合成生物学相关文章
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当前共找到 5012 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-05-25 |
Bacillus-derived antimicrobial peptides as alternatives to antibiotics in poultry: mechanisms, applications, and future prospects- a review
2026-May-23, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-026-04941-3
PMID:42176025
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综述 | 综述了芽孢杆菌源抗菌肽作为家禽中抗生素替代品的机制、应用及未来前景 | 系统总结了芽孢杆菌源抗菌肽（包括核糖体合成细菌素和非核糖体合成脂肽）的结构多样性、多机制作用（膜靶向、生物膜调节、免疫调节及霉菌毒素相关肠道保护）以及其在替代抗生素中的潜力与挑战 | 抗菌肽活性受肽类、配方、微生物生态和宿主生理因素影响，可能存在适应性或基因编码耐药性，且面临肽不稳定性、体内疗效差异、菌株特异性差异、安全性问题及缺乏标准化比较模型等转化挑战 | 评估芽孢杆菌源抗菌肽作为家禽中抗生素替代品的可行性，并探讨其作用机制、应用限制及未来发展方向 | 家禽病原菌及芽孢杆菌源抗菌肽 | 机器学习 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 芽孢杆菌 | NA | 农业, 食品 |
| 2 | 2026-05-25 |
Emerging Applications of CAR-T Cell Therapy in Overcoming Resistance and Expanding Targets in Hematologic Malignancies: Insights from Recent Research
2026-May-23, Current treatment options in oncology
IF:3.8Q2
DOI:10.1007/s11864-025-01371-z
PMID:42176091
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综述 | 综述CAR-T细胞疗法在克服血液恶性肿瘤耐药性和扩展靶点方面的最新研究进展 | 提出CRISPR增强CAR-T和合成生物学同种异体系统以提升疗效和可及性，并聚焦近两年内的创新 | 未提及具体临床试验数据的详细分析和长期随访结果 | 总结克服CAR-T疗法耐药性的策略并探索提高安全性和可及性的方法 | 血液恶性肿瘤（包括B细胞急性淋巴细胞白血病、弥漫大B细胞淋巴瘤、多发性骨髓瘤、急性髓系白血病、T细胞白血病） | 数字病理学 | 血液肿瘤 | CAR-T | NA | 文本 | NA | CRISPR-Cas9, 合成生物学 | T细胞 | 多靶点CAR、下一代构建体、同种异体CAR系统 | 医学 |
| 3 | 2026-05-25 |
Machine learning-assisted single-cell Raman imaging for rapid, sensitive detection and intracellular mapping of carotenoids in plant cell cultures
2026-May-23, Plant cell reports
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s00299-026-03858-x
PMID:42176120
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研究论文 | 利用机器学习辅助的单细胞拉曼成像技术快速灵敏检测植物细胞培养物中的类胡萝卜素并进行细胞内图谱分析 | 将拉曼成像与多层感知器神经网络相结合，实现基于类胡萝卜素组成的非破坏性、无标记烟草BY-2细胞分类 | 未明确提及局限性 | 开发无标记单细胞分析平台，用于基于类胡萝卜素含量的植物细胞分类 | 烟草BY-2细胞系，包括野生型和转基因细胞系 | 机器学习 | NA | 拉曼成像，表面增强拉曼散射，HPLC | 多层感知器神经网络 | 光谱图像 | 多个烟草BY-2细胞系，包括野生型和转基因品系 | NA | 烟草BY-2细胞 | NA | 植物合成生物学，代谢工程 |
| 4 | 2026-05-25 |
Bacterial 3D genome architecture: organization, regulation, and synthetic biology applications
2026-May-23, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-04117-8
PMID:42177580
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综述 | 综述细菌三维基因组结构的组织、调控机制及其在合成生物学中的应用 | 整合染色体构象捕获与成像研究的见解，突出基因组架构对环境信号的动态响应，并探讨三维基因组学在合成生物学中的潜在应用 | 细菌基因组架构及其调控的详细原则尚未完全阐明 | 理解细菌三维基因组的结构组织、调控因素以及在合成生物学中的应用前景 | 细菌三维基因组架构及其调控因子 | NA | NA | 染色体构象捕获, 成像 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | NA | 合成生物学, 医学 |
| 5 | 2026-05-25 |
Identification of a thermotolerant strain of Aureobasidium melanogenum DA22 and functional analysis of Spt23 as a key transcriptional regulator in high-temperature polymalic acid fermentation
2026-May-22, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.134956
PMID:42176819
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研究论文 | 鉴定耐高温菌株Aureobasidium melanogenum DA22并分析转录调控因子Spt23在高温聚苹果酸发酵中的关键作用 | 首次从野生型菌株中筛选出天然耐高温菌株DA22，并发现膜结合转录因子Spt23通过调控脂质和麦角固醇合成以及还原性三羧酸循环，增强高温条件下细胞生长和聚苹果酸产量 | 研究主要聚焦于单一转录因子Spt23，未探索其他潜在耐热基因的协同效应或长期工业适应性 | 构建耐高温聚苹果酸生产菌株，实现工业热应激条件下的有机酸高效发酵 | Aureobasidium melanogenum DA22菌株及其转录调控因子Spt23 | 工业生物技术 | NA | RT-qPCR, 基因过表达, 基因敲除, 摇瓶发酵, 5升生物反应器发酵 | NA | 基因表达数据, 生理指标数据, 发酵产量数据 | 120个野生型菌株分离物 | 基因过表达, 基因敲除 | Aureobasidium melanogenum DA22 | 过表达膜结合转录因子SPT23的基因回路 | 工业生物技术 |
| 6 | 2026-05-25 |
Engineered Biocatalytic Strategies for Pesticide Degradation in Food Systems: From Catalytic Performance to Practical Applications
2026-May-14, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.6c01905
PMID:42133536
|
综述 | 本综述介绍了食品系统中酶法降解农药的工程策略，从催化性能到实际应用的最新进展 | 系统性地总结了天然酶、纳米酶及多酶/混合级联系统在农药降解中的应用，并探讨了人工智能辅助设计和合成生物学等新兴方法 | 实际应用受限于催化效率低、稳定性和可重复使用性不足、规模化限制以及监管不确定性 | 提供面向应用的酶法农药降解技术综述，重点强调性能增强和鲁棒性提升的工程策略 | 农药残留 | NA | NA | 酶降解 | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | 多酶或混合级联系统 | 食品, 农业 |
| 7 | 2026-05-25 |
Vesicle-Templated Self-Assembly of Programmable Freestanding Multi-μm DNA Shells
2026-May-13, Nano letters
IF:9.6Q1
DOI:10.1021/acs.nanolett.6c00402
PMID:42130031
|
研究论文 | 介绍一种通过囊泡模板自组装实现可程序化、独立的多微米DNA壳层的方法 | 首次实现了独立于脂质囊泡的DNA壳层，并展示了结合界面可编程性以实现多层壳层控制 | 未提及具体局限性 | 开发独立的、类膜DNA壳层以用于自下而上合成生物学 | DNA壳层在巨型单层囊泡上的组装及通过表面活性剂去除脂质体后的释放 | 合成生物学 | NA | DNA折纸术，寡核苷酸纳米星基元 | NA | NA | NA | DNA折纸，寡核苷酸自组装 | NA | NA | 合成生物学 |
| 8 | 2026-05-25 |
A genetic manipulation tool based on the GP35 recombinase for targeted gene editing in mycoplasmas of ruminants
2026-Apr-27, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2026.113096
PMID:42055338
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研究论文 | 介绍了一种基于GP35重组酶的遗传操作工具，用于反刍动物支原体的靶向基因编辑 | 首次利用噬菌体SPP1的GP35重组酶实现长单链DNA重组工程，在牛支原体中实现精准基因插入和缺失，编辑率高达77.78%-100%，消除了随机脱氨的风险 | 未明确提及局限性，但可能需验证在其他反刍动物病原体中的转换效果 | 开发有效的遗传工具以促进反刍动物支原体的致病机制研究和疫苗开发 | 反刍动物支原体，特别是牛支原体 | 合成生物学 | 牛支原体病 | GP35重组酶介导的重组工程 | NA | 基因序列和突变体数据 | NA | GP35重组酶 | 牛支原体 | 基于GP35重组酶的基因编辑系统 | 医学, 农业 |
| 9 | 2026-05-25 |
Tunable low-rate genomic recombination with Cre-lox in Escherichia coli: a versatile tool for anoxic environmental biosensing and synthetic biology
2026-04-22, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.01768-25
PMID:41870091
|
研究论文 | 开发了一种在大肠杆菌中利用Cre-lox系统实现可调低速率基因组重组的方法，应用于厌氧环境生物传感和合成生物学 | 开发了严格调控、可滴定的Cre重组酶系统，实现了低重组率和最小基础活性，并展示了其在厌氧砷检测中的实用性 | 论文未明确说明系统的长期稳定性和潜在脱靶效应 | 开发可用于环境生物传感和合成生物学的可调低速率基因组重组工具 | 大肠杆菌及基于重组的砷生物传感器 | 合成生物学 | NA | Cre-lox位点特异性重组 | NA | NA | 未明确样本数量 | Cre-lox系统 | 大肠杆菌 | 基于Cre-lox的砷响应生物传感器电路 | 环境监测, 合成生物学 |
| 10 | 2026-05-25 |
Amalgamation of Biofilms and Synthetic Biology: A Paradigm Shift in Biotechnology
2026-Feb-17, Medical principles and practice : international journal of the Kuwait University, Health Science Centre
IF:2.9Q1
DOI:10.1159/000550994
PMID:41701651
|
综述 | 本文综述了生物膜工程与合成生物学交叉领域的最新进展，重点介绍了调控生物膜行为以用于生物技术应用和解决相关挑战的策略 | 整合了噬菌体疗法、电遗传系统、微生物联合体设计、群体感应调控、遗传电路、胞外聚合物修饰和抗菌肽涂层表面等多种策略，实现了对生物膜结构、组成和代谢输出的精确调控 | 存在生物安全性、异质性、可扩展性和监管合规性等挑战 | 探讨合成生物学工具在生物膜工程中的应用，以优化生物膜在废水处理、生物修复、生物能源和诊断等领域的性能，并控制致病性生物膜 | 生物膜及其工程化系统 | 机器学习 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 遗传电路 | 环境, 能源, 医学 |
| 11 | 2026-05-25 |
Predicting lasso peptide structure with LassoPred
2026, Methods in enzymology
DOI:10.1016/bs.mie.2026.01.037
PMID:42177065
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研究论文 | 提出LassoPred，一个基于机器学习的模块化计算流程，用于从序列预测套索肽的三维结构 | LassoPred通过整合ESM2嵌入训练的支持向量机分类器注释关键拓扑特征（异肽环和塞子残基），并采用拓扑感知的结构构建器组装和优化原子模型，实现了近实验精度，同时将预测时间缩短至分钟级，并将已知套索肽结构覆盖率从不足50个扩展至超过4000个基因组挖掘模型 | 输入标题与摘要中未明确提及局限性 | 从序列准确预测套索肽的三维结构，桥接序列发现与结构洞察的差距 | 套索肽（LaPs） | 机器学习 | NA | 机器学习、同源建模、能量最小化 | 支持向量机 | 序列数据 | 超过4000个基因组挖掘模型 | NA | NA | NA | 酶学、结构生物学、合成生物学、治疗学设计 |
| 12 | 2026-05-25 |
Pathway crosstalk enables degradation of aromatic compounds in marine Roseobacter clade bacteria
2025-09-17, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.00978-25
PMID:40793766
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研究论文 | 通过多组学分析和CRISPR-Cas基因编辑，破译海洋玫瑰杆菌分支菌中芳香化合物的降解途径，发现β-酮己二酸途径与β-氧化途径在硫解步骤的交叉对话 | 首次揭示海洋玫瑰杆菌分支菌中芳香化合物降解的完整途径，并发现途径交叉对话的新机制 | 研究主要基于模型化合物，对其他芳香化合物的适用性及海洋环境中的实际降解效率尚待验证 | 阐明海洋细菌中芳香化合物的生物转化途径，为环境修复和生物碳循环利用奠定基础 | 海洋玫瑰杆菌分支菌中的芳香化合物降解途径 | 合成生物学 | NA | 多组学分析, CRISPR-Cas基因编辑, NGS | NA | 基因组数据, 代谢组数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 海洋玫瑰杆菌分支菌 | β-酮己二酸途径与β-氧化途径的交叉对话 | 环境, 工业生物技术 |
| 13 | 2026-05-25 |
Enhanced phenanthrene degradation by a synthetically engineered E. coli consortium utilizing the SCRaMbLE for the evolution of key genes
2025-09-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2025.139152
PMID:40628214
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研究论文 | 本研究利用SCRaMbLE方法对关键基因进行进化，构建了由三株工程化大肠杆菌组成的合成菌群，用于高效降解菲 | 首次将SCRaMbLE方法应用于多环芳烃降解菌群关键基因的定向进化，显著提升了菲的降解效率 | 研究仅测试了100 mg/L的菲浓度，未评估其他浓度或实际污染环境中菌群的降解性能 | 开发基于合成生物学和SCRaMbLE的微生物菌群策略，以增强菲的生物降解 | 菲，一种多环芳烃污染物 | 环境工程 | NA | SCRaMbLE | NA | 生物降解数据 | 三个工程化大肠杆菌菌株（E. coli SCRPHE033、E. coli SCRKA065、E. coli CRSA）在含有100 mg/L菲的MSM培养基中测试 | SCRaMbLE | 大肠杆菌BL21(DE3) | 菲完全矿化的三个分解代谢模块（上游、下游及辅助模块），整合17个关键基因 | 环境生物修复 |
| 14 | 2026-05-25 |
CTGCT, Centre of Excellence for the Technologies of Gene and Cell Therapy: Collaborative translation of scientific discoveries into advanced treatments for neurological rare genetic diseases and cancer
2025, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2024.11.051
PMID:39760072
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评论 | CTGCT卓越中心旨在将科学发现转化为针对神经系统罕见遗传病和癌症的先进基因与细胞疗法 | 斯洛文尼亚首个此类中心，整合合成生物学工具、基因编辑、RNA技术、免疫调控工程及新型递送系统，建立GMP设施推动临床转化 | 尚未提供具体实验数据或临床结果评估 | 推动基因与细胞疗法从基础研究向临床应用转化 | 神经系统罕见遗传病和癌症 | 数字病理学 | 神经系统罕见遗传病, 癌症 | 基因编辑, 剪接技术, RNA技术, 免疫调控工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN | 哺乳动物细胞 | NA | 医学 |
| 15 | 2026-05-24 |
Unveiling the adaptive structure-function synergy in thermophilic translation initiation factor 1: A molecular dynamics framework
2026-Aug, Biophysical chemistry
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.bpc.2026.107644
PMID:42085878
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研究论文 | 通过分子动力学模拟揭示嗜热翻译起始因子1的结构-功能协同适应性机制 | 首次通过全原子分子动力学模拟系统比较嗜热与中温翻译起始因子1的动态特性，揭示嗜热因子通过扩展氢键和盐桥网络增强结构刚性的分子机制 | 仅基于计算机模拟，缺乏体外实验验证；仅研究了单一嗜热菌株的IF1蛋白 | 阐明嗜热细菌翻译起始因子1的热稳定性分子机制，为工程化耐热蛋白建立框架 | 嗜热菌Thermoanaerobacterium thermosaccharolyticum的IF1蛋白（TT_IF1）与中温菌Flavobacterium kingsejongi的IF1蛋白（FK_IF1） | 分子生物学 | 不适用 | 分子动力学模拟，主成分分析 | 不适用 | 模拟轨迹数据 | 每种IF1蛋白3次独立模拟，每次1000纳秒 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 合成生物学，工业生物技术 |
| 16 | 2026-05-24 |
Membrane-Spanning Nanopores Formed from Nucleic Acids
2026-May-22, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.5c00905
PMID:42173496
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综述 | 本文综述了基于核酸（尤其是DNA）构建的跨膜纳米孔的最新进展 | 系统总结了从亚纳米通道到可定制大分子传输几何结构的设计原则，并强调RNA折纸技术用于创建基因可编码纳米孔的独特机遇 | NA（摘要未明确提及局限性） | 探讨合成核酸纳米孔的设计原理、优势及在单分子传感和合成生物学中的应用前景 | 基于核酸（DNA和RNA）的自组装跨膜纳米孔 | 合成生物学, 生物物理学 | NA | DNA纳米技术, RNA折纸, 单分子传感 | NA | NA | NA | DNA折纸, RNA折纸 | NA（未指定宿主生物） | 跨膜纳米孔通道 | 医学, 合成生物学, 生物技术 |
| 17 | 2026-05-24 |
