合成生物学相关文章
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当前共找到 4496 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-02-26 |
Streptomyces as a versatile host platform for heterologous production of microbial natural products
2026-Feb-25, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00036j
PMID:40923873
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综述 | 本文全面回顾了2004年至2024年间利用链霉菌作为异源表达平台生产微生物天然产物的研究进展 | 首次对过去20年超过450项相关研究进行了数据驱动的定量分析，总结了表达趋势、关键影响因素及技术进展 | 作为一篇综述文章，主要基于现有文献进行分析，未提出新的实验数据或技术突破 | 评估链霉菌作为异源表达平台在挖掘微生物天然产物生物合成基因簇方面的潜力和应用 | 链霉菌宿主及其异源表达的各类生物合成基因簇 | 合成生物学 | NA | 异源表达、基因组工程、合成生物学工具、组合生物合成 | NA | 文献数据 | 超过450项同行评审研究 | 基因组工程 | 链霉菌 | 生物合成基因簇的异源表达与调控 | 药物发现 |
| 2 | 2026-02-26 |
Toward a unified pipeline for natural product discovery: tools and strategies for NRPS and PKS pathway exploration and engineering
2026-Feb-25, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00041f
PMID:40719200
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综述 | 本文综述了将非核糖体肽合成酶和聚酮合酶系统转化为可理性设计平台的最新进展，涵盖基因组挖掘、高通量筛选、合成生物学工具及计算建模等方法 | 强调计算建模（如同源建模、分子对接、分子动力学模拟）与深度学习策略如何与传统技术互补，加速定制化天然产物类似物的发现与组装 | NA | 探索和改造NRPS与PKS生物合成途径，以发现和设计新型天然产物 | 非核糖体肽合成酶和聚酮合酶系统及其产生的天然产物 | 合成生物学 | NA | 基因组挖掘、高通量筛选、去重复分析、同源建模、分子对接、分子动力学模拟、深度学习 | 深度学习模型 | NA | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 3 | 2026-02-26 |
Lactic Acid Bacteria Bacteriocins: Classification, Biosynthesis, Health Benefits, and Strategies for Enhanced Efficacy
2026-Feb-25, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c14047
PMID:41700423
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综述 | 本文综述了乳酸菌细菌素的分类、生物合成、健康益处及增强效能的策略 | 提供了更新的细菌素分类（I-III类），并分析了产量影响因素和增强效能的策略，如代谢工程和合成生物学 | 产量优化和临床转化方面仍存在挑战 | 综述乳酸菌细菌素的研究进展，以指导其治疗开发和规模化生产 | 乳酸菌细菌素 | NA | 感染和癌症 | NA | NA | NA | NA | 代谢工程, 合成生物学 | 乳酸菌 | NA | 食品, 生物医学 |
| 4 | 2026-02-26 |
DNA Framework-Encoded Digital Recorder for Bacterial Discrimination
2026-Feb-25, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.6c01091
PMID:41738382
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研究论文 | 开发了一种基于DNA框架的位置编码系统（DFDR），用于同时区分多种核酸序列，并应用于细菌鉴别 | 利用三角形DNA框架实现位点特异性功能化，单单元可同时解析18个核酸靶标，比传统DNA自组装系统的复用能力提高6倍，并支持多重信号的顺序和可重写记录 | NA | 开发一种能够同时区分多种生物分子信号的技术，用于精确诊断共感染和评估医疗环境 | 核酸序列（包括16S rRNA混合物）和临床相关呼吸道病原体 | 合成生物学 | 呼吸道感染 | DNA框架自组装、核酸杂交 | NA | 核酸序列数据 | 医院环境和天然河水样本 | DNA自组装 | NA | 基于三角形DNA框架的位置编码系统，每条边用正交探针功能化以靶向不同DNA序列 | 医学诊断、环境监测、信息存储 |
| 5 | 2026-02-26 |
A comprehensive ruminant microbial catalog (CRMC) reveals convergent selection for key vitamin-synthesizing pathways and genes across ruminants and human
2026-Feb-25, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giag016
PMID:41738843
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研究论文 | 本研究基于反刍动物胃肠道宏基因组样本，构建了一个全面的反刍动物微生物基因组目录（CRMC），并系统揭示了维生素合成微生物的功能特征、生态角色及其在反刍动物与人类肠道中的趋同选择模式 | 构建了迄今为止最全面的反刍动物胃肠道微生物基因组目录（CRMC），并首次系统揭示了跨反刍动物宿主的维生素合成微生物在关键合成途径和基因节点上的趋同选择模式 | 研究主要基于宏基因组组装基因组（MAGs），可能无法完全覆盖低丰度或难培养的微生物类群 | 阐明反刍动物胃肠道维生素合成微生物的功能特征、生态角色及其跨宿主分布模式 | 反刍动物胃肠道微生物组，特别是维生素合成微生物 | 宏基因组学 | NA | 宏基因组测序 | NA | 宏基因组序列数据 | 2,325个宏基因组样本，来自8种反刍动物宿主 | NA | 反刍动物（8种） | NA | 农业，工业生物技术 |
| 6 | 2026-02-26 |
Genomic Perplexity and the Evolution of Context-Dependent Function
2026-Feb-25, Molecular biology and evolution
IF:11.0Q1
DOI:10.1093/molbev/msag041
PMID:41739546
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研究论文 | 本文提出基因组困惑度的概念，通过类比大型语言模型，将基因组视为编码功能概率分布的动态系统，而非固定功能集合 | 引入基因组困惑度作为量化基因在宿主环境中统计意外性的信息论指标，并建立基因组背景依赖性与Transformer注意力机制的概念类比 | 理论框架尚需实证验证，未提供具体实验数据或计算模型的具体实现细节 | 建立解释基因组功能背景依赖性的理论框架，并量化基因水平转移的适应度成本 | 基因组功能演化、基因背景依赖性、水平基因转移 | 计算生物学 | NA | 信息论分析、概念建模 | Transformer注意力机制类比模型 | 基因组数据、泛基因组数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、进化建模 |
| 7 | 2026-02-26 |
Synthetic gene circuits that selectively target RAS-driven cancers
2026-Feb-24, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.104320
PMID:41733988
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研究论文 | 本文提出了一种结合多个RAS传感器的合成基因回路，用于选择性靶向RAS驱动的癌症细胞 | 通过将多个RAS传感器整合到基因回路中，实现了对突变RAS细胞前所未有的高选择性蛋白表达 | 未在动物模型中进行验证，且仅限于RAS驱动的癌症类型 | 开发能够选择性靶向RAS突变癌症细胞的合成基因回路疗法 | RAS驱动的癌症细胞 | 合成生物学 | 癌症 | 合成基因回路设计 | NA | NA | 多种RAS驱动的癌细胞系 | 合成基因回路 | 哺乳动物细胞 | 包含多个RAS传感器的模块化基因回路，可感知突变RAS并选择性表达治疗性蛋白 | 医学 |
| 8 | 2026-02-26 |
Advancing codon language modeling with synonymous codon constrained masking
2026-Feb-24, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag166
PMID:41736545
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研究论文 | 本文介绍了SynCodonLM，一种通过同义密码子约束掩码来改进密码子语言建模的方法，以更好地捕捉DNA层面的生物学特征 | 引入同义密码子约束掩码，将密码子级与蛋白质级语义解耦，使模型能学习核苷酸特异性模式，并在DNA层面特征敏感的基准测试中表现优异 | NA | 改进密码子语言建模，以更准确地建模蛋白质编码DNA序列并捕捉DNA层面的生物学特征 | 蛋白质编码DNA序列 | 自然语言处理 | NA | 密码子语言建模 | 语言模型 | DNA序列 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 9 | 2026-02-26 |
SSB-mediated enhancement of argonaute activity triggers SOS filamentation in bacteria
2026-Feb-24, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag175
PMID:41736547
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研究论文 | 本文揭示了嗜热栖热菌Argonaute蛋白（TtAgo）在细菌生理中的作用，特别是其与TtSSB相互作用促进DNA损伤和细胞丝状化的机制 | 首次发现TtAgo过表达能通过破坏细胞分裂检查点触发细菌丝状化，并阐明TtSSB招募TtAgo至复制叉增强其DNA结合活性的新机制 | 研究主要基于嗜热栖热菌和大肠杆菌模型，在其他细菌中的普适性未验证 | 探究原核Argonaute蛋白在细菌细胞周期和DNA修复途径中的生理功能 | 嗜热栖热菌Argonaute蛋白（TtAgo）及其与单链DNA结合蛋白（TtSSB）的相互作用 | 合成生物学 | NA | 扫描电子显微镜、核DNA染色、截短蛋白变体分析 | NA | 图像数据、分子相互作用数据 | 使用嗜热栖热菌和大肠杆菌作为研究模型 | NA | 嗜热栖热菌, 大肠杆菌 | NA | 合成生物学, 生物技术 |
| 10 | 2026-02-26 |
Green Biosynthesis of Terpenoid-Derived Flavor and Fragrance Compounds: Advances and Strategic Perspectives
2026-Feb-20, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c08719
PMID:41718042
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综述 | 本文系统综述了利用合成生物学策略绿色生物合成萜类香料化合物的最新进展与未来展望 | 从低成本底物利用、宿主菌株兼容性选择、酶修饰、动态途径调控、细胞区室化和毒性耐受增强等综合工程策略视角，系统总结了萜类生物合成的最新突破 | NA | 为萜类化合物的可持续生产提供关键见解和指导 | 萜类及其衍生物 | 合成生物学 | NA | 生物合成 | NA | NA | NA | NA | 微生物细胞工厂 | 代谢途径 | 食品, 工业生物技术 |
| 11 | 2026-02-26 |
Precision Fermentation Processes for Producing Novel Foods and Its Sustainable Applications
2026-Feb, Journal of basic microbiology
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/jobm.70160
PMID:41735245
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综述 | 本文对精准发酵技术在可持续食品生产中的应用进行了系统综述，整合了微生物菌株设计、生物工艺工程、技术经济可行性、环境绩效和监管准备度等多个方面 | 提供了一个整合微生物菌株设计、生物工艺工程、技术经济可行性、环境绩效和监管准备度的统一框架，弥补了以往仅关注产品或特定生物的综述的不足 | 面临高资本和能源成本、放大效率低、下游处理复杂、消费者接受度以及监管不确定性等挑战 | 评估精准发酵技术在可持续食品生产中的应用、技术经济可行性和环境影响 | 精准发酵过程及其在食品生产中的应用 | NA | NA | 精准发酵、代谢途径工程 | NA | 文献数据 | 37项符合纳入标准的研究（包括实验室研究、工业案例研究、技术经济分析和生命周期评估） | 合成生物学 | 微生物宿主 | 代谢途径工程 | 食品, 工业生物技术 |
| 12 | 2026-02-26 |
The rise and future of peptide-based antimicrobials
2026-Jan-30, Journal of microbiology (Seoul, Korea)
DOI:10.71150/jm.2510002
PMID:41736369
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综述 | 本文综述了肽类抗生素的兴起与未来，涵盖其发现、优化和应用的最新进展，包括结构分类、作用机制以及人工智能和合成生物学等新兴策略 | 整合了人工智能、合成生物学和现代递送技术等新兴策略，以应对抗菌素耐药性挑战，并系统分类肽类抗生素以指导其治疗潜力 | NA | 探讨肽类抗生素作为传统小分子药物替代品的潜力，以应对日益严重的抗菌素耐药性威胁 | 肽类抗生素，包括天然、半合成和全合成类型，以及其结构分类如α-螺旋、β-折叠、环状和延伸形式 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 13 | 2026-02-26 |
High-throughput yeast engineering in biofoundries: towards autonomous and scalable synthetic biology
2026-Jan-05, FEMS yeast research
IF:2.4Q3
DOI:10.1093/femsyr/foag003
PMID:41591451
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综述 | 本文综述了生物铸造厂如何通过整合自动化、人工智能和标准化工作流程，推动高通量酵母工程向自主化和规模化方向发展 | 探讨了从DBTL（设计-构建-测试-学习）循环向自主优化的“自动驾驶实验室”和Design-Build-Deploy（设计-构建-部署）循环的转变趋势 | 仍存在协议可变性、AI工具整合不足以及国际标准、数据治理和伦理保障需要协调等关键障碍 | 推动酵母工程的高通量、自主化和规模化发展，以实现经济、可持续的大规模生物制造 | 酵母工程、生物铸造厂及其在菌株开发中的应用 | 合成生物学 | NA | 基因组编辑、表型筛选、预测建模 | 预测模型（AI驱动） | NA | NA | CRISPR-Cas9（提及基因组编辑，但未明确指定工具） | 酵母 | NA | 工业生物技术 |
| 14 | 2026-02-26 |
Structure and encapsulation of carbonic anhydrase within the α-carboxysome
2025-Nov-18, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2523723122
PMID:41223214
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研究论文 | 本研究解析了α-羧化体内部碳酸酐酶的结构及其封装机制 | 首次揭示了CsoSCA的六聚体三聚体结构，证明其封装不依赖锌离子和连接蛋白CsoS2，并阐明了其在羧化体内部连接Rubisco与外壳的桥梁作用 | 研究主要基于合成微型外壳和细菌模型，体内完整羧化体的动态组装过程仍需进一步验证 | 阐明α-羧化体中碳酸酐酶的结构特征及其在微区室内的封装机制 | 化能自养细菌Halothiobacillus neapolitanus的α-羧化体碳酸酐酶CsoSCA | 结构生物学 | NA | 分子结构解析、合成微型外壳技术 | NA | 结构数据、生化实验数据 | NA | 合成生物学技术 | Halothiobacillus neapolitanus（化能自养细菌） | 羧化体微区室封装系统（包含Rubisco和碳酸酐酶的半透性蛋白质外壳） | 合成生物学、生物技术 |
| 15 | 2026-02-26 |
Regulatory helix plays a key role in genetic ON-OFF switching for the 2'-deoxyguanosine-sensing mRNA element
2025-07, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.110282
PMID:40412519
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研究论文 | 本文通过化学探测和荧光淬灭实验，揭示了2'-脱氧鸟苷感应核糖开关在转录过程中的动态调控机制 | 发现核糖开关并非简单的二元开关，而是通过关键中间态在RNA合成过程中精细调控下游基因转录 | 研究主要基于体外实验，需要进一步在体内验证调控机制 | 阐明2'-脱氧鸟苷感应核糖开关的转录调控机制 | 2'-脱氧鸟苷感应核糖开关及其转录中间体 | 合成生物学 | NA | 化学探测、荧光淬灭实验 | NA | 结构探测数据、荧光信号数据 | NA | NA | NA | 核糖开关调控元件 | 医学, 合成生物学 |
| 16 | 2026-02-26 |
Compliant DNA Origami Nanoactuators as Size-Selective Nanopores
2024-09, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202405104
PMID:39014922
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研究论文 | 本文介绍了一种可重构的DNA折纸纳米孔，其孔径可通过分子触发器调节，实现了尺寸选择性跨膜运输 | 结合DNA折纸纳米技术、机械启发设计和合成生物学，创建了具有可调孔径和可逆构象变化的纳米孔，克服了传统生物纳米孔孔径固定的限制 | NA | 开发一种可调节孔径的纳米孔技术，以扩展其在生物物理学和生物技术中的应用 | DNA折纸纳米孔（MechanoPore）及其在脂质体膜中的重构与功能 | 合成生物学 | NA | DNA折纸纳米技术、3D-DNA-PAINT超分辨率成像、染料流入测定、倒置乳液cDICE技术、共聚焦成像 | NA | 图像数据（超分辨率和共聚焦成像） | NA | DNA折纸 | 脂质体（人工膜系统） | 可重构纳米孔（MechanoPore），具有三个稳定状态和可调孔径的机械开关 | 药物递送, 生物分子分选, 传感, 合成生物学 |
| 17 | 2026-02-26 |
Synthetic biology: at the crossroads of genetic engineering and human therapeutics-a Keystone Symposia report
2021-12, Annals of the New York Academy of Sciences
IF:4.1Q1
DOI:10.1111/nyas.14710
PMID:34786712
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会议报告 | 本文总结了2021年5月3日至4日举行的Keystone eSymposium，探讨了合成生物学在细胞和基因疗法中的潜在应用 | 强调合成生物学在人类治疗中的临床应用，而非技术细节，并讨论了多种疗法（如T细胞、基因、病毒疗法和益生菌）的工程化改进 | NA | 探索合成生物学如何转化细胞和基因疗法以治疗多种疾病 | 真核和原核细胞，包括T细胞、基因疗法、病毒疗法和益生菌 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 真核细胞, 原核细胞 | 生物传感器, 逻辑门, 代谢途径 | 医学 |
| 18 | 2026-02-25 |
Exploring marine-derived compounds as potential anti-cancer agents: Mechanisms and therapeutic implications
2026-May, Cancer pathogenesis and therapy
DOI:10.1016/j.cpt.2025.08.004
PMID:41732213
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综述 | 本文全面综述了海洋来源化合物作为潜在抗癌剂的机制、治疗应用及临床发展 | 系统总结了海洋来源化合物的多样化抗癌机制，并强调了通过海洋生物技术、合成生物学及新型给药系统克服其应用限制的未来方向 | 海洋来源化合物存在产量低、结构复杂、水溶性差和生物利用度有限等挑战，阻碍了其更广泛的临床应用 | 探索海洋来源化合物作为抗癌剂的潜力，包括其作用机制、治疗应用及临床转化 | 海洋来源的化合物（如生物碱、多糖、肽类、萜类、聚酮类）及其抗癌活性 | NA | 癌症 | 基因组挖掘、合成生物学、发酵技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 19 | 2026-02-25 |
Double-edged sword: Aspergillus flavus as a threat to food safety and a resource for biotechnology
2026-Feb-21, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108848
PMID:41730464
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综述 | 本文综述了黄曲霉作为食品安全威胁与生物技术资源双重角色的最新研究进展 | 将黄曲霉重新定义为具有双重用途的生物体，既关注其生物安全问题，又挖掘其作为可利用化学多样性来源的潜力 | NA | 探讨黄曲霉次级代谢产物的多样性、调控机制及其在生态、致病和生物技术中的应用 | 黄曲霉及其次级代谢产物 | NA | NA | 真菌基因组学、代谢组学、基因组挖掘、CRISPR技术、异源表达 | NA | NA | NA | CRISPR, 合成生物学平台 | NA | NA | 医药, 农业 |
| 20 | 2026-02-25 |
Engineered E. coli Nissle 1917 Depletes Branched-Chain Amino Acids to Suppress Colorectal Tumorigenesis
2026-Feb-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00804
PMID:41712535
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研究论文 | 本研究通过工程化改造大肠杆菌Nissle 1917菌株，使其在肠道中消耗支链氨基酸，从而抑制结直肠癌的发生和发展 | 首次利用合成生物学方法改造益生菌，通过靶向支链氨基酸代谢来抑制结直肠肿瘤发生，为癌症治疗提供了新策略 | 研究基于AOM/DSS诱导的小鼠结直肠癌模型，尚未在人体中进行验证 | 开发基于工程化益生菌的结直肠癌治疗新方法 | 工程化大肠杆菌Nissle 1917菌株（ECN-Deg和ECN-Tra）及其对结直肠癌的抑制作用 | 合成生物学 | 结直肠癌 | 基因工程、动物模型实验 | NA | 动物实验数据、代谢组学数据 | AOM/DSS诱导的结直肠癌小鼠模型 | 基因工程 | 大肠杆菌（E. coli Nissle 1917） | 支链氨基酸消耗途径 | 医学 |