合成生物学相关文章
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当前共找到 5182 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-06-18 |
A programmable Aeromonas chassis, AMAX2, for advanced biomanufacturing
2026-Jun-17, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.00231-26
PMID:42148730
|
研究论文 | 开发下一代工程化气单胞菌底盘AMAX2，用于先进生物制造 | 通过删除毒力相关和非必需基因增强生物安全性，同时保持快速生长和蛋白质表达，并整合多种功能模块（如无DNA微细胞生成、表面展示、蛋白转运） | 可能存在的长期稳定性或大规模生产中的未知挑战 | 开发可编程的细菌底盘用于工业生物制造和生物治疗 | AMAX2底盘及其工程化功能模块 | 合成生物学 | NA | CRISPRi-seq, 基因工程 | NA | 基因组数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 气单胞菌 | 可诱导系统、表面展示系统、VI型分泌系统、微细胞生成系统 | 工业生物技术, 医药 |
| 2 | 2026-06-18 |
Hydrazinoacetic acid is a biosynthetic precursor of the bacterially produced nitramine, N-nitroglycine
2026-Jun-17, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.00631-26
PMID:42159495
|
研究论文 | 本研究揭示了细菌产生的硝胺类天然产物N-硝基甘氨酸的生物合成路径，鉴定肼基乙酸为关键前体 | 首次阐明N-硝基甘氨酸的生物合成途径，发现肼基乙酸作为前体，并确定其从赖氨酸衍生的硝基氮来源 | 仅通过同位素标记和体外重建验证，尚未在体内完整证实通路；硝胺生物合成中间体为推测性 | 解析细菌产生硝胺类化合物的生物合成机制，探索可持续生产含能硝胺的合成生物学途径 | N-硝基甘氨酸及其生物合成途径 | 合成生物学 | NA | LC-MS/MS, 稳定同位素标记, 生物信息学基因簇分析, 体外酶促重建 | NA | 质谱数据, 晶体结构数据 | NA | NA | NA | 硝胺生物合成途径（涉及肼基乙酸生成） | 能源, 工业生物技术 |
| 3 | 2026-06-18 |
Chemical Synthesis of Mirror-Image Proteins Reveals Chirality-Dependent Cellular Uptake Mediated by a Cell-Penetrating Peptide
2026-Jun-17, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.6c03792
PMID:42307060
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研究论文 | 通过化学合成镜像蛋白，揭示手性依赖的细胞摄取机制，并比较D-型和L-型货物在细胞穿透肽介导下的内化效率 | 首次系统研究在恒定递送载体条件下，货物手性对细胞摄取效率的影响，并证明L-型货物比镜像D-型货物更有效地被内化 | 未探讨不同细胞穿透肽或递送系统手性影响的普适性 | 探究货物手性在细胞穿透肽介导的细胞摄取中的作用 | 不同大小和结构复杂性的L-型和D-型模型货物，共轭至环状十精氨酸细胞穿透肽 | 合成生物学 | NA | 化学合成、流式细胞术、凝胶分析、共聚焦显微镜 | NA | 图像、定量分析数据 | 多种哺乳动物细胞系 | NA | 哺乳动物细胞 | NA | 医学、合成生物学 |
| 4 | 2026-06-18 |
Superfolder Green Fluorescent Protein (sfGFP): A Versatile Tool for Biotechnology Research
2026-Jun-17, Applied biochemistry and biotechnology
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s12010-026-05783-x
PMID:42307699
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综述 | 综述超折叠绿色荧光蛋白（sfGFP）作为生物技术研究通用工具的特性、优势及局限性 | 指出sfGFP的核心价值不在于亮度和光稳定性普遍优越，而在于能在传统GFP变体折叠或性能受损的条件下维持荧光 | 荧光对pH敏感、单体行为依赖背景、光稳定性未优化，需根据应用需求选择并与其他新型GFP比较 | 评估sfGFP在生物技术研究中的多功能应用潜力及其适用场景 | 超折叠绿色荧光蛋白（sfGFP）及其在不同生物技术系统中的应用 | 生物技术 | NA | 蛋白质工程, 荧光蛋白工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物技术, 合成生物学, 蛋白质设计 |
| 5 | 2026-06-18 |
Breaking the photosynthetic monopoly on carbohydrate production through artificial synthesis
2026-Jun-16, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108952
PMID:42303061
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综述 | 批判性审视超越光合作用限制的人工碳水化合物合成策略 | 提出通过人工智能驱动的催化剂设计、模块化合成生物学平台和可再生能源整合来建立经济可行的人工碳水化合物生产 | 辅因子再生效率低、催化剂选择性权衡和经济竞争力是实际部署的主要障碍 | 探索超越光合作用限制的人工碳水化合物合成途径 | 三种主要方法：直接电化学CO₂还原、合成酶级联反应和混合生物人工系统 | 合成生物学 | NA | 直接电化学CO₂还原、合成酶级联反应、混合生物人工系统 | NA | NA | NA | AI驱动的催化剂设计、模块化合成生物学平台 | NA | 人工碳水化合物合成途径 | 农业、环境、能源、工业生物技术 |
| 6 | 2026-06-18 |
Modular Scalable Synthetic Gene Circuits for Complex Functions Within Minimal Computational Layers in Human Cells
2026-Jun-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-74408-y
PMID:42303993
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研究论文 | 提出一种模块化设计框架，在人类细胞中以较少的计算层实现复杂功能的基因电路 | 通过集成正交转剪接AND门、天然-合成杂合启动子和合成microRNA，在最小化计算层的同时实现复杂逻辑功能，克服了传统级联架构的可扩展性障碍 | 可能仍存在负载效应和长期稳定性问题，且适用范围可能受限于特定细胞类型 | 开发可扩展的合成基因电路设计框架，用于人类细胞中的复杂遗传编程 | 人类细胞中的合成基因电路 | 合成生物学 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 正交转剪接、天然-合成杂合启动子、合成microRNA | 人类细胞 | 三输入组合逻辑门、半加器、全加器、动态3对1多路复用器（含专用选择器过载状态输出） | 生物医学, 生物技术, 基础生物学 |
| 7 | 2026-06-18 |
Assembling a True "Olympic Gel" From over 16 000 Combinatorial DNA Rings
2026-Jun, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202520549
PMID:41789447
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研究论文 | 报告从超过16 000个组合DNA环成功组装真正的奥运凝胶，并表征其遗传、机械和结构特性 | 首次从大规模组合DNA环库成功组装具有独特力学和溶胀特性的奥运凝胶，结合聚合物物理、合成生物学和DNA纳米技术创建新型材料平台 | 未明确提及，但可能涉及奥运凝胶的实际应用规模化挑战 | 实现从DNA环组装真正的奥运凝胶并研究其网络拓扑对宏观材料性质的影响 | 超过16 000个不同序列的DNA环 | 合成生物学 | NA | 下一代测序, 振荡流变学, 原子力显微镜, 冷冻电子显微镜, 大规模计算模拟 | NA | 序列数据, 图像, 机械特性数据 | 超过16 000个独特DNA环分子 | 酶促活化, 分子内环化 | NA | DNA环库, 网络拓扑设计 | 生物材料, 仿生系统, 软物质物理 |
| 8 | 2026-06-18 |
Butyrate-Producing Bacteria in Intestinal Disease Therapy: Potential and Challenges
2026-Jun, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.70260
PMID:42307077
|
综述 | 综述丁酸盐产生菌在肠道疾病治疗中的潜力与挑战 | 整合机制理解与转化实践，评估新兴策略如精准益生元、噬菌体介导的生态位工程和AI个性化治疗 | 转化治疗面临瓶颈：丁酸盐产生菌对氧气高度敏感，交叉喂养网络需要生态学方法而非单菌株策略，宿主环境决定丁酸盐的保护或促进作用 | 总结丁酸盐产生菌在肠道健康中的作用机制，评估其在肠道疾病治疗中的转化现状和未来方向 | 丁酸盐产生菌（包括Faecalibacterium prausnitzii、Roseburia spp.、Eubacterium rectale等厌氧厚壁菌门细菌）及其在炎症性肠病、结直肠癌、放射损伤、感染和移植物抗宿主病中的作用 | NA | 炎症性肠病， 结直肠癌， 放射损伤， 感染， 移植物抗宿主病 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学方法 | 人类肠道微生物群 | 丁酸盐产生菌的代谢通路与交叉喂养网络 | 医学 |
| 9 | 2026-06-18 |
Parabiotics as Next-Generation Microbiome Therapeutics: Insights into Mechanisms, Evidence, and Therapeutic Potential
2026-May-02, Current microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00284-026-04942-x
PMID:42069941
|
综述 | 本文综述了后生元作为下一代微生物组疗法的机制、证据和治疗潜力 | 系统阐述了后生元在免疫调节、抗炎和屏障增强方面的独特机制，并总结了其在脆弱人群中的安全优势 | 标准化和监管协调方面仍存在挑战 | 评估后生元作为微生物组靶向干预策略的临床应用前景 | 后生元（非活菌微生物细胞或其成分） | NA | 儿科腹泻、肌肉衰减、肠易激综合征、特应性皮炎、呼吸道感染、内脏脂肪堆积、抗生素相关菌群失调 | 宏基因组学、新一代测序、蛋白质组学、代谢组学、CRISPR-Cas系统、合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas系统 | 嗜酸乳杆菌、副干酪乳杆菌、植物乳杆菌、双歧杆菌 | NA | 医学, 食品 |
| 10 | 2026-06-18 |
Engineered live bacteria for liver diseases and gut-liver axis disorders: from genetic modification to advanced delivery systems
2026-Apr-29, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-026-04483-2
PMID:42057131
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综述 | 综述了工程化活菌在治疗肝脏疾病及肠肝轴疾病中的应用，涵盖从基因修饰到先进递送系统的进展 | 系统总结了内部基因修饰和外部共价连接两种策略，并详述了胶囊、微囊和纳米制剂等新型剂量形式在活菌递送中的应用 | 未讨论工程化活菌在临床应用中的具体安全性评估和长期稳定性问题 | 探讨工程化活菌作为靶向肝脏和肠道疾病的新型治疗方法的潜力 | 工程化活菌菌株（如双歧杆菌、大肠杆菌Nissle 1917、枯草芽孢杆菌、布拉氏酵母菌、罗伊氏乳杆菌）及其递送系统 | 微生物工程 | 肝细胞癌、非酒精性脂肪性肝病、酒精性肝病 | 基因工程、合成生物学 | NA | NA | NA | 基因工程、合成生物学 | 双歧杆菌、大肠杆菌Nissle 1917、枯草芽孢杆菌、布拉氏酵母菌、罗伊氏乳杆菌 | 治疗性分子递送通路、内部基因修饰、外部共价连接 | 医学 |
| 11 | 2026-06-18 |
Molecular kinetics dictate population dynamics in CRISPR-based plasmid defense
2026-Apr-07, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2525424123
PMID:41911458
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研究论文 | 通过成像方法揭示CRISPR质粒防御中分子动力学如何决定群体动态 | 首次将分子动力学、单细胞变异和空间结构多尺度结合，量化CRISPR-Cas系统对质粒传播的影响，并提出基于单细胞参数的预测模型 | 实验基于特定质粒RP4和CRISPR-Cascade系统，可能不适用于其他系统或环境 | 研究分子动力学如何决定细菌群体中CRISPR质粒防御的动态 | 结合质粒RP4和CRISPR-Cascade复合物的细菌群体 | 合成生物学 | NA | 荧光标记、时序成像、单细胞追踪 | 基于智能体的空间模型 | 图像 | 未明确样本数量，涉及细菌群体、单细胞水平分析 | CRISPR-Cas | 细菌 | CRISPR-Cascade质粒防御系统 | 合成生物学, 农业, 医学 |
| 12 | 2026-06-18 |
Editorial: Biofabrication and synthetic biology for enhanced medicinal plant bioproduction
2026, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2026.1876560
PMID:42306426
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 13 | 2026-06-18 |
Genetic Surfaceome E. coli Reprogramming Enables Selective Water Oxidation
2025-11, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202508100
PMID:40817601
|
研究论文 | 通过合成操纵子调控大肠杆菌表面组实现选择性水氧化 | 首次在微生物基因组层面设计合成操纵子，通过冰核蛋白锚定真菌胆红素氧化酶于细胞表面，实现接近零过电位的选择性水氧化，并完全抑制氧还原反应 | NA | 开发可再生的微生物平台用于选择性催化和人工光合作用 | 大肠杆菌表面组工程改造 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、基因工程、蛋白质表达 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 合成操纵子、冰核蛋白锚定、IPTG诱导表达系统 | 能源、环境、生物催化 |
| 14 | 2026-06-18 |
In vivo self-assembled siRNAs within small extracellular vesicles attenuate LRRK2-induced neurodegeneration in Parkinson's disease models
2025-02-10, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society
IF:10.5Q1
DOI:10.1016/j.jconrel.2024.12.045
PMID:39722304
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研究论文 | 利用合成生物学策略，通过基因电路在小细胞外囊泡内自组装siRNA，靶向LRRK2基因，减轻帕金森病模型中的神经退行性变 | 开发了一种基于合成生物学的基因电路，通过静脉注射后能在肝脏中自组装并递送LRRK2 siRNA进入黑质，实现非侵入性靶向治疗 | 研究仅限于小鼠模型，未在人类中验证；长期安全性和有效性尚需评估 | 开发一种通过小细胞外囊泡递送siRNA以治疗帕金森病的方法 | 帕金森病小鼠模型（LRRK2R1441G小鼠） | 合成生物学 | 帕金森病 | 基因电路设计、小细胞外囊泡、siRNA技术 | NA | NA | 多个小鼠模型（具体数量未提及） | NA | 小鼠 | 包含神经元靶向RVG标签和LRRK2 siRNA的基因电路 | 医学 |
| 15 | 2026-06-18 |
Engineering biology and chemical approaches to the construction of vitamin B12 analogues and antivitamins B12 as probes and therapeutic agents
2025, Advances in microbial physiology
DOI:10.1016/bs.ampbs.2025.07.003
PMID:40846392
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综述 | 综述利用工程生物学和化学方法构建维生素B12类似物及抗维生素B12作为探针和治疗剂的研究进展 | 通过合成生物学在E. coli中异源表达有氧B12生物合成途径，高产生物合成中间体和无钴B12前体，并用于生成含铑、镍、锌等过渡金属的金属取代类似物及有机抗代谢物和荧光标记衍生物，用于探针B12依赖酶、追踪维生素运输和选择性破坏微生物或疾病相关代谢 | 文中未明确论述局限性，可能包括合成类似物的体内稳定性、特异性及临床转化的挑战 | 探索合成维生素B12类似物和抗维生素B12在生物研究和治疗中的应用 | 维生素B12类似物、抗维生素B12、金属取代类似物、荧光标记衍生物 | 合成生物学 | NA | 异源表达、化学合成 | NA | NA | NA | 合成生物学 | E. coli | 维生素B12生物合成途径 | 医学, 农业, 环境 |
| 16 | 2026-06-18 |
Reversible Control of Gene Expression by Guest-Modified Adenosines in a Cell-Free System via Host-Guest Interaction
2024-07-10, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.4c04262
PMID:38941287
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研究论文 | 本研究通过宿主-客体相互作用，利用客修饰腺苷在无细胞系统中实现基因表达的可逆控制 | 首次将宿主-客体相互作用应用于无细胞基因表达系统，通过CB[7]与客修饰腺苷的结合实现可逆的基因表达调控 | 未明确说明，但可能涉及修饰效率、可逆性动力学精细调控的复杂性及体内应用的潜在挑战 | 开发一种可逆、可编程的基因表达控制方法，用于无细胞系统和合成生物学 | 客修饰腺苷、CB[7]宿主分子、T7启动子序列、无细胞基因表达系统 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 无细胞系统 | 逻辑门式可逆调控，基于CB[7]与客修饰腺苷的宿主-客体相互作用形成/解离DNA双链结构 | 合成生物学, 医学 |
| 17 | 2026-06-18 |
Reversible Nucleic Acid Storage in Deconstructable Glassy Polymer Networks
2024-06-26, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.4c01925
PMID:38865160
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研究论文 | 提出T-REX方法，利用可分解玻璃聚合物网络实现DNA的可逆存储 | 受化石生物标本长期保存启发，开发了一种基于热固性增强玻璃聚合物网络的DNA封装和提取技术，实现从水性到有机相的快速转移，并允许使用较温和的试剂提取DNA | 该方法的长期稳定性和可扩展性尚需进一步验证，且相比传统低温存储可能面临规模化应用挑战 | 解决核酸长期保存中依赖电力和冷链的问题，提供低成本、时间高效、可持续的DNA保存方案 | 不同长度尺度的DNA分子（从数十碱基到千兆碱基） | 分子生物学 | NA | DNA封装、玻璃聚合物网络、有机相转移 | NA | DNA序列数据 | 涵盖从数十碱基到千兆碱基的DNA样本 | T-REX（热固增强玻璃聚合物网络） | NA | NA | 合成生物学、基因组学、数字信息存储 |
| 18 | 2026-06-18 |
Chemotactic Interactions Drive Migration of Membraneless Active Droplets
2024-06-12, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.4c02823
PMID:38620052
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研究论文 | 研究酶活性的无膜液滴通过趋化相互作用实现集体迁移及其在合成生物学中的应用 | 首次在体外重现无膜液滴通过外部pH梯度驱动的化学趋化集体行为，并利用酶活性调控液滴迁移速度和方向性，进而重建简单的原代谢途径 | NA | 模仿自然界的趋化相互作用，在微米尺度上构建具有细胞特征的无膜活性液滴，并探索其在合成生物学中的潜力 | 酶活性细胞大小的无膜液滴 | 合成生物学 | NA | 酶活性调控、pH梯度生成 | NA | 图像 | NA | NA | NA | 原代谢途径重建 | 医学、工业生物技术 |
| 19 | 2026-06-18 |
Model-guided metabolic rewiring to bypass pyruvate oxidation for pyruvate derivative synthesis by minimizing carbon loss
2024-03-19, mSystems
IF:5.0Q1
DOI:10.1128/msystems.00839-23
PMID:38315666
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research paper | 利用模型指导的代谢重布线，通过最小化碳损失绕过丙酮酸氧化以合成丙酮酸衍生物 | 结合基因组规模代谢模型与三种算法分析来设计菌株，并通过双顺反子盒调控表达、T7 RNA聚合酶介导的小RNA动态控制以及适应性实验室进化筛选非理性设计靶点，建立了新型好氧代谢模式以最小化碳损失 | NA | 设计微生物细胞工厂以在好氧条件下最小化碳损失并高效合成丙酮酸衍生物 | 大肠杆菌（Escherichia coli） | NA | NA | 基因组规模代谢模型、约束通量平衡分析、几何通量平衡分析、通量变量分析 | 基因组规模代谢模型 | NA | NA | CRISPR-Cas9（用于基因编辑）、T7 RNA聚合酶 | 大肠杆菌（E. coli） | 双歧旁路途径、乙醛酸支路、T7 RNA聚合酶介导的合成小RNA开关 | 工业生物技术 |
| 20 | 2026-06-17 |
Engineered commensal Bacteroides thetaiotaomicron enables targeted drug delivery to colorectal tumors
2026-07-10, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society
IF:10.5Q1
DOI:10.1016/j.jconrel.2026.114945
PMID:42036032
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研究论文 | 基于肠道共生菌Bacteroides thetaiotaomicron的工程化细菌系统用于结直肠肿瘤靶向药物递送 | 首次利用人体肠道天然共生菌Bacteroides thetaiotaomicron作为底盘细胞，通过筛选表面锚定蛋白建立高效展示系统，实现肿瘤靶向蛋白HlpA的表面展示及结直肠肿瘤特异性靶向 | NA | 开发基于肠道共生菌的安全靶向癌症治疗策略 | Bacteroides thetaiotaomicron工程化菌株及结直肠肿瘤模型 | 合成生物学 | 结直肠癌 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | Bacteroides thetaiotaomicron | 肿瘤靶向蛋白HlpA表面展示系统及溶血素E治疗模块 | 医学 |