本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['synthetic biology']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价9.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-03-07 |
Recent advances in computer-aided engineering of microbial synthesis and nutritional functions of fucosylated oligosaccharides
2026 May-Jun, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108849
PMID:41740692
|
综述 | 本文综述了岩藻糖基化寡糖的微生物合成和计算机辅助工程的最新进展,重点关注其在婴儿健康中的营养功能 | 结合生物信息学方法与合成生物学策略,实现岩藻糖基化寡糖的精确和可扩展生产 | NA | 提高岩藻糖基化寡糖的微生物合成效率,促进其工业化应用 | 岩藻糖基化寡糖 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、代谢工程、生物信息学、虚拟筛选 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | E. coli, S. cerevisiae | 代谢途径、生物传感器 | 医药、食品 |
| 2 | 2026-03-07 |
Assembling a True "Olympic Gel" From over 16 000 Combinatorial DNA Rings
2026-Mar-06, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202520549
PMID:41789447
|
研究论文 | 本研究成功组装了一种由超过16000种不同DNA环构成的真正“奥林匹克凝胶”,并验证了其独特的溶胀行为和弹性响应 | 首次通过酶激活独特序列域的方法,成功避免了非预期的交联和聚合,实现了由大规模组合DNA环库组装真正的奥林匹克凝胶 | NA | 研究网络拓扑结构对宏观材料性质的影响,并探索其作为生物和仿生系统中遗传信息载体的功能 | 由超过16000种不同DNA环组成的奥林匹克凝胶材料 | DNA纳米技术 | NA | 下一代测序、振荡流变学、大规模计算模拟、原子力显微镜、低温电子显微镜 | NA | DNA序列数据、力学性能数据、结构图像数据 | 超过16000种不同的DNA环分子 | NA | NA | NA | 材料、工业生物技术 |
| 3 | 2026-03-07 |
Repositioning the Leader Peptide in Graspetide Biosynthesis
2026-Mar-06, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c21135
PMID:41789461
|
研究论文 | 本研究通过重新定位前导肽序列在graspetide生物合成中的位置,探索了合成生物学中组合酶法生成新型肽类产物的策略 | 首次通过将前导肽序列从N端重新定位至C端,实现了对graspetide合成酶ThfB底物选择性的保留,并成功构建了具有双重前导序列(N端和C端)的嵌合RiPP产物 | 前导肽重新定位后酶修饰速率降低了约2倍,可能影响整体合成效率 | 开发合成生物学策略以扩展核糖体合成和翻译后修饰肽(RiPPs)的结构多样性 | fuscimiditide前体肽及其graspetide合成酶ThfB | 合成生物学 | NA | 前导肽工程、酶催化环化、嵌合肽合成 | NA | 生物化学数据 | NA | 前导肽序列重定位 | NA | 双前导序列(N端和C端)指导的嵌合RiPP生物合成途径 | 工业生物技术 |
| 4 | 2026-03-07 |
Design-driven optimization of low-cost reagent formulations for reproducible and high-yielding cell-free gene expression
2026-Mar-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69605-8
PMID:41786720
|
研究论文 | 本文通过多维度确定性筛选设计,优化了无细胞基因表达系统的试剂配方,以降低成本、提高重现性和产量 | 开发了一种基于12种组分的简单、可重现的无细胞试剂配方,实现了高达95%的成本降低,并能从氮碱基和核糖生产核苷三磷酸 | NA | 优化无细胞基因表达系统的试剂配方,以降低成本和复杂性,提高蛋白质生产的重现性和产量 | 无细胞基因表达系统及其试剂配方 | 合成生物学 | NA | 无细胞基因表达 | NA | 实验数据 | 1,231种不同的试剂配方 | NA | NA | NA | 生物技术、蛋白质制造 |
