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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-06-25 |
Synthetic biology of oncolytic bacteria: Comparative microbial chassis and precise killing strategies
2026-Dec, Toxicology reports
DOI:10.1016/j.toxrep.2026.102292
PMID:42339179
|
综述 | 综述利用合成生物学工程改造溶瘤细菌的最新进展,包括不同微生物底盘及精确杀灭策略 | 系统比较了多种微生物底盘(沙门氏菌、李斯特菌、大肠杆菌、梭菌、双歧杆菌、酵母等)在癌症治疗中的应用,并总结了CRISPR/Cas9基因编辑、遗传逻辑电路和自杀开关等合成生物学技术增强安全性和特异性的方法 | NA | 为开发具有精确靶向能力和增强治疗稳定性的溶瘤细菌提供合成生物学视角 | 溶瘤细菌及其微生物底盘 | 合成生物学 | 癌症 | CRISPR/Cas9基因编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 沙门氏菌, 李斯特菌, 大肠杆菌, 梭菌, 双歧杆菌, 酵母 | 遗传逻辑电路, 自杀开关 | 医学 |
| 2 | 2026-06-25 |
Microbial factories for lipid: Engineering synthetic routes and regulatory networks for Triacylglycerol biosynthesis
2026-Oct, Food microbiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.fm.2026.105136
PMID:42215216
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综述 | 系统总结微生物三酰甘油生产的合成途径与调控网络工程进展,为可持续油脂生物制造提供技术路线图 | 将脂质生物化学基础与先进代谢工程技术相结合,提出非模式产油微生物开发、酶工程优化及共培养等创新策略 | 未涉及具体实验数据验证,主要基于文献分析提出未来方向 | 综述微生物三酰甘油生产的最新进展,为工业规模生物制造提供系统技术路线 | 产油微生物及三酰甘油合成路径 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | 文献数据 | NA | NA | 产油微生物 | 三酰甘油合成通路 | 生物能源, 食品工业 |
| 3 | 2026-06-25 |
Haplotype-resolved T2T genome and population resequencing provide insights into the domestication and mogroside biosynthesis of Siraitia grosvenorii (Cucurbitaceae)
2026-Jul, Horticulture research
IF:7.6Q1
DOI:10.1093/hr/uhag103
PMID:42338566
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研究论文 | 通过单倍型解析的T2T基因组和群体重测序,揭示了罗汉果的驯化历史及其罗汉果甜苷生物合成机制 | 首次构建了罗汉果单倍型解析的端粒到端粒无缺口基因组,并结合群体基因组分析阐明了驯化瓶颈和选择性清除对基因组结构的影响 | 未明确提及,但可能受限于样本量(173个重测序基因组)和功能验证实验的缺失 | 解析罗汉果的驯化过程及罗汉果甜苷V的生物合成机制,为分子育种和合成生物学提供基因组基础 | 罗汉果(Siraitia grosvenorii)及其基因组、群体和转录组数据 | 基因组学 | NA | T2T基因组组装、群体重测序、比较基因组学、转录组分析 | NA | 基因组序列、重测序数据、转录组数据 | 单倍型基因组(2个单倍型)及173个重测序基因组 | NA | NA | NA | 农业、食品 |
| 4 | 2026-06-25 |
Transcription Factors: A Promising Third-Generation Core Sensing Element for Developing Low-Cost, On-Site Rapid Detection Technologies for Food Contaminants
2026-Jun-24, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c14507
PMID:42262033
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综述 | 综述转录因子作为第三代核心传感元件在食品污染物快速检测中的发展与应用 | 提出近端诱变策略,并整合人工智能辅助分析来优化转录因子及其DNA结合位点 | NA | 总结转录因子在开发低成本、现场快速食品污染物检测技术中的应用和挑战 | 转录因子及其同源DNA结合位点 | 机器学习和合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 微生物系统 | 转录因子生物传感器 | 食品安全 |
| 5 | 2026-06-25 |
Bioengineered bacteria in cancer immunotherapy: mechanistic advances, therapeutic strategies and clinical potential
2026-Jun-24, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-026-05030-1
PMID:42340392
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综述 | 综述生物工程细菌在癌症免疫治疗中的机制进展、治疗策略和临床潜力 | 系统总结了合成生物学、基因工程和理化修饰在细菌编程中的应用,以及多种治疗模态的协同整合 | 免疫清除、遗传稳定性、毒性风险和肿瘤微环境异质性等挑战限制了临床转化 | 探讨生物工程细菌作为癌症免疫治疗平台的设计与临床应用 | 生物工程细菌 | 合成生物学 | 癌症 | 基因工程, 合成生物学, 理化修饰 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick | 细菌 | 群体感应回路, 缺氧响应启动子, 配体-受体靶向系统 | 医学 |
| 6 | 2026-06-25 |
Genetically engineered outer membrane vesicles as next-generation bionanomaterials for therapeutic and diagnostic applications
2026-Jun-23, Journal of materials chemistry. B
DOI:10.1039/d6tb00650g
PMID:42300204
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综述 | 本文系统综述了基因工程外膜囊泡作为下一代生物纳米材料在治疗和诊断应用中的设计策略与转化前景 | 整合合成生物学与基因工程技术将天然外膜囊泡转化为可编程智能生物纳米平台,并系统阐述表面展示、货物装载及膜调控三大工程策略 | 临床转化面临规模化生产、安全性评估和监管路径等关键挑战 | 探讨基因工程外膜囊泡在精准治疗与诊断中的设计原则及未来发展方向 | 基因工程外膜囊泡(geOMVs) | 合成生物学 | 癌症 | 基因工程 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 革兰氏阴性菌 | 表面展示、货物封装、膜调控 | 医学 |
| 7 | 2026-06-25 |
Recent advances in protein engineering and synthetic applications of amino acid oxidases
2026-Jun-23, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.135229
PMID:42336113
|
综述 | 全面分析了氨基酸氧化酶的催化机制和活性检测方法,并重点介绍了蛋白质工程策略的最新进展及其合成应用 | 重点阐述了定向进化、理性/半理性设计及AI引导策略在提升AAO活性、稳定性和底物范围方面的应用,并强调了其在化学酶级联反应、多酶级联去消旋化和动力学拆分中的扩展合成应用 | NA | 总结氨基酸氧化酶蛋白质工程策略和合成应用的最新进展,以推动其在现代生物催化和合成生物学中的应用 | 氨基酸氧化酶(D型和L型) | NA | NA | 蛋白质工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 制药, 农业化学 |
| 8 | 2026-06-25 |
SARGE: Serine Integrase-Assisted Rapid Genome Integration through Cassette Exchange in Escherichia coli
2026-Jun-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00334
PMID:42319839
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研究论文 | 介绍了一种基于丝氨酸整合酶的大肠杆菌快速基因组整合平台SARGE,通过盒交换实现大DNA片段的迭代插入 | 结合正交丝氨酸整合酶PhiC31和Bxb1与合理的供体质粒设计,无需抗性标记切除即可实现快速、可编程的整合循环,并采用双荧光报告系统实现肉眼直接筛选正确重组子 | 当前尚未探索在除大肠杆菌外的其他微生物宿主中的应用,且对更大尺寸DNA片段的整合效率有待验证 | 开发一种高效、可扩展且简便的迭代基因组整合平台,用于合成生物学和基因组工程 | 大肠杆菌基因组 | 合成生物学 | NA | 丝氨酸整合酶辅助的盒交换 | NA | NA | NA | PhiC31整合酶, Bxb1整合酶, 双荧光报告系统(sfGFP和mKate) | 大肠杆菌 | 基因盒交换系统,包含双荧光报告基因的绿色-红色筛选策略 | 工业生物技术, 合成生物学 |
| 9 | 2026-06-25 |
Tardigrade-Derived Strategy for Low-Cost Storage of Cell-Free Expression Lysates
2026-Jun-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00281
PMID:42319881
|
研究论文 | 该论文提出一种利用水熊虫来源的CAHS蛋白实现无细胞表达裂解液低成本储存的方法 | 首次将水熊虫源CAHS蛋白用于无细胞表达系统,无需添加剂即能在室温干燥条件下保持蛋白质合成活性 | 研究未深入探讨CAHS蛋白保护机制在不同无细胞系统或长期储存下的稳定性 | 解决无细胞表达系统对低温储存的依赖,降低其制备与保存成本 | 无细胞表达裂解液及水熊虫来源的CAHS保护蛋白 | 合成生物学 | NA | 干燥、裂解液制备、蛋白质合成活性检测 | NA | 实验数据 | 未明确说明样本数量,涉及含CAHS蛋白与对照无CAHS的无细胞裂解液 | NA | 大肠杆菌(推测) | NA | 合成生物学、便携式生物技术 |
| 10 | 2026-06-25 |
Synthetic Mirror Bacteria as a Frontier for Chiral Synthetic Biology and Biocontainment
2026-Jun, MicrobiologyOpen
IF:3.9Q2
DOI:10.1002/mbo3.70356
PMID:42338029
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综述 | 本文综述了镜像细菌的理论发展,涵盖分子基础、工程策略、生物安全考量及生态影响 | 系统性阐述了镜像生物学系统的构建原则及其与天然生物系统的立体化学不兼容性,为手性合成生物学和生物防护提供新视角 | 镜像细菌仍停留在理论构想阶段,自复制镜像细胞系统的整合面临重大科学挑战 | 探讨镜像细菌的理论可行性、工程挑战及生物安全与生态影响 | 镜像细菌及其构成的镜像生物学系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 11 | 2026-06-25 |
Expanding the genetic toolset: using serine recombinases to integrate riboregulatory elements into industrially relevant microbial chassis
2026-Jan-08, Journal of industrial microbiology & biotechnology
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/jimb/kuag015
PMID:42228948
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研究论文 | 本论文展示了联合使用顺式抑制子(CR)与丝氨酸重组酶辅助基因组工程(SAGE)技术,将核糖调控元件整合到工业相关微生物底盘中的方法。 | 创新点在于实现了两种合成生物学工具(顺式抑制子和丝氨酸重组酶辅助基因组工程)的联合应用,成功将核糖调控元件高效整合到多种工业微生物中,并验证了其在不同遗传背景下的高度可移植性。 | 限制因素可能包括对更多微生物宿主的适用性需进一步验证,以及顺式抑制子调控效果的绝对范围可能受限于特定宿主基因表达环境。 | 旨在扩展生物制造中工业微生物的基因操作工具集,实现多种宿主简便的基因组操作和精确基因表达调控。 | 工业相关微生物宿主:恶臭假单胞菌、谷氨酸棒杆菌和富养罗尔斯通氏菌。 | 合成生物学 | NA | 顺式抑制子、丝氨酸重组酶辅助基因组工程(SAGE) | NA | 荧光报告基因表达数据 | 三种微生物宿主:恶臭假单胞菌、谷氨酸棒杆菌、富养罗尔斯通氏菌,每种宿主整合多种顺式抑制子,但未明确样本数量 | 丝氨酸重组酶辅助基因组工程(SAGE) | 恶臭假单胞菌、谷氨酸棒杆菌、富养罗尔斯通氏菌 | 顺式抑制子(CR)核糖调控元件整合至染色体 | 工业生物技术、生物制造 |
| 12 | 2026-06-25 |
From feeding cell to fruiting body: Multidrug transport in the life cycle of Dictyostelium discoideum
2026, Advances in microbial physiology
DOI:10.1016/bs.ampbs.2026.02.002
PMID:42203389
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综述 | 综述了Dictyostelium discoideum生命周期中多药转运蛋白的功能和潜力 | 首次系统整合Dictyostelium discoideum的多药耐药蛋白组,结合RNAseq和转录组共表达数据,提出MDR蛋白在趋化、合作和细胞分化中的未探索角色 | 实验验证的转运蛋白报告稀少,功能数据主要基于生物信息学推测 | 强调ABC、MFS、MATE、SMR/DMT、RND、AbgT和PACE转运蛋白群在Dictyostelium生命周期中的关键问题和研究方向 | Dictyostelium discoideum中的多药耐药蛋白 | 微生物学 | NA | RNAseq | NA | RNAseq数据、转录组共表达数据 | NA | NA | Dictyostelium discoideum | NA | 医学、合成生物学、药物研究 |
| 13 | 2026-06-24 |
Evaluating Malat1-derived 3'end sequences for functional transgene expression in human cells using synthetic mRNA delivery
2026-Dec, RNA biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1080/15476286.2026.2670832
PMID:42093635
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研究论文 | 评估基于Malat1衍生3'末端序列在人类细胞中通过合成mRNA递送实现功能性转基因表达的效果 | 首次系统比较了长链非编码RNA Malat1衍生的3'端基序(包含保守三螺旋结构)与经典poly(A)尾在合成报告RNA中的表达效能 | 测试的Malat1衍生基序表达效率持续低于经典poly(A)尾,且未优化三螺旋序列折叠 | 探索poly(A)尾替代策略在合成mRNA表达中的应用潜力 | Malat1衍生的3'端基序与经典poly(A)尾在编码绿色荧光蛋白的合成报告RNA中的表达比较 | 分子生物学 | NA | 合成mRNA递送 | NA | NA | NA | NA | 人类细胞 | NA | 合成生物学,RNA治疗 |
| 14 | 2026-06-24 |
Sustainable production of natural sweeteners through synthetic biology
2026-Aug, Journal of bioscience and bioengineering
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.jbiosc.2026.04.001
PMID:42103513
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综述 | 系统总结了12种代表性天然甜味剂的代谢途径和微生物合成方法 | 通过代谢工程和酶工程构建微生物细胞工厂,为天然甜味剂的高效可持续生产提供了创新途径,并系统分析了不同合成方案的优缺点和核心技术瓶颈 | 仅总结了当前生产过程中的核心技术瓶颈,并未深入探讨大规模工业化的具体挑战 | 为天然甜味剂的工业化优化和生产提供理论支持和技术参考 | 12种代表性天然甜味剂(包括甜蛋白、萜类苷、黄酮类、多元醇和单糖) | 合成生物学 | NA | 代谢工程, 酶工程 | NA | NA | NA | NA | 微生物(微生物细胞工厂) | 代谢途径 | 食品, 医药 |
| 15 | 2026-06-24 |
Microbial Degradation of Plastics: Mechanisms, Pathways, and Multiomics Insights
2026-Jun-23, Environmental science & technology
IF:10.8Q1
DOI:10.1021/acs.est.6c02515
PMID:42258349
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综述 | 综述微生物降解塑料的机制、途径及多组学见解,分析降解效率的异质性并提出未来研究方向 | 整合多组学功能分析与合成生物学策略,系统连接微生物特性与塑料降解四阶段(定殖、解聚、同化、矿化),并提出缩小实验室发现与实际应用差距的框架 | 聚合物性质、实验条件和评估方法的变异性严重阻碍了跨研究比较,限制了实验室发现向实际应用的转化 | 促进微生物塑料修复研究,识别关键知识空白并提供可行建议 | 塑料降解过程中的微生物分类、酶解聚合及多组学功能分析 | 合成生物学 | NA | 多组学分析 | NA | 文本 | NA | CRISPR-Cas9, 酶工程, 合成微生物群落设计 | 微生物(未具体指定) | 生物增强策略(遗传修饰、酶工程、合成微生物群落) | 环境 |
| 16 | 2026-06-24 |
Tangled Tail of Mechanically Interlocked Peptides
2026-Jun-23, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.6c05395
PMID:42334221
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综述 | 系统回顾自然界中发现的机械互锁肽和化学家从肽组分合成的机械互锁分子,提出统一命名法并促进跨学科融合 | 首次系统比较天然和人工合成的机械互锁肽,提出统一命名法以弥合分子生物学与超分子化学之间的研究鸿沟 | NA | 概述机械互锁肽领域的进展,建立统一命名法并促进跨学科合作 | 机械互锁肽以及由肽组分合成的机械互锁分子 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 17 | 2026-06-24 |
Endogenous constitutive promoters with a broad range of transcriptional activities for plant synthetic biology
2026-Jun-22, Plant cell reports
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s00299-026-03885-8
PMID:42329465
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研究论文 | 本文从本氏烟草中鉴定了一系列内源性组成型启动子,并通过定量分析比较了其在不同植物物种中的转录活性,为植物合成生物学提供了可靠的内源启动子替代方案 | 首次系统筛选并定量测定了本氏烟草内源性组成型启动子在不同植物物种(包括双子叶和单子叶植物)中的转录强度范围,并建立了相对于CaMV 35S启动子的定量基准 | 跨物种分析显示启动子活性在玉米等单子叶植物中普遍降低,表明物种特异性影响较大,可能限制其在某些作物中的应用 | 提供具有准确定量转录活性的内源性组成型启动子,用于植物合成生物学中的基因表达精确控制 | 本氏烟草内源性组成型启动子候选序列 | 植物合成生物学 | NA | GFP报告基因检测、双荧光素酶报告基因检测、原生质体转化 | NA | 基因表达定量数据 | 多个内源性启动子候选序列,在白菜、辣椒、玉米等异源物种中进行评估 | NA | 本氏烟草、白菜、辣椒、玉米 | 组成型启动子驱动的报告基因表达系统 | 农业、工业生物技术 |
| 18 | 2026-06-24 |
A plug-and-play cytochrome P450 system enables de novo biosynthesis of 2-phenylethanol derivatives
2026-Jun-19, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2026.102493
PMID:42314827
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研究论文 | 开发了一种基于细胞色素P450的即插即用系统,实现了2-苯乙醇衍生物的从头生物合成 | 首次将定向酶进化与系统代谢工程整合,构建了区域发散性和对映选择性的P450BM3变体,并在解脂耶氏酵母中实现了高滴度的(R)-苯乙醇二醇和红景天苷的生物合成 | 文章未明确提及局限性 | 实现高价值芳香族化合物的可持续生物制造 | 2-苯乙醇衍生物,如(R)-苯乙醇二醇、酪醇、红景天苷和2-苯乙基-β-D-葡萄糖苷 | 合成生物学 | NA | 定向酶进化, 系统代谢工程, 结构导向设计 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 解脂耶氏酵母 (Yarrowia lipolytica) | 即插即用的细胞色素P450系统,包括脂肪酸羟化酶P450BM3变体及其底物通路 | 工业生物技术, 医药 |
| 19 | 2026-06-24 |
Nanofluidics for Pioneering Synthetic Biology of Bottom-Up Cell-Free Molecular Systems
2026-Jun-12, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00178
PMID:42284545
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观点文章 | 提出利用纳米流体技术作为变革平台,推动自下而上的无细胞分子系统合成生物学发展 | 首次提出纳米流体技术作为桥接自下而上无细胞分子系统组装难题的变革性平台,利用纳米限域效应和精准质量传输实现分子构建块的主动组装 | 自组装挑战巨大,当前技术对有序时空结构的主动组装仍存在困难 | 推动合成生物学中自下而上无细胞分子系统的定量设计和有序组装 | 自下而上无细胞分子系统中的分子构建块 | 合成生物学 | NA | 纳米流体技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 20 | 2026-06-24 |
Common γ-chain cytokines in brain tumor immunotherapy: Biological barriers and advances in macromolecular delivery systems
2026-Jun, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.152288
PMID:42092664
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综述 | 探讨常见γ链细胞因子在脑肿瘤免疫治疗中的应用,重点关注生物屏障和递送系统的进展 | 系统总结了基于纳米颗粒、外泌体和细胞载体的递送平台如何克服脑肿瘤免疫治疗中细胞因子面临的生物屏障、半衰期短和毒性等挑战 | 缺乏具体的临床试验数据支持,多数讨论仍基于体外和动物模型结果,临床转化前景尚不明确 | 研究常见γ链细胞因子在脑肿瘤免疫治疗中的潜力和递送策略 | 常见γ链细胞因子(如IL-2、IL-7、IL-15等)以及脑肿瘤微环境 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |