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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-07-14 |
Global research trends and hotspots of plant physiologically active substances: quantitative visualization analysis based on CiteSpace
2026-Aug, Plant biology (Stuttgart, Germany)
DOI:10.1111/plb.70219
PMID:42287740
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综述 | 基于CiteSpace对植物生理活性物质全球研究趋势与热点的定量可视化分析 | 首次利用CiteSpace文献计量学方法系统梳理了2000-2024年间植物生理活性物质领域的研究动态,揭示了从基础化合物分离向先进机制研究、功能食品和纳米递送系统的转变趋势 | 仅基于Web of Science核心合集数据,可能存在数据库覆盖偏差;定性分析依赖关键词突发性指标,未能全面评估文献质量 | 综述植物生理活性物质领域的研究趋势、热点演变及未来方向,为跨学科合作和工业开发提供路线图 | 8096篇来自Web of Science核心合集的文献 | 文献计量学 | 代谢疾病 | 文献计量分析 | NA | 文献数据 | 8096篇文献 | NA | NA | NA | 医学、农业、工业生物技术 |
| 2 | 2026-07-14 |
Transposons as Tools for Future Genome Engineering in Yeasts and Filamentous Fungi
2026-Jul-13, Yeast (Chichester, England)
DOI:10.1002/yea.70036
PMID:42439777
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综述 | 总结了转座子在酵母和丝状真菌基因组工程中作为工具的研究现状和未来机遇 | 系统概述了不同类型转座子(如ITR DNA转座子、LTR及非LTR反转录转座子和CRISPR相关转座子)在真菌基因组工程中的应用潜力,特别是CASTs在低同源重组效率宿主中实现大片段定点整合的优势 | 转座子工具在非酵母属宿主中的开发仍处于早期阶段,实际应用可能受制于转座效率、靶向特异性和宿主适应性 | 探讨转座子技术在真菌基因组工程中的发展前景,加速菌株开发 | 酵母和丝状真菌 | NA | NA | 转座子技术、CRISPR相关转座子(CASTs) | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9(用于转座子整合) | 酵母属、丝状真菌 | NA | 合成生物学、代谢工程 |
| 3 | 2026-07-14 |
Discovery of novel bio-resources from the hidden biodiversity of marine mangrove ecosystems
2026-Jul-13, Environmental geochemistry and health
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10653-026-03325-2
PMID:42440035
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综述 | 综述了海洋红树林生态系统中隐藏生物多样性的新型生物资源,重点介绍了其微生物和生物活性化合物的发现与应用 | 强调了基因组引导发现方法(多组学和宏基因组学)在识别不可培养微生物新型生物合成途径中的应用,以及合成生物学推动的可规模化生产 | 未明确提到具体研究限制,可能包括对红树林生态系统持续保护的需求以及验证策略的整合挑战 | 总结红树林相关微生物和生物群的生物活性及其衍生代谢物,突出其在生物技术中的可持续创新潜力 | 红树林相关微生物和生物群,包括细菌、真菌、藻类和无脊椎动物 | NA | NA | 色谱技术、LC-MS/NMR分析、计算机模拟工具、多组学、宏基因组学 | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 医学, 环境管理, 工业过程 |
| 4 | 2026-07-14 |
Enhancing the Secretion Systems: Genetic Engineering of Super Bioagents for Effective Plant Disease Control
2026-Jul-12, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.70303
PMID:42437521
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综述 | 本文综述了通过遗传工程改造微生物分泌系统以开发超级生物制剂用于植物病害控制的前景 | 提出了超级生物制剂的概念,强调利用CRISPR/Cas基因组编辑、蛋白酶工程和合成生物学精准改造分泌系统以增强病原靶向和分泌效率 | 大规模部署生物防治剂仍面临挑战,且超级生物制剂的实际应用和田间性能验证尚不充分 | 探讨通过理性定量工程化微生物分泌系统将传统生物防治剂转化为集成超级生物制剂的可能性 | 微生物分泌系统和超级生物制剂 | 机器学 | 植物病害 | CRISPR/Cas基因组编辑、蛋白酶工程、合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 微生物 | 分泌系统工程 | 农业 |
| 5 | 2026-07-14 |
Challenges and Future Directives of Synthetic Biology in Engineering Plant-Microbe Partnerships for Sustainable Agriculture
2026-Jul-12, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.70291
PMID:42437522
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综述 | 本文综述了合成生物学在工程植物-微生物共生关系中面临的挑战,并提出了未来研究方向 | 系统分析了生态、生物、技术和监管等多方面障碍,并提出了系统级整合多组学分析、预测建模和框架响应遗传设计的解决思路 | 未涉及具体实验验证或量化分析,主要基于文献综述提出观点 | 探讨合成生物学在植物-微生物工程应用中的限制因素及未来研究重点 | 植物-微生物共生体系 | 合成生物学 | NA | 多组学分析、预测建模、合成生物学工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 植物、微生物 | 框架响应遗传设计、稳健可控微生物底盘 | 农业 |
| 6 | 2026-07-14 |
Recent Progress in the Total Synthesis and Biosynthesis of Arborisidine
2026-Jul, Chirality
IF:2.8Q2
DOI:10.1002/chir.70119
PMID:42324070
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综述 | 总结了arborisidine的全合成与生物合成研究的最新进展 | 通过比较多种合成策略,为其他家族成员的合成提供科学见解,并为基于该结构骨架的药物设计提供方法论支持 | NA | 综述arborisidine的全合成与生物合成研究进展,为相关合成和药物设计提供参考 | arborisidine及其类似物的合成与生物合成途径 | NA | NA | 全合成、生物合成 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 药物设计 |
| 7 | 2026-07-14 |
Synthetic developmental engineering of human liver organogenesis
2026-Jul-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.205040
PMID:42440359
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综述 | 讨论利用合成生物学和计算分析增强肝类器官的开发,以模拟人类肝脏发育 | 整合合成生物学与计算分析来推进肝类器官的血管化、区域化、命运规范和外部信号响应 | 肝类器官面临重现性和成熟度不足的挑战 | 促进下一代多细胞人类干细胞衍生系统的开发 | 人类胚胎肝脏发育和体外肝类器官模型 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 人类干细胞 | NA | 医学, 再生医学 |
| 8 | 2026-07-14 |
Versatile 2-Oxoglutarate-Dependent Dioxygenases Catalyze Radical-Mediated Multifunctional Skeleton Reconstructions and Oxidation Modifications of Taxoids
2026-03-18, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.6c01169
PMID:41746272
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研究论文 | 本研究鉴定了两种新型2-酮戊二酸依赖性双加氧酶,它们能够催化紫杉烷类化合物从6/8/6骨架到5/7/6等骨架的重排及氧化修饰,并揭示了其自由基介导的催化机制 | 发现并表征了两种具有高度催化多样性的双加氧酶(TcOGD1和TcOGD2),它们能催化多种骨架重排和氧化反应,包括首次阐明5/7/6紫杉烷骨架形成的自由基介导C-C键断裂机制 | 紫杉烷类化合物在植物中的产量有限,且部分新骨架化合物的生物合成途径尚未完全阐明 | 探索紫杉烷二萜类化合物结构多样性的形成机制,并开发用于构建独特紫杉烷骨架的生物催化工具 | 两种新型2-酮戊二酸依赖性双加氧酶(TcOGD1和TcOGD2)及紫杉烷类底物 | 合成生物学 | 癌症 | NMR波谱学 | NA | NA | 5种新型-5/7/6紫杉烷化合物从中国红豆杉植物中分离 | NA | NA | NA | 药物 |
| 9 | 2026-07-14 |
Repositioning the Leader Peptide in Graspetide Biosynthesis
2026-03-18, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c21135
PMID:41789461
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研究论文 | 本文通过将前导肽序列重新定位到核心肽的C端,展示了底物选择性翻译后修饰的保留,并生成了由两个前导序列引导的嵌合RiPP产物 | 创新性地将前导序列从N端重新定位到C端,利用双前导序列策略生成自然界未见的机械互锁肽产物,扩展了RiPP的结构多样性 | 重新定位后酶修饰速率降低约2倍,可能影响效率 | 探索前导肽重新定位对Graspetide生物合成的影响,并生成新型RiPP产物 | fuscimiditide前体肽及graspetide合成酶ThfB | 合成生物学 | NA | RiPP生物合成 | NA | NA | NA | NA | NA | 前导序列重新定位的嵌合RiPP产物 | 合成生物学 |
| 10 | 2026-07-14 |
Next generation CAR-T cells to tackle solid tumors
2026-03-10, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society
IF:10.5Q1
DOI:10.1016/j.jconrel.2026.114650
PMID:41570863
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综述 | 本文综述了新一代CAR-T细胞疗法应对实体瘤的挑战和创新设计 | 系统性比较了克服实体瘤障碍的先进合成生物学策略,包括逻辑门控系统、多输入CAR设计、共表达细胞因子受体和耐药性改造 | 仅讨论了体外和临床前研究,缺乏大规模临床试验验证 | 探讨提高CAR-T细胞在实体瘤中疗效的结构性和生物学障碍及创新解决方案 | CAR-T细胞设计及其在实体瘤微环境中的相互作用 | NA | 实体瘤 | NA | NA | NA | NA | 逻辑门控系统、嵌合开关受体、显性负受体 | 人类T细胞 | 逻辑门控CAR、多输入CAR、装甲CAR、共表达细胞因子受体 | 医学 |
| 11 | 2026-07-14 |
Leveraging AI for cell biology discovery
2026-Jan-08, Biochemical Society transactions
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BST20253023
PMID:41502213
|
综述 | 探讨人工智能在细胞生物学中的多样化应用,包括显微镜成像、药物发现和合成生物学 | 系统总结了AI在单细胞分辨率分析、复杂模式识别和细胞行为建模中的最新进展 | 未深入讨论AI模型泛化性和跨数据集验证的实际困难 | 概述AI技术如何推动细胞生物学基础研究与治疗应用 | 细胞生物学中的AI方法及数据(图像、转录组、蛋白质结构等) | 计算机视觉, 自然语言处理, 机器学习 | NA | 深度学习, 高通量技术 | 神经网络, 深度学习模型 | 图像, 文本, 蛋白质结构数据 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 12 | 2026-07-14 |
Ultrasensitive Multiplexed Detection of Protein Biomarkers via Aptamer-Driven T7 RNA Polymerase Amplification
2025-11-04, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.5c04805
PMID:41123957
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研究论文 | 报道了一种通过适配体驱动的T7 RNA聚合酶级联扩增系统,实现血清中蛋白生物标志物的超灵敏、双通道可视化检测 | 将蛋白响应核酸电路与等温RNA转录结合,利用荧光RNA-染料复合物产生红绿荧光信号,实现免仪器的超灵敏多靶标检测,并通过红绿荧光逻辑门直观解读结果 | 未明确提及局限性,但可能涉及适配体筛选的复杂度、临床样本中基质效应及长期稳定性等潜在挑战 | 开发一种简单、高灵敏、无干扰的蛋白生物标志物多重检测方法,用于早期诊断和精准医疗 | 以甲胎蛋白和人血清白蛋白为模型蛋白的生物标志物 | 数字病理学 | 肝癌(甲胎蛋白相关) | 适配体驱动的T7 RNA聚合酶级联扩增 | NA | 荧光信号数据 | 加标和临床样本验证,回收率90%-110%,与ELISA结果高度一致 | NA | NA | 适配体驱动的T7 RNA聚合酶级联扩增电路,产生荧光RNA-染料复合物,实现逻辑门操作 | 医学 |
| 13 | 2026-07-14 |
Expanding horizons of CRISPR applications beyond genome editing
2025-10, Trends in genetics : TIG
IF:13.6Q1
DOI:10.1016/j.tig.2025.06.003
PMID:40645879
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综述 | 综述了CRISPR技术在基因组编辑之外的应用扩展,涵盖分子诊断、生物传感、转录调控、分子成像、蛋白质相互作用图谱和单细胞分析等领域 | 系统总结了CRISPR技术从基因组编辑向多领域拓展的最新进展,特别是结合合成生物学、AI和空间组学的交叉应用 | 当前CRISPR技术在临床转化中仍存在脱靶效应、递送效率低和特异性不足等限制,需进一步研究克服 | 全面阐述CRISPR技术在基因组编辑之外的多样化应用及其未来发展方向 | CRISPR-Cas系统及其相关技术(如dCas蛋白、侧切活性等) | 分子生物学、合成生物学 | NA | CRISPR, Cas酶, 侧切活性, 催化失活Cas蛋白, CRISPR引导邻近标记, 单细胞CRISPR筛选 | NA | 核酸、离子、代谢物、蛋白质、空间组学数据 | NA | CRISPR-Cas9, CRISPR-Cas12, CRISPR-Cas13, dCas9, dCas13 | NA | NA | 分子诊断、生物传感、转录调控、分子成像、蛋白质相互作用分析、单细胞分析 |
| 14 | 2026-07-14 |
Glycyrrhiza, a commonly used medicinal herb: Review of species classification, pharmacology, active ingredient biosynthesis, and synthetic biology
2025-09, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.11.019
PMID:39551128
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综述 | 本文全面综述了甘草属植物的分类学、药理学、活性成分生物合成及合成生物学,旨在为甘草的分子育种和合成生物学研究提供基础 | 整合了甘草属植物的系统分类、多组学研究及生物合成途径,特别强调了代谢工程和微生物绿色生产在提高活性成分产量中的应用 | 未提及具体的研究数据或实验验证,依赖于现有文献的总结 | 提供甘草属植物的综合视角,促进分子育种和合成生物学领域的发展 | 甘草属物种、活性成分(三萜类、黄酮类、多糖)及其药理活性 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、多组学分析 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | 代谢途径 | 医药、资源保护 |
| 15 | 2026-07-14 |
Design and construction of light-regulated gene transcription and protein translation systems in yeast P. Pastoris
2025-07, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.08.008
PMID:39117107
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研究论文 | 在毕赤酵母中设计和构建光调控基因转录与蛋白质翻译系统 | 首次在毕赤酵母中构建了光调控的基因转录和蛋白质翻译双系统,通过光敏传感器和稀有密码子刹车设计实现精确调控 | 光调控系统的性能优化可能依赖于特定配置(如LRE位置和拷贝数),且可能未在复杂蛋白表达场景中验证 | 开发具有优异表达能力和光敏感性的光调控基因转录与蛋白质翻译系统,以优化毕赤酵母在生物技术和合成生物学中的应用 | 光调控基因转录和蛋白质翻译系统 | 合成生物学 | NA | 光调控基因表达 | NA | 基因表达数据 | NA | 光敏传感器(WC-1)、顺式元件(LRE)设计、稀有密码子刹车 | 毕赤酵母(P. pastoris) | 光诱导启动子、光抑制启动子、光抑制翻译系统(稀有密码子刹车) | 生物技术、合成生物学 |
| 16 | 2026-07-14 |
Combining culture optimization and synthetic biology to improve production and detection of secondary metabolites in Myxococcus xanthus: application to myxoprincomide
2024-12-05, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.01740-24
PMID:39431896
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研究论文 | 通过结合培养优化和合成生物学,提高黄色粘球菌中次生代谢物(如myxoprincomide)的产量与检测能力 | 提出名为2PRIM-BOOST的新策略,结合底盘菌株工程与两步生长培养基优化,增强非核糖体肽合成酶(NRPS)/聚酮合酶(PKS)次生代谢物的生产,并促进医学相关生物活性筛选 | 该方法目前仅针对myxoprincomide进行验证,尚需应用于更多隐性代谢物以全面验证其有效性 | 提高粘细菌次生代谢物的实验室产量,以发现新药物前体 | 黄色粘球菌DZ2菌株及其产生的次生代谢物myxoprincomide | 合成生物学 | NA | 合成生物学、启动子工程、培养基优化 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9或相关基因组工程工具(未明确指定) | 黄色粘球菌(Myxococcus xanthus) | 组成型强启动子插入至生物合成基因簇上游 | 医学 |
| 17 | 2026-07-13 |
Phytomicrobiome-based approaches for sustainable crop performance and environmental resilience
2026-Oct, Microbiological research
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.micres.2026.128605
PMID:42398311
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综述 | 综述基于植物微生物组的工程策略,旨在提升作物可持续生产和环境恢复力 | 整合了基因组编辑、合成生物学、宏基因组学和AI驱动建模等先进工具,系统阐述了优化植物-微生物互作以实现精准农业的新范式 | 未明确讨论工程微生物组在实际田间应用中可能存在的生态风险和长期稳定性挑战 | 探索通过微生物组工程改善植物抗逆性、适应性和作物产量的现代方法及应用 | 植物微生物组(包括细菌、真菌、原生生物、病毒和线虫)及其与宿主植物的相互作用 | 机器学习 | NA | 宏基因组学, 合成生物学, 基因组编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 植物 | 人工微生物群落 | 农业, 环境 |
| 18 | 2026-07-13 |
In silico identification and characterisation of putative biphenyl degradation mechanism in gut-derived Pediococcus pentosaceus
2026-Sep-01, Environmental research
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.envres.2026.125000
PMID:42276346
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研究论文 | 本研究通过计算分析鉴定了从蟑螂肠道分离的片球菌QS-GN03_1中潜在的联苯降解机制 | 首次在肠道来源的片球菌中通过基因组分析发现一个可能通过水平基因转移获得的bphC基因,并揭示了其作为完整Bph操纵子退化遗存的可能性 | 预测的自由配体结合能显示PPBPHCIII与配体的结合亲和力弱于功能验证的1EIR复合物,且菌株缺乏独立的PCB矿化能力 | 探索利用益生微生物减少多氯联苯(PCBs)在牲畜肠道中吸收的策略 | 蟑螂(美洲大蠊)肠道来源的片球菌QS-GN03_1 | 计算生物学 | NA | 全基因组测序 | NA | 基因组序列 | 单一菌株QS-GN03_1 | CRISPR-Cas9, IS30家族插入序列 | 片球菌(Pediococcus pentosaceus) | 联苯降解通路(Bph操纵子) | 农业, 环境, 工业生物技术 |
| 19 | 2026-07-13 |
Targeting the phenolic A-ring unifies the toxicology and remediation of environmental estrogens in aquatic environments
2026-Sep-01, Environmental research
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.envres.2026.125044
PMID:42297271
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综述 | 综述了环境雌激素在水生环境中的毒理学机制及其修复策略,强调酚A环结构在毒性和修复中的核心作用 | 提出以酚A环结构为共同靶点统一环境雌激素的毒理学机制和修复策略,并探讨合成生物学在靶向生物降解中的潜力 | 主要基于现有文献综述,缺乏实际环境条件下修复技术的系统性实验验证,且针对复杂污染物混合物的挑战仅初步讨论 | 阐明环境雌激素基于酚A环结构的有害机制,并指导其在水生系统中的靶向消除策略 | 环境雌激素(包括类固醇和非类固醇类)及其在水生环境中的生态毒理效应 | 环境科学 | NA | 生物转化、化学转化、物理吸附、合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学工具(如CRISPR-Cas9) | NA | 靶向生物降解途径 | 环境 |
| 20 | 2026-07-13 |
One-step selection of high-affinity COP1 aptamers
2026-Sep, aBIOTECH
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.abiote.2026.100060
PMID:42434511
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研究论文 | 开发了一种基于磁珠的一步式适体筛选方法(BOSS),成功筛选出高亲和力的AtCOP1适体 | 提出BOSS方法,将传统SELEX的多个步骤简化为一步,显著提高筛选效率并减少非特异性结合 | 研究仅验证了针对AtCOP1蛋白的可行性,未测试其他靶标;体内共定位实验未评估适体的功能调控效果 | 开发高效适体筛选平台以支持植物合成生物学应用 | 拟南芥组成型光形态建成蛋白1(AtCOP1)的N端RING结构域 | 合成生物学 | NA | BOSS方法、高通量测序 | NA | 核酸序列数据 | 随机ssDNA文库(未说明具体数量) | NA | 植物(拟南芥) | NA | 农业、合成生物学 |