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当前共找到 5987 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
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| 1 | 2026-11-05 |
Coacervate droplets as a liquefier for the solid-to-liquid transition of RNA aggregates
2026-Nov-10, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2604185123
PMID:42975940
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研究论文 | 本文通过将复杂凝聚层设计为液化剂，主动重塑固体RNA-肽聚集体为功能性液滴，并解码其多尺度机制 | 首次提出利用复杂凝聚层作为液化剂主动逆转RNA聚集体的固化，揭示凝聚层浸润介导分子缓冲的跨尺度机制，并建立小分子阴离子形成凝聚层效果最佳的设计规则 | 研究主要基于体外模型和全原子模拟，在活体复杂环境中的适用性和长期安全性有待验证 | 探索主动逆转RNA聚集体固化并恢复其功能的方法，为合成生物学和治疗干预提供框架 | 固体RNA-肽聚集体和复杂凝聚层液滴 | 合成生物学 | NA | 全原子模拟、系统实验 | 全原子模拟 | 实验数据、模拟数据 | NA | NA | NA | NA | 医学, 合成生物学 |
| 2 | 2026-11-05 |
Global health security and smallpox: A strategic review of post-eradication biosafety and preparedness
2026-Nov-04, Politics and the life sciences : the journal of the Association for Politics and the Life Sciences
DOI:10.1017/pls.2026.10031
PMID:42978405
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综述 | 本文以天花为案例，综述了后根除时代合成生物学进展与群体免疫下降背景下的全球生物安全与防范准备 | 将天花再出现风险重新定义为全球治理危机而非单纯技术副产品，并提出融合One Health原则与跨国协调的多维治理框架 | 作为综述性文章，未提供原始实验数据或定量风险评估模型 | 评估后根除时代天花的生物安全与生物政治防范准备，分析正痘病毒合成可行性与免疫缺口两大风险的汇聚 | 天花及正痘病毒、2022年猴痘疫情、全球生物安全治理框架 | 全球健康安全 | 天花, 猴痘 | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学, 公共卫生 |
| 3 | 2026-11-05 |
Advancing Terpenoid Biosynthesis in Saccharomyces cerevisiae: Synthetic Biology Approaches for Efficient Longifolene Production
2026-Nov-03, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2026.102577
PMID:42977118
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研究论文 | 该文通过系统代谢工程改造酿酒酵母，整合酶组装、辅因子再生和碳流重编程三个模块，实现长叶烯的高效生物合成 | 首次将RIDD-RIAD肽介导的酶组装、双NADPH再生系统（外源FDH与内源PPP通量增强）以及NOG通路整合与转录抑制因子DOS2/YNR063W敲除相结合，实现长叶烯产量的显著提升 | 产物回收和培养方案的差异限制了与其他微生物生产过程的直接比较，且该策略对其他萜类或天然产物的广泛适用性仍需进一步验证 | 在酿酒酵母中建立系统代谢工程框架，克服酶催化、辅因子供应和前体可用性三大瓶颈，实现长叶烯的高效可持续生产 | 酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae）及长叶烯合成通路 | 合成生物学, 代谢工程 | NA | 系统代谢工程, 结构导向酶筛选, 发酵工程, 补料分批培养 | NA | NA | 摇瓶培养和5 L生物反应器补料分批发酵 | NA | 酿酒酵母 | 长叶烯生物合成代谢通路，包含RIDD-RIAD肽介导的酶组装模块、FDH-PPP双NADPH再生系统和NOG通路整合的碳流重编程模块 | 工业生物技术, 绿色制造 |
| 4 | 2026-11-05 |
Ca2+ signature gates responsiveness to exogenous auxin in Arabidopsis roots
2026-11-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-78361-8
PMID:42977750
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研究论文 | 利用光遗传学方法在拟南芥根细胞中施加钙信号，研究钙信号对生长素响应性的动态调控 | 首次使用光门控钙渗透性Channelrhodopsin 2变体XXM2.0在植物根细胞中精确施加钙信号，揭示钙信号作为生长素敏感性的动态调节因子，并鉴定CaM7-CNGC14模块 | 研究主要在拟南芥根中进行，钙信号与生长素交叉调控的分子机制仍需进一步解析，CaM7-CNGC14模块的direct证据有待补充 | 探究钙信号如何动态调节拟南芥根中外源生长素的响应性 | 拟南芥根细胞 | 植物科学, 合成生物学 | NA | 光遗传学, Channelrhodopsin 2变体XXM2.0, 钙成像, 转录组分析 | NA | 荧光图像, 转录组数据, 表型数据 | NA | 光遗传学工具XXM2.0 | 拟南芥 | 光控钙信号通路 | 农业, 植物生物技术 |
| 5 | 2026-11-05 |
Circadian rhythms in arthritis: from pathophysiology to chronotherapy
2026-Nov-03, Nature reviews. Rheumatology
DOI:10.1038/s41584-026-01454-7
PMID:42977800
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综述 | 本文综述了关节炎中昼夜节律在病理生理学中的作用及时间治疗学的应用前景 | 系统整合了关节炎症状与细胞因子水平的昼夜节律变化，并提出利用合成生物学方法实现定时药物递送的时间治疗策略 | 时间治疗学的实际临床应用仍面临挑战，骨关节炎的时间模式个体差异大且证据尚不充分 | 探讨昼夜节律在关节炎病理生理中的作用，并评估基于昼夜节律的时间治疗学转化潜力 | 骨关节炎和类风湿关节炎 | 数字病理学 | 关节炎 | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 6 | 2026-11-05 |
The tryptophan prenyltransferase ComQ from Bacillus subtilis 168 can prenylate daptomycin at Trp1
2026-Nov, The FEBS journal
DOI:10.1111/febs.70578
PMID:42068243
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研究论文 | 研究枯草芽孢杆菌168的色氨酸异戊烯基转移酶ComQ能否对环状抗菌肽达托霉素进行异戊烯基化修饰 | 首次证明ComQ不仅能修饰线性肽ComX，还能对环状肽达托霉素进行法尼基化修饰 | 仅进行了体外实验验证，未在体内或活细胞中验证；修饰位点和效率需进一步确认；未实际构建工程化ComQ变体 | 探究ComQ作为合成生物学工具对环状抗菌肽进行异戊烯基化的可行性 | ComQ酶、ComX信息素、达托霉素 | 合成生物学 | NA | RiPPs方法、AlphaFold建模、蛋白质纯化 | AlphaFold | 蛋白质结构、序列 | NA | NA | 大肠杆菌、枯草芽孢杆菌 | NA | 医药 |
| 7 | 2026-11-05 |
STRATUM-structured framework for reporting, assessment, and translational utility of metagenomics
2026-Nov-01, Journal of AOAC International
IF:1.7Q3
DOI:10.1093/jaoacint/qsag085
PMID:42714244
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研究论文 | 本文提出了STRATUM框架，一个基于使用场景分层的大型宏基因组学报告、评估和转化应用框架，旨在将质量保证、元数据报告和解释标准与决策后果对齐。 | 引入了STRATUM框架，这是一个基于决策后果分层的证据框架，将分析严谨性和报告标准与决策背景进行结构化校准，并提供跨用例指导，涵盖监测、监管和国家安全应用 | 摘要中未明确提及研究的局限性 | 为应用宏基因组学建立与决策背景相适应的证据标准，支持可重复、透明和可辩护的测序监测 | 宏基因组下一代测序（mNGS）的输出结果及其在生物监测中的应用 | 宏基因组学, 生物监测 | NA | 宏基因组下一代测序（mNGS） | NA | 测序数据, 元数据 | NA | NA | NA | NA | 医学, 环境, 食品, 国家安全 |
