合成生物学相关文章

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当前共找到 5916 篇文献,本页显示第 1 - 20 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 工程工具 宿主生物 回路设计 应用领域
1 2026-10-25
Microbial Genetic Resource Conservation Techniques
2027, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
综述 本章综述了微生物遗传资源保护的主要原理、方法与局限,并探讨了冷冻生物学、材料科学与合成生物学结合的先进保护策略 强调将冷冻生物学、材料科学与合成生物学相结合以发展先进保护策略的必要性,并将微生物保护定位为可持续生物经济和全球健康体系的关键组成部分 文章为综述性章节,未提供原始实验数据;指出了维持微生物活力、遗传稳定性和功能完整性的挑战以及现有保护方法的局限 概述对生物医学和环境重要的微生物,审视其保护的主要原理、方法和局限,并指出先进保护策略的发展方向 对生物医学和环境具有重要意义的微生物遗传资源 合成生物学, 微生物学 NA NA NA 文本 NA NA NA NA 医学, 环境, 工业生物技术
2 2026-10-25
Emerging Strategies for the Preservation of Microorganisms of Biomedical and Environmental Importance
2027, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
综述 本文综述了具有生物医学和环境重要性的微生物保藏新兴策略,强调在多样分类群和微生物群落中保持活力、遗传稳定性和功能完整性 整合组学指导的保藏、干态技术和合成生物学,提出微生物组层面的保藏和工程化微生物系统等创新方案,并倡导从保藏分离菌株转向保藏功能性微生物群落 作为综述文章,未提供原始实验数据验证所提策略;对极端微生物、严格厌氧菌和复杂微生物组的保藏难题仍缺乏成熟的解决方案 评估生物医学和环境相关微生物保藏的新兴策略,应对微生物多样性未充分保藏的问题,支持公共卫生、科学可重复性和可持续生物经济发展 具有生物医学和环境重要性的微生物及其群落,包括极端微生物、严格厌氧菌和复杂微生物组 微生物学 NA 组学指导的保藏、新一代冷冻干燥、干态技术、合成生物学 NA 文本 NA NA NA 工程化微生物系统 医学, 环境, 农业
3 2026-10-25
Unveiling the Molecular Secrets of Seaweeds: A Comprehensive Review of Bioinformatics Applications in Algal Research
2026-Dec, Omics : a journal of integrative biology IF:2.2Q3
综述 全面综述生物信息学在海藻基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学、微生物组和功能基因组学研究中的应用 系统整合多组学、基因编辑、人工智能、机器学习和合成生物学等新兴策略在海藻研究中的应用前景 基因组资源不完整、数据标准化不足、计算预测缺乏实验验证 总结生物信息学方法在海藻研究中的应用现状、工具数据库及未来发展方向 海藻 生物信息学 NA 高通量测序, 多组学, 生物信息学分析 机器学习, 人工智能 基因组数据, 转录组数据, 蛋白质组数据, 代谢组数据, 微生物组数据 NA 基因编辑 海藻 NA 医药, 农业, 能源, 食品, 工业生物技术
4 2026-10-25
CEM 2.0: Co-evolution-guided mining of superior extremophilic proteins via a curated proteome database and protein language model
2026-Dec, Engineering microbiology
研究论文 提出CEM 2.0框架,通过整合极端微生物蛋白质组数据库、基于ProteinBERT的多维评估器和交互式挖掘流程,实现不依赖模板的极端微生物蛋白质挖掘 不依赖预定义模板和领域知识,利用共进化引导和蛋白质语言模型实现全蛋白质宇宙的极端微生物蛋白质挖掘 仅通过湿实验和已发表研究的计算验证,未进行大规模实验筛选;数据库覆盖六种极端特征可能不全面 开发不依赖现有模板的极端微生物蛋白质挖掘方法,全面探索全蛋白质宇宙中的功能性极端微生物蛋白质 极端微生物蛋白质 机器学习 NA 蛋白质语言模型、共进化分析 ProteinBERT 蛋白质序列 NA NA NA NA 医学, 工业生物技术, 合成生物学
5 2026-10-25
Microbial shaping of fermented dairy product quality: formation mechanisms and regulatory strategies for texture, flavor, and functionality
2026-Dec-01, Food research international (Ottawa, Ont.)
综述 本文综述了微生物如何调控发酵乳制品(酸奶、奶酪、酸奶油)的质构、风味和功能特性的形成机制,并探讨了基于基因编辑、合成生物学和AI驱动过程控制的调控策略 通过跨产品比较微生物作用机制,提出从经验实践向可预测、设计导向的发酵乳制品制造转型的框架 作为综述性文章,未提供原始实验数据验证所提出的调控策略 阐明微生物调控发酵乳制品质构、风味和功能代谢物合成的机制,并讨论合理设计微生物功能和精准发酵管理的新兴策略 发酵乳制品(酸奶、奶酪、酸奶油)及其微生物代谢活动 食品微生物学 NA NA NA 文本 NA 基因编辑, 合成生物学 NA NA 食品, 医学
6 2026-10-25
From bioreactor to table: reinventing future protein supply through cellular agriculture
2026-Dec-01, Food research international (Ottawa, Ont.)
综述 系统综述细胞培养肉和精密发酵两条细胞农业核心路径的技术进展、产业化挑战与未来前景 将细胞培养肉与精密发酵两条路径纳入统一分析框架,并强调智能化与自动化作为从菌株筛选到生物工艺优化的关键催化剂,同时深入考察感官特征、消费者心理与监管框架等市场社会因素 作为综述文章未提供原始实验数据,成本、技术与公众认知方面的挑战仍然存在,细胞农业目前定位为传统蛋白质系统的补充而非替代 系统审视细胞农业中细胞培养肉与精密发酵的技术进步、产业化瓶颈及未来发展方向 细胞培养肉、精密发酵及其生产的肉类、乳制品和蛋类等替代蛋白产品 细胞农业、食品生物技术、合成生物学 NA 细胞培养、精密发酵、合成生物学工程化细胞工厂 NA 文献 NA 合成生物学 NA 高效细胞工厂(代谢工程改造的微生物细胞工厂) 食品、工业生物技术
7 2026-10-25
Lactic acid bacteria bacteriocins: From antimicrobial mechanisms to next-generation applications in the food industry
2026-Dec-01, Food research international (Ottawa, Ont.)
综述 系统综述乳酸菌细菌素的分类、作用机制及其在食品工业中的应用,并探讨基因组学、合成生物学和计算设计驱动的新一代发展方向 整合基因组挖掘工具(如antiSMASH)、CRISPR代谢工程、机器学习活性预测、生成式AI从头设计肽以及刺激响应材料等前沿技术,提出从发现到生产、设计到应用的完整发展路径 乳酸菌细菌素面临产量低、纯化成本高、抗菌谱窄以及在复杂食品基质中不稳定等商业化挑战 为乳酸菌细菌素从有前景的天然产物发展为多功能新一代食品保鲜工具提供指导 乳酸菌细菌素(核糖体合成的抗菌肽) 合成生物学, 食品科学, 计算生物学 NA 基因组挖掘, CRISPR, 机器学习, 生成式人工智能, 计算设计 机器学习, 生成式AI 文本 NA CRISPR-Cas9, antiSMASH 乳酸菌 NA 食品, 医药
8 2026-10-25
Pharmaco-microdynamics (PMD): Redefining dose, exposure, and control for living drug carriers
2026-Nov, Annales pharmaceutiques francaises IF:1.0Q4
综述 本文提出药-微动力学(PMD)框架,用于重新定义活体药物载体的剂量、暴露和控制,并探讨经典PK/PD在活体治疗中的局限性 提出了PMD这一量化递送科学框架,定义了功能暴露积分(F-AUC)、定植效率(CE)、停留时间加权活性(RTWA)、有效功能浓度(EFC)和遗传稳定性指数(GSI)等新指标,将暴露重新概念化为由种群动力学、功能输出动力学、空间药理学和进化动力学四个相互依赖的轴控制的生物过程 作为综述,未提供新的实验数据;PMD框架的实践验证和标准化仍需进一步研究 批判性审视经典PK/PD在建模活体药物载体方面的局限性,形式化PMD的核心原则,并通过三个定量案例研究加以说明 活体药物递送系统,包括益生菌、工程微生物治疗剂和活体生物治疗产品 机器学习, 数字病理学 苯丙酮尿症, 肿瘤, 复发性艰难梭菌感染 NA NA 文本 NA NA NA NA 医学
9 2026-10-25
A practical guide to investigating biomolecular condensates: a comment from the plant community
2026-Nov, Science China. Life sciences
评论 该文从植物学界视角出发,系统梳理研究植物生物分子凝聚物的方法学框架,涵盖计算预测、体外重构、分子动力学模拟、活细胞与超分辨成像、材料性质测量、膜相关凝聚物及合成凝聚物工程 针对植物细胞特有的刚性细胞壁、膨压、质体自发荧光、复杂内膜系统和急性环境响应等挑战,首次系统提出植物凝聚物研究的完整方法学框架与最佳实践 作为评论性文章,未提供原始实验数据,所提方法框架仍需在不同植物体系和凝聚物类型中进一步验证 为植物及更广泛领域的生物分子凝聚物研究建立严谨、可重复且概念一致的研究基础,并探讨其在作物遗传改良和合成生物学中的应用前景 植物细胞中的生物分子凝聚物 细胞生物学 NA 计算预测,体外重构,分子动力学模拟,活细胞成像,超分辨成像,材料性质测量,合成凝聚物工程 NA 文本 NA NA 植物 合成凝聚物工程 农业,合成生物学
10 2026-10-25
Reprogramming Plant Salt Tolerance: A Systems Biology Perspective on Algae-Derived Elicitors and Biostimulants
2026-11, Plant, cell & environment
综述 系统综述藻类及其提取物作为生物刺激素和诱导子通过调控离子稳态、渗透调节、ROS清除和激素信号等机制重编程植物耐盐性的多维互作,并探讨从分子机制到田间应用的转化瓶颈与未来方向 从系统生物学视角整合藻类诱导子与植物防御系统的多维互作,提出结合多组学整合、合成生物学、精准农业和纳米递送系统来充分利用藻类-植物共生体潜力的未来路线 从实验室受控条件到田间规模效力的转化仍是突出瓶颈,且缺乏多因子复合胁迫场景下的作物特异性效力数据 综合评估藻类衍生化合物如何编排植物耐盐性并重编程转录网络,比较其与其他生物刺激素类别的差异,并指明知识空白与未来研究方向 藻类及其生物活性提取物(多糖、植物激素、多元醇)与盐胁迫下的植物防御系统 植物科学 NA NA NA 文本 NA NA 植物 NA 农业
11 2026-10-25
Cordyceps as a multitarget therapeutic platform: biology, bioactive metabolites, and translational challenges
2026-Oct-23, Archives of microbiology IF:2.3Q3
综述 系统综述冬虫夏草及相关真菌的生物学、活性代谢物、分子机制及转化应用挑战 将分类学、代谢物生物合成、分子机制与技术创新整合于转化框架中,提出冬虫夏草作为系统级多靶点治疗平台 缺乏充分的临床验证,存在物种鉴定、化学标准化、药代动力学限制、产品可重复性及安全性评估等问题 全面整合冬虫夏草的分类学、生态学、宿主互作、化学成分、生物合成途径、药理活性及转化前景 冬虫夏草(Ophiocordyceps sinensis)、蛹虫草(Cordyceps militaris)、蝉花(Cordyceps cicadae)及相关分类群 微生物学, 药理学, 合成生物学 癌症, 炎症性疾病, 代谢性疾病, 神经退行性疾病 基因组学, 转录组学, 代谢组学, 生物合成基因簇分析, 合成生物学, 代谢工程, 精准发酵 NA 文本 NA NA NA NA 医学, 食品, 工业生物技术
12 2026-10-25
T Cell Receptor-Engineered T Cell Therapy in Solid Tumors: Where We Stand and What's to Come
2026-Oct-23, Annual review of medicine IF:15.1Q1
综述 本文综述了TCR-T细胞疗法在实体瘤中的生物学原理、临床证据、安全性考量及耐药机制,并讨论了未来优化方向 系统总结了TCR-T细胞疗法在实体瘤中的最新临床进展(如afamitresgene autoleucel获批用于滑膜肉瘤),并整合了抗原选择、基因编辑和合成生物学等前沿技术对安全性和疗效的改进 TCR-T细胞疗法仍存在HLA限制、抗原异质性、on-target/off-tumor毒性以及抗原丢失和T细胞耗竭等耐药机制的限制 总结TCR-T细胞疗法在实体瘤中的研究现状并探讨未来优化其治疗潜力的方向 TCR-T细胞疗法及实体瘤患者 肿瘤免疫治疗 实体瘤(包括滑膜肉瘤) T细胞受体工程化T细胞疗法、基因编辑、合成生物学 NA 文本 NA 基因编辑 人类T细胞 NA 医学
13 2026-10-25
From ecosystem engineering to living computers: integrating dual-paradigm bacterial therapeutics for solid tumor microenvironment reprogramming
2026-Oct-23, International journal of pharmaceutics IF:5.3Q1
综述 构建双范式框架,整合工程化细菌治疗与生态系统编辑以重编程实体瘤微环境 提出结合工程细菌疗法和生态系统编辑的双范式框架,并增加患者分层和适应性治疗监测的假设生成框架 缺乏前瞻性临床验证,临床经验因菌株、减毒方式、给药途径、肿瘤生物学、治疗背景和患者特征差异而异 探讨细菌疗法作为精准肿瘤学组成部分的潜力,并强调前瞻性临床验证的必要性 肿瘤相关微生物生态系统和实体瘤微环境 合成生物学、肿瘤微生物学、精准肿瘤学 实体瘤 噬菌体介导靶向、竞争置换、代谢重编程、环境传感器、遗传逻辑电路 NA 文本 NA NA 细菌 环境传感器、遗传逻辑电路、治疗有效载荷 医学
14 2026-10-25
Innovative Microbial Chassis for Systems and Synthetic Biology
2026-Oct-22, Advances in biochemical engineering/biotechnology
综述 系统探讨了系统和合成生物学中广泛使用及新兴的微生物底盘系统,涵盖其核心生物学特性、遗传与代谢工程进展及工业应用 系统比较多种微生物底盘在关键性能指标上的差异,提出整合系统与合成生物学的理性底盘设计思路 作为综述章节,未提供原始实验数据,缺乏对具体底盘改造策略的定量验证 为高效、稳健、可放大的生物制造提供理性底盘设计的可操作见解 微生物底盘系统,包括大肠杆菌、酿酒酵母、枯草芽孢杆菌和谷氨酸棒杆菌 合成生物学 NA 遗传工程, 代谢工程 NA 文本 NA NA 大肠杆菌, 酿酒酵母, 枯草芽孢杆菌, 谷氨酸棒杆菌 NA 医药, 能源, 工业生物技术
15 2026-10-25
Synthetic activation of gibberellin signalling reveals spatial coordination of root growth
2026-Oct-22, Nature plants IF:15.8Q1
研究论文 该研究开发了合成GA(sGA)与改造的GID1(mGID1)正交系统,用于在拟南芥中细胞特异性激活GA信号,揭示根内皮层和表皮中GA信号的协同作用对根伸长至关重要 开发了sGA-mGID1正交配体-受体系统,sGA与内源GID1结合能力极低,mGID1可选择性识别sGA,实现了体内细胞特异性激活GA信号,为植物激素信号的空间精确重编程提供了通用平台 研究主要基于拟南芥模型,sGA-mGID1系统在其他作物中的适用性和效率尚未验证;对GA运输分子机制的直接证据仍有限 探究GA信号在根不同细胞层中的空间协调作用,并开发可细胞特异性激活GA信号的合成生物学工具 拟南芥(Arabidopsis)根系,包括内皮层和表皮等细胞层 植物合成生物学 NA 化学遗传学正交配体-受体系统、遗传转化、荧光成像 NA 图像、荧光显微数据 NA NA 拟南芥(Arabidopsis thaliana) 正交配体-受体信号激活系统(sGA-mGID1),用于细胞特异性激活赤霉素信号通路 农业、植物合成生物学
16 2026-10-25
Bacterial R-bodies with common morphologies and unrolling dynamics are phylogenetically scattered, indicating extensive lateral gene transfer and wide application potential
2026-Oct-21, Applied and environmental microbiology IF:3.9Q2
研究论文 该研究比较了来自六种假单胞菌门的R小体的形态学和展开动力学,揭示了广泛的水平基因转移,并首次根据酸诱导延伸动力学将R小体分为快速爆发型和慢速型两类 首次利用高帧率光学显微镜视频记录研究R小体的延伸和回缩动力学,发现R小体可分为快速爆发型和慢速型两类;结合电子显微镜形态学与遗传数据揭示了广泛的水平基因转移 研究仅涉及六种假单胞菌门的R小体,样本量有限;水平基因转移的存在使得基于遗传数据的统一框架变得复杂 整合R小体的遗传学、形态学和展开动力学特征,为构建R小体生物技术工具箱提供依据 来自六种假单胞菌门的R小体,包括系统发育多样的内共生菌和非内共生菌 合成生物学 NA 电子显微镜,高帧率光学显微镜视频记录 NA 图像,视频,遗传数据 六种假单胞菌门的R小体 NA 假单胞菌门细菌 NA 医学,材料,工业生物技术
17 2026-10-25
Interaction between the oxidative pentose phosphate pathway and chlororespiration sustains high-rate algal exoelectrogenesis
2026-Oct-20, Plant physiology and biochemistry : PPB IF:6.1Q1