PURE makes PURE: reconstitution of the PURE cell-free system from self-synthesized proteins
2026-May-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-73337-0
PMID:42173857
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研究论文 | 本研究展示了PURE无细胞系统可以从其自身合成的蛋白质中重建，实现非核糖体蛋白质组分的自我再生 | 首次证明PURE系统中的36种非核糖体蛋白质可以完全通过该系统自身合成，并重建出功能完整的PURE系统，标志着向通用生化构建器迈出关键一步 | 尚未完全实现整个系统（包括核糖体和其他复杂组分）的自主复制，未提及长期稳定性和实际应用中的瓶颈 | 探索无细胞系统自我再生能力，推动通用生化构建器的实现 | PURE无细胞系统中36种非核糖体蛋白质 | 合成生物学 | NA | PURE无细胞系统，蛋白质纯化 | NA | NA | 36种非核糖体蛋白质及其组合 | NA | E. coli（用于制备PURE系统组分） | 自我再生回路（PURE系统组分自我合成与重建） | 合成生物学，生物技术 |
| 18 | 2026-05-24 |
The interaction between the RNA aptamer Dap1 and DasR mirrors DNA operator site recognition in GntR repressors
2026-May-20, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag489
PMID:42165134
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研究论文 | 揭示了RNA适配体Dap1与细菌阻遏蛋白DasR的相互作用机制，类似于GntR阻遏物中的DNA操纵子位点识别 | 首次解析了SELEX衍生的RNA适配体Dap1与GntR/HutC家族阻遏蛋白DasR的复合物晶体结构，发现其识别模式与DNA双链结合高度相似，并基于结构设计出新型适配体Dap1m1，实现了对同源蛋白NagR的调控 | 未提及实验的局限性，如适配体设计仅针对少数位点随机化，或对其他GntR家族成员的通用性有待验证 | 研究RNA适配体与细菌阻遏蛋白的相互作用，并探索设计新型适配体-蛋白相互作用对 | RNA适配体Dap1及其靶标GntR/HutC家族阻遏蛋白DasR，以及同源蛋白NagR | 合成生物学 | NA | X射线晶体学、SELEX | NA | 三维结构数据 | NA | SELEX | NA | RNA适配体调控回路（适配体-阻遏蛋白相互作用对） | 合成生物学、医学（基因调控应用） |
| 19 | 2026-05-24 |
Quantitative Measurement of Synthetic Repression Curves Reveals Design Challenges for Genetic Circuit Engineering under Growth Arrest
2026-May-13, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00123
PMID:42125829
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研究论文 | 在生长停滞条件下定量测量合成抑制曲线，揭示基因电路工程的设计挑战 | 首次系统性研究生长停滞对遗传NOT门电路行为的影响，发现非抑制表达水平下降超过100倍是主导因素，并指出只需解决单一性能参数即可改善电路功能 | 仅关注生长停滞对抑制曲线的影响，未涉及其他生理状态或更复杂电路；样本量有限，仅使用单细胞分辨率测量 | 探究生长停滞对工程化遗传电路性能的影响 | 基因NOT门文库 | 合成生物学 | NA | 单细胞分辨率测量 | NA | 基因表达数据 | 基因NOT门文库（具体数量未提及） | NA | 细菌 | 遗传NOT门 | 工业生物技术，环境 |
| 20 | 2026-05-24 |
Repurposing the Diatom Periplastidial Compartment for Heterologous Terpenoid Production
2026-May-08, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00919
PMID:42101919
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研究论文 | 系统剖析了硅藻周质体区室用于异源萜类化合物生产的潜力，并提出了该区室作为可工程化细胞内空间的策略 | 首次系统评估了硅藻中周质体区室（PPC）用于萜类生物合成的能力，揭示了所有主要异戊二烯磷酸前体在各区室中的可及性，并提出PPC作为与质体整合的可工程化空间 | 未明确说明本研究的局限性，但可能包括各区间产率差异及生理负担的未完全评估 | 探索硅藻周质体区室在异源萜类生产中的工程化潜力，并建立区室特异性工程策略 | 硅藻（三角褐指藻等）及其亚细胞区室（细胞质、叶绿体、周质体区室） | 合成生物学 | NA | 靶向异源合成酶表达、代谢工程 | NA | 代谢产物分析数据 | NA（涉及代表性半萜、单萜、倍半萜和四萜合成酶的多区室靶向实验） | NA | 硅藻 | 异源萜类生物合成通路（涉及DMAPP、GPP、FPP、GGPP前体的通路） | 工业生物技术、可持续生产 |