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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-09-28 |
Construction and evaluation of an inside-out lysis system based on T4 lysozyme
2027-Jan, Protein expression and purification
IF:1.4Q4
DOI:10.1016/j.pep.2026.106983
PMID:42492745
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研究论文 | 构建并评估了一种基于T4溶菌酶的内向外裂解系统,用于大肠杆菌的编程性细胞破坏 | 通过融合三种分泌信号肽(PelB、NapA和HybA)到T4溶菌酶,发现NapA-T4溶菌酶(N-T4L)具有最高的胞内蛋白泄漏水平,并首次系统评估了化学因素对裂解效果的影响 | 未提及 | 构建基于T4溶菌酶的内向外裂解系统,实现大肠杆菌的编程性细胞破坏,为合成生物学应用提供基础 | 大肠杆菌(Escherichia coli) | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌 | 基于T4溶菌酶的内向外裂解系统,融合分泌信号肽PelB、NapA和HybA | 工业生物技术 |
| 2 | 2026-09-28 |
Alkaliphilic microbial cellulases: sources, structural insights, and bioengineering approaches for industrial applications
2026-Sep-26, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-026-05227-4
PMID:42799763
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综述 | 本文综述了嗜碱性微生物纤维素酶的微生物来源、结构特征、作用机制及其在工业生物加工中的应用与生物工程改造策略 | 系统整合了嗜碱性纤维素酶的来源、结构与作用机制,并综述了酶工程、合成生物学和设计型纤维素体在提升其催化性能、稳定性和底物特异性方面的最新进展 | 嗜碱性纤维素酶的长期稳定性不足、与传统发酵系统不兼容,且缺乏标准化的酶活性测定方法,限制了其大规模工业应用 | 为嗜碱性纤维素酶的微生物来源、结构特征、作用机制及工业应用提供最新综述,并探讨其生物工程改造策略 | 嗜碱性纤维素酶及其产生微生物 | 工业生物技术 | NA | 酶工程, 合成生物学, 设计型纤维素体 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 能源, 工业生物技术, 环境, 材料 |
| 3 | 2026-09-28 |
Sclareol Production Driven by Advanced Synthetic Biology Strategies
2026-Sep-22, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.6c07601
PMID:42798971
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综述 | 本文系统综述了合成生物学驱动下的香紫苏醇生产策略,重点包括微生物底盘工程、代谢途径优化和酶工程 | 系统整合了AI辅助预测、多组学分析、高通量筛选和智能发酵等新兴技术在香紫苏醇生产中的应用 | 文章为综述性文章,未提供原始实验数据,且对现有挑战的分析可能不够全面 | 探讨合成生物学和代谢工程策略提高香紫苏醇生产的进展与挑战,提出未来发展方向 | 香紫苏醇及其微生物底盘细胞 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、代谢工程、酶工程、AI辅助预测、多组学分析、高通量筛选、智能发酵 | NA | 文本 | NA | NA | 微生物底盘细胞 | NA | 医药、农业、食品、工业生物技术 |
| 4 | 2026-09-28 |
A risk-based framework to guide oversight of nucleic acid constructs
2026, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2026.1870125
PMID:42528926
|
观点文章 | 本文提出一个基于风险的分层框架,用于对合成核酸产品进行生物安全相关分类,以指导筛查监管。 | 提出了一个三层分类系统,区分定制与非定制产品,并根据序列长度和来源病毒的风险等级进行划分。 | 框架基于专家意见,缺乏实证数据支持,部分中间风险类别需要进一步研究和政策开发。 | 为核酸合成筛查提供基于风险的分类指导,以平衡生物安全监管与合法研究负担。 | 合成核酸产品,包括DNA和RNA序列及其构建体。 | 生物安全 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 5 | 2026-09-28 |
Genome-wide analysis of TPS family reveals kaurene synthase-like genes in Isodon rubescens f. lushanensis
