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当前共找到 5850 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-10-16 |
Enhancing the Secretion Systems: Genetic Engineering of Super Bioagents for Effective Plant Disease Control
2026-Nov, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.70303
PMID:42437521
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综述 | 本文综述了通过CRISPR/Cas基因组编辑、蛋白酶工程和合成生物学改造微生物分泌系统，开发超级生物制剂用于植物病害防控的研究进展 | 提出通过合理定量的微生物分泌系统工程将传统生物防治剂转化为超级生物制剂的假设，并构建了连接分泌效率、调控和田间表现的系统级生物工程框架 | 生物防治剂大规模部署仍面临挑战，超级生物制剂的田间适应性和有效性有待进一步验证 | 探索微生物分泌系统的分子机制及超级生物制剂作为植物病害管理前沿的潜力 | 微生物分泌系统、传统生物防治剂、超级生物制剂、植物微生物组 | 合成生物学 | 植物病害 | CRISPR/Cas基因组编辑, 蛋白酶工程, 合成生物学 | NA | 文本 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 增强型分泌系统 | 农业 |
| 2 | 2026-10-16 |
CLEAN Database: providing enzyme function coverage for over 55 million sequences
2026-Oct-15, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag1003
PMID:42876371
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研究论文 | 该文章介绍了一个名为CLEAN Database的综合数据库，包含超过5500万条酶功能注释，覆盖1,098,305个菌株，由CLEAN AI模型预测，并提供网页界面和突变效应预测功能 | 利用AI模型CLEAN对超过5500万条序列进行酶功能注释，覆盖超过100万个菌株，并基于蛋白质语言模型提供突变效应预测的交互式可视化 | 酶功能注释基于AI预测而非实验验证，可能包含预测错误 | 提供全面的酶功能注释资源，促进酶发现及其在合成生物学、代谢工程等领域的应用 | 酶蛋白序列 | 机器学习 | NA | 蛋白质语言模型 | CLEAN AI模型 | 文本 | 55,000,000条酶功能注释，来自1,098,305个菌株 | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 3 | 2026-10-16 |
Craig Venter, a microbiologist
2026-Oct-14, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.01732-26
PMID:42757841
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评论 | 文章回顾了克雷格·文特尔在微生物学和疫苗学领域的革命性贡献 | 强调文特尔对微生物学和疫苗学的贡献，而不仅仅是基因组学和大数据 | NA | 阐明文特尔对微生物学和疫苗学的革命性贡献 | 克雷格·文特尔的科学工作 | 微生物学 | NA | 基因组测序、合成生物学 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 4 | 2026-10-16 |
The Potential of Self-Maintainable Living Materials
2026-Oct-14, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.78082
PMID:42873924
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综述 | 该文综述了工程活体材料（ELMs）作为一类自主且可自我维持的新材料，整合代谢活跃的生物组分以实现传感、自修复和自适应功能，并探讨其设计原理、挑战与转化路径 | 将自主性和自我维持能力定义为下一代活体材料的核心特征，并系统整合合成生物学中可编程基因线路、群体感应通讯和代谢工程等进展，提出闭环决策与环境反馈调控的材料设计框架 | 在进化稳定性、生物防护、长期存活性和可规模化制造方面仍存在关键挑战 | 探讨自我维持型自主活体材料的设计原理、当前挑战和转化路径，以实现在真实环境中的持续运行 | 工程活体材料（ELMs），包括整合了微生物、真菌、藻类和哺乳动物细胞的代谢活跃生物组分的结构支架材料 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、可编程基因线路、群体感应通讯、代谢工程 | NA | 文本 | NA | NA | 微生物、真菌、藻类、哺乳动物细胞 | 可编程基因线路、群体感应通讯、闭环决策回路 | 建筑、农业、环境修复、生物能源、生物医学 |
| 5 | 2026-10-16 |
Engineering the microbial architects: a genetic revolution in bio-electrochemical hydrogen production
2026-Oct-14, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.109076
PMID:42874939
|
综述 | 综述合成生物学、生物电催化与反应器工程的融合，用于可持续生物制氢 | 提出将合成生物学、生物电催化和反应器工程整合为一体化框架，并强调CRISPR-Cas9多重基因组编辑在优化产氢通路中的精准优势 | 未涉及具体实验验证，可扩展性、技术经济可行性等瓶颈尚未解决 | 探讨通过合成生物学和基因工程改造微生物以提高生物电化学系统制氢效率的策略与前景 | 产电微生物类群、生物电化学系统（BESs）、CRISPR-Cas9编辑的微生物 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9, 合成生物学, 生物电催化, 反应器工程 | NA | 文本 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 能源, 环境 |
| 6 | 2026-10-16 |
De novo design of cysteine proteases
2026-Oct-14, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-026-11143-w
PMID:42875488
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研究论文 | 该论文介绍了从头设计能水解多肽骨架的半胱氨酸蛋白酶，成功率为19%，速率提升高达3×10^3倍 | 首次从头设计能够以序列依赖性方式水解多肽骨架的蛋白酶，与天然蛋白酶折叠差异大（TM score < 0.50），且六个晶体结构与设计模型非常接近 | 剩余活性与最活跃的天然半胱氨酸蛋白酶之间的差距源于活性位点预组织和底物定位的不完善 | 从头设计能够水解多肽骨架的半胱氨酸蛋白酶，实现序列依赖性切割 | 设计的半胱氨酸蛋白酶及其底物多肽 | 蛋白质工程 | NA | 从头蛋白质设计、X射线晶体学、计算分析 | NA | 序列、结构 | 69个设计，13个成功 | NA | 哺乳动物细胞 | NA | 医学、合成生物学 |
| 7 | 2026-10-16 |
Modelling mouse embryogenesis from chemically induced totipotent stem cells
2026-Oct-14, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-026-11164-5
PMID:42875493
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研究论文 | 该研究建立了从化学诱导的全能样干细胞（ciTotiSCs）出发，在体外连续发育出小鼠胚胎模型（EMs）的条件，这些模型能够重现从植入前桑葚胚到原肠胚后阶段的关键发育过程 | 首次证明单一诱导的非生殖系细胞类型（ciTotiSCs）能够自主重现完整的早期小鼠胚胎发生过程，包括形成具有胚胎和胚外腔室的胚胎模型，并发育出功能性心脏组织 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未验证是否适用于其他哺乳动物；体外发育的胚胎模型与自然胚胎之间可能存在细微差异；长期培养的安全性和伦理问题有待进一步探讨 | 建立从化学诱导的全能样干细胞生成小鼠胚胎模型的条件，以研究哺乳动物胚胎发育并探索从非生殖系细胞创建多细胞生物的可能性 | 小鼠胚胎模型（EMs）和化学诱导的全能样干细胞（ciTotiSCs） | 发育生物学、合成生物学 | NA | 化学诱导重编程、体外胚胎培养 | NA | NA | NA | NA | 小鼠 | NA | 医学、基础研究 |
| 8 | 2026-10-16 |
Elucidating the molecular mechanism of tryptophan-derived indole metabolite biosynthesis in Lactiplantibacillus plantarum DPUL-S164
