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当前共找到 5532 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
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| 1 | 2026-08-16 |
Exploring rare coumarins biosynthesis by Gloeophyllum trabeum: an integrated computational genomics, molecular docking and spectroscopic approach
2026-Aug-14, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-026-05181-9
PMID:42599545
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研究论文 | 该研究整合计算基因组学、分子对接和光谱分析，探索了木材腐朽真菌Gloeophyllum trabeum中罕见的香豆素生物合成途径，并表征了四种具有抗菌活性的化合物。 | 首次在Gloeophyllum trabeum中全面表征了四种罕见的香豆素类聚酮化合物，并预测了其生物合成基因簇，同时通过分子对接识别出oosponol和oospoglycol作为有前景的抗菌药物先导化合物。 | 仅在体外条件下对Gloeophyllum trabeum的抗菌活性和化合物进行了表征，缺乏体内实验验证；部分化合物结构为推测性的，且基因簇与化合物之间的具体对应关系未完全验证。 | 探索Gloeophyllum trabeum合成罕见香豆素类化合物的潜力，以应对抗生素耐药性威胁，并为其在新型抗生素开发中的应用提供基础。 | 木材腐朽真菌Gloeophyllum trabeum及其产生的香豆素类聚酮化合物。 | 计算基因组学, 分子对接, 光谱分析 | 细菌感染（抗生素耐药性相关） | LC-MS, 二维NMR, 基因组挖掘, 分子对接 | 分子对接模型 | 光谱数据, 基因组序列数据, 分子对接数据 | 四种化合物及三种微生物（大肠杆菌、酿酒酵母、枯草芽孢杆菌） | NA | Gloeophyllum trabeum | 异香豆素类生物合成基因簇 | 医学, 生物技术 |
| 2 | 2026-08-16 |
Chemical Synthesis of Mirror-Image Proteins Reveals Chirality-Dependent Cellular Uptake Mediated by a Cell-Penetrating Peptide
2026-Aug-12, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.6c03792
PMID:42307060
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研究论文 | 通过化学合成镜像蛋白，研究细胞穿透肽介导的细胞摄取中的手性依赖性 | 首次系统研究在保持递送载体恒定的条件下，货物手性对细胞摄取效率的影响，发现L型货物比D型货物更易被细胞摄取 | 未明确指出，但可能包括仅使用了特定的细胞穿透肽和模型货物，以及体外实验的局限性 | 探究镜像蛋白在细胞穿透肽介导下的手性依赖性细胞摄取机制，为镜像蛋白在治疗和合成生物学中的应用提供基础 | L型和D型三种不同大小和结构复杂性的模型货物与相同的环状十精氨酸细胞穿透肽缀合物 | 化学生物学 | NA | 化学合成 | NA | 流式细胞术、凝胶分析、共聚焦显微镜图像 | 多种哺乳动物细胞系 | NA | 哺乳动物细胞 | NA | 医学、合成生物学 |
| 3 | 2026-08-16 |
Harnessing yeast for polyhydroxyalkanoates (PHAs) production: Challenges, engineering strategies, and future prospects
2026-Aug-07, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.153992
PMID:42567388
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综述 | 本文综述了酵母菌生产聚羟基脂肪酸酯（PHAs）的现状、挑战、工程策略及未来前景，重点涵盖野生酵母和工程化酵母的产量提升方法 | 总结了利用酵母作为替代宿主生产PHAs的独特优势，包括抗逆性、GRAS状态、底物利用多样性和亚细胞区室环境，并系统分析了多种合成生物学和代谢工程策略的优缺点 | 指出了酵母基PHAs生产的知识空白，并解释了其相对于其他微生物来源的局限性 | 评估酵母菌作为PHAs生产宿主的可行性，并探讨提高产量的工程策略 | 野生酵母菌株和工程化酵母菌株 | 合成生物学, 代谢工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 酵母菌 | PHAs生物合成途径、竞争途径敲除、代谢工程前体供应、可再生原料利用 | 环境, 工业生物技术 |
| 4 | 2026-08-16 |
bHLH Family Transcription Factors: Molecular Switches in Plant Specialized Metabolism
2026-Aug-03, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells15151400
PMID:42587808
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综述 | 本文综述了碱性螺旋-环-螺旋（bHLH）转录因子作为植物特殊代谢调控开关的作用，重点探讨了茉莉酸-JAZ-MYC模块及其在多种植物代谢途径中的调控机制 | 采用直接-级联-杂交框架整合启动子语法、空间能力、储存解剖结构和证据层次，区别于以途径或MYC2为中心的现有综述 | 未提供具体的实验数据或量化分析，为定性综述 | 系统阐述bHLH转录因子在植物特殊代谢中的调控机制，并提出工程应用策略 | bHLH转录因子、植物特殊代谢物（如萜类、生物碱、苯丙烷类、黄酮类等）及其相关调控模块 | 植物分子生物学 | NA | 多组学引导的因子发现 | NA | 文献数据 | NA | NA | 拟南芥、红豆杉、青蒿、长春花、丹参、银杏、水稻、棉花 | 茉莉酸-JAZ-MYC调控模块 | 农业、医药、合成生物学 |
| 5 | 2026-08-16 |
Fructans and Fructooligosaccharides in Plants and Fruits: Metabolism, Functional Roles, and Emerging Biotechnological Opportunities
2026-Jul-30, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules31152656
PMID:42588504
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综述 | 本文综述了植物和水果中果聚糖和低聚果糖的代谢、功能作用及新兴生物技术机遇 | 重点关注水果中果聚糖的未充分探索领域，并整合了最新的生物技术策略如代谢工程和合成生物学 | 未提及 | 提供果聚糖和低聚果糖代谢的更新概述，并探讨其在植物生理和人类营养中的双重作用及生物技术应用机会 | 植物和水果中的果聚糖和低聚果糖 | 植物生物学、代谢工程 | 不适用 | 育种、代谢工程、合成生物学 | 不适用 | 文献数据 | 不适用 | 育种、代谢工程、合成生物学 | 植物 | 果聚糖生物合成途径 | 食品、营养保健品、农业 |
| 6 | 2026-08-16 |
Mechanism of Terpene Formation in Pogostemon cablin cv. Jing Huoxiang Revealed by Metabolome and Transcriptome Analysis
2026-Jul-30, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27156836
PMID:42589492
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研究论文 | 通过代谢组和转录组分析揭示了荆广藿香不同组织中萜类化合物的形成机制，特别是根中多环倍半萜的积累和生物合成调控 | 首次系统研究了广藿香地下部分（根）中倍半萜的生物合成，整合代谢组和转录组数据，并揭示了根特异积累的多环倍半萜及其调控网络 | 未提及 | 阐明荆广藿香不同组织中萜类化合物的生物合成机制，特别是根中多环倍半萜的积累和调控网络 | 荆广藿香（Pogostemon cablin cv. Jing Huoxiang）的根、茎、叶、花和腺毛 | 植物代谢组学与转录组学 | NA | GC-MS, 转录组测序, 生物信息学分析, 共表达网络分析 | NA | 代谢组数据, 转录组数据 | 未明确样本数量，涉及根、茎、叶、花和腺毛五种组织 | NA | 荆广藿香（Pogostemon cablin cv. Jing Huoxiang） | NA | 医药, 香料, 生物燃料 |
| 7 | 2026-08-16 |
Cyanobacterial Circadian Clock: Molecular Mechanisms and Physiological Outputs
2026-Jul-27, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants15152293
PMID:42588797
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综述 | 本文综述了蓝藻生物钟的分子机制、生理输出及其在进化上的意义 | 挑战了原核生物仅被动响应环境信号的假设，展示了不依赖转录-翻译反馈的蛋白质振荡器，并提供了对生物钟进化逻辑的独特见解 | 未明确提及具体局限性，但指出了包括振荡器与细胞周期耦合、生态型功能分化和群落水平作用等未解问题 | 总结蓝藻生物钟研究进展，阐明其分子基础、输入输出网络及生理协调机制，为合成生物学和生物计时原理提供基础 | 蓝藻的生物钟系统，特别是KaiA、KaiB和KaiC蛋白振荡器 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 蓝藻 | KaiABC蛋白振荡器 | 合成生物学, 生物技术 |
| 8 | 2026-08-16 |
Genome-Wide Identification and Functional Verification of Core Berberine Bridge-like Enzyme Genes for Benzylisoquinoline Alkaloid Biosynthesis in Corydalis saxicola Bunting
2026-Jul-27, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27156708
PMID:42589364
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研究论文 | 对岩黄连中参与苄基异喹啉生物碱生物合成的核心小檗碱桥酶样基因进行了全基因组鉴定与功能验证 | 首次对岩黄连的BBE基因家族进行全面的功能基因组学分析，并通过体外酶学实验证实了候选基因催化特定底物生成脱氢卡维丁和药根碱的氧化酶活性 | 未明确说明研究的局限性 | 鉴定和功能验证岩黄连中参与苄基异喹啉生物碱生物合成的核心BBE样基因，为种质保护和合成生物学改良奠定基础 | 岩黄连中的小檗碱桥酶样基因家族 | 基因组学 | NA | 全基因组分析、系统发育分析、表达分析、蛋白质结构预测、分子对接、体外酶学实验 | NA | 基因组序列、基因表达数据、蛋白质结构数据 | 从岩黄连基因组中鉴定出22个BBE家族成员 | NA | NA | NA | 医药 |
| 9 | 2026-08-16 |
Natural flavonoids in multiple sclerosis: molecular insights and emerging therapeutic strategies
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1888423
PMID:42597552
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综述 | 本文综述了天然黄酮类化合物在多发性硬化中的分子机制和新兴治疗策略，涵盖实验模型和人类研究证据 | 系统整合了黄酮类化合物在调节NF-κB、Nrf2、炎症小体信号及小胶质细胞/巨噬细胞极化中的作用，并探讨了结构-活性关系、代谢和糖基化对暴露的影响，以及合成生物学在规模化生产和衍生物优化中的应用 | 临床证据尚早期且结果不一，存在低且可变生物利用度、血脑屏障穿透有限、标准化不足及与获批疗法潜在相互作用等转化障碍 | 总结黄酮类化合物对多发性硬化的治疗潜力及其分子机制，并评估新兴递送和优化策略 | 天然黄酮类化合物及其在多发性硬化中的分子靶点和细胞过程 | 神经免疫学 | 多发性硬化 | NA | NA | 文本 | NA | 合成生物学 | NA | NA | 医学 |
| 10 | 2026-08-15 |
Growth, signals, and survival: the evolutionary divergence of terpenoid metabolism in terrestrial plants
2026-Aug-14, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d6np00035e
PMID:42598787
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综述 | 本文综述了陆地植物萜类代谢的进化分化，涵盖其结构多样性、生物合成途径、功能角色及基因组学、代谢组学和合成生物学方面的进展 | 强调了基因家族谱系特异性扩张与功能分化如何驱动萜类代谢网络的组合模块化，从而产生复杂的生物活性结构，并探讨了其在植物生态和生物技术应用中的多重作用 | 未提供具体实验数据或定量分析，主要基于已有文献总结 | 阐述陆地植物萜类代谢的进化机制及其在植物生长和环境互作中的功能，并展望生物技术创新潜力 | 陆地植物的萜类代谢系统，包括相关酶类（如萜烯合酶和细胞色素P450单加氧酶）及基因家族 | 植物生物学, 进化生物学, 合成生物学 | NA | 基因组学, 代谢组学, 合成生物学 | NA | 文本 | NA | 合成生物学工具（未具体指定） | NA | 萜类代谢途径的组合模块化设计 | 医药, 能源, 材料, 食品, 工业生物技术, 农业 |
| 11 | 2026-08-15 |
A Dual-Dimensional CRISPR Toolkit Enables One-Step High-Efficiency Multiplex Genome Editing in Komagataella phaffii
2026-Aug-13, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2026.102525
PMID:42595042
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研究论文 | 本研究开发了一种名为EMGES 3.0的双维CRISPR工具，实现甲醇营养型毕赤酵母K. phaffii中的一步式高效多重基因组编辑和长片段整合。 | 首次实现了超长片段（>16kb）的一步式整合，以及在中性位点的多片段同时整合，显著提高了编辑效率和简化了实验流程。 | 虽然实现了高效率和多重编辑，但对于超长片段整合效率仍相对较低（14.8%），可能需要进一步优化。 | 解决K. phaffii中多重基因编辑和精确大片段整合的技术难题，以促进C1生物经济和高价值化合物生产。 | 甲醇营养型酵母Komagataella phaffii。 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9基因组编辑 | NA | DNA序列数据 | 多种基因编辑和整合效率评估的克隆数量未明确。 | CRISPR-Cas9 | 毕赤酵母（Komagataella phaffii） | 设计了一个基于CRISPR的多重基因编辑系统，包括优化的表观遗传载体和修复工程底盘。 | 工业生物技术 |
| 12 | 2026-08-14 |
An orthogonal mammalian gene circuit for selective sensing of taurine-conjugated bile acids
2026-Sep-17, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2026.154326
PMID:42492193
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研究论文 | 本研究利用来自霍乱弧菌的胆汁酸诱导型二鸟苷酸环化酶VC1372，在哺乳动物细胞中构建了一种正交的牛磺酸结合胆汁酸响应基因回路，实现对Tau-BAs的选择性检测。 | 首次将细菌来源的VC1372酶改造为哺乳动物细胞中的正交代谢物传感器，实现对牛磺酸结合胆汁酸的选择性检测，避免了内源受体干扰。 | 该基因回路主要在体外细胞水平验证，尚未在体内模型中进行测试，且对低浓度Tau-BAs的敏感性和特异性有待进一步优化。 | 开发一种能够在哺乳动物细胞中正交且选择性响应牛磺酸结合胆汁酸的合成基因回路，为相关疾病的诊断和治疗提供模块化平台。 | 哺乳动物细胞中的合成基因回路，以及主要循环Tau-BAs（TCA、TDCA、TCDCA）。 | 合成生物学 | 慢性肝病、代谢性疾病、神经退行性疾病 | 定点突变、基因回路构建、细胞培养、荧光报告基因检测 | NA | 实验数据（基因表达响应数据） | NA | 定点突变 | 哺乳动物细胞 | 正交牛磺酸结合胆汁酸响应基因回路，包括VC1372酶促模块和BldD依赖性转录模块 | 医学 |
| 13 | 2026-08-14 |
Integrative Quantum and Systems Biology of Cancer: From Molecular Fluctuations to Ecological Outcomes
2026-Aug-12, Bio Systems
DOI:10.1016/j.biosystems.2026.105923
PMID:42586472
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综述 | 本文从多尺度自适应系统视角审视癌症，评估整合量子与系统生物学框架的有效性，并区分各尺度上已有证据与提出的假设。 | 提出将量子效应、系统生物学和生态学观点整合到癌症研究中，并强调通过基准测试和可证伪性来评估框架价值。 | 这是专家叙述性综合而非系统性综述，且量子贡献被认为是残余效应，证据有限。 | 评估量子与系统生物学框架在癌症研究中的适用性，并明确其预测能力与局限性。 | 癌症作为多尺度自适应系统，包括分子波动、表观遗传、细胞群体生态等。 | 系统生物学 | 癌症 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 14 | 2026-08-14 |
Site-specific recombinases and their essential role in synthetic biology
2026-Aug-08, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.109005
PMID:42570711
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综述 | 本文系统综述了位点特异性重组酶在合成生物学中的基本概念、结构机制、工程策略及多样化功能应用 | 全面总结了位点特异性重组酶的分类、结构机制、个体特性、重组模型、工程策略及功能应用，提供了一个系统的视角 | 未提及具体局限性 | 系统概述位点特异性重组酶的基本概念和最新进展，以支持合成生物学工具箱的发展 | 位点特异性重组酶 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 遗传电路设计、DNA组装 | 合成生物学 |
| 15 | 2026-08-14 |
Live-cell imaging of enhancer-promoter dynamics reveals transient contact-driven gene activation
2026-Jun-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.06.21.733446
PMID:42367879
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研究论文 | 本文通过活细胞超分辨率成像技术，结合合成生物学平台，研究增强子与启动子之间的动态相互作用，发现基因激活由短暂接触介导 | 开发了优化的合成生物学平台，首次实现超高分辨率下同时可视化增强子-启动子三维距离和新生转录，并结合多种互补方法揭示接触机制 | 未明确提及局限性，但基于摘要，可能受限于细胞系模型和成像技术的时间分辨率 | 阐明增强子与启动子相互作用的空间和时间机制，并揭示其与转录激活的关系 | 增强子-启动子相互作用及其与基因激活的关系 | 活细胞成像 | NA | 超分辨率活细胞成像、3D基因组学 | NA | 图像 | 多种细胞系（具体数量未提及） | 合成生物学平台 | 哺乳动物细胞 | 增强子-启动子接触可视化系统 | 生物医学研究 |
| 16 | 2026-08-14 |
Metabolic Pathways and Molecular Regulatory Mechanisms of Nervonic Acid Biosynthesis in Malania oleifera
2026-Jun-18, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27125507
PMID:42353223
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综述 | 本文系统总结了马拉尼奥油藤中神经酸生物合成的代谢途径与分子调控机制，包括脂肪酸合成、极长链脂肪酸延伸和Δ15去饱和过程，并讨论了多组学数据、转录调控和表观遗传调控。 | 整合多组学数据，分析了KCS基因家族的系统发育和共线性分布，并讨论了转录调控网络及表观遗传调控在神经酸积累中的作用，提出了代谢工程和合成生物学应用的展望。 | 未提供具体的实验验证数据，主要基于已有研究进行综述和推测。 | 系统总结神经酸在马拉尼奥油藤中的生物合成途径和调控机制，为可持续神经酸生产的代谢工程和合成生物学提供理论基础。 | 马拉尼奥油藤（Malania oleifera）中的神经酸生物合成相关酶和调控因子。 | 植物分子生物学、代谢工程 | NA | 多组学数据分析 | NA | 基因组、转录组等组学数据 | NA | NA | NA | NA | 生物技术、农业 |
| 17 | 2026-08-14 |
Next-Generation Bionic Sensors for Small Molecule Detection: Integrating Synthetic Biology, Nanomaterials, and Artificial Intelligence
2026-Jun-15, Micromachines
IF:3.0Q2
DOI:10.3390/mi17060725
PMID:42354756
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综述 | 本文综述了结合合成生物学、纳米材料和人工智能的下一代仿生传感器在小分子检测中的最新进展，重点讨论了如何克服传统方法的局限性并实现复杂环境中的实时检测。 | 首次系统性地整合合成生物学、纳米材料和人工智能三个领域，提出了一种问题导向的视角来设计下一代仿生传感器，涵盖了从生物识别元件到信号处理的全流程创新。 | 讨论中提及了AI驱动系统在可扩展性、成本、数据可靠性和伦理方面面临的挑战，但未提供具体的解决方案或实验验证。 | 旨在提供一个全面的概述，展示下一代仿生传感器如何通过跨学科整合解决小分子检测中的关键难题，推动实际应用。 | 小分子检测中的生物识别元件（如酶、抗体、适配体、分子印迹聚合物）以及纳米材料（如石墨烯、碳纳米管、量子点、MXenes）和AI技术。 | 机器学习 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 环境, 食品 |
| 18 | 2026-08-14 |
Global Probiotic Markets Meet Synthetic Biology: Translational Challenges and Escherichia coli Nissle 1917 as a Model Chassis
2026-Jun-11, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms14061306
PMID:42354930
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综述 | 本文综述了全球益生菌市场扩张与合成生物学在活体生物治疗产品开发中的应用，重点讨论了以大肠杆菌Nissle 1917为模型底盘的工程化策略、治疗机遇及转化障碍 | 将益生菌市场扩张与活体生物治疗产品开发联系起来，并以大肠杆菌Nissle 1917作为模型底盘，探讨其外膜囊泡在治疗递送中的潜力 | 未提及具体实验数据或临床验证结果，可能缺乏实证支持 | 探讨合成生物学如何将益生菌转化为可编程微生物平台，以弥合市场扩张与临床转化之间的差距 | 全球益生菌市场、活体生物治疗产品、大肠杆菌Nissle 1917 | 合成生物学 | 肠道相关疾病 | NA | NA | 综述文献 | NA | NA | 大肠杆菌Nissle 1917 | 可编程微生物平台，用于感知疾病相关信号并产生治疗输出 | 医学 |
| 19 | 2026-08-14 |
Design and Implementation of a Blue-Light-Controlled Gene-Switch System
2026-Jun-10, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules31122032
PMID:42357431
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研究论文 | 开发并优化了一种蓝光诱导的T7RNAP双输入调控基因开关系统，实现了精确的时空基因控制，并集成了苯甲酸响应模块以实现化学关闭功能 | 结合蓝光精确诱导与苯甲酸化学关闭的双输入调控，实现了非侵入性、按需激活及生态应用中的可控关闭 | 未提及 | 构建可预测、可编程的基因开关系统，用于生物制造、治疗和微生物工程中的精确基因控制 | 蓝光诱导的T7RNAP系统及其变体，包括RBS序列、串联T7启动子和split-T7RNAP变体 | 合成生物学 | NA | 基因表达调控 | NA | 荧光输出和实时生长曲线数据 | 未明确样本数量，涉及多种RBS变体、启动子构建和模块测试 | NA | 未明确 | 蓝光诱导的双输入基因开关，包含苯甲酸响应模块 | 医学、环境、工业生物技术 |
| 20 | 2026-08-14 |
From Genome to Pharmacome: Current Status and Future Perspectives of Multi-Omics Integration in Traditional Chinese Medicine Research
2026-May-30, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes17060634
PMID:42353793
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综述 | 本文综述了多组学整合在中药研究中的应用现状与未来方向，涵盖基因组学、表观基因组学、生物合成途径解析、合成生物学和系统药理学等四个相关领域，并提出了实验验证框架以弥合统计关联与因果验证之间的差距 | 提出了一种分层实验验证框架和迭代的计算-实验反馈回路，以因果性验证从多组学数据推断出的生物合成和药理途径，弥补当前多组学分析仅停留在统计关联层面的不足 | 未对提出的验证框架和优先级进行实证测试或案例验证，且主要基于文献综述，缺少具体实验结果支持 | 推动中药研究从描述性向数据驱动的机制性分析转变，实现精准医学目标，同时保留传统方剂的多组分特征 | 中药药用材料、生物合成途径、系统药理学机制 | 机器学习和系统生物学、多组学整合 | 不适用 | 高通量测序、转录组学、蛋白质组学、代谢组学、表观基因组学 | 不适用 | 基因组、转录组、蛋白质组、代谢组数据 | 不适用 | 不适用 | 微型生物（用于异源生产） | 合成生物学生产平台 | 医学、工业生物技术 |