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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-02-16 |
Causes and consequences of experimental variation in Nicotiana benthamiana transient expression
2026-Feb-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69458-1
PMID:41690913
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研究论文 | 本研究通过分析本氏烟草瞬时表达实验中的变异来源,建立了变异模型并提出了减少变异性的实验设计指南 | 首次对本氏烟草农杆菌浸润瞬时表达系统的实验变异进行了全面建模分析,并基于三年纵向数据提出了量化实验设计指南 | 研究主要针对本氏烟草系统,结论可能不直接适用于其他植物瞬时表达系统 | 探究本氏烟草瞬时表达实验中的变异来源并建立减少变异性的实验设计方法 | 本氏烟草(Nicotiana benthamiana)农杆菌浸润瞬时表达系统 | 合成生物学 | NA | 农杆菌浸润瞬时表达技术 | 变异模型、功效分析 | 实验数据 | 1915株植物(三年纵向数据) | 农杆菌介导的基因递送 | 本氏烟草(Nicotiana benthamiana) | 瞬时表达系统 | 农业、工业生物技术 |
| 2 | 2026-02-16 |
Microbial medicines: Unlocking the therapeutic potential of the microbiome in cancer treatment
2026-Feb-12, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society
IF:10.5Q1
DOI:10.1016/j.jconrel.2026.114720
PMID:41690480
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综述 | 本文综述了工程化微生物作为癌症治疗剂的应用,重点探讨其在检测疾病标志物和精准递送治疗载荷方面的潜力 | 利用合成生物学和基因工程技术开发工程化微生物,以靶向肿瘤微环境并增强抗肿瘤免疫力,为癌症治疗提供新策略 | 存在个体间变异性、安全性问题以及监管障碍等挑战 | 评估微生物作为治疗剂在癌症治疗中的应用潜力 | 工程化微生物及其在胰腺癌、乳腺癌、肺癌和结直肠癌等癌症治疗中的作用 | 合成生物学 | 癌症 | 基因工程、合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 细菌 | 生物传感器、逻辑门 | 医学 |
| 3 | 2026-02-16 |
Microbial electrochemical synergy: A mechanistic framework for enhanced bioelectrochemical remediation of halogenated organic pollutant in soil-water matrices
2026-Feb-09, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2026.141415
PMID:41690271
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综述 | 本文提出了一个名为“微生物电化学协同”的概念框架,用于系统解析生物电化学系统在修复土壤-水基质中卤代有机污染物的性能 | 提出了一个整合性的机制框架,将机器学习、多组学和合成生物学工具协同起来,以指导下一代生物电化学技术的理性设计和精确调控 | NA | 提升生物电化学系统在复杂土壤-水基质中修复卤代有机污染物的可扩展性和可持续性 | 生物电化学系统及其在修复卤代有机污染物中的应用 | NA | NA | 机器学习,多组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 环境 |
| 4 | 2026-02-16 |
Machine learning-optimized long single-stranded DNA synthesis technology empowers high-precision diagnostic-therapeutic integration in living cells
2026-Feb-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag131
PMID:41674382
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研究论文 | 本研究开发了一种名为Ouroborosyn-ssDNA的NEAR平台,通过酶工程与计算优化相结合,实现了长单链DNA的高纯度合成,并应用于活细胞的高精度诊疗一体化 | 结合phi29 DNA聚合酶和Nb.BbvCI切口酶于甲酸盐缓冲液中,显著提升了ssDNA的合成长度(达15000 nt)和产率(提升4.73倍),并利用机器学习优化了镁离子动态和热调制等关键参数 | NA | 解决当前DNA纳米技术在合成长单链DNA时面临的高纯度与均质性不足的挑战 | 长单链DNA(ssDNA)的合成技术及其在活细胞诊疗一体化中的应用 | 合成生物学 | 宫颈癌 | 切口酶辅助复制(NEAR)、固相合成、机器学习优化 | NA | NA | NA | CRISPR | 宫颈癌细胞 | 六螺旋束DNA折纸-CRISPR复合物,用于核仁素靶向的基因组编辑 | 医学 |
| 5 | 2026-02-16 |
LINC00973/DTX3L Axis Promotes Non-Small Cell Lung Cancer Progression and Serves as a Therapeutic Target
2026-Feb, Smart medicine
DOI:10.1002/smmd.70029
PMID:41684454
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研究论文 | 本研究揭示了长链非编码RNA LINC00973在非小细胞肺癌中通过稳定DTX3L蛋白并激活AKT信号通路促进肿瘤进展的机制,并开发了基于外泌体递送siRNA的靶向治疗策略 | 首次发现LINC00973/DTX3L轴在非小细胞肺癌中的致癌作用,并创新性地采用RGD修饰外泌体和合成生物学策略实现靶向治疗 | 未明确LINC00973在肺癌亚型中的特异性表达差异,临床前模型的长期安全性尚未验证 | 探究LINC00973在非小细胞肺癌中的生物学功能及治疗靶点价值 | 非小细胞肺癌组织样本、肺癌细胞系、小鼠肿瘤模型 | 肿瘤生物学 | 肺癌 | 高通量测序、功能获得/缺失实验、外泌体递送技术、合成生物学 | NA | RNA测序数据、临床病理数据、体内外实验数据 | 配对的NSCLC肿瘤组织与癌旁组织样本(具体数量未说明) | 合成生物学技术 | 小鼠模型、肝脏细胞(用于外泌体生产) | 基于肝脏生产携带靶向siRNA外泌体的合成生物学系统 | 医学 |
| 6 | 2026-02-16 |
Mining the Hidden Pharmacopeia: Fungal Endophytes, Natural Products, and the Rise of AI-Driven Drug Discovery
2026-Jan-29, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27031365
PMID:41683797
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综述 | 本文综述了真菌内生菌天然产物的化学与生物合成多样性,并探讨了人工智能如何将天然产物发现从经验筛选转变为具有直接工业应用价值的预测性学科 | 将真菌内生菌的进化优化化学与现代人工智能工具相结合,系统性地扩展、工程化和工业化天然产物先导化合物,以应对生物医学和可持续性挑战 | NA | 探讨人工智能如何变革天然产物发现领域,并将其转化为具有工业应用价值的预测性学科 | 真菌内生菌产生的天然产物及其生物合成基因簇 | 机器学习 | NA | 人工智能、机器学习、深度学习、多组学整合 | 生成式AI、扩散模型 | 基因组数据、代谢组数据、生物合成基因簇数据 | NA | NA | NA | NA | 药物发现、合成生物学 |
| 7 | 2026-02-16 |
Phage Therapy in Plant Disease Management: 110 Years of History, Current Challenges, and Future Trends
2026-Jan-24, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants15030368
PMID:41681534
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综述 | 本文回顾了噬菌体疗法在植物病害管理中110年的历史,探讨了当前挑战和未来趋势 | 整合了合成生物学、先进噬菌体递送系统和人工智能,以推动下一代生物农药的开发 | NA | 回顾噬菌体疗法在植物病害管理中的历史、挑战和未来趋势 | 噬菌体(细菌病毒)及其在植物病害控制中的应用 | NA | 植物病害 | 噬菌体疗法 | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 农业 |
| 8 | 2026-02-16 |
Membrane and proteome allocation constraints in Escherichia coli models during overflow metabolism
2026-Jan-23, Biophysical journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.bpj.2026.01.028
PMID:41580894
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研究论文 | 本研究开发了膜相关约束通量平衡分析模型,以探究大肠杆菌在溢流代谢中膜资源分配的关键作用 | 引入了可调节的膜蛋白质量约束,首次在基因组尺度模型中整合膜分配限制,提高了溢流代谢预测的准确性 | 模型可能未涵盖所有膜相关生物物理因素,且主要基于大肠杆菌,在其他微生物中的普适性有待验证 | 探究膜资源分配如何与整体蛋白质组限制共同调控细菌生理和溢流代谢 | 大肠杆菌的代谢策略和膜蛋白表达 | 代谢工程 | NA | 通量平衡分析 | MAFBA | 基因组尺度代谢模型数据 | NA | NA | 大肠杆菌 | NA | 工业生物技术 |
| 9 | 2026-02-15 |
Synergistic defense in cotton: Lignin-mediated barriers and JA/ET signaling pathways against Verticillium wilt
2026-Mar, Plant science : an international journal of experimental plant biology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.plantsci.2025.112943
PMID:41407016
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综述 | 本文综述了棉花通过木质素物理屏障与JA/ET信号通路协同防御黄萎病的机制 | 揭示了木质素介导的物理屏障与JA/ET信号通路的协同防御机制,并识别了关键调控因子GhBLH7-D06、GhKWL1和GbTCP20 | 不同棉花品种中通路的贡献度存在争议,且环境调控机制尚不明确 | 阐明棉花对黄萎病的协同防御机制,为开发持久广谱的抗病策略提供理论基础 | 棉花(Gossypium spp.)及其与黄萎病菌(Verticillium dahliae)的互作 | 植物病理学/合成生物学 | 植物病害(黄萎病) | 多组学分析(multi-omics) | NA | NA | NA | CRISPR | 棉花 | JA/ET信号通路与苯丙烷类代谢途径的协同调控网络 | 农业 |
| 10 | 2026-02-15 |
Expression of nano-engineered RNA organelles in bacteria
2026-Feb-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69336-w
PMID:41688461
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研究论文 | 本文利用RNA纳米技术在细菌中设计和表达非天然的膜无细胞器 | 采用分支RNA基序通过碱基配对相互作用共转录组装,实现正交、非混合的凝聚体,并嵌入蛋白质结合适配体实现选择性蛋白质招募 | NA | 设计合成生物分子凝聚体以研究其自然对应物的功能,并用于细胞和代谢工程 | 大肠杆菌中的合成膜无细胞器 | 合成生物学 | NA | RNA纳米技术 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌 | 合成膜无细胞器(凝聚体),具有可逆溶解和重组装特性 | 生物技术 |
| 11 | 2026-02-15 |
The emerging impact of CRISPR and gene editing on global crop improvement
2026-Feb-14, Transgenic research
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s11248-026-00484-x
PMID:41688767
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综述 | 本文全面评述了CRISPR基因编辑技术对全球作物改良的影响、机制、应用及未来潜力 | 系统总结了CRISPR技术从基础机制到多样化编辑工具(如碱基编辑、先导编辑、表观基因组编辑)的发展,并探讨了其与合成生物学、人工智能等前沿技术融合的前景 | 存在脱靶效应、监管障碍、伦理问题及公众接受度等挑战 | 探讨CRISPR基因编辑技术在全球作物改良中的应用与影响 | 植物(作物) | NA | NA | CRISPR-Cas9, 碱基编辑, 先导编辑, 表观基因组编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 细菌, 古菌, 植物 | NA | 农业 |
| 12 | 2026-02-15 |
Biodesulfurization: Back on-stage through synthetic biology and metabolic engineering approaches
2026-Feb-12, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103449
PMID:41687421
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综述 | 本文综述了利用合成生物学和代谢工程方法复兴生物脱硫技术的最新进展,重点关注4S途径及其在红球菌和革兰氏阴性菌平台中的应用 | 整合了红球菌(野生型性能、调控、系统生物学和基因工程)与革兰氏阴性菌平台(特别是假单胞菌)的最新进展,其中操纵子重构和底盘设计与工艺级限制条件相结合 | NA | 探讨通过合成生物学和代谢工程方法实现生物脱硫技术的商业化应用 | 中馏分燃料中的持久性有机硫化合物及其生物脱硫过程 | NA | NA | 合成生物学、代谢工程、系统生物学、基因工程 | NA | NA | NA | 操纵子重构、底盘设计 | Rhodococcus, Pseudomonas | 4S途径(生物脱硫途径)、操纵子架构(基因顺序、翻译调控、染色体整合) | 能源, 工业生物技术 |
| 13 | 2026-02-15 |
Design and engineering of photorespiration bypasses in plants
2026-Feb-11, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2026.02.007
PMID:41687960
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综述 | 本文综述了通过合成生物学方法设计和工程化植物中的光呼吸旁路,以克服C3植物光呼吸导致的碳损失并提高光合效率 | 将光呼吸旁路分为三类:叶绿体定位的碳释放旁路、碳中性旁路和碳正性旁路,并强调了一些将乙醇酸代谢导向高价值代谢物生产的策略 | NA | 克服C3植物光呼吸的固有局限性,提高光合效率 | 植物中的光呼吸旁路 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 植物 | 光呼吸旁路,包括碳释放、碳中性和碳正性旁路,以及乙醇酸代谢重编程 | 农业 |
| 14 | 2026-02-15 |
"Microbial metabolites in cardioprotection: an immune-engineered framework for heart failure and post-ischemic remodeling: a narrative review"
2026-Feb, Annals of medicine and surgery (2012)
DOI:10.1097/MS9.0000000000004529
PMID:41675890
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综述 | 本文是一篇叙述性综述,探讨了肠道微生物代谢物在心血管保护中的作用,特别是针对心力衰竭和缺血后重塑,并提出了一个免疫工程框架 | 提出了一个将合成生物学、新型递送系统和后生元制剂相结合的“免疫工程框架”,用于精准调控肠道-心脏轴,这代表了一种治疗心血管疾病的新范式 | 存在显著的转化障碍,包括药代动力学、监管以及微生物群异质性等问题,且临床验证和监管标准化仍至关重要 | 客观评估肠道微生物代谢物的心脏保护潜力,探讨其分子通路、治疗选择及转化障碍 | 肠道微生物代谢物(如短链脂肪酸、尿石素、吲哚、氧化三甲胺、硫化氢)及其对心血管系统的影响 | NA | 心血管疾病 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 医学 |
| 15 | 2026-02-15 |
Gene insertion and transcriptional regulation of Escherichia coli based on CRISPR-associated transposases
2026-Jan-31, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.149850
PMID:41628878
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研究论文 | 本研究基于CRISPR相关转座酶开发了MUSCULAR-CAST和Tn-CRISPRi工具,用于实现大肠杆菌中大型多顺反子表达盒的高效基因组整合和基因表达调控 | 开发了基于Tn6677型IF CRISPR相关转座酶系统的可编程工具MUSCULAR-CAST,首次实现了1-10K大小多顺反子表达盒的高效基因组整合,并基于其靶向模块开发了具有广泛PAM序列适应性的基因抑制工具Tn-CRISPRi | NA | 开发合成生物学中用于基因组整合和转录调控的高效工具 | 大肠杆菌 | 合成生物学 | NA | CRISPR相关转座酶系统 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, CRISPRi | E. coli | 多顺反子表达盒整合、基因抑制回路 | 工业生物技术 |
| 16 | 2026-02-15 |
Stem cells in organogenesis and regeneration
2026-Jan-18, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-025-04889-z
PMID:41549301
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综述 | 本文综述了干细胞在器官发生和再生中的作用,包括干细胞类型、信号通路、器官形成、再生修复以及先进技术和伦理问题 | 整合了干细胞生物学的最新进展,如CRISPR、3D生物打印和合成生物学在干细胞治疗中的应用,并探讨了未来方向和伦理挑战 | NA | 概述干细胞在器官发生和再生中的基础与临床潜力 | 干细胞类型(如胚胎干细胞、诱导多能干细胞、间充质干细胞)、器官发生过程、再生修复机制 | NA | NA | CRISPR, 3D生物打印, 合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR | NA | NA | 医学 |
| 17 | 2026-02-15 |
Innovations in cell-free synthetic biology via microfluidic approaches
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.08.004
PMID:41688139
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综述 | 本章节综述了基于微流控技术的无细胞合成生物学方法,探讨了其基本原理、整合案例及潜在应用 | 提出微流控技术与无细胞系统的协同整合,作为开发创新合成生物学平台的先驱性方法 | NA | 探讨微流控技术如何解决无细胞合成生物学面临的挑战,并推动其在多领域的应用 | 无细胞合成生物学系统与微流控技术的整合平台 | 合成生物学 | NA | 微流控技术、无细胞转录翻译系统 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物医学、治疗、诊断、环境 |
| 18 | 2026-02-15 |
Cell-free systems for expression of transmembrane protein
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.09.001
PMID:41688133
|
综述 | 本章讨论了无细胞蛋白合成(CFPS)系统在跨膜蛋白表达中的基本原理、进展和应用 | 强调了CFPS作为开放、可重复、高产平台,可规避体内表达的诸多限制,并探讨了结合膜模拟物、折叠伴侣、非标准氨基酸等生化方法以及混合系统、微流控反应器、高通量自动化等技术创新 | NA | 探讨无细胞蛋白合成系统在跨膜蛋白表达中的应用潜力 | 跨膜蛋白 | NA | NA | 无细胞蛋白合成 | NA | NA | NA | NA | 原核生物,真核生物 | NA | 药物发现,结构生物学,生物传感器开发,下一代生物制剂生产 |
| 19 | 2026-02-15 |
Challenges and opportunities in cell-free systems
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.08.006
PMID:41688140
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综述 | 本章全面评估了无细胞系统(CFS)面临的技术挑战、科学局限以及相关的伦理、环境和社会问题,并探讨了其在合成生物学等领域的未来机遇 | 系统性地整合了CFS的技术挑战、伦理考量与发展机遇,为下一代合成生物学的研究、教学和政策制定提供了基础参考 | 作为综述章节,未提出具体实验数据或技术解决方案,主要基于现有文献进行评述 | 评估无细胞系统技术的现状、挑战与未来机遇 | 无细胞系统技术及其在生物医学等领域的应用 | 合成生物学 | NA | 无细胞系统 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 20 | 2026-02-15 |
Cell-free systems for vaccine production
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.08.001
PMID:41688142
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综述 | 本章全面概述了无细胞系统在生物医学科学领域的应用,重点关注疫苗开发与生产 | 提出了多项创新方案以解决当前无细胞平台的局限性,如糖工程引入功能性糖基化、冻干技术改善储存与分发、外泌体递送设计下一代疫苗,以及机器学习集成优化生产流程 | 当前无细胞平台存在翻译后修饰不足、内毒素存在和生产成本高等限制 | 探讨无细胞系统在生物医学研究中的应用,特别是疫苗开发与生产 | 无细胞系统及其在疫苗生产中的应用,包括来自恶性疟原虫、鼠衣原体和SARS-CoV-2等挑战性病原体的抗原表达 | 合成生物学 | NA | 无细胞系统、糖工程、冻干技术、外泌体递送、机器学习 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |