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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-04-15 |
The next frontier: Exploring plant hypoxia sensing and response mechanisms through synthetic biology
2026-Apr-21, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2606254123
PMID:41973930
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2 | 2026-04-15 |
From Xylose to Biobased High-Value Chemicals: Advances in Microbial Xylose Utilization for Industrial Biotechnology
2026-Apr-14, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c06628
PMID:41979057
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综述 | 本文综述了微生物利用木糖代谢的最新研究进展,重点探讨了木糖代谢途径、代谢工程策略以及基于木糖生产高价值化学品的潜力 | 总结了利用代谢工程和合成生物学技术改进微生物木糖利用的最新进展,并讨论了未来克服关键挑战的机会,如高效木糖提取和葡萄糖与木糖的共利用 | NA | 旨在支持开发更高效的木糖生物转化过程,促进木质纤维素原料的广泛利用 | 木糖代谢、微生物转化、高价值化学品生产 | 工业生物技术 | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 能源, 工业生物技术 |
| 3 | 2026-04-15 |
Decoding Outer Membrane β-Barrels: From Structural Curiosity to Engineered Nanotherapeutics
2026-Apr-13, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.5c00902
PMID:41973831
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综述 | 本文综述了外膜β-桶状蛋白(OMPs)的结构、功能多样性及其在生物传感、药物递送和纳米医学等领域的工程应用 | 将OMPs从结构研究对象提升为精准生物分子设计和下一代纳米治疗剂的工程平台,整合了结构生物学进展与理性工程应用 | NA | 探讨外膜β-桶状蛋白的结构功能特性及其在纳米治疗和合成生物学中的应用潜力 | 革兰氏阴性菌、线粒体和叶绿体中的跨膜β-桶状外膜蛋白(OMPs) | NA | NA | 冷冻电镜(cryo-EM)、核磁共振(NMR)、分子动力学模拟(MD simulations)、AlphaFold | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学、合成生物学、纳米医学 |
| 4 | 2026-04-15 |
Natural Food Pigments: From Biosynthesis to Application
2026-Apr-09, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c05093
PMID:41954457
|
综述 | 本文综述了天然食品色素的来源、分类、生物合成途径、合成生物学策略、药理活性机制及其在医药、保健品和化妆品等领域的应用进展 | 系统整合了天然色素的生物合成、合成生物学策略、药理机制及多领域应用,并结合代谢工程、人工智能辅助筛选和生物传感等新兴技术,提出了从基础合成到高价值应用的跨学科发展路径 | NA | 为天然色素成分的创新研究提供新的整合视角,并强调其作为“功能性色素”在天然药物开发中的多重潜力 | 天然食品色素 | NA | NA | 代谢工程、人工智能辅助筛选、生物传感 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药, 保健品, 化妆品 |
| 5 | 2026-04-15 |
Epigenetic Control of Toehold-Mediated Strand Displacement for Programmable Molecular Circuit Regulation and Enhanced microRNA Detection
2026-Apr-08, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.6c01658
PMID:41952075
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研究论文 | 本文介绍了一种利用单碱基N-甲基腺苷(mA)修饰调控DNA链置换反应动力学的表观遗传调控系统,并将其应用于microRNA检测 | 首次将单碱基表观遗传修饰(mA)引入DNA链置换的toehold区域,实现了对分子电路动力学的可编程、可逆调控 | NA | 开发一种可编程调控分子电路动力学的新方法,并提高microRNA检测的灵敏度与特异性 | DNA链置换反应、催化发夹组装电路、癌症相关microRNA-21 | 合成生物学 | 癌症 | 单碱基N-甲基腺苷(mA)修饰、去甲基化酶FTO调控、细胞内成像 | NA | NA | NA | NA | NA | 催化发夹组装电路、表观遗传调控的DNA链置换系统 | 生物传感、分子计算、合成生物学 |
| 6 | 2026-04-15 |
Benchmarking genetic elements for high-level protein expression using a novel Marchantia polymorpha transient expression system
2026-Apr, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.151715
PMID:41911994
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研究论文 | 本研究开发了一种基于农杆菌的瞬时表达系统,用于快速评估地钱中的遗传元件,并系统性地比较了多种启动子、终止子和信号肽的性能 | 开发了首个用于地钱的高通量瞬时表达系统,可在8天内完成实验,显著提高了遗传元件表征的效率,并发现了一个截短的CaMV35S启动子变体,其活性比标准版本提高了409倍 | NA | 开发并验证一种快速高效的瞬时表达系统,以扩展地钱的遗传工具包并提高蛋白质表达水平 | 地钱(Marchantia polymorpha)中的遗传元件,包括启动子、终止子和信号肽 | 合成生物学 | NA | 农杆菌介导的瞬时表达系统 | NA | 蛋白质表达数据 | 21个启动子、15个终止子和7个信号肽 | 农杆菌介导的转化 | 地钱(Marchantia polymorpha) | NA | 农业 |
| 7 | 2026-04-15 |
Overriding Bioprocess Perturbations With a Cell-Machine Interface for Reliable Microbial Stress-Response Control
2026-Apr, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.70329
PMID:41973552
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研究论文 | 本研究通过细胞-机器接口Segregostat系统,在工业生物反应器扰动条件下,实现了对大肠杆菌和酿酒酵母一般应激反应的可靠控制 | 首次将细胞-机器接口应用于克服工业生物反应器环境扰动,通过实时控制动态营养变化来放大宿主兼容性波动,从而增强应激响应控制的鲁棒性 | 研究主要基于两种模式微生物,未扩展到更复杂的工业菌株或真实大规模生产环境,且对扰动机制的假设仍需进一步验证 | 开发在工业生物处理扰动条件下可靠控制微生物应激响应的方法,以提升工程基因电路的性能稳定性 | 大肠杆菌和酿酒酵母的一般应激响应 | 合成生物学 | NA | 流式细胞术自动化、规模缩小生物反应器实验 | NA | 细胞群体动态数据、表型分化数据 | 使用大肠杆菌和酿酒酵母两种微生物进行实验 | Segregostat(实时控制系统) | 大肠杆菌, 酿酒酵母 | 一般应激响应控制回路 | 工业生物技术 |
| 8 | 2026-04-15 |
Valorization of ligustrum species: biosynthesis, metabolic engineering, and pharmacology of bioactive compounds
2026-Mar-27, Bioresources and bioprocessing
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s40643-026-01042-3
PMID:41888324
|
综述 | 本文综述了女贞属植物的生物活性化合物、药理特性、组学分析及生物合成研究进展,并提出整合多组学、合成生物学和绿色制造以实现其全植物价值化和种质资源保护的策略 | 提出整合多组学、合成生物学和绿色制造的综合性方法,以促进女贞属植物的全植物价值化和可持续利用,为药用资源开发提供新的理论框架和技术范式 | NA | 建立女贞属植物作为药用资源的全面开发和可持续利用的理论框架与技术范式 | 女贞属植物及其生物活性化合物(如三萜类、苯乙醇苷类、黄酮类等) | NA | NA | 多组学分析、代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药、农业、环境、食品 |
| 9 | 2026-04-15 |
Label-Free Microfluidic Modulation Spectroscopy Monitors RNA Origami Structure and Stability
2026-Mar-16, Biosensors
DOI:10.3390/bios16030166
PMID:41892058
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研究论文 | 本研究采用微流控调制光谱技术,作为无标记的结构生物传感器,用于监测RNA折纸的结构与稳定性 | 首次将微流控调制光谱技术应用于RNA折纸的结构分析,实现了对RNA碱基和碱基对在1760-1600 cm⁻¹振动指纹区的无标记、高通量检测 | NA | 开发一种可扩展的、溶液相的RNA折纸结构监测方法,以评估其设计架构、成熟过程及稳定性分布 | RNA折纸结构,特别是六螺旋束带扣的RNA折纸模型 | 合成生物学 | NA | 微流控调制光谱 | NA | 光谱数据 | NA | NA | NA | RNA折纸作为支架用于生物传感、合成生物学和纳米医学 | 生物传感, 合成生物学, 纳米医学 |
| 10 | 2026-04-15 |
Leveraging a synthetic biology approach to enhance BCG-mediated expansion of Vγ9Vδ2 T cells
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0343925
PMID:41941447
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研究论文 | 本研究利用合成生物学方法改造BCG疫苗,使其过量产生HMBPP以增强Vγ9Vδ2 T细胞的扩增,从而提升抗结核免疫效果 | 首次通过改造BCG的MEP途径过量产生HMBPP,利用宿主对细菌异戊二烯途径中间产物的自我-非我识别机制激活Vγ9Vδ2 T细胞 | 研究目前仅进行体外实验,尚未在动物模型或人体中验证效果 | 开发更有效的抗结核疫苗 | BCG疫苗菌株和人类Vγ9Vδ2 T细胞 | 合成生物学 | 结核病 | 合成生物学工程、同线性分析、体外刺激实验 | NA | 基因组数据、体外细胞实验数据 | 超过63种分枝杆菌物种的356个基因组 | 合成生物学方法 | BCG(牛分枝杆菌减毒株) | 合成MEP途径基因座,过表达HMBPP合成酶GcpE以积累HMBPP | 医学 |
| 11 | 2026-04-15 |
Systems biology can provide guidance to synthetic biology in the pursuit of new drug targets
2026, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2026.1770107
PMID:41971098
|
观点文章 | 本文通过案例研究展示了系统生物学分析在指导药物靶点发现中的力量,强调动态建模作为合成生物学中药物干预设计的探索工具 | 利用系统生物学分析简化生理电路,揭示直觉可能误导药物靶点选择,并展示动态建模如何克服这一挑战,为合成生物学提供指导 | 案例研究基于简化的线性代谢通路模型,可能未完全反映真实生物系统的复杂性 | 探索系统生物学如何指导合成生物学在寻找新药物靶点方面的应用 | 涉及NQO1酶和β-拉帕醌的癌症相关氧化还原电路,作为生理反馈机制的案例 | 系统生物学与合成生物学 | 癌症 | 动态建模 | NA | NA | NA | NA | NA | 涉及NQO1酶的正反馈回路,模拟生理和病理中观察到的电路类型 | 医学 |
| 12 | 2026-04-15 |
Programmable saponin biosynthesis from gene networks to predictive biomanufacturing
2026, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2026.1800149
PMID:41971552
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综述 | 本文综述了皂苷生物合成从基因网络到预测性生物制造的最新进展,包括合成生物学工具和AI辅助设计在优化生产平台中的应用 | 将皂苷研究从描述性途径阐明转向预测性和可编程的生物制造,通过合成生物学和AI技术实现精确控制与优化 | NA | 探讨皂苷生物合成的可编程和预测性生物制造策略 | 皂苷生物合成途径、基因网络和工业生物制造平台 | 合成生物学 | NA | CRISPR-based transcriptional modulation, synthetic promoters, transcription factor rewiring, structure-guided enzyme engineering, AI-assisted protein design | NA | 基因组、多组学数据、代谢基因簇分析 | NA | CRISPR-Cas9 | engineered microbes, plant suspension cells, hairy roots, adventitious root systems | biosynthetic networks, metabolic pathways | medicine, industrial biotechnology |
| 13 | 2026-04-15 |
Leveraging a synthetic biology approach to enhance BCG-mediated expansion of Vγ9Vδ2 T cells
2025-May-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.05.651767
PMID:40654943
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研究论文 | 本研究利用合成生物学方法改造BCG疫苗,使其产生更多HMBPP以增强Vγ9Vδ2 T细胞的扩增,旨在提高抗结核疫苗的免疫原性 | 首次尝试通过改造BCG中的MEP途径来提升疫苗效力,并利用HMBPP感知机制触发宿主自我-非我识别,这是一种新的策略 | 虽然过表达GcpE能有效诱导Vγ9Vδ2 T细胞扩增,但开发更有效的疫苗仍需大量后续工作,且合成MEP基因座未能增强T细胞扩增,表明多基因异位表达可能导致反馈抑制 | 测试提高BCG的免疫原性能否在保持其安全性的同时改善疫苗效果 | BCG疫苗菌株、Vγ9Vδ2 T细胞、HMBPP磷酸抗原 | 合成生物学 | 结核病 | 合成生物学工程、同线性分析、重组菌株构建、刺激试验 | NA | 基因组数据、实验数据 | 超过63种分枝杆菌物种的356个基因组 | 合成生物学方法 | BCG(牛分枝杆菌) | 设计合成MEP基因座以特异性过量生产HMBPP,并测试过表达限速基因GcpE | 医学 |
| 14 | 2026-04-14 |
Comprehensive genomic analysis reveals the class II diterpene cyclases in Dodonaea viscosa
2026-Jul, Phytochemistry
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.phytochem.2026.114886
PMID:41881186
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研究论文 | 本研究通过基因组测序和注释,揭示了药用植物Dodonaea viscosa中两类II类二萜环化酶的发现与生化特性 | 首次提供了D. viscosa的核基因组草图以及完整的叶绿体和线粒体基因组序列,并鉴定了两个新的II类二萜环化酶DvCPS和DvKPS | NA | 阐明D. viscosa中生物活性二萜类化合物的生物合成途径,以支持通过合成生物学实现规模化生产 | 药用植物Dodonaea viscosa及其基因组与二萜环化酶 | 合成生物学 | NA | 基因组测序、生化表征 | NA | 基因组序列数据 | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 15 | 2026-04-14 |
Evolutionary insights and guidelines to achieve effective and high-yield non-ribosomal peptide and polyketide engineering
2026-Apr-11, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2026.102755
PMID:41967291
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综述 | 本文综述了基于进化原理的非核糖体肽和聚酮工程的有效策略,以提升新型抗生素的生物合成产量 | 从单纯依赖结构数据转向结合进化原则和数据集指导工程策略,优化重组边界选择并平衡高通量与准确性 | 重组组装线普遍存在产量降低问题,且尚无单一工程策略能显著最小化产量损失 | 实现高效高产的非核糖体肽和聚酮工程,以生产新型抗生素和其他生物活性分子 | 非核糖体肽合成酶(NRPS)和聚酮合酶(PKS)组装线 | 合成生物学 | NA | 进化分析、重组工程、高通量方法 | NA | 结构数据、进化数据集 | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 16 | 2026-04-14 |
NUPACK: Computational Nucleic Acid Analysis and Design
2026-Apr-02, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00817
PMID:41926704
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研究论文 | 介绍NUPACK软件套件,用于核酸结构、设备和系统的分析与设计,服务于核酸纳米技术、分子编程、合成生物学等领域的研究人员 | NUPACK 4引入了增强的物理模型(如共轴和悬垂堆叠子系综)、显著加速(测试管分析速度提升20-120倍)、支持大规模复合物(如30,000 nt)、混合材料(核苷酸分辨率指定)以及多样化的硬软序列约束设计 | NA | 开发用于核酸结构分析与设计的计算工具,以支持核酸纳米技术、分子编程和合成生物学等领域的研究 | 核酸结构、设备和系统 | 合成生物学 | NA | 计算分析算法 | NA | 核酸序列数据 | NA | NA | NA | 动态杂交级联反应路径工程和结构工程,包括假结可能性 | 医学, 工业生物技术 |
| 17 | 2026-04-14 |
Bacterial Extracellular Vesicles in Biomedical Research and Clinical Translation
2026-Apr, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.70350
PMID:41968466
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综述 | 本文综述了细菌胞外囊泡在生物医学研究和临床转化中的应用与挑战 | 系统总结了利用分子与合成生物学技术(如基因操作、表面功能化、糖工程和模块化展示技术)对细菌胞外囊泡进行靶向生物工程改造的最新进展,以生产具有增强安全性、稳定性、靶向精度和功能多样性的定制化囊泡 | 规模化生产、安全性、标准化和监管框架等关键转化挑战仍需解决 | 探讨细菌胞外囊泡作为多功能工具在生物医学领域的潜力及其临床转化前景 | 细菌胞外囊泡 | 合成生物学 | NA | 基因操作、表面功能化、糖工程、模块化展示技术 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | NA | 医学 |
| 18 | 2026-04-14 |
Incoherent feedforward loop dominates the robustness and tunability of necroptosis biphasic, emergent, and coexistent dynamics
2026-Mar, Fundamental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.fmre.2024.02.009
PMID:41971832
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研究论文 | 本研究通过建模分析,揭示了坏死性凋亡信号通路中RIP1-RIP3-Caspase-8非相干前馈环作为核心拓扑结构,主导双相、涌现和共存动力学的鲁棒性与可调性 | 首次引入潜在景观和香农熵量化坏死性凋亡共存动力学的不确定性,并系统筛选出实现BEC动力学的最小电路拓扑,确认非相干前馈环的核心作用 | 研究基于电路建模和理论分析,实验验证可能有限,且主要关注三节点电路,可能未涵盖更复杂网络 | 探究坏死性凋亡信号通路中双相、涌现和共存动力学的电路结构基础与调控机制 | 坏死性凋亡信号通路中的RIP1、RIP3和Caspase-8蛋白及其相互作用网络 | 合成生物学 | 细胞死亡相关疾病 | 电路建模、网络拓扑分析、随机电路分析、潜在景观和香农熵计算 | NA | 理论模型数据 | NA | NA | NA | 非相干前馈环嵌入RIP3对RIP1的正反馈,以及RIP3自磷酸化的钟形调节 | 医学 |
| 19 | 2026-04-14 |
Advancements in the Application of Ribosomally Synthesized and Post-Translationally Modified Peptides (RiPPs)
2024-04-15, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14040479
PMID:38672495
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综述 | 本文综述了核糖体合成和翻译后修饰肽(RiPPs)在新型治疗应用方面的最新进展 | 系统总结了利用合成生物学和生物信息学新方法(如异源表达、遗传重构和利用修饰酶的底物耐受性)生产与工程化RiPPs,以及采用mRNA展示、表面展示和双杂交系统等前沿筛选技术加速具有药物潜力的RiPPs的发现 | NA | 探讨RiPPs作为新型治疗药物的潜力及其相关生产与工程化技术 | 核糖体合成和翻译后修饰肽(RiPPs) | NA | NA | 异源表达、遗传重构、mRNA展示、表面展示、双杂交系统 | NA | NA | NA | 合成生物学、基因工程 | NA | NA | 医药 |
| 20 | 2026-04-14 |
The AP2/ERF Transcription Factor PgERF120 Regulates Ginsenoside Biosynthesis in Ginseng
2024-03-13, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14030345
PMID:38540764
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研究论文 | 本研究通过鉴定并功能验证AP2/ERF转录因子PgERF120在人参皂苷生物合成中的调控作用 | 首次在人参中报道AP2/ERF转录因子家族对人参皂苷合成的调控作用,并发现PgERF120基因对乙烯处理最为敏感 | 研究仍处于初步验证阶段,具体调控机制和下游靶基因尚未完全阐明 | 探究AP2/ERF转录因子在人参皂苷生物合成中的调控功能 | 人参毛状根及其中PgERF120基因 | 合成生物学 | NA | 荧光定量PCR、基因克隆、农杆菌介导转化 | NA | 基因表达数据、代谢物含量数据 | 转基因人参毛状根系 | 农杆菌介导转化 | 人参 | 人参皂苷生物合成途径调控 | 医药 |