合成生物学相关文章
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当前共找到 4385 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-02-08 |
Blue food proteins-derived immunomodulatory peptides: sources, preparation, identification techniques, mechanisms, and critical challenges of commercial application
2026-Mar-01, Food research international (Ottawa, Ont.)
DOI:10.1016/j.foodres.2025.118136
PMID:41652731
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综述 | 本文系统综述了蓝色食品蛋白质来源的免疫调节肽（IMPs）的海洋来源、制备技术、鉴定方法、作用机制及商业化应用的关键挑战 | 首次系统总结了IMPs的免疫学通路（包括非特异性和特异性免疫）及关键信号级联（如NF-κB和MAPK），并批判性评估了其体内外免疫调节活性的证据 | IMPs面临胃肠道稳定性不足、长期安全性验证缺乏和工业可扩展性挑战 | 探讨蓝色食品蛋白质来源的免疫调节肽作为功能性生物活性物质在免疫营养和治疗应用中的潜力 | 蓝色食品（海洋来源）蛋白质衍生的免疫调节肽 | NA | NA | 提取、纯化、鉴定技术（如合成生物学、精准发酵、AI驱动的肽设计） | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药、食品（免疫营养） |
| 2 | 2026-02-08 |
Biotechnology meets AI: Accelerating next-generation of microbial breeding for food biomanufacturing
2026-Mar-01, Food research international (Ottawa, Ont.)
DOI:10.1016/j.foodres.2025.118152
PMID:41652737
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综述 | 本文综述了结合先进生物技术与人工智能（AI）加速下一代微生物育种以促进食品生物制造的发展 | 提出了将大气室温等离子体（ARTP）诱变、空间诱变等生物技术与新兴AI模型（如蛋白质语言模型）整合到“设计-构建-测试-学习”循环中，以实现更高效、精准和智能的微生物育种 | NA | 加速下一代微生物育种，以应对全球人口增长和环境压力，实现高效、可持续的食品生物制造 | 用于食品生物制造的微生物 | 机器学习 | NA | ARTP诱变， 空间诱变， 合成生物学 | 蛋白质语言模型 | NA | NA | NA | NA | NA | 食品， 工业生物技术 |
| 3 | 2026-02-08 |
Synthetic biology for sustainable food colourant production: Innovations and opportunities
2026-Feb-28, Food chemistry
IF:8.5Q1
DOI:10.1016/j.foodchem.2025.147749
PMID:41475255
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综述 | 本文探讨了合成生物学在可持续天然食品着色剂生产中的应用、创新与机遇 | 提出通过整合从AI辅助生物设计到系统生物学等多学科平台，并创新经济和法律机制，以加速可持续天然食品着色剂的产业化 | NA | 解决天然食品着色剂的供应限制问题，并促进其可持续生产与产业化 | 天然食品着色剂，特别是通过微生物细胞工厂和植物品种生产的产品 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、AI辅助生物设计、系统生物学、精密发酵 | NA | NA | NA | NA | 微生物细胞工厂、植物 | NA | 食品、工业生物技术 |
| 4 | 2026-02-08 |
Enhancement of Nitrogenase Activity in Recombinant Escherichia coli by Replacing Upstream Region of nif Operon from Paenibacillus Species
2026-Feb-12, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202500711
PMID:41640351
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研究论文 | 本研究通过替换Paenibacillus物种nif操纵子上游区域，增强了重组大肠杆菌的固氮酶活性 | 发现特定上游区域可作为组成型σ依赖性启动子在E. coli中发挥作用，并通过合成生物学方法结合启动子替换来提升电子转移和金属簇组装 | NA | 理解异源大规模生产固氮酶在E. coli中的限制，并提升其固氮酶活性 | 重组大肠杆菌及来自Paenibacillus物种的nif操纵子 | 合成生物学 | NA | 克隆、启动子替换、合成生物学方法 | NA | NA | 多种来自Paenibacillus物种的nif操纵子 | Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 大肠杆菌 | 固氮酶基因簇（nif操纵子）及其上游启动子区域 | 农业, 环境 |
| 5 | 2026-02-08 |
Phenazine-Based Synthetic Biology to Signal Between Cells and Electrodes
2026-Feb-07, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.70169
PMID:41653016
|
研究论文 | 本文开发了一种基于吩嗪的模块化系统，实现电子设备与工程细菌种群之间的双向氧化还原通信 | 利用吩嗪修饰调制信号接收，建立电子与生物信息处理之间的多功能桥梁，简化了生物电子系统的入门要求 | NA | 开发生物电子系统以实现电子设备与生物系统之间的无缝通信 | 工程细菌种群和电子设备 | 合成生物学 | NA | 氧化还原信号传递、电化学检测 | NA | 电化学信号、生物信号 | NA | 合成生物学框架 | 细菌 | 基于吩嗪的生物传感器和通信通道，包括电子信号编码、生物信号传输、双域信号接收和可控噪声模块 | 环境监测、适应性生物制造、响应性生物医学设备 |
| 6 | 2026-02-08 |
Revitalizing actinobacteria research: an urgent response to the antimicrobial resistance crisis
2026-Feb-05, Natural products and bioprospecting
IF:4.8Q1
DOI:10.1007/s13659-025-00587-8
PMID:41639343
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综述 | 本文通过文献计量分析揭示了抗生素发现基础研究的衰退与抗菌素耐药性危机加剧之间的失衡，并主张利用现代技术重新投资于放线菌天然产物发现 | 通过八十年文献的计量分析，首次量化揭示了放线菌研究自二十世纪中叶高峰后急剧减少，并与AMR危机加剧形成鲜明对比，提出了结合基因组学、人工智能和合成生物学进行战略性再投资的新范式 | 分析主要基于文献计量数据，未涉及具体实验验证或技术实施细节，提出的解决方案需要大量资金和行业投入才能实现 | 分析抗生素发现研究与抗菌素耐药性危机之间的失衡关系，并提出复兴抗生素研发管道的战略方向 | 放线菌（Actinomycetota）及相关抗生素发现研究文献 | NA | 抗菌素耐药性感染 | 文献计量分析、基因组学、人工智能、合成生物学 | NA | 文献数据 | 八十年（约80年）的文献数据 | NA | 放线菌（Actinomycetota） | NA | 医药 |
| 7 | 2026-02-08 |
From sequence to structure: A comprehensive review of deep learning models for RNA structure prediction
2026-Feb-05, Current opinion in structural biology
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.sbi.2025.103216
PMID:41650708
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综述 | 本文全面回顾了从传统物理方法到当前深度学习模型在RNA二级和三级结构预测中的演变 | 系统性地探讨了三种深度学习范式：基于语言模型的方法、端到端结构预测器以及几何距离预测方法，并提出了针对RNA数据稀缺和模型可解释性的未来研究方向 | RNA结构预测仍面临训练数据有限、复杂非规范相互作用和构象灵活性等独特挑战，且需要高质量结构数据集的扩展 | 回顾和评估深度学习模型在RNA结构预测领域的应用，以推动该领域的方法创新 | RNA的二级和三级结构 | 计算生物学 | NA | 深度学习 | 语言模型、端到端结构预测器、几何距离预测模型 | RNA序列和结构数据 | NA | NA | NA | NA | 基因调控、药物设计、合成生物学 |
| 8 | 2026-02-08 |
Recent advances of engineered bacteria for therapeutic applications
2026-Feb-04, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2025.11.013
PMID:41234015
|
综述 | 本文系统回顾了工程细菌在治疗应用中的最新进展，重点关注其在肿瘤治疗和代谢紊乱管理中的角色 | 通过合成生物学方法，结合计算建模和模块化基因电路设计，提升了工程细菌的时空精度、生物安全性和可扩展生产 | NA | 探讨工程细菌作为生物治疗平台在疾病干预中的发展和应用 | 工程细菌系统 | 合成生物学 | 肿瘤、代谢紊乱 | 合成生物学、基因工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 大肠杆菌、酿酒酵母、枯草芽孢杆菌、哺乳动物细胞 | 开关、振荡器、逻辑门、生物传感器、代谢途径 | 医学 |
| 9 | 2026-02-08 |
Cell-free protein synthesis in microcompartments towards cell-cell communication
2026-Feb, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103416
PMID:41411873
|
综述 | 本文综述了在微区室中利用无细胞蛋白质合成系统构建合成细胞，并实现合成细胞间通信的不同策略与进展 | 系统比较了基于微区室化与无细胞表达系统的合成细胞通信策略，重点分析了不同通信模式在渗透性、资源更新、稳定性与可扩展性之间的权衡，以及其在程序化与仿生性之间的平衡 | NA | 探讨并比较实现合成细胞间细胞通信的不同实验策略与工程方法 | 基于微区室（如微流控区室、液滴、囊泡）和无细胞蛋白质表达系统的合成细胞 | 合成生物学 | NA | 微流控技术、无细胞蛋白质表达系统 | NA | NA | NA | NA | NA | 遗传电路（用于实现通信的信号传导、处理和输出生成阶段） | 合成生物学、生物技术 |
| 10 | 2025-12-21 |
Reimagining colour with synthetic biology
2026-Feb, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.11.022
PMID:41419346
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 11 | 2026-02-08 |
Challenges and opportunities for establishing biofoundries in Latin America
2026-Feb, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103419
PMID:41421018
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perspective | 本文探讨了在拉丁美洲建立生物铸造厂（biofoundries）所面临的挑战与机遇，强调了自动化设计-构建-测试-学习（DBTL）循环对加速生物设计和创新的重要性 | 提出了一个整合多组学、合成生物学方法、可持续性评估和生物工艺放大能力的综合生物铸造厂模型框架，旨在连接生物多样性与工业创新 | NA | 分析在拉丁美洲建立生物铸造厂的基础设施、网络、可持续发展和监管协调方面的机遇与挑战 | 拉丁美洲的生物铸造厂建立倡议 | 合成生物学 | NA | 多组学（multi-omics）、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 12 | 2026-02-08 |
Advances in tailoring camelina and pennycress oilseeds for specialty metabolites
2026-Feb, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103422
PMID:41485390
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综述 | 本文综述了利用合成生物学和基因组编辑技术优化亚麻荠和荠菜油籽以生产特种代谢物的最新进展 | 通过基因组编辑重写内源脂质代谢以移除竞争途径，并结合生物勘探识别更高效酶，显著提高产品产量 | NA | 优化油籽作物作为生产下一代生物产品的多功能平台 | 亚麻荠和荠菜油籽 | 合成生物学 | NA | 基因组编辑，生物勘探 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | Camelina sativa, Thlaspi arvense | 外源途径扩展油多样性，内源脂质代谢重写 | 农业，工业生物技术 |
| 13 | 2026-02-08 |
Model acetogens as chassis for CO2-driven bioproduction
2026-Feb, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103423
PMID:41512746
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综述 | 本文综述了模型产乙酸菌在厌氧CO2转化中的核心作用，探讨其代谢能力、菌株开发及新兴生物工艺策略，以释放其在低碳生物制造中的潜力 | 强调了模型产乙酸菌作为微生物细胞工厂，通过气体发酵进行可持续生物生产的创新应用，特别是在CO2单独生物转化中的能量挑战方面 | 与合成气应用相比，CO2单独生物转化在能量上更具挑战性，需要菌株开发、生物工艺优化和可再生能源整合方面的创新解决方案 | 探索产乙酸菌作为微生物细胞工厂，通过Wood-Ljungdahl途径固定CO2，用于可持续生物生产和低碳生物制造 | 模型产乙酸菌及其代谢能力、菌株开发和生物工艺策略 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学、气体发酵 | NA | NA | NA | NA | 产乙酸菌 | Wood-Ljungdahl途径，耦合氢或一氧化碳氧化到CO2固定 | 工业生物技术、能源、环境 |
| 14 | 2026-02-08 |
Late Stage Mannan Metabolism in Cellvibrio japonicus Requires the Combined Action of a Mannosyl-Glucose Phosphorylase and a Mannobiose Epimerase
2026-Feb, Molecular microbiology
IF:2.6Q3
DOI:10.1111/mmi.70043
PMID:41525168
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研究论文 | 本研究对Cellvibrio japonicus中的甘露寡糖代谢酶——甘露糖基-葡萄糖磷酸化酶和甘露二糖差向异构酶进行了生理和生化表征 | 揭示了Mgp130A和EpiA在甘露聚糖代谢后期阶段的关键作用，并发现了一种新的质粒pJKN5用于改进互补分析，以及缺乏epiA基因菌株中半乳糖取代甘露寡糖的毒性效应 | 研究主要聚焦于C. japonicus这一特定细菌，未涉及其他生物系统或更广泛的代谢途径 | 探究细菌甘露寡糖代谢的酶学机制及其在合成生物学中的应用潜力 | Cellvibrio japonicus中的甘露糖基-葡萄糖磷酸化酶(Mgp130A)和甘露二糖差向异构酶(EpiA) | 合成生物学 | NA | 功能突变分析、生化测定、酶活性分析 | NA | 生化数据 | NA | 质粒构建 | Cellvibrio japonicus | NA | 生物技术、医药开发、可再生化学品生产 |
| 15 | 2026-02-08 |
Alkaloids and flavonoids of Solanaceae: Mechanisms of action in neurodegenerative diseases
2026-Feb, Brain research bulletin
IF:3.5Q2
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综述 | 本文系统总结了茄科植物生物碱和类黄酮的结构特征、治疗潜力及其对抗阿尔茨海默病、帕金森病和亨廷顿病等神经退行性疾病的核心作用机制 | 系统总结了茄科植物来源的多种生物碱和类黄酮对多种神经退行性疾病的治疗潜力与多靶点调控机制，并展望了合成生物学和纳米递送系统等新技术在促进其临床应用方面的潜力 | 这些天然产物在提取纯化、生物利用度、靶点选择性和临床转化方面仍面临挑战 | 探讨茄科植物生物碱和类黄酮在神经退行性疾病治疗中的作用机制与应用前景 | 茄科植物来源的生物碱（如尼古丁、阿托品、东莨菪碱）和类黄酮（如槲皮素、木犀草素、山奈酚、花青素） | NA | 神经退行性疾病 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 16 | 2026-02-08 |
