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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-11-16 |
Construction of a stable T7 expression system inSaccharomyces cerevisiae based on extranuclear replication system
2026-Nov-14, Biotechnology letters
IF:2.0Q3
DOI:10.1007/s10529-026-03803-8
PMID:43033326
|
研究论文 | 本文通过利用来源于乳酸克鲁维酵母的线性质粒pGKL1/pGKL2的核外复制系统,在酿酒酵母中构建了一个稳定的细胞质T7表达系统 | 利用核外复制系统将T7表达系统定位于细胞质,规避了核质分区和mRNA出核效率低的问题;发现高阶DNA结构显著影响T7转录效率,质粒上的转录效率比基因组DNA高100倍 | 系统依赖选择压力维持稳定性;仅在酿酒酵母中验证;未全面评估不同蛋白的表达效果及工业化规模应用潜力 | 在酿酒酵母中构建稳定的细胞质T7表达系统以实现高效重组蛋白生产 | 酿酒酵母F102-2u及基于pGKL1/pGKL2的细胞质线性质粒p1 | 合成生物学 | NA | 核外复制系统、T7表达系统、IRES介导翻译 | NA | 荧光素酶发光强度、荧光数据、qPCR转录数据 | NA | NA | 酿酒酵母 | 基于pGKL1/pGKL2线性质粒的细胞质T7表达盒(含IRES)与基因组整合的T7 RNA聚合酶表达框 | 医学、工业生物技术 |
| 2 | 2026-11-16 |
From oil biosynthesis to precision breeding: Genetic improvement of fatty acid composition in oilseed crops
2026-Nov-14, Progress in lipid research
IF:14.0Q1
DOI:10.1016/j.plipres.2026.101400
PMID:43033895
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综述 | 本文综述了油料作物脂肪酸组成的代谢基础、遗传结构及多组学辅助基因发现,并提出了从位点发现到等位基因优选、靶向编辑、途径工程和田间应用的精准育种设计框架 | 提出了将位点发现与等位基因优选、靶向编辑、途径工程及田间部署相衔接的设计框架,并强调了多基因合成生物学、人工智能辅助酶与启动子设计以及未充分利用油料作物挖掘等新兴机遇 | 文章为综述性工作,强调仍需生化验证和田间水平性能评估,且多组学发现的位点与候选基因尚需功能验证 | 总结食用油脂肪酸多样性的代谢基础,探讨遗传结构与多组学辅助发现如何加速控制脂肪酸组成的位点、等位基因和候选基因鉴定,并梳理油料作物改良策略 | 主要油料作物和特色油料作物的食用油脂肪酸组成及相关基因、等位基因与代谢途径 | 植物遗传学与育种 | NA | 连锁作图、混合分组测序、全基因组关联分析、转录组学、蛋白质组学、泛基因组分析 | NA | 文本 | NA | 单基因编辑、转基因操作、多基因合成生物学 | 油料作物 | 脂肪酸合成、去饱和与延长、酰基编辑、三酰甘油组装及脂质周转相关的代谢途径工程 | 农业, 食品, 工业生物技术 |
| 3 | 2026-11-16 |
Recent approaches to modulate citrinin biosynthesis in Monascus species: a review
2026-Nov-13, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-026-05400-3
PMID:43024006
|
综述 | 本文综述了红曲霉中桔霉素生物合成的调控机制及降低桔霉素产量的最新策略 | 系统整合了表观遗传调控、全局调控网络和环境因子与桔霉素生物合成基因簇的相互作用,并提出了将表观遗传工程与多组学、人工智能辅助的菌株设计相结合以构建低产或不产桔霉素红曲霉菌株的新思路 | 文章为综述性总结,未提供新的实验数据;对表观遗传工程与人工智能辅助设计策略的实际应用效果和安全性缺乏实证评估 | 总结调控红曲霉桔霉素生物合成的分子与表观遗传机制,并评估工程化改造低产或不产桔霉素菌株的最新研究进展 | 红曲霉(Monascus spp.)及其桔霉素生物合成途径 | 合成生物学、代谢工程、食品生物技术 | NA | 转录组学、蛋白质组学、多组学、RNA干扰、CRISPR/Cas基因组编辑、合成生物学、表观遗传修饰分析 | NA | 文本 | NA | CRISPR-Cas9、RNA干扰 | 红曲霉(Monascus spp.) | 桔霉素生物合成基因簇的调控网络改造、表观遗传修饰调控、全局调控因子(如velvet复合体)调控 | 食品、医药、营养保健品、化妆品、工业生物技术 |
| 4 | 2026-11-16 |
