合成生物学相关文章

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当前共找到 5691 篇文献,本页显示第 1 - 20 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 工程工具 宿主生物 回路设计 应用领域
1 2026-09-18
Bacterial Laccase: Recent Advances in Production, Engineering Strategies, and Diagnostic Applications
2026-Oct, Biotechnology and bioengineering IF:3.5Q2
综述 本文综述了细菌漆酶在近十年的生产、蛋白质工程策略及诊断应用方面的研究进展 整合了超过120篇同行评审论文,系统评估了细菌漆酶从实验室研究到环境监测、工业加工和医学诊断实际生物催化剂的转变 文章仅指出了剩余挑战和未来研究方向,未明确列出自身综述的局限性 综述细菌漆酶的生产技术、蛋白质工程策略和诊断应用的最新进展 细菌漆酶 合成生物学 NA 定向进化、理性设计、翻译后修饰、计算建模 NA 文本 超过120篇同行评审论文 NA 大肠杆菌, 枯草芽孢杆菌 NA 医学, 环境, 工业生物技术
2 2026-09-18
Challenges and Future Directives of Synthetic Biology in Engineering Plant-Microbe Partnerships for Sustainable Agriculture
2026-Oct, Biotechnology and bioengineering IF:3.5Q2
综述 本文综述了合成生物学在工程化植物-微生物伙伴关系中以促进可持续农业所面临的挑战及未来研究方向 系统性地整合了生态、生物、技术和监管四个维度的障碍,并提出了向系统级方法转变的路径,包括多组学分析、预测建模和框架响应型遗传设计 作为综述文章,未提供原始实验数据,对具体技术方案的可行性缺乏实证验证 审视限制合成生物学应用于工程化植物-微生物伙伴关系的挑战,并指出未来研究方向 植物-微生物伙伴关系、合成生物学工程化应用 合成生物学 NA 多组学分析、预测建模、遗传设计 NA 文本 NA NA 植物, 微生物 NA 农业
3 2026-09-18
Highly Efficient Enzymatic Catalytic Transformation for the Synthesis of Rare Ginsenoside Compound K (CK) and Its Bioactivity Study
2026-Oct, Biotechnology and bioengineering IF:3.5Q2
研究论文 本研究通过合成生物学方法,在大肠杆菌中表达β-糖苷酶,高效催化人参皂苷Rb1转化为稀有皂苷CK,并初步研究了CK的抗衰老生物活性 实现了β-糖苷酶的高效重组表达(摇瓶2.1 g/L,5L发酵罐10.1 g/L),并证明粗酶液可在4小时内将95%的Rb1(10 g/L)转化为CK,同时首次系统评价了CK的抗氧化、促胶原合成和抗衰老活性 仅在体外细胞水平验证了CK的抗衰老活性,缺乏体内动物实验和临床验证;未对β-糖苷酶进行纯化和酶学性质深入研究 建立稀有皂苷CK的高效酶催化合成方法,并探究其抗衰老生物活性,为CK的规模化生物制造和抗皱化妆品应用提供依据 人参皂苷Rb1、稀有皂苷CK、重组β-糖苷酶、大肠杆菌BL21(DE3)工程菌 合成生物学 NA 重组蛋白表达、酶催化生物转化、体外细胞实验 NA NA NA NA 大肠杆菌 β-糖苷酶表达通路 医药、化妆品
4 2026-09-18
Application and progress of synthetic biology technology in amino acid production
2026-Oct, Bioprocess and biosystems engineering IF:3.5Q2
综述 本文综述了合成生物学技术在氨基酸生产中的应用与进展,涵盖代谢途径设计、基因线路与动态调控、高通量筛选平台及多种氨基酸的生产策略 系统整合并批判性评述了合成生物学在氨基酸生物合成中的最新进展,包括代谢途径重构、遗传线路与动态调控技术、高通量筛选平台的建立,以及对天然氨基酸、支链氨基酸和非经典氨基酸生产策略的全面阐述 讨论了宿主细胞适应性进化和代谢通量平衡等主要瓶颈,但作为综述未提供新的实验数据 探讨新的研发策略以推进生物合成氨基酸的生产 氨基酸生物合成途径及生产菌株 合成生物学 NA 合成生物学、代谢工程、基因线路、动态调控、高通量筛选 NA 文本 NA NA NA 遗传线路与动态调控技术 食品、饲料、医药、化妆品、工业生物技术
5 2026-09-18
Discovery of D-peptides that allosterically enhance SARS-CoV-2 3CLpro activity by stabilizing its monomeric state
2026-Oct, Protein science : a publication of the Protein Society IF:4.5Q1
研究论文 本研究基于从头设计的D-肽抑制剂,改造出多种D-肽,它们能结合SARS-CoV-2 3CLpro单体并别构激活其催化功能,其中LY11具有高亲和力和强激活效力 首次发现D-肽可通过稳定3CLpro单体状态别构增强其催化活性,揭示了3CLpro成熟与催化机制的新见解,并提供了可调控的蛋白酶分子工具 摘要未提及该D-肽在体内或细胞水平的效果,也未说明其在抗病毒治疗中是否会产生副作用或耐药性 研究3CLpro单体的催化机制,并开发能别构调控其活性的D-肽 SARS-CoV-2 3CLpro蛋白酶及其单体状态 机器学习, 数字病理学, 生物信息学 COVID-19 生物物理方法, 计算模拟 NA 分子结构数据, 结合亲和力数据, 酶动力学数据 NA NA NA NA 医学, 合成生物学
6 2026-09-18
Balance Between Order and Disorder: Quantum-Epigenetic Pathways for the Emergence and Continuous Evolution of Life
2026-Sep-16, Acta biotheoretica IF:1.4Q4
综述 该综述整合物理学、化学和生物学,探讨生命起源、进化与再造中量子-表观遗传途径,以及合成生物学、表观遗传学、倍性变异和量子效应的作用 提出量子-表观遗传视角,强调无序与有序的平衡作为进化驱动力,将合成生物学与量子效应、表观遗传和倍性变异结合,用于设计、修复和扩展生命 基于文献综述,缺乏实验验证,量子效应在生物系统中的作用尚需进一步实证研究 探索生命起源、进化和再造的多维涌现方法,整合物理、化学和生物学,提出量子-表观遗传框架 生命系统、前生命化学、原细胞、再生医学、生物工程和天体生物学 合成生物学 癌症 NA NA 文本 NA NA NA NA 医学, 生物工程, 天体生物学
7 2026-09-18
Engineered living materials: integration of living and nonliving systems
2026-Sep-09, Bioresource technology IF:9.7Q1
综述 该文章综述了工程化活体材料(ELMs)的设计、制造和应用进展,并讨论了其挑战与新兴策略 强调了底盘工程、智能基质、生物打印、原位生长等最新进展,以及多细胞联合体、遗传生物防护和AI引导逆向设计等新兴策略 机械稳健性与细胞活力之间的权衡、传质受限、长期功能不稳定、生物-非生物界面复杂性、生物安全风险和可扩展制造等关键挑战 概述ELM设计、制造和应用的最新进展,并探讨其转化潜力与新兴策略 工程化活体材料(ELMs),即整合活细胞与非活性基质的生物混合材料 合成生物学、材料科学 NA 生物打印、原位生长、合成生物学、人工智能引导逆向设计 NA NA NA NA NA NA 医学、环境修复、生物制造
8 2026-09-18
Controlling viscoelastic behavior and microstructural organization in engineered living materials using synthetic adhesins and rheometry
2026-Sep-08, Acta biomaterialia IF:9.4Q1
研究论文 利用合成细胞黏附素和流变学手段,系统研究如何通过黏附强度、细胞大小、细胞形状和黏附逻辑调控细菌工程活材料(ELMs)的黏弹性和微观结构 首次将合成细胞黏附素与流变学相结合,系统实现多细胞细菌ELMs的力学性能精确调控,并首次证明流变学可作为主动塑造ELMs微观结构的工具,控制细胞聚集和颗粒重排 研究主要聚焦于细菌体系,是否适用于真核细胞或其他类型ELMs尚需进一步验证;对复杂三维结构的调控能力及长期稳定性未做深入探讨 探索从第一性原理出发,通过合成黏附素和流变学手段理性调控工程活材料的黏弹性行为与微观结构组织 由活细菌构建的多细胞工程活材料(ELMs) 合成生物学 NA 流变学、合成细胞黏附素 NA 流变学数据 NA NA 细菌 NA 生物医药、生物打印、微生物群落设计
9 2026-09-18
De Novo Autogenic Engineered Living Functional Materials
2026-Sep, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
研究论文 该文章通过蛋白质挖掘、计算建模和合成生物学手段,构建了一个通用的从头自主发生型工程活材料(ELMs)平台,实现了CsgA类似物纳米纤维的生物合成及宏观功能材料的制备 分析了33,564个CsgA同源物,利用AlphaFold2和分子动力学模拟解析β-螺旋蛋白结构稳定性,通过重编程大肠杆菌curli系统实现非模式细菌来源CsgA类似物ELMs的生物合成,分子量提高达9倍,β-折叠重复单元扩展,并展示了3D打印和选择性结合纳米颗粒及抗体等可编程功能 文中未明确提及研究的局限性 建立一个发现、设计和利用天然生物分子系统以推进下一代自主发生型工程活材料的通用框架 CsgA类似同源蛋白及大肠杆菌curli分泌系统 合成生物学 NA 蛋白质挖掘、AlphaFold2结构预测、分子动力学模拟、合成生物学、curli系统重编程 AlphaFold2、分子动力学模拟 蛋白质序列、蛋白质结构 33,564个CsgA类似同源物 NA 大肠杆菌 curli分泌系统重编程用于CsgA类似物ELMs生物合成 材料、医学
10 2026-09-18
pH-Responsive Biomineralized Probiotic for Self-Amplifying Mucosal Vaccination: Gut-Engineered Antigen Factories Drive Targeted Cervical Tumor Regression
2026-02, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
研究论文 本文设计了一种pH响应性生物矿化枯草芽孢杆菌口服生物杂交疫苗(B-BS/E7@M),在肠道中构建抗原工厂持续产生HPV16 E7抗原,用于靶向治疗宫颈癌。 首次将合成生物学与刺激响应性生物材料相结合,构建了可自我复制的活体生物治疗系统;利用磷酸钙矿化涂层赋予益生菌胃酸抗性,并通过益生菌-黏膜相互作用延长肠道滞留时间,实现持续抗原暴露和自放大黏膜免疫。 研究主要在TC-1小鼠模型中进行,尚未在人体临床试验中验证安全性和有效性;长期口服益生菌疫苗的潜在副作用和免疫耐受问题需进一步评估。 开发一种口服生物杂交疫苗,通过肠道工程化抗原工厂实现持续HPV16 E7抗原生产,从而诱导强效黏膜和全身免疫应答,靶向治疗宫颈癌。 宫颈癌(HPV16 E7阳性肿瘤),使用TC-1小鼠肿瘤模型和枯草芽孢杆菌作为疫苗载体。 机器学习, 数字病理学 宫颈癌 合成生物学, 生物矿化, 口服疫苗工程, 免疫组化, 流式细胞术 NA 图像, 文本 TC-1小鼠模型(具体数量未在摘要中说明) NA 枯草芽孢杆菌 pH响应性生物矿化益生菌抗原工厂(B-BS/E7@M),通过磷酸钙矿化涂层和益生菌-黏膜相互作用实现持续抗原生产 医学
11 2026-09-18
Mechanistic Perspectives From Genomics and Pangenomics of Medicinal and Aromatic Plants: Linking Genome Architecture to Phytochemical Diversity
2026, International journal of genomics IF:2.6Q2
综述 本文综述了基因组学和泛基因组学如何揭示药用与芳香植物中基因组结构与植物化学多样性之间的关联 从机制角度整合了基因组结构变异与次生代谢多样性的证据,并系统评估了因果关系的证据强度,同时探讨了泛基因组学、多组学、基因编辑、合成生物学和人工智能在代谢通路发现与工程化中的应用前景 许多基因组-代谢物关系仍缺乏直接功能验证,不同物种间证据强度差异较大,部分结论仍以关联性为主而非因果性 阐明基因组结构与植物化学多样性之间的机制联系,并总结功能基因组学、精准育种和代谢工程的发展方向 药用与芳香植物(MAPs)及其次生代谢产物 基因组学 NA 长读长测序,染色体级别基因组组装,泛基因组学,多组学整合,基因编辑,合成生物学,人工智能 NA 基因组,代谢组,多组学 NA 基因编辑(CRISPR-Cas9等) 药用与芳香植物 次生代谢生物合成通路 医药,食品,工业生物技术
12 2026-09-18
A comprehensive review of genomic-scale genetic engineering as a strategy to improve bacterial productivity
2025-11, Microbiology (Reading, England)
综述 本文综述了细菌基因组工程工具从随机诱变到CRISPR/Cas等精准多重编辑策略的演进,及其在提升细菌生产力中的应用。 针对该领域缺乏统一概述的问题,整合历史里程碑与实际应用,提供基因组工程工具演进与前景的全面视角。 未提及具体实验验证或数据,属于文献综述,缺乏原始实验数据支持。 总结基因组规模遗传工程工具在细菌中的发展历程与应用,以提升细菌生产力。 细菌基因组工程工具及其在细菌生产中的应用。 合成生物学 NA CRISPR/Cas NA 文本 NA CRISPR-Cas9 细菌 NA 工业生物技术
13 2026-09-18
From Nano to Quantum: Ethics Through a Lens of Continuity
2025-10-13, Science and engineering ethics IF:2.7Q2
研究论文 本文通过连续性视角,借鉴纳米技术伦理讨论的经验教训,分析和指导量子技术伦理话语的塑造 提出使用连续性视角,将纳米伦理讨论中的关键特征作为分析工具,用于评估和分析新兴的量子技术伦理话语,避免重复过去的错误 文章主要基于理论分析和文献回顾,缺乏实证数据支持,且未提供具体的量子技术伦理框架或操作指南 探讨如何借鉴纳米技术伦理讨论的经验,指导量子技术伦理和负责任创新的早期话语发展 纳米技术和量子技术的伦理讨论话语 机器学习 NA NA NA 文本 NA NA NA NA 医学, 工业生物技术
14 2026-09-18
Unexplored regions of the protein sequence-structure map revealed at scale by a library of foldtuned language models
2025-Sep-19, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 该文提出foldtuning方法,利用蛋白质语言模型生成远离天然序列的蛋白质变体,构建了覆盖700多个天然折叠的模型库,并通过实验验证了三个不同折叠靶标的稳定性与功能。 提出foldtuning方法,将蛋白质语言模型重新定义为探索蛋白质“深空”区域的探针,通过生成和自反馈机制,在强制核心结构约束下,探索与天然示例同源性极低或没有可检测同源性的序列空间,并构建了覆盖700多个天然折叠的模型库。 摘要中未明确提及研究局限性,可能包括实验验证仅针对三个折叠靶标,且对生成蛋白的功能验证范围有限。 探索蛋白质序列-结构映射中未被探索的区域,超越定向进化等金标准实验方法的限制,研究远离天然序列的蛋白质序列空间。 蛋白质序列-结构映射、蛋白质语言模型、SCOP数据库中的700多个天然折叠,包括GPCR、小GTP酶、细胞表面受体、DNA结合域、信号/调节域等。 机器学习 NA 蛋白质语言模型、foldtuning、生成与自反馈 蛋白质语言模型 蛋白质序列与结构数据 覆盖SCOP数据库中超过700个天然折叠,实验验证了三个折叠靶标:SH3结构域、barnase抑制剂barstar和胰岛素 NA NA NA 医学、工业生物技术
15 2026-09-18
STRAIGHT-IN Dual: a platform for dual, single-copy integrations of DNA payloads and gene circuits into human induced pluripotent stem cell
2025-Sep-05, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了STRAIGHT-IN Dual平台,能够在一周内以100%效率同时将两个DNA有效载荷单拷贝整合到人类诱导多能干细胞中 实现了双DNA有效载荷的同时、等位基因特异性、单拷贝整合,效率达到100%,且在一周内完成;利用STRAIGHT-IN平台实现近乎无疤痕的货物整合,便于组件回收利用;设计了grazoprevir诱导的synZiFTR系统,可与四环素诱导系统互补,在同一细胞内独立、可调、时序控制不同转录因子的表达 摘要中未明确提及研究局限性 开发一种高效、快速的双DNA有效载荷和基因电路整合平台,用于人类诱导多能干细胞的精确基因工程 人类诱导多能干细胞(hiPSCs) 合成生物学 NA STRAIGHT-IN Dual平台、synZiFTR系统 NA NA NA STRAIGHT-IN平台 人类诱导多能干细胞 grazoprevir诱导的synZiFTR系统 医学、工业生物技术
16 2026-09-18
Engineering microalgal cell wall-anchored proteins using GP1 PPSPX motifs and releasing with intein-mediated fusion
2025-Jul-08, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究在微藻中开发了一种利用GP1糖蛋白的PPSPX基序将蛋白质锚定在细胞壁上,并通过pH敏感内含肽实现可控释放的双系统 首次鉴定出GP1糖蛋白中的PPSPX基序是细胞壁锚定的关键信号,并创新性地结合pH敏感内含肽实现了蛋白质的时空可控释放 摘要中未明确说明该系统的局限性 开发一种在微藻中实现蛋白质细胞壁锚定和可控释放的双系统,以优化蛋白质定位和环境触发释放 微藻细胞壁锚定蛋白系统,包括GP1糖蛋白、PHL7塑料降解酶、mCherry荧光蛋白和RecA来源的pH敏感内含肽 合成生物学 NA 蛋白质工程、荧光动力学分析、Western blot分析 NA 蛋白质表达与释放数据、荧光数据、Western blot图像 NA 内含肽介导的蛋白质剪接 微藻 GP1-PPSPX锚定系统与pH敏感内含肽切割释放系统组合 医学、环境、工业生物技术
17 2026-09-17
Biological Parts in Yeast Synthetic Biology: From Regulatory Elements to Predictive Design Platforms
2026-Sep-16, FEMS yeast research IF:2.4Q3
综述 该综述系统梳理了酵母合成生物学中生物元件从调控元件到预测性设计平台的发展历程,涵盖DNA、RNA和蛋白质水平的调控,并连接组装框架、生物铸造厂和机器学习,描绘从元件中心工程向预测性系统级设计的转变 提供跨DNA、RNA和蛋白质水平调控的生物元件演化的整合视角,并将这些进展与组装框架、生物铸造厂和机器学习相联系,追踪从元件中心工程向预测性系统级设计的轨迹 作为综述,未涉及具体实验验证,可能未涵盖所有最新研究进展,且对预测性设计平台的实际应用效果缺乏深入评估 综述酵母合成生物学中生物元件的发展,连接调控元件、组装框架、生物铸造厂和机器学习,描绘从元件中心工程向预测性系统级设计的转变 酵母合成生物学中的生物元件,特别是酿酒酵母中的调控元件、组装框架、生物铸造厂和机器学习方法 合成生物学 NA NA 机器学习 文本 NA NA 酿酒酵母 多基因通路、遗传电路、动态调控系统 医药, 工业生物技术
18 2026-09-16
Machine learning-guided discovery of poly(ethylene terephthalate)-binding modules to enhance durable whole-cell degradation
2026-Nov, Bioresource technology IF:9.7Q1
研究论文 该研究开发了机器学习辅助流程,从天然蛋白质结构中挖掘PET结合模块,以增强全细胞对PET的降解能力 将基于profile HMM的同源搜索与监督式PET水解酶机器学习模型(PETML)相结合,发现家族13的CBM可作为PET结合模块,并通过双锚定系统共展示实现全细胞催化剂的增强降解和可回收性 未明确说明机器学习模型的泛化能力、双锚定系统在其他宿主中的适用性以及大规模应用的经济可行性 发现新型PET结合模块,提高PET水解酶在疏水表面的吸附和降解效率,构建可重复使用的全细胞生物催化剂 PET塑料、PET水解酶、碳水化合物结合模块(CBMs)、大肠杆菌全细胞催化剂 机器学习, 合成生物学 NA 机器学习辅助挖掘, 同源搜索, 高通量对接, 分子动力学模拟, 蛋白质融合, 全细胞表面展示 PETML(监督式机器学习模型) 蛋白质序列, 分子结构数据, 实验吸附和降解数据 197个非冗余候选结合模块 NA 大肠杆菌 双锚定系统(OmpA和EhaA)共展示tCBM13-1与FAST-PETase 环境, 材料, 工业生物技术
19 2026-09-16
De novo synthesis of large-scale metabolic pathways for natural products and their optimization strategies
2026-Nov, Bioresource technology IF:9.7Q1
综述 系统分析了在微生物细胞工厂中从头合成大规模代谢途径(≥10个酶促步骤)以生产天然产物的核心策略与前沿技术,并探讨了系统生物学建模与机器学习在其中的新兴作用 整合了理性设计、动态控制与模块化共培养策略以应对代谢负担、途径失衡和宿主毒性等挑战,并强调了智能算法与多学科工具结合在复杂天然产物生物制造中的潜力 作为综述文章,未提供原始实验数据,所讨论的策略和技术在实际应用中的可行性和通用性仍需进一步验证 系统分析在微生物细胞工厂中重构大规模代谢途径以高效可持续生产高价值天然产物的核心策略与前沿技术 大规模代谢途径(≥10个酶促步骤)、天然产物、微生物细胞工厂 合成生物学 NA 先进克隆方法、模块化途径设计、自组装方法(蛋白质/DNA支架和代谢通道)、共培养系统中的分工优化、动态调控机制(启动子工程、核糖开关、基于生物传感器的反馈控制)、系统生物学建模、机器学习 NA 文本 NA NA 微生物细胞 模块化代谢途径、自组装支架、代谢通道、动态调控回路(启动子工程、核糖开关、生物传感器反馈控制) 医药、工业生物技术
20 2026-09-16
Identification and Catalytic Optimization of Pinene Oxidases in Paeoniflorin Biosynthetic Pathway
2026-Sep-15, Plant physiology IF:6.5Q1
研究论文 本文鉴定了芍药苷生物合成途径中三个新的细胞色素P450酶,并对其催化特性进行了优化 发现了CYP71AN126和CYP76A225/226三个新的P450酶,确定了α-蒎烯C4氧化是芍药苷生物合成的关键步骤,并鉴定了L493残基在调控催化位点特异性和底物特异性中的关键作用 芍药苷的完整生物合成途径尚未完全阐明 解析芍药苷生物合成途径并优化关键酶的催化效率 芍药苷生物合成途径中的蒎烯氧化酶(CYP71AN126和CYP76A225/226) 合成生物学 NA 病毒诱导基因沉默(VIGS)、定点突变、蛋白质结构预测 NA 序列数据、结构数据 NA 定点突变 NA 芍药苷生物合成途径 医药
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