2026-Oct-14, Journal of the science of food and agriculture
IF:3.3Q2
DOI:10.1002/jsfa.71143
PMID:42875994
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研究论文 | 该研究通过基因组功能注释、生物信息学分析、高效液相色谱和实时荧光定量PCR，系统阐明了植物乳杆菌DPUL-S164代谢色氨酸产生吲哚-3-乳酸、吲哚-3-乙酸的分子调控机制 | 首次鉴定gene0696和gene0697作为植物乳杆菌DPUL-S164中参与色氨酸代谢生产吲哚-3-乳酸途径的功能代谢基因簇，并系统揭示了多基因模块协同调控色氨酸代谢的分子机制 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 系统阐明植物乳杆菌DPUL-S164代谢色氨酸产生吲哚-3-乳酸、吲哚-3-羧醛和吲哚-3-乙酸的分子调控机制 | 植物乳杆菌DPUL-S164及其色氨酸代谢产物吲哚-3-乳酸、吲哚-3-乙酸和吲哚-3-羧醛 | 微生物学, 代谢组学, 合成生物学 | NA | 全基因组功能注释, 生物信息学分析, 高效液相色谱, 实时荧光定量PCR | NA | 基因序列, 代谢物定量数据, 基因表达数据 | NA | NA | 植物乳杆菌DPUL-S164 | 色氨酸代谢途径（涉及芳香族氨基酸转氨酶、乳酸脱氢酶和醛脱氢酶的多基因模块协同调控） | 医学, 食品, 工业生物技术 |
| 9 | 2026-10-16 |
Engineering microbial platforms for diversified biosynthesis of antidepressant tryptophan-derived neuroactive compounds
2026-Oct-09, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.109071
PMID:42855022
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综述 | 本文综述了通过合成生物学、代谢工程和酶工程构建微生物细胞工厂，用于高效生物合成色氨酸衍生的抗抑郁神经活性化合物（如血清素、褪黑素、5-HTP、裸盖菇素等）的最新进展 | 聚焦于细菌血红素依赖型色氨酸羟化酶的新兴作用，以及AI辅助的酶和通路工程在扩展生物合成工具箱中的应用，并提出了将智能菌株设计与先进生物过程工程相结合的前瞻性思路 | 当前生产仍受限于低可持续性、选择性差和制造成本高；综述本身未提供原始实验数据，主要基于现有文献总结 | 总结和展望微生物平台合成色氨酸衍生抗抑郁神经活性化合物的研究进展，包括色氨酸过量生产、羟基化生物催化剂、下游生物合成途径和辅因子工程 | 色氨酸衍生的神经活性化合物，包括血清素、褪黑素、5-羟色氨酸（5-HTP）、裸盖菇素及相关吲哚衍生物 | 合成生物学，代谢工程 | 抑郁症，神经精神疾病 | 合成生物学，代谢工程，酶工程，AI辅助酶和通路工程 | NA | 文本 | NA | NA | 微生物（具体宿主未明确） | 色氨酸过量生产、羟基化生物催化、下游生物合成途径、辅因子工程等代谢通路 | 医学，工业生物技术 |
| 10 | 2026-10-16 |
Development of a high-throughput proteome sample preparation workflow based on efficient protein extraction to empower rational design of yeast cell factories
2026-Oct-04, Talanta
IF:5.6Q1
DOI:10.1016/j.talanta.2026.130738
PMID:42874363
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研究论文 | 本文报道了一种基于离子液体、盐酸胍和醋酸锂组合溶剂加热处理的高效蛋白质提取策略（IGL-H），结合磁性固相烷基化材料实现高通量酵母蛋白质组样品制备，并应用于研究不同氮源下产朊假丝酵母的蛋白质组动态。 | 提出IGL-H溶剂组合提取方法，可快速高效提取多种酵母在不同生长阶段的蛋白质；与经典玻璃珠研磨法相比，蛋白质产量更高、蛋白质组覆盖度相当或更优，且能回收更高比例的内膜运输系统整合膜蛋白；结合mSPA材料可在1.5小时内实现高通量样品制备，Pearson相关系数超过0.97。 | 摘要中未明确提及该研究的局限性。 | 开发高效、高通量的酵母蛋白质组样品制备工作流程，以支持酵母细胞工厂的理性设计。 | 多种酵母物种（包括产朊假丝酵母）在不同生长阶段及不同氮源条件下的蛋白质组。 | 合成生物学、蛋白质组学 | NA | 质谱蛋白质组学、磁性固相烷基化（mSPA） | NA | 质谱蛋白质组数据 | NA | NA | 酵母（包括产朊假丝酵母） | NA | 工业生物技术、医学 |
| 11 | 2026-10-16 |
Nanoparticles and the gut-microbiome: a dual strategy for oral brain delivery
2026-Sep-30, International journal of pharmaceutics
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.ijpharm.2026.127477
PMID:42815656
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综述 | 本文综述了口服脑部递送策略，提出将血脑屏障视为肠-微生物-脑轴动态系统的一部分，并重点探讨纳米颗粒和细菌胞外囊泡在克服肠道和血脑屏障中的作用 | 提出将血脑屏障视为受肠-微生物-脑轴影响的连续动态系统的一部分，并强调微生物组组成和代谢功能的个体差异对口服脑部递送的影响，倡导精准微生物组药理学 | 未涉及具体原始实验数据，主要基于现有文献的批判性评价和概念框架的提出 | 探讨口服脑部递送中纳米颗粒和肠道微生物组的双重策略，以克服血脑屏障和上游肠道屏障 | 口服脑部递送平台、纳米颗粒、细菌胞外囊泡、肠道微生物组 | 机器学习和其它 | 神经退行性疾病和精神疾病 | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 12 | 2026-10-16 |
Biocatalytic and synthetic biology strategies for S-type lignin valorization
2026-Sep-15, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.154513
PMID:42744263
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综述 | 本文综述了S型木质素单体生物转化为高价值产品的生物催化与合成生物学策略，重点分析了O-去甲基化和开环反应的代谢瓶颈及相关关键酶 | 系统聚焦于S型木质素单体（3,5-二甲氧基取代）的微生物代谢瓶颈，突出Rieske非血红素铁单加氧酶、四氢叶酸依赖型O-去甲基酶和细胞色素P450过氧化酶在去甲基化中的关键作用，并整合代谢工程策略解决辅因子失衡和中间体毒性问题 | 现有O-去甲基酶底物谱较窄，宿主对木质素衍生流股的耐受性不足，缺乏真实木质素衍生流股的验证，工业转化尚不成熟 | 总结木质素解聚、生物漏斗和合成生物学驱动的S型木质素单体转化路径设计的最新进展，提出未来研究方向以推动可持续生物经济和工业转化 | 木质素衍生的S型（紫丁香基）单体及其微生物生物转化途径 | 合成生物学，代谢工程 | NA | 生物催化，代谢工程，合成生物学，酶工程 | NA | 文本 | NA | NA | NA | 木质素解聚途径，生物漏斗途径，O-去甲基化代谢途径，合成生物学驱动的代谢通路 | 能源，材料，工业生物技术，环境 |
| 13 | 2026-10-16 |
Synthetic horizontal gene transfer for ecosystem restoration
2026-Aug-14, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-026-00919-9
PMID:42870292
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研究论文 | 该研究通过构建消费者-资源模型，探究合成水平基因转移对生态 consortium 中生物多样性和生物量恢复的影响 | 首次在多种群生态群落模型中研究工程质粒水平转移对生态系统恢复的机制与最优条件 | 基于理论模型，缺乏实验验证，且未考虑自然环境中的复杂因素 | 探索合成水平基因转移在生态系统恢复中的潜力和应用条件 | 土壤微生物群落生态 consortium 模型 | 机器学习 | NA | NA | 消费者-资源模型 | NA | NA | NA | NA | NA | 环境 |
| 14 | 2026-10-16 |
A signal peptide-guided approach towards in situ functionalization of bacterial nanocellulose in Komagataeibacter rhaeticus
2026-Jul-17, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-026-00734-w
PMID:42469887
