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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-05-16 |
Evaluating Malat1-derived 3'end sequences for functional transgene expression in human cells using synthetic mRNA delivery
2026-Dec, RNA biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1080/15476286.2026.2670832
PMID:42093635
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研究论文 | 评估利用长链非编码RNA MALAT1来源的3'端序列替代poly(A)尾实现人类细胞中转基因表达的功能 | 首次系统比较了MALAT1来源的三螺旋结构与经典poly(A)尾在合成mRNA表达中的功能差异 | MALAT1来源序列的表达效率始终低于经典poly(A)尾,需优化三螺旋序列和折叠以增强翻译能力 | 探索poly(A)尾的替代策略,用于合成生物学和RNA治疗中的功能性转基因表达 | MALAT1来源的3'端序列基序与经典poly(A)尾 | 分子生物学 | NA | 合成mRNA递送 | NA | NA | NA | NA | 人细胞 | NA | 合成生物学, RNA治疗 |
| 2 | 2026-05-16 |
PHYCUT: Scalable Multiplex CRISPR/Cas9 Editing for Genome Engineering in the Diatom Phaeodactylum tricornutum
2026-05-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00843
PMID:41979903
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研究论文 | 开发了一种名为PHYCUT的多重CRISPR/Cas9编辑系统,用于硅藻基因组工程,并实现α(1,3)岩藻糖基化基因的多重编辑 | 首次在硅藻中建立基于Csy4内切核糖核酸酶处理多导向RNA阵列的质粒型多重CRISPR/Cas9系统,实现了高效的多位点同时编辑 | 未提及编辑效率的具体量化数据,且仅针对α(1,3)岩藻糖基化途径的三个基因进行验证,系统在其他基因座或不同硅藻物种中的适用性尚未评估 | 克服硅藻中缺乏稳健的多重CRISPR/Cas9编辑系统的局限,开发高效基因组工程工具 | 三角褐指藻(Phaeodactylum tricornutum) | 合成生物学 | 不适用 | CRISPR/Cas9 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | CRISPR-Cas9, Csy4 | 三角褐指藻(Phaeodactylum tricornutum) | 基于Csy4处理多导向RNA阵列的质粒型CRISPR/Cas9系统 | 生物技术, 医药 |
| 3 | 2026-05-16 |
Plant Synthetic Biology Takes Off: Bryophytes Onboard with New Tools, Systems, and Opportunities
2026-05-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00092
PMID:41984537
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综述 | 本文综述了苔藓植物在植物合成生物学作为新型工具、系统和机遇平台的最新进展 | 强调苔藓植物作为替代实验平台可弥补被子植物系统复杂性限制,推动跨植物谱系的通用和协同生物工程方法建立 | 未明确提及具体限制 | 突出苔藓植物作为植物合成生物学系统的重要性,并讨论其技术发展与应用前景 | 苔藓植物(包括藓类、角苔类和地钱类),特别是作为主要模型的物种 | NA | NA | 模块化克隆、基因回路、基因组编辑、合成基因组学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 苔藓植物(藓类、角苔类、地钱类) | 基因回路 | 农业, 工业生物技术 |
| 4 | 2026-05-16 |
Engineering Rapamycin-Induced Dimerization for Control of Gene Expression in Plants
2026-05-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00125
PMID:41990133
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研究论文 | 开发了一种雷帕霉素诱导的FKBP-FRB分裂转录因子系统,用于植物中基因表达的精确控制 | 通过系统优化多种DNA结合域、FRB重复序列和启动子架构,将诱导倍数提升至87倍,且诱导表达水平超过2×CaMV35S组成型启动子;雷帕霉素可通过简单喷洒或土壤施用实现控制 | 研究提及现有化学诱导系统的局限性,但未明确阐述本系统在非目标植物或环境中的潜在风险如持久性 | 实现植物基因表达的时间、空间和定量精确控制,替代现有诱导系统缺陷 | 植物(具体物种未明述,但数据表型涉及叶、土壤施用等通用植物模型) | 合成生物学 | NA | 雷帕霉素诱导系统、分裂转录因子系统 | NA | 基因表达数据、应用方法数据 | NA | NA | 植物(具体物种未明述) | 雷帕霉素诱导的二聚化分裂转录因子系统;包含hFRB-结合域和hFKBP12-转录激活域的回路设计 | 农业、生物技术 |
| 5 | 2026-05-16 |
Yeast MoClo Secretion and Surface Display Toolkit 2.0: Improvements and Applications for Analysis of protein-protein Interactions and Whole-Cell Biocatalysis
2026-05-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00085
PMID:42025218
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研究论文 | 描述了酵母MoClo分泌与表面展示工具包2.0的改进和应用,用于分析蛋白质相互作用和全细胞生物催化 | 新增了基于N端截短Aga1和C端Aga2的锚定蛋白部分,以及GFP荧光互补检测和分泌增强蛋白部分,并展示了在抗GFP纳米抗体展示和PET塑料降解中的新应用 | 未在摘要中明确提及 | 改进酵母MoClo分泌与表面展示工具包并扩展其应用 | 酵母细胞以及用于分泌和表面展示的异源蛋白 | 合成生物学 | NA | MoClo模块化克隆 | NA | NA | 多个蛋白质部分和酵母菌株 | MoClo | 酿酒酵母 | 分泌和表面展示线路,包括锚定蛋白、GFP互补系统和分泌增强蛋白 | 生物技术, 环境 |
| 6 | 2026-05-16 |
Construction and Application of a Multicolor Bactosensor for Detecting Bioavailable Antibiotic Mixtures in the Environment
2026-05-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00891
PMID:42027138
|
研究论文 | 构建了一种多色细菌传感器,用于同时检测环境中的四环素和红霉素 | 首次将两个基于转录因子的传感模块整合到一个质粒中,并通过引入抗生素抗性基因提升性能,实现了通过智能手机图像颜色差异定量区分二元抗生素混合物 | 主要针对两种抗生素的检测,对于更复杂混合物的适用性未在论文中明确讨论 | 开发一种可现场部署的细菌传感器,用于环境中抗生素混合物的定量检测 | 四环素和红霉素 | NA | NA | 合成生物学、荧光传感 | NA | 图像 | 真实水样(未明确数量) | NA | 大肠杆菌 | 多色细菌传感器,包含基于转录因子的四环素和红霉素传感模块 | 环境监测 |
| 7 | 2026-05-16 |
Metabolic Engineering of Bacillus subtilis for High-Level Production of Salidroside from Potato Starch
2026-05-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00803
PMID:42048483
|
研究论文 | 通过代谢工程手段,在枯草芽孢杆菌中利用马铃薯淀粉高效生产红景天苷 | 首次在枯草芽孢杆菌中引入芳香醛合酶合成酪醇,结合群体感应动态调控系统优化红景天苷生产,并利用马铃薯淀粉作为碳源实现高效发酵 | 目前仅在摇瓶发酵水平实现生产,未提及工业规模放大及成本分析 | 开发可持续的红景天苷生产方法,推动天然产物生物合成的工业化应用 | 枯草芽孢杆菌工程菌株 | 代谢工程 | NA | 代谢工程、发酵工程 | NA | 实验数据 | 工程菌株BS18及其他中间菌株 | NA | 枯草芽孢杆菌 | 异源芳香醛合酶合成酪醇途径、内源醇脱氢酶筛选、群体感应动态调控系统、磷酸葡萄糖变位酶和UDP-葡萄糖焦磷酸化酶过表达 | 生物医药,化妆品,工业生物技术 |
| 8 | 2026-05-16 |
A Streamlined and High-Osmolarity Bacillus subtilis Cell-Free Platform for Rapid Characterization of Genetic Regulatory Elements
2026-05-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00165
PMID:42052911
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研究论文 | 建立了一种简化且高渗透压的枯草芽孢杆菌无细胞平台,用于快速表征遗传调控元件 | 系统重新评估了传统的提取制备和反应环境,省略了常规所需的流出培养和透析步骤,并通过将钾谷氨酸浓度提高至400 mM并添加渗透保护剂甜菜碱,显著增强了翻译能力 | 未提及具体局限性 | 开发一种简化的枯草芽孢杆菌无细胞系统,用于快速表征遗传调控元件 | 枯草芽孢杆菌无细胞系统中的遗传调控元件 | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白质合成 | NA | NA | NA | NA | 枯草芽孢杆菌 | 遗传调控元件,包括启动子强度分析和catabolite抑制子CcpA介导的阻遏 | 合成生物学、工业生物技术 |
| 9 | 2026-05-16 |
Multiplexed Engineering of Salmonella Typhimurium for Targeted Cancer Therapies
2026-05-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00119
PMID:42085230
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综述 | 提出一个系统性工程框架,用于将鼠伤寒沙门氏菌改造为有效的抗癌活体生物治疗产品 | 提出了一个多模块协同工程框架,涵盖菌株减毒、靶向增强、定植优化、治疗生产、裂解控制释放和辅助模块,将鼠伤寒沙门氏菌从病原体转化为抗肿瘤载体 | 工程化鼠伤寒沙门氏菌在遗传稳定性和临床转化方面存在挑战和瓶颈 | 总结通过合成生物学方法工程化鼠伤寒沙门氏菌用于靶向癌症治疗的关键方法,并推动其临床应用 | 鼠伤寒沙门氏菌 | 合成生物学 | 癌症 | 合成生物学重组 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Golden Gate Assembly | 鼠伤寒沙门氏菌 | 多模块协同工程回路,包括减毒回路、靶向增强回路、定植优化回路、治疗生产回路、裂解控制释放回路和辅助模块 | 医学 |
| 10 | 2026-05-16 |
Systematic Evaluation of Different Ribonucleoprotein Complexes as Posttranscriptional Biosensors in Cell-Free TX-TL Systems
2026-05-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00170
PMID:42086502
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研究论文 | 系统评估了三种不同的核糖核蛋白复合物在无细胞转录-翻译系统中作为转录后生物传感器的性能 | 首次系统比较了RISC、MS2-CNOT7和L7Ae三种RNP复合物在真核、原核和重组无细胞平台中的传感器功能,并成功在PURE系统中实现了蛋白酶响应性L7Ae介导的条件抑制 | IVT RNA基miRNA传感器存在报告基因基础表达水平难以可靠量化的瓶颈,MS2-CNOT7传感器则受限于裂解液依赖性约束 | 探索核糖核蛋白复合物在无细胞转录-翻译系统中作为转录后生物传感器的潜力 | RISC、MS2-CNOT7和L7Ae三种核糖核蛋白复合物 | 合成生物学 | NA | 无细胞转录-翻译系统、体外转录、荧光素酶报告基因 | NA | 实验数据 | NA | NA | NA | 转录后生物传感器电路(RISC、MS2-CNOT7、L7Ae) | 医学、环境 |
| 11 | 2026-05-16 |
Temporal Programming of Cell-Free Transcription Using Orthogonal Enzyme-Responsive DNA Blockers
2026-May-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00147
PMID:42137991
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研究论文 | 利用正交酶响应DNA阻断剂实现无细胞转录的时间编程 | 通过三种正交的酶(RNase H、UDG和Fpg)可控降解阻断链,实现多个转录模板的独立时延控制,并将计时器用于调控Cas12a的附带切割活性 | 仅测试了酶浓度和阻断链浓度对延迟时间的影响,未探讨细胞环境中可能存在的复杂干扰因素 | 开发一种通用的无细胞转录时间编程框架,实现时间延迟和时序控制 | DNA转录计时器、阻断链、三种降解酶 | 合成生物学 | NA | 无细胞转录 | NA | NA | NA | NA | 无细胞系统 | 正交酶响应DNA转录计时器 | 合成生物学 |
| 12 | 2026-05-16 |
Modeling of Conjugative- and Phage- Mediated CRISPR-based System against Antimicrobial Resistant Bacteria
2026-May-14, IEEE transactions on bio-medical engineering
DOI:10.1109/TBME.2026.3693402
PMID:42133510
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研究论文 | 利用系统生物学方法建立数学模型,模拟结合型和噬菌体介导的CRISPR系统对抗抗菌耐药细菌的动态过程 | 通过数学建模整合突变效应和传递系统动力学,比较了工程化益生菌和噬菌体在CRISPR切割与CRISPR干扰两种抗菌执行器中的表现,为合成生物学抗耐药策略提供了定量优化框架 | 模型基于数学假设,未在真实生物系统中验证;参数简化可能忽略宿主免疫反应等复杂生物学因素 | 评估工程化结合型益生菌和噬菌体通过CRISPR系统沉默耐药基因或直接切割基因组来对抗抗菌耐药细菌的潜力 | 耐药细菌、工程化益生菌和工程化噬菌体组成的递送系统及抗菌执行器(CRISPR切割与CRISPR干扰) | 系统生物学 | 抗菌耐药感染 | 数学建模 | 动力学模型 | 模拟数据 | NA | CRISPR-Cas9, CRISPR干扰 | 益生菌, 噬菌体 | CRISPR基因编辑和基因沉默回路 | 医学 |
| 13 | 2026-05-16 |
Engineered Biocatalytic Strategies for Pesticide Degradation in Food Systems: From Catalytic Performance to Practical Applications
2026-May-14, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.6c01905
PMID:42133536
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综述 | 综述了食品系统中酶法降解农药的工程策略,从催化性能到实际应用 | 重点介绍了通过工程策略提升酶降解农药的性能和稳定性,包括天然酶、纳米酶、多酶或杂合级联系统,以及人工智能辅助设计和合成生物学等新兴方法 | 实际应用受限于催化效率低、稳定性和可重复使用性不足、规模化限制及监管不确定性 | 提供面向应用的酶法降解农药最新进展综述,并批判性分析将实验室系统转化为实际食品基质的主要障碍 | 食品系统中农药残留的酶法降解策略 | 机器学习 | NA | 酶降解 | NA | NA | NA | NA | NA | 多酶级联系统 | 食品 |
| 14 | 2026-05-16 |
Understanding Cell Wall Enzyme Function: From Classical Approaches to New Biotechnology
2026-May-14, Journal of experimental botany
IF:5.6Q1
DOI:10.1093/jxb/erag227
PMID:42135035
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综述 | 综述了植物细胞壁相关碳水化合物活性酶的功能研究方法,从经典技术到合成生物学和人工智能等新兴工具 | 整合了经典生化与遗传方法以及高通量筛选、无细胞系统、微生物宿主、植物平台和CRISPR/Cas9等合成生物学工具,并强调了AI蛋白质模型和实验室自动化的潜力 | 未提及具体实验结果或定量比较不同方法的效率 | 提供研究植物细胞壁相关CAZymes功能的策略概述,以推动食品、生物能源和生物产品应用 | 植物细胞壁中碳水化合物活性酶 | 合成生物学 | NA | 高通量筛选,无细胞系统,CRISPR/Cas9基因组编辑,碱基编辑,AI蛋白质模型 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9,碱基编辑 | 微生物宿主,植物 | NA | 食品,生物能源,生物产品,材料 |
| 15 | 2026-05-16 |
Emerging porous materials for cell encapsulation
2026-May-13, Chemical Society reviews
IF:40.4Q1
DOI:10.1039/d4cs00071d
PMID:42132741
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综述 | 从合成生物学和材料科学角度总结了细胞@MOF、细胞@COF和细胞@HOF复合材料的最新进展 | 首次以框架材料为核心,系统梳理了多孔非生物外骨骼的合成策略及其在细胞封装中的应用 | 仅综述现有研究,缺乏实验验证和新方法提出 | 总结多孔材料在细胞封装中的合成策略、性能评估及应用前景 | 细胞@MOF、细胞@COF和细胞@HOF复合材料 | 合成生物学, 材料科学 | NA | 多孔材料合成, 细胞表面修饰 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 细胞治疗, 生物催化, 生物传感, 二氧化碳减排 |
| 16 | 2026-05-16 |
Molecular recruitment and release using DNA host condensates
2026-May-12, Nanoscale horizons
IF:8.0Q1
DOI:10.1039/d5nh00586h
PMID:41774821
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研究论文 | 本研究表征了通过将适体纳入DNA纳米星来构建能够招募目标生物分子到致密相的凝聚体,并利用“kleptamer”寡核苷酸实现生物分子从凝聚体中的释放 | 展示了利用DNA纳米星中的适体工程化凝聚体以招募和释放生物分子的能力,并揭示了适体位置不影响凝聚体形成和招募效率的鲁棒性 | 仅聚焦于链霉亲和素(SA)作为模型生物分子,未探索其他靶标;未深入探讨释放动力学和长期稳定性 | 研究利用DNA宿主凝聚体进行分子招募和释放的设计原理 | DNA纳米星凝聚体、适体、链霉亲和素(SA)、kleptamer寡核苷酸 | 合成生物学 | NA | DNA纳米星设计、适体掺入、荧光标记 | NA | 实验数据 | NA | NA | 无细胞系统(体外) | 适体介导的分子招募与释放回路 | 合成生物学、生物材料 |
| 17 | 2026-05-16 |
Harnessing biosynthetic logic for next-generation ADC payloads
2026-May-12, Chemical Society reviews
IF:40.4Q1
DOI:10.1039/d5cs01487e
PMID:42015662
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综述 | 本文综述了基于生物合成逻辑开发新一代抗体药物偶联物(ADC)载药的研究进展 | 通过基因组挖掘和合成生物学方法揭示临床载药的生物合成基因簇和酶学逻辑,拓展载药化学空间,并讨论非毒素模式以补充传统细胞毒素 | 未明确说明该领域的当前挑战或未来研究的具体局限性 | 总结临床载药的发现、生物合成和生产进展,利用生物合成知识推动更安全、高效和机制复杂的ADC疗法 | 抗体药物偶联物及其载药 | 合成生物学 | 肿瘤 | 基因组挖掘、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 18 | 2026-05-16 |
Recent advances in decoding biosynthetic pathways and synthetic biology approaches for plant alkaloids
2026-May-12, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00089k
PMID:42132682
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综述 | 综述2018至2025年间植物生物碱生物合成途径解析与合成生物学方法的最新进展 | 对主要类别的代表性植物生物碱的途径解析挑战(立体化学控制、重要环化、定制修饰)及长途径解码创新方法进行系统总结,并讨论合成生物学与代谢工程策略在微生物高效生产中的应用 | 未具体说明局限性,但该领域对特定酶催化步骤和途径完整性的理解仍存在挑战 | 促进植物生物碱功能基因表征、合成生物系统开发、产量优化和药物创新,加速高价值植物生物碱的发现和规模化生产 | 单萜吲哚生物碱、四氢异喹啉生物碱、托品烷生物碱等主要类别的代表性植物生物碱 | NA | NA | 合成生物学, 代谢工程, 微生物生产 | NA | NA | NA | NA | 微生物(大肠杆菌、酵母等) | 生物合成途径重构 | 药学, 药物发现, 可持续生产 |
| 19 | 2026-05-16 |
Growth versus decline: root aging and plant performance
2026-May-05, The Plant cell
DOI:10.1093/plcell/koag115
PMID:41990352
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综述 | 综述了根系衰老的分子与生理机制及其对植物生长和作物生产力的影响 | 将根系衰老与生长调控两个过程概念性连接,并探讨了延迟衰老或重激活生长的遗传与合成生物学策略 | 尚未提供具体的实验验证数据,主要基于现有研究的整合与推测 | 阐明根系衰老的机制及其对植物性能的影响,并探索延缓衰老以提升作物生产力的潜在方法 | 植物根系(特别是衰老过程中的根) | NA | NA | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick | 作物植物 | 延迟根系衰老或重激活生长的合成生物学电路 | 农业, 环境 |
| 20 | 2026-05-16 |
Plant-derived indole alkaloids in chronic inflammatory diseases: molecular mechanisms, therapeutic potential and translational challenges
2026-May, Inflammopharmacology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s10787-026-02244-z
PMID:42009998
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综述 | 整合植物来源的吲哚生物碱在慢性炎症性疾病中的化学、来源、机制及治疗潜力 | 系统阐述了吲哚生物碱对NF-κB、JAK/STAT、MAPK、PI3K/AKT、NLRP3炎症小体和AhR信号等多个炎症轴的调控作用,并特别强调了单萜类和色氨酸衍生物在微生物群和器官特异性治疗中的前景 | 主要依靠临床前证据支持,面临转化障碍,需要合成生物学、代谢组学和合理杂化设计的未来进展 | 评估植物来源的吲哚生物碱在慢性炎症性疾病中的分子机制、治疗潜力和转化挑战 | 植物来源的吲哚生物碱及其对炎症和氧化应激的影响 | NA | 慢性炎症性疾病(包括结肠炎、骨关节炎、COPD、动脉粥样硬化、慢性肾病和炎症驱动的癌症) | NA | NA | 文献数据 | NA | NA | NA | NA | 医学 |