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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-03-01 |
Natural products as modulators of ferroptosis: Therapeutic implications and molecular mechanisms in disease treatment
2026-May, The Journal of nutritional biochemistry
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jnutbio.2026.110259
PMID:41490559
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综述 | 本文综述了天然产物作为铁死亡调节剂在疾病治疗中的治疗意义和分子机制 | 系统性地基于结构类别和作用机制对天然产物(如萜类、黄酮类、生物碱等)进行分类,并阐明其通过铁螯合、ROS调节等途径调节铁死亡,强调了纳米递送系统和合成生物学作为克服其应用限制的前景策略 | 天然产物的应用受到来源有限、成分复杂和药代动力学特征不稳定等因素的限制 | 探讨天然产物作为铁死亡调节剂在疾病治疗中的潜力及分子机制 | 天然产物(萜类、黄酮类、生物碱、皂苷、多酚等) | NA | 癌症、神经退行性疾病、糖尿病、心血管疾病 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 2 | 2026-03-01 |
Genetic toolbox development for engineering Bacteroides and other bacterial species
2026-Apr, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2026.102709
PMID:41643388
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综述 | 本文综述了针对非模式细菌(特别是拟杆菌属)的合成生物学工具箱开发策略,以支持工程化活体治疗或诊断机器的研究 | 强调为非模式共生和益生菌菌株开发定制化遗传工具,以克服传统实验室适应物种的局限性,推动原位工程化活体治疗应用 | NA | 开发适用于非模式细菌的合成生物学工具箱,以建立分子生物学框架,促进这些物种的遗传和代谢操作 | 拟杆菌属及其他非模式细菌菌株 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | Bacteroides, Escherichia coli | 生物传感器、代谢通路 | 医学 |
| 3 | 2026-03-01 |
Enhanced Heterologous Production of Tylosin Through Pathway Reconstruction and Integrated Optimization in Streptomyces
2026-Mar, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.70203
PMID:41761947
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研究论文 | 本研究通过ExoCET技术克隆了泰乐菌素生物合成基因簇,在链霉菌宿主中实现异源表达,并通过培养基优化和基因工程策略显著提高了泰乐菌素产量 | 采用ExoCET技术克隆大型GC-rich基因簇,结合两步组装策略在多种链霉菌宿主中实现异源表达,并通过启动子替换和调控基因敲除优化产量 | NA | 提高泰乐菌素的异源生物合成效率并开发增强治疗活性的类似物 | 泰乐菌素生物合成基因簇及其在链霉菌宿主中的表达 | 合成生物学 | NA | ExoCET技术、基因克隆、发酵优化、启动子替换、基因敲除 | NA | NA | 三种链霉菌宿主(包括S. albus J1074) | ExoCET | Streptomyces fradiae QL100, Streptomyces albus J1074, 其他链霉菌宿主 | 泰乐菌素生物合成途径的重建与优化,包括关键基因(tylGI和tylI)的启动子替换和调控基因(tylQ)的敲除 | 医药 |
| 4 | 2026-03-01 |
Editing and synthetic applications of chloroplast genomes
2026-Feb-26, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2026.101783
PMID:41761616
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综述 | 本文综述了叶绿体基因组编辑与合成应用的最新进展,包括基因组最小化、高效编辑和代谢途径重设计 | 整合了叶绿体基因组精简、精准编辑工具和代谢途径动态调控等前沿技术,为下一代叶绿体工程铺平道路 | NA | 优化叶绿体功能,实现高价值化合物的从头生物合成和作物性状改良 | 植物和藻类的叶绿体基因组 | 合成生物学 | NA | 基因组编辑、代谢途径重设计 | NA | NA | NA | NA | 植物、藻类 | 代谢途径重设计、能量代谢动态调控 | 农业、生物技术 |
| 5 | 2026-03-01 |
"Lys-Leu" Motif Empowers Expedient OaAEP1-Catalyzed Generation of N‑Terminal Cysteine Recombinant Proteins for Bioconjugation and Semisynthesis
2026-Feb-23, JACS Au
IF:8.5Q1
DOI:10.1021/jacsau.5c01395
PMID:41755832
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研究论文 | 本研究报道了一种基于“Lys-Leu”基序辅助的AEP1酶催化切割方法,用于高效生成N端半胱氨酸重组蛋白,以用于生物偶联和半合成应用 | 该方法显著提高了P2'位所有20种天然氨基酸的切割效率,兼容多种底物(包括难处理的包涵体蛋白),并实现了一步法原位生成与功能化 | NA | 开发一种高效、通用的位点特异性蛋白质修饰平台 | N端半胱氨酸重组蛋白 | 合成生物学与化学生物学 | NA | AEP1酶催化切割 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学(活细胞成像、治疗开发) |
| 6 | 2026-03-01 |
Recognition of Non-standard Base Pairs by Triplex-Forming Oligonucleotides Containing an Expanded Genetic Alphabet
2026-Feb-17, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-8652009/v1
PMID:41756467
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研究论文 | 本文通过使用人工扩展遗传信息系统(AEGIS)的核碱基,扩展了三链形成寡核苷酸(TFOs)对双链DNA的序列特异性识别能力,实现了在pH中性条件下对标准、损伤或合成碱基对的高亲和力靶向 | 利用AEGIS核碱基系统性地评估了120种碱基三联体组合,识别出至少12种新的模块化三联体,可在pH中性条件下以纳摩尔亲和力靶向双链DNA,突破了天然核碱基的限制 | NA | 扩展三链形成寡核苷酸对双链DNA的序列特异性识别能力,以克服天然核碱基在靶向序列和pH稳定性方面的限制 | 三链形成寡核苷酸(TFOs)、双链DNA、标准/损伤/合成碱基对、AEGIS核碱基 | 合成生物学 | NA | Hoogsteen碱基配对、化学和酶法合成TFOs | NA | NA | 120种碱基三联体组合 | AEGIS(人工扩展遗传信息系统) | NA | NA | 医学、分子传感、核酸纳米技术 |
| 7 | 2026-03-01 |
Strategies for Improving Aptamer Screening Efficiency: Library Design, Awareness Innovation, and Instrument Assistance
2026, Critical reviews in analytical chemistry
IF:4.2Q1
DOI:10.1080/10408347.2024.2411244
PMID:39378058
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综述 | 本文综述了提高适配体筛选效率的策略,包括库设计、筛选意识创新和仪器辅助 | 总结了SELEX优化策略,通过合理库设计、新颖筛选意识和先进设备,将筛选轮数显著减少至<8轮,时间缩短至<3周,并提升适配体性能 | NA | 提供适配体筛选方法的实用参考,以克服SELEX在初始库盲目性、耗时和性能不足方面的挑战 | 适配体及其筛选方法,特别是SELEX技术 | 合成生物学 | NA | SELEX(指数富集的配体系统进化) | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物传感器、疾病治疗、合成生物学 |
| 8 | 2026-03-01 |
Exploring structural, functional, evolutionary, and genetic characteristics of sugar transporters in maize and their roles in abiotic stress tolerance
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0342990
PMID:41746965
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研究论文 | 本文通过生物信息学分析鉴定了玉米中的60个糖转运蛋白,并研究了它们在非生物胁迫耐受性中的潜在作用 | 首次在玉米中系统鉴定和表征糖转运蛋白家族,并通过干湿实验结合的方法揭示了它们在非生物胁迫响应中的调控机制 | 研究主要基于生物信息学预测和初步实验验证,需要进一步的体内功能验证来确认转运蛋白的具体作用机制 | 探索玉米糖转运蛋白的结构、功能和进化特征,及其在非生物胁迫耐受性中的作用 | 玉米糖转运蛋白家族 | 生物信息学 | NA | RNA-Seq, qRT-PCR, 系统发育分析, 共表达分析, 分子对接 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 蛋白质序列数据 | 60个玉米糖转运蛋白 | NA | 玉米 | NA | 农业 |
