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当前共找到 5528 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-08-14 |
An orthogonal mammalian gene circuit for selective sensing of taurine-conjugated bile acids
2026-Sep-17, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2026.154326
PMID:42492193
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研究论文 | 本研究利用来自霍乱弧菌的胆汁酸诱导型二鸟苷酸环化酶VC1372，在哺乳动物细胞中构建了一种正交的牛磺酸结合胆汁酸响应基因回路，实现对Tau-BAs的选择性检测。 | 首次将细菌来源的VC1372酶改造为哺乳动物细胞中的正交代谢物传感器，实现对牛磺酸结合胆汁酸的选择性检测，避免了内源受体干扰。 | 该基因回路主要在体外细胞水平验证，尚未在体内模型中进行测试，且对低浓度Tau-BAs的敏感性和特异性有待进一步优化。 | 开发一种能够在哺乳动物细胞中正交且选择性响应牛磺酸结合胆汁酸的合成基因回路，为相关疾病的诊断和治疗提供模块化平台。 | 哺乳动物细胞中的合成基因回路，以及主要循环Tau-BAs（TCA、TDCA、TCDCA）。 | 合成生物学 | 慢性肝病、代谢性疾病、神经退行性疾病 | 定点突变、基因回路构建、细胞培养、荧光报告基因检测 | NA | 实验数据（基因表达响应数据） | NA | 定点突变 | 哺乳动物细胞 | 正交牛磺酸结合胆汁酸响应基因回路，包括VC1372酶促模块和BldD依赖性转录模块 | 医学 |
| 2 | 2026-08-14 |
Integrative Quantum and Systems Biology of Cancer: From Molecular Fluctuations to Ecological Outcomes
2026-Aug-12, Bio Systems
DOI:10.1016/j.biosystems.2026.105923
PMID:42586472
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综述 | 本文从多尺度自适应系统视角审视癌症，评估整合量子与系统生物学框架的有效性，并区分各尺度上已有证据与提出的假设。 | 提出将量子效应、系统生物学和生态学观点整合到癌症研究中，并强调通过基准测试和可证伪性来评估框架价值。 | 这是专家叙述性综合而非系统性综述，且量子贡献被认为是残余效应，证据有限。 | 评估量子与系统生物学框架在癌症研究中的适用性，并明确其预测能力与局限性。 | 癌症作为多尺度自适应系统，包括分子波动、表观遗传、细胞群体生态等。 | 系统生物学 | 癌症 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 3 | 2026-08-14 |
Site-specific recombinases and their essential role in synthetic biology
2026-Aug-08, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.109005
PMID:42570711
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综述 | 本文系统综述了位点特异性重组酶在合成生物学中的基本概念、结构机制、工程策略及多样化功能应用 | 全面总结了位点特异性重组酶的分类、结构机制、个体特性、重组模型、工程策略及功能应用，提供了一个系统的视角 | 未提及具体局限性 | 系统概述位点特异性重组酶的基本概念和最新进展，以支持合成生物学工具箱的发展 | 位点特异性重组酶 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 遗传电路设计、DNA组装 | 合成生物学 |
| 4 | 2026-08-14 |
bHLH Family Transcription Factors: Molecular Switches in Plant Specialized Metabolism
2026-Aug-03, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells15151400
PMID:42587808
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综述 | 本文综述了bHLH转录因子作为植物 specialized metabolism（特化代谢）中的分子开关，重点讨论了茉莉酸-JAZ-MYC模块的调控机制及其在不同植物中的实例。 | 不同于以通路或MYC2为中心的综述，本文提出了一个直接-级联-混合框架，整合了启动子语法、空间能力、储存解剖学和证据层次。 | 未提及明显的局限性。 | 探讨bHLH转录因子在植物特化代谢中的调控作用，并总结其共享原则及工程应用策略。 | 植物中的bHLH转录因子及其调控的特化代谢产物，如萜类、生物碱、苯丙素、黄酮类、硫代葡萄糖苷等。 | 植物分子生物学 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | 植物 | 调控网络 | 农业, 药用代谢产物生产, 食品质量, 合成生物学 |
| 5 | 2026-08-14 |
Fructans and Fructooligosaccharides in Plants and Fruits: Metabolism, Functional Roles, and Emerging Biotechnological Opportunities
2026-Jul-30, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules31152656
PMID:42588504
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综述 | 该文综述了植物和水果中果聚糖与低聚果糖的代谢、功能作用及新兴生物技术机遇 | 强调水果中果聚糖的潜在功能，并讨论了育种、代谢工程和合成生物学增强果聚糖积累的最新进展 | 未提及具体局限性 | 提供果聚糖和FOS代谢的更新概述，并探讨其在植物生理和人类营养中的双重作用及生物技术应用 | 植物和水果中的果聚糖与低聚果糖 | 植物生物学、合成生物学 | NA | 育种、代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9、TALEN、ZFN、Gibson Assembly、Golden Gate Assembly、BioBrick | 植物（如作物） | 代谢途径（果聚糖生物合成途径） | 农业、食品、营养保健品 |
| 6 | 2026-08-14 |
Mechanism of Terpene Formation in Pogostemon cablin cv. Jing Huoxiang Revealed by Metabolome and Transcriptome Analysis
2026-Jul-30, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27156836
PMID:42589492
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研究论文 | 通过代谢组和转录组分析，揭示了荆藿香不同组织中萜类化合物的积累模式及其生物合成调控机制 | 首次系统研究了荆藿香地下部分（根）中多环倍半萜的代谢基础，并通过共表达网络分析发现了潜在的编码高效多环倍半萜合酶的候选基因及一个受β-石竹烯/α-蛇麻烯调控的三级代谢通路 | 未提及具体局限性 | 阐明荆藿香不同组织中萜类化合物的生物合成调控机制，为合成生物学优化萜类生产提供基础 | 荆藿香（Pogostemon cablin cv. Jing Huoxiang）的根、茎、叶、花和腺毛组织 | 转录组学、代谢组学 | NA | GC-MS、RNA-seq | 共表达网络分析 | 代谢组数据、转录组数据 | 根、茎、叶、花和腺毛组织的样品 | NA | NA | NA | 医药、香料、生物燃料 |
| 7 | 2026-08-14 |
Cyanobacterial Circadian Clock: Molecular Mechanisms and Physiological Outputs
2026-Jul-27, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants15152293
PMID:42588797
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综述 | 本文综述了蓝藻生物钟的分子机制和生理输出，重点分析了KaiABC蛋白振荡器的工作原理及其在代谢调控中的作用。 | 挑战了原核生物仅被动响应环境信号的假设，展示了翻译后振荡器独立于转录-翻译反馈的运作方式，并整合了进化可塑性和合成生物学设计视角。 | 对振荡器与细胞周期耦合、生态型功能分化及群落水平作用等未解问题仍有待深入探讨。 | 阐明蓝藻昼夜节律钟的分子运作、演化逻辑及其生理功能，为生物计时原理和合成生物学电路设计提供理论基础。 | 蓝藻的KaiA、KaiB和KaiC蛋白组成的生物钟振荡器及其输入输出网络。 | 分子生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 蓝藻 | KaiABC蛋白振荡器（作为生物钟核心回路） | 合成生物学 |
| 8 | 2026-08-14 |
Genome-Wide Identification and Functional Verification of Core Berberine Bridge-like Enzyme Genes for Benzylisoquinoline Alkaloid Biosynthesis in Corydalis saxicola Bunting
2026-Jul-27, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27156708
PMID:42589364
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研究论文 | 本研究对岩黄连中的小檗碱桥样酶基因家族进行了全基因组鉴定和功能验证，揭示了其在苯并异喹啉生物碱生物合成中的作用 | 首次对岩黄连中BBL基因家族进行全基因组鉴定，并通过体外酶学实验证实了特定BBL基因催化四电子氧化反应生成脱氢卡维丁和药根碱，为岩黄连中特征性生物碱的生物合成提供了分子基础 | 研究主要基于体外酶学实验，未进行体内功能验证或代谢工程应用 | 鉴定并验证岩黄连中负责苯并异喹啉生物碱核心骨架氧化的关键BBL基因功能 | 岩黄连（Corydalis saxicola Bunting）中的小檗碱桥样酶基因家族成员 | 功能基因组学 | NA | 全基因组鉴定、系统发育分析、表达谱分析、蛋白质结构预测、分子对接、体外酶学实验 | NA | 基因组序列、基因表达数据、蛋白质结构数据 | 22个BBL基因成员 | NA | NA | NA | 医学、工业生物技术 |
| 9 | 2026-08-14 |
Live-cell imaging of enhancer-promoter dynamics reveals transient contact-driven gene activation
2026-Jun-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.06.21.733446
PMID:42367879
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研究论文 | 本文通过活细胞超分辨率成像技术，结合合成生物学平台，研究增强子与启动子之间的动态相互作用，发现基因激活由短暂接触介导 | 开发了优化的合成生物学平台，首次实现超高分辨率下同时可视化增强子-启动子三维距离和新生转录，并结合多种互补方法揭示接触机制 | 未明确提及局限性，但基于摘要，可能受限于细胞系模型和成像技术的时间分辨率 | 阐明增强子与启动子相互作用的空间和时间机制，并揭示其与转录激活的关系 | 增强子-启动子相互作用及其与基因激活的关系 | 活细胞成像 | NA | 超分辨率活细胞成像、3D基因组学 | NA | 图像 | 多种细胞系（具体数量未提及） | 合成生物学平台 | 哺乳动物细胞 | 增强子-启动子接触可视化系统 | 生物医学研究 |
| 10 | 2026-08-14 |
Metabolic Pathways and Molecular Regulatory Mechanisms of Nervonic Acid Biosynthesis in Malania oleifera
2026-Jun-18, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27125507
PMID:42353223
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综述 | 本文系统总结了马拉尼奥油藤中神经酸生物合成的代谢途径与分子调控机制，包括脂肪酸合成、极长链脂肪酸延伸和Δ15去饱和过程，并讨论了多组学数据、转录调控和表观遗传调控。 | 整合多组学数据，分析了KCS基因家族的系统发育和共线性分布，并讨论了转录调控网络及表观遗传调控在神经酸积累中的作用，提出了代谢工程和合成生物学应用的展望。 | 未提供具体的实验验证数据，主要基于已有研究进行综述和推测。 | 系统总结神经酸在马拉尼奥油藤中的生物合成途径和调控机制，为可持续神经酸生产的代谢工程和合成生物学提供理论基础。 | 马拉尼奥油藤（Malania oleifera）中的神经酸生物合成相关酶和调控因子。 | 植物分子生物学、代谢工程 | NA | 多组学数据分析 | NA | 基因组、转录组等组学数据 | NA | NA | NA | NA | 生物技术、农业 |
| 11 | 2026-08-14 |
Next-Generation Bionic Sensors for Small Molecule Detection: Integrating Synthetic Biology, Nanomaterials, and Artificial Intelligence
2026-Jun-15, Micromachines
IF:3.0Q2
DOI:10.3390/mi17060725
PMID:42354756
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综述 | 本文综述了结合合成生物学、纳米材料和人工智能的下一代仿生传感器在小分子检测中的最新进展，重点讨论了如何克服传统方法的局限性并实现复杂环境中的实时检测。 | 首次系统性地整合合成生物学、纳米材料和人工智能三个领域，提出了一种问题导向的视角来设计下一代仿生传感器，涵盖了从生物识别元件到信号处理的全流程创新。 | 讨论中提及了AI驱动系统在可扩展性、成本、数据可靠性和伦理方面面临的挑战，但未提供具体的解决方案或实验验证。 | 旨在提供一个全面的概述，展示下一代仿生传感器如何通过跨学科整合解决小分子检测中的关键难题，推动实际应用。 | 小分子检测中的生物识别元件（如酶、抗体、适配体、分子印迹聚合物）以及纳米材料（如石墨烯、碳纳米管、量子点、MXenes）和AI技术。 | 机器学习 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 环境, 食品 |
| 12 | 2026-08-14 |
Global Probiotic Markets Meet Synthetic Biology: Translational Challenges and Escherichia coli Nissle 1917 as a Model Chassis
2026-Jun-11, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms14061306
PMID:42354930
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综述 | 本文综述了全球益生菌市场扩张与合成生物学在活体生物治疗产品开发中的应用，重点讨论了以大肠杆菌Nissle 1917为模型底盘的工程化策略、治疗机遇及转化障碍 | 将益生菌市场扩张与活体生物治疗产品开发联系起来，并以大肠杆菌Nissle 1917作为模型底盘，探讨其外膜囊泡在治疗递送中的潜力 | 未提及具体实验数据或临床验证结果，可能缺乏实证支持 | 探讨合成生物学如何将益生菌转化为可编程微生物平台，以弥合市场扩张与临床转化之间的差距 | 全球益生菌市场、活体生物治疗产品、大肠杆菌Nissle 1917 | 合成生物学 | 肠道相关疾病 | NA | NA | 综述文献 | NA | NA | 大肠杆菌Nissle 1917 | 可编程微生物平台，用于感知疾病相关信号并产生治疗输出 | 医学 |
| 13 | 2026-08-14 |
Design and Implementation of a Blue-Light-Controlled Gene-Switch System
2026-Jun-10, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules31122032
PMID:42357431
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研究论文 | 开发并优化了一种蓝光诱导的T7RNAP双输入调控基因开关系统，实现了精确的时空基因控制，并集成了苯甲酸响应模块以实现化学关闭功能 | 结合蓝光精确诱导与苯甲酸化学关闭的双输入调控，实现了非侵入性、按需激活及生态应用中的可控关闭 | 未提及 | 构建可预测、可编程的基因开关系统，用于生物制造、治疗和微生物工程中的精确基因控制 | 蓝光诱导的T7RNAP系统及其变体，包括RBS序列、串联T7启动子和split-T7RNAP变体 | 合成生物学 | NA | 基因表达调控 | NA | 荧光输出和实时生长曲线数据 | 未明确样本数量，涉及多种RBS变体、启动子构建和模块测试 | NA | 未明确 | 蓝光诱导的双输入基因开关，包含苯甲酸响应模块 | 医学、环境、工业生物技术 |
| 14 | 2026-08-14 |
From Genome to Pharmacome: Current Status and Future Perspectives of Multi-Omics Integration in Traditional Chinese Medicine Research
2026-May-30, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes17060634
PMID:42353793
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综述 | 本文综述了多组学整合在中药研究中的应用现状与未来方向，涵盖基因组学、表观基因组学、生物合成途径解析、合成生物学和系统药理学等四个相关领域，并提出了实验验证框架以弥合统计关联与因果验证之间的差距 | 提出了一种分层实验验证框架和迭代的计算-实验反馈回路，以因果性验证从多组学数据推断出的生物合成和药理途径，弥补当前多组学分析仅停留在统计关联层面的不足 | 未对提出的验证框架和优先级进行实证测试或案例验证，且主要基于文献综述，缺少具体实验结果支持 | 推动中药研究从描述性向数据驱动的机制性分析转变，实现精准医学目标，同时保留传统方剂的多组分特征 | 中药药用材料、生物合成途径、系统药理学机制 | 机器学习和系统生物学、多组学整合 | 不适用 | 高通量测序、转录组学、蛋白质组学、代谢组学、表观基因组学 | 不适用 | 基因组、转录组、蛋白质组、代谢组数据 | 不适用 | 不适用 | 微型生物（用于异源生产） | 合成生物学生产平台 | 医学、工业生物技术 |
| 15 | 2026-08-14 |
RpaA Overexpression Enhances Bioluminescence Intensity and Elevates Rhythmic Extracellular Vesicle Yield in Synechococcus elongatus PCC 7942
2026-May-25, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life16060885
PMID:42355412
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研究论文 | 本研究探讨了蓝细菌昼夜节律输出调控因子RpaA对PCC 7942细胞外囊泡产量的调控作用，发现RpaA过表达可增强生物发光强度并提高细胞外囊泡的产量 | 首次揭示昼夜节律输出信号与细胞外囊泡生物发生之间的关联，并提出RpaA过表达作为提高细胞外囊泡产量的有效策略 | 摘要未提及研究的局限性 | 研究RpaA在调节蓝细菌PCC 7942细胞外囊泡生产中的作用，并探索提高细胞外囊泡产量的策略 | 蓝细菌PCC 7942及其RpaA基因 | 合成生物学 | NA | 转录分析 | NA | 基因表达数据 | NA | 基因敲除和过表达 | Synechococcus elongatus PCC 7942 | 昼夜节律输出调控回路 | 工业生物技术、医学（纳米载体技术） |
| 16 | 2026-08-14 |
From Discovery to Manufacturing: A Quantitative Review of Phosphonates and Strategies for High-Titer Production
2026-May-22, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms14061170
PMID:42354795
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综述 | 本文对膦酸酯天然产物进行了定量综述，涵盖其发现趋势、生物活性、产生菌分类及高产策略，并提出加速发现和改善生产可及性的建议 | 首次对1959年至今的71篇膦酸酯天然产物报告进行系统性定量分析，整合发现趋势与生物功能及规模化生产之间的联系，并总结结构-活性关系和工程策略 | 综述依赖已发表的报告，可能遗漏未发表或非细菌来源的数据，且定量分析受限于原始报告的质量和完整性 | 系统梳理膦酸酯天然产物的发现、生物活性和生产策略，为加速新膦酸酯发现和提高产量提供方向 | 膦酸酯天然产物及其产生菌（主要为细菌） | 天然产物研究 | NA | 代谢工程、合成生物学、生物催化级联 | NA | 文献数据 | 71篇报告（1959年至今） | NA | 细菌 | 代谢途径工程 | 医学、农业 |
| 17 | 2026-08-14 |
Therapeutic Applications of Natural Products in Biomedicine and Pharmacotherapy
2026-May-22, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life16060873
PMID:42355401
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综述 | 本文对天然产物在药物化学、生物医学和药物治疗中的治疗应用进行了批判性和整合性分析，重点探讨其结构、功能和转化之间的联系 | 提出一个连接结构、功能和转化的系统，结合化学、药理学和转化方法，以应对天然产物开发中的挑战 | 未提供具体实验数据，仅基于文献综述，可能缺乏实证验证 | 分析天然产物在药物发现和精准医学中的潜力，并批判性评估当前策略和挑战 | 代表性天然产物如紫杉醇、青蒿素和姜黄素 | 药物化学 | NA | 基因组挖掘、合成生物学、网络药理学 | NA | 文献数据 | NA | 基因组挖掘 | NA | NA | 医学 |
| 18 | 2026-08-14 |
Recent strategies in synthetic food production for sustainable food security: applications and challenges
2026, Frontiers in nutrition
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fnut.2026.1829214
PMID:42358301
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综述 | 本文综述了合成食品生产的最新策略，包括细胞、组织和干细胞培养技术、转基因生物、微生物发酵、植物蛋白工程及人工智能等，并探讨其在可持续食品安全中的应用与挑战 | 系统性地整合了多种前沿技术（如合成生物学、人工智能）在合成食品生产中的应用，并全面分析了其经济、监管和公众接受度方面的挑战 | 合成食品生产面临高生产成本、缺乏技术优化、监管复杂性及安全性等问题，且商业化需要先进技术降低成本和立法支持 | 探讨合成食品生产的创新技术及其在满足全球食品安全需求方面的潜力和挑战 | 合成食品，包括培养肉、人工甜味剂、微生物蛋白、新型脂肪、强化及合成乳制品和功能食品成分 | 生物技术 | NA | 细胞培养、组织培养、干细胞培养、转基因技术、微生物发酵、合成生物学、人工智能 | NA | 文本 | NA | 转基因、合成生物学 | 微生物、植物细胞 | 代谢途径工程 | 食品工业、医药、农业、营养保健品 |
| 19 | 2026-08-13 |
ROS-responsive bio-hybrid probiotics for synergistic acute lung injury therapy
2026-Nov, Colloids and surfaces. B, Biointerfaces
DOI:10.1016/j.colsurfb.2026.115903
PMID:42314510
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研究论文 | 本文报道了一种双功能工程化副干酪乳杆菌，通过合成生物学分泌白介素-4并结合材料表面修饰以清除活性氧，用于急性肺损伤的协同治疗。 | 将合成生物学与响应性材料工程相结合，构建了兼具细胞因子免疫调节和微环境响应抗氧化功能的双功能工程益生菌，实现了在炎症肺组织中的靶向递送和疗效累积。 | 摘要未提及具体局限性。 | 开发一种工程化益生菌平台，通过免疫调节和抗氧化应激协同作用，实现对急性肺损伤的有效治疗。 | 工程化副干酪乳杆菌、LPS和铜绿假单胞菌诱导的急性肺损伤小鼠模型。 | 合成生物学 | 急性肺损伤 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 副干酪乳杆菌 | 分泌白介素-4的基因回路，耦合材料表面修饰的活性氧清除功能。 | 医学 |
| 20 | 2026-08-13 |
Chemical Synthesis of Mirror-Image Proteins Reveals Chirality-Dependent Cellular Uptake Mediated by a Cell-Penetrating Peptide
2026-Aug-12, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.6c03792
PMID:42307060
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研究论文 | 本文通过化学合成镜像蛋白质，研究细胞穿透肽介导的细胞摄取过程中手性依赖性，发现L型货物比D型更有效被内化 | 首次在保持递送载体恒定的条件下系统研究货物手性对细胞摄取效率的影响 | 未探讨不同细胞类型或体内环境对手性摄取的影响，且主要基于体外细胞实验 | 探究镜像蛋白质在细胞摄取过程中的手性效应，为设计治疗性或合成生物学应用提供基础 | L型和D型构型的模型货物（不同大小和结构复杂性）及环状十精氨酸（cR10）细胞穿透肽 | 合成生物学 | NA | 化学合成 | NA | 细胞图像、流式细胞术数据 | 多种哺乳动物细胞系 | NA | 哺乳动物细胞 | NA | 医学、合成生物学 |