| 5 | 2026-03-07 |
Recruiting orthogonal biological systems for engineering microorganisms
2026-Mar-04, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.12.023
PMID:41786536
|
综述 | 本文综述了微生物合成生物学中正交策略的最新进展与应用,包括正交遗传系统、代谢途径、能量系统和调控系统的构建 | 总结了正交策略在微生物合成生物学中的创新应用,以解决工程过程对自然代谢的干扰问题 | NA | 探讨正交策略在微生物合成生物学中的应用,以增强工程微生物的功能和可预测性 | 微生物细胞及其正交工程系统 | 合成生物学 | NA | 正交工程策略 | NA | NA | NA | NA | 微生物细胞 | 正交遗传系统、代谢途径、能量系统、调控系统 | 工业生物技术 |
| 6 | 2026-03-07 |
Enhanced Heterologous Production of Tylosin Through Pathway Reconstruction and Integrated Optimization in Streptomyces
2026-Mar, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.70203
PMID:41761947
|
研究论文 | 本研究通过ExoCET技术克隆了87 kb的泰乐菌素生物合成基因簇,并在三种链霉菌宿主中实现异源表达,优化发酵培养基和关键基因启动子替换,显著提高了泰乐菌素产量 | 采用ExoCET技术高效克隆大型GC-rich基因簇,结合两步组装策略实现异源表达,并通过启动子替换和调控基因敲除优化产量和生物合成起始时间 | NA | 提高泰乐菌素的异源生物合成效率,开发具有增强治疗活性的类似物 | 泰乐菌素生物合成基因簇及其在链霉菌宿主中的表达 | 合成生物学 | NA | ExoCET技术,发酵优化,启动子替换,基因敲除 | NA | NA | NA | ExoCET | Streptomyces fradiae QL100, S. albus J1074 | 泰乐菌素生物合成途径重构,包括关键基因启动子替换和调控基因敲除 | 医药,兽医医学 |
| 7 | 2026-03-07 |
Developing artificial cytoskeletons using RNA origami-based nanotubes
2026-Feb-28, Progress in biophysics and molecular biology
DOI:10.1016/j.pbiomolbio.2026.02.006
PMID:41765186
|
综述 | 本文综述了利用RNA折纸纳米管构建人工细胞骨架的新兴领域,探讨了其设计策略、功能优势及在合成生物学与纳米技术中的应用前景 | 系统性地提出了利用RNA折纸技术构建可编程仿生细胞骨架网络的创新概念,突出了RNA在共转录折叠、复杂三级结构形成及与细胞机器接口方面的独特优势 | 存在体内稳定性不足和递送效率低等挑战 | 探索RNA折纸纳米管在构建人工细胞骨架中的应用,推动合成细胞工程与RNA纳米技术的发展 | RNA折纸纳米管及其仿生的微管与肌动蛋白丝结构 | 合成生物学 | NA | RNA折纸技术 | NA | NA | NA | NA | NA | 仿生细胞骨架网络(模拟微管与肌动蛋白丝) | 纳米技术, 合成生物学, 医疗 |
| 8 | 2026-03-07 |
From biopolymers to microcompartments: A structured review of protein-based scaffolds for enzyme immobilization
2026-Feb-27, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108851
PMID:41765154
|
综述 | 本文系统回顾了从天然生物聚合物到工程化蛋白质支架,再到细菌微区室(BMCs)等用于酶固定的蛋白质基支架的进展 | 采用分层视角,从天然生物聚合物支架推进到工程化蛋白质支架,并重点介绍了作为新兴细胞器样平台的细菌微区室(BMCs)在空间精度、选择性渗透性和封装多酶途径方面的优势 | NA | 回顾酶固定化支架的发展,为未来支架设计提供信息并拓宽生物催化的应用范围 | 用于酶固定的蛋白质基支架,包括生物聚合物、工程化蛋白质支架和细菌微区室 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术, 医学 |
| 9 | 2026-03-07 |
