合成生物学相关文章
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当前共找到 4909 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-05-07 |
Proanthocyanidins: structure, biosynthesis, regulation, and structure-activity relationships
2026-Sep, aBIOTECH
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.abiote.2026.100047
PMID:42088953
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综述 | 综述了原花青素的结构多样性、生物合成途径、调控网络及应用前景 | 系统阐述了原花青素聚合的非酶促机制、MYB-bHLH-WD40核心转录复合物的调控作用，并指出了结构-活性关系的关键知识空白 | 未阐明聚合反应的细胞定位、聚合机制及精确的结构-活性关系 | 总结原花青素研究最新进展，明确未来研究方向 | 原花青素 | NA | NA | 基因编辑， 合成生物学， 纯化技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 植物 | NA | 医疗， 食品， 动物营养 |
| 2 | 2026-05-07 |
Metabolic Engineering of Aureobasidium melanogenum for Efficient Production of Gluconic Acid
2026-May-06, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c13595
PMID:42017485
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research paper | 通过代谢工程改造出芽短梗霉菌高效生产葡萄糖酸 | 首次通过敲除普鲁兰、聚苹果酸、liamocin和黑色素关键基因并结合过表达内源葡萄糖氧化酶基因，构建出目前报道产量最高的葡萄糖酸生产菌株 | 未提及该工程菌株在工业规模化生产中的长期稳定性和经济性评估 | 高效生产葡萄糖酸 | 出芽短梗霉菌株TSYW-58 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | 一个出发菌株和多个工程菌株 | CRISPR-Cas9等基因编辑工具（未明确说明具体工具） | Aureobasidium melanogenum（出芽短梗霉） | 葡萄糖氧化酶过表达及副产物合成通路敲除 | 工业生物技术 |
| 3 | 2026-05-07 |
Optimizing Bispecific Antibody Expression via Multi-Omics Analysis and Vector Redesign
2026-May-06, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.70228
PMID:42089360
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研究论文 | 通过多组学分析和载体重设计优化双特异性抗体的表达 | 提出了整合序列级生物信息学和合成生物学诊断的方法，直接提高了复杂生物制品的可制造性，为解决隐蔽表达缺陷提供通用框架 | NA | 解决双特异性抗体在中国仓鼠卵巢细胞中表达效率低的问题 | 三种IgG-scFv格式的双特异性抗体 | 机器学习 | NA | RNA测序、剪接预测、密码子优化评估、基序筛选 | NA | 文本、序列数据 | 三种双特异性抗体候选物 | NA | 中国仓鼠卵巢细胞 | NA | 医学 |
| 4 | 2026-05-07 |
Profiling Selectivity for the Shigella Virulence Factor OspF
2026-May-05, Biochemistry
IF:2.9Q3
DOI:10.1021/acs.biochem.6c00109
PMID:42018782
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研究论文 | 探索志贺菌毒力因子OspF的底物选择性，揭示其修饰多种细胞靶点 | 首次联合使用合成磷酸肽分析和自下而上化学蛋白质组学谱分析，发现OspF在MAPK家族内具有选择性，并识别出MAPK家族外的新靶点如Rab1A和酪蛋白激酶2β | 需要进一步研究以揭示OspF在志贺菌致病中的完整作用 | 表征OspF的底物谱并阐明其选择性 | 志贺菌毒力因子OspF及其底物 | 数字病理学 | 感染性疾病 | NA | NA | NA | NA | NA | 志贺氏菌 | NA | 医学 |
| 5 | 2026-05-07 |
Multiplexed Engineering of Salmonella Typhimurium for Targeted Cancer Therapies
2026-May-05, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00119
PMID:42085230
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综述 | 系统综述基于合成生物学的鼠伤寒沙门氏菌工程化改造方法，将其从病原体转化为安全高效的抗癌活体生物治疗产品 | 提出自适应优化与治疗增强的系统工程框架，涵盖减毒、靶向增强、定植优化、治疗剂生产、裂解控制释放及辅助模块等多维改造策略 | 未涉及临床试验数据，工程菌的遗传稳定性与临床转化瓶颈仍需进一步突破 | 总结鼠伤寒沙门氏菌工程化改造的关键方法，推动其从病原体向抗肿瘤载体的转化应用 | 鼠伤寒沙门氏菌及其工程化改造策略 | 合成生物学 | 癌症 | 合成生物学基因电路设计 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9,TALEN,Gibson组装,Golden Gate组装 | 鼠伤寒沙门氏菌 | 减毒电路、靶向增强电路、定植优化电路、治疗剂生产通路、裂解控制释放系统、辅助模块 | 医学 |
| 6 | 2026-05-07 |
Systematic Evaluation of Different Ribonucleoprotein Complexes as Posttranscriptional Biosensors in Cell-Free TX-TL Systems
2026-May-05, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00170
PMID:42086502
|
研究论文 | 系统评估不同核糖核蛋白复合体在无细胞转录翻译系统中作为转录后生物传感器的性能 | 首次系统比较三种核糖核蛋白复合体（RISC、MS2-CNOT7、L7Ae）在不同无细胞平台中的传感能力，并成功实现蛋白酶响应的L7Ae条件性抑制，拓宽了无细胞生物传感器的应用范围 | 体外转录RNA传感器存在报告基因基础表达水平量化困难的问题，MS2-CNOT7系统受裂解液依赖性限制而降低可编程性 | 评估核糖核蛋白复合体作为无细胞转录后生物传感器的可行性及鲁棒性 | 三种核糖核蛋白复合体（RISC、MS2-CNOT7、L7Ae）及其在无细胞系统中的应用 | 合成生物学 | NA | 无细胞转录翻译系统（TX-TL）、体外转录（IVT） | NA | 实验数据 | NA | NA | 真核细胞、原核细胞、重组系统 | 转录后生物传感器（RISC、MS2-CNOT7、L7Ae核糖核蛋白电路）、蛋白酶响应的条件性抑制电路 | 医学、环境 |
| 7 | 2026-05-07 |
Genetic code expansion: Bridging synthetic biology precision and cellular complexity to decipher molecular mechanisms of diseases
2026-May-04, Current opinion in chemical biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.cbpa.2026.102690
PMID:42085977
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综述 | 本文概述了遗传密码扩展技术在生理相关背景下研究疾病生物学的进展、挑战和新兴方法 | 将GCE定位为转化合成生物学平台，用于机制性解析疾病过程，强调其在越来越接近生理环境中的应用 | 该技术广泛实施的主要挑战仍待解决，但具体局限性文中未详细说明 | 利用遗传密码扩展技术解析疾病的分子机制 | 动态蛋白质相互作用、翻译后修饰和信号事件 | 合成生物学 | NA | 遗传密码扩展 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 8 | 2026-05-07 |
HySimODE: a hybrid stochastic-deterministic simulation framework for multiscale models of biological systems
2026-May-03, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag185
PMID:41999207
|
研究论文 | 介绍HySimODE，一个用于生物系统多尺度模型的混合随机-确定性模拟框架 | 通过机器学习分类器自动分配物种至随机或确定性区间，消除手动指定和模型重构需求，实现数据驱动的混合模拟 | 可能依赖于训练数据集的多样性，对超出训练分布的新模型泛化能力有限 | 开发自动化混合模拟框架，处理包含低拷贝随机和丰度确定性的生物化学模型 | 生物化学ODE模型，包括合成生物学的宿主-电路相互作用模型和神经生物学的长期突触增强模型 | 机器学习 | NA | 混合模拟、ODE求解器、机器学习分类器 | 机器学习分类器、随机模拟、确定性ODE集成器 | 生物化学ODE模型数据 | 多个动态区域的生物化学ODE模型数据集 | NA | NA | NA | 合成生物学、神经生物学 |
| 9 | 2026-05-07 |
Recombinant human serum albumin-A paradigm shift: From laboratory development to industrial-scale production, and clinical translation
2026-May-03, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108914
PMID:42086096
|
综述 | 综述了重组人血清白蛋白从实验室开发到工业规模生产和临床转化的范式转变 | 强调范例转变不仅仅来自产量考量，而是来自可扩展性、成本效益、法规可行性与下一代纯化策略兼容性的最优整合，并指出其工程化潜力可作为创新药物递送和先进疗法中的通用平台 | 实现全部潜力取决于克服生产规模化的经济挑战、确保产品一致性，以及利用合成生物学和智能制造来开创新一代多功能生物治疗药物 | 阐述重组人血清白蛋白的工业化路径和临床验证，并展望其未来应用方向 | 重组人血清白蛋白 | 合成生物学 | NA | 重组蛋白生产、下一代纯化策略 | NA | 文献资料 | NA | NA | Komagataella phaffii, 转基因水稻 | NA | 医学 |
| 10 | 2026-05-07 |
Specialized proresolving mediator-loaded extracellular vesicles mitigate pulmonary inflammation
2026-May-01, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2025-0398OC
PMID:41124277
|
研究论文 | 利用合成生物学策略载入特异性促消退介质的外泌体减轻肺部炎症 | 首次通过合成生物学方法，利用多基因表达载体共表达消退素生物合成酶，将生物活性脂质介质（消退素）选择性装载到细胞外囊泡中，并验证其在减轻肺部炎症中的治疗潜力 | 研究仅在小鼠模型中进行验证，未涉及人类临床试验；对细胞外囊泡装载消肿素的具体机制及体内长期安全性尚无深入探讨 | 开发一种可扩展的载有消退素的细胞外囊泡平台，用于治疗急性肺损伤及其他慢性炎症性疾病 | 人胚肾293T细胞、THP-1巨噬细胞、内皮细胞、脂多糖处理小鼠 | 数字病理学 | 急性肺损伤, 慢性炎症性疾病 | 合成生物学, 细胞外囊泡装载, 多基因表达载体 | NA | 实验数据, 图像（内皮细胞粘附与通透性评估） | 体外细胞实验（多组重复）；体内小鼠实验（脂多糖处理组与对照组，样本量未具体说明） | 多基因表达载体 | 人胚肾293T细胞 | 消退素生物合成酶（环加氧酶2, 5-脂氧合酶, 15-脂氧合酶）共表达通路 | 医学 |
| 11 | 2026-05-07 |
Multi-Targeting Non-Specific Genome Engineering in Bacteria
2026-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202521532
PMID:41801001
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研究论文 | 开发了一种基于多靶向整合酶系统的通用基因组工程方法MNGE，用于在多种细菌中高效整合代谢基因或途径 | 提出MNGE方法，基于多靶向整合酶系统实现多拷贝、高度随机（仅需核心TT二核苷酸）的基因整合，适用于革兰氏阳性和阴性菌，并显著提高异源宿主中化合物产量 | NA | 开发一种宿主独立的通用基因组工程方法，以高效整合和表达代谢基因或途径 | 多种细菌，包括革兰氏阳性菌（链霉菌、糖多孢菌）和革兰氏阴性菌（伯克霍尔德菌、紫色杆菌） | NA | NA | MNGE, 多靶向整合酶系统 | NA | NA | NA | NA | 链霉菌 (Streptomyces albus), 伯克霍尔德菌 (Burkholderia gladioli) | 代谢途径整合 | 代谢工程，合成生物学，工业生物技术 |
| 12 | 2026-05-07 |
Followers' Choice: The Trends Transforming Precision Medicine, Synthetic Biology, and Sustainable Microbiology
2026-May, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.70370
PMID:42087404
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 13 | 2026-05-07 |
STRAIGHT-IN Dual: a platform for dual single-copy integrations of DNA payloads and gene circuits into human induced pluripotent stem cells
2026-Apr-30, Nature biomedical engineering
IF:26.8Q1
DOI:10.1038/s41551-026-01677-9
PMID:42062565
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研究论文 | STRAIGHT-IN Dual平台能够在人诱导多能干细胞中高效同时进行两个DNA构建体的等位基因特异性单拷贝整合 | 开发了STRAIGHT-IN Dual平台，实现一周内同时进行两个DNA构建体的等位基因特异性单拷贝整合，并支持近无疤痕载荷整合和组件循环利用 | NA | 开发高效的双基因整合平台，加速干细胞中合成生物学的设计-构建-测试循环 | 人诱导多能干细胞(hiPSCs)及其分化产生的神经元、运动神经元和内皮细胞 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 人诱导多能干细胞, 神经元, 运动神经元, 内皮细胞 | 四环素诱导型控制与格拉佐普瑞韦诱导型合成基因开关 | 医学, 生物技术 |
| 14 | 2026-05-07 |
Unveiling the adaptive structure-function synergy in thermophilic translation initiation factor 1: A molecular dynamics framework
2026-Apr-30, Biophysical chemistry
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.bpc.2026.107644
PMID:42085878
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研究论文 | 通过分子动力学模拟揭示嗜热翻译起始因子1的结构-功能协同适应性机制 | 首次从原子层面揭示嗜热细菌中翻译起始因子1的热稳定性机制，包括扩展的氢键和盐桥网络以及进化优化导致的构象波动受限 | NA | 阐明嗜热翻译起始因子1的热适应分子机制，为工程化热稳定蛋白提供框架 | 嗜热细菌Thermoanaerobacterium thermosaccharolyticum的翻译起始因子1（TT_IF1）及其常温同源物Flavobacterium kingsejongi的翻译起始因子1（FK_IF1） | 结构生物学 | NA | 分子动力学模拟、主成分分析 | NA | 分子动力学轨迹 | 每种蛋白进行3次重复，每次1000纳秒分子动力学模拟 | NA | NA | NA | 合成生物学, 工业生物技术 |
| 15 | 2026-05-07 |
Engineering AraC L9K for inducer-independent pBAD activation in Salmonella Gallinarum
2026-Apr-28, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2026.04.019
PMID:42061758
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研究论文 | 通过基因组修改和定点突变，在鸡沙门氏菌中生成不依赖诱导剂的AraC变体，实现pBAD启动子的组成型激活 | 首次在鸡沙门氏菌中通过L9K替换获得组成型激活的AraC变体，绕过了阿拉伯糖依赖的阻遏-激活转换机制 | 未在体内或大规模培养条件下验证系统的稳定性和通用性 | 开发不依赖外源诱导剂的AraC-pBAD表达系统，用于微生物生物制造和合成生物学 | 鸡沙门氏菌（Salmonella Gallinarum） | 合成生物学 | NA | 定点突变，基因组编辑，绿色荧光蛋白表达分析，电泳分析，结构建模 | NA | 生长曲线，蛋白质表达水平，电泳数据 | NA | CRISPR-Cas9（用于基因组删除），定点突变 | 鸡沙门氏菌（Salmonella enterica serovar Gallinarum） | pBAD启动子驱动的组成型表达系统（通过L9K突变AraC实现） | 工业生物技术，合成生物学，治疗生物技术 |
| 16 | 2026-05-07 |
Systematic investigation of double emulsion dewetting dynamics for the robust production of giant unilamellar vesicles
2026-Apr-22, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d6lc00098c
PMID:42018534
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研究论文 | 系统研究双乳液去润湿动力学以实现巨型单层囊泡的稳健生产 | 揭示了脂质组成、水相条件、液滴约束和流体动力学如何协同促进或阻碍去润湿过程，确定成功形成GUV的关键是动态Marangoni应力与热力学界面力在受限条件下的临界平衡 | 研究仅探讨了特定条件下的参数影响，未涵盖所有可能的生理相关条件或长期稳定性 | 提高液滴微流控GUV平台的可靠性和可及性，以推动生物物理学、合成生物学和药物发现领域的进展 | 巨型单层囊泡（GUVs）的形成过程 | 生物物理学 | NA | 双乳液液滴微流控 | NA | 实验数据（流体动力学和界面力测量） | 未明确样本数量，涉及多种脂质组成和溶液条件的系统测试 | NA | NA | NA | 生物物理学、合成生物学、药物发现 |
| 17 | 2026-05-07 |
An in vitro approach for simulating divergent Golgi O-glycosylation of tumor-associated MUC1 from normal MUC1
2026-04-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-72151-y
PMID:42020444
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研究论文 | 通过体外合成生物学方法模拟肿瘤相关MUC1与正常MUC1的差异性高尔基体O-糖基化 | 首次采用体外一锅合成生物学方法模拟癌症相关的糖基化通路差异，结合动力学和计算机反应动态模拟解析酶定位和底物特异性 | NA | 解析肿瘤相关MUC1异常糖基化的分子机制 | MUC1黏蛋白及其糖基化过程 | 合成生物学 | 肿瘤 | 体外一锅合成生物学方法，动力学模拟，计算机反应动态模拟 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 18 | 2026-05-07 |
Synthetic multicolor antigen-stabilizable nanobody platform for intersectional labeling and functional imaging
2026-Apr-22, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-026-03056-3
PMID:42020773
|
研究论文 | 提出了一种合成多色抗原稳定纳米抗体平台，用于交叉标记和功能成像 | 通过将超过20种荧光蛋白和生物传感器工程化到8种纳米抗体中，建立了通用的抗原稳定荧光纳米抗体设计，仅在与目标抗原结合时才发出明亮荧光，实现了无背景的细胞内蛋白可视化 | 未明确说明局限性 | 开发一种合成生物学驱动的多色抗原稳定纳米抗体平台，用于精确研究蛋白动态、细胞过程和复杂生物系统 | 荧光蛋白、生物传感器、纳米抗体、小鼠脑组织、斑马鱼胚胎 | 合成生物学 | NA | 荧光成像 | NA | 图像 | 超过20种荧光蛋白和生物传感器、8种纳米抗体、斑马鱼胚胎和小鼠脑组织 | 蛋白工程 | 小鼠、斑马鱼 | 抗原稳定荧光纳米抗体系统，包含组成型、光激活和光开关荧光蛋白以及基于荧光蛋白的强度型生物传感器 | 医学、生物学 |
| 19 | 2026-05-07 |
Context-aware synthetic promoter design using neural networks enables rewiring of eukaryotic transcriptional networks
2026-Mar-17, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-026-00684-5
PMID:41844670
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研究论文 | 提出了一个基于人工神经网络的框架，用于酿酒酵母中情境感知的合成启动子设计，实现转录网络的重新编程 | 首次提出了一个能够预测最优转录因子结合位点插入位置和启动子重写程度的神经网络框架，无需先验实验表征即可实现高达98.4%的抑制率 | 模型针对酿酒酵母设计，可能需要针对其他生物进行调整；实验验证仅涉及TetR和Mig1转录因子，未见对其他转录因子的泛化性验证 | 开发一种可扩展的、预测性的方法用于工程化调控序列并重新编程转录逻辑 | 酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae）的合成启动子与转录因子结合位点 | 合成生物学 | NA | 神经网络；启动子工程；转录因子结合位点重组 | 人工神经网络（ANN） | 序列数据 | 6,011个天然酵母启动子 | NA | 酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae） | 启动子-转录因子结合位点重组设计 | 合成生物学 |
| 20 | 2026-05-07 |
Improving governance in the age of synthetic biology, artificial intelligence, and diverging threats
2026, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2026.1705143
PMID:42088837
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研究论文 | 探讨合成生物学和人工智能时代如何改进治理以应对生物安全威胁 | 提出了一个包含四个相互关联组件的混合治理框架，并结合专家共识制定政策建议 | 依赖于少数专家的意见，可能无法涵盖所有视角 | 在合成生物学和人工智能时代改进治理，降低生物武器开发与扩散风险 | 生物威胁优先事项及治理框架 | NA | NA | Delphi过程 | NA | 定性数据 | 13位来自不同相关领域的专家 | 合成生物学 | NA | NA | 生物安全, 治理 |