合成生物学相关文章
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当前共找到 4881 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-05-03 |
The gut-tumor connection: the role of microbiota in cancer progression and treatment strategies
2026-May, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.08.038
PMID:40850681
|
综述 | 探讨肠道微生物群在癌症进展和治疗策略中的作用 | 系统总结了肠道微生物群、肿瘤相关微生物群与肿瘤微环境之间的复杂相互作用，并评估其作为癌症治疗靶点的潜力 | 缺乏标准化方案、先进的测序技术和改进的动物模型，限制了微生物群-癌症相互作用研究的发展 | 探索肠道微生物群与肿瘤微环境的关系及其对个性化癌症治疗的启示 | 肠道微生物群、肿瘤相关微生物群及肿瘤微环境 | 自然语言处理 | NA | 二代测序 | NA | 综述数据 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 2 | 2026-05-03 |
Advances and opportunities for computational interrogation of plant proteins
2026-May, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.70899
PMID:42055456
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综述 | 综述了计算分析方法在植物蛋白质研究中的进展与机遇 | 强调了计算工具在加速植物蛋白质功能发现方面的潜力，并整合了新兴方法与传统实验手段的优势 | 植物内研究仍受限于遗传转化方法的可用性和效率 | 推动计算与实验结合，以克服植物蛋白质研究瓶颈，促进农业、生态和气候韧性进展 | 植物蛋白质 | 机器学习 | NA | 蛋白质结构预测、动力学模拟、相互作用分析 | NA | 蛋白质序列、结构数据 | NA | NA | 植物 | NA | 农业, 生态, 气候韧性 |
| 3 | 2026-05-03 |
Harnessing synthetic circuits to illuminate microbial electron transfer: a perspective on engineered metabolism
2026-Apr-30, Journal of microbiology & biology education
IF:1.6Q2
DOI:10.1128/jmbe.00290-25
PMID:41627025
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研究论文 | 该视角文章聚焦于一项利用合成基因电路促进微生物电子传递的研究，展示了通过工程化代谢生产氧化还原活性代谢物增强胞外电子传递和发电的能力 | 创新点在于通过合成生物电路控制氧化还原介质的产生，为理解微生物电子流和生物电子设计提供新视角，并作为教育案例整合多学科知识 | NA | 探讨合成电路在微生物电子传递中的应用，并强调其在教育中促进跨学科学习的潜力 | 微生物电子传递和工程化代谢 | 合成生物学 | NA | 合成基因电路 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | 合成基因电路用于生产并释放吩嗪-1-羧酸（一种氧化还原活性代谢物） | 生物技术, 教育 |
| 4 | 2026-05-03 |
Toward life with a 19-amino acid alphabet through generative artificial intelligence design
2026-Apr-30, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aeb5171
PMID:42060756
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研究论文 | 通过计算设计与合成生物学探索构建仅由19种氨基酸组成的生命体 | 首次证明异亮氨酸在生命活动中可被替代，并利用蛋白质语言模型和结构模型成功设计出功能性无异亮氨酸蛋白质，构建出可存活的19氨基酸细胞 | 当前仅针对大肠杆菌进行验证，且替代过程依赖大量的计算重设计，可能需进一步优化以适用于其他生物体 | 探索简化氨基酸字母表（19种氨基酸）构建生命体的可行性 | 大肠杆菌中的核糖体及其382个异亮氨酸残基 | 蛋白质工程，合成生物学 | NA | 蛋白质语言模型，基于结构的模型，计算设计，合成生物学 | 蛋白质语言模型，基于结构的模型 | 蛋白质序列与结构数据 | 核糖体中的382个异亮氨酸残基，21个重新设计的亚基 | NA | 大肠杆菌 | 无异亮氨酸核糖体设计 | 合成生物学，基础生物学研究 |