研究论文 本文研究了绿藻Parachlorella kessleri MACC-38中氧化戊糖磷酸途径(OPPP)与氯呼吸之间相互作用维持高效藻类胞外电子生成(exoelectrogenesis)的生理机制。 揭示了在无胁迫处理条件下,OPPP通过葡萄糖-6-磷酸脱氢酶上调提供NADPH作为胞外电子生成的主要还原力,并发现由质体末端氧化酶(PTOX)介导的氯呼吸通过重新氧化质体醌库来维持氧化还原稳态,从而持续支持胞外电子生成。 研究主要基于生理和生化数据,未明确涉及合成生物学工具的具体应用验证,且机制模型仍需进一步遗传学验证。 探究绿藻Parachlorella kessleri MACC-38中高效胞外电子生成的生理基础,特别是OPPP和氯呼吸的相互作用机制。 绿藻Parachlorella kessleri MACC-38菌株 合成生物学、生物电化学 NA 生理生化分析、电子传递测定 NA 生理生化数据 NA NA Parachlorella kessleri NA 能源、环境
18 2026-10-25
SCULPT-MCP: Systematic Chromosomal Upgrades for Locus-Driven Protein Topologies in Microcompartments
2026-Oct-16, ACS chemical biology IF:3.5Q2
研究论文 通过系统性地改变基因在操纵子中的位置,研究其对细菌微区室形态和功能的影响 首次证明基因顺序是控制蛋白质纳米机器组装和功能的可编程设计原则 研究仅针对pduN基因和特定微区室,普适性有待验证 探索基因顺序对蛋白质纳米结构形态发生和功能的影响 细菌微区室(BMCs)及其关键结构基因pduN 合成生物学 NA 基因工程、分子克隆 NA 实验数据 NA NA 细菌 基因操纵子重排 医学, 工业生物技术
19 2026-10-25
Elucidating the Requirements for microRNA-Mediated Upregulation Enables Reengineering of Upregulatory Sites
2026-Oct-16, ACS chemical biology IF:3.5Q2
研究论文 本研究利用miRFluR双荧光报告系统,以miR-891b上调B3GLCT为模型,系统探究了miRNA介导上调的分子要求,并证明上调位点可被重新设计以响应其他miRNA 首次系统揭示miRNA上调蛋白表达需要特定序列元件和RNA二级结构,且该效应具有上下文依赖性并受局部UTR结构影响;证明上调位点可通过重新设计被其他miRNA触发,为合成生物学操作提供新可能 研究仅基于miRFluR报告系统和一个模型系统(miR-891b调控B3GLCT),上调机制的普遍性仍需在更多内源基因和生理环境中验证 阐明miRNA介导基因上调的分子要求,并探索通过重新设计上调位点实现合成生物学调控的可行性 miRNA上调调控机制,以miR-891b对B3GLCT的上调为模型系统 合成生物学,分子生物学 NA miRFluR双荧光报告基因检测,定点突变,截短分析 NA 荧光报告数据,序列数据 NA NA 哺乳动物细胞 双荧光报告基因系统(miRFluR) 医学,合成生物学
20 2026-10-25
Mining Phage Genomes for Regulatory Elements to Develop a SynBio Toolbox for Non-Model Pseudomonads
2026-Oct-16, ACS synthetic biology IF:3.7Q1
研究论文 该文通过ONT-cappable测序绘制了五种假单胞菌噬菌体的全长初级转录本图谱,挖掘启动子和终止子等调控元件,并在非模式假单胞菌中验证其功能,构建了合成生物学工具箱 首次从噬菌体基因组中系统挖掘并实验验证了适用于荧光假单胞菌和丁香假单胞菌的启动子和终止子文库,发现了噬菌体编码RNAP的特有启动子基序,所获元件比现有跨物种SynBio工具具有更精细的基因表达调控能力 仅对10个启动子和5个终止子进行了体内定量表征,验证子集有限,且元件功能仅在少数假单胞菌菌株中测试,通用性有待进一步验证 从噬菌体基因组中挖掘调控元件,为非模式假单胞菌开发合成生物学工具箱 五种假单胞菌噬菌体(KIL5、KIL3b、KNP、ϕ2、pphageB21)及荧光假单胞菌GL-S-306和丁香假单胞菌 合成生物学 NA ONT-cappable-sequencing、转录组测序 NA 序列数据、转录组数据 五种噬菌体基因组,鉴定出232个转录起始位点和176个转录终止位点;10个启动子和5个终止子在荧光假单胞菌GL-S-306中进行体内表征 NA 荧光假单胞菌、丁香假单胞菌 启动子和终止子调控元件文库 医学、工业生物技术
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