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当前共找到 5811 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-10-10 |
Next-generation fermented foods from non-conventional proteins: Linking fermentation dynamics, flavor chemistry, and gut microbiome modulation
2027-Jan-02, International journal of food microbiology
IF:5.0Q1
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综述 | 本文综述了以非传统蛋白质为原料的下一代发酵食品，探讨了发酵动力学、风味化学与肠道微生物组的关联，并提出了整合的过程-性质-健康（PPH）框架 | 定义了下一代发酵食品（NGFFs）的概念，提出了整合的过程-性质-健康（PPH）关联框架，并探讨了人工智能、合成生物学和生命周期评估在加速该领域转化中的应用 | 人类证据有限，存在持续的知识空白、文献中未解决的冲突以及方法论限制 | 综合控制发酵对非传统蛋白质基质的级联效应，连接发酵动力学、风味化学和肠道微生物组调节，为NGFF的合理设计提供整体框架 | 非传统蛋白质（如昆虫、微藻、单细胞生物、新型植物）及其发酵产物 | 食品科学 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 食品，医学 |
| 2 | 2026-10-10 |
Advances in Bioproduction of Feed Amino Acids in China
2026-Oct-09, Advances in biochemical engineering/biotechnology
DOI:10.1007/10_2026_337
PMID:42850321
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综述 | 该章节综述了中国饲料氨基酸生物生产的发展，重点介绍了五种饲料小品种氨基酸（L-色氨酸、L-异亮氨酸、L-缬氨酸、L-组氨酸和L-精氨酸）高产菌株开发的技术与策略，并涵盖中国饲料氨基酸产业的生产策略、主要生产商、全球产能份额及未来增长前景 | 系统总结了合成生物学在饲料小品种氨基酸生产中的应用进展，包括基因编辑、代谢途径调控和AI辅助设计等技术，并聚焦中国饲料氨基酸产业的整体发展格局 | 作为综述章节，未提供原始实验数据；主要聚焦中国市场，对其他地区的覆盖有限 | 综述中国饲料氨基酸生物生产的技术与产业发展，特别是五种小品种氨基酸高产菌株的开发策略 | L-色氨酸、L-异亮氨酸、L-缬氨酸、L-组氨酸和L-精氨酸五种饲料小品种氨基酸及其生产菌株 | 合成生物学 | NA | 微生物发酵、基因编辑、代谢途径调控、AI辅助设计 | NA | 文本 | NA | 基因编辑 | NA | 代谢途径 | 医学, 工业生物技术 |
| 3 | 2026-10-10 |
Beyond methylation: (re)generation and application of SAM analogs
2026-Oct-08, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d6np00073h
PMID:42847546
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综述 | 本文综述了2021至2026年间SAM类似物的（再）生成与应用方面的进展，重点关注甲基转移酶催化的高选择性烷基化反应 | 总结了通过一步再生、仿生多酶途径和工程化全细胞系统从甲硫氨酸类似物、烷烃硫醇、卤代烷及相关烷基化试剂中（再）生成SAM类似物的最新进展，并涵盖辅因子在甲基单元、氨基酸部分和核碱基上的修饰以扩展反应范围、增强稳定性并在复杂反应体系中提供正交性 | NA | 综述SAM类似物生成与应用的最新进展，探讨如何克服SAM再生效率低和SAM类似物合成繁琐的障碍，推动转移酶化学超越甲基化 | SAM类似物、甲基转移酶（MTs）、甲硫氨酸类似物、烷烃硫醇、卤代烷及相关烷基化试剂 | 合成生物学 | NA | 酶促供应与再生、一步再生、仿生多酶途径、工程化全细胞系统 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 生物催化, 药物发现, 合成方法开发, 合成生物学 |
| 4 | 2026-10-10 |
The chloroplast-mitochondria interaction under water extremes: Insights into metabolic tug-of-war
2026-Oct-08, Current opinion in plant biology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.pbi.2026.102976
PMID:42849088
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综述 | 本文综述了在水分极端条件下叶绿体与线粒体之间的代谢协调、逆行信号和能量感知网络，并探讨了通过工程化细胞器间通信提高作物抗逆性的策略 | 系统整合了叶绿体-线粒体在水分极端下的代谢协调、逆行信号与能量感知网络，并提出了基于新兴技术工程化细胞器间通信以提升作物抗逆性的新框架 | 作为综述文章，未提供原始实验数据，所提出的工程化策略仍处于概念阶段，缺乏实证验证 | 综述水分极端条件下叶绿体与线粒体代谢协调及逆行信号机制，并探讨工程化代谢互作以改良作物抗逆性的未来方向 | 植物叶绿体与线粒体在干旱和淹水条件下的代谢协调与信号网络 | 植物系统生物学 | NA | 细胞器特异性代谢组学、合成生物学 | NA | 文本 | NA | NA | 植物 | NA | 农业 |
| 5 | 2026-10-10 |
Engineering CAR-T cell therapies for digestive tract cancer: advances, challenges, and strategies to overcome tumor heterogeneity and immunosuppressive barriers
2026-Oct-08, Neoplasia (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.neo.2026.101375
PMID:42849114
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综述 | 系统总结CAR-T细胞疗法在消化道癌症中面临的抗原异质性、免疫抑制微环境和代谢抑制等障碍，并归纳相应的应对策略 | 采用“挑战-解决方案”范式，整合最新临床数据，客观剖析CAR-T在消化道恶性肿瘤中的进展，并提出系统优化路线图 | 抗原丢失、生产可扩展性和临床反应不一致等问题仍未解决 | 探讨CAR-T细胞疗法在消化道癌症中的转化应用，克服肿瘤异质性和免疫抑制屏障 | 消化道癌症（胃癌、结直肠癌、食管癌） | 肿瘤免疫治疗 | 消化道癌症 | CAR-T细胞疗法 | NA | 临床数据 | NA | NA | NA | 双靶点CAR、细胞因子表达构建体、逻辑门控受体 | 医学 |
| 6 | 2026-10-10 |
Constructing nucleoside deaminase-assisted orthogonal DNA replication system for continuous evolution in prokaryotes
2026-Oct-07, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2026.102563
PMID:42843617
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研究论文 | 本文开发了核苷脱氨酶辅助的正交DNA复制系统，用于在原核生物中实现连续进化 | 将核苷脱氨酶与正交DNA复制耦合，显著提高了突变率并调节突变偏好，实现了快速进化 | 未明确说明 | 构建一个高效的连续进化平台，用于加速调控元件、蛋白质功能和代谢途径的进化 | 工程化苏云金芽孢杆菌和合成大肠杆菌系统 | 合成生物学 | NA | 核苷脱氨酶辅助的正交DNA复制（NDAORep） | NA | NA | NA | NA | 苏云金芽孢杆菌, 大肠杆菌 | 正交DNA复制系统结合核苷脱氨酶 | 代谢工程, 合成生物学 |
| 7 | 2026-10-10 |
Reprogramming the therapeutic fate of living biotherapeutic products for intestinal diseases via biomaterials
2026-Oct-01, Biomaterials
IF:12.8Q1
|
综述 | 本文综述了利用生物材料修饰细菌以治疗肠道疾病（如炎症性肠病和结直肠癌）的策略、机制及最新进展。 | 系统总结了脂质涂层、水凝胶、有机-无机杂化材料、抗体或功能蛋白以及细胞膜等多种生物材料修饰细菌表面的策略，并阐述了其增强细菌性能的机制，同时提出了基于高通量平台、合成生物学和人工智能设计下一代生物材料修饰细菌的展望。 | 天然菌株存在存活率低、定植效率有限、免疫清除和非特异性靶向等问题；生物材料修饰细菌的设计仍面临挑战，尚未实现临床广泛应用。 | 系统总结生物材料修饰细菌的策略和机制，并展望下一代基于高通量平台、合成生物学和人工智能的生物材料修饰细菌设计。 | 活体生物治疗产品（LBP）和生物材料修饰细菌（BMB），用于治疗炎症性肠病和结直肠癌等肠道疾病。 | 肠道疾病治疗、生物材料、合成生物学 | 炎症性肠病、结直肠癌 | 生物材料修饰（脂质涂层、水凝胶、有机-无机杂化材料、抗体或功能蛋白、细胞膜修饰） | NA | 文本 | NA | NA | 细菌 | NA | 医学 |
| 8 | 2026-10-10 |
Innovations and applications in synthetic biology: a PhD researcher's perspective
2026-Sep-22, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2026.09.015
PMID:42850182
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 9 | 2026-10-10 |
De novo genes in plants: Origins, mechanisms, and functional implications
2026-Sep-10, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2026.102098
PMID:42723285
|
综述 | 本文综述了植物新基因的起源、进化机制、功能以及鉴定方法，并探讨了其在作物改良和合成生物学中的应用前景 | 系统整合了植物新基因的转录优先、开放阅读框优先和并发模型等主要诞生路径，并提出了全基因组共线性比对、多组学证据和机器学习相结合的新基因鉴定改进策略 | 快速序列进化、基因组注释质量、多倍化和转座元件等因素给当前新基因鉴定方法带来了挑战，每种方法均存在重要局限性，且新基因的功能验证仍然不足 | 总结植物新基因研究的最新进展，阐明其起源与进化机制、功能意义，并探讨改进鉴定方法和未来研究方向 | 植物新基因（de novo genes） | 机器学习, 基因组学, 进化生物学 | NA | 全基因组共线性比对, 多组学分析, 机器学习 | 机器学习 | 文本, 基因组序列, 多组学数据 | NA | NA | 植物 | NA | 农业, 医学, 合成生物学 |
| 10 | 2026-10-10 |
Advances in large DNA fragment assembly for microbial cell factory engineering
2026-Sep, Quantitative biology (Beijing, China)
DOI:10.1002/qub2.70039
PMID:42845956
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综述 | 该综述总结了用于微生物细胞工厂工程的大DNA片段组装方法的最新进展，涵盖体外和体内多重基因组装及基因组规模技术 | 系统比较了大规模DNA片段组装方法在组装原理、容量和效率方面的关键特征，并强调了其在异源途径构建、宿主代谢重编程和扩展复杂生物合成网络中的应用 | 未涉及具体实验验证，主要基于文献总结，且可能未涵盖所有最新技术 | 为工程化高性能微生物细胞工厂提供理论和技术框架，推动工业生物制造的发展 | 大DNA片段组装方法及微生物细胞工厂 | 合成生物学 | NA | DNA组装技术 | NA | 文本 | NA | NA | 微生物 | 代谢途径、合成基因组、新染色体 | 工业生物技术、医学 |
| 11 | 2026-10-10 |
Editorial: Education in synthetic biology
2026, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2026.1990539
PMID:42846403
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 12 | 2026-10-10 |
Engineered bacteria and engineered probiotics for intestinal disease therapy: a bibliometric and knowledge mapping analysis
2026, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2026.1970221
PMID:42851468
|
文献计量学研究论文 | 该文通过文献计量学和知识图谱分析，表征了工程细菌和工程益生菌用于肠道疾病治疗的研究格局、知识结构、研究热点和新兴趋势 | 首次对工程细菌和工程益生菌用于肠道疾病治疗领域进行系统的文献计量学和知识图谱分析，揭示了研究热点从传统益生菌抗炎作用向可编程活体治疗策略的转变 | 文献计量数据仅反映研究主题的分布和趋势，而非直接证明治疗效果；2026年数据为部分年度数据集；仅纳入Web of Science和Scopus数据库的文献 | 表征工程细菌和工程益生菌用于肠道疾病治疗的研究格局、知识结构、研究热点和新兴趋势 | 2015年至2026年间发表的499篇关于工程细菌和工程益生菌用于肠道疾病治疗的相关文献 | 文献计量学, 合成生物学, 微生物组学 | 炎症性肠病, 结直肠癌, 肠道疾病 | 文献计量分析, 知识图谱分析, 关键词共现分析, 共被引分析 | NA | 文本 | 499篇文献（2015-2026年发表） | NA | NA | NA | 医学 |
| 13 | 2026-10-10 |
AI-enabled fungal biomanufacturing: from genome mining to the artificial intelligence virtual cell
2026, Mycology
DOI:10.1080/21501203.2026.2716430
PMID:42852178
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综述 | 该综述总结了AI在真菌生物制造中的应用进展，涵盖基因组挖掘、酶与通路分析、基因组编辑、代谢网络建模和智能发酵控制，并提出了人工智能虚拟细胞（AIVC）的概念 | 提出了人工智能虚拟细胞（AIVC）的新概念，将多组学数据、机制建模和机器学习整合到统一的多尺度框架中，用于模拟真菌细胞的动态行为 | 数据质量与标准化问题、跨尺度模型整合与可解释性挑战、预测与实验验证之间的差距 | 系统综述AI和虚拟细胞技术在推动下一代真菌生物技术中的作用 | 真菌细胞工厂 | 机器学习 | NA | 多组学技术、基因组挖掘、基因组编辑、代谢网络建模、机器学习 | 机器学习 | 多组学数据 | NA | NA | 真菌 | NA | 医药, 农业, 环境, 工业生物技术 |
| 14 | 2026-10-09 |
Bidirectional photoriboswitch for translational regulation in mammalian cells
2026-Oct-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.117671
PMID:42840230
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研究论文 | 该研究开发了一种双向光核糖开关平台，通过光诱导蛋白质二聚化和内含肽介导的拆分蛋白重组，实现对多种mRNA翻译的正交上调和下调调控 | 首次构建了双向光核糖开关平台，能够模拟正交RNA结合蛋白介导的多mRNA上/下调调控；创新性地利用光二聚化阻断内含肽重组构建Light-OFF系统，并与Light-ON系统正交组合，实现双向翻译调控；功能模块可灵活替换以适应不同需求 | 摘要中未明确提及该研究的局限性 | 开发一种能够在哺乳动物细胞中实现双向翻译调控的光核糖开关平台，为合成生物学提供精确、按需的翻译控制工具 | 哺乳动物细胞中的mRNA翻译过程 | 合成生物学 | NA | 光遗传学、内含肽介导的拆分蛋白重组、光诱导蛋白质二聚化 | NA | NA | NA | NA | 哺乳动物细胞 | 双向光核糖开关：Light-OFF系统（光二聚化阻断内含肽重组）与Light-ON系统（光诱导不同拆分内含肽对重组）正交组合，通过光感应正交重组RNA结合蛋白来调控各自靶mRNA的翻译 | 医学、工业生物技术 |
| 15 | 2026-10-09 |
Semi-Rational Design of CpNampt Mutants for Enhanced Nicotinamide Mononucleotide (NMN) Synthesis in Saccharomyces cerevisiae
2026-Oct-07, Microbial physiology
IF:2.9Q3
DOI:10.1159/mip/adqag002
PMID:42842535
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研究论文 | 通过对酿酒酵母中NMN消耗途径基因进行双敲除，并结合AI辅助设计突变CpNampt酶，构建高效生产NMN的微生物细胞工厂 | 结合代谢工程与AI辅助酶设计，对来源于Chitinophaga pinensis的CpNampt进行半理性设计，获得高效突变体I229A，显著提高NMN产量 | 未提及 | 提高酿酒酵母中NMN的合成效率，构建绿色高效的NMN生产菌株 | 酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae）及CpNampt酶 | 合成生物学 | 衰老相关疾病 | 代谢工程、AI辅助酶设计、基因敲除 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 酿酒酵母 | NMN合成代谢途径 | 医药、工业生物技术 |
| 16 | 2026-10-09 |
Retention and biosynthesis of diverse nitroarenes in Escherichia coli after combinatorial nitroreductase gene deletions
2026-Oct-07, Nature chemistry
IF:19.2Q1
DOI:10.1038/s41557-026-02266-8
PMID:42844378
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研究论文 | 本文通过构建含有多达15个硝基还原酶基因敲除的大肠杆菌菌株，全面分析细菌硝基还原酶活性，并评估20多种外源硝基芳烃化合物的稳定性，进而改进或实现硝基芳烃化合物的生物合成 | 构建了含有多达15个已知和候选硝基还原酶基因敲除的大肠杆菌菌株，系统评估了20多种外源硝基芳烃化合物的稳定性，并利用这些工具实现了硝基芳烃化合物的生物合成、生物催化转化以及半合成和位点特异性掺入 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 系统研究细菌硝基还原酶活性对硝基芳烃化合物稳定性的影响，并利用工程化菌株改进或实现硝基芳烃化合物的生物合成 | 大肠杆菌菌株和20多种外源硝基芳烃化合物 | 合成生物学, 代谢工程 | NA | 基因敲除 | NA | NA | 构建了含有多达15个硝基还原酶基因敲除的大肠杆菌菌株，评估了20多种硝基芳烃化合物 | NA | 大肠杆菌 | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 17 | 2026-10-09 |
Engineering cyanobacterial resilience for cadmium bioremediation: linking Cd speciation, cellular detoxification, and synthetic biology
2026-Oct-06, RSC advances
IF:3.9Q2
DOI:10.1039/d6ra05152a
PMID:42840824
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综述 | 该综述构建了一个整合框架，将镉的形态与生物可利用性、细胞摄取与解毒机制以及合成生物学改造策略相联系，以工程化蓝细菌的镉修复抗性。 | 提出不应单纯追求镉积累最大化，而应将镉去除、蓝细菌抗性、金属回收、遗传稳定性和生物防护作为相互关联的过程参数进行优化。 | 区分了蓝细菌中直接验证的机制与从其他生物或金属体系推断的策略，且从分子机制到可规模化应用仍需关键验证。 | 为工程化蓝细菌抗镉胁迫并实现镉生物修复提供整合性理论框架和未来设计方向。 | 蓝细菌及其对镉的形态转化、摄取、解毒和生物质相关金属回收过程。 | 合成生物学 | NA | 组学、合成生物学、纳米生物活体材料、光生物反应器工程 | NA | 文本 | NA | 合成生物学 | 蓝细菌 | 金属硫蛋白表达、金属响应转运系统、抗氧化响应、镉隔离与解毒通路 | 环境 |
| 18 | 2026-10-09 |
Critical review of artificial intelligence in synthetic biology: DBTL cycle applications, challenges, and design rules for microbial strain engineering
2026-Oct-03, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-026-05314-0
PMID:42828724
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综述 | 本文综述了人工智能（包括机器学习、深度学习和语言模型）在合成生物学设计-构建-测试-学习（DBTL）循环中的应用、挑战及微生物菌株工程的设计规则 | 系统性地分析了AI工具在DBTL循环各阶段（从设计到最终数据分析）的应用方式，并评估了其验证水平和证据等级，同时提出了微生物菌株工程的设计规则 | 模型行为存在不确定性、数据验证和透明度有限、数据分析和解释困难、模型预测存在不确定性，以及安全和伦理问题 | 分析人工智能在合成生物学中的应用，识别AI工具在DBTL循环各阶段的应用方式，评估其验证和证据水平 | 合成生物学中的DBTL循环，包括遗传电路设计、蛋白质工程、代谢通路优化和多组学数据分析 | 机器学习, 合成生物学 | NA | 机器学习, 深度学习, 语言模型, 多组学数据分析 | 神经网络, 深度学习, 语言模型 | 多组学数据, 文本 | NA | NA | 微生物 | 遗传电路设计, 代谢通路优化 | 医学, 能源, 环境生物技术 |
| 19 | 2026-10-09 |
Microbial fermentation-mediated starch modification: Structural evolution, mechanistic insights, traditional application and future perspectives
2026-Oct-03, Food chemistry
IF:8.5Q1
DOI:10.1016/j.foodchem.2026.151430
PMID:42843163
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综述 | 该综述系统总结了微生物发酵介导的淀粉改性，重点关注淀粉功能性质、多尺度结构演变及其机制，并讨论了传统应用和未来发展方向 | 不同于以往主要总结发酵介导质量变化的综述，本文整合了主要微生物、发酵策略和传统食品应用，核心聚焦于淀粉功能性质，将多尺度结构、理化性质、回生行为和消化性的变化与微生物种类、底物来源和发酵参数相关联，并基于基因工程和合成生物学探讨了未来方向 | 现有文献中存在不一致的研究发现，且发酵从经验实践向可控精准技术领域的转变仍面临挑战 | 探讨微生物发酵介导的淀粉改性机制，包括结构演变、理化性质变化、回生行为和消化性调控，并展望未来发展方向 | 天然淀粉及发酵改性后的淀粉 | 食品科学 | NA | 微生物发酵、基因工程、合成生物学 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 食品 |
| 20 | 2026-10-09 |
Bioremediation processes for removing plutonium from the environment: a review
2026-Aug, Environmental science and pollution research international
DOI:10.1007/s11356-026-38278-7
PMID:42821248
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综述 | 本文综述了利用生物修复过程从环境中去除钚的机制、挑战及最新进展，重点关注整合生物、化学和技术创新以实现有效的钚去污 | 聚焦于钚这一特殊放射性污染物的生物修复，并强调合成生物学、基因工程和纳米技术与生物修复策略的整合 | 当前知识存在空白，生物修复在实际核废料管理中的可行性、效率及规模化应用仍面临挑战 | 建立生物修复作为核废料管理的可行、经济有效且环境可持续的方法 | 钚污染环境及用于生物修复的微生物和植物 | 环境生物技术 | NA | 生物修复、合成生物学、基因工程、纳米技术 | NA | 文本 | NA | NA | 微生物, 植物 | NA | 环境 |