| 5 | 2026-05-03 |
From known knowns to unknown unknowns: synthetic biology paths to antimicrobial discovery
2026-Apr-30, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2026.102759
PMID:42066660
|
评论性文章 | 提出一个合成生物学中心框架，将抗菌天然产物按化学新颖性和工程可及性分为四个象限，以指导抗菌发现策略 | 从已知已知到未知未知的二维映射框架重新定义了合成生物学视角下的天然产物分类，并揭示了不同象限间的动态转化关系 | NA | 提出基于合成生物学的抗菌天然产物发现路径框架，应对当前抗生素耐药挑战 | 抗菌天然产物 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 6 | 2026-05-03 |
RNA sensors and actuators for dynamic cellular regulation
2026-Apr-30, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2026.04.005
PMID:42067429
|
综述 | 探讨RNA传感器与执行器在动态细胞调控中的设计及应用 | 总结了合成生物学、RNA疗法进展及RNA结构动态学理解，推动新型RNA传感器和执行器的发展 | RNA工程在合成细胞控制中的应用仍落后于蛋白质系统 | 利用RNA传感器和执行器调控细胞活动，增强微生物合成和基因治疗 | RNA传感器和执行器 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | RNA传感器和执行器 | 医学, 工业生物技术 |
| 7 | 2026-05-03 |
From fundamental understanding to engineering carboxysomes for biotechnological applications
2026-Apr-30, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2026.101882
PMID:42068046
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综述 | 综述了从基础理解到工程化改造羧基体用于生物技术应用的最新进展 | 系统总结了羧基体在合成生物学和生物工程中的设计原理，包括可编程结构、货物封装、半渗透性和模块化组装，并提出了将其改造为高效固碳引擎和多功能纳米材料的新策略 | 实现壳渗透性的精确控制和货物封装的高效性，以及将羧基体整合到异源宿主中仍面临挑战 | 探讨羧基体的分子机制及其在生物技术中的应用潜力 | 羧基体（一种自组装蛋白质微区室） | 合成生物学 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | 固碳通路、纳米材料 | 工业生物技术、环境 |
| 8 | 2026-05-03 |
Structure-function relationships and industrial integration of extremophilic xylanases for sustainable xylo-oligosaccharide production
2026-Apr-29, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.134751
PMID:42067162
|
综述 | 系统总结了极端嗜热木聚糖酶的结构功能关系及其在低聚木糖可持续生产中的工业整合策略 | 从分子适应机制（离子对网络、疏水核心、表面静电）角度解析极端酶稳定性，并整合蛋白质工程与合成生物学策略进行酶工程改造 | 未来需要进一步提升极端嗜热木聚糖酶在商业实施中的性能以实现可持续生物加工 | 研究极端嗜热木聚糖酶的结构功能关系及其在低聚木糖可持续生产中的应用 | 极端嗜热木聚糖酶（嗜热、嗜盐、嗜酸/嗜碱来源） | NA | NA | 蛋白质工程、合成生物学 | NA | NA | NA | 蛋白质工程、合成生物学 | NA | NA | 工业生物技术、农业、环境 |
| 9 | 2026-05-03 |
Combination of adaptive laboratory evolution and metabolic engineering on Vibrio natriegens for efficient production of 3-hydroxypropionic acid from ethanol
2026-Apr-29, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.134757
PMID:42067166
|
