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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-08-26 |
Reconstructing food colorants via synthetic biology: From microbial cell factories to sustainable biomanufacturing supply chains
2026-Oct-31, Food research international (Ottawa, Ont.)
DOI:10.1016/j.foodres.2026.120221
PMID:42637367
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综述 | 本文综述了利用合成生物学和代谢工程构建微生物细胞工厂,以可持续方式生产红、黄、蓝三原色食品着色剂的研究进展,并探讨了相关挑战与未来方向 | 系统性地从分子到系统层面评估了多尺度工程策略,并对比了全球监管框架,为生物基着色剂的工业化整合提供了综合视角 | 未涵盖所有食品着色剂类别,且对工业应用中的具体技术瓶颈(如成本、规模化)讨论有限 | 探讨微生物合成食品着色剂的技术进展、监管挑战及未来研究重点,以推动其工业化应用 | 微生物细胞工厂生产的红、黄、蓝色食品着色剂 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、代谢工程 | NA | 文献数据 | NA | NA | 微生物(如细菌、酵母等) | NA | 食品工业 |
| 2 | 2026-08-26 |
Innovations in Bacteriophage Genome Engineering for Combating Multidrug-Resistant Bacterial Infections
2026-Oct, Foodborne pathogens and disease
IF:1.9Q3
DOI:10.1089/fpd.2024.0194
PMID:40216545
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综述 | 本文综述了噬菌体基因组工程的最新进展,旨在应对多重耐药细菌感染,重点介绍了CRISPR/Cas9、同源重组等工程技术及其应用 | 系统总结了利用CRISPR/Cas9、同源重组等先进基因组工程技术改造噬菌体,以增强其靶向性和宿主范围,为治疗多重耐药菌感染提供新思路 | 未详细讨论工程噬菌体在临床转化中的具体挑战,如体内稳定性、免疫反应等问题 | 探讨噬菌体基因组工程在克服多重耐药菌感染中的潜力和未来发展方向 | 多重耐药细菌及其噬菌体 | 合成生物学 | 多重耐药菌感染 | CRISPR/Cas9,同源重组 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 细菌 | NA | 医学 |
| 3 | 2026-08-26 |
Directed evolution of functional intrinsically disordered proteins
2026-Sep, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-025-02128-3
PMID:41513854
|
研究论文 | 本文提出一种定向进化方法,用于在活细胞中进化功能性的合成内在无序蛋白(synIDPs),并展示其在蛋白质电路调控和抗生素耐药性逆转中的应用。 | 首次系统性地开发了定向进化方法,用于进化具有不同相行为和热响应特性的合成内在无序蛋白,并引入了反选择方法以筛选作为溶解度标签的蛋白。 | 摘要未提及具体局限性。 | 开发一种系统性的定向进化方法,以克服设计功能性合成内在无序蛋白的挑战,并扩展其在合成生物学和生物技术中的应用。 | 合成内在无序蛋白(synIDPs)及其在活细胞中的相行为、热响应和溶解度特性。 | 合成生物学 | NA | 定向进化、反选择 | NA | 蛋白序列和表型数据 | NA | NA | 活细胞(具体未指明) | 蛋白质电路 | 合成生物学, 生物技术 |
| 4 | 2026-08-26 |
Functional amyloids as molecular switches: emerging roles in diverse signalling pathways
2026-Aug-26, Biochemical Society transactions
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BST20250193
PMID:42638611
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综述 | 本文综述了功能性淀粉样蛋白作为分子开关在多种信号通路中的作用,强调其结构、组装机制及生物学功能 | 系统性地阐述了功能性淀粉样蛋白作为可编程分子开关的机制,并探讨了其在合成生物学和医疗领域的潜在应用 | 未提供具体的实验数据,对功能性淀粉样蛋白的调控机制讨论较为概括,缺乏深度定量分析 | 综述功能性淀粉样蛋白在信号转导中的角色,并探讨其在治疗和合成生物学中的设计前景 | 功能性淀粉样蛋白及其在信号通路中的调控系统,如RIPK1:RIPK3坏死体、真菌朊病毒和酵母及后生动物中的类朊病毒系统 | 分子生物学 | NA | NA | NA | 综述文献 | 不适用 | NA | 哺乳动物细胞、真菌、酵母、后生动物 | 可编程淀粉样蛋白开关 | 医疗、合成生物学 |
| 5 | 2026-08-26 |
[Construction and practice of a talent training model for synthetic biology]
2026-Aug-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.260172
PMID:42638071
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研究论文 | 本文探讨了江南大学在合成生物学人才培养模式上的改革与实践,包括课程模块、实践教育体系和数字化平台建设 | 提出了跨学科融合、工程实践导向、数字化智能驱动的培养范式,并建立了包含认知构建、能力提升和品格培养的系统性工程实践教育体系 | 未提及具体局限性信息 | 总结合成生物学人才培养模式的改革措施,为相关专业建设提供参考 | 江南大学合成生物学专业及其人才培养模式 | 教育 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 教育 |
| 6 | 2026-08-26 |
Research progress on biosynthesis and regulation of monoterpenoid compounds
2026-Aug-24, Natural products and bioprospecting
IF:4.8Q1
DOI:10.1007/s13659-026-00640-0
PMID:42635857
|
综述 | 本文综述了单萜类化合物的生物合成途径、多层次调控机制以及通过代谢工程和合成生物学在微生物中异源生产的最新进展,并讨论了可持续高效生物制造的主要瓶颈和优化策略。 | 系统总结了单萜类化合物的生物合成与调控研究进展,并特别强调了异源生产中的瓶颈与优化策略,为可持续生物制造提供了综合视角。 | 未明确提及具体实验数据或案例的局限性,主要基于文献综述,可能缺乏对特定问题深入实验验证。 | 总结单萜类化合物生物合成和调控的研究进展,并探讨异源生产的优化策略,以促进其高效可持续的生物制造。 | 单萜类化合物及其生物合成途径、调控机制和异源生产系统。 | 生物技术 | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | 文本 | NA | NA | 大肠杆菌、酿酒酵母 | 单萜类化合物生物合成途径 | 食品、香精、医药、农业 |
| 7 | 2026-08-26 |
Probiotic-Derived Antimicrobial Proteins and Peptides: Molecular Mechanisms, Clinical Applications, and Future Therapeutic Perspectives
2026-Aug-24, Probiotics and antimicrobial proteins
IF:4.4Q2
DOI:10.1007/s12602-026-11180-x
PMID:42635917
|
综述 | 本文综述了益生菌来源的抗菌蛋白和肽(PAPs)的分子机制、临床用途及未来治疗前景,重点介绍了其直接抗菌作用和宿主调节功能。 | 系统总结了PAPs的四类直接抗菌机制及其与宿主调节的双重功能,并探讨了合成生物学和人工智能等前沿技术在其开发和递送中的应用。 | PAPs的转化应用仍面临稳定性、可扩展性、安全性和监管分类等挑战,相关解决方案尚处早期阶段。 | 评估PAPs的抗菌机制、宿主调节效应及其在临床和食品等领域的应用潜力,并为未来开发提供方向。 | 益生菌(特别是乳酸菌)产生的抗菌蛋白和肽,如细菌素和酪蛋白水解片段。 | 微生物学、医学、蛋白质工程 | 感染性疾病(包括多重耐药病原体感染) | NA | NA | 文献资料 | NA | 合成生物学、人工智能辅助发现 | 乳酸菌(作为产生菌) | NA | 医学、食品工业、生物技术 |
| 8 | 2026-08-26 |
SynBio 8.0: A Portrait of a Growing Canadian Ecosystem
2026-Aug-24, Canadian journal of microbiology
IF:1.8Q4
DOI:10.1139/cjm-2026-0122
PMID:42636477
|
会议综述 | 本文总结了在加拿大滑铁卢大学举办的第八届年度加拿大合成生物学研讨会(SynBio 8.0)的主要观点和活动,展示了加拿大合成生物学领域的多样性和发展势头。 | 该会议涵盖了从生物制造、酶工程到环境微生物学、新工具开发和植物合成生物学等多个前沿主题,并创下了海报提交数量的纪录,反映了该领域的快速发展。 | 本文为会议综述,未提供具体研究数据或详细技术分析,主要基于会议讨论和演讲内容。 | 旨在展示加拿大合成生物学社区的现状、趋势和未来方向,强调跨学科合作和实际应用。 | 加拿大合成生物学社区的研究人员、学员和行业参与者。 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 文本(会议记录、演讲摘要) | 约140名来自加拿大及国际的参会者 | NA | NA | NA | 工业生物技术, 环境, 农业, 材料 |
| 9 | 2026-08-26 |
