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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-07-06 |
Advancing synthetic biology with engineered chemically inducible gene regulatory systems
2026-Jul-02, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108963
PMID:42392239
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综述 | 系统梳理了化学诱导基因调控系统的最新进展,重点介绍以启动子为中心的工程设计及其在合成生物学中的核心作用 | 提出五种核心设计原则(正交性、可逆响应、剂量依赖、模块兼容性和序列依赖的结构调控),并重点介绍AI驱动的启动子预测、G-四链体等新型DNA开关以及工程化受体通路等新兴策略 | 存在诱导剂渗透性、交叉反应和可扩展性等挑战 | 综述工程化化学诱导基因调控系统的最新进展,推动合成生物学发展 | 化学诱导基因调控系统中的工程化启动子及相关调控元件 | 合成生物学 | NA | AI驱动启动子预测、高通量筛选、启动子重塑、转录因子工程、G-四链体系统 | NA | NA | NA | NA | NA | 代谢途径优化、精准基因治疗、生物传感器、可编程合成电路 | 生物制造、治疗学、智能细胞系统 |
| 2 | 2026-07-06 |
Flaxseed gum-reinforced sodium alginate semi-interpenetrating polymer network W1/O/W2 emulgels for targeted co-delivery of prebiotics and engineered "living factory": a novel next-generation synbiotic system for anoxia-triggered synergistic inulin metabolism
2026-Jun-24, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.153201
PMID:42342179
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研究论文 | 通过将合成生物学与生物大分子组装技术结合,开发了一种新型工程化合生元递送平台,实现低聚果糖与工程菌的靶向共递送 | 首次将半互穿聚合物网络结构与合成生物学工程菌相结合,构建了具有缺氧触发协同代谢功能的新型合生元系统,实现了不依赖宿主微生物群异质性的精准菌群调控 | 目前仅在体外验证了肠道环境响应性释放和酶解效果,尚缺乏体内动物实验数据支持其实际疗效 | 开发一种新型工程化合生元系统,实现低聚果糖与工程菌的靶向共递送和缺氧响应的协同代谢 | 工程化大肠杆菌Nissle 1917、亚麻籽胶增强海藻酸钠水凝胶、W1/O/W2多重乳液凝胶 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、乳液凝胶制备、半互穿聚合物网络组装 | NA | 实验数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌Nissle 1917 | 缺氧响应性菊粉酶分泌回路 | 医药 |
| 3 | 2026-07-06 |
Riboregulation in bacteria: From simple switches to complex regulatory networks
2026-06-07, Postepy biochemii
DOI:10.18388/tkbrr231
PMID:42400427
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综述 | 本文综述了细菌中核糖调控从简单开关到复杂调控网络的作用机制和应用 | 系统总结了核糖调控的多层网络特性,包括sRNA结合蛋白和RNA海绵的调控作用,并强调了Hfq-CLASH等现代方法在体内识别这些相互作用的应用 | 未提供具体实验数据或定量分析来支持所述机制 | 阐述细菌核糖调控在适应性中的关键作用及其在合成生物学和抗抗生素耐药性中的应用 | 细菌的核糖调控元件,包括核糖开关、温度传感器、反义RNA和sRNA网络 | 合成生物学 | NA | Hfq-CLASH | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 核糖调控网络,包括开关、传感器和调控回路 | 合成生物学, 医学 |
| 4 | 2026-07-06 |
Beyond the Sequence: Chemical and Topological Design and Innovations in mRNA Therapeutics
2026-Apr-08, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.5c00347
PMID:41875901
|
综述 | 综述了mRNA化学和拓扑工程的最新进展,涵盖酶促、化学和混合方法扩展修饰库、线性/环状/分支mRNA拓扑合成策略、结构-活性关系及下一代mRNA治疗应用 | 首次系统性整合mRNA的化学可编程性与拓扑工程(如环状RNA、分支结构、合成套索结构)两个维度,突破传统序列设计范式 | 部分拓扑结构(如合成套索)的体内稳定性与免疫原性数据尚不充分,大规模临床应用仍需验证 | 系统阐述化学与拓扑工程如何调控mRNA稳定性、免疫原性和翻译效率,推动下一代mRNA疗法发展 | 信使RNA(mRNA)分子及其化学修饰与拓扑结构 | 数字生物学, 合成生物学 | 传染病, 肿瘤, 遗传病 | 化学合成, 酶促修饰, 拓扑工程 | NA | NA | NA | NA | NA | 环状RNA, 分支mRNA, 合成套索结构 | 医学 |
| 5 | 2026-07-06 |
Ultrasound-Responsive Engineered Bacteria for Targeted Cancer Therapy: Strategies, Mechanisms, and Applications
2026-Apr, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202523952
PMID:41764403
|
综述 | 本文综述了超声响应工程菌在靶向癌症治疗中的策略、机制及应用 | 首次系统整合超声与工程菌联合应用的交互机制,提出超声调控生物活性分子和智能药物递送系统的新方向 | 该综述主要总结当前研究进展,未包含具体实验数据或临床验证案例 | 全面理解工程菌修饰方法、作用机制及其与超声联合应用的交互机制,为开发超声响应智能治疗系统提供理论基础 | 工程菌与超声联合应用于肿瘤治疗的研究进展 | 合成生物学 | 肿瘤 | NA | NA | NA | NA | NA | 细菌 | NA | 医学 |
| 6 | 2026-07-06 |
Data storage and retrieval with unnatural proteins expressed via E. coli
2026-Feb-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70061-7
PMID:41764153
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研究论文 | 通过大肠杆菌表达的人工随机序列蛋白质实现数据存储与检索 | 将数字数据编码为氨基酸序列并整合到类胶原蛋白模板中,利用大肠杆菌表达实现数据存储;通过胰蛋白酶消化结合LC-MS/MS分析实现完整数据恢复,并展示蛋白质比DNA更高的稳定性以及利用亲和标签实现随机访问和加密数据保护 | 文中未明确提及局限性 | 建立基于蛋白质的数据存储框架,实现高效、稳定的数据存储与检索 | 人工随机序列蛋白质、类胶原蛋白模板、大肠杆菌表达系统 | 合成生物学 | NA | LC-MS/MS | NA | 氨基酸序列、数字数据 | NA | NA | 大肠杆菌 | NA | 数据存储、合成生物学、蛋白质工程 |
| 7 | 2026-07-06 |
Characterization of a consensus-designed trans-cinnamic acid decarboxylase for styrene biosynthesis
2025-06-11, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.00714-25
PMID:40407334
|
研究论文 | 表征一种共识设计的反式肉桂酸脱羧酶,用于苯乙烯的生物合成 | 首次通过真菌阿魏酸脱羧酶的多重序列比对的共识蛋白设计,获得一种高效的反式肉桂酸脱羧酶PSC1,并解析了其高分辨率的晶体结构(2.1 Å),揭示了关键催化残基 | 苯乙烯对微生物的毒性仍然是一个挑战,且该酶的工业应用还需进一步优化 | 实现从L-苯丙氨酸两步法生物合成苯乙烯,并表征关键酶PSC1的物理化学性质和三维结构 | 共识设计的反式肉桂酸脱羧酶PSC1,以及溶剂耐受菌株DOT-T1E | 合成生物学 | NA | NA | NA | 结构数据(蛋白质晶体结构) | NA | NA | DOT-T1E(溶剂耐受菌株) | 两步法苯乙烯生物合成途径:L-苯丙氨酸→肉桂酸→苯乙烯 | 工业生物技术 |
| 8 | 2026-07-05 |
The critical patch size problem on networks
2026-Sep, Mathematical biosciences
IF:1.9Q3
DOI:10.1016/j.mbs.2026.109749
PMID:42320745
|
研究论文 | 研究网络环境中人口持续存活的临界斑块大小问题 | 首次在图论框架内系统研究临界斑块大小,推导出随机网络中保证种群持久生存的谱图参数界限 | 分析依赖于线性化算子特征值条件,可能未完全捕捉非线性动态行为的复杂性 | 探讨强异质介质(网络)中种群动态的临界斑块大小及其影响因素 | 离散晶格、多连接晶格及随机网络上的种群动态 | 网络科学 | NA | NA | 图拉普拉斯算子 | 网络结构数据 | NA | NA | NA | NA | 生态网络、合成生物学、脑连接组神经退行性疾病传播建模 |
| 9 | 2026-07-05 |
