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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-02-06 |
Corrigendum to "Precise control of transcriptional stoichiometry in bacteria: From mechanisms to synthetic biology applications" [Biotechnology Advances 86 (2026) 108748]
2026-Oct, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108816
PMID:41611037
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2 | 2026-07-10 |
From fragmented workflows to integrated pipelines: Bridging enzymatic DNA synthesis, assembly, and MutS-based error correction
2026-Oct, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108941
PMID:42225240
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综述 | 本文回顾了酶促DNA合成、组装和基于MutS的纠错技术的集成方法,提出构建从片段化工作流到集成管线的基因合成流程 | 强调上游选择对下游结果的约束关系,提出基于MutS的酶促错配清除策略具有更优的纠错效率和流程兼容性,并论证酶促DNA合成与下游酶促过程的水相兼容性为构建连续自动化工作流创造了机会 | 未提供具体的实验验证或定量比较不同纠错策略的性能数据 | 探讨如何将酶促DNA合成、片段组装和MutS纠错整合为连续自动化工作流,以实现高保真、高通量和可扩展的基因与通路级DNA序列构建 | 酶促DNA合成、片段组装、基于MutS的纠错技术以及基因构建流程的集成 | 合成生物学 | NA | 酶促DNA合成、MutS酶促错配清除、基因组装 | NA | NA | NA | MutS | NA | NA | 合成生物学、生物技术 |
| 3 | 2026-07-10 |
Liquid-liquid phase separation in metabolic engineering: Mechanistic insights, emerging applications, and future challenges
2026-Oct, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108931
PMID:42225537
|
综述 | 系统总结液-液相分离在代谢工程中的设计原理、分子决定因素和调控策略,及其在代谢通道、基因表达控制和可编程细胞功能模块构建中的应用 | 首次系统整合液-液相分离与人工智能/深度学习在代谢工程中的应用,建立序列-相行为定量关系,推动从经验设计向预测性工程框架转变 | 凝聚体老化及与宿主细胞环境的兼容性等关键挑战尚未完全解决,限制了下一代稳定可调凝聚体的开发 | 为合成生物学和代谢工程领域提供集成理论框架和前瞻性视角,促进基于液-液相分离的下一代可编程微生物细胞工厂平台开发 | 基于液-液相分离的人工凝聚体及其在代谢工程中的应用 | 合成生物学, 代谢工程 | NA | NA | 深度学习 | 序列数据 | NA | NA | 微生物细胞 | 人工凝聚体(代谢通道、基因表达调控、可编程功能模块) | 工业生物技术, 医学 |
| 4 | 2026-07-10 |
Recent advances in microbial production of S-adenosyl-L-methionine and its high-value derivatives
2026-Oct, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108948
PMID:42288128
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综述 | 综述了利用微生物生产S-腺苷-L-甲硫氨酸及其高价值衍生物的最新进展 | 重点总结了系统代谢工程和合成生物学在提高微生物系统中SAM生物合成、利用和循环方面的策略,特别是SAM在合成阿魏酸、麦角硫因、肌酸、亚精胺和β-甲基苯丙氨酸等代表性衍生物中的作用 | 当前挑战包括工业生产仍依赖化学合成,环境负担和可持续性问题尚未完全解决 | 推动微生物平台实现SAM及其高价值衍生物的可持续生物制造 | 微生物系统中的SAM及其衍生物(如阿魏酸、麦角硫因、肌酸、亚精胺和β-甲基苯丙氨酸) | 数字生物学 | NA | 系统代谢工程、合成生物学 | NA | 文本 | NA | NA | 微生物(具体种类未提及) | SAM生物合成和循环途径 | 工业生物技术 |
| 5 | 2026-07-10 |
Breaking the photosynthetic monopoly on carbohydrate production through artificial synthesis
2026-Oct, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108952
PMID:42303061
|
综述 | 批判性审视超越光合作用限制的人工碳水化合物合成途径策略 | 提出通过人工智能驱动的催化剂设计、模块化合成生物学平台和可再生能源整合来突破光合作用局限的创新思路 | 辅因子再生效率低、催化剂选择性权衡和经济竞争力不足是当前实际应用的主要障碍 | 建立人工碳水化合物合成途径以超越光合作用的效率、空间和时间限制 | 三种人工碳水化合物合成途径:直接电化学CO₂还原、合成酶级联反应和杂合生物人工系统 | 合成生物学 | NA | 电化学还原、酶工程、生物人工系统 | NA | NA | NA | 模块化合成生物学平台 | NA | 人工碳水化合物合成途径 | 农业,能源,环境,工业生物技术 |
| 6 | 2026-07-10 |
Codon compression and novel codon creation for multiplex non-canonical amino acid incorporation
2026-Oct, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108961
PMID:42342169
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综述文章 | 系统分类了用于多重非规范氨基酸整合的两种主要策略框架:自然密码子压缩和新型密码子创建 | 首次将多重非规范氨基酸整合策略系统分为密码子压缩和新型密码子创建两大框架,并提出结合部分密码子压缩、适应性实验室进化和人工智能辅助设计的集成未来流程 | 依赖于宿主适应性、编码容量和整合效率的多重约束因素分析,但未提供具体的实验验证数据 | 推进合成生物学中多重非规范氨基酸同时整合的关键前沿技术 | 非规范氨基酸的遗传编码系统及多重整合策略 | 合成生物学 | NA | 遗传密码扩展技术、全基因组重编码、非天然碱基对技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 蛋白质工程、合成生物学 |
| 7 | 2026-07-10 |
Engineered microorganisms unlock a new era of diterpenoid biomanufacturing: recent advances and future perspectives
2026-Jul-09, Bioresources and bioprocessing
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s40643-026-01094-5
PMID:42420691
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综述 | 总结了通过工程微生物生产二萜类化合物的最新进展,并展望了未来方向 | 系统综述了二萜类化合物在微生物细胞工厂中的生物合成途径构建和工程策略,强调了工业规模应用的潜力 | 未提供具体的实验数据或定量比较,可能缺乏对特定挑战的深入分析 | 探讨二萜类化合物微生物合成的进展、挑战和未来前景 | 二萜类化合物的生物合成途径和工程微生物菌株 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌, 酿酒酵母, 解脂耶氏酵母, 圆红冬孢酵母 | 二萜类化合物生物合成途径 | 医药, 化妆品, 食品添加剂, 工业生物技术 |
| 8 | 2026-07-10 |
Scarless one-tube genome assembly via computationally optimized uracil-DNA glycosylase reactions
2026-Jul-08, RSC chemical biology
IF:4.2Q2
DOI:10.1039/d5cb00317b
PMID:42238783
|
研究论文 | 本研究提出了一种利用尿嘧啶-DNA糖基化酶的单管无疤痕基因组组装平台,用于高效构建工程噬菌体 | 无需长同源臂、限制性酶切位点、Cas系统或同源重组,通过尿嘧啶-DNA糖基化酶实现模块化基因组组装,并减少二级结构形成风险 | NA | 开发一种快速、灵活的噬菌体基因组组装和编辑方法 | T7噬菌体基因组 | 合成生物学 | NA | 尿嘧啶-DNA糖基化酶反应 | NA | NA | NA | 尿嘧啶-DNA糖基化酶 | T7噬菌体 | NanoLuc荧光素酶报告基因整合入T7基因组 | 医学、环境监测、工业生物技术 |
| 9 | 2026-07-10 |
Tangled Tail of Mechanically Interlocked Peptides
2026-07-08, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.6c05395
PMID:42334221
|
综述 | 本文系统回顾了天然存在的机械互锁肽和化学合成肽基互锁分子,旨在建立统一命名法并促进跨学科研究 | 首次统一天然与人工合成机械互锁肽的命名体系,通过比较两者的化学特性架起分子生物学与超分子化学的桥梁 | 未详细讨论机械互锁肽在合成生物学中的具体工程化应用案例 | 建立机械互锁肽的统一分类命名体系,促进跨学科研究合作 | 天然存在的机械互锁肽和化学合成的肽基机械互锁分子 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 机械互锁肽(包括串联环、链甲结构等拓扑结构) | 合成生物学基础研究 |
| 10 | 2026-07-10 |
The structural chemistry and biosynthesis of chlorophylls
2026-Jul-08, RSC chemical biology
IF:4.2Q2
DOI:10.1039/d6cb00082g
PMID:42370298
|
研究论文 | 综述叶绿素的结构化学与生物合成途径,涵盖从原卟啉IX到叶绿素a的七步反应及多种叶绿素和细菌叶绿素的合成机制,并利用AlphaFold 3建模预测酶结构 | 利用AlphaFold 3建模完整叶绿素生物合成酶体系,揭示亚基关联、辅因子排列及催化机制,提出底物结合与产物转移新模型,为合成生物学构建杂合途径扩展光谱范围提供见解 | 未提及具体实验验证或实际应用案例 | 阐明叶绿素和细菌叶绿素的生物合成途径及结构化学特征,探索利用合成生物学扩展太阳光谱利用范围的潜力 | 叶绿素a、b、c、d、f以及细菌叶绿素a、b、e等 | 结构生物学 | NA | AlphaFold 3 | AlphaFold 3 | NA | NA | 合成生物学方法 | NA | 杂合叶绿素和细菌叶绿素合成途径 | 能源、农业 |
| 11 | 2026-07-10 |
pH-Tolerant Tripeptide Coacervates as Biomimetic Catalytic Microreactors
2026-Jul-08, Chemistry (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/chem.71406
PMID:42417505
|
研究论文 | 构建基于三肽的凝聚液滴作为仿生催化微反应器,具备广泛的pH和盐浓度耐受性 | 通过将芳香族残基和低聚乙二醇基团整合到最小肽序列中,设计出环境耐受性强的三肽凝聚液滴,实现高效催化和多功能应用 | 未提及具体局限性 | 开发环境稳定且功能多样的仿生催化微反应器,用于增强化学反应效率 | 三肽凝聚液滴及其在催化反应中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 凝聚液滴微反应器 | 合成生物学,前生物化学 |
| 12 | 2026-07-10 |
Protein Turnover in Plants - Cost of Synthesis, Repair and Crop Engineering Opportunities
2026-Jul-08, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiag481
PMID:42418770
|
综述 | 本文探讨植物蛋白质周转的代价,包括合成、修复及作物工程机会 | 强调化学损伤作为蛋白质周转的重要原因,并系统分析其呼吸成本对作物产量的影响,提出利用修复机制改善作物性能的新策略 | 未详细讨论不同植物物种中蛋白质修复机制的差异,以及实际田间应用面临的挑战 | 理解蛋白质损伤的原因、能量后果及修复机制,为提高作物产量提供工程策略 | 植物中的蛋白质周转过程,包括损伤、修复和合成 | 植物生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | 植物 | 蛋白质修复机制及代谢途径优化 | 农业 |
| 13 | 2026-07-10 |
Engineering commensal microbes for host health
2026-Jul-08, Cell host & microbe
IF:20.6Q1
DOI:10.1016/j.chom.2026.05.025
PMID:42419270
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综述 | 总结工程化活体生物治疗产品(eLBPs)在多种疾病中的应用进展 | 提出了下一代eLBPs理性设计的框架,综合了底盘选择、DNA递送、治疗表达调控和生物遏制系统的进展 | 在实现可预测定植、持久治疗活性和体内稳健生物遏制方面仍存在挑战 | 综述工程共生微生物在宿主健康中的应用,并推动eLBPs从实验系统向临床应用的转化 | 工程化活体生物治疗产品(eLBPs)及其在炎症性疾病、代谢疾病、癌症和感染性疾病中的应用 | 合成生物学 | 炎症性疾病、代谢疾病、癌症、感染性疾病 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 共生微生物 | 感知和响应宿主生理信号的微生物疗法 | 医学 |
| 14 | 2026-07-10 |
A portable Cas6f-based system for multiplex translational repression in bacteria
2026-Jul-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-75135-0
PMID:42420316
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研究论文 | 提出了一种基于Cas6f的紧凑型系统MORTISE,用于革兰氏阴性菌中可编程、可调谐的多重翻译抑制 | 该系统不依赖宿主Hfq或RNase因子,能在不同细菌物种中稳健运行,同时实现单启动子多重敲低和一步法组装多达九个引导序列 | NA | 开发一种紧凑、正交且可移植的多重翻译抑制系统,以解决合成生物学中精准调控的挑战 | 革兰氏阴性菌中的翻译抑制 | 合成生物学 | NA | Cas6f系统 | NA | NA | NA | Cas6f | 大肠杆菌, 恶臭假单胞菌 | 多重翻译抑制系统MORTISE | 工业生物技术, 代谢工程 |
| 15 | 2026-07-10 |
A Minimal Four-Enzyme Suite Enables Biosynthesis of the C20 Diterpenoid Alkaloid Atisinium
2026-Jul-08, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2026.07.004
PMID:42421322
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研究论文 | 本研究揭示了一种由四个酶组成的紧凑模块,能够将ent-atiserene转化为C20二萜生物碱atisinium,阐明了二萜生物碱核心骨架组装的最小分子基础 | 首次定义了由三个细胞色素P450单加氧酶和一个新功能化短链脱氢酶/还原酶组成的最小四酶模块,实现了二萜生物碱核心骨架的完整合成途径解析,并在烟草和酵母中异源重建 | NA | 阐明二萜生物碱核心骨架组装的分子机制,并为合成生物学途径重建提供基础 | 毛茛科植物露蕊乌头中的二萜生物碱生物合成途径相关酶 | 合成生物学 | NA | 病毒诱导基因沉默, 异源表达, 酶活性分析 | NA | NA | NA | NA | 烟草, 酵母 | 二萜生物碱生物合成途径 | 医药 |
| 16 | 2026-07-10 |
The human microbiome as a source of novel bioactive natural products: structures, bioactivities, and biosynthetic insights
2026-Jul, Journal of natural medicines
IF:2.5Q3
DOI:10.1007/s11418-026-02044-3
PMID:42251226
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综述 | 综述人类微生物组作为新型生物活性天然产物来源的结构、生物活性及生物合成见解 | 从共进化视角系统总结人类微生物组中生物活性天然产物的结构多样性、生物合成途径及治疗潜力,并整合宏基因组学、单细胞基因组学、合成生物学等多组学策略以加速发现 | 未提及具体局限性,可能包括微生物组中大量不可培养微生物的限制及临床转化的挑战 | 概述人类微生物组中发现的关键代谢物的结构特征、生物合成途径和生物活性,以及发现策略和治疗应用前景 | 人类微生物组中的微生物及其产生的生物活性天然产物 | 机器学习和深度学习 | 免疫相关疾病、感染性疾病、神经系统疾病 | 宏基因组学、单细胞基因组学、合成生物学、组学整合分析、基因组挖掘 | NA | 基因组数据、代谢组数据 | NA | 合成生物学 | 人类微生物组(肠道、口腔、皮肤、阴道) | NA | 医学、药物开发 |
| 17 | 2026-07-10 |
Salt as a Master Regulator of Microbial Assembly and Metabolic Pathways in Fermented Fish: From Preservation to Flavor Innovation
2026-Jul, Comprehensive reviews in food science and food safety
IF:12.0Q1
DOI:10.1111/1541-4337.70561
PMID:42415276
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综述 | 本文综述了盐度作为发酵鱼中微生物组装和代谢途径的主调控因子的作用,探讨了从传统防腐到风味创新的转变 | 提出从经验加工转向精准代谢调控的范式转变,通过整合多组学与合成生物学重建微生物网络,以解决减盐带来的安全与风味挑战 | 未提供具体实验数据或案例验证,仅基于现有文献提出概念框架 | 分析盐度调控发酵鱼中微生物群落组装和代谢轨迹的机制,并探索减盐条件下的安全与风味创新策略 | 发酵鱼中的微生物群落(如嗜盐菌、乳酸菌、酵母)及其代谢产物 | 食品生物技术 | NA | 多组学、合成生物学 | NA | 文献综述数据 | NA | NA | NA | 微生物代谢网络重建 | 食品工业 |
| 18 | 2026-07-10 |
Next-Generation Cyanobacterial Biocontrol Agents for Crop Fungal Diseases: Molecular Mechanisms, Omics Insights, Applications, and Biosafety Considerations
2026-Jul, Journal of basic microbiology
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/jobm.70181
PMID:42423136
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综述 | 综述蓝细菌作为作物真菌病害生物防治剂的研究进展、分子机制及生物安全性考虑 | 系统整合蓝细菌抗真菌代谢物的分子机制、组学见解及合成生物学应用前景,为开发可持续作物保护方案提供新视角 | 田间应用受环境多变性和制剂限制,综述未提供具体实验验证数据 | 总结蓝细菌在真菌病害管理中应用的最新进展,讨论生物安全性问题,展望未来研究方向 | 蓝细菌及其抗真菌代谢物(如VOC、EPS、裂解酶) | NA | 作物真菌病害 | 多组学方法(基因组挖掘)、合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 蓝细菌 | 生物控制剂(抗真菌代谢物通路) | 农业 |
| 19 | 2026-07-10 |
To Biotic or Abiotic: Biohybrid Systems for Artificial Photosynthesis
2026-Jun-29, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.5c00963
PMID:42371621
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综述 | 综述生物-非生物界面杂合系统在人工光合作用中的进展 | 探讨合成生物学、计算与可视化技术以及高分辨率表征方法在提升电子传递过程和设计架构方面的综合应用,为超越自然系统提供新途径 | NA | 推动人工光合作用及生物-非生物杂合系统的实际应用发展 | 自然光合蛋白质、无机光催化剂和高级生物杂合材料 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 可再生能源、人工光合作用 |
| 20 | 2026-07-10 |
Metabolic Engineering of Microbial Cell Factories for Sustainable Production of Glycolic Acid: Pathways, Chassis, and Strategies toward Poly(glycolic acid) Bioplastics
2026-Jun-24, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00078
PMID:42340804
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综述 | 系统总结利用微生物细胞工厂可持续生产乙醇酸的最新进展,包括关键生物合成途径、底盘生物和策略,并探讨其在聚乙醇酸生物塑料中的应用 | 全面比较了多种生物合成途径(乙醛酸支路、C5-糖裂解途径和新路线)及底盘生物,并强调了代谢工程与合成生物学方法(如酶优化、动态调控)以及工业化关键方面(如下游处理、技术经济分析和生命周期评估) | 文中未明确提及具体局限,但综述性质可能缺乏实验验证和定量比较 | 总结微生物合成乙醇酸的可持续生产路径和策略,推动聚乙醇酸生物塑料的工业化发展 | 微生物细胞工厂及其代谢途径和底盘生物 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、系统代谢工程、AI辅助设计 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 代谢工程工具 | 多种微生物底盘(如大肠杆菌、酵母等) | 乙醛酸支路、C5-糖裂解途径、新型代谢途径、动态调节回路(基于生物传感器) | 工业生物技术, 材料 |