合成生物学相关文章

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当前共找到 5557 篇文献,本页显示第 1 - 20 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 工程工具 宿主生物 回路设计 应用领域
1 2026-08-22
Recent advances in protein engineering and synthetic applications of amino acid oxidases
2026-Nov, Bioresource technology IF:9.7Q1
综述 本文综述了氨基酸氧化酶(AAOs)的催化机制、活性测定方法,并重点介绍了蛋白质工程策略(如定向进化、理性/半理性及AI引导方法)及其在化学酶级联反应和多酶级联消旋化等合成应用中的最新进展。 全面分析D-和L-型AAOs的催化机制,并强调AI引导的蛋白质工程策略和化学酶级联等新兴合成应用。 未详细讨论AAOs的底物特异性和稳定性在实际工业应用中的具体限制。 总结AAOs的蛋白质工程和合成应用进展,以推动其在现代生物催化和合成生物学中的应用。 氨基酸氧化酶(AAOs) 机器学习 NA 蛋白质工程、定向进化、理性设计、AI引导设计 NA 文本 NA NA NA NA 医药、农业化学、工业生物技术
2 2026-08-22
Bioorthogonal chemistry-driven multi-enzyme strategy for efficient terpenoid biosynthesis
2026-Nov, Bioresource technology IF:9.7Q1
研究论文 本文开发了一种基于生物正交化学的多酶级联策略,通过构建有序交联酶复合物实现萜类化合物的高效体外合成 利用生物正交蛋白配对技术将六种缩短的甲羟戊酸途径酶组装成有序交联酶复合物,实现酶的空间有序排列,并通过多层荧光标记技术验证排列,该策略具有模块化和通用性 摘要中未提及明显局限性,可能包括体外系统稳定性或成本等问题 开发一种稳健、通用且可重复使用的体外多酶级联平台,用于高效合成高价值萜类化合物,推动体外合成生物学发展 来自缩短甲羟戊酸途径的六种酶,以及β-法尼烯合酶和紫杉二烯合酶 合成生物学 NA 生物正交化学、多层荧光标记技术、体外酶级联 NA 实验数据(产物浓度、酶活性) β-法尼烯生产实验:包含有序交联酶复合物、野生型游离酶混合物和随机交联酶复合物三种系统 生物正交蛋白配对 体外系统(无宿主生物) 有序交联酶复合物(O-CLEs)用于甲羟戊酸途径的级联反应 工业生物技术
3 2026-08-22
Gene expression and metabolic regulation of carotenoid and withanolide biosynthetic pathways in Withania somnifera with emphasis on FPPS-mediated regulation
2026-Sep, Protoplasma IF:2.5Q2
研究论文 本文全面研究了印度人参(Withania somnifera)中类胡萝卜素和醉茄内酯生物合成途径的基因表达与代谢调控,重点探讨了法尼基焦磷酸合酶(FPPS)的调控作用 首次对22个相关基因进行转录谱分析,发现FPPS作为关键通量调控酶,并通过瞬时过表达WsFPPS2验证其在醉茄内酯合成中的上游调控作用 研究主要基于转录水平和瞬时表达实验,缺乏稳定的遗传转化和长期代谢流分析 阐明印度人参中类胡萝卜素和醉茄内酯生物合成途径的基因表达与代谢调控机制,特别是FPPS介导的调控,为代谢工程提供靶点 印度人参(Withania somnifera)的营养和生殖组织 植物代谢工程 NA 转录组分析、瞬时过表达、系统发育分析 NA 基因表达谱数据 22个基因,包含不同组织和过表达叶片样本 瞬时过表达(农杆菌介导) 印度人参(Withania somnifera) 醉茄内酯和类胡萝卜素生物合成途径中的FPPS过表达 医药
4 2026-08-22
Flaxseed gum-reinforced sodium alginate semi-interpenetrating polymer network W1/O/W2 emulgels for targeted co-delivery of prebiotics and engineered "living factory": a novel next-generation synbiotic system for anoxia-triggered synergistic inulin metabolism
2026-Sep, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1
研究论文 本研究开发了一种基于亚麻籽胶增强海藻酸钠半互穿聚合物网络的W1/O/W2乳凝胶系统,用于靶向共递送益生元(菊粉)和工程化“活工厂”大肠杆菌Nissle1917,实现缺氧触发的协同菊粉代谢 创新性地将合成生物学与生物大分子组装相结合,构建了下一代工程化合生元平台,通过缺氧响应性菊粉酶分泌系统实现不依赖宿主菌群异质性的精准微生物组调控 摘要中未提及研究的局限性 旨在开发一种新型工程化合生元系统,实现益生元和工程菌的同步递送,并利用缺氧触发机制实现菊粉的靶向代谢,从而克服宿主菌群异质性对益生元功效的限制 工程化大肠杆菌Nissle1917及其分泌的菊粉酶,以及亚麻籽胶-海藻酸钠乳凝胶系统 合成生物学 NA NA NA NA NA NA 大肠杆菌Nissle1917 缺氧响应性双酶系统,用于靶向菊粉酶分泌 医学, 食品
5 2026-08-22
An insoluble de novo protein enables survival of Escherichia coli by sequestering a gene repressor
2026-Aug-25, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本研究通过筛选组合文库,鉴定了一种不溶性全新蛋白质,该蛋白质通过隔离基因阻遏蛋白MetJ,上调胱硫醚β-合酶表达,从而挽救大肠杆菌中致死性基因缺失,维持细胞存活。 首次发现不溶性全新蛋白质能够通过隔离阻遏蛋白来执行生命维持功能,为全新蛋白质在细胞中的功能提供新见解,可能对合成生物学和自然进化中基因新生研究有启示。 摘要未提及明显的局限性,但可能包括该蛋白质特异性、机制普遍性及体内适用性的潜在限制。 研究全新蛋白质能否通过提供新型生物学功能,在细胞中执行生命维持作用,并揭示其机制。 大肠杆菌以及一种全新蛋白质(UnDeR) 合成生物学 NA 组合文库筛选、蛋白质组学分析 NA 序列数据、蛋白质组数据 组合文库中的序列以及特定大肠杆菌菌株(数量未明确) NA 大肠杆菌 调控通路:通过隔离MetJ阻遏蛋白,上调胱硫醚β-合酶表达 合成生物学
6 2026-08-22
Toward Complex Polyketide Biosynthesis in Yarrowia lipolytica via Metabolic Reprogramming
2026-Aug-21, Journal of microbiology and biotechnology IF:2.5Q3
综述 本文综述了通过代谢重编程在解脂耶氏酵母中实现复杂聚酮化合物生物合成的先进策略、案例研究及未来方向。 总结了从经典代谢重编程到细胞器工程和亚细胞区室化等新兴方法的最新策略,并批判性评估了当前局限性。 当前策略仍存在产量瓶颈和代谢负担等问题,尚未完全实现工业规模的复杂聚酮生产。 旨在将解脂耶氏酵母建立为可编程、工业可行的聚酮化合物生产平台。 解脂耶氏酵母及其代谢工程改造。 代谢工程、合成生物学 NA 代谢工程、合成生物学 NA 文献资料 NA NA 解脂耶氏酵母 代谢通路重编程、细胞器工程、亚细胞区室化 医药、工业生物技术
7 2026-08-22
The molecular mechanisms and therapeutic targeting of microtubule glutamylation in mitosis and cancer
2026-Aug-20, Pharmacology & therapeutics IF:12.0Q1
综述 本文综述了微管谷氨酰化在有丝分裂和癌症中的分子机制,并探讨了针对该通路的治疗策略 首次将微管谷氨酰化通路定位为癌症治疗的多面靶点,讨论了从代谢干预、直接酶抑制到靶向蛋白降解和合成生物学等前沿治疗策略 摘要中未提及局限性,可能缺乏对现有治疗策略临床效果的详细评估 阐明微管谷氨酰化在有丝分裂中的分子机制及其在癌症发生中的作用,并评估相关治疗策略 微管谷氨酰化相关酶(如TTLL11、TTLL4、TTLL6、TTLL12)及肿瘤细胞 癌症生物学 癌症 NA NA 文献资料 NA 合成生物学 NA NA 医学
8 2026-08-22
Advanced gene editing technologies for oncology mechanisms, applications, and clinical implementation
2026-Aug-20, Cancer gene therapy IF:4.8Q1
综述 本文全面综述了先进基因编辑技术在肿瘤学中的机制、应用及临床实施情况 系统梳理了包括碱基编辑、先导编辑、PASTE系统以及ARCUS、MegaTALs等混合平台在内的最新进展,并结合人工智能、生物传感器和合成生物学概念 未明确提及具体局限性,但可能涉及递送优化、脱靶效应和伦理问题等挑战 探讨基因编辑技术在癌症治疗中的精确分子疗法及其临床转化前景 多种癌症类型,包括肺癌、乳腺癌、结直肠癌、血液癌、肝癌、胰腺癌、头颈癌、食管癌、前列腺癌、胃癌和脑癌 合成生物学 癌症 ZFN、TALEN、CRISPR/Cas系统(Cas9、Cas12、Cas13)、碱基编辑、先导编辑、PASTE系统、ARCUS、MegaTALs、重组酶 NA 文本 NA ZFN、TALEN、CRISPR-Cas9、CRISPR-Cas12、CRISPR-Cas13、碱基编辑、先导编辑、PASTE系统、ARCUS、MegaTALs、重组酶 哺乳动物细胞 CAR-T细胞工程、免疫检查点调控 医学
9 2026-08-22
Metabolic engineering of Komagataella phaffii for enhanced production of heterologous proteins and small molecules: key strategies and future directions
2026-Aug-19, Applied and environmental microbiology IF:3.9Q2
综述 本文综述了Komagataella phaffii代谢工程在提高异源蛋白和小分子产量方面的进展,涵盖表达系统发展、核心优化策略及未来方向 系统总结了代谢流控制、动态调控、系统建模、底盘细胞优化等综合策略,并为工业应用提供方向性指导 未提供具体实验数据,对挑战的讨论较为宏观 概述Komagataella phaffii代谢工程的最新进展,并探讨未来发展方向 Komagataella phaffii的代谢工程及异源蛋白和小分子生产 代谢工程、合成生物学 NA 代谢工程、系统建模 NA NA NA NA Komagataella phaffii 代谢通路调控策略,如代谢流控制、动态调控 工业生物技术
10 2026-08-22
Applications of synthetic biology in biomedicine
2026-Aug-19, Molecular biomedicine IF:6.3Q1
综述 本文系统综述了合成生物学在生物医学领域的应用进展,包括基础工具、关键技术、创新策略及临床转化价值 提出了从技术原理到临床转化的系统框架,涵盖AI赋能元件设计、闭环智能调控、通用型细胞及多模式诊疗平台等前沿方向 合成生物学系统在体内靶向和编辑精度不足、基因电路功能稳定性差、免疫原性风险高、制造成本高以及伦理监管滞后等瓶颈 为开发下一代基于合成生物学的诊断和治疗策略提供理论支持和技术指导 合成生物学系统及相关技术 合成生物学 多种疾病(如病原体和肿瘤) DNA合成与组装、计算建模、基因编辑、RNA调控、蛋白质工程 NA NA NA 基因编辑(具体工具未指明) 多种底盘细胞(具体未指明) 人工基因电路、调控电路 医学
11 2026-08-22
PlantGFM: A Genomic Foundation Model for Discovery and Creation of Plant Genes
2026-Aug, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本文介绍了PlantGFM,一种基于Hyena算子的植物基因组基础模型,通过预训练和微调实现了长上下文预测和从头基因设计,并在植物中验证了其转录和蛋白表达活性 首次展示了大型语言模型生成的序列在植物中实现DNA-RNA-蛋白质表达的可行性,并通过AI-人类知识融合筛选管道验证了从头设计基因的功能 未提及具体局限性,可能包括对长上下文预测的准确性或生成基因在复杂植物环境中的稳定性等未充分验证的问题 开发一种植物基因组基础模型,以实现植物基因的发现和从头设计,推动植物合成生物学和AI辅助育种的发展 12种植物物种的基因组序列,以及用于微调的10个已注释植物基因组 机器学习 NA 基因组预训练,序列生成 基于Hyena算子的基础模型 基因组序列 10.84亿个核苷酸来自12种植物,7个候选基因在烟草中验证 NA 本塞姆氏烟草 NA 农业,合成生物学
12 2026-08-22
Characterization and Wound-Healing Effects of Fucoidan from Sargassum polycystum Collected in South Sulawesi in a Staphylococcus aureus-Infected Rat Model
2026-Jul-21, Marine biotechnology (New York, N.Y.)
研究论文 从南苏拉威西采集的羊栖菜中提取岩藻多糖,并评估其对金黄色葡萄球菌感染大鼠模型的伤口愈合效果 首次研究了来自南苏拉威西潮间带的羊栖菜中岩藻多糖的伤口愈合潜力,并证实其安全性和有效性 未提供具体局限性信息 评估羊栖菜中提取的岩藻多糖对金黄色葡萄球菌感染伤口的愈合效果及其安全性 羊栖菜中提取的岩藻多糖以及金黄色葡萄球菌感染的大鼠模型 海洋生物学、医学 皮肤感染、伤口愈合 FTIR、¹H NMR、¹³C NMR、溶血试验、组织学分析 NA 图像、光谱、组织学数据 大鼠,6毫米切除伤口,感染金黄色葡萄球菌(0.1 mL,10⁷ CFU/mL),对照组使用凡士林 NA 大鼠 NA 医学、可持续海洋生物技术
13 2026-08-22
Bacteria mediated tumor therapy recent advances challenges and future perspectives
2026-Jul-17, Discover oncology IF:2.8Q2
综述 系统总结了细菌介导肿瘤治疗的历史发展、内在抗肿瘤机制、基因工程策略及多模式生物杂合系统,并讨论了临床转化中的挑战与未来方向 提出下一代智能化、可控且临床可转化的细菌来源活体抗肿瘤系统的合理设计策略 临床转化受限于生物安全控制不足、脱靶定植、不受控制的增殖、免疫清除以及缺乏标准化生产和监管指南 综述细菌介导肿瘤治疗的研究进展,分析不同平台的优缺点和核心瓶颈,并展望未来设计方向 工程化细菌及细菌来源的生物杂合系统 合成生物学 肿瘤 合成生物学 NA NA NA CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick 细菌 基因修复、环境响应可编程表达、细胞毒性蛋白生产、多模式联合治疗系统 医学
14 2026-08-22
SynBio-DSP: an integrated synthetic biology platform with fed-batch fermentation and continuous downstream processing for sustainable production of thermostable cellulases
2026-Jun-14, Biotechnology for biofuels and bioproducts IF:3.3Q3
研究论文 本文介绍了一个名为SynBio-DSP的综合合成生物学平台,该平台整合了分批补料发酵和连续下游处理技术,用于可持续生产耐热纤维素酶,并通过多目标优化显著降低了生产成本和碳足迹。 首次将合成生物学、机器学习指导的生物过程优化和连续下游处理相结合,形成一个集成平台,利用QTL系统和CRISPRi技术增强纤维素酶生产,并通过PEF-ASL系统实现高效酶回收,整体优化生产和回收过程。 研究主要基于实验室规模和500公斤/年的设施模型,实际工业规模应用可能面临放大挑战;sfGFP融合蛋白导致酶活性轻微下降,可能影响某些应用场景。 开发一个集成平台,协同结合合成生物学、机器学习和连续下游处理技术,以实现纤维素酶的可持续和经济高效生产。 研究对象为超耐热纤维素酶CtCel9A,利用重组枯草芽孢杆菌菌株进行生产。 合成生物学 NA CRISPR干扰(CRISPRi)、响应面法(RSM)、高斯过程回归 高斯过程回归(GPR)和NSGA-III多目标优化模型 实验室测量数据(酶活性、能量消耗等)和模拟数据 本研究涉及微生物发酵和连续处理实验,具体样本量为高吞吐量微生物反应器中的多次实验,但未提供具体数字。 CRISPR-Cas9 枯草芽孢杆菌 设计了QTL系统用于自诱导,结合CRISPRi介导的细胞壁减弱,以及连续的脉冲电场辅助协同裂解系统。 工业生物技术、能源
15 2026-08-22
Base modifications shift tertiary structure and activity in synthetic RNA origami and a natural ribozyme
2026-May-13, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 研究碱基修饰(如5-甲基胞嘧啶和N1-甲基假尿苷)对合成RNA折纸纳米结构和天然四膜虫核酶三级结构及功能的影响 首次揭示碱基修饰通过改变碱基堆叠能量而非碱基配对,重塑RNA折叠景观,影响合成RNA纳米结构和天然核酶的结构-功能关系 主要依赖体外实验,未深入探索体内环境的影响,且仅考察了特定修饰和特定RNA系统 阐明常见碱基修饰对RNA三级结构和功能的影响机制,为合成生物学和疗RNA设计提供指导 合成RNA折纸纳米结构和天然四膜虫核酶 结构生物学 NA 冷冻电镜,FRET,生化实验 NA 结构图像和生化数据 多个RNA折纸样品和四膜虫核酶样品 NA NA NA 合成生物学,医药
16 2026-08-22
Application of bacteriophages in the prevention and control of bacterial infectious diseases in animals
2026, Frontiers in microbiology IF:4.0Q2
综述 本文综述了噬菌体在动物细菌性传染病防控中的应用,涵盖溶菌性噬菌体疗法、噬菌体展示衍生干预以及CRISPR-Cas等工程化平台,并分析了从临床前研究到兽医应用的转化瓶颈 不同于以往描述性综述,本文系统分析转化瓶颈,包括宿主范围限制、药代动力学局限和监管碎片化,并评估了微生物群保护和生物膜穿透等声称优势的研究证据,同时承认实验结果不一致性和固有应用限制 大多数证据仍处于临床前阶段,转化差距显著,且有益效应的实验结果不一致 评估噬菌体在动物细菌性传染病防控中的应用潜力,并提出实现兽医治疗学应用所需的协调进展 牲畜、家禽和水产养殖动物中的细菌性传染病 生物信息学、合成生物学 细菌性传染病 噬菌体疗法、噬菌体展示、CRISPR-Cas系统 NA NA NA CRISPR-Cas9 动物宿主(牲畜、家禽、水产养殖) 多功能生物平台,整合直接杀伤、免疫调节和抗原递送 医学、农业
17 2026-08-22
Natural polysaccharides as immune adjuvants to overcome immune checkpoint inhibitor resistance: mechanistic insights, clinical evidence, and translational challenges
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
综述 本文系统评述了天然多糖作为免疫佐剂克服免疫检查点抑制剂耐药的机制、临床证据及转化挑战 首次系统阐述天然多糖通过重塑肠道菌群-代谢轴、逆转免疫抑制微环境等四种核心机制克服免疫检查点抑制剂耐药,并提出结合AI辅助糖组学、合成生物学和工业6.0的精准医疗工作流程 缺乏大规模随机III期试验证据,多糖尚不能作为标准佐剂验证;存在结构异质性、质量控制不规范、口服生物利用度低和临床试验方案不一致等转化瓶颈 构建机制引导的路线图,加速天然多糖免疫检查点抑制剂佐剂的临床转化 天然多糖及其免疫调节作用、免疫检查点抑制剂耐药机制 免疫学 恶性肿瘤 NA NA 文献数据 NA NA NA NA 医学
18 2026-08-22
Minimal logic gates for probiotic Escherichia coli Nissle 1917 sensing and treatment of dual-bacteria intestinal infection
2025-12, Gut microbes IF:12.2Q1
研究论文 本研究设计了针对益生菌大肠杆菌Nissle 1917的最小逻辑门,用于感知并治疗由两种细菌引起的肠道双重感染 设计并实现了针对双重细菌感染的“AND”逻辑门,使益生菌能够同时检测并杀死两种病原体,并在小鼠模型中验证了预防和治疗效果 尚未提及具体的局限性 开发一种能够感知并治疗双重细菌感染的工程益生菌策略 益生菌大肠杆菌Nissle 1917以及两种病原菌 合成生物学 肠道感染 基因工程 逻辑门 实验数据 小鼠模型 NA 大肠杆菌 AND逻辑门 医学
19 2026-08-22
Research progress on gut microbiota in colorectal cancer immunotherapy
2025-11, Biochimica et biophysica acta. Reviews on cancer
综述 系统综述肠道微生物及其代谢产物在结直肠癌免疫治疗中调节免疫检查点抑制剂疗效的关键进展 全面总结特定菌群及代谢产物调控ICIs疗效的机制,并探讨基于合成生物学的工程菌疗法等新干预策略 综述基于现有文献,未包含最新未发表数据,且机制结论可能受研究异质性影响 为通过调节肠道微生物组优化结直肠癌免疫治疗提供理论依据 结直肠癌患者及肠道微生物群 微生物组学、肿瘤免疫学 结直肠癌 NA NA 文献数据 NA 合成生物学 肠道微生物 基于菌群的免疫调节通路 医学
20 2026-08-22
Synthetic biology approaches for improving the specificity and efficacy of cancer immunotherapy
2024-05, Cellular & molecular immunology IF:21.8Q1
综述 本文综述了合成生物学在提高癌症免疫治疗特异性和疗效方面的应用,重点讨论了两种主要策略:工程化免疫细胞靶向肿瘤表面抗原和工程化基因回路检测瘤内疾病特征 强调合成生物学在增强免疫治疗特异性、可控性和疗效方面的创新工具,提出了两种主策略并展望未来突破 未具体提及局限性,但综述中隐含挑战包括肿瘤异质性、基因回路稳定性等 概述癌症免疫治疗现状和未来前景,突出合成生物学在提高特异性、可控性和疗效中的作用 癌症免疫治疗中的工程化免疫细胞和基因回路 合成生物学 癌症 NA NA NA NA NA NA 基因回路(用于检测瘤内疾病特征) 医学
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