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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-04-20 |
Synthetic control of implanted engineered liver tissue growth
2026-Apr-17, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adz8362
PMID:41996502
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研究论文 | 本文提出了一种通过合成生物学工具控制植入工程肝组织在体内生长的新策略,旨在解决工程组织植入物在治疗器官衰竭时尺寸扩展的临床转化难题 | 首次将合成生物学与组织工程结合,实现了在植入后通过合成生物学触发(BOOST)按需诱导工程肝组织在体内原位生长,突破了传统工程组织尺寸限制 | 研究目前仅以肝组织为概念验证,尚未在其他器官或临床规模验证,且长期安全性和免疫反应需进一步评估 | 开发一种通过合成生物学控制植入工程组织在体内生长的方法,以生成大型器官植入物用于治疗器官衰竭 | 工程肝组织,特别是人类肝细胞在三维致密工程组织中的增殖行为 | 合成生物学与组织工程 | 器官衰竭 | 合成生物学工具,YAP和生长因子信号通路调控 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 人类肝细胞 | 通过合成生物学工具控制YAP和生长因子信号轴,驱动组织扩张的生物传感器或逻辑门电路 | 医学 |
| 2 | 2026-04-20 |
Unlocking non-model organisms with CRISPR-Cas: A roadmap for sustainable biotechnology
2026-Apr-17, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108890
PMID:42000334
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综述 | 本文批判性地评估了将CRISPR-Cas基因组编辑技术应用于非模式生物所面临的挑战与机遇,并提出了一个系统性解决宿主特异性障碍、技术方案及实际应用的框架 | 提出了一个系统性框架,将CRISPR-Cas应用于非模式生物,并详细探讨了宿主特异性障碍、创新解决方案(如工程化Cas变体、宿主适应性递送系统)以及无需双链断裂的编辑模式 | 作为一篇综述,它主要整合现有研究,未提供新的原始实验数据,且其实施依赖于未来工具民主化、递送系统进步和伦理治理的建立 | 评估并推动CRISPR-Cas基因组编辑在非模式生物中的应用,以解决可持续生物技术中的全球性挑战 | 非模式生物 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas基因组编辑、碱基编辑、先导编辑、CRISPR相关转座酶(CAST)、重组酶辅助工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | 非模式生物(泛指,未指定具体物种) | NA | 农业、生物制造、环境修复、能源、工业生物技术 |
| 3 | 2026-04-20 |
Duckweeds: from fundamental biology to a sustainable plant chassis for biotechnology
2026-Apr-16, Advanced biotechnology
DOI:10.1007/s44307-026-00110-1
PMID:41989705
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综述 | 本文综述了浮萍作为可持续生物技术平台的潜力,包括其独特生物学特性、基因组解码、遗传工具开发以及在分子农业中的应用进展 | 提出浮萍作为下一代植物底盘生物,整合了其简化基因组、高效转基因表达特性与CRISPR-Cas9等现代基因编辑工具,为可持续生物制造提供了创新平台 | 需要建立整合组学数据库、通用遗传工具包和可扩展的栽培技术才能实现从概念验证到工业应用的转化 | 评估浮萍作为可持续植物底盘在生物技术领域的应用潜力 | 浮萍(Lemnaceae)及其在生物工程中的应用 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9基因编辑、遗传转化、组学分析 | NA | 基因组数据、表型数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 浮萍(Lemnaceae) | 代谢工程途径、疫苗和 therapeutic proteins 生产系统 | 农业, 环境, 工业生物技术 |
| 4 | 2026-04-20 |
Strategies for enhancing specificity and efficacy of oncolytic viruses in cancer treatment
2026-Apr-16, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2026.110708
PMID:41999961
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综述 | 本文综述了通过工程化策略增强溶瘤病毒在癌症治疗中的肿瘤选择性和疗效的最新进展 | 系统总结了利用转录靶向、微RNA脱靶、病毒进入重定向、多层逻辑门控调控系统以及联合免疫调节剂、纳米颗粒封装等多种策略来设计“智能”溶瘤病毒,以提高其安全性和疗效 | NA | 提高溶瘤病毒疗法的肿瘤选择性和治疗效力,以促进其更广泛的临床应用 | 溶瘤病毒 | NA | 癌症 | 系统与合成生物学技术 | NA | NA | NA | NA | NA | 多层逻辑门控调控系统 | 医学 |
| 5 | 2026-04-20 |
Amino acids in yeast fermentation: A review of their roles from nutrients to modulators
2026-Apr-16, International journal of food microbiology
IF:5.0Q1
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综述 | 本文综述了发酵系统中氨基酸的来源及其对酵母的多方面调控作用,包括作为营养物质和关键调节因子影响酵母生理、风味代谢和胁迫耐受性 | 系统整合了当前关于氨基酸在发酵系统中动态来源及其作为调节因子(而非仅氮源)对酵母性能的多重调控作用的知识,并指出未来需结合多组学、合成生物学和生态模型的研究方向 | 对非酿酒酵母和真实发酵环境的异质性了解仍存在显著知识空白 | 阐明氨基酸与酵母的相互作用,以优化发酵质量和效率 | 发酵系统中的氨基酸及其对酵母(特别是酿酒酵母)的调控作用 | NA | NA | 多组学、合成生物学、生态建模 | NA | NA | NA | NA | 酵母(包括酿酒酵母和非酿酒酵母) | NA | 食品工业(发酵食品生产) |
| 6 | 2026-04-20 |
From Xylose to Biobased High-Value Chemicals: Advances in Microbial Xylose Utilization for Industrial Biotechnology
2026-Apr-14, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c06628
PMID:41979057
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综述 | 本文综述了微生物利用木糖生产高价值化学品的最新研究进展,重点关注代谢工程和合成生物学策略 | 总结了木糖代谢途径、代谢工程策略及高价值化学品生产的最新进展,并讨论了未来克服关键挑战的机会 | NA | 提高微生物对木糖的利用效率,以促进木质纤维素生物质的高效生物转化 | 木糖代谢、微生物转化过程、高价值化学品生产 | 工业生物技术 | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | NA | 能源, 工业生物技术 |
| 7 | 2026-04-20 |
PHYCUT: Scalable Multiplex CRISPR/Cas9 Editing for Genome Engineering in the Diatom Phaeodactylum tricornutum
2026-Apr-14, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00843
PMID:41979903
|
研究论文 | 本文开发了PHYCUT系统,一种基于质粒的CRISPR/Cas9工具,用于在三角褐指藻中实现可扩展的多重基因组编辑 | 利用Csy4内切核糖核酸酶处理多向导RNA阵列,克服了三角褐指藻中缺乏高效多重CRISPR/Cas9编辑系统的障碍 | NA | 开发一种用于硅藻多重基因组工程的CRISPR/Cas9编辑工具,以优化其糖基化途径 | 海洋硅藻三角褐指藻 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Csy4 | Phaeodactylum tricornutum | 多向导RNA阵列处理系统 | 工业生物技术 |
| 8 | 2026-04-20 |
Decoding Outer Membrane β-Barrels: From Structural Curiosity to Engineered Nanotherapeutics
2026-Apr-13, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.5c00902
PMID:41973831
|
综述 | 本文综述了跨膜β-桶状外膜蛋白(OMPs)的结构、功能多样性及其在生物传感、药物递送和纳米医学等领域的工程应用前景 | 整合了OMPs从早期结构研究到理性工程应用的跨学科进展,提出将其从结构研究对象转变为精准生物分子设计和下一代纳米治疗剂的范式转换 | NA | 系统总结外膜β-桶状蛋白的结构功能特性及其工程化应用潜力 | 革兰氏阴性菌、线粒体和叶绿体中的跨膜β-桶状外膜蛋白(OMPs) | 结构生物学与合成生物学 | NA | 冷冻电镜(cryo-EM)、核磁共振(NMR)、分子动力学模拟(MD simulations)、AlphaFold | NA | 结构数据、生物化学数据 | NA | 理性蛋白质工程 | 革兰氏阴性菌、线粒体、叶绿体 | β-桶状蛋白支架的工程化改造 | 医学、合成生物学、纳米医学 |
| 9 | 2026-04-20 |
Natural Food Pigments: From Biosynthesis to Application
