本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['synthetic biology']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价9.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-06-11 |
Xeno nucleic acids (XNAs): advances in synthesis, diagnostics, and therapeutics
2026-Sep-05, Bioorganic chemistry
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.bioorg.2026.110000
PMID:42160832
|
综述 | 系统综述异源核酸(XNA)的基本特性、合成方法、结构表征及其在诊断和治疗中的生物医学应用 | 全面总结异源核酸的结构多样性、合成策略进展,并重点阐述其在FDA批准的寡核苷酸药物和超灵敏液体活检中的突破性临床转化 | 当前面临规模化合成、高效递送系统及结构-功能关系理解不足等挑战 | 综述异源核酸的化学修饰类型、合成技术、表征方法及其在精准医学中的转化潜力 | 异源核酸(含锁核酸、肽核酸、己糖醇核酸、氟阿拉伯糖核酸、吗啉代寡聚体等变体) | 分子生物学 | NA | 亚磷酰胺化学合成、工程化聚合酶介导的酶促合成、热熔分析、圆二色谱、核磁共振、质谱、适应性测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学、生物技术 |
| 2 | 2026-06-11 |
Recombinant human serum albumin-A paradigm shift: From laboratory development to industrial-scale production, and clinical translation
2026-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108914
PMID:42086096
|
综述 | 本文综述了重组人血清白蛋白从实验室开发到工业规模生产和临床转化的路径 | 强调重组人血清白蛋白的生产平台选择不仅基于产量,还综合考虑了可扩展性、成本效益、监管可行性和与下一代纯化策略的兼容性,并展望了其作为多功能生物治疗平台的潜力 | 实现其全部潜力取决于克服生产规模化的经济挑战、确保产品一致性以及利用合成生物学和智能制造 | 总结重组人血清白蛋白的工业化路径并探讨其未来应用价值 | 重组人血清白蛋白的生产平台(酵母和转基因水稻)及临床证据 | NA | NA | 重组蛋白表达、综合多模式纯化技术 | NA | NA | NA | 合成生物学, 智能制造 | 酵母(Komagataella phaffii), 转基因水稻 | NA | 医学, 药物递送, 先进疗法 |
| 3 | 2026-06-11 |
Metabolic engineering strategies for microbial amino acid production: From molecular mechanisms to systems optimization
2026-Aug, Enzyme and microbial technology
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.enzmictec.2026.110901
PMID:42166812
|
综述 | 从分子机制到系统优化,系统综述微生物氨基酸生产的代谢工程策略 | 提出一个涵盖分子、网络和系统三个层面的层级约束策略框架,并评估各策略的权衡与边界条件 | 未提供具体的实验验证或定量比较不同策略的性能 | 指导理性选择代谢工程策略,推动氨基酸生物制造的高效可持续发展 | 微生物细胞工厂 | NA | NA | 代谢工程、合成生物学、系统生物学 | NA | 综述文献 | NA | NA | 微生物 | NA | 医药、食品、保健品、化工 |
| 4 | 2026-06-11 |
Engineering Escherichia coli for high-level poly(3-hydroxybutyrate) production: Recent advances and future perspective
2026 Jul-Aug, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108858
PMID:41765153
|
综述 | 汇总了工程化大肠杆菌高效生产聚(3-羟基丁酸酯)的关键进展,并强调了新兴策略以增强其作为可持续生物塑料生产底盘的作用 | 总结了合成生物学和代谢工程中优化前体可用性、增强还原力、微调途径表达等最新策略,特别是糖酵解工程、合成途径引入、竞争途径删除、phasin表达、启动子优化和辅因子再生等综合方法 | 未提及具体局限性,但可能涉及实际生产中的成本、放大效率或菌株稳定性等挑战 | 促进大肠杆菌作为底盘用于聚(3-羟基丁酸酯)可持续和可规模化生产 | 聚(3-羟基丁酸酯)及重组大肠杆菌 | 合成生物学 | NA | 代谢工程, 合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 大肠杆菌 | 糖酵解途径, 还原性甘氨酸途径, 苏氨酸旁路途径 | 工业生物技术, 环境 |
| 5 | 2026-06-11 |
From biopolymers to microcompartments: A structured review of protein-based scaffolds for enzyme immobilization
2026 Jul-Aug, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108851
PMID:41765154
|
综述 | 本文系统回顾了从生物聚合物到蛋白质支架再到细菌微区室的酶固定化支架研究进展 | 采用层级化视角,从天然生物聚合物到工程化蛋白质支架,再到新兴的类细胞器细菌微区室平台,特别强调细菌微区室在空间精度、选择渗透性和多酶途径封装方面的潜力 | 主要基于现有文献综述,未涉及具体实验验证或量化比较不同支架的性能 | 综述蛋白质基支架在酶固定化中的应用,特别是多酶级联反应和代谢途径控制方面的进展 | 生物聚合物、蛋白质支架、细菌微区室等酶固定化平台 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 细菌 | 多酶途径封装系统 | 工业生物技术, 医药 |
| 6 | 2026-06-11 |
Engineering microbial cell factories for succinic acid biomanufacturing: Challenges and perspectives
2026 Jul-Aug, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108861
PMID:41791685
|
综述 | 系统评估用于琥珀酸生物制造的微生物细胞工厂,并讨论面临的挑战与未来前景 | 通过整合合成生物学工具、系统生物学、代谢建模和过程工程,提出多学科视角的策略框架以优化碳流量、氧化还原平衡和工业化规模 | 未提供具体实验数据或量化比较,可能缺乏对不同微生物平台工业适用性的详细经济分析 | 评估用于琥珀酸生物制造的微生物平台及关键工程设计策略,推动生物基琥珀酸的商业化 | 多种细菌和酵母等微生物细胞工厂 | 机器学习 | NA | 代谢工程, 合成生物学, 系统生物学, 过程工程 | 代谢模型 | NA | NA | 合成生物学工具 | 细菌, 酵母 | 天然与异源生物合成途径设计的逻辑电路 | 工业生物技术 |
| 7 | 2026-06-11 |
Metabolic engineering of microbial pathways for 5-aminolevulinic acid biosynthesis: Recent advances and biotechnological applications
2026-Jul, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2026.03.012
PMID:41881187
|
综述 | 回顾微生物合成5-氨基乙酰丙酸的最新进展及生物技术应用 | 综述了代谢工程和合成生物学在构建高效细菌细胞工厂方面的创新策略,包括前体供应、辅因子再生、途径工程、生物传感器调控及系统代谢控制 | 讨论了当前挑战,如复杂反应途径、低生产率和环境问题,但未提供具体数据对比 | 总结细菌5-ALA生物生产的最新进展,指导下一代微生物平台开发 | 微生物细胞工厂,特别是细菌宿主 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | C4和C5生物合成途径、前体供应、辅因子再生、转运系统、生物传感器调控 | 农业, 医药, 化妆品, 动物饲料工业 |
| 8 | 2026-06-11 |
Engineering aminoacyl-tRNA synthetase activity to enhance branched-chain amino acid biosynthesis
2026-Jul, Biochimie
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.biochi.2026.03.014
PMID:41933685
|
研究论文 | 通过工程化氨酰tRNA合成酶活性来增强支链氨基酸生物合成 | 首次提出将氨酰tRNA合成酶作为提升支链氨基酸产量的工程靶点,综合tRNA修饰、靶向诱变和合成生物学工具创制高效微生物细胞工厂 | 直接工程化BCAA氨酰tRNA合成酶的方法仍较为罕见,需进一步优化 | 探索通过工程化氨酰tRNA合成酶活性提升支链氨基酸微生物产量的策略 | 支链氨基酸(缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸)的微生物合成途径 | 合成生物学、代谢工程 | NA | 代谢工程、靶向诱变、tRNA修饰 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 大肠杆菌, 谷氨酸棒杆菌 | 生长耦合选择系统、氨酰tRNA合成酶-tRNA工程化 | 工业生物技术 |
| 9 | 2026-06-11 |
Deep learning unlocks sequence-divergent synthetic promoters to empower Streptomyces natural product engineering
2026-Jul, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2026.05.009
PMID:42208848
|
研究论文 | 利用深度学习设计序列多样化的合成启动子,以增强链霉菌天然产物的工程化能力 | 首次为链霉菌建立人工智能生成的启动子库,实现前所未有的设计效率、广泛的序列多样性和精确的性能调控 | 启动子库的100个候选序列中仍有8%无活性,且仅在四种链霉菌宿主中验证,泛化性可能有限 | 开发深度学习驱动的启动子设计方法,突破链霉菌遗传工具开发的瓶颈,提升天然产物产量 | 链霉菌天然产物工程化中的合成启动子 | 机器学习 | NA | 深度生成模型 | 深度生成模型 | 基因序列 | 10亿个计算设计的启动子序列,其中100个经实验验证 | NA | 链霉菌 | 合成启动子 | 医药, 工业生物技术 |
| 10 | 2026-06-11 |
Membrane-Spanning Nanopores Formed from Nucleic Acids
2026-Jun-10, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.5c00905
PMID:42173496
|
综述 | 探讨基于核酸(特别是DNA纳米孔)构建的合成跨膜纳米孔的最新进展 | 系统总结了DNA纳米孔从亚纳米离子通道到可定制大分子通道的多样化架构,并突出RNA折纸技术用于基因编码纳米孔的独特潜力 | 未具体说明,但综述性质决定其可能缺乏实验验证和定量比较 | 评述核酸基纳米孔的设计原理、膜锚定方法、脂质重排影响及功能动态调控 | 核酸纳米孔(DNA纳米孔及RNA折纸纳米孔) | 分子生物学 | 未涉及 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 单分子传感, 细胞操纵 |
| 11 | 2026-06-11 |
Engineered Probiotics Protect against Pseudomonas aeruginosa Post Antibiotic Exposure
2026-Jun-10, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00063
PMID:42267686
|
研究论文 | 开发工程化益生菌,在抗生素暴露后保护宿主免受铜绿假单胞菌感染 | 将代谢物补充与抗原特异性黏膜免疫整合,提出模块化可编程益生菌策略 | 仅在抗生素暴露小鼠模型中验证,未涉及人体试验或长期安全性评估 | 探索抗生素治疗后保护宿主免受机会致病菌感染的新方法 | 抗生素暴露后的小鼠模型及铜绿假单胞菌感染 | 合成生物学 | 细菌感染 | 合成生物学工程改造 | Nissle 1917 (EcN) 益生菌模型 | NA | NA | 合成生物学模块 | Escherichia coli Nissle 1917 (EcN) | 丁酸过表达模块及外膜囊泡展示抗原模块 | 医学 |
| 12 | 2026-06-11 |
Scanning the horizon: deep mutational scanning approaches in virology
2026-Jun-10, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.01784-25
PMID:42267826
|
综述 | 总结深度突变扫描技术在病毒学中的最新进展和应用 | 系统回顾了合成生物学如何变革突变文库构建,以及DMS在跨宿主、组织和免疫压力下的突变效应量化新应用 | 主要依赖现有研究总结,未涉及方法本身的局限性讨论 | 综述DMS在病毒学和病毒进化中的技术及概念进展,并展望未来研究方向 | 病毒突变效应及其在病毒基因组中的演化约束 | 病毒学 | NA | 深度突变扫描 | NA | 测序数据 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 13 | 2026-06-11 |
Pharmaco-microdynamics (PMD): Redefining Dose, Exposure, and Control for Living Drug Carriers
2026-Jun-09, Annales pharmaceutiques francaises
IF:1.0Q4
DOI:10.1016/j.pharma.2026.06.002
PMID:42264080
|
综述 | 介绍药效微生物动力学作为量化活体药物递送系统的框架,重新定义剂量、暴露和控制的概念 | 首次提出药效微生物动力学框架,整合药理学、微生物生态学、合成生物学等多学科原理,建立针对活体治疗剂的定量递送科学体系 | 框架仍处于理论阶段,实际应用中的边界条件和有效性需进一步验证 | 建立量化活体药物递送系统的框架以替代传统药代动力学/药效学模型 | 活体药物载体,包括益生菌、工程微生物疗法和活体生物治疗产品 | NA | 苯丙酮尿症、复发性艰难梭菌感染 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 同步裂解细菌肿瘤疗法 | 医学 |
| 14 | 2026-06-11 |
Developing artificial cytoskeletons using RNA origami-based nanotubes
2026-Jun, Progress in biophysics and molecular biology
DOI:10.1016/j.pbiomolbio.2026.02.006
PMID:41765186
|
综述 | 探讨利用基于RNA折纸的纳米管构建人工细胞骨架的概念及其潜在应用 | 提出将RNA折纸作为可编程支架用于构建仿生细胞骨架网络,利用RNA的共转录折叠、三级相互作用及与细胞机器交互等独特优势 | 体内稳定性和有效递送仍是主要挑战 | 为RNA纳米技术与合成细胞工程的交叉领域提供基础理解并启发未来发展 | RNA折纸纳米管及其在人工细胞骨架中的应用 | 合成生物学 | NA | RNA折纸 | NA | NA | NA | RNA折纸 | NA | 纳米管结构,模仿微管和肌动蛋白丝 | 纳米技术, 合成生物学, 医学 |
| 15 | 2026-06-11 |
Advancing Genetic Code Expansion in Live Cells Through Metabolic Engineering
2026-Jun, Annual review of chemical and biomolecular engineering
IF:7.6Q1
|
综述 | 综述通过代谢工程在活细胞中推进遗传密码扩展的研究进展 | 系统总结了通过代谢工程在细胞内合成非标准氨基酸以克服传统依赖外源添加限制的创新策略 | 未具体提及局限性,但可推断当前方法可能面临代谢途径效率、宿主兼容性等挑战 | 探讨代谢工程与遗传密码扩展结合在合成生物学中的应用前景 | 遗传密码扩展技术及非标准氨基酸的生物合成系统 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、遗传密码扩展 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、基础研究、应用研究 |
| 16 | 2026-06-11 |
Advances in biocontainment strategies of engineered microbes for use in humans
2026-Jun, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2026.102727
PMID:41780106
|
综述 | 本文综述了用于人体的工程微生物的生物防护策略的最新进展 | 全面讨论了多种生物防护策略的单独使用和组合使用,以及在临床试验中的应用和效果,并提出了标准化测试生物防护逃逸的需求 | 未明确指出具体研究的局限性,但暗示当前防护策略仍需进一步发展以确保安全 | 综述用于生物医学应用的工程微生物的生物防护策略的现状 | 工程微生物的生物防护策略 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 毒素-抗毒素系统、杀死开关、营养缺陷型、CRISPR靶向DNA降解、非标准氨基酸、物理屏障 | 医学 |
| 17 | 2026-06-11 |
Repurposing bacterial secretion systems for the design of living therapeutics
2026-Jun, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2026.102726
PMID:41780105
|
综述 | 综述利用细菌分泌系统改造共生或益生大肠杆菌,设计活体治疗药物以定向递送治疗蛋白 | 系统比较了不同细菌分泌系统(包括源自病原体的系统)用于工程菌递送治疗性蛋白的优缺点,并以炎症性肠病为例展示了合成生物学在解决治疗递送挑战中的应用 | 未提及具体实验验证或临床转化中的数据,可能停留在概念综述层面 | 探讨通过工程化细菌分泌系统实现治疗蛋白定向递送,克服传统给药方式的系统性副作用 | 共生和益生大肠杆菌及其改造的分泌系统 | 合成生物学 | 炎症性肠病 | 细菌分泌系统工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 大肠杆菌 | 分泌系统(如源自病原体的分泌装置)与转录调控通路 | 医学 |
| 18 | 2026-06-11 |
Combining model-based and data-driven models: An application to synthetic biology resource competition
2026-Jun, Mathematical biosciences
IF:1.9Q3
DOI:10.1016/j.mbs.2026.109649
PMID:41791590
|
research paper | 探索将机器学习与机理模型相结合的方法,并应用于合成生物学资源竞争问题 | 引入部分不确定模型结构(PUMS)和嵌入式物理信息神经网络(ePINNs),确保机器学习组件不忽略机械约束,实现混合建模的鲁棒预测与物理一致性 | 机理模型构建费时费力,且依赖简化假设可能无法完全捕捉现实复杂性 | 结合机器学习与机理模型,提升预测能力、系统洞察力及对稀疏或噪声数据的处理能力 | 基因网络模型中的资源竞争问题 | machine learning | NA | 物理信息神经网络(PINN) | 嵌入式物理信息神经网络(ePINNs) | NA | NA | NA | NA | 基因网络模型,资源竞争电路 | 合成生物学 |
| 19 | 2026-06-11 |
Cytochrome P450-mediated structural diversification of diketopiperazine alkaloids
2026-Jun, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103476
PMID:41793977
|
综述 | 综述细胞色素P450酶催化的二酮哌嗪生物碱结构多样化的最新进展 | 重点介绍了P450酶超越羟基化的催化多样性,包括二聚化、核苷碱基偶联和分子内环化,以及利用工程化P450变体进行可持续生物合成的新策略 | NA | 探讨细胞色素P450酶在二酮哌嗪结构多样化中的作用及其在药物发现中的应用 | 细胞色素P450酶和二酮哌嗪生物碱 | NA | NA | P450酶催化、合成生物学 | NA | NA | NA | 工程化P450变体 | NA | NA | 药物发现、合成生物学 |
| 20 | 2026-06-11 |
Engineering a Virus-Derived X Family DNA Polymerase FvPolX for de novo DNA Synthesis
2026-Jun, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.75017
PMID:41915827
|
研究论文 | 报道了一种源自Faustovirus的X家族DNA聚合酶FvPolX,并通过蛋白质工程改造实现高效的从头DNA合成 | 首次发现并理性改造微生物来源的PolX酶FvPolX,将其从几乎无活性转变为高效催化,同时构建了仅含掌部和拇指亚结构域的最小化突变体,扩展了从头DNA合成的酶工具箱 | NA | 开发和优化微生物来源的X家族DNA聚合酶用于酶促从头DNA合成 | FvPolX酶及其变体,包括突变体和截短版本s149FvPolX | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程理性设计 | NA | NA | NA | 蛋白质工程 | Faustovirus | NA | 工业生物技术 |