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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-04-21 |
Functional identification of key enzymes in calycosin biosynthesis in Astragalus membranaceus and establishment of heterologous expression system
2026-Dec, Pharmaceutical science advances
DOI:10.1016/j.pscia.2026.100118
PMID:42005051
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研究论文 | 本研究鉴定了黄芪中毛蕊异黄酮生物合成的三个关键酶,并成功在酵母和烟草中建立了异源表达系统 | 揭示了毛蕊异黄酮的新型合成途径,发现AmOMT2的多功能性拓宽了AmIFS的底物范围 | NA | 阐明黄芪中毛蕊异黄酮的生物合成途径并建立异源生产系统 | 黄芪(Astragalus membranaceus)及其关键生物合成酶 | 合成生物学 | NA | 异源表达、组织特异性表达分析 | NA | NA | NA | 异源表达系统 | 酵母, 烟草 | 毛蕊异黄酮生物合成途径(涉及AmIFS、AmOMT2、AmI3'H三个关键酶) | 医药 |
| 2 | 2026-04-21 |
iFLinkC-EZ: A scalable and automatable method for the assembly of complex fusion proteins and multi-gene expression constructs based on the iFLinkC framework
2026-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2026.03.008
PMID:42006855
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研究论文 | 本文介绍了一种名为iFLinkC-EZ的可扩展且可自动化的方法,用于组装复杂融合蛋白和多基因表达构建体,基于iFLinkC框架 | iFLinkC-EZ通过遗传手段纯化DNA组装产物,简化了组装过程并实现了机器人自动化兼容,克服了先前iFLinkC方法中物理纯化DNA片段的复杂性和操作技能要求 | NA | 开发一种标准化框架,用于组装任意大小和复杂度的蛋白质编码序列和多基因表达构建体 | 融合蛋白和多基因表达构建体,包括单色和多色多荧光融合蛋白以及多顺反子表达构建体 | 合成生物学 | NA | 迭代功能连接子克隆(iFLinkC)和iFLinkC-EZ组装算法 | NA | DNA序列 | NA | Golden Gate, iFLinkC | 酵母 | 合成蛋白开关、传感器、多酶复合物以及由此组成的遗传电路和代谢途径 | 生物技术、基础研究 |
| 3 | 2026-04-21 |
Deep learning revolutionizes protein research: Advances in structure prediction, functional annotation, and engineered design
2026-Jun, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2026.03.012
PMID:41839238
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综述 | 本文综述了深度学习如何通过连接结构预测、功能注释和理性设计,形成一个协同循环,从而彻底改变蛋白质研究 | 提出了一个统一的“预测-理解-创造”范式,展示了深度学习在蛋白质结构预测、功能注释和从头设计中的突破性进展,并阐述了这些领域如何相互促进,形成一个自我强化的循环 | 在数据稀缺性、模型可解释性以及分布外泛化方面仍存在挑战 | 阐述深度学习如何变革蛋白质研究,并展示结构预测、功能注释和理性设计之间的协同循环 | 蛋白质(特别是单域、球状蛋白质) | 机器学习 | NA | 深度学习,生成式AI,逆向折叠模型,混合实验-计算工作流(如与AI集成的冷冻电镜) | 端到端深度学习模型(如AlphaFold2),多模态模型,生成式AI | 序列数据,3D坐标,相互作用数据 | NA | NA | NA | NA | 药物开发,合成生物学 |
| 4 | 2026-04-21 |
Microbial lipids for a sustainable future: the growing potential of synthetic microbial engineering for consumer oils
2026-May, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2026.2615047
PMID:41692578
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综述 | 本文探讨了合成微生物工程在可持续生产消费油脂方面的潜力,以应对传统作物依赖带来的环境问题 | 利用合成生物学和自动化生物铸造技术,开发微生物作为可持续油脂来源的新方法 | NA | 推动消费油脂产业向可持续微生物生物制造经济转型 | 微生物油脂及其在食品、营养品、塑料、化妆品、燃料等产品中的应用 | 合成生物学 | NA | 合成酵母基因组学、自动化生物铸造 | NA | NA | NA | NA | 酵母 | NA | 食品, 营养品, 塑料, 动物饲料, 化妆品, 药品, 燃料 |
| 5 | 2026-04-21 |
Engineering non-ribosomal peptide synthesis: tuning the antibiotics engine of the microbial world
2026-May, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2026.2615819
PMID:41771683
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综述 | 本文综述了通过合成生物学方法工程化改造非核糖体肽合成酶以提高抗生素产量和生物活性的主要进展 | 系统总结了通过代谢工程、启动子调控和异源表达等合成生物学策略优化非核糖体肽生产的创新方法 | NA | 利用合成生物学技术优化非核糖体肽合成酶,以提高抗生素类肽的产量和生物活性 | 非核糖体肽合成酶及其产生的抗生素肽类 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、代谢工程、异源表达 | NA | NA | NA | 启动子工程、代谢通路重定向 | 微生物 | 生物合成基因簇、代谢通路工程 | 医药 |
| 6 | 2026-04-21 |
OptoChaperone─A Biohybrid Tool for Regulating Protein Condensates in Cells and In Vitro
2026-Apr-19, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.6c04074
PMID:42002974
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研究论文 | 本文介绍了一种名为OptoChaperone的光激活生物杂交系统,用于在体外和活细胞中精确、可逆地调控蛋白质凝聚体的形成与溶解 | 开发了一种基于光响应开关的生物杂交工具,实现了对蛋白质液-液相分离(LLPS)的可逆、时空控制,无需化学添加剂或客户蛋白的基因修饰 | NA | 研究蛋白质凝聚体的调控机制,开发新型工具以解析其在细胞生理和病理中的作用 | 疾病相关蛋白质凝聚体,如融合肉瘤蛋白、TAR DNA结合蛋白43和热休克因子1 | 合成生物学 | NA | 光激活分子系统 | NA | NA | NA | OptoChaperone | 活细胞 | 光响应开关系统,用于控制分子伴侣活性以调节蛋白质凝聚体 | 医学, 合成生物学, 生物分子工程 |
| 7 | 2026-04-21 |
High-performance bioimaging and biosensing via nucleobase-editing enzymes
2026-Apr-17, Chemical Society reviews
IF:40.4Q1
DOI:10.1039/d5cs00678c
PMID:41773995
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综述 | 本文综述了核苷碱基编辑酶在生物成像和生物传感中的高性能应用,包括其催化原理、集成模式以及未来发展方向 | 将核苷碱基编辑酶重新用作可编程执行器,实现高特异性、高效放大和生理条件兼容的敏感监测 | NA | 探讨核苷碱基编辑酶在生物传感和生物成像中的应用潜力 | 核苷碱基编辑酶(如脱氨酶、甲基转移酶/去甲基化酶和DNA糖基化酶)及其在核酸、蛋白质和细胞过程监测中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 诊断, 治疗监测, 合成生物学 |
| 8 | 2026-04-21 |
Rhodo-Box: A Synthetic Biology Toolbox to Facilitate Metabolic Engineering of Rhodobacter sphaeroides
2026-Apr-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00808
PMID:41832780
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研究论文 | 本文介绍了Rhodo-Box,一个为Rhodobacter sphaeroides设计的合成生物学工具箱,旨在促进其代谢工程应用 | 开发了Rhodo-Box工具箱,通过适应和扩展Zymo-Parts模块化克隆框架,为Rhodobacter sphaeroides提供了标准化的遗传元件和半自动化克隆方法 | NA | 促进Rhodobacter sphaeroides作为可持续生物制造底盘微生物的代谢工程应用 | Rhodobacter sphaeroides(一种紫色非硫α-变形菌) | 合成生物学 | NA | 模块化克隆、半自动化克隆 | NA | NA | NA | Zymo-Parts, Gibson Assembly | Rhodobacter sphaeroides | 包括复制起点、启动子、诱导表达系统、RBS和转录终止子在内的遗传元件集合 | 工业生物技术 |
| 9 | 2026-04-21 |
Vacuum and Sonication Treatment Enable Efficient Transient Gene Expression in Various Monocot and Eudicot Plant Seedlings
2026-Apr-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00855
PMID:41865287
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研究论文 | 本文介绍了一种名为VAST的瞬时基因表达方法,通过真空和超声处理显著提高了多种单子叶和双子叶植物幼苗的基因表达效率和适用性 | VAST方法结合了真空渗透和超声预处理,优化了植物生长条件,相比现有方法在提高基因表达效率的同时减少了组织损伤,并成功应用于多种关键作物物种 | NA | 开发一种高效、通用的瞬时基因表达方法,以促进功能基因组学、合成生物学和生物技术研究 | 多种单子叶和双子叶植物幼苗,包括番茄、谷子、柳枝稷、玉米和小麦等关键作物物种 | 合成生物学 | NA | 瞬时基因表达、真空渗透、超声处理 | NA | NA | NA | NA | 番茄、谷子、柳枝稷、玉米、小麦等植物幼苗 | NA | 农业、生物技术 |
| 10 | 2026-04-21 |
Vibrio natriegens, a Promising Chassis from Strain Property to Protein Expression: A Review
2026-Apr-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00761
PMID:41886740
|
综述 | 本文系统介绍了Vibrio natriegens作为合成生物学中蛋白质表达宿主的生物学特性、工程化改造及最新应用进展 | 重点关注Vibrio natriegens在蛋白质表达领域的最新研究成果,这是以往综述中较少涉及的内容 | NA | 为研究人员提供使用Vibrio natriegens进行蛋白质表达的全面概述,并推动合成生物学领域的更广泛研究 | Vibrio natriegens菌株及其在蛋白质表达中的应用 | 合成生物学 | NA | 分子生物学工具、基因组注释、代谢途径分析 | NA | NA | NA | NA | Vibrio natriegens | NA | 工业生物技术 |
| 11 | 2026-04-21 |
Multifunctional Roles and Microbial Production Bottlenecks of Ergothioneine
2026-Apr-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00735
PMID:41919719
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综述 | 本文综述了麦角硫因的多功能作用、微生物生产瓶颈、关键酶发现、代谢工程策略及其在食品、化妆品和制药行业的应用 | 系统总结了麦角硫因生物合成与分解代谢途径关键酶的最新发现,以及通过合成生物学和代谢组学实现的高效异源生产策略,包括化学酶级联催化路线达到的47.3 g/L最高产量 | 作为综述文章,未提出新的实验数据或原创性生产方法,主要基于现有文献进行总结分析 | 探讨麦角硫因的生产瓶颈、生物合成途径优化及其在多个工业领域的应用潜力 | 麦角硫因及其生物合成与分解代谢途径的关键酶 | 合成生物学 | NA | 代谢组学、代谢工程、化学酶催化级联 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 大肠杆菌、酿酒酵母 | 麦角硫因生物合成途径的异源重构与优化 | 食品、化妆品、制药 |
| 12 | 2026-04-21 |
NUPACK: Computational Nucleic Acid Analysis and Design
2026-Apr-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00817
PMID:41926704
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研究论文 | 本文介绍了NUPACK软件套件,用于核酸结构、设备和系统的分析与设计,服务于核酸纳米技术、分子编程、合成生物学和生命科学领域的研究人员 | NUPACK 4引入了增强的物理模型(如共轴和悬挂堆叠子系综)、显著的速度提升(20-120倍)、处理大规模复合物的能力(如30,000 nt)、混合材料支持以及多样化的序列约束设计 | NA | 开发和分析核酸结构、设备及系统,以支持核酸纳米技术、分子编程和合成生物学等领域的研究 | 核酸结构、设备和系统,包括复杂和试管系综中的相互作用链物种 | 合成生物学 | NA | 计算分析和设计算法 | NA | 核酸序列数据 | NA | NA | NA | 动态杂交级联和结构工程,包括假结的可能性 | 医学, 工业生物技术 |
| 13 | 2026-04-21 |
HySimODE: A hybrid stochastic-deterministic simulation framework for multiscale models of biological systems
2026-Apr-17, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag185
PMID:41999207
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研究论文 | 介绍HySimODE框架,一种用于生物系统多尺度建模的混合随机-确定性仿真工具 | 通过机器学习分类器自动分配物种的随机或确定性机制,无需手动指定机制或重新构建模型 | NA | 为混合随机-确定性生物化学系统仿真提供自动化框架 | 生物化学ODE模型 | 计算生物学 | NA | 机器学习分类器、刚性ODE求解器 | 混合随机-确定性模型 | ODE模型 | 涵盖多种动态机制的数据集 | NA | NA | NA | 合成生物学、神经生物学 |
| 14 | 2026-04-21 |
LinkCraft: An interactive tool for the design of flexible linkers
2026-Apr-17, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2026.169814
PMID:42001978
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研究论文 | 本文介绍了一个名为LinkCraft的计算工具,用于理性设计多域蛋白质中的内在无序连接子 | LinkCraft工具通过集成序列组成、电荷模式和长度等多因素,支持基于理化性质的自定义连接子序列生成和评估,推动了从以域为中心到以多模块为中心的蛋白质设计转变 | NA | 开发一个计算工具以促进多域蛋白质中内在无序连接子的理性设计 | 多域蛋白质中的内在无序连接子 | 合成生物学 | NA | 计算建模 | NA | 蛋白质序列和结构数据 | NA | NA | NA | NA | 生物技术, 合成生物学 |
| 15 | 2026-04-21 |
Post-translational modifications of silk proteins
2026-Apr-16, RSC chemical biology
IF:4.2Q2
DOI:10.1039/d6cb00012f
PMID:41822872
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综述 | 本文综述了丝蛋白的翻译后修饰(PTMs)如何赋予其化学多样性,从而调控其高级组装、水合作用和共价连接性,并探讨了这些修饰对蛋白质结构稳定性和机械性能的贡献 | 整合了蛋白质组学揭示的低丰度PTMs新发现,并强调了合成生物学和生物正交化学在程序化安装修饰以调控理化性质方面的最新进展 | NA | 为在化学生物学与材料科学交叉领域预测性设计下一代蛋白质基材料奠定基础 | 丝蛋白及其翻译后修饰 | 化学生物学与材料科学交叉领域 | NA | 蛋白质组学、合成生物学、生物正交化学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 材料 |
| 16 | 2026-04-21 |
Strategies for enhancing specificity and efficacy of oncolytic viruses in cancer treatment
2026-Apr-16, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2026.110708
PMID:41999961
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综述 | 本文综述了通过工程化改造溶瘤病毒以增强其肿瘤选择性和治疗效能的策略 | 系统总结了利用转录靶向、微RNA脱靶、病毒进入重定向、多层逻辑门调控系统以及联合免疫调节剂、纳米颗粒封装、载体细胞运输等多种前沿策略来设计“智能”溶瘤病毒 | NA | 提高溶瘤病毒在癌症治疗中的特异性和疗效 | 溶瘤病毒 | NA | 癌症 | 系统与合成生物学技术 | NA | NA | NA | NA | NA | 多层逻辑门调控系统 | 医学 |
| 17 | 2026-01-26 |
A new frontier in synthetic biology: leveraging phase separation for robust gene circuits
2026-Apr-15, Science bulletin
IF:18.8Q1
DOI:10.1016/j.scib.2026.01.020
PMID:41580366
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 18 | 2026-04-21 |
A Combinatorial Strategy of Semirational Screening and Rational Design for Engineering an α-1,2-Fucosyltransferase toward Efficient 2'-Fucosyllactose Biosynthesis
2026-Apr-15, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.6c00566
PMID:41983305
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研究论文 | 本文通过结合半理性筛选与理性设计策略,改造α-1,2-岩藻糖基转移酶,实现了高效、无副产物2'-岩藻糖基乳糖的生物合成 | 开发了一种结合理性计算设计(结构、进化和稳定性预测)与基于工程化L-岩藻糖响应生物传感器(FcsR-P)的半理性筛选的双重蛋白质工程策略,并通过启动子和载体优化实现了高效突变库筛选 | NA | 开发微生物平台用于高效生产2'-岩藻糖基乳糖(2'-FL),同时消除二岩藻糖基乳糖(DFL)等副产物 | α-1,2-岩藻糖基转移酶BKHT | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、理性计算设计、半理性筛选、生物传感器技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌(E. coli) | L-岩藻糖响应生物传感器(FcsR-P)、2'-FL生物合成途径 | 食品、工业生物技术 |
| 19 | 2026-04-21 |
Plant Synthetic Biology Takes Off: Bryophytes Onboard with New Tools, Systems, and Opportunities
2026-Apr-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00092
PMID:41984537
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综述 | 本文综述了植物合成生物学领域的最新进展,强调苔藓植物作为替代实验平台的重要性,以推动工具开发和跨植物谱系的协同生物工程方法 | 提出将苔藓植物(包括苔藓、角苔和地钱)作为植物合成生物学的简化模型系统,以弥补传统被子植物研究的局限性,促进通用工具和方法的开发 | 当前研究仍主要集中于被子植物,苔藓植物作为实验平台的潜力尚未充分探索,可能限制了跨植物谱系应用的广泛性 | 推动植物合成生物学的发展,通过利用更简单的植物系统来增强对植物的理解、重新设计和编程能力 | 苔藓植物(苔藓、角苔和地钱),特别是作为模型系统 | 合成生物学 | NA | 模块化克隆、基因电路、基因组编辑、合成基因组学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick | 苔藓植物(包括苔藓、角苔和地钱) | 基因电路、合成基因组学 | 农业、环境、工业生物技术 |
| 20 | 2026-04-21 |
Advanced materials for non-alcoholic fatty liver disease and cardiovascular disease comorbidity therapeutics
2026-Apr-07, Biomaterials
IF:12.8Q1
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综述 | 本文从材料科学视角重新审视非酒精性脂肪肝病与心血管疾病共病,并提出一个结合病理生理学与工程原理的转化设计框架 | 提出以材料为核心的转化设计框架,将NAFLD-CVD共病的病理机制映射到器官选择性及刺激响应性治疗干预,并整合AI引导设计与合成生物学回路以实现自适应多器官控制 | NA | 为NAFLD-CVD共病开发系统性代谢重编程的精准治疗方法 | 非酒精性脂肪肝病与心血管疾病共病的病理机制及治疗平台 | NA | 非酒精性脂肪肝病, 心血管疾病 | NA | NA | NA | NA | CRISPR, 合成生物学回路 | NA | 合成生物学回路用于自适应多器官控制 | 医学 |