2026-Apr-09, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c05093
PMID:41954457
|
综述 | 本文综述了天然食品色素的生物合成、合成生物学策略、药理活性机制以及在医药、保健和化妆品中的应用进展 | 系统整合了天然色素的生物合成途径、合成生物学策略、药理活性机制及多领域应用,结合代谢工程、人工智能辅助筛选和生物传感等新兴技术,提出了从基础合成到高价值应用的跨学科发展路径 | NA | 探讨天然色素的生物合成、应用潜力及作为功能性色素在天然药物开发中的多重价值 | 天然食品色素,包括吡咯、类异戊二烯、醌类、酚类和甜菜碱等五大结构类别 | NA | NA | 代谢工程、人工智能辅助筛选、生物传感 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药、保健、化妆品 |
| 10 | 2026-04-20 |
Epigenetic Control of Toehold-Mediated Strand Displacement for Programmable Molecular Circuit Regulation and Enhanced microRNA Detection
2026-Apr-08, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.6c01658
PMID:41952075
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研究论文 | 本文提出了一种利用N-甲基腺苷(mA)表观遗传修饰调控DNA链置换反应动力学的方法,实现了对分子电路的可编程控制,并应用于microRNA检测 | 首次将单碱基表观遗传修饰(mA)引入DNA链置换的toehold区域,实现了对反应动力学的可编程和可逆调控 | 未明确说明该方法在其他类型核酸电路中的普适性限制 | 开发一种可编程调控DNA链置换反应动力学的方法,以增强分子电路的功能和检测性能 | DNA链置换反应、催化发夹组装电路、microRNA-21 | 合成生物学 | 癌症 | DNA链置换、表观遗传修饰(N-甲基腺苷)、去甲基化酶FTO调控 | NA | 分子反应动力学数据、细胞内成像数据 | NA | NA | NA | 表观遗传调控的DNA链置换电路、催化发夹组装电路 | 生物传感、分子计算、合成生物学 |
| 11 | 2026-04-20 |
Synthetic biology approaches to generate temperature-sensitive alleles for the Sterile Insect Technique
2026-Apr, Insect science
IF:2.9Q1
DOI:10.1111/1744-7917.70186
PMID:41178318
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综述 | 本文综述了利用合成生物学方法开发温度敏感等位基因以改进昆虫不育技术中雄性品系培育的策略 | 提出结合CRISPR/Cas基因组编辑、理性蛋白质设计及温度诱导型N-降解决定子/内含肽等合成生物学工具,创建新型非转基因遗传性别品系 | 在雄性决定基因座或染色体上整合和表达基因的技术尚未稳定建立,需要开发将温度敏感表型与雌性发育关联的额外策略 | 开发适用于昆虫不育技术的温度敏感遗传性别品系,实现环境友好的害虫防控 | 昆虫不育技术的目标物种 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas基因组编辑、理性蛋白质设计、温度诱导型N-降解决定子、温度敏感内含肽 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 昆虫(目标害虫物种) | 温度敏感等位基因设计、性别决定/剂量补偿基因靶向 | 农业 |
| 12 | 2026-04-20 |
Isolation, engineering and ecology of temperate phages from the human gut
2025-11, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09614-7
PMID:41094135
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研究论文 | 本研究从人类肠道细菌中分离、表征了134个可诱导的前噬菌体,并构建了一个合成微生物组,以探索温和噬菌体在肠道环境中的多样性和功能 | 通过大规模培养和诱导实验,首次系统性地扩展了人类肠道温和噬菌体的实验验证对,揭示了前噬菌体诱导的复杂机制和遗传多样性 | 研究中仅18%的计算预测前噬菌体能在纯培养中被诱导,表明现有预测方法存在局限性,且实验条件可能未完全模拟体内环境 | 研究人类肠道温和噬菌体的多样性、遗传特征及其与宿主细菌的相互作用机制 | 人类肠道细菌分离株中的可诱导前噬菌体 | 微生物学 | NA | 宏基因组学、数据挖掘、培养诱导实验、合成微生物组共培养 | NA | 基因组序列、培养实验数据 | 252个人类肠道细菌分离株 | 合成微生物组构建 | 人类肠道细菌(具体未指定)、Caco2人结肠细胞 | NA | 合成生物学、生物技术、微生物组研究 |
| 13 | 2026-04-20 |
Promiscuity of an Alcohol-Dependent Hemiterpene Pathway for the In Vivo Production of a Non-Natural Alkylated Tryptophan Derivative
2025-04-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00865
PMID:40134314
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研究论文 | 本文揭示了一种人工酒精依赖性半萜途径的广泛特异性,并展示了其在体内生产非天然烷基化色氨酸衍生物的能力 | 通过结合ADH模块和芳香族异戊二烯基转移酶的广泛特异性,首次在体内生产非天然烷基化色氨酸衍生物,扩展了异戊二烯类化合物的化学空间 | 未明确提及具体实验规模或下游酶应用的限制 | 研究人工酒精依赖性半萜途径的广泛特异性及其在异戊二烯生物合成中的应用 | ADH模块中的酸磷酸酶PhoN、异戊烯基激酶IPK和下游芳香族异戊二烯基转移酶 | 合成生物学 | NA | 体内生物合成途径工程 | NA | NA | NA | Gibson Assembly, BioBrick | E. coli | 酒精依赖性半萜途径,包括PhoN和IPK酶模块,用于生产烷基焦磷酸盐 | 工业生物技术 |
| 14 | 2026-04-20 |
Effective removal of Pb from industrial wastewater: A new approach to remove Pb from wastewater based on engineered yeast
2025-01-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2024.136516
PMID:39561540
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研究论文 | 本研究开发了一种基于工程酵母去除工业废水中铅的新方法,通过基因改造和工艺优化实现了低成本、高效率的铅去除 | 提出基于工程酵母生物调控机制的成本控制和工艺放大新技术方案,开发了低成本工程培养基,并采用响应面法优化工业培养系统 | 未明确说明工程酵母的长期稳定性、大规模应用中的生物安全性评估以及与其他重金属共存时的选择性 | 解决工程酵母在重金属污染治理中应用的高成本和工艺放大难题 | 工业废水中的铅污染 | 合成生物学 | NA | 基因敲除技术、响应面优化方法 | NA | 实验数据 | 铅酸电解液和工业含铅废水 | CRISPR-Cas9 | 酵母 | 通过敲除编码O-乙酰-L-高丝氨酸巯基酶的基因构建产硫化氢的工程酵母菌株 | 环境 |
| 15 | 2026-04-20 |
Development of a C18 Supercritical Fluid Chromatography-Tandem Mass Spectrometry Methodology for the Analysis of Very-Long-Chain Polyunsaturated Fatty Acid Lipid Matrices and Its Application to Fish Oil Substitutes Derived from Genetically Modified Oilseeds in the Aquaculture Sector
2020-Sep-08, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.0c02631
PMID:32923786
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研究论文 | 开发了一种基于C18超临界流体色谱-串联质谱的方法,用于分析含超长链多不饱和脂肪酸的复杂脂质基质,并将其应用于评估转基因油籽来源的鱼油替代品在鲑鱼养殖中的效果 | 首次将高强度的硅胶C18柱与超临界流体色谱-串联质谱联用,实现了对复杂脂质组中脂质类别的离散分离及同类别内异构体的选择性分析,特别适用于合成生物学改造产物的脂质组学研究 | 方法主要针对含超长链多不饱和脂肪酸的复杂脂质组,对于其他类型脂质基质的适用性未进行广泛验证 | 开发一种快速、环保且高效的脂质组学分析方法,用于评估转基因油籽来源的鱼油替代品在鲑鱼养殖中的营养效果 | 鲑鱼肉中的复杂脂质组,特别是含有18:3、20:5和22:6等超长链多不饱和脂肪酸的三酰甘油和磷脂 | NA | NA | 超临界流体色谱-串联质谱、主动扫描四极杆技术、数据非依赖性采集 | NA | 质谱数据 | 饲喂转基因油籽补充饲料的鲑鱼与对照饲料鲑鱼的肉质样本 | NA | 转基因油籽(陆地油籽作物) | NA | 农业、水产养殖、工业生物技术 |
| 16 | 2026-04-19 |
Deep learning revolutionizes protein research: Advances in structure prediction, functional annotation, and engineered design
2026-Jun, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2026.03.012
PMID:41839238
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综述 | 本文综述了深度学习如何通过连接蛋白质结构预测、功能注释和理性设计,形成一个协同循环,从而彻底改变蛋白质研究 | 提出了一个统一的“预测-理解-创造”范式,展示了深度学习在蛋白质科学中如何形成一个自我强化的循环,将结构预测、功能注释和从头设计紧密结合 | 在数据稀缺性、模型可解释性以及分布外泛化方面仍存在挑战 | 阐述深度学习如何变革蛋白质研究,并展示结构预测、功能注释和理性设计之间的协同循环 | 蛋白质,特别是单域球状蛋白质 | 机器学习 | NA | 深度学习,生成式AI,逆向折叠模型,冷冻电镜与AI集成 | 端到端深度学习模型(如AlphaFold2),多模态模型,生成式AI模型 | 3D坐标,序列数据,相互作用数据 | NA | NA | NA | NA | 药物开发,合成生物学 |
| 17 | 2026-04-19 |
RNA-templated diversity generation via reverse transcription and homologous recombination: an evolutionary hypothesis
2026-Apr-17, Theory in biosciences = Theorie in den Biowissenschaften
DOI:10.1007/s12064-026-00469-8
PMID:41995898
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研究论文 | 本文提出了一种名为“通过逆转录酶生成多样性”的互补机制,用于解释基因组多样化的新途径 | 提出DGbyRT机制,通过逆转录和同源重组整合RNA到基因组,偏向转录组已有区域,改变序列探索的统计分布 | NA | 探讨基因组多样化的进化机制,特别是基于RNA模板的逆转录和重组过程 | 细胞或外源RNA、逆转录酶、同源重组过程、转录的假基因和重复序列 | NA | NA | 逆转录、同源重组 | NA | NA | NA | AutoDiMe | NA | NA | NA |
| 18 | 2026-04-19 |
Microfluidic platforms for precision delivery of therapeutic cells in regenerative and personalized medicine
2026-Apr-02, Advanced drug delivery reviews
IF:15.2Q1
DOI:10.1016/j.addr.2026.115865
PMID:41935637
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综述 | 本文综述了微流控技术在再生与个性化医学中用于治疗性细胞精准递送的最新进展 | 强调了微流控平台如何通过精确操控流体、生物材料和细胞,改善细胞活力、定位精度和植入持久性,并结合CRISPR基因编辑与合成生物学开发“智能”治疗细胞 | 仍面临监管标准化、大规模生产和临床工作流程整合的挑战 | 推动精准再生医学的发展,解决治疗性细胞临床转化中的递送难题 | 间充质干细胞、诱导多能干细胞、工程化细胞构建体、CAR-T细胞等治疗性细胞 | NA | NA | 微流控技术、软光刻、热塑性塑料加工、3D打印、水凝胶集成、CRISPR基因组编辑 | NA | NA | NA | CRISPR | NA | NA | 医学 |
| 19 | 2026-04-19 |
A century of vitamin E research: The innovative journey from basic biology to synthetic bio-manufacturing
2026-Apr, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.70235
PMID:41866783
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综述 | 本文回顾了维生素E研究一个世纪以来的进展,从基础生物学到合成生物制造 | 揭示了种子特异性酯酶VTE7,建立了叶绿素降解与生育酚合成的直接联系,并探讨了合成生物学方法生产天然维生素E的新范式 | NA | 探索维生素E的化学组成、功能、生物合成途径及生产策略 | 维生素E及其生物活性分子 | NA | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物平台 | NA | 医药、工业生物技术 |
| 20 | 2026-04-19 |
Cell-in-Shell Metacells in Single-Cell Nanoencapsulation
2026-Apr, ChemPlusChem
IF:3.0Q2
DOI:10.1002/cplu.202500586
PMID:41999168
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概念报告 | 本文提出了“元细胞”这一新概念,用于定义一类具有动态功能、环境响应性和可编程行为的工程化活细胞-外壳系统 | 首次提出“元细胞”概念,并定义了其三个核心功能特征:可重构性、可负载性和运动性,为单细胞纳米封装领域建立了统一的概念框架 | 这是一篇概念性报告,尚未提供具体的实验验证或技术实现细节 | 为单细胞纳米封装技术建立统一的概念框架,推动其在先进疗法、微型机器人和交互式生物混合系统等领域的应用 | 单细胞纳米封装形成的细胞-外壳结构(元细胞) | 合成生物学 | NA | 单细胞纳米封装 | NA | NA | NA | NA | 活细胞 | NA | 医学, 微型机器人, 生物混合系统 |