合成生物学相关文章

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当前共找到 5645 篇文献,本页显示第 1 - 20 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 工程工具 宿主生物 回路设计 应用领域
1 2026-09-08
Advances in combinatorial CRISPRi screening and applications: Decoding higher-order interactions for next-generation microbial cell factories in synthetic biology
2026-Dec, Microbiological research IF:6.1Q1
综述 本文综述了组合式CRISPR干扰筛选的最新进展及其在合成生物学中解码微生物细胞工厂复杂表型和高阶相互作用的应用 系统阐述了成对和高阶组合CRISPRi筛选策略,涵盖多重gRNA阵列设计、正交系统及高维数据处理算法,并强调其在解码遗传冗余和缓冲机制中的独特优势 当前面临系统噪声和文库构建挑战,限制了筛选的准确性和规模 为解码复杂性状和推动下一代微生物细胞工厂的理性设计提供指导 微生物细胞工厂,涉及碳通量优化和抗环境胁迫的多基因网络 合成生物学,系统生物学 NA CRISPR干扰(CRISPRi),多重引导RNA阵列,组合筛选 NA 高维筛选数据,遗传互作数据 NA CRISPR-Cas9 微生物(如细菌、酵母等) 组合CRISPRi系统,多重gRNA阵列,正交调控系统 工业生物技术,合成生物学
2 2026-09-08
Synthetic biology strategies for engineering microbial therapeutics in metabolic diseases and cancer
2026-Dec, Microbiological research IF:6.1Q1
综述 本文综述了合成生物学在代谢疾病和癌症中工程化微生物治疗策略的最新进展,包括底盘选择、电路架构、应用及挑战。 系统性地总结了合成生物学在微生物治疗中的应用,强调从被动载体到可编程活体治疗剂的转变,并讨论了代谢疾病和癌症中的具体案例。 临床转化仍受限于体内存活和功能活性变异、定植不一致、代谢和遗传不稳定性、生物封控需求、制造复杂性和剂量控制不确定。 探讨合成生物学在工程化微生物治疗剂中的应用,以治疗代谢疾病和癌症。 工程化微生物(如大肠杆菌和其他微生物平台)用于代谢疾病和癌症治疗。 合成生物学 代谢疾病、癌症 合成生物学 NA NA NA NA 大肠杆菌(E. coli),其他微生物平台 合成基因电路,用于感知、计算和响应宿主环境,如降解有毒代谢物、表达治疗蛋白。 医学
3 2026-09-08
Rational design of next-generation bioinoculants: Integrating molecular engineering of plant-microbe interactions with advanced formulation strategies
2026-Dec, Microbiological research IF:6.1Q1
综述 本文提出将下一代生物接种剂重新概念化为工程化生物系统,通过整合植物-微生物相互作用的分子工程与先进制剂策略,以实现可预测、高性能的农业应用 提出了一个统一框架,将制剂视为生态和生理界面,通过桥接合成生物学、材料科学和根际生态学,实现生物接种剂的理性设计 未具体说明局限性,可能涉及当前技术整合的挑战和实际应用中的不确定性 为下一代生物接种剂的理性设计提供集成框架,以提高农业可持续性和气候韧性 植物相关微生物及其相互作用,以及制剂技术 合成生物学 NA 合成基因电路、压力耐受工程、代谢重编程 NA 文本 NA NA 植物相关微生物 合成基因电路、信号响应调控通路 农业
4 2026-09-08
Efficient rDNA-mediated multi-copy integration of gene clusters in Aureobasidium melanogenum
2026-Nov, Journal of biotechnology IF:4.1Q2
研究论文 本研究开发了一种基于核糖体DNA(rDNA)介导的多拷贝基因簇整合策略,成功在出芽短梗霉菌(Aureobasidium melanogenum)中高效整合大片段基因并提升黑色素产量。 首次在非传统酵母底盘出芽短梗霉中利用高度重复的rDNA序列作为同源重组位点,实现大片段基因簇(11.0kb)的多拷贝稳定整合,并显著提高表达水平及代谢产物产量。 摘要中未提及本研究的具体局限性,可能包括对整合位点特异性及长期遗传稳定性的进一步评估需求等。 旨在解决Aureobasidium melanogenum中缺乏大片段基因簇重组技术的问题,通过rDNA介导的多拷贝整合促进该宿主的代谢工程改造。 研究对象为Aureobasidium melanogenum菌株,以及插入的gfp基因、pks基因和由pks、npg1、scd构成的黑色素合成基因簇。 合成生物学 NA 同源重组(rDNA介导) NA 基因序列数据 本研究中使用了不同rDNA区域(rDNA1、rDNA2、rDNA3)进行整合,并测试了gfp(0.7kb)、pks(7.0kb)及11.0kb基因簇,但样本具体数量未在摘要中说明。 NA Aureobasidium melanogenum rDNA介导的多拷贝基因整合(使用RNA聚合酶I启动子区域、部分26S rDNA区域、RNA聚合酶I终止子区域作为同源重组位点) 工业生物技术
5 2026-09-08
The molecular mechanisms and therapeutic targeting of microtubule glutamylation in mitosis and cancer
2026-Nov, Pharmacology & therapeutics IF:12.0Q1
综述 本文综述了微管谷氨酰化在细胞分裂和癌症中的分子机制,并探讨了针对该过程的治疗策略 将微管谷氨酰化定位为癌症治疗的多面靶点,并探讨了从代谢干预到靶向蛋白降解和合成生物学等前沿治疗手段 未提供具体实验数据或候选药物的临床验证结果 阐明微管谷氨酰化在细胞分裂和肿瘤发生中的机制,并评估其作为癌症治疗靶点的潜力 微管谷氨酰化相关酶(如TTLL11、TTLL4、TTLL6、TTLL12)及其在细胞分裂和癌症中的作用 分子生物学 癌症 NA NA 文献数据 NA NA NA NA 医学
6 2026-09-08
Integrative quantum and systems biology of cancer: From molecular fluctuations to ecological outcomes
2026-Oct, Bio Systems
综述 本文以多尺度适应性系统视角审视癌症,评估整合量子与系统生物学框架的预测能力,并区分各尺度上已证实与推测的内容,同时探讨其相对于体细胞突变理论的附加价值。 提出癌症作为多尺度适应性系统的整合框架,在各尺度上明确区分证据与推测,并设计可证伪性检验,挑战了随机突变和均匀适应性策略的传统观点。 作为专家叙述性综合而非系统性综述,可能引入作者偏见,且其结论的普遍性受限于现有证据。 评估整合量子与系统生物学框架在癌症研究中的预测能力和附加价值,并明确其在不同尺度上的可检验预测。 癌症多尺度系统,包括分子、细胞、组织和生态尺度。 系统生物学 癌症 NA NA 文本 NA NA NA NA 医学
7 2026-09-08
γ-Butyrolactones and γ-butenolides as autoregulatory systems: key mediators of intraspecific, interspecific, and interkingdom communication in Streptomyces
2026-Sep-06, Archives of microbiology IF:2.3Q3
综述 本文综述了链霉菌中γ-丁内酯和γ-丁烯内酯作为自调控系统,在种内、种间及跨界通讯中的关键作用,并提出了整合多组学、合成生物学和微生物生态学的未来研究方向。 首次将GBL和GBN介导的种间通讯功能分为四种主题:实验验证的配体-受体对、外源化合物介导的受体响应、提取物或共培养介导的互补作用以及链霉菌-真菌通讯假说,并提出了前瞻性研究议程。 对GBL和GBN介导的种间通讯的生态范围、分子决定因素和功能结果仍缺乏深入探索。 总结GBL和GBN的化学多样性和调控机制,并推动对链霉菌种间群体感应网络的理解,以促进沉默生物合成基因簇的激活和新天然产物的发现。 链霉菌中的γ-丁内酯和γ-丁烯内酯信号分子及其介导的通讯机制。 微生物学 NA 多组学 NA NA NA 合成生物学 链霉菌 群体感应系统 医药、农业、食品、工业生物技术
8 2026-09-08
Unveiling the Molecular Secrets of Seaweeds: A Comprehensive Review of Bioinformatics Applications in Algal Research
2026-Sep-06, Omics : a journal of integrative biology IF:2.2Q3
综述 这篇综述全面介绍了生物信息学在海藻研究中的应用,涵盖基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学、微生物组和功能基因组学,并讨论了相关计算工具、数据库及新兴策略。 强调多组学整合、基因组编辑、人工智能、机器学习和合成生物学等新兴策略在海藻研究中的应用,展示了生物信息学在推动海藻生物学系统级理解和可持续生物技术转化中的重要作用。 指出当前面临的挑战,包括基因组资源不完整、数据标准化不足以及计算预测需要实验验证。 旨在概述生物信息学方法在海藻研究中的应用,并探讨其在生物燃料、营养保健品、药物和可持续农业等领域的转化潜力。 海藻(包括其基因组、转录组、蛋白质组、代谢组、微生物组等)。 生物信息学 NA 高通量测序、多组学技术 NA 基因组、转录组、蛋白质组、代谢组、微生物组数据 NA 基因组编辑(如CRISPR-Cas9等) 海藻 NA 生物技术、海洋生物经济、可持续农业、药物研发
9 2026-09-08
A Modular PLUG-IN Photosynthetic Chassis With Tunable Thermal Control for Mammalian Systems
2026-Sep, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 开发了在海洋微拟球藻中具有热调控的模块化“PLUG-IN”底盘,实现代谢输出和细胞壁完整性的可编程控制,并验证其在哺乳动物宿主中的跨物种兼容性 利用比较转录组学鉴定了两个高度热诱导的启动子,构建了模块化热基因扩增系统,实现热激活的AtWRI1表达增强三酰甘油和EPA积累,以及温度依赖的CesA1基因沉默导致细胞壁快速弱化,且不影响生长,并展示在哺乳动物系统中的功能 未明确提及限制,但可能包括对实验室条件、特定物种或热控制范围的依赖性 开发热调控的模块化“PLUG-IN”底盘,实现微藻中生长、生产和细胞壁重构的同步,并为光合生物生产和微藻合成生物学提供通用平台 海洋微拟球藻(Nannochloropsis oceanica)以及哺乳动物宿主 合成生物学 NA 比较转录组学、热调控基因表达系统 NA 转录组数据 NA 热启动子介导的基因表达调控 Nannochloropsis oceanica, 哺乳动物细胞 热控模块化底盘,包括热基因扩增、热激活AtWRI1表达、温度依赖CesA1基因沉默,以及代谢和细胞壁模块的耦合 工业生物技术
10 2026-09-08
CREAT: A CRISPR-Based Genome Trimming Strategy for Systematic Identification of Dispensable Regions and Rapid Genome Reduction
2026-Sep, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 提出了一种基于CRISPR的基因组修剪策略CREAT,用于系统鉴定非必需区域并快速减少基因组大小。 整合CRISPR靶向基因组切割与同源臂行走,实现了对基因组亚区域必需性的高通量分类,并支持连续多轮基因组修剪,适用于多种微生物。 主要依赖于可编辑性高的微生物,且对某些物种中Cas9介导的效率需借助重组酶系统来提高。 开发一种可扩展且普遍适用的策略,用于快速构建最小基因组微生物,以支撑基础生物学和合成生物学研究。 火山菌Saccharolobus islandicus、枯草芽孢杆菌Bacillus subtilis和大肠杆菌Escherichia coli的基因组。 基因组工程、合成生物学。 NA CRISPR基因组编辑、同源臂行走、基因组修剪。 NA 基因组序列数据。 涉及一个菌株(Saccharolobus islandicus)和两个菌株(Bacillus subtilis和Escherichia coli)的基因组。 CRISPR-Cas9、CRISPR-Cas靶向系统、λ-Red重组酶。 Saccharolobus islandicus、Bacillus subtilis、Escherichia coli。 合成基因表达盒用于替换非必需区域。 合成生物学、生物技术、工业微生物学。
11 2026-09-08
Environmental Release of Genetically Intervened Microorganisms: Towards a New Narrative
2026-Sep, Microbial biotechnology IF:4.8Q1
综述 本文回顾了基因工程微生物环境释放的历史与现状,提出从管控转向共生的治理新框架 强调基因工程微生物与自然进化生命的连续性,提出以可追溯性、管理和长期监测替代绝对封闭的新范式 未提供具体实验数据或案例验证,主要基于理论视角 探讨基因工程微生物环境释放的治理框架转变,以促进其用于生态修复 基因工程微生物及其环境释放政策 合成生物学 NA NA NA 文本 NA NA NA NA 环境
12 2026-09-08
Streptomyces Autoregulator Biosensors from Natural Product Cluster-Situated Regulators
2026-Jun-19, ACS chemical biology IF:3.5Q2
研究论文 本研究开发了八种基于簇定位调控因子的链霉菌自诱导物生物传感器,并探讨了其配体合成、交叉反应、正交性及共培养应用 首次将生物信息预测的链霉菌群体感应系统转化为具有不同激活倍数、配体亲和力和选择性的八种生物传感器,并实现了十二个正交信号系统 尚未在全文细节中明确讨论局限,但可能包括配体合成路线复杂及体内动态范围有限等 开发并验证基于CSR的链霉菌自诱导物生物传感器,用于解析天然产物调控中的群体感应并构建正交遗传电路 链霉菌属中基于簇定位调控因子(如TetR样阻遏物)的自诱导物生物传感器及其配体 合成生物学, 生物传感器 NA 生物传感器构建, 配体化学合成 NA 实验数据(生物活性、亲和力等) 八种生物传感器及十二个正交信号系统 NA 链霉菌属 基于群体感应的生物传感器及多输入遗传电路 工业生物技术, 药物发现
13 2026-09-08
Engineering Protein Stability with Small Molecules: A Review of the ecDHFR Destabilizing Domain System
2026-Jun-19, ACS chemical biology IF:3.5Q2
综述 本文综述了ecDHFR去稳定域系统通过配体诱导稳定化实现对蛋白质丰度条件性控制的机制、性能及优化,并评估其相对于其他条件基因表达系统的优势与局限。 系统性地总结了ecDHFR-DD系统在多个生物体中的应用,并探讨了其在害虫和媒介管理中的应用潜力,拓宽了该系统的应用范围。 主要局限性在于对条件性蛋白控制系统的全面比较可能受限于已有文献的覆盖面,且对于新兴应用领域的探讨可能缺乏实证支持。 综合现有知识,评估ecDHFR-DD系统作为条件性蛋白质稳定工具的机制、性能和优化策略,并展望其在多学科中的应用前景。 ecDHFR去稳定域系统及其在不同生物体(如酵母、无脊椎动物模型、哺乳动物细胞)中的应用。 合成生物学 NA 蛋白质工程 NA 文献 不适用 NA 酿酒酵母, 无脊椎动物, 哺乳动物细胞 去稳定域系统 医学, 农业, 工业生物技术
14 2026-09-08
Marine-derived Bioactive Compounds: A Promising Frontier against Multidrug-resistant Microbial Infections
2026, Mini reviews in medicinal chemistry
综述 本文探讨海洋来源的生物活性化合物作为对抗多重耐药微生物感染的新型抗生素来源的潜力,并综述了相关发现、生物合成和结构优化方面的最新进展。 强调海洋生态系统作为未被充分利用的天然产物库,以及利用海洋生物技术、基因组学、宏基因组学和合成生物学等创新方法来发现和优化具有新作用机制的抗菌化合物。 海洋来源化合物存在自然丰度低、培养困难和结构复杂性等挑战,限制了其临床转化。 探索海洋来源的天然产物作为新型抗生素的潜力,以应对多重耐药菌感染。 海洋生物及其代谢产物,如海绵、被囊动物、藻类及海洋来源的细菌和真菌。 天然产物研究、海洋生物学 多重耐药菌感染(如金黄色葡萄球菌、铜绿假单胞菌、鲍曼不动杆菌感染) NA NA NA NA 合成生物学(未具体列出工具) 海洋细菌和真菌 NA 医学
15 2026-09-08
Templated Pluripotent Stem Cell Differentiation via Substratum-Guided Artificial Signaling
2024-10-14, ACS biomaterials science & engineering IF:5.4Q2
研究论文 本文介绍了一种名为PSC-MATRIX的平台,该平台结合细胞工程与生物材料设计,通过底物引导的人工信号传导,实现多能干细胞的可控分化。 该平台首次将可编程生物材料扩展到多能干细胞,通过正交信号传导激活形态发生素产生,实现对基因表达的时间与空间控制,从而以非天然信号通道探究发育事件。 文中未提及具体局限性,但平台目前仅在特定培养条件下验证,可能限制其广泛适用性。 开发一种合成生物学工具,用于研究多能干细胞分化中的分子机制,并指导细胞命运决定。 人类多能干细胞(PSCs),特别是经合成Notch(synNotch)工程化的细胞。 合成生物学 NA 细胞工程、生物材料设计、合成Notch信号传导 NA 图像和分子生物学数据 未具体说明,但涉及人类多能干细胞培养,最长11天 合成Notch(synNotch) 人类多能干细胞 人工信号传导回路,用于响应可溶性输入并控制转基因表达,以调控分化 医学、生物技术
16 2026-09-07
Photoperiod-dependent regulation of secondary growth by auxin flux: how it occurs and how to benefit from it
2026-Oct, Biological reviews of the Cambridge Philosophical Society
综述 本文综述了光周期通过生长素通量调控树木次生生长的机制,并探讨了利用该机制增强树木生长和抗旱性的合成生物学策略 提出光周期通过生长素通量独立于顶端生长调节次生生长的假说,并探讨利用合成生物学工程光周期不敏感的生长素生物合成来优化树木性能的新策略 关于FT/TFL1样和CCA1/LHY样因子在光周期调控生长素通量中的作用尚不明确,且缺乏直接实验证据 阐明光周期调控次生生长的机制,并探索通过合成生物学方法提高树木在气候变化下的生长和抗旱性 温带林木(特别是杨树)的次生生长期(木质部分化阶段) 植物生物学 NA NA NA NA NA 合成生物学 杨树 光周期不敏感的生长素生物合成通路 农业, 环境
17 2026-09-07
Protein modification: convergence of artificial intelligence, synthetic biology, and nano-assembly
2026-Oct-01, Food chemistry IF:8.5Q1
综述 本文批判性审视了生物合成蛋白质功能增强的最新进展,重点介绍人工智能、合成生物学和纳米组装交叉融合的策略 强调计算设计、人工智能引导的蛋白质工程和遗传密码扩展的整合,以及化学、酶和物理场辅助修饰技术与多组分自组装和纳米制造等宏观方法的协同效应 未具体说明局限性 探讨通过跨学科合成方法提升生物合成蛋白质功能,以实现可持续高性能蛋白质配料 生物合成蛋白质 合成生物学、人工智能、纳米技术 NA 人工智能引导的蛋白质工程、遗传密码扩展、化学修饰、酶修饰、物理场辅助修饰、纳米制造 NA 文本 NA NA NA NA 食品、生物技术
18 2026-09-07
Engineering extracellular vesicles for targeted siRNA delivery: Advances, therapeutic applications, and clinical translation
2026-Sep-05, Nanomedicine : nanotechnology, biology, and medicine IF:4.7Q2
综述 本文全面综述了工程化细胞外囊泡用于靶向小干扰RNA递送的研究进展、治疗应用和临床转化前景 系统总结了包括电穿孔、超声处理、挤出、母细胞工程和微流控等多种货物装载策略,以及利用肽、抗体、适配体和混合纳米平台进行表面功能化的最新进展,并探讨了合成生物学、基因组工程和人工智能等新兴技术的潜在应用 细胞外囊泡的大规模生产、货物装载效率、标准化、质量控制、监管审批和临床转化仍面临重大挑战 探讨工程化细胞外囊泡作为小干扰RNA递送平台的潜力,推动下一代精准RNA疗法的发展 工程化细胞外囊泡及其靶向小干扰RNA递送系统 纳米医学 癌症、神经系统疾病、肝脏疾病、心血管疾病、炎症性疾病和传染病 电穿孔、超声处理、挤出、微流控、细胞工程、表面功能化 NA 文献资料 NA 合成生物学、基因组工程、细胞工程 NA NA 医学
19 2026-09-07
Application of Emerging Technologies in the Antiviral Field
2026-Sep-05, Antiviral research IF:4.5Q1
综述 本文综述了类器官模型、基因编辑、人工智能驱动的分子设计和合成生物学四种前沿技术在抗病毒研究中的应用,强调其协同作用并推动抗病毒策略向智能化发展 提出了将四种前沿技术(类器官、基因编辑、AI、合成生物学)整合为一种协同工作流的观点,涵盖疾病建模、靶点发现、分子设计、构建、测试和迭代优化,推动抗病毒研究从经验方法转向精准智能策略 技术整合和可扩展性方面仍存在挑战,需要高质量生物数据集和更强跨学科合作以发挥转化潜力 探讨新兴技术如何重塑抗病毒研究,构建一个框架以指导人类和动物健康中抗病毒策略的智能演进 病毒性疾病及其相关技术平台,包括类器官、基因编辑、人工智能和合成生物学工具 人工智能 病毒性疾病 基因编辑 NA NA NA CRISPR-Cas9 NA 合成生物学Design-Build-Test-Learn循环 医学
20 2026-09-07
De novo coassembly of functional chlorophyll- and carotenoid-protein complexes in Saccharomyces cerevisiae
2026-Sep-04, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 在酿酒酵母中通过整合13个异源基因和删除3个内源基因,重建了完整的叶绿素生物合成途径,并成功实现了叶绿素a的生产,同时扩展了类胡萝卜素模块,实现了两种色素-蛋白复合物的体内共组装 首次在非光合真核生物酿酒酵母中完成完整的叶绿素生物合成途径的异源重建,并实现了功能性的叶绿素和类胡萝卜素-蛋白复合物的共组装,展示了高保真的色素结合和天然功能 摘要中未明确提及局限性,但可能包括叶绿素生产滴度相对较低以及途径复杂性导致的资源竞争问题 在非光合真核生物中建立异源生产叶绿素及色素-蛋白复合物的平台,为研究光合复合物的组装和工程化光驱动代谢提供基础 酿酒酵母中的叶绿素生物合成途径及植物和蓝藻来源的色素-蛋白复合物 合成生物学 NA NA NA NA NA CRISPR-Cas9 酿酒酵母 叶绿素生物合成途径和酮类胡萝卜素生物合成模块 工业生物技术
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