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当前共找到 5535 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-08-18 |
Advances, challenges, and opportunities in engineering C5 and C6 sugar transporters in yeast for bio-based industrial biotechnology
2026-Sep, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2026.2680416
PMID:42386498
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综述 | 本文综述了酵母中C5和C6糖转运蛋白工程化的进展、挑战和机遇，以推动生物基工业生物技术发展。 | 总结了C5糖转运的关键瓶颈，并重点介绍了理性蛋白工程、定向进化和机器学习等策略在扩展C5转运蛋白库和优化转运效率方面的最新突破。 | 未详细讨论C6糖转运的具体机制及全部工程化案例（根据摘要推断）。 | 促进酵母高效转化戊糖（D-木糖和L-阿拉伯糖），实现可持续的生物基生产。 | 酵母中的D-木糖和L-阿拉伯糖转运蛋白 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 酵母 | NA | 工业生物技术 |
| 2 | 2026-08-18 |
Fluorescent-Activating Proteins Manipulate Self-Assembly Peptides Trafficking and Intracellular Distribution
2026-Aug-17, ACS applied bio materials
IF:4.6Q2
DOI:10.1021/acsabm.6c00950
PMID:42606054
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研究论文 | 本文报道了一种结合孔雀石绿的自组装肽系统，该系统与荧光激活蛋白相互作用，能够精确调控肽在细胞内的运输和分布，从而逃避溶酶体降解 | 通过利用荧光激活蛋白的特异性结合特性，实现了对肽亚细胞定位的动态调控，具有时空控制肽聚集和分解的能力，为药物递送和合成生物学提供了新工具 | 摘要未明确提及局限性 | 开发一种能够精确调控细胞内肽运输和分布的自组装肽系统，以避免溶酶体降解并实现靶向递送 | 自组装肽与孔雀石绿的结合物及其与荧光激活蛋白的相互作用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 图像（共聚焦成像） | NA | NA | NA | 自组装肽-孔雀石绿系统与荧光激活蛋白的相互作用电路 | 药物递送、合成生物学 |
| 3 | 2026-08-18 |
Exploring rare coumarins biosynthesis by Gloeophyllum trabeum: an integrated computational genomics, molecular docking and spectroscopic approach
2026-Aug-14, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-026-05181-9
PMID:42599545
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研究论文 | 该研究通过整合计算基因组学、分子对接和波谱分析，探索了木材腐朽真菌Gloeophyllum trabeum合成罕见香豆素类化合物的能力，并鉴定出具有抗菌活性的新化合物 | 首次系统研究了Gloeophyllum trabeum合成罕见香豆素类化合物的能力，结合基因组挖掘和分子对接揭示了其生物合成基因簇，并鉴定出四种新的聚酮类化合物，其中oosponol展现出对Moraxella catarrhalis UspA1蛋白的强亲和力 | 化合物1的结构仅为初步鉴定，且所发现的化合物目前无法商业化获取，其抗菌活性机制和体内效果仍需进一步验证 | 探索Gloeophyllum trabeum合成罕见香豆素类化合物的潜力，为开发新型抗生素提供候选化合物 | Gloeophyllum trabeum真菌及其产生的香豆素类化合物 | 计算基因组学、分子对接、微生物学 | 细菌感染 | LC-MS、2-D NMR、基因组挖掘、分子对接、平板覆盖生物测定 | NA | 基因序列、光谱数据、对接评分 | 一种真菌（Gloeophyllum trabeum）及其培养滤液，对抗三种微生物（E. coli, S. cerevisiae, B. subtilis） | NA | Gloeophyllum trabeum | NA | 医学、工业生物技术 |
| 4 | 2026-08-18 |
A dual-dimensional CRISPR toolkit enables one-step high-efficiency multiplex genome editing in Komagataella phaffii
2026-Aug-13, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2026.102525
PMID:42595042
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研究论文 | 本研究建立了高效的CRISPR工具EMGES 3.0，在Komagataella phaffii中实现一步法多重基因编辑和长片段整合，用于绿色生物制造和C1利用 | 首次在K. phaffii中实现超长片段(>16 kb)的一步整合，并达到14.8%的效率 | 超长片段整合效率相对较低，且实验在特定菌株中验证，可能需要进一步优化以广泛适用 | 提升K. phaffii的基因编辑效率和简化复杂代谢途径重构过程，以促进C1基生物经济工业化 | Komagataella phaffii菌株及其工程改造 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 基因编辑效率数据、代谢产物产量数据 | 本研究使用了多种基因编辑实验，但具体样本数量未在摘要中说明 | CRISPR-Cas9 | Komagataella phaffii | 双锤头核酶-sgRNA-丁型肝炎病毒核酶(dHgH)介导的sgRNA表达系统及多重基因敲除与长片段整合电路 | 工业生物技术, 绿色生物制造 |
| 5 | 2026-08-18 |
Mitochondria as programmable redox rheostats: Advancing from transplantation to bioengineered organelle therapeutics
2026-Aug-04, Redox biology
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.redox.2026.104338
PMID:42567043
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综述 | 本文综述了线粒体从移植到生物工程化细胞器治疗的转变，强调线粒体作为可编程的氧化还原变阻器在疾病治疗中的潜力 | 提出了将线粒体视为可编程治疗单元而非静态载体的新观点，整合合成生物学、纳米医学和生物材料原理进行线粒体工程改造 | 未具体说明临床试验中的挑战和解决方案，如长期安全性、免疫原性等问题 | 探讨线粒体工程化策略及其在疾病治疗中的应用前景，以及从移植到工程化治疗的转变 | 线粒体及其功能障碍相关疾病，如缺血再灌注损伤、神经退行性疾病和代谢综合征 | 合成生物学、纳米医学、生物材料 | 缺血再灌注损伤、神经退行性疾病、代谢综合征 | 线粒体移植、表面功能化、基因调控、递送平台（如融合胶囊、光热纳米刀） | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 医学 |
| 6 | 2026-08-18 |
PlantGFM: A Genomic Foundation Model for Discovery and Creation of Plant Genes
2026-Aug, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.75772
PMID:42160034
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研究论文 | 介绍PlantGFM，一种基于Hyena算子的植物基因组基础模型，预训练于12种植物共108.4亿个核苷酸，支持长上下文预测和序列生成，并展示了其在植物基因发现和从头设计中的应用 | 首次在植物中展示了大语言模型生成序列的DNA-RNA-蛋白质表达，通过AI-人类知识融合筛选管线设计并验证了新型植物基因候选，具有生成植物NLR基因的涌现能力 | 未提及具体限制，但可能依赖于预训练和微调数据的代表性，以及生成基因在自然环境中的功能验证不足 | 利用基因组基础模型实现植物基因的发现与从头设计，以支持植物合成生物学和AI辅助育种 | 12种植物物种的基因组序列，以及10个注释的植物基因组用于微调 | 机器学习 | NA | 基因组测序（核苷酸序列） | Hyena算子，基因组基础模型 | 基因序列 | 12种植物物种，108.4亿个核苷酸；10个注释的植物基因组；7个候选基因在烟草中验证 | NA | 烟草（Nicotiana benthamiana） | NA | 农业, 合成生物学 |
| 7 | 2026-08-18 |
Deep Learning Predicts Dissimilar DNA-DNA Binding and Engineers Hyperconnected Networks
2026-Jul-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-75395-w
PMID:42426013
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研究论文 | 开发了深度学习模型BINND，用于预测DNA-DNA非正交结合，并通过超高通量平台验证其准确性，展示了在合成生物学中利用全序列空间的潜力 | 首次提出利用非正交相互作用而非避免它们，结合超高通量测量与深度学习模型，实现了超过80%的预测准确性和比现有模型快50倍的速度 | 未明确说明限制，但可能包括模型依赖特定序列集和实验条件，以及泛化能力在更复杂生物系统中的不确定性 | 利用DNA-DNA相互作用作为测试平台，开发准确且快速的模型来预测非正交相互作用，以支持合成生物学中的全序列空间利用 | DNA-DNA相互作用，包括多样序列和非特异性结合 | 机器学习 | NA | 超高通量测序、深度学习 | 神经网络（BINND） | 序列数据 | 数百万个相互作用 | NA | NA | NA | 生物工程、合成生物学、DNA纳米技术 |
| 8 | 2026-08-18 |
Tangled Tail of Mechanically Interlocked Peptides
2026-07-08, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.6c05395
PMID:42334221
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综述 | 本文综述了机械互锁肽（MIPs）在自然界中的发现及化学合成进展，并提出了统一命名法，以促进分子生物学与超分子化学领域的融合。 | 首次系统比较自然界存在的机械互锁生物分子与化学合成的肽基机械互锁分子，并提出统一的命名法，为跨学科研究奠定基础。 | 未提及具体实验数据或量化分析，可能缺乏对实际应用挑战的深入讨论。 | 综述机械互锁肽的研究现状，建立统一命名法，并促进生物学与化学领域的跨学科合作。 | 自然界存在的机械互锁生物分子（如连环DNA、HK97噬菌体衣壳蛋白）及化学合成的机械互锁肽。 | 化学生物学，合成生物学 | NA | NA | NA | 文本，综述数据 | NA | NA | NA | 机械互锁肽结构（如连环肽、链甲结构） | 基础研究，化学生物学 |
| 9 | 2026-08-18 |
A portable Cas6f-based system for multiplex translational repression in bacteria
2026-Jul-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-75135-0
PMID:42420316
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研究论文 | 本文介绍了一种基于Cas6f的紧凑型系统MORTISE，用于革兰氏阴性细菌中的多重翻译抑制，不依赖宿主Hfq或RNase，并在大肠杆菌和恶臭假单胞菌中验证了功能 | 提出了一种无需宿主因子、紧凑的Cas6f平台MORTISE，可实现多重翻译抑制，性能优于现有工具，且支持单启动子多重敲低和九位点一步组装 | 本文未明确提及局限性 | 开发一种可移植、可调、多重的基因抑制工具，用于合成生物学中的代谢工程和多重调控 | 大肠杆菌和恶臭假单胞菌中的基因表达调控 | 合成生物学 | NA | 染色体报告基因检测 | NA | 基因组数据 | 未明确 | Cas6f | 大肠杆菌, 恶臭假单胞菌 | 翻译抑制系统MORTISE | 工业生物技术 |
| 10 | 2026-08-18 |
Omics Technologies-Driven Research and Applications of Synthetic Biology
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-5264-0_16
PMID:42108303
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综述 | 本文系统阐述了整合多组学、空间组学和培养组学如何为合成生物学提供全链条解决方案，涵盖功能预测、动态调控、功能验证和群落构建，并推动其在生物制造、环境修复和医疗健康等领域的应用 | 提出整合多组学、空间组学和培养组学的全链条策略，以解决合成生物学中功能稳定性差、代谢通路适应性不足和自然微生态模拟困难等关键挑战 | 未明确讨论具体实验验证或技术局限性，内容偏向概念性综述 | 探讨组学技术如何驱动合成生物学的研究与应用，实现组学与合成生物学的深度融合 | 合成生物系统，包括合成菌群、底盘菌株和自然微生态系统 | 合成生物学 | NA | 组学技术（多组学、空间组学、培养组学） | NA | 文本、组学数据 | NA | NA | NA | 代谢通路优化 | 生物制造、环境修复、医疗健康 |
| 11 | 2026-08-18 |
Current status and future perspectives of multi-modal bacteria-based cancer therapies
2025-10, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70485
PMID:41121752
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综述 | 本文综述了基于细菌的多模式癌症治疗方法的当前状况和未来前景，重点探讨细菌的肿瘤靶向机制、免疫调节功能及其作为药物递送平台的潜力。 | 系统总结了基因工程和纳米生物技术在细菌介导的癌症治疗中的整合，提出了多模式协同治疗策略，并展望了人工智能在优化合成生物学设计和预测细菌-宿主相互作用中的应用。 | 未明确指出具体的临床前或临床研究局限性，可能包括细菌治疗的毒性、安全性和临床转化挑战。 | 探讨细菌在肿瘤治疗中的应用，特别是其肿瘤靶向性、免疫调节功能以及作为多效应协同治疗平台的潜力。 | 细菌作为癌症治疗载体，以及其与免疫治疗、光动力治疗、声动力治疗等方法的组合应用。 | 癌症治疗，合成生物学，纳米技术 | 癌症 | 基因工程，纳米技术 | NA | 临床前研究数据，临床进展 | NA | 基因工程 | 细菌 | 基因线路，用于增强肿瘤特异性和治疗效果的合成生物学设计 | 医学 |
| 12 | 2026-08-17 |
Automated synthetic cell-based screening for designed proteins with emergent functions
2026-Aug-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-76787-8
PMID:42603823
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研究论文 | 本文介绍了PUREdrop平台，一种自动化微流控系统，用于在合成细胞中筛选具有涌现功能的蛋白质库 | PUREdrop平台首次将无细胞表达和微流控技术结合，实现高通量筛选蛋白质库的涌现功能，如时空自组织 | 摘要未提及局限性 | 加速蛋白质工程中复杂功能的筛选，推动自下而上合成生物学的发展 | 细菌细胞分裂蛋白FtsZ及其计算重设计变体，以及FtsZ的通用蛋白调节因子 | 合成生物学 | NA | 微流控、无细胞表达 | NA | 图像 | 每个构建体数千个皮升级合成细胞 | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 13 | 2026-08-17 |
Chemical Synthesis of Mirror-Image Proteins Reveals Chirality-Dependent Cellular Uptake Mediated by a Cell-Penetrating Peptide
2026-Aug-12, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.6c03792
PMID:42307060
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研究论文 | 通过化学合成镜像蛋白，揭示了细胞穿透肽介导的细胞摄取具有手性依赖性。 | 首次系统地研究了货物手性对细胞摄取效率的影响，同时保持递送载体恒定，直接评估手性在跨膜转运中的作用。 | 研究仅使用了特定的细胞穿透肽和细胞系，未涵盖所有可能的生物学环境，且未深入探讨手性效应的分子机制。 | 探究镜像蛋白在细胞穿透肽递送中的摄取效率与手性之间的关系。 | L-和D-构型的三种模型货物（尺寸和结构复杂度递增）与相同的环状十精氨酸细胞穿透肽结合。 | 化学生物学 | 不适用 | 化学合成 | 不适用 | 流式细胞术数据、凝胶分析图像、共聚焦显微镜图像 | 多种哺乳动物细胞系（具体数量未提供） | 不适用 | 哺乳动物细胞 | 不适用 | 医学、合成生物学 |
| 14 | 2026-08-17 |
A high-throughput heterologous expression platform for plant synthetic biology based on Arabidopsis suspension cells
2026-Jul-10, Journal of experimental botany
IF:5.6Q1
DOI:10.1093/jxb/eraf545
PMID:41432110
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研究论文 | 本文建立了一种基于拟南芥悬浮细胞的高通量异源表达平台，用于植物合成生物学中复杂多基因途径的工程化。 | 该平台无需特殊设备或耗材，兼容多种细胞系，可在两周内快速生成100克转基因细胞，并支持单构建体中至少六个基因的堆叠表达。 | 摘要中未提及明确的局限性。 | 开发一种高效、可扩展的异源表达平台，以加速植物合成生物学的设计-构建-测试循环，并应对生物固氮等重大生物技术挑战。 | 拟南芥悬浮细胞，以及固氮酶铁钼辅因子成熟酶NifB的同源物。 | 合成生物学 | NA | 植物细胞包浸润转化，瞬态和稳定转化 | NA | 基因表达数据 | 未具体说明样本数量，涉及多个细胞系和NifB同源物文库。 | NA | 拟南芥（悬浮细胞） | 多基因堆叠表达系统，包含氮酶模块成分NifU, NifS, FdxN和NifB。 | 农业，工业生物技术 |
| 15 | 2026-08-16 |
Harnessing yeast for polyhydroxyalkanoates (PHAs) production: Challenges, engineering strategies, and future prospects
2026-Aug-07, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.153992
PMID:42567388
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综述 | 本文综述了酵母菌生产聚羟基脂肪酸酯（PHAs）的现状、挑战、工程策略及未来前景，重点涵盖野生酵母和工程化酵母的产量提升方法 | 总结了利用酵母作为替代宿主生产PHAs的独特优势，包括抗逆性、GRAS状态、底物利用多样性和亚细胞区室环境，并系统分析了多种合成生物学和代谢工程策略的优缺点 | 指出了酵母基PHAs生产的知识空白，并解释了其相对于其他微生物来源的局限性 | 评估酵母菌作为PHAs生产宿主的可行性，并探讨提高产量的工程策略 | 野生酵母菌株和工程化酵母菌株 | 合成生物学, 代谢工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 酵母菌 | PHAs生物合成途径、竞争途径敲除、代谢工程前体供应、可再生原料利用 | 环境, 工业生物技术 |
| 16 | 2026-08-16 |
bHLH Family Transcription Factors: Molecular Switches in Plant Specialized Metabolism
2026-Aug-03, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells15151400
PMID:42587808
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综述 | 本文综述了碱性螺旋-环-螺旋（bHLH）转录因子作为植物特殊代谢调控开关的作用，重点探讨了茉莉酸-JAZ-MYC模块及其在多种植物代谢途径中的调控机制 | 采用直接-级联-杂交框架整合启动子语法、空间能力、储存解剖结构和证据层次，区别于以途径或MYC2为中心的现有综述 | 未提供具体的实验数据或量化分析，为定性综述 | 系统阐述bHLH转录因子在植物特殊代谢中的调控机制，并提出工程应用策略 | bHLH转录因子、植物特殊代谢物（如萜类、生物碱、苯丙烷类、黄酮类等）及其相关调控模块 | 植物分子生物学 | NA | 多组学引导的因子发现 | NA | 文献数据 | NA | NA | 拟南芥、红豆杉、青蒿、长春花、丹参、银杏、水稻、棉花 | 茉莉酸-JAZ-MYC调控模块 | 农业、医药、合成生物学 |
| 17 | 2026-08-16 |
Fructans and Fructooligosaccharides in Plants and Fruits: Metabolism, Functional Roles, and Emerging Biotechnological Opportunities
2026-Jul-30, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules31152656
PMID:42588504
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综述 | 本文综述了植物和水果中果聚糖和低聚果糖的代谢、功能作用及新兴生物技术机遇 | 重点关注水果中果聚糖的未充分探索领域，并整合了最新的生物技术策略如代谢工程和合成生物学 | 未提及 | 提供果聚糖和低聚果糖代谢的更新概述，并探讨其在植物生理和人类营养中的双重作用及生物技术应用机会 | 植物和水果中的果聚糖和低聚果糖 | 植物生物学、代谢工程 | 不适用 | 育种、代谢工程、合成生物学 | 不适用 | 文献数据 | 不适用 | 育种、代谢工程、合成生物学 | 植物 | 果聚糖生物合成途径 | 食品、营养保健品、农业 |
| 18 | 2026-08-16 |
Mechanism of Terpene Formation in Pogostemon cablin cv. Jing Huoxiang Revealed by Metabolome and Transcriptome Analysis
2026-Jul-30, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27156836
PMID:42589492
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研究论文 | 通过代谢组和转录组分析揭示了荆广藿香不同组织中萜类化合物的形成机制，特别是根中多环倍半萜的积累和生物合成调控 | 首次系统研究了广藿香地下部分（根）中倍半萜的生物合成，整合代谢组和转录组数据，并揭示了根特异积累的多环倍半萜及其调控网络 | 未提及 | 阐明荆广藿香不同组织中萜类化合物的生物合成机制，特别是根中多环倍半萜的积累和调控网络 | 荆广藿香（Pogostemon cablin cv. Jing Huoxiang）的根、茎、叶、花和腺毛 | 植物代谢组学与转录组学 | NA | GC-MS, 转录组测序, 生物信息学分析, 共表达网络分析 | NA | 代谢组数据, 转录组数据 | 未明确样本数量，涉及根、茎、叶、花和腺毛五种组织 | NA | 荆广藿香（Pogostemon cablin cv. Jing Huoxiang） | NA | 医药, 香料, 生物燃料 |
| 19 | 2026-08-16 |
Cyanobacterial Circadian Clock: Molecular Mechanisms and Physiological Outputs
2026-Jul-27, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants15152293
PMID:42588797
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综述 | 本文综述了蓝藻生物钟的分子机制、生理输出及其在进化上的意义 | 挑战了原核生物仅被动响应环境信号的假设，展示了不依赖转录-翻译反馈的蛋白质振荡器，并提供了对生物钟进化逻辑的独特见解 | 未明确提及具体局限性，但指出了包括振荡器与细胞周期耦合、生态型功能分化和群落水平作用等未解问题 | 总结蓝藻生物钟研究进展，阐明其分子基础、输入输出网络及生理协调机制，为合成生物学和生物计时原理提供基础 | 蓝藻的生物钟系统，特别是KaiA、KaiB和KaiC蛋白振荡器 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 蓝藻 | KaiABC蛋白振荡器 | 合成生物学, 生物技术 |
| 20 | 2026-08-16 |
Genome-Wide Identification and Functional Verification of Core Berberine Bridge-like Enzyme Genes for Benzylisoquinoline Alkaloid Biosynthesis in Corydalis saxicola Bunting
2026-Jul-27, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27156708
PMID:42589364
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研究论文 | 对岩黄连中参与苄基异喹啉生物碱生物合成的核心小檗碱桥酶样基因进行了全基因组鉴定与功能验证 | 首次对岩黄连的BBE基因家族进行全面的功能基因组学分析，并通过体外酶学实验证实了候选基因催化特定底物生成脱氢卡维丁和药根碱的氧化酶活性 | 未明确说明研究的局限性 | 鉴定和功能验证岩黄连中参与苄基异喹啉生物碱生物合成的核心BBE样基因，为种质保护和合成生物学改良奠定基础 | 岩黄连中的小檗碱桥酶样基因家族 | 基因组学 | NA | 全基因组分析、系统发育分析、表达分析、蛋白质结构预测、分子对接、体外酶学实验 | NA | 基因组序列、基因表达数据、蛋白质结构数据 | 从岩黄连基因组中鉴定出22个BBE家族成员 | NA | NA | NA | 医药 |