Living drug carriers: Microbial and bioengineered platforms redefining precision therapeutic and immunomodulatory delivery
2026-Aug-24, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society
IF:10.5Q1
DOI:10.1016/j.jconrel.2026.115274
PMID:42636890
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综述 | 本文综述了工程化微生物活体药物载体,包括基因修饰细菌和益生菌平台,在精准治疗和免疫调节递送方面的最新进展 | 强调了微生物活体药物载体将可编程生物传感、原位治疗合成、适应性免疫调节和可控药物递送整合于单一活体底盘中的独特优势 | 未具体说明局限性,但提及了临床转化中的挑战,如微生物活性、生物分布、安全性和复杂生理环境中的可控激活 | 探讨工程化微生物活体药物载体在精准医学中的潜力和临床应用前景 | 工程化微生物活体药物载体,包括基因修饰细菌和益生菌平台 | 合成生物学 | 癌症、自身免疫性疾病、炎症性疾病、代谢和内分泌疾病、神经免疫疾病(如肌萎缩侧索硬化症)、感染性疾病(如寨卡病毒)、罕见遗传病 | 合成生物学、基因电路设计、生物封存、封装技术、生物材料-微生物杂交、刺激响应释放平台 | NA | NA | NA | NA | 微生物(如细菌) | 可编程生物传感、基因表达程序控制、原位治疗合成、适应性免疫调节 | 医学 |
| 10 | 2026-08-26 |
Prophage Activation Triggers Extracellular Synthesis of DNA in Bacterial Biofilms via Rolling Circle Replication
2026-Aug-24, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.3695434
PMID:42638202
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研究论文 | 本文揭示了前噬菌体激活通过滚环复制触发细菌生物膜中细胞外DNA合成的新机制,并展示了利用该机制构建功能性DNA超结构的生物技术平台。 | 首次发现前噬菌体可被利用来合成具有特定功能的程序化eDNA超结构,通过设计自定义环形模板引导G-四链体序列的滚环复制,在营养限制条件下触发前噬菌体激活和细胞裂解,形成球形或线状超结构,并增强电化学性能或表现出过氧化物酶活性。 | 本研究主要基于环境细菌(Shewanella oneidensis和Bacillus subtilis),且eDNA合成依赖于营养限制条件,可能限制了其在其他宿主或条件下的普适性。 | 探究前噬菌体在控制eDNA合成、结构和活性中的作用,并开发一种利用前噬菌体工程化功能性DNA材料的新平台。 | Shewanella oneidensis和Bacillus subtilis及其携带的前噬菌体。 | 合成生物学 | NA | 滚环复制,荧光报告基因,实时监测,G-四链体-血红素DNAzyme分析,电化学测量 | NA | 图像(荧光显微),电化学数据 | 涉及两种细菌菌株,具体样本量未说明 | NA | Shewanella oneidensis, Bacillus subtilis | 自定义环形模板指导的G-四链体序列滚环复制,前噬菌体激活触发细胞裂解和eDNA合成 | 合成生物学, 生物技术 |
| 11 | 2026-08-26 |
Harnessing Yeast Biodiversity for Advanced Industrial Applications
2026-Aug-22, FEMS yeast research
IF:2.4Q3
DOI:10.1093/femsyr/foag031
PMID:42631727
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综述 | 这篇综述总结了利用酵母生物多样性进行工业应用的最新进展,包括自然多样性和人工多样性,并强调了多组学分析、人工智能辅助工程和过程优化的重要性 | 系统性地整合了自然多样性与人工多样性(如适应性实验室进化、代谢或表观遗传工程和合成生物学)的概念,并提出将极端嗜极酵母作为胁迫适应模型以及结合多组学、人工智能和过程优化来充分利用酵母生物多样性 | 未提供具体实验数据或案例的详细分析,可能对某些新兴技术的应用深度不足 | 探讨如何利用酵母生物多样性提升工业生物生产效率,并指出未来关键策略 | 酿酒酵母和非传统酵母物种 | 工业生物技术 | NA | 多组学分析、适应性实验室进化、代谢工程、表观遗传工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 酿酒酵母和非传统酵母物种 | NA | 工业生物技术 |
| 12 | 2026-08-26 |
Toward Complex Polyketide Biosynthesis in Yarrowia lipolytica via Metabolic Reprogramming
2026-Aug-21, Journal of microbiology and biotechnology
IF:2.5Q3
DOI:10.4014/jmb.2606.06035
PMID:42625493
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综述 | 本文综述了通过代谢重编程在非常规酵母解脂耶氏酵母中实现复杂聚酮化合物生物合成的最新策略,包括经典代谢重编程和新兴的细胞器工程与亚细胞区室化方法。 | 系统总结了从经典代谢重编程到新兴细胞器工程和亚细胞区室化等策略,并强调了解脂耶氏酵母作为高价值聚酮化合物生产平台的优势。 | 当前聚酮化合物生产仍面临产量低、结构复杂性有限等挑战,需进一步优化代谢网络和工程策略。 | 将解脂耶氏酵母建立为可编程、工业可行的聚酮化合物生产平台。 | 解脂耶氏酵母(Yarrowia lipolytica)及其聚酮化合物生物合成途径。 | 合成生物学 | 不适用 | 代谢工程 | 不适用 | 文献数据 | 不适用 | 不适用 | 解脂耶氏酵母 | 聚酮化合物生物合成途径 | 医药、工业生物技术 |
| 13 | 2026-08-26 |
Inter-species horizontal transfer of biosynthetic gene clusters: an evolutionary driver for chemical diversity in bacterial communities
2026-Aug-19, Essays in biochemistry
IF:5.6Q1
DOI:10.1042/EBC20250014
PMID:41847751
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评述文章 | 本文探讨了生物合成基因簇(BGC)在细菌间水平转移的机制及其对化学多样性的进化意义,并为合成生物学提供启示。 | 提出BGC作为可移动单元的观点,挑战传统基因组中心视角,并强调模仿自然模块化转移系统以工程化可移植生物合成平台。 | 未涉及具体的实验验证,且对BGC转移后功能维持和动态追踪的挑战仅作讨论。 | 阐明BGC水平转移的机制和进化影响,并探索其在合成生物学中的应用潜力。 | 细菌群落中的生物合成基因簇(BGC)及其水平转移机制。 | 微生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 生物合成基因簇(BGC)转移系统 | 合成生物学 |
| 14 | 2026-08-26 |
A guide to Direct Pathway Cloning (DiPaC) for natural product discovery
2026-Aug-19, Essays in biochemistry
IF:5.6Q1
DOI:10.1042/EBC20250016
PMID:42210810
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综述 | 本文综述了直接途径克隆(DiPaC)技术在天然产物发现中的应用,涵盖其方法原理、应用案例和技术指导 | DiPaC结合长片段PCR和体外DNA组装,无需中间文库构建、体内重组或多抗生素筛选标记,实现生物合成途径的同步克隆和重构,提供载体、宿主和途径架构的广泛灵活性 | 未明确提及局限性,但指出了扩增挑战性序列和组装策略等常见技术障碍 | 介绍DiPaC作为天然产物研究中高效灵活的合成生物学方法,并提供应用指导 | 生物合成基因簇(BGCs)及天然产物 | 合成生物学 | NA | 长片段PCR、体外DNA组装 | NA | 基因组序列数据 | NA | DiPaC | 多种微生物(未具体指定) | 生物合成途径的克隆和重构,包括启动子交换、调控元件移除和模块化重建 | 医学、工业生物技术 |
| 15 | 2026-08-26 |
Reimagining Lignin Valorization: Synthetic Biology-Enabled Sustainable Aromatic Carbon Biomanufacturing
2026-Aug, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.76698
PMID:42474033
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综述 | 本文提出通过合成生物学实现木质素增值利用的范式转变,强调从孤立催化步骤转向集成解聚、转化和调控框架,以推动可持续芳香碳生物制造 | 提出以合成生物学设计逻辑为核心的集成解聚、转化和调控框架,强调调控控制而非仅通路完整性是决定木质素生物转化效率、稳健性和可扩展性的关键 | 未具体说明实验验证或定量数据,可能缺乏实际应用中的可行性评估 | 提出木质素增值利用的路线图,将合成生物学驱动的调控作为可持续芳香碳生物制造的统一原则 | 木质素及其衍生物,涉及解聚、转化和代谢调控过程 | 合成生物学 | NA | 光酶催化、化学-生物杂合体 | NA | NA | NA | NA | 微生物细胞工厂 | 动态调控回路、基于生物传感器的控制、生长-生产解耦机制 | 工业生物技术 |
| 16 | 2026-08-26 |
Adaptive Responses of Tropical Crops: A Multi-Scale Omics Integrated Perspective
2026-Aug, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.76735
PMID:42505031
