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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-04-30 |
Synthetic Biology Approaches to Enzymology in Food and Agriculture Systems
2026-Apr-29, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c16525
PMID:41962132
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综述 | 探讨合成生物学在食品和农业系统中酶学应用的最新进展 | 批判性地评估了其他行业技术如何适应食品和农业领域,提出了综合合成生物学实现酶工程以促进食品安全、提高产量和副产物增值的创新方法 | 当前合成生物学在食品系统中的整合存在局限性和监管挑战 | 研究合成生物学在食品和农业系统中酶学的应用,以解决全球粮食不安全问题 | 食品和农业系统中的酶学过程及酶工程策略 | NA | NA | 酶工程,合成生物学,生物催化,计算酶路径设计 | NA | NA | NA | NA | NA | 酶工程代谢路径 | 农业,食品 |
| 2 | 2026-04-30 |
A Combinatorial Strategy of Semirational Screening and Rational Design for Engineering an α-1,2-Fucosyltransferase toward Efficient 2'-Fucosyllactose Biosynthesis
2026-Apr-29, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.6c00566
PMID:41983305
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研究论文 | 通过半理性筛选和理性设计组合策略工程化α-1,2-岩藻糖基转移酶,实现高效无副产物的2'-岩藻糖基乳糖生物合成 | 结合理性计算设计(结构、进化和稳定性预测)与半理性筛选(基于L-岩藻糖响应生物传感器),首次获得五重突变体M5,实现了124.25 g/L的2'-FL产量且无副产物DFL | 未明确讨论该策略对其他岩藻糖基转移酶或不同底物的普适性,也未评估长期工业生产的稳定性 | 开发无副产物的高效2'-FL微生物合成平台 | α-1,2-岩藻糖基转移酶BKHT及其突变体 | 合成生物学 | NA | 定点饱和突变、理性计算设计、生物传感器筛选 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌 | L-岩藻糖响应生物传感器(FcsR-P) | 工业生物技术、食品 |
| 3 | 2026-04-30 |
Biological Detoxification of Gossypol: Enzymatic Mechanisms, System Engineering, and Prospects for Green Valorization
2026-Apr-29, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c17645
PMID:41989489
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综述 | 本文综述了棉酚的生物解毒机制,包括酶学原理、系统工程策略以及绿色高值化利用的前景 | 将棉酚活性酶分为四个功能模块(官能团修饰、芳环裂解、增溶缀合和自由基介导环化),并提出产物解析验证方法以明确定义解毒终点 | 现有解毒方法主要依据总棉酚减少而非产物解析证据,缺乏解毒转化的明确验证 | 系统阐述棉酚的生物解毒机制,并提出绿色高值化利用的策略 | 棉酚及其解毒酶与微生物系统 | NA | NA | 酶工程, 多酶级联, 人工智能辅助酶/通路挖掘, 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | 解毒代谢通路(包括棉酚活性酶的功能模块) | 农业, 食品, 工业生物技术 |
| 4 | 2026-04-30 |
OptoChaperone─A Biohybrid Tool for Regulating Protein Condensates in Cells and In Vitro
2026-Apr-29, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.6c04074
PMID:42002974
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研究论文 | 报道一种名为OptoChaperone的光激活生物杂交系统,用于在体外和活细胞中精确调控蛋白质凝聚体 | 首次利用光响应开关控制分子伴侣活性,实现对蛋白质液-液相分离的可逆、时空精确调控,无需化学添加剂或基因修饰 | 未提及长期稳定性和体内应用可能面临的光毒性问题 | 开发可逆、精确控制蛋白质凝聚体的光遗传学工具 | 疾病相关蛋白质凝聚体,包括融合肉瘤蛋白、TAR DNA结合蛋白43和热休克因子1 | 合成生物学 | 神经退行性疾病 | 光遗传学 | NA | NA | NA | 光响应分子系统 | 活细胞 | 光控分子伴侣系统,蓝光激活抑制功能使蛋白质凝聚体解聚,紫外光失活允许凝聚体形成 | 医学, 合成生物学, 生物分子工程 |
| 5 | 2026-04-30 |
Biosynthesized Silk-Amyloid-Mussel Proteins as Dissolution Recyclable Materials With Tunable Supercontraction
2026-Apr-29, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.73200
PMID:42051062
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研究论文 | 利用蛋白质工程和合成生物学设计丝绸-淀粉样蛋白-贻贝杂合蛋白,制备可溶解回收的高性能蛋白基材料 | 通过合理平衡非晶域与结晶域的相互作用,实现高强度、韧性、低超收缩及完全可回收性的蛋白基材料设计 | NA | 开发可溶解回收、高性能且可持续的蛋白基材料 | 丝绸-淀粉样蛋白-贻贝(SAM)杂合蛋白及其纤维和水凝胶 | 材料科学 | NA | 蛋白质工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 材料科学、可持续材料 |
| 6 | 2026-04-30 |
A Streamlined and High-Osmolarity Bacillus subtilis Cell-Free Platform for Rapid Characterization of Genetic Regulatory Elements
2026-Apr-29, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00165
PMID:42052911
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研究论文 | 建立一种简化且高渗透压的枯草芽孢杆菌无细胞平台,用于快速表征基因调控元件 | 通过重新评估传统提取制备和反应环境,省略了运行后孵育和耗时透析步骤,并将反应缓冲液中的钾谷氨酸盐浓度提高至400 mM并添加渗透保护剂甜菜碱,显著增强了翻译能力 | 未提及在非模型细菌物种中的广泛应用验证 | 开发一种简化且稳健的无细胞系统,用于预测性表征基因调控元件和复杂遗传调控 | 枯草芽孢杆菌无细胞系统及基因调控元件 | 合成生物学 | NA | 无细胞系统(CFS)、荧光蛋白表达 | NA | 荧光强度数据、启动子活性数据集 | 多个启动子文库数据集(具体数量未提及) | NA | 枯草芽孢杆菌、李斯特菌 | 基因调控回路(如CcpA-HPr介导的启动子抑制) | 工业生物技术 |
| 7 | 2026-04-30 |
Metabolic Engineering of Bacillus subtilis for High-Level Production of Salidroside from Potato Starch
2026-Apr-28, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00803
PMID:42048483
|
研究论文 | 通过代谢工程策略使枯草芽孢杆菌能够以马铃薯淀粉为碳源高产红景天苷 | 引入芳香醛合酶从内源L-酪氨酸合成酪醇,抑制竞争代谢途径,筛选内源醇脱氢酶,并利用群体感应动态调控系统优化红景天苷生产 | 未提及具体限制,可能包括产量在工业规模下仍需优化 | 开发可持续的红景天苷生产方法 | 枯草芽孢杆菌工程菌株 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA | 代谢工程, 群体感应动态调控系统 | 枯草芽孢杆菌 | 代谢通路工程,包括引入芳香醛合酶、抑制竞争通路、过表达磷酸葡糖变位酶和尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶 | 生物医药, 化妆品 |
| 8 | 2026-04-30 |
Chemical and synthetic biology tools to interrogate and control cell-cell interactions in vivo
2026-Apr-27, Current opinion in chemical biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.cbpa.2026.102688
PMID:42048798
|
综述 | 本篇综述讨论了利用化学和合成生物学工具在体内探究和控制细胞-细胞相互作用的最新进展 | 专注于体内研究进展,强调在天然环境中保持细胞动态、组织结构和环境线索,从而揭示复杂生物系统中细胞相互作用的通用原理 | NA | 探讨用于研究和控制体内细胞间相互作用的化学与合成生物学工具的发展与应用 | 细胞-细胞相互作用、蛋白质介导的通讯 | 合成生物学 | NA | 化学工具、合成生物学工具 | NA | NA | NA | NA | 多细胞生物(体内) | NA | 基础生物学研究 |
| 9 | 2026-04-30 |
Construction and Application of a Multicolor Bactosensor for Detecting Bioavailable Antibiotic Mixtures in the Environment
2026-Apr-24, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00891
PMID:42027138
|
研究论文 | 本研究构建了一种多色细菌传感器,能够同时检测环境中的四环素和红霉素,并通过智能手机图像实现二元抗生素混合物的定量区分 | 首次将两个基于转录因子的传感模块整合到单一质粒中,通过引入抗生素抗性基因提升性能,并利用智能手机荧光颜色差异实现抗生素混合物的可视化定量检测 | 未明确说明,但可能涉及传感器对复杂环境基质中其他干扰物的通用性或长期稳定性 | 开发一种可现场部署的多色细菌传感器,用于环境中生物可利用抗生素混合物的定量检测 | 环境中四环素和红霉素的二元混合物 | 合成生物学 | NA | 基于转录因子的传感模块、抗生素抗性基因工程 | NA | 图像 | 真实水样 | 质粒构建、转录因子工程 | 大肠杆菌 | 双输入传感器模块(四环素和红霉素响应回路) | 环境监测 |
| 10 | 2026-04-30 |
Yeast MoClo Secretion and Surface Display Toolkit 2.0: Improvements and Applications for Analysis of protein-protein Interactions and Whole-Cell Biocatalysis
2026-Apr-23, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00085
PMID:42025218
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研究论文 | 介绍了酵母MoClo分泌与表面展示工具包2.0的改进和应用,用于分析蛋白-蛋白相互作用和全细胞生物催化 | 新增基于截短型Aga1的N端融合和基于Aga2的C端融合的锚定蛋白部分,以及通过GFP荧光互补实现分泌蛋白的高通量检测和增强分泌的酵母蛋白部分 | 未提及具体限制 | 改进和扩展MoClo YSD工具包,并展示其在合成生物学等领域的应用 | 酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 合成生物学 | NA | MoClo模块化克隆 | NA | NA | NA | MoClo | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 分泌与表面展示系统,包括信号肽、锚定蛋白、GFP荧光互补和分泌增强蛋白 | 合成生物学,工业生物技术 |
| 11 | 2026-04-30 |
Tailored base editing toolkits for functional genomics and metabolic engineering in the halophile Salinivibrio
2026-Apr-22, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2026.04.012
PMID:42031218
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研究论文 | 在嗜盐菌Salinivibrio中开发了高效的碱基编辑平台,并应用于功能基因组学和代谢工程 | 首次在非模式嗜盐菌Salinivibrio中建立腺嘌呤和胞嘧啶碱基编辑器,并开发了新型融合蛋白PmCDA-TadA8e-nCas9-UGI实现双碱基同时编辑 | 未提及 | 开发高效的碱基编辑工具以推动嗜盐菌的合成生物学和工业应用 | 嗜盐菌Salinivibrio sp. TGB4 | 合成生物学 | NA | 碱基编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | Salinivibrio sp. TGB4 | 碱基编辑器(ABE、CBE、双碱基编辑器)和代谢通路(乙酸代谢及聚3-羟基丁酸生物合成) | 工业生物技术 |
| 12 | 2026-04-30 |
Co-Immobilization of SpyTag-Cyclized Enzymes on a γPFD-SpyCatcher Hydrogel to Address Broad Specificity
2026-Apr-21, Gels (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/gels12040348
PMID:42042186
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研究论文 | 开发了一种基于自组装γPFD-SpyCatcher水凝胶的可编程蛋白质支架,用于体内共固定SpyTag环化级联酶,以解决酶广底物特异性导致的副反应和产量降低问题 | 通过SpyTag环化酶与γPFD-SpyCatcher水凝胶的共固定策略,实现级联酶的空间有序组织,显著提高产物产量 | 未明确提及,但可能包括体内支架稳定性或适用酶类型的限制 | 解决工程代谢途径中酶广底物特异性导致的副反应和产量降低问题 | SpyTag环化酶和γPFD-SpyCatcher水凝胶空间组织方法 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | SpyTag/SpyCatcher系统 | 工程微生物(未具体说明,可能是大肠杆菌或酵母) | 基于γPFD-SpyCatcher水凝胶的级联酶共固定支架 | 合成生物学, 工业生物技术 |
| 13 | 2026-04-30 |
Beyond tiny aquatic plants: how duckweeds serve the world as revolutionary crops for alleviating resource and energy crises
2026-Apr-21, Food chemistry
IF:8.5Q1
DOI:10.1016/j.foodchem.2026.149330
PMID:42048806
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综述 | 综述浮萍作为革命性作物在缓解资源和能源危机中的作用 | 系统阐述了浮萍在替代蛋白、可持续生物燃料、合成生物学底盘和太空生命支持系统等多领域的应用潜力,并通过生命周期和技术经济评估验证其环境与经济可行性 | 未明确讨论浮萍大规模商业化生产中的具体挑战或潜在风险 | 全面评估浮萍作为革命性作物在缓解资源和能源危机方面的潜力 | 浮萍(水生植物) | 合成生物学 | NA | 生命周期评估、技术经济评估 | NA | 文本 | NA | 合成生物学底盘 | 浮萍 | NA | 农业, 能源, 环境, 工业生物技术 |
| 14 | 2026-04-30 |
PHYCUT: Scalable Multiplex CRISPR/Cas9 Editing for Genome Engineering in the Diatom Phaeodactylum tricornutum
2026-Apr-14, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00843
PMID:41979903
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研究论文 | 开发了一种名为PHYCUT的基于质粒的CRISPR/Cas9系统,用于在海洋硅藻中实现多基因同时编辑,以降低其蛋白质的岩藻糖基化水平 | 首次在硅藻中建立了基于Csy4核糖核酸内切酶处理多向导RNA的CRISPR/Cas9多重编辑系统,实现了三个岩藻糖基化基因的同时编辑 | 未提及在非靶标位点的脱靶效应评估,以及编辑效率的定量比较分析 | 为硅藻基因组工程提供一种可靠的多位点CRISPR/Cas9编辑工具,并推动其糖基化途径的人源化改造 | 海洋硅藻Phaeodactylum tricornutum | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9, Csy4核糖核酸内切酶 | NA | 基因组序列 | NA | CRISPR-Cas9 | Phaeodactylum tricornutum | 基于Csy4的多向导RNA处理系统 | 工业生物技术, 医药 |
| 15 | 2026-04-30 |
Metabolic Engineering of Rhodotorula toruloides for Biosynthesis of Retinal
2026-Apr-02, Journal of fungi (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/jof12040258
PMID:42042353
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研究论文 | 通过代谢工程改造圆红冬孢酵母NP11以生产视黄醛 | 首次在圆红冬孢酵母中引入并优化多种来源的β-胡萝卜素15,15'-双加氧酶基因,并结合多基因过表达和发酵条件优化,实现了视黄醛的高效生物合成 | 未进行详细的代谢流分析或基因调控网络优化,产量仍有提升空间 | 实现视黄醛的微生物合成,为萜类化合物的生物制造提供细胞工厂 | 圆红冬孢酵母NP11 | 合成生物学 | NA | 代谢工程, 发酵优化 | NA | 浓度数据 | 工程菌株Rt13及多种基因改造菌株 | NA | 圆红冬孢酵母 | 视黄醛合成途径:包含β-胡萝卜素15,15'-双加氧酶基因以及IDI1、BTS1、CARRP、CARB过表达 | 医药, 食品, 化妆品 |
| 16 | 2026-04-30 |
Functional Diversity of Probiotic Effector Molecules: Insights into Their Role in Improving Gut Health
2026-Apr, Annual review of food science and technology
IF:10.6Q1
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综述 | 本文综述了益生菌效应分子的功能多样性及其在改善肠道健康中的作用 | 系统总结了益生菌效应分子的主要类别和作用机制,并提出了高通量鉴定和合成生物学等新兴方法在解锁其治疗潜力方面的应用 | 益生菌效应分子的高通量鉴定和体内验证及有效剂量确定仍面临挑战 | 阐明益生菌效应分子的多样性及其功能,以促进靶向益生菌疗法和功能性食品的设计 | 益生菌效应分子,包括细菌多糖聚合物、表面蛋白、分泌肽和酶、细胞外囊泡及小分子代谢物 | 肠道微生物组与益生菌研究 | 肠道健康相关疾病 | 比较基因组学、合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 益生菌 | NA | 医学、食品 |
