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当前共找到 5671 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-09-12 |
The big kinship of proline: Counting saturated and unsaturated secondary amino acids of different ring size
2026-Oct, Biochimie
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.biochi.2026.06.010
PMID:42320729
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研究论文 | 本文提出了一种数学枚举方法，用于系统计数不同环大小的饱和与不饱和环状仲α-氨基酸和亚氨基酸，并给出了递推公式（修正的Lucas序列）及显式计数公式 | 首次针对所有可能的环状仲α-氨基酸和亚氨基酸，按环中原子数和饱和/不饱和类型进行系统数学枚举，推导出修正Lucas序列的递推公式及显式计数公式，为该类化合物的虚拟数据库构建和计算机辅助合成设计提供了数学基础 | 研究主要基于数学枚举和理论推导，缺乏实验验证；对已表征结构的综述可能不够全面；未涉及立体化学异构体的详细计数 | 建立环状仲α-氨基酸和亚氨基酸的数学枚举方法，统计不同环大小下饱和与不饱和化合物的数量，并为虚拟化合物数据库构建和化学合成计算辅助设计提供理论工具 | 环状仲α-氨基酸和亚氨基酸（包括脯氨酸及其非蛋白质源性同系物和衍生物） | 计算生物学 | NA | 数学枚举、递推公式推导、组合数学 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 2 | 2026-09-12 |
Bacterial surface layer - Properties, role, applications and challenges - A review of the next-generation nanotechnological tool
2026-Oct, Journal of microbiological methods
IF:1.7Q4
DOI:10.1016/j.mimet.2026.107648
PMID:42542137
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综述 | 本文综述了细菌表面层（S层）蛋白的结构特性、自组装机制及其在纳米生物技术、疫苗开发、生物传感、药物递送和超滤等领域的应用，并讨论了商业化面临的挑战与解决方案 | 首次将S层生物学机制与工程化制造、蛋白质设计工作流程及商业化路线图进行整合，提供了先前综述未涵盖的可操作方案和基准 | 高纯度蛋白生产的可扩展性、重组表达的成本效益、严苛工业条件下的稳定性以及生物衍生纳米材料的监管路径尚未解决；合成替代品也带来实际和经济竞争 | 系统总结S层蛋白的特性、功能与应用，分析其从理论潜力向功能原型转化的工程化与商业化瓶颈，并展望其在医学、工业与环境领域的变革前景 | 细菌和古菌的表面层（S层）蛋白及其自组装形成的二维晶体阵列 | 纳米生物技术 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | 细菌, 古菌 | NA | 医学, 工业生物技术, 环境 |
| 3 | 2026-09-12 |
Biosynthesis and Biotransformation of Plant Triterpenoids: Current Advances and Future Perspectives
2026-Sep-11, Advances in biochemical engineering/biotechnology
DOI:10.1007/10_2026_355
PMID:42720748
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综述 | 本文综述了植物三萜类化合物的生物合成与生物转化，重点介绍了合成生物学和人工智能在微生物细胞工厂生产三萜类化合物中的应用。 | 首次系统总结了人工智能在加速植物三萜类化合物途径解析、异源酶和微生物底盘工程化以及工艺优化中的应用前景。 | 未涉及具体实验数据，主要基于现有文献的归纳总结。 | 综述植物三萜类化合物的生物合成途径、关键酶家族、结构多样性和生物活性，并探讨提高微生物细胞工厂生产效率的策略及未来方向。 | 植物三萜类化合物（包括四环和五环三萜皂苷）及其微生物细胞工厂（尤其是酿酒酵母）。 | 合成生物学 | 癌症, 炎症性疾病, 肝脏疾病, 免疫性疾病 | 合成生物学, 代谢工程, 人工智能 | NA | 文本 | NA | NA | 酿酒酵母 | 代谢途径（涉及OSCs、P450s、UGTs等酶） | 医药, 食品 |
| 4 | 2026-09-12 |
SCULPT-MCP: Systematic Chromosomal Upgrades for Locus-Driven Protein Topologies in Microcompartments
2026-Sep-11, ACS chemical biology
IF:3.5Q2
DOI:10.1021/acschembio.6c00504
PMID:42721414
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研究论文 | 本文展示了通过将关键结构基因pduN在操纵子中重新定位来塑造细菌微区室的形态和功能，从而建立操纵子架构作为纳米结构形态发生的可编程遗传框架。 | 发现基因顺序可以控制纳米级组装和区室化功能，尽管蛋白质序列相同；建立了操纵子架构作为纳米结构形态发生的可编程遗传框架。 | 未提及 | 探索基因顺序对蛋白质纳米机器组装和功能的影响，并开发定制几何形状和活性的自组装纳米器件的合成生物学策略。 | 细菌微区室（BMCs）及其关键结构基因pduN。 | 合成生物学 | NA | 基因重定位 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 操纵子 | 医学 |
| 5 | 2026-09-12 |
Sulfated polysaccharides and their utilization mechanisms by microorganisms: A review
2026-Sep-10, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.154431
PMID:42722257
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综述 | 本文综述了硫酸化多糖的来源、结构、生物活性以及微生物降解机制 | 系统讨论了肝素、硫酸软骨素、岩藻多糖和磺达肝癸钠四种典型硫酸化多糖的结构与生物活性，并重点分析了拟杆菌门、乳酸菌和微球菌的降解策略及活性酶的作用 | 未提及具体的研究局限性 | 总结硫酸化多糖的研究进展，探讨其微生物降解机制及应用潜力 | 硫酸化多糖（肝素、硫酸软骨素、岩藻多糖、磺达肝癸钠）及降解它们的微生物 | 糖生物学 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学，代谢工程，医疗保健 |
| 6 | 2026-09-12 |
De novo Genes in Plants: Origins, Mechanisms, and Functional Implications
2026-Sep-10, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2026.102098
PMID:42723285
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综述 | 该综述总结了植物新基因的起源机制、进化特征、功能作用及识别方法，并展望了其在作物改良和合成生物学中的应用前景 | 系统整合了植物新基因的转录优先、开放阅读框优先及并发模型等主要起源路径，并强调了长非编码RNA中的潜在编码能力、表观遗传激活及调控网络整合等未来关键问题 | 当前新基因识别方法受限于序列快速进化、基因组注释质量、多倍体及转座元件等因素，且每种方法均存在重要局限性 | 总结植物新基因研究的最新进展，阐明其如何塑造植物适应性并探讨其在精准育种和合成生物学中的应用潜力 | 植物新基因（从头基因） | 基因组学 | NA | 全基因组共线性比对，多组学证据，机器学习方法 | 机器学习 | 文本，基因组序列 | NA | NA | 植物 | NA | 农业，工业生物技术 |
| 7 | 2026-09-12 |
Systematic mapping of insertion-tolerant regions enables capsid engineering of an infectious RNA phage
2026-Sep-09, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.01639-26
PMID:42573247
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研究论文 | 该研究结合MuA转座酶介导的插入突变与反向遗传学系统，系统鉴定了RNA噬菌体MS2和PP7中耐插入区域（ITRs），并在此基础上实现了感染性RNA噬菌体的衣壳工程改造 | 首次系统绘制了RNA噬菌体MS2和PP7的耐插入区域图谱；首次在感染性RNA噬菌体中实现衣壳蛋白工程改造，成功在PP7衣壳蛋白中插入Arg-Gly-Asp基序并保持感染性 | 研究仅针对MS2和PP7两种RNA噬菌体，耐插入区域图谱可能不适用于其他RNA噬菌体；工程化噬菌体的稳定性与野生型相当，未显著提升；仅在模型中验证了清除效果，尚未进行体内实验验证 | 系统鉴定RNA噬菌体MS2和PP7基因组中的耐插入区域，并利用这些信息实现感染性RNA噬菌体的衣壳工程改造，为RNA噬菌体作为合成生物学平台奠定基础 | RNA噬菌体MS2和PP7 | 合成生物学 | NA | MuA转座酶介导的插入突变、反向遗传学系统、cDNA克隆技术 | NA | 序列数据、结构数据 | 筛选了4555个MS2和2228个PP7随机插入克隆，分别鉴定出29个和26个非冗余耐插入区域 | MuA转座酶 | NA | NA | 医学、工业生物技术 |
| 8 | 2026-09-12 |
Microbial partnerships and molecular mechanisms in plant stress physiology for climate-resilient and sustainable farming
2026-Sep-08, Planta
IF:3.6Q1
DOI:10.1007/s00425-026-05140-6
PMID:42709227
|
综述 | 本文综述了植物-微生物伙伴关系及其分子机制在提高作物养分获取和逆境耐受性中的作用，并探讨了多组学、人工智能和合成生物学在设计与应用微生物接种剂和合成微生物群落方面的潜力 | 整合生态、生理和分子视角，强调人工智能与大数据分析在优化基于微生物组的可持续农业策略中的新前沿作用 | 作为综述，未提供原始实验数据，且将先进微生物组策略转化为可扩展的田间应用仍面临挑战 | 探讨植物-微生物相互作用及其分子机制，以提升作物气候适应性和可持续农业生产力 | 植物相关微生物群落、作物、根际分泌物、植物激素和群体感应信号 | 农业微生物组学 | NA | 多组学、人工智能、合成生物学、大数据分析 | NA | 文本 | NA | NA | 植物 | 合成微生物群落 | 农业、环境 |
| 9 | 2026-09-12 |
Advances and challenges in building microbial cell factories for phytohormone biomanufacturing toward sustainable agriculture
2026-Sep-07, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.109035
PMID:42705366
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综述 | 系统总结了植物激素的分类、生物功能和生物合成途径，重点介绍了利用微生物细胞工厂生产植物激素的合成生物学策略，并讨论了相关挑战及未来方向 | 全面整合了植物激素微生物合成的多种合成生物学策略，并提出了自动化、机器学习和人工智能在加速微生物细胞工厂开发中的应用前景 | 未涉及具体实验数据，主要基于文献综述，缺乏对特定策略的定量比较和实验验证 | 探讨利用微生物细胞工厂生产植物激素的合成生物学策略，以实现可持续农业中的绿色病虫害管理 | 植物激素（脱落酸、赤霉素、茉莉酸、水杨酸、生长素等）及其微生物细胞工厂 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、代谢工程、启动子工程、辅因子工程、转运蛋白工程、动态调控、细胞色素P450工程、亚细胞区室化、蛋白质工程、自动化与人工智能工程 | NA | 文本 | NA | NA | 微生物 | 植物激素生物合成途径 | 农业 |
| 10 | 2026-09-12 |
Engineering extracellular vesicles for targeted siRNA delivery: Advances, therapeutic applications, and clinical translation
2026-Sep-05, Nanomedicine : nanotechnology, biology, and medicine
IF:4.7Q2
DOI:10.1016/j.nano.2026.103020
PMID:42700828
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综述 | 本文综述了工程化细胞外囊泡用于靶向siRNA递送的研究进展、治疗应用及临床转化前景 | 系统整合了EV工程化策略（如电穿孔、超声、挤出、亲本细胞工程、微流控等货物装载方法及肽、抗体、适配体、杂合纳米平台等表面功能化修饰），并全面总结了工程化EV介导的siRNA递送在多种疾病中的治疗应用，同时探讨了合成生物学、基因组工程、人工智能和多功 能杂合囊泡等新兴技术的整合 | 在大规模制造、货物装载效率、标准化、质量控制、监管审批和临床转化方面仍面临挑战 | 探讨工程化细胞外囊泡作为靶向siRNA递送平台的生物学特性、工程化策略、治疗应用及临床转化前景 | 细胞外囊泡（EVs）、siRNA、RNA干扰机制及相关疾病模型 | 机器学习 | 肺癌 | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 11 | 2026-09-12 |
Engineering post-transcriptional regulation via synthetic membraneless organelles
2026-Sep-03, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2026.102546
PMID:42692139
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研究论文 | 该研究通过工程化合成无膜细胞器，在大肠杆菌中实现了靶向mRNA的隔离和可编程的转录后调控 | 将合成无膜细胞器的应用从翻译后调控扩展到转录后调控，通过正交RNA结合蛋白-适配体相互作用实现靶向mRNA隔离，并展示了在细胞分裂拯救和母乳寡糖生产中的应用 | 研究仅在大肠杆菌中验证，未在其他宿主中测试，且未详细评估系统的脱靶效应和长期稳定性 | 扩展合成无膜细胞器的功能范围，使其能够进行RNA中心调控，实现可编程的转录后控制 | 大肠杆菌中的mRNA和合成无膜细胞器 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、RNA结合蛋白-适配体相互作用 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌 | 合成无膜细胞器（凝聚体）作为模块化枢纽，整合翻译机制或隔离靶转录本 | 医学、工业生物技术 |
| 12 | 2026-09-12 |
Predictive design of tissue-specific mammalian enhancers that function in the mouse embryo
2026-Sep, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-026-02729-1
PMID:42642514
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研究论文 | 该文章提出了一种利用深度学习设计在小鼠胚胎中具有组织特异性的合成增强子的通用策略 | 首次证明仅从DNA序列即可可靠推断哺乳动物增强子功能，并能从头设计在体内发挥作用的组织特异性合成增强子 | 训练集规模有限，设计的增强子数量较少（15个），且仅在心脏、肢体和中枢神经系统中验证，未涵盖更多组织类型 | 开发一种能够预测性设计在哺乳动物体内（小鼠胚胎）可靠发挥功能的组织特异性增强子的方法 | 小鼠胚胎中的心脏、肢体和中枢神经系统组织特异性增强子 | 机器学习 | NA | 染色质可及性测序、迁移学习、深度学习 | CNN | 序列数据、染色质可及性数据 | 15个合成增强子，基于精选的染色质可及性数据及已验证的人类和小鼠增强子 | NA | 小鼠 | 组织特异性增强子 | 医学、合成生物学、基因治疗 |
| 13 | 2026-09-12 |
Synthetic biology
2026-Sep, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-026-03289-9
PMID:42722812
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 14 | 2026-09-12 |
Engineering plasmids with synthetic origins of replication
2026-Feb-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68907-1
PMID:41629321
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研究论文 | 该文章通过重新设计天然pMB1复制起点，构建了具有可定制拷贝数的合成复制起点质粒，并实现了模块化、多重信号响应及多质粒兼容共维持 | 首次对天然pMB1复制起点进行重构并创建合成复制起点（SynORI），利用合成RNA调控因子实现独立拷贝数控制，并构建了可模块化响应多种信号的兼容质粒系统 | 研究仅在E. coli中验证了质粒共维持一周，未在其他宿主或更长时间尺度上验证其稳定性和通用性 | 建立具有合成复制起点的质粒平台，以提升质粒的可调性、兼容性和模块化程度，服务于合成生物学 | 质粒复制起点（pMB1）及大肠杆菌中的质粒 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、质粒工程、RNA调控 | NA | NA | 6个兼容SynORI质粒在大肠杆菌中共维持一周 | NA | E. coli | 合成复制起点（SynORI）、合成RNA调控因子、多重信号响应报告系统、兼容质粒库 | 工业生物技术、医学 |
| 15 | 2026-09-12 |
Metabolic Engineering of Microbial Strains for 1,2,4-Butanetriol Production: Progress and Future Perspectives
2026, Advances in biochemical engineering/biotechnology
DOI:10.1007/10_2026_322
PMID:42477129
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综述 | 本文综述了微生物菌株代谢工程生产1,2,4-丁三醇的研究进展，包括生物合成途径设计、代谢工程与工艺优化策略以及利用木质纤维素生物质作为可持续原料，并展望了结合人工智能技术提升生产效率的未来方向 | 系统整合了1,2,4-丁三醇生物合成途径设计、代谢工程与过程优化策略，并首次提出将人工智能技术与先进代谢工程和合成生物学方法相结合以提升1,2,4-丁三醇生产效率的未来方向 | 实现具有成本竞争力的1,2,4-丁三醇生产仍面临重大挑战，现有代谢工程和工艺优化策略尚未达到经济可行的生产水平 | 综述微生物代谢工程生产1,2,4-丁三醇的研究进展，并探讨未来提升生产效率的策略 | 工程化微生物菌株（细菌和酵母细胞工厂）及其1,2,4-丁三醇生物合成途径 | 工业生物技术 | NA | 代谢工程、合成生物学、过程优化、人工智能技术 | NA | 文本 | NA | NA | 细菌, 酵母 | 1,2,4-丁三醇生物合成途径 | 医药, 工业生物技术, 材料, 能源 |
| 16 | 2026-09-12 |
The Landscape of Synthetic Biology and Bioengineering in Spain
2026 Jan-Dec, Engineering biology
DOI:10.1049/enb2.70011
PMID:42724222
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综述 | 本文综述了西班牙合成生物学与生物工程领域二十年来的发展历程，涵盖自下而上的合成细胞工程、自上而下的活体系统重编程以及计算与人工智能驱动的设计，并探讨了该国在欧洲合成细胞计划、全球生物铸造网络、SEVA标准化平台及高级培训项目中的角色与未来挑战 | 系统性地梳理了西班牙合成生物学从经典分子生物学向多机构协同生态系统转型的全景，首次重点整合了其在欧洲合成细胞倡议、全球生物铸造网络、SEVA标准化平台及MISB硕士和SYNBIO-CSIC COFUND博士网络等培训项目中的贡献，并提出了工程雄心与生物学复杂性、创新与可部署性、控制与涌现之间的核心张力框架 | 作为一篇观点性综述，未提供原始实验数据或定量分析，主要基于作者视角进行定性总结，可能无法全面覆盖西班牙所有合成生物学研究机构与产业动态 | 梳理并评估西班牙合成生物学与生物工程领域的发展轨迹、当前优势与新兴机遇，明确其在欧洲及全球工程生物学领域的定位，并讨论该领域面临的关键技术、监管、概念与转化挑战 | 西班牙合成生物学与生物工程研究社区、相关研究机构、标准化平台（SEVA）、培训项目（MISB硕士、SYNBIO-CSIC COFUND博士网络）以及欧洲合成细胞计划和全球生物铸造网络 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医药, 工业生物技术, 环境, 材料 |
| 17 | 2026-09-12 |
Microbiome-driven resistance in cervical cancer therapy: from mechanistic dissection to clinical translation
2025-12-29, Expert reviews in molecular medicine
IF:4.5Q2
DOI:10.1017/erm.2025.10029
PMID:41457383
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综述 | 本文综述了微生物组驱动宫颈癌治疗耐药的机制及临床转化应用 | 系统整合了阴道微生物失调通过乳酸介导代谢重编程、免疫检查点稳定和药物代谢改变驱动耐药的机制，并提出了合成生物学驱动的精准微生物组疗法和多中心标准化试验方案 | 缺乏统一的临床试验标准，地理变异（如撒哈拉以南非洲HIV合并感染）对治疗反应的影响尚未充分阐明，机制研究向临床转化的证据仍有限 | 阐明微生物组驱动宫颈癌治疗耐药的机制并推动临床转化 | 宫颈癌患者阴道微生物组及治疗耐药 | 数字病理学 | 宫颈癌 | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 18 | 2026-09-12 |
Efficient site-specific integration of kilobase-length DNA fragments in plant cells via Kp03 recombinase
2025-11-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116508
PMID:41187057
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研究论文 | 评估大丝氨酸重组酶Kp03在水稻和拟南芥中高效介导长达27.3 kb DNA片段位点特异性整合的能力。 | 首次系统评估Kp03重组酶在植物细胞中实现kb级DNA片段定点整合，并展示其与NM-PE基因组编辑系统联用实现内源位点靶向整合。 | 研究主要基于瞬时原生质体和水稻愈伤组织，尚未获得稳定遗传的转基因植株；整合效率随片段增大而下降。 | 开发高效植物基因组大片段定点整合工具，推动植物合成生物学发展。 | 水稻和拟南芥原生质体、水稻愈伤组织。 | 合成生物学, 植物基因组工程 | NA | 大丝氨酸重组酶介导的位点特异性整合, 原生质体瞬时转化, NM-PE基因组编辑 | NA | 分子实验数据 | 未明确说明具体样本数量 | Kp03重组酶, NM-PE | 水稻, 拟南芥 | 位点特异性重组系统 | 农业, 合成生物学 |
| 19 | 2026-09-12 |
Genomically integrated cassettes swapping: bringing modularity to the strain level in Saccharomyces cerevisiae
2025-01-30, FEMS yeast research
IF:2.4Q3
DOI:10.1093/femsyr/foaf032
PMID:40577080
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研究论文 | 本文描述了在酿酒酵母中利用CRISPR介导的盒交换系统，实现基因组整合盒的标准化交换或移除，将模块化提升到菌株水平 | 首次实现了对已整合到基因组中的表达盒进行标准化交换或移除，通过条形码靶向CRISPR（Cas9和Cas12a）一步完成盒的替换或野生型位点恢复，将模块化原则扩展到菌株水平 | 目前仅应用于荧光蛋白表达盒的交换，未展示在复杂代谢途径或工业相关菌株中的应用，效率约90%仍有提升空间 | 开发一种系统，能够轻松地通过CRISPR介导交换或移除先前整合的盒，从而将模块化带到菌株水平，增强修改现有菌株的可能性并减少步骤 | 酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae）的基因组整合表达盒 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9, CRISPR-Cas12a | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, CRISPR-Cas12a | 酿酒酵母 | 基因组整合的荧光蛋白表达盒交换系统 | 工业生物技术 |
| 20 | 2026-09-12 |
In silico encounters: harnessing metabolic modelling to understand plant-microbe interactions
2025-01-14, FEMS microbiology reviews
IF:10.1Q1
DOI:10.1093/femsre/fuaf030
PMID:40705360
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综述 | 本文综述了利用基因组尺度代谢建模研究植物-微生物相互作用的研究进展 | 系统梳理了代谢建模在共生、致病和微生物群落系统中的应用，并探讨了其作为合成微生物群落设计测试平台的潜力 | 作为综述，未提供原始实验数据，且指出了该领域仍面临的挑战，如模型精度和整合多组学数据的困难 | 总结代谢建模在理解植物-微生物相互作用中的应用，并展望未来方向 | 植物-微生物相互作用，包括共生、致病和微生物群落系统 | 系统生物学 | NA | 基因组尺度代谢建模 | 基因组尺度代谢网络模型 | 基因组、宏基因组、表型组等多组学数据 | NA | NA | 植物 | NA | 农业 |