S-layers as natural building blocks for nanobiotechnology and synthetic biology
2026-Jul-03, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2026.102787
PMID:42398461
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综述 | 综述S层蛋白作为纳米生物技术和合成生物学天然构建模块的架构、组装和功能化 | 将S层蛋白定位为兼具纳米精度、可编程性和遗传可设计性的统一平台,连接自下而上材料设计与生物复杂性 | 规模化生产、稳定性和系统集成方面的当前局限性,以及宿主-微生物相互作用中的未充分认识作用 | 克服当前限制,释放S层蛋白作为遗传可编程生物灵感界面的全部潜力 | 细菌和古菌的S层蛋白晶格 | 合成生物学 | NA | 自组装蛋白晶格、遗传工程融合蛋白 | NA | NA | NA | NA | 细菌和古菌 | 可编程二维生物材料界面,包括分子筛选、生物传感器、生物矿化和纳米图案化 | 纳米生物技术、合成生物学、医学、环境 |
| 10 | 2026-07-05 |
Phytomicrobiome-based approaches for sustainable crop performance and environmental resilience
2026-Jun-30, Microbiological research
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.micres.2026.128605
PMID:42398311
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综述 | 本文综述了基于植物微生物组的方法,用于提升作物可持续生产力和环境恢复力,重点关注先进工具如基因组编辑、合成生物学、宏基因组学和AI驱动模型在优化植物-微生物互作中的应用 | 系统性总结了现代工具(合成生物学、AI模型、宏基因组学)在植物微生物组工程中的应用,提出针对特定作物和环境条件设计人工微生物群落的新范式 | 未涉及具体实验案例验证或量化分析,缺乏对工程化微生物群落实地应用的长期效果评估 | 优化植物-微生物互作以促进可持续农业和生态系统修复 | 植物微生物组(包括细菌、真菌、原生生物、病毒、线虫)及其与植物的共进化关系 | 机器学习和人工智能、分子生物学 | NA | 宏基因组学、基因组编辑、合成生物学 | AI驱动模型 | 宏基因组数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 植物(未具体指定) | 人工微生物群落 | 农业, 环境 |
| 11 | 2026-07-05 |
To Biotic or Abiotic: Biohybrid Systems for Artificial Photosynthesis
2026-Jun-29, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.5c00963
PMID:42371621
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综述 | 本文综述了人工光合作用中生物-非生物杂化系统的进展,旨在利用天然光合蛋白、无机光催化剂和先进杂化材料实现光诱导能量或燃料生成 | 通过整合合成生物学、计算和可视化技术及高分辨率表征手段,深入理解界面电子转移过程并优化设计架构,为超越自然光合系统提供新途径 | 当前仍面临实际应用中的挑战,如系统稳定性、效率提升及规模化生产等 | 综述人工光合作用与生物-非生物杂化系统的最新进展,推动未来杂化设计及实际应用开发 | 天然光合蛋白、无机光催化剂、先进生物杂化材料 | 机器学习 | NA | 高分辨率表征 | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | 人工光合作用系统、光诱导能量或燃料生成系统 | 可再生能源 |
| 12 | 2026-07-05 |
Metabolic Engineering of Microbial Cell Factories for Sustainable Production of Glycolic Acid: Pathways, Chassis, and Strategies toward Poly(glycolic acid) Bioplastics
2026-Jun-24, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00078
PMID:42340804
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综述 | 系统总结微生物细胞工厂可持续生产乙醇酸的代谢工程进展,涵盖生物合成途径、底盘细胞和策略,以推动聚乙醇酸生物塑料发展 | 首次全面整合新兴生物合成途径(如C5-糖裂解途径)、动态调控策略及工业放大技术(如膜分离和原位产物去除),并强调系统代谢工程与AI辅助设计的结合 | 多数途径的理论碳转化效率与实际产量仍有差距,工业放大中过程经济性和底盘细胞鲁棒性尚需优化 | 推动乙醇酸微生物合成的可持续生产,支持聚乙醇酸生物塑料的工业化应用和循环生物经济 | 乙醇酸生物合成途径(乙醛酸支路、C5-糖裂解途径等)、多种微生物底盘细胞、底物利用策略 | 代谢工程与合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学、酶优化、辅因子平衡、动态调控、原位产物去除、生命周期评估 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌、酿酒酵母、枯草芽孢杆菌 | 乙醛酸支路、C5-糖裂解途径、生物传感器动态调控回路 | 工业生物技术、环境、材料 |
| 13 | 2026-07-05 |
SARGE: Serine Integrase-Assisted Rapid Genome Integration through Cassette Exchange in Escherichia coli
2026-Jun-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00334
PMID:42319839
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研究论文 | 报告了SARGE,一种丝氨酸整合酶辅助的快速基因组整合平台,通过盒式交换实现大DNA片段的迭代整合 | 结合正交丝氨酸整合酶PhiC31和Bxb1与理性供体质粒设计,无需抗性标记切除即可实现快速可编程整合,并采用双荧光报告系统和裸眼筛选策略,实现100%准确率 | 目前仅在大肠杆菌中验证,对其他微生物宿主的适用性未充分探讨 | 开发一种高效、易扩展的迭代基因组整合平台,简化基因组工程流程 | 大肠杆菌基因组中的盒式交换 | 合成生物学 | NA | 丝氨酸整合酶介导的盒式交换 | NA | NA | NA | PhiC31整合酶, Bxb1整合酶, 双荧光报告系统 | 大肠杆菌 | 盒式交换系统,结合双荧光报告系统(sfGFP和mKate)用于筛选 | 合成生物学 |
| 14 | 2026-07-05 |
Tardigrade-Derived Strategy for Low-Cost Storage of Cell-Free Expression Lysates
2026-Jun-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00281
PMID:42319881
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研究论文 | 本研究利用水熊虫来源的CAHS蛋白实现无细胞表达系统的低成本干燥保存 | 首次将水熊虫来源的胞质丰富热溶性蛋白用于无细胞表达系统的保护,无需任何添加剂即可在低成本室温干燥条件下保持蛋白质合成活性 | 未详细评估不同干燥条件或长期储存稳定性,也未比较其他保护添加剂的优劣 | 开发一种低成本的室温干燥保存无细胞表达系统的方法 | 水熊虫来源的胞质丰富热溶性蛋白 | 合成生物学 | NA | 无细胞表达系统 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物技术, 点对点应用 |
| 15 | 2026-07-05 |
Spatial Control of CAR T Cell Activation Using Tumor-Homing Polymers
2025-02-12, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.4c15442
PMID:39902740
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研究论文 | 提出一种利用肿瘤归巢聚合物实现CAR-T细胞空间激活控制的新框架IMPACT | 首次结合合成生物学与生物材料方法,通过聚合物介导的解剖学控制实现IF-THEN门控CAR-T细胞的靶向激活 | 仅在小鼠肿瘤模型中进行了初步验证,未涉及人体临床试验 | 开发一种通过聚合物介导的肿瘤定位策略,以提高CAR-T细胞治疗的特异性并减少脱靶毒性 | CAR-T细胞及肿瘤归巢聚合物 | 合成生物学, 生物材料 | 肿瘤 | 合成生物学, 生物材料工程 | NA | 动物实验数据 | 小鼠肿瘤模型中的实验样本 | NA | 小鼠 | IF-THEN门控CAR-T细胞电路,通过荧光素标记聚合物触发条件性蛋白表达 | 医学 |
| 16 | 2026-07-05 |
YF17D-based vaccines - standing on the shoulders of a giant
2024-05, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202250133
PMID:38571392
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综述 | 综述基于YF17D的黄热病疫苗平台的研究进展及其在预防和治疗多种疾病中的应用 | 系统总结了YF17D作为疫苗平台的独特免疫原性机制,并展示了其在开发新型重组活疫苗(包括已获批的日本脑炎和登革热疫苗)以及针对新兴病毒感染、寄生虫病、慢性感染和癌症的临床前候选疫苗中的广泛应用 | 历史安全担忧和制造挑战仍需克服,且YF17D疫苗的广泛使用仍需进一步研究 | 综述YF17D作为疫苗平台的最新见解,并探讨其在满足未满足的医疗需求和应对大流行准备中的作用 | 基于YF17D的疫苗及其在预防和治疗疾病中的应用 | NA | 黄热病、日本脑炎、登革热、拉沙热、寨卡病毒病、COVID-19、疟疾、HIV、慢性肝炎、癌症 | 分子病毒学、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 17 | 2026-07-05 |
Designing synthetic RNA for delivery by nanoparticles
2017-Mar-29, Journal of physics. Condensed matter : an Institute of Physics journal
DOI:10.1088/1361-648X/aa5561
PMID:28004640
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综述 | 本文综述了用于纳米颗粒递送的合成RNA设计,涵盖RNA纳米颗粒的类型、结构分析与建模、功能化以及细胞应用 | 系统整合了RNA纳米颗粒从设计、建模、合成到功能化和细胞应用的完整路径,并强调RNA递送后的细胞内加工过程 | 未报道具体实验验证,仅基于现有研究进行综述 | 概述用于纳米颗粒递送的合成RNA设计方法及其在基因表达调控和潜在治疗中的应用 | RNA纳米颗粒及核酸纳米结构 | 合成生物学 | NA | RNA纳米技术、结构预测工具 | NA | 综述文献 | NA | NA | NA | RNA纳米颗粒,用于基因表达调控的纳米结构 | 医学 |
| 18 | 2026-07-04 |
Deploying Artificial Metalloenzymes in Complex Environments: Strategies and Applications
2026-Jul-14, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.70446
PMID:42390013
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综述 | 本文综述了人工金属酶在复杂环境(细胞裂解液、全细胞催化剂和活体动物)中部署的策略与应用,重点讨论了其设计原则、瓶颈和机遇 | 系统总结了人工金属酶在三种复杂生物环境(细胞裂解液、全细胞催化剂和活体动物)中的稳定化策略和适应方法,突出了其作为鲁棒工具的设计突破 | 人工金属酶在复杂环境中的组装困难、金属辅因子不稳定及细胞组分干扰仍是主要挑战 | 推动人工金属酶在合成生物学、化学生物学和生物医学等领域的实际应用 | 人工金属酶 (ArMs) | 合成生物学, 化学生物学 | NA | 金属蛋白工程, 辅因子修饰 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 化学生物学, 生物医学 |
| 19 | 2026-07-04 |
Improving cell-free metabolism through direct integration of artificial respiratory chains
2026-Jul-07, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2613483123
PMID:42391401
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研究论文 | 通过直接整合人工呼吸链来改善无细胞代谢 | 开发并定制人工呼吸链以维持CO固定16酶催化循环中的快速电子转移,同时利用电子流合成ATP,并展示人工呼吸链可多样化接受多个电子入口并耦合其他生物功能 | 自维持/自能量人工类生命系统构建中整合能量守恒机制的挑战 | 构建自维持/自能量的人工类生命系统 | 无细胞代谢网络和人工呼吸链 | 合成生物学 | NA | 无细胞代谢、人工呼吸链构建 | NA | NA | NA | NA | NA | 人工呼吸链、CO固定16酶催化循环(crotonyl-CoA/ethylmalonyl-CoA/hydroxybutyryl-CoA) | NA |
| 20 | 2026-07-04 |
Living sensors: Engineering plants to sense and report on their environments
2026-Jul-02, Current opinion in plant biology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.pbi.2026.102923
PMID:42391913
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综述 | 总结利用合成生物学设计工程化植物作为环境监测活体传感器的研究进展 | 整合三种主要策略:天然启动子系统、蛋白基因编码生物传感器、植物-微生物跨界信号网络,并结合光学报告系统实现远程监测 | NA | 综述工程化植物作为环境监测活体传感器的最新进展 | 工程化植物(植物传感器、哨兵植物) | 合成生物学 | NA | NA | NA | 图像 | NA | NA | 植物, 微生物 | 基于天然启动子的感知-响应模块、基于蛋白质的生物传感器、植物-微生物跨界信号网络 | 环境监控, 土地管理 |