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综述 | 本文综述了热带作物在长期自然选择和驯化下形成的适应策略,涵盖基因组特征、结构变异和育种对适应性轨迹的影响,并展望了未来研究方向 | 整合多尺度组学视角,系统阐述热带作物适应性机制,并提出将热带适应机制应用于其他作物的合成生物学和基因编辑策略 | 未提供具体的实验数据或案例验证,主要基于现有文献的总结和展望 | 总结热带作物适应性策略,并为气候适应性可持续农业提供理论依据和实践策略 | 热带作物,如甘蔗、香蕉、木薯、橡胶和油棕 | 基因组学 | NA | 多组学(如基因组学、转录组学等) | NA | 文献资料 | NA | 基因编辑 | NA | NA | 农业 |
| 17 | 2026-08-26 |
Next-Generation Food Enzymology: From Metagenomic Discovery to AI-Driven Biocatalyst Design
2026-Jul-29, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.6c04349
PMID:42461222
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评述 | 本文探讨了宏基因组学、人工智能和合成生物学融合如何推动食品酶学进入新时代,实现从传统生物催化剂到定制化新型酶的转变。 | 强调宏基因组发现与AI驱动的生物催化剂设计的整合,将酶工程从经验性过程转变为预测性学科。 | 未提供实验验证或具体案例,仅基于前瞻性视角讨论。 | 探讨宏基因组学、AI和合成生物学在开发定制化生物催化剂用于可持续、精准的下一代食品加工中的应用。 | 食品酶学生物催化剂 | 合成生物学 | NA | 宏基因组学、多组学、蛋白质结构预测、de novo蛋白设计 | NA | 序列数据、结构数据 | NA | NA | NA | NA | 食品 |
| 18 | 2026-08-26 |
In vitro properties of large serine integrase hybrids derived from ϕC31 and TG1 integrases
2026-Jul-17, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag750
PMID:42535648
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研究论文 | 本研究报道了来源于ϕC31和TG1整合酶的杂合整合酶的体外活性,这些酶能高效重组杂合attP×attB底物,同时通过TG1衍生的卷曲螺旋结构域保留与同源重组方向性因子(RDF)的相互作用 | 提出了一种模块化框架,通过混合ϕC31和TG1整合酶来工程化具有定制特异性的丝氨酸整合酶,并验证了DNA结合域与att位点识别基序在决定特异性中的关键作用 | 研究仅限于体外实验,未涉及体内应用或靶向自定义基因组位点的实际验证 | 开发可编程的丝氨酸整合酶,以扩展其靶向特定基因组位点的应用范围 | ϕC31和TG1整合酶及其杂合变体 | 合成生物学 | NA | 体外重组分析 | NA | 实验数据 | NA | NA | NA | 杂合整合酶系统,涉及attP和attB底物重组及attL×attR重组 | 基因组工程, 合成生物学 |
| 19 | 2026-08-26 |
Functional Diversity of Probiotic Effector Molecules: Insights into Their Role in Improving Gut Health
2026-04, Annual review of food science and technology
IF:10.6Q1
|
综述 | 本文综述了益生菌效应分子(PEMs)的功能多样性,重点探讨其在改善肠道健康中的作用机制 | 系统总结了PEMs的类别、作用机制及面临的挑战,并提出利用比较基因组学、合成生物学和下一代益生菌等新兴方法开发其治疗潜力 | 未提及具体实验数据或临床验证,缺乏定量分析 | 阐明PEMs的多样性和功能,以促进靶向益生菌疗法和创新功能食品的设计 | 益生菌效应分子,包括细菌聚糖聚合物、表面蛋白、分泌肽和酶、细胞外囊泡及小分子代谢物 | 微生物组学 | 肠道疾病 | 比较基因组学、合成生物学 | NA | 文本 | NA | 合成生物学 | NA | NA | 医学、食品 |
| 20 | 2026-08-26 |
Synthetic Biology Approaches in Reducing Mycotoxin Contamination and Enhancing Food System Sustainability
2026-04, Annual review of food science and technology
IF:10.6Q1
|
综述 | 本文探讨了合成生物学在减少霉菌毒素污染和提升食品系统可持续性方面的作用,包括快速检测、有效控制及副产物增值转化等应用 | 整合人工智能和多组学技术开发识别元件、抗菌剂和降解酶,并强调CRISPR多重编辑和微生物细胞工厂等新兴技术 | 未提及具体实验数据或局限性,可能缺乏定量评估 | 阐述合成生物学在霉菌毒素降解和食品及副产物增值转化中的关键作用,推动食品安全和循环生物经济 | 霉菌毒素、产毒真菌、食品及加工副产物 | 合成生物学 | 霉菌毒素中毒 | CRISPR、多组学、人工智能 | NA | 文献数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 微生物 | 微生物细胞工厂 | 食品, 农业, 环境 |