合成生物学相关文章

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当前共找到 6012 篇文献,本页显示第 1 - 20 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 工程工具 宿主生物 回路设计 应用领域
1 2026-11-10
Harnessing plant redox networks and bacterial modulation for next-generation abiotic stress resilience in crops
2026-Nov-07, Plant physiology and biochemistry : PPB IF:6.1Q1
综述 该综述系统探讨植物氧化还原稳态的分子机制、植物激素与促生菌的调控作用,以及多组学、合成生物学和人工智能在培育抗逆作物中的应用 整合植物氧化还原网络、根际促生菌调控与合成生物学及人工智能等下一代工程策略,提出增强作物非生物胁迫韧性的综合机制框架 作为综述文章,未提供原始实验数据验证所提出的整合框架,且对合成生物学和人工智能在氧化还原调控网络工程中的实际应用仍处于展望阶段 阐明植物氧化还原稳态的分子机制及促生菌的调控作用,并探索合成生物学与人工智能工程化氧化还原网络以加速气候韧性作物培育的潜力 植物(作物)及其氧化还原调控网络、植物激素信号和植物根际促生菌 植物科学, 农业科学, 合成生物学 NA 多组学方法(转录组学、表观基因组学等), 合成生物学, 人工智能 NA 文本 NA NA 植物(作物) 氧化还原调控网络工程 农业
2 2026-11-10
Mapping human neurodevelopment-Brain organoids meet lineage tracing
2026-Nov, FEBS letters IF:3.0Q3
综述 本文综述了脑类器官结合谱系追踪技术在人脑发育研究中的应用现状 强调脑类器官作为动态三维系统可进行纵向分析,结合组学技术的谱系追踪系统能以高分辨率解析人类发育过程 现有谱系追踪技术在保真度、可扩展性和转化相关性方面存在局限,需进一步改进 理解人脑发育相关的细胞谱系和时间进程,并探讨谱系追踪工具的改进方向 脑类器官和人类发育组织 发育生物学 NA 谱系追踪, 组学技术 NA NA NA NA NA NA 医学
3 2026-11-10
Spatially Encoded Protocell Network for Non-Cascaded Parallel Biocomputation
2026-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 提出一种基于空间编码梯度响应原细胞群的非级联生物计算架构,在三维水凝胶矩阵中利用反应-扩散动力学实现并行多阈值逻辑运算 采用非级联架构,通过空间编码和梯度响应原细胞群避免信号衰减、串扰和不稳定性,实现无需信号路由的并行多阈值计算,支持高容错非线性逻辑操作 仅在概念验证层面实现半加器和全加器,未展示更复杂逻辑电路或大规模集成能力,且系统稳定性和可扩展性需进一步验证 克服分子级联计算中的信号衰减、串扰和不稳定性问题,实现复杂并行生物计算 空间编码的梯度响应原细胞群和三维水凝胶基质 合成生物学, 分子计算 NA 反应-扩散动力学, 空间编码 NA NA NA NA 原细胞 基于空间编码原细胞网络的多阈值并行逻辑门(半加器和全加器) 医学, 工业生物技术
4 2026-11-10
Microbial production of γ-curcumene in metabolically engineered Escherichia coli using a novel γ-curcumene synthase from Parthenium argentatum
2026-Aug-12, Journal of biological engineering IF:5.7Q1
研究论文 该研究从银胶菊中鉴定了一种新型γ-姜黄烯合酶PaCS,并在代谢工程改造的大肠杆菌中实现了γ-姜黄烯的微生物生产 鉴定了一种与之前报道的广藿香γ-姜黄烯合酶系统发育不同的新型γ-姜黄烯合酶PaCS,并首次建立了γ-姜黄烯的微生物生产平台 未明确说明产量提升的具体限制因素,且仅测试了两种培养基,未进行更大规模的发酵验证 建立γ-姜黄烯的微生物生产平台,扩展萜类合酶工具箱,为γ-姜黄烯衍生分子的生物合成和下游升级提供基础 银胶菊来源的γ-姜黄烯合酶PaCS及代谢工程改造的大肠杆菌 合成生物学, 代谢工程 NA GC-MS, NMR, 代谢工程, 发酵工程 NA NA NA 异源甲羟戊酸途径 大肠杆菌 异源甲羟戊酸途径代谢通路 能源, 工业生物技术
5 2026-11-10
Modeling of Conjugative- and Phage-Mediated CRISPR-Based System Against Antimicrobial Resistant Bacteria
2026-08, IEEE transactions on bio-medical engineering
研究论文 该研究建立数学模型,评估工程化接合益生菌和噬菌体递送CRISPR系统(基因切割和CRISPR干扰)对抗耐药细菌的策略,并与传统噬菌体疗法比较 采用系统生物学方法定量比较接合细菌和噬菌体两种递送系统介导的CRISPR基因切割与CRISPRi基因沉默策略,并显式纳入突变对抗菌执行器功能的影响 研究基于数学模拟,缺乏实验验证;模型参数可能依赖于假设;未考虑宿主免疫反应和复杂微环境因素 利用系统生物学方法评估基于合成生物学的工程化益生菌和噬菌体策略对抗抗菌素耐药性的潜力,并优化治疗方案 抗生素耐药细菌、工程化接合益生菌、工程化噬菌体 系统生物学、合成生物学 细菌感染、抗菌素耐药 数学建模、CRISPR基因切割、CRISPR干扰(CRISPRi)、噬菌体疗法 常微分方程数学模型 模拟数据 NA CRISPR-Cas 益生菌、噬菌体、细菌 CRISPR基因切割系统、CRISPR干扰(CRISPRi)基因沉默系统、接合递送系统、噬菌体递送系统 医学、制药
6 2026-11-10
Alkaloids and flavonoids of Solanaceae: Mechanisms of action in neurodegenerative diseases
2026-02, Brain research bulletin IF:3.5Q2
综述 系统总结茄科植物生物碱和黄酮类成分的结构特征及其抗阿尔茨海默病、帕金森病和亨廷顿病的治疗潜力与核心作用机制 系统整合茄科来源生物碱(如尼古丁、阿托品、东莨菪碱)和黄酮类(如槲皮素、木犀草素、山奈酚、花青素)对三大神经退行性疾病的多靶点调控机制,并提出通过合成生物学和纳米递送系统促进临床转化的前景 未涉及具体实验验证,仅基于文献总结;天然产物在提取纯化、生物利用度、靶点选择性和临床转化方面仍面临挑战 探讨茄科植物次生代谢产物在神经退行性疾病治疗中的作用机制与应用潜力 茄科植物来源的生物碱和黄酮类化合物 药理学, 神经科学, 天然产物化学 阿尔茨海默病, 帕金森病, 亨廷顿病 文献综述 NA 文本 NA NA NA NA 医学, 制药
7 2026-11-10
The renaissance of Salmonella-based cancer therapy: convergence of AI, synthetic circuits, and TME remodeling
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
综述 本文综述了基于沙门氏菌的癌症治疗的复兴,探讨了人工智能、合成基因电路和肿瘤微环境重塑如何克服历史障碍 提出将AI驱动工具(如Cello和SHASI-ML)与合成生物学结合,实现从静态减毒到动态理性设计的转变,并强调沙门氏菌作为免疫调节剂而非单纯载体的新角色 文章为展望性综述,未提供新的实验数据,所讨论的策略仍需进一步的临床验证 总结沙门氏菌癌症治疗领域的最新进展,并探讨AI和合成电路如何推动下一代工程菌的开发 减毒沙门氏菌及其在癌症免疫治疗中的应用 癌症免疫治疗, 合成生物学 癌症 合成生物学, 人工智能 NA 文本 NA NA 沙门氏菌 同步裂解系统, 缺氧响应逻辑门 医学
8 2026-11-10
Plant microbiome engineering: from inoculation to genome editing
2026, Frontiers in microbiology IF:4.0Q2
综述 该综述整合了分子遗传学、微生物生态学和系统级微生物组设计,提出了将植物及其微生物组视为可工程化全息生物体的框架,涵盖从接种到基因组编辑的植物微生物组工程 将CRISPR/Cas基因组编辑、RNA干扰、合成微生物群落(SynComs)设计、AI辅助决策框架(机器学习和生态建模)以及气候韧性机制整合到统一的概念框架中,而非像以往综述那样分别讨论CRISPR介导的植物-微生物工程和SynCom设计 批判性评估了生态稳定性、性状权衡、生物安全和监管挑战等方面的局限性,这些因素制约了大规模部署 提出气候智能型微生物组工程的整合框架,并确定从经验性接种向预测性、可持续和社会负责任的农业生物技术过渡所需的关键研究优先事项 植物相关微生物组、植物-微生物互作、合成微生物群落(SynComs) 合成生物学, 微生物生态学, 农业生物技术 NA CRISPR/Cas基因组编辑, RNA干扰, 多组学, 机器学习, 生态建模 机器学习, 生态模型 多组学数据 NA CRISPR-Cas 植物, 微生物 合成微生物群落(SynComs) 农业
9 2026-11-10
Engineered implementations of spatial computation in biological systems
2025-10, Seminars in cell & developmental biology IF:6.2Q1
综述 探讨生物系统中空间分布式和区室化工程化生物计算框架,超越传统单细胞逻辑系统 通过模拟形态发生素梯度和细胞区室化等自然现象,实现合成空间计算系统的可扩展性、鲁棒性和适应性 未提及具体实验验证或应用案例的局限性 探索空间分布式和区室化框架在工程化生物计算中的应用,以解决超越传统计算架构的复杂计算挑战 工程化生物计算系统,特别是空间分布式和区室化框架 合成生物学 NA NA NA NA NA NA NA 空间计算电路、形态发生素梯度模拟、细胞区室化 医学, 环境, 诊断
10 2026-11-10
Streamline automated biomedical discoveries with agentic bioinformatics
2025-08-31, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
综述 探讨智能体生物信息学作为由大语言模型驱动的自主智能体新领域,综述其核心原理、方法、应用及挑战 提出智能体生物信息学这一新研究领域,强调自主、自适应智能体的协同工作与自我导向数据探索能力 未涉及具体实证研究或系统实现,主要停留在概念与展望层面,缺乏量化评估 探索智能体生物信息学的核心原理、演进方法和多样化应用,展望其在克服现代生物学重大挑战中的潜力 智能体生物信息学系统及其在生物医学数据探索中的应用 生物信息学 NA 大语言模型、自主智能体 大语言模型智能体 生物数据集 NA NA NA NA 医学, 药物发现, 合成生物学
11 2026-11-10
Insights into a dual function amide oxidase/macrocyclase from lankacidin biosynthesis
2018-09-28, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文揭示了抗生素lankacidin生物合成中双功能酰胺氧化酶/大环化酶LkcE的分子基础 首次报道了MAO家族中一个成员同时催化酰胺氧化和分子内Mannich反应的双功能活性,并揭示了其独特的二聚化模式、活性位点残基和构象变化 未明确说明 探究LkcE双功能活性的分子机制 LkcE酶及其催化的反应 合成生物学, 酶学 NA NA NA NA NA NA NA NA 医学, 工业生物技术
12 2026-11-09
Programmable crosslinking strategies for the rational design of engineered protein hydrogels
2027-Jan, Colloids and surfaces. B, Biointerfaces
综述 本文综述了工程化蛋白质水凝胶的设计原理,重点讨论了结构基序、生物活性结构域和刺激响应元件在调控水凝胶组装与功能中的作用,并总结了物理和化学交联策略及其对网络结构、力学性能、降解行为和刺激响应性的影响 系统整合了蛋白质工程、合成生物学、超分子化学和生物分子偶联技术,强调通过可编程交联策略实现蛋白质水凝胶的理性设计,并突出结构-性能-功能关系 作为综述文章,未提供原始实验数据,且未对现有交联策略的普适性、临床转化瓶颈和长期体内稳定性进行深入定量比较 总结工程化蛋白质水凝胶的设计原则与可编程交联策略,阐明蛋白质设计与组装同水凝胶性能之间的关系 工程化蛋白质水凝胶及其蛋白质构建模块、交联策略和功能应用 生物材料 NA 蛋白质工程, 合成生物学, 超分子化学, 生物分子偶联 NA 文本 NA NA NA NA 医学, 材料
13 2026-11-09
Biotechnology has outgrown the organism
2026-Nov-07, Trends in biotechnology IF:14.3Q1
评论 文章提出使用“生物实体”作为监管分类前的初始筛选类别,以应对合成生物学产生的模糊生物体边界的混合构造 提出“生物实体”这一概念,定义为能够与生物系统有意义地相互作用或促进生物过程的能力,作为监管分类前的初始筛选类别 文章为评论性质,未提供具体实施框架或案例验证 探讨合成生物学产物对基于生物体的生物安全监管的挑战,并提出新的监管筛选概念 合成生物学产生的混合构造及生物安全监管体系 合成生物学 NA NA NA NA NA NA NA NA 医学, 工业生物技术, 环境
14 2026-11-09
Spatial control of enzyme orientation at the lipid droplet interface enables regio- and chemoselective metabolic flux
2026-Nov-06, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 该文章通过在酵母脂滴界面设计锚定基序来空间控制酶取向,从而重排三酶级联反应以实现区域和化学选择性代谢流 利用分子动力学模拟设计脂滴锚定基序,实现酶在脂滴单层界面的定向排列(面向胞质或面向脂滴内部),并首次在脂滴界面空间重排三酶级联反应以促进亲水性底物向疏水性产物的定向转化 研究仅在酵母脂滴体系中验证,未涉及其他细胞器或宿主;产量仍处于毫克每升级别,距工业化应用有差距;对动态细胞内环境的长期稳定性未作深入评估 实现多酶级联反应在脂滴界面的空间可控固定与取向调控,增强催化性能和定向代谢流 酵母脂滴界面及三酶级联反应(用于前脱氧紫色杆菌素生物合成) 合成生物学 NA 分子动力学模拟 NA 模拟数据 NA NA 酵母 三酶级联代谢通路(前脱氧紫色杆菌素生物合成) 工业生物技术, 医药
15 2026-11-09
AI-enhanced CRISPR-Cas9 therapeutics: Advances in precision, safety, and delivery
2026-Nov-05, Progress in biophysics and molecular biology
综述 综述了AI增强的CRISPR-Cas9疗法在精准性、安全性和递送方面的最新进展 系统整合AI在gRNA设计、脱靶预测、AI设计核酸酶(如OpenCRISPR-1)、紧凑高保真SaCas9变体设计、强化学习流程优化以及CAR T细胞疗法与安全评估中的应用 仍面临脱靶效应、染色体易位、免疫原性和监管等问题,且缺乏充分的临床验证 总结CRISPR-Cas9医学应用及AI驱动优化的最新进展与未来方向 CRISPR-Cas9基因组编辑系统及其治疗应用(CAR T细胞、CAR-NK、遗传病、传染病、再生医学) 机器学习, 基因编辑, 数字病理 遗传病, 传染病, 血液肿瘤 CRISPR-Cas9, 碱基编辑, 先导编辑, 深度学习, 强化学习, 单细胞测序, 类器官 深度学习架构, 强化学习 文本 NA CRISPR-Cas9 哺乳动物细胞 NA 医学
16 2026-11-09
Beyond the salt barrier: CRISPR-mediated DNA reprogramming to uncouple yield from tolerance in Rice: A review
2026-Nov, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1
综述 本文综述了利用CRISPR介导的DNA重编程在水稻中解耦产量与耐盐性的策略,提出一个涵盖五个机制层级的系统级干预框架 提出从单基因Na+排除转向多层级系统干预,整合CRISPR敲除负调控因子、细胞骨架强化、盐生植物设计原理导入、ROS-光合轴重校准及多模块聚合,并设计十年路线图 五个层级中三个(盐生植物来源结构性状、细胞骨架强化、完整多模块聚合)在水稻中尚未验证,70%以上产量稳定性目标仍为理想设计而非实证结果 探讨如何通过CRISPR介导的DNA重编程实现水稻耐盐性与产量的解耦,提出系统级育种策略 水稻(Oryza sativa L.),特别是盐敏感和耐盐基因型,以及盐生植物Oryza coarctata 农业生物技术 非生物胁迫(盐胁迫) CRISPR/Cas9基因编辑、标记辅助导入、快速育种、基因组选择 NA 文本 NA CRISPR-Cas9 水稻(Oryza sativa),可能涉及Oryza coarctata基因导入 多模块合成生物学回路设计:包括负调控因子敲除、细胞骨架运输强化、盐腺结构导入、ROS-光合分子开关重校准及多模块聚合的Salt-Shield Rice系统 农业
17 2026-11-09
Sulfated polysaccharides and their utilization mechanisms by microorganisms: A review
2026-Nov, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1
综述 本文综述了硫酸多糖(SPS)的来源、结构组成、生物活性以及微生物对其降解机制的研究进展 系统比较了不同微生物(拟杆菌门Sus-like系统、乳酸菌、微球菌)对硫酸多糖的降解策略,并探讨了微生物自身合成SPS在其生存发展中的作用 作为综述文章,未提供原始实验数据,对降解机制的分子细节和不同微生物间协同作用的阐述可能不够深入 总结硫酸多糖的结构、生物活性及微生物降解利用机制,为其在合成生物学、代谢工程和医疗保健领域的应用提供参考 硫酸多糖(肝素、硫酸软骨素、岩藻聚糖、磺达肝癸钠)及降解它们的微生物(拟杆菌门、乳酸菌、微球菌) 糖生物学 NA NA NA 文本 NA NA NA NA 医学, 工业生物技术
18 2026-11-09
Dual-targeted bioengineered bacterial extracellular vesicles ameliorate senile osteoporosis via SAE1-mediated NAT10 SUMOylation and ac4C-dependent glycolysis
2026-Aug-07, Journal of nanobiotechnology IF:10.6Q1
研究论文 本研究通过合成生物学构建了双靶向生物工程化细菌外膜囊泡(BT-BEVs-CS),利用SAE1介导的NAT10 SUMO化及ac4C依赖性糖酵解改善老年性骨质疏松 构建了同时展示骨靶向肽SDSSD、趋化因子受体CXCR4和SAE1的双靶向生物工程化BEVs,首次揭示了SAE1-NAT10/ac4C-PGI调控轴在BMSCs成骨分化中的作用 仅提供临床前概念验证,尚未进行临床转化验证;BEVs的规模化生产、安全性及长期效应有待进一步评估 开发靶向调控骨髓间充质干细胞成骨分化的纳米干预策略以治疗老年性骨质疏松 老年性骨质疏松小鼠模型及骨髓间充质干细胞(BMSCs) 骨科学、再生医学、纳米医学 老年性骨质疏松 合成生物学、蛋白质工程、RNA表观遗传学、SUMO化修饰分析 NA 体内外实验数据、分子生物学数据 NA 合成生物学 细菌(用于生产细菌外膜囊泡) 双靶向BEVs展示系统(骨靶向肽SDSSD、CXCR4、SAE1) 医学
19 2026-11-09
Trace elements and tumors: homeostatic networks, molecular mechanisms and new horizons for precision intervention
2026-07-30, Molecular cancer IF:27.7Q1
综述 系统阐述铁、铜、锌、硒、锰五种微量元素的稳态网络、分子机制及其在肿瘤精准干预中的新前沿 提出元素成瘾机制解释肿瘤劫持微量元素调控网络,整合铁死亡和铜死亡等新型细胞死亡方式,并将微量元素视为肿瘤免疫微环境的分子开关,同时分类总结元素响应纳米平台和合成生物学工程免疫细胞等跨学科治疗策略 大多数治疗证据来自临床前模型,缺乏临床转化验证,且当前知识体系仍存在空白,需要更严谨的基础研究支撑 系统梳理五种核心微量元素在生理和肿瘤条件下的调控网络与分子机制,为肿瘤精准干预提供理论框架和未来研究方向 铁、铜、锌、硒、锰五种微量元素的代谢网络、肿瘤细胞、肿瘤免疫微环境、肿瘤血管生成与转移过程 肿瘤生物学、系统生物学、代谢调控 泛癌种 NA NA 文本 NA NA NA NA 医学
20 2026-11-09
Bioconversion of carotenoids into high-value crocins using a marine sponge carotenoid cleavage dioxygenase
2026-Jun, The New phytologist
研究论文 该文章研究了海洋海绵Suberites domuncula来源的类胡萝卜素裂解双加氧酶(SdCDO)在大肠杆菌和番茄中的异源表达,发现其能将番茄红素和β-胡萝卜素裂解为藏红花素前体藏红花酸二醛,并促进番茄果实中藏红花素积累 首次发现海绵来源的CCD具有将类胡萝卜素转化为藏红花素前体的酶学可塑性,并证明其可重定向植物类胡萝卜素代谢以合成藏红花素,揭示了CCD在不同物种间的功能多样性 研究主要基于异源表达系统,对SdCDO在天然海绵宿主中的生理功能尚未阐明,且番茄中内源类胡萝卜素相关基因广泛下调的机制有待进一步研究 评估海洋海绵CCD形成类视黄醇的能力,并探索其在类胡萝卜素代谢工程中的应用潜力 海洋海绵Suberites domuncula来源的类胡萝卜素裂解双加氧酶(SdCDO)、番茄红素、β-胡萝卜素、番茄(Solanum lycopersicum)果实 合成生物学、植物代谢工程 NA 异源表达、代谢分析、超微结构分析、转录组分析 NA 代谢物数据、显微图像、转录组数据 NA NA 大肠杆菌(Escherichia coli)、番茄(Solanum lycopersicum) 类胡萝卜素裂解代谢途径(SdCDO介导的类胡萝卜素向藏红花素转化途径) 农业、医药、食品
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