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当前共找到 5660 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-09-10 |
Antibiotic factories on the move: Synthetic bacteria survive drinking water treatment and continuously produce antibiotics
2026-Oct-15, Water research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.watres.2026.126462
PMID:42435597
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研究论文 | 该研究发现合成抗生素高产菌株S. lividans LJ1018在饮用水处理系统中存活并持续产生抗生素，促进抗生素抗性细菌出现和传播，对供水安全构成新的风险。 | 首次探索合成抗生素高产细菌在自然水体及全饮用水供应系统中的命运，揭示其作为“移动抗生素工厂”能够穿透处理屏障并持续产抗生素，驱动抗性基因传播，重新定义合成生物学微生物的生物安全风险。 | 尚需实地验证环境条件模拟的准确性，并评估多种合成菌株在不同供水系统中的普遍性影响。 | 评估合成抗生素高产细菌在饮用水供应系统中的命运及其对水质安全的影响。 | 合成抗生素高产菌株S. lividans LJ1018及其在源水、处理过程和供水系统中的行为。 | 环境生物技术 | NA | 模拟饮用水处理流程、氯消毒、基因工程菌株构建 | NA | 实验数据 | 未明确样本数量，涉及模拟源水和饮用水处理过程及供水系统。 | 基因工程 | S. lividans LJ1018 | 合成抗生素生产菌株（高产Act-D的基因改造） | 环境生物技术, 工业生物技术 |
| 2 | 2026-09-10 |
Multi-Omics Analyses Reveal the Red and Far-Red Light Combination Enhancing Heterologous Protein and Metabolite Production in Nicotiana benthamiana
2026-Oct, Plant, cell & environment
DOI:10.1111/pce.15573
PMID:40269597
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研究论文 | 本研究探讨了不同光质对烟草瞬时表达外源蛋白和代谢产物的影响，发现红远红光组合显著提高表达效率 | 首次系统研究了光质对农杆菌介导的瞬时表达效率的影响，并揭示了红远红光通过降低植物防御通路促进农杆菌生长和表达增强的机制 | 未明确说明 | 探究光质如何影响烟草叶片中外源蛋白和代谢产物的瞬时表达效率及其潜在机制 | 烟草叶片中瞬时表达的重组绿色荧光蛋白和外源代谢产物紫杉二烯 | 植物合成生物学 | NA | 转录组学、蛋白质组学、代谢组学 | NA | 转录组、蛋白质组、代谢组数据 | 五种光质处理下的烟草植株，具体样本数未说明 | NA | 烟草 | NA | 植物生物技术、代谢工程 |
| 3 | 2026-09-10 |
Predicting transcriptional regulators in plants in the era of artificial intelligence
2026-Oct, Current opinion in plant biology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.pbi.2026.102955
PMID:42648065
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综述 | 本文综述了人工智能时代下预测植物转录调控因子的方法进展，涵盖了多组学整合、机器学习和深度学习等前沿技术。 | 本文整合了多组学与人工智能（包括机器学习和基础模型）的最新进展，提出其对植物转录调控关系预测的变革性作用，并探讨了在作物改良和合成生物学中的应用前景。 | 文中未提及具体实验验证或定量比较不同方法的性能，侧重于方法综述和未来展望。 | 综述并展望利用多组学和人工智能预测植物转录调控因子的现状与未来方向。 | 植物中的转录因子及其靶基因，以及它们所处的调控网络。 | 人工智能，机器学习 | NA | 多组学（包括转录组学、表观基因组学等）、机器学习、深度学习 | 机器学习模型、深度学习模型、基础模型（如预训练模型） | 高通量测序数据、多组学数据 | NA | NA | 植物 | NA | 农业，合成生物学 |
| 4 | 2026-09-10 |
Morphogenesis of multicellular glandular trichomes in plants
2026-Oct, Current opinion in plant biology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.pbi.2026.102952
PMID:42648064
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综述 | 本文综述了植物多细胞腺毛形态发生的最新研究进展，探讨了其调控机制和未来方向。 | 聚焦于多细胞腺毛形态发生的调控机制，并讨论了合成生物学在利用腺毛生产高价值化合物方面的潜力。 | 文献中提到了该领域面临的主要挑战，但具体局限性未明确说明。 | 阐明腺毛发育的调控机制，以改善植物抗逆性并利用合成生物学生产高价值化合物。 | 植物多细胞腺毛。 | 植物生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | 植物 | 腺毛代谢途径 | 农业, 工业生物技术 |
| 5 | 2026-09-10 |
Engineering a genetic construct to express soluble proteins tethered to the cell membrane
2026-Sep-16, Bioscience reports
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BSR20260216
PMID:42619223
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研究论文 | 本文设计了一种基因构建体，使可溶性蛋白锚定到细胞膜上，并验证其功能及在聚合物脂质纳米盘中的整合与纯化 | 提出一种模块化基因构建体，允许可溶性蛋白通过细胞膜锚定表达，结合计算模拟和实验验证，并展示其可在纳米盘中整合及通过组氨酸标签纯化 | 仅使用绿色荧光蛋白作为模型蛋白进行验证，未深入探索替换其他基因后的具体应用效果 | 开发用于表达细胞膜锚定的可溶性蛋白的基因构建体，以扩展合成生物学工具库 | 基因构建体、绿色荧光蛋白、细胞膜、聚合物脂质纳米盘 | 合成生物学 | NA | 计算模拟、实验验证 | NA | 基因序列、实验数据 | 未明确样本数量，使用绿色荧光蛋白作为模型蛋白 | NA | 未明确宿主生物（可能为细菌） | 基因构建体用于表达细胞膜锚定的可溶性蛋白 | 医学、生物技术 |
| 6 | 2026-09-10 |
Systematic mapping of insertion-tolerant regions enables capsid engineering of an infectious RNA phage
2026-Sep-09, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.01639-26
PMID:42573247
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研究论文 | 系统映射RNA噬菌体MS2和PP7的插入耐受区域，并实现PP7衣壳蛋白的工程化改造 | 首次在感染性RNA噬菌体中实现衣壳蛋白工程化，建立了基于MuA转座酶插入突变和反向遗传学的系统工作流程 | 未详细说明具体局限性，但暗示目前仅对少数ITR进行了功能验证 | 为RNA噬菌体作为合成生物学平台提供基因组插入设计原则，实现衣壳工程化 | RNA噬菌体MS2和PP7 | 合成生物学 | NA | MuA转座酶介导的插入突变、反向遗传学、定点突变、噬菌斑形成实验 | NA | 基因序列、蛋白质结构数据 | MS2的4555个和PP7的2228个随机插入克隆 | MuA转座酶介导的插入突变 | 大肠杆菌 | 肽展示位点（RGD基序插入） | 生物技术、医学 |
| 7 | 2026-09-10 |
STRATUM-Structured Framework for Reporting, Assessment, and Translational Utility of Metagenomics
2026-Sep-09, Journal of AOAC International
IF:1.7Q3
DOI:10.1093/jaoacint/qsag085
PMID:42714244
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研究论文 | 本文提出了STRATUM，一个基于使用场景分层的大规模平行测序（mNGS）报告、评估和转化效用框架。 | STRATUM框架创新性地根据决策后果对分析严谨性、验证期望和报告要求进行分层，提供三级解释模型和跨领域指导原则。 | 摘要未明确提及局限性。 | 为宏基因组测序的应用建立灵活的质量保证和报告标准，以提高结果的一致性和决策者的信心。 | 宏基因组测序流程及其在公共卫生、食品安全、环境监测、合成生物学检测和国家安全等领域的应用。 | 宏基因组学 | NA | 宏基因组二代测序（mNGS） | NA | 测序数据 | NA | NA | NA | NA | 公共卫生、食品安全、环境监测、国家安全 |
| 8 | 2026-09-10 |
A simplified and highly efficient cell-free protein synthesis system for prokaryotes
2026-Sep-08, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.109495
PMID:42708445
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研究论文 | 本文介绍了一种简化的高效原核无细胞蛋白合成系统，将核心反应组分从35种减少至7种，并开发了快速裂解液制备方案，提高了系统的可及性和鲁棒性 | 通过系统筛选将传统无细胞蛋白合成系统的核心反应组分大幅简化，并开发了省时省力的快速裂解液制备方案，同时保持甚至提高了蛋白表达水平 | 摘要未明确提及局限性 | 优化原核无细胞蛋白合成系统，提高其效率和易用性，以支持基础研究、生物技术和合成生物学应用 | 原核无细胞蛋白合成系统及其反应组分和裂解液制备流程 | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白合成 | NA | NA | NA | NA | 原核生物（如大肠杆菌） | NA | 生物技术、基础生命科学研究 |
| 9 | 2026-09-10 |
Microbial partnerships and molecular mechanisms in plant stress physiology for climate-resilient and sustainable farming
2026-Sep-08, Planta
IF:3.6Q1
DOI:10.1007/s00425-026-05140-6
PMID:42709227
|
综述 | 本文综述了植物-微生物互作及其在气候变化下提高作物抗逆性和可持续农业中的分子机制，并探讨了多组学、人工智能和合成生物学在精准设计生物接种剂和合成微生物群落中的应用 | 整合生态学、生理学和分子生物学视角，提出利用人工智能和合成生物学优化微生物组策略以实现气候适应性可持续农业的新前沿 | NA | 总结植物-微生物互作和分子机制在气候适应性与可持续农业中的知识，并探讨先进工具的应用前景 | 植物相关微生物群落及其对作物胁迫生理的影响 | 微生物组学、合成生物学 | NA | 多组学（OMICs） | NA | 组学数据 | NA | 合成生物学工具（未具体指明） | 植物 | NA | 农业 |
| 10 | 2026-09-10 |
Decoding next-generation heavy metal bioremediation via species-specific Earthworm and its gut microbiome interactions: insights from molecular responses, multi-omics, synthetic biology, and artificial intelligence
2026-Sep-08, Biodegradation
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s10532-026-10367-x
PMID:42709282
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综述 | 本文综述了蚯蚓及其肠道微生物组在重金属生物修复中的下一代策略，整合了物种特异性生理、分子解毒机制、合成生物学创新、多组学见解和人工智能建模，以推进生态可持续的修复方法。 | 详细阐明了蚯蚓-微生物联合体在金属隔离、转化和解毒中的协同作用，超越传统的以生物体为中心的观点，转向生态工程化的宿主-共生体系统。 | 未明确提及具体局限性，因文章为综述，可能缺乏实验数据支持。 | 建立一个统一框架，将物种特异性蚯蚓生理、肠道微生物组功能、分子解毒途径、合成生物学、多组学和人工智能模型整合，以推进可持续的重金属生物修复。 | 蚯蚓及其肠道微生物组，以及它们对重金属生物修复的相互作用。 | 环境科学，微生物组学，合成生物学，人工智能 | NA | 多组学，合成生物学工具，人工智能建模 | 富集动力学模型，人工智能预测模型 | 多组学数据（基因组、转录组、蛋白质组、代谢组），文本，数值数据 | 未明确指定样本数量，综述涵盖多个物种和数据类型。 | 基因编辑，途径重建，设计共生微生物 | 蚯蚓 | 目标金属结合途径（合成生物学设计） | 环境修复，生物技术 |
| 11 | 2026-09-10 |
Rewiring lactobacilli: challenges, opportunities, and the translational path to therapeutics
2026-Sep-08, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2026.102826
PMID:42710429
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综述 | 本文讨论了将乳杆菌工程化用于治疗应用的研究现状，重点关注处于临床评估阶段的候选菌株，并概述了关键的技术障碍及潜在解决方案。 | 系统性地聚焦于乳杆菌工程化的治疗应用，特别强调了临床评估中的候选菌株，并指出了实现其临床转化所需克服的技术挑战。 | 原文未提供明确局限性信息，但从讨论内容推断，可能包括乳杆菌工程化的遗传工具包有限、物种和菌株依赖性差异，以及工程菌株稳定性和安全性的不确定性。 | 探讨乳杆菌工程化用于治疗应用的现状、挑战与机遇，并提出加速其临床转化的潜在解决方案。 | 乳杆菌属的益生菌菌株，特别是正在进行临床评估的工程菌株。 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 乳杆菌 | 治疗性产物生产电路 | 医学 |
| 12 | 2026-09-10 |
Controlling viscoelastic behavior and microstructural organization in engineered living materials using synthetic adhesins and rheometry
2026-Sep-08, Acta biomaterialia
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.actbio.2026.08.044
PMID:42710705
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research paper | 利用合成细胞粘附素和流变学方法，系统研究活细菌工程化活体材料（ELM）的粘弹性和微观结构调控 | 首次将非生命材料中的流变学规律系统验证于细菌ELM，并提出通过合成粘附素与细菌细胞参数调节实现对材料力学性能的精确控制，同时揭示流变学作为主动塑造材料微观结构的工具 | 摘要未提供具体局限性信息 | 从第一性原理出发，实现工程化活体材料机械性能的合理调控，并深化对材料粘弹性和微结构控制的理解 | 由活细菌组成的多细胞工程化活体材料（ELM） | 合成生物学, 材料科学 | NA | 合成粘附素, 流变学测量 | NA | 流变学数据, 显微图像（若涉及） | 未明确样本数量，涉及不同粘附素强度、细胞形状、多组分混合比例的细菌样本 | 合成粘附素（可能涉及基因工程工具） | 细菌（如大肠杆菌，具体未明确） | 细胞间合成粘附素系统 | 生物打印, 微生物群落设计, 生物医学 |
| 13 | 2026-09-10 |
Harnessing bacterial biology and components for next-generation vaccine development
2026-Sep-07, Microbial pathogenesis
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.micpath.2026.108823
PMID:42705503
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综述 | 本文探讨利用细菌生物学及其组成成分作为下一代疫苗设计的通用平台，包括类毒素、多糖、外膜囊泡、鞭毛蛋白和细菌影等成分作为抗原和内在佐剂，以及乳酸菌作为靶向黏膜递送载体，通过激活模式识别受体诱导免疫应答，并整合合成生物学以应对多变威胁 | 系统性地综述了细菌组分作为疫苗平台的多功能应用，强调了它们在作为抗原和佐剂方面的双重作用，以及利用合成生物学实现多价疫苗响应的潜力 | 未明确提及具体局限性 | 探讨细菌生物学及其组分在开发下一代疫苗中的潜力，以应对新兴病原体并建立广泛的保护性免疫 | 细菌组分（类毒素、多糖、外膜囊泡、鞭毛蛋白、细菌影）和乳酸菌 | 疫苗学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 乳酸菌 | 免疫调节通路设计 | 医学 |
| 14 | 2026-09-10 |
Predictive design of tissue-specific mammalian enhancers that function in the mouse embryo
2026-Sep, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-026-02729-1
PMID:42642514
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研究论文 | 本文提出一种利用深度学习设计组织特异性哺乳动物增强子的通用策略，并在小鼠胚胎中验证了其功能 | 通过深度学习和迁移学习，结合染色质可及性数据和已验证增强子，首次实现从头设计在体内可靠运作的哺乳动物组织特异性增强子 | 未提及具体限制 | 开发一种通用方法，以预测性地设计在体内发挥作用的组织特异性合成增强子 | 小鼠胚胎中的心脏、肢体和中枢神经系统组织 | 机器学习 | NA | 染色质可及性测序、深度学习 | 卷积神经网络 | 基因组序列、染色质可及性数据 | 训练集包含已验证的人类和小鼠增强子；设计了15个合成增强子并进行了体内验证 | NA | 小鼠 | 组织特异性增强子 | 基因治疗、合成生物学 |
| 15 | 2026-09-10 |
Beyond the salt barrier: CRISPR-mediated DNA reprogramming to uncouple yield from tolerance in Rice: A review
2026-Sep-01, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.154254
PMID:42680037
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综述 | 本文综述了通过CRISPR介导的DNA重编程，超越传统钠离子排斥策略，实现水稻耐盐性与产量解耦的多层级系统干预方法 | 提出五层级系统级干预策略，包括去除负调控因子、增强细胞骨架运输、导入盐生植物设计原理、调整ROS-光合作用轴以及多模块聚合，以解决耐盐性与产量之间的权衡问题 | 提出的五层级中，盐生植物来源的结构性状、细胞骨架增强和全多模块聚合尚未在水稻中得到验证，目标仍是设想而非实证结果 | 旨在开发持久且产量稳定的耐盐水稻品种，通过多模块聚合实现超过70%的产量稳定性，在8-10 dS m盐度条件下 | 水稻（Oryza sativa L.） | 合成生物学 | 不适用 | CRISPR/Cas9、标记辅助回交、快速育种、基因组选择 | 不适用 | 综述文献 | 不适用 | CRISPR-Cas9 | 水稻 | 多模块聚合的“耐盐盾牌水稻”基因型设计 | 农业 |
| 16 | 2026-09-10 |
Environmental Release of Genetically Intervened Microorganisms: Towards a New Narrative
2026-Sep, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.70441
PMID:42703030
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综述 | 本文综述了基因工程微生物环境释放的现状与挑战，提出从限制性监管转向可追溯、管理和长期监测的新框架，以促进其在环境修复中的应用 | 提出将工程微生物视为与自然进化生命连续体的一部分，强调从控制转向关怀与伙伴关系的治理范式，并引入基因组条码、数字孪生等新工具 | 未提供具体的实证数据或案例研究，主要基于概念性讨论和综述 | 重新审视基因工程微生物环境释放的监管框架，提出促进其负责任应用的新叙事 | 基因工程微生物及其环境释放的监管与应用 | 环境生物技术 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | 基因组条码 | 微生物 | NA | 环境修复, 工业生物技术 |
| 17 | 2026-09-10 |
Nitrene generation and transfer for unnatural biosynthesis in living cells
2026-Aug-18, Nature chemistry
IF:19.2Q1
DOI:10.1038/s41557-026-02224-4
PMID:42613447
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研究论文 | 本文展示了在活细胞内通过细胞色素P450催化的氮宾转移反应，实现非天然产物的生物合成，从简单碳源产生多种含氮化合物 | 首次在活细胞中实现代谢中间体的分子间氮宾转移反应，拓展了合成生物学的化学空间，能够合成传统有机化学难以制备的化合物 | 未明确提及，但可能受限于底物范围和产率 | 开发活细胞中的非天然生物合成途径，将氮宾化学与代谢工程结合以生产高价值含氮化合物 | 细胞色素P450酶及代谢途径中的酶 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 活细胞（具体宿主未指明） | 代谢途径设计，包括N-乙酰氧基苯胺的生物合成以及氮宾转移反应 | 工业生物技术、医药、农业 |
| 18 | 2026-09-10 |
Optimized Yeast Surface Display Workflow for Directed Evolution of Proteases
2026-08-04, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/72559
PMID:42612041
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研究论文 | 本文介绍了一种优化的酵母表面展示工作流程，用于蛋白酶的直接进化，通过荧光激活细胞分选（FACS）筛选高特异性蛋白酶变体。 | 提出了一种优化的分步协议，包括DNA插入文库和底物盒的设计、高效电转化（转化效率高达每微克DNA 10个转化子）、多轮FACS富集和测序，并演示了将TEV蛋白酶从天然底物进化到新底物的过程。 | 信息不足，未明确提及局限性。 | 通过直接进化工程化蛋白酶，使其具有对非天然底物序列的高特异性，应用于生物技术、医学和合成生物学。 | 蛋白酶变体，特别是烟草蚀刻病毒核内蛋白酶A（TEVp）。 | 合成生物学 | NA | 酵母表面展示、FACS、电转化、DNA测序 | NA | 序列数据、流式细胞术数据 | 使用酵母细胞文库，具体数量未提及。 | CRISPR-Cas9 | 酿酒酵母（S. cerevisiae） | 基因电路设计涉及底物盒的构建，包含融合蛋白和信号肽序列。 | 生物技术, 医学, 工业生物学 |
| 19 | 2026-09-10 |
Design and optimization of a kinase-controlled allosteric switch
2026-Aug, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-026-03163-1
PMID:42481857
|
研究论文 | 本文设计并优化了一种由激酶控制的变构开关，使其能够响应磷酸化信号，从而调控转录输出 | 利用工程化变构技术，将激酶FRET生物传感器架构应用于磷酸化控制蛋白开关的设计，实现了20倍的磷酸化依赖性转录输出变化，且具有可推广性 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 开发一种通用的基于激酶响应的合成生物学工具，用于生物传感和合成生物学应用 | ERK控制的转录因子，哺乳动物发育类器官 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程，FRET | NA | 生物数据 | NA | NA | 哺乳动物细胞 | 磷酸化控制的变构开关 | 合成生物学，生物传感 |
| 20 | 2026-09-10 |
Coupled intracellular redox and extracellular respiration sensing for quantitative oxidative stress profiling
2026-Jun-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.30.727573
PMID:42282784
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研究论文 | 本文提出一种结合基因编码氧化还原生物传感器和光学氧传感器的双荧光平台，用于定量检测工业酵母细胞内的氧化还原状态和细胞外呼吸活性 | 首次集成细胞内氧化还原感应与细胞外呼吸测量，实现非侵入性、动态、多尺度的氧化应激定量分析，并揭示不同酵母物种间的氧化还原-呼吸表型差异 | 平台主要针对工业酵母系统验证，且依赖特定传感器和微孔板设置，可能限制其在不同细胞类型或大规模应用中的普遍适用性 | 通过同时测量细胞内氧化还原状态和细胞外呼吸活动，定量评估细胞氧化应激，以应用于生物制造和合成生物学中的细胞适应性评估 | 两个工业酵母物种：Crabtree阳性的酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)和专性呼吸酵母解脂耶氏酵母(Yarrowia lipolytica) | 生物传感器、合成生物学 | NA | 基因编码荧光生物传感器、光学氧传感器、荧光显微镜、微孔板读数仪 | NA | 荧光信号、氧消耗速率、图像数据 | 两种酵母菌株（酿酒酵母和解脂耶氏酵母），可能涉及多个培养条件（如葡萄糖、甘油）和药物处理（抗霉素A）下的测量，具体样本数量未提供 | 基因工程（用于稳定表达roGFP2 Tsa2ΔC传感器），具体工具如CRISPR等未提及 | 酿酒酵母(S. cerevisiae)、解脂耶氏酵母(Y. lipolytica) | 基因编码氧化还原生物传感器(roGFP2 Tsa2ΔC)与光学氧传感器集成的双荧光传感系统 | 生物制造、合成生物学 |