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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-08-04 |
Autonomous intranasal delivery systems for central nervous system therapeutics
2026-Aug-03, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-026-01781-5
PMID:42543397
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综述 | 本文综述了用于中枢神经系统治疗的自主动脉内给药系统,涵盖合成纳米颗粒、细胞外囊泡和活体治疗剂等策略。 | 强调通过纳米技术和合成生物学实现自主、可编程的鼻脑给药,模块化设计功能组件并整合宿主响应机制。 | 未明确讨论临床转化中的安全性、长期稳定性或实际人体验证。 | 探讨自主鼻内给药系统在治疗神经系统疾病中的潜力和设计原理。 | 自主鼻内给药系统,包括合成纳米颗粒、细胞外囊泡和活体给药剂。 | 合成生物学 | 神经系统疾病 | 纳米技术 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 2 | 2026-08-04 |
Mitigating chromium-induced oxidative stress in plants: a cross-talk between phytohormones and rhizospheric microbes
2026-Aug-03, International journal of phytoremediation
IF:3.4Q2
DOI:10.1080/15226514.2026.2703740
PMID:42545045
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综述 | 本文综述了六价铬诱导植物氧化应激的机制,以及植物激素与根际微生物之间的相互作用,并提出了缓解铬胁迫的策略 | 整合了多组学和合成生物学方法,提出了ACC脱氨酶AP2/ERF通路是PGPR介导的Cr(VI)耐受的关键途径,并揭示了植物激素组合策略优于单一激素 | 缺乏田间规模验证,所有有效性指标均为实验室估计,需要多季节农艺确认 | 总结Cr(VI)诱导的氧化应激机制,探讨植物激素与根际微生物在缓解铬胁迫中的协同作用 | 植物、根际微生物(PGPR) | 植物科学 | 重金属胁迫 | 多组学、合成生物学 | NA | 文献数据 | NA | 合成生物学 | 植物 | 植物激素与微生物信号通路 | 农业、环境 |
| 3 | 2026-08-04 |
Can Cells Be Fully Programmed and Engineered?
2026-Aug-02, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.70331
PMID:42543882
|
观点文章 | 本文从视角角度探讨了合成生物学中细胞编程和工程化的范式,提出应利用生物复杂性而非强制模拟硅基芯片,并展望了生物物理混合实体与生物安全措施的发展 | 提出将细胞视为动态计算资源而非刚性硅基芯片,倡导利用生物物理混合实体(如细胞-半导体壳、硅纳米线、聚合物水凝胶)增强细胞功能,并强调生物安全的重要性 | 作为观点文章,缺乏实验数据支持,主要基于理论论证和已有案例总结 | 探讨合成生物学中细胞编程和工程化的合理范式,主张顺应生物复杂性而非强制模拟数字计算 | 合成生物学中的细胞编程与工程化,包括生物物理混合实体(如细胞与半导体、硅纳米线、聚合物水凝胶的整合) | 合成生物学 | 癌症(提及癌症摧毁电路) | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 细胞电路(如癌症摧毁电路、爆炸物检测、炎症记录型益生菌电路) | 医学、环境、工业生物技术 |
| 4 | 2026-08-04 |
Harnessing human tumor organoids for cancer modeling and precision therapy
2026-Aug-01, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1093/procel/pwag007
PMID:41698840
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综述 | 本文综述了人类肿瘤类器官在癌症建模和精准治疗中的应用,涵盖其生成技术、应用及未来发展方向。 | 强调了肿瘤类器官作为转化医学平台的优势,并整合了微环境共培养系统、芯片类器官、3D生物打印和人工智能驱动分析等新兴技术。 | 完全模拟微环境仍具挑战,特别是血管复杂性和系统性免疫反应的复制。 | 探讨人类肿瘤类器官在癌症建模和精准治疗中的潜力,并推动其作为功能性精准医学工具的临床应用。 | 人类肿瘤类器官,包括患者来源的类器官、基因工程平台及正常组织和人多能干细胞来源的类器官。 | 数字病理学 | 癌症 | 类器官培养、共培养系统、器官芯片、3D生物打印、人工智能分析 | NA | 图像、文本、生物样本数据 | NA | NA | 人类细胞 | NA | 医学 |
| 5 | 2026-08-04 |
Peptide-Ligand Cooperative Interplay Drives Gold Nanoparticle Encapsulation by Protein Cages
2026-Aug, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.73690
PMID:42093323
|
研究论文 | 该论文通过实验和分子动力学模拟,研究了金纳米颗粒在encapsulin蛋白笼中的封装机制,揭示了配体与肽段的协同作用如何调控封装效率 | 首次从分子层面揭示肽-配体协同效应如何驱动金纳米颗粒在蛋白笼中的封装,并连接实验观察与自由能景观,为生物启发的纳米笼设计提供新见解 | 研究主要集中在初始结合阶段,未完全涵盖封装过程的后续动力学或体内应用场景 | 理解并控制金纳米颗粒在encapsulin蛋白笼中的封装机制,为选择性递送和模板合成提供设计指导 | 金纳米颗粒、encapsulin蛋白笼、封装肽 | 合成生物学、纳米技术 | NA | 分子动力学模拟 | 分子动力学模拟模型 | 实验数据、模拟数据 | 不同盐浓度和配体/肽功能化条件下的多个实验组 | NA | NA | NA | 合成生物学、生物催化、治疗递送 |
| 6 | 2026-08-04 |
Bioinspired Artificial Bioenergetic Organelles: Design Principles, Nanofabrication and Therapeutic Translation
2026-Aug, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.73889
PMID:42377939
|
综述 | 本文综述了基于线粒体和类囊体工程化的仿生生物能量细胞器的设计原则、纳米制造技术及其在疾病治疗中的应用,重点探讨其恢复细胞能量稳态的机制和转化挑战 | 提出生物能量细胞器作为主动重塑病理微环境的治疗平台,区别于传统纳米载体,通过整合代谢恢复和多靶点治疗作用实现疾病干预 | 关键转化挑战包括靶向递送、免疫相容性、功能持久性、生物安全性以及长期代谢命运等问题尚未解决 | 概述人工生物能量细胞器的设计原则、机制基础和疾病特异性应用,并讨论其转化前景 | 线粒体和类囊体工程化的生物能量细胞器 | 合成生物学 | 肿瘤、心血管疾病、神经退行性疾病、炎症性疾病 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 7 | 2026-08-04 |
From Circuits to Symphonies: A Systems-Engineering Blueprint for Multimicrobial Synthetic Biology
2026-Jul-31, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.76981
PMID:42536811
|
观点文章 | 提出一个受交响乐启发的系统工程框架,用于多微生物合成生物学,将群落设计组织在四个协调层面,并提供一个模块化工程蓝图,以指导合成微生物群落的构建、稳定和优化。 | 将多微生物工程重新定位为协调系统设计而非孤立的遗传控制问题,提出模块化而非规定性的框架,允许根据应用需求和环境复杂性部署不同的协调层。 | 讨论了代谢物运输、群体漂移、参数不确定性和过程规模实施等约束,但具体解决方案未详细展开。 | 为多微生物合成生物学提供结构化的系统工程框架,促进合成微生物群落在工业、环境和治疗领域的应用。 | 合成微生物群落(微生物聚生体)。 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 协调层包括通信、时间调控、生态结构和预测建模,设计涉及振荡控制、合成生态学等 | 工业、环境、医学 |
| 8 | 2026-08-04 |
Metabolic engineering strategies: utilizing different microbial strains and advanced technologies for the synthesis of high-valued terpenoids
2026-Jul-27, Antonie van Leeuwenhoek
DOI:10.1007/s10482-026-02389-5
PMID:42509354
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综述 | 本文综述了利用不同微生物菌株和先进技术合成高价值萜类化合物的代谢工程策略 | 系统总结了人工智能和机器学习在萜类代谢工程中的应用,包括途径预测、代谢通量优化、酶工程和瓶颈识别 | 未详细讨论具体菌株和技术的实验验证细节 | 探讨微生物生产萜类化合物的代谢工程策略,并强调计算方法的整合以优化菌株 | 微生物菌株及萜类生物合成途径 | 代谢工程、合成生物学 | NA | 基因工程、人工智能、机器学习 | AI/ML模型(未具体指定) | 基因组学、系统生物学数据 | NA | 基因编辑工具(未具体指定) | 微生物宿主(如大肠杆菌、酵母等,未具体列出) | 萜类生物合成途径的异源重构和代谢通量重定向 | 医药、营养保健品、化妆品、农业、香料、生物燃料 |
| 9 | 2026-08-04 |
Design guide for synthetic small regulatory RNAs for high-efficiency gene knockdown in bacteria
2026-Jul, Journal of microbiology (Seoul, Korea)
DOI:10.71150/jm.2603026
PMID:42543183
|
研究论文 | 本文提供了一个设计合成小调节RNA(sRNAs)的详细指南,以实现细菌中高效基因敲低 | 提出了综合的sRNA设计原则和关键优化因素,包括支架选择、目标mRNA结合亲和力、目标mRNA二级结构和Hfq表达水平,并强调跨物种适用性 | 文中未提及具体实验数据或验证,可能缺乏实际应用中的性能评估 | 提供一套详细的协议,用于设计和构建合成sRNA,以在细菌中实现高效基因敲低 | 合成小调节RNA(sRNAs)及目标基因mRNA | 机器学习 | NA | 合成生物学设计 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌及其他细菌宿主 | 合成小调节RNA(sRNA)基因敲低系统 | 合成生物学、代谢工程 |
| 10 | 2026-08-04 |
Leveraging synthetic biology for the commercialization of renewable fuels and chemicals aligning sustainable development goals
2026, Preparative biochemistry & biotechnology
IF:2.0Q3
DOI:10.1080/10826068.2025.2578270
PMID:41191734
|
综述 | 本文综述了合成生物学在可再生燃料和绿色化学品商业化中的应用,重点探讨其如何通过DNA建模、代谢工程和微生物发酵的进步,优化来自非粮食原料(如木质纤维素生物质)的生物燃料生产,并分析行业现状与挑战。 | 从合成生物学视角系统探讨生物燃料和生物化学品商业化的潜力,强调非粮食原料的应用及可持续发展目标的协同,并聚焦菌株工程优化和产业化挑战。 | 综述未包含具体的实验数据或案例量化分析,对生物安全、知识产权等挑战的讨论较为概览性。 | 探讨合成生物学在生物燃料和绿色化学品生产中的作用,评估其实现商业化及支持可持续发展的可能性。 | 产乙醇等生物燃料的工程微生物菌株,包括大肠杆菌和酿酒酵母等。 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、DNA建模、微生物发酵 | NA | 综述性文献 | NA | NA | 大肠杆菌、酿酒酵母 | NA | 能源、工业生物技术 |
| 11 | 2026-08-04 |
Parallel DLD microfluidics for chloroplast isolation and sorting
2025-09-09, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d5lc00348b
PMID:40497380
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研究论文 | 本文介绍了一种基于确定性侧向位移(DLD)的微流控平台,用于通过大小分离叶绿体,实现高效、自动化的叶绿体分离和分类。 | 该平台集成了四个具有不同临界直径的平行DLD阵列,实现带通滤波和同时分离不同大小的叶绿体,提高了可重复性,并避免了传统蔗糖密度梯度方法缺乏精确大小分离的缺点。 | 分离效率在50-85%之间,纯度在17-66%之间,表明仍有提升空间,可能受限于样本复杂性和微流控设计。 | 开发一种基于微流控的叶绿体分离方法,用于植物研究、生物技术和合成生物学应用。 | 叶绿体,大小范围3至8微米。 | 微流控技术 | NA | 微流控DLD技术 | NA | 实验数据 | 叶绿体样本,大小范围3-8微米,未提供具体数量。 | NA | 植物细胞 | NA | 植物研究, 生物技术, 合成生物学 |
| 12 | 2026-08-04 |
Turn-on protein switches for controlling actin binding in cells
2024-07-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49934-2
PMID:38992021
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研究论文 | 本文介绍了一组名为可控肌动蛋白结合开关工具(CASTs)的蛋白质设计,可通过外部刺激调控其肌动蛋白结合行为,用于合成生物学和细胞形状控制。 | 开发了蛋白质开关工具,能够通过外部刺激调控肌动蛋白结合,具有开启动力学可调、正交性和多重性的特点,并可插入天然蛋白序列以局部控制F-肌动蛋白结合,或构建结构以控制细胞和组织形态。 | 未在摘要中明确提及具体局限性。 | 开发可控的肌动蛋白结合蛋白开关,以研究单个肌动蛋白结合蛋白的功能,并推动合成生物学在细胞骨架操控中的应用。 | 肌动蛋白结合蛋白开关工具(CASTs)及其在细胞中的功能。 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程 | NA | NA | NA | NA | 细胞 | 受控肌动蛋白结合开关 | 合成生物学, 医学 |
| 13 | 2026-08-04 |
Turn-On Protein Switches for Controlling Actin Binding in Cells
2023-Oct-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.26.561921
PMID:37961502
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研究论文 | 本文描述了一套名为可控肌动蛋白结合开关工具(CASTs)的蛋白质设计,能够通过外部刺激控制其肌动蛋白结合行为,并在细胞中实现局部调控 | 设计出可响应多种外部输入、具有可调开启动力学和正交性的可遗传编码蛋白质开关,并证明其可插入天然蛋白序列或构建新结构以控制细胞和组织形态与行为 | 文中未明确提及研究的局限性 | 开发可控制肌动蛋白结合行为的蛋白质开关,以研究肌动蛋白结合蛋白的细胞功能并推动合成生物学应用 | 肌动蛋白结合蛋白和丝状肌动蛋白 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程 | NA | NA | NA | NA | 细胞 | 可控肌动蛋白结合开关工具(CASTs) | 合成生物学 |
| 14 | 2026-08-04 |
Digital switching in a biosensor circuit via programmable timing of gene availability
2014-Dec, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/nchembio.1680
PMID:25306443
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研究论文 | 本研究展示了通过位点特异性重组酶对多基因电路中的基因可用性进行可编程时间控制,从而校正瞬态递送引起的电路泄漏,并提高了生物传感器的性能 | 首次利用位点特异性重组酶实现对基因可用性的时间编程,以改善瞬态递送下基因电路的稳健性,显著降低泄漏并提高动态范围 | 摘要未提及明确的局限性 | 开发一种通过时间控制基因可用性来优化瞬态递送基因电路性能的方法 | 用于内源性microRNA检测的比例传感器及基于miRNA表达谱的细胞类型分类 | 合成生物学 | NA | 基因电路设计、位点特异性重组酶、microRNA传感 | NA | 基因表达数据(miRNA表达谱) | 未明确样本数量,但涉及细胞类型分类实验 | 位点特异性重组酶 | 哺乳动物细胞 | 基因电路(比例传感器、抑制组件及其靶标的时间去同步化) | 医学 |
| 15 | 2026-08-03 |
Bacterial surface layer ⸻ Properties, role, applications and challenges ⸻ A review of the next-generation nanotechnological tool
2026-Aug-01, Journal of microbiological methods
IF:1.7Q4
DOI:10.1016/j.mimet.2026.107648
PMID:42542137
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综述 | 本文综述了细菌表面层(S层)蛋白的结构特性、生物学功能、应用潜力及面临的挑战,并探讨其作为下一代纳米技术工具的应用前景 | 本文独特地将S层蛋白的机制生物学与面向制造的工程化、蛋白质设计流程和商业化路线图相结合,提供了以往综述未涵盖的可行方案和基准 | S层蛋白向商业化规模应用转化仍面临挑战,包括高纯度蛋白生产的可扩展性、成本效益高的重组表达、恶劣工业条件下的稳定性以及生物来源纳米材料的监管路径未明确 | 综述S层蛋白在纳米生物技术、疫苗开发、生物传感、药物递送和超滤等领域的应用,并分析其从理论向功能原型转化的前景 | 细菌和古菌的表面层(S层)蛋白 | 合成生物学、纳米生物技术 | NA | 重组表达、融合蛋白技术、交联域工程、计算建模 | NA | 综述文献 | NA | NA | 细菌、古菌 | S层自组装二维结晶晶格,用于酶固定化、纳米图案化、脂质双分子层稳定化 | 医学、工业、环境 |
| 16 | 2026-08-03 |
Plant-derived antioxidants: Biosynthesis, refining and applications
2026-Jul-26, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108989
PMID:42503343
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综述 | 本文综述了植物源抗氧化剂(PDAs)在分类、来源、抗氧化机制、生物合成与调控、提取精炼以及应用方面的最新进展 | 整合合成生物学、绿色纯化和纳米递送策略,以克服植物源抗氧化剂的工业挑战并提出精准设计和多功能应用的新见解 | 未提及具体局限性,可能面临天然丰度低、杂质复杂、稳定性差及提取中的污染和变质等挑战 | 总结植物源抗氧化剂的生物合成、精炼和功能性应用,以替代合成抗氧化剂并预防慢性疾病 | 植物源抗氧化剂如多酚类、萜类、维生素、生物碱和皂苷 | 合成生物学 | 神经退行性疾病、心血管疾病、糖尿病、癌症 | 合成生物学、绿色纯化、纳米递送 | NA | 文本 | NA | NA | 植物 | NA | 食品工业、医疗保健 |
| 17 | 2026-08-03 |
Caffeinated Coli: Inspiring the Next Generation of Scientists through Synthetic Biology
2026-Jul-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.07.17.738993
PMID:42539253
|
研究论文 | 介绍“Caffeinated Coli”教育模块,通过工程化大肠杆菌进行生物测定实验,向高中学生传授合成生物学和遗传工程知识 | 将合成生物学引入高中课堂,利用仅能在咖啡因上生长的大肠杆菌作为教学工具,结合NGSS标准设计灵活模块,支持不同水平学生 | 模块已在8所德克萨斯高中实施,但未提及长期效果或推广到其他地区的可行性 | 通过实践学习激发学生对科学、技术、工程和数学的兴趣,并普及合成生物学教育 | 高中学生和教师,以及一种经基因工程改造以依赖咖啡因生长的大肠杆菌菌株 | 教育、合成生物学 | NA | 生物测定实验 | NA | 实验数据、教育反馈 | 8所德克萨斯高中,具体学生和教师数量未提及 | NA | 大肠杆菌 | 生物传感器(大肠杆菌依赖咖啡因生长) | 教育、生物技术 |
| 18 | 2026-08-03 |
In vitro properties of large serine integrase hybrids derived from ϕC31 and TG1 integrases
2026-Jul-17, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag750
PMID:42535648
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研究论文 | 本文研究了源自ϕC31和TG1整合酶的杂交丝氨酸整合酶的体外活性,这些酶能高效重组混合attP × attB底物,同时保留对同源重组方向性因子的相互作用和方向性控制。 | 提出了一种模块化框架,通过利用TG1衍生的卷曲螺旋结构域保留与同源RDF的相互作用,并保持方向性控制,从而能够工程化具有定制特异性的可编程丝氨酸整合酶。 | 研究仅限于体外活性分析,尚需通过结构预测工具和扩展的LSR发现与表征来进一步验证体内应用和定制基因组位点的理性设计。 | 开发一种模块化方法,用于工程化具有定制特异性的可编程丝氨酸整合酶,以用于基因组工程和合成生物学。 | ϕC31和TG1整合酶产生的杂交丝氨酸整合酶及其对混合attP × attB底物的重组活性。 | 合成生物学 | NA | 体外重组活性分析,结构预测工具 | NA | 生物化学数据 | NA | NA | NA | 重组系统,具有方向性控制 | 医学, 工业生物技术 |
| 19 | 2026-08-03 |
Controlled assembly of exogenous DNA-based materials in living cells
2026-Jul, Fundamental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.fmre.2023.12.009
PMID:42539686
|
综述 | 本文综述了外源DNA基材料在活细胞内的受控组装,涵盖多种刺激条件下的组装机制及其在生物医学和合成生物学中的应用。 | 系统总结了外源DNA材料在细胞内不同刺激条件下的动态组装,并重点阐述了其在改变细胞环境、干扰亚细胞结构和癌症诊疗中的三大应用。 | 未明确提及具体局限性,但可能受限于当前技术对细胞内组装过程的精确控制和体内应用的临床转化挑战。 | 全面综述外源DNA基材料在活细胞内的受控组装机制及其生物学效应,展望该领域的未来研究方向。 | 外源DNA基材料及其在活细胞内的组装体和功能模块。 | 合成生物学 | 癌症 | DNA纳米技术 | NA | NA | NA | NA | 活细胞 | 生物传感器、逻辑门、药物递送系统 | 医学、生物技术 |
| 20 | 2026-08-03 |
Insight into the eminent biotechnological applications of xylanolytic enzymes for sustainable bioprocessing
2025-Aug, 3 Biotech
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s13205-025-04415-1
PMID:40657403
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综述 | 本文全面综述了木聚糖的结构、木聚糖酶在降解中的作用及其在造纸、食品、纺织和制药等行业的工业应用,并讨论了通过纳米生物技术和CRISPR/CAS等先进工具提高木聚糖酶热稳定性的方法。 | 整合了纳米生物技术、CRISPR/CAS技术、宏基因组生物勘探、蛋白质工程和合成生物学等前沿方法,用于木聚糖酶的热稳定性提升和应用拓展,并强调了监管框架和标准化对可持续性的重要性。 | 未详细讨论木聚糖酶大规模工业应用的经济可行性和潜在环境风险。 | 全面阐述木聚糖酶在生物技术和可持续生物加工中的多功能作用,并指出未来研究创新方向。 | 木聚糖及其降解酶(木聚糖酶) | 生物技术 | NA | CRISPR/CAS技术、纳米生物技术、宏基因组学、蛋白质工程、合成生物学 | NA | 文献资料 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 代谢通路(木聚糖降解通路) | 工业生物技术 |