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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-06-16 |
Engineered bacteria in disease diagnosis and therapy: A synthetic biology perspective
2026-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2026.04.028
PMID:42293685
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综述 | 这篇综述从合成生物学角度总结了工程菌在疾病诊断和治疗中的应用进展 | 系统梳理了合成生物学技术(如CRISPR/Cas9、DNA组装、定向进化及人工智能集成)如何赋能工程菌作为“活体传感器”和定制化治疗载体,并讨论了提升安全性和有效性的工程策略 | 工程菌的临床转化仍面临稳定定植、免疫原性控制、大规模生产标准化及监管伦理框架等挑战 | 优化细菌功能以拓展其在诊断和精准医学中的潜力 | 工程菌 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9, DNA组装, 定向进化, 人工智能 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 细菌 | 生物传感器, 靶向药物递送, 免疫调控, 微生物组调节 | 医学 |
| 2 | 2026-06-16 |
Identification of a thermotolerant strain of Aureobasidium melanogenum DA22 and functional analysis of Spt23 as a key transcriptional regulator in high-temperature polymalic acid fermentation
2026-Oct, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.134956
PMID:42176819
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研究论文 | 鉴定了一株耐热菌株 Aureobasidium melanogenum DA22,并分析了转录调控因子 Spt23 在高温聚苹果酸发酵中的关键作用 | 发现并鉴定了天然耐热菌株 DA22,并过表达膜相关转录因子 SPT23 基因构建耐热微生物细胞工厂,在高温下显著提高聚苹果酸产量 | 未说明长期工业化条件下的稳定性和成本效益 | 构建耐热微生物细胞工厂,实现高温下高效有机酸生产 | 耐热菌株 Aureobasidium melanogenum DA22 及转录因子 Spt23 | 合成生物学 | NA | 过量表达、基因敲除、RT-qPCR、发酵工程 | NA | 生长曲线、发酵滴度、基因表达水平、形态观察 | 筛选120株野生型分离株,其中DA22为耐热菌株 | 过量表达、基因敲除 | Aureobasidium melanogenum | 过表达SPT23基因的合成生物学回路,用于增强耐热性和有机酸生产 | 工业生物技术 |
| 3 | 2026-06-16 |
Xeno nucleic acids (XNAs): advances in synthesis, diagnostics, and therapeutics
2026-Sep-05, Bioorganic chemistry
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.bioorg.2026.110000
PMID:42160832
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综述 | 全面综述异源核酸(XNA)的合成、表征及其在诊断和治疗中的应用 | 系统性地概述了多种异源核酸变体的合成方法、结构特性及临床转化潜力,强调其在分子诊断和精准医学中的变革性作用 | 当前面临可规模化合成、有效递送系统及全面结构-功能理解的挑战 | 总结异源核酸(XNA)的化学修饰、合成方法、表征技术及生物医学应用 | 锁核酸、肽核酸、己糖醇核酸、氟阿拉伯糖核酸、吗啉代寡聚体等异源核酸变体 | 分子生物学、生物技术 | NA | 磷酰胺化学法、工程聚合酶酶促合成法、热熔融分析、圆二色光谱、核磁共振、质谱、测序方法 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学(精准医学、分子诊断、治疗)、生物技术 |
| 4 | 2026-06-16 |
Engineered commensal Bacteroides thetaiotaomicron enables targeted drug delivery to colorectal tumors
2026-Jul-10, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society
IF:10.5Q1
DOI:10.1016/j.jconrel.2026.114945
PMID:42036032
|
研究论文 | 基于肠道共生菌多形拟杆菌构建靶向递送系统,用于结直肠癌治疗 | 首次利用肠道共生菌多形拟杆菌作为底盘细胞,通过筛选表面锚蛋白建立高效展示系统,实现结直肠肿瘤靶向药物递送 | 尚需进一步验证该系统的长期安全性和在更大规模动物模型中的疗效 | 开发基于肠道共生菌的靶向癌症治疗新策略 | 多形拟杆菌(Bacteroides thetaiotaomicron) | 合成生物学 | 结直肠癌 | 表面展示系统 | NA | NA | 体外细胞模型、AOM/DSS诱导的小鼠模型 | 合成生物学工具箱 | 多形拟杆菌(Bacteroides thetaiotaomicron) | 肿瘤靶向蛋白HlpA表面展示模块、溶血素E治疗模块 | 医学 |
| 5 | 2026-06-16 |
Deep learning unlocks sequence-divergent synthetic promoters to empower Streptomyces natural product engineering
2026-Jul, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2026.05.009
PMID:42208848
|
研究论文 | 利用深度学习设计序列发散的合成启动子,增强链霉菌天然产物工程 | 首次为链霉菌建立AI生成的启动子库,深度学习赋能设计效率、序列多样性和性能精确调控 | NA | 开发深度学习驱动的合成启动子设计方法,克服链霉菌遗传工具开发的限制,提升天然产物产量 | 链霉菌合成启动子及其对天然产物工程的影响 | 机器学习 | NA | 深度学习,深度生成模型 | NA | 序列数据 | 10亿个计算机设计的启动子序列,其中100个候选启动子经实验验证 | NA | 链霉菌 | 合成启动子文库 | 工业生物技术,医药 |
| 6 | 2026-06-16 |
Bioconjugation Strategies for Revealing the Roles of Glycerophospholipids in Cells
2026-Jun-15, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.70428
PMID:42287618
|
综述 | 综述了用于揭示甘油磷脂在细胞中作用的生物共轭策略 | 整合了化学全合成、生物正交化学、活细胞成像等多种跨学科方法,为脂质功能研究和治疗创新提供新路径 | 仅总结现有方法,未提出新的实验设计或突破性技术 | 探索甘油磷脂在细胞中的复杂功能及代谢机制 | 甘油磷脂及其类似物 | 合成生物学 | NA | 生物正交化学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 7 | 2026-06-16 |
Adaptive evolution of oxidosqualene cyclases driving triterpene scaffold diversification for limonoid biosynthesis in Melia toosendan
2026-Jun-15, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2026.101965
PMID:42289993
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研究论文 | 本研究通过染色体级别基因组组装和功能分析,揭示了川楝中氧化角鲨烯环化酶的适应性进化驱动柠檬苦素生物合成三萜骨架多样化的分子机制 | 首次发现川楝中OSC基因家族通过新功能化产生11种不同三萜骨架,并鉴定出4个关键氨基酸残基替换足以切换产物特异性,揭示了正向选择驱动代谢创新的分子基础 | 研究主要基于瞬时表达和系统发育分析,尚需更全面的体内功能验证和晶体结构解析,且替代途径的生理意义仍需进一步阐明 | 阐明植物中三萜骨架多样化的适应性进化分子机制 | 川楝(Melia toosendan)中的氧化角鲨烯环化酶基因家族 | 生物信息学 | NA | 染色体级别基因组组装, NGS, 瞬时表达 | NA | 基因组序列, 代谢物谱 | 1个川楝品种的基因组和14个OSC基因 | NA | 本氏烟草(Nicotiana benthamiana) | NA | 合成生物学,农业(植物源杀虫剂) |
| 8 | 2026-06-16 |
Substrate Specificity of B12-Depedent Ribonucleotide Reductases: Biotechnology and Metabolic Implications
2026-Jun-15, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202500344
PMID:42290402
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研究论文 | 研究了两类热稳定性核糖核苷酸还原酶对多种天然和非天然核苷酸的底物特异性,评估其生物技术应用潜力 | 首次系统性地研究了核糖核苷酸还原酶对非经典核苷酸的底物特异性,发现酶倾向于转化带有修饰官能团的核苷碱基底物,揭示了生物技术和合成生物学应用中的潜力与限制 | 仅聚焦于两种热稳定性RNR,未涵盖其他来源或类型的RNR;对非天然核苷酸的转化效率及体内应用验证不足 | 探索核糖核苷酸还原酶的底物混杂性及其在生物技术中的应用潜力,同时增进对天然核苷酸代谢的理解 | 两种热稳定性核糖核苷酸还原酶及其对多种天然和非天然核苷酸的转化 | 合成生物学 | NA | 酶活性测定、底物特异性分析 | NA | 实验数据(酶动力学参数) | 两种热稳定性核糖核苷酸还原酶,测试了多种核苷酸底物 | NA | NA | NA | 生物技术、合成生物学 |
| 9 | 2026-06-16 |
Harnessing natural variation for photosynthetic improvement in next-generation crop breeding
2026-Jun-15, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.70317
PMID:42290551
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综述 | 本文综述了利用自然遗传变异改善光合作用的策略,以支持下一代作物育种 | 整合自然遗传变异与合成生物学和光合遗传工程的互补方法,提出优化光合作用以提升作物产量和抗逆性的战略框架 | 未详细讨论具体田间验证结果和长期环境适应性挑战 | 探索通过自然变异和现代生物技术优化光合作用,提升作物产量潜力和气候适应性的策略 | 作物光合性状的自然遗传变异及其分子调控机制 | 农业生物技术 | NA | 光合遗传工程、合成生物学 | NA | 综述文献数据 | NA | 合成生物学 | 作物 | 光合代谢通路优化 | 农业 |
| 10 | 2026-06-16 |
A Modular PLUG-IN Photosynthetic Chassis With Tunable Thermal Control for Mammalian Systems
2026-Jun-15, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.76102
PMID:42294635
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研究论文 | 开发一种热调控的模块化“即插即用”光合底盘,实现微藻代谢输出与细胞完整性的可编程控制 | 首次实现跨真核生物界的热调控模块化合成生物学底盘,在微藻和哺乳动物宿主中均保持功能,并耦合代谢工程与细胞壁工程实现无研磨脂质回收 | 未明确讨论热诱导系统在长期培养中的稳定性及可能的代谢负担,未评估大规模工业应用中的热控制成本 | 开发一种与哺乳动物系统兼容的热调控光合底盘,同步控制生长、生产与细胞壁重构 | 海洋微藻(Nannochloropsis oceanica)和哺乳动物宿主 | 合成生物学 | NA | 转录组学比较分析、热诱导启动子工程、基因沉默 | NA | 转录组数据 | NA | 热激活基因扩增系统、基因沉默 | Nannochloropsis oceanica, 哺乳动物细胞 | 热调控代谢模块(AtWRI1表达增强三酰甘油和EPA积累)与细胞壁模块(CesA1沉默导致细胞壁弱化)耦合 | 工业生物技术, 医药 |
| 11 | 2026-06-16 |
From fermentation to pharmabiotics: engineering kefir-derived Lactobacillus for targeted intratumoral immunotherapy in colorectal Cancer
2026-Jun-14, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.117032
PMID:42289150
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综述 | 探讨将开菲尔中乳酸菌转化为工程活生物治疗药物,用于结直肠癌的靶向瘤内免疫治疗 | 提出从发酵到药物的流程,利用合成生物学改造开菲尔乳酸菌,使其能够靶向肿瘤缺氧区域并原位释放纳米抗体和细胞因子,将冷肿瘤转化为热肿瘤以增强免疫治疗 | 面临生物遏制、生产和监管等转化挑战 | 开发工程化活生物治疗药物用于结直肠癌的靶向免疫治疗 | 开菲尔中的乳酸菌菌株 | 合成生物学 | 结直肠癌 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 乳酸菌(开菲尔来源) | 靶向肿瘤缺氧区域的生物传感器及纳米抗体和细胞因子释放电路 | 医学 |
| 12 | 2026-06-16 |
From agri-food wastes to high-value products: research progress, technological innovation, and challenges in the resource recycling of Chinese Baijiu by-products
2026-Jun-14, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.135149
PMID:42289255
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综述 | 系统分析中国白酒副产物的化学成分、风味化合物和微生物资源,并综述其在功能微生物筛选、高价值成分提取、先进生物燃料生产、生物基材料制造、新型饲料和肥料开发等方面的资源化利用研究进展 | 深入分析了白酒副产物资源化利用面临的挑战和未来发展方向,并创新性地提出利用人工智能加速生物制造、构建级联生物炼制系统等策略 | 关键化学反应效率低、工艺放大困难、单一生产模式导致资源浪费等限制因素 | 探讨如何高效利用白酒生产过程中产生的大量有机废弃物,推动绿色低碳经济和资源循环利用 | 中国白酒生产副产物 | 机器学习 | NA | 合成生物学、热化学技术 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术、环境 |
| 13 | 2026-06-16 |
SynBio-DSP: an integrated synthetic biology platform with fed-batch fermentation and continuous downstream processing for sustainable production of thermostable cellulases
2026-Jun-14, Biotechnology for biofuels and bioproducts
IF:3.3Q3
DOI:10.1186/s13068-026-02783-1
PMID:42289753
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研究论文 | 开发了一种整合合成生物学、机器学习引导的生物过程优化和连续下游处理的平台,用于可持续生产耐热纤维素酶 | 首次提出了QLM自诱导系统和CRISPRi介导的细胞壁弱化策略,并结合高斯过程回归和高通量微型生物反应器优化发酵,以及新型脉冲电场辅助协同裂解系统实现高效酶回收 | sfGFP融合导致比活性降低8.3%,可能需要进一步优化融合标签设计 | 通过协同优化细胞设计和工艺配置,实现可持续且经济可行的生物催化剂生产 | 枯草芽孢杆菌底盘细胞以及超耐热纤维素酶CtCel9A | 合成生物学 | NA | 合成生物学、CRISPRi、高通量发酵、响应面法、多目标优化 | 高斯过程回归、响应面法、NSGA-III算法 | 实验数据和过程参数 | NA | CRISPR-Cas9, 脉冲电场 | 枯草芽孢杆菌 | 群体感应裂解调制自诱导系统和CRISPRi介导的细胞壁弱化回路 | 工业生物技术, 能源 |
| 14 | 2026-06-16 |
Global research trends and hotspots of plant physiologically active substances: quantitative visualization analysis based on CiteSpace
2026-Jun-13, Plant biology (Stuttgart, Germany)
DOI:10.1111/plb.70219
PMID:42287740
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综述 | 基于CiteSpace的文献计量分析,系统回顾了2000至2024年间植物生理活性物质研究的全球趋势与热点 | 首次通过定量可视化分析揭示了植物生理活性物质研究从基础分离到机制研究、功能性食品及纳米递送系统的阶段性转变,并识别了新兴热点如植物免疫调控、肠道微生物互作和分子动力学模拟 | 仅依赖Web of Science核心合集数据库,可能遗漏其他语种或非索引文献,且分析周期截至2024年,后续研究趋势未覆盖 | 系统梳理植物生理活性物质研究的全球趋势、热点演变及未来方向,指导跨学科合作与可持续开发利用 | 植物来源的生理活性物质(如植物化合物、抗氧化剂等) | 文献计量学 | NA | 文献计量分析,CiteSpace可视化 | NA | 文献数据(文本) | 8096篇文献(2000-2024年Web of Science核心合集) | NA | NA | NA | 医学,农业,工业生物技术,功能性食品 |
| 15 | 2026-06-16 |
Development, Optimization, and Application of an Episomal Plasmid System for Rhodotorula toruloides
2026-Jun-13, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2026.102489
PMID:42288134
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研究论文 | 报道了圆红冬孢酵母首个功能性附加型质粒系统及其在代谢工程和CRISPR基因组编辑中的应用 | 首次在圆红冬孢酵母中建立功能性附加型质粒系统,并开发了Cre-loxP介导的体内再环化策略以解决转化效率问题,同时利用该平台建立了首个无缝基因组编辑CRISPR系统 | 转化效率仍需进一步改善,质粒拷贝数较低可能影响基因表达水平 | 建立圆红冬孢酵母的附加型质粒系统以加速代谢工程和合成生物学研究 | 圆红冬孢酵母(Rhodotorula toruloides) | 合成生物学 | NA | 附加型质粒, Cre-loxP重组, CRISPR, GFP报告基因 | NA | NA | NA | CRISPR, Cre-loxP系统 | 圆红冬孢酵母(Rhodotorula toruloides) | 代谢途径(三乙酸内酯、脂肪醇、柠檬烯生产) | 工业生物技术 |
| 16 | 2026-06-16 |
Recent advances in microbial production of S-adenosyl-L-methionine and its high-value derivatives
2026-Jun-13, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108948
PMID:42288128
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综述 | 综述了微生物生产S-腺苷-L-甲硫氨酸及其高价值衍生物的最新进展 | 系统总结了系统代谢工程和合成生物学在提高微生物中SAM生物合成、利用和循环方面的工程策略,并强调了SAM在代表性衍生物(如阿魏酸、麦角硫因、肌酸、亚精胺和β-甲基苯丙氨酸)生物合成中的作用 | 工业上SAM及其衍生物的生产仍依赖化学合成,存在环境负担和可持续性问题 | 探讨微生物平台用于SAM及SAM衍生化合物生物合成的工程策略和挑战 | S-腺苷-L-甲硫氨酸及其高价值衍生物 | 合成生物学 | NA | 系统代谢工程, 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | NA | 工业生物技术, 医药 |
| 17 | 2026-06-16 |
Transplantation of encapsulated fecal microbiota: research progress and future trends
2026-Jun-13, World journal of pediatrics : WJP
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s12519-026-01056-z
PMID:42288685
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综述 | 综述了封装粪便微生物群移植的研究进展与未来趋势,从经验性转移向工程化生物治疗转变 | 强调封装FMT作为活性生物治疗产品的关键制剂,推动从全群落微生物制剂向合成生物学创新的转变 | 缺乏大规模随机对照试验,尤其是儿科研究;监管定义不一致且国际指南尚未建立 | 总结封装FMT的研究进展和监管挑战,探索未来发展方向以提升标准化和个性化治疗 | 封装粪便微生物群移植的临床研究,包括成人和儿科患者 | NA | 肠道疾病,复发性艰难梭菌感染 | 封装技术 | NA | 文献和数据综合 | NA | NA | 人类肠道微生物群 | NA | 医学 |
| 18 | 2026-06-16 |
Engineering Lactobacillus for therapeutic delivery and biosensing: lessons from niche adaptation
2026-Jun-13, Future microbiology
IF:2.5Q3
DOI:10.1080/17460913.2026.2686558
PMID:42288957
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综述 | 该文章综述了利用乳杆菌属菌株进行治疗递送和生物传感的工程化方法,及其从生态位适应性中获得的经验教训 | 总结了乳杆菌通过基因组特征、压力响应和生物膜形成实现的生态位适应性,并探讨了如何将这些特性转化为合成生物学工具以拓展其作为活体生物治疗产品和生物传感器的应用 | 在稳定性和监管方面仍存在挑战 | 综述乳杆菌工程化在治疗递送和生物传感中的应用前景 | 乳杆菌属菌株 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | 乳杆菌 | 活体治疗产品,生物传感器,基因回路 | 医学,食品安全,环境监测,诊断 |
| 19 | 2026-06-16 |
In silico identification and characterisation of putative biphenyl degradation mechanism in gut-derived Pediococcus pentosaceus
2026-Jun-11, Environmental research
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.envres.2026.125000
PMID:42276346
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研究论文 | 本研究利用计算生物学方法鉴定并表征了源自蟑螂肠道的戊糖片球菌QS-GN03_1中潜在的联苯降解机制 | 首次在戊糖片球菌中鉴定出通过水平基因转移获得且独立存在的bphC基因同源物,并通过分子对接和动力学模拟验证其功能潜力,同时发现其基因组中含有IS30家族插入序列,为合成生物学改造提供了机会 | 该菌株缺乏独立的PCB矿化能力,且预测的PPBPHCIII酶与功能验证的1EIR复合物相比结合亲和力较弱,主要是因为氢键形成较少 | 鉴定和表征戊糖片球菌中潜在的联苯降解能力,以开发用于PCB解毒的益生菌饲料添加剂 | 蟑螂肠道来源的戊糖片球菌QS-GN03_1菌株及其潜在联苯降解基因 | 机器学习 | NA | 全基因组测序,分子对接,分子动力学模拟 | NA | 基因组序列,蛋白质结构数据 | 一个戊糖片球菌菌株 | CRISPR-Cas9,合成生物学 | 戊糖片球菌 | Bph操纵子整合电路 | 农业,环境,食品 |
| 20 | 2026-06-16 |
Engineered Probiotics Protect against Pseudomonas aeruginosa Post Antibiotic Exposure
2026-Jun-10, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00063
PMID:42267686
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研究论文 | 基于工程化益生菌EcN开发模块化程序性策略,整合代谢物补充与抗原特异性黏膜免疫,保护抗生素暴露后机体免受铜绿假单胞菌感染 | 首次将丁酸过度合成与抗原展示外膜囊泡释放功能整合于单一益生菌平台,实现代谢免疫协同保护 | 仅在抗生素暴露小鼠模型中验证,尚未在临床样本或复杂微生物群落中测试 | 开发替代抗生素依赖的感染控制新策略 | 抗生素暴露后的小鼠模型及工程化大肠杆菌Nissle 1917(EcN) | 合成生物学 | 铜绿假单胞菌感染性疾病 | 外膜囊泡工程、丁酸代谢工程 | NA | 动物实验数据 | 抗生素暴露后小鼠模型(具体数量未说明) | 合成生物学菌株构建 | 大肠杆菌Nissle 1917 (EcN) | 丁酸代谢通路(丁酸过度合成)及抗原展示回路(外膜囊泡展示PcrV或OprL抗原) | 医学 |