合成生物学相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 工程工具 宿主生物 回路设计 应用领域
1 2026-06-06
Autoinducer 2 as a universal language in microbial consortia: decoding molecular mechanisms, ecological impacts, and application
2026-Dec-31, Gut microbes IF:12.2Q1
综述 系统综述AI-2的双重结构动态、受体多样性及其在菌群互作中的调控机制 首次系统整合AI-2双重结构动态(S-THMF-硼酸盐/R-THMF互变)及其在细菌间通讯中的环境依赖性角色,并梳理受体多样性(如LuxP与LsrB)及信号传导机制 未深入探讨空间异质性对AI-2介导通讯的影响及多群体感应系统协调的机制 解码AI-2作为通用语言在菌群通讯中的作用,并绘制其在化学工程与环境可持续性中的应用路线 AI-2信号分子及其介导的微生物群落互作 微生物组学 NA NA NA NA NA NA NA NA 健康, 农业, 工业, 环境生态
2 2026-06-06
Melatonin-enabled omics: understanding plant responses to single and combined abiotic stresses for climate-smart agriculture
2026-Dec, GM crops & food
综述 本文综述了褪黑素在基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学等多组学层面调控植物应对单一和复合非生物胁迫的机制,并探讨了多组学整合(泛组学)方法及遗传工程和合成生物学在气候变化智慧农业中的应用潜力 首次系统整合褪黑素在多组学层面(基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学、miRNA组学、表观基因组学、表型组学、离子组学、微生物组学)调控植物非生物胁迫耐受性的机制,并强调多组学交叉和泛组学方法的应用 作为综述,未提供新的实验数据,且各研究间方法、物种和胁迫条件差异较大,限制了结论的直接可比性 阐明褪黑素通过多组学调控植物应对单一和复合非生物胁迫的机制,并为培育气候智慧型作物提供策略 植物在单一和复合非生物胁迫下的多组学响应 机器学习 NA 多组学技术(基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学、miRNA组学、表观基因组学、表型组学、离子组学、微生物组学) NA 多组学数据 NA 遗传工程、合成生物学 植物 NA 农业
3 2026-06-06
Astaxanthin biomanufacturing under hierarchical constraints: Integrating synthetic biology and artificial intelligence for scalable production
2026-Sep, Biotechnology advances IF:12.1Q1
综述 本文重新构想虾青素生物合成是一个层级约束管理问题,并提出一个层级对齐的AI辅助框架,以实现可规模化生产 将人工智能从通用预测工具转化为结构化的方法论,通过与生物层级显式对齐,链接表型观察、通路推理和分子设计,减少对经验试错的依赖 该框架是概念性的,需在具体实验系统中验证,且AI辅助设计需大量高质量多组学数据支持 解决虾青素生物制造中的层级约束问题,提出基于合成生物学与人工智能的可规模化生产框架 虾青素生物合成路径及相关的分子、通路和系统层级约束 合成生物学 NA 蛋白语言模型、图学习模型、卷积神经网络、多模态学习、大型语言模型 蛋白语言模型、图神经网络、卷积神经网络、多模态学习模型、大型语言模型 序列数据、网络拓扑数据、多组学数据、表型图像数据 NA NA NA 代谢通路优化 工业生物技术
4 2026-06-06
Discovering what is possible: How synthetic biology illuminates development
2026-Jun-04, Cell systems IF:9.0Q1
综述 探讨合成生物学如何通过自下而上的方法阐明胚胎发育的一般原理和因果机制 强调合成系统虽简化但能测试发育潜力极限、厘清因果关系并为预测模型提供依据 未明确讨论合成系统与自然系统的差异及简化带来的潜在偏差 理解多细胞组织如何从细胞间相互作用中涌现 合成生物学重建的发育过程(干细胞与合成生物学重建的类胚胎系统) 合成生物学、发育生物学 NA 基因工程、成像技术、计算建模 NA NA NA 基因组工程 NA NA 医学、发育生物学研究
5 2026-06-06
Living buildings with living electronics: towards biologically intelligent biohybrids
2026-Jun-04, Trends in biotechnology IF:14.3Q1
观点文章 探讨将电活性生物膜作为生物智能组件融入建筑,实现从实验室原型到集成架构的转型 提出将电活性生物膜编程为生物晶体管和逻辑处理器等生物智能组件,而非简单生物催化剂,实现建筑功能化 未明确提及局限,可能涉及从实验室原型到实际建筑集成的技术挑战和规模化问题 规划电活性生物膜混合生物-人工系统从实验室原型向分布式资源回收集成架构的转型路线 电活性生物膜及其在建筑中的应用 合成生物学 NA 合成生物学、人工智能 NA NA NA 合成生物学 电活性生物膜 生物晶体管、逻辑处理器 建筑、环境、工业生物技术
6 2026-06-06
Untapped microbial factories for next-generation therapeutics: Endophytic fungi of medicinal plants
2026-Jun-04, Microbial cell factories IF:4.3Q1
综述 探讨药用植物内生真菌作为下一代治疗药物可持续来源的潜力 系统综述了多组学技术与合成生物学在激活沉默基因簇和提高代谢物产量中的应用,并提出了产业化面临的挑战与解决方案 大规模生产中产量低、沉默基因簇难激活、规模化困难仍是主要障碍 揭示内生真菌作为生物工厂生产生物活性次级代谢物的潜力及未来研究方向 药用植物内生真菌及其产生的生物活性次级代谢物 天然产物发现与生物技术 癌症、感染性疾病、炎症、糖尿病 OSMAC共培养、表观遗传修饰、基因组学、转录组学、代谢组学 NA 基因组、转录组、代谢组数据 NA 合成生物学工具 药用植物内生真菌 生物合成基因簇调控与代谢途径工程 医药、环境友好型制药
7 2026-06-06
Genetic encoding of multiple distinct noncanonical amino acids
2026-Jun, Trends in biochemical sciences IF:11.6Q1
综述 本文综述了在遗传编码中同时引入多种非规范氨基酸的研究进展 介绍了利用相互正交的翻译系统和扩展密码子库实现多种非规范氨基酸同时编码的突破性技术,特别是哺乳动物系统中稀有密码子重新编码与终止密码子抑制的整合实现了五种不同非规范氨基酸的遗传编码 未明确阐述当前技术的局限性 总结在遗传编码中同时编码多种不同非规范氨基酸的变革性进展 多种非规范氨基酸及其遗传编码系统 合成生物学 NA 遗传编码, 非规范氨基酸(ncAA)引入, 密码子重新编码, 终止密码子抑制 NA NA NA NA 哺乳动物细胞 NA 医药, 合成生物学
8 2026-06-06
Antimicrobial discovery from underexplored environments: unlocking specialized metabolism
2026-Jun, Current opinion in microbiology IF:5.9Q1
综述 探讨从未充分探索环境中发现抗生素的新策略,重点介绍先进培养技术、多组学、合成生物学和人工智能如何解锁隐秘的微生物代谢途径以应对抗生素耐药性危机 整合生态学、组学、合成生物学和人工智能等新兴方向,覆盖从稀有微生物群落到古菌及古代蛋白质组挖掘的跨维度创新方法 未具体讨论这些新策略在实际应用中的可扩展性、成本效益及潜在生态环境影响 总结和推进从新环境中发现抗生素的研究方向,填补抗生素发现创新缺口 常规土壤微生物以外的未被充分探索的微生物资源(稀有分类群、古菌、未培养微生物、古代蛋白质组) 机器学习 抗微生物耐药性相关疾病 多组学、合成生物学、人工智能 NA NA NA NA NA NA 医学, 工业生物技术
9 2026-06-06
Systematic Reprogramming of Rhodobacter sphaeroides for Efficient Biosynthesis of Coenzyme Q10 and Porphyrins
2026-May-26, ACS synthetic biology IF:3.7Q1
综述 系统总结了通过代谢工程和合成生物学手段改造光合细菌Rhodobacter sphaeroides以高效合成辅酶Q10和卟啉类化合物的研究进展 首次全面梳理了Rhodobacter sphaeroides作为微生物底盘在萜类和四吡咯生物合成中的代谢灵活性及工程改造策略 未涉及大规模工业生产中成本控制和长期稳定性挑战 评估并展示Rhodobacter sphaeroides作为平台生物在合成生物学和工业生物生产中的应用潜力 紫色非硫光合细菌Rhodobacter sphaeroides 合成生物学 NA 代谢工程, 合成生物学, 发酵控制 NA NA NA NA Rhodobacter sphaeroides 萜类和四吡咯生物合成途径 工业生物技术, 医药
10 2026-06-06
Engineering an Artificial Taxol Biosynthetic Pathway from Baccatin III in Yeast
2026-May-26, ACS synthetic biology IF:3.7Q1
研究论文 本文在酵母中构建了一条人工紫杉醇生物合成途径,从巴卡亭III出发仅需三步酶促反应即可转化为紫杉醇 构建了一条人工途径替代天然复杂途径,利用β-苯丙氨酰辅酶A连接酶的广泛底物范围和结构-活性分析改造BAPT酶以提高对非天然底物的催化效率 目前该途径仍处于酵母工程初步阶段,可能面临产量和可扩展性等瓶颈挑战 利用合成生物学实现紫杉醇的可持续生产,解决其半合成方法成本高和条件苛刻的问题 酵母细胞以及紫杉醇生物合成相关酶(PCL和BAPT) 合成生物学 癌症 代谢工程 NA NA NA 酵母代谢工程 酿酒酵母 人工紫杉醇生物合成途径(将巴卡亭III转化为紫杉醇的三步酶促途径) 医学, 工业生物技术
11 2026-06-06
Decoding heavy metal tolerance in rice: Nucleic acid-based technologies shaping global food security
2026-May-25, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1
综述 回顾核酸基技术在提升水稻重金属耐受性中的应用,从QTL定位到CRISPR编辑及多组学分析的最新进展 系统梳理了从QTL定位、群体GWAS、泛基因组到CRISPR基因组编辑的完整技术演化路径,整合转录组、表观基因组和宏基因组工具揭示重金属耐受机制 特异性与必需性困境、多金属拮抗(镉/砷氧化还原冲突)以及调控分歧(SDN-1豁免与转基因分类差异)构成主要障碍 阐明核酸基技术如何重构水稻重金属耐受性的发现到部署流程,保障全球粮食安全 水稻(特别是镉和砷耐受性与低累积品系) 机器学习 肺癌 QTL定位,GWAS,CRISPR-Cas9,转录组学,表观基因组学,宏基因组学 NA 基因组数据,转录组数据,表观基因组数据,宏基因组数据 NA CRISPR-Cas9 水稻 NA 农业,食品
12 2026-06-06
Bottom-Up Creation of Virus-like Particles via Post-Insertion of Protein-Lipid Conjugates
2026-May-20, ACS synthetic biology IF:3.7Q1
research paper 本文报道了一种通过将蛋白-脂质偶联物后插入到预先形成的脂质体中,自下而上生成病毒样颗粒的方法 利用SNAP-tag/BG生物正交反应实现蛋白-脂质共价偶联,并实现无洗涤剂插入脂质双层,解耦偶联物设计与脂质体设计,促进病毒样颗粒的快速系统优化 NA 开发一种自下而上的方法生成脂质体病毒样颗粒,用于疫苗递送和合成生物学等应用 SARS-CoV-2 Spike蛋白与绿色荧光蛋白(GFP)构建的病毒样颗粒 synthetic biology COVID-19 NA NA NA NA SNAP-tag/BG反应 Expi293F细胞 蛋白-脂质偶联物后插入脂质体形成病毒样颗粒 medicine, vaccine development, drug delivery, synthetic biology
13 2026-06-06
Bibliometric-Based Analysis of Global Trends and Collaborative Networks in Plant Genetic Engineering (1994-2024)
2026-May, Plant biotechnology journal IF:10.1Q1
综述 对1994-2024年间植物基因工程领域的全球趋势和合作网络进行文献计量分析 首次系统揭示植物基因工程领域的国际合作双核心结构,并预测未来技术方向包括种质数字化、多基因编辑、智能育种和合成生物学 NA 系统分析植物基因工程全球趋势及合作网络 全球植物基因工程相关文献 文献计量学 NA 文献计量分析 NA 文本 1994-2024年全球文献数据 CRISPR-Cas9, 农杆菌介导转化, RNA干扰 烟草 NA 农业
14 2026-06-06
A synthetic gene circuit to convert biochemical signals to electrical signal in engineered sensory bacteria for electrochemical biosensing
2026-Apr-15, Biosensors & bioelectronics IF:10.7Q1
研究论文 构建了一个综合合成基因电路,将生物化学信号(NO)转化为电信号,实现电化学生物传感 通过合成生物学工具设计间接电子传递(IET)通路,结合NO响应模块和PCA合成模块,创制电活性细菌以增强电信号输出,首次实现单细胞水平NO的原位电化学检测 受限于合成基因电路的复杂性和工程改造细菌的稳定性,实际应用可能面临长期运行和转化效率挑战 开发基于工程电活性微生物的电化学生物传感器,用于细胞内信号分子的高灵敏检测 作为电活性细菌模型的大肠杆菌(Escherichia coli),以及信号分子一氧化氮(NO) 合成生物学、电化学生物传感 NA 合成生物学、电化学检测、间接电子传递通路、基因电路工程 NA 电化学信号数据 单细胞水平检测,具体样本数量未提及 Synthetic Biology, 基因电路设计 大肠杆菌 (Escherichia coli) NO响应模块与PCA合成模块耦合的合成基因电路,实现生化信号转电信号 医学(如生物传感诊断)、环境监测、生物技术
15 2026-06-06
One-step construction of robust protocells and prototissues in water
2026-Apr-08, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 提出一种气液微流控辅助扩散抑制络合策略,实现原细胞和原组织的一步法稳健构建 首次实现低成本、高通量原细胞制造及厘米级三维原组织精确构建,所得原组织在水和空气中均具良好机械完整性 未说明具体限制 开发稳健原细胞和原组织的构建方法并模拟复杂生命行为 原细胞和原组织 NA NA 气液微流控辅助扩散抑制络合 NA NA NA NA NA NA 合成生物学, 生物工程
16 2026-06-06
Protein coacervation-driven active forces power protocell dynamics
2026-Apr-07, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 构建温度响应弹性蛋白原细胞模型,研究蛋白质凝聚驱动主动力及力学放大机制 首次通过蛋白质液-液相分离(LLPS)在无ATP驱动下产生可调收缩力,并利用数学模型证明皮牛级力可放大至宏观机械功 力放大机制的具体分子细节和体内应用验证尚未涉及 探索蛋白质凝聚体的力学协调与力缩放原理,为合成生物学和软体机器人提供驱动力模型 温度响应弹性蛋白原细胞模型 合成生物学 NA 蛋白质工程、液-液相分离(LLPS)、数学模型建模 热力学模型(基于弹性蛋白相分离) NA NA 蛋白质工程(弹性蛋白交联) NA 温度响应弹性蛋白膜收缩回路(含LLPS复合物包裹与排出机制) 合成生物学, 生物材料, 软体机器人
17 2026-06-06
Engineering microbial therapeutics for metabolic disorders: synthetic biology strategies and future direction
2026-Apr, Current opinion in biotechnology IF:7.1Q1
review 综述利用合成生物学设计工程微生物疗法治疗代谢紊乱的策略和未来方向 提出将合成生物学应用于工程益生菌和微生物系统作为自我调节的活体疗法,实现精准治疗与可持续生物生产的融合 主要讨论临床前研究,缺乏临床应用的详细分析和挑战 评估合成生物学如何使工程益生菌和微生物系统成为治疗代谢紊乱的自调节疗法 代谢紊乱,包括2型糖尿病、肥胖症和代谢功能障碍相关脂肪性肝炎等 NA 代谢紊乱 NA NA NA NA NA 微生物宿主 可分泌治疗分子、降解有害代谢物、重塑宿主代谢微环境、响应生理信号的自适应反馈控制回路 医学
18 2026-06-06
The disputed identity of Pseudomonas putida KT2440: when taxonomists rename your favorite microbe
2026-Mar-11, mBio IF:5.1Q1
评论 讨论了假单胞菌KT2440的分类学重新命名引发的争议,强调社区实践和历史连贯性在命名中的重要性 率先质疑了自上而下的分类重新命名决策,提出了在微生物命名中需平衡系统发育分析与社区实践的论点 主要基于单一菌株案例,未涉及更广泛的命名争议或量化分析命名变更的实际影响 探讨KT2440菌株重新命名的合理性,倡导保留传统名称或通过广泛协商寻求替代方案 假单胞菌KT2440菌株 微生物学 NA 系统发育分析 NA 系统发育数据 单一菌株(KT2440) NA NA NA NA
19 2026-06-06
Next generation CAR-T cells to tackle solid tumors
2026-Mar-10, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society IF:10.5Q1
综述 综述了下一代CAR-T细胞疗法在实体瘤中的应用,重点介绍了克服抗原特异性、肿瘤微环境等障碍的创新设计 系统比较了逻辑门控、多输入CAR设计、细胞因子受体共表达、装甲CAR等合成生物学方法,以突破实体瘤治疗挑战 未具体讨论临床转化中的安全性评估、生产成本或长期疗效数据 指导未来研究并加速CAR-T疗法从血液癌症向实体瘤的转化 新一代CAR-T细胞构建体及其在实体瘤治疗中的设计策略 数字病理学 实体瘤 NA NA NA NA NA 人类T细胞 逻辑门控系统,多输入CAR设计,细胞因子受体共表达,装甲CAR,嵌合开关受体,显性负受体 医学
20 2026-06-06
Advances in artificial cells capable of metabolic mimicry: from fundamentals to applications
2026-Mar-09, Chemical Society reviews IF:40.4Q1
综述 综述了能够模拟代谢的人工细胞从基础原理到应用的研究进展 系统总结了基于不同物理特性的人工细胞用于代谢模拟的优势与局限,并涵盖了能量生成、合成代谢和分解代谢的多种策略 未提及具体实验验证或定量比较不同人工细胞系统的性能 为设计和部署人工代谢系统提供见解,推动下一代合成生物学工具的发展 人工细胞系统 合成生物学 NA NA NA NA NA NA NA 代谢模拟回路(包括能量生成、碳固定、脂质合成、蛋白质表达及碳氮代谢分解途径) 生物传感, 疾病诊断
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