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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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1 | 2025-02-18 |
Regulating Protein Immobilization During Cell-Free Protein Synthesis in Hyaluronan Microgels
2025-Feb-17, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202400668
PMID:39957478
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研究论文 | 本文研究了在透明质酸微凝胶中无细胞蛋白质合成(CFPS)和原位蛋白质积累的相互作用 | 首次使用双功能微凝胶作为实验平台,研究蛋白质合成的时间和空间调控 | 研究仍处于初步阶段,需要进一步验证和优化 | 研究无细胞蛋白质合成和蛋白质在微凝胶中的积累 | 透明质酸微凝胶和His标签修饰的GFP | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白质合成(CFPS) | NA | NA | NA |
2 | 2025-02-18 |
In vivo self-assembled siRNAs within small extracellular vesicles attenuate LRRK2-induced neurodegeneration in Parkinson's disease models
2025-Feb-10, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society
IF:10.5Q1
DOI:10.1016/j.jconrel.2024.12.045
PMID:39722304
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研究论文 | 本研究开发了一种合成生物学策略,通过小细胞外囊泡(sEVs)将LRRK2的小干扰RNA(siRNAs)自组装并递送至黑质,以减轻帕金森病(PD)模型中的神经退行性变 | 利用遗传电路(裸DNA质粒形式)实现siRNA的自组装和递送,通过sEVs将siRNA靶向递送至黑质,为PD治疗提供了新的策略 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中进行验证 | 开发一种通过sEVs递送siRNA以减轻PD模型中LRRK2诱导的神经退行性变的治疗策略 | LRRK2R1441G小鼠模型 | 合成生物学 | 帕金森病 | siRNA自组装和递送 | 遗传电路 | NA | 两种小鼠模型 |
3 | 2025-02-18 |
Bacterial and bacterial derivatives-based drug delivery systems: a novel approach for treating central nervous system disorders
2025-Feb, Expert opinion on drug delivery
IF:5.0Q1
DOI:10.1080/17425247.2024.2444364
PMID:39688950
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综述 | 本文综述了基于细菌及其衍生物的药物递送系统在治疗中枢神经系统疾病中的最新研究进展 | 利用细菌及其衍生物作为药物递送系统,通过其独特的趋化性、生物相容性和靶向能力,克服传统方法的限制,实现精确药物递送 | 生物安全性、免疫排斥和规模化生产等挑战仍需解决 | 探索细菌及其衍生物作为药物递送系统在中枢神经系统疾病治疗中的应用 | 缺血性脑损伤、神经退行性疾病和胶质瘤 | 生物医学工程 | 中枢神经系统疾病 | 基因工程、合成生物学和纳米技术 | NA | NA | NA |
4 | 2025-02-18 |
Synthetic transcription factors establish the function of nine amino acid transactivation domains of Komagataella phaffii Mxr1
2025-Jan-22, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.108211
PMID:39855340
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研究论文 | 本研究通过合成转录因子揭示了Komagataella phaffii Mxr1中九个氨基酸转录激活域(9aaTADs)的功能 | 首次全面表征了K. phaffii锌指转录因子中的9aaTADs,揭示了其通过Gcn5介导的组蛋白乙酰化在转录激活中的关键作用 | 研究仅针对K. phaffii中的Mxr1转录因子,未扩展到其他物种或转录因子 | 研究K. phaffii Mxr1转录因子中9aaTADs的功能及其在乙醇和甲醇代谢中的作用 | K. phaffii Mxr1转录因子及其9aaTADs | 合成生物学 | NA | 合成转录因子构建与功能分析 | NA | 基因表达数据 | K. phaffii Δmxr1菌株及其突变体 |
5 | 2025-02-17 |
Mechanisms and applications of bacterial luciferase and its auxiliary enzymes
2025-Mar, Archives of biochemistry and biophysics
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.abb.2025.110307
PMID:39824239
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研究论文 | 本文探讨了细菌荧光素酶(LuxAB)及其辅助酶的机制和应用 | 最近的研究阐明了C4a-氢过氧黄素形成的机制,并识别了关键催化残基如His44,这些残基促进了光生成中重要的黄素中间体的生成 | 实现红移发射、优化信号强度以及识别与发光物种生成相关的机制等挑战性问题仍有待探索 | 研究目的是更好地理解LuxAB反应,并探索其在生物技术和生物医学应用中的潜力 | 细菌荧光素酶(LuxAB)及其辅助酶 | 生物技术 | NA | 蛋白质工程和合成生物学 | NA | NA | NA |
6 | 2025-02-17 |
Metabolite-Responsive Control of Transcription by Phase Separation-Based Synthetic Organelles
2025-Feb-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00633
PMID:39954260
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研究论文 | 本文通过基于液-液相分离的合成细胞器,将代谢信号转化为基因转录的调控 | 开发了一种基于液-液相分离的合成细胞器,能够将代谢信号转化为基因转录的调控,为合成生物学提供了新的材料方法 | NA | 开发具有生命感知和适应能力的合成材料 | 合成细胞器及其在基因转录调控中的应用 | 合成生物学 | NA | 液-液相分离 | NA | NA | NA |
7 | 2025-02-17 |
A novel NAC36-MYB18-TAT2 model regulates the synthesis of phenolic acid in Salvia miltiorrhiza Bunge
2025-Feb-12, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.140987
PMID:39952526
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研究论文 | 本文揭示了丹参中NAC36-MYB18-TAT2分子模型调控酚酸合成的分子机制 | 首次报道了SmTAT2在丹参中的生物学功能及其调控机制,并揭示了NAC36-MYB18-TAT2分子模型在酚酸合成中的作用 | NA | 研究丹参中酚酸合成的分子机制及其调控 | 丹参(Salvia miltiorrhiza Bunge) | 合成生物学 | NA | 转基因实验(过表达和CRISPR/Cas9)、分子相互作用实验(酵母单杂交、双荧光素酶报告基因实验和电泳迁移率实验) | NAC36-MYB18-TAT2分子模型 | 分子生物学数据 | NA |
8 | 2025-02-17 |
DNAdesign: feature-aware in silico design of synthetic DNA through mutation
2025-Feb-04, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf052
PMID:39891349
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研究论文 | DNAdesign是一个基于网络的工具,用于基于DNA序列和形状特征比较和设计突变 | DNAdesign能够同时考虑序列突变引起的不同读取模式的改变,提供基于DNA序列和形状特征的突变设计 | NA | 研究基因调控和合成生物学应用,如合成增强子和转录因子结合位点的设计 | DNA序列和形状特征 | 生物信息学 | NA | Deep DNAshape | NA | DNA序列 | NA |
9 | 2025-02-17 |
Genetic retargeting of E3 ligases to enhance CAR T cell therapy
2024-Feb-15, Cell chemical biology
IF:6.6Q1
DOI:10.1016/j.chembiol.2023.10.024
PMID:37989314
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研究论文 | 本文开发了一种双功能融合蛋白,通过将目标蛋白与E3连接酶复合物桥接,强制目标泛素化和降解,以增强CAR T细胞疗法的抗肿瘤效力 | 开发了条件性降解策略,包括可诱导的降解转基因表达或小分子依赖的E3招募,并设计了针对SMAD2和SMAD3的降解剂,以阻断TGFβ信号传导 | NA | 增强CAR T细胞疗法的抗肿瘤效力 | CAR T细胞 | 合成生物学 | 癌症 | E3连接酶复合物 | NA | NA | NA |
10 | 2025-02-17 |
Noncanonical Streptococcus sanguinis ComCDE circuitry integrates environmental cues in transformation outcome decision
2024-Feb-15, Cell chemical biology
IF:6.6Q1
DOI:10.1016/j.chembiol.2023.09.007
PMID:37832551
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研究论文 | 本文研究了血链球菌中一种新型的竞争-捕食协调机制,揭示了其ComCDE电路在环境信号整合中的作用 | 发现了血链球菌中不同于其他链球菌的ComCDE电路,揭示了其独特的CSP前体切割模式和ABC转运蛋白的作用,并发现了一个ComCDE依赖的细菌素基因座 | NA | 探索血链球菌中自然竞争状态的调控机制及其在进化中的作用 | 血链球菌(Streptococcus sanguinis) | 合成生物学 | NA | 合成生物学设备 | NA | NA | NA |
11 | 2025-02-16 |
Advancing cellulose utilization and engineering consolidated bioprocessing yeasts: current state and perspectives
2025-Feb-13, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-025-13426-0
PMID:39939397
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综述 | 本文综述了在酿酒酵母中表达纤维素酶的策略,并探讨了通过现代合成生物学工具优化CBP酵母菌株的潜力 | 总结了在酿酒酵母中表达纤维素酶的最新进展,并探讨了通过现代合成生物学工具优化CBP酵母菌株的潜力 | 尽管已经报道了将纤维素底物一步转化为乙醇的方法,但其产量和生产率远低于工业要求 | 探讨将木质纤维素生物质转化为生物燃料和绿色化学品的生物转化策略 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 合成生物学 | NA | 纤维素酶表达系统 | NA | NA | NA |
12 | 2025-02-16 |
Study on the framework of ATP energy cycle system in Escherichia coli
2025-Feb-12, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-024-13350-9
PMID:39937288
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研究论文 | 本研究旨在开发一种快速、无标记、多站点、多拷贝的基因组编辑系统,以推进合成生物学在Escherichia coli中的应用 | 识别并高效表达了ATP合成途径中的ppk基因(No.8),并利用MUCICAT技术将其插入E.coli基因组的不同位置和拷贝数,实现了不同活性水平 | 研究主要集中在E.coli中,未涉及其他生物体 | 开发一种快速、无标记、多站点、多拷贝的基因组编辑系统,以推进合成生物学 | Escherichia coli | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9, MUCICAT | NA | 基因组数据 | NA |
13 | 2025-02-16 |
Oligonucleotide subsets selection by single nucleotide resolution barcode identification
2025-Feb-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-56856-0
PMID:39939320
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研究论文 | 本文介绍了一种利用序列特异性循环核苷酸合成和模板寡核苷酸阻断的寡核苷酸子集选择方法 | 该方法无需引物进行选择性杂交,并能够以少于五个核苷酸的条形码长度编码和选择数百个子集,增强了寡核苷酸库的可编程性 | NA | 旨在解决复杂寡核苷酸库中子集选择的问题,提高基因组学、合成生物学和DNA数据存储领域的效率和成本效益 | 寡核苷酸库 | 合成生物学 | NA | 序列特异性循环核苷酸合成 | NA | NA | NA |
14 | 2025-02-16 |
Multiscale Mathematical Modeling in Systems Biology: A Framework to Boost Plant Synthetic Biology
2025-Feb-05, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants14030470
PMID:39943032
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综述 | 本文探讨了多尺度数学建模在植物合成生物学中的应用,以评估和减轻相关风险 | 提出了将多尺度数学建模与农业数据分析技术结合,以全面理解作物在不同生物尺度上的表现 | 多尺度数学建模在植物中的应用仍然不足 | 通过多尺度数学建模提高植物合成生物学的安全性,增强作物对病虫害和干旱的抵抗力 | 玉米(Zea mays L.) | 系统生物学 | NA | 参数估计、分岔分析、敏感性分析 | 多尺度数学模型 | 农业数据 | NA |
15 | 2025-02-16 |
Efficient Site-Directed Mutagenesis Mediated by Primer Pairs with 3'-Overhangs
2025-Feb, Current protocols
DOI:10.1002/cpz1.70104
PMID:39945594
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研究论文 | 本文介绍了一种优化的定点诱变方案,利用具有3'端突出部分的引物对提高诱变效率和降低错误率 | 通过使用部分互补的引物对和3'端突出部分,显著提高了定点诱变的效率和成功率,同时减少了错误率和所需时间 | 需要熟练的实验人员进行操作,且依赖于高转化效率的细菌细胞 | 开发一种更高效、可靠的定点诱变方法,用于分子生物学、蛋白质工程、质粒工程和合成生物学 | 定点诱变引物对和高转化效率的DH5α细菌细胞 | 分子生物学 | NA | 定点诱变技术 | NA | NA | 每个诱变反应通常需要分析3个菌落,熟练的实验人员可在一周内构建1到2打突变质粒 |
16 | 2025-02-16 |
The Establishment of Artificial RNA Cascade Circuits for Gene Regulation Based on Doxycycline-Induced Pre-mRNA Alternative Splicing
2025-Jan-29, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26031163
PMID:39940931
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研究论文 | 本研究开发了一种基于多西环素诱导的前mRNA选择性剪接的人工RNA级联电路,用于基因调控 | 通过将RNA核糖开关和TetR适配体整合到必需基因外显子中,意外获得了具有完全相反调控功能的'开-关'开关CTM和C2ITetR>4A,并创建了内含子剪接的双开关RNA级联系统 | NA | 开发一种基于多西环素诱导的前mRNA选择性剪接的人工RNA级联电路,用于基因调控 | 肿瘤细胞 | 合成生物学 | 肿瘤 | RNA剪接调控 | NA | 基因表达数据 | NA |
17 | 2025-02-16 |
Colored Proteins Act as Biocolorants in Escherichia coli
2025-Jan-21, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules30030432
PMID:39942539
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研究论文 | 本文探讨了彩色蛋白质在大肠杆菌中作为生物着色剂的应用,特别是GfasPurple在不同条件下的稳定性 | 研究发现GfasPurple在高温、乙醇、酸碱等恶劣条件下具有优异的耐受性,并通过突变扩展了色蛋白的颜色库 | 研究主要集中在大肠杆菌中,未涉及其他生物体或更广泛的应用场景 | 研究彩色蛋白质作为生物着色剂的潜力及其在不同条件下的稳定性 | 大肠杆菌及多种彩色蛋白质(如eGFP、sfGFP、mKate2、GfasPurple等) | 合成生物学 | NA | 突变技术、吸收光谱分析 | NA | 实验数据、光谱数据 | 多种彩色蛋白质及其突变体 |
18 | 2025-02-16 |
Active learning of enhancers and silencers in the developing neural retina
2025-Jan-15, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2024.12.004
PMID:39778579
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研究论文 | 本文提出了一种主动学习方法,用于训练能够区分增强子和沉默子的模型,这些增强子和沉默子由光感受器转录因子CRX的结合位点组成 | 通过结合合成生物学和不确定性采样,生成多轮大规模并行报告实验数据,迭代训练模型,使其能够区分具有相同序列但功能相反的CRX位点 | 模型训练依赖于CRX结合位点的基因组数据,可能无法推广到其他转录因子或不同的细胞环境 | 开发一种能够区分增强子和沉默子的模型,以解释转录因子在不同环境下的激活或抑制功能 | 光感受器转录因子CRX的结合位点 | 机器学习 | NA | 主动学习、合成生物学、大规模并行报告实验 | 深度学习模型 | 基因组序列数据 | 几乎所有的CRX结合位点 |
19 | 2025-02-16 |
Enhancing active ingredient biosynthesis in Chinese herbal medicine: biotechnological strategies and molecular mechanisms
2025, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.18914
PMID:39950047
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综述 | 本文探讨了现代生物技术在中草药活性成分生物合成增强中的潜力,包括其化学组成、生物合成途径、分子调控机制以及提取和合成生产策略 | 整合了生物合成、分子调控、提取方法和合成生物学的见解,提出了增强中草药活性成分生产的理论和实践指导 | 未提及具体实验数据或案例研究,主要基于现有文献和理论分析 | 增强中草药活性成分的生物合成,促进其在现代医学中的广泛应用 | 中草药的活性成分 | 生物技术 | NA | 代谢工程、合成生物学工具 | NA | NA | NA |
20 | 2025-02-16 |
Synthetic biology in Mexico: Brief history, current landscape, and perspectives towards a bio-based economy
2025 Jan-Dec, Engineering biology
DOI:10.1049/enb2.12037
PMID:39950160
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综述 | 本文综述了合成生物学在墨西哥的发展历史、现状及向生物经济转型的展望 | 强调了iGEM竞赛在推动墨西哥合成生物学发展中的重要作用,并概述了当前的教育、公民科学倡议以及研究和工业景观 | 未具体提及研究方法的局限性 | 探讨合成生物学在墨西哥的发展及其对生物经济的潜在贡献 | 墨西哥的合成生物学发展 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |