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当前共找到 5746 篇文献,本页显示第 1 - 20 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 工程工具 宿主生物 回路设计 应用领域
1 2026-09-27
A 6His-2Flag dual-tag strategy enables high-yield production of antimicrobial peptide N6 in Pichia pastoris to combat multidrug-resistant Klebsiella pneumonia
2027-Apr, Synthetic and systems biotechnology IF:4.4Q1
研究论文 本研究在毕赤酵母X-33中建立了抗菌肽N6的高效异源表达系统,采用6His-2Flag双标签融合策略结合甲酸介导的切割,实现了N6的高产,并验证了其抗多重耐药肺炎克雷伯菌的活性 采用创新的6His-2Flag双标签融合策略结合甲酸介导切割,实现抗菌肽N6在毕赤酵母中的高产(1.02 g/L),显著超越以往报道并达到可规模化工业生产水平 尚未开展临床试验,仅在小鼠系统感染模型中验证了疗效,其人体安全性和药代动力学特性仍需进一步研究 建立抗菌肽N6的高效异源表达系统并评估其抗多重耐药肺炎克雷伯菌的治疗潜力 抗菌肽N6、多重耐药肺炎克雷伯菌临床分离株、毕赤酵母X-33表达系统、小鼠系统感染模型 合成生物学 细菌感染 异源蛋白表达、6His-2Flag双标签融合、甲酸介导切割、MIC测定、生物膜清除实验 小鼠系统感染模型 实验数据 NA 6His-2Flag双标签融合策略 毕赤酵母X-33 6His-2Flag双标签融合抗菌肽N6表达盒 医学
2 2026-09-27
Identifying paths to ammonium production in Vibrio natriegens by characterizing nitrogenase regulation
2026-Sep-25, Metabolic engineering IF:6.8Q1
研究论文 该文章通过功能基因组学、靶向突变和报告基因实验,鉴定了Vibrio natriegens中固氮