合成生物学相关文章
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当前共找到 5144 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-06-15 |
Engineering Escherichia coli for high-level poly(3-hydroxybutyrate) production: Recent advances and future perspective
2026 Jul-Aug, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108858
PMID:41765153
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综述 | 本文综述了工程化大肠杆菌用于高效生产聚(3-羟基丁酸酯)的最新进展，并强调了增强其作为可持续生物塑料生产底盘的新兴策略 | 系统总结了合成生物学和代谢工程在大肠杆菌中优化前体供应、增强还原力、微调途径表达等策略，特别是工程化糖酵解途径、引入还原性甘氨酸和苏氨酸旁路路径、删除竞争途径、表达phasin、优化启动子和辅因子再生策略的协同作用 | NA | 综述工程化大肠杆菌高效生产聚(3-羟基丁酸酯)的研究进展，并展望其作为可持续生物塑料生产平台的未来前景 | 大肠杆菌工程化菌株用于聚(3-羟基丁酸酯)生产 | 合成生物学，代谢工程 | NA | 合成生物学，代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌 | 聚(3-羟基丁酸酯)生物合成途径，包括前体优化、辅因子再生等代谢路径工程 | 工业生物技术，环境，材料 |
| 2 | 2026-06-15 |
From biopolymers to microcompartments: A structured review of protein-based scaffolds for enzyme immobilization
2026 Jul-Aug, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108851
PMID:41765154
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综述 | 文章综述了从天然生物聚合物到工程蛋白支架，再到细菌微区室等蛋白质基支架在酶固定化中的应用进展 | 采用分层次视角，从天然生物聚合物支架逐步过渡到工程蛋白支架，并最终聚焦细菌微区室作为新兴类细胞器平台的潜力，强调其空间精度和选择性通透性 | 未详细讨论传统载体的某些优势，如成本效益和工业适用性，且对细菌微区室的实际大规模应用挑战提及较少 | 探讨蛋白质基支架在酶固定化中的结构多样性、功能特性及其在生物催化中的应用前景 | 天然生物聚合物支架、工程蛋白支架、细菌微区室等蛋白质基支架系统 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | NA | NA | NA | 多酶级联路径、代谢途径设计 | 工业生物技术、生物医学 |
| 3 | 2026-06-15 |
Programmable AND-gate strategy to reduce false positives in rolling circle amplification
2026-Jun-15, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2026.118515
PMID:41707426
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研究论文 | 引入AND门布尔逻辑的多钥匙滚环扩增技术，通过检测多个核酸序列作为扩增前提来降低假阳性率 | 首次将AND门布尔逻辑策略应用于滚环扩增，通过多序列检测显著减少假阳性，并在单核苷酸多态性检测中实现高特异性 | 未明确提及，但可能涉及多输入AND门在复杂样本中的扩展性或长期稳定性验证不足 | 开发一种低假阳性率的核酸生物传感器，适用于即时检测场景 | 核酸序列（DNA和RNA）的检测与扩增 | 合成生物学 | NA | 滚环扩增 | NA | 核酸序列数据 | NA | NA | NA | AND门布尔逻辑电路 | 医学诊断 |
| 4 | 2026-06-15 |
Transcription Factors: A Promising Third-Generation Core Sensing Element for Developing Low-Cost, On-Site Rapid Detection Technologies for Food Contaminants
2026-Jun-09, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c14507
PMID:42262033
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综述 | 综述转录因子作为第三代核心传感元件在食品污染物低成本、现场快速检测技术中的应用进展 | 提出近端突变策略和与人工智能辅助分析相结合的系统优化方法，以提升转录因子传感器性能 | 仍面临识别元件工程化、信号转导集成及实际样本复杂性等挑战 | 综述转录因子在食品安全检测中的传感应用及工程优化策略 | 转录因子及其DNA结合位点 | 机器学习 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 微生物系统 | 生物传感器（转录因子作为识别元件） | 食品, 环境 |
| 5 | 2026-06-15 |
Engineering Protein Stability with Small Molecules: A Review of the ecDHFR Destabilizing Domain System
2026-Jun-09, ACS chemical biology
IF:3.5Q2
DOI:10.1021/acschembio.6c00466
PMID:42262317
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综述 | 本文综述了ecDHFR去稳定化结构域系统通过配体诱导稳定实现蛋白质稳定性条件控制的机制、性能及优化方法 | 系统总结了ecDHFR-DD系统在不同生物体中的跨物种应用优势，并探讨了其在功能基因组学、合成生物学及生物医学等新兴领域的潜力，同时首次提出在害虫和病媒管理中的应用前景 | 未深入比较该系统与DNA/RNA调控系统的长期稳定性及在复杂多细胞生物体内的脱靶效应 | 综合评估ecDHFR-DD系统的机制、性能及优化策略，并拓展其应用领域 | ecDHFR去稳定化结构域（DD）系统及其在酵母、无脊椎动物模型和哺乳动物细胞中的应用 | 合成生物学 | NA | 蛋白质稳定性调控 | NA | NA | NA | NA | 酵母、无脊椎动物模型、哺乳动物细胞 | 配体诱导的蛋白质稳定化调控回路 | 功能基因组学、合成生物学、生物医学研究、害虫和病媒管理 |
| 6 | 2026-06-15 |
Evaluating DNA Function Understanding in Genomic Language Models Using Evolutionarily Implausible Sequences
2026-Jun-08, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00024
PMID:42260904
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研究论文 | 提出Nullsettes评估框架，测试基因组语言模型在进化上不可能序列中对功能突变的理解能力 | 首次引入Nullsettes框架评估gLMs对合成表达盒中功能突变的理解，揭示模型依赖进化模式匹配而非机制性理解的局限 | 研究仅关注特定类型的合成表达盒，未涵盖所有可能的序列功能；且仅测试了LOF突变，未涉及其他突变类型 | 评估基因组语言模型对DNA功能的理解能力，而非简单的模式记忆 | 合成表达盒中的功能丧失突变序列 | 自然语言处理 | NA | NGS | 基因组语言模型 (gLM) | 序列数据 | NA | NA | NA | 合成表达盒 | 合成生物学 |
| 7 | 2026-06-15 |
Cascading recombinase memory switch for programmable and stable gene expression in Pseudomonas putida
2026-Jun-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag589
PMID:42268684
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研究论文 | 设计了一种基于整合酶的级联重组酶记忆开关，实现恶臭假单胞菌中可编程且稳定的基因表达 | 首次在非模式工业菌株恶臭假单胞菌中构建了整合酶级联切换开关，实现稳定的遗传记忆和生物工艺相关表型控制 | 未提及开关在不同环境条件下的长期稳定性及对宿主生长的影响 | 开发适用于工业相关微生物的稳定遗传记忆元件，实现可编程基因表达和生物工艺控制 | 恶臭假单胞菌（Pseudomonas putida） | 合成生物学 | NA | 级联重组酶开关、整合酶系统、T7 RNA聚合酶、翻译水平调控 | NA | NA | NA | Bxb1丝氨酸整合酶、T7 RNA聚合酶 | 恶臭假单胞菌（Pseudomonas putida） | 级联切换开关，包含鼠李糖诱导的Bxb1整合酶模块、绝缘反转模块、正交T7 RNA聚合酶基因、PT7驱动的目标模块，以及用于控制生物膜形成的超活性二鸟苷酸环化酶 | 工业生物技术 |
| 8 | 2026-06-15 |
Advances in biocontainment strategies of engineered microbes for use in humans
2026-Jun, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2026.102727
PMID:41780106
|
综述 | 综述了用于人体的工程微生物的生物遏制策略进展 | 全面总结了多种生物遏制策略及其在临床中的应用与局限性，并强调了标准化测试的必要性 | 未提供具体实验数据或案例分析的细节，仅基于现有文献进行讨论 | 探讨用于生物医学应用的工程微生物的生物遏制策略的现状和未来方向 | 工程微生物及其生物遏制策略 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 微生物 | 毒素-抗毒素系统、自杀开关、营养缺陷型、基于CRISPR的靶向DNA降解、非标准氨基酸、物理屏障 | 医学 |
| 9 | 2026-06-15 |
Engineering a Virus-Derived X Family DNA Polymerase FvPolX for de novo DNA Synthesis
2026-Jun, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.75017
PMID:41915827
|
研究论文 | 报道并理性工程化了一种病毒来源的X家族DNA聚合酶FvPolX，用于从头DNA合成 | 首次发现并改造了微生物来源的X家族DNA聚合酶FvPolX，显著提升其催化活性，并构建了最小功能化突变体s149FvPolX，拓宽了从头DNA合成的酶工具箱 | 当前研究仅局限于FvPolX酶活性优化，缺乏对更长片段合成、保真度及体内应用的深入验证 | 开发高效、多样化的从头DNA合成酶，克服现有动物来源TdT酶的限制 | Faustovirus来源的X家族DNA聚合酶FvPolX及其工程化变体 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程 | NA | NA | NA | NA | NA | 从头DNA合成酶 | 工业生物技术, 合成生物学 |
| 10 | 2026-06-15 |
Diterpene Synthases as Gatekeepers of Bioactive Diterpenoids: A Resource for Discovery and Engineering toward Efficient Synthesis
2026-May-29, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00190
PMID:42215860
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综述 | 综述二萜合酶作为生物活性二萜类化合物合成的守门酶，为发现和工程化改造以实现高效合成提供资源 | 建立了包含562个功能表征二萜合酶的综合性功能数据库，并通过整合生物信息学分析阐明不同功能类别的催化机制、产物多样性和系统发育分布 | 未提及具体局限性 | 总结二萜类化合物的生物活性和应用，构建二萜合酶功能数据库，并探讨其在合成生物学中的发展方向 | 二萜合酶（diTPSs）以及代表性二萜类化合物 | 合成生物学 | NA | 合成生物学，代谢工程 | NA | 序列数据库 | 562个功能表征的二萜合酶 | NA | 微生物（如微生物细胞工厂） | 二萜类化合物生物合成途径 | 医药，农业，化妆品，食品 |
| 11 | 2026-06-15 |
Valorizing renewable biomass into potential prebiotic oligosaccharides: Enzymatic, microbial, and synthetic biology strategies
2026-May-26, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.134974
PMID:42203116
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综述 | 本文综述了利用酶工程、微生物工程和合成生物学策略将可再生生物质转化为潜在益生元低聚糖的最新进展 | 系统整合了从海洋和陆地生物质资源生产多种新型低聚糖（如新琼寡糖、纤维寡糖等）的酶法和微生物技术，并强调了GRAS级微生物宿主合成人乳低聚糖的生物制造途径 | 未详细讨论大规模生产的经济可行性和下游纯化挑战 | 总结可再生生物质转化为益生元低聚糖的生物技术方法及其在个性化营养和微生物组靶向治疗中的应用潜力 | 海洋大型藻类、木质纤维素残渣、富含果胶作物等可再生生物质 | 合成生物学 | NA | 酶工程、代谢工程、微生物共培养 | NA | NA | NA | 代谢工程、合成生物学 | GRAS级微生物宿主 | 微生物生物合成途径（如人乳寡糖合成） | 食品、医学 |
| 12 | 2026-06-15 |
Microbial lipids for a sustainable future: the growing potential of synthetic microbial engineering for consumer oils
2026-May, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2026.2615047
PMID:41692578
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综述 | 探讨合成微生物工程在生产可持续消费油和脂类中的潜力 | 总结了合成酵母基因组学和自动化生物铸造厂等最新进展，为微生物脂类可持续生产提供新思路 | 未具体讨论实际应用中的技术瓶颈或经济可行性 | 推动可持续微生物脂类生物制造经济的发展 | 微生物脂类及合成生物学方法 | 合成生物学 | NA | 合成酵母基因组学、自动化生物铸造厂 | NA | NA | NA | NA | 酵母 | 微生物脂类合成途径 | 食品、保健品、塑料、动物饲料、化妆品、制药、燃料 |
| 13 | 2026-06-15 |
Sea buckthorn for future foods: bioactive mechanisms, synthetic biology, and precision delivery systems
2026-Apr-01, Food research international (Ottawa, Ont.)
DOI:10.1016/j.foodres.2026.118364
PMID:41763752
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综述 | 系统综述沙棘作为未来食品的生物活性机制、合成生物学应用及精准递送系统 | 整合合成生物学（CRISPR/Cas9代谢工程与精密发酵）、纳米递送技术和个性化营养策略，构建沙棘从传统药用到未来智能食品的转化框架 | 未涉及具体实验验证数据，缺乏不同递送系统效率的定量比较，未讨论沙棘全产业链的技术经济可行性 | 探索沙棘生物活性成分的应用潜力，提出合成生物与食品工程相结合的产业化路径 | 沙棘中的黄酮类、类胡萝卜素、脂肪酸、维生素、多糖等生物活性成分 | 合成生物学, 食品工程 | NA | CRISPR/Cas9介导代谢工程, 精密发酵, 纳米封装技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 微生物（用于精密发酵的工程菌株） | 代谢工程通路优化、营养递送系统（封装、黏膜黏附平台） | 食品, 医药 |
| 14 | 2026-06-15 |
Ultrasound-Responsive Engineered Bacteria for Targeted Cancer Therapy: Strategies, Mechanisms, and Applications
2026-Apr, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202523952
PMID:41764403
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综述 | 综述了超声响应工程菌在肿瘤靶向治疗中的策略、机制与应用 | 系统整合了超声调控与工程菌微生物治疗相结合的创新策略，并详细阐述其作用机制及最新研究进展 | 未明确讨论该组合策略在临床转化中面临的挑战或潜在风险 | 总结工程菌在肿瘤治疗中的直接修饰方法、作用机制及应用策略，并重点阐述超声与工程菌联合应用的相互作用机制和研究进展 | 超声响应工程菌及其在肿瘤治疗中的应用 | 合成生物学、纳米科学、微生物治疗 | 肿瘤 | 合成生物学、纳米技术 | NA | NA | NA | NA | NA | 超声响应智能递药系统、生物活性分子调控回路 | 医学 |
| 15 | 2026-06-15 |
Biofilm engineering through c-di-GMP tuning boosts bioleaching efficiency and arsenic tolerance in Acidithiobacillus ferrooxidans
2026-Mar-18, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.02288-25
PMID:41705824
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研究论文 | 通过调节c-di-GMP信号增强氧化亚铁硫杆菌的生物膜形成、生物浸出效率和砷耐受性 | 通过调控全局调控分子c-di-GMP同时增强生物浸出效率和重金属耐受性，克服了传统单性状改造的局限性 | NA | 探索通过工程化c-di-GMP信号通路来优化生物浸出微生物的多个关键性状 | 氧化亚铁硫杆菌（Acidithiobacillus ferrooxidans） | 合成生物学 | NA | c-di-GMP调控技术 | NA | 转录组数据 | 三种工程菌株S-222、S-306和S-651 | NA | 氧化亚铁硫杆菌（Acidithiobacillus ferrooxidans） | 通过过表达鸟苷酸环化酶基因调控c-di-GMP信号通路 | 工业生物技术, 环境 |
| 16 | 2026-06-15 |
Adenosine Triphosphate-Producing Artificial Cells: Biomimetic Construction Strategies and Applications
2026-Mar-13, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202500934
PMID:41773731
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综述 | 该论文系统综述了通过仿生构建策略生产三磷酸腺苷的人工细胞的三种方法及其在生物医学和能源领域的应用 | 创新性地系统整合了三种构建能量自给人工细胞的策略，包括基于质子泵和ATP酶的组装、直接封装细胞器以及非经典系统，并探讨了其催化效率和生物分子封装能力 | 未明确提及当前构建策略在稳定性、可扩展性和成本效益方面的具体挑战 | 探索人工细胞中三磷酸腺苷合成的三种构建策略的最新进展，并推动从基础研究向实际应用的转化 | 人工细胞中的三磷酸腺苷合成系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | ATP合成途径模拟 | 医学, 环境, 材料 |
| 17 | 2026-06-15 |
BOTany methods: accessible automation for plant synthetic biology
2026-Mar-02, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiag066
PMID:41715940
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研究论文 | 开发了一套基于Opentrons OT-2机器人的模块化BOTany方法，用于实现植物合成生物学常见实验操作的自动化 | 通过表格化输入无需编程经验即可操作，降低了自动化门槛，并提供了从简单到复杂操作的端到端分子克隆流程 | 依赖于Opentrons OT-2机器人平台，且验证方案可能仍需针对特定实验条件进行微调 | 提高植物合成生物学实验中自动化技术的可及性和易用性 | 植物分子生物学和合成生物学相关的实验流程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 18 | 2026-06-15 |
Advancing codon language modeling with synonymous codon constrained masking
2026-Feb-24, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag166
PMID:41736545
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研究论文 | 提出了一种受生物学约束的同义密码子掩码语言模型SynCodonLM，用于建模蛋白质编码DNA序列 | 在密码子语言模型中引入同义密码子约束，使模型仅从同义选项中预测掩码密码子，从而分离密码子层面与蛋白质层面的语义，捕捉核苷酸特异性模式 | NA | 开发能更好捕获DNA层面生物学特征的密码子语言模型，推进合成生物学中的序列设计 | 蛋白质编码DNA序列 | 自然语言处理 | NA | 密码子语言建模 | SynCodonLM (基于Transformer的密码子语言模型) | DNA序列 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 19 | 2026-06-15 |
Design prokaryotic cis-regulatory elements using language model
2026-Feb-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag122
PMID:41693567
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研究论文 | 提出了一个名为PromoGen2的语言模型，用于设计原核生物顺式调控元件（CREs），无需先验实验数据 | 该模型在无明显实验数据下设计CREs，从17000个原核生物基因组预训练，零样本预测启动子强度相关性显著提升（平均Spearman相关从0.27提高到0.50），参数减少10^3倍，并在多种细菌中实现100%设计成功率 | 原文未明确提及局限性 | 开发一个广泛适用的平台，用于生成数千种原核生物的功能性启动子 | 原核生物顺式调控元件（CREs） | 机器学习 | NA | 语言模型 | PromoGen2, PromoGen2-proka | DNA序列 | 17000个原核生物基因组 | NA | Escherichia coli, Bacillus subtilis, Bacillus licheniformis, Agrobacterium tumefaciens, Jejubacter sp. L23 | 启动子 | 合成生物学, 微生物学 |
| 20 | 2026-06-15 |
Precision Fermentation Processes for Producing Novel Foods and Its Sustainable Applications
2026-Feb, Journal of basic microbiology
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/jobm.70160
PMID:41735245
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综述 | 系统综述精准发酵技术用于生产新型食品及其可持续应用的研究进展 | 首次在统一框架内整合微生物菌株设计、生物过程工程、技术经济可行性、环境绩效和监管准备度，填补了以往产品导向或生物体导向综述的空白 | 存在高资本和能源成本、放大效率低、下游处理复杂、消费者接受度低及监管不确定性等挑战 | 系统分析精准发酵在可持续食品生产中的进展与挑战 | 精准发酵生产新型食品的相关研究和案例 | NA | NA | 精准发酵 | NA | 文献数据 | 37项研究纳入综述 | 代谢途径工程 | 微生物 | 代谢途径 | 食品, 工业生物技术 |