合成生物学相关文章

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当前共找到 5794 篇文献,本页显示第 1 - 20 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 工程工具 宿主生物 回路设计 应用领域
1 2026-10-07
Advances and perspectives in genetically encoded biosensors for biomarker detection and theranostic circuits
2027-May, Synthetic and systems biotechnology IF:4.4Q1
综述 本文综述了基于转录调控的基因编码生物传感器(主要利用变构转录因子和双组分系统)在生物标志物检测和诊疗电路中的应用进展与前景 聚焦于微生物底盘而非哺乳动物系统,利用其易操作的遗传特性、快速响应动力学以及作为自主活体益生菌进行原位诊疗的独特潜力,并将传感器与效应基因耦合构建智能治疗遗传电路,实现闭环诊疗范式 讨论了当前挑战和未来临床转化面临的问题,但未具体说明本文自身的局限性 综述基因编码生物传感器在生物标志物检测和诊疗电路中的最新进展,探索其在靶向疾病干预中的应用,并讨论临床转化面临的挑战和未来前景 基因编码生物传感器,特别是基于变构转录因子和双组分系统的转录调控生物传感器,以及工程化微生物底盘 合成生物学 NA 合成生物学,基因编码生物传感器,转录调控工程 NA 文本 NA NA 微生物底盘 将调控传感模块整合到工程化微生物底盘,并与效应基因耦合构建智能治疗遗传电路,实现闭环诊疗 医学
2 2026-10-07
Prophage Activation Triggers Extracellular Synthesis of DNA in Bacterial Biofilms via Rolling Circle Replication
2026-Oct-05, Angewandte Chemie (International ed. in English)
研究论文 本文通过设计定制环状模板,利用前噬菌体激活触发细菌裂解和胞外DNA合成,在希瓦氏菌和枯草芽孢杆菌中构建了可编程的eDNA超结构 首次揭示了前噬菌体通过滚环复制控制胞外DNA合成、结构和功能的机制,并建立了在活细菌群落中工程化功能DNA材料的新型生物技术平台 研究仅在希瓦氏菌和枯草芽孢杆菌两种模式细菌中验证,尚未在更广泛的环境微生物或复杂自然生物膜中测试 探究前噬菌体在控制胞外DNA合成、结构和活性中的作用,并开发可编程eDNA超结构的合成平台 希瓦氏菌(Shewanella oneidensis)和枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)及其生物膜中的前噬菌体 合成生物学 NA 滚环复制、G-四链体(GQ)基序、荧光报告菌株实时监测 NA 图像、文本 NA NA 希瓦氏菌、枯草芽孢杆菌 定制环状模板指导的滚环复制产生多聚G-四链体串联体,自组装成球形或线状超结构 医学、环境、材料、工业生物技术
3 2026-10-07
The ferroptosis-cuproptosis crosstalk in hematological malignancies: multi-omics insights into gene-regulated cell death and emerging therapeutic opportunities
2026-Oct-03, Apoptosis : an international journal on programmed cell death IF:6.1Q1
综述 本文综述了血液系统恶性肿瘤中铁死亡与铜死亡之间的交叉对话,探讨了多组学视角下基因调控的细胞死亡机制及新兴治疗机会 提出了铁死亡-铜死亡轴(金属-氧化还原网络)的概念,整合多组学方法揭示RCD易感性景观,并提出人工智能、合成生物学和类器官系统相结合的精准细胞死亡工程展望 生物标志物标准化缺乏、临床试验设计困难以及患者动态分层挑战 探讨血液系统恶性肿瘤中铁死亡与铜死亡的交叉调控机制,并探索基于多组学的治疗靶点和精准细胞死亡工程策略 血液系统恶性肿瘤 多组学 血液系统恶性肿瘤 基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学、金属组学、单细胞分析、空间分析 NA 多组学数据、文本 NA NA NA NA 医学
4 2026-10-07
Deep learning architectures achieve state-of-the-art (SOTA) accuracy in protein secondary structure prediction
2026-Oct, Molecular diversity IF:3.9Q2
综述 本文综述了深度学习架构在蛋白质二级结构预测中的最新进展,涵盖混合模型设计、基准数据集和评估指标,并讨论了当前方法学局限及未来方向 系统总结了从早期机器学习到卷积神经网络、循环神经网络及Transformer架构(如AlphaFold2)在蛋白质二级结构预测中的演进,并提出了跨物种验证、不确定性感知建模及整合异质生物数据等未来方向 存在数据依赖性和数据集偏差,方法学仍有局限 概述蛋白质二级结构预测领域的最新进展,包括混合模型设计、基准数据集和评估指标,并讨论当前局限和未来方向 蛋白质二级结构预测的计算方法 机器学习 NA NA CNN, RNN, Transformer, AlphaFold2 序列数据 NA NA NA NA 医学, 合成生物学, 药物开发