| 8 | 2026-11-05 |
Letter to the Editor: The Gut Microbiome-Endocrine Axis in Obesity: Mechanisms and Therapeutics
2026-11, Journal of gastroenterology and hepatology
IF:3.7Q2
DOI:10.1111/jgh.70772
PMID:42767274
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读者来信 | 本文是对Mao等人关于肠道微生物组-内分泌轴与肥胖的综述的评论信，提出三个扩展方向以增强临床相关性 | 提出GLP-1受体激动剂与肠道微生物组的双向互作、上消化道微生物生态位与合成生物学方法（工程化丁酸梭菌局部分泌GLP-1）、以及肠道-内分泌轴的昼夜节律维度与表型导向精准医学的整合 | 作为读者来信，未提供原始实验数据，主要为观点和建议 | 评论并扩展肠道微生物组-内分泌轴在肥胖中的机制与治疗框架，增强其临床转化价值 | 肠道微生物组、GLP-1受体激动剂、肥胖患者、工程化丁酸梭菌、昼夜节律与表型分型 | 微生物组学、内分泌学、代谢疾病、精准医学 | 肥胖 | NA | NA | 文本 | NA | 合成生物学 | 丁酸梭菌 | 工程化丁酸梭菌在肠道腔内局部分泌GLP-1 | 医学 |
| 9 | 2026-11-05 |
Genetic Engineering Efforts to Generate Chlamydomonas Strains for Large-Scale Biomolecule Production
2026-Nov, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.70466
PMID:42978385
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综述 | 综述了通过基因工程和合成生物学手段改造莱茵衣藻以生产生物分子的研究进展 | 系统总结了莱茵衣藻在萜类化合物和重组蛋白生产方面的遗传与代谢工程策略，并比较了其产量与其他光合底盘（如蓝细菌、苔藓）的差异 | 莱茵衣藻的工业化应用仍缺乏，需要进一步的技术进步、明确的国际法规和社会接受度 | 探讨利用基因工程策略提高莱茵衣藻生产高价值生物分子的能力 | 莱茵衣藻（Chlamydomonas reinhardtii） | 合成生物学 | NA | 基因工程、代谢工程、合成生物学 | NA | 文本 | NA | NA | 莱茵衣藻 | 代谢途径 | 工业生物技术、医药 |
| 10 | 2026-11-05 |
Characterization of a salt-responsive promoter from the moss Physcomitrium patens
2026-Oct-29, Plant physiology and biochemistry : PPB
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.plaphy.2026.111908
PMID:42976534
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研究论文 | 该论文表征了小立碗藓（Physcomitrium patens）中一个盐响应启动子Pp3c20_8210，并分析了其顺式调控元件在盐诱导基因表达中的作用 | 鉴定了一个盐诱导型启动子Pp3c20_8210，并通过构建缩短的工程化版本和定点删除关键转录因子结合位点（Homeodomain、MYB、GATA、Dof），发现Homeodomain和GATA结合位点是启动子活性的主要驱动因素 | 在实验条件下删除MYB和Dof转录因子结合位点对启动子响应性无统计学显著影响，可能由于其他调控元件的补偿机制；未在植物体内进行更长期或田间验证 | 表征小立碗藓中渗透和盐胁迫响应启动子，鉴定盐诱导型启动子并解析其顺式调控元件，为植物合成基因调控提供工具 | 小立碗藓（Physcomitrium patens）的天然启动子Pp3c20_8210及其工程化缩短版本 | 合成生物学 | NA | 启动子表征、定点缺失突变、荧光报告基因（Venus）表达监测 | NA | 荧光表达数据 | NA | 定点缺失突变 | 小立碗藓（Physcomitrium patens） | 盐响应启动子及其工程化变体 | 农业, 合成生物学 |
| 11 | 2026-11-05 |
Tutorial: biomembranes in hybrid living bioelectronics
2026-Oct, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-026-01382-6
PMID:42458075
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综述 | 本文是一篇教程综述，探讨了基于聚合物半导体和微纳加工方法将生物膜模型与芯片器件集成，形成混合活体生物电子界面，并讨论其在药物发现、诊断和神经形态计算中的应用 | 系统整合材料科学、纳米技术和合成生物学技术，通过结构功能化、化学或生物表面修饰增强细胞粘附和细胞与工程表面的相互作用，利用聚合物半导体和微纳加工方法将生物相关细胞膜模型与芯片器件集成，提升细胞-器件耦合 | 现有技术依赖简化的合成模型，缺乏生物复杂性 | 研究生物膜与电子器件的集成界面，增强细胞-器件耦合，并用于研究膜水平相互作用 | 生物相关细胞膜模型、聚合物半导体、芯片器件 | 生物电子学 | NA | 电阻抗测量、微纳加工、表面功能化修饰 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 12 | 2026-11-05 |
Context-aware synthetic promoter design using neural networks enables rewiring of eukaryotic transcriptional networks
2026-Mar-17, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-026-00684-5
PMID:41844670
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研究论文 | 该文提出一种人工神经网络框架，用于在酿酒酵母中基于上下文感知设计合成启动子，预测最佳转录因子结合位点插入位置和启动子改写程度，并通过实验验证实现高抑制率和转录网络重连。 | 首次开发了用于启动子-转录因子结合位点重组的ANN工具，能够预测最佳TFBS插入位点及所需启动子改写程度，实现了无需预先实验表征的合成启动子设计，并成功重连酵母转录网络。 | 研究仅针对酿酒酵母和TetR、Mig1等特定转录因子结合位点进行验证，模型的通用性和在其他真核生物中的适用性尚未充分证明。 | 开发一种基于神经网络的上下文感知合成启动子设计方法，实现真核转录网络的精准重编程。 | 酿酒酵母天然启动子和转录因子结合位点（TetR、Mig1） | 合成生物学 | NA | 人工神经网络预测、启动子工程、实验验证 | 人工神经网络（ANN） | 序列数据 | 6,011个天然酵母启动子 | NA | 酿酒酵母 | 转录因子结合位点插入的启动子重连、葡萄糖依赖的基因调控回路 | 医药, 工业生物技术 |
| 13 | 2026-11-05 |
Replacing of Cysteine with Selenocysteine: Biochemical Considerations, Computational Modeling, and Protein Engineering Applications
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-5158-2_6
PMID:42681358
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综述 | 本文综述了用硒代半胱氨酸（Sec）替换半胱氨酸（Cys）的生化基础、计算建模及蛋白质工程应用 | 整合了Sec的生化、结构和进化视角，并强调计算和量子化学研究揭示Sec的酸碱行为、键解离能和金属结合偏好，以及二硒键与二硫键的比较分析 | 作为综述文章，未提供原始实验数据，且可能未全面涵盖所有相关研究 | 探讨Sec替换Cys的生化考虑、计算建模和蛋白质工程应用，以指导合理的硒蛋白工程 | 硒代半胱氨酸（Sec）和半胱氨酸（Cys），以及硒蛋白 | 蛋白质工程 | NA | 计算化学、量子化学、蛋白质工程、合成生物学 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术, 生物工程 |
| 14 | 2026-11-05 |
OpenIDS2: A low-cost, 3D-printed, open-source platform for reproducible construction of DNA microarray synthesizers
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0338478
PMID:41411291
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研究论文 | 本文介绍了OpenIDS2，一个低成本、3D打印、开源的第二代喷墨式DNA微阵列合成器平台，用于实验室环境的寡核苷酸合成 | 将设备体积缩小至原版OpenIDS的三分之一，通过定制PCB集成所有控制电子元件，采用蠕动泵基批量溶液输送系统提高操作稳定性和制造可及性，大部分机械部件设计为可3D打印，显著增强了作为开源硬件平台的可重复性和全球可及性 | 仅在CPG基底上成功合成了15-mer poly(dT)序列，验证的序列长度和类型有限，尚未展示更复杂或更长寡核苷酸序列的合成能力 | 开发一种低成本、开源、可重复构建的台式寡核苷酸合成平台，降低实验室自动化的入门门槛 | DNA寡核苷酸合成设备及15-mer poly(dT)序列 | 合成生物学 | NA | 喷墨式DNA合成、亚磷酰胺化学、urea-PAGE、HPLC | NA | NA | 15-mer poly(dT)序列合成样本 | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 15 | 2026-11-05 |
A rapid and scalable approach to build synthetic repetitive hormone-responsive promoters
2024-07, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.14313
PMID:38379432
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研究论文 | 本文开发了一种简单、单管反应的方法，用于合成含有多个重复元件的DNA序列，并构建了合成重复激素响应启动子，在植物中验证了其功能 | 开发了一种单管反应方法，结合填充序列的PCR扩增和GoldenBraid克隆技术，能够高效、可扩展地合成高复杂度的串联重复DNA序列，克服了商业DNA合成公司拒绝高复杂度序列订单的限制 | 文中未明确提及研究局限性 | 克服高复杂度重复DNA序列合成困难的问题，建立一种快速可扩展的合成重复激素响应启动子的方法 | 合成重复DNA序列、植物激素响应启动子、转基因植物 | 合成生物学 | NA | PCR扩增、GoldenBraid分子克隆、IIS型限制性内切酶消化-连接反应、GUS报告基因分析 | NA | DNA序列、图像（GUS染色） | NA | GoldenBraid, IIS型限制性内切酶 | 植物 | 合成乙烯响应启动子10x2EBS-S10融合GUS报告基因 | 农业, 合成生物学 |
| 16 | 2026-11-05 |
Circular single-stranded DNA as a programmable vector for gene regulation in cell-free protein expression systems
2024-05-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49021-6
PMID:38821953
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研究论文 | 该文介绍了一种可编程的环状单链DNA（CssDNA）载体，在酵母无细胞蛋白表达系统中通过DNA和RNA聚合酶进行基因表达和调控。 | 首次将CssDNA作为可编程载体用于无细胞蛋白表达系统的基因表达和调控，利用正义和反义CssDNA的不同途径实现基因调控，并构建了多种基因调控逻辑门。 | 研究主要基于酵母无细胞系统，未在其他CFE系统中验证；CssDNA的稳定性和大规模制备可能受限。 | 探索CssDNA在无细胞蛋白表达系统中作为可编程载体进行基因表达和调控的可行性，丰富合成生物学工具箱。 | 环状单链DNA（CssDNA）载体及酵母无细胞蛋白表达系统 | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白表达（CFE） | NA | NA | NA | NA | 酵母 | 基因调控逻辑门 | 医学, 工业生物技术 |
| 17 | 2026-11-05 |
Structure of the intact tail machine of Anabaena myophage A-1(L)
2024-03-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-47006-z
PMID:38531972
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研究论文 | 本文报道了完整的长尾噬菌体A-1(L)尾部机器的高分辨率冷冻电镜结构，包括颈部、尾部和附着的纤维，并进行了生化实验验证 | 首次解析了完整A-1(L)尾部机器的高分辨率结构，发现了独特的十五聚体颈部结构、五组分基板、成对折叠的尾纤维，并鉴定了基板枢纽的双水解活性和尾纤维上的两个宿主受体结合域，同时有助于重新注释其基因组 | 摘要中未明确提及研究的局限性 | 解析A-1(L)完整尾部机器的结构，理解其感染机制，并促进其作为合成生物学底盘噬菌体的应用 | 长尾噬菌体A-1(L)及其宿主鱼腥藻PCC 7120 | 结构生物学 | NA | 冷冻电镜, 生化实验 | NA | 图像, 生化数据 | NA | NA | 鱼腥藻PCC 7120 | NA | 合成生物学, 医学 |
| 18 | 2026-11-04 |
Development of a high-throughput proteome sample preparation workflow based on efficient protein extraction to empower rational design of yeast cell factories
2027-Mar-01, Talanta
IF:5.6Q1
DOI:10.1016/j.talanta.2026.130738
PMID:42874363
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研究论文 | 本文开发了一种基于离子液体、盐酸胍和乙酸锂组合加热处理（IGL-H）的高效酵母蛋白提取方法，并结合磁固相烷基化（mSPA）材料实现高通量蛋白质组样品制备，用于酵母细胞工厂的理性设计 | 提出IGL-H溶剂组合加热提取策略，实现快速、高蛋白产量和更广蛋白质组覆盖的酵母蛋白提取，且可兼容液体处理工作站进行高通量样品制备，总时间少于1.5小时，Pearson相关系数超过0.97 | 摘要中未明确说明该方法的局限性 | 解决酵母细胞壁结构坚固和菌株文库规模快速扩大带来的高效蛋白提取和高通量蛋白质组分析难题，以支持酵母细胞工厂的理性设计 | 酵母细胞（包括不同生长阶段和不同物种的酵母，以及产朊假丝酵母Candida utilis） | 合成生物学，蛋白质组学 | NA | 质谱蛋白质组学，磁固相烷基化（mSPA） | NA | 蛋白质组数据 | NA | NA | 酵母（包括产朊假丝酵母Candida utilis） | NA | 工业生物技术，医学，能源 |
| 19 | 2026-11-04 |
Engineering CAR-T cell therapies for digestive tract cancer: advances, challenges, and strategies to overcome tumor heterogeneity and immunosuppressive barriers
2026-Dec, Neoplasia (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.neo.2026.101375
PMID:42849114
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综述 | 系统总结CAR-T细胞疗法在消化道肿瘤中面临的抗原异质性、免疫抑制微环境等瓶颈及应对策略 | 采用挑战-解决方案范式，整合前沿临床数据，提出未来转化开发的系统性优化路线图 | 抗原丢失、生产可扩展性和临床反应不一致等未解决问题仍需依赖γδT平台、合成生物学和通用CAR设计来攻克 | 综述CAR-T细胞疗法在消化道肿瘤中的进展、挑战及克服肿瘤异质性和免疫抑制屏障的策略 | 消化道肿瘤（胃癌、结直肠癌、食管癌）及CAR-T细胞疗法 | 肿瘤免疫治疗 | 消化道肿瘤 | CAR-T细胞疗法 | NA | 文本 | NA | NA | NA | 双靶点CAR、细胞因子表达构建体、逻辑门控受体 | 医学 |
| 20 | 2026-11-04 |
Harnessing yeast biodiversity to identify superior chassis strains for metabolic engineering and precision fermentation
2026-Nov-03, FEMS yeast research
IF:2.4Q3
DOI:10.1093/femsyr/foag060
PMID:42974969
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综述 | 本文综述了如何利用酵母生物多样性筛选和选择用于代谢工程和精密发酵的优良底盘菌株，重点关注八种酵母的基因组、代谢调控、底物利用和胁迫耐受性差异 | 提出将底盘身份视为设计变量，并将底盘选择纳入设计-构建-测试-学习循环，倡导从经验性菌株筛选转向基于多组学、表型分析、代谢建模和机器学习的多样性驱动预测性底盘选择 | 作为综述文章，未提供新的实验数据，未对提出的预测性底盘选择框架进行实验验证 | 探讨酵母物种内和物种间的多样性如何影响底盘性能，并讨论从经验筛选向预测性底盘选择的转变 | 八种酵母物种：酿酒酵母、解脂耶氏酵母、马克斯克鲁维酵母、Komagataella phaffii、Ogataea polymorpha、Rhodotorula toruloides、Lipomyces starkeyi 和 Pichia kudriavzevii | 合成生物学, 代谢工程 | NA | 多组学, 表型分析, 代谢建模, 机器学习 | 机器学习模型, 代谢模型 | 多组学数据, 表型数据 | NA | NA | 酿酒酵母, 解脂耶氏酵母, 马克斯克鲁维酵母, Komagataella phaffii, Ogataea polymorpha, Rhodotorula toruloides, Lipomyces starkeyi, Pichia kudriavzevii | 代谢途径 | 医药, 能源, 工业生物技术, 材料 |