| 17 | 2026-04-30 |
Synthetic Biology Approaches in Reducing Mycotoxin Contamination and Enhancing Food System Sustainability
2026-Apr, Annual review of food science and technology
IF:10.6Q1
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综述 | 综述合成生物学在减少真菌毒素污染和增强食品系统可持续性方面的应用 | 整合人工智能与多组学技术开发识别元件、抗菌剂和降解酶,并强调CRISPR多重编辑和微生物细胞工厂等新兴技术 | NA | 探讨合成生物学在真菌毒素控制和食品副产物可持续利用中的解决方案 | 产毒真菌、真菌毒素、食品及加工副产物 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 微生物细胞 | 微生物细胞工厂、生物传感器 | 农业, 食品, 环境 |
| 18 | 2026-04-30 |
Radiation-Responsive Promoters: Molecular Mechanisms, Screening Strategies, and Translational Applications as Radiation Biomarkers
2026-Mar-26, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb48040348
PMID:42042008
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综述 | 系统分析了辐射响应启动子的分子机制、筛选策略及其作为辐射生物标志物的转化应用 | 首次将辐射响应启动子分为五大类并系统比较其调控逻辑、剂量响应特征及临床部署证据,提出了区分生物标志物导向与工具导向的报告基因系统的双轨框架 | 缺乏临床级验证、标准化剂量响应曲线缺失、可重复性不足 | 系统梳理辐射响应启动子的分子机制与筛选策略,评估其在辐射生物标志物开发中的转化潜力 | 辐射响应启动子 | 数字病理学 | NA | 功能基因组学与转录组学、表观遗传修饰分析、合成生物学启动子工程 | NA | 文本 | NA | 合成生物学启动子工程 | NA | 辐射响应启动子回路 | 医学 |
| 19 | 2026-04-30 |
Minor groove tetrads: a potent and versatile capping interaction for i-motif structures
2026-Feb, Biophysical reviews
IF:4.9Q1
DOI:10.1007/s12551-026-01406-1
PMID:41909615
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review | 综述了小沟四联体(MGTs)作为i-motif结构封盖相互作用的强效多功能机制 | 揭示了MGT能稳定i-motif结构,使其在中性pH下折叠,并仅用两个C:C⁺对形成紧凑构型,同时可逆pH响应且不扭曲B-DNA几何结构 | 尚未提供体内应用的长期稳定性数据或在复杂生物环境中的直接验证 | 探索小沟四联体在i-motif工程中的稳定机制及其在纳米技术和合成生物学中的应用潜力 | 小沟四联体与i-motif DNA结构的相互作用 | 合成生物学 | NA | 荧光光谱、化学修饰(2'-氟取代、荧光胞苷类似物) | NA | NA | NA | NA | NA | i-motif纳米结构(含MGT封盖) | 生物传感, 纳米技术, 合成生物学 |
| 20 | 2026-04-30 |
AI-Driven De Novo Binder Design: From Structure Prediction to Closed-Loop Optimization
2026, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.34133/csbj.0070
PMID:42052042
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综述 | 总结了人工智能驱动从头设计蛋白结合物的标准化技术栈,涵盖从结构预测到闭环优化的实用工作流程 | 系统整合了结构预测、蛋白质语言模型和扩散生成建模等前沿技术,提出了从计算设计到实验反馈的完整闭环优化框架 | 面临诱导契合、负设计和数据集偏差等关键挑战,端到端复合物生成尚未实现 | 综述人工智能驱动的从头蛋白结合物设计方法,建立标准化技术栈 | 蛋白结合物(包括抗体和非抗体支架,如单抗体和设计的锚蛋白重复蛋白) | 机器学习 | NA | 结构预测、蛋白质语言模型、扩散生成建模 | 扩散模型、蛋白质语言模型 | 蛋白质序列、蛋白质结构数据 | NA | NA | NA | NA | 医学、合成生物学 |