CO2-driven biosurfactant synthesis by bacteria within CCUS
2026-Feb-25, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-026-13761-w
PMID:41741775
|
综述 | 本文综述了微生物在CCUS(碳捕集、利用与封存)框架内利用CO₂驱动生物表面活性剂合成的代谢与工程学进展 | 系统探讨了厌氧及CO₂富集培养系统中CO₂代谢与生物表面活性剂合成的关联,并整合了合成生物学、模块化路径设计及人工智能优化等前沿技术 | 面临技术与经济层面的挑战,具体实施方案的规模化与能效仍需进一步验证 | 探索通过微生物碳捕集与生物表面活性剂生产相结合,实现温室气体减排与可持续生物制造的策略 | 微生物(细菌)的CO₂代谢途径与生物表面活性剂合成机制 | 合成生物学与代谢工程 | NA | 遗传工程、合成生物学、系统级建模、人工智能 | NA | NA | NA | 合成生物学工具(未具体说明) | 细菌(未具体说明菌种) | 碳固定模块与生物表面活性剂合成途径的耦合设计 | 环境, 工业生物技术 |
| 10 | 2026-03-07 |
Advancing codon language modeling with synonymous codon constrained masking
2026-Feb-24, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag166
PMID:41736545
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为SynCodonLM的密码子语言模型,通过同义密码子约束掩码来改进蛋白质编码DNA序列的建模 | 该模型引入了基于生物学的约束,仅从同义选项预测掩码密码子,从而解耦密码子级与蛋白质级语义,能学习核苷酸特异性模式 | NA | 改进密码子语言模型以更好地捕获DNA级生物学特征 | 蛋白质编码DNA序列 | 自然语言处理 | NA | 密码子语言建模 | 语言模型 | DNA序列 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 11 | 2026-03-07 |
SSB-mediated enhancement of argonaute activity triggers SOS filamentation in bacteria
2026-Feb-24, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag175
PMID:41736547
|
研究论文 | 本研究揭示了嗜热栖热菌Argonaute蛋白(TtAgo)在细菌中过表达会通过破坏细胞分裂检查点,引发暂时的细菌丝状化现象 | 首次发现SSB蛋白与TtAgo相互作用,将其招募到复制叉,增强其DNA结合活性,从而调控细菌细胞周期和DNA修复途径 | 研究主要基于模式细菌(嗜热栖热菌和大肠杆菌),在其他细菌中的普适性尚未验证 | 探究原核Argonaute蛋白在细菌生理学中的作用及其调控机制 | 嗜热栖热菌Argonaute蛋白(TtAgo)及其与SSB蛋白的相互作用 | 合成生物学 | NA | 扫描电子显微镜、核DNA染色、截短蛋白变体分析 | NA | 显微图像、分子相互作用数据 | 嗜热栖热菌和大肠杆菌两种细菌模型 | NA | 嗜热栖热菌, 大肠杆菌 | NA | 合成生物学, 生物技术 |
| 12 | 2026-03-07 |
Harnessing Endophytic Fungi as a Sustainable Source of Novel Anticancer Agents: Opportunities, Challenges, and Future Directions
2026-Feb-17, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules31040693
PMID:41752469
|
综述 | 本文综述了内生真菌作为可持续抗癌药物新来源的潜力、挑战及未来方向 | 强调内生真菌作为结构多样抗癌代谢物的未充分开发来源,并探讨了OSMAC、共培养、表观遗传激活等增强发现和产量的策略 | NA | 探索内生真菌作为可持续、低毒性抗癌药物的来源,以克服现有疗法的局限性 | 内生真菌及其产生的抗癌代谢物(如生物碱、萜类、聚酮化合物和肽类) | NA | 癌症 | OSMAC、微生物共培养、表观遗传激活、基因组挖掘、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 13 | 2026-03-07 |
CRISPR-Mediated Silkworm: The Oncoming Agricultural Revolutions and a Rising Model Organism
2026-Feb-12, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes17020230
PMID:41751614
|
综述 | 本文综述了CRISPR基因组编辑技术在蚕中的应用,强调了其在蚕的疾病抗性、产量提升和新材料开发方面的突破,并探讨了CRISPR、泛基因组学和人工智能交叉领域的新方向 | 将CRISPR技术从简单基因敲除扩展到大规模全基因组筛选,并结合人工智能预测CRISPR结果,为蚕的分子育种和合成生物学提供新方法 | NA | 总结蚕基因组编辑的进展,探讨CRISPR技术在蚕农业和生物制造中的应用前景 | 蚕(家蚕) | 合成生物学 | NA | CRISPR基因组编辑 | NA | 基因组、转录组、蛋白质组数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 蚕(家蚕) | NA | 农业, 工业生物技术 |
| 14 | 2026-03-07 |
[Biosynthesis and functions of human milk oligosaccharides]
2025-Oct-17, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.250490
PMID:41755593
|
综述 | 本文综述了人乳寡糖的生理功能、应用潜力及其生物合成技术,重点关注通过合成生物学方法提高产量 | 结合代谢工程与合成生物学技术,利用不同底盘细胞显著提高人乳寡糖的产量,为食品和制药行业新产品开发提供新机遇 | NA | 探讨人乳寡糖的生物合成技术及其在食品和制药行业的应用潜力 | 人乳寡糖 | 合成生物学 | NA | 代谢工程,合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 底盘细胞 | NA | 食品,制药 |
| 15 | 2026-03-06 |
In vivo self-assembled siRNAs ameliorate neurological pathology in TDP-43-associated neurodegenerative disease
2026-Mar-05, Brain : a journal of neurology
IF:10.6Q1
DOI:10.1093/brain/awaf330
PMID:40916343
|
研究论文 | 本文提出了一种基于合成生物学的方法,利用体内自组装siRNA靶向TDP-43蛋白,通过小细胞外囊泡递送至中枢神经系统,改善TDP-43相关神经退行性疾病的病理症状 | 利用内源性小RNA处理机制自组装siRNA封装的小细胞外囊泡,并借助宿主自然循环系统运输siRNA,实现高效、微创的基因治疗 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化效果和长期安全性仍需进一步验证 | 开发针对TDP-43蛋白异常积累的基因治疗策略,以治疗肌萎缩侧索硬化和额颞叶变性等神经退行性疾病 | TDP-43蛋白、siRNA、小细胞外囊泡、小鼠模型中的神经病理学变化 | 合成生物学 | 神经退行性疾病 | siRNA技术、小细胞外囊泡递送、立体定向注射、腺相关病毒递送系统 | NA | NA | 小鼠模型 | CRISPR-Cas9(可能用于工程化肝细胞,但未明确提及,故输出NA) | 小鼠 | 工程化肝细胞表达并包装靶向TDP-43的siRNA到狂犬病毒糖蛋白标记的小细胞外囊泡中,形成自组装递送系统 | 医学 |
| 16 | 2026-03-06 |
In vivo self-assembled SOD1-siRNAs mitigate muscle atrophy and denervation in amyotrophic lateral sclerosis
2026-Mar-05, Brain : a journal of neurology
IF:10.6Q1
DOI:10.1093/brain/awaf291
PMID:40795306
|
研究论文 | 本研究开发了一种合成生物学策略,通过重编程肝脏在体内自组装封装SOD1-siRNA的小细胞外囊泡,以靶向脊髓神经元并特异性沉默突变SOD1基因,从而缓解肌萎缩侧索硬化症小鼠模型的肌肉萎缩和去神经支配症状 | 利用合成生物学策略将肝脏重编程为组织底盘,实现体内自组装靶向神经元的小细胞外囊泡封装siRNA,并设计了基于AAV的长期自组装策略,单次注射即可实现持续抑制突变蛋白 | 研究目前仅在Tg(SOD1G93A)转基因小鼠模型中进行,尚未在人类患者中验证 | 开发针对家族性ALS中SOD1基因突变的特异性基因沉默治疗策略 | Tg(SOD1G93A)转基因小鼠(ALS动物模型) | 合成生物学 | 肌萎缩侧索硬化症 | siRNA基因沉默技术、小细胞外囊泡递送技术、AAV载体技术 | NA | 动物实验数据、蛋白质水平检测、行为学评估 | Tg(SOD1G93A)转基因小鼠 | 合成生物学构建、AAV载体 | 小鼠(肝脏细胞) | CMV启动子驱动的合成构建体,编码SOD1-siRNA及sEV表面RVG靶向肽 | 医学 |
| 17 | 2026-03-06 |
Seizing the key nodes in glabridin biosynthesis network: identification of enzymes for producing licorice hairy roots with high levels of glabridin
2026-Mar-05, Molecular horticulture
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s43897-025-00202-x
PMID:41782076
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析和体外酶实验,阐明了光甘草定生物合成的两条互连途径,并鉴定出关键酶,构建了高产光甘草定的转基因毛状根平台 | 首次揭示了光甘草定生物合成中依赖与不依赖OMT/ODMT的两条互连途径,并通过过表达关键酶GgIFR使毛状根中光甘草定含量提高44倍,达到与4年生野生根相当的水平 | NA | 阐明光甘草定生物合成网络并建立可持续的工业化生产平台 | 光甘草定生物合成途径及其关键酶 | 合成生物学 | NA | 多组学分析、体外酶活性测定、农杆菌介导的转化系统 | NA | 多组学数据、酶活性数据 | NA | 农杆菌介导的转化 | 甘草毛状根 | 光甘草定生物合成途径(包括OMT/ODMT依赖的甲基化-去甲基化循环途径和OMT/ODMT非依赖途径) | 医药、化妆品 |
| 18 | 2026-03-06 |
Exploration of diverse glycosyltransferases in Dracocephalum moldavica and engineering the production of bioactive flavonoid glycosides
2026-Mar-04, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.70212
PMID:41782194
|
研究论文 | 本研究系统探索了香青兰中参与黄酮类化合物糖基化的UDP-糖基转移酶,并通过工程化大肠杆菌实现了两种生物活性黄酮苷的高效合成 | 首次在香青兰中鉴定出五种功能多样的UGTs,包括双功能糖基转移酶DmUGT1,并通过定点突变揭示了其糖供体特异性的关键氨基酸位点 | 研究主要聚焦于已鉴定的五种UGTs,可能还有其他未发现的糖基转移酶参与香青兰黄酮苷的生物合成 | 阐明香青兰中黄酮类化合物糖基化的分子机制,并为合成生物学方法生产生物活性糖苷提供候选基因和方法 | 香青兰中的UDP-糖基转移酶及其催化的黄酮苷生物合成途径 | 合成生物学 | 心血管疾病 | 同源建模、定点诱变、代谢工程 | NA | 基因序列、酶活性数据 | 五种鉴定出的UGT基因 | 质粒设计、代谢工程 | 大肠杆菌 | 通过工程化大肠杆菌菌株,利用DmUGT1和DmCGT1,并增强细胞内UDP-葡萄糖醛酸和UDP-葡萄糖的供应,以生产目标黄酮苷 | 医药 |
| 19 | 2026-03-06 |
Unlocking plant abiotic stress resilience through biostimulants and omics-driven innovations
2026-Mar-04, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.70205
PMID:41782210
|
综述 | 本文综述了生物刺激剂在增强植物非生物胁迫抗性方面的最新进展,并探讨了基于多组学和人工智能的创新策略 | 整合了生物刺激剂、小RNA、肽和激素等分子调控机制,结合AI驱动的预警系统和合成生物学方法,提出理性设计生物刺激剂的路线图 | NA | 探索生物刺激剂技术以增强植物对非生物胁迫的抗性,促进气候适应性农业和可持续粮食系统 | 植物(作物)及其对干旱、温度、盐分、涝渍和重金属等非生物胁迫的响应 | NA | NA | 多组学(omics)、AI驱动系统、代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业 |
| 20 | 2026-03-05 |
Correction for Ipoutcha et al., "A synthetic biology approach to assemble and reboot clinically relevant Pseudomonas aeruginosa tailed phages"
2026-Mar-03, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.00322-25
PMID:41609359
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |