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当前共找到 5865 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-10-18 |
Synthetic Biology Tools and Strategies for Microbial Cell Factory Construction
2027-Aug-02, Advances in biochemical engineering/biotechnology
DOI:10.1007/10_2026_363
PMID:42888301
|
综述 | 本章系统总结了构建和优化微生物细胞工厂的合成生物学工具与策略，涵盖基因编辑、代谢途径设计、系统生物学建模、计算工具与自动化筛选等 | 整合了从标准化生物元件、模块化设计到Design-Build-Test-Learn循环的系统工程框架，并强调了机器学习、人工智能、高通量筛选和实验室自动化在加速菌株开发与闭环DBTL循环中的作用 | 作为综述性章节，未提供原始实验数据或新的实验验证，主要基于已有文献进行归纳总结 | 总结构建微生物细胞工厂用于可持续生产燃料、化学品、药物及高附加值生物产品的主要工具和策略 | 微生物细胞工厂及代表性微生物底盘细胞 | 合成生物学 | NA | CRISPR基因组编辑、转录和翻译调控、模块化DNA组装、多组学分析、高通量筛选 | 基因组尺度代谢模型、机器学习、人工智能 | 多组学数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 微生物底盘细胞 | 代谢途径、动态调控、模块化基因线路 | 医药, 能源, 工业生物技术, 材料, 食品 |
| 2 | 2026-10-18 |
Targeted immune modulation through smart biomaterials and programmable biopharmaceuticals: A review
2026-Oct-16, Journal of biomaterials applications
IF:2.3Q4
DOI:10.1177/08853282261483961
PMID:42886884
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综述 | 本文综述了通过智能生物材料和可编程生物制药实现靶向免疫调节的最新进展，包括混合生物材料-生物制剂系统 | 系统总结了能响应疾病微环境信号（如pH变化、缺氧、氧化应激和炎症酶）的智能生物材料，以及通过工程化生物机制指导免疫细胞行为和分子信号的可编程生物制药，并强调了混合平台将环境响应性与生物治疗效力相结合的优势 | 存在生物复杂性、制造可扩展性、长期安全性评估和监管转化等挑战 | 探讨通过智能生物材料、可编程生物制药及混合系统实现靶向免疫调节，推动从传统全身免疫调节向自适应和位点特异性免疫控制转变 | 免疫介导疾病相关的免疫调节疗法、智能生物材料、可编程生物制药及混合生物材料-生物制剂系统 | 免疫工程 | 免疫介导疾病 | NA | NA | 文本 | 2022年至2026年间发表的同行评议研究 | NA | NA | NA | 医学 |
| 3 | 2026-10-18 |
Intratumoral microbiota in cancer immunotherapy: metabolic-epigenetic crosstalk and engineered bacterial therapeutics
2026-Oct-16, Experimental hematology & oncology
IF:9.4Q1
DOI:10.1186/s40164-026-00840-x
PMID:42888465
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综述 | 文章综述了肿瘤内微生物群通过代谢-表观遗传互作影响免疫治疗疗效的机制，以及工程化细菌作为可编程活体疗法在癌症免疫治疗中的应用 | 系统整合了肿瘤内微生物群代谢产物（短链脂肪酸、次级胆汁酸、氧化三甲胺、色氨酸衍生物）通过DNA甲基化、组蛋白修饰和非编码RNA重塑宿主表观遗传并调控抗肿瘤免疫的机制；同时总结了合成生物学工程菌实现肿瘤特异性定植、可控药物释放及多模式功能（细胞因子分泌、免疫检查点阻断、STING通路激活、代谢重编程）的治疗策略 | 存在异质性、抗载体免疫和制造复杂性等临床转化挑战 | 阐明肿瘤内微生物群在癌症免疫治疗中的代谢-表观遗传串扰机制，并探讨靶向肿瘤内微生物群的工程化细菌治疗策略 | 肿瘤内微生物群、微生物代谢产物、宿主免疫微环境、表观遗传景观、工程化细菌 | 肿瘤免疫学, 微生物组学, 合成生物学 | 癌症 | NA | NA | 文本 | NA | NA | 工程化细菌 | 工程化细菌活体治疗系统（肿瘤特异性定植、可控药物释放、细胞因子分泌、免疫检查点阻断、STING通路激活、代谢重编程） | 医学 |
| 4 | 2026-10-18 |
AI empowers scalable and programmable RNA design
2026-Oct-15, Molecular cell
IF:14.5Q1
DOI:10.1016/j.molcel.2026.09.025
PMID:42880215
|
综述 | 探讨人工智能如何利用三级结构来指导功能RNA的序列设计与生成，从而替代传统试错流程 | 强调以三级结构为基础、由AI驱动序列生成的可扩展、可编程RNA设计新范式 | 未具体说明模型性能、数据规模及实验验证范围 | 总结AI在功能RNA设计中的应用，并展望可扩展、可编程的RNA设计路径 | 功能性RNA分子及其三级结构 | 合成生物学，RNA治疗 | NA | 人工智能辅助的RNA设计，实验结构测定 | NA | RNA结构数据，序列数据 | NA | NA | NA | NA | 医学，工业生物技术 |
| 5 | 2026-10-18 |
The Potential of Self-Maintainable Living Materials
2026-Oct-14, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.78082
PMID:42873924
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综述 | 本文综述了工程活体材料（ELMs）的设计原理、当前挑战及转化路径，探讨其作为自维持自主系统的潜力 | 将自主性定位为下一代活体材料的定义性能力，系统整合合成生物学中的可编程基因电路、群体感应通信和代谢工程，实现闭环决策与最小外部输入下的功能维持 | 在进化稳定性、生物防护、长期存活性和可规模化制造方面仍存在关键挑战 | 考察自维持自主活体材料的设计原理、当前挑战和转化路径，以实现其在真实环境中的持续运行 | 工程活体材料（ELMs），包括整合了微生物、真菌、藻类和哺乳动物细胞的結構支架系统 | 合成生物学 | NA | 可编程基因电路，群体感应通信，代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 微生物，真菌，藻类，哺乳动物细胞 | 可编程基因电路，群体感应通信，闭环决策系统 | 建筑，农业，环境修复，生物能源，生物医学 |
| 6 | 2026-10-18 |
Synthetic Approaches as Empirical Tools for Testing Evolutionary Theory
2026-Oct-01, Genome biology and evolution
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/gbe/evag245
PMID:42817818
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综述 | 综述合成方法（如深度突变扫描、祖先序列重建、受控进化和合成生物学）如何作为实证工具检验进化理论的基本问题 | 系统梳理高通量图谱、重建实验、受控进化和合成生物学等方法在检验突变效应分布、适应度地形、可进化性、发育约束、历史偶然性等进化理论问题中的新发现 | 作为综述，未提供原始实验数据，且合成方法在模拟自然进化复杂性方面仍存在局限 | 探讨合成方法如何重塑和扩展进化生物学的基础理论问题 | 进化理论中的核心问题，包括突变效应分布、适应度地形结构、可进化性、发育约束、历史偶然性和进化系统工程 | 进化生物学 | NA | 深度突变扫描、祖先序列重建、受控进化、合成生物学 | NA | 序列、表型 | NA | NA | NA | NA | 基础研究 |
| 7 | 2026-10-18 |
Evolutionary chemical learning in dimerization networks
2026-Sep, Physical review. E
DOI:10.1103/bszq-gftl
PMID:42888651
|
研究论文 | 本文提出了基于竞争性二聚化网络（CDN）的化学学习框架，通过定向进化在体外训练网络，实现多类分类等学习任务 | 利用分子物种间的可逆二聚化作为可调突触权重，通过定向进化（突变、选择、扩增）在无数字硬件和无需预知所有微观结合常数的情况下训练网络完成学习任务，并引入对比增强损失函数提升性能 | 研究基于数值模拟，尚未进行实际体外实验验证；依赖定向进化过程可能耗时且受实验条件限制 | 探索竞争性二聚化网络作为化学学习平台的可行性，实现模拟物理计算并连接合成生物学与机器学习 | 竞争性二聚化网络（CDN），由蛋白质或DNA-RNA寡聚体等分子物种组成 | 机器学习, 合成生物学 | NA | 定向进化, 数值模拟 | 竞争性二聚化网络（CDN） | 数值模拟数据, 分子结合亲和力数据 | NA | 定向进化, 突变, 选择, 扩增 | NA | 竞争性二聚化网络（CDN），分子物种类似神经元，结合亲和力作为可调突触权重 | 医学, 工业生物技术 |
| 8 | 2026-10-18 |
The plant Golden Gate toolkit: compatibility, interoperability, and harmonized assembly in plant synthetic biology
2026-Jul-21, Plant methods
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s13007-026-01563-0
PMID:42482144
|
综述 | 该综述全面概述了超过25种成熟的植物特异性Golden Gate克隆试剂盒，深入探讨了其模块的兼容性，并提出了提高系统协调性的关键方法 | 系统梳理了植物特异性Golden Gate克隆试剂盒的兼容性与互操作性，提出了包括驯化策略、甲基化酶辅助的分级DNA组装以及多克隆位点在内的系统协调化方法 | 作为综述文章，未提供新的实验数据验证所提出的协调化策略 | 改善植物合成生物学中Golden Gate克隆试剂盒之间的兼容性与互操作性，简化克隆工作流程并降低新技术门槛 | 超过25种植物特异性Golden Gate克隆试剂盒及其模块 | 合成生物学 | NA | Golden Gate克隆 | NA | 文本 | 超过25种植物特异性Golden Gate克隆试剂盒 | Golden Gate Assembly | 植物 | 遗传模块和转录单元的标准化组装 | 农业 |
| 9 | 2026-10-18 |
Epigenetic landscape of Leishmania-host interactions
2025-12, Epigenomics
IF:3.0Q2
DOI:10.1080/17501911.2025.2574836
PMID:41099169
|
综述 | 本文综述了利什曼原虫与宿主相互作用的表观遗传景观，包括物种特异性表观遗传变化、宿主免疫信号调控机制以及基于表观遗传和合成生物学的治疗策略 | 系统总结了利什曼原虫与宿主互作中的表观遗传修饰（如染色质重塑、组蛋白PTMs、ncRNAs），并首次提出合成基因电路可调控宿主和寄生虫表观基因组，将合成生物学与表观遗传学结合用于利什曼病控制 | 作为综述文章，未提供原始实验数据验证；合成基因电路调控表观基因组的策略仍处于概念阶段，缺乏体内验证 | 阐明利什曼原虫与宿主相互作用的表观遗传机制，并探讨表观遗传学和合成生物学策略在控制利什曼病中的未来潜力 | 利什曼原虫（不同物种）及其宿主（包括共感染和共病模型） | 表观遗传学, 合成生物学, 感染免疫学 | 利什曼病 | 结构化文献综述（Web of Science, PubMed, Scopus），涉及表观遗传修饰分析（染色质重塑、组蛋白翻译后修饰、非编码RNA） | NA | 文本 | NA | 合成基因电路 | 利什曼原虫, 哺乳动物宿主细胞 | 合成基因电路用于调控宿主和寄生虫表观基因组 | 医学 |
| 10 | 2026-10-18 |
Decoding and reengineering the promoter specificity of T7-like RNA polymerases based on phage genome sequences
2025-02-27, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf140
PMID:40042813
|
研究论文 | 该文通过挖掘噬菌体基因组中的启动子，揭示了T7类RNA聚合酶与启动子特异性相互作用的规则，并基于此重新设计了正交的RNAP-启动子变体 | 首次对多种噬菌体单亚基RNA聚合酶及其启动子进行系统性基因组挖掘，利用直接耦合分析揭示了决定特异性的关键氨基酸和核苷酸位点，并构建了稀疏连接网络，设计出比现有更严格正交的T7 RNAP-启动子变体及具有新相互作用的变体 | 研究主要基于计算预测和有限实验验证，未全面覆盖所有ssRNAPs的多样性，且设计的变体在体内应用中的正交性和效率需进一步评估 | 揭示T7类RNA聚合酶与启动子序列共变异的规则，并用于工程化新型RNAP-启动子对 | 噬菌体单亚基RNA聚合酶（ssRNAPs）及其同源启动子，特别是T7类RNA聚合酶 | 合成生物学 | NA | 基因组挖掘、直接耦合分析、序列共变异分析 | NA | 序列 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 11 | 2026-10-18 |
The mutational landscape of Bacillus subtilis conditional hypermutators shows how proofreading skews DNA polymerase error rates
2025-02-27, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf147
PMID:40057377
|
研究论文 | 该研究构建了枯草芽孢杆菌的条件性超突变体，以解析DNA聚合酶初始核苷酸选择性、校对和错配修复对突变率的贡献 | 构建了带有polC校对缺陷等位基因和/或mutL缺陷等位基因的条件性超突变体，丰富了定向进化的合成生物学工具箱，并使用数学模型分析了错误逃逸MMR和校对的表观概率 | 分析中面临处理可能异质性突变聚合计数的困难，以及对野生型中导致突变的途径未知的困难 | 解析DNA聚合酶初始核苷酸选择性、DNA聚合酶校对和错配修复对突变率的贡献 | 枯草芽孢杆菌（Bacillus subtilis） | 合成生物学 | NA | 突变累积实验 | 数学模型 | NA | NA | NA | 枯草芽孢杆菌 | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 12 | 2026-10-18 |
Molecular glues and induced proximity: An evolution of tools and discovery
2024-06-20, Cell chemical biology
IF:6.6Q1
DOI:10.1016/j.chembiol.2024.04.001
PMID:38688281
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综述 | 探讨分子胶和诱导邻近工具的发展与发现，强调分子胶作为探针和治疗药物的潜力及挑战 | 提出从合成生物学和生物物理学领域汲取灵感，挖掘化学文库中类胶分子 | 分子胶相比经典抑制剂在治疗开发中仍然罕见，其简单结构和重塑蛋白质相互作用的能力对广泛应用和设计构成挑战 | 综述分子胶和诱导邻近工具的发展与发现，探讨其作为治疗药物的潜力 | 小分子分子胶 | 化学生物学 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 13 | 2026-10-18 |
A universal molecular control for DNA, mRNA and protein expression
2024-03-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46456-9
PMID:38509097
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研究论文 | 本文利用合成生物学原理构建了一个多组学对照pREF，可作为DNA、mRNA和蛋白质表达的通用分子标准 | 首次开发出可跨基因组学、转录组学和蛋白质组学方法兼容的通用合成标准，包含21个合成基因，可体外转录为mRNA对照和体外翻译为匹配的蛋白质对照，且可独立繁殖和可持续制备 | 未明确提及 | 解决当前缺乏跨下一代测序和质谱方法兼容的参考标准的问题，提供基因表达的整合测量标准 | 合成基因pREF序列及其体外转录的mRNA和体外翻译的蛋白质 | 合成生物学, 多组学 | NA | 下一代测序, 质谱, 体外转录, 体外翻译 | NA | DNA序列, RNA序列, 蛋白质丰度数据 | NA | 合成生物学原理 | NA | 多组学控制序列pREF，编码21个合成基因 | 医学, 工业生物技术 |
| 14 | 2026-10-18 |
Co-administration of tecovirimat and ACAM2000™ in non-human primates: Effect of tecovirimat treatment on ACAM2000 immunogenicity and efficacy versus lethal monkeypox virus challenge
2020-01-16, Vaccine
IF:4.5Q2
DOI:10.1016/j.vaccine.2019.10.049
PMID:31677948
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研究论文 | 研究在非人灵长类动物中同时接种ACAM2000天花疫苗和tecovirimat抗病毒药物的相互作用，评估疫苗免疫原性和对致死性猴痘病毒攻击的保护效果。 | 首次在非人灵长类动物模型中系统评估tecovirimat与ACAM2000疫苗联合使用的免疫原性和保护效力，揭示两者可能的相互作用。 | 仅在非人灵长类动物中进行，样本量有限，且三项研究结果不完全一致，第三项研究显示体液免疫降低，需要进一步研究确认。 | 了解天花疫苗ACAM2000与抗病毒药物tecovirimat联合使用时对疫苗免疫原性和保护效力的影响。 | 非人灵长类动物（猴子） | 传染病学、疫苗学 | 天花、猴痘 | 疫苗接种、病毒攻击实验、免疫学检测 | NA | 实验数据、免疫学数据、临床观察数据 | 三项研究中共涉及数十只猴子（具体数量未在摘要中明确列出） | NA | 非人灵长类动物 | NA | 医学、公共卫生 |
| 15 | 2026-10-17 |
DNA Nanotechnology-Based Robotic Devices for Frontier Applications in Healthcare
2026-Oct-16, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.76227
PMID:42885354
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综述 | 本文综述了基于DNA纳米技术的机器人设备（DNRDs）在医疗保健领域的发展、设计原理、机制基础及前沿应用 | 系统总结了DNA折纸、DNA步行器和分子逻辑电路驱动的动态刺激响应系统，涵盖逻辑门控纳米药丸、精准生物传感器和自主治疗剂等新兴应用，并提出了提升安全性、稳健性和临床可转化性的新兴策略 | 在复杂生理环境中的结构稳定性难以维持，可扩展且低成本的制造困难，以及免疫原性、毒性、脱靶活性、意外激活、生物分布和长期生物命运等监管与安全问题限制临床转化 | 全面讨论DNRDs的演化、设计原则和机制基础，评估其在诊断、治疗和合成生物学中的作用，并探讨转化局限与未来发展方向 | 基于DNA纳米技术的机器人设备（DNRDs），包括DNA折纸、DNA步行器和分子逻辑电路 | 合成生物学 | NA | DNA折纸，DNA步行器，分子逻辑电路 | NA | 文本 | NA | DNA折纸，DNA步行器，分子逻辑电路 | NA | 分子逻辑电路，逻辑门控纳米药丸，生物传感器 | 医学，合成生物学 |
| 16 | 2026-10-17 |
Engineering root development with high precision
2026-Oct-16, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.71583
PMID:42885824
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综述 | 该文章讨论了如何利用单细胞技术、空间转录组学和合成生物学整合谱系追踪、发育历史遗传记录、细胞类型特异性工程和可编程遗传回路，以理解和控制植物根系结构 | 提出整合谱系追踪、发育历史遗传记录、细胞类型特异性工程和可编程遗传回路来理解和控制根系结构，并强调工程化自适应和情境依赖发育行为的新兴策略，包括历史依赖和可逆响应程序以及重连根系-环境相互作用 | 未提及 | 探讨如何整合多种前沿技术来理解和精确工程化植物根系发育 | 植物根系发育 | 合成生物学 | NA | 单细胞技术、空间转录组学、合成生物学 | NA | NA | NA | 可编程遗传回路 | 植物 | 可编程遗传回路、历史依赖和可逆响应程序 | 农业 |
| 17 | 2026-10-17 |
Programming biological behavior with AI-guided de novo protein design
2026-Oct-15, Molecular cell
IF:14.5Q1
DOI:10.1016/j.molcel.2026.08.027
PMID:42880220
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综述 | 本文展望了如何利用人工智能引导的从头蛋白质设计，从设计双分子相互作用推进到构建蛋白质反应网络，从而编程复杂的生物行为 | 提出了从从头设计双分子结合剂向自下而上构建可编程、模块化、可控的蛋白质反应网络转变的新视角，以驱动信号放大、决策和纠错等涌现性细胞行为 | 当前仍面临可设计的蛋白质动态、多步骤功能和非平衡系统等挑战，基础方法仍需持续改进 | 探讨从头蛋白质设计如何超越双分子相互作用，实现复杂涌现性生物行为的编程 | 从头设计的蛋白质组件及其反应网络 | 合成生物学 | NA | 人工智能引导的从头蛋白质设计 | NA | 文本 | NA | NA | NA | 蛋白质反应网络 | 医学, 生物技术, 合成生物学 |
| 18 | 2026-10-17 |
Integration by parts: The multi-layered mechanisms of cis-regulatory control
2026-Oct-15, Molecular cell
IF:14.5Q1
DOI:10.1016/j.molcel.2026.09.016
PMID:42880219
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综述 | 该文章提出了一个将顺式调控元件（CRE）的调控逻辑分为结合水平整合和转录水平整合两个层次的框架，并讨论了多层机制如何控制基因表达 | 提出了一个两层框架来理解CRE调控逻辑，并识别出反复出现的定量模式“乘法加饱和”，统一了结合特异性和灵活性 | 文章是理论框架和综述，未提供新的实验数据验证所提出的模型 | 提出一个框架来理解顺式调控元件如何整合信号控制基因表达，并解释深度学习预测表达的现象 | 顺式调控元件（CREs）、转录因子（TFs）、共因子、核小体 | 机器学习 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学, 合成生物学 |
| 19 | 2026-10-17 |
Designer Enzymes: Food-System-Oriented Biocatalysts for Mitigating Mycotoxin Contamination and Reducing Postharvest Grain Loss
2026-Oct-04, Foods (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/foods15193538
PMID:42883645
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综述 | 本文综述了针对食品体系中霉菌毒素污染设计酶制剂的研究进展，提出了“设计酶”概念及五维框架以推动从实验室到实际应用的转化 | 提出了“设计酶”这一面向部署的工程化概念，强调在优化前先定义预期使用条件，并构建了包含机制理解、预测设计整合、多目标优化、部署就绪性及安全与法规准备度的五维框架作为转化瓶颈的定性诊断工具 | 五维框架仅为定性诊断工具，并非经过正式验证的数值评分系统；文章属于综述性质，未提供新的实验数据 | 探讨如何通过面向食品系统的酶工程设计克服霉菌毒素脱毒酶从实验室到实际应用的转化障碍 | 黄曲霉毒素、脱氧雪腐镰刀菌烯醇及相关单端孢霉烯族毒素、玉米赤霉烯酮、赭曲霉毒素A和伏马毒素等主要霉菌毒素 | 合成生物学 | 食品安全 | 蛋白质工程、结构导向工程、人工智能辅助突变优先级排序、稳定性优化、设计-构建-测试-学习工作流、合成生物学、多酶系统 | NA | 文本 | NA | NA | NA | 多酶系统 | 食品，农业 |
| 20 | 2026-10-17 |
A Review of Nuclear-Organellar Communication in Response to Heat Stress
2026-Sep-30, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants15192995
PMID:42884859
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综述 | 本文综述了植物在热胁迫下通过细胞核与细胞器之间的通讯维持细胞稳态的机制，包括热信号感知、第二信使产生、核转录重编程及细胞器逆行信号调控 | 系统整合了核-细胞器通讯在热胁迫响应中的信号传导网络，提出了不同细胞器中候选热感受蛋白，并指出叶绿体和线粒体内在热感知能力、细胞器间第二信使动态协调等关键未解决问题 | 作为综述性文章，未提供原始实验数据验证所提出的模型；许多候选热感受蛋白和信号通路仍需进一步实验验证 | 总结植物通过核-细胞器通讯应对热胁迫的分子机制，并探讨利用基因组编辑、合成生物学和人工智能辅助设计培育耐热作物的应用前景 | 植物（特别是其细胞核、内质网、叶绿体和线粒体等细胞器） | 机器学习 | NA | NA | NA | 文本 | NA | CRISPR-Cas9 | 植物 | NA | 农业 |