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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-09-14 |
Engineering a genetic construct to express soluble proteins tethered to the cell membrane
2026-Sep-16, Bioscience reports
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BSR20260216
PMID:42619223
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研究论文 | 该研究通过计算模拟与实验验证,设计了一个能够将可溶性蛋白锚定在细胞膜上表达的基因构建体,并以绿色荧光蛋白为模型进行了验证 | 开发了一种模块化、通用的基因构建体,可将可溶性蛋白固定在细胞膜上,并可通过组氨酸标签纯化,克服了现有工具缺乏通用性和模块性的问题 | 研究仅以绿色荧光蛋白作为模型蛋白验证,尚未在其他目标蛋白中广泛测试,其在复杂生理环境中的适用性有待进一步验证 | 设计并验证一种可将可溶性蛋白锚定于细胞膜的基因构建体,以填补合成生物学中此类模块化工具的空白 | 绿色荧光蛋白作为模型可溶性蛋白,以及表达该蛋白的细胞系统 | 合成生物学 | NA | 计算模拟,实验验证,荧光成像,蛋白纯化 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学,工业生物技术 |
| 2 | 2026-09-14 |
Elucidating the Requirements for microRNA-Mediated Upregulation Enables Reengineering of Upregulatory Sites
2026-Sep-14, ACS chemical biology
IF:3.5Q2
DOI:10.1021/acschembio.6c00503
PMID:42728713
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研究论文 | 利用miRFluR双荧光报告系统,系统研究miRNA介导的蛋白表达上调所需的序列和结构条件,并实现上调位点的重新设计 | 揭示了miRNA上调蛋白表达需要特定序列元件和RNA二级结构,且该效应依赖于局部UTR结构背景;首次证明上调位点可被重新设计以响应替代miRNA | 研究仅以miR-891b调控B3GLCT为模型系统,上调机制在其他miRNA和靶标中的普适性尚待验证 | 阐明miRNA介导蛋白表达上调的分子要求,并探索上调位点的重新设计可能性 | miR-891b及其靶标B3GLCT的3'UTR上调位点 | 合成生物学 | NA | 双荧光报告基因检测(miRFluR assay)、定点突变、截短分析 | NA | 荧光信号数据、序列数据 | NA | NA | 哺乳动物细胞 | 双荧光报告基因系统(miRFluR) | 医学, 工业生物技术 |
| 3 | 2026-09-14 |
Advances in CRISPR-Based Genetic Engineering of Bifidobacterium
2026-Sep-12, Biochimie
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.biochi.2026.09.003
PMID:42731613
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综述 | 本文综述了基于CRISPR的基因编辑技术在双歧杆菌工程化改造中的进展,涵盖从传统同源重组到CRISPR/Cas系统、CRISPRi/a和碱基编辑的应用。 | 系统总结了内源和外源CRISPR系统在双歧杆菌中的应用,并强调了CRISPR技术与合成生物学整合以开发下一代工程化双歧杆菌平台的潜力。 | 菌株特异性差异和限制-修饰屏障仍然是主要制约因素,同时存在生物安全方面的担忧。 | 概述双歧杆菌基因组编辑技术的发展,特别是CRISPR相关技术,并探讨其在临床前和食品生物技术中的应用前景。 | 双歧杆菌 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas, CRISPRi/a, 碱基编辑 | NA | 文本 | NA | CRISPR-Cas9 | 双歧杆菌 | NA | 医学, 食品 |
| 4 | 2026-09-14 |
Sulfated polysaccharides and their utilization mechanisms by microorganisms: A review
2026-Sep-10, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.154431
PMID:42722257
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综述 | 本文综述了硫酸化多糖(SPS)的来源、结构、生物活性以及微生物对其的降解机制,重点探讨了肠道微生物(特别是拟杆菌门、乳酸菌和微球菌)降解SPS的策略和相关酶的作用 | 系统比较了不同微生物对硫酸化多糖的降解策略,并强调了微生物自身合成的SPS在其生存发展中的作用 | 摘要中未明确提及 | 总结硫酸化多糖的研究进展,探讨其微生物降解机制及应用潜力 | 硫酸化多糖(肝素、硫酸软骨素、岩藻多糖、磺达肝癸钠)及降解它们的微生物(拟杆菌门、乳酸菌、微球菌等) | 合成生物学, 代谢工程 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学, 合成生物学, 代谢工程, 医疗保健 |
| 5 | 2026-09-14 |
Engineering Bacillus Subtilis for Efficient Biosynthesis of Riboflavin: Current Knowledge and Future Perspectives
2026-Sep, Applied biochemistry and biotechnology
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s12010-026-05755-1
PMID:42207417
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综述 | 本综述全面总结了近年来通过代谢工程策略增强枯草芽孢杆菌核黄素生物合成的研究进展,并展望了未来发展方向 | 系统整合了合成生物学工具(如核糖开关工程、调控元件设计、高通量筛选)与多组学数据和机器学习驱动预测建模,提出了构建智能枯草芽孢杆菌细胞工厂的前瞻性框架 | 精确调控控制、多基因表达优化和基因组整合效率仍面临挑战;过量生产的代谢负担和缺乏可跨工业规模预测菌株性能的通用调控模型限制了实际应用 | 总结增强枯草芽孢杆菌核黄素生物合成的代谢工程策略,并探讨未来发展方向 | 枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)核黄素生物合成途径 | 合成生物学, 代谢工程 | NA | 代谢工程, 适应性实验室进化, 组学分析, 13C代谢通量分析, 核糖开关工程, 高通量筛选 | 机器学习预测模型 | 多组学数据 | NA | NA | 枯草芽孢杆菌 | 核黄素生物合成途径, 核糖开关调控元件 | 医药, 食品, 工业生物技术 |
| 6 | 2026-09-14 |
Vesicle-Templated Self-Assembly of Programmable Freestanding Multi-μm DNA Shells
2026-05-27, Nano letters
IF:9.6Q1
DOI:10.1021/acs.nanolett.6c00402
PMID:42130031
|
研究论文 | 本文介绍了一种简单且广泛适用的方法,通过先在巨型单层囊泡上组装DNA壳,再经表面活性剂介导去除脂质体,获得保留膜模板几何形状的独立DNA壳 | 首次实现了独立、膜模拟的DNA壳,通过囊泡模板化自组装及表面活性剂去除脂质体,利用两种不同DNA构造(复杂桶状DNA折纸和简单11寡核苷酸纳米星基序)展示方法的普适性,并通过DNA折纸的位点特异性可寻址性实现多层壳的可控形成 | 摘要中未明确提及 | 开发一种简单、广泛适用的方法,构建独立、膜模拟的DNA壳,用于自下而上的合成生物学中可调谐的DNA-only区室化 | 巨型单层囊泡、DNA折纸结构、11寡核苷酸纳米星基序、DNA壳 | 合成生物学 | NA | DNA折纸、囊泡模板化自组装、表面活性剂介导脂质体去除 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学、材料 |
| 7 | 2026-09-14 |
An in vitro approach for simulating divergent Golgi O-glycosylation of tumor-associated MUC1 from normal MUC1
2026-Apr-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-72151-y
PMID:42020444
|
研究论文 | 本文建立了一种体外一锅法合成生物学方法,模拟正常与肿瘤相关MUC1的分歧O-糖基化途径,以解析肿瘤相关抗原的合成机制 | 首次通过体外一锅法合成生物学方法模拟MUC1分歧糖基化途径,证明GALNTs向ER的癌症相关重定位导致Tn抗原完全占据,并揭示ST6GALNAC1专一性驱动α-2-6唾液酸化且严格偏好T13位点 | 该研究为体外模拟体系,可能无法完全反映体内复杂细胞环境中的糖基化过程 | 阐明癌症中异常糖基化的分子机制,特别是MUC1肿瘤相关抗原的合成途径 | MUC1蛋白的O-糖基化过程及相关糖基转移酶(GALNTs、ST6GALNAC1) | 糖生物学 | 癌症 | 体外一锅法合成生物学、动力学模拟、计算机反应动态模拟 | 动力学模型、计算机反应动态模拟 | 动力学数据、模拟数据 | NA | NA | NA | 模拟分歧糖基化途径的体外合成生物学体系 | 医学 |
| 8 | 2026-09-14 |
Programmable Synthesis of DNA Networks in Giant Vesicles via Rolling Circle Amplification
2026-04-15, Nano letters
IF:9.6Q1
DOI:10.1021/acs.nanolett.6c00726
PMID:41919686
|
研究论文 | 本文提出了一种通过滚环扩增(RCA)在巨型囊泡内可编程合成DNA网络以增强囊泡力学性能的仿生微反应器平台 | 利用RCA信号在巨型囊泡内部构建长DNA链并组织成内部网络,使合成囊泡的刚性比原始囊泡提高一个数量级,首次将分子尺度生化活性与介观尺度力学行为耦合,并通过DNA折纸纳米孔实现囊泡内外环境的分子运输与可控扩增 | 摘要中未明确提及该研究的局限性 | 构建具有功能调控和机械反馈能力的合成细胞,推动合成生物学、生物制造和仿生材料领域的发展 | 巨型囊泡(giant vesicles)内的DNA网络及DNA折纸纳米孔 | 合成生物学 | NA | 滚环扩增(RCA)、DNA折纸(DNA origami) | NA | NA | NA | NA | NA | 基于滚环扩增的DNA网络自组装通路,结合DNA折纸纳米孔形成具有分子运输功能的合成区室 | 医学, 材料, 工业生物技术 |
| 9 | 2026-09-14 |
Late Stage Mannan Metabolism in Cellvibrio japonicus Requires the Combined Action of a Mannosyl-Glucose Phosphorylase and a Mannobiose Epimerase
2026-02, Molecular microbiology
IF:2.6Q3
DOI:10.1111/mmi.70043
PMID:41525168
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研究论文 | 该研究对Cellvibrio japonicus中参与甘露聚糖代谢后期阶段的甘露糖基-葡萄糖磷酸化酶(Mgp130A)和甘露二糖差向异构酶(EpiA)进行了生理学和生物化学表征 | 首次对C. japonicus中甘露聚糖代谢后期阶段的Mgp130A和EpiA进行了功能突变分析和生化测定,构建了新质粒pJKN5用于互补分析,并发现了缺乏epiA基因的菌株中半乳糖取代的甘露寡糖具有意外的毒性效应 | 研究主要聚焦于C. japonicus这一特定菌株,未验证这些酶在其他细菌中的普适性,且对毒性效应的分子机制未深入探讨 | 阐明C. japonicus中甘露聚糖代谢后期阶段甘露糖基-葡萄糖磷酸化酶和甘露二糖差向异构酶的生理重要性和生化活性 | Cellvibrio japonicus中的甘露糖基-葡萄糖磷酸化酶(Mgp130A)和甘露二糖差向异构酶(EpiA) | 合成生物学 | NA | 功能突变分析,生化酶活测定,质粒互补分析 | NA | NA | NA | NA | Cellvibrio japonicus | NA | 医药,工业生物技术 |
| 10 | 2026-09-14 |
Bacteriophage research in India and its implications for human health: A scoping review
2026-Feb, The Indian journal of medical research
DOI:10.25259/IJMR_2923_2025
PMID:41949138
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综述 | 该文章通过范围综述系统梳理了印度噬菌体研究的现状,并重点分析了其对人类健康的意义 | 首次对印度噬菌体研究进行系统性的范围综述,按照应用领域、研究类型和结局进行分类,并明确指出了印度在噬菌体研究转化领域的关键缺口 | 纳入研究大多来自实验室环境,临床和转化研究极少,缺乏临床试验、药代动力学-药效动力学研究、合成生物学方法以及One Health综合监测系统 | 系统调查和分类印度开展的噬菌体研究,重点评估其对人类健康的影响 | 在印度环境中开展的噬菌体或噬菌体治疗相关原创研究,涵盖人类、动物和环境 | 医学 | 抗菌药物耐药性感染 | NA | NA | 文本 | 111项研究(来自5个数据库共4756篇文献筛选后纳入) | NA | NA | NA | 医学 |
| 11 | 2026-09-14 |
Governing synthetic biology and artificial intelligence (AI) convergence: emerging biosecurity priorities for Africa
2026, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2026.1834976
PMID:42729550
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研究论文 | 本文分析了合成生物学与人工智能融合在非洲带来的生物安全治理挑战,并提出了适应性的治理优先事项 | 引入并讨论了“结构性暴露点”这一概念,定义为增加新兴技术能力超越监管可能性的系统性治理条件,并针对非洲情境提出了具体的治理优先事项和适应性治理方法 | 文章主要基于对非洲生物安全监管机构和国家框架的分析,可能缺乏对具体实施效果的实证评估 | 填补合成生物学与人工智能融合在非洲生物安全治理方面的研究空白,提出切实可行的治理路径 | 非洲的生物安全监管机构和国家框架 | 生物安全治理 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学, 环境 |
| 12 | 2026-09-14 |
Innate lymphoid cells in the spotlight: from biomarkers to blueprint for innovative immunotherapy
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1655730
PMID:40963622
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综述 | 本文综述了先天淋巴细胞(ILCs)在免疫调节、组织稳态和疾病发病机制中的作用,并探讨其作为生物标志物和创新免疫治疗蓝图的潜力。 | 系统整合了ILC亚群的功能多样性、可塑性和组织驻留性,强调其作为预测、诊断和治疗靶点的作用,并提出结合多组学、单细胞图谱和合成生物学指导ILC疗法设计的新视角。 | ILC亚群异质性、可塑性、组织限制性驻留和有限的可扩展性仍是临床转化的障碍。 | 综述ILC生物学和转化研究进展,探讨其作为生物标志物和治疗靶点的潜力,并展望下一代精准免疫治疗。 | 先天淋巴细胞(ILCs),包括ILC1s、ILC2s、ILC3s和淋巴组织诱导细胞(LTi) | 免疫学,免疫治疗 | 自身免疫疾病,癌症 | NA | NA | 文本 | NA | 嵌合抗原受体(CARs) | NA | NA | 医学 |
| 13 | 2026-09-13 |
Bacterial R-bodies with common morphologies and unrolling dynamics are phylogenetically scattered, indicating extensive lateral gene transfer and wide application potential
2026-Sep-11, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.00864-26
PMID:42725757
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研究论文 | 该研究比较了六种假单胞菌门细菌的R-body的形态学、遗传学及展开动力学,揭示了广泛的水平基因转移,并首次根据酸诱导延伸动力学将R-body分为快速爆发和慢速两类 | 首次利用高帧率光学显微镜视频记录研究R-body的延伸与回缩动力学,发现R-body可分为快速爆发和慢速两种酸诱导延伸类型,并提出该动力学标准可能是选择生物技术用R-body工具的最有用依据 | 研究仅涵盖六种假单胞菌门的R-body,样本量有限,且广泛的水平基因转移使得基于遗传数据的统一分类框架变得复杂 | 整合不同物种R-body的遗传学、形态学和展开动力学数据,为构建R-body生物技术工具箱提供分类依据 | 来自六种假单胞菌门的R-body,包括系统发育多样的内共生菌和非内共生菌 | 合成生物学 | NA | 电子显微镜,高帧率光学显微镜视频记录 | NA | 图像,视频,遗传数据 | 六种假单胞菌门的R-body | NA | NA | NA | 医学,材料 |
| 14 | 2026-09-13 |
Research progress on metabolic engineering for efficient squalene synthesis in yeast cell factories
2026-Sep-11, Biotechnology letters
IF:2.0Q3
DOI:10.1007/s10529-026-03785-7
PMID:42726309
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综述 | 本文综述了酵母细胞工厂中角鲨烯生物合成途径及代谢工程策略,重点介绍了多细胞器协同工程和证据来源区分。 | 系统总结了通过增强甲羟戊酸途径、调控竞争代谢途径、亚细胞区室化工程、优化辅因子平衡和产物外排策略等提高角鲨烯产量的方法,并强调了多细胞器协同工程的重要性,特别是解脂耶氏酵母和酿酒酵母中的细胞器工程。 | 本文为综述,未进行原始实验研究,可能受限于现有文献的覆盖范围和证据质量。 | 综述酵母中角鲨烯的生物合成途径和代谢工程策略,为未来提高角鲨烯产量和促进相关萜类化合物合成提供基础。 | 酵母细胞工厂,特别是解脂耶氏酵母和酿酒酵母。 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | 解脂耶氏酵母, 酿酒酵母 | 角鲨烯生物合成途径 | 食品, 医药, 疫苗佐剂 |
| 15 | 2026-09-13 |
Evolving conservation: The role of unconventional approaches to restore contemporary vertebrate populations and genomic biodiversity
2026-Sep-03, The Journal of heredity
IF:3.0Q2
DOI:10.1093/jhered/esag040
PMID:42166210
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综述 | 本文探讨了非常规生物技术手段(如基因救援、合成生物学和基因编辑)在恢复当代脊椎动物种群和基因组生物多样性中的作用,并分析了其机遇、伦理争议与监管挑战 | 提出将生物技术与保护生物学和恢复生态学进行审慎、透明整合的观点,强调在生态学知识和利益相关者参与的基础上协调保护与恢复目标 | 生物技术整合面临生态不可预测性和公众对野生种群基因干预的抵制等伦理、生态和监管问题 | 审视生物技术在保护和恢复中的应用现状,探讨如何通过生物技术手段应对生物多样性丧失的挑战 | 脊椎动物种群、基因组生物多样性、濒危物种、入侵物种 | 保护生物学、恢复生态学 | NA | 基因救援、合成生物学、基因编辑 | NA | NA | NA | 基因编辑 | NA | NA | 环境、农业 |
| 16 | 2026-09-13 |
From Circuits to Symphonies: A Systems-Engineering Blueprint for Multimicrobial Synthetic Biology
2026-Sep, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.76981
PMID:42536811
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综述 | 本文提出一个受交响乐启发的系统工程框架,用于多微生物合成生物学,将联合体设计组织为通信、时间调控、生态构建和预测建模四个协调层,并提供模块化工程蓝图以指导合成微生物群落的构建、稳定和优化 | 首次提出受交响乐启发的系统工程框架,将多微生物合成生物学从孤立遗传控制重新定位为协调系统设计问题;提出四个应用依赖的协调层(通信、时间调控、生态构建、预测建模)和模块化工程蓝图 | 框架是模块化而非规定性的,未提供具体实验验证;涉及代谢物运输、种群漂移、参数不确定性和过程规模实施等约束 | 为多微生物合成生物学提供一个结构化的系统工程基础,指导合成微生物群落在工业、环境和治疗应用中的开发 | 合成微生物联合体(多物种微生物群落) | 合成生物学 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | 多微生物联合体协调层设计(通信、时间调控、生态构建、预测建模) | 工业生物技术, 环境, 医学 |
| 17 | 2026-09-13 |
Predictive design of tissue-specific mammalian enhancers that function in the mouse embryo
2026-Sep, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-026-02729-1
PMID:42642514
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研究论文 | 该文章提出了一种利用深度学习设计在小鼠胚胎中具有组织特异性的合成增强子的通用策略 | 首次证明深度学习可以在哺乳动物基因组的体内调控复杂性中可靠地设计组织特异性增强子,仅需适度训练集即可实现 | 研究仅在小鼠胚胎中测试了15个增强子,样本量有限,且未涉及其他哺乳动物或成体组织 | 开发能够可靠设计在哺乳动物体内发挥功能的组织特异性增强子的通用方法 | 小鼠胚胎中的心脏、肢体和中枢神经系统组织特异性增强子 | 机器学习 | NA | 染色质可及性测序 | CNN | 序列 | 15个合成增强子 | NA | 小鼠 | NA | 医学, 合成生物学, 基因治疗 |
| 18 | 2026-09-13 |
Integrated multi-omics analysis reveals a pH-driven metabolic and translational switch in Ureaplasma parvum
2026-08-04, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.03463-25
PMID:42429378
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研究论文 | 本文通过整合蛋白质组学、代谢组学和RNA修饰图谱,构建了微小脲原体pH适应的系统级模型 | 揭示了微小基因组细菌通过预先存在的共调控功能模块的分岔式激活来实现pH适应,并强调了表观转录组动态重组在适应性中的重要性 | 未明确说明样本量,且研究结果可能受限于单一物种,需进一步验证是否可推广至其他基因组缩减微生物 | 构建微小脲原体pH适应的系统级模型,探究其适应机制 | 微小脲原体(Ureaplasma parvum) | 多组学 | NA | 蛋白质组学, 代谢组学, RNA修饰图谱 | NA | 组学数据 | NA | NA | NA | NA | 医学, 合成生物学 |
| 19 | 2026-09-13 |
Engineering plasmids with synthetic origins of replication
2026-Feb-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68907-1
PMID:41629321
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研究论文 | 该文章通过重构天然pMB1复制起点,创建了具有可定制拷贝数的质粒,并进一步开发了使用合成RNA调控因子的兼容性SynORI系统,实现独立拷贝控制、信号响应和多重复制报告。 | 首次系统性重构天然pMB1复制起点以创建可调拷贝数的合成复制起点SynORI,并利用合成RNA调控因子实现兼容性独立拷贝控制、模块化信号响应以及多重复制报告功能;构建了包含6个兼容SynORI质粒的文库并在一周内于大肠杆菌中共同维持。 | 摘要未明确说明该SynORI系统在不同宿主或工业条件下的长期稳定性、脱靶效应及与天然质粒的相互作用等潜在限制。 | 建立创建具有合成复制起点质粒的可行性,并开发可用于合成生物学的SynORI技术。 | 质粒复制起点(天然pMB1起点)及合成复制起点SynORI系统。 | 合成生物学 | NA | 质粒工程、合成RNA调控因子、合成复制起点工程 | NA | NA | 6个兼容SynORI质粒文库,在大肠杆菌中共同维持一周。 | NA | E. coli | 合成复制起点(SynORI)系统、合成RNA调控因子、多重复制报告系统 | 合成生物学、生物技术 |
| 20 | 2026-09-13 |
The Landscape of Synthetic Biology and Bioengineering in Spain
2026 Jan-Dec, Engineering biology
DOI:10.1049/enb2.70011
PMID:42724222
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综述 | 本文是一篇观点文章,系统梳理了西班牙合成生物学与生物工程过去二十年的发展轨迹、核心贡献、当前优势与新兴机遇,并讨论了该领域面临的技术、监管、概念与转化挑战 | 首次以国家视角全面描绘西班牙合成生物学共同体的发展图景,突出其在欧洲合成细胞计划、全球生物铸造网络、SEVA标准化平台以及MISB硕士和SYNBIO-CSIC COFUND博士网络等高级培训项目中的角色,并聚焦物质-生命界面、生物制造和可持续生物技术等新兴方向 | 作为观点文章,未提供原始实验数据或系统性定量分析,对西班牙合成生物学发展水平的评估主要基于作者视角,可能缺乏全面的文献计量或产业调研支撑 | 梳理并评述西班牙合成生物学与生物工程的发展历程、现状与未来方向,为政策制定、科研布局和人才培养提供参考 | 西班牙合成生物学与生物工程研究共同体、相关机构、平台、培训项目及政策环境 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医药, 工业生物技术, 环境, 材料 |