合成生物学相关文章
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当前共找到 4946 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-05-15 |
Structure-function relationships and industrial integration of extremophilic xylanases for sustainable xylo-oligosaccharide production
2026-Aug, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.134751
PMID:42067162
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综述 | 系统总结了利用蛋白质工程和合成生物学策略工程化改造极端微生物木聚糖酶，以实现从木质纤维素生物质中可持续生产低聚木糖的研究进展 | 全面分析了极端微生物木聚糖酶在不同严苛条件下的结构适应性（如离子对网络、疏水核心和表面静电）及其在工业整合中的技术经济与生命周期评估 | 未来仍需进一步努力增强极端微生物木聚糖酶的商业化应用以实现可持续生物加工 | 探索极端微生物木聚糖酶的结构功能关系及其工业整合，以实现可持续的低聚木糖生产 | 极端微生物木聚糖酶（来源于嗜热、嗜盐、嗜酸/嗜碱微生物）及其在低聚木糖生产中的应用 | NA | NA | 蛋白质工程、合成生物学 | NA | NA | NA | 蛋白质工程, 合成生物学 | 嗜热微生物, 嗜盐微生物, 嗜酸/嗜碱微生物 | NA | 工业生物技术, 环境 |
| 2 | 2026-05-15 |
Base modifications shift tertiary structure and activity in synthetic RNA origami and a natural ribozyme
2026-May-13, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-72891-x
PMID:42128887
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研究论文 | 研究碱基修饰对合成RNA折纸纳米结构和天然四膜虫核酶的三级结构折叠及功能的影响 | 首次揭示5-甲基胞嘧啶和N1-甲基假尿苷等碱基修饰通过影响碱基堆积能量而非碱基配对，改变RNA折叠景观和结构-功能关系，对合成生物学和治疗用RNA设计具有指导意义 | 未探讨其他碱基修饰类型或更高阶结构对RNA折叠的影响，且实验温度依赖性机制尚需进一步验证 | 阐明碱基修饰对RNA三级结构折叠和功能的影响机制 | 合成RNA折纸纳米结构和天然四膜虫核酶 | 合成生物学，结构生物学 | NA | 低温电子显微镜（cryo-EM），荧光共振能量转移（FRET），生化分析 | NA | 图像，荧光数据，生化数据 | NA | NA | NA | NA | 医学，合成生物学 |
| 3 | 2026-05-15 |
Recombinant Protein Drugs: A 2025 Update
2026-May-13, BioDrugs : clinical immunotherapeutics, biopharmaceuticals and gene therapy
IF:5.4Q1
DOI:10.1007/s40259-026-00783-z
PMID:42129013
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综述 | 本文对2025年重组蛋白药物领域进行综述，整合了生产平台、蛋白质工程和监管科学的进展 | 强调蛋白质从替代疗法向多功能治疗平台的转变，涵盖下一代蛋白格式如双特异性抗体、纳米抗体和自组装生物材料 | 未提及具体临床失败案例或新兴技术的潜在风险 | 更新重组蛋白药物的现状，并概述塑造下一代生物制剂的技术 | 重组蛋白药物及其生产平台、工程策略和监管框架 | 机器学习 | 肿瘤、炎症、代谢性疾病 | 重组蛋白生产 | NA | 文本 | NA | NA | 微生物菌株、哺乳动物细胞、植物平台 | 双特异性抗体、纳米抗体、融合蛋白、自组装生物材料 | 医学 |
| 4 | 2026-05-15 |
Vesicle-Templated Self-Assembly of Programmable Freestanding Multi-μm DNA Shells
2026-May-13, Nano letters
IF:9.6Q1
DOI:10.1021/acs.nanolett.6c00402
PMID:42130031
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研究论文 | 本文介绍了一种简单、广泛适用的方法，通过在巨型单层囊泡上组装DNA壳，再用表面活性剂去除脂质体，释放出可编程的独立多微米DNA壳 | 首次实现从脂质体模板释放独立DNA壳，并保留膜模板几何形状；展示了DNA折纸和纳米星两种不同结构单元构建可调DNA壳的可行性 | 未详细讨论DNA壳在去除脂质体后的稳定性、生物相容性及潜在应用场景 | 开发一种制造独立、膜模拟DNA壳的方法，用于自下而上合成生物学中的新型区室化 | 巨型单层囊泡上的DNA壳 | 合成生物学 | NA | DNA折纸、脂质体去除 | NA | NA | NA | DNA折纸、纳米星 | NA | DNA壳结构（多层壳） | 合成生物学 |
| 5 | 2026-05-15 |
Molecular recruitment and release using DNA host condensates
2026-May-12, Nanoscale horizons
IF:8.0Q1
DOI:10.1039/d5nh00586h
PMID:41774821
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研究论文 | 利用DNA纳米星构建人工生物分子凝聚体，实现目标分子的招募与释放 | 首次将适配体集成到DNA纳米星中，实现凝聚体对目标生物分子的可调控招募与释放，并验证了适配体位置对系统功能鲁棒性的影响 | 仅研究了链霉亲和素（SA）一种模型分子，未探索对其他类型生物分子的通用性；凝聚体的长期稳定性和在复杂生物环境中的性能未评估 | 设计具有分子招募与释放功能的DNA凝聚体，用于合成生物学中的空间自组织 | DNA纳米星凝聚体及其适配体修饰的变体 | 合成生物学 | NA | DNA纳米技术、适配体工程 | NA | 实验数据 | NA | DNA纳米结构组装 | 无细胞系统（体外实验） | DNA纳米星凝聚体系统（含适配体） | 合成生物学 |
| 6 | 2026-05-15 |
Harnessing biosynthetic logic for next-generation ADC payloads
2026-May-12, Chemical Society reviews
IF:40.4Q1
DOI:10.1039/d5cs01487e
PMID:42015662
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综述 | 本文回顾了抗体药物偶联物（ADC）中有效载荷的发现、生物合成和制造方面的最新进展，重点关注其生物遗传起源、酶组装和规模化生产策略，并探讨利用生物合成逻辑扩展化学空间 | 通过基因组挖掘和合成生物学揭示临床有效载荷的生物合成基因簇和酶机制，为下一代ADC有效载荷的创新提供新思路 | 未明确讨论实际应用中可能遇到的挑战，如有效载荷的稳定性或肿瘤特异性问题 | 探索利用生物合成逻辑扩展ADC有效载荷化学空间，推动更安全、更有效和机制更复杂的疗法 | 抗体药物偶联物（ADC）的有效载荷，特别是天然产物衍生的细胞毒素和非毒性新模态 | 合成生物学 | 癌症 | 基因组挖掘、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 7 | 2026-05-15 |
Biological valorization of non-food feedstocks: A critical review
2026-May-12, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108918
PMID:42128207
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综述 | 系统综述非食物原料的生物增值化，涵盖原料特性、转化路线与废物升级策略 | 阐明非食物原料特性、生物转化路线与废物升级策略之间的机制联系，整合工艺优化策略与前沿进展 | NA | 为非食物原料生物炼制提供机制理解与战略指导，促进循环经济与粮食安全保障 | 非食物原料（如木质纤维素、工业废弃物等）及其生物转化与废物升级技术 | NA | NA | 厌氧消化、堆肥、合成生物学、多组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 环境, 工业生物技术 |
| 8 | 2026-05-15 |
A Streamlined and High-Osmolarity Bacillus subtilis Cell-Free Platform for Rapid Characterization of Genetic Regulatory Elements
2026-Apr-29, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00165
PMID:42052911
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研究论文 | 建立了一种简化且高渗透压的枯草芽孢杆菌无细胞平台，用于快速表征遗传调控元件 | 首次发现可以省略传统无细胞体系制备中的流出孵育和透析步骤；通过提高离子强度（钾谷氨酸盐浓度至400 mM）并添加渗透保护剂甜菜碱，显著增强了翻译能力；验证了平台作为细菌生理预测替代物的有效性 | 未详细说明该高谷氨酸框架在其他革兰氏阳性菌中的具体适用性和通用性 | 建立一种简化的枯草芽孢杆菌无细胞平台，用于快速评估和表征遗传调控元件 | 枯草芽孢杆菌无细胞体系及多种遗传调控元件 | 合成生物学 | NA | 无细胞体系、荧光检测、体内启动子文库 | NA | 荧光强度数据 | 涉及sfGFP表达及CcpA-HPr调控实验，具体样本量未明确 | NA | 枯草芽孢杆菌 | 遗传调控元件表征平台，包括启动子强度分析和CcpA-HPr调控回路 | 工业生物技术 |
| 9 | 2026-05-15 |