| 9 | 2026-03-01 |
Vesicle constriction by rings of Janus nanoparticles and aggregates of curved proteins
2019-Aug-23, Nanotechnology
IF:2.9Q2
DOI:10.1088/1361-6528/ab1ed5
PMID:31048566
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研究论文 | 本文研究了Janus纳米颗粒环和弯曲蛋白质聚集体对囊泡的机械收缩作用,通过模拟和实验揭示了膜收缩的机制 | 首次报道了Janus纳米颗粒环和弯曲蛋白质聚集体作为合成纳米结构模拟收缩蛋白和支架蛋白,诱导囊泡自发收缩,并揭示了高度弯曲F-BAR结构域在细胞分裂中的重要作用 | 研究基于模拟和理论模型,可能未完全覆盖实际生物系统中的复杂动态因素,且实验验证部分未在摘要中详细说明 | 探究膜收缩和分裂的机制,设计膜收缩纳米结构以应用于合成生物学 | 囊泡、Janus纳米颗粒环、弯曲蛋白质聚集体(如DNA折纸支架) | 合成生物学 | NA | Monte Carlo模拟、模拟退火、弹性膜模型 | NA | 模拟数据 | NA | DNA折纸 | NA | NA | 合成生物学 |
| 10 | 2026-02-28 |
Synthetic Biology and Metabolic Engineering of Microalgae for Sustainable Lipid and Terpenoid Production: An Updated Perspective
2026-Mar, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70405
PMID:41117552
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综述 | 本文更新了微藻合成生物学与代谢工程在可持续生产脂质和萜类化合物方面的最新进展 | 聚焦于新兴的遗传工具包加速DBTL循环、基因组规模代谢建模的突破以及细胞器靶向生物合成策略 | NA | 评估微藻作为可持续生物制造平台在食品、燃料和生物制造产业中的应用潜力 | 关键微藻模型,包括莱茵衣藻、微拟球藻属和三角褐指藻 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、代谢工程、基因组规模代谢建模 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | Chlamydomonas reinhardtii, Nannochloropsis spp., Phaeodactylum tricornutum | 细胞器靶向生物合成途径,用于生产多不饱和脂肪酸和萜类化合物 | 食品, 燃料, 工业生物技术 |
| 11 | 2026-02-28 |
Advances in the construction and biological applications of DNA condensates
2026-Feb-27, Nanoscale
IF:5.8Q1
DOI:10.1039/d5nr05322f
PMID:41758048
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综述 | 本文综述了通过液-液相分离构建DNA凝聚物的策略及其在模拟无膜细胞器、生物传感、细胞调控和药物递送等领域的生物应用 | 利用DNA序列可编程性、多样相互作用模式和易化学修饰特性,构建多刺激响应的人工DNA凝聚物,并展望了与光遗传学、单分子技术和机器学习辅助序列设计结合的智能多组分系统 | 时空控制有限、易受核酸酶降解、存在免疫原性,这些挑战需解决以推进其在活体系统中的转化应用 | 概述DNA凝聚物的构建策略及其生物应用,并讨论未来发展方向 | DNA凝聚物及其在合成生物学和精准医学中的应用 | 合成生物学 | NA | 液-液相分离(LLPS)、序列驱动自组装、聚合物或蛋白质介导的凝聚、环境调控(如DNA浓度、离子强度、pH、温度) | NA | NA | NA | NA | NA | 模拟无膜细胞器、可编程生化微环境 | 医学、合成生物学 |
| 12 | 2026-02-28 |
Preparation strategies and biomedical applications of DNA hydrogels
2026-Feb-25, Chemical science
IF:7.6Q1
DOI:10.1039/d5sc08190d
PMID:41657654
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综述 | 本文总结了DNA水凝胶的制备策略及其在细胞培养、药物递送和组织工程等生物医学领域的应用进展 | 系统性地将DNA纳米技术与合成生物学相结合,利用DNA作为结构框架或交联剂构建具有生物组织相似性的三维网络结构,并突出其高生物相容性、可编程响应性和特异性识别功能 | 讨论了DNA水凝胶发展当前面临的挑战,但未在摘要中具体说明 | 总结DNA水凝胶的制备策略,分析其应用优势,并展望未来研究方向 | DNA水凝胶 | 材料科学 | NA | DNA纳米技术、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物医学 |
