合成生物学相关文章

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当前共找到 5496 篇文献,本页显示第 1 - 20 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 工程工具 宿主生物 回路设计 应用领域
1 2026-08-08
S-layer (Glyco)protein lattices: Biophysical principles of antifouling at prokaryotic interfaces
2026-Aug-07, Quarterly reviews of biophysics IF:7.2Q1
综述 该综述整合历史超微结构观察与现代原子分辨率结构数据和生物物理原理,论证抗污性是所有细菌和古菌S层的基本和普遍功能,并探讨其在生物技术和材料科学中的仿生应用。 首次将S层抗污性置于低雷诺数物理框架下,强调晶格动力学、晶体纳米形貌、静电马赛克、碎片化疏水性、结构化水合壳和聚糖介导的空间排斥的协同作用。 主要基于理论综合,缺乏直接实验验证抗污性机制在不同环境下的定量比较。 阐明S层(糖)蛋白晶格在低雷诺数环境中的抗污生物物理机制,并突出其作为可调界面的潜力。 细菌和古菌的表面层(S层)蛋白和糖蛋白晶格。 生物物理学 NA NA NA 文献数据 NA NA 细菌和古菌 NA 生物技术、合成生物学、材料科学
2 2026-08-08
Microbial lipases: advances in metagenomics and artificial intelligence for enzyme discovery and engineering
2026-Aug-07, Archives of microbiology IF:2.3Q3
综述 本文综述了宏基因组学和人工智能技术在微生物脂肪酶发现与工程中的最新进展,并简要概述了脂肪酶的来源、结构特征、理化性质及工业应用 强调了宏基因组学与人工智能技术的协同作用,用于酶的识别和理性设计,整合大规模序列数据库与预测性计算建模工具,并展望了蛋白质语言模型、生成式人工智能、合成生物学和多组学整合的未来发展 存在异源表达水平低、缺乏高质量信息以及工业规模验证有限等挑战 探讨宏基因组学和人工智能技术在微生物脂肪酶发现与工程中的应用,以推动高效经济的酶开发和可持续生物技术应用 微生物脂肪酶 宏基因组学、人工智能 NA 宏基因组学、人工智能 蛋白质语言模型、生成式人工智能 序列数据 NA NA NA NA 工业生物技术
3 2026-08-08
Regulation of Escherichia coli fermentation processes: from molecular mechanisms to smart industrial practice
2026-Aug-07, Archives of microbiology IF:2.3Q3
综述 本文系统综述了大肠杆菌发酵调控从分子机制到智能工业实践的范式转变,涵盖跨尺度关联、先进缓解策略、多尺度建模与数字孪生等前沿方向 提出从经验性过程调整向跨尺度、深度耦合的智能控制框架转变,整合模型预测控制与动态合成生物学电路,并强调数字孪生作为工业发酵透明化的工具 未提及具体实验数据或案例验证,主要基于文献综述,缺乏实际工业应用的量化评估 阐明大肠杆菌发酵调控的现代范式,从分子机制到智能工业实践,推动绿色生物制造 大肠杆菌发酵过程 工业生物技术 NA 多尺度建模、计算流体动力学、基因组规模代谢模型、数字孪生、合成生物学电路 模型预测控制、数字孪生、基因组规模代谢模型 文献数据 NA 合成生物学电路 大肠杆菌 基于群体感应的生长-生产解耦、代谢物响应反馈回路、光遗传开关 工业生物技术、绿色生物制造
4 2026-08-08
Integrative framework for selecting gene delivery technologies in microalgae for synthetic biology
2026-Aug-07, Molecular biology reports IF:2.6Q3
研究论文 本研究对微藻合成生物学中使用的基因递送技术进行了比较分析,并提出了一个实用的方法选择框架 提出了一个基于工程目标和物种特异性细胞特征来组织基因递送方法的选择框架,该框架强调了递送平台需兼容多样化货物、受体物种和工程应用 新兴技术如细胞穿透肽和金属有机框架的实用性需要更广泛的物种级验证 为微藻合成生物学中的基因递送技术选择提供指导框架 微藻基因递送技术,包括常规技术和新兴技术 合成生物学 NA 基因递送技术(包括 agitation、微粒轰击、电穿孔、农杆菌介导转化、细胞穿透肽、金属有机框架) NA 文献数据 NA NA 微藻 NA 工业生物技术
5 2026-08-08
Integrated multi-omics analysis reveals a pH-driven metabolic and translational switch in Ureaplasma parvum
2026-Aug-04, Microbiology spectrum IF:3.7Q2
研究论文 该研究通过整合蛋白质组学、代谢组学和RNA修饰分析,构建了微小病原体微小脲原体在不同pH条件下的适应性系统模型 首次揭示了在缺乏典型转录调控系统的基因组最小细菌中,通过pH驱动的代谢和翻译开关实现适应性可塑性的机制,并强调了表观转录组在其中的关键作用 未明确指出,但可能受限于体外培养条件与体内微环境差异,以及多组学数据整合的复杂性 构建微小脲原体pH适应的系统级模型,理解基因组最小生物如何通过转录后和代谢调控实现适应性 微小脲原体(Ureaplasma parvum) 系统生物学 泌尿生殖道感染 蛋白质组学、代谢组学、RNA修饰分析 系统级模型 蛋白质、代谢物、RNA修饰数据 NA NA NA NA 医学、合成生物学
6 2026-08-08
Phage as a prospective arsenal against superbugs
2026-Aug-04, Molecular biology reports IF:2.6Q3
综述 本文全面评述了噬菌体疗法作为抗超级细菌武器库的现状,涵盖其现代分类、治疗优势、生物技术应用、临床转化流程及面临的挑战 系统整合了基于基因组的噬菌体分类、基因工程改造、噬菌体衍生蛋白及噬菌体-抗生素协同作用等前沿应用,并展望了合成生物学和人工智能在克服科学、监管和商业障碍中的潜力 尽管有同情使用和临床试验的有力证据,仍存在显著的科学、监管和商业障碍,且论文未提供具体临床效果数据 探讨噬菌体疗法作为抗生素替代品的潜力,并分析其从实验室到临床应用的转化路径及未来发展方向 噬菌体及其衍生蛋白在抗菌治疗中的应用 微生物学 抗菌素耐药性相关感染 基因组测序、基因工程 NA 文献资料 NA 基因工程(未指定具体工具) 细菌(未指定具体菌种) NA 医学
7 2026-08-08
Engineering Naematelia aurantialba as a Robust Synthetic Biology Chassis: Stable Episomal Vector Construction and Metabolic Optimization for Enhanced Polysaccharide Synthesis
2026-Aug-04, Bioresource technology IF:9.7Q1
研究论文 本研究为金耳(Naematelia aurantialba)构建了稳定的遗传平台,包括优化原生质体再生、鉴定微型着丝粒元件以实现稳定的附加体复制,并通过表达透明颤菌血红蛋白增强细胞呼吸,最终使金耳多糖产量提高44.8% 首次在金耳中鉴定出475-bp微型着丝粒核心元件,并利用其构建稳定的自主复制附加体载体,解决了转化子遗传嵌合和荧光异质性问题,为金耳代谢工程提供了高效工具 摘要未提及研究的局限性,可能包括对非模式真菌的适用性有限、微型着丝粒元件的普适性待验证等 建立金耳作为稳健合成生物学底盘,通过遗传工具开发和代谢优化提高金耳多糖产量 金耳(Naematelia aurantialba)菌株NX-20,及其工程改造菌株 合成生物学 NA 原生质体再生、基因组分析、密码子偏好分析、异源表达 NA 基因组序列、生化数据、发酵数据 金耳菌株NX-20,具体样本数量未明确 NA 金耳(Naematelia aurantialba) 携带微型着丝粒元件的附加体表达载体,整合透明颤菌血红蛋白(VHb)基因 工业生物技术
8 2026-08-08
Engineered microorganisms and nanomaterials in cancer therapy: Emerging hybrid systems and translational challenges
2026-Aug-04, Nanomedicine : nanotechnology, biology, and medicine IF:4.7Q2
综述 本文综述了工程微生物与纳米材料在癌症治疗中的应用,重点关注其作用机制、治疗潜力及转化挑战,并特别讨论了微生物-纳米材料混合平台的优势。 系统性地整合了合成生物学与纳米技术在肿瘤治疗中的交叉进展,特别强调微生物-纳米材料混合平台协同增强疗效和调节肿瘤微环境的创新策略。 文中指出生物安全性、生物相容性、监管批准和临床转化等关键挑战尚未完全解决,可能限制实际应用。 总结工程微生物和纳米材料在癌症诊断和治疗中的最新应用,探讨混合系统的潜力和转化难点,以推动下一代精准肿瘤学发展。 工程微生物、纳米材料、肿瘤微环境、肿瘤微生物组及相关癌症治疗平台 合成生物学 癌症 NA NA 综述性文献 NA NA 微生物(未具体指定) NA 医学
9 2026-08-08
Functional diversity, evolution, and translational potential of isoprenoids in eukaryotic membranes
2026-Aug, Trends in biochemical sciences IF:11.6Q1
综述 本文综述了类异戊二烯在真核生物膜中的功能多样性、进化及其翻译潜力,重点关注它们作为膜成分如何调节膜性质,并讨论了合成生物学在生产相关类异戊二烯方面的进展与局限 系统性地整合了类异戊二烯的结构多样性与膜功能关系,并深入探讨了其在合成生物学生产中的调控和储存机制 未提供具体实验数据,可能缺乏对某些细节机制的深入验证 阐明类异戊二烯在真核膜中的作用及其合成生物学生产的潜力与挑战 类异戊二烯及其衍生化合物在植物、真菌和动物细胞膜中的结构与功能 合成生物学 NA 合成生物学 NA 文献数据 NA NA NA NA 生物技术, 医药
10 2026-08-08
Harnessing natural variation for photosynthetic improvement in next-generation crop breeding
2026-Aug, Journal of integrative plant biology IF:9.3Q1
综述 本文综述了作物光合作用自然变异的遗传基础及其在下一代育种中的应用,探讨了通过合成生物学和基因工程提升光合效率的策略 整合了自然遗传变异与合成生物学两大途径,提出了利用光合多样性优化作物产量的战略框架 指出当前对光合性状调控网络的理解仍有限,工程化应用面临挑战 探索通过光合作用改良提升作物产量潜力和气候适应性的策略 作物光合性状及相关遗传资源 植物科学 NA NA NA 文献数据 NA 合成生物学 作物 光合作用相关代谢通路和调控网络 农业
11 2026-08-08
Engineered diazotrophs with host-inducible nitrogen supply systems: Transforming rice farming through innovative nitrogen biofertilizers
2026-Aug, Journal of integrative plant biology IF:9.3Q1
综述 本文综述了工程化固氮菌作为宿主诱导氮供应系统的研究进展,探讨其作为新型氮生物肥料在可持续水稻农业中的潜力 强调将合成生物学与微生物组研究相结合,开发定制化氮输出型固氮菌及合成微生物群落,并识别对微生物干预敏感的水稻品种 未提及具体实验结果或定量数据,缺乏对实际田间应用的详细评估 提出通过生物固氮补充植物氮营养、减少工业氮肥依赖的路线图,推动可持续农业发展 固氮菌、水稻品种、合成微生物群落 合成生物学 NA NA NA 综述文献 NA 合成生物学工具 水稻 氮输出型固氮菌及合成微生物群落 农业
12 2026-08-08
TolC Is Required for a Mixed-Linkage β-Glucan (MLG) Biosynthesis: Engineering Bacteria for MLG Overproduction
2026-Aug, Microbial biotechnology IF:4.8Q1
研究论文 该研究揭示了TolC蛋白在苜蓿中华根瘤菌混合连接β-葡聚糖生物合成中的关键作用,并通过共过表达策略实现了MLG的高效生产 首次发现外膜蛋白TolC作为MLG生物合成机器的一部分,与BgsA和BgsB形成三聚复合体,并通过共过表达tolC、bgsBA和组成型活性二鸟苷酸环化酶(pleD*)实现8倍的MLG产量提升 TolC与BgsA和BgsB复合体的具体分子机制尚未完全阐明,且生产优化仅在特定条件下验证 探究MLG生物合成所需的关键组分并开发增强MLG生产的方法 苜蓿中华根瘤菌及中生根瘤菌等根瘤菌宿主 合成生物学 NA 基因敲除、互补表达、共过表达、生物反应器发酵 NA 基因序列、生物量、MLG产量数据 涉及多种根瘤菌菌株,具体样本数量未明确 基因敲除、遗传互补、共过表达(非指定工程工具) 苜蓿中华根瘤菌、中生根瘤菌 通过共过表达tolC和bgsBA以及pleD*来增强MLG生物合成的基因回路 工业生物技术、材料科学
13 2026-08-08
Engineering rhizobacterial communities for soil and plant health
2026-Aug, Microbiology (Reading, England)
综述 本文综述了通过工程化根际细菌群落来改善土壤和植物健康的最新进展,重点介绍了合成生物学在构建可编程微生物群落中的应用 将工程化微生物群落(EngComs)定义为带有合成基因回路的菌株增强型微生物联合体,扩展了SynCom方法,实现可编程功能如细胞间通讯、劳动分工、生物传感和受控养分动员,并强调了工程化植物-微生物界面的新兴策略 大多数系统仍在简化或人工条件下表征,面临环境复杂性、遗传稳定性、生物防护和监管约束等关键挑战,从实验室到田间转化仍需解决 推动合成生物学与根际生态和生物物理理解的整合,开发用于可持续农业的可编程植物-微生物系统 根际细菌群落及其与植物的相互作用 合成生物学 NA 合成生物学 NA NA NA 合成基因回路 根际细菌 合成信号通路、多输入基因回路、生物传感器 农业
14 2026-08-08
Modular Scalable Synthetic Gene Circuits for Complex Functions Within Minimal Computational Layers in Human Cells
2026-Jun-16, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 提出一种模块化可扩展的合成基因电路设计框架,通过较少的计算层在人类细胞中实现复杂功能。 采用正交反剪接AND门、天然-合成杂交启动子和合成microRNA的组合,在减少计算层数的同时实现复杂逻辑功能,提高了电路的可扩展性并降低了资源消耗。 未明确说明局限性。 开发能在人类细胞中执行复杂遗传程序且计算层数最少化的可扩展基因电路。 人类细胞中的合成基因电路。 合成生物学 不适用 基因电路工程 不适用 不适用 不适用 不适用 人类细胞 三输入组合逻辑门、半加器、全加器、动态3-1多路复用器 生物医学、生物技术、基础生物学
15 2026-08-08
Bioengineering Living Biohybrid Therapeutics for Synergistic H2S Gaseous-Photothermal Cancer Eradication
2026-01, Advanced healthcare materials IF:10.0Q1
研究论文 开发了一种整合工程菌与自矿化硫化铜纳米颗粒的活体生物混合治疗平台,用于协同硫化氢气体-光热癌症治疗 将工程微生物原位产生硫化氢与自矿化硫化铜纳米颗粒结合,形成活体生物杂化物,首次实现气体与光热疗法的协同癌症治疗 未提及 开发高效、安全的癌症治疗新方法,通过生物杂交平台实现协同气体-光热治疗 工程化兼性厌氧菌Vibrio natriegens,乳腺癌荷瘤小鼠模型 合成生物学,纳米技术 乳腺癌 NA NA 体内成像数据、肿瘤抑制率数据 乳腺癌荷瘤小鼠模型 NA Vibrio natriegens 代谢通路:细菌产生硫化氢并合成硫化铜纳米颗粒 医学
16 2026-08-08
The promise and peril of mirror bacteria
2026, Acta biochimica Polonica IF:1.4Q4
观点文章 本文探讨镜像细菌从理论概念走向实际可行性的前景与风险,分析其在应用、伦理、监管和文化层面的影响 超越狭隘的生物安全讨论,从更广泛的伦理、监管和文化角度审视镜像细菌,将其视为科学与社会应对创造新型生命责任的罕见测试案例 未提供具体实验数据或详细技术方案,属于观点性论述 评估镜像细菌的机遇与风险,探讨其伦理、监管和文化影响,并为合成生物学治理框架提供建议 镜像细菌 合成生物学 NA NA NA NA NA NA NA NA 医学、生物工程、信息存储
17 2026-08-08
The Enzyme-Bag Platform for Cytochrome P450 Biotransformation and High-Throughput Drug Metabolism Screening
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
研究论文 介绍了一种基于裂殖酵母的酶袋平台,用于细胞色素P450生物转化和高通量药物代谢筛选 利用半完整细胞方法(酶袋系统)结合重组人CYP酶,避免了传统微粒体制备和纯化蛋白的繁琐过程,支持所有57种人CYP酶的功能分析,并兼容多种检测方式 文中未明确提及研究的局限性 开发一种简化且多用途的药物代谢研究平台,以支持药理学、毒理学和精准医学中的酶活性、底物特异性和抑制剂分析 人细胞色素P450酶(包括孤儿CYP)、II相酶(UGTs、SULTs)、昆虫P450s,以及裂殖酵母和酿酒酵母等宿主 药物代谢研究,合成生物学 不适用 重组表达、选择性透化处理、生物转化实验、发光检测、色谱和质谱分析 不适用 实验数据(酶活性、代谢产物谱) 所有57种人CYP酶及扩展至II相酶和昆虫P450s,未提及具体样本数量 不适用 裂殖酵母,酿酒酵母 生物转化平台,包括CYPome基因文库和酶袋cocktail高通量筛选系统 药物代谢,毒理学,合成生物学,药物开发
18 2026-08-08
A Physics-Inspired Approach to Improve Oligonucleotide Design and Gene Synthesis
2026, Computational and structural biotechnology journal IF:4.4Q2
研究论文 提出一种基于统计物理模型的算法,用于优化聚合酶循环组装(PCA)中的寡核苷酸设计,以改善基因合成的产量和可靠性。 采用统计物理模型和转移矩阵形式精确求解低温度解,结合模拟退火修复和密码子重设计,相比启发式方法能更有效地处理短、GC偏向或易形成二聚体的序列。 未明确讨论算法在处理复杂异源二聚体相互作用时的计算成本,以及实验验证仅覆盖14个代表性设计,可能不足以全面评估其普遍适用性。 改进PCA基因合成中寡核苷酸的设计,确保均匀杂交温度和最小化非特异性二聚体形成,特别是针对困难序列。 超过10,000条被认为不适合合成的序列,以及14个代表性设计用于实验验证。 合成生物学 NA 聚合酶循环组装(PCA)、琼脂糖凝胶电泳 统计物理模型、转移矩阵、模拟退火 序列数据 10,000多条序列(计算评估),14个代表性设计(实验验证) NA NA 寡核苷酸设计 合成生物学、自动化基因组装
19 2026-08-08
Saccharomyces cerevisiae in cancer research: modeling tumor biology and enabling drug discovery
2026, Microbial cell (Graz, Austria)
综述 本文综述了酿酒酵母在癌症研究中的应用,包括模拟肿瘤生物学和促进药物发现。 将酿酒酵母作为一种简化和可扩展的真核模型,用于研究癌症相关的保守细胞过程,并作为转化和生物技术应用的平台。 未明确提及,但可能包括酵母与哺乳动物系统在癌症复杂性方面的差异。 探讨酵母平台在癌症研究中的应用,包括肿瘤生物学建模和药物发现。 酿酒酵母及其在癌症研究中的应用。 生物技术 癌症 遗传操作、异源表达、合成生物学、功能基因组学、高通量筛选。 NA NA NA CRISPR-Cas9, 合成生物学技术。 酿酒酵母 用于研究致癌信号、代谢重编程、应激适应、DNA修复和自噬的工程酵母平台。 医学、工业生物技术
20 2026-08-08
A discovery platform for identification of host-induced bacterial biosensors from diverse sources
2025-Sep, Molecular systems biology IF:8.5Q1
研究论文 本文介绍了一种利用细菌记忆电路和高变DNA条形码的高通量筛选平台,用于从多种肠道细菌中识别宿主诱导的生物传感器,并验证了其在炎症疾病监测和自主控制合成功能方面的应用 创新点在于扩展了生物传感器筛选平台的灵活性和能力,通过自定义的双组分系统识别和克隆流程构建来自不同肠道细菌的传感器库,并利用高变DNA条形码在单个实验中并行追踪数千个独特克隆 未提供明确的局限性信息 旨在开发一种发现平台,以识别来自多样来源的宿主诱导细菌生物传感器,促进合成生物学工具在复杂环境中的应用 肠道细菌中的双组分系统和生物传感器克隆,以及小鼠体内的传感器活性 合成生物学 炎症性疾病 DNA条形码、双组分系统识别和克隆 NA 基因序列和传感器活性数据 约150个推定生物传感器,涉及数千个独特克隆,并在小鼠模型中评估 NA 肠道细菌、小鼠模型 细菌记忆电路和生物传感器 医学、生物技术
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