 合成生物学, 微生物学, 细胞生物学 NA 分子遗传学, 基因组分析, 现代细胞生物学方法 NA 文献 NA NA 鱼腥藻(Anabaena) NA 生物技术, 合成生物学
3 2026-10-22
From genome editing to chromosome engineering in plants
2026-Oct-20, Trends in biotechnology IF:14.3Q1
综述 综述植物大片段基因组工程与染色体工程的主要策略、优缺点及其在基础植物生物学和作物育种中的应用 系统整合双链断裂、先导编辑、重组酶和转座酶四类技术,实现从千碱基到兆碱基DNA片段的可编程删除、插入、替换、重复、倒位和易位,并提出人工智能加速大片段基因组工程优化 未涉及具体实验验证数据,缺乏对各策略在不同植物物种中效率与脱靶效应的定量比较,人工智能整合尚处于展望阶段 总结植物大片段基因组工程策略并推动从基因组编辑向染色体工程的转变 植物基因组大片段DNA及染色体 植物基因组工程 NA 双链断裂技术、先导编辑、重组酶、转座酶 NA 文本 NA CRISPR-Cas9, 先导编辑, 重组酶, 转座酶 植物 NA 农业, 医学
4 2026-10-22
Programmable bacterial vaccine vectors: A Design-Build-Control framework for precision immune engineering
2026-Oct-18, Biotechnology advances IF:12.1Q1
综述 提出一个源自合成生物学的设计-构建-控制(DBC)框架,将细菌载体工程统一为可系统设计的问题,并综述了各阶段策略、平台类别、材料配方、转化决定因素及人工智能应用 将细菌疫苗载体工程重构为统一的生物技术问题,并引入设计-构建-控制(DBC)框架系统评估生物安全、可制造性和临床转化 人工智能在细菌载体设计中的应用部分仍属前瞻性,尚需实验验证 为可编程细菌疫苗载体的精准免疫工程提供系统化的设计-构建-控制框架 活细菌疫苗载体,包括减毒革兰氏阴性菌和革兰氏阳性菌、益生菌底盘,以及外膜囊泡、细菌幽灵和孢子等非复制系统 合成生物学 传染病, 肿瘤, 兽医疾病 NA NA 文本 NA NA 革兰氏阴性菌, 革兰氏阳性菌, 益生菌 诱导型启动子, 群体感应回路, 杀伤开关, 平衡致死系统, 无抗生素质粒维持系统 医学, 农业
5 2026-10-22
From oleaginous microalga to marine chassis: synthetic biology and process-aware biomanufacturing in Nannochloropsis
2026-Oct-17, Biotechnology advances IF:12.1Q1
综述 本文系统评述了海洋微藻Nannochloropsis从产油微藻向海洋光合生物制造底盘发展的合成生物学工具与过程感知制造进展 提出并评估Nannochloropsis作为可预测、可复用、过程感知的海洋底盘是否成熟,强调基因组架构、细胞器靶向规则、动态调控与迭代DBTL表型分析的重要性,并主张产品特异性底盘配置优于通用菌株 结果仍受基因组位点、菌株背景、胞内区室、生理状态和培养条件强烈影响,缺乏可复用基因组架构、可靠的细胞器靶向规则、动态调控和适配迭代DBTL的表型分析,且菌株设计与培养、收获、产物回收及部署耦合不足 评估现有合成生物学与过程感知生物制造进展是否足以支撑Nannochloropsis成为可预测、可复用、过程感知的海洋光合生产底盘 海洋微藻Nannochloropsis属 合成生物学 NA 基因组资源、核转化、同源重组、CRISPR/Cas编辑、标记回收、定点整合、模块化多基因组装 NA NA NA CRISPR-Cas9 Nannochloropsis 代谢途径工程(碳分配、三酰甘油积累、EPA合成与脂质类别分配、类胡萝卜素代谢、重组蛋白生产、特种代谢物合成) 医药, 工业生物技术, 食品
6 2026-10-22
Endophytes for climate-resilient agriculture: Mechanisms and systems-level insights
2026-Oct-15, Plant physiology and biochemistry : PPB IF:6.1Q1
综述 本文综述了内生菌在气候韧性农业中的作用机制及系统生物学见解 强调多组学和系统水平方法揭示内生菌介导的植物代谢、免疫和微生物组组装调控,并提出整合多组学、微生物组工程、合成生物学和精准农业的路径 田间表现不稳定、环境适应性、制剂与递送、宿主微生物兼容性、生态相互作用、生物安全及监管要求等制约农业转化 综合当前关于内生菌多样性、作物定殖、宿主特异性、植物-微生物信号传导及促生、抗病、养分获取和非生物胁迫耐受机制的知识 内生细菌和真菌及其与作物的互作 农业微生物学 NA 多组学 NA 文本 NA NA 植物 NA 农业
7 2026-10-22
Engineering the microbial architects: a genetic revolution in bio-electrochemical hydrogen production
2026-Oct-14, Biotechnology advances IF:12.1Q1
综述 综述合成生物学、生物电催化和反应器工程在可持续生物制氢中的融合框架 将合成生物学、生物电催化与反应器工程整合为生物制氢框架,并强调CRISPR-Cas9多重基因组编辑相较传统诱变在通路优化中的精准优势 存在可扩展性、技术经济可行性等技术瓶颈 探讨微生物生物电化学制氢的工程化改造与系统集成策略 产电微生物类群及生物电化学系统(BESs) 合成生物学 NA CRISPR-Cas9基因组编辑, 合成生物学, 生物电催化 NA 文本 NA CRISPR-Cas9 NA 调控网络重连, 代谢通路优化 能源, 环境
8 2026-10-22
AI-guided design and biomaterial integration for next-generation extracellular vesicle therapeutics: an evidence-weighted translational framework
2026-Jul-25, Journal of nanobiotechnology IF:10.6Q1
综述 本文提出一个证据加权框架,整合人工智能、生物材料、合成生物学和先进验证系统,以推动下一代细胞外囊泡疗法的临床转化 将AI引导设计、生物材料整合、合成生物学和先进验证系统融合为下一代EV框架,并以证据加权方式区分已验证系统与长期概念 AI方法多为回顾性验证而缺乏前瞻性治疗设计验证;生物材料对EV完整性、剂量标准化和控制报告不一致;可编程或触发响应EV系统仍主要处于临床前阶段;尚无FDA批准的EV疗法 构建证据加权的转化议程,推动细胞外囊泡疗法的临床转化 细胞外囊泡(EVs)及其治疗和诊断应用 机器学习, 数字病理学, 生物材料, 合成生物学 NA 人工智能, 生物材料, 合成生物学, 先进验证系统 NA 文本 NA NA NA 可编程或触发响应EV系统 医学
9 2026-10-22
The structure of the Vibrio natriegens 70S ribosome in complex with the proline-rich antimicrobial peptide Bac5(1-17)
2025-04-22, Nucleic acids research IF:16.6Q1
研究论文 本文报道了富含脯氨酸抗菌肽Bac5(1-17)与维氏弧菌70S核糖体复合物的冷冻电镜结构,揭示了其与核糖体出口通道的独特结合模式 首次解析了Bac5与核糖体复合物的结构,发现尽管Bac5与Bac7及其他I型PrAMPs序列相似,但其与核糖体出口通道的相互作用模式完全不同;Bac5与A位点和P位点tRNA在肽基转移酶中心的结合位点重叠,表明该I型PrAMP可干扰翻译起始的晚期阶段和延伸的早期阶段 仅解析了Bac5(1-17)与维氏弧菌70S核糖体的复合物结构,未进行体内功能验证;未比较Bac5与其他I型PrAMPs在结合模式上的详细差异 解析Bac5与细菌核糖体复合物的结构,阐明Bac5的结合模式和作用机制 Bac5(1-17)抗菌肽与维氏弧菌70S核糖体复合物 结构生物学 细菌感染 冷冻电镜 NA 结构数据 1个Bac5(1-17)与维氏弧菌70S核糖体复合物结构 NA 维氏弧菌 NA 医学, 合成生物学
10 2026-10-22
Deciphering the biosynthetic potential of microbial genomes using a BGC language processing neural network model
2025-04-10, Nucleic acids research IF:16.6Q1
研究论文 本文提出了一种基于Transformer的语言模型BGC-Prophet,用于生物合成基因簇(BGC)的预测和分类,并在大规模基因组和宏基因组数据中进行了验证 利用Transformer编码器捕获基因间的位点依赖关系,实现了超高通量的BGC预测,在效率和保真度上显著优于现有方法,并首次进行了泛系统发育和全宏基因组的BGC筛查 摘要未明确提及研究的局限性 解密微生物基因组中BGC的生物合成潜力,开发高效准确的BGC预测工具,并探索BGC的进化模式 微生物基因组和宏基因组中的生物合成基因簇(BGCs) 生物信息学、机器学习 NA Transformer语言模型 Transformer 基因组序列、宏基因组序列 85,203个基因组和9,428个宏基因组 NA NA NA 合成生物学、药物发现
11 2026-10-22
A mediator-free sonogenetic switch for therapeutic protein expression in mammalian cells
2025-03-20, Nucleic acids research IF:16.6Q1
研究论文 本文提出了一种无需介质的超声诱导基因开关SUPER,利用低强度超声产生ROS激活KEAP1/NRF2通路,在哺乳动物细胞中实现治疗蛋白表达的远程精准控制 首次实现无需纳米颗粒或热效应的超声直接调控基因表达,利用内源性ROS感应系统KEAP1/NRF2/ARE构建合成基因开关,具备良好的可逆性和多种细胞类型适用性 仅在1型糖尿病小鼠模型中进行了概念验证,长期安全性和免疫原性未评估,微胶囊封装细胞的长期存活和功能维持有待进一步研究 开发一种无需介质、非侵入性的超声响应基因开关,实现对哺乳动物细胞中治疗蛋白表达的时空精准调控 哺乳动物细胞(包括hMSC-TERT),1型糖尿病小鼠模型 合成生物学 1型糖尿病 超声刺激,ROS感应,合成基因回路 NA NA NA NA 哺乳动物细胞 基于KEAP1/NRF2/ARE通路的超声响应基因开关,利用合成ARE启动子驱动靶基因表达 医学
12 2026-10-22
Coli bond: A dual-function encryption system for secure information storage and transmission by microorganisms
2025, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 该论文提出了一种名为Coli Bond的双功能加密系统,利用合成生物学改造的大肠杆菌实现DNA信息的安全存储与可控传输 将DNA存储的高密度与合成生物学的动态调控相结合,通过咖啡因浓度和温度控制信息传递,并引入温度敏感的自毁机制确保信息不可逆销毁 多次转移后菌株活力快速下降可能影响长期稳定性,信息传输依赖于特定条件(咖啡因和温度)的控制 开发一种安全可控的微生物信息存储与传输平台 工程化的大肠杆菌菌株 合成生物学 NA DNA存储、合成生物学 NA DNA编码信息 NA NA 大肠杆菌 咖啡因降解途径、温度敏感自毁机制 医学, 工业生物技术
13 2026-10-22
Leveraging the histidine kinase-phosphatase duality to sculpt two-component signaling
2024-06-10, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文以细菌光敏色素双组分系统为范式,研究传感器组氨酸激酶的激酶-磷酸酶双重催化活性如何决定信号响应,并通过改造获得更高灵敏度和反转输出的衍生系统 揭示了激酶-磷酸酶平衡对双组分系统信号响应的决定性作用,获得了红光灵敏度提高十倍的衍生系统,并构建了红光下输出增加的反转型TCS 研究主要基于单一细菌光敏色素TCS范式,衍生系统仅在特定条件下验证,尚未系统评估在其他TCS或体内复杂环境中的普适性 探究组氨酸激酶的激酶-磷酸酶催化双重性如何影响双组分系统的信号响应,并利用这一特性工程化改造信号响应特性 细菌光敏色素双组分系统及其衍生系统 合成生物学 NA 定点突变、蛋白质工程、光遗传学调控 NA NA NA NA 细菌 双组分信号系统(传感器组氨酸激酶-响应调节蛋白)及衍生改造系统 合成生物学,工业生物技术
14 2026-10-22
Exploring plant-derived phytochrome chaperone proteins for light-switchable transcriptional regulation in mammals
2024-06-08, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 该文章在哺乳动物细胞和小鼠中验证植物来源的光敏色素伴侣蛋白FHY1和FHL的功能,并构建光开关转录调控平台PTRC及CRISPRa系统 首次在哺乳动物中利用植物光敏色素伴侣蛋白FHY1/FHL与ΔPhyA构建光控转录调控复合物PTRC,实现红光/远红光切换的正交、模块化、可调基因转录控制,并与CRISPRa、小分子或蓝光诱导模块整合 摘要未明确说明局限性,可能包括光控系统在深层组织中的穿透性限制、长期光毒性或免疫原性等问题 开发基于植物光敏色素伴侣蛋白的先进光开关转录因子系统,用于哺乳动物基因表达的精确调控 哺乳动物细胞和小鼠 合成生物学 NA 光遗传学、CRISPRa、转录调控工程 NA NA NA CRISPRa 哺乳动物细胞, 小鼠 光开关转录调控复合物PTRC(FHY1/FHL-ΔPhyA),PTRC控制CRISPRa系统,及与小分子或蓝光诱导模块整合的调控回路 医学, 生物医学工程
15 2026-10-21
Expanding photosynthesis through biosolar oxic N2 fixation: toward a sustainable BioNitrogen Economy
2026-Oct-19, Bioresource technology IF:9.7Q1
综述 综述固氮蓝细菌的多样性、固氮酶保护策略及基因工程改造,提出光合固氮(PNF)驱动的可持续生物氮经济路线图 提出光合固氮(PNF)概念,将光合作用的功能范围从碳固定扩展到碳氮双固定,并系统提出太阳能驱动的生物氮经济路线图 作为综述文章,未提供原始实验数据,所提出的路线图尚需实验验证和规模化应用检验 探讨利用固氮蓝细菌将光合作用扩展到大气氮固定,推动从化石燃料依赖的化学氮经济向可持续生物氮经济转型 固氮蓝细菌(diazotrophic cyanobacteria)及其固氮酶系统 合成生物学, 代谢工程, 农业生物技术 NA 合成生物学, 基因组工程, AI辅助多组学分析 NA 多组学数据, 文献数据 NA NA 蓝细菌 NA 农业, 工业生物技术, 环境, 能源
16 2026-10-21
Additive Manufacturing of Metabolically Active Living Materials with Enhanced Biocontainment
2026-Oct-19, ACS applied bio materials IF:4.6Q2
研究论文 该文通过结合预打印配方开发和后打印乙醇处理,增强3D打印酵母活体材料中的细胞保留能力(生物封闭) 结合材料策略(添加MAA/DMAEMA共聚单体)和后打印乙醇浸泡处理来增强生物封闭,而非仅依赖合成生物学策略;发现乙醇浸泡后形成外周无生长区与代谢活跃核心共存的结构 操作窗口仅约4-5天;乙醇浸泡会降低酵母活力(DMAEMA和高浓度MAA显著降低活力);仅针对酵母Saccharomyces cerevisiae和F127-BUM水凝胶体系 提升3D打印工程活体材料中细胞的物理保留能力(生物封闭),延长细胞在基质中的保留时间 酵母Saccharomyces cerevisiae细胞与Pluronic F127-bisurethane methacrylate (F127-BUM)水凝胶构成的工程活体材料 合成生物学, 工程活体材料, 3D打印 NA 挤出式3D打印, UV交联, 乙醇浸泡处理 NA 实验数据(活力、保留时间、乙醇产量等) NA NA Saccharomyces cerevisiae(酿酒酵母) NA 工业生物技术, 生物制造
17 2026-10-21
Targeting phenol-soluble modulins: eco-friendly theragnostic strategies against Staphylococcus aureus biofilms
2026-Oct-19, Future microbiology IF:2.5Q3
综述 综述了靶向酚溶性调节蛋白(PSM)对抗金黄色葡萄球菌生物膜的生态友好诊疗策略 提出将纳米技术、基因编辑、多组学、人工智能和合成生物学相结合,开发针对PSM的先进抗毒力策略 CRISPR-Cas9和dCas9等基因编辑方法存在递送困难 总结靶向PSM毒力因子以对抗金黄色葡萄球菌生物膜的绿色诊疗策略 金黄色葡萄球菌及耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)的生物膜和毒力因子PSM 微生物学, 纳米医学, 合成生物学 细菌感染 绿色合成金属纳米颗粒, 多组学(基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学), CRISPR-Cas9, dCas9, 人工智能, 合成生物学 NA 文献 2010至2026年间发表的文献 CRISPR-Cas9, dCas9 金黄色葡萄球菌 NA 医学
18 2026-10-21
Programming biological behavior with AI-guided de novo protein design
2026-Oct-15, Molecular cell IF:14.5Q1
观点文章 探讨AI引导的从头蛋白质设计如何从双分子相互作用迈向自下而上构建蛋白质反应网络,以编程复杂生物行为。 提出将从头蛋白质设计从分子结合剂拓展到可编程蛋白质反应网络的视角,强调模块化、可控组件驱动涌现性生物行为。 尚未解决可设计蛋白质动力学、多步功能和非平衡系统等挑战。 展望从头蛋白质设计在构建蛋白质反应网络和编程生物行为方面的未来方向。 从头设计的蛋白质组件及蛋白质反应网络。 合成生物学 NA AI引导的从头蛋白质设计 NA NA NA NA NA 蛋白质反应网络 医学,生物技术,合成生物学
19 2026-10-21
Engineering CAR-T cell therapies for digestive tract cancer: advances, challenges, and strategies to overcome tumor heterogeneity and immunosuppressive barriers
2026-Oct-08, Neoplasia (New York, N.Y.)
综述 系统总结CAR-T细胞疗法在消化道肿瘤中面临的抗原异质性、免疫抑制微环境和代谢抑制等瓶颈及其应对策略 采用挑战-解决方案范式,整合前沿临床数据,提出针对消化道恶性肿瘤CAR-T疗法的系统性优化路线图 抗原丢失、生产可扩展性和临床反应不一致等未解决问题仍然存在 探讨CAR-T细胞疗法在消化道肿瘤中的进展、挑战及克服肿瘤异质性和免疫抑制屏障的策略 消化道肿瘤,包括胃癌、结直肠癌和食管癌 肿瘤免疫治疗 消化道肿瘤 CAR-T细胞疗法 NA 文本 NA NA NA 双靶点CAR、细胞因子表达构建体、逻辑门控受体 医学
20 2026-10-21
Designer Enzymes: Food-System-Oriented Biocatalysts for Mitigating Mycotoxin Contamination and Reducing Postharvest Grain Loss
2026-Oct-04, Foods (Basel, Switzerland)
综述 本文综述了用于缓解霉菌毒素污染和减少采后粮食损失的食品体系导向的设计酶,并提出了一个五维框架来评估其从实验室到实际应用的转化瓶颈 提出了“设计酶”这一面向部署的工程概念,即在优化前先定义预期使用条件,并以此指导分子、制造、制剂、安全和监管决策;同时构建了包含机理理解、预测设计整合、多目标优化、部署就绪性以及安全与监管准备度的五维定性诊断框架 五维框架仅作为定性诊断工具而非经过正式验证的数值评分系统;综述基于文献证据而非原始实验数据,可能受限于已发表研究的偏倚和覆盖范围 批判性审视基于酶的霉菌毒素解毒技术从实验室表征到实际食品或饲料应用的转化差距,并提出结构化的路线图以指导有前景的解毒酶走向可信、安全且可规模化的应用 主要霉菌毒素类别包括黄曲霉毒素、脱氧雪腐镰刀菌烯醇及相关单端孢霉烯族毒素、玉米赤霉烯酮、赭曲霉毒素A和伏马毒素,以及针对这些毒素的天然酶和工程化变体 食品科学, 蛋白质工程, 合成生物学 NA 蛋白质工程, 结构引导工程, AI辅助突变优先排序, 稳定性优化, Design-Build-Test-Learn工作流, 合成生物学, 多酶系统 NA 文本 NA NA NA 多酶系统 食品, 饲料, 农业
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