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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-11-07 |
Scientometric analysis of mycosporine-like amino acids from 1989 to 2025: Current trends and applications
2027-Jan, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.135690
PMID:42632472
|
文献计量分析 | 本文对1989至2025年间类菌胞素氨基酸（MAAs）的研究进行了首次文献计量分析，揭示了研究趋势、主要领域和新兴主题 | 首次对MAAs研究进行全面的文献计量分析，覆盖1989至2025年的859篇文献，揭示了研究主题聚类和新兴趋势 | 仅基于Web of Science核心合集数据库，可能遗漏其他数据库的文献；分析工具仅使用VOSviewer，方法较为单一 | 评估MAAs研究的全球发展态势、研究热点和未来方向，为基础研究和治疗应用提供路线图 | 1989至2025年间发表的MAAs相关研究文献 | 海洋生物学, 生物化学与分子生物学, 环境科学, 生物技术应用微生物学 | NA | 文献计量分析 | NA | 文本（文献元数据） | 859篇文献 | NA | NA | NA | 医学, 化妆品, 环境, 生物技术 |
| 2 | 2026-11-07 |
Physiological, behavioral, and genetic factors that shape interactions in the plant growth-promoting maize rhizosphere synthetic community
2026-Nov-06, mSystems
IF:5.0Q1
DOI:10.1128/msystems.00888-26
PMID:42992937
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研究论文 | 本文构建了一个由31株细菌组成的玉米根际合成群落（MARSc），并研究了其成员间的相互作用、生物膜形成、基因组特征及其对玉米生长的促进作用 | 开发了一个基因组支持的31成员细菌合成群落MARSc，代表爱荷华州土壤中玉米根系微生物多样性，并以KT2440为模型底盘；发现生物膜基因与根际丰度相关但与生物膜形成不相关；MARSc在低氮条件下可提高玉米生物量40%-50% | 合成群落仅包含可培养菌株，可能无法完全代表自然微生物组的复杂性；研究局限于爱荷华州土壤和玉米根系，普适性有待验证 | 理解根际微生物组组装和功能的关键因素，并开发可用于实验操控的合成群落工具 | 玉米根际微生物组、31株细菌合成群落（MARSc）及其与玉米的互作 | 微生物组学 | NA | 基因组分析、微生物组 profiling、共培养互作实验、生物膜形成测定 | NA | 基因组数据、表型数据、微生物组丰度数据 | 31株细菌（30株分离株+KT2440），玉米植株在不同氮肥水平下的实验 | NA | 玉米 | NA | 农业 |
| 3 | 2026-11-07 |
Small genomes, big lessons: What viruses teach us about structure-based riboregulation
2026-Nov-05, Molecular cell
IF:14.5Q1
DOI:10.1016/j.molcel.2026.10.001
PMID:42933405
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综述 | 综述了RNA病毒中基于RNA结构的基因调控机制，并探讨了其与真核生物转录组中结构介导的基因调控的相似性 | 将病毒RNA结构调控机制与真核生物转录组中的结构介导基因调控进行类比，提出RNA结构作为基因表达核心调控层的观点，并强调其广泛的治疗和合成生物学潜力 | 作为综述文章，未提供新的实验数据；对RNA结构元件作为调控模块的功能和机制研究尚处于早期阶段，相关机制理解仍有限 | 总结不同病毒家族中基于RNA结构的调控机制，揭示核糖调控的基本构建模块和真核生物中保守的基因控制原理 | RNA病毒基因组中的结构化RNA元件及真核生物转录组中的结构介导调控元件 | RNA生物学、病毒学、基因调控 | 病毒感染性疾病 | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学, 合成生物学 |
| 4 | 2026-11-07 |
Organoids and organs-on-a-chip as new approach methodologies at the convergence of cell biology and bioengineering
2026-Nov-05, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2026.10.003
PMID:42950820
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综述 | 该文综述了类器官和器官芯片作为新方法学在细胞生物学与生物工程融合中的进展，探讨其在转化医学中的应用与挑战 | 强调合成生物学、多组学、机器学习和基因工程交叉融合，将NAMs定位为加速治疗发现和个性化医疗的基础平台 | 存在可重复性、验证和监管接受度方面的挑战 | 综合类器官、器官芯片及其他生物工程技术在转化医学中的进展，识别剩余差距和新兴机遇 | 类器官、器官芯片及其他生物工程化人类组织模型 | 数字病理学, 机器学习, 生物工程 | NA | 多组学, 机器学习, 基因工程, 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 人类细胞 | NA | 医学, 药物开发 |
| 5 | 2026-11-07 |
AI-Enhanced CRISPR-Cas9 Therapeutics: Advances in Precision, Safety, and Delivery
2026-Nov-05, Progress in biophysics and molecular biology
DOI:10.1016/j.pbiomolbio.2026.101967
PMID:42987985
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综述 | 该综述总结了AI增强的CRISPR-Cas9在精准性、安全性和递送优化方面的最新进展及其临床应用 | 系统整合了人工智能与CRISPR-Cas9在指导RNA设计、脱靶预测、递送优化、AI设计核酸酶（如OpenCRISPR-1、紧凑高保真SaCas9变体）及强化学习流程优化等方面的前沿进展，并强调多尺度建模、可解释AI与合成生物学、单细胞测序、类器官和纳米材料的融合 | 作为综述，缺乏原始实验验证；未对AI模型的临床转化效果进行定量评估；对安全性风险（脱靶效应、染色体易位、免疫原性、监管问题）的讨论以定性为主 | 探讨人工智能如何提升CRISPR-Cas9基因编辑的精准性、安全性和递送效率，并展望其临床转化与个性化医疗前景 | CRISPR-Cas9基因组编辑系统、指导RNA、核酸酶变体、碱基编辑器与先导编辑器、CAR T细胞与CAR-NK细胞、基因疾病、感染性疾病和再生医学应用 | 机器学习 | 遗传病, 感染性疾病, 癌症 | CRISPR-Cas9, 碱基编辑, 先导编辑, 深度学习, 强化学习 | 深度学习, 强化学习 | 文本 | NA | CRISPR-Cas9 | 哺乳动物细胞 | NA | 医学 |
| 6 | 2026-11-07 |
Systematic screen of RNA binding proteins that enhance circular RNA translation
2026-Nov-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-77614-w
PMID:42982803
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研究论文 | 本文开发了一种基于细胞的系统，系统筛选能增强环状RNA翻译的RNA结合蛋白，并利用机器学习预测更多激活因子 | 建立了系统筛选增强环状RNA翻译的RBP的细胞平台，鉴定出68个非经典翻译激活因子，并设计了机器学习算法提取序列特征以预测新的激活因子 | 激活因子的作用具有上下文依赖性，筛选系统可能无法完全反映体内生理条件 | 系统鉴定和预测能增强环状RNA翻译的RNA结合蛋白，拓展RNA合成生物学工具库 | 环状RNA、RNA结合蛋白、IRES元件 | RNA合成生物学 | NA | 基于细胞的筛选系统、机器学习 | 机器学习算法 | 序列数据、实验筛选数据 | 筛选鉴定出68个蛋白 | NA | 哺乳动物细胞 | NA | 医学、工业生物技术 |
| 7 | 2026-11-07 |
Protein resource allocation across subcellular compartments revealed by large-scale absolute quantitative proteomics in yeast
2026-Nov-03, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2621208123
PMID:42945261
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研究论文 | 该研究构建了迄今最大的酵母绝对定量蛋白质组数据集，涵盖两种酵母的300个蛋白质组，揭示了亚细胞区室间蛋白质资源分配与细胞表型的关系 | 构建了迄今最大的酵母绝对定量蛋白质组数据集（300个蛋白质组），结合大数据分析、公式拟合和机器学习，在系统层面揭示了亚细胞资源分配的规律，并发现少数区室的蛋白质质量分数可准确预测酵母生理参数 | 研究仅涉及两种酵母物种，预测模型基于特定实验条件，向其他物种或条件的推广性有待验证 | 揭示酵母亚细胞区室间蛋白质资源分配的规律及其与细胞生理表型的关系 | 两种酵母物种（Crabtree阳性与Crabtree阴性物种） | 定量蛋白质组学, 系统生物学 | NA | 绝对定量蛋白质组学 | 机器学习 | 定量蛋白质组数据 | 300个绝对定量蛋白质组（来自两种酵母物种，涵盖多种实验条件） | NA | 酵母 | NA | 合成生物学, 工业生物技术 |
| 8 | 2026-11-07 |
Deep mutational scanning of the GPCR rhodopsin reveals pleiotropic mutational effects and their roles in modulating receptor signaling
2026-Nov-03, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2624087123
PMID:42961938
|
研究论文 | 该研究通过深度突变扫描技术，在细胞水平上同时评估视紫红质（一种GPCR）的多种分子表型，揭示了多效性突变效应及其对受体信号传导的调节作用 | 开发了一种基于细胞的检测方法，能够同时评估GPCR的多种分子表型（基础活性、配体依赖信号传导和细胞受体丰度），并结合深度突变扫描系统地研究了视紫红质中约2000个单残基替换对三种表型的影响 | 研究仅针对视紫红质这一特定GPCR，可能无法完全代表其他GPCR的多效性效应；细胞检测系统可能与体内环境存在差异；仅测试了单残基替换，未涉及多突变组合 | 探究生物物理多效性如何影响GPCR的进化与信号传导能力，特别是视紫红质中突变的多效性效应及其对受体信号调节的作用 | 视紫红质（一种视觉GPCR） | 蛋白质工程, 分子生物学, 合成生物学 | NA | 深度突变扫描, 基于细胞的检测方法 | NA | 实验测量数据（活性、信号传导、受体丰度） | 约2000个单残基替换，约6000次测量（覆盖三种分子表型） | NA | 哺乳动物细胞（用于基于细胞的检测） | NA | 医学, 合成生物学, 治疗开发 |
| 9 | 2026-11-07 |
Ca2+ signature gates responsiveness to exogenous auxin in Arabidopsis roots
2026-11-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-78361-8
PMID:42977750
|
研究论文 | 利用光遗传学手段在拟南芥根细胞中施加钙信号，研究钙信号对外源生长素响应性的动态调控作用 | 首次使用光门控钙通透通道视紫红质2变体XXM2.0光遗传学地在拟南芥根细胞中施加精确的钙信号特征，并揭示钙信号作为生长素敏感性的动态调节因子，提出CaM7-CNGC14模块介导钙依赖性门控 | 研究主要为相关性证据，CaM7-CNGC14模块的因果关系和分子机制尚需进一步验证，且仅局限于拟南芥根系 | 探究钙信号如何动态调控植物根细胞对外源生长素的响应性及其分子机制 | 拟南芥根细胞 | 植物生物学, 合成生物学 | NA | 光遗传学, 钙成像, 转录组分析 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 拟南芥 | 光遗传学钙信号调控回路 | 农业, 植物生物技术 |
| 10 | 2026-11-07 |
The tryptophan prenyltransferase ComQ from Bacillus subtilis 168 can prenylate daptomycin at Trp1
2026-Nov, The FEBS journal
DOI:10.1111/febs.70578
PMID:42068243
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研究论文 | 本研究探究枯草芽孢杆菌168的色氨酸异戊烯基转移酶ComQ能否作为合成生物学工具对环状抗菌肽达托霉素进行法尼基化修饰 | 首次证明ComQ不仅能修饰线性肽ComX，还能对环状肽达托霉素进行法尼基化，拓展了该酶的底物范围 | 仅在体外验证了ComQ对达托霉素的法尼基化活性，未在体内或活细胞中验证，且底物特异性改造尚未实现 | 探究ComQ能否作为合成生物学工具对环状抗菌肽进行法尼基化修饰，并探索其底物识别机制 | 枯草芽孢杆菌168的ComQ酶、ComX信息素、达托霉素 | 合成生物学 | NA | RiPPs方法、AlphaFold建模、体外酶活实验 | AlphaFold | 蛋白质序列与结构数据、实验数据 | NA | NA | 大肠杆菌 | NA | 医学、工业生物技术 |
| 11 | 2026-11-07 |
STRATUM-structured framework for reporting, assessment, and translational utility of metagenomics
2026-Nov-01, Journal of AOAC International
IF:1.7Q3
DOI:10.1093/jaoacint/qsag085
PMID:42714244
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研究论文 | 本文提出STRATUM框架，一种按用例分层的大规模宏基因组测序报告、评估与转化应用框架 | 提出按决策后果分层的三级解释模型，将QA、元数据报告和解释标准与宏基因组测序输出的用途和后果相匹配 | 摘要未明确说明框架的实证验证数据或实际应用评估结果 | 为应用宏基因组学建立与决策情境相适应的质量与报告标准 | 宏基因组下一代测序（mNGS）在公共卫生、食品安全、环境监测、合成生物学检测和国家安全等生物监测用例中的应用 | 宏基因组学，生物监测，公共卫生 | NA | 宏基因组下一代测序（mNGS） | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学，环境，食品，国家安全 |
| 12 | 2026-11-07 |
Letter to the Editor: The Gut Microbiome-Endocrine Axis in Obesity: Mechanisms and Therapeutics
2026-11, Journal of gastroenterology and hepatology
IF:3.7Q2
DOI:10.1111/jgh.70772
PMID:42767274
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读者来信 | 该文是对Mao等人关于肠道微生物-内分泌轴与肥胖的综述的评论信，提出三个扩展方向以增强其临床相关性 | 提出将GLP-1受体激动剂与肠道微生物组的双向互作、上消化道微生物生态位与合成生物学方法（如工程化丁酸梭菌在肠腔内局部分泌GLP-1）、以及肠道-内分泌轴的昼夜节律维度与表型引导的精准医学相结合 | 作为读者来信，未提供原始实验数据，所提扩展方向仅为观点性建议，缺乏实证验证 | 评论并扩展关于肠道微生物组-内分泌轴在肥胖中作用机制的综述，推动其向个性化肥胖干预的临床转化 | 肠道微生物组、GLP-1受体激动剂、上消化道微生物生态位、工程化丁酸梭菌、昼夜节律与肥胖表型亚型 | 微生物组学, 代谢疾病, 精准医学 | 肥胖 | NA | NA | 文本 | NA | 合成生物学方法 | 丁酸梭菌 | 工程化丁酸梭菌在肠腔内局部分泌GLP-1 | 医学 |
| 13 | 2026-11-07 |
Targeting phenol-soluble modulins: eco-friendly theragnostic strategies against Staphylococcus aureus biofilms
2026-Nov, Future microbiology
IF:2.5Q3
DOI:10.1080/17460913.2026.2751166
PMID:42897951
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综述 | 本文综述了靶向金黄色葡萄球菌酚溶性调节蛋白（PSM）的环保型诊疗策略，包括绿色合成金属纳米颗粒、CRISPR-Cas9/dCas9基因编辑、多组学、人工智能和合成生物学等方法 | 提出将纳米技术、基因编辑、多组学、人工智能和合成生物学相结合，开发针对PSM的先进抗毒力策略 | CRISPR-Cas9和dCas9等基因编辑方法存在递送困难，纳米颗粒干预的优化仍需多组学方法支持 | 探讨针对金黄色葡萄球菌PSM毒力因子的环保型诊疗策略，以应对抗生素耐药性威胁 | 金黄色葡萄球菌（包括耐甲氧西林金黄色葡萄球菌MRSA）的生物膜及酚溶性调节蛋白（PSMs） | 微生物学, 纳米医学, 合成生物学 | 细菌感染, 抗生素耐药性 | 绿色合成金属纳米颗粒, CRISPR-Cas9, dCas9, 多组学（基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学）, 人工智能 | NA | 文本（文献） | NA（文献综述，检索2010至2026年发表的文献） | CRISPR-Cas9, dCas9 | 金黄色葡萄球菌 | NA | 医学 |
| 14 | 2026-11-07 |
Genetic Engineering Efforts to Generate Chlamydomonas Strains for Large-Scale Biomolecule Production
2026-Nov, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.70466
PMID:42978385
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综述 | 综述了通过基因工程和合成生物学平台改造莱茵衣藻以生产生物分子的策略和进展 | 强调莱茵衣藻的广泛合成生物学工具箱和代谢工程策略可用于提高工业性状并生产多种生物技术相关生物分子，且产率与其他光合底盘相当或更高 | 莱茵衣藻的工业应用仍然缺乏，需要进一步技术进展、明确的国际法规和社会接受度 | 探讨利用基因工程和代谢工程策略改造莱茵衣藻实现大规模生物分子生产的潜力 | 莱茵衣藻（Chlamydomonas reinhardtii） | 合成生物学 | NA | 基因工程、代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 莱茵衣藻 | NA | 工业生物技术、医药 |
| 15 | 2026-11-07 |
A multispecies foundation model for genome function prediction, gene annotation and sequence design
2026-Oct-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.22.695963
PMID:42990234
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研究论文 | 本文介绍了一个跨物种的基础模型NTv3，用于基因组功能预测、基因注释和可控序列设计 | 提出了长上下文跨物种基础模型NTv3，在超过128,000个基因组上预训练，并在15个动物和植物基因组的16,262个功能轨道上后训练；首次将功能预测、基因注释和调控序列设计统一在一个模型中；使用离散扩散设计具有特定活性水平的调控DNA序列，并在果蝇增强子上实验验证 | 摘要中未明确提及 | 开发一个能够跨系统发育多样物种进行功能预测、基因注释和可控序列生成的统一基础模型 | 基因组DNA序列，涵盖哺乳动物、鸟类、鱼类、植物、真菌和原生生物等19个物种 | 基因组学、机器学习 | NA | 深度学习基础模型、离散扩散 | Nucleotide Transformer v3 (NTv3)，基于Transformer的基础模型 | 基因组序列、功能基因组轨道数据 | 超过128,000个基因组用于预训练，16,262个功能轨道来自15个动物和植物基因组，评估涵盖19个物种 | NA | NA | NA | 农业、生物多样性研究、生物技术、医学 |
| 16 | 2026-11-07 |
Engineered probiotics target granulomas to treat mycobacterial infection
2026-Oct-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.10.27.762313
PMID:42990267
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研究论文 | 该研究改造益生菌Nissle 1917使其靶向并定植肉芽肿，通过感知缺氧微环境和双模式裂解电路释放抗分枝杆菌载荷，以治疗分枝杆菌感染 | 利用坏死肉芽肿的缺氧微环境限制细菌生长，开发结合胞内和胞外杀伤的双模式裂解电路实现持续载荷释放并限制进化逃逸，并工程化表达分枝杆菌噬菌体来源的酶 | 未明确说明 | 建立利用可编程活微生物靶向肉芽肿性感染的合成生物学框架 | 益生菌Nissle 1917、分枝杆菌、肉芽肿 | 合成生物学 | 分枝杆菌感染 | 合成生物学、基因工程 | NA | NA | NA | NA | 益生菌Nissle 1917 | 双模式裂解电路 | 医学 |
| 17 | 2026-11-07 |
EXPERT: A practical and forward-looking guide to capturing protein expression and purification metadata to develop machine learning models
2026-Sep-29, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2026.113610
PMID:42810683
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研究论文 | 该文提出了EXPERT框架，用于标准化记录蛋白质表达与纯化实验元数据，以支持机器学习模型的开发 | 首次提出社区驱动的结构化模板EXPERT，统一蛋白质表达与纯化实验报告标准，兼顾流程可重复性与机器学习建模需求 | 该文仅为指南性建议，尚未在大规模实验中验证其有效性，且参数集可能需要随领域发展持续更新 | 解决蛋白质工程与合成生物学中实验报告不一致、不完整、不标准化的问题，以支持可重复研究和机器学习模型构建 | 蛋白质表达与纯化实验流程及其元数据 | 机器学习 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学,工业生物技术 |
| 18 | 2026-11-07 |
Dual-targeted bioengineered bacterial extracellular vesicles ameliorate senile osteoporosis via SAE1-mediated NAT10 SUMOylation and ac4C-dependent glycolysis
2026-Aug-07, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-026-04820-5
PMID:42989227
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研究论文 | 该研究通过合成生物学构建了双靶向生物工程化细菌外囊泡，递送SAE1以促进骨髓间充质干细胞成骨分化，从而改善老年性骨质疏松 | 构建了同时展示骨靶向肽SDSSD、趋化因子受体CXCR4和SAE1的双靶向生物工程化细菌外囊泡（BT-BEVs-CS），并首次揭示了SAE1-NAT10/ac4C-PGI调控轴在成骨分化中的作用 | 研究仅在临床前小鼠模型中验证，尚未进行人体临床试验，转化可行性仍需进一步评估 | 探索靶向调控骨髓间充质干细胞成骨分化以干预老年性骨质疏松的新策略 | 老年性骨质疏松小鼠模型及骨髓间充质干细胞 | 骨生物学、纳米医学、合成生物学 | 老年性骨质疏松 | 合成生物学、细菌外囊泡工程化、SUMO化修饰检测、ac4C RNA修饰测序 | NA | 体内外实验数据、图像、分子生物学数据 | NA | 合成生物学 | 细菌（用于生产细菌外囊泡） | 双靶向细菌外囊泡表面展示系统（骨靶向肽SDSSD、CXCR4、SAE1） | 医学 |
| 19 | 2026-11-07 |
Microbial CO2 bioconversion: integrating carbon fixation pathways and sustainable biomanufacturing
2026, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2026.1961758
PMID:42985149
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综述 | 该综述系统评估了微生物二氧化碳生物转化的最新进展，整合了自然与合成碳固定途径、微生物生产平台、代谢工程策略、产物多样化及技术经济考量，并进行了文献计量分析 | 不同于以往仅关注碳固定途径、气体发酵或代谢工程等单一主题的综述，本文提出了一个连接自然与合成碳固定途径、微生物生产平台、代谢工程策略、产物多样化和技术经济考量的整合框架，并结合对913篇文献的系统文献计量分析 | 本文为综述性文章，未提供原始实验数据；主要障碍包括CO质量传递、碳固定效率、能量限制、工艺放大、下游处理和经济可行性等问题仍待解决 | 全面评估微生物CO2生物转化的最新进展， bridging生物学、技术和工业视角，识别推动生物CO2转化向可规模化、可持续生物制造发展的核心要素 | 微生物CO2生物转化相关研究文献（913篇Web of Science核心合集索引文献） | 合成生物学, 代谢工程, 生物制造 | NA | 文献计量分析, 合成生物学, 系统代谢工程, 微生物电合成, 生物电化学系统, 合成微生物群落, 人工智能辅助菌株工程 | NA | 文本（文献数据） | 913篇文献 | NA | 微生物 | NA | 医学/医药（燃料、化学品、生物材料、蛋白质等增值产品生产）, 工业生物技术, 环境（碳捕集与利用）, 能源 |
| 20 | 2026-11-07 |
HydroGuard: a controlled release hydrogel-phage delivery system to combat catheter-associated urinary tract infections
2026, Frontiers in systems biology
DOI:10.3389/fsysb.2026.1923468
PMID:42991163
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研究论文 | 本文构建了一种基于明胶甲基丙烯酰基（Gel-MA）水凝胶和噬菌体的可控释放系统HydroGuard，用于防治导管相关尿路感染（CAUTI），并结合多尺度计算模型预测其性能 | 利用粪肠球菌分泌的明胶酶（GelE）触发GelMA水凝胶降解，实现噬菌体的酶响应性靶向释放；整合合成生物学、组织工程和多尺度计算建模（生物膜模拟、捕食者-猎物模型、计算蛋白设计）来优化系统 | 目前仅获得初步抑制效果，需测试不同噬菌体组合；概念验证使用异源表达GelE的大肠杆菌DH5α模拟粪肠球菌，而非直接在目标病原体上验证；实验证据尚不充分 | 通过工程化HydroGuard系统，解决导管表面生物膜形成问题，预防导管相关尿路感染 | 粪肠球菌（Enterococcus faecalis）生物膜、噬菌体、GelMA水凝胶、大肠杆菌DH5α（作为GelE表达宿主） | 合成生物学, 组织工程, 计算生物学 | 导管相关尿路感染 | 噬菌体疗法, 水凝胶递送系统, 异源蛋白表达, 数学建模, 基于代理的生物膜模拟, 计算蛋白设计 | 基于代理的生物膜模型, 捕食者-猎物模型, 多尺度计算框架 | 实验数据（体外生物膜抑制实验）, 计算模拟数据 | NA | NA | 大肠杆菌DH5α | 酶触发降解-噬菌体释放系统（GelE响应性GelMA水凝胶） | 医学 |