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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-04-24 |
Tunable low-rate genomic recombination with Cre-lox in Escherichia coli: a versatile tool for anoxic environmental biosensing and synthetic biology
2026-Apr-22, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.01768-25
PMID:41870091
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研究论文 | 开发了一种在大肠杆菌中可调的低速率基因组重组Cre-lox系统,用于缺氧环境生物传感和合成生物学 | 实现了严格调控、可滴定的Cre重组酶系统,在低重组率和最小基础活性下工作,并在染色体上表现出更好的记忆保留能力 | 现有亚砷酸盐全细胞生物传感器在厌氧条件下的灵敏度和工作流程存在局限 | 开发用于环境生物传感和合成生物学的可调遗传记忆工具 | 大肠杆菌中的Cre重组酶系统和亚砷酸盐生物传感器 | 合成生物学 | NA | Cre-lox重组系统 | NA | NA | NA | Cre-lox | 大肠杆菌 | 可调重组系统、亚砷酸盐生物传感器 | 环境监测, 合成生物学, 微生物生态学, 进化研究 |
| 2 | 2026-04-24 |
Systematic investigation of double emulsion dewetting dynamics for the robust production of giant unilamellar vesicles
2026-Apr-22, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d6lc00098c
PMID:42018534
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研究论文 | 系统研究了双乳液去润湿动力学,以稳健生产巨型单层囊泡 | 揭示了脂质组成、水相条件、液滴限制和流体动力学在去润湿过程中的关键平衡,并确定了生理盐条件下脂质粘附能作为主要控制参数 | 未提及具体局限性 | 提高液滴微流控巨型单层囊泡平台的可靠性和可及性,以推动生物物理学、合成生物学和药物发现的发展 | 巨型单层囊泡的形成过程 | 其他 | 不适用 | 双乳液液滴微流控 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 医学、生物技术 |
| 3 | 2026-04-24 |
Profiling Selectivity for the Shigella Virulence Factor OspF
2026-Apr-22, Biochemistry
IF:2.9Q3
DOI:10.1021/acs.biochem.6c00109
PMID:42018782
|
研究论文 | 利用合成磷酸肽底物分析和自下而上化学蛋白质组学技术,研究志贺氏菌毒力因子OspF的底物选择性 | 发现OspF不仅对MAPK家族具有选择性,还能修饰大量其他细胞靶点,包括Rab1A和酪蛋白激酶2β,并挖掘了其在位点特异性蛋白编辑中的潜在应用 | 未全面揭示OspF在志贺氏菌致病过程中的全部作用,需要进一步研究 | 揭示志贺氏菌毒力因子OspF的底物选择性及其在感染中的作用 | OspF磷酸苏氨酸裂解酶及其在宿主细胞中的底物 | 数字病理学 | 传染病 | 合成磷酸肽底物分析,自下而上化学蛋白质组学 | NA | 蛋白质组数据 | 包括MAPK家族蛋白、Rab1A和酪蛋白激酶2β在内的多种细胞靶点 | NA | 志贺氏菌(Shigella) | NA | 医学,合成生物学 |
| 4 | 2026-04-24 |
An in vitro approach for simulating divergent Golgi O-glycosylation of tumor-associated MUC1 from normal MUC1
2026-Apr-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-72151-y
PMID:42020444
|
研究论文 | 通过体外合成生物学方法模拟肿瘤相关MUC1与正常MUC1的差异性高尔基体O-糖基化过程 | 首次提出体外一锅合成生物学方法来模拟糖基化分流路径,揭示癌症相关酶的定位重排(GALNTs转移到内质网)导致Tn抗原完全占据,并通过动力学和计算机模拟发现ST6GALNAC1对T13位点的严格偏好性驱动sTn上调 | 研究主要基于体外系统,可能无法完全还原体内复杂环境;未涉及其他糖基转移酶或调控因子的相互作用 | 阐明肿瘤相关MUC1异常糖基化的分子机制,特别是酶定位和底物特异性对糖链合成的影响 | MUC1的O-糖基化途径,包括GALNTs、ST6GALNAC1等糖基转移酶及Tn、sTn等肿瘤相关抗原 | 合成生物学 | 癌症 | 体外一锅合成生物学方法,动力学模拟,计算机反应动态模拟 | 反应动力学模型 | NA | NA | NA | 体外无细胞系统 | 糖基化分流路径模拟系统,包含GALNTs酶定位重排和ST6GALNAC1驱动的唾液酸化反应 | 医学 |
| 5 | 2026-04-24 |
Synthetic multicolor antigen-stabilizable nanobody platform for intersectional labeling and functional imaging
2026-Apr-22, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-026-03056-3
PMID:42020773
|
research paper | 提出了一种合成多色抗原稳定纳米抗体平台,用于交联标记和功能成像 | 开发了覆盖450 nm至660 nm全可见光谱的抗原稳定荧光纳米抗体(VIS-Fbs),通过将20多种荧光蛋白和生物传感器工程化到8种纳米抗体中,实现了仅在与目标抗原结合时才发光的通用设计 | 未明确说明 | 构建抗原稳定荧光纳米抗体平台,实现细胞内蛋白的无背景可视化、多抗原的多色检测以及特定细胞群和细胞器的选择性靶向 | 荧光蛋白、生物传感器、纳米抗体 | 合成生物学 | NA | 荧光蛋白工程、生物传感器设计 | NA | 图像 | 超过20种荧光蛋白和生物传感器,8种纳米抗体 | NA | 小鼠、斑马鱼胚胎 | 抗原稳定荧光纳米抗体平台 | 医学、生物学研究 |
| 6 | 2026-04-24 |
Synthetic biology's uncertain regulatory future in the wake of Loper Bright Enterprises v. Raimondo
2026-Apr-22, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-026-03114-3
PMID:42020847
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7 | 2026-04-24 |
Gibson Assembly of Highly Repetitive DNA
2026-Apr-22, Biochemistry
IF:2.9Q3
DOI:10.1021/acs.biochem.6c00002
PMID:42021475
|
研究论文 | 本文报告了一种基于Gibson Assembly的可扩展、序列定义的重复DNA模块化质粒框架,用于构建高度重复的DNA序列 | 提出了一种迭代重复扩增策略,通过Gibson Assembly结合dIII和HI酶切,实现重复单元数的指数增长(每周期2n-1),同时保持质粒架构完整性 | 最大重复数可能受限于大肠杆菌宿主中蛋白质表达和功能表征的瓶颈 | 建立一种通用策略,用于构建大型重复DNA序列并编码可编程蛋白质聚合物 | 编码五肽Gly-Val-Gly-Val-Pro(GVGVP)重复单元的弹性蛋白样多肽(ELP) | 合成生物学 | NA | Gibson Assembly | NA | DNA序列数据 | 构建了含有最多513个GVGVP重复单元的质粒文库,并在NEB 5-alpha细胞中表征了多达257个重复单元的表达 | Gibson Assembly | NEB 5-alpha大肠杆菌 | 模块化质粒架构,包含用于迭代重复扩增的dIII和HI酶切位点及Gibson Assembly重组位点 | 合成生物学、生物材料 |
| 8 | 2026-04-24 |
Protein-free membrane fusion: A refined view of the delicate fusogenic properties of calcium
2026-Apr-21, Biophysical journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.bpj.2026.03.040
PMID:41863074
|
研究论文 | 本文使用微流控捕获平台结合共聚焦显微镜,定量研究了钙离子介导的巨型单层囊泡融合,揭示了其作为无蛋白质融合剂的精细特性 | 首次在细胞大小的膜上系统量化钙离子介导的融合效率,并发现融合依赖于狭窄的参数空间,澄清了不同尺寸囊泡实验间的长期矛盾 | 研究仅限于特定脂质成分和钙浓度,未涵盖生理条件下其他离子或蛋白质的影响 | 阐明钙离子在无蛋白质条件下促使细胞大小膜融合的机制及其应用潜力 | 巨型单层囊泡 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 图像 | 数百个单个囊泡 | NA | NA | NA | 合成生物学, 膜重构研究 |
| 9 | 2026-04-24 |
From CRISPR functional genomics to synthetic interventions: engineering antiviral strategies
2026-Apr-21, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.00057-26
PMID:41910274
|
综述 | 综述从CRISPR功能基因组学到合成干预策略的进展,探讨如何利用宿主-病毒相互作用图谱设计抗病毒方案 | 将CRISPR功能基因组学与合成生物学相结合,系统性地从宿主依赖性筛选转向可编程抗病毒干预设计,并总结跨病毒家族的通用原则 | 综述未详细讨论筛选提名机制在工程化转化为有效安全抗病毒策略时的具体约束和挑战 | 连接CRISPR功能基因组学与合成抗病毒设计,归纳新兴原理并分析工程化抗病毒策略的可行性 | 病毒-宿主相互作用、宿主依赖性因子、抗病毒合成干预策略 | 机器学, 功能基因组学 | 病毒感染相关疾病 | CRISPR功能基因组学、单细胞测序、成像、空间表型、类器官模型 | CRISPR筛选、基因电路 | 基因组数据、图像 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 受体诱饵、条件蛋白降解系统、感染感知基因电路、工程化免疫细胞 | 医学 |
| 10 | 2026-04-24 |
Employing synthetic biology to modulate metabolic flux: Current strategies and applications
2026-Apr-21, Journal of bioscience and bioengineering
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.jbiosc.2026.03.012
PMID:42020273
|
综述 | 综述了利用合成生物学调控代谢通量的最新基因调控工具和策略,及其在生物制造中的应用 | 根据基因调控的分子层面(中心法则及以外)对工具进行分类,并指出了尚未充分探索但具有潜力的工具 | 单一策略无法适用于所有系统,需根据具体系统采用定制化方法 | 总结代谢工程中用于调控代谢通量的基因调控工具和策略,推动生物制造发展 | 细菌、古菌和真核生物中的多酶途径基因调控工具 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术, 能源, 材料, 医药, 食品 |
| 11 | 2026-04-24 |
Unveiling the mechanistic principles and engineered exploitation of bacteria and derivatives in precision drug delivery
2026-Apr-20, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108902
PMID:42019701
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综述 | 系统探讨四种细菌衍生递送系统在精准药物递送中的工程策略与应用潜力 | 深入分析并对比活体生物治疗产品、细菌分泌系统、细胞外收缩注射系统和细菌外膜囊泡四种前沿递送平台的机制、载荷特性和工程灵活性 | 临床转化中面临安全性、稳定性和可控制性等挑战 | 阐明细菌及其衍生物在精准药物递送中的工程化原理与应用 | 四种细菌衍生递送系统:活体生物治疗产品、细菌分泌系统、细胞外收缩注射系统、细菌外膜囊泡 | NA | NA | 合成生物学、纳米技术、免疫学 | NA | NA | NA | NA | NA | 遗传电路、分子注射器、纳米注射器、纳米载体 | 医学 |
| 12 | 2026-04-24 |
Vacuum and Sonication Treatment Enable Efficient Transient Gene Expression in Various Monocot and Eudicot Plant Seedlings
2026-Apr-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00855
PMID:41865287
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research paper | 介绍了一种名为VAST的瞬时转化方法,通过真空和超声处理显著提高了多种单子叶和双子叶植物幼苗中瞬时基因表达的效率和通用性 | 首次将真空浸润和超声预处理结合应用于农杆菌共培养前的幼苗转化,系统优化植物生长条件,大幅提升瞬时基因表达效率并减少组织损伤,成功应用于包括小麦、玉米在内的多种关键作物 | NA | 开发一种高效、通用且简单的瞬时转化方法,用于功能基因组学、合成生物学和生物技术研究 | 多种单子叶和双子叶植物幼苗,包括番茄、谷子、柳枝稷、玉米和小麦等 | machine learning | NA | 真空浸润、超声处理、农杆菌介导转化 | NA | NA | 涉及多种植物物种,具体样本数量未提及 | 农杆菌 | 番茄、谷子、柳枝稷、玉米、小麦等植物 | 瞬时基因表达系统 | 农业、生物技术 |
| 13 | 2026-04-24 |
On-Demand Droplet Routing and Splitting Using Independently Addressable Interdigitated Electrodes
2026-Mar-20, Micromachines
IF:3.0Q2
DOI:10.3390/mi17030375
PMID:41900261
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研究论文 | 提出一种利用独立寻址叉指电极实现按需液滴路由和分裂的低电压微流控平台 | 将倾斜叉指电极与非对称Y型结点集成,在单一器件中实现电可调液滴分裂与分选,并通过低电压介电泳实现液滴动态路由和实时确定性分裂 | NA(摘要未明确提及局限性) | 开发低电压微流控平台,实现液滴的按需路由和分裂,用于生物化学分析 | 微流控芯片中的液滴 | 微流控 | NA | 微流控、介电泳 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 药物发现、单细胞分析、分子诊断、合成生物学 |
| 14 | 2026-04-24 |
Unintended Creation or Insertion of Antisense Promoter Motifs During Codon Optimization: A Cyber-Biosecurity Risk
2026-Mar-12, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms14030638
PMID:41900397
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研究论文 | 本研究探究密码子优化过程中无意引入或有意插入反义启动子基序(如“TATAAT”)的网络安全风险,并开发了计算管道进行检测和防御 | 首次揭示密码子优化工具中双向DNA链筛查的缺失可能导致潜在生物网络安全漏洞,并提出计算防御策略 | 研究主要基于计算机模拟分析和公共数据集,缺乏湿实验验证插入反义基序后的实际生物效应 | 评估密码子优化过程中反义启动子基序的无意引入或有意插入风险,并提出防御方法 | 484741个蛋白质编码序列及其密码子优化后的反义链基序 | 合成生物学 | NA | 密码子优化 | NA | 基因组序列 | 484,741个蛋白质编码序列 | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 15 | 2026-04-24 |
A Scaffoldomics Platform for Modular In Vivo Enzyme Colocalisation and Its Application to Naringenin Biosynthesis
2026-Mar, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.70328
PMID:41814496
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研究论文 | 开发了一种‘支架组学’平台,用于模块化体内酶共定位,并应用于柚皮素生物合成 | 提出了一种通用的‘支架组学’合成框架,能够实现多达四种途径酶在蛋白支架上的组合组装,并通过大肠杆菌中染色体编码的生物传感器实现实时检测和途径评估 | 当前方法仍可能劳动密集且效率不足,但该平台展示了显著改善 | 提高微生物细胞工厂的代谢效率,增强精细化学品的产量 | 微生物细胞工厂中的酶共定位系统 | 合成生物学 | NA | 蛋白支架组装、生物传感器 | NA | 实验数据 | 多种酶组合的支架组装和柚皮素生物合成实验 | 蛋白质工程、生物传感器 | 大肠杆菌 | 蛋白支架用于多酶复合物组装和代谢途径优化 | 工业生物技术、医药 |
| 16 | 2026-04-24 |
Point-of-Care Devices to Detect Zika and Other Emerging Viruses
2020-06-04, Annual review of biomedical engineering
IF:12.8Q1
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综述 | 本文综述了用于检测寨卡病毒及其他新兴病毒的即时检测设备,重点比较了侧向流免疫层析法和合成生物学诊断方法 | 本文创新性地提出侧向流免疫层析法与合成生物学诊断(包括CRISPR诊断)相结合可能是未来可扩展快速诊断的最佳方案,并描述了结合功能化多色纳米颗粒和计算方法来区分密切相关的病原体 | NA | 评估和比较多种快速诊断平台,为应对新兴病毒传播提供有效的即时检测策略 | 寨卡病毒及其他新兴病毒 | 人工智能 | 寨卡病毒感染 | 侧向流免疫层析法,合成生物学诊断,CRISPR诊断 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 合成基因回路(病原体核酸序列识别激活回路) | 医学 |
| 17 | 2026-04-23 |
iFLinkC-EZ: A scalable and automatable method for the assembly of complex fusion proteins and multi-gene expression constructs based on the iFLinkC framework
2026-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2026.03.008
PMID:42006855
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研究论文 | 本文介绍了一种基于iFLinkC框架的可扩展且可自动化的方法iFLinkC-EZ,用于组装复杂融合蛋白和多基因表达构建体 | iFLinkC-EZ通过遗传手段纯化DNA组装产物,简化了组装过程并使其兼容机器人自动化,克服了传统方法需要物理纯化DNA片段的限制 | NA | 开发一种标准化框架,用于组装任意大小和复杂度的蛋白质编码序列和多基因表达构建体 | 融合蛋白和多基因表达构建体,包括单色和多色多荧光融合蛋白以及多顺反子表达构建体 | 合成生物学 | NA | 迭代功能性连接子克隆(iFLinkC) | NA | NA | NA | Golden Gate Assembly | 酵母 | 合成蛋白开关、传感器、多酶复合物以及由此组成的遗传电路和代谢途径 | 生物技术 |
| 18 | 2026-04-23 |
Membrane-Based Assembly and Interactions in Immune Receptors
2026-Apr-22, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.5c00993
PMID:41865294
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综述 | 本文综述了免疫受体在脂质双层中的组装和分子相互作用原理,重点关注其模块化结构和跨膜域在信号传导中的作用 | 系统总结了免疫受体跨膜域特异性相互作用的分子原则和结构基序,并探讨其在合成生物学中的应用潜力 | NA | 理解免疫受体的组装机制及其跨膜相互作用在结构和功能中的作用 | 免疫受体及其跨膜蛋白模块 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 19 | 2026-04-23 |
Natural Food Pigments: From Biosynthesis to Application
2026-Apr-22, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c05093
PMID:41954457
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综述 | 本文综述了天然食品色素的生物合成、合成生物学策略、药理活性机制以及在医药、保健和化妆品中的应用进展 | 系统整合了天然色素的生物合成路径、合成生物学策略、药理活性机制及多领域应用,结合代谢工程、人工智能辅助筛选和生物传感等新兴技术,提出了从基础合成到高价值应用的跨学科发展路径 | NA | 探讨天然色素的生物合成、应用潜力及作为功能性色素在天然药物开发中的多重价值 | 天然食品色素,包括吡咯、类异戊二烯、醌类、酚类和甜菜碱五大结构类别 | NA | NA | 代谢工程、人工智能辅助筛选、生物传感 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药、保健、化妆品 |
| 20 | 2026-04-23 |
Decoding Outer Membrane β-Barrels: From Structural Curiosity to Engineered Nanotherapeutics
2026-Apr-22, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.5c00902
PMID:41973831
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综述 | 本文综述了外膜β-桶状蛋白(OMPs)的结构、功能多样性及其在生物传感、药物递送和纳米医学等领域的工程应用前景 | 将OMPs从结构研究对象提升为可工程化的精准生物分子设计平台,并系统整合了其从基础发现到纳米治疗应用的全链条发展 | 作为综述文章,未提出新的实验数据或具体技术方案,主要基于现有文献进行整合分析 | 探讨外膜β-桶状蛋白的结构功能特性及其在生物工程与纳米治疗领域的应用潜力 | 革兰氏阴性细菌、线粒体和叶绿体中的跨膜β-桶状外膜蛋白(OMPs) | 结构生物学与合成生物学 | NA | 冷冻电镜(cryo-EM)、核磁共振(NMR)、分子动力学模拟(MD simulations)、AlphaFold | NA | 结构数据、生物化学数据、相互作用组数据 | NA | 理性设计工程 | 革兰氏阴性细菌、线粒体、叶绿体 | 生物传感器、药物递送系统、诊断平台 | 医学、合成生物学、纳米医学、生物传感、诊断 |