研究论文 | 结合适应性实验室进化和代谢工程改造需钠弧菌以高效从乙醇生产3-羟基丙酸 | 首次通过适应性实验室进化筛选获得能利用乙醇产3-羟基丙酸的需钠弧菌，并结合代谢工程优化显著提高产量 | 摇瓶和1L生物反应器中产量仍有提升空间，未提及大规模发酵的可行性和经济性评估 | 开发乙醇作为非粮碳源生产高附加值化学品3-羟基丙酸的微生物工艺 | 需钠弧菌（Vibrio natriegens） | 合成生物学 | NA | 适应性实验室进化、代谢工程 | NA | 实验数据 | NA | NA | 需钠弧菌（Vibrio natriegens） | 3-羟基丙酸生物合成途径（含启动子优化） | 工业生物技术 |
| 10 | 2026-05-03 |
Metabolic Engineering of Aureobasidium melanogenum for Efficient Production of Gluconic Acid
2026-Apr-22, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c13595
PMID:42017485
|
研究论文 | 通过代谢工程改造黑酵母菌以高效生产葡萄糖酸 | 首次通过敲除普鲁兰、聚苹果酸、liamocin和黑色素等副产物合成相关基因，并过表达内源葡萄糖氧化酶基因，构建了一株高产葡萄糖酸的工程菌株，在补料分批发酵中达到了目前报道的最高产量 | 未详细评估该工程菌株在工业规模下的长期稳定性和生产成本 | 通过代谢工程手段提高黑酵母菌生产葡萄糖酸的效率 | 黑酵母菌（Aureobasidium melanogenum）菌株TSYW-58及其工程改造后的菌株PPLMPG-6 | 合成生物学 | NA | 代谢工程, 基因敲除, 基因过表达, 发酵技术 | NA | 发酵数据 | 单一菌株及其工程改造后代 | CRISPR-Cas9 | 黑酵母菌（Aureobasidium melanogenum） | 敲除普鲁兰、聚苹果酸、liamocin和黑色素生物合成基因，并过表达葡萄糖氧化酶基因的代谢通路设计 | 工业生物技术, 医药, 食品 |
| 11 | 2026-05-03 |
From CRISPR functional genomics to synthetic interventions: engineering antiviral strategies
2026-04-21, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.00057-26
PMID:41910274
|
综述 | 本文综述了从CRISPR功能基因组学到合成生物学干预的进展，旨在工程化抗病毒策略 | 将CRISPR功能基因组学筛选与合成生物学设计相结合，提出可编程干预手段（如受体诱饵、基因电路和工程化免疫细胞） | 讨论从筛选机制转化为安全有效抗病毒策略时面临的约束条件 | 连接CRISPR功能基因组学与合成抗病毒设计，总结跨病毒家族通用原则 | 病毒与宿主相互作用中的宿主依赖性因子和限制因子 | 功能基因组学, 合成生物学 | 病毒相关疾病 | CRISPR扰动筛选, 单细胞测序, 成像技术, 空间表型分析, 类器官模型 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 人类细胞 | 受体诱饵及结合分子、条件性蛋白降解系统、感染感应基因电路、可调抗病毒功能免疫细胞 | 医学 |
| 12 | 2026-05-03 |
Engineering Rapamycin-Induced Dimerization for Control of Gene Expression in Plants
2026-Apr-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00125
PMID:41990133
|
研究论文 | 开发了一种基于雷帕霉素诱导的FKBP-FRB分裂转录因子系统，用于植物基因表达的精确调控 | 首次在植物中开发出雷帕霉素诱导的FKBP-FRB分裂转录因子系统，通过系统优化实现87倍诱导倍数且超过组成型表达，表面喷洒或土壤施用即可诱导 | 未明确说明局限性，但可能存在雷帕霉素对植物细胞的其他影响或系统在田间环境的稳定性问题 | 开发一种低背景、高诱导、操作简便的植物化学诱导基因表达系统 | 植物（如模式植物），具体物种未指定 | NA | NA | 分裂转录因子系统 | NA | NA | NA | NA | 植物（如模式植物） | 雷帕霉素诱导的FKBP-FRB分裂转录因子系统，含DNA结合域与转录激活域的融合蛋白 | 农业、工业生物技术 |
| 13 | 2026-05-03 |
A standardized workflow for kinetic metabolic model curation and dissemination
2026-Apr, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1014227
PMID:42008579
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research paper | 提出一个标准化工作流程，用于动力学代谢模型的构建、注释、可视化和共享 | 整合社区标准和开源工具，确保模型的可重复性、互操作性和用户可访问性 | NA | 提高动力学代谢模型的可重复性和实用性 | 动力学代谢模型 | NA | NA | NA | 动力学代谢模型 | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 代谢工程, 系统生物学 |
| 14 | 2026-05-03 |
Emerging ultrafast technologies in biotechnology
2025-May, 3 Biotech
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s13205-025-04309-2
PMID:40292246
|
综述 | 重点介绍超快技术在生物技术中的应用，包括实时可视化和精确操纵生物分子过程 | 整合了飞秒激光、超快光谱、泵浦-探针显微镜、CARS及阿秒光谱等多种超快技术，并探讨了其与人工智能和纳米技术的结合，推动诊断、个性化医疗和合成生物学发展 | 面临光损伤、与复杂生物系统整合困难以及伦理考量等挑战 | 综述超快技术在生物技术中的变革性应用及潜力 | 涉及蛋白质折叠路径、酶活性、能量转移机制、CRISPR基因编辑实时监测、细胞动力学、神经活动等生物分子过程和动态 | 机器学习, 数字病理学 | NA | 飞秒激光, 超快光谱, 泵浦-探针显微镜, 相干反斯托克斯拉曼散射, 阿秒光谱 | NA | 图像, 文本 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 医学, 农业, 环境, 能源, 材料, 食品, 工业生物技术 |
| 15 | 2026-05-03 |
Prevention of ribozyme catalysis through cDNA synthesis enables accurate RT-qPCR measurements of context-dependent ribozyme activity
2025-04-16, RNA (New York, N.Y.)
DOI:10.1261/rna.080243.124
PMID:40050070
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研究论文 | 开发并验证了一种通过cDNA合成抑制核酶催化活性以实现准确RT-qPCR测量上下文依赖性核酶活性的方法 | 在样本制备工作流程中引入寡核苷酸以抑制核酶活性，恢复RT-qPCR测量的准确性，首次解决了RNA提取和逆转录条件诱发核酶裂解导致测量不准确的问题 | 研究仅在体外已知上下文依赖性核酶裂解的RNA组上验证，未涉及体内复杂环境或多种核酶类型，潜在限制于实际应用场景的泛化能力 | 准确测量不同遗传和环境上下文中的核酶活性，以验证新核酶序列及基于核酶的生物技术 | 自裂解核酶及其上下文依赖性活性 | 分子生物学 | NA | RT-qPCR, RNA提取, cDNA合成 | NA | RNA定量数据 | 一组已知体外上下文依赖性裂解的RNA样本 | NA | NA | 自裂解核酶（自切割RNA） | 合成生物学, 生物制造, 核酸治疗 |
| 16 | 2026-05-03 |
Active learning of enhancers and silencers in the developing neural retina
2025-Jan-15, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2024.12.004
PMID:39778579
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研究论文 | 开发了一种主动学习方法，用于训练区分增强子和沉默子的模型，并在发育中的神经视网膜中应用 | 将主动学习与合成生物学及不确定性采样相结合，迭代训练模型以区分功能相反的转录因子结合位点 | 未明确说明局限性 | 训练能够区分增强子和沉默子的模型，解释相同转录因子在不同上下文中激活或抑制转录的机制 | 发育中的神经视网膜中的增强子和沉默子 | 机器学习 | NA | 大规模并行报告分析 | 深度学习模型 | 基因组序列 | 几乎全部CRX结合位点及多轮合成生物学数据 | NA | NA | NA | 医学 |
| 17 | 2026-05-02 |
STRAIGHT-IN Dual: a platform for dual single-copy integrations of DNA payloads and gene circuits into human induced pluripotent stem cells
2026-Apr-30, Nature biomedical engineering
IF:26.8Q1
DOI:10.1038/s41551-026-01677-9
PMID:42062565
