合成生物学相关文章
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当前共找到 5513 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-08-12 |
Bacterial compartments and biological condensates as nanoreactors for biocatalysis
2026-Oct, Advances in colloid and interface science
IF:15.9Q1
DOI:10.1016/j.cis.2026.103972
PMID:42276006
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综述 | 本文综述了工程化细菌区室和生物凝聚体作为纳米反应器在生物催化中的应用，重点讨论多酶自组装系统在可持续有机合成和合成生物学中的潜力 | 探讨了细菌区室和生物凝聚体作为新型自组装多酶生物催化剂的界面，为可持续有机合成与合成生物学之间建立联系 | 未提供具体实验结果，缺乏对实际应用限制的深入分析 | 综述工程化细菌区室和生物凝聚体在多酶生物催化中的应用，促进可持续化学合成 | 工程化细菌区室（如微区室）和生物凝聚体（如无膜细胞器） | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 多酶自组装系统（细菌区室和生物凝聚体作为纳米反应器） | 工业生物技术、可持续化学 |
| 2 | 2026-08-12 |
Stable, micron-scale lipocondensates achieving prolonged circulation without PEGlyated lipids
2026-Aug-11, Biomaterials science
IF:5.8Q1
DOI:10.1039/d6bm00335d
PMID:42405635
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研究论文 | 本研究报道了一种稳定的微米级脂质凝聚体（LipCons），其具有独特的脂质组织和优异的血液循环相容性，无需聚乙二醇化脂质即可实现长效循环。 | 首次展示了天然脂质组成的凝聚体在微米尺度上能够稳定存在，并且循环半衰期远超传统脂质体，突破了微米级系统不稳定的限制。 | 摘要中未明确提及实验的具体限制条件或潜在问题。 | 探究脂质凝聚体的分子组成如何影响脂质组织和界面行为，并开发一种无聚乙二醇化的长效药物递送平台。 | 脂质凝聚体（LipCons），由天然脂质组成。 | 合成生物学 | NA | 小角X射线散射（SAXS）、荧光漂白恢复（FRAP） | NA | 实验数据（散射数据、荧光数据） | 未明确报告样本数量，但涉及多种脂质组成凝聚体的制备和表征。 | NA | NA | 脂质凝聚体（LipCons），球状微米级组装体。 | 医学, 合成生物学 |
| 3 | 2026-08-12 |
Construction of cell factories, and multi-enzymatic and chemoenzymatic cascades to enable the efficient production of alkaloids
2026-Aug-11, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d6np00031b
PMID:42578823
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综述 | 本文综述了通过构建细胞工厂、多酶级联和化学酶级联实现生物碱高效生产的最新进展，涵盖原核和真核系统、多酶级联及化学酶合成。 | 全面整合了合成生物学和生物催化在生物碱生产中的应用，梳理了战略教训、局限性及解决方案，揭示了这些平台的变革潜力。 | 文中讨论了平台固有的局限性，但具体限制未在摘要中详细说明。 | 总结生物碱生物合成的关键进展，并展示合成生物学和生物催化如何重塑生物碱生产以扩大医药应用。 | 生物碱合成途径及其在细胞工厂中的多酶级联和化学酶级联。 | 合成生物学 | NA | 多酶级联、化学酶级联 | NA | NA | NA | NA | 原核生物、真核生物 | 多酶级联和化学酶级联途径 | 医药 |
| 4 | 2026-08-12 |
Hydrogen sulfide as a potential translational hub for crop salinity tolerance
2026-Aug-10, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2026.07.005
PMID:42575808
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综述 | 本文批判性地探讨了硫化氢在植物盐胁迫适应性响应中的信号机制，指出现有证据多为相关性且依赖药理学干预，并提出向因果机制研究转变的策略。 | 强调从现象观察转向因果机制，倡导利用先进遗传工具、体内动态成像、合成生物学和系统水平分析来阐明硫化氢信号的特异性和因果性，以发掘其在作物耐盐性改良中的转化潜力。 | 综述指出现有研究主要基于相关性证据和药理学干预，缺乏因果性验证，但未具体讨论自身局限。 | 探讨硫化氢信号在植物盐胁迫适应性响应中的机制性作用，并提出研究策略以促进其在作物耐盐性改良中的应用。 | 植物（特别是作物）中的硫化氢信号通路及其与盐胁迫响应的关联。 | 植物生物学 | 非疾病（植物盐胁迫） | 遗传工具、体内动态成像、合成生物学（提及） | NA | 文献、实验数据（综述） | NA | 合成生物学工具（提及，但具体未指定） | 植物 | NA | 农业 |
| 5 | 2026-08-12 |
Advances in combinatorial CRISPRi screening and applications: Decoding higher-order interactions for next-generation microbial cell factories in synthetic biology
2026-Aug-06, Microbiological research
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.micres.2026.128663
PMID:42574952
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综述 | 本文综述了组合CRISPR干扰（CRISPRi）筛选的最新进展及其在合成生物学中解码微生物细胞工厂高阶相互作用的应用。 | 系统阐述了组合CRISPRi在揭示复杂表型背后多基因相互作用方面的优势，包括设计策略、计算分析方法和应用案例。 | 当前面临系统噪音和文库构建等挑战，尚未完全解决。 | 解码复杂性状并推动下一代细胞工厂的合理设计。 | 微生物细胞工厂中的多基因调控网络。 | 合成生物学 | NA | CRISPRi | NA | 基因表达数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 微生物 | 组合CRISPRi筛选系统 | 工业生物技术 |
| 6 | 2026-08-12 |
Cascading attrition of in vivo CAR-T therapy: From systemic delivery failure to functional collapse
2026-Aug-05, Critical reviews in oncology/hematology
DOI:10.1016/j.critrevonc.2026.105521
PMID:42556595
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综述 | 本文综述了体内CAR-T疗法的级联衰减过程，从全身递送失败到功能崩溃，并探讨了克服这些障碍的策略 | 提出通过确定性设计而非增量改进来应对随机失效级联，强调免疫伪装表面和逻辑门控电路的合理整合 | 未提供具体实验数据，仅基于现有文献进行综述性分析 | 探讨体内CAR-T疗法的临床转化障碍，并提出设计策略以增强功能持久性 | 体内CAR-T细胞疗法及其递送载体（慢病毒载体和脂质纳米颗粒） | 合成生物学 | 血液恶性肿瘤、实体瘤、自身免疫性疾病 | CAR-T细胞疗法 | NA | NA | NA | NA | T细胞 | 逻辑门控电路 | 医学 |
| 7 | 2026-08-12 |
Mechanism underlying the high regulatory performance of the doxycycline riboswitch G12
2026-08-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-76256-2
PMID:42547503
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研究论文 | 本文识别并机制性表征了多西环素核糖开关G12，其在酵母和人类细胞中表现出卓越的调控性能，并揭示了其配体响应构象切换机制 | 首次通过RNA Capture-SELEX高效富集配体响应构象切换的适体，并机理上阐明G12通过稳定折叠中间体实现高效调控 | 研究主要限于体外和细胞水平的机制分析，未探讨在体内动物模型中的长期应用效果 | 揭示多西环素核糖开关G12高调控性能的分子机制，并扩展合成生物学工具箱 | 多西环素结合适体G12及其在酵母和人类细胞中的表达调控 | 合成生物学 | NA | RNA Capture-SELEX, 常规SELEX, NGS, 单分子光镊力谱, 停止流荧光光谱, 化学探针 | NA | 序列数据, 力学数据, 荧光动力学数据 | 未知文库规模，但涉及酵母和人类细胞系 | NA | 酵母, 人类细胞 | 多西环素响应核糖开关（调控翻译和剪接） | 医学, 工业生物技术 |
| 8 | 2026-08-12 |
Modeling of Conjugative- and Phage-Mediated CRISPR-Based System Against Antimicrobial Resistant Bacteria
2026-Aug, IEEE transactions on bio-medical engineering
DOI:10.1109/TBME.2026.3693402
PMID:42133510
|
研究论文 | 本研究采用系统生物学方法，开发数学模型来评估结合工程化接合益生菌和噬菌体的CRISPR系统对抗抗菌素耐药细菌的潜力，比较基因沉默与直接杀灭等不同策略的效果 | 该模型整合了递送系统（工程化接合益生菌和噬菌体）与作用器（CRISPR切割和CRISPR干扰），并明确纳入影响作用器功能的突变参数，模拟其对治疗性能的影响，从而评估系统鲁棒性 | 模型为理论模拟，未涉及实验验证，且可能简化了复杂的生物过程 | 评估基于工程化接合益生菌和噬菌体的CRISPR系统作为替代抗菌策略以对抗抗菌素耐药性的可行性，并为其设计和剂量优化提供定量基础 | 抗菌素耐药细菌、工程化接合益生菌、工程化噬菌体 | 系统生物学 | 抗菌素耐药感染 | 数学建模、系统生物学分析 | NA | 模拟数据 | NA | CRISPR-Cas9、CRISPR干扰（CRISPRi） | 益生菌、噬菌体 | CRISPR系统（切割和干扰）、噬菌体递送系统、接合递送系统 | 医学 |
| 9 | 2026-08-12 |
Phosphorylation networks as regulatory hubs in plant stress signaling: kinase dynamics, crosstalk, and network plasticity
2026-Jul-24, Plant cell reports
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s00299-026-03917-3
PMID:42496748
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综述 | 本文综述了植物胁迫信号传导中磷酸化网络作为调控枢纽的作用，重点讨论了激酶动态、串扰和网络可塑性 | 强调了磷酸化在植物胁迫信号中的核心枢纽作用，并整合了磷酸化蛋白质组学、激酶网络图谱和系统生物学的最新进展，提出了利用磷酸化动态推进气候智能农业的策略 | 未明确说明局限性 | 总结并突出磷酸化网络在植物胁迫响应中的调控作用及其在气候智能农业中的转化潜力 | 模型植物和作物中的磷酸化网络及主要激酶家族 | 系统生物学 | NA | 磷酸化蛋白质组学、激酶网络图谱、多组学整合 | NA | 组学数据 | NA | 合成生物学 | 植物 | 磷酸化调控网络 | 农业 |
| 10 | 2026-08-12 |
γ-Class carbonic anhydrases: Ancient enzymes at the interface of early earth metabolism, microbial physiology, and modern biochemical innovation
2026-Jul-17, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.153551
PMID:42468588
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综述 | 本文综述了γ-碳酸酐酶的结构、机制和功能，涵盖其古老起源、微生物生理作用及现代生物技术应用。 | 强调γ-CAs的金属灵活性和与太古宙缺氧富铁环境兼容的催化机制，并提出了其潜在硅酸酶活性及作为选择性抗菌药物靶点的可能性。 | 存在关于催化混杂性和CamH亚类机制的未解决问题，限制了对其功能的全面理解。 | 总结当前对γ-碳酸酐酶的结构、催化和功能知识，并指出未来研究方向以阐明其在酶进化和微生物生理学中的作用。 | γ-碳酸酐酶，包括Cam和CamH亚类，来自古菌（特别是产甲烷菌）及人类病原体如霍乱弧菌。 | 微生物学 | 细菌感染 | NA | NA | 文献数据 | NA | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术, 环境 |
| 11 | 2026-08-12 |
The Expanding Reactivity of Cobamide-Containing Proteins: From Mechanistic Understanding to Non-native Biocatalysis
2026-Jul-03, ACS catalysis
IF:11.3Q1
DOI:10.1021/acscatal.6c03394
PMID:42577960
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perspective | 本文综述了含钴胺素蛋白的反应性，从机制理解到非天然生物催化应用，强调了其在选择性C-C键形成、C-H官能化和烷基化等转化中的潜力 | 提出了将含钴胺素蛋白作为非天然生物催化多功能平台的新兴策略，结合蛋白质工程和合成生物学进展 | 主要基于文献总结，未提供新的实验数据，非天然生物催化应用仍处于初期阶段 | 总结含钴胺素蛋白的功能机制，并探讨其在非天然生物催化中的前景 | 含钴胺素蛋白（如异构酶、甲基转移酶、还原性脱卤酶） | 合成生物学, 蛋白质工程 | NA | 蛋白质工程, 合成生物学 | NA | 文献 | NA | 蛋白质工程 | NA | NA | 工业生物技术, 化学合成 |
| 12 | 2026-08-12 |
Essential Proteins Prediction Using Features Synergy Model and GO Pure Centrality
2026 Jul-Aug, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2026.3698655
PMID:42224331
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研究论文 | 提出了一种基于特征协同模型和GO纯中心性的必需蛋白质预测方法FSM，以提高鉴定率 | 提出了特征协同模型（FSM）和GO纯中心性（GPC）新指标，结合基因表达数据、GO注释和进化保守性，有效减少PPI数据噪声并考虑特征关系 | 摘要未提及具体限制 | 开发一种新的必需蛋白质预测方法，克服现有计算方法的缺点，提高鉴定能力 | 必需蛋白质，酵母蛋白质相互作用网络 | 机器学习 | NA | NA | 特征协同模型 | 蛋白质相互作用数据、基因表达数据、GO注释数据、亚细胞定位和直系同源蛋白质数据 | 三个不同的酵母数据集 | NA | NA | NA | 合成生物学、医学 |
| 13 | 2026-08-12 |
Engineering a PD-L1-sensing synthetic receptor for programmable macrophage response
2026-Jun-06, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-026-00708-y
PMID:42251359
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研究论文 | 本文介绍了一种基于合成Notch受体的架构（SNIPR），使单核细胞样细胞能够感知PD-L1并条件性激活吞噬程序，从而实现对巨噬细胞行为的可编程控制 | 将PD-L1从末端治疗靶点重新定义为合成回路激活的可编程输入信号，并建立了配体响应控制工程化巨噬细胞行为的模块化框架 | 研究仅在体外进行，未涉及体内验证；CV1-Fc作为模型效应分子，其临床实用性需进一步探索 | 通过合成受体工程实现巨噬细胞对免疫调节配体的感应和程序化响应，以增强对肿瘤细胞的吞噬作用 | 表达PD-L1的SKOV-3卵巢癌细胞和THP-1来源的巨噬细胞 | 合成生物学 | 卵巢癌 | 合成受体工程 | 合成Notch受体（SNIPR） | 体外实验数据 | 未明确指定样本数量，涉及SKOV-3细胞系和THP-1细胞系 | NA | 哺乳动物细胞（THP-1单核细胞样细胞、SKOV-3癌细胞） | 基于合成Notch的受体（SNIPR），检测PD-L1并触发荧光报告基因或CV1-Fc表达 | 医学 |
| 14 | 2026-08-12 |
Transcriptional regulation: efficient genetic engineering tools for non-conventional yeasts
2026-Jan-05, FEMS yeast research
IF:2.4Q3
DOI:10.1093/femsyr/foag032
PMID:42545751
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综述 | 本文综述了非传统酵母中用于代谢工程和合成生物学应用的转录调控工具，包括经典启动子、转录因子以及CRISPR/Cas介导的转录激活和抑制等新型可编程技术 | 系统性地总结了非传统酵母中转录调控工具的最新进展，特别强调了动态调控系统和CRISPR/Cas介导的转录调控策略，以优化代谢通量和平衡细胞资源 | 未提供具体的实验数据或案例研究，主要基于文献综述 | 探讨非传统酵母中精确调控基因表达和协调控制代谢途径的遗传工程工具，以促进高效生物燃料和高价值化学品的生产 | 非传统酵母菌株 | 合成生物学、代谢工程 | NA | CRISPR/Cas、启动子工程、转录因子工程 | NA | 文献综述 | NA | CRISPR-Cas9 | 非传统酵母 | 代谢途径重布线、动态调控系统 | 工业生物技术、能源、医药 |
| 15 | 2026-08-12 |
Life beyond 6000 genes: from sequence to synthesis in a post-genomics era
2026-Jan-05, FEMS yeast research
IF:2.4Q3
DOI:10.1093/femsyr/foag034
PMID:42556387
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综述 | 本文回顾了酵母基因组测序三十年来的成就，并展望了后基因组时代合成生物学、人工智能和生物电子学的发展趋势 | 综合历史成就与未来趋势，强调基因组学从描述性资源转变为工程生物学的核心基础设施，并探讨人工智能和生物电子学可能塑造的未来方向 | 未提及具体局限性 | 庆祝酵母测序项目成果，阐述基因组学如何演变为工程生物学的使能基础设施，并展望未来三十年酵母基因组学和工程生物学的发展 | 酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae）基因组 | 基因组学、合成生物学、系统生物学 | NA | 基因组测序、功能基因组学、合成基因组学 | NA | 基因组序列数据 | NA | NA | 酿酒酵母 | NA | 生物技术、工业生物技术 |
| 16 | 2026-08-12 |
SEGUID v2: Extending SEGUID checksums for circular, linear, single- and double-stranded biological sequences
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0346164
PMID:42566484
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研究论文 | 提出SEGUID v2，扩展原始SEGUID校验和以支持环状、线状、单链和双链生物序列 | SEGUID v2生成方向性和旋转不变性的校验和，适用于单链、双链（可能错配）、线状和环状DNA及RNA序列，并采用Base64url编码以确保在文件名和URL中的直接使用 | 摘要未提及明显限制 | 扩展SEGUID校验和以支持环状DNA和双链DNA等更多序列类型 | SEGUID校验和算法及其在各类生物序列中的应用 | 生物信息学 | NA | SHA-1哈希、Base64url编码 | NA | 序列数据（DNA、RNA、蛋白质） | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 17 | 2026-08-12 |
Harnessing heterogeneity for the rational design of cell manufacturing
2025-12-17, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101458
PMID:41412112
|
观点文章 | 本文提出利用细胞异质性作为设计特征，通过系统与合成生物学工具优化细胞治疗产品的生产质量与产量 | 将细胞异质性视为有利的设计要素而非障碍，提出一个结合系统与合成生物学的框架，将细胞输入状态映射到输出命运，以分子层面定义质量属性 | 未提供具体实验验证或案例研究，仅提出概念框架 | 优化干细胞衍生的细胞治疗产品的制造过程，提升其稳健性、产量和质量 | 干细胞衍生的异质性细胞群体及其在细胞治疗生产中的应用 | 系统生物学, 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 18 | 2026-08-12 |
Ectopic expression to synthetic design: Deriving engineering principles of lncRNA-mediated epigenetic regulation
2025-12-17, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101478
PMID:41412114
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综述 | 本文综述了长链非编码RNA介导的表观遗传调控机制，并探讨了通过异位表达和合成设计来工程化lncRNA的策略。 | 提出了从基础研究到合成设计的转化视角，强调利用lncRNA的模块化特性构建可编程的染色质调控系统，以实现基因剂量校正等应用。 | 未详细讨论具体实验设计或实证数据，主要基于现有研究的展望。 | 探讨lncRNA介导的表观遗传调控原理，并为合成生物学中的表观遗传工程提供设计原则。 | 长链非编码RNA（lncRNA）及其介导的表观遗传调控系统。 | 合成生物学 | NA | 异位表达、转基因系统 | NA | 文献综述 | NA | NA | NA | 模块化lncRNA元件构建的可编程染色质调控系统 | 医学、生物技术 |
| 19 | 2026-08-12 |
Integrating synthetic biology to understand and engineer the heart, lung, blood, and sleep systems
2025-12-17, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101446
PMID:41412113
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观点文章 | 本文探讨了合成生物学在心脏、肺、血液和睡眠系统中的应用，强调通过基因组工程、动态基因回路和高维生物传感器实现精确控制，并展望了与AI结合的未来方向 | 提出了将合成生物学与人工智能引导的电路设计相结合，用于构建高分辨率细胞和组织尺度模型的新视角 | 关键挑战包括在生理相关模型中的递送、转基因稳定性和稳健的时空控制 | 理解并工程化心脏、肺、血液和睡眠系统，以促进多细胞生物学的定量模型和跨领域整合 | 心脏、肺、血液和睡眠系统相关细胞和组织 | 合成生物学 | NA | 基因组工程、动态基因回路、高维生物传感器、组学数据 | NA | 组学数据 | NA | NA | 人类细胞 | 可调转录调控器、合成组织器、反馈回路 | 医学、基因治疗、药物开发 |
| 20 | 2026-08-12 |
Accelerated design of Escherichia coli reduced genomes using a whole-cell model and machine learning
2025-10-15, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101392
PMID:40997797
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研究论文 | 本文展示了利用机器学习替代模型加速全细胞模型运行，从而设计具有减少基因组的大肠杆菌细胞。 | 首次将机器学习替代模型应用于全细胞模型以提高计算效率，并成功设计出删除40%基因的大肠杆菌减量基因组。 | 未提及具体局限性，但可能包括依赖全细胞模型的准确性及模拟环境与实验验证的差异。 | 利用机器学习加速全细胞模型，实现高效设计定制化减量基因组的大肠杆菌。 | 大肠杆菌全细胞模型和机器学习替代模型。 | 机器学习, 合成生物学 | NA | 全细胞模型, 机器学习 | 机器学习替代模型 | 全细胞模型模拟数据 | 一个大肠杆菌全细胞模型 | NA | 大肠杆菌 | 减量基因组设计 | 工业生物技术, 合成生物学 |