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当前共找到 5463 篇文献,本页显示第 1 - 20 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 工程工具 宿主生物 回路设计 应用领域
1 2026-08-02
Applying the design-build-test-learn framework to precision fermentation for sustainable food ingredients
2026-Aug, Food science and biotechnology IF:2.4Q3
综述 本文综述了设计-构建-测试-学习(DBTL)框架在精准发酵中的应用,用于可持续食品成分的合成,重点关注食品级微生物平台的开发。 系统性地将DBTL框架应用于食品级精准发酵,强调安全、法规和消费者接受度对菌株选择及工程策略的影响,并整合计算设计、自动化构建、高通量测试和数据驱动学习。 未提及具体局限性,可能缺乏对工业规模化挑战或法规细节的深入讨论。 探讨DBTL框架作为系统性迭代方法,用于开发食品级微生物细胞工厂,生产可持续的食品成分,如替代蛋白、风味化合物和功能性碳水化合物。 食品级微生物菌株,用于精准发酵生产可持续食品成分。 合成生物学 NA 精准发酵 NA 文献数据 NA NA 微生物 DBTL循环(设计-构建-测试-学习) 食品工业
2 2026-08-02
From Circuits to Symphonies: A Systems-Engineering Blueprint for Multimicrobial Synthetic Biology
2026-Jul-31, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
观点文章 提出一个以交响乐为灵感的系统工程框架,用于多微生物合成生物学,组织联合体设计跨四个协调层,并提供一个模块化工程蓝图来指导合成微生物联合体的构建、稳定和优化 提出一个交响乐启发的系统级工程框架,将联合体设计组织为沟通、时间调控、生态结构和预测建模四个协调层,并提供一个模块化而非规定性的蓝图,以根据应用需求部署不同协调层 框架是模块化而非规定性,未提供具体实施方案;受限于代谢物运输、种群漂移、参数不确定性和过程规模实施等约束 为多微生物合成生物学提供系统级工程框架,指导合成微生物联合体的设计、稳定和优化,以应对超越细胞内遗传电路的生态、时间和空间动态 合成微生物联合体及其工程协调层 合成生物学 NA NA 混合建模 NA NA NA NA 振荡器 工业生物技术,环境,医学
3 2026-08-02
Beyond the parasite: reframing cutaneous leishmaniasis as a host-microbiome-vector ecosystem
2026-Jul-31, International journal of pharmaceutics IF:5.3Q1
综述 本文综述了皮肤利什曼病(CL)的疾病结果如何由宿主免疫、利什曼原虫和宿主-白蛉微生物组之间的动态相互作用决定,并探讨了从单一感染模型转向宿主-微生物-寄生虫整合模型的治疗策略,包括工程和合成生物学方法以及人工智能驱动的框架。 将皮肤利什曼病重新定义为宿主-微生物组-媒介生态系统,并提出整合工程平台与人工智能引导的系统级治疗策略,以应对传统治疗的局限性。 未详细讨论具体实验数据或临床验证结果,综述性质可能缺乏实证支持。 提出皮肤利什曼病治疗的系统级策略,整合宿主-微生物-寄生虫-媒介因素及人工智能工具,以减少全球疾病负担。 皮肤利什曼病及其宿主、利什曼原虫、宿主-白蛉微生物组和媒介(白蛉)生态系统。 数字病理学, 机器学习 皮肤利什曼病 合成生物学, 人工智能 NA 文本 NA 合成生物学 白蛉 NA 医学, 环境
4 2026-08-02
Gram-scale production of forskolin in yeast through biosynthetic network elucidation and pathway optimization
2026-Jul-31, Bioresource technology IF:9.7Q1
研究论文 本研究通过阐明佛司可林生物合成网络并优化下游途径,在酵母中实现了克级规模生产,最终在5升生物反应器中达到2.7 g/L的最高产量。 首次阐明了佛司可林生物合成中三个细胞色素P450介导多位点氧化的复杂网络,并通过多维度工程策略(包括中心碳流优化、限速酶工程、P450电子传递链强化和发酵优化)显著提高了产量,达到目前报道的最高滴度。 摘要未明确提及局限性,但可推测可能存在对复杂代谢网络理解的不足或P450催化活性仍需进一步改进。 通过合成生物学方法实现佛司可林在酵母中的可持续高效生产,并阐明其生物合成途径。 佛司可林及其生物合成途径中的关键酶(P450s)和酵母宿主。 合成生物学 骨质疏松、心血管疾病、代谢综合征 NA NA NA NA NA 酿酒酵母 佛司可林生物合成途径(包括P450介导的多位点氧化) 医药、营养保健品
5 2026-08-02
Caffeinated Coli: Inspiring the Next Generation of Scientists through Synthetic Biology
2026-Jul-21, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了一个名为“Caffeinated Coli”的教育模块,通过合成生物学和遗传工程,将探究式学习引入高中课堂,学生使用经改造的细菌进行生物测定实验,以测量液体中的咖啡因含量。 该模块创新地将合成生物学实验引入高中教育,使用仅依赖咖啡因生长的基因工程菌株作为教学工具,并遵循NGSS标准,适应不同水平的生物学课程。 本文未提及模块的局限性,如实验条件限制或学生接受度的差异。 通过教育模块激发高中生对科学、技术、工程和数学(STEM)的兴趣,并引入21世纪的生物学研究。 高中生、参与教师、基因工程改造的大肠杆菌菌株。 教育、合成生物学 NA 生物测定实验,包括细菌培养和生长测量。 NA 实验数据(细菌生长测量)、问卷反馈。 过去两个学年在德克萨斯州8所高中实施。 NA 大肠杆菌 NA 教育
6 2026-08-02
Bacillus-derived antimicrobial peptides as alternatives to antibiotics in poultry: mechanisms, applications, and future prospects- a review
2026-May-23, Archives of microbiology IF:2.3Q3
综述 本文综述了芽孢杆菌来源的抗菌肽作为家禽生产中抗生素替代品的多样性、结构特征、生物合成、作用机制及其应用前景。 系统总结了芽孢杆菌抗菌肽的多种作用机制,包括膜靶向、生物膜调控、免疫调节和防霉菌毒素肠损伤,并提出了基因组挖掘、合成生物学和计算设计相结合的未来开发方向。 抗菌肽活性受肽类、配方、微生物生态和宿主生理因素影响,且存在肽不稳定性、体内疗效差异、菌株差异、安全性问题及缺乏标准化比较模型等转化挑战。 评估芽孢杆菌抗菌肽作为家禽生产中抗生素替代品的潜力,并总结其机制和未来研究方向。 芽孢杆菌来源的抗菌肽,包括核糖体合成的细菌素和非核糖体合成的脂肽(如表面活性素、伊枯草菌素和丰原素)。 微生物学、合成生物学 肠道感染、抗微生物耐药性、霉菌毒素相关肠损伤 基因组挖掘、合成生物学、计算肽设计 NA 文献数据 NA 合成生物学 家禽 NA 农业、食品、医药
7 2026-08-02
Green Drug Discovery: Leveraging Biodiversity for Sustainable Pharmaceutical Solutions
2026-Jan, Chemistry & biodiversity IF:2.3Q3
综述 本文探讨了绿色制药的变革潜力,整合生物多样性、绿色化学、生物技术和人工智能,以实现可持续的药物发现与生产 提出下一代绿色制药概念,整合生物多样性、绿色化学、生物技术和AI,以促进环保高效的药物生产过程 面临生物勘探伦理问题、保护工作和生物多样性资源公平惠益分享等挑战 探索绿色制药在推动可持续医药未来中的作用 植物、微生物和海洋生物中的生物活性化合物 机器学习和人工智能 不适用 CRISPR基因编辑、代谢工程、生物催化、超临界流体萃取 不适用 不适用 不适用 CRISPR-Cas9 不适用 不适用 医药
8 2026-08-01
Development, optimization, and application of an episomal plasmid system for Rhodotorula toruloides
2026-Sep, Metabolic engineering IF:6.8Q1
研究论文 本文首次为红冬孢酵母(Rhodotorula toruloides)开发了功能性附加体质粒系统,并优化了转化效率,实现了多基因途径表达和CRISPR基因组编辑。 首次构建了R. toruloides的附加体质粒系统,通过筛选多种来源的自主复制序列(ARS)鉴定出功能元件C63F4,并开发了Cre-loxP介导的体内再环化策略以提高转化效率,同时建立了简化的CRISPR无缝基因组编辑工具。 文中未提及明确的局限性,但可能包括质粒稳定性和拷贝数仍有提升空间,以及系统对其他菌株的适用性未知。 开发并优化红冬孢酵母的附加体质粒系统,以加速代谢工程、合成生物学和基础研究。 红冬孢酵母(Rhodotorula toruloides)菌株CBS14及其工程改造。 合成生物学 NA NGS(用于筛选ARS)、CRISPR-Cas9 NA 基因序列、质粒稳定性数据、基因表达数据 筛选了多种来源的候选ARS,具体样本数未提及 CRISPR-Cas9、Cre-loxP系统 红冬孢酵母(Rhodotorula toruloides) 附加体质粒系统pC63F4,包含自主复制序列(ARS)C63F4、GFP报告基因、多基因代谢途径(用于三乙酸内酯、脂肪醇和柠檬烯生产)、以及基于CRISPR的基因组编辑工具 工业生物技术、代谢工程
9 2026-08-01
A plug-and-play cytochrome P450 system enables de novo biosynthesis of 2-phenylethanol derivatives
2026-Sep, Metabolic engineering IF:6.8Q1
研究论文 开发了一种基于细胞色素P450的即插即用系统,通过定向进化和代谢工程,在解脂耶氏酵母中实现了2-苯乙醇衍生物的从头生物合成 通过结构引导的酶工程实现了P450BM3的区域发散性羟基化,具有高区域选择性和对映选择性;在5升生物反应器中实现了最高产量;意外发现糖基转移酶的混杂活性,促进了红景天苷和2-苯乙基-β-D-吡喃葡萄糖苷的创纪录生产 摘要中未提及明确的局限性 开发可扩展和适应性强的即插即用氧化生物催化系统,用于可持续生产高价值芳香族化合物 2-苯乙醇衍生物,包括(R)-1-苯基乙二醇、酪醇、红景天苷和2-苯乙基-β-D-吡喃葡萄糖苷 合成生物学 NA 定向酶进化、结构引导的蛋白质工程、代谢工程 NA 文本、实验数据 不适用 CRISPR-Cas9 解脂耶氏酵母 细胞色素P450驱动的羟基化途径 工业生物技术
10 2026-08-01
Evolution-guided high yield production of potent Gαq/11-signalling inhibitors FR900359 and YM-254890
2026-Sep, Metabolic engineering IF:6.8Q1
研究论文 本文通过进化引导的合成生物学策略,开发了稳健的异源微生物系统,用于高产生产Gαq/11信号抑制剂FR900359和YM-254890 首次采用进化引导策略,利用未培养微生物来源和链霉菌强启动子,实现了FR900359和YM-254890在异源宿主中的高产生产,并开发了双拷贝BGC宿主以进一步提高产量 未明确提及,但可能涉及异源宿主的生产稳定性或BGC组装复杂性 开发高产、成本效益高的微生物生产系统,用于生产Gαq/11信号抑制剂FR900359和YM-254890,以促进其生物技术应用和药物开发 FR900359和YM-254890的生物合成基因簇,以及异源宿主Burkholderia gladioli Δgbn::attB和Δgbn::2attB 合成生物学 Gα突变肿瘤 异源表达、基因簇组装、启动子工程 NA 序列数据、产量数据 多个BGC构建体和两种异源宿主菌株 CRISPR-Cas9 Burkholderia gladioli 生物合成基因簇的异源表达和双重拷贝 医学、工业生物技术
11 2026-08-01
Genetic code expansion: Bridging synthetic biology precision and cellular complexity to decipher molecular mechanisms of diseases
2026-Aug, Current opinion in chemical biology IF:6.9Q1
综述 本文综述了遗传密码扩展技术在疾病生物学研究中的最新进展,重点介绍其如何通过定点引入非天然氨基酸来解析动态蛋白互作、翻译后修饰和信号事件,并讨论该技术面临的挑战及未来发展方向 强调遗传密码扩展技术作为合成生物学平台,在生理相关环境中以高时空精度剖析疾病分子机制的独特优势,并展望新兴方法学 遗传密码扩展技术在更广泛应用中仍面临关键挑战,如效率、特异性和体内适用性等限制 探讨遗传密码扩展技术在疾病机制研究中的应用潜力和局限,提出其作为转化性合成生物学平台的愿景 疾病相关的分子通路、蛋白质相互作用、翻译后修饰和信号事件 合成生物学 多种疾病(未具体指明) 遗传密码扩展 NA NA NA 非天然氨基酸定点掺入 活体系统(如细胞) 遗传密码扩展系统 医学
12 2026-08-01
Discovery and engineering of polymerases and ligases for the synthesis of modified nucleic acids
2026-Aug, Current opinion in chemical biology IF:6.9Q1
综述 本文综述了利用工程化聚合酶和连接酶合成含非天然构建块的寡核苷酸的最新进展,并提供了一个简化生物催化剂家族脚手架发现的网络应用。 重点关注计算工具加速核酸修饰酶的发现与工程化,并提供了一个公开的网络应用以辅助生物催化剂家族探索。 未提及明确局限性。 综述酶促寡核苷酸合成中工程化聚合酶和连接酶的最新方法,并推动该领域的工具化应用。 寡核苷酸、聚合酶、连接酶、非天然构建块 合成生物学 NA 酶促合成 NA 文本 NA NA NA NA 医疗、诊断、合成生物学
13 2026-08-01
Synthetic DNA circuits for programming cell functions
2026-Aug, Current opinion in chemical biology IF:6.9Q1
综述 本文综述了合成DNA电路在细胞功能编程中的最新进展,重点介绍了DNA逻辑网络与细胞环境的整合,以实现对细胞功能的逻辑门控控制。 强调从体外演示向体内功能实施的范式转变,并探讨了将DNA电路与内源通路接口的策略。 未明确提及具体局限性。 探讨利用合成DNA电路编程细胞功能的方法,以推动精准治疗和自主生物制造的发展。 合成DNA电路及其在细胞环境中的集成。 合成生物学 NA NA NA NA NA NA NA 链置换、逻辑门、放大器、神经形态架构 医学、工业生物技术
14 2026-08-01
Exploring halophilic microorganisms for novel antimicrobial discovery: molecular mechanisms and computational approaches
2026-Jul-31, Folia microbiologica IF:2.4Q3
综述 本文综述了嗜盐微生物作为新型抗菌物质来源的潜力,涵盖其生态适应性、抗菌机制及组学和计算学发现方法 将生态适应性、非经典抗菌机制和现代组学及计算学发现流程整合为统一的抗菌物质发现框架 大多数已报道的化合物仍停留在体外阶段,体内验证进展有限 探索嗜盐微生物作为新型抗菌物质来源,以应对抗生素耐药性危机 嗜盐微生物及其产生的生物活性代谢物 微生物学 多重耐药菌感染 多组学、计算学发现流程 NA 文本 NA 合成生物学、代谢工程 嗜盐微生物 沉默生物合成通路激活 医学、工业生物技术
15 2026-08-01
De Novo Autogenic Engineered Living Functional Materials
2026-Jul-31, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
研究论文 本文介绍了一个基于蛋白质挖掘、计算建模和合成生物学的通用平台,用于从头设计自主工程活体功能材料(ELMs),实现了从非模式细菌中生物合成CsgA样ELMs,并展示了增强的机械性能、UV-C防护和可编程功能 通过分析33,564个CsgA样同源物,结合AlphaFold2和分子动力学模拟,实现从头设计自主功能ELMs,并从非模式细菌中生物合成分子量增加至9倍、β-折叠重复单元扩展的CsgA样蛋白,同时实现了3D打印性和选择性结合纳米颗粒及抗体的可编程功能 未明确说明局限性,但可能包括对非模式细菌中ELM合成的效率和生产规模限制 开发一个通用平台,用于发现、设计和利用天然生物分子系统,以推进下一代自主工程活体材料 大肠杆菌curli机器和CsgA样同源蛋白 合成生物学 NA AlphaFold2, 分子动力学模拟, 合成生物学 AlphaFold2 蛋白质序列数据 33,564个CsgA样同源物 CRISPR-Cas9 大肠杆菌 curli分泌途径重编程 材料科学, 生物技术
16 2026-08-01
Efficient rDNA-mediated multi-copy integration of gene clusters in Aureobasidium melanogenum
2026-Jul-30, Journal of biotechnology IF:4.1Q2
研究论文 本研究利用Aureobasidium melanogenum的核糖体DNA(rDNA)序列作为同源重组位点,实现了基因簇的多拷贝整合,并提高了黑色素产量 首次在Aureobasidium melanogenum中利用rDNA序列作为同源重组位点,实现大片段基因簇的多拷贝整合,并显著提高目标基因的表达稳定性和代谢产物的产量 研究仅限于Aureobasidium melanogenum,未在其他非传统酵母中验证该方法的通用性 开发一种在Aureobasidium melanogenum中高效整合大片段基因簇的方法,以促进该底盘细胞的代谢工程改造 Aureobasidium melanogenum的rDNA位点,以及gfp基因、pks基因和黑色素合成基因簇 合成生物学 NA 同源重组、rDNA介导的多拷贝整合 NA 基因序列、表达数据 包含gfp(0.7kb)和pks(7.0kb)基因,以及11.0kb基因簇,拷贝数分别为7.0、8.0和15.0 CRISPR-Cas9 Aureobasidium melanogenum NA 工业生物技术
17 2026-08-01
Converging quality by design, artificial intelligence, and biofoundry automation: A new paradigm for scalable circular biomanufacturing
2026-Jul-30, Biotechnology advances IF:12.1Q1
综述 本文评述了合成生物学中质量设计、人工智能和自动化生物铸造的融合,探讨了如何将设计-构建-测试-学习循环从研究工具转变为工业发展框架,并分析了扩大规模、监管和社会瓶颈,以推动循环生物制造。 强调质量设计、人工智能和生物铸造自动化的三者融合是当前领域发展的关键,而不仅仅是单一技术;并对比了欧盟和美国的监管框架对技术采用的影响。 未提及具体技术细节或数据,缺乏实证分析,可能受益于更具体的数据支持。 探讨合成生物学从实验室创新到工业规模循环生物制造的路径,并确定未来十年需满足的要求以支持循环生物经济。 合成生物学产品(包括微生物、植物和动物系统)和设计-构建-测试-学习循环。 合成生物学 不适用 人工智能辅助生物设计,生物铸造自动化 不适用 不适用 不适用 不适用 微生物、植物、动物系统 设计-构建-测试-学习循环 工业生物技术
18 2026-08-01
In vitro properties of large serine integrase hybrids derived from ϕC31 and TG1 integrases
2026-Jul-17, Nucleic acids research IF:16.6Q1
研究论文 本研究报道了由ϕC31和TG1整合酶衍生的杂合整合酶的体外活性,这些酶能高效重组杂合attP×attB底物,同时通过TG1来源的卷曲螺旋结构域保持与同源重组方向性因子(RDF)的相互作用。 提出了一种模块化框架,用于工程化具有定制特异性的丝氨酸整合酶,通过杂合整合酶保留底物识别和方向性控制,为设计靶向自定义基因组位点的重组酶提供了新策略。 研究仅限于体外活性分析,未涉及体内应用;杂合整合酶的特异性可能受限于现有att位点识别基序。 探索杂合丝氨酸整合酶的可编程性,以实现对自定义基因组位点的精确重组。 ϕC31和TG1整合酶及其杂合变体,以及对应的杂合attP和attB底物。 合成生物学,基因组工程 NA 体外重组活性分析 NA 实验数据(重组效率、底物特异性) 未明确(涉及多种杂合整合酶和底物组合) NA NA 杂合整合酶系统,用于位点特异性重组 合成生物学,基因组工程
19 2026-08-01
Small Regulatory RNAs in Prokaryotes: Key Features, Identification, Environmental Roles, and Applications
2026-Jul-16, Microorganisms IF:4.1Q2
综述 该综述整合了海洋和环境原核生物中小调控RNA的计算预测、宏组学发现和合成生物学应用,提供了从识别到功能和工程应用的多层次视角 区别于以往侧重模式生物的综述,本文聚焦海洋和环境原核生物,整合了计算预测、宏组学发现和合成生物学应用,并批判性评估了sRNA识别工具,强调了减少假阳性预测的策略 未明确说明 全面综述原核生物sRNA生物学,强调其在环境适应和生物技术应用中的关键作用,并为菌株工程提供资源 海洋和环境原核生物中的小调控RNA(sRNA) 生物信息学 NA 计算预测、宏基因组学、宏转录组学 NA 基因组序列、转录组数据 未明确说明 合成RNA工程 未明确说明 合成sRNA调控元件 工业生物技术、环境科学
20 2026-08-01
Global Research Trends on Polyhydroxyalkanoate-Producing Microorganisms: A Bibliometric and Scientometric Analysis of Sustainable Bioplastic Biotechnology
2026-Jul-15, Microorganisms IF:4.1Q2
研究论文 通过文献计量和科学计量方法,分析2014至2025年间全球关于聚羟基脂肪酸酯产生微生物及其在生物基包装中应用的研究趋势。 采用Scopus数据库结合Bibliometrix和VOSviewer工具,揭示研究主题从基础生理和分类学向代谢工程、合成生物学及量子建模等新兴方向的转变,并识别关键的技术空白。 研究存在下游加工挑战、混合微生物群落管理困难以及资金不足等限制,影响PHAs的商业可扩展性和可持续性。 评估全球PHA产生微生物研究的产出、合作网络及主题演变,并指出未来研究重点以克服经济和技术的瓶颈。 关于聚羟基脂肪酸酯产生微生物的研究文献及其在生物基包装中的应用。 机器学习 不适用 文献计量分析 不适用 文献数据 2014-2025年间发表的学术论文 CRISPR-Cas9 不适用 不适用 环境, 材料
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