合成生物学相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 工程工具 宿主生物 回路设计 应用领域
1 2026-11-04
Development of a high-throughput proteome sample preparation workflow based on efficient protein extraction to empower rational design of yeast cell factories
2027-Mar-01, Talanta IF:5.6Q1
研究论文 本文开发了一种基于离子液体、盐酸胍和乙酸锂组合加热处理(IGL-H)的高效酵母蛋白提取方法,并结合磁固相烷基化(mSPA)材料实现高通量蛋白质组样品制备,用于酵母细胞工厂的理性设计 提出IGL-H溶剂组合加热提取策略,实现快速、高蛋白产量和更广蛋白质组覆盖的酵母蛋白提取,且可兼容液体处理工作站进行高通量样品制备,总时间少于1.5小时,Pearson相关系数超过0.97 摘要中未明确说明该方法的局限性 解决酵母细胞壁结构坚固和菌株文库规模快速扩大带来的高效蛋白提取和高通量蛋白质组分析难题,以支持酵母细胞工厂的理性设计 酵母细胞(包括不同生长阶段和不同物种的酵母,以及产朊假丝酵母Candida utilis) 合成生物学,蛋白质组学 NA 质谱蛋白质组学,磁固相烷基化(mSPA) NA 蛋白质组数据 NA NA 酵母(包括产朊假丝酵母Candida utilis) NA 工业生物技术,医学,能源
2 2026-11-04
Engineering CAR-T cell therapies for digestive tract cancer: advances, challenges, and strategies to overcome tumor heterogeneity and immunosuppressive barriers
2026-Dec, Neoplasia (New York, N.Y.)
综述 系统总结CAR-T细胞疗法在消化道肿瘤中面临的抗原异质性、免疫抑制微环境等瓶颈及应对策略 采用挑战-解决方案范式,整合前沿临床数据,提出未来转化开发的系统性优化路线图 抗原丢失、生产可扩展性和临床反应不一致等未解决问题仍需依赖γδT平台、合成生物学和通用CAR设计来攻克 综述CAR-T细胞疗法在消化道肿瘤中的进展、挑战及克服肿瘤异质性和免疫抑制屏障的策略 消化道肿瘤(胃癌、结直肠癌、食管癌)及CAR-T细胞疗法 肿瘤免疫治疗 消化道肿瘤 CAR-T细胞疗法 NA 文本 NA NA NA 双靶点CAR、细胞因子表达构建体、逻辑门控受体 医学
3 2026-11-04
Harnessing yeast biodiversity to identify superior chassis strains for metabolic engineering and precision fermentation
2026-Nov-03, FEMS yeast research IF:2.4Q3
综述 本文综述了如何利用酵母生物多样性筛选和选择用于代谢工程和精密发酵的优良底盘菌株,重点关注八种酵母的基因组、代谢调控、底物利用和胁迫耐受性差异 提出将底盘身份视为设计变量,并将底盘选择纳入设计-构建-测试-学习循环,倡导从经验性菌株筛选转向基于多组学、表型分析、代谢建模和机器学习的多样性驱动预测性底盘选择 作为综述文章,未提供新的实验数据,未对提出的预测性底盘选择框架进行实验验证 探讨酵母物种内和物种间的多样性如何影响底盘性能,并讨论从经验筛选向预测性底盘选择的转变 八种酵母物种:酿酒酵母、解脂耶氏酵母、马克斯克鲁维酵母、Komagataella phaffii、Ogataea polymorpha、Rhodotorula toruloides、Lipomyces starkeyi 和 Pichia kudriavzevii 合成生物学, 代谢工程 NA 多组学, 表型分析, 代谢建模, 机器学习 机器学习模型, 代谢模型 多组学数据, 表型数据 NA NA 酿酒酵母, 解脂耶氏酵母, 马克斯克鲁维酵母, Komagataella phaffii, Ogataea polymorpha, Rhodotorula toruloides, Lipomyces starkeyi, Pichia kudriavzevii 代谢途径 医药, 能源, 工业生物技术, 材料
4 2026-11-04
Artificial photosynthetic cells: bridging chemical energization with biological functionalization
2026-Nov-02, Chemical Society reviews IF:40.4Q1
综述 系统阐述人工光合细胞的理性设计原则与涌现功能,从仿生视角总结构建模块、组装范式及功能应用 从仿生视角系统整合人工光合细胞的构建模块(细胞模拟底盘、光捕获引擎、多级催化网络、界面工程)与三大组装范式(半人工生物杂合系统、自下而上重构合成系统、全非生物光合模拟物),并前瞻性提出细胞间通讯、运动性和区室分裂等原始生命特征 作为综述文章,未提供原始实验数据;指出该领域仍存在关键技术瓶颈与常见陷阱,尚未实现真正集成化的人工光合细胞平台 阐明人工光合细胞的合理设计原则与涌现功能图景,为合成生物学、功能材料化学与系统生物工程的深度融合提供方向 人工光合细胞(在细胞/细胞模拟区室中重现光合功能的仿生系统) 合成生物学 NA NA NA 文本 NA NA NA NA 医学, 能源, 工业生物技术
5 2026-11-04
Cyclotides from Clitoria ternatea: Genomic Organization, Biosynthesis, and Roles in Plant Defense
2026-Nov-02, Planta medica IF:2.1Q2
综述 本文综述了蝶豆中环肽的基因组组织、生物合成机制及其在植物防御中的功能,并探讨了其合成生物学应用潜力 揭示了蝶豆将环肽结构域整合到白蛋白-1基因中(替代β链结构域)的独特进化机制,区别于其他携带独立环肽基因的植物家族,并系统整合了基因组、转录组和功能研究 作为综述文章,未提供新的实验数据;对环肽调控网络和防御动态机制的理解仍不完整,空间单细胞分析等多组学整合研究尚待开展 综合阐述蝶豆环肽的生物合成、基因组组织及其生物技术应用潜力 蝶豆(Clitoria ternatea)及其产生的环肽(cyclotides) 植物基因组学、天然产物生物合成、合成生物学 NA 基因组学、转录组学、多组学、空间单细胞分析 NA 文本(基因组与转录组数据综述) NA NA 蝶豆(Clitoria ternatea) NA 医学、农业
6 2026-11-04
Research progress in the production, purification, and applications of long single-stranded DNA
2026-Nov-02, Biotechnology advances IF:12.1Q1
综述 系统总结长单链DNA的生产、制备、纯化策略及其在DNA折纸和基因治疗中的应用,并展望未来发展趋势 系统梳理了长ssDNA从生产、制备到纯化的全流程技术瓶颈,将CRISPR-Cas辅助方法定位为合成后处理工具并单独讨论,同时提出模板非依赖性酶促从头合成、自动化DNA制造、合成生物学生产系统和AI辅助序列优化等未来发展方向 作为综述文章未提供原始实验数据验证;对各类生产与纯化策略仅作比较性讨论,缺乏定量性能基准;对AI辅助序列优化等新兴方向仅作展望而未深入评估其可行性 总结长单链DNA生产、制备与纯化领域的研究进展,比较不同策略的特点与局限,并展望未来发展方向 长单链DNA(long ssDNA)及其生产、制备与纯化技术 合成生物学 NA 噬菌体-大肠杆菌生物学生产、模板依赖性酶促扩增、病毒载体介导的ssDNA基因组生成、CRISPR-Cas辅助处理、酶促链转换、纯化技术 NA 文本 NA CRISPR-Cas 大肠杆菌, 噬菌体 NA 医学, 材料
7 2026-11-04
Transposons as Tools for Future Genome Engineering in Yeasts and Filamentous Fungi
2026-Nov, Yeast (Chichester, England)
综述 总结基于转座子的基因组工程工具在酵母和丝状真菌中的开发与应用前景 系统整合真菌ITR DNA转座子、LTR及非LTR逆转录转座子工具,并强调CASTs在大片段基因定点整合中绕过低同源重组效率限制的潜力 转座子工具在酵母和丝状真菌中仍未被充分探索,CASTs等工具的实际应用尚待验证 梳理并展望基于转座子的基因组工程工具在酵母和丝状真菌中的应用 酵母和丝状真菌 合成生物学 NA 转座子系统,CRISPR-associated transposons NA 文本 NA CRISPR-Cas 酵母,丝状真菌 NA 工业生物技术,医学
8 2026-11-04
Bacteriophage P22 Virus-Like Particles as Nanoscale Protein Scaffolds for Plant Synthetic Biology
2026-Nov, Plant biotechnology journal IF:10.1Q1
研究论文 探索噬菌体P22病毒样颗粒作为植物合成生物学纳米级蛋白质支架,首次在本氏烟草中实现组装并展示货物封装与外部蛋白展示 首次在真核植物系统中表达并组装P22 VLPs,并证明其可定向封装重组货物蛋白、共封装多种蛋白、通过直接融合实现封装,以及利用SpyTag/SpyCatcher实现体内货物封装与外部蛋白展示的同步编程 仅在本氏烟草中通过瞬时表达验证,未涉及稳定转基因植物,未评估大规模生产可行性或体内应用性能 开发适用于植物合成生物学的病毒样颗粒蛋白质支架工具 肠道噬菌体P22病毒样颗粒及重组货物蛋白 合成生物学 NA 瞬时表达、SpyTag/SpyCatcher蛋白偶联 NA NA NA SpyTag/SpyCatcher 本氏烟草 基于P22 VLP的蛋白质支架与货物封装系统 医学, 工业生物技术
9 2026-11-04
Engineering Methylobacterium as a C1 biomanufacturing platform: Metabolic architecture, regulatory networks, and synthetic biology strategies
2026-Oct-29, Biotechnology advances IF:12.1Q1
综述 本文系统综述了甲基杆菌作为C1生物制造平台的代谢架构、调控网络及合成生物学策略,涵盖甲醇氧化、甲醛缓冲、丝氨酸循环与EMC途径的耦合,以及高值化学品生产和菌株工程优化 提出了产物-底盘匹配框架,系统评估甲基杆菌底盘优劣及工程瓶颈,并整合全球转录调控、代谢阀门控制和光-甲基营养配置等先进工程策略 当前在滴度、产率和规模化方面仍存在局限,调控控制、通量协调和鲁棒性增强等方面有待突破 总结甲基杆菌从甲基营养模式生物向可编程C1合成生物学底盘转变的研究进展,并展望未来发展方向 甲基杆菌属(Methylobacterium)及其代谢网络与调控系统 合成生物学 NA NA NA 文本 NA NA 甲基杆菌 NA 医学, 农业, 工业生物技术, 食品, 材料
10 2026-11-04
Organoids and organs-on-a-chip as new approach methodologies at the convergence of cell biology and bioengineering
2026-Oct-28, Cell stem cell IF:19.8Q1
综述 该文综述了类器官和器官芯片等新方法学在细胞生物学与生物工程学交叉领域的发展,探讨其在转化医学中的应用、挑战与前景 强调细胞生物学家与生物工程师之间的跨学科对话,提出将合成生物学、多组学、机器学习和基因工程融合,使NAMs成为加速治疗发现和规模化个性化医疗的基础平台 仍存在可重复性、验证和监管接受度方面的差距与挑战 综合类器官、器官芯片及其他生物工程技术在转化医学中的进展,识别剩余差距并展望新兴机遇 类器官、器官芯片及其他生物工程化人类组织模型 细胞生物学, 生物工程学, 转化医学 NA 类器官培养, 器官芯片, 合成生物学, 多组学, 机器学习, 基因工程 NA NA NA NA 人类细胞 NA 医学, 药物开发
11 2026-11-04
Advances and emerging perspectives in arsenic bioremediation: a review study on mechanisms and innovations
2026-May-12, Environmental geochemistry and health IF:3.2Q2
综述 该综述整合金属蛋白质组学和合成生物学,连接实验室尺度微生物机制与现场尺度部署,探讨砷生物修复的机制与创新 整合金属蛋白质组学与合成生物学,提出AST生产和植物吸力技术等创新方法,并倡导循环经济方法将砷从有害污染物转化为工业回收的有价值资源 当前研究多基于受控实验室条件,从实验室到真实现场场景存在“放大差距”,需依赖2025-2026建模数据库和相关根际微生物群落研究来弥合 综述砷生物修复的机制与创新进展,为开发未来基于微生物的修复方法提供战略指导,以保护全球水资源和净化环境 砷污染环境及参与砷转化的微生物(如Alishewanella agri和Bacillus cereus) 环境生物技术 NA 金属蛋白质组学, 合成生物学 NA 文献数据 NA NA NA NA 环境, 医学, 工业生物技术
12 2026-11-04
Elucidating the regulatory role of the Shine-Dalgarno sequence in structural gene expression of the malolactic enzyme operon using a GFP/mCherry model
2026-May-08, World journal of microbiology & biotechnology IF:4.0Q2
研究论文 该文通过GFP/mCherry报告系统研究苹果酸乳酸酶操纵子中Shine-Dalgarno序列对结构基因表达的调控作用 构建了模拟天然重叠(翻译偶联)和工程化非重叠结构的平行GFP/mCherry报告系统,结合定点SD2突变、16S rRNA杂交能(ΔG)计算和mRNA二级结构最小自由能(MFE)预测,揭示了SD2在翻译偶联系统中的非线性、架构特异性调控逻辑 研究仅在E. coli和L. lactis异源宿主中进行,未在天然宿主O. oeni中验证;未涉及MLF实际发酵条件下的调控表现 阐明苹果酸乳酸酶操纵子中Shine-Dalgarno序列对结构基因表达的转录后调控机制 苹果酸乳酸酶操纵子(mleA和mleP基因)的基因间序列及SD2序列 合成生物学 NA 定点突变、GFP/mCherry双荧光报告系统、16S rRNA杂交能(ΔG)计算、mRNA二级结构最小自由能(MFE)预测 NA 荧光表达数据、计算预测数据 NA 定点突变 E. coli, L. lactis GFP/mCherry双报告基因翻译偶联系统及非偶联系统 食品, 合成生物学
13 2026-11-04
Engineering a high-efficiency expression system in Tremella fuciformis using novel promoters and optimized transformation conditions
2026-May-08, World journal of microbiology & biotechnology IF:4.0Q2
研究论文 该研究通过鉴定强效内源启动子和系统优化根癌农杆菌介导的转化方案,在银耳中建立了高效表达系统 鉴定了三个新的内源启动子(P4、P5、P7),其驱动eGFP表达效率分别比对照野生型菌株高67.8倍、11.8倍和7倍,且优于组成型gpd启动子(效率提升高达1476.74%);同时发现使用棕色氧化铝处理酵母样细胞表面损伤可促进T-DNA转移,使转化子数量增加2.25倍 未提及具体局限性 开发银耳的高效表达系统以促进其分子育种和合成生物学研究 银耳(Tremella fuciformis)的酵母样细胞 合成生物学 NA 根癌农杆菌介导转化、扫描电子显微镜观察 NA 图像、实验数据 未明确说明样本数量 根癌农杆菌介导转化 银耳 NA 医学、工业生物技术
14 2026-11-04
Parabiotics as Next-Generation Microbiome Therapeutics: Insights into Mechanisms, Evidence, and Therapeutic Potential
2026-May-02, Current microbiology IF:2.3Q3
综述 综述副益生菌(非活性微生物细胞及其组分)的作用机制、临床证据与治疗潜力 系统整合副益生菌在安全性、稳定性及制剂适用性上的优势,并结合多组学、CRISPR与合成生物学等新技术讨论其精准化与规模化生产 副益生菌在标准化和法规协调方面仍存在挑战,相关证据仍需进一步规范与统一 总结副益生菌的治疗应用、技术进展与转化潜力,强调其在精准健康和下一代功能性营养中的作用 副益生菌(非活性微生物细胞及其组分,如肽聚糖、磷壁酸、表面蛋白) 微生物组学 儿科腹泻, 肠易激综合征, 特应性皮炎, 呼吸道感染, 抗生素相关菌群失调 宏基因组学, NGS, 蛋白质组学, 代谢组学, CRISPR-Cas系统, 合成生物学 NA 文本 NA CRISPR-Cas NA NA 医学, 食品
15 2026-11-04
Plant-derived indole alkaloids in chronic inflammatory diseases: molecular mechanisms, therapeutic potential and translational challenges
2026-May, Inflammopharmacology IF:4.6Q1
综述 本文综述植物来源吲哚生物碱在慢性炎症性疾病中的化学结构、来源、分子机制、治疗潜力及转化挑战 系统整合吲哚生物碱对NF-κB、JAK/STAT、MAPK、PI3K/AKT、NLRP3炎症小体和AhR等多条炎症轴的多靶点调控机制,并强调AhR与NF-κB/STAT3通路整合及微生物群和器官选择性治疗前景 主要证据来自临床前研究,临床转化证据不足,存在合成生物学、代谢组学和合理杂交设计等转化障碍 整合植物来源吲哚生物碱的化学、来源和机制通路证据,评估其作为慢性炎症性疾病多靶点治疗骨架的潜力和转化挑战 植物来源吲哚生物碱及其在慢性炎症性疾病中的作用 药理学, 天然产物化学, 免疫学 慢性炎症性疾病, 结肠炎, 骨关节炎, 慢性阻塞性肺疾病, 动脉粥样硬化, 慢性肾脏病, 炎症驱动癌症 文献综述, 数据库检索 NA 文本 PubMed、Scopus和Google Scholar数据库截至2025年12月的相关临床前、临床和综述文献 NA NA NA 医学, 药物开发
16 2026-04-24
Synthetic biology's uncertain regulatory future in the wake of Loper Bright Enterprises v. Raimondo
2026-May, Nature biotechnology IF:33.1Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
17 2026-11-04
Decoding and exploiting intratumoral microbiota: from microenvironment modulation to clinical intervention
2026-Apr-25, Molecular biology reports IF:2.6Q3
综述 本文综述了瘤内微生物群在调节肿瘤微环境和作为临床干预靶点方面的作用 系统总结了瘤内微生物群通过多种机制塑造免疫抑制微环境并影响治疗反应,并提出了工程细菌、噬菌体疗法和细菌胞外囊泡等新型干预策略,以及整合空间多组学、合成生物学和纳米技术的精准治疗范式 仍存在重大挑战,包括瘤内微生物群的时空动态解析、与宿主细胞机制相互作用的阐明以及安全有效的临床转化 探讨瘤内微生物群作为肿瘤微环境关键组分的调控作用及其临床干预潜力 瘤内微生物群、肿瘤微环境、肿瘤细胞、免疫细胞 肿瘤微生物学、肿瘤免疫学 癌症 NA NA 文本 NA NA NA NA 医学
18 2026-11-04
Engineering strategies for the biosynthesis of rare sugars in microbial cell factories
2026-Apr-25, World journal of microbiology & biotechnology IF:4.0Q2
综述 本综述系统总结了利用微生物细胞工厂生物合成稀有糖的研究进展,包括代谢工程、酶工程、生物催化和发酵过程优化等策略。 从多层次工程策略协同整合的角度系统梳理稀有糖生物合成的最新进展,并涵盖D-阿洛酮糖、D-塔格糖、D-阿洛糖、L-核糖、L-核酮糖和L-木酮糖等多种代表性稀有糖。 作为综述文章,未提供原始实验数据;稀有糖天然丰度低、传统生产方法效率低,实现大规模工业化应用仍面临生产效率和工业可行性方面的挑战。 总结稀有糖生物合成的最新进展,探讨构建高效微生物细胞工厂的关键挑战与未来方向。 稀有糖(D-阿洛酮糖、D-塔格糖、D-阿洛糖、L-核糖、L-核酮糖、L-木酮糖)及其微生物细胞工厂 合成生物学与代谢工程 NA 代谢工程, 酶工程, 生物催化, 发酵过程优化 NA 文本 NA NA 微生物细胞工厂 稀有糖生物合成途径 食品, 医药, 健康产业
19 2026-11-04
RNA-templated diversity generation via reverse transcription and homologous recombination: an evolutionary hypothesis
2026-Apr-17, Theory in biosciences = Theorie in den Biowissenschaften
研究论文 提出一种通过逆转录和同源重组从RNA模板生成基因组多样性的进化假说 提出DGbyRT机制,即细胞或外源RNA逆转录为cDNA后经同源定向重组整合进基因组,使变异偏向转录组已有区域并可能改变序列空间探索的统计分布 仅为假说性论述,缺乏实验验证;机制细节和频率调控尚未明确 探讨基因组多样化的补充机制,连接逆转录、同源重组与进化生物学 基因组多样性、RNA转录本、逆转录酶、假基因、重复序列 进化生物学 NA 逆转录、同源定向重组 NA 文本 NA NA NA NA 医学, 工业生物技术
20 2026-11-04
PANoptosis as a drug discovery framework: integrating cell death architecture with clinical translation
2026-04, Genes and immunity IF:5.0Q2
综述 该综述整合了细胞死亡架构与临床转化,系统阐述了PANoptosis的分子机制、调控因子、药理干预策略及生物标志物,并提出了临床极性与时机模型以指导药物发现 提出“临床极性与时机模型”区分PANoptosis应被诱导(凋亡抵抗肿瘤)或抑制(细胞因子风暴、缺血再灌注损伤)的临床情境,并整合证据分级框架、新兴生物标志物组合及合成生物学手段实现组织限定性调控 作为综述文章缺乏原始实验数据验证,所述证据分级框架和临床极性与时机模型尚需前瞻性临床试验验证,生物标志物 panels 的临床实用性有待确认 将PANoptosis作为药物发现框架,整合细胞死亡架构与临床转化,为感染性、炎症性、肿瘤及神经退行性疾病的选择性调控提供治疗策略 PANoptosis通路及其组分(ZBP1、AIM2、NLRP3、Pyrin、ASC、RIPK1、FADD、caspase-1/8、RIPK3-MLKL、gasdermin),以及相关小分子抑制剂、生物制剂和核酸药物 药物发现, 转化医学, 分子药理学 脓毒症, 癌症, 神经退行性疾病, 缺血再灌注损伤, 感染性疾病, 炎症性疾病 NA NA 文本 NA 合成生物学方法 NA NA 医学, 药物发现
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