5 2026-10-07
Tutorial: biomembranes in hybrid living bioelectronics
2026-Oct, Nature protocols IF:13.1Q1
综述 本文是一篇教程综述,探讨了混合活体生物电子学中生物膜与电子器件的集成方法,涵盖聚合物半导体、微纳加工、表面修饰等技术,并讨论了其在药物发现、诊断和神经形态计算中的应用 系统性地将生物膜模型与芯片器件集成,结合材料科学、纳米技术和合成生物学,提出增强细胞-器件耦合的新途径,并探索其在神经形态计算等新兴领域的应用 现有技术依赖简化的合成模型,缺乏生物复杂性;生物膜与电子界面的长期稳定性和集成度仍需进一步验证 探讨生物膜与电子器件的集成方法,增强细胞-器件耦合,推动药物发现、诊断和神经形态计算等应用 生物膜、细胞膜模型、聚合物半导体、芯片器件 生物电子学 NA 电阻抗测量、微纳加工、表面修饰、结构功能化 NA NA NA NA NA NA 医学, 神经形态计算
6 2026-10-07
Engineering defensins: Heterologous expression strategies from genetic engineering to synthetic biology
2026-Sep-29, Biotechnology advances IF:12.1Q1
综述 本文从整合工程学的角度综述了防御素的生产,强调表达调控、宿主生理与分子设计之间的相互作用,并建立了一个整合基因工程、合成生物学和AI驱动设计的多维工程框架 建立了一个整合基因工程、合成生物学和AI驱动设计策略的多维工程框架,将防御素工程从经验优化推向理性和定量化设计,并扩展优化范围超越天然序列空间 天然可用性有限,异源生产存在产量低、宿主毒性、折叠效率低和生物活性丧失等问题 改善防御素的生产、功能稳定性和可制造性,并指导可规模化生产策略的开发 防御素(Defensins),一类结构多样的宿主防御肽 合成生物学 NA 基因工程, 合成生物学, 人工智能驱动设计 NA NA NA NA NA NA 医学, 工业生物技术
7 2026-10-07
Engineered platforms for melanogenesis research: Bridging synthetic biology, bioengineering, and biomimetics
2026-Sep, Bioengineering & translational medicine IF:6.1Q1
综述 该综述整合合成生物学、生物工程和仿生技术在黑色素生成研究中的应用,提出统一框架以研究色素沉着生物学并实现黑色素及黑色素基生物材料的可扩展生产 提出将合成生物学作为研究黑色素生成的多功能工具包的统一框架,整合分子工程、微生物生物系统和仿生技术,强调非传统系统在基础色素研究及皮肤科和生物技术转化应用中的变革潜力 作为综述文章,未提供原始实验数据;现有合成生物学平台在生理相关性、伦理约束、高维护成本和有限可扩展性方面仍存在局限 整合合成生物学平台在研究和操控色素沉着生物学方面的进展,提出统一框架以推动黑色素生成的基础研究和转化应用 黑色素生成过程、色素沉着生物学、黑色素合成通路、患者来源色素沉着模型 合成生物学 色素紊乱 基因工程、异源表达系统、仿生构建体、无细胞检测 NA 文本 NA NA NA 黑色素合成通路 医学、生物技术、材料
8 2026-10-07
Fluorogenic RNA Aptamer-Based Activity Quantification of T7 RNA Polymerase
2026-Aug-18, Biochemistry IF:2.9Q3
研究论文 该文章开发了一种基于荧光RNA适配体的体外转录检测方法,用于定量测定T7 RNA聚合酶的活性单位 使用Broccoli RNA适配体作为转录报告基因,结合商业化的T7 RNA聚合酶作为标准参照,开发了一种无需放射性、简便且定量的荧光体外转录检测方法 未明确提及方法的检测限、线性范围或与其他方法的全面比较 开发一种简便、定量的荧光体外转录检测方法,以替代传统的放射性聚合酶活性测定方法 T7 RNA聚合酶及其工程化变体 合成生物学 NA 体外转录测定、荧光RNA适配体检测 NA 荧光信号数据、酶活性数据 NA NA NA NA 医学、工业生物技术
9 2026-10-07
Phage as a prospective arsenal against superbugs
2026-Aug-04, Molecular biology reports IF:2.6Q3
综述 本文综述了噬菌体疗法作为对抗超级细菌的一种有前景的方法,涵盖了基于基因组的分类、治疗优势、生物技术应用、转化流程以及临床挑战,并讨论了合成生物学和人工智能在推动噬菌体疗法发展中的作用 全面整合了噬菌体疗法的现代基因组分类、基因工程改造、噬菌体衍生蛋白、噬菌体-抗生素协同组合以及从来源到临床转化的完整工作流程,并强调了合成生物学与人工智能在克服现有障碍中的潜力 未具体说明,文中提到尽管有 compassionate use 和临床试验的积极证据,但仍存在重大的科学、监管和商业障碍 全面审视噬菌体疗法作为对抗抗菌素耐药性超级细菌的替代策略的当前景观,并探讨其未来发展方向 噬菌体、超级细菌(抗菌素耐药细菌) 传染病学、微生物学、合成生物学 细菌感染、抗菌素耐药性感染、慢性伤口感染、肺部感染 噬菌体疗法、基因工程、噬菌体衍生蛋白、噬菌体-抗生素协同组合、合成生物学、人工智能 NA 文本 NA NA NA NA 医学
10 2026-10-07
An advanced genome engineering platform for Komagataella phaffii enabling versatile in vivo DNA assembly and multiplex integration
2026-Jul-11, Journal of biological engineering IF:5.7Q1
研究论文 本文开发了一种增强同源重组效率的Komagataella phaffii(毕赤酵母)基因组工程平台,通过敲除Ku70并过表达RAD52显著提升CRISPR/Cas9编辑效率,实现了多片段体外组装和多位点整合,并成功验证了类胡萝卜素生物合成途径 通过在染色体水平协同敲除Ku70和过表达RAD52构建了HR增强型底盘(dKR),将短50-bp同源臂的整合效率从野生型的15.3%提升至68.1%;实现了九个线性DNA片段的无载体多片段组装(效率86.5%);采用tRNA-核酶CRISPR系统实现三个基因组位点的同步多基因座整合(效率44.6%);并支持十个片段的体内质粒直接组装(效率44.8%),绕过了大肠杆菌克隆步骤 摘要中未明确提及研究限制 加速基于甲醇的生物制造的设计-构建-测试-学习(DBTL)循环,将K. phaffii从蛋白质表达宿主推进为广泛适用的合成生物学和代谢工程底盘 Komagataella phaffii(毕赤酵母)及其基因组工程工具 合成生物学 NA CRISPR/Cas9基因组编辑、tRNA-核酶CRISPR系统、同源重组介导的DNA组装 NA NA NA CRISPR-Cas9 Komagataella phaffii 类胡萝卜素生物合成途径(用于功能性验证) 合成生物学, 代谢工程, 生物制造, 工业生物技术
11 2026-10-07
Next-Generation Probiotics in Allergy Therapy: Scientific Evidence and Clinical Applications
2026, Anti-inflammatory & anti-allergy agents in medicinal chemistry
综述 本文综述了下一代益生菌在过敏治疗中的应用,包括其免疫调节机制、临床证据及未来发展方向 系统总结了下一代益生菌(如Akkermansia muciniphila、Faecalibacterium prausnitzii等)相比传统益生菌在过敏治疗中的靶向优势和更精准的免疫调节机制 存在菌株特异性、剂量、免疫缺陷个体安全性及可能的监管分类问题 探讨下一代益生菌在过敏治疗中的科学证据和临床应用前景 下一代益生菌(如Akkermansia muciniphila、Faecalibacterium prausnitzii、Bacteroides fragilis及某些梭菌簇)和传统益生菌(如乳杆菌和双歧杆菌) 机器学习 过敏性疾病(特应性皮炎、过敏性鼻炎、哮喘、食物过敏) NA NA 文本 NA NA NA NA 医学
12 2026-10-07
Targeted delivery platforms for in vivo immune cell engineering: emerging strategies for cancer immunotherapy
2026, Frontiers in pharmacology IF:4.4Q1
综述 本文综述了用于体内免疫细胞工程的靶向递送平台,包括细胞穿透肽、抗体和受体介导递送、脂质纳米颗粒、聚合物载体和仿生递送系统,并讨论了其在癌症免疫治疗中的应用 系统总结了绕过传统体外细胞工程瓶颈的体内免疫细胞工程靶向递送策略,涵盖mRNA、CRISPR/Cas基因编辑系统等货物的选择性递送,并展望了纳米医学、合成生物学、基因组工程和人工智能辅助材料科学的整合 未明确提及本文的具体局限性,但指出靶向特异性、递送效率、治疗安全性、制造工艺和监管等问题尚未解决 探讨体内免疫细胞工程靶向递送技术面临的生物屏障及最新递送策略,并综述其在血液恶性肿瘤和实体瘤中的最新应用 免疫细胞(包括T细胞、NK细胞、巨噬细胞、树突状细胞等)及靶向递送系统 癌症免疫治疗, 药物递送, 基因编辑 血液恶性肿瘤, 实体瘤 mRNA疗法, CRISPR/Cas基因编辑, 靶向药物递送 NA 文本 NA CRISPR-Cas9 哺乳动物细胞 NA 医学
13 2026-10-07
Next-generation CRISPR systems and advanced delivery paradigms for precision crop improvement: a comparative case study in sugar beet (Beta vulgaris L.)
2026, Frontiers in plant science IF:4.1Q1
综述 本文综述了利用新一代CRISPR系统和先进递送范式生产无转基因作物的技术,以甜菜作为案例进行比较研究 系统比较了多种无转基因作物生产策略,并首次以甜菜为案例进行分类评估,提出将合成生物学与先进基因组编辑工具结合的方案 组织培养方案仍是生产基因组编辑植物的主要障碍,部分策略仅在模式作物中验证,尚未在甜菜中实现 探讨如何利用新一代CRISPR技术和递送范式加速气候智慧型甜菜品种的精准改良 甜菜(Beta vulgaris L.)及模式作物 农业基因组学 NA CRISPR基因编辑、基因组写入、Leaper技术、超紧凑核酸酶 NA 文本 NA CRISPR-Cas9 甜菜(Beta vulgaris L.)、植物 NA 农业
14 2026-10-07
Anti-aging effect of low molecular weight recombinant humanized collagen on photo-aging by activating adherence junction signaling pathways
2025, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 该研究评估了低分子量重组人源胶原蛋白肽(LRHC)的皮肤渗透性及其抗皮肤光老化的效果与分子机制 选用低分子量重组人源胶原蛋白肽(LRHC),系统评估其皮肤渗透率(8小时达74.7±14.2%)及抗光老化作用,并通过转录组测序首次揭示其通过激活黏附连接信号通路维持细胞骨架结构、通过激活TGF-β信号通路促进ECM生成的抗衰老机制 对RHC穿透皮肤并发挥抗衰老作用的研究仍然有限,其潜在机制在很大程度上尚未被探索 探究低分子量重组人源胶原蛋白肽(LRHC)的皮肤渗透能力及其抗皮肤光老化的作用与机制 低分子量重组人源胶原蛋白肽(LRHC)、皮肤成纤维细胞、光老化裸鼠模型 皮肤生物学、化妆品科学 皮肤老化(光老化) 转录组测序 光老化裸鼠模型 转录组测序数据、图像 光老化裸鼠模型(未提及具体样本数量) 合成生物学 NA NA 医学、化妆品
15 2026-10-07
Multiphase coacervates: mimicking complex cellular structures through liquid-liquid phase separation
2024-11-07, Chemical communications (Cambridge, England)
综述 本文综述了多相凝聚体在模拟复杂细胞结构方面的研究进展,包括设计策略、机制、结构调控及其在仿生学中的应用 聚焦于多相凝聚体作为模拟层级复杂细胞结构的稳健框架,并总结了设计策略、机制、结构调控和应用 未提及 总结多相凝聚体的最新进展,探讨其在合成生物学和材料科学中的潜力 多相凝聚体(凝聚体微滴) 合成生物学 NA 液-液相分离 NA 文本 NA NA NA NA 医学, 材料
16 2026-10-07
Optogenetic manipulation of BMP signaling to drive chondrogenic differentiation of hPSCs
2023-12-26, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 本研究利用光遗传学BMP信号系统(optoBMP)驱动人类胚胎干细胞向软骨细胞分化 首次通过CRISPR-Cas9将光遗传BMP系统整合到AAVS1位点,实现用蓝光代替BMP生长因子驱动hESCs软骨分化 未明确说明光遗传系统长期激活的稳定性及体内应用潜力 探索光遗传学在人类发育研究和组织工程中的应用 人类胚胎干细胞(hESCs) 合成生物学、组织工程 NA 光遗传学、CRISPR-Cas9基因编辑 NA 转录组数据、图像 NA CRISPR-Cas9 人类胚胎干细胞 光遗传BMP信号系统(optoBMP) 医学、组织工程
17 2026-10-06
Evaluating Malat1-derived 3'end sequences for functional transgene expression in human cells using synthetic mRNA delivery
2026-12, RNA biology IF:3.6Q2
研究论文 本文评估了基于Malat1衍生的3'端序列元件替代poly(A)尾的策略,通过合成mRNA递送在人类细胞中实现功能性转基因表达 首次系统比较Malat1衍生的3'端基序与经典poly(A)尾在合成报告RNA中的翻译效率,并探索三螺旋结构作为poly(A)替代方案的可行性 测试的Malat1衍生基序虽然能支持报告mRNA的翻译,但其效率始终低于经典poly(A)尾;未来需要优化三螺旋序列和折叠、测试更多三螺旋结构并探索小分子调控含三螺旋RNA的稳定性和翻译 评估基于Malat1衍生3'端序列替代poly(A)尾的策略,以探索其在合成生物学和RNA治疗中的应用潜力 编码绿色荧光蛋白的合成报告RNA,包含Malat1衍生的3'端基序或经典poly(A)尾 合成生物学 NA 合成mRNA递送 NA NA NA NA 人类细胞 NA 医学,合成生物学
18 2026-10-06
The grammar of the pangenome: terms, concepts, methods, and emerging patterns-a general framework for comparative genomics and genome biology
2026-Oct-05, Microbiology and molecular biology reviews : MMBR IF:8.0Q1
综述 本文综述了泛基因组研究的基本概念、术语、方法和新兴模式,并提出了比较基因组学和基因组生物学的通用框架 提出了修订的泛基因组标准、标准操作流程以及提高分析可重复性的进一步目标,并基于249个分类群和17,858个基因组序列的分析展示了主要模式 泛基因组分析采用多种不同流程,不可避免地引入了可重复性挑战 综述泛基因组研究的基本概念,比较计算平台和算法,提出提高可重复性的标准操作流程和框架 泛基因组研究的概念、方法、计算平台、算法以及249个分类群的基因组序列 比较基因组学 NA 泛基因组分析 NA 基因组序列 249个分类群,17,858个基因组序列 NA NA NA 医学,合成生物学,生物技术
19 2026-10-06
Research progress of Rumen microbes utilizing lignocellulose for high-value chemical production
2026-Sep, Biodesign research
综述 系统总结了瘤胃微生物降解木质纤维素及其代谢途径用于高值化学品生产的机制、策略与瓶颈 聚焦瘤胃微生物组作为木质纤维素转化平台,整合过程、群落与遗传层面策略,并提出多组学与合成生物学提升群落稳定性与代谢可控性 未涉及具体实验验证,瘤胃微生物群落不稳定、代谢通量难控制及工艺放大困难等瓶颈仍待解决 为基于瘤胃微生物的可持续木质纤维素高值化转化工艺提供理论与技术指导 瘤胃微生物及其木质纤维素降解与化学品合成代谢网络 合成生物学 NA 多组学分析,合成生物学 NA 文本 NA NA 瘤胃微生物 NA 工业生物技术,能源,材料
20 2026-10-06
Programmable living therapeutics for cancer immunotherapy
2026-05-21, Cell chemical biology IF:6.6Q1
综述 该综述将合成生物学驱动的活体疗法在肿瘤免疫治疗中的应用划分为工程化CAR-T细胞、溶瘤细菌和溶瘤病毒三大模态,并系统梳理了各模态的合成线路设计与临床转化挑战 首次将工程化CAR-T细胞、溶瘤细菌和溶瘤病毒三大活体治疗模态统一纳入合成生物学框架进行系统分类比较,并综合提出线路复杂度、靶向精度、底盘优化和跨平台协同四大转化瓶颈 作为综述性文章,未提供原始实验数据,缺乏对所述合成线路的定量性能比较与标准化评估,且临床转化可行性分析主要停留在理论层面 系统梳理可编程活体疗法在肿瘤免疫治疗中的合成生物学设计策略,总结三大模态的最新进展,并探讨临床转化面临的关键挑战与未来方向 工程化CAR-T细胞、溶瘤细菌、溶瘤病毒等活体治疗平台 合成生物学 癌症 合成生物学线路工程 NA 文本 NA NA CAR-T细胞, 细菌, 病毒 小分子响应开关, 物理信号响应开关, 肿瘤标志物响应开关, 群体感应线路, 肿瘤微环境响应逻辑门, 肿瘤选择性启动子, miRNA靶向模块, 衣壳/配体重靶向 医学
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