合成生物学相关文章
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当前共找到 5284 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-07-03 |
Deploying Artificial Metalloenzymes in Complex Environments: Strategies and Applications
2026-Jul-14, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.70446
PMID:42390013
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综述 | 本文综述了人工金属酶在复杂环境（如细胞裂解液、全细胞催化剂和活体动物）中的部署策略与应用，重点介绍其设计原理、突破及未来机遇 | 系统总结了人工金属酶在三种复杂生物环境中的稳定化与适配策略，并展望其在合成生物学、化学生物学及生物医学研究中的进展 | 未详细讨论金属辅因子毒性、细胞代谢干扰等实际应用中的具体挑战量化分析 | 探讨人工金属酶在复杂环境中保持功能鲁棒性的策略及其在化学生物学和治疗学中的应用潜力 | 人工金属酶（ArMs）及其在不同场景（细胞裂解液、全细胞催化剂、活体动物）中的部署 | 化学生物学、合成生物学 | NA | 金属蛋白工程、蛋白设计 | NA | NA | NA | 金属辅因子修饰、蛋白工程 | 大肠杆菌、哺乳动物细胞（推测基于细胞裂解液和全细胞催化剂场景） | 人工金属酶催化回路（如非天然反应催化通路） | 化学生物学、生物医学、合成生物学 |
| 2 | 2026-07-03 |
Inhibitors of nutrient pathways: nature's overlooked antibiotic arsenal
2026-Jul-02, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d6np00036c
PMID:42387997
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综述 | 回顾了抑制营养代谢途径的天然产物抗生素，并将其分类为四种机制类别 | 首次系统整理并分类了抑制营养代谢途径的天然抗生素，强调其结构多样性和未被充分利用的治疗潜力 | 未详细讨论每种化合物的具体合成途径或临床前研究结果，且部分数据可能受历史方法学偏差影响 | 重新审视并整合营养途径抑制剂作为抗生素发现的新来源，以应对耐药性挑战 | 73类天然产物化合物 | 天然产物化学, 微生物学 | 细菌感染性疾病 | 全细胞活性测试, 基因组挖掘, 合成生物学 | NA | 化合物结构数据 | 73类化合物 | NA | NA | NA | 医学 |
| 3 | 2026-07-03 |
Turbocharging fundamental science translation through controlled environment agriculture
2026-Jul, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2025.08.014
PMID:41033905
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综述 | 该文章探讨了可控环境农业如何加速植物科学突破从实验室到农业应用的转化 | 系统性阐述了可控环境农业作为研究平台和生产系统的双重角色，重新构想作物设计，实现不依赖季节和昼夜节律的增强光合作用、资源与代谢效率提升、定制植物架构及高价值化合物可靠生产 | 文章指出可控环境农业在整合新兴育种、基因组学和合成生物学工具方面仍面临挑战，但未详细说明具体局限性 | 综述可控环境农业在加速基础科学发现向农业应用转化中的进展与挑战 | 基于可控环境农业的作物设计，包括增强光合作用、资源与代谢效率、植物架构及高价值化合物生产 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 基因组编辑工具, 合成生物学工具 | 植物 | 代谢途径 | 农业, 环境 |
| 4 | 2026-07-03 |
Chromoproteins: visible tools for advancing synthetic biology
2026-Jul, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.10.020
PMID:41309430
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评论文章 | 综述了色蛋白在合成生物学中的最新进展，包括其理化性质、分类、工程策略和新兴应用 | 系统阐述了色蛋白作为可见报告因子的独特优势，并展望其通过理性设计推动合成生物学平台发展的潜力 | 当前色蛋白变体的发现和设计仍需进一步推进，以满足更模块化和可及的应用需求 | 总结色蛋白研究进展并探索其在合成生物学中的应用 | 色蛋白及其变体 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 原核生物, 真核生物 | 可见报告因子 | NA |
| 5 | 2026-07-03 |
CRISPR as a next-generation environmental biosurveillance tool for air, land, and water
2026-Jul, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.11.014
PMID:41421891
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综述 | 本文综述了CRISPR技术在环境生物监测中的应用，提出其作为下一代空气、土地和水体监测工具的发展路线图 | 整合CRISPR技术、计算科学、合成生物学和生物监测领域的交叉进展，提出战略路线图以建立CRISPR-eBx作为一线生物监测解决方案 | 文中指出的关键挑战包括部署到新颖生物/基因靶标和环境源时需解决的问题 | 评估CRISPR在环境生物监测中的潜力并构建战略路线图 | 环境核酸中的生物体，包括病原体、入侵物种和濒危物种 | 机器学习 | NA | CRISPR | NA | 环境核酸数据 | NA | CRISPR-Cas | NA | 生物传感器 | 环境监测, 生物监测 |
| 6 | 2026-07-03 |
A synthetic biology roadmap for sustainable production of the plant-originated anti-cancer drug paclitaxel
2026-Jul, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.11.013
PMID:41506928
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综述 | 探讨合成生物学在可持续生产植物源抗癌药物紫杉醇中的应用路线图 | 提出利用非常规底盘（如植物相关蓝细菌和丝状真菌）增强P450兼容性，并构建融合无细胞系统、合成微生物群落、杂合化学酶合成和机器学习等先进工具的实用框架 | 尚未通过实验验证所提策略的可行性，且紫杉醇生物合成途径的复杂性仍是主要瓶颈 | 提出合成生物学路线图以实现紫杉醇的可持续生产 | 紫杉醇及其生物合成途径 | 合成生物学 | 癌症 | 合成生物学、无细胞系统、机器学习 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 植物相关蓝细菌, 丝状真菌 | 代谢途径、生物传感器 | 医学 |
| 7 | 2026-07-03 |
Construct design for precise DNA insertion in plants
2026-Jul, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2026.01.005
PMID:41846181
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综述 | 本文综述了植物基因组中精确DNA插入的构建设计原则与策略 | 系统评估了短片段、大片段及多片段插入方法的特点与构建要求，并探讨将非植物先进技术用于提升植物敲入效率和精确性的潜力 | 未提供实验验证结果，且主要基于现有文献分析，缺乏对新型技术的直接比较 | 为植物合成生物学、遗传学及作物改良中的精确DNA插入提供构建设计指导 | 植物基因组中的靶向DNA插入方法 | NA | NA | 靶向DNA插入、敲入 | NA | NA | NA | NA | 植物 | NA | 农业、合成生物学 |
| 8 | 2026-07-03 |
A synthetic cell microreactor with two types of interacting dynamic DNA-based pores
2026-Jul, Nature chemistry
IF:19.2Q1
DOI:10.1038/s41557-026-02124-7
PMID:42141071
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研究论文 | 构建了一种具有两种相互作用的动态DNA基孔的双颈合成细胞微反应器，用于模拟细胞膜动态功能并执行多步生化反应 | 通过光响应小孔和自排列可密封大孔的协同信号通路，实现时空精确控制的分子序贯递送，并展示了超越自然系统的三维DNA晶体合成 | 未提及长期稳定性、扩展至更多孔类型或体内应用的挑战 | 通过动态膜组件重建细胞复杂性，推进合成生物学和仿生纳米技术 | 双颈合成细胞微反应器（DCM）及其膜上的两种动态DNA基孔 | 合成生物学 | NA | DNA纳米技术 | NA | NA | NA | DNA纳米结构自组装 | 巨单层囊泡（GUV） | 双重DNA基孔系统（光响应小孔+自排列可密封大孔）协同信号通路 | 合成生物学, 生物纳米技术 |
| 9 | 2026-07-03 |
Inorganic nanomaterials empowering bacteria: a new paradigm for biomedical applications
2026-Jul-01, Journal of materials chemistry. B
DOI:10.1039/d6tb00687f
PMID:42301118
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综述 | 本文综述了利用无机纳米材料赋予细菌新功能以构建杂合系统的策略及其在生物医学中的应用 | 提出了通过无机纳米材料为细菌提供物理保护、增强多模态成像和引入光热/磁热协同治疗等新机制，构建功能性杂合系统，推动了细菌疗法向临床转化 | 目前杂合系统的生物安全性和临床转化仍面临挑战，需进一步研究 | 探讨无机纳米材料赋能细菌构建智能杂合系统，用于诊断和治疗应用，为下一代生物医学平台奠定基础 | 无机纳米材料与细菌构建的杂合系统 | 机器学 | 肿瘤、耐药菌感染、肠道菌群失调 | NA | NA | NA | NA | 表面修饰、细胞内矿化、微胶囊包封 | 细菌 | NA | 医学 |
| 10 | 2026-07-03 |
Advances and prospects in cell therapy for cancer: explorations from T cells to stem cells
2026-Jul-01, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-026-02780-8
PMID:42380095
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综述 | 系统概述了从T细胞到干细胞的各种癌症细胞治疗策略的最新进展、作用机制和临床转化 | 综合性分析了细胞治疗从自体到通用型、从血液肿瘤到实体瘤、从体外到体内工程化的扩展趋势，并纳入新兴技术如多组学、人工智能和合成生物学的整合 | 肿瘤异质性、免疫抑制微环境和治疗相关毒性仍是主要挑战 | 总结癌症细胞治疗领域的最新进展并展望未来方向 | T细胞（CAR-T、TCR-T、TILs、γδT细胞）、NK细胞、巨噬细胞、树突状细胞、B细胞和干细胞 | 数字病理学 | 癌症 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 11 | 2026-07-03 |
Machine learning-guided discovery of poly(ethylene terephthalate)-binding modules to enhance durable whole-cell degradation
2026-Jul-01, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.135279
PMID:42385911
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研究论文 | 通过机器学习辅助方法发现能与聚对苯二甲酸乙二醇酯（PET）结合的模块，从而增强大肠杆菌全细胞对 PET 的降解能力 | 首次将机器学习模型与基于profile隐马尔可夫模型的同源搜索相结合，从天然蛋白质中挖掘PET结合模块，并验证了其在提高酶吸附和全细胞催化效率方面的有效性 | 该研究主要基于大肠杆菌表面展示系统，可能在其他宿主或工业条件下的适用性有限；且未探讨模块的长期稳定性或对环境因素的影响 | 开发可重复使用的全细胞生物催化剂，用于PET的高效降解和塑料回收 | 从天然蛋白质中筛选PET结合模块，特别是糖类结合模块家族13中的候选物 | 机器学习, 合成生物学 | NA | 机器学习, 同源搜索, 分子对接, 分子动力学模拟, 表面展示 | PET水解酶机器学习模型（PETML） | 蛋白质序列数据, 蛋白质结构数据 | 197个非冗余候选序列用于对接筛选，1个优选模块（tCBM13-1）进行实验验证 | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly | 大肠杆菌 | 双锚蛋白系统（OmpA和EhaA）用于共展示PET结合模块与FAST-PETase | 环境, 工业生物技术 |
| 12 | 2026-07-03 |
Acoustic cavitation-enhanced lymphatic trafficking of inhaled bacterial-sourced biohybrid vaccines for antitumor immunity
2026-Jul-01, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2026.06.007
PMID:42386468
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研究论文 | 提出一种结合合成生物学与声学工程的生物杂交纳米疫苗平台，实现非侵入性气道至淋巴结的疫苗接种策略以增强抗肿瘤免疫 | 利用工程化非致病性大肠杆菌作为活体抗原工厂，结合超声响应性锰螯合细菌膜纳米囊泡，通过低频超声触发声学液滴汽化，实现空化增强的淋巴转运，克服肺部生理屏障 | 可能涉及工程菌株的安全性和超声设备的临床转化挑战 | 开发下一代个性化免疫治疗的吸入式疫苗 | 工程化大肠杆菌TOP10菌株、肿瘤抗原、小鼠肺部淋巴结 | 合成生物学 | 癌症 | 声学液滴汽化、纳米囊泡包裹 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 大肠杆菌TOP10 | 细菌膜纳米囊泡作为抗原递送载体 | 医学 |
| 13 | 2026-07-03 |
Advances, challenges, and opportunities in engineering C5 and C6 sugar transporters in yeast for bio-based industrial biotechnology
2026-Jul-01, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2026.2680416
PMID:42386498
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综述 | 综述了酵母中工程化C5和C6糖转运蛋白的进展、挑战和机遇，以用于生物基工业生物技术 | 总结了C5糖转运的主要瓶颈，并强调了通过理性蛋白质工程、定向进化和机器学习等方法扩展C5转运蛋白库的突破性进展 | 尽管已取得重要突破，但C5糖的高效转运仍是主要限制，包括转运蛋白对C5糖亲和力低、受葡萄糖强烈抑制及降解等问题 | 综述酵母中糖转运蛋白工程的最新进展，以解决C5糖高效转运的瓶颈，推动可持续生物基生产 | 酵母细胞及其中C5和C6糖转运蛋白 | 机器学习 | NA | 理性蛋白质工程、定向进化、机器学习 | NA | NA | NA | NA | 酿酒酵母 | 代谢路径工程 | 工业生物技术, 生物能源, 农业, 生物医学 |
| 14 | 2026-07-03 |
Bacterial degradation of aromatic ester pollutants in agro-ecosystems: implications for bioremediation
2026-Jul-01, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-026-13916-9
PMID:42387175
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综述 | 本文综述了农业生态系统中芳香酯类污染物的细菌降解机制及其在生物修复中的应用 | 结合合成生物学方法和细菌生态生理特性，提出增强原位降解的新策略 | 未提供具体的实验数据或定量分析，缺乏实际应用案例验证 | 阐述细菌降解芳香酯类污染物的遗传、代谢和进化机制，以及合成生物学在修复中的应用前景 | 芳香酯类污染物（芳香酸酯和芳香醇酯）及降解细菌 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 细菌 | NA | 农业, 环境 |
| 15 | 2026-07-03 |
Towards the construction of a virtual yeast
2026-Jul, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-026-10574-9
PMID:42387167
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研究论文 | 提出一个名为“虚拟酵母”的AI驱动智能体，通过整合多模态生物数据、机制推理和主动实验，模拟真核细胞行为 | 首次将大语言模型协调层与多个领域特定AI模块结合，构建闭环学习管道自主设计和执行实验，实现细胞行为的计算模拟 | 尚处于概念验证阶段，实际计算复杂度高，依赖数据质量和完整性 | 推进细胞生命计算模拟，优化生物合成途径，加速靶点发现和假设生成 | 酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae）作为遗传可操作和数据丰富的模式系统 | 机器学习， 合成生物学 | NA | NA | 大语言模型， 生成式模型， 表示学习模型 | 多模态生物数据（包括机制知识、亚细胞结构和动态状态） | NA | NA | 酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae） | 虚拟细胞模型（功能模块包括遗传、代谢和结构系统） | 合成生物学， 生物技术 |
| 16 | 2026-07-03 |
Rapid and Continuous Directed Evolution in Vibrio natriegens Utilizing an In Vivo Hypermutation System
2026-Jun-26, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00936
PMID:42362483
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研究论文 | 本研究在快速生长的非致病菌Vibrio natriegens中建立体内超突变系统MutaT7，实现连续定向进化 | 首次在Vibrio natriegens中建立MutaT7超突变系统，利用其极短的倍增时间将TEM-1蛋白的定向进化时间缩短至36小时 | NA | 建立基于Vibrio natriegens的快速连续定向进化平台 | Vibrio natriegens宿主菌株和TEM-1模型蛋白 | 合成生物学 | NA | MutaT7超突变系统 | NA | NA | NA | MutaT7 | Vibrio natriegens | 胞嘧啶脱氨酶与T7 RNA聚合酶融合蛋白 | 工业生物技术, 蛋白质工程 |
| 17 | 2026-07-03 |
Genome-Scale Metabolic Modeling of Terpenoid Biosynthesis: Advances and Perspectives
2026-Jun-26, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.6c03926
PMID:42362489
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综述 | 系统回顾了基因组规模代谢模型在萜类生物合成中的进展，涵盖四种典型微生物及未来发展方向 | 系统总结了GSMMs在模型微生物和非模型微生物中应用于萜类生产的进展，并讨论多约束模型及机器学习与合成生物学整合的前景 | 未提及具体的实验验证或模型性能比较，仅提供理论参考 | 为萜类细胞工厂的智能设计和高效构建提供理论参考 | 四种典型产萜微生物：大肠杆菌、酿酒酵母、蓝细菌和耶氏酵母 | 系统生物学, 合成生物学 | NA | 基因组规模代谢模型 | NA | 代谢模型 | NA | NA | 大肠杆菌, 酿酒酵母, 蓝细菌, 耶氏酵母 | 萜类合成代谢途径 | 医药, 农业, 能源, 食品 |
| 18 | 2026-07-03 |
Codon compression and novel codon creation for multiplex non-canonical amino acid incorporation
2026-Jun-24, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108961
PMID:42342169
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综述 | 系统分类多路非经典氨基酸整合的策略为自然密码子压缩和新型密码子创建两大框架 | 首次将多路非经典氨基酸整合策略系统分为两种框架，并提出结合部分密码子压缩、适应性实验室进化和AI辅助设计的综合未来路线 | 未提供实验验证或具体性能数据，仅进行理论评估 | 探讨实现多路非经典氨基酸整合的策略，克服遗传编码复杂性的限制 | 非经典氨基酸的多重整合、遗传密码扩展 | 合成生物学 | NA | 遗传密码扩展 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 蛋白工程、合成生物学 |
| 19 | 2026-07-03 |
Chemical Synthesis of Mirror-Image Proteins Reveals Chirality-Dependent Cellular Uptake Mediated by a Cell-Penetrating Peptide
2026-Jun-17, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.6c03792
PMID:42307060
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研究论文 | 通过化学合成镜像蛋白质，揭示了由细胞穿膜肽介导的细胞内化过程对手性依赖性的差异 | 首次系统研究了货物手性在细胞内化中的作用，通过保持恒定递送载体（cR10细胞穿膜肽）直接评估手性对摄取效率的影响 | 未明确讨论体内环境对手性依赖摄取的潜在影响，且研究仅限于体外细胞系实验 | 探究镜像肽和蛋白质在生物医学应用中，手性对细胞内化效率的影响 | 在L-和D-构型下合成的三种不同大小和结构复杂性的货物蛋白，并与细胞穿膜肽cR10偶联 | 合成生物学 | NA | 化学合成 | NA | 流式细胞术、凝胶分析、共聚焦显微镜图像 | 多种哺乳动物细胞系，具体样本量未说明 | NA | 哺乳动物细胞 | NA | 医学, 合成生物学 |
| 20 | 2026-07-03 |
The Origin of Life in the Light of Evolution
2026-May-08, ArXiv
PMID:42389247
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综述 | 从进化视角重新审视生命起源问题，强调必须研究生命如何从生物学前系统进化而来 | 将生命起源从单纯的化学问题拓展为进化问题，提出种群遗传学框架整合地理化学、前生物化学和分子生物学等多学科证据 | NA（标题与摘要未明确说明） | 批判性总结现有生命起源研究并倡导基于进化的研究议程 | 生命起源、最后普遍共同祖先（LUCA）、前LUCA进化史、原始代谢与自催化网络、原始细胞、翻译系统的出现、DNA基因组转变 | 进化生物学, 合成生物学 | NA | 比较基因组学, 系统发育学, 生物化学, 地球科学 | NA | NA | NA | 合成细胞 | NA | 前代谢与自催化网络、原始细胞 | 基础生物学 |