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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-07-31 |
Characterization of OsNrx3i1, the first intron of rice OsNrx3 gene, as a candidate intron-mediated enhancement element for synthetic promoter engineering
2027-Feb, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2026.06.006
PMID:42529265
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研究论文 | 本研究表征了水稻OsNrx3基因的第一个内含子OsNrx3i1作为候选内含子介导增强元件,用于合成启动子工程 | 首次发现水稻OsNrx3基因的第一个内含子具有内含子介导增强(IME)活性,并证实其可通过破坏抑制性上游开放阅读框和嵌入优化5'UTR支架来释放增强潜力,在单子叶植物中表现出竞争性效能 | 所有测试的内含子均表现出环境依赖性和宿主特异性,在双子叶植物中的活性有限 | 开发可用于植物合成生物学的内含子介导增强元件 | 水稻OsNrx3基因的第一个内含子OsNrx3i1 | 植物合成生物学 | NA | NA | NA | 基因表达数据 | 水稻原生质体和稳定转基因植物样本以及双子叶植物本氏烟草瞬时表达样本 | NA | 水稻(Oryza sativa),本氏烟草(Nicotiana benthamiana) | 合成最小启动子 | 农业,工业生物技术 |
| 2 | 2026-07-31 |
Fast, Streamlined In Situ Genotyping of Bacterial Strains for Single-Cell and Subcellular Dynamics Profiling
2026-Jul-27, Chemical & biomedical imaging
DOI:10.1021/cbmi.5c00220
PMID:42529381
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研究论文 | 开发了一种快速、精简的原位基因分型方法,用于细菌菌株的单细胞和亚细胞动力学分析 | 通过表面修饰策略抑制微流控芯片中荧光探针的非特异性聚集,并结合条形码化拷贝数可调质粒,解耦活细胞成像与事后基因分型的冲突,实现了高通量、低扰动的细菌动态表型筛选 | 未明确提及,但从上下文推断可能涉及方法对特定细菌菌株的普适性或长期成像的稳定性挑战 | 克服现有技术在时间分辨率、单细胞信息与实验通量之间的权衡,实现大规模单细胞和亚细胞动力学表型筛选 | 细菌菌株(文库)中的单细胞动态表型及其对应基因型 | 机器学习和合成生物学 | NA | 活细胞延时成像、序贯荧光原位杂交、微流控芯片、基因分型 | NA | 显微图像 | NA | NA | 细菌 | 条形码化拷贝数可调质粒(用于基因分型标签) | 基础生物学, 合成生物学 |
| 3 | 2026-07-31 |
[Evaluation of the skin barrier repair function and anti-inflammatory activity of recombinant mussel mucin Mfp151]
2026-Jul-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.250750
PMID:42522623
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研究论文 | 利用合成生物学技术高效生产重组贻贝粘蛋白Mfp151,并评估其抗炎和皮肤屏障修复功能 | 首次通过合成生物学方法高效获取重组贻贝粘蛋白Mfp151,并系统验证其在体外和体内的抗炎、抗氧化及皮肤修复活性 | 未提及重组蛋白的长期安全性评估及大规模生产工艺优化 | 评估重组贻贝粘蛋白Mfp151的皮肤屏障修复功能和抗炎活性 | 重组贻贝粘蛋白Mfp151 | 合成生物学 | 皮肤老化、炎症 | 合成生物学、CCK-8检测、qPCR、跨膜电阻测量、划痕实验、ELISA、自由基清除实验 | NA | 实验数据 | 体外模型:人永生化角质形成细胞(HaCaT)、人包皮成纤维细胞(HFF-1)、人单核细胞白血病细胞(THP-1);体内模型:斑马鱼晒伤模型 | NA | NA | NA | 医学、化妆品 |
| 4 | 2026-07-31 |
A risk-based framework to guide oversight of nucleic acid constructs
2026, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2026.1870125
PMID:42528926
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评论文章 | 提出一个基于风险的框架,以指导对核酸构建体的监督,旨在根据生物安全相关性对合成核酸产品进行分类 | 构建了一个三级分类框架,将定制与非定制产品区分,并根据长度和来源划分为高、中、低风险类别,为比例性筛查提供指导 | 未明确覆盖所有材料,如非定制仓库中的长病毒序列,需要进一步调查和政策发展 | 基于风险评估制定合成核酸产品的分类框架,优化生物安全监督 | 合成核酸产品,包括DNA和RNA序列、寡核苷酸及非DNA/RNA核酸 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物安全 |
| 5 | 2026-07-31 |
Microbial remediation of recalcitrant pollutants in soil and geo-environmental engineering systems
2026, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2026.1904267
PMID:42529377
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综述 | 综述微生物修复土壤中难降解污染物的过程及其在地环境工程系统中的应用 | 综合讨论了难降解污染物类型、土壤微生物群落及关键微生物过程,并批判性地评估了地环境工程应用,如生物刺激、生物强化、根际修复、真菌修复、微生物诱导碳酸盐沉淀和渗透反应性生物屏障,同时指出了合成生物学、工程微生物菌群、纳米生物修复和人工智能等新兴创新 | 未明确提及综述的具体局限性 | 总结微生物修复难降解污染物的原理、过程及地环境工程应用,并展望未来研究方向 | 土壤中难降解污染物(如多环芳烃、石油烃、氯化化合物、农药、药物、全氟和多氟烷基物质及重金属)及微生物群落 | 机器学习和数字病理 | NA | 微生物降解、生物吸附、生物累积、生物转化、生物矿化、共代谢、生物膜介导过程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 细菌、真菌、放线菌、微生物菌群 | 生物修复途径(如降解、转化、固定化、解毒) | 环境 |
| 6 | 2026-07-30 |
Learning from nature's plant engineers: Hijacking metabolism and development beyond genetics
2026-Aug, Current opinion in plant biology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.pbi.2026.102905
PMID:42250525
|
综述 | 本文探讨了除基因工程外,利用自然界中细菌、真菌和昆虫等生物劫持植物代谢和发育的机制,为合成生物学提供新思路 | 提出超越传统基因工程视角,从物种间相互作用中学习植物代谢重编程的新策略 | NA | 研究自然界生物劫持植物代谢的机制,扩展合成生物学的概念边界 | 植物代谢网络及其与细菌、真菌、昆虫的相互作用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 植物 | NA | 农业, 工业生物技术, 材料 |
| 7 | 2026-07-30 |
Living sensors: Engineering plants to sense and report on their environments
2026-Aug, Current opinion in plant biology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.pbi.2026.102923
PMID:42391913
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综述 | 综述了利用合成生物学改造植物作为活体传感器,以感知和报告环境胁迫的研究进展 | 总结了三类主要策略:利用天然启动子系统、工程化蛋白基生物传感器以及构建植物-微生物跨界信号网络,并结合光学报告系统实现远程检测 | 未明确讨论现有传感器植物在田间部署中的稳定性、可扩展性及环境安全评估等具体限制 | 设计可部署于田间的工程植物传感器,用于实时环境监测和土地管理 | 工程改造的传感器植物(包括植感器或哨兵植物) | 合成生物学 | NA | 合成生物学, 基因工程 | NA | 光学信号(荧光、生物发光、色素信号等) | NA | NA | 植物 | 感知-响应模块(包括天然启动子系统、蛋白基生物传感器、植物-微生物跨界信号网络) | 环境监测, 农业 |
| 8 | 2026-07-30 |
Next-Generation Food Enzymology: From Metagenomic Discovery to AI-Driven Biocatalyst Design
2026-Jul-29, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.6c04349
PMID:42461222
|
评论 | 讨论宏基因组学和人工智能如何融合以推动下一代食品酶学的创新,实现从经验性酶发现到预测性生物催化剂设计的转变 | 将宏基因组学与AI驱动的蛋白质设计相结合,实现从传统经验性酶发现到预测性精准生物催化剂设计的范式转变 | NA | 探讨宏基因组学、人工智能和合成生物学在食品酶学中的应用,推动下一代食品加工中的定制化生物催化剂开发 | 食品加工中的酶和生物催化剂 | 机器学习 | NA | 宏基因组学, 蛋白质结构预测, 蛋白质设计 | NA | 基因组数据 | NA | 宏基因组学, 合成生物学 | NA | NA | 食品 |
| 9 | 2026-07-30 |
Silkworm synthetic biology: Toolkit development, chassis engineering, and biomanufacturing applications
2026-Jul-29, Insect science
IF:2.9Q1
DOI:10.1111/1744-7917.70331
PMID:42522963
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综述 | 本文综述了家蚕合成生物学在底盘特征、工程工具包、代表性应用和未来前景方面的最新进展 | 系统总结了家蚕作为昆虫合成生物学底盘的潜力,涵盖了从工具开发到生物制造应用的完整流程,并提出了利用泛基因组学、多组学和人工智能辅助设计的未来方向 | 跨品系适应性有限、调控元件标准化不完整、整合与表达行为不确定性以及生物安全问题 | 介绍家蚕合成生物学的进展并讨论其在基础研究和生物技术中的应用前景 | 家蚕(Bombyx mori)及其丝腺 | 合成生物学 | NA | 稳定转基因、定点整合、可编程基因组编辑、时空基因调控、重组酶系统、基因沉默、启动子和增强子捕获 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, 重组酶系统 | 家蚕(Bombyx mori) | 组织特异性表达系统、诱导表达系统、重组酶系统、基因沉默系统 | 医学、农业、工业生物技术 |
| 10 | 2026-07-30 |
Adaptive Responses of Tropical Crops: A Multi-Scale Omics Integrated Perspective
2026-Jul-27, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.76735
PMID:42505031
|
综述 | 本文从多组学整合视角综述了热带作物应对极端和多变环境的适应策略 | 提出通过多组学解析协同胁迫响应机制、利用野生种质和分子设计育种加速抗逆品种开发、基于生态位框架优化热带农林复合系统,以及将热带适应机制通过合成生物学和基因编辑应用于其他作物 | 未具体讨论各作物适应机制的细节数据支持及现有研究的技术局限性 | 探索热带作物适应性策略并为气候适应性可持续农业提供理论和实践方案 | 甘蔗、香蕉、木薯、橡胶、油棕等热带作物 | 数字病理学 | 不适用 | 多组学、分子设计育种、合成生物学、基因编辑 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | CRISPR-Cas9 | 热带作物(如甘蔗、香蕉、木薯等) | 不适用 | 农业 |
| 11 | 2026-07-30 |
Engineering therapeutic super-competitor cells for educative cancer treatment and ecological replacement
2026-Jul-27, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2026.218765
PMID:42508749
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综述 | 提出治疗性超级竞争细胞(TSCs)作为一种可编程的、进化感知的肿瘤教育治疗框架,通过生态竞争而非直接杀伤来控制肿瘤 | 将主动杀伤转变为可控生态竞争,整合癌症生态学、发育细胞竞争和合成生物学,提供进化感知的肿瘤治疗新范式 | 该框架仍处于假设阶段,尚未建立临床平台,现有研究多为理论性,缺乏实验验证 | 探索基于生态竞争的治疗性超级竞争细胞用于肿瘤教育治疗和生态替代 | 治疗性超级竞争细胞(TSCs)及其在肿瘤微环境中的生态互动 | 合成生物学, 癌症生态学 | 肿瘤 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | NA | 生态竞争回路、代谢限制回路、免疫重塑回路 | 医学 |
| 12 | 2026-07-30 |
Metabolic engineering strategies: utilizing different microbial strains and advanced technologies for the synthesis of high-valued terpenoids
2026-Jul-27, Antonie van Leeuwenhoek
DOI:10.1007/s10482-026-02389-5
PMID:42509354
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综述 | 综述利用不同微生物菌株和先进技术合成高价值萜类化合物的代谢工程策略 | 系统总结了人工智能和机器学习在萜类生物合成途径预测、代谢通量优化、酶工程和瓶颈识别中的新兴应用 | 未具体讨论当前策略的局限性,但指出需要系统整合计算方法进一步优化菌株 | 探讨通过微生物代谢工程生产高价值萜类化合物的策略和技术进展 | 萜类化合物的微生物合成途径及工程菌株 | 机器学习 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | 萜类生物合成途径 | 医药, 农业, 食品, 工业生物技术 |
| 13 | 2026-07-30 |
Converting Food Waste into Value-Added Products: A Review on Current Technologies, Challenges, and Future Perspectives
2026-Jul-22, Foods (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/foods15142577
PMID:42511323
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review | 综述了将食物废弃物转化为增值产品的当前技术、挑战与未来展望 | 综合评述了绿色提取技术、生物化学、热化学、酶和微生物方法,并探讨了生物精炼、人工智能、数字生物精炼、合成生物学和碳中和生产系统等新兴进展 | 原料异质性、工艺可扩展性、监管框架、经济可行性和可持续性评估等关键挑战 | 批判性分析食物废弃物转化为增值产品的策略,支持向弹性循环生物经济系统转型 | 主要农业食品副产品,如果渣、蔬菜残渣、油籽粕、乳制品副产品和农业工业废物 | machine learning | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | food, environment, industrial biotechnology |
| 14 | 2026-07-30 |
Small Regulatory RNAs in Prokaryotes: Key Features, Identification, Environmental Roles, and Applications
2026-Jul-16, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms14071561
PMID:42514066
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综述 | 整合计算预测、宏组学发现和合成生物学应用,全面探讨原核生物中调控性小RNA的关键特征、鉴定方法、环境角色及工程应用 | 从鉴定到功能及工程应用的多层次视角,结合环境宏组学数据揭示未培养微生物群落中sRNA的多样性,并系统评估合成sRNA在代谢工程中的应用 | 未明确指出具体局限性,但可能包含对预测工具假阳性挑战的讨论不足 | 提供原核生物sRNA生物学的整体视图,突出其在环境适应与生物技术应用中的桥梁作用 | 原核生物(特别关注海洋和环境相关的前核生物)中的调控性小RNA | 机器学习, 计算生物学 | NA | 计算预测, 宏组学, 宏转录组学, RNA相互作用组图谱 | NA | 宏基因组, 宏转录组, RNA相互作用组数据 | NA | 合成RNA工程 | 原核生物(海洋和环境来源) | 合成sRNA调控电路(用于代谢工程) | 环境科学, 工业生物技术 |
| 15 | 2026-07-30 |
Global Research Trends on Polyhydroxyalkanoate-Producing Microorganisms: A Bibliometric and Scientometric Analysis of Sustainable Bioplastic Biotechnology
2026-Jul-15, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms14071550
PMID:42514055
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综述 | 对2014至2025年间聚羟基脂肪酸酯(PHA)生产微生物及其在生物基包装中应用的全球研究趋势进行了科学计量和文献计量分析 | 首次系统揭示了PHA研究从基础生理分类向代谢工程、合成生物学、低成本底物优化、多组学工具及量子建模等复杂应用的学科转变,并识别出关键技术差距 | 主要依赖单一数据库,且对下游加工、混合微生物群落管理和资金不足等瓶颈仅作定性分析,缺乏定量比较 | 评估PHA生产微生物的研究趋势及其在可持续生物塑料中的商业化潜力 | 与PHA生产相关的科学出版物及国际合作网络 | 文献计量分析 | NA | CRISPR-Cas9, 多组学工具, 量子建模 | NA | 文献数据 | 2014至2025年间的相关科学出版物 | CRISPR-Cas9 | 混合微生物群落 | 代谢通路, 基因编辑 | 环境, 工业生物技术 |
| 16 | 2026-07-30 |
The Genetic Transformation Mechanism and Application of Plant Hairy Roots
2026-Jul-13, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants15142160
PMID:42514528
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综述 | 本文总结了发根农杆菌介导的植物毛状根诱导的分子机制、遗传物质递送系统的发展、毛状根诱导与再生平台的构建、毛状根分子机制及其在遗传育种中的应用,以及利用毛状根提取次生代谢产物 | 阐述了毛状根遗传转化系统在单一步骤中产生转基因纯合子的优势,以及其在基因编辑、快速驯化和合成生物学驱动育种等前沿技术中的加速作用 | 未提及限制因素 | 总结毛状根遗传转化机制及其在植物遗传育种和次生代谢产物提取中的应用 | 植物毛状根 | 植物生物技术 | NA | 发根农杆菌介导的毛状根诱导 | NA | NA | NA | 发根农杆菌 | 植物 | 毛状根诱导系统 | 农业, 生物技术 |
| 17 | 2026-07-30 |
Microbial Lignin Valorization to Protocatechuic Acid and Catechol: Biofunneling Pathways and Metabolic Engineering Strategies
2026-Jul-03, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom16070979
PMID:42509773
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综述 | 综述微生物木质素转化为原儿茶酸和儿茶酚的途径及代谢工程策略 | 系统总结微生物将木质素衍生物转化为原儿茶酸和儿茶酚的生物漏斗途径,并强调原儿茶酸脱羧酶作为关键酶桥的作用 | 许多微生物生产策略仅使用纯化的木质素衍生模型化合物,而非真实木质素原料,且面临木质素顽固性、解聚产物异质性、中间体毒性和酶效率有限等挑战 | 推动木质素生物转化为原儿茶酸和儿茶酚,以发展可持续的生物精炼和循环生物经济 | 微生物将木质素衍生芳香化合物转化为原儿茶酸和儿茶酚的途径及工程策略 | 合成生物学 | NA | 木质素解聚技术(热化学和生物方法)、代谢工程(基因删除、通路重连、转运蛋白工程、CRISPR调控) | NA | NA | NA | CRISPR | 微生物(未特指) | 生物漏斗途径(如O-去甲基化、羟基化、脱羧酶转化) | 工业生物技术、环境 |
| 18 | 2026-07-30 |
Engineering an Optogenetic pH-Modulator in Bacteria
2026-Jul, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202524319
PMID:42095488
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研究论文 | 在细菌中工程化光遗传pH调节系统,实现胞外pH的可逆调控 | 首次将光遗传学与基因工程结合,在微生物中构建可动态调控胞外pH的合成系统,并实现长达14天的持续循环 | 系统对培养基成分、补料速率和光照模式等环境因素高度依赖,离实际应用仍有差距 | 构建无需人工干预即可在高低pH状态间切换的微生物系统 | 改造的细菌细胞 | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 光诱导启动子控制重组脲酶表达,结合降解标签和环境优化 | 工业生物技术 |
| 19 | 2026-07-30 |
Synthetic developmental engineering of human liver organogenesis
2026-07-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.205040
PMID:42440359
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综述 | 讨论人类胚胎肝脏发育和当前用于体外生成肝脏类器官的模型,并探讨如何整合合成生物学和计算分析来增强类器官 | 提出将合成生物学和计算分析整合以增强肝脏类器官的新方法,包括促进血管化、建立分区、优化命运规范和响应外部信号 | 面临可重复性和实现成年水平成熟等挑战 | 推动下一代多细胞人类干细胞衍生系统的开发 | 人类肝脏发育过程和体外肝脏类器官模型 | 数字病理学 | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学工具(具体未指定) | 人类干细胞 | 合成发育工程策略包括血管化、分区、命运规范和外部信号响应 | 医学 |
| 20 | 2026-07-30 |
Special Milk and Synthetic Biology: A Dual-Perspective Review of Ingredient Substitutions in Breast-Milk-Simulated Infant Formula
2026-Jul, Comprehensive reviews in food science and food safety
IF:12.0Q1
DOI:10.1111/1541-4337.70572
PMID:42504013
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review | 本文综述了两种补充性策略——特殊乳利用和合成生物学驱动的精准制造——在开发模拟母乳的婴儿配方粉成分中的应用 | 首次提出特殊乳基质与精准发酵生物活性物融合的策略,将婴儿配方粉从成分模仿转向结构-功能仿生 | 大多数研究集中于单一成分而非整合配方系统,且缺乏稳健的临床验证 | 探索替代牛奶的婴儿配方粉中成分替代策略,以更接近模拟母乳的复杂功能 | 特殊乳(如羊奶、骆驼奶、驴奶、水牛奶、牦牛奶)及合成生物学平台生产的生物活性成分(如2'-岩藻糖基乳糖和重组乳铁蛋白) | NA | NA | 多组学整合、精准发酵 | NA | 综述型文章 | NA | NA | NA | NA | 食品、医学 |