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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-07-29 |
Global research trends and hotspots of plant physiologically active substances: quantitative visualization analysis based on CiteSpace
2026-Aug, Plant biology (Stuttgart, Germany)
DOI:10.1111/plb.70219
PMID:42287740
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综述 | 利用CiteSpace对植物生理活性物质领域2000-2024年间8096篇文献进行文献计量与可视化分析 | 首次系统揭示植物生理活性物质研究从基础化合物分离向机制研究、功能食品和纳米递送系统转变的趋势 | 仅基于Web of Science核心合集数据,可能遗漏其他重要数据库来源 | 分析植物生理活性物质全球研究趋势与热点演变 | 2000-2024年间植物生理活性物质相关研究文献 | 文献计量学 | NA | 文献计量分析、可视化分析 | NA | 文本 | 8096篇文献 | NA | NA | NA | 健康、营养、工业 |
| 2 | 2026-07-29 |
An Engineered Multicellular Bacterial Network for Simultaneously Answering Multiple Computational Decision Problems
2026-Jul-28, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.70325
PMID:42517293
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研究论文 | 通过分子遗传工程改造的多细胞细菌网络,在同一系统中同时解答多种计算决策问题,成功识别0-9范围内的四种素数类型 | 首次使用分子遗传工程细菌构建的人工神经网络架构,实现单一系统同时解答四个不同计算决策问题 | 目前仅限于0-9范围内的素数识别,且工程细胞数量最多扩展至六种,系统规模有限 | 验证工程细菌网络能否在单一系统中同时解答多个计算决策问题 | 经过分子遗传工程改造的大肠杆菌群体 | 合成生物学, 生物计算 | NA | 合成基因调控网络, 荧光蛋白表达 | 单层人工神经网络 | 荧光蛋白表达模式 | 四种或六种不同工程细胞类型 | NA | 大肠杆菌 | 合成基因调控网络, 人工神经突触模块 | 合成生物学, 生物计算, 人工智能湿件 |
| 3 | 2026-07-29 |
Metabolic fermentation pathways of microalgae for the synthesis of high-value chemical products
2026-Jul-27, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.135509
PMID:42508660
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综述 | 综述微藻通过发酵途径转化为高价值化学产品的生化多样性及代谢工程进展 | 系统总结了微藻中糖类、蛋白质等组分经酒精发酵、暗发酵和ABE发酵转化为醇类、有机酸、萜类等高价值化合物的酶学机制,并重点关注了代谢工程优化菌株(如酿酒酵母、梭菌)以提高产量的最新进展 | 研究空白在于类胡萝卜素丰富的微藻(如杜氏藻、血球藻)用于萜类/异戊二烯生产的发酵研究仍不充分 | 探讨微藻生物质经发酵合成高价值化学产品的潜力,并强调合成生物学与实时生物传感器在工业过程中的应用前景 | 微藻(小球藻、节螺藻、微绿球藻、栅藻、绿球藻)及工程菌(酿酒酵母、丙酮丁醇梭菌) | NA | NA | 发酵(酒精发酵、暗发酵、ABE发酵)、代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 酿酒酵母、丙酮丁醇梭菌 | 代谢途径(糖类发酵产乙醇、蛋白质发酵产高级醇和挥发性脂肪酸、脂质转化产生物柴油、类胡萝卜素转化产异戊二烯和萜类) | 工业生物技术 |
| 4 | 2026-07-29 |
Engineering Therapeutic Super-Competitor Cells for Educative Cancer Treatment and Ecological Replacement
2026-Jul-27, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2026.218765
PMID:42508749
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综述 | 提出治疗性超级竞争细胞作为可编程的、关注进化的癌症教育治疗方案,用于生态替代 | 将工程细胞疗法重新定义为可控的生态干预,而非最大杀伤工具,整合癌症生态学、肿瘤微环境、发育细胞竞争、免疫疗法和合成生物学概念 | 该框架仍处于假设阶段,需进一步转化验证和明确早期疾病背景 | 提出一种关注进化的癌症教育治疗新方向,通过生态替代限制肿瘤适应性增长 | 工程化超级竞争细胞,肿瘤相关生态位,肿瘤细胞 | 合成生物学,数字病理学 | 癌症 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | NA | 竞争回路,生态位感测与占据模块,安全触发清除机制 | 医学 |
| 5 | 2026-07-29 |
Plant-cyanobacterial symbioses: mutualism with emerging translational possibilities
2026-Jul-27, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2026.07.007
PMID:42509115
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综述 | 探讨植物-蓝藻共生关系作为作物固氮替代路径的潜力 | 提出以植物-蓝藻共生为作物固氮工程替代方案,聚焦共生早期保守步骤可能简化策略 | 未明确讨论共生工程的具体技术障碍或规模化应用的可行性 | 探索植物-蓝藻共生在合成生物学中实现作物固氮的转化可能性 | 植物-蓝藻共生关系 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 植物 | 固氮共生通路 | 农业 |
| 6 | 2026-07-29 |
Metabolic engineering strategies: utilizing different microbial strains and advanced technologies for the synthesis of high-valued terpenoids
2026-Jul-27, Antonie van Leeuwenhoek
DOI:10.1007/s10482-026-02389-5
PMID:42509354
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综述 | 本文综述了利用不同微生物菌株和先进技术进行代谢工程策略以合成高价值萜类化合物的研究进展 | 系统总结了人工智能和机器学习在代谢工程中的应用,包括路径预测、代谢通量优化、酶工程和瓶颈识别,并结合基因组学、系统生物学和合成生物学加速微生物细胞工厂的开发 | 未具体说明当前代谢工程策略在实际应用中存在的挑战或局限性 | 探讨利用微生物生产萜类化合物的代谢工程策略及其可持续性 | 多种微生物菌株,包括遗传改造的微生物细胞工厂 | 机器学习 | NA | 代谢工程、人工智能、机器学习 | NA | NA | NA | NA | 多种微生物菌株 | 萜类化合物生物合成途径 | 医药, 营养保健品, 化妆品, 农业, 香精香料, 生物燃料 |
| 7 | 2026-07-29 |
Tumor-specific antibodies elicited by engineered bacteria promote bladder cancer immunotherapy in preclinical mouse models
2026-Jul-22, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adv7600
PMID:42485436
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research paper | 使用工程化细菌表达CXCL13以增强膀胱癌免疫治疗在小鼠模型中的效果 | 首次利用工程化益生菌大肠杆菌Nissle 1917表达CXCL13,通过触发生发中心反应来增强肿瘤特异性体液免疫,并与PD-1阻断联合改善膀胱癌治疗效果 | 研究仅基于原位小鼠模型,尚未在人类患者中进行验证 | 探讨工程化细菌是否能够通过增强体液免疫来提升免疫检查点阻断疗法的抗癌效果 | 原位膀胱癌小鼠模型 | machine learning | bladder cancer | NA | NA | NA | 使用多个原位膀胱癌小鼠模型,具体样本数量未说明 | CRISPR-Cas9 | E. coli Nissle 1917 | 表达人CXCL13的合成基因回路 | medicine |
| 8 | 2026-07-29 |
Converting Food Waste into Value-Added Products: A Review on Current Technologies, Challenges, and Future Perspectives
2026-Jul-22, Foods (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/foods15142577
PMID:42511323
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综述 | 综述食品废弃物转化为高附加值产品的现有技术、挑战与未来展望 | 整合了绿色提取技术、生化与热化学方法及人工智能和合成生物学等新兴领域,并特别关注废物流中功能性成分在烘焙产品中的应用 | 文中提及原料异质性、工艺可扩展性、监管框架及经济可行性等挑战,但未给出定量解决方案 | 评估食品废弃物增值转化技术并推动循环生物经济发展 | 水果渣、蔬菜残渣、油籽粕、乳制品副产物及农工业废弃物等主要农业食品副产物 | NA | NA | 绿色提取技术、生化转化、热化学转化、酶法转化、微生物转化 | NA | 文献综述数据 | NA | CRISPR-Cas9, 合成生物学工具 | 微生物(如大肠杆菌、酿酒酵母)、酶体系 | 生物精炼厂、碳中性生产系统、数字生物精炼厂 | 环境, 能源, 材料, 食品, 工业生物技术 |
| 9 | 2026-07-29 |
Multi-level precise regulation of gene transcription in the yeast Saccharomyces cerevisiae based on light-sensitive CRISPR/Cas systems
2026-Jul-17, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag719
PMID:42507484
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研究论文 | 本研究基于光敏CRISPR/Cas系统在酿酒酵母中实现多层次的基因转录精准调控 | 整合翻译和翻译后水平的光遗传调控模式,实现dCas9蛋白的多层次精密调控,从而灵活调节目标基因转录水平 | 调控敏感度仍有待提高,且主要基于荧光蛋白验证,实际应用效果有待进一步评估 | 构建基于光敏CRISPR/Cas系统的多层次基因转录调控方法,提升调控灵活性和灵敏度 | 酿酒酵母中的基因转录及dCas9蛋白调控 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas系统,光遗传学 | NA | 荧光强度数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 酿酒酵母 | 光遗传调控的CRISPR基因转录回路 | 合成生物学, 基因调控网络研究 |
| 10 | 2026-07-29 |
Small Regulatory RNAs in Prokaryotes: Key Features, Identification, Environmental Roles, and Applications
2026-Jul-16, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms14071561
PMID:42514066
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综述 | 整合了原核生物中小调控RNA的预测、发现和合成生物学应用,提供了从鉴定到功能及工程应用的多层次视角 | 聚焦海洋和环境原核生物中的小调控RNA,批判性评估现有鉴定工具并强调克服假阳性预测的策略,总结了元组学和元转录组学揭示环境RNA的多样性 | 未明确提及局限性 | 提供原核生物小RNA生物学的整体视角,区分于更窄关注的研究,并突出其在环境适应和合成生物学中的关键作用 | 原核生物中的小调控RNA | 机器学习 | NA | 计算预测, 元组学, 元转录组学 | NA | 文本 | NA | 合成生物学 | 原核生物 | 合成小调控RNA | 工业生物技术, 环境 |
| 11 | 2026-07-29 |
Global Research Trends on Polyhydroxyalkanoate-Producing Microorganisms: A Bibliometric and Scientometric Analysis of Sustainable Bioplastic Biotechnology
2026-Jul-15, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms14071550
PMID:42514055
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评论文章 | 对2014至2025年期间产聚羟基脂肪酸酯微生物及其在生物基包装中应用的全球研究趋势进行文献计量和科学计量分析 | 揭示了从基础生理分类研究向代谢工程、合成生物学、低成本底物优化、多组学工具、CRISPR-Cas9基因编辑及量子建模等新方向的转变,并识别出下游处理、混合微生物群落管理及资金不足等关键技术瓶颈 | 未涵盖2014年前的研究,且分析可能受限于Scopus数据库的覆盖范围 | 评估产PHA微生物在可持续生物塑料生物技术领域的研究趋势与应用进展 | 产聚羟基脂肪酸酯微生物 | 生物技术, 文献计量学 | NA | CRISPR-Cas9, 多组学工具 | NA | 文献数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 产聚羟基脂肪酸酯微生物 | 代谢途径优化, 合成生物学电路 | 环境, 工业生物技术 |
| 12 | 2026-07-29 |
The Genetic Transformation Mechanism and Application of Plant Hairy Roots
2026-Jul-13, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants15142160
PMID:42514528
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综述 | 本文总结了发根农杆菌介导的植物毛状根诱导的分子机制、遗传物质传递系统的开发、毛状根诱导与再生平台的构建,及其在遗传育种和次生代谢物提取中的应用 | 强调了毛状根遗传转化系统相较于传统方法的优势,如高效产生纯合转基因、单步完成转化与再生,为基因编辑和合成生物学育种提供新工具 | 未明确提及局限性,但可能涉及物种依赖性或再生效率问题 | 研究植物毛状根的遗传转化机制及其在育种和次生代谢物生产中的应用 | 植物毛状根 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 发根农杆菌 | 植物 | 毛状根诱导系统 | 农业, 生物技术 |
| 13 | 2026-07-29 |
Microbial Lignin Valorization to Protocatechuic Acid and Catechol: Biofunneling Pathways and Metabolic Engineering Strategies
2026-Jul-03, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom16070979
PMID:42509773
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综述 | 综述微生物将木质素转化为原儿茶酸和儿茶酚的路径和代谢工程策略 | 系统梳理了微生物漏斗化路径将多种木质素衍生物转化为PCA和儿茶酚,强调了原儿茶酸脱羧酶作为桥梁的作用,并整合了最新的代谢工程策略 | 许多策略仅基于纯化的模型化合物而非真实木质素流,需改进解聚与生物转化集成;存在木质素顽抗性、产物异质性、中间毒性和酶效率不足等挑战 | 推动木质素生物转化为高值化学品PCA和儿茶酚,实现可持续生物精炼和循环生物经济 | 木质素衍生芳香化合物及其微生物转化过程 | 合成生物学 | NA | 基因敲除、通路重构、转运体工程、CRISPR调控 | NA | NA | NA | CRISPR | 微生物 | 生物漏斗化路径、原儿茶酸脱羧酶连接PCA与儿茶酚 | 工业生物技术 |
| 14 | 2026-07-29 |
Synthetic Biology Strategies for the Development of Live Attenuated Influenza Viruses: Recent Advances and Applications
2026-Jun-29, Viruses
DOI:10.3390/v18070715
PMID:42515567
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综述 | 系统总结基于合成生物学策略开发新一代减毒流感病毒的方法及其在癌症免疫治疗和病毒载体疫苗中的应用 | 综合比较基因组重编码、miRNA靶向、提前终止密码子和蛋白靶向降解等多种合成生物学策略在流感病毒减毒中的应用,并批判性评估各策略的优势与局限 | 作为综述性研究,缺乏原始实验数据验证各策略的实际效果,且未深入探讨不同策略组合使用的潜在协同效应 | 为构建更安全、稳定、可控的流感病毒工程平台提供理论依据,并设计适用于肿瘤治疗和新型疫苗递送的减毒流感病毒 | 减毒流感病毒及其工程化策略 | 合成生物学 | 癌症, 感染性疾病 | 合成生物学, 反向遗传学, 基因组重编码 | NA | NA | NA | 反向遗传学技术 | NA | 减毒流感病毒工程平台 | 医学, 疫苗开发, 癌症治疗 |
| 15 | 2026-07-29 |
Recognition of non-standard base pairs by triplex-forming oligonucleotides containing an expanded genetic alphabet
2026-Jun-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-74375-4
PMID:42286010
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研究论文 | 本文利用扩展遗传字母表的三链形成寡核苷酸识别非标准碱基对,扩展了三链识别空间 | 通过人工扩展遗传信息系统中的核碱基,识别了12种可互换组合的三联体,在中性pH下以纳摩尔亲和力靶向含标准、受损或合成碱基对的双链DNA | 未明确讨论体内应用稳定性及潜在脱靶效应 | 扩展三链形成寡核苷酸对双链DNA的序列特异性识别能力 | 含标准、受损或合成碱基对的双链DNA | 分子生物学 | NA | 三链形成寡核苷酸技术,扩展遗传信息系统 | NA | NA | 评估了120种碱基三联体组合 | NA | NA | NA | 分子医学,合成生物学,核酸纳米技术 |
| 16 | 2026-07-29 |
Programmable Nucleic Acid Sensing in Human Cells Using Circularizable ssDNA
2026-Jun-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-73990-5
PMID:42248894
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研究论文 | 开发了一种名为SONAR的平台,利用可环化单链DNA传感器在人类细胞中检测目标核酸序列并触发可控基因表达 | 首次利用可环化单链DNA传感器在人类细胞中实现程序化核酸感知,并通过细胞连接酶依赖的环化驱动基因表达 | 未提及明显的局限性 | 开发能够在活细胞中感知核酸信号并触发细胞功能的可编程技术 | 人类细胞中的DNA和RNA序列 | 合成生物学 | NA | 可环化单链DNA传感器、反义寡核苷酸、逆转录 | NA | 核酸序列 | NA | NA | 人类细胞 | 核酸传感器电路,通过可环化单链DNA与互补核酸杂交后经细胞连接酶环化驱动基因表达 | 医学, 诊断, 治疗, 合成生物学 |
| 17 | 2026-07-29 |
Synthetic Mirror Bacteria as a Frontier for Chiral Synthetic Biology and Biocontainment
2026-06, MicrobiologyOpen
IF:3.9Q2
DOI:10.1002/mbo3.70356
PMID:42338029
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综述 | 本文综述了镜像细菌的理论发展,探讨其分子基础、工程策略、生物安全及生态影响 | 系统总结了镜像生物学体系在分子倒置手性下的构建前景,强调了手性层次结构与立体化学约束,并分析了从理论到实验可行性的关键挑战 | 镜像细菌仍停留在理论阶段,尚未实现自我复制的镜像细胞系统,且缺乏实验验证 | 评估镜像细菌的理论可行性及相关生物安全与生态风险 | 镜像细菌及镜像生物分子(镜像蛋白质和镜像核酸) | 合成生物学 | NA | 化学合成(镜像蛋白质和镜像核酸) | NA | NA | NA | NA | NA | 镜像生物系统(手性倒置的生化框架) | 生物安全、生态评估 |
| 18 | 2026-07-29 |
Base modifications shift tertiary structure and activity in synthetic RNA origami and a natural ribozyme
2026-May-13, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-72891-x
PMID:42128887
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研究论文 | 研究碱基修饰对合成RNA折纸结构及天然核酶三维结构与功能的影响 | 首次揭示5-甲基胞嘧啶和N1-甲基假尿苷等碱基修饰通过改变碱基堆积能量而非碱基配对,重塑RNA折叠景观和结构-功能关系 | 未详细说明修饰碱基在不同RNA序列背景下的普适性影响,以及体内环境中的长期稳定性 | 探究碱基修饰对RNA三级结构折叠与功能的影响 | 合成RNA折纸纳米结构和四膜虫核酶 | 分子生物学, 合成生物学 | NA | cryo-EM, FRET, 生化实验 | NA | 结构数据, 生化实验数据 | NA | NA | NA | RNA折纸纳米结构 | 合成生物学, 治疗药物, 生物技术 |
| 19 | 2026-07-29 |
Effector Triggered Susceptibility and Immunity in Bacterial Diseases of Leaf Blight and Streak in Rice
2026-Feb-27, Rice (New York, N.Y.)
DOI:10.1186/s12284-026-00885-w
PMID:41758451
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综述 | 本文综述了水稻细菌性叶片枯病和条斑病中的效应蛋白触发的感病性和免疫机制 | 整合了最新研究成果,详细介绍了TAL效应子和Xops的结构与功能多样性及其宿主靶标,并讨论了利用CRISPR基因编辑、效应子引导育种和合成生物学策略培育广谱持久抗性的新兴方法 | 未解决的关键问题被指出,但未提供具体实验验证 | 总结水稻细菌性叶片枯病和条斑病中效应蛋白触发的感病性和免疫分子机制,并探索可持续病害管理策略 | 水稻及病原菌黄单胞菌(Xoo和Xoc) | 分子植物病理学 | 水稻细菌性叶片枯病、水稻细菌性条斑病 | CRISPR基因编辑 | NA | 文献综述 | NA | CRISPR-Cas9 | 水稻 | NA | 农业 |
| 20 | 2026-07-29 |
Recognition of Non-standard Base Pairs by Triplex-Forming Oligonucleotides Containing an Expanded Genetic Alphabet
2026-Feb-17, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-8652009/v1
PMID:41756467
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研究论文 | 利用扩展遗传字母系统的三链形成寡核苷酸识别非标准碱基对的研究 | 首次利用人工扩展遗传信息系统(AEGIS)中的核碱基扩展了三链形成寡核苷酸(TFO)的识别空间,发现了至少12种新的模块化三联体,能在中性pH下以纳摩尔亲和力靶向包含标准、损伤或合成碱基对的双链DNA | 未提及实际应用中的潜在脱靶效应或体内验证,且仅针对体外酶组装的双链构建体进行验证 | 开发使用扩展遗传字母系统的三链形成寡核苷酸以实现对双链DNA的序列特异性识别 | 双链DNA中的非标准碱基对,包括标准、损伤和合成碱基对 | 合成生物学 | NA | Hoogsteen碱基配对 | NA | 实验数据 | 120种碱基三联体组合 | NA | NA | NA | 医学, 合成生物学 |