合成生物学相关文章
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当前共找到 4897 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-05-05 |
Engineering the Liquid-to-Solid Transition of Biomolecular Condensates: Molecular Mechanisms, Control Strategies, and Applications
2026-May-03, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.73582
PMID:42070290
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综述 | 系统梳理了生物分子凝聚体从液态到固态转变的分子机制、控制策略及应用 | 整合生物物理学、合成生物学和材料科学，首次全面阐述液固转变的分子语法、时空控制工程策略及在生物系统设计中的新兴应用 | 当前对液固转变的精确时空控制仍面临挑战，未来需进一步探索其在系统化学和合成生物学中的设计原则 | 探讨生物分子凝聚体液固转变的工程化调控及其在疾病治疗和合成生物学中的应用 | 生物分子凝聚体及其液固转变过程 | 合成生物学 | NA | 液-液相分离观察技术、分子工程方法 | NA | NA | NA | NA | NA | 液固转变调控回路 | 医学、系统化学、合成生物学 |
| 2 | 2026-05-05 |
Deep learning architectures achieve state-of-the-art (SOTA) accuracy in protein secondary structure prediction
2026-May-03, Molecular diversity
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s11030-026-11570-x
PMID:42071121
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综述 | 本文综述了深度学习架构在蛋白质二级结构预测中达到最先进精度的最新进展 | 系统总结了混合模型设计、基准数据集和评估指标的最新进展，并讨论了未来方向如跨物种验证、不确定性感知建模和异构生物数据整合 | 当前方法存在数据依赖性和数据集偏差问题 | 综述深度学习在蛋白质二级结构预测领域的进展并指出未来方向 | 蛋白质二级结构预测方法 | 深度学习 | NA | NA | CNN, RNN, Transformer, AlphaFold2 | 蛋白质序列数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 药物开发, 疾病研究 |
| 3 | 2026-05-05 |
Multi-Targeting Non-Specific Genome Engineering in Bacteria
2026-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202521532
PMID:41801001
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研究论文 | 开发了一种基于多靶向整合酶系统的通用基因组工程方法MNGE，用于在多种细菌中实现多拷贝、高度随机的基因整合 | 首次开发了不依赖宿主的多靶向非特异性基因组工程方法MNGE，基于多靶向整合酶系统实现了在革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌中基因或代谢途径的多拷贝高度随机整合 | 未明确说明局限性，但可能涉及对非TT核心序列的潜在脱靶效应或大型基因簇整合效率的进一步优化需求 | 开发一种通用且高效的基因组工程方法，用于在多种细菌中实现代谢基因或通路的多拷贝随机整合，以提高高价值化合物的产量 | 革兰氏阳性菌（链霉菌属和糖多孢菌属）及革兰氏阴性菌（伯克霍尔德菌属和紫色杆菌属） | 合成生物学 | NA | MNGE（多靶向非特异性基因组工程）、多靶向整合酶系统 | NA | NA | 涉及四个菌株（链霉菌、糖多孢菌、伯克霍尔德菌、紫色杆菌）及两个基因簇（UK-2 BGC 41kb、盐霉素BGC 106kb、FR900359 BGC 66kb） | 多靶向整合酶系统 | 链霉菌属、糖多孢菌属、伯克霍尔德菌属、紫色杆菌属 | 多拷贝随机整合系统（基于多靶向整合酶） | 工业生物技术、医药 |
| 4 | 2026-05-05 |
Recent advances in Chlamydomonas reinhardtii as a green factory for sustainable biofuels and bioproduct production
2026-May-01, New biotechnology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.nbt.2026.04.005
PMID:42070768
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综述 | 本文综述了莱茵衣藻作为绿色工厂在可持续生物燃料和高价值生物产品集成生产方面的最新进展 | 强调将生物燃料生产与高价值生物产品生产相结合的综合视角，以推动循环生物经济发展 | 面临碳和氧化还原分配、叶绿体-脂滴相互作用、产品一致性等挑战，以及规模化限制、生长-产量权衡和下游加工成本高等瓶颈 | 评估莱茵衣藻在可持续生物燃料和高价值生物产品集成生产中的潜力和工程策略 | 莱茵衣藻 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 莱茵衣藻 | 三酰甘油积累、乙醇发酵、光生物产氢、重组蛋白表达、类胡萝卜素合成、多糖合成、可降解聚合物合成等代谢途径 | 医药, 营养品, 材料, 工业生物技术, 环境, 能源 |
| 5 | 2026-05-05 |
Breaking boundaries for PFAS surveillance in water reservoirs: CRISPR-electrochemical synergies from MXene to microfluidics- A review
2026-Apr-30, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2026.118756
PMID:42070443
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综述文章 | 本文提出基于磺酸盐-MXene、CRISPR-Cas12a和微流体自动化协同融合的下一代PFAS监测框架 | 首次提出分子工程化磺酸盐-MXene、CRISPR-Cas12a与微流体自动化的协同融合，实现皮摩尔亲和力、阿托摩尔灵敏度和分钟级检测 | NA | 开发超越现有方法限制的超灵敏、特异、便携且低成本的PFAS监测技术 | 全氟和多氟烷基物质（PFAS） | 合成生物学，环境监测 | NA | CRISPR-Cas12a，微流体技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas12a | NA | 生物传感器，基于适体的CRISPR检测电路 | 环境监测，水安全 |
| 6 | 2026-05-05 |
A Streamlined and High-Osmolarity Bacillus subtilis Cell-Free Platform for Rapid Characterization of Genetic Regulatory Elements
2026-Apr-29, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00165
PMID:42052911
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研究论文 | 建立了高渗透压枯草芽孢杆菌无细胞平台，用于快速表征基因调控元件 | 通过系统优化提取和反应环境，省去传统透析步骤，并利用高离子强度（400 mM谷氨酸钾）和渗透保护剂甜菜碱显著提高翻译能力，验证了该平台作为细菌生理预测代理的有效性 | NA | 开发一种简化且稳健的无细胞系统，用于快速表征基因调控元件 | 枯草芽孢杆菌无细胞系统 | 合成生物学 | NA | 无细胞系统、荧光蛋白合成、磷酸化级联反应 | NA | 基因表达数据集 | NA | NA | 枯草芽孢杆菌 | 调控电路（CcpA与HPr复合物对含-box启动子的抑制） | 合成生物学、基础研究、蛋白质生产 |
| 7 | 2026-05-05 |
Metabolic Engineering of Bacillus subtilis for High-Level Production of Salidroside from Potato Starch
2026-Apr-28, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00803
PMID:42048483
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研究论文 | 通过代谢工程策略改造枯草芽孢杆菌，实现了以马铃薯淀粉为碳源高产红景天苷 | 引入芳香醛合酶（AAS）合成酪醇，抑制竞争代谢途径，筛选内源醇脱氢酶，并利用群体感应动态调控系统优化红景天苷生产 | 未提及 | 开发可持续的红景天苷生产方法 | 枯草芽孢杆菌（Bacillus subtilis） | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 枯草芽孢杆菌（Bacillus subtilis） | 群体感应动态调控系统 | 生物医药，化妆品 |
| 8 | 2026-05-05 |
Construction and Application of a Multicolor Bactosensor for Detecting Bioavailable Antibiotic Mixtures in the Environment
2026-Apr-24, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00891
PMID:42027138
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研究论文 | 构建一种多色细菌传感器，用于同时检测环境中的四环素和红霉素混合物 | 通过将两个基于转录因子的传感模块整合到单个质粒中，并引入抗生素抗性基因提升性能，实现了对二元抗生素混合物的定量区分，仅需通过智能手机拍摄的细菌图像进行荧光颜色对比 | 未提及对更复杂混合物（如三种或更多抗生素）的检测能力或长期稳定性 | 开发一种现场可部署的多色细菌传感器，用于定量检测环境中的抗生素混合物及其生物可利用组分 | 环境水样中的抗生素混合物（四环素和红霉素） | 合成生物学 | NA | 荧光成像、抗生素抗性基因工程 | NA | 图像 | 实际水样中的若干样本 | 质粒构建 | 大肠杆菌 | 多色细菌传感器（基于转录因子的双模块整合） | 环境监测 |
| 9 | 2026-05-05 |
Yeast MoClo Secretion and Surface Display Toolkit 2.0: Improvements and Applications for Analysis of protein-protein Interactions and Whole-Cell Biocatalysis
2026-Apr-23, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00085
PMID:42025218
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研究论文 | 描述了酵母MoClo分泌和表面展示工具包2.0的改进及其在蛋白质-蛋白质相互作用分析和全细胞生物催化中的应用 | 新增基于截短Aga1和C端融合Aga2的锚蛋白部件，引入GFP荧光互补检测和高通量分泌增强蛋白，以及展示纳米抗体评估相互作用和PET塑料降解的全细胞催化应用 | 未明确提及，但可能涉及工具包在复杂环境中的稳定性和普适性限制 | 改进MoClo YSD工具包并拓展其在合成生物学和生物催化中的应用 | 酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae） | 合成生物学 | NA | 模块克隆（MoClo），GFP互补，共免疫沉淀，流式细胞术 | NA | 蛋白质相互作用数据和酶活性数据 | 未明确样本量，涉及GFP标签蛋白和PET降解酶系统 | MoClo | 酿酒酵母 | 分泌和表面展示系统，包括锚蛋白融合、GFP互补传感器、共展示PET降解酶与MHETase的代谢通路 | 生物技术，环境保护 |
| 10 | 2026-05-05 |
Functional Characterization and Mutagenesis Studies of a Microbial-like Diterpene Synthase from Huperzia serrata
2026-Apr-17, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules31081329
PMID:42076007
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研究论文 | 该研究从传统中药材蛇足石杉中鉴定并功能表征了一种微生物样的二萜合酶MTPSL1，通过诱变分析揭示了其多功能性，并发现S224A突变能显著提升三种二萜骨架的产量 | 首次从蛇足石杉中报道微生物样萜烯合酶，并揭示了其多功能性的分子基础，特别是S224A突变能显著提高海洋特异性二萜的产量，为蛋白质工程和合成生物学应用奠定了基础 | 研究中未提及MTPSL1在植物体内的完整生物合成途径或与其他酶的相互作用，且仅通过转录组分析推测了下游修饰酶，缺乏直接的功能验证 | 探索传统药用植物蛇足石杉中微生物样萜烯合酶的存在及功能 | 蛇足石杉中的微生物样二萜合酶MTPSL1 | 数字病理学 | 不适用 | 转录组分析、NGS、诱变、结构解析 | 不适用 | 转录组数据、化合物结构数据 | 从蛇足石杉转录组中鉴定出一种酶，通过7种化合物解析其功能 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 医学,工业生物技术 |
| 11 | 2026-05-05 |
A Clozapine-Responsive GPCR-Based Gene Switch for Pharmacological Control of Gene Expression in Mammalian Cells and In Vivo
2026-Apr-09, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27083381
PMID:42074026
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研究论文 | 报道了一种基于氯氮平响应性GPCR的基因开关，用于哺乳动物细胞和体内的药理学基因表达调控 | 首次将设计药物专一激活受体与信号依赖性转录调控结合，建立基于人GPCR的氯氮平响应基因开关，实现亚纳摩尔至低纳摩尔浓度灵敏响应及体内低剂量口服或局部给药诱导 | 可能涉及氯氮平的潜在副作用及长期体内调控稳定性需进一步评估 | 开发临床适用的药理学可控基因表达平台，用于哺乳动物合成生物学和细胞治疗 | 设计GPCR基因开关、cAMP或钙响应合成启动子、海藻酸微囊化报告细胞 | 合成生物学 | NA | 基因开关设计、cAMP/钙信号通路调控 | NA | NA | C57BL/6J小鼠模型，每日氯氮平剂量0.3 mg/kg | NA | 哺乳动物细胞（HEK293等）、C57BL/6J小鼠 | GPCR偶联信号依赖性转录调控回路 | 医学 |
| 12 | 2026-05-05 |
Osmotic signaling governs sunscreen biosynthesis to safeguard desert cyanobacteria against desiccation
2026-Apr, mLife
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/mlf2.70075
PMID:42079446
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研究论文 | 揭示了渗透信号通过调控防晒霜类菌胞素样氨基酸的生物合成来保护沙漠蓝细菌免受干燥胁迫 | 首次发现类菌胞素样氨基酸在干旱条件下作为渗透保护剂的双重功能，并鉴定出Dsp1-OrrA信号通路介导渗透诱导的MAA生物合成 | 未详细探讨MAA在其他胁迫条件下的具体功能，以及该信号通路在其他生物中的保守性 | 研究类菌胞素样氨基酸在沙漠蓝细菌应对干燥胁迫中的作用及其调控机制 | 沙漠蓝细菌（一种沙漠适应性的蓝细菌） | 合成生物学, 微生物学 | 不适用 | 基因破坏、生化分析、系统发育基因组分析 | 不适用 | 基因组数据、生化实验数据 | 不适用 | 不适用 | 沙漠蓝细菌 | 不适用 | 环境生物技术, 合成生物学 |
| 13 | 2026-05-05 |
3D Expansion-PALM (PhotoActivated Localization Microscopy) Dissects Protein-Protein Interactions Down to the Molecular Scale in Bacteria
2026-Mar-28, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms14040772
PMID:42075168
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研究论文 | 结合膨胀显微镜与光激活定位显微镜实现细菌中蛋白质相互作用的分子尺度三维成像 | 首次在细菌中实现双色三维膨胀光激活定位显微镜，达到约3纳米的空间分辨率，并通过优化膨胀协议最小化色差和信号串扰，结合高度选择性倾斜照明提高单分子灵敏度 | 需要进一步验证该方法在其他高密度生物样本（如细胞器或分子凝聚体）中的普适性和可重复性 | 开发一种用于研究原核生物及高密度样本中分子组织的方法 | 细菌中参与组氨酸生物合成的HisF和HisH蛋白质 | 显微镜成像 | NA | 膨胀显微镜, PALM, 双色三维超分辨率成像 | NA | 图像 | NA | NA | 细菌 | NA | 微生物学, 合成生物学, 细胞生物物理学 |
| 14 | 2026-05-05 |
Applications of Metabolomics in the Development of Biomedicine and Biotechnology
2026, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-3-032-18966-0_21
PMID:42071157
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综述 | 探讨代谢组学从早期谱分析到与先进分析平台、计算生物学和精准医学整合的发展过程，并强调其在癌症、心血管疾病、糖尿病等疾病中的生物标志物发现、机制阐明和个性化治疗中的应用 | 系统阐述了代谢组学在生物医学和生物技术领域的整合应用，包括单细胞代谢组学和机器学习等新兴工具，及其在代谢流追踪和人工途径设计中的实践驱动作用 | 未明确提及具体局限性 | 概述代谢组学在生物医学和生物技术开发中的应用进展 | 代谢物和代谢途径，用于疾病机制和生物过程研究 | 生物信息学 | 癌症， 心血管疾病， 糖尿病 | 代谢组学， 单细胞代谢组学， 机器学习 | NA | 代谢物数据 | NA | NA | NA | 人工代谢途径 | 医学， 生物技术， 合成生物学 |
| 15 | 2026-05-05 |
Levels of autonomy in synthetic biology engineering
2020-12, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.15252/msb.202010019
PMID:33331138
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综述 | 探讨合成生物学工程中的自主性层次，分析标准化与自动化在工程生物体中的应用现状与挑战 | 系统梳理其他工程领域标准化与自动化经验，对比分析合成生物学领域尚未实现全流程自动化的核心障碍 | 未提供具体实验数据或定量分析，属于概念性综述，缺乏对现有自主性层次划分的实证验证 | 评估合成生物学工程中自主性水平的现状与发展方向 | 合成生物学工程过程及自主化设计方法 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 16 | 2026-05-04 |
Efficient cell factory design by combining meta-heuristic algorithm with enzyme-constrained metabolic models
2026-Aug, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.134706
PMID:42034297
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研究论文 | 提出MetaStrain框架，将酶约束代谢模型与元启发式算法结合，用于高效设计微生物细胞工厂 | 首次将元启发式算法与酶约束模型整合，通过降维预筛选和数值编码策略高效探索组合基因编辑空间，实现非直觉组合靶点的快速识别 | 未提供实验验证中脱靶效应的分析，且对大型代谢网络的计算复杂度评估不充分 | 开发一种计算框架以优化微生物细胞工厂中多基因靶点设计，提高目标产物产量 | 酿酒酵母和大肠杆菌的代谢网络模型 | NA | NA | 酶约束代谢模型 | 元启发式算法 | NA | 通过计算模拟涉及酿酒酵母的2-苯乙醇和亚精胺生物合成，实验验证使用大肠杆菌的五靶点组合菌株 | CRISPR-Cas9, 代谢工程 | 酿酒酵母, 大肠杆菌 | 组合基因编辑策略，包括敲除、过表达和酶修饰 | 工业生物技术 |
| 17 | 2026-05-04 |
The tryptophan prenyltransferase ComQ from Bacillus subtilis 168 can prenylate daptomycin at Trp1
2026-May-02, The FEBS journal
DOI:10.1111/febs.70578
PMID:42068243
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研究论文 | 本研究首次证明来自枯草芽孢杆菌168的色氨酸异戊二烯转移酶ComQ能够异戊二烯化环状抗菌肽达托霉素，显示出其作为合成生物学工具的潜力 | 首次发现ComQ不仅修饰线性肽，还能异戊二烯化环状肽，扩大了底物范围，为生物活性化合物的生物合成工程提供了新工具 | 未提及体内应用或工程化ComQ变体的具体效果 | 探究ComQ作为合成生物学工具异戊二烯化环状抗菌肽的可行性 | 枯草芽孢杆菌168的异戊二烯转移酶ComQ及其底物ComX和信息素和达托霉素 | 合成生物学 | NA | 克隆、蛋白纯化、AlphaFold建模 | AlphaFold | 蛋白质结构 | NA | NA | 大肠杆菌 | NA | 医学、工业生物技术 |
| 18 | 2026-05-04 |
Parabiotics as Next-Generation Microbiome Therapeutics: Insights into Mechanisms, Evidence, and Therapeutic Potential
2026-May-02, Current microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00284-026-04942-x
PMID:42069941
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综述 | 综述了后生元作为下一代微生物组疗法的机制、证据和治疗潜力 | 首次系统总结后生元（非活性微生物或其组分）在安全性、稳定性和功能食品应用中的优势，并整合组学技术（如宏基因组学、CRISPR-Cas）对其研发的加速作用 | 标准化和监管协调仍面临挑战 | 探讨后生元在微生物组靶向干预中的应用及其转化潜力 | 后生元（非活性微生物细胞或其组分） | NA | 儿科腹泻、肌肉衰减、肠易激综合征、特应性皮炎、呼吸道感染、代谢性疾病 | 宏基因组学、下一代测序、蛋白质组学、代谢组学、CRISPR-Cas系统、合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas系统 | NA | NA | 医学、食品 |
| 19 | 2026-05-04 |
The convergence of AI-driven engineering biology and emerging technologies advancing globally networked autonomous biofoundries
2026-May-01, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103503
PMID:42068969
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综述 | 综述了人工智能驱动的工程生物学与新兴技术的融合，推动全球网络化自主生物铸造厂的发展 | 提出AI驱动自主生物铸造厂概念，整合计算设计、自动化制造与数据驱动学习于自适应框架，并强调数字孪生和全细胞建模等技术的融合 | 未具体说明当前技术融合的实证验证或实际部署面临的挑战细节 | 探讨人工智能与合成生物学融合以构建全自主生物铸造厂的技术趋势 | AI驱动的合成生物学技术、自动化生物铸造厂、全细胞建模与数字孪生系统 | 人工智能, 合成生物学 | NA | 全细胞建模, 数字孪生, 自动化实验 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 20 | 2026-05-04 |
RNA sensors and actuators for dynamic cellular regulation
2026-Apr-30, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2026.04.005
PMID:42067429
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综述 | 本文综述了用于动态细胞调控的RNA传感器和致动器的工程化进展 | 从RNA结构动力学角度强调其与蛋白质系统相比的优势，并整合了合成生物学、RNA治疗学的最新进展 | 未提及具体实验验证或量化比较与蛋白质系统的性能差异 | 推动RNA在合成细胞控制方案中的应用，提升微生物生物合成和靶向基因治疗 | RNA传感器和致动器 | 合成生物学 | NA | RNA工程 | NA | NA | NA | NA | NA | RNA传感器与致动器 | 医学, 工业生物技术 |