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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-06-02 |
Eukaryotic cell-free protein synthesis: Chassis diversification, system engineering, and emerging applications
2026-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2026.04.022
PMID:42221684
|
综述 | 从系统工程角度全面综述和分析真核无细胞蛋白质合成系统的最新进展,涵盖底盘多样化、系统设计和新兴应用 | 从系统工程视角综合分析底盘多样化、核心反应组件理性设计,并探讨人工智能和合成生物学工具在突破标准化和成本瓶颈中的应用潜力 | 当前标准化和成本瓶颈仍阻碍工业化进程,需通过人工智能和合成生物学工具进一步优化 | 为构建经济、高通量的真核无细胞生物制造平台提供理论参考和实践指导 | 真核无细胞蛋白质合成系统 | NA | NA | 无细胞蛋白质合成 | NA | NA | NA | NA | 真核生物底盘 | NA | 人工细胞构建、生物电子接口开发、微阵列芯片设计 |
| 2 | 2026-06-02 |
Employing synthetic biology to modulate metabolic flux: Current strategies and applications
2026-Aug, Journal of bioscience and bioengineering
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.jbiosc.2026.03.012
PMID:42020273
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综述 | 本综述总结了代谢工程中用于调控代谢流的最新基因调控工具和策略及应用 | 根据中心法则的分子调控水平对工具进行分类,并讨论了尚未充分开发的潜在工具 | 未提供具体实验数据或比较分析,仅基于文献综述 | 总结代谢工程中的基因调控工具和策略,以促进可持续生物制造 | 细菌、古菌和真核生物中的多酶途径基因调控工具 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 细菌, 古菌, 真核生物 | 代谢调控回路,包括基因开关、振荡器、逻辑门、生物传感器、代谢途径 | 工业生物技术, 医药, 农业, 环境, 能源, 材料, 食品 |
| 3 | 2026-06-02 |
Enhanced tRNA array method version 2 for simultaneous in vitro synthesis of 21 tRNAs
2026-Aug, Journal of bioscience and bioengineering
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.jbiosc.2026.03.014
PMID:42025521
|
研究论文 | 开发了改进版tRNA阵列方法,实现21种tRNA的同步体外合成 | 通过序列修饰和引入前导序列,解决了原tRNA阵列方法中特定tRNA组限制翻译活性的问题 | NA | 提高tRNA阵列方法的翻译活性,使之与单独制备tRNA的性能相当 | tRNA阵列方法及翻译活性受限的tRNA组 | 合成生物学 | NA | 体外转录与翻译,序列修饰 | NA | NA | NA | NA | NA | tRNA阵列,包含前导序列的基因表达系统 | 合成生物学,生物技术 |
| 4 | 2026-06-02 |
Tailored base editing toolkits for functional genomics and metabolic engineering in the halophile Salinivibrio
2026-Aug, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2026.04.012
PMID:42031218
|
研究论文 | 开发了适用于嗜盐菌Salinivibrio的碱基编辑工具包,用于功能基因组学和代谢工程 | 首次在非模式嗜盐菌中开发高效的碱基编辑平台,实现单、双、三位点替换,以及新型融合蛋白实现协同双碱基编辑 | 未提及在更广泛嗜盐菌中的适用性或长期稳定性 | 开发高效遗传工具以促进嗜盐菌的工业应用 | 嗜盐菌Salinivibrio sp. TGB4 | 合成生物学 | NA | 碱基编辑 | NA | NA | NA | ABE, CBE, PmCDA-TadA8e-nCas9-UGI | Salinivibrio sp. TGB4 | 碱基编辑工具,包括腺嘌呤和胞嘧啶碱基编辑器及协同双碱基编辑器 | 工业生物技术 |
| 5 | 2026-06-02 |
Engineering AraC L9K for inducer-independent pBAD activation in Salmonella Gallinarum
2026-Aug, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2026.04.019
PMID:42061758
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研究论文 | 通过在肠炎沙门氏菌血清型鸡伤寒沙门氏菌中结合宿主基因组修饰和定点诱变,生成不依赖诱导剂的AraC变体L9K,实现pBAD启动子的组成型高表达 | 首次在沙门氏菌中通过L9K单点突变获得不依赖阿拉伯糖的AraC组成型激活变体,且与常用pBAD载体兼容,避免了代谢负担 | NA | 开发不依赖外源诱导剂的AraC-pBAD表达系统,用于微生物制造和合成生物学应用 | 肠炎沙门氏菌血清型鸡伤寒沙门氏菌 | 合成生物学 | NA | 定点诱变,基因敲除,结构建模 | NA | NA | NA | 靶向诱变 | 肠炎沙门氏菌血清型鸡伤寒沙门氏菌 | 不依赖诱导剂的组成型基因表达系统 | 工业生物技术,医学,合成生物学 |
| 6 | 2026-06-02 |
Synthetic biology-driven innovations in triple-negative breast cancer: Integrating engineering design with targeted therapeutics
2026-Aug, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2026.04.017
PMID:42082082
|
综述 | 综述合成生物学驱动的三阴性乳腺癌精准诊疗工程化策略 | 系统整合合成生物学与工程化设计原理,涵盖细胞工程、微生物工程和核酸工程三大类策略,并提出联合免疫肿瘤学与精准医学克服肿瘤异质性和耐药性的协同潜力 | 未提及具体临床转化障碍或体内验证数据,理论框架多于实验证据 | 总结合成生物学方法在三阴性乳腺癌中的最新进展,探索下一代自适应个性化治疗方案 | 三阴性乳腺癌(TNBC) | 合成生物学 | 三阴性乳腺癌 | 合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 哺乳动物细胞 | 基因回路 | 医学 |
| 7 | 2026-06-02 |
Sustainable production of natural sweeteners through synthetic biology
2026-Aug, Journal of bioscience and bioengineering
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.jbiosc.2026.04.001
PMID:42103513
|
综述 | 综述合成生物学在天然甜味剂可持续生产中的应用 | 系统总结了12种代表性天然甜味剂的代谢途径和微生物合成方法,分析不同合成方案的优缺点及核心技术瓶颈 | 未提供具体实验数据或定量比较 | 为天然甜味剂的工业优化和生产提供理论支持和技术参考 | 12种代表性天然甜味剂(包括甜蛋白、萜类糖苷、黄酮类、多元醇和单糖) | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 代谢工程,酶工程 | 微生物细胞工厂 | 代谢通路 | 食品 |
| 8 | 2026-06-02 |
Powering next-generation precision therapeutics through integrated synthetic transcriptional systems
2026-May-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2026.117308
PMID:42035420
|
综述 | 综述整合合成转录系统在精准治疗中的应用进展,涵盖启动子工程、模块化转录因子设计和人工智能辅助的理性设计 | 从经验试错转向理性预测设计,通过人工智能辅助实现了合成启动子和转录因子的协同整合,支持多输入感知、可调表达和高正交性 | 未明确讨论系统在体内应用的长期稳定性和免疫原性等潜在问题 | 推动合成转录系统在哺乳动物精准治疗中的应用,增强治疗精确性并减少脱靶效应 | 合成启动子与合成转录因子的整合系统 | 合成生物学 | 复杂疾病 | 合成生物学技术 | NA | NA | NA | NA | 哺乳动物细胞 | 逻辑门、反馈回路、可调系统 | 医学 |
| 9 | 2026-06-02 |
Phenazine-Based Synthetic Biology to Signal Between Cells and Electrodes
2026-May, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.70169
PMID:41653016
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研究论文 | 开发了一种基于吩嗪的模块化系统,实现电子设备与工程菌群之间的双向氧化还原通信 | 利用吩嗪修饰和模块化通信通道设计,首次实现使用商用电极进行电子设备与生物系统间的双向氧化还原信号传递 | NA | 建立电子设备与活体系统之间无缝通信的生物电子系统,特别是通过吩嗪基氧化还原信号实现双向通信 | 工程化细菌群体、吩嗪生物合成系统、商业电极 | 合成生物学 | NA | 电化学检测、吩嗪生物合成、氧化还原信号 | NA | 电化学信号、生物信号 | NA | NA | 大肠杆菌 | 模块化通信通道,包括电子信号编码(过氧化氢激活)、生物信号传输(PhzF调控的吩嗪合成)、双域信号接收(SoxRS响应电路和电化学检测)、可控噪声(吩嗪降解酶) | 环境监测、适应性生物制造、响应性生物医学设备 |
| 10 | 2026-06-02 |
Prolyl hydroxylase-dependent proteolysis enables the orthogonal hypoxia responses in plants
2026-Apr-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71366-3
PMID:41957032
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research paper | 本文通过合成生物学方法在拟南芥中构建了一个三组分系统,实现氧依赖的蛋白质降解,从而探究植物和动物缺氧反应机制的差异 | 首次利用合成生物学设计三组分系统来模拟动物的氧感知机制于植物中,揭示了植物与动物在缺氧反应中的潜在保守性机制 | 系统中仅部分恢复了缺氧诱导突变体的响应能力,表明该机制在植物中可能不完全替代自然途径 | 探究植物和动物是否通过相同的分子机制应对缺氧胁迫,并开发作物改良工具 | 拟南芥(Arabidopsis thaliana) | 植物生物学、合成生物学 | NA | 合成生物学、蛋白质降解系统 | NA | NA | NA | NA | 拟南芥 | 三组分氧依赖蛋白质降解系统 | 农业 |
| 11 | 2026-06-02 |
From Cellular Organization to Synthetic Platforms: Liquid-Liquid Phase Separation as a Framework for Functional Biomolecular Condensates
2026-01-14, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.5c20923
PMID:41480717
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综述 | 综述了液-液相分离驱动生物分子凝聚体形成的分子机制、设计策略及其在合成生物学中的转化前景 | 将液-液相分离原理从细胞组织引申至合成平台,系统归纳了利用内在无序蛋白、模块化互作基序和RNA支架设计功能性凝聚体的策略 | 未涉及合成凝聚体在体内复杂环境中的长期稳定性及潜在脱靶效应 | 总结液-液相分离介导的凝聚体分子机制与工程设计方法,促进细胞生物物理学与生物工程的交叉研究 | 液-液相分离形成的生物分子凝聚体 | 合成生物学 | NA | 液-液相分离 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | NA | 合成凝聚体(用于增强催化、代谢控制、靶向药物递送和生物传感) | 医学, 工业生物技术 |
| 12 | 2026-06-02 |
Chemically synthesized high-fidelity oligos ≤ 600 nt as building blocks to accelerate complex gene construction in synthetic biology
2026, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysag005
PMID:42222009
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研究论文 | 报道一种名为UCOS的新型平台,用于高效合成长度≤600个核苷酸、具有复杂重复序列和碱基分布不均特征的高保真寡核苷酸 | 采用非多孔硅微球替代传统可控孔玻璃作为固相载体,结合5'侧翼序列杂交的全长富集和错误去除酶,显著提升复杂超长寡核苷酸的合成保真度 | NA | 开发能够高效合成复杂、超长DNA片段的方法,以支持合成生物学和基因工程应用 | 超长复杂寡核苷酸(≤600 nt),包括串联重复序列和碱基分布不均的序列 | 合成生物学 | NA | UCOS(超长复杂寡核苷酸合成) | NA | DNA序列 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、代谢工程、合成基因组学 |
| 13 | 2026-06-02 |
Evolution shapes and conserves genomic signatures in viruses
2024-10-30, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-07098-1
PMID:39478059
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研究论文 | 研究了2,768种真核病毒基因组的特征,揭示病毒基因组签名的特异性及其与宿主的关系 | 首次大规模系统分析病毒基因组签名,发现多数病毒具有高度特异性签名,且物种间差异显著,同时揭示了病毒与宿主基因组签名的差异及其进化选择压力 | NA | 探究病毒基因组签名的存在性、特异性及其在病毒基因组进化中的依赖性和选择性压力 | 来自105个病毒科的2,768种真核病毒 | 机器学习 | NA | NA | NA | 基因组序列 | 2,768种真核病毒物种 | NA | 真核宿主细胞 | NA | 医学, 合成生物学 |
| 14 | 2026-06-02 |
Revisiting the current and emerging concepts of postharvest fresh fruit and vegetable pathology for next-generation antifungal technologies
2024-07, Comprehensive reviews in food science and food safety
IF:12.0Q1
DOI:10.1111/1541-4337.13397
PMID:38924311
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综述 | 回顾当前和新兴的采后鲜果蔬菜病理学概念,为下一代抗真菌技术提供方向 | 提出基于微生物组和病理生物组的新概念,并强调利用合成生物学、sRNA技术、噬菌体、群体感应和群体猝灭策略等前沿技术调控微生物组以控制感染 | 未明确讨论这些新兴技术的实际应用挑战、成本效益或规模化可行性 | 探索采后鲜果蔬菜真菌感染控制的新策略,提升食品安全性 | 采后鲜果蔬菜及其微生物组和病理生物组 | 机器学习、数字农业 | 真菌感染相关疾病(如霉菌毒素中毒) | 基因组技术、小RNA技术、群体感应、群体猝灭、合成生物学 | 深度学习 | 基因组数据、数据库信息、微生物组数据 | NA | CRISPR-Cas9、合成生物学工具 | 鲜果蔬菜(如水果和蔬菜) | NA | 农业、食品 |
| 15 | 2026-06-02 |
Self-Assembly of Heterogeneous Ferritin Nanocages for Tumor Uptake and Penetration
2024-05, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202309271
PMID:38368258
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研究论文 | 利用合成生物学策略在埃希氏大肠杆菌中构建铁蛋白装配工具箱系统,实现异质铁蛋白纳米笼的可控自组装,并研究其肿瘤摄取和穿透能力 | 首次采用合成生物学方法制造均匀可重复的蛋白质纳米颗粒,通过铁蛋白亚基/变体的胞内组装实现异质组分精准调控,揭示了纳米颗粒配体密度与肿瘤靶向/穿透之间的关系 | NA | 探究纳米颗粒异质性在决定其在生物系统中命运的重要性,特别是配体密度对肿瘤靶向和穿透的影响 | 异质铁蛋白纳米笼(FHn),由人铁蛋白重链(FH)和轻链组成,在埃希氏大肠杆菌中组装 | 合成生物学 | 肿瘤 | 合成生物学装配、铁蛋白亚基组装、体内组装系统 | NA | NA | NA | 合成生物学工具箱 | 埃希氏大肠杆菌 | 铁蛋白装配工具箱系统,用于异质纳米笼的自组装 | 医学 |
| 16 | 2026-06-02 |
Genetic Engineering and Rebooting of Bacteriophages in L-Form Bacteria
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3523-0_16
PMID:38066374
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研究论文 | 本文详细介绍了在L型细菌中通过基因工程改造和重启噬菌体的方法 | 提出利用细胞壁缺陷的L型细菌作为宿主,以激活感染革兰氏阳性菌的合成噬菌体基因组,克服了传统转化革兰氏阳性菌的困难 | NA | 开发新型无标记基因组编辑方法,促进治疗性噬菌体的工程化改造 | 噬菌体的基因工程改造和重启技术 | 合成生物学 | 感染性疾病 | 基因工程、噬菌体基因组合成与重启 | NA | NA | NA | 合成生物学方法 | L型细菌(细胞壁缺陷)、革兰氏阳性菌 | NA | 医学(噬菌体疗法) |
| 17 | 2026-06-02 |
Synthetic Biology to Engineer Bacteriophage Genomes
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3523-0_17
PMID:38066375
|
研究论文 | 本文综述了合成生物学领域中用于工程化噬菌体基因组的两种主要策略:噬菌体电穿孔重组工程和酵母为基础的噬菌体工程平台 | 系统比较了两种成功用于遗传改造噬菌体基因组的新技术,突出了合成生物学在开发具有新功能的专用噬菌体方面的进展 | 未说明 | 介绍并比较用于基因工程噬菌体基因组的技术策略 | 噬菌体基因组 | 合成生物学 | NA | BRED、酵母为基础的噬菌体工程 | NA | NA | NA | BRED、酵母工程平台 | 噬菌体、酵母 | NA | 病原体控制与检测、靶向药物递送、新材料组装 |
| 18 | 2026-06-02 |
Construction of stable microbial consortia for effective biochemical synthesis
2023-11, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2023.05.008
PMID:37330325
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综述 | 综述了通过合成生物学和代谢工程技术构建稳定微生物联合体以有效生产化学品的进展 | 系统总结了控制微生物共培养中社会互作用的策略,包括底物分离、副产物消除、交叉喂养和群体感应电路设计,并提出了跨学科方法提高联合体稳定性 | 未涉及实际工业应用中微生物联合体的长期稳定性验证 | 探讨构建稳定微生物联合体的设计原则,以增强化学品生产 | 微生物联合体 | 合成生物学, 代谢工程 | NA | 合成生物学, 代谢工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 多种微生物(如大肠杆菌、酿酒酵母等) | 群体感应电路 | 工业生物技术 |
| 19 | 2026-06-01 |
Advances in biocontainment strategies of engineered microbes for use in humans
2026-Jun, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2026.102727
PMID:41780106
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综述 | 综述了用于人体的工程微生物的生物防护策略 | 综合讨论了多种生物防护策略及其在临床试验中的使用和效果 | 未涉及标准化测试的具体实施细节 | 讨论用于生物医学应用的工程微生物的生物防护策略现状 | 工程微生物及其生物防护策略 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 非标准氨基酸 | 微生物 | 毒素-抗毒素系统、自杀开关、营养缺陷型、基于CRISPR的靶向DNA降解、物理屏障 | 医学 |
| 20 | 2026-06-01 |
Repurposing bacterial secretion systems for the design of living therapeutics
2026-Jun, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2026.102726
PMID:41780105
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综述 | 本文综述了利用细菌分泌系统改造共生和益生菌以设计活体治疗药物的方法 | 系统比较了不同细菌分泌系统在工程化治疗蛋白递送中的优缺点,并聚焦于通过合成生物学改造革兰氏阴性菌以绕过其复杂外膜屏障的策略 | 部分分泌系统来源于病原菌,可能存在安全性和生物相容性方面的局限性 | 开发基于工程化细菌的靶向治疗蛋白递送系统以解决药物全身副作用问题 | 大肠杆菌等共生和益生菌的分泌系统及治疗蛋白载荷 | 合成生物学 | 炎症性肠病 | 细菌分泌系统工程 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌 | 分泌系统与治疗蛋白载荷的工程化整合,包括转录调控通路 | 医学 |