2026, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2026.1937259
PMID:42798568
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研究论文 | 本研究通过基因组和转录组分析,鉴定了Isodon rubescens f. lushanensis中83个TPS基因,并功能表征了5个二萜合酶基因。 | 首次对Isodon rubescens f. lushanensis进行全基因组TPS家族分析,揭示了其独特的二萜生物合成途径,并鉴定了与lushanrubescensin生物合成相关的候选基因。 | 研究仅对5个二萜合酶基因进行了功能表征,未全面验证所有候选基因的功能,且未进行体内功能验证。 | 阐明Isodon rubescens f. lushanensis与Isodon rubescens之间化学成分差异的分子基础。 | Isodon rubescens f. lushanensis的基因组和转录组,以及TPS基因家族。 | 植物基因组学 | NA | 基因组测序, 转录组测序, RT-qPCR, 异源表达 | NA | 基因组序列, 转录组序列, 表达数据 | NA | NA | 酿酒酵母 | NA | 医药, 合成生物学 |
| 6 | 2026-09-28 |
Engineering Agonistic Bispecifics to Investigate the Influence of Distance on Surface-Mediated Complement Activation
2024-07-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2400091
PMID:38819221
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研究论文 | 该研究通过设计不同长度的连接子构建双特异性纳米抗体,探究距离对表面介导补体激活的影响 | 首次系统研究连接子长度和柔性对C1激活的影响,发现存在最佳端到端距离范围,并揭示补体激活差异源于C4b沉积和膜裂解而非C1激活或C4切割 | 研究仅使用双特异性纳米抗体,未全面比较其他抗体类型,且未在体内验证 | 探究几何参数(连接子长度)对C1结合和补体激活的影响,优化靶向细胞杀伤的激动剂设计 | 双特异性纳米抗体、C1复合物、补体系统 | 合成生物学 | NA | DNA纳米技术、蛋白质工程 | NA | NA | NA | DNA纳米技术 | NA | 双特异性纳米抗体作为C1激动剂 | 医学 |
| 7 | 2026-09-28 |
Advanced "Green" Prebiotic Composite of Bacterial Cellulose/Pullulan Based on Synthetic Biology-Powered Microbial Coculture Strategy
2022-Aug-08, Polymers
IF:4.7Q1
DOI:10.3390/polym14153224
PMID:35956737
|
研究论文 | 该研究通过合成生物学驱动的微生物共培养策略,开发了一种基于细菌纤维素/普鲁兰多糖的先进绿色益生元复合材料。 | 利用合成生物学驱动的微生物共培养策略,将益生元活性“嫁接”到细菌纤维素上,制备出环保且质量更好的复合材料。 | 摘要中未明确提及该研究的局限性。 | 开发细菌纤维素和益生元生产菌的共培养系统,以获得具有益生元活性的细菌纤维素基复合材料。 | 细菌纤维素、普鲁兰多糖、益生菌菌株GG、胶凝糖、黄原胶、共培养系统。 | 合成生物学 | NA | 共培养、扫描电子显微镜、傅里叶变换红外光谱 | NA | 图像、光谱数据 | NA | NA | NA | NA | 食品、医药 |
| 8 | 2026-09-28 |
Anaerobic Digestion of Food Waste and Its Microbial Consortia: A Historical Review and Future Perspectives
2022-08-03, International journal of environmental research and public health
DOI:10.3390/ijerph19159519
PMID:35954875
|
综述 | 本文综述了餐厨垃圾厌氧消化(FWAD)及其微生物群落的研究进展,从全球现状、关键条件与微生物群落变化、分子生物技术发展历程到多组学和合成生物学展望 | 系统梳理了FWAD微生物群落研究从经典菌株分离到高通量测序及同位素示踪的发展历程,并首次提出整合多组学和合成生物学来理解和调控FWAD功能微生物群落 | 目前缺乏对FWAD微生物群落的全面和预测性理解,这是FWAD领域的主要研究挑战 | 综述FWAD及其微生物群落的研究历史与未来展望,以期更好地管理全球可再生餐厨垃圾能源 | 餐厨垃圾厌氧消化过程中的微生物群落 | 环境生物技术 | NA | 高通量测序、同位素示踪、多组学、合成生物学 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 能源、环境 |
| 9 | 2026-09-28 |
Evaluation of existing guidelines for their adequacy for the food and feed risk assessment of microorganisms obtained through synthetic biology