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研究论文 | 该研究在Komagataeibacter rhaeticus中系统评估了信号肽介导的蛋白质转运机制，建立了单底盘细菌纳米纤维素原位功能化的合成生物学框架 | 首次在K. rhaeticus中全基因组鉴定Sec转运系统并系统性基准测试信号肽介导的蛋白质转运，实现了单底盘同时合成细菌纳米纤维素和原位功能化，开发了渗透休克释放策略将酶活性提高30% | 重组蛋白被滞留在周质空间中，限制了其胞外可用性，影响了功能化效率 | 建立单底盘系统实现细菌纳米纤维素合成与原位功能化的同步进行，推动可编程生物工程活材料的发展 | Komagataeibacter rhaeticus iGEM菌株及其产生的细菌纳米纤维素 | 合成生物学 | NA | 液相色谱-串联质谱（LC-MS/MS）、SignalP 5.0预测、荧光成像 | NA | 蛋白质组数据、荧光图像 | NA | NA | Komagataeibacter rhaeticus | 信号肽介导的蛋白质转运通路 | 材料、医学 |
| 15 | 2026-10-16 |
Cannabichromene (CBC): a comprehensive review of biosynthesis, pharmacology, therapeutic potential, and translational perspectives
2026-Jul-16, Journal of cannabis research
IF:4.1Q1
DOI:10.1186/s42238-026-00454-4
PMID:42464425
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综述 | 本文对大麻色烯（CBC）的生物合成、药理作用、治疗潜力及转化前景进行了全面综述 | 系统性整合了CBC在生物合成途径、独特受体作用谱（如TRPV通道激动及内源性大麻素再摄取抑制）及治疗应用方面的最新进展，并首次提出将纳米递送、合成生物学与多组学整合作为推动CBC临床转化的关键方向 | 缺乏临床试验数据，制剂局限性明显，监管体系碎片化，且现有研究多为临床前证据 | 全面梳理CBC的生物合成、药理特性、治疗潜力及转化挑战，明确其作为高潜力但研究不足的植物大麻素的地位 | 大麻色烯（CBC）及其生物合成途径、药理靶点、临床前疗效与转化应用 | 药理学与治疗学 | 炎症性疾病, 疼痛, 感染性疾病, 癌症, 神经退行性疾病, 抑郁症, 皮肤病 | 文献综述, 生物合成途径分析, 药代动力学分析, 分子药理学评估 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 16 | 2026-10-16 |
Multi-omics analyses reveal cellular responses to biosynthesis of the non-natural cofactor nicotinamide cytosine dinucleotide
2026, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2026.1954596
PMID:42871180
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研究论文 | 通过多组学分析非天然辅因子NCD生物合成对细胞的影响 | 首次利用多组学分析NCD生物合成对细胞的影响，发现NCD(H)的氧化还原状态与天然辅因子隔离 | 未明确说明样本量及具体组学数据规模 | 研究非天然辅因子NCD生物合成对细胞的生物学效应 | 能够自主合成NCD的细胞株 | 合成生物学 | NA | 多组学分析、蛋白质组学、通量分析 | NA | 组学数据 | NA | NA | NA | NA | 医学, 合成生物学 |
| 17 | 2026-10-16 |
Programmable synthetic engineering of adaptive microbial cell factories: from amide transforming enzymes to advanced biocatalytic systems
2026, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2026.1921701
PMID:42871668