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研究论文 | 该论文介绍了一种名为STRAIGHT-IN Dual的平台，能够高效地将两个DNA构建体同时、等位基因特异性地单拷贝整合到人类诱导多能干细胞中 | STRAIGHT-IN Dual平台实现了在一周内对两个DNA构建体进行高效、同时、等位基因特异性单拷贝整合，并支持组件回收用于后续修饰 | NA | 开发一种高效、快速的双重DNA整合平台，用于在人类诱导多能干细胞中进行基因电路和细胞命运编程的测试 | 人类诱导多能干细胞 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 人类诱导多能干细胞 | 可诱导合成基因开关 | 医学 |
| 18 | 2026-05-02 |
Engineering AraC L9K for Inducer-Independent pBAD Activation in Salmonella Gallinarum
2026-Apr-28, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2026.04.019
PMID:42061758
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研究论文 | 通过在肠炎沙门氏菌鸡伤寒变种中结合宿主基因组修饰和定点诱变，生成不依赖诱导剂的AraC变体，实现pBAD启动子的组成型激活 | 首次在沙门氏菌中通过L9K突变实现无需阿拉伯糖诱导的pBAD系统组成型表达，且活性水平达到或超过完全诱导的野生型系统 | 研究仅在Salmonella Gallinarum中进行，未在其它细菌宿主中验证该系统的通用性和稳定性 | 开发一种不依赖外源诱导剂的AraC-pBAD表达系统，以克服工业规模化和治疗应用中诱导剂依赖的限制 | 肠炎沙门氏菌鸡伤寒变种（Salmonella enterica serovar Gallinarum） | 合成生物学 | NA | 定点诱变 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9（或定点诱变） | 肠炎沙门氏菌鸡伤寒变种 | pBAD启动子系统（AraC变体） | 微生物制造, 合成生物学, 治疗生物技术 |
| 19 | 2026-05-02 |
Engineering Plant-Derived P450 Enables the Efficient Production of Berberine through a Concise and Modular Enzymatic Cascade in E. coli
2026-Apr-27, JACS Au
IF:8.5Q1
DOI:10.1021/jacsau.6c00169
PMID:42063854
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研究论文 | 通过工程化植物来源的P450酶，设计模块化酶促级联反应在大肠杆菌中高效生产小檗碱 | 优化设计了绕过多个天然步骤的简明模块化途径，并结合表达优化、结构指导设计、共识突变和机器学习综合工程化CYP719A1，获得活性提高8.9倍且热稳定性改善的变体 | NA | 解决植物膜结合细胞色素P450酶催化瓶颈，实现植物天然产物小檗碱的可持续高效生产 | 植物来源的CYP719A1酶及其工程化变体 | 合成生物学、代谢工程 | NA | 蛋白质工程、机器学习、酶级联反应 | 机器学习模型 | 序列和结构数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 模块化酶促级联途径（包含P450依赖步骤） | 医药、工业生物技术 |
| 20 | 2026-05-02 |
Engineered commensal Bacteroides thetaiotaomicron enables targeted drug delivery to colorectal tumors
2026-Apr-24, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society
IF:10.5Q1
DOI:10.1016/j.jconrel.2026.114945
PMID:42036032
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研究论文 | 工程化肠道共生菌多形拟杆菌实现结直肠肿瘤靶向药物递送 | 基于天然肠道共生菌多形拟杆菌构建新型细菌递送系统，通过筛选表面锚定蛋白实现肿瘤靶向蛋白展示，并整合治疗模块实现双重抗肿瘤效果 | 尚需进一步评估临床安全性和长期免疫反应 | 开发基于肠道共生菌的靶向肿瘤治疗新策略 | 多形拟杆菌 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 微生物工程 | NA | NA | AOM/DSS诱导的结直肠癌小鼠模型 | NA | 多形拟杆菌 | 肿瘤靶向蛋白展示系统及溶血素E治疗模块 | 医学 |