2022-Aug, EFSA journal. European Food Safety Authority
DOI:10.2903/j.efsa.2022.7479
PMID:35991959
|
评估报告 | EFSA评估了合成生物学微生物在食品和饲料风险评估中的现有指南是否充分。 | 识别了与使用或生产非寻常或自然界新成分相关的新危害,并建议针对特定领域更新指南。 | 指南在评估生物质营养价值、微生物对肠道微生物组的影响、新自然界蛋白质的过敏潜力、水平基因转移的影响以及活细胞摄入的潜在风险方面存在不足。 | 评估合成生物学在农业食品领域的近期发展,确定其是否构成潜在新危害/风险,并评估现有风险评估指南的充分性。 | 用于食品和饲料链的合成生物学微生物。 | 合成生物学风险评估 | NA | 合成生物学 | NA | 文本 | 15个案例 | NA | 微生物 | NA | 食品, 饲料 |
| 10 | 2026-09-28 |
Evaluation of existing guidelines for their adequacy for the food and feed risk assessment of genetically modified plants obtained through synthetic biology
2022-Jul, EFSA journal. European Food Safety Authority
DOI:10.2903/j.efsa.2022.7410
PMID:35873722
|
评论 | 欧洲食品安全局GMO专家组评估了现有指南对通过合成生物学获得的转基因植物进行食品和饲料风险评估的充分性和适当性 | 通过假设性案例研究,系统评估了当前和近期合成生物学方法在食品和饲料风险评估中的适用性,并识别了需要更新的领域 | 基于假设性案例研究,可能未涵盖所有合成生物学应用;未提供具体的实验数据验证 | 评估现有指南对合成生物学来源转基因植物的食品和饲料风险评估的充分性,并确定是否需要更新指南 | 通过合成生物学获得的转基因植物(GMPs)及其食品和饲料产品 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | 植物 | NA | 食品, 农业 |
| 11 | 2026-09-28 |
Metabolic Engineering Strategies for Improved Lipid Production and Cellular Physiological Responses in Yeast Saccharomyces cerevisiae
2022-Apr-21, Journal of fungi (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/jof8050427
PMID:35628683
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综述 | 本文综述了酿酒酵母中脂质生产的代谢工程策略,包括脂肪酸合成、脂质积累、脂质储存和脂肪酸修饰四个模块,以及细胞生理响应的变化 | 系统总结了脂质合成的四个模块及其代谢工程策略,并探讨了脂质途径工程与细胞生理特性(如细胞膜完整性、活性氧水平、线粒体膜电位)之间的关系,提出了利用CRISPR基因组编辑和机器学习模型等合成生物学工具的未来趋势 | 作为综述,未提供原始实验数据,且主要聚焦于酿酒酵母,可能未全面涵盖其他产脂微生物的研究进展 | 总结提高酿酒酵母脂质生产的代谢工程策略,并探讨脂质途径工程对细胞生理特性的影响及未来发展方向 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)及其脂质生产途径 | 代谢工程 | NA | NA | NA | 文本 | NA | CRISPR基因组编辑工具 | 酿酒酵母 | 脂质合成途径(包括脂肪酸生物合成模块、脂质积累模块、脂质储存模块和脂肪酸修饰模块) | 生物燃料,油脂化学品,化妆品 |
| 12 | 2026-09-28 |
Material Engineering in Gut Microbiome and Human Health
2022, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/2022/9804014
PMID:35958108
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综述 | 本文综述了材料工程在肠道微生物组与人类健康研究中的应用,包括类器官、器官芯片、水凝胶、生物传感器和口服递送系统等生物材料技术 | 首次将肠道微生物组与材料研究两个不同领域进行综合聚焦的综述,提出材料工程在肠道微生物组与人类健康中的交叉研究主题 | 作为综述文章,未提供原始实验数据;临床转化所需的监管规则尚不完善 | 加速肠道微生物组研究工具的开发和靶向肠道微生物组的治疗手段的开发 | 肠道微生物组、肠道类器官、肠道芯片模型、水凝胶、微生物组生物传感器、口服细菌递送系统 | 机器学习 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 13 | 2026-09-28 |
Enabling protein-hosted organocatalytic transformations
2020-Apr-22, RSC advances
IF:3.9Q2
DOI:10.1039/d0ra01526a
PMID:33184588
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综述 | 本文综述了有机催化人工酶的发展,包括其制备方法、性能优化技术以及应用实例 | 强调了有机催化人工酶在提高有机催化生物相容性和扩展酶催化功能方面的创新 | 未具体说明,但综述讨论了挑战 | 讨论有机催化人工酶的发展 | 有机催化人工酶 | 蛋白质工程 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 化学, 合成生物学 |
| 14 | 2026-09-27 |
A 6His-2Flag dual-tag strategy enables high-yield production of antimicrobial peptide N6 in Pichia pastoris to combat multidrug-resistant Klebsiella pneumonia
2027-Apr, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2026.08.012
PMID:42787492
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研究论文 | 本研究在毕赤酵母X-33中建立了抗菌肽N6的高效异源表达系统,采用6His-2Flag双标签融合策略结合甲酸介导的切割,实现了N6的高产,并验证了其抗多重耐药肺炎克雷伯菌的活性 | 采用创新的6His-2Flag双标签融合策略结合甲酸介导切割,实现抗菌肽N6在毕赤酵母中的高产(1.02 g/L),显著超越以往报道并达到可规模化工业生产水平 | 尚未开展临床试验,仅在小鼠系统感染模型中验证了疗效,其人体安全性和药代动力学特性仍需进一步研究 | 建立抗菌肽N6的高效异源表达系统并评估其抗多重耐药肺炎克雷伯菌的治疗潜力 | 抗菌肽N6、多重耐药肺炎克雷伯菌临床分离株、毕赤酵母X-33表达系统、小鼠系统感染模型 | 合成生物学 | 细菌感染 | 异源蛋白表达、6His-2Flag双标签融合、甲酸介导切割、MIC测定、生物膜清除实验 | 小鼠系统感染模型 | 实验数据 | NA | 6His-2Flag双标签融合策略 | 毕赤酵母X-33 | 6His-2Flag双标签融合抗菌肽N6表达盒 | 医学 |
| 15 | 2026-09-27 |
Identifying paths to ammonium production in Vibrio natriegens by characterizing nitrogenase regulation
2026-Sep-25, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2026.102556
PMID:42790619
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研究论文 | 该文章通过功能基因组学、靶向突变和报告基因实验,鉴定了Vibrio natriegens中固氮酶调控蛋白的作用及其对铵与氮气的响应 | 首次系统表征了Vibrio natriegens固氮酶的调控网络,发现NifA足以激活固氮酶基因表达且NtrBC并非必需但影响表达时序,同时揭示GlnB和GlnK对NtrBC的冗余抑制更类似于非固氮大肠杆菌 | 研究主要基于遗传和报告基因实验,未全面解析所有调控因子的分子机制及翻译后修饰水平 | 解析Vibrio natriegens固氮酶的调控机制,为利用廉价氮源生产铵提供理论基础 | Vibrio natriegens的固氮酶调控蛋白及其调控网络 | 合成生物学 | NA | 功能基因组学, 靶向突变, 报告基因实验 | NA | NA | NA | NA | Vibrio natriegens | NA | 工业生物技术 |
| 16 | 2026-09-27 |
Designing gene expression with MPRA and AI: A new paradigm for synthetic and therapeutic regulation
2026-Sep-22, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.109049
PMID:42772476
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综述 | 本文综述了条形码MPRA技术与深度学习模型相结合用于cis调控元件理性设计与基因表达调控的新范式 | 将条形码MPRA技术与AI驱动建模框架融合,实现数据高效且跨情境可泛化的CRE设计与预测 | 存在当前技术和概念上的局限,尚未完全实现安全、可编程且临床相关的调控控制系统 | 综合MPRA平台与AI建模在CRE理性工程中的最新进展,展望下一代cis调控工程与基因治疗路线图 | cis调控元件、合成调控元件、基因表达调控系统 | 机器学习 | NA | MPRA、深度学习建模、条形码技术 | 深度学习模型 | 序列数据 | NA | NA | 微生物、哺乳动物细胞 | cis调控元件、合成调控元件 | 医学、工业生物技术 |
| 17 | 2026-09-27 |
Next-generation fermented foods from non-conventional proteins: Linking fermentation dynamics, flavor chemistry, and gut microbiome modulation
2026-Sep-19, International journal of food microbiology
IF:5.0Q1
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综述 | 该综述定义了下一代发酵食品(NGFFs),即通过理性发酵非常规蛋白质底物,实现优异感官、营养和肠道健康效果,并系统阐述了发酵动态、风味化学与肠道微生物调节之间的级联关系 | 提出下一代发酵食品(NGFFs)的明确定义,构建了过程-属性-健康(PPH)关联框架以理性设计NGFF,并探讨人工智能、合成生物学和生命周期评估加速其转化应用 | 人类证据仍然有限,存在持续的知识空白、文献中未解决的矛盾以及方法论局限性,当前理解多基于描述性案例研究而非预测性机制设计 | 系统综合受控发酵对非常规蛋白质底物的级联效应,连接发酵动态与风味化学及肠道微生物调节,提出NGFF的理性设计框架并指明优先研究方向 | 非常规蛋白质来源,包括昆虫、微藻、单细胞生物和新型植物 | 食品科学 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 食品,医学 |
| 18 | 2026-09-27 |
Probiotics and Extracellular Vesicles as Redox Modulators in Wound Healing: From Microbial Therapeutics to Engineered Nanotherapeutic Strategies
2026-Sep-15, Antioxidants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/antiox15091172
PMID:42792211
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综述 | 本文综述了益生菌及其细胞外囊泡作为氧化还原调节剂在伤口愈合中的作用,从微生物治疗到工程化纳米治疗策略 | 系统整合了益生菌来源EVs在伤口愈合中调控氧化还原的机制证据,并提出工程化益生菌EVs作为可编程氧化还原纳米治疗平台的新概念,强调其相较传统抗氧化剂和哺乳动物EV系统的优势(无细胞、微生物组兼容、易于工程化) | 多数机制关联来自通路标志物或间接实验,缺乏直接机制验证;益生菌来源EVs用于伤口愈合的证据主要处于临床前阶段,缺乏直接临床证据;EV标准化、生物安全性、生物分布、药代动力学及临床验证等关键问题尚未解决 | 综合评估益生菌、细胞外囊泡及益生菌来源工程化EVs在伤口愈合中作为氧化还原调节剂的治疗潜力,探索从微生物治疗向工程化纳米治疗策略的转化路径 | 益生菌、益生菌来源细胞外囊泡、工程化益生菌EVs、慢性伤口 | 再生医学、纳米医学 | 慢性伤口 | 结构化文献检索与证据筛选、合成生物学、货物装载、生物材料辅助递送系统、ROS响应平台 | NA | 文本 | NA | NA | 益生菌 | NA | 医学 |
| 19 | 2026-09-27 |
Biobased Compounds and the Circular Economy: A Bibliometric Review of Waste Valorization and Environmental Sustainability
2026-Sep-15, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules31183262
PMID:42796550
|
综述 | 通过文献计量学与系统综述方法,绘制了生物基化合物与循环经济研究的知识结构图谱,识别了研究空白与优先领域 | 综合运用文献计量学与系统综述方法,首次系统识别了生物基化合物与循环经济领域的十大转型研究空白,并构建了研究优先级指数 | 理论基础薄弱及研究持续时间有限,机械性能与可再加工性面临额外的跨学科复杂性 | 绘制生物基化合物与循环经济研究的知识结构,识别研究优先领域与工业可扩展性差距 | 2010年至2026年发表的生物基化合物与循环经济相关同行评审文献 | 机器学习 | NA | 文献计量分析、系统综述、关键词共现网络分析、合著网络分析 | NA | 文本 | 1306篇同行评审文献(检索自Scopus,初始检索1350篇,经PRISMA筛选后纳入1306篇) | NA | NA | NA | 环境, 材料, 工业生物技术 |
| 20 | 2026-09-27 |
Fungal Biotechnology for Sustainable Biocomposites: From Mycelium Growth to Material Translation
2026-Sep-15, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules31183272
PMID:42796559
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综述 | 系统评述真菌生物技术驱动的菌丝体基生物复合材料,涵盖真菌生物合成、底物转化、加工策略与材料性能之间的关系 | 从真菌生物合成到材料转化的全链条视角整合了合成生物学、先进材料化学与数字化生物制造,强调加工驱动的材料优化与多功能菌丝体基生物复合材料的可规模化设计 | 作为综述文章,未提供原始实验数据,对具体工艺参数、规模化生产的经济性与技术瓶颈缺乏定量分析 | 评估菌丝体基生物复合材料的研究进展,阐明真菌生物合成、底物转化、加工策略与材料性能之间的关系,并探讨未来发展方向 | 菌丝体基生物复合材料(MBCs),包括真菌菌丝、几丁质、壳聚糖、β-葡聚糖及聚合物底物 | 材料科学 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | 真菌 | NA | 材料, 环境, 包装, 建筑 |