Fe(II)/2-oxoglutarate-dependent dioxygenase bifunctionally catalyzes ring formation involving sequential terminal carbon oxidation for pyrrolizidinone alkaloid biosynthesis
2026-Nov-12, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.155262
PMID:43020353
|
研究论文 | 该文阐明了Fe(II)/2-酮戊二酸依赖型双加氧酶UcsF催化L-异亮氨酸末端C5连续氧化并形成五元环的分子机制 | 揭示了UcsF独特的开放活性口袋和Asp279'协助的PCET介导的两步连续氧化新机制 | 未明确说明反应中间体的直接捕获证据及体外重构效率的限制 | 解析UcsF的结构基础与连续氧化催化机制 | UcsF酶、L-异亮氨酸及其氧化产物 | 合成生物学, 酶学, 结构生物学 | NA | X射线晶体学, 分子对接, 分子动力学模拟, 量子化学计算, 定点突变, 动力学分析, 溶剂同位素效应 | NA | 蛋白质结构, 计算模拟数据, 实验动力学数据 | NA | NA | NA | NA | 医药, 合成生物学 |
| 5 | 2026-11-16 |
Biosynthetic Gene Clusters of Astragalus Triterpenoid Saponins: From Genome Discovery to Synthetic Biology and Biomanufacturing Prospects
2026-Nov-06, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants15213466
PMID:43029075
|
综述 | 本文综述了黄芪三萜皂苷生物合成基因簇的基因组发现、途径生物化学及合成生物学工程化生产进展 | 系统整合了黄芪属六个代表性基因组组装中三萜皂苷生物合成基因簇的分布特征,明确了骨架合成酶基因位于约4 Mb基因簇之外,并首次对现有异源生产平台与药典质量标准进行基准比较 | 下游体内路由、形成黄芪皂苷I和II的乙酰化步骤以及皂苷的调控、区室化、转运和储存机制仍未解析,异源生产仅处于概念验证阶段 | 整合基因组挖掘、途径生物化学与合成生物学工程,评估现有生产平台并梳理从概念验证到可持续生物制造的瓶颈 | 黄芪属植物基因组及黄芪甲苷IV等环阿屯烷型三萜皂苷生物合成途径 | 合成生物学 | 心血管疾病, 肿瘤 | 基因组挖掘, 途径生物化学, 合成生物学, 代谢工程 | NA | 基因组序列, 文本 | 6个代表性黄芪属基因组组装 | NA | 酵母, 毛状根 | 三萜皂苷生物合成代谢途径 | 医药, 工业生物技术 |
| 6 | 2026-11-16 |
Microbial Biotransformation of Plant Bioactive Compounds: Mechanisms, Enhanced Bioactivities, and Applications in Functional Food Development
2026-Oct-30, Foods (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/foods15213894
PMID:43027525
|
综述 | 本文综述了微生物生物转化植物活性化合物(多酚、黄酮、生物碱、萜类、皂苷)的机制、增强的生物活性及其在功能食品开发中的应用 | 系统整合了乳酸菌、酵母和丝状真菌介导的植物活性化合物转化通路(脱糖基化、水解、氧化还原、甲基化、糖基化)及其酶学机制,并展望多组学、合成生物学、酶工程与智能发酵技术的融合 | 机制理解尚不完整,缺乏工艺标准化,安全性评价不足,规模化放大与监管问题有待解决 | 总结微生物转化植物活性化合物的最新进展,探讨其在功能食品开发中的应用潜力与挑战 | 植物来源活性化合物(多酚、黄酮、生物碱、萜类、皂苷)及乳酸菌、酵母、丝状真菌等转化微生物 | 食品科学, 微生物学, 天然产物化学 | NA | 微生物发酵, 酶催化, 多组学, 合成生物学, 酶工程 | NA | 文本 | NA | NA | 乳酸菌, 酵母, 丝状真菌 | NA | 食品, 医药 |
| 7 | 2026-11-16 |
Algal-Bacterial Symbiotic Systems for Resource Recovery and High-Value Product Generation from Ammonia-Rich Food Wastewater: A Review
2026-Oct-30, Foods (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/foods15213893
PMID:43027524
|
综述 | 综述了藻-菌共生系统在氨氮富集食品废水处理中的协同机制、反应器构型以及生物质高值化利用与商业化障碍 | 系统整合了以群体感应为关键调控路径的藻-菌协同机制,并前瞻性提出合成生物学、人工智能辅助过程控制与生物精炼相结合以推动藻-菌共生系统从实验室走向实际应用的路径 | 作为综述缺乏原始实验数据;对所提及的合成生物学和AI辅助过程控制等新兴方向尚缺乏充分的实证支撑;对商业化障碍仅有定性讨论 | 总结藻-菌共生系统处理富氨食品废水的最新知识,阐明脱氮、生物质生产与高值产物生成的协同机制,并探讨规模化实施与资源回收的发展方向 | 富含氨氮的食品加工废水、微藻-细菌共生体(菌群与生物膜)及其收获生物质 | 环境生物技术,废水处理,生物资源工程,合成生物学 | NA | 藻-菌共培养,群体感应调控,合成生物学,人工智能辅助过程控制,生物精炼 | NA | 文献文本 | NA | NA | 微藻,细菌 | NA | 环境,能源,农业,食品,工业生物技术 |
| 8 | 2026-11-16 |
Engineering Silk and Silk-like Proteins into High-Performance Fiber Materials
2026-Oct-23, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27219455
PMID:43027707
|
综述 | 本文综述了将丝蛋白及类丝蛋白工程化为高性能纤维材料的最新进展,涵盖从序列设计到纤维性能的跨尺度关系 | 系统整合了合成生物学对蛋白序列、重复数、分子量和模块化结构的精确控制,并建立了序列-结构-性能关系与多尺度纤维工程的关联框架 | 作为综述文章未提供原始实验数据,且指出规模化重组生产和数据驱动序列设计仍待进一步发展 | 探讨如何通过工程化手段将丝蛋白及类丝蛋白转化为力学与功能优化的高性能纤维材料 | 丝蛋白及类丝蛋白(silk and silk-like proteins) | 合成生物学, 材料科学 | NA | 合成生物学, 蛋白质工程, 重组蛋白生产, 纺丝技术 | NA | 文献数据 | NA | NA | NA | NA | 材料, 医学, 纺织, 可持续材料 |
| 9 | 2026-11-16 |
Advances in probiotics and gut microbiota-derived extracellular vesicles for the prevention and treatment of osteoporosis
2026, Frontiers in nutrition
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fnut.2026.1884520
PMID:43032666
|
综述 | 本文综述了益生菌和肠道菌群来源的细胞外囊泡在骨质疏松症防治中的作用及机制 | 系统总结了工程化细胞外囊泡(如BEVs-BMP-2-CXCR4)在骨靶向治疗中的潜力,并强调肠-骨轴的多轴调控机制 | 细胞外囊泡影响成骨细胞和破骨细胞分化与活性的分子机制尚不明确 | 探讨益生菌和肠道菌群来源细胞外囊泡在骨质疏松症中的治疗潜力 | 骨质疏松症、益生菌、肠道菌群、细胞外囊泡 | 医学 | 骨质疏松症 | NA | NA | 文献 | NA | 合成生物学 | NA | NA | 医学 |
| 10 | 2026-11-16 |
Next-Generation Probiotics: Emerging Mechanisms, Therapeutic Innovations, and Future Perspectives
2026, BioMed research international
IF:2.6Q3
DOI:10.1155/bmri/8353908
PMID:43032967
|
综述 | 综述探讨下一代益生菌从经验性使用向功能性微生物疗法的转变,连接作用机制与临床转化障碍 | 提出益生菌疗效缺口概念,强调功能优先框架,整合机制关联效力指标、前瞻性应答者识别、靶向递送和临床意义证据 | 作为综述未提供原始实验数据验证所提框架,对具体制造和监管问题的解决方案讨论有限 | 批判性审视益生菌研究从传统菌株向工程化微生物和定义性微生物效应物的转变,分析机制与临床转化障碍 | 益生菌、下一代益生菌、工程化微生物、定义性微生物效应物、非活性微生物产物 | 微生物组学 | NA | 多组学 | NA | 文本 | NA | 合成生物学 | NA | 可编程微生物平台 | 医学 |
| 11 | 2026-11-16 |
The Immune-Nanomedicine Axis in Glioblastoma: From Biomimetic Delivery to Immune Reprogramming
2026, International journal of nanomedicine
IF:6.6Q1
DOI:10.2147/IJN.S655635
PMID:43034623
|
综述 | 该综述系统阐述了胶质母细胞瘤中免疫-纳米医学轴,涵盖仿生递送、免疫重编程及临床转化瓶颈 | 不同于现有文献主要罗列纳米材料性质,本文聚焦于解码工程化平台如何主动重编程GBM免疫微环境中的特定细胞区室,并系统梳理从仿生递送到免疫重编程的完整轴线 | 复杂纳米材料的规模化生产、严重的脱靶神经免疫毒性以及宿主固有的生理约束从根本上制约了临床转化 | 梳理免疫-纳米医学轴在胶质母细胞瘤治疗中的最新临床前概念验证研究,探讨工程化平台如何克服血脑屏障和免疫抑制微环境 | 胶质母细胞瘤及其免疫微环境(包括髓系基质、树突状细胞、T细胞、自然杀伤细胞等细胞区室) | 纳米医学, 肿瘤免疫学 | 胶质母细胞瘤 | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 12 | 2026-11-16 |
Designing microbial consortia with defined social interactions
2018-08, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-018-0091-7
PMID:29942078
|
研究论文 | 该文章通过社会相互作用工程构建了具有明确相互作用模式的合成微生物群落,并结合模型预测其种群动态 | 将模块化通路重构与模型创建相结合,构建了六种具有不同相互作用模式的双菌株群落,并证明模型可扩展到三菌株和四菌株生态系统 | 研究主要基于双菌株群落,对更复杂生态系统的预测能力有限,且空间动态的见解仍属初步 | 开发具有可预测动态的合成微生物群落,并建立社会相互作用编程的系统框架 | 合成微生物群落(双菌株、三菌株和四菌株生态系统) | 合成生物学 | NA | 模块化通路重构、数学模型构建 | 基于相互作用模式的种群动态模型 | 种群动态数据、模型模拟数据 | 六种双菌株群落,以及三菌株和四菌株生态系统 | NA | NA | 模块化通路重构以创建不同社会相互作用模式(偏利共生、偏害共生、中性共生、合作、竞争和捕食) | 医学、环境、工业生物技术 |
| 13 | 2026-11-16 |
Self-organizing multicellular structures designed using synthetic biology
2018-07, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/d41586-018-05564-5
PMID:29988052
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 14 | 2026-11-16 |
Synthetic biology: designs on life
2005-Nov-24, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/438417a
PMID:16306958
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 15 | 2026-11-16 |
Programming cellular function
2005-Nov, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/nchembio1105-304
PMID:16408063
|
评论 | 文章报道了2005年8月召开的一次会议,该会议展示了合成生物学领域在细胞工程方面的进展,并讨论了伦理、安全和安保议题 | 总结了细胞工程和合成生物学领域的最新进展,并探讨了相关的伦理、安全和安保问题 | 文章仅为会议报道,未提供具体的研究数据或实验细节 | 介绍合成生物学领域在细胞工程方面的进展,并讨论相关的伦理、安全和安保问题 | 合成生物学领域的细胞工程技术和相关伦理、安全议题 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 16 | 2026-11-14 |
Microbiome-guided rhizosphere engineering for sustainable remediation of agricultural soil contaminants
2026, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2026.1994433
PMID:43016950
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综述 | 本文是一篇小型综述,系统梳理了微生物组引导的根际工程在农业土壤污染物可持续修复中的应用,并将各类方法按田间验证程度分为三个层级 | 不同于常规综述,本文对现有证据进行分层评估(田间验证、盆栽/微宇宙新兴、概念性),并明确区分了微塑料去除中的拦截、吸附、风化、转化与矿化过程,指出报告中的去除通常并非降解 | 仅有两个领域被证明达到田间验证水平(金属固定与植物提取、烃类根际修复),且均依赖培养分离物而非工程微生物;微塑料根际修复尚未在土壤中验证;合成生物学、CRISPR群落编辑和计算设计仍处于概念阶段;缺乏田间规模的标准化证据 | 评估和分层根际工程方法在农业土壤污染物修复中的可部署性,识别推动方法从低层级向高层级跨越所需的关键测量指标 | 农业土壤中的农药残留、重金属、石油烃和微塑料等混合污染物及其根际微生物群落 | 环境微生物学 | NA | NA | NA | 文本 | NA | CRISPR | NA | NA | 环境, 农业 |
| 17 | 2026-11-13 |
Natural and engineered bacteriophages against multidrug-resistant ESKAPE pathogens: current landscape and clinical translation
2026-Dec, Future microbiology
IF:2.5Q3
DOI:10.1080/17460913.2026.2752147
PMID:42953984
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综述 | 综述天然和工程化噬菌体对抗多重耐药ESKAPE病原体的现状及临床转化面临的挑战 | 系统整合尾丝修饰、解聚酶与内溶素增强、CRISPR基因组编辑及计算设计噬菌体鸡尾酒等合成生物学工程策略,并批判性分析其临床转化障碍 | 缺乏原始实验数据,未提供新的实验结果或临床证据 | 探讨工程化噬菌体对抗多重耐药ESKAPE病原体的工程改造策略、临床转化障碍及推广所需关键步骤 | 多重耐药ESKAPE病原体及天然与工程化噬菌体 | 合成生物学、医学微生物学 | 医院获得性感染、多重耐药细菌感染 | 合成生物学、CRISPR基因组编辑、尾丝修饰、解聚酶与内溶素增强、计算设计噬菌体鸡尾酒 | NA | 文本 | NA | CRISPR-Cas | 噬菌体、细菌 | 工程化噬菌体鸡尾酒 | 医学、制药 |
| 18 | 2026-11-13 |
Bacterial outer membrane vesicles at the Host-Pathogen interface: Biochemical mechanisms, immunomodulation, clinical and biotechnological applications
2026-Nov-11, Acta microbiologica et immunologica Hungarica
IF:1.3Q4
DOI:10.1556/030.2026.03095
PMID:43012915
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综述 | 综述细菌外膜囊泡的形成机制、货物分选、宿主细胞摄取、免疫调节及其临床与生物技术应用 | 系统整合了OMV从生物发生、选择性货物包装到宿主免疫调控的分子机制,并批判性评估了其在疫苗、肿瘤免疫治疗和药物递送等临床与生物技术平台中的应用 | 作为综述文章,未提供原始实验数据,对现有OMV研究的异质性和机制细节缺乏统一验证 | 阐明OMV在宿主-病原体界面的生物化学机制、免疫调节作用及临床和生物技术应用前景 | 细菌外膜囊泡(OMVs),包括革兰阴性菌分泌的囊泡及其与宿主细胞的相互作用 | 微生物学, 免疫学, 合成生物学 | 感染性疾病, 癌症 | NA | NA | 文本 | NA | NA | 革兰阴性细菌, 哺乳动物细胞 | 工程化OMV平台(下一代疫苗和药物递送系统) | 医学, 生物技术 |
| 19 | 2026-11-13 |
Hierarchical design strategies for tuning genetic circuits
2026-Nov-11, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2026.10.013
PMID:43015170
|
综述 | 建立了一个分层框架来调控基因电路,涵盖生物部件设计、DNA合成与组装、载体选择、宿主细胞实现和跨宿主转移 | 提出将基因电路调控视为跨多个设计层次的系统工程过程,并整合分层设计策略与迭代故障排除 | 作为综述,未提供新的实验数据或定量验证 | 为基因电路调控提供更可预测和可靠的实用路线图 | 基因电路 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | 基因电路 | 医学, 工业生物技术 |
| 20 | 2026-11-13 |
Emerging synthetic biology toolkits to control gene expression and provide therapeutic avenues in cardiovascular disease
2026-Nov-11, Expert opinion on investigational drugs
IF:4.9Q1
DOI:10.1080/13543784.2026.2761884
PMID:43016050
|
综述 | 该文综述了用于控制基因表达并为心血管疾病提供治疗途径的新兴合成生物学工具包 | 系统总结了可调调控开关、可编程基因回路、合成传感模块和肠-心轴工程等合成生物学启发技术及其在心血管医学中的转化潜力 | 存在非哺乳动物组件、免疫原性、监管不确定性以及伦理和安全问题等临床转化障碍 | 探讨合成生物学在心血管疾病基因表达调控和疾病管理中的转化应用与未来机遇 | 心血管疾病相关的基因表达调控与治疗技术 | 合成生物学 | 心血管疾病 | NA | NA | 文本 | NA | NA | 哺乳动物细胞 | 可调调控开关、可编程基因回路、合成传感模块、肠-心轴工程 | 医学 |