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综述 | 本文综述了从酰胺转化酶到先进生物催化系统的可编程合成工程，重点探讨了微生物转谷氨酰胺酶（MTGase）作为微生物细胞工厂中蛋白质水平控制组件的潜力 | 将MTGase定位为合成生物学中可控的蛋白质水平平台，系统整合了蛋白质工程、合成基因电路、CRISPR调控、纳米生物材料和空间生物催化等前沿技术，并区分了前瞻性应用与已确立能力 | 存在胞内脱靶交联、蛋白质稳态负担、交联化学计量比可变、MTGase活性时间控制有限、底盘依赖性和工业放大等关键未解决障碍 | 探讨酰胺转化酶向工程化生物催化系统的转变，评估MTGase如何作为微生物细胞工厂中蛋白质水平控制组件被利用 | 酰胺酶、天冬酰胺酶、谷氨酰胺酶、腈水解酶、腈水合酶、酰基转移酶、氨甲酰酶，特别是微生物转谷氨酰胺酶（MTGase） | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、合成基因电路、CRISPR调控、代谢控制、纳米生物材料、空间生物催化、AlphaFold辅助结构预测、分子对接、分子动力学、机器学习引导的诱变、代谢建模 | 机器学习 | 文本 | NA | CRISPR-Cas9 | 微生物 | 合成基因电路、代谢途径 | 医学, 工业生物技术 |
| 18 | 2026-10-16 |
A Rapid and Reversible Molecular "Switch" Regulating Protein Expression in Chlamydomonas reinhardtii
2025-06, Plant, cell & environment
DOI:10.1111/pce.15360
PMID:39838873
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研究论文 | 本研究将源于哺乳动物的DD/Shield-1系统应用于莱茵衣藻，通过调控外源蛋白的稳定性实现快速、可逆的蛋白表达控制，并成功构建了诱导表达LbCas12a的菌株用于基因编辑。 | 首次在莱茵衣藻中应用DD/Shield-1系统调控外源蛋白表达，实现了快速、可逆的分子开关功能，并成功用于调控基因编辑蛋白LbCas12a的表达。 | 系统依赖于外源添加Shield-1配体，可能增加成本；未提及在大规模培养中的稳定性和效率。 | 开发一种在莱茵衣藻中快速、可逆调控外源蛋白表达的分子开关工具。 | 莱茵衣藻（Chlamydomonas reinhardtii） | 合成生物学 | NA | DD/Shield-1系统 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas12a | 莱茵衣藻 | 分子开关（DD/Shield-1调控的蛋白降解系统） | 工业生物技术 |
| 19 | 2026-10-16 |
Detecting respiratory viral RNA using expanded genetic alphabets and self-avoiding DNA
2015-Nov-15, Analytical biochemistry
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.ab.2015.08.015
PMID:26299645
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研究论文 | 结合自回避分子识别系统（SAMRS）、人工扩展遗传信息系统（AEGIS）和转写技术，开发了一种多重呼吸道病毒核酸检测方法，可区分流感A/B、RSV、SARS和MERS冠状病毒，最低检测限为20μl样本中10个MERS病毒粒子 | 将合成生物学新兴领域的SAMRS（促进多重检测）和AEGIS（实现低噪声PCR）相结合，并辅以转写技术将靶标中的标准核苷酸转化为AEGIS核苷酸以改善杂交，从而解决多重核酸检测中引物和探针间相互作用导致的灵敏度降低、假阳性和假阴性等问题 | 尚未在临床样本中大规模验证；多重检测的实际通量和成本效益仍需进一步评估；SAMRS和AEGIS修饰的引物和探针合成成本可能较高 | 开发一种低成本、高灵敏度和高准确度的多重呼吸道病毒核酸检测方法，以支持流行病学监测和个体患者治疗指导 | 流感病毒A型、流感病毒B型、呼吸道合胞病毒（RSV）、严重急性呼吸综合征冠状病毒（SARS）和中东呼吸综合征冠状病毒（MERS） | 分子诊断 | 呼吸道病毒感染, 流感, SARS, MERS | PCR, 逆转录PCR, 多重Luminex检测, 自回避分子识别系统（SAMRS）, 人工扩展遗传信息系统（AEGIS）, 转写技术 | NA | 核酸序列, 荧光信号 | 20μl样本中低至10个MERS病毒粒子 | NA | NA | NA | 医学 |
| 20 | 2026-10-16 |
Natural products and synthetic biology
2014-Oct-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/sb400025p
PMID:24742095
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |