合成生物学相关文章
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当前共找到 5346 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-07-12 |
One-step selection of high-affinity COP1 aptamers
2026-Sep, aBIOTECH
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.abiote.2026.100060
PMID:42434511
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研究论文 | 开发了一种基于磁珠的一步式适配体筛选方法（BOSS），并成功筛选出针对拟南芥COP1蛋白的高亲和力适配体 | 提出了一种简化且高效的BOSS方法，无需多轮SELEX操作即可一步筛选高亲和力适配体，并首次获得植物COP1蛋白的适配体 | 仅以AtCOP1-RING域为靶标进行概念验证，未广泛测试其他靶标；适配体在体内应用中的稳定性和长期效果未评估 | 开发高效的一步式适配体筛选方法，用于合成生物学工具的开发 | 拟南芥COP1蛋白的N端RING域 | 合成生物学 | NA | SELEX, 高通量测序 | NA | 序列数据 | 随机ssDNA文库（具体数量未提及） | NA | 大肠杆菌（表达AtCOP1-RING域） | 适配体作为生物传感器和光遗传学工具 | 植物生物学, 合成生物学 |
| 2 | 2026-07-12 |
Engineering 2,4-Diacetylphloroglucinol-Hyper-Tolerant Escherichia coli via Adaptive Evolution for Efficient Biosynthesis and an Organic Solvent-Free Downstream Process
2026-Jul-10, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00194
PMID:42429219
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研究论文 | 通过适应性进化工程改造2,4-二乙酰基间苯三酚超耐受大肠杆菌，实现高效生物合成和无有机溶剂下游工艺 | 首次通过适应性实验室进化获得DAPG超耐受大肠杆菌菌株，并结合基因组重测序鉴定关键突变，构建了精确工程菌株；同时开发了无有机溶剂的绿色提取方法，回收率超过98% | 未明确说明，但可能涉及进化菌株的稳定性、DAPG产量在实际大规模发酵中的性能以及突变叠加的通用性 | 解决DAPG生物合成中宿主毒性和下游处理效率低的关键瓶颈 | 大肠杆菌菌株以及DAPG耐受性相关突变 | 合成生物学 | NA | 适应性实验室进化、基因组重测序 | NA | NA | NA | 适应性实验室进化 | 大肠杆菌 | DAPG响应型基因回路 | 农业 |
| 3 | 2026-07-12 |
Integrated multi-omics analysis reveals a pH-driven metabolic and translational switch in Ureaplasma parvum
2026-Jul-10, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.03463-25
PMID:42429378
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研究论文 | 通过整合多组学分析揭示微小病原体解脲支原体在无典型转录调控系统下依赖pH驱动的代谢与翻译适应机制 | 首次提出最小基因组细菌通过预先存在的功能模块差异激活实现表型可塑性，并揭示表观转录组（RNA修饰）在pH适应中的动态重组作用，挑战了传统认为细菌适应必须依赖转录调控的观点 | 未明确pH信号直接感知机制，且研究仅限于体外条件，未在宿主微环境验证模型 | 构建解脲支原体在pH波动条件下的系统级适应模型，解释最小基因组微生物的适应性可塑性机制 | 解脲支原体（Ureaplasma parvum） | 微生物学, 系统生物学 | 泌尿生殖道感染 | 蛋白质组学, 代谢组学, RNA修饰分析（表观转录组学） | NA | 蛋白质丰度, 代谢物浓度, RNA修饰谱 | NA（未提供具体样本量） | NA | 解脲支原体（天然宿主为人类泌尿生殖道） | NA | 医学, 合成生物学 |
| 4 | 2026-07-12 |
Engineering extracellular vesicle biogenesis for therapeutic gene delivery: emerging genetic programming strategies and translational prospects
2026-Jul-10, Molecular biology reports
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s11033-026-12320-w
PMID:42429865
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综述 | 本文综述了利用遗传工程策略改造细胞外囊泡生物发生过程，以实现治疗性基因递送的最新进展和转化前景 | 整合了细胞外囊泡生物发生知识与新兴遗传工程技术，包括CRISPR-Cas9基因组编辑和合成生物学工具，以实现可编程基因递送系统的构建 | 面临囊泡异质性、大规模生产和临床转化等关键挑战 | 探讨将细胞外囊泡转化为可编程基因递送系统的策略及其在精准医学中的应用前景 | 细胞外囊泡及其在基因治疗中的应用 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 可编程基因递送系统 | 医学 |
| 5 | 2026-07-12 |
De novo synthesis of large-scale metabolic pathways for natural products and their optimization strategies
2026-Jul-10, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.135370
PMID:42431421
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综述 | 系统分析利用合成生物学在微生物细胞工厂中重建大规模代谢通路（≥10个酶促步骤）的核心策略和前沿技术 | 整合智能算法与多学科工具以突破复杂天然产物生物制造瓶颈，并强调理性设计、动态控制与模块化共培养策略的结合 | 未具体说明限制 | 探讨天然产物大规模代谢通路的重建策略及其优化方法，以实现高效可持续的生物制造 | 天然产物及相关代谢通路 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick | 微生物细胞工厂（如大肠杆菌、酿酒酵母等） | 代谢通路（包括模块化设计、自组装结构、动态调控机制等） | 医药, 生物制造 |
| 6 | 2026-07-12 |
The disorazole family of potent anticancer agents: structures, bioactivity, total synthesis, and heterologous biosynthesis
2026-Jul-10, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2026.07.028
PMID:42431458
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综述 | 系统综述了disorazole家族的结构、生物活性、全合成和异源生物合成，阐述了从化学合成迈向工程化生物合成的范式转变 | 阐明了从传统全合成挑战（如通过大环内酯化或环二聚化合成A1、C1、Z1）转向可编程生物合成工程（F和Z系列）的范式转变，并重点展示了异源表达、基于Red/ET重组工程的途径重构和模块化聚酮合酶工程等关键技术如何革新了这些分子的生产和多样化 | NA | 对disorazole家族进行全面系统分析，弥合复杂化学合成与现代生物合成工程之间的差距，并提出整合生物合成可扩展性与合成化学精度的未来转化策略 | Disorazole家族天然产物（包括A/C系列和Z-F家族） | 天然产物化学，合成生物学 | 癌症 | 异源表达，Red/ET重组工程，模块化聚酮合酶工程，全合成（通过大环内酯化或环二聚化） | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Red/ET重组工程 | Sorangium cellulosum | 异源生物合成途径重构和模块化聚酮合酶工程，用于生产disorazole及其类似物 | 医学 |
| 7 | 2026-07-12 |
Rewiring cellular immunotherapy: From CAR evolution to circuit innovations across diseases
2026-Jul-09, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108980
PMID:42425236
|
综述 | 综述嵌合抗原受体（CAR）细胞免疫治疗从线性受体设计发展为可编程免疫电路的演变过程，并讨论其在多种疾病中的应用策略 | 将CAR免疫治疗重新定义为生物信号处理系统，系统梳理从线性CAR架构到可编程免疫电路的转变，并比较体外和体内免疫细胞重编程工程策略 | 依赖于现有文献，可能未涵盖未发表的新兴技术或长期临床数据 | 总结CAR免疫治疗在信号处理视角下的演变，以及在不同疾病背景下电路CAR的设计原则和工程策略 | 基于CAR的免疫细胞治疗系统，包括T细胞、自然杀伤细胞和巨噬细胞等替代免疫细胞 | 数字病理学, 机器学习 | 血液恶性肿瘤 | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN | T细胞, 自然杀伤细胞, 巨噬细胞 | 可编程免疫电路，包括多输入整合、逻辑运算和上下文依赖输出 | 医学 |
| 8 | 2026-07-12 |
Deep Learning Predicts Dissimilar DNA-DNA Binding and Engineers Hyperconnected Networks
2026-Jul-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-75395-w
PMID:42426013
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研究论文 | 开发了BINND模型，通过深度学习预测非正交DNA-DNA相互作用，并展示了其在超连网络工程中的应用 | 提出从回避弱或非特异性相互作用转向利用完整序列空间的新范式，结合超高通量平台和深度学习模型，实现快速准确的预测 | 未提及模型在复杂生物系统或临床环境中的验证，也未讨论潜在的非特异性交叉干扰问题 | 开发能够准确快速预测非正交DNA-DNA相互作用的模型，以扩展合成生物学的序列空间利用 | DNA-DNA相互作用 | 机器学习 | NA | 深度学习 | 神经网络（BINND） | DNA相互作用数据 | 数百万个相互作用测量 | NA | NA | 超连网络 | 医学, 生物工程, DNA折纸 |
| 9 | 2026-07-12 |
Heterologous Expression of an Abandoned Termite Mound Fungus Gene Cluster Reveals a Protective Aldehyde-Alcohol Cycle and a Candidate Termiticidal Metabolite
2026-Jul-05, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00101
PMID:42402854
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研究论文 | 通过合成生物学方法异源表达废弃白蚁巢真菌的基因簇，揭示了一个保护性的醛-醇循环以及一种候选杀蚁代谢产物 | 首次通过合成生物学手段解码隐蔽生态代谢，整合多组学与异源途径表达，阐明了一个空间分离的醛-醇循环自我保护系统，并发现了一种具有强效杀蚁活性的代谢产物 | 未提及 | 探索药用真菌乌灵参（Wulingshen）在白蚁废弃巢穴中特异性适应的分子基础 | 乌灵参真菌及其附属微生物组 | 合成生物学 | NA | 宏基因组学、转录组学、异源表达 | NA | 测序数据 | 野生标本样本 | 合成生物学工具（未具体说明） | 真菌宿主（未具体说明） | α-吡喃酮代谢物家族合成途径及醛-醇循环 | 生态学, 农业（害虫防治） |
| 10 | 2026-07-12 |
Technology-driven revolution in CO2 fixation: From natural pathways to programmable Biosystems
2026-Jul-02, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108964
PMID:42392238
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综述 | 本文综述了从自然途径到可编程生物系统的二氧化碳固定技术驱动革命 | 创新性在于集成分析了从自然途径优化到人工系统构建的范式转变，强调了代谢工程、合成生物学、电化学和纳米材料的深度融合，并引入人工智能辅助设计 | 综述主要聚焦于微生物系统，可能未涵盖其他潜在的二氧化碳固定技术如化学或物理方法，且对实际应用中的经济可行性讨论有限 | 总结并分析二氧化碳固定技术的进展，推动精准、高效和碳负性的生物制造 | 二氧化碳固定途径和微生物转化系统 | 机器学习 | NA | CRISPR-Cas, 微生物电合成, 半人工光合系统 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | 微生物 | 合成途径（如rGly, CETCH, THETA循环） | 环境, 工业生物技术 |
| 11 | 2026-07-12 |
Synthetic biology-engineered immunotherapies: Precision control of immune responses
2026 Jul-Aug, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108871
PMID:41864375
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综述 | 合成生物学设计的免疫疗法通过精确控制免疫反应，为癌症和免疫疾病提供新策略 | 利用合成生物学设计模块化信号回路和逻辑门控激活，实现免疫行为的上下文依赖和反馈控制，提升治疗特异性和可调性 | 未提及具体临床试验数据和长期安全性评估 | 综述合成生物学在精准免疫治疗中的转化潜力 | 合成免疫回路、逻辑门控激活、反馈控制细胞因子分泌 | NA | 肿瘤, 免疫疾病 | 合成生物学工程 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 哺乳动物细胞 | 逻辑门控激活回路、反馈控制细胞因子分泌回路 | 医学 |
| 12 | 2026-07-12 |
Genetic Toolbox Expansion Enables Constitutively Fluorescent Lacticaseibacillus rhamnosus for Functional Microbiome Research
2026-Jul, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.70405
PMID:42426988
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研究论文 | 扩展了鼠李糖乳杆菌的遗传工具箱，实现了组成型荧光表达，用于功能性微生物组研究 | 通过直接质粒克隆和测试在植物乳杆菌中验证过的遗传元件，首次在鼠李糖乳杆菌GR-1中实现组成型荧光蛋白（mCherry、mScarlet3和sfGFP）表达，并表征了启动子的热响应性和稳定性 | 遗传工具仍有限，仅验证了部分启动子和荧光蛋白，未涉及更复杂的合成生物学应用 | 扩展鼠李糖乳杆菌的遗传工具箱，推动功能性微生物组研究和合成生物学应用 | 鼠李糖乳杆菌GR-1和GG菌株 | 合成生物学 | NA | 直接质粒克隆 | NA | NA | 两个鼠李糖乳杆菌菌株（GR-1和GG）及一个金黄色葡萄球菌菌株 | NA | 鼠李糖乳杆菌GR-1 | 组成型荧光蛋白表达系统 | 医学、工业生物技术 |
| 13 | 2026-07-12 |
Diverse molecular mechanisms of in vivo haploid induction in plants: from fertilization interference to genome programming
2026-Jun-29, Plant cell reports
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s00299-026-03882-x
PMID:42373814
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综述 | 综述植物体内单倍体诱导的三种核心分子机制及其应用平台 | 将雄配子缺陷、配子体重编程和着丝粒工程三种机制整合为统一框架，并强调无转基因基因组编辑平台及AI辅助设计 | 双子叶植物、大基因组作物及父本单倍体诱导效率低 | 阐明植物体内单倍体诱导的分子机制并推动跨物种通用系统开发 | 植物雄性配子（MTL/DMP/KPL）、配子体（BBM-BAR1）、着丝粒（CENH3/KNL2） | 农业生物技术 | NA | 基因组编辑（HIEdit, GEDH）、多组学、合成生物学、机器学习 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 植物（作物） | 合成无融合生殖通路 | 农业 |
| 14 | 2026-07-12 |
Microfluidics-Based Engineering of Molecular Self-Assembly and Manufacturing for Artificial Cell Systems
2026-Jun-25, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00249
PMID:42358072
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观点文章 | 探讨如何通过微流控平台与分子自组装协同作用构建人造细胞系统 | 提出将微流控作为提供外部物理边界条件的平台来引导分子自组装，而非替代生物调控；并将微流控平台分为从分子组装到多细胞体的四个层级进行系统化分类 | 未提供具体的实验验证数据或量化结果，主要基于理论框架和未来展望 | 解决中尺度人造细胞系统构建中纯分子自组装随机性的问题，推动人造细胞技术标准化和产业化 | 分子自组装系统、微流控工程平台、人造细胞系统 | 合成生物学 | NA | 微流控、分子自组装 | NA | NA | NA | 微流控 | NA | NA | 工业生物技术, 医药 |
| 15 | 2026-07-12 |
Beyond Compartmentalization: Deciphering Reaction Kinetics in Liquid-Liquid Phase Separation for Rational Biotechnological Design
2026-Jun-25, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00259
PMID:42350320
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综述 | 系统阐述液-液相分离如何调控反应动力学，并推动合成生物学在医学和生物技术中的应用 | 整合蛋白质介导和非蛋白质介导的液-液相分离，系统性解析其通过反应物浓度、反应-扩散耦合、微环境工程和酶活性调节等机制精确控制反应动力学，并建立合理设计指南 | 当前对液-液相分离精确控制反应动力学的机制理解不完整，阻碍了相关应用的合理设计和优化 | 桥接液-液相分离在反应动力学调控中的知识鸿沟，为下一代合成生物学应用提供设计原则 | 蛋白质介导和非蛋白质介导的液-液相分离系统 | 合成生物学 | NA | 液-液相分离 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物催化，代谢工程，诊断，治疗，生命起源研究，人工细胞构建 |
| 16 | 2026-07-12 |
Endogenous constitutive promoters with a broad range of transcriptional activities for plant synthetic biology
2026-Jun-22, Plant cell reports
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s00299-026-03885-8
PMID:42329465
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研究论文 | 本研究从本塞姆氏烟草中鉴定内生组成型启动子，并定量表征其转录活性，为植物合成生物学提供CaMV 35S启动子的可靠替代 | 首次系统鉴定了本塞姆氏烟草的内源组成型启动子库，通过GFP和双荧光素酶报告系统定量测定其转录强度，并在多个异源物种中验证了启动子活性的跨物种保守性 | 启动子在单子叶植物（如玉米）中的活性显著降低，跨物种应用的通用性有限 | 为植物合成生物学提供具有定量定义转录强度的内源组成型启动子，作为CaMV 35S启动子的替代方案 | 本塞姆氏烟草的内源组成型启动子 | 植物合成生物学 | NA | GFP报告基因分析、双荧光素酶报告系统、原生质体瞬时表达 | NA | 基因表达数据 | 多个候选启动子，在拟南芥、白菜、辣椒、玉米等物种的原生质体中测试 | NA | 本塞姆氏烟草、白菜、辣椒、玉米 | 组成型启动子表达系统 | 农业、工业生物技术 |
| 17 | 2026-07-12 |
The big kinship of proline: Counting saturated and unsaturated secondary amino acids of different ring size
2026-Jun-19, Biochimie
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.biochi.2026.06.010
PMID:42320729
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研究论文 | 对脯氨酸及其同系物（不同环大小的饱和与不饱和环状次级氨基酸）进行数学枚举和特性概述 | 提出了所有可能环状次级α-氨基酸和亚氨基酸的数学枚举程序，导出了修正卢卡斯序列的递归公式以及明确计数公式，为虚拟化合物数据库构建和化学合成计算机辅助设计提供了新方法 | 研究主要基于理论枚举和已知结构概述，未涉及实验验证或实际应用的具体效果评估 | 枚举不同环大小下所有可能的饱和与不饱和环状次级氨基酸，并提供这些化合物的结构和功能特性概述 | 脯氨酸及其同系物（不同环大小的环状次级α-氨基酸和亚氨基酸） | 合成生物学 | NA | 数学枚举 | NA | 文本与化学结构数据 | NA | NA | NA | NA | 生物技术, 合成生物学, 药理学 |
| 18 | 2026-07-12 |
A programmable Aeromonas chassis, AMAX2, for advanced biomanufacturing
2026-06-17, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.00231-26
PMID:42148730
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研究论文 | 该论文报道了下一代工程化气单胞菌底盘AMAX2，通过删除毒力和非必需基因增强生物安全性，同时保持快速生长和蛋白质表达，并整合多种合成生物学功能用于先进生物制造 | AMAX2在保持高生长速率和蛋白质产量的基础上，通过基因删除显著提升生物安全性，并集成可诱导系统、tRNA补充、基因组规模CRISPRi-seq必需基因鉴定、无DNA微细胞生产、表面展示和蛋白靶向分泌等多功能模块 | 论文未明确讨论AMAX2在长期培养中的遗传稳定性，以及与其他常用底盘（如大肠杆菌）在工业规模生产中的成本效益比较 | 开发一种兼具高性能、生物安全性和多功能性的可编程微生物底盘，用于先进生物制造和生物治疗开发 | 气单胞菌底盘AMAX2及其工程化改造 | 合成生物学 | NA | CRISPRi-seq, 基因删除, 质粒系统, 细胞表面展示, 蛋白质分泌系统 | NA | 基因组数据, 功能实验数据, 生物安全性数据 | 细胞和动物模型（具体数量未在摘要中提供） | CRISPRi-seq, 质粒工程 | 气单胞菌 | 可诱导表达系统, tRNASupplementation系统, SpyCatcher-SpyTag表面展示系统, VI型分泌系统介导的蛋白质转运 | 工业生物技术, 医学 |
| 19 | 2026-07-12 |
Hydrazinoacetic acid is a biosynthetic precursor of the bacterially produced nitramine, N-nitroglycine
2026-06-17, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.00631-26
PMID:42159495
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研究论文 | 本研究揭示了肼基乙酸是细菌产生的硝胺——N-硝基甘氨酸的生物合成前体 | 首次阐明天然产物N-硝基甘氨酸的生物合成途径，发现肼基乙酸是其关键前体，并验证了赖氨酸为硝基氮的来源，通过基因簇重建和同位素标记实验确认了合成路线 | 研究未完全阐明硝胺生物合成的全部步骤，且生物合成途径在工业生产中的可持续性尚需进一步开发 | 阐明细菌产生的硝胺天然产物N-硝基甘氨酸的生物合成机制 | 链霉菌属细菌（Streptomyces）及N-硝基甘氨酸 | 合成生物学 | NA | 稳定同位素标记、液相色谱-串联质谱（LC-MS/MS）、生物信息学分析、基因簇重建 | NA | 同位素标记数据、蛋白质组学数据、晶体结构数据 | 使用多种同位素标记前体（L-赖氨酸、甘氨酸、肼基乙酸）进行培养实验，样本数量未明确说明 | NA | 链霉菌属细菌（Streptomyces） | N-硝基甘氨酸的生物合成途径，涉及肼基乙酸的生成及硝胺中间体 | 工业生物技术、能源（含能材料） |
| 20 | 2026-07-12 |
Membrane-Based Assembly and Interactions in Immune Receptors
2026-Apr-22, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.5c00993
PMID:41865294
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综述 | 综述了免疫受体的膜基组装与相互作用，重点关注其模块化结构及跨膜结构域在信号转导中的作用 | 系统总结了免疫受体在脂双层中组织的分子原理和结构基序，揭示了跨膜结构域特异性相互作用的重复模式及其在合成生物学中的应用潜力 | NA | 理解免疫受体的构建机制及膜内分子相互作用对其结构与功能的影响 | 免疫受体（如配体结合模块和信号模块组成的跨膜蛋白）及其跨膜结构域 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | 合成生物学, 医学 |