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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-03-19 |
Advances in detecting category A biothreat agents: Toward symptom-driven sensing strategies
2026-Sep, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2026.02.002
PMID:41847150
|
综述 | 本文综述了针对A类生物威胁剂的最新生物传感平台,并探讨了其诊断目标、优化方法及与临床症状的关联 | 提出建立传感技术与临床应用之间的系统性联系,支持针对生物恐怖、流行病和公共卫生的医疗资源分配研究 | NA | 开发针对A类生物威胁剂的传感技术,以应对生物恐怖和公共卫生威胁 | A类生物威胁剂 | NA | 生物恐怖相关疾病 | 生物传感平台 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 公共安全 |
| 2 | 2026-03-19 |
Functional organization and regulatory logic of the ped gene cluster in Pseudomonas species
2026-Mar-18, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.00046-26
PMID:41705821
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综述 | 本文综述了假单胞菌属中ped基因簇的功能组织与调控逻辑,重点解析了其遗传结构、酶功能和多层次调控机制 | 整合了ped基因簇的功能与调控特征,提出了将其作为模块化平台应用于微生物学的参考框架,并通过跨物种比较揭示了基因簇的保守性与适应性差异 | 部分开放阅读框(如PP_2684、PP_2685、PP_2686)的功能尚未明确表征,调控网络的具体作用机制仍需进一步实验验证 | 解析假单胞菌属中ped基因簇的遗传组织与调控机制,为酒精氧化相关的基础与应用研究提供理论框架 | 假单胞菌属(重点为Pseudomonas putida KT2440和Pseudomonas aeruginosa PAO1)的ped基因簇及其编码的PQQ依赖性脱氢酶 | 合成生物学 | NA | 比较基因组分析、调控网络解析 | NA | 基因组数据、文献数据 | 假单胞菌属多个物种(以KT2440和PAO1为重点) | NA | Pseudomonas putida KT2440, Pseudomonas aeruginosa PAO1 | 酒精氧化代谢通路、包含YiaY脱氢酶和PP_2683组氨酸激酶的复杂信号转导网络 | 环境微生物学、生物修复、生物生产、合成生物学 |
| 3 | 2026-03-19 |
Biofilm engineering through c-di-GMP tuning boosts bioleaching efficiency and arsenic tolerance in Acidithiobacillus ferrooxidans
2026-Mar-18, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.02288-25
PMID:41705824
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研究论文 | 通过调控Acidithiobacillus ferrooxidans中的c-di-GMP信号来增强生物膜形成、生物浸出效率和砷耐受性 | 提出了一种通过靶向调控全局调控分子c-di-GMP来同时增强生物浸出效率和重金属耐受性的新方法,克服了传统基因工程策略一次只能修改单一性状的限制 | NA | 提高生物浸出效率并增强对重金属(如砷)的耐受性 | Acidithiobacillus ferrooxidans(一种在采矿环境中普遍存在的模型生物浸出微生物) | 合成生物学 | NA | 基因工程、转录组分析 | NA | NA | NA | 基因过表达 | Acidithiobacillus ferrooxidans | 通过过表达diguanylate cyclase基因(如S-222、S-306、S-651)来调控c-di-GMP水平,从而重编程生物膜基质组成 | 环境、工业生物技术 |
| 4 | 2026-03-19 |
Inter-species horizontal transfer of biosynthetic gene clusters: an evolutionary driver for chemical diversity in bacterial communities
2026-Mar-18, Essays in biochemistry
IF:5.6Q1
DOI:10.1042/EBC20250014
PMID:41847751
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综述 | 本文探讨了细菌间生物合成基因簇的水平转移机制及其对细菌群落化学多样性的进化驱动作用 | 挑战了传统以基因组为中心的次生代谢观点,提出模仿自然界模块化转移系统可为合成生物学提供可移植生物合成平台的设计灵感 | 未涉及具体实验验证数据,主要基于理论探讨和现有文献分析 | 研究生物合成基因簇在细菌种间水平转移的机制及其进化意义 | 细菌生物合成基因簇及其水平转移过程 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 文献分析 | NA | NA | 细菌 | 可移植生物合成平台 | 工业生物技术 |
| 5 | 2026-03-19 |
Nanoparticle-Based Membranes on Coacervates: From Interfacial Assembly to Biomimetic Applications
2026-Mar-18, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202514620
PMID:41848017
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综述 | 本文综述了基于纳米颗粒膜包覆的凝聚层体系,重点介绍了其界面组装机制、理化性质改善及在仿生应用中的潜力 | 系统归纳了纳米颗粒膜包覆凝聚层的三种主要组装驱动力(界面能驱动、静电作用主导、多机制协同),并阐明该技术如何突破无膜结构的动态不稳定性限制 | 当前纳米颗粒包覆凝聚层微滴的设计与调控仍存在局限性,如膜结构的精确动态控制与功能集成度有待提升 | 通过纳米颗粒膜包覆技术增强凝聚层的结构稳定性和功能可编程性,推动其在合成生物学和仿生材料领域的应用 | 由液-液相分离形成的凝聚层及其纳米颗粒包覆复合体系 | 合成生物学 | NA | 界面自组装技术、纳米颗粒包覆技术 | NA | NA | NA | NA | NA | 仿生功能模块(细胞代谢模拟、吞噬作用、运动性、信号转导) | 材料, 工业生物技术 |
| 6 | 2026-03-19 |
Context-aware synthetic promoter design using neural networks enables rewiring of eukaryotic transcriptional networks
2026-Mar-17, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-026-00684-5
PMID:41844670
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研究论文 | 本文提出了一种基于神经网络的上下文感知合成启动子设计框架,用于在酿酒酵母中重编程转录网络 | 开发了首个用于启动子-转录因子结合位点重组的神经网络工具,实现了无需实验表征的高效启动子工程 | NA | 通过合成启动子设计实现真核生物转录网络的重编程 | 酿酒酵母的启动子和转录因子结合位点 | 合成生物学 | NA | 人工神经网络 | ANN | 启动子序列数据 | 6,011个天然酵母启动子 | NA | 酿酒酵母 | TetR和Mig1转录因子结合位点的启动子工程 | 工业生物技术 |
| 7 | 2026-03-19 |
Construct design for precise DNA insertion in plants
2026-Mar-17, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2026.01.005
PMID:41846181
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综述 | 本文深入综述了植物中构建体设计原则和靶向DNA插入(敲入)策略,为合成生物学、遗传学和作物改良提供实用指导 | 系统评估了当前敲入方法在短片段、大片段和多片段插入中的优缺点,并探讨了非植物先进技术在提高植物敲入效率和精度方面的潜力 | NA | 为促进敲入技术在作物遗传改良中的有效应用,减少脱靶效应 | 植物基因组中的DNA插入构建体设计 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 植物 | NA | 农业 |
| 8 | 2026-03-19 |
Deep learning revolutionizes protein research: Advances in structure prediction, functional annotation, and engineered design
2026-Mar-14, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2026.03.012
PMID:41839238
|
综述 | 本文综述了深度学习如何通过一个协同循环,从根本上改变了蛋白质研究,连接了结构预测、功能注释和理性设计 | 提出了一个统一的“预测-理解-创造”范式,将深度学习确立为蛋白质科学新时代的基石,将领域从描述性观察转变为有原则、可编程的生物分子功能工程 | 在数据稀缺性、模型可解释性和分布外泛化方面仍存在挑战 | 展示深度学习如何通过一个协同循环,连接蛋白质结构预测、功能注释和理性设计,从而加速药物开发和合成生物学领域的发现 | 蛋白质,特别是具有足够进化信息的单域、球状蛋白质 | 机器学习 | NA | 深度学习,生成式AI,逆折叠模型,冷冻电镜与AI集成 | 端到端深度学习模型(如AlphaFold2),多模态模型,生成式AI | 3D坐标,序列数据,相互作用数据 | NA | NA | NA | NA | 药物开发,合成生物学 |
| 9 | 2026-03-19 |
Biological reduction of Fenton sludge: Electron transfer mechanisms, regulatory strategies, and prospects
2026-Mar-13, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.134424
PMID:41833913
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综述 | 本文综述了Fenton污泥生物还原中的电子转移机制、调控策略及未来展望,强调其在资源回收中的潜力 | 聚焦于电子转移网络框架的动态耦合机制,并详细阐述了调控策略如环境参数优化、基因工程和微生物电化学技术 | NA | 探讨Fenton污泥生物还原的资源回收策略及其电子转移机制 | Fenton污泥及铁还原细菌 | 环境生物技术 | NA | 生物还原、基因工程、微生物电化学技术 | NA | NA | NA | 基因工程 | 铁还原细菌 | NA | 环境 |
| 10 | 2026-03-19 |
Friedelane-type oxidosqualene cyclases in friedelin production: Advances in biosynthesis, functional characterization, structure-function relationships, and engineering strategies
2026-Mar-09, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.151349
PMID:41812943
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综述 | 本文综述了friedelane型氧化鲨烯环化酶在friedelin生物合成中的研究进展,包括功能表征、结构-功能关系及工程策略 | 首次报道植物OSC的冷冻电镜结构,揭示了独特的“阳离子穿梭运行”机制,并整合多组学技术识别了18种friedelane型OSC酶 | 未明确提及具体实验数据或样本规模的限制,主要基于现有文献综述 | 探讨friedelin的生物合成、酶功能及工程化生产策略,以实现其可持续生物制造 | friedelane型氧化鲨烯环化酶(OSCs)及friedelin生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 多组学整合技术、冷冻电镜(cryo-EM)、代谢途径工程、蛋白质工程 | NA | NA | NA | 代谢途径工程、蛋白质工程、亚细胞区室化 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | friedelin生物合成途径的重建 | 医药、工业生物技术 |
| 11 | 2026-03-19 |
Improving the Skin-Conformability of Wearable Continuous Glucose Monitors With Synthetic Hydrogel Electrodes
2026-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202517501
PMID:41572506
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研究论文 | 本文介绍了一种通过合成生物电子策略开发的酶水凝胶电极(GelZymes),旨在克服传统酶电极的机械和界面限制,提升可穿戴连续血糖监测设备的皮肤贴合性 | GelZymes提供了两个核心创新:一是采用单块可扩展的3D架构,统一了酶膜和电极,简化了制造过程并消除了界面不稳定性;二是实现了类似组织的粘弹性,结合了拉伸性和粘附性,这在刚性酶膜中很少能实现 | NA | 研究目的是开发一种改进的可穿戴连续血糖监测设备,通过合成生物电子策略提升其皮肤贴合性和生物电化学性能 | 研究对象是酶水凝胶电极(GelZymes),用于可穿戴生物传感器 | 生物电子学 | 糖尿病 | 合成生物电子策略、酶固定化技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 12 | 2026-03-19 |
Microbial melanin: biosynthesis, functional Insights, and emerging research challenges
2026-Jan-27, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-025-04757-1
PMID:41591674
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综述 | 本文综述了微生物黑色素在生物合成途径、生产优化策略、挑战及潜在应用方面的最新进展 | 重点强调了组学技术和基因工程在阐明生物合成机制和提高产量方面的关键作用,并提出了整合合成生物学、先进分析技术和全面安全性评估的未来研究方向 | NA | 为微生物黑色素这一快速发展的领域提供全面且具有批判性的参考 | 微生物黑色素 | NA | NA | 组学技术,基因工程 | NA | NA | NA | NA | 细菌,真菌 | NA | 生物技术 |
| 13 | 2026-03-19 |
Decoding signaling architectures: CAR versus TCR dynamics in solid tumor immunotherapy
2026-01-25, Acta biochimica et biophysica Sinica
IF:3.3Q1
DOI:10.3724/abbs.2025190
PMID:41132090
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综述 | 本文比较了T细胞受体(TCR)和嵌合抗原受体(CAR)在信号传导架构上的差异,并总结了针对实体瘤免疫治疗中CAR-T细胞功能提升的最新策略 | 系统性地解码了CAR与TCR在信号动力学上的差异,并强调了通过工程化优化CAR设计、增强免疫突触形成、调整ITAM数量/强度以及整合新型共刺激域等突破性策略,以缩小实体瘤与血液肿瘤疗效差距 | NA | 旨在改善CAR-T细胞在实体瘤免疫治疗中的疗效,通过理解信号传导机制并开发创新策略来克服现有障碍 | T细胞受体(TCR)、嵌合抗原受体(CAR)及其在实体瘤免疫治疗中的应用 | 免疫学 | 实体瘤 | 合成生物学工具、表观遗传重编程 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | T细胞 | 可调/逻辑门控的CAR激活 | 医学 |
| 14 | 2026-03-19 |
A modular single- and dual-gene expression toolkit for Kluyveromyces marxianus
2026-Jan-23, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-026-04794-4
PMID:41571921
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研究论文 | 本研究为马克斯克鲁维酵母开发了一套模块化的单基因和双基因表达工具包,以促进其在合成生物学和工业蛋白质生产中的应用 | 开发了基于筛选元件(pENO启动子和pHTX双向启动子)的单基因和双基因表达系统,并首次在马克斯克鲁维酵母中实现了稳定的、受遗传元件组合、碳源和培养时间调控的表达,以及利用SV40核定位信号实现亚细胞靶向 | NA | 开发适用于马克斯克鲁维酵母的基因表达工具,以克服其表达工具有限的障碍,推动其作为微生物底盘在合成生物学和工业蛋白质生产中的应用 | 马克斯克鲁维酵母 | 合成生物学 | NA | 基因表达系统构建、荧光蛋白定位 | NA | NA | NA | Gibson Assembly, BioBrick | Kluyveromyces marxianus (马克斯克鲁维酵母) | 单基因表达系统(含短基因间序列IGG用于双顺反子表达)、双基因表达系统(基于双向启动子pHTX)、核定位系统(利用SV40 NLS) | 工业生物技术 |
| 15 | 2026-03-19 |
Phyllosphere microbiome: Exploring the unexplored frontiers for precision agricultural and environmental sustainability
2026-Jan-19, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-026-04788-2
PMID:41549150
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综述 | 本文综述了叶际微生物组在可持续农业和环境健康中的关键作用、潜力及当前应用挑战,并探讨了利用组学技术、合成生物学等前沿手段开发精准农业工具的机遇 | 系统性地将叶际微生物组定位为地球最大微生物栖息地之一,并强调其在精准农业和环境可持续性中尚未被充分开发的战略价值,提出了结合组学、合成生物学和生态建模的精准部署新框架 | 叶际微生物的实际应用仍受限于环境不稳定性、田间持久性差、功能表征不完整以及叶面微气候多变等挑战,植物-微生物互作的特异性和微生物相互作用的复杂性也增加了部署难度 | 探索叶际微生物组在推动精准农业和环境可持续性方面的潜力与实现路径 | 植物叶际(气生表面)的微生物群落,包括细菌、真菌和酵母 | NA | NA | 组学技术(omics technologies)、微生物群落工程、纳米递送系统、合成生物学、生态建模 | NA | NA | NA | NA | 植物(泛指) | NA | 农业, 环境 |
| 16 | 2026-03-19 |
The Role of Bacterial Outer Membrane Vesicles in Tumor Development: Facts, Potential Applications and Future Perspectives
2026, International journal of nanomedicine
IF:6.6Q1
DOI:10.2147/IJN.S582600
PMID:41847176
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综述 | 本文综述了细菌外膜囊泡在肿瘤发展中的作用,包括其促进或抑制肿瘤的机制,以及作为工程化纳米疫苗和免疫治疗剂的转化潜力 | 系统性地将OMVs的作用与癌症的14个标志对齐,并探讨了其作为可编程纳米平台的工程化应用前景 | NA | 探讨细菌外膜囊泡在肿瘤生物学中的角色及其在癌症预防、诊断和治疗中的潜在应用 | 细菌外膜囊泡及其在肿瘤发展中的机制 | NA | 癌症 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | 革兰氏阴性和革兰氏阳性细菌 | 可编程囊泡设计 | 医学 |
| 17 | 2026-03-19 |
Single-molecule force spectroscopy of toehold-mediated strand displacement
2024-08-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51813-9
PMID:39217165
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研究论文 | 本文通过单分子力谱技术结合微流控增强光阱和粗粒度模拟,研究了toehold介导的链置换过程的单分子动力学 | 首次在单分子水平上实时观察TMSD过程,实现了微秒和纳米级分辨率,并揭示了序列效应在链置换中的重要性 | NA | 探究toehold介导的链置换在单分子层面的动力学特性 | DNA和RNA链的toehold介导链置换过程 | NA | NA | 单分子力谱、微流控增强光阱、粗粒度模拟 | NA | 力谱数据、模拟数据 | NA | NA | NA | NA | 核酸纳米技术、合成生物学 |
| 18 | 2026-03-18 |
Growth factor applications and clinical translation: advances and challenges
2026-Dec, Annals of medicine
IF:4.9Q1
DOI:10.1080/07853890.2026.2642893
PMID:41837883
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综述 | 本文系统回顾了生长因子的分类、基础研究进展及其在神经退行性疾病、骨再生和代谢紊乱等领域的应用,并深入分析了临床转化中的主要挑战与解决方案 | 通过整合当前进展与限制,为加速下一代生长因子疗法发展提供了全面的路线图和技术参考,强调多学科整合以提升精准性、安全性和疗效 | 生长因子的临床转化仍受限于药代动力学特性不佳、精确递送困难、潜在副作用以及高昂的工业化生产成本 | 加速生长因子疗法的临床转化,以应对退行性疾病、组织损伤和代谢紊乱 | 生长因子及其在再生医学、肿瘤学和代谢调节中的应用 | NA | 神经退行性疾病、骨再生、代谢紊乱 | 蛋白质工程、化学修饰、智能响应递送系统(如基于细胞外囊泡的平台)、多因子顺序释放技术 | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 医学 |
| 19 | 2026-03-18 |
p-Benzoyl-l-phenylalanine as a Multifunctional Noncanonical Amino Acid in Synthetic Biology: Photoprobing, Photocatalysis, and Structural Programming for Biocontainment
2026-Mar-16, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202525502
PMID:41664298
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综述 | 本文综述了对苯甲酰-L-苯丙氨酸(pBzF)作为一种多功能非经典氨基酸在合成生物学中的应用,涵盖光探针、光催化和结构编程等领域 | 确立pBzF作为一种多功能光化学和结构基元,用于构建具有非天然、光响应和催化功能的蛋白质 | NA | 探讨pBzF在合成生物学中的多功能应用,包括光化学、结构编程和生物控制 | pBzF作为一种非经典氨基酸及其在蛋白质工程中的应用 | 合成生物学 | NA | 遗传编码、定向进化、光化学技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学、工业生物技术 |
| 20 | 2026-03-18 |
RNA Aptamers and Epitranscriptomics: Charting Unexplored Territories in RNA Biology
2026-Mar-16, Molecular diagnosis & therapy
IF:4.1Q1
DOI:10.1007/s40291-026-00841-w
PMID:41838348
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perspective | 本文探讨了RNA适配体与表观转录组学在RNA生物学中的交叉领域,聚焦于RNA修饰如何影响适配体折叠或结合,以及适配体如何用于检测或调控表观转录组状态 | 首次系统性地探索RNA适配体与表观转录组学之间的概念和机制重叠,提出其潜在融合作为创新前沿 | 这些领域之间的直接调控联系尚未完全阐明,需要未来研究进一步探索 | 激发RNA适配体和表观转录组学研究社区之间的讨论,并吸引对未来研究前沿的关注 | RNA适配体(通过SELEX等方法体外选择的单链RNA寡核苷酸)和表观转录组修饰(如m6A、Ψ、m5C) | RNA生物学 | NA | SELEX(系统进化配体指数富集)及相关方法 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 诊断学、治疗学、分子传感、合成生物学、转录后调控、RNA基础治疗 |