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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-10-15 |
Diverse oxidosqualene cyclases for triterpenoid biosynthesis
2027-May, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2026.08.001
PMID:42866665
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研究论文 | 本研究通过构建包含348个已知功能氧化角鲨烯环化酶(OSC)的数据集,分析其系统发育关系和基序特征,总结了三萜类化合物生物合成中OSC的挖掘策略 | 构建了迄今为止最大的已知功能OSC集中资源库(348个),系统分类了88种三萜骨架并总结了常见骨架形成机制,通过系统发育和基序分析揭示了植物来源OSC序列、结构与产物之间的关系 | 摘要中未明确提及研究的具体局限性 | 构建已知功能OSC数据集,分析OSC的序列、结构与产物关系,总结OSC挖掘策略,为发现或设计具有特定产物谱的OSC提供方向 | 348个已知功能的氧化角鲨烯环化酶(OSCs)及其产生的88种三萜类骨架 | 合成生物学 | NA | 系统发育分析、基序分析 | NA | 序列数据、结构数据、产物数据 | 348个已知功能的OSC | NA | NA | NA | 医药、化妆品、生物农药、合成生物学 |
| 2 | 2026-10-15 |
Evolution, structural diversity and functional plasticity of plant derived multifunctional proteases and α-amylases inhibitors
2026-Oct-13, Plant molecular biology
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s11103-026-01767-x
PMID:42867572
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综述 | 本文综述了植物来源多功能蛋白酶和α-淀粉酶抑制剂的进化、结构多样性和功能可塑性,涵盖其结构组织、抑制机制、进化多样化、计算结构生物学进展以及农业和生物技术应用 | 提出了扩展的多功能抑制剂定义,将作用于同一底物途径的抑制剂(如α-淀粉酶/α-葡萄糖苷酶和胰蛋白酶/胰凝乳蛋白酶系统)纳入范畴,并系统整合了AlphaFold等计算结构生物学新进展与结构导向工程改造策略 | 结构和体内验证方面仍存在空白,昆虫适应性、抗性进化、生物安全性和生态影响等挑战尚未充分解决,多功能抑制剂向可持续农业和生物技术应用的转化仍需进一步研究 | 综述植物来源多功能蛋白酶和α-淀粉酶抑制剂的结构、功能、进化及应用,提出扩展定义并探讨其向可持续农业和生物技术应用转化的前景与挑战 | 植物来源多功能抑制剂(MFIs),包括Bowman-Birk家族、Kunitz型家族和谷物胰蛋白酶/α-淀粉酶抑制剂 | 结构生物学 | NA | 分子对接,分子动力学模拟,基于AlphaFold的蛋白质结构预测,蛋白质工程,重组表达,合成生物学,基因组编辑 | AlphaFold | 文本 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 农业,食品,工业生物技术 |
| 3 | 2026-10-15 |
PrimeStack editors enable efficient and site-specific integration of large multigene cargos in plants
2026-Oct-13, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3003778
PMID:42868167
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研究论文 | 本文提出PrimeStack平台,将先导编辑与Bxb1大丝氨酸整合酶结合,在水稻基因组安全港位点实现多基因、多千碱基大片段DNA的定点整合 | 开发了不依赖双链断裂的PrimeStack平台,利用优化后的先导编辑变体先高保真、高遗传率地安装attP着陆位点,再通过Bxb1介导的重组实现不可逆的大片段基因整合,整合效率高达45%,并用类胡萝卜素基因盒验证了其可用性 | 仅在评估条件下观察至移栽土壤后5周,未发现与野生型植株明显的形态学差异,长期稳定性和多代遗传性尚需进一步验证 | 实现植物基因组中大片段多基因DNA的精确、定点整合,推动作物生物技术与合成生物学发展 | 水稻(Oryza sativa)再生植株 | 合成生物学 | NA | 先导编辑、大丝氨酸整合酶Bxb1介导的重组、接合点特异性PCR分析 | NA | DNA序列 | NA | 先导编辑(Prime Editing)、Bxb1大丝氨酸整合酶 | 水稻(Oryza sativa) | 先导编辑安装attP着陆位点后由Bxb1介导的不可逆定点整合通路,用于多基因堆叠和代谢途径构建 | 农业、工业生物技术 |
| 4 | 2026-10-15 |
Engineering of bacterial outer membrane vesicles for biotechnological applications
2026-Oct-13, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.109073
PMID:42869258
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综述 | 本文综述了细菌外膜囊泡(OMVs)的底盘工程和功能多样化,从合成生物学角度探讨其作为模块化可编程系统的应用 | 提出了五种诱导超囊泡化的策略和两种构建合成囊泡的框架,并展望了刺激响应型囊泡、自组装结构和混合生物合成材料等未来创新方向 | OMVs存在产量低、组成异质性和货物装载随机性等固有挑战 | 总结OMV底盘工程和功能多样化的最新进展,为其在生物技术领域的应用提供合成生物学视角 | 革兰氏阴性菌分泌的外膜囊泡(OMVs) | 合成生物学 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | 革兰氏阴性菌 | NA | 医学, 环境修复, 先进材料科学 |
| 5 | 2026-10-14 |
Expanding global access to synthetic biology
2026-Oct, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-026-03338-3
PMID:42864486
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6 | 2026-10-15 |
Synthetic horizontal gene transfer for ecosystem restoration
2026-Aug-14, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-026-00919-9
PMID:42870292
|
研究论文 | 通过数学模型研究合成水平基因转移在生态群落中的影响,以恢复生态系统 | 首次在多种群生态群落中,耦合多物种动态与基因传播,探索合成质粒转移的机制和机遇 | 仅基于理论模型,缺乏实验验证 | 理解工程质粒在多种群生态群落中转移的机制和机遇,以恢复生态系统 | 土壤微生物群落(生态联合体模型) | 机器学习 | NA | NA | 消费者-资源模型 | NA | NA | NA | NA | NA | 环境 |
| 7 | 2026-10-15 |
Integrated multi-omics analysis reveals a pH-driven metabolic and translational switch in Ureaplasma parvum
2026-08-04, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.03463-25
PMID:42429378
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研究论文 | 该研究通过整合蛋白质组学、代谢组学和RNA修饰分析,构建了微小脲原体(Ureaplasma parvum)在pH适应过程中的系统级模型 | 首次在基因组极度缩减的微小脲原体中揭示了由pH驱动的代谢和翻译转换策略,并强调了表观转录组在适应性调控中的关键作用 | 研究主要基于组学数据构建模型,缺乏直接的遗传学功能验证实验 | 构建微小病原体pH适应的系统级模型,揭示基因组缩减生物如何实现适应性可塑性 | 微小脲原体(Ureaplasma parvum) | 多组学整合分析 | 泌尿生殖道感染 | 蛋白质组学,代谢组学,RNA修饰测序 | NA | 组学数据 | NA | NA | NA | NA | 医学,合成生物学 |
| 8 | 2026-10-15 |
A signal peptide-guided approach towards in situ functionalization of bacterial nanocellulose in Komagataeibacter rhaeticus
2026-Jul-17, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-026-00734-w
PMID:42469887
|
研究论文 | 该研究在K. rhaeticus中基准测试了信号肽介导的蛋白质转运,并利用该机制在细菌纳米纤维素合成过程中实现原位功能化 | 首次在K. rhaeticus中系统评估天然和异源信号肽介导的蛋白质转运,并实现了单底盘细菌纳米纤维素的原位功能化,结合渗透休克释放策略将酶活性提高30% | 重组蛋白主要滞留在周质空间,限制了其向细胞外的释放,影响了功能蛋白的胞外可用性 | 建立单底盘系统,实现细菌纳米纤维素合成与原位功能化的同步进行,推动可编程生物工程活材料的发展 | Komagataeibacter rhaeticus iGEM菌株及细菌纳米纤维素 | 合成生物学 | NA | 液相色谱-串联质谱、SignalP 5.0预测、荧光成像、渗透休克 | NA | 蛋白质序列、质谱数据、荧光图像 | NA | NA | Komagataeibacter rhaeticus | 信号肽介导的蛋白质转运途径 | 材料、医学 |
| 9 | 2026-04-15 |
The next frontier: Exploring plant hypoxia sensing and response mechanisms through synthetic biology
2026-Apr-21, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2606254123
PMID:41973930
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 10 | 2026-10-15 |
Microbial response and resistance mechanisms against diverse anthropogenic pollutants
2026, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2026.1775529
PMID:42057789
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综述 | 本文综述了微生物(细菌、微藻和真菌)对人为污染物(重金属、有机污染物、纳米材料和微塑料)的响应及抗性机制,并探讨了组学技术在揭示这些机制中的应用 | 系统整合了多种人为污染物对多种微生物的毒性效应,并全面总结了天然抗性和适应性实验室进化策略下的分子机制,强调了组学技术(基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学)在揭示污染物特异性和生物特异性适应策略中的重要性 | 群落水平的多组学研究存在局限性,关于真菌的数据相对有限,混合培养研究面临挑战,这些因素阻碍了对微生物响应和抗性机制的全面理解 | 增强对微生物如何响应人为污染物(包括重金属、有机污染物如多环芳烃、纳米材料和微塑料)的理解,并探讨其抗性机制,以指导开发污染物耐受菌株用于生物修复、生物监测和合成生物学应用 | 细菌、微藻和真菌等微生物 | 环境微生物学 | NA | 基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 环境、医学、工业生物技术 |
| 11 | 2026-10-15 |
Biosecurity in the age of synthetic nucleic acids: modernizing the law to manage emerging threats
2026 Jan-Jun, Journal of law and the biosciences
IF:2.5Q1
DOI:10.1093/jlb/lsag005
PMID:42058498
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评论 | 本文探讨合成核酸技术带来的生物安全挑战,主张通过结合有约束力的国际义务与统一技术标准的跨国新治理方法来管理合成核酸,并建议现代化现有国际法。 | 提出应基于跨国新治理方法管理合成核酸,结合有约束力的国际义务与统一技术标准,并建议利用市场准入和资金权力推动全球实践。 | 文章为分析性评论,未提供实证数据或具体实施案例,主要基于现有法律框架的评估。 | 评估当前国际和国内生物安全制度对合成核酸的适用性,并提出现代化法律建议以管理新兴生物技术风险。 | 合成核酸技术、国际卫生条例、禁止生物武器公约、联合国安理会第1540号决议、国家生物安全法、国际基因合成联盟标准、ISO 20688-2标准。 | 生物安全治理 | NA | 合成核酸技术 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学,工业生物技术 |
| 12 | 2026-10-15 |
Advances in plant metabolic engineering through synthetic biology
2026, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2026.1957203
PMID:42866118
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综述 | 本文综述了植物代谢工程中合成生物学的进展,重点介绍了CRISPR-Cas系统、多重基因组编辑、基因敲入敲除、CRISPR介导的基因调控、碱基编辑、引导编辑、RNA靶向技术、合成启动子和基因堆叠等主要技术及其在作物改良中的应用,并简要讨论了人工智能在代谢途径设计和优化中的作用 | 系统梳理了植物代谢工程中合成生物学的最新使能技术,并强调了人工智能在代谢途径和基因组编辑工具设计优化中的新兴作用 | 作为综述文章,未提供原创实验数据;对人工智能应用的讨论较为简要,缺乏对技术瓶颈和转化挑战的深入分析 | 总结植物代谢工程中合成生物学的主要技术及其在作物改良中的应用,并展望人工智能在代谢途径和编辑工具设计优化中的前景 | 植物代谢途径、作物基因组、调控元件 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas系统、多重基因组编辑、基因敲入/敲除、CRISPRi/CRISPRa、碱基编辑、引导编辑、RNA靶向技术、合成启动子、基因堆叠 | NA | 文本 | NA | CRISPR-Cas9, 碱基编辑, 引导编辑 | 植物 | 代谢途径、合成启动子、基因堆叠 | 农业, 食品 |
| 13 | 2026-10-15 |
Synthetic Biology Approaches for Representative Bioactive Metabolites of Medicinal Mushrooms
2026, International journal of medicinal mushrooms
IF:1.4Q4
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综述 | 本文综述了合成生物学方法在药用蘑菇代表性生物活性代谢物生物合成和异源微生物生产中的应用。 | 系统总结了虫草素、灵芝酸、麦角硫因、茯苓酸、火木层孔菌素、猴头菇素和桑黄多糖等关键生物活性成分的生物合成和异源微生物生产的最新进展,并提供了基于合成生物学的方法学策略。 | 未具体说明各代谢物合成途径的完整解析程度、产量水平及工业化应用面临的挑战。 | 总结药用蘑菇关键生物活性成分的生物合成和异源微生物生产进展,并提供基于合成生物学的方法学策略。 | 药用蘑菇中的生物活性代谢物,包括虫草素、灵芝酸、麦角硫因、茯苓酸、火木层孔菌素、猴头菇素和桑黄多糖。 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医药, 工业生物技术 |
| 14 | 2026-10-15 |
Review Article: Overcoming Antigen Expression Barriers in CAR-T Therapy for Solid Tumors
2026, Critical reviews in oncogenesis
DOI:10.1615/CritRevOncog.2026064031
PMID:42870621
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综述 | 该综述探讨了CAR-T疗法在实体瘤中面临的抗原表达障碍,并总结通过多特异性靶向、衔接平台和逻辑门控受体电路等下一代工程策略来克服这些障碍。 | 系统性地总结了针对实体瘤抗原异质性、免疫抑制微环境和抗原逃逸的多特异性靶向、衔接平台和逻辑门控受体电路(OR、AND、NOT及多层设计)等下一代工程策略。 | 作为综述文章,未提供原始实验数据;所讨论的多数下一代工程策略仍处于临床前或早期临床阶段,其持久临床获益尚未充分验证。 | 探讨CAR-T疗法在实体瘤中面临的抗原表达障碍,并总结克服这些障碍的工程策略,以推动CAR-T疗法在实体瘤中的广泛应用。 | CAR-T疗法在实体瘤中的抗原表达障碍及下一代工程策略 | 肿瘤免疫治疗 | 实体瘤 | CAR-T细胞工程 | NA | 文本 | NA | NA | NA | 逻辑门控受体电路(OR、AND、NOT及多层设计) | 医学 |
| 15 | 2026-10-15 |
Multi-omics analyses reveal cellular responses to biosynthesis of the non-natural cofactor nicotinamide cytosine dinucleotide
2026, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2026.1954596
PMID:42871180
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研究论文 | 通过多组学分析研究细胞对非天然辅因子烟酰胺胞嘧啶二核苷酸(NCD)生物合成的响应 | 首次通过多组学分析系统揭示NCD生物合成对细胞的影响,发现NCD(H)的氧化还原状态与天然辅因子基本隔离,且NCD合成对细胞生长影响极小 | 研究主要基于多组学数据和通量分析,对NCD在更广泛生理条件下的长期影响及潜在脱靶效应尚未充分验证 | 探究NCD生物合成对细胞的生物学效应,评估其作为非天然辅因子在化学生物学和合成生物学中应用的可行性 | 能够自主合成NCD的细胞株及其亲本菌株 | 合成生物学 | NA | 多组学分析(蛋白质组学、代谢组学)、通量分析 | NA | 组学数据、通量数据 | 多株不同NCD合成水平的细胞系 | NA | NA | NCD生物合成途径 | 医学, 工业生物技术 |
| 16 | 2026-10-15 |
DAPE cloning with modified primers for producing designated lengths of 3' single-stranded ends in PCR products
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0318015
PMID:39946422
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研究论文 | 本文介绍了一种名为DAPE的新型DNA克隆方法,通过修饰引物和T5核酸外切酶生成指定长度的3'单链末端,实现不依赖序列和连接的高效DNA组装 | DAPE方法利用硫代磷酸修饰引物和T5核酸外切酶,能够生成精确长度的3'突出端,克服了传统SLIC技术因外切酶活性过强而无法克隆小于50 bp DNA片段的限制 | 摘要中未提及该方法的局限性 | 开发一种通用的、不依赖序列和连接的克隆方法,能够高效精确地组装任意大小的DNA片段,包括小于50 bp的片段 | 线性化DNA片段,包括小片段如gRNA和表位标签 | 合成生物学 | NA | DNA克隆、PCR、核酸外切酶处理 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 17 | 2026-10-13 |
Sustainable biomanufacturing of paclitaxel: From pathway elucidation to green production systems
2026-Oct-11, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.136054
PMID:42860225
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综述 | 本文综述了紫杉醇生物合成途径的解析进展以及利用微生物和植物底盘进行可持续生物制造的挑战与前沿方向 | 系统整合了紫杉醇生物合成途径的最新解析成果(如P450和2-OG/Fe(II)依赖双加氧酶)、异源底盘重构瓶颈以及AI驱动酶工程、产油酵母、合成菌群和光合微藻等新兴策略 | 未提供原始实验数据,且异源途径重构仍受P450催化效率低、代谢负担和产物细胞毒性等瓶颈制约 | 探讨如何通过合成生物学和代谢工程实现紫杉醇的可持续、可扩展和环境友好型生物制造 | 紫杉醇生物合成途径及大肠杆菌、酿酒酵母、植物底盘等异源生产系统 | 合成生物学, 代谢工程 | 癌症 | 途径解析, 异源表达, 酶工程, AI驱动酶工程 | NA | 文本 | NA | NA | 大肠杆菌, 酿酒酵母, 植物, 产油酵母, 光合微藻 | 紫杉醇生物合成途径 | 医学, 工业生物技术 |
| 18 | 2026-10-13 |
The ferroptosis-cuproptosis crosstalk in hematological malignancies: multi-omics insights into gene-regulated cell death and emerging therapeutic opportunities
2026-Oct-03, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-026-02451-7
PMID:42829391
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综述 | 本文综述了血液系统恶性肿瘤中铁死亡与铜死亡之间的交叉调控网络,探讨了多组学整合、单细胞与空间分析以及新兴治疗策略 | 提出铁死亡-铜死亡单一轴的概念,即一个涵盖脂质过氧化、线粒体功能障碍和蛋白质毒性应激的金属-氧化还原网络,并倡导人工智能、合成生物学和类器官系统相结合的精准细胞死亡工程 | 生物标志物缺乏标准化、临床试验设计困难以及患者动态分层挑战 | 阐述铁死亡-铜死亡轴在血液系统恶性肿瘤中的作用,并探索基于多组学的治疗靶点和精准细胞死亡工程前景 | 血液系统恶性肿瘤 | 机器学习,数字病理学 | 血液系统恶性肿瘤 | 多组学(基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学、金属组学)、单细胞分析、空间分析 | NA | 文本,图像 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 19 | 2026-10-13 |
Recent Progress in the Microbial Production and Applications of Indole Alkaloids
2026-Oct, Indian journal of microbiology
IF:2.1Q3
DOI:10.1007/s12088-026-01554-8
PMID:42861072
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综述 | 本文综述了吲哚生物碱的微生物来源(包括内生菌、细菌、蓝细菌和真菌)以及生物技术生产方法和应用的最新进展 | 系统总结了细菌、真菌、内生菌和蓝细菌等多种微生物作为吲哚生物碱可持续生产平台的潜力,并强调了代谢工程、合成生物学和优化发酵方法在提高产量和结构多样性方面的最新进展 | 摘要中未明确提及本综述的局限性 | 概述吲哚生物碱的微生物来源,探讨生物技术生产方法的最新进展,并强调其在医药和农业等领域的应用 | 吲哚生物碱及其微生物生产体系(包括内生菌、细菌、蓝细菌和真菌) | 合成生物学 | 癌症 | 代谢工程, 合成生物学, 优化发酵方法 | NA | 文本 | NA | NA | 细菌, 真菌, 内生菌, 蓝细菌 | NA | 医药, 农业 |
| 20 | 2026-10-13 |
Developing artificial cytoskeletons using RNA origami-based nanotubes
2026-06, Progress in biophysics and molecular biology
DOI:10.1016/j.pbiomolbio.2026.02.006
PMID:41765186
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综述 | 本文综述了利用RNA折纸纳米管构建人工细胞骨架的新兴概念,探讨了其设计策略、动态调控及应用前景 | 系统性地提出了以RNA折纸纳米管为基础构建人工细胞骨架的新范式,强调了RNA相较于DNA在共转录折叠、复杂三级相互作用及与细胞机器互作方面的独特优势 | RNA在体内的稳定性及高效递送仍面临重大挑战,人工细胞骨架的功能验证尚不充分 | 为RNA纳米技术与合成细胞工程的交叉领域提供基础性理解,并激发未来相关研究的发展 | RNA折纸纳米管及人工细胞骨架 | 合成生物学 | NA | RNA折纸纳米技术 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学, 材料, 工业生物技术 |