合成生物学相关文章
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当前共找到 4887 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-05-04 |
Efficient cell factory design by combining meta-heuristic algorithm with enzyme-constrained metabolic models
2026-Aug, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.134706
PMID:42034297
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研究论文 | 提出MetaStrain框架，将酶约束代谢模型与元启发式算法结合，用于高效设计微生物细胞工厂 | 首次将元启发式算法与酶约束模型整合，通过降维预筛选和数值编码策略高效探索组合基因编辑空间，实现非直觉组合靶点的快速识别 | 未提供实验验证中脱靶效应的分析，且对大型代谢网络的计算复杂度评估不充分 | 开发一种计算框架以优化微生物细胞工厂中多基因靶点设计，提高目标产物产量 | 酿酒酵母和大肠杆菌的代谢网络模型 | NA | NA | 酶约束代谢模型 | 元启发式算法 | NA | 通过计算模拟涉及酿酒酵母的2-苯乙醇和亚精胺生物合成，实验验证使用大肠杆菌的五靶点组合菌株 | CRISPR-Cas9, 代谢工程 | 酿酒酵母, 大肠杆菌 | 组合基因编辑策略，包括敲除、过表达和酶修饰 | 工业生物技术 |
| 2 | 2026-05-04 |
The tryptophan prenyltransferase ComQ from Bacillus subtilis 168 can prenylate daptomycin at Trp1
2026-May-02, The FEBS journal
DOI:10.1111/febs.70578
PMID:42068243
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研究论文 | 本研究首次证明来自枯草芽孢杆菌168的色氨酸异戊二烯转移酶ComQ能够异戊二烯化环状抗菌肽达托霉素，显示出其作为合成生物学工具的潜力 | 首次发现ComQ不仅修饰线性肽，还能异戊二烯化环状肽，扩大了底物范围，为生物活性化合物的生物合成工程提供了新工具 | 未提及体内应用或工程化ComQ变体的具体效果 | 探究ComQ作为合成生物学工具异戊二烯化环状抗菌肽的可行性 | 枯草芽孢杆菌168的异戊二烯转移酶ComQ及其底物ComX和信息素和达托霉素 | 合成生物学 | NA | 克隆、蛋白纯化、AlphaFold建模 | AlphaFold | 蛋白质结构 | NA | NA | 大肠杆菌 | NA | 医学、工业生物技术 |
| 3 | 2026-05-04 |
Parabiotics as Next-Generation Microbiome Therapeutics: Insights into Mechanisms, Evidence, and Therapeutic Potential
2026-May-02, Current microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00284-026-04942-x
PMID:42069941
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综述 | 综述了后生元作为下一代微生物组疗法的机制、证据和治疗潜力 | 首次系统总结后生元（非活性微生物或其组分）在安全性、稳定性和功能食品应用中的优势，并整合组学技术（如宏基因组学、CRISPR-Cas）对其研发的加速作用 | 标准化和监管协调仍面临挑战 | 探讨后生元在微生物组靶向干预中的应用及其转化潜力 | 后生元（非活性微生物细胞或其组分） | NA | 儿科腹泻、肌肉衰减、肠易激综合征、特应性皮炎、呼吸道感染、代谢性疾病 | 宏基因组学、下一代测序、蛋白质组学、代谢组学、CRISPR-Cas系统、合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas系统 | NA | NA | 医学、食品 |
| 4 | 2026-05-04 |
The convergence of AI-driven engineering biology and emerging technologies advancing globally networked autonomous biofoundries
2026-May-01, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103503
PMID:42068969
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综述 | 综述了人工智能驱动的工程生物学与新兴技术的融合，推动全球网络化自主生物铸造厂的发展 | 提出AI驱动自主生物铸造厂概念，整合计算设计、自动化制造与数据驱动学习于自适应框架，并强调数字孪生和全细胞建模等技术的融合 | 未具体说明当前技术融合的实证验证或实际部署面临的挑战细节 | 探讨人工智能与合成生物学融合以构建全自主生物铸造厂的技术趋势 | AI驱动的合成生物学技术、自动化生物铸造厂、全细胞建模与数字孪生系统 | 人工智能, 合成生物学 | NA | 全细胞建模, 数字孪生, 自动化实验 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5 | 2026-05-04 |
RNA sensors and actuators for dynamic cellular regulation
2026-Apr-30, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2026.04.005
PMID:42067429
|
综述 | 本文综述了用于动态细胞调控的RNA传感器和致动器的工程化进展 | 从RNA结构动力学角度强调其与蛋白质系统相比的优势，并整合了合成生物学、RNA治疗学的最新进展 | 未提及具体实验验证或量化比较与蛋白质系统的性能差异 | 推动RNA在合成细胞控制方案中的应用，提升微生物生物合成和靶向基因治疗 | RNA传感器和致动器 | 合成生物学 | NA | RNA工程 | NA | NA | NA | NA | NA | RNA传感器与致动器 | 医学, 工业生物技术 |
| 6 | 2026-05-04 |
Filamentous fungal synthetic biology: Current applications and ongoing developments
2026-Apr-30, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108912
PMID:42069191
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综述 | 该文章综述了丝状真菌合成生物学的当前应用和发展趋势，涵盖食品、医药、材料科学和生物修复等领域 | 系统性地将丝状真菌的现有应用与合成生物学技术相结合，推动语言标准化和创新，并探讨新兴技术如3D打印和无细胞系统的影响 | 指出了所研究领域内的特定挑战和研究空白，但未提供具体实验验证 | 促进对丝状真菌工程和合成生物学的理解，并标准化相关术语以推动创新 | 丝状真菌及其在合成生物学中的应用 | 合成生物学 | NA | 基因测序、计算技术、3D打印、无细胞系统 | NA | 文献数据 | NA | NA | 丝状真菌 | NA | 食品, 医药, 材料科学, 生物修复 |
| 7 | 2026-05-04 |
Synthetic Biology Approaches to Enzymology in Food and Agriculture Systems
2026-Apr-29, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c16525
PMID:41962132
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综述 | 探讨合成生物学方法在食品与农业系统中酶学应用的研究进展 | 系统综述了合成生物学在酶工程领域的最新进展，重点讨论了如何将其他行业的技术改造应用于食品与农业系统 | 当前存在的局限性及监管问题，需要进一步探索合成生物学在全球食品系统中的整合方向 | 探索合成生物学在食品与农业系统中通过酶介导解决方案应对全球粮食不安全问题的应用 | 食品与农业系统中的酶及其工程化改造方法 | 合成生物学 | NA | 酶工程、生物催化、计算设计 | NA | NA | NA | NA | NA | 酶介导的代谢途径和生物催化通路 | 食品, 农业 |
| 8 | 2026-05-04 |
OptoChaperone─A Biohybrid Tool for Regulating Protein Condensates in Cells and In Vitro
2026-Apr-29, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.6c04074
PMID:42002974
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研究论文 | 报道了一种名为OptoChaperone的光控生物杂合系统，用于在体外和活细胞中调控蛋白质凝聚体 | 利用光响应开关控制分子伴侣活性，实现蛋白质凝聚体的可逆、精准、时空可控调节，无需化学添加剂或基因修饰 | 未提及在体内长期应用的稳定性或可能的免疫原性 | 开发一种可逆且高效的光控工具来操纵蛋白质凝聚体，以研究其在细胞生理和病理中的作用 | 蛋白质凝聚体，包括融合肉瘤蛋白、TAR DNA结合蛋白43和热休克因子1 | 合成生物学 | 神经退行性疾病（如肌萎缩侧索硬化、额颞叶痴呆） | 光控分子伴侣系统 | NA | NA | NA | NA | NA | 光控分子伴侣系统（OptoChaperone） | 医学、合成生物学、生物分子工程 |
| 9 | 2026-05-04 |
Electrochemical biosensor for ultrasensitive thrombin detection based on aptamer-modulated transcriptional inhibition of cell-free synthetic biology
2026-Apr-28, Talanta
IF:5.6Q1
DOI:10.1016/j.talanta.2026.129898
PMID:42068939
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研究论文 | 开发了一种基于适配体调控无细胞合成生物学转录抑制的电化学生物传感器，用于超灵敏凝血酶检测 | 将适配体门控的无细胞合成生物学与电化学分析相结合，利用适配体构象变化调控T7 RNA聚合酶转录，实现信号放大和超灵敏检测 | 未详细说明在复杂生物基质中的长期稳定性及实际临床样本的大规模验证 | 实现凝血酶的超灵敏特异性检测，并为无细胞电化学分析蛋白质靶标提供通用策略 | 凝血酶（作为模型靶标）及人血清样本 | 生物传感 | 心血管疾病 | 电化学分析 | NA | 电化学信号 | 20倍稀释人血清样本，具体数量未提及 | NA | NA | 适配体调控的转录抑制开关 | 医学, 临床诊断 |
| 10 | 2026-05-04 |
Regulatory mechanisms of secondary metabolite biosynthesis in medicinal plants under drought: advances and perspectives
2026-Apr-25, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2026.158246
PMID:42068881
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综述 | 总结干旱条件下药用植物中萜类、苯丙烷类和生物碱等次生代谢物生物合成的转录调控机制及其应用前景 | 首次从转录调控网络、微生物群落变化、表观遗传重塑等多维度系统阐述干旱对药用植物次生代谢的影响机制，并提出了筛选双功能基因和利用合成生物学策略的应用路径 | 基于现有文献的定性归纳，缺乏定量比较或元分析，且对具体信号通路和分子机制的实验验证不足 | 揭示干旱胁迫下药用植物次生代谢物合成的转录调控机制，为培育高含量活性成分的优质品种和智能灌溉管理提供理论依据 | 药用植物中的萜类、苯丙烷类和生物碱等次生代谢物 | 植物生物学 | NA | 文献检索与综合评述 | NA | 文本 | NA | 合成生物学 | 药用植物 | NA | 农业, 医药, 食品, 化妆品 |
| 11 | 2026-05-04 |
Profiling Selectivity for the Shigella Virulence Factor OspF
2026-Apr-22, Biochemistry
IF:2.9Q3
DOI:10.1021/acs.biochem.6c00109
PMID:42018782
|
研究论文 | 探究志贺氏菌毒力因子OspF的底物选择性，发现其修饰范围远超MAPK家族，包括Rab1A和酪蛋白激酶2β | 结合合成磷酸肽分析和化学蛋白质组学技术，首次揭示OspF在MAPK家族内具有选择性，并发现其广泛修饰多种细胞靶点 | 需进一步研究OspF在感染中的完整功能及病理学作用 | 阐明磷酸苏氨酸裂合酶OspF的底物谱及其在细菌感染中的分子机制 | 志贺氏菌毒力因子OspF及其修饰的宿主细胞靶点 | 合成生物学 | 细菌感染性疾病 | 合成磷酸肽分析，化学蛋白质组学，亲核膦化学探针 | NA | 肽段序列数据 | NA | NA | NA | NA | 医学，合成生物学 |
| 12 | 2026-05-04 |
Gibson Assembly of Highly Repetitive DNA
2026-Apr-22, Biochemistry
IF:2.9Q3
DOI:10.1021/acs.biochem.6c00002
PMID:42021475
|
研究论文 | 提出一种基于吉布森组装的高重复性DNA序列模块化组装策略，成功构建编码弹性蛋白样多肽的重组质粒文库 | 首次实现基于吉布森组装的高重复性DNA序列迭代扩增，通过dIII和HI酶切-组装循环使重复数呈指数增长，并验证了完整质粒序列 | 重复数上限受限于宿主菌表达效率，仅验证至513个重复单元的ELP表达和257个重复的功能表征 | 建立可扩展、序列确定的高重复DNA重复序列合成方法学框架 | 编码五肽GVGVP的重复DNA序列及弹性蛋白样多肽 | 合成生物学 | NA | 吉布森组装 | NA | DNA序列 | 构建了含1至513个GVGVP重复单元的质粒文库，验证至257个重复单元的功能表达 | 吉布森组装 | NEB 5-alpha细胞（大肠杆菌） | 重复序列扩增电路（基于吉布森组装的迭代扩增系统） | 工业生物技术, 材料科学 |
| 13 | 2026-05-04 |
Decoding nucleic acid contributions to phase separation and ordering in biomolecular condensates
2026-Mar-19, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag253
PMID:41909948
|
研究论文 | 研究核酸在生物分子凝聚体中调控相分离和有序化的作用 | 系统揭示了核酸长度和杂交程度对相变行为的影响，并提出生物凝聚体稳定性的评价指标，同时表征液晶有序形成的条件 | 仅关注模型系统（寡核苷酸与中度电荷无序肽的混合），未涉及天然复杂环境中的多组分相互作用 | 填补核酸在液-液相分离中作用的研究空白，指导合成含核酸凝聚体的设计 | 具有不同长度和杂交程度的寡核苷酸与中度电荷无序肽的混合体系 | 计算生物学 | NA | 分子动力学模拟 | NA | 实验数据与模拟轨迹 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 生物医学 |
| 14 | 2026-05-04 |
Programmable, target-induced fluorogenic CRISPR-tDeg platform for live-cell RNA visualization
2026-Mar-19, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag279
PMID:41909946
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研究论文 | 开发了一种名为CtDeg的模块化RNA成像平台，通过目标诱导荧光和degron介导的降解机制实现活细胞RNA的高特异性可视化 | 首次将Pepper RNA基序嵌入crRNA支架，利用degron介导的降解有效抑制背景信号，实现目标RNA识别驱动的荧光激活，显著提高信噪比 | 未提及具体的局限性 | 开发一种低背景、高特异性的活细胞RNA成像平台 | 活细胞中的RNA分子，包括paraspeckle装配动态和SARS-CoV-2基因组RNA | 合成生物学 | NA | CRISPR-dCas13, 荧光成像 | NA | 图像 | NA | CRISPR-Cas13, degron | 哺乳动物细胞 | 目标诱导荧光CRISPR-tDeg电路 | 合成生物学, RNA生物学 |
| 15 | 2026-05-04 |
Steps Toward Recapitulating Endothelium: A Perspective on the Next Generation of Hemocompatible Coatings
2024-10, Macromolecular bioscience
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/mabi.202400152
PMID:39072925
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综述 | 讨论如何通过合成生物学和涂层技术模拟内皮细胞功能，以改善血液接触医疗设备的血液相容性 | 提出将自下而上的合成生物学（特别是合成细胞）与被动和活性生物表面涂层相结合，协同模拟内皮细胞的三种关键功能，以克服血液相容性挑战 | 未具体说明当前技术的局限性，但隐含地指出了实现内皮功能模拟的复杂性及协同集成功能的必要性 | 开发新一代仿生内皮涂层，用于血液接触医疗设备以增强血液相容性 | 血液接触医疗设备及其表面的内皮模拟涂层 | 数字病理学 | 心血管疾病 | NA | NA | NA | NA | 自下而上的合成生物学（合成细胞） | 哺乳动物细胞 | 模拟内皮细胞的三重功能：保护血液成分、调节凝血和促进纤维蛋白溶解 | 医学 |
| 16 | 2026-05-03 |
The gut-tumor connection: the role of microbiota in cancer progression and treatment strategies
2026-May, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.08.038
PMID:40850681
|
综述 | 探讨肠道微生物群在癌症进展和治疗策略中的作用 | 系统总结了肠道微生物群、肿瘤相关微生物群与肿瘤微环境之间的复杂相互作用，并评估其作为癌症治疗靶点的潜力 | 缺乏标准化方案、先进的测序技术和改进的动物模型，限制了微生物群-癌症相互作用研究的发展 | 探索肠道微生物群与肿瘤微环境的关系及其对个性化癌症治疗的启示 | 肠道微生物群、肿瘤相关微生物群及肿瘤微环境 | 自然语言处理 | NA | 二代测序 | NA | 综述数据 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 17 | 2026-05-03 |
Advances and opportunities for computational interrogation of plant proteins
2026-May, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.70899
PMID:42055456
|
综述 | 综述了计算分析方法在植物蛋白质研究中的进展与机遇 | 强调了计算工具在加速植物蛋白质功能发现方面的潜力，并整合了新兴方法与传统实验手段的优势 | 植物内研究仍受限于遗传转化方法的可用性和效率 | 推动计算与实验结合，以克服植物蛋白质研究瓶颈，促进农业、生态和气候韧性进展 | 植物蛋白质 | 机器学习 | NA | 蛋白质结构预测、动力学模拟、相互作用分析 | NA | 蛋白质序列、结构数据 | NA | NA | 植物 | NA | 农业, 生态, 气候韧性 |
| 18 | 2026-05-03 |
Harnessing synthetic circuits to illuminate microbial electron transfer: a perspective on engineered metabolism
2026-Apr-30, Journal of microbiology & biology education
IF:1.6Q2
DOI:10.1128/jmbe.00290-25
PMID:41627025
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研究论文 | 该视角文章聚焦于一项利用合成基因电路促进微生物电子传递的研究，展示了通过工程化代谢生产氧化还原活性代谢物增强胞外电子传递和发电的能力 | 创新点在于通过合成生物电路控制氧化还原介质的产生，为理解微生物电子流和生物电子设计提供新视角，并作为教育案例整合多学科知识 | NA | 探讨合成电路在微生物电子传递中的应用，并强调其在教育中促进跨学科学习的潜力 | 微生物电子传递和工程化代谢 | 合成生物学 | NA | 合成基因电路 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | 合成基因电路用于生产并释放吩嗪-1-羧酸（一种氧化还原活性代谢物） | 生物技术, 教育 |
| 19 | 2026-05-03 |
Toward life with a 19-amino acid alphabet through generative artificial intelligence design
2026-Apr-30, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aeb5171
PMID:42060756
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研究论文 | 通过计算设计与合成生物学探索构建仅由19种氨基酸组成的生命体 | 首次证明异亮氨酸在生命活动中可被替代，并利用蛋白质语言模型和结构模型成功设计出功能性无异亮氨酸蛋白质，构建出可存活的19氨基酸细胞 | 当前仅针对大肠杆菌进行验证，且替代过程依赖大量的计算重设计，可能需进一步优化以适用于其他生物体 | 探索简化氨基酸字母表（19种氨基酸）构建生命体的可行性 | 大肠杆菌中的核糖体及其382个异亮氨酸残基 | 蛋白质工程，合成生物学 | NA | 蛋白质语言模型，基于结构的模型，计算设计，合成生物学 | 蛋白质语言模型，基于结构的模型 | 蛋白质序列与结构数据 | 核糖体中的382个异亮氨酸残基，21个重新设计的亚基 | NA | 大肠杆菌 | 无异亮氨酸核糖体设计 | 合成生物学，基础生物学研究 |
| 20 | 2026-05-03 |
From known knowns to unknown unknowns: synthetic biology paths to antimicrobial discovery
2026-Apr-30, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2026.102759
PMID:42066660
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评论性文章 | 提出一个合成生物学中心框架，将抗菌天然产物按化学新颖性和工程可及性分为四个象限，以指导抗菌发现策略 | 从已知已知到未知未知的二维映射框架重新定义了合成生物学视角下的天然产物分类，并揭示了不同象限间的动态转化关系 | NA | 提出基于合成生物学的抗菌天然产物发现路径框架，应对当前抗生素耐药挑战 | 抗菌天然产物 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |