合成生物学相关文章
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当前共找到 4484 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-02-24 |
Construction and analysis of a cell factory for terpenoid biosynthesis in Pichia pastoris via metabolic engineering and metabolomics
2026-Mar, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.08.015
PMID:41725898
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研究论文 | 本研究通过代谢工程和代谢组学方法，在毕赤酵母中构建并分析了一个用于萜类化合物生物合成的通用细胞工厂 | 开发了一种“即插即用”的细胞工厂，通过增强MVA途径表达和减少分支途径分流策略，实现了多种萜类化合物的高效合成，并利用系统生物学分析揭示了关键蛋白拷贝数增加对精氨酸等代谢途径的影响 | 菌株的鲁棒性和紧密调控的代谢网络限制了理性代谢工程改造的潜力 | 构建高效的微生物细胞工厂以实现萜类化合物的大规模生产 | 毕赤酵母作为宿主细胞，用于生产β-榄香烯、β-法尼烯、(+)-瓦伦烯、(-)-α-红没药醇等萜类化合物 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、代谢组学、系统生物学分析 | NA | 代谢物数据 | 不同工程菌株 | 代谢工程 | 毕赤酵母 | 增强MVA途径表达和减少分支途径分流的通用萜类化合物生物合成细胞工厂 | 医药、保健品、香料 |
| 2 | 2026-02-24 |
Enhancing CRISPR/Cas-Mediated Gene Knockout With Short Non-Homologous Oligonucleotides
2026-Feb-22, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70548
PMID:41725298
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研究论文 | 本文报道了通过共递送短双链非同源寡核苷酸（dsNHO）可显著提高莱茵衣藻中CRISPR/Cas介导的基因敲除效率 | 发现了非同源寡核苷酸增强（NOE）现象，可将基因敲除效率提高高达100倍，并揭示了其通过干扰DNA双链断裂传感通路来促进易错修复的机制 | 研究主要基于莱茵衣藻模型，在其他生物中的普适性需进一步验证 | 提高CRISPR/Cas系统在莱茵衣藻中的基因敲除效率，以促进合成生物学应用 | 莱茵衣藻（Chlamydomonas reinhardtii） | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas基因编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 莱茵衣藻（Chlamydomonas reinhardtii） | NA | 工业生物技术 |
| 3 | 2026-02-24 |
Engineered Bacteria as living detectors of tumor DNA: A new diagnostic frontier
2026-Feb-20, Clinica chimica acta; international journal of clinical chemistry
DOI:10.1016/j.cca.2026.120914
PMID:41724454
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综述 | 本文综述了利用合成生物学技术设计基因工程细菌作为生物传感器，用于原位检测肿瘤DNA（特别是KRAS突变）的最新进展 | 将基因工程细菌作为活体检测器，利用其天然感受态和水平基因转移能力，结合CRISPR-Cas工具选择性识别和整合突变DNA序列，实现肿瘤DNA的原位检测 | 存在生物安全性、定植效率以及检测灵敏度限制等问题 | 开发用于癌症诊断的工程化细菌生物传感器 | 肿瘤DNA（特别是KRAS突变） | 合成生物学 | 结直肠癌、胃肠道癌及其他实体瘤 | CRISPR-Cas、水平基因转移、同源重组 | NA | DNA序列 | NA | CRISPR-Cas | 多种细菌物种 | 生物传感器、遗传电路、安全电路 | 医学 |
| 4 | 2026-02-24 |
Harnessing endophytes and Multi-Omics for sustainable Colchicine biosynthesis
2026-Feb-18, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-026-04790-8
PMID:41706338
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综述 | 本文综述了利用内生菌和多组学技术促进濒危药用植物Gloriosa superba可持续生产秋水仙碱的系统性策略 | 提出将内生菌生物学与多组学技术、合成生物学整合的系统级合成框架，将秋水仙碱生物合成重新定义为植物-微生物协同代谢网络 | NA | 开发可持续、可扩展的秋水仙碱生产方法，同时支持Gloriosa superba的保护 | Gloriosa superba（植物）、其相关的内生真菌和细菌 | 合成生物学 | 痛风、关节炎、癌症、炎症性疾病 | 多组学分析（转录组学、蛋白质组学、代谢组学）、CRISPR基因组编辑 | NA | NA | NA | CRISPR | 异源微生物宿主 | 秋水仙碱合成途径重建 | 医药 |
| 5 | 2026-02-24 |
T Cell Receptor Co-Stimulation Through Magnetogenetic Tools: A Platform for Wireless Rewiring of Cellular Signaling
2026-Feb-17, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.5c10000
PMID:41726657
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研究论文 | 本文介绍了一种用于T细胞受体共刺激的磁遗传学平台，利用磁场实现T细胞的无创激活 | 开发了一种无线、磁控的磁遗传学工具，作为TCR信号的可调共刺激器，结合抗原刺激增强T细胞激活 | NA | 探索合成生物学策略以控制细胞功能，用于治疗应用，特别是免疫细胞行为的精确调控 | HEK293细胞、Jurkat细胞和原代人T细胞 | 合成生物学 | NA | 钙成像、qPCR、蛋白质组学分析 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | HEK293, Jurkat, 原代人T细胞 | 磁遗传学平台，涉及工程化TRPV1、TRPV4和电磁感知基因（EPG）构建体 | 医学 |
| 6 | 2026-02-24 |
seq2ribo: Structure-aware integration of machine learning and simulation to predict ribosome location profiles from RNA sequences
2026-Feb-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.08.700508
PMID:41726975
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研究论文 | 本文介绍了一种名为seq2ribo的混合模拟与机器学习框架，用于仅基于mRNA序列预测核糖体A位点位置 | 结合了结构感知的TASEP模拟与机器学习抛光模型，无需依赖表达水平数据或基因组背景，在多种细胞类型中实现高保真预测 | 未明确说明模型在极端序列或非典型结构下的泛化能力限制 | 开发一种仅从RNA序列预测核糖体位置分布的工具，以支持合成生物学中的mRNA序列理性设计与优化 | mRNA序列及其对应的核糖体A位点位置 | 机器学习 | NA | 核糖体测序（Ribo-seq）、RNA-seq | 混合框架（结构感知TASEP与抛光模型） | 序列数据 | 多种细胞类型（iPSC、HEK293、LCL、RPE-1） | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 7 | 2026-02-24 |
APMSR: an intelligent QA system for synthetic biology empowered by adaptive prompting and multi-source knowledge retrieval
2026-Feb-05, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-38006-8
PMID:41644613
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研究论文 | 本文提出了一种名为APMSR的优化策略，通过自适应提示生成与多源知识检索相结合，构建了一个面向合成生物学领域的智能问答系统 | 提出了结合自适应提示生成与基于LinUCB算法的动态多源知识检索的优化策略，有效平衡探索与利用，提升了领域特定信息检索的相关性和精确度 | NA | 解决合成生物学领域专业问答中大型语言模型存在的知识鸿沟和幻觉问题，提升问答系统的准确性和鲁棒性 | 面向合成生物学领域的智能问答系统 | 自然语言处理 | NA | 自适应提示生成、多源知识检索、LinUCB算法 | 大型语言模型 | 文本 | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 8 | 2026-02-24 |
Genome Position Does Not Impact Transgene Expression Efficiency in the Ancient Red Alga Cyanidioschyzon merolae
2026-Jan-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.31.703004
PMID:41659391
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研究论文 | 本研究在嗜热嗜酸红藻Cyanidioschyzon merolae中建立了高通量核基因组工程框架，并验证了基因组位置对转基因表达效率无显著影响 | 首次通过实验验证了C. merolae中40个基因间位点作为中性整合位点，并建立了机器人辅助的高通量转化方法 | 研究仅针对C. merolae这一特定藻类物种，结论在其他生物中的普适性尚未验证 | 系统研究基因组位置对转基因表达的影响，建立合成生物学底盘生物的基因组工程平台 | 嗜热嗜酸红藻Cyanidioschyzon merolae | 合成生物学 | NA | 生物信息学基因组分析、液体处理机器人技术、异源蛋白和代谢产物检测 | NA | 基因组数据、蛋白质表达数据、代谢产物数据 | 40个基因间位点（覆盖16条染色体），验证了38个位点 | 同源重组 | Cyanidioschyzon merolae（嗜热嗜酸红藻） | 异源异戊二烯合酶表达系统 | 工业生物技术 |
| 9 | 2026-02-24 |
Rational engineering of combinatorial bacterial therapies for cancer
2026-Jan-28, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-03951-0
PMID:41606628
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综述 | 本文综述了基于合成生物学的工程化细菌在癌症治疗中的最新进展，重点探讨了遗传电路设计如何提升肿瘤特异性、调控治疗递送和激活宿主免疫系统 | 通过组合遗传电路策略实现细菌疗法的可编程时空控制和群体行为调控，推动细菌从简单定植剂向多功能治疗平台的转变 | 未提及具体实验数据或临床转化中的具体技术障碍细节 | 探讨如何通过理性工程化设计下一代微生物癌症疗法 | 工程化细菌及其遗传电路在癌症治疗中的应用 | 合成生物学 | 癌症 | 合成生物学遗传电路设计 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 细菌 | 肿瘤特异性靶向电路、治疗载荷释放调控电路、免疫调节电路、时空控制电路和群体行为电路 | 医学 |
| 10 | 2026-02-24 |
High-throughput yeast engineering in biofoundries: towards autonomous and scalable synthetic biology
2026-Jan-05, FEMS yeast research
IF:2.4Q3
DOI:10.1093/femsyr/foag003
PMID:41591451
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综述 | 本文综述了生物铸造厂如何通过整合自动化、人工智能和标准化工作流程，推动高通量酵母工程向自主化和规模化方向发展 | 提出从DBTL循环向Design-Build-Deploy循环转变的自主化“自动驾驶实验室”概念，并强调国际标准协调与数据治理的重要性 | 存在协议可变性和人工智能工具集成不足等关键障碍 | 探讨生物铸造厂如何加速酵母菌株开发，推动可持续规模化生物制造 | 酵母工程与生物铸造厂 | 合成生物学 | NA | 基因组编辑、表型筛选、预测建模 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 酵母 | NA | 工业生物技术 |
| 11 | 2026-02-24 |
Synthetic transcription factors establish the function of nine amino acid transactivation domains of Komagataella phaffii Mxr1
2025-03, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.108211
PMID:39855340
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研究论文 | 本研究通过构建合成转录因子，系统表征了Komagataella phaffii中Mxr1转录因子的九个氨基酸反式激活结构域（9aaTADs）的功能与机制 | 首次在K. phaffii锌指转录因子中全面鉴定21个推测的9aaTADs，发现其中10个具有功能，并揭示其通过Gcn5介导的组蛋白乙酰化机制激活转录 | 研究主要基于Δmxr1突变株的体外功能验证，体内生理环境下的调控网络及与其他转录因子的相互作用尚未完全阐明 | 探究K. phaffii中Mxr1转录因子的9aaTADs结构域的功能特性与分子机制 | Komagataella phaffii（巴斯德毕赤酵母）的Mxr1转录因子及其9aaTADs结构域 | 合成生物学 | NA | 合成转录因子构建、基因敲除株功能互补、靶基因转录激活分析 | NA | 分子生物学实验数据 | 21个推测的9aaTADs结构域（包括TAD A-V） | 合成生物学设计（合成转录因子构建） | Komagataella phaffii（巴斯德毕赤酵母） | 由Mxr1ZF DNA结合域与串联9aaTADs组成的合成转录因子系统 | 工业生物技术 |
| 12 | 2026-02-23 |
Exosome precision engineering: A comprehensive method for targeted gene and drug delivery
2026-Apr, Pathology, research and practice
DOI:10.1016/j.prp.2026.156369
PMID:41619536
|
综述 | 本文综述了外泌体精准工程作为靶向基因和药物递送载体的最新方法、进展与挑战 | 整合了合成生物学与外泌体工程的最新策略，包括表面靶向修饰、先进装载技术（如远程装载、刺激响应系统）以及用于递送CRISPR/Cas9的基因工程方法 | 面临大规模生产、免疫安全性以及监管审批等挑战 | 探讨工程化外泌体作为多功能平台在精准医疗和疾病治疗中的应用潜力 | 外泌体（作为药物和基因递送载体） | 合成生物学 | 癌症 | CRISPR/Cas9，远程装载，刺激响应系统 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 哺乳动物细胞 | 生物传感器（通过表面配体、抗体或肽实现靶向），刺激响应递送系统 | 医学 |
| 13 | 2026-02-23 |
Energy-driven innovations in computational de novo protein engineering
2026-Mar, Progress in biophysics and molecular biology
DOI:10.1016/j.pbiomolbio.2026.01.005
PMID:41570866
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综述 | 本文系统回顾了能量模型在计算从头蛋白质工程中的关键作用及其驱动创新的方式 | 提出了一个基于精度-成本-通量权衡的方法选择决策框架，并整合了经典力场、量子力学方法与AI驱动预测，为治疗性和工业蛋白质设计提供了协同的物理基础与数据驱动策略路线图 | NA | 推动计算从头蛋白质工程的发展，以设计具有定制功能的新型蛋白质 | 蛋白质 | 计算生物学 | NA | 分子动力学(MD)、热力学积分、蒙特卡洛采样、机器学习(ML)、深度学习(DL) | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物技术, 医学, 合成生物学 |
| 14 | 2026-02-23 |
The dual role of teichoic acids in gram-positive bacteria: Structural diversity dictates pathogenic and probiotic functions
2026-Feb-13, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.150925
PMID:41692204
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综述 | 本文综述了革兰氏阳性细菌中磷壁酸的结构多样性如何决定其致病性和益生功能 | 系统比较了病原体和益生菌中的壁磷壁酸和脂磷壁酸，并探讨了合成生物学方法在重新设计磷壁酸合成中的应用 | NA | 阐明磷壁酸的结构多样性如何调控其与宿主的双重相互作用 | 革兰氏阳性细菌中的磷壁酸 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学方法 | 革兰氏阳性细菌 | NA | 医学, 食品 |
| 15 | 2026-02-23 |
Bio-Oil from Phototrophic Microorganisms: Innovative Technologies and Strategies
2026-Jan-26, Biotech (Basel (Switzerland))
DOI:10.3390/biotech15010011
PMID:41718349
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综述 | 本文综述了利用光养微生物生产生物油的技术与策略，重点讨论了热化学转化技术和生物优化方法的进展 | 强调将先进热化学转化技术与定向生物优化策略有效结合，是实现光养微生物规模化生产生物油的最有前景途径 | NA | 探讨利用光养微生物生产液体生物燃料的可行技术与策略，以支持低碳能源系统转型 | 光养微生物（特别是微藻）及其生物油生产 | NA | NA | 水热液化、快速热解、催化提质（加氢脱氧等）、菌株优化、胁迫诱导、共培养、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 光养微生物（微藻） | NA | 能源 |
| 16 | 2026-02-23 |
Breaking the cell wall for efficient DNA delivery to diatoms
2026-Jan-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68562-6
PMID:41571648
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研究论文 | 本文提出了针对硅藻（特别是三角褐指藻和假微型海链藻）的高效DNA递送方法，包括优化的电穿孔和PEG转化技术 | 开发了高效的DNA递送方法，首次实现Cas9核糖核蛋白复合体在硅藻中的高效递送，并发现硅藻体内组装（DIVA）新机制 | NA | 开发适用于硅藻的遗传工程工具，以提升其作为细胞工厂的利用潜力 | 三角褐指藻（Phaeodactylum tricornutum）和假微型海链藻（Thalassiosira pseudonana） | 合成生物学 | NA | 电穿孔、PEG转化、Cas9核糖核蛋白复合体递送 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 三角褐指藻, 假微型海链藻 | NA | 环境, 能源, 工业生物技术 |
| 17 | 2026-02-22 |
Design and Modeling of Biosensor-Driven Encapsulation Systems for Systemic Delivery of Bacterial Cancer Therapy
2026-Feb-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00598
PMID:41528100
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研究论文 | 本文设计并建模了用于细菌癌症疗法系统递送的生物传感器驱动的封装系统 | 开发了基于群体感应或酸感应的生物传感器驱动封装系统，可自主控制细菌荚膜多糖表达以改善药代动力学特性，并首次建立了双状态药代动力学模型来模拟活体治疗剂的动态行为 | 未在临床环境中验证，模型基于假设参数，需要进一步实验验证 | 改进细菌癌症疗法的系统递送安全性和有效性 | 工程化大肠杆菌Nissle 1917 | 合成生物学 | 癌症 | 基因工程、药代动力学建模 | 双状态药代动力学模型 | 实验数据、模拟数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 生物传感器驱动的基因回路，包含群体感应和酸感应模块，用于自主控制荚膜多糖表达 | 医学 |
| 18 | 2026-02-22 |
Conformation-programmed DNA computing
2026-Feb-20, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aec8383
PMID:41706864
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研究论文 | 本文提出了一种基于构象编程的DNA计算框架，通过整合序列可编程性与构象动力学实现多级信号处理 | 首次将序列可编程性与构象动态信号整合于DNA计算中，通过多聚胸腺嘧啶环实现构象信号编码与放大，并构建了可区分7-15个核苷酸环长的构象感知DNA神经网络 | 未明确说明系统在复杂生物环境中的稳定性与长期运行效果 | 开发能够整合序列与构象维度的自适应DNA计算系统 | DNA分子网络与构象信号处理机制 | 合成生物学 | NA | DNA计算、构象编程、催化发夹组装 | DNA神经网络 | 分子构象信号 | NA | DNA自组装 | NA | 变构DNA计算框架、催化发夹组装系统、microRNA响应型基因调控回路 | 医学、合成生物学 |
| 19 | 2026-02-22 |
Green Biosynthesis of Terpenoid-Derived Flavor and Fragrance Compounds: Advances and Strategic Perspectives
2026-Feb-20, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c08719
PMID:41718042
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综述 | 本文系统综述了萜类香料化合物的绿色生物合成最新进展、关键工程策略及未来研究方向 | 从合成生物学角度系统总结了利用低成本底物、选择兼容宿主菌株以及通过酶修饰、动态通路调控等策略克服萜类生物合成瓶颈的最新进展 | NA | 为萜类化合物的可持续生产提供关键见解和指导 | 萜类及其衍生物（香料和香精化合物） | 合成生物学 | NA | 微生物细胞工厂、酶工程、通路工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 大肠杆菌, 酿酒酵母 | 代谢通路（萜类合成途径）、动态调控回路、细胞区室化设计 | 食品, 工业生物技术 |
| 20 | 2026-02-22 |
A Bacteroides synthetic biology toolkit to build an in vivo malabsorption biosensor
2026-Feb-19, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.12.052
PMID:41610848
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研究论文 | 开发了针对Bacteroides thetaiotaomicron的合成生物学工具包，用于构建体内吸收不良生物传感器 | 首次为Bacteroides thetaiotaomicron开发了包含可抑制启动子、DNA调控系统、模块化转录报告电路和替代质粒整合模式的遗传工具包 | 工具包仅在体外和小鼠模型中验证，尚未在人体中测试 | 开发用于肠道环境监测的非侵入性生物传感器 | Bacteroides thetaiotaomicron细菌及其遗传调控系统 | 合成生物学 | 肠道疾病 | 遗传工程、荧光报告系统 | 生物传感器电路 | 荧光图像数据 | 小鼠模型 | 合成生物学工具包（包含启动子工程、DNA调控系统、报告电路设计） | Bacteroides thetaiotaomicron | 模块化荧光转录报告电路，用于检测肠道渗透压变化 | 医学（肠道健康监测） |