Metabolic Engineering of Bacillus subtilis for High-Level Production of Salidroside from Potato Starch
2026-Apr-28, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00803
PMID:42048483
|
研究论文 | 该研究通过代谢工程策略改造枯草芽孢杆菌，以马铃薯淀粉为碳源高效生产红景天苷 | 引入芳香醛合酶从头合成酪醇、结合群体感应动态调控系统优化产量，并通过过表达关键酶平衡前体供应 | 未提及 | 开发可持续的红景天苷生产方法，为工业化应用奠定基础 | 枯草芽孢杆菌工程菌株 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 枯草芽孢杆菌 | 红景天苷生物合成途径、群体感应动态调控系统 | 生物医药, 化妆品 |
| 10 | 2026-05-15 |
Reset-free DNA logic circuits for real-time input processing and memory
2026-Apr-03, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aeb1699
PMID:41921006
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研究论文 | 提出一种基于立足点介导链反应的无复位DNA逻辑电路，用于实时输入处理和记忆存储 | 首次实现无需复位操作的DNA逻辑电路，通过连续可逆链迁移机制支持实时数据处理和记忆功能，并基于DNA折纸平台构建多种组合逻辑门和记忆元件 | NA | 开发无复位DNA逻辑电路，实现实时输入处理和记忆功能 | DNA逻辑电路元件（逻辑门、触发器、寄存器） | 合成生物学 | NA | 立足点介导链反应（TCR）、DNA折纸 | NA | NA | NA | NA | NA | 组合逻辑门（AND、OR）、置位复位触发器、数据锁存器、级联寄存器 | 生物传感、诊断、合成生物学 |
| 11 | 2026-05-15 |
Engineering ligands for theophylline riboswitches expands its regulatory dynamic range in prokaryotic and eukaryotic systems
2026-Mar-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70870-w
PMID:41872214
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研究论文 | 通过结构导向设计合成4-喹唑啉酮衍生物，显著提升茶碱核糖开关在原核和真核系统中的调控动态范围 | 首次通过合理设计合成配体，将核糖开关的激活倍数从75倍提升至380倍，并在多种生物系统及CRISPR-Cas9应用中实现更高效的基因调控 | 未提及配体在不同宿主中的长期稳定性和潜在毒性 | 优化核糖开关配体以提高其调控性能，推动合成生物学和生物医学工程应用 | 茶碱核糖开关及其合成配体4-喹唑啉酮衍生物 | 合成生物学 | NA | 结构导向配体设计、核糖开关调控、CRISPR-Cas9基因编辑 | NA | 基因表达数据、结合亲和力数据、编辑效率数据 | 多种生物系统（细菌、分枝杆菌、真核细胞）中的实验数据 | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌、分枝杆菌、真核细胞 | 茶碱核糖开关调控回路 | 生物医学工程 |
| 12 | 2026-05-15 |
Functional organization and regulatory logic of the ped gene cluster in Pseudomonas species
2026-03-18, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.00046-26
PMID:41705821
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综述 | 综述了假单胞菌属中ped基因簇的功能组织与调控逻辑 | 首次系统整合假单胞菌属中ped基因簇的遗传组织、酶学功能和多层调控机制，并比较了不同物种间的进化保守性与适应性差异 | 未涉及实验验证，主要基于现有文献的总结与分析 | 建立ped基因簇作为模块化平台在应用微生物学中的参考框架 | 假单胞菌属中的ped基因簇及其编码的PQQ依赖性脱氢酶 | 合成生物学, 环境微生物学 | NA | 比较基因组学, 信号转导网络分析 | NA | 基因序列, 调控元件 | NA | NA | 假单胞菌属（KT2440和PAO1） | 基于PQQ依赖性脱氢酶的氧化途径，包含调节组件（如Fe依赖的YiaY脱氢酶和PP_2683组氨酸激酶） | 合成生物学, 环境修复, 生物生产 |
| 13 | 2026-05-15 |
Jumping Over Hurdles: Challenges and Solutions in Phage Therapy
2026-Mar, PHAGE (New Rochelle, N.Y.)
DOI:10.1177/26416549251409584
PMID:42130959
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综述 | 探讨噬菌体疗法在应对抗生素耐药性中的潜力、当前挑战及未来发展方向 | 系统总结了基因组学、合成生物学和CRISPR技术对噬菌体工程化的推动作用，以及个性化噬菌体疗法基于微生物组特征的应用进展 | 未深入具体临床数据，缺乏对噬菌体耐药性机制的详细分析，且未涉及标准化临床试验的量化结果 | 评估噬菌体疗法作为抗生素替代方案的现状、障碍及优化策略 | 慢性多重耐药感染患者（如移植患者）和噬菌体工程化技术 | 机器学习 | 传染病 | 基因组学、合成生物学、CRISPR-Cas9 | NA | 文献综述 | NA（基于现有研究综述） | CRISPR-Cas9 | 噬菌体 | NA（未涉及具体回路设计） | 临床医学 |
| 14 | 2026-05-15 |
Marine-derived antimicrobial peptides (AMPs): Blue biotechnological assets for sustainable healthcare and circular bioeconomy
2026, Advances in protein chemistry and structural biology
DOI:10.1016/bs.apcsb.2025.08.002
PMID:41581932
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综述 | 综述了海洋来源抗菌肽作为可持续医疗和循环生物经济中的蓝色生物技术资产的潜力 | 强调了海洋抗菌肽的低耐药性倾向、多功能生物活性以及通过基因组学、机器学习等新技术革新发现的途径 | 讨论了生产可扩展性和监管框架等关键挑战 | 探索海洋抗菌肽作为可持续替代品以应对全球抗生素耐药性危机 | 海洋来源抗菌肽 | NA | NA | NGS, 宏基因组学, 机器学习, 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 异源表达宿主（未具体指定） | NA | 医疗, 水产养殖, 食品安全, 环境修复 |
| 15 | 2026-05-15 |
Expanding the genetic code: phage-driven evolution of pyrrolysyl-synthetase for site-specific incorporation of synthetic phenylalanine and tyrosine derivatives
2026, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2026.1737987
PMID:41924351
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研究论文 | 本研究利用噬菌体辅助非连续进化技术对吡咯赖氨酰-tRNA合成酶进行定向进化，以增强其对苯丙氨酸和酪氨酸衍生物等非经典氨基酸的识别与掺入能力 | 首次将噬菌体辅助非连续进化应用于PylRS工程化，高效获得了底物特异性显著增强的突变体，并揭示了底物结合口袋的关键突变区域 | 未对进化后变体的体内蛋白质表达效率进行全面评估，也未探讨其在复杂细胞环境中的长期稳定性 | 拓展PylRS底物谱，实现酪氨酸和苯丙氨酸衍生物在蛋白质中的位点特异性掺入 | 来源于Methanosarcina mazei的吡咯赖氨酰-tRNA合成酶及其突变体 | 合成生物学 | NA | 噬菌体辅助非连续进化, 荧光掺入检测, 质谱分析 | NA | 测序数据, 荧光定量数据 | 未明确样品数量，涉及PylRS突变文库及多个进化变体 | PANCE | 噬菌体 | NA | 合成生物学 |
| 16 | 2026-05-15 |
Delivery of Encapsulated Intelligent Engineered Probiotic for Inflammatory Bowel Disease Therapy
2025-01, Advanced healthcare materials
IF:10.0Q1
DOI:10.1002/adhm.202403704
PMID:39629555
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研究论文 | 开发了一种黏液包封微球凝胶递送系统，用于封装基因工程益生菌，实现对炎症性肠病的诊断和治疗 | 设计了外部黏膜涂层（透明质酸和表没食子儿茶素没食子酸酯）与内部高生物相容性聚丝氨酸改性藻酸盐微球结合的双层递送系统，有效保护工程菌免受胃部恶劣环境影响并延长肠道定殖时间至24小时 | 实验仅基于炎症性肠病模型，未提及在人类患者中的验证结果 | 解决工程菌递送至病变部位并实现持续定殖的挑战，推动活体生物治疗产品的临床转化 | 基因工程益生菌（用于检测和治疗肠炎） | 合成生物学, 生物医学工程 | 炎症性肠病 | 合成生物学, 微球凝胶封装 | NA | 体内动物模型数据 | NA | 基因工程 | 益生菌（具体种类未说明） | 生物标志物检测与Avcystatin释放回路 | 医学 |
| 17 | 2026-05-15 |
Revolutionizing structural biology: AI-driven protein structure prediction from AlphaFold to next-generation innovations
2025, Advances in protein chemistry and structural biology
DOI:10.1016/bs.apcsb.2025.04.002
PMID:40973394
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综述 | 探讨从AlphaFold到下一代创新中人工智能驱动的蛋白质结构预测如何革命化结构生物学 | 系统回顾蛋白质结构预测从传统方法到AlphaFold及后续模型（如RoseTTAFold和OmegaFold）的演变，并重点分析AlphaFold的设计、方法论和性能，同时指出其局限性及未来方向 | 模型在预测蛋白质复合体和动态变化方面存在不足，且对计算资源要求较高 | 综述人工智能在蛋白质结构预测中的进展与应用，并展望未来发展方向 | 蛋白质结构预测方法及其在生物医学中的应用 | 机器学习, 结构生物学 | NA | AlphaFold, RoseTTAFold, OmegaFold, 同源建模, 从头预测 | 人工智能模型（如AlphaFold） | 蛋白质序列与结构数据 | NA | NA | NA | NA | 医学, 合成生物学, 药物发现 |
| 18 | 2026-05-12 |
Epigenome regulators imbue a single eukaryotic promoter with diverse gene expression dynamics
2026-May-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.115805
PMID:42111206
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研究论文 | 通过筛选80种染色质相关蛋白，研究单个真核启动子如何产生多样的基因表达动态 | 首次揭示单个基因可驱动丰富多样的动态表达谱，并建立了三状态启动子动力学模型 | 研究仅在酵母中进行，可能无法直接推广到其他真核生物 | 探索单个真核启动子产生多样基因表达动态的机制 | 酿酒酵母中的染色质相关蛋白 | 机器学习 | NA | 活细胞显微成像 | 动力学模型 | 图像， 时间序列数据 | 80种染色质相关蛋白在单细胞水平进行分析 | NA | 酿酒酵母 | NA | 合成生物学 |
| 19 | 2026-05-12 |
Synthesis of Amines for Active Pharmaceutical Ingredients Using the Whole-Cell Factory Saccharomyces Cerevisae
2026-May-14, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202500898
PMID:42107106
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综述 | 该综述总结了利用全细胞工厂酿酒酵母合成活性药物成分中胺类化合物的最新进展 | 系统总结了代谢工程和基因工程策略，包括基因组编辑、基因表达优化和代谢通路平衡，以克服酶基因表达、辅因子再生和前体通道化等瓶颈 | 当前挑战包括系统生物学和合成生物学工具的整合，以实现酿酒酵母作为工业胺生产可扩展平台的目标 | 回顾酿酒酵母在胺类生物催化中的工程化策略，并展望其工业应用前景 | 酿酒酵母工程菌株及其合成的胺类、氨基醇、氨基酸和复杂生物碱化合物 | 合成生物学 | NA | 代谢工程, 基因工程, 基因组编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 酿酒酵母 | 代谢通路 | 医药, 工业生物技术 |
| 20 | 2026-05-12 |
A Linear Mixed Effects Model for Evaluating Synthetic Gene Circuits
2026-May-11, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00171
PMID:42112575
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研究论文 | 提出利用线性混合效应模型评估合成基因电路的性能 | 首次提出将线性混合效应模型用于量化分析基因布尔逻辑门性能，并通过蒙特卡洛模拟推荐样本量 | 未涉及模型在复杂动态环境下的验证，且主要基于模拟数据验证 | 标准化合成基因电路性能的统计评估方法 | 144个已发表布尔逻辑门及模拟基因电路数据 | 机器学习 | NA | 线性混合效应模型, k-means聚类, 蒙特卡洛模拟 | 线性混合效应模型, k-means | 基因电路性能数据 | 144个已发表布尔逻辑门 | NA | NA | 布尔逻辑门（OR, AND等），多输入多输出门 | 合成生物学, 计算, 生物传感, 人类健康 |