Development and Application of a Cumate-Inducible Promoter, Pgc, in Komagataella pastoris
2026-Feb, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.70311
PMID:41634977
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研究论文 | 本研究在Komagataella pastoris中开发并应用了一种基于CymR/CuO系统的可诱导启动子Pgc，用于精确控制基因表达 | 通过系统优化CuO操作序列在强启动子P中的插入位点，获得了高活性变体Pgc，并构建了截短的CymR表达启动子Pt，最终建立了具有约11倍诱导能力的可诱导表达系统 | NA | 为Komagataella pastoris开发安全、经济且严格可控的可诱导启动子系统，用于代谢工程和途径工程 | Komagataella pastoris酵母 | 合成生物学 | NA | 启动子工程、基因表达调控 | NA | NA | NA | 启动子设计、基因回路构建 | Komagataella pastoris | 基于CymR/CuO系统的可诱导基因回路，包含优化的CuO操作序列和截短的CymR表达单元 | 工业生物技术 |
| 17 | 2026-02-08 |
HMRPred: A Machine Learning-Based Web Resource for Identification of Heavy Metal Resistance Proteins
2026-Jan-22, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2026.169659
PMID:41580067
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研究论文 | 开发了一个基于机器学习的网络资源HMRPred，用于识别重金属抗性蛋白 | 首个针对多种重金属（砷、镉、铬等十种金属）和生物域的系统性重金属抗性蛋白分类资源，解决了传统同源性方法的局限性 | NA | 开发可靠的机器学习框架以识别重金属抗性蛋白，支持环境修复和合成生物学应用 | 重金属抗性蛋白和非抗性蛋白 | 机器学习 | NA | 机器学习算法 | 多种机器学习分类器 | 蛋白质序列 | 经过实验验证的抗性和非抗性蛋白数据集 | NA | NA | NA | 环境, 农业, 工业生物技术 |
| 18 | 2026-02-08 |
Ultra-high-throughput mapping of genetic design space
2026-Jan-14, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09933-9
PMID:41535463
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研究论文 | 本文介绍了一种名为CLASSIC的遗传筛选平台，结合长读和短读NGS技术，用于高通量评估任意长度遗传构建体的表达谱 | 开发了CLASSIC平台，首次实现单次实验中同时分析超过10个基因电路设计（5-20 kb），并利用机器学习模型预测电路行为，揭示遗传部件组合规则 | NA | 加速合成生物学研究，通过高通量筛选基因电路设计，学习遗传部件组合到功能的映射关系 | 人类细胞中的基因电路设计，包含多样遗传部件组合的构建体 | 合成生物学 | NA | 长读和短读下一代测序（NGS） | 机器学习模型 | 测序数据 | 超过10个基因电路设计（5-20 kb）在单次实验中 | NA | 人类细胞 | 基因电路设计，包括遗传部件组合，如逻辑门、生物传感器等 | 工业生物技术 |
| 19 | 2026-02-08 |
A programmable ribozyme for RNA signal transduction
2026-Jan-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-68175-5
PMID:41519779
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研究论文 | 本文报道了一种可编程的RNA信号转导核酶平台UNBAR，用于RNA检测和功能转导 | 开发了一种全新的可编程核酶平台，允许RNA触发直接激活非编码RNA效应子，具有单核苷酸特异性和模块化设计 | NA | 开发一种通用的RNA信号转导平台，用于合成生物学、诊断和基因调控 | 可编程核酶、RNA触发序列、非编码RNA效应子（如sgRNA、shRNA、适配体） | 合成生物学 | NA | RNA工程、细胞检测、体外传感 | NA | RNA序列数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 斑马鱼胚胎、人类细胞 | 双位点自切割核酶，具有模块化传感域和切割产物，设计为RNA触发激活的逻辑门 | 医学、合成生物学、诊断 |
| 20 | 2026-02-08 |
Engineering delivery platforms for CRISPR-Cas and their applications in healthcare, agriculture and beyond
2026-Jan-05, Nanoscale advances
IF:4.6Q2
DOI:10.1039/d5na00535c
PMID:41640466
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综述 | 本文综述了CRISPR-Cas系统的递送平台挑战及其在医疗、农业等领域的应用 | 全面概述了CRISPR技术递送的关键挑战以及当前和新兴的递送策略，包括病毒载体、非病毒物理方法和纳米颗粒基方式 | NA | 探讨CRISPR-Cas系统的递送平台及其在医疗、农业等领域的应用 | CRISPR-Cas系统及其递送策略 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas系统，包括碱基编辑器和先导编辑器 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 医疗，农业，环境，工业生物技术 |