| 13 | 2026-02-28 |
Metabolic engineering of microorganisms for the valorization of C2 feedstocks
2026-Feb-25, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103457
PMID:41747573
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综述 | 本文综述了微生物代谢工程在将C2原料转化为高价值化学品和材料方面的最新进展 | 强调了合成生物学、酶工程、基因组尺度代谢模型和人工智能驱动设计的整合,以构建下一代、电气化和数字引导的C2生物精炼厂 | NA | 探索微生物代谢工程在C2原料增值化中的应用 | 微生物,包括大肠杆菌、假单胞菌属和光合宿主,以及C2原料 | NA | NA | 代谢工程、合成生物学、酶工程、基因组尺度代谢模型、人工智能驱动设计 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 大肠杆菌, 假单胞菌属, 光合宿主 | 反向β-氧化、基于醛醇缩合的碳延伸、硫胺素焦磷酸依赖性模块 | 工业生物技术, 能源, 材料 |
| 14 | 2026-02-28 |
Synthetic gene circuits that selectively target RAS-driven cancers
2026-Feb-24, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.104320
PMID:41733988
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研究论文 | 本文提出了一种合成基因电路,通过整合多个RAS传感器来选择性靶向RAS驱动的癌症细胞,表达治疗性蛋白 | 结合多个RAS传感器以提高癌症选择性,实现前所未有的突变RAS细胞特异性输出蛋白表达 | NA | 开发针对RAS驱动癌症的新型合成基因电路治疗策略 | RAS驱动的癌症细胞 | 合成生物学 | 癌症 | 合成基因电路设计 | NA | NA | NA | NA | 哺乳动物细胞 | 整合多个RAS传感器的合成基因电路,用于选择性表达治疗性蛋白 | 医学 |
| 15 | 2026-02-28 |
Bioorthogonal and synthetic biology-engineered bacterial outer membrane vesicles for enhanced photo-immunotherapy
2026-Feb-23, Acta biomaterialia
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.actbio.2026.02.044
PMID:41740694
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研究论文 | 本研究开发了一种结合生物正交化学与合成生物学工程改造的细菌外膜囊泡(OMV)平台,用于增强乳腺癌的光热免疫治疗 | 通过合成生物学改造细菌使其自主产生富含IL-2的OMV,并整合生物正交靶向(N3/DBCO系统)与光热治疗(ICG),实现了程序化免疫调节与肿瘤特异性递送的多功能协同 | 未明确说明临床前研究的动物模型具体类型及长期安全性评估数据 | 克服传统OMV在肿瘤免疫治疗中载药能力有限、肿瘤蓄积不足和快速清除的障碍 | 乳腺癌肿瘤模型 | 合成生物学 | 乳腺癌 | 合成生物学改造、电穿孔封装、代谢糖工程、生物正交化学 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 细菌(具体菌种未指明) | 通过基因工程使亲本细菌持续表达白细胞介素-2(mIL2)并富集于外膜囊泡 | 医学 |
| 16 | 2026-02-28 |
Recent advances in computer-aided engineering of microbial synthesis and nutritional functions of fucosylated oligosaccharides
2026-Feb-23, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108849
PMID:41740692
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综述 | 本文综述了岩藻糖基化寡糖在微生物合成中的最新进展,重点关注计算机辅助工程在提升合成效率和营养功能方面的应用 | 结合生物信息学方法与合成生物学策略,实现岩藻糖基化寡糖的精确和可扩展生产,并应用理性设计和虚拟筛选优化岩藻糖基转移酶选择 | NA | 探讨微生物合成岩藻糖基化寡糖的替代方法,以克服天然提取和化学合成的成本与规模限制 | 岩藻糖基化寡糖 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、代谢工程、生物信息学 | NA | NA | NA | NA | 工程微生物菌株 | NA | 医药、食品 |
| 17 | 2026-02-28 |
Artificial Intelligence and the Discovery of Antibiotics: Reinventing with Opportunities, Challenges, and Clinical Translation
2026-Feb-23, Antibiotics (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/antibiotics15020233
PMID:41750530
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综述 | 本文综述了人工智能在加速和优化抗生素发现过程中的作用,包括靶点识别、虚拟筛选、分子设计和早期测试等环节 | 系统性地探讨了AI与合成生物学、纳米技术和多组学数据的协同作用,提出了下一代抗菌方法的框架,并分析了Abaucin等AI驱动发现的案例 | 存在数据不足、算法偏见以及研究与临床转化之间的鸿沟等挑战 | 应对抗菌素耐药性危机,开发新的治疗物质 | 小分子抗生素和抗菌肽 | 机器学习 | NA | NA | 机器学习,深度学习,自然语言处理,生成模型 | 多组学数据 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 18 | 2026-02-28 |
Engineered Bacteria as living detectors of tumor DNA: A new diagnostic frontier
2026-Feb-20, Clinica chimica acta; international journal of clinical chemistry
DOI:10.1016/j.cca.2026.120914
PMID:41724454
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综述 | 本文综述了利用合成生物学技术设计基因工程细菌作为生物传感器,用于原位检测肿瘤来源DNA(特别是KRAS突变)的最新进展、策略与应用前景 | 将基因工程细菌与CRISPR-Cas工具结合,利用细菌的自然感受态和水平基因转移能力,实现对肿瘤突变DNA的特异性识别与报告输出,开创了肿瘤DNA活体检测的新诊断范式 | 存在生物安全性、定植效率以及检测灵敏度限制等挑战 | 开发基于工程细菌的肿瘤DNA生物传感器,用于癌症的精准诊断与个性化治疗 | 肿瘤来源的DNA(特别是驱动癌症的KRAS突变) | 合成生物学 | 结直肠癌、胃肠道癌及其他实体瘤 | CRISPR-Cas工具、水平基因转移、同源重组 | NA | DNA序列 | NA | CRISPR-Cas | 多种细菌物种 | 用于特异性检测突变DNA序列的生物传感器电路,包含选择性靶向、整合突变序列及产生可观察报告输出的遗传回路 | 医学 |
| 19 | 2026-02-28 |
Harnessing Endophytic Fungi as a Sustainable Source of Novel Anticancer Agents: Opportunities, Challenges, and Future Directions
2026-Feb-17, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules31040693
PMID:41752469
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综述 | 本文综述了内生真菌作为新型抗癌剂可持续来源的潜力、机遇、挑战及未来发展方向 | 系统评估了内生真菌作为可持续、低毒性、多靶点抗癌药物新来源的潜力,并总结了增强其生物活性代谢物发现和产量的多种策略 | NA | 探讨利用内生真菌开发新型、可及、经济且环保的抗癌疗法 | 内生真菌及其产生的生物活性代谢物(如生物碱、萜类、聚酮化合物和肽类) | NA | 癌症 | OSMAC、微生物共培养、表观遗传激活、基因组挖掘、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 20 | 2026-02-28 |
From Waste to Worth: The Role of Fermentation in a Sustainable Future
2026-Feb-12, Foods (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/foods15040664
PMID:41750856
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综述 | 本文综述了发酵技术在可持续生物技术中的作用,重点探讨其如何将农业和食品废弃物转化为高附加值产品,并促进循环生物经济和实现联合国可持续发展目标 | 系统阐述了发酵技术从传统生物转化过程演变为现代可持续生物技术平台的角色转变,并强调了其在连接食品、健康和环境系统方面的综合潜力 | 指出了限制该技术规模化应用的关键技术和监管障碍 | 探讨发酵技术在可持续未来中的作用,特别是在循环生物经济和可持续食品系统中的应用 | 发酵过程、有机废弃物、高附加值产品(生物活性化合物、有机酸、生物燃料、酶、蛋白质) | NA | NA | 发酵技术、精准发酵、合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 微生物 | NA | 食品, 医疗保健, 环境, 能源, 工业生物技术 |