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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-07-18 |
Microbial factories for lipid: Engineering synthetic routes and regulatory networks for Triacylglycerol biosynthesis
2026-Oct, Food microbiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.fm.2026.105136
PMID:42215216
|
综述 | 综述微生物合成三酰甘油(TAG)的最新进展及未来研究方向 | 系统整合合成生物学与代谢工程策略,提出工业规模微生物TAG生物制造的技术路线图 | 未讨论非模式微生物的基因编辑工具局限性及扩大化生产的经济可行性 | 促进可持续脂质来源的微生物系统开发 | 产油微生物(油质微生物)及其三酰甘油合成途径 | NA | NA | 代谢工程,合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物(产油微生物) | 三酰甘油生物合成路径(如TAG组装途径、代谢网络调控) | 生物能源,食品工业,工业生物技术 |
| 2 | 2026-07-18 |
Evaluation of Ogataea polymorpha DUR31 TPP riboswitch as a tool to downregulate gene expression in the yeast Komagataella phaffii
2026-Sep-25, New biotechnology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.nbt.2026.06.009
PMID:42372865
|
research paper | 在酵母Komagataella phaffii中评估Ogataea polymorpha的DUR31 TPP核糖开关,作为下调基因表达的工具 | 首次评估了来自多形汉逊酵母的DUR31 TPP核糖开关在Komagataella phaffii中的功能性,展示了其作为正交调控工具的潜力 | 核糖开关存在显著的泄漏表达,无法作为严格的分子开关;剪接效率受局部序列背景影响 | 开发用于Komagataella phaffii的基因表达调控工具 | Komagataella phaffii(毕赤酵母)和Ogataea polymorpha(多形汉逊酵母) | 合成生物学 | NA | 流式细胞术,RT-PCR | NA | 荧光报告基因数据 | NA | 核糖开关(TPP核糖开关) | Komagataella phaffii | TPP核糖开关调控基因表达系统 | 工业生物技术 |
| 3 | 2026-07-18 |
From fermentation to pharmabiotics: engineering kefir-derived Lactobacillus for targeted intratumoral immunotherapy in colorectal Cancer
2026-Sep-15, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.117032
PMID:42289150
|
综述 | 本文综述了从发酵到药物生物的流程,将开菲尔中的乳杆菌工程改造为用于结直肠癌靶向瘤内免疫治疗的活体生物治疗产品 | 提出了将开菲尔来源的乳杆菌通过合成生物学改造为肿瘤靶向活体药物,实现局部免疫微环境重塑和协同免疫检查点抑制剂治疗 | 面临生物遏制、生产放大和监管审批等转化挑战 | 开发基于工程化乳杆菌的活体生物治疗产品用于结直肠癌靶向免疫治疗 | 开菲尔中的乳杆菌菌株 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 合成生物学 | NA | 文本 | NA | CRISPR-Cas9 | 乳杆菌 | 肿瘤低氧区域靶向生物传感器、体内原位生物反应器、纳米抗体和细胞因子释放回路 | 医学 |
| 4 | 2026-07-18 |
Bottom-up reconstitution of model membrane systems: a mini-review
2026-Jul-29, Biochemical Society transactions
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BST20250291
PMID:42460640
|
综述 | 总结自下而上重构模型膜系统的最新进展,重点介绍支撑脂双层和巨单层囊泡的制备与应用 | 系统总结了近年来微米尺度膜系统在蛋白质组装、膜曲率感知与重塑、通透性及细胞骨架组织等方面的关键见解,并突出了悬浮膜、膜-凝聚物相互作用及巨单层囊泡在合成生物学中的应用等新兴方向 | 未详细讨论其他类型的模型膜系统(如平面膜片、纳米级囊泡),且受篇幅限制未能深入分析具体实验细节 | 综述自下而上重构模型膜系统在研究膜组织与功能物理原理方面的进展 | 支撑脂双层和巨单层囊泡等模型膜系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物医学 |
| 5 | 2026-07-18 |
Nanofluidics for Pioneering Synthetic Biology of Bottom-Up Cell-Free Molecular Systems
2026-Jul-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00178
PMID:42284545
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观点文章 | 提出纳米流体学作为变革性平台,推动自下而上无细胞分子系统合成生物学发展 | 提出利用纳米流体学的纳米限域效应和精确质量传输,实现分子构建块主动组装成功能整合的时空结构,为合成生物学提供新范式 | 未详细阐述具体实验验证或应用案例,仅提出概念性框架和挑战 | 推动自下而上无细胞分子系统的合成生物学从随机提取物系统向重构、分子定义系统转变 | 无细胞分子系统中的分子构建块和纳米流体装置 | 合成生物学 | NA | 纳米流体学 | NA | NA | NA | 纳米流体装置 | NA | 分子主动组装系统 | 合成生物学, 纳米技术 |
| 6 | 2026-07-18 |
Multilevel Metabolic Engineering of Probiotic Escherichia coli Nissle 1917 for Antibiotic-Free Production of β-Alanine
2026-Jul-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00228
PMID:42270566
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研究论文 | 通过多层级代谢工程改造益生菌大肠杆菌Nissle 1917,实现无抗生素生产β-丙氨酸 | 首次研究了TdcC、SstT、SdaC和RhaT转运蛋白在β-丙氨酸积累中的作用,并实现了益生菌EcN生产β-丙氨酸的最高产量 | 未提及明确局限,但可能涉及发酵过程的规模化挑战或长期稳定性 | 开发益生菌EcN作为微生物细胞工厂,实现β-丙氨酸的无抗生素高效生产 | 益生菌大肠杆菌Nissle 1917 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA(涉及5升生物反应器中的发酵过程) | NA(多层级代谢工程策略,包括异源酶引入、通路强化等) | 大肠杆菌Nissle 1917 | β-丙氨酸生物合成途径,包括前体L-天冬氨酸供应双通路强化、竞争通路动态调控、中枢代谢重编程和转运系统工程化 | 工业生物技术 |
| 7 | 2026-07-18 |
A Comprehensive Review on Metabolomics-Guided Metabolite Production in Plant Tissue Culture: Integrating Omics and Synthetic Biology for Enhanced Yields
2026-Jul-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00352
PMID:42301185
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综述 | 本文综述了在植物组织培养中通过代谢组学引导代谢物生产的方法,整合组学和合成生物学以提高产量 | 将植物组织培养从试错实践重新定义为预测性系统工程领域,通过代谢组学作为核心决策层连接代谢表型与理性途径设计 | 分析覆盖范围、培养稳定性和代谢可预测性方面仍存在挑战 | 探索代谢组学引导的植物组织培养中代谢物生产策略,并整合合成生物学和多组学框架 | 植物组织培养中次生代谢物的生产与控制 | 合成生物学 | NA | 代谢组学, 多组学整合 | NA | 代谢组学数据 | NA | CRISPR-Cas9, 合成启动子, 模块化遗传回路, 异源表达系统 | 植物细胞 | 模块化遗传回路, 代谢途径设计 | 医学, 农业, 工业生物技术 |
| 8 | 2026-07-18 |
SARGE: Serine Integrase-Assisted Rapid Genome Integration through Cassette Exchange in Escherichia coli
2026-Jul-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00334
PMID:42319839
|
research paper | 报道了一种名为SARGE的丝氨酸整合酶辅助快速基因组整合平台,通过盒交换实现大肠杆菌中大型DNA片段的迭代插入 | 结合正交的PhiC31和Bxb1丝氨酸整合酶与合理的供体质粒设计,实现无需抗性标记切除的快速可编程整合循环,并开发双荧光报告系统和肉眼直接筛选策略 | 目前仅在大肠杆菌中验证,扩展到其他遗传可操作微生物宿主的能力尚待确认 | 构建一个稳健且易用的基因组工程平台,简化迭代基因组整合流程 | 大肠杆菌 | 合成生物学 | NA | 丝氨酸整合酶辅助盒交换 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 双荧光报告系统(sfGFP和mKate)用于筛选 | 工业生物技术 |
| 9 | 2026-07-18 |
Tardigrade-Derived Strategy for Low-Cost Storage of Cell-Free Expression Lysates
2026-Jul-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00281
PMID:42319881
|
研究论文 | 提出一种利用缓步动物来源的CAHS蛋白保护无细胞表达系统在室温干燥下稳定的方法 | 首次利用缓步动物来源的CAHS蛋白作为单一添加剂,无需其他成分即可在低成本室温干燥条件下保护无细胞表达系统的蛋白合成活性 | 未明确说明CAHS蛋白对其他类型无细胞系统或更复杂生物过程的保护效果,以及长期储存稳定性 | 开发低成本的室温储存方法,提高无细胞表达系统的可及性和便携性 | 无细胞表达系统以及缓步动物来源的胞质丰富热溶性(CAHS)蛋白 | 合成生物学 | NA | 无细胞表达系统 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 10 | 2026-07-18 |
Metabolic Engineering of Microbial Cell Factories for Sustainable Production of Glycolic Acid: Pathways, Chassis, and Strategies toward Poly(glycolic acid) Bioplastics
2026-Jul-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00078
PMID:42340804
|
review | 系统综述了微生物细胞工厂可持续生产乙醇酸的途径、底盘、策略及其在聚乙醇酸生物塑料中的应用进展 | 全面比较了不同生物合成途径的碳转化效率及代谢特性,结合工业化的技术经济分析和生命周期评估,强调了人工智能辅助设计与过程优化的整合前景 | 未涉及大规模工业验证的具体数据,部分新兴路径在菌株中的实际效能有待进一步实验验证 | 综述微生物合成乙醇酸的可持续生产路线,以支持聚乙醇酸生物塑料的开发 | 微生物细胞工厂生产乙醇酸的关键要素,包括生物合成途径、遗传改造策略和工业化考量 | 合成生物学、代谢工程 | NA | 合成生物学、代谢工程 | NA | 文本、图表 | NA | CRISPR-Cas9, 生物传感器 | 大肠杆菌、酵母、枯草芽孢杆菌 | 代谢通路工程(乙醛酸支路、C5糖裂解途径、新合成路径)、动态调控回路 | 工业生物技术、材料、环境 |
| 11 | 2026-07-18 |
Microfluidics-Based Engineering of Molecular Self-Assembly and Manufacturing for Artificial Cell Systems
2026-Jul-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00249
PMID:42358072
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观点文章 | 本文探讨如何利用微流控技术工程化分子自组装过程,以构建功能稳定的人工细胞系统 | 提出将微流控作为提供物理边界条件的平台,而非仅仅替代生物调控,从而协同内在自组装与确定性工程,构建稳健的分子系统 | 未提供具体实验验证,主要基于理论分析和观点阐述 | 探索微流控技术在人工细胞系统构建中的应用,推动自下而上合成生物学从实验室原型向标准化生物制造转变 | 人工细胞系统中的分子自组装与微流控工程化平台 | 合成生物学 | NA | 微流控 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术, 医学 |
| 12 | 2026-07-18 |
Rapid and Continuous Directed Evolution in Vibrio natriegens Utilizing an In Vivo Hypermutation System
2026-Jul-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00936
PMID:42362483
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研究论文 | 在需钠弧菌中建立基于体内超突变系统的快速持续定向进化方法 | 首次在需钠弧菌中建立MutaT7系统(VnMutaT7),利用其极快生长速度(倍增时间为大肠杆菌的一半),将模型蛋白TEM-1对抗生素头孢他啶的耐药性进化时间缩短至36小时 | NA | 开发需钠弧菌作为加速蛋白质工程平台的应用潜力 | 需钠弧菌中的MutaT7系统及TEM-1蛋白 | 合成生物学 | NA | 体内超突变系统(MutaT7),定向进化 | NA | NA | NA | MutaT7(胞苷脱氨酶与T7 RNA聚合酶融合) | 需钠弧菌 (Vibrio natriegens) | 基于T7启动子的体内超突变系统 | 工业生物技术 |
| 13 | 2026-07-18 |
Beyond Compartmentalization: Deciphering Reaction Kinetics in Liquid-Liquid Phase Separation for Rational Biotechnological Design
2026-Jul-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00259
PMID:42350320
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综述 | 本文综述了液-液相分离(LLPS)如何通过反应物浓度、反应-扩散耦合、微环境工程和酶活性调节等机制调控反应动力学,并讨论其在合成生物学中的应用 | 首次整合蛋白质介导和非蛋白质介导的LLPS,系统解析LLPS通过多种机制精准调控反应动力学的原理,并为合理设计下一代LLPS驱动的合成生物学提供机制见解和设计指南 | 当前对LLPS精确调控反应动力学的机械性理解尚不完整,阻碍了基于LLPS应用的理性设计和优化 | 建立LLPS调控反应动力学的基本原理,为合成生物学中基于LLPS的合理设计提供理论基础和指导 | 液-液相分离(LLPS)及其在生物催化、代谢工程、诊断、治疗、生命起源研究和人工细胞构建中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 代谢通路、生物传感器、人工细胞 | 生物技术, 医学 |
| 14 | 2026-07-18 |
Probiotics unveiled: bridging general health benefits to the era of precision medicine
2026-Jul-17, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-026-05143-1
PMID:42463603
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综述 | 本研究综述了益生菌从一般健康促进剂向精准医学时代靶向疗法的转变过程 | 整合心理生物学、下一代益生菌、改造菌株、人工智能和合成生物学技术,重新定义益生菌在个性化医疗中的关键工具角色 | 未明确提及具体限制 | 探讨益生菌从一般健康促进到精准医学靶向治疗的转变及其在个性化医疗中的应用 | 益生菌及其在人体微生物组、遗传特征和健康状况中的靶向应用 | 精准医学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 15 | 2026-07-18 |
Protein engineering: Status report
2026-Jul-17, Protein engineering, design & selection : PEDS
DOI:10.1093/protein/gzag020
PMID:42466865
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综述 | 该报告全面概述了蛋白质工程领域作为一门快速发展的学科,整合计算、分子生物学、结构导向、进化及合成方法,以创造具有定制结构和有用功能的新蛋白质或改良蛋白质 | 强调了机器学习和人工智能方法在蛋白质工程中日益增长的影响力,并指出该领域正进入一个‘黄金时代’,同时设计、筛选和实际应用方面仍面临挑战 | 未提及具体限制 | 提供蛋白质工程领域的及时快照,涵盖核心方法论和主要应用领域,如酶、治疗、检测、合成生物学和材料 | 蛋白质工程领域整体,重点关注酶、治疗剂、检测工具、合成生物学和材料中的蛋白质 | 机器学习 | NA | 计算、分子生物学、结构导向、进化、合成方法 | 机器学习、基于人工智能的方法 | NA | NA | 计算设计、分子生物学工具、进化方法 | NA | NA | 医药、分子成像、诊断、塑料回收、工业化学 |
| 16 | 2026-07-18 |
Bacteria mediated tumor therapy recent advances challenges and future perspectives
2026-Jul-17, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-05611-y
PMID:42467272
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综述 | 系统综述细菌介导肿瘤治疗的历史发展、内在抗肿瘤机制、基因工程策略和多模式生物混合系统 | 提出下一代智能、可控、临床可转化的细菌衍生活体抗肿瘤系统的合理设计策略 | 临床转化仍受制于生物安全性控制不足、脱靶定植、不受控制的增殖、免疫清除以及缺乏标准化制造和监管指南 | 综述细菌介导肿瘤治疗的研究进展、挑战和未来展望 | 工程化细菌及基于细菌的生物混合系统 | 合成生物学 | 肿瘤 | 合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 厌氧菌、兼性厌氧菌 | 环境响应可编程表达、细胞毒性蛋白生产、多模式联合治疗 | 医学 |
| 17 | 2026-07-18 |
Metabolic engineering of Komagataella phaffii for enhanced production of heterologous proteins and small molecules: key strategies and future directions
2026-Jul-16, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.00110-26
PMID:42461011
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综述 | 对Komagataella phaffii代谢工程用于提高异源蛋白和小分子产量的关键策略和未来方向进行综述 | 系统总结了代谢工程在Komagataella phaffii中的应用,涵盖代谢流控制、动态控制、系统建模等多个核心优化策略 | 未提供具体实验数据,作为综述存在局限 | 概述Komagataella phaffii代谢工程的最新进展和未来方向 | Komagataella phaffii的代谢工程策略 | NA | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA | NA | Komagataella phaffii | NA | 工业生物技术 |
| 18 | 2026-07-18 |
Light-directed biofilm formation reveals the functional contributions of periplasmic cytochromes to the electrochemical activity of Shewanella oneidensis
2026-Jul-16, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.01264-26
PMID:42461042
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研究论文 | 利用光诱导生物膜形成方法,揭示了周质细胞色素对希瓦氏菌电化学活性的功能贡献 | 结合靶向基因敲除与光诱导生物膜图案化技术,克服了周质细胞色素网络复杂性和原生生物膜变异性带来的挑战,实现了对周质细胞色素在向外电子传递和生物膜传导中不同功能的区分 | 未明确提及但可能包括:仅使用单一突变体组合、未在非电极环境验证、长期稳定性未评估 | 阐明希瓦氏菌周质细胞色素在向外电子传递和生物膜传导中的具体功能角色 | 希瓦氏菌MR-1的周质细胞色素突变体 | 合成生物学, 微生物电化学 | NA | 光诱导生物膜图案化, 伏安法测量, 电化学栅控测量 | NA | 电化学信号, 生物膜图像 | 多种周质细胞色素基因敲除菌株的图案化生物膜,具体数量未给出 | 靶向基因敲除, 光诱导图案化 | 希瓦氏菌 MR-1 | 光诱导生物膜形成系统(可能基于光敏蛋白调控) | 生物能源, 环境修复 |
| 19 | 2026-07-18 |
Next-Generation Food Enzymology: From Metagenomic Discovery to AI-Driven Biocatalyst Design
2026-Jul-16, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.6c04349
PMID:42461222
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评论文章 | 本文探讨了宏基因组学、人工智能和合成生物学融合驱动下食品酶学的新时代,从宏基因组发现到AI驱动的生物催化剂设计 | 将宏基因组学与人工智能结合,实现从经验性酶发现到预测性生物催化剂设计的转变 | 可能缺乏具体实验验证和定量比较,属于前瞻性观点讨论 | 推动食品酶学进入可持续、精准和下一代食品加工应用的新阶段 | 食品加工中的生物催化剂 | 机器学习 | NA | 宏基因组学, 人工智能 | 蛋白质结构预测模型, 功能建模 | 宏基因组数据 | NA | 合成生物学 | NA | 定制生物催化剂 | 食品 |
| 20 | 2026-07-18 |
Cannabichromene (CBC): a comprehensive review of biosynthesis, pharmacology, therapeutic potential, and translational perspectives
2026-Jul-16, Journal of cannabis research
IF:4.1Q1
DOI:10.1186/s42238-026-00454-4
PMID:42464425
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综述 | 全面综述大麻色烯(CBC)的生物合成、药理学、治疗潜力及转化前景 | 系统整合了CBC的生物合成途径、独特的受体相互作用谱(如TRP通道激动剂)及非精神活性优势,并提出纳米递送系统、合成生物学等未来方向 | 缺乏临床试验数据,口服生物利用度低,监管碎片化,且现有证据仅基于临床前研究 | 评估CBC作为治疗候选分子的现状,并识别转化研究中的关键挑战 | 大麻色烯(CBC)及其前体大麻色烯酸(CBCA) | 药物化学 | 炎症、疼痛、癌症、神经退行性疾病、抑郁症、皮肤病 | 高效液相色谱、质谱、酶活性测定、分子生物学 | NA | 生物化学数据、药理学数据、毒理学数据 | NA | NA | 大麻(Cannabis sativa L.) | 大麻素生物合成途径(聚酮/甲羟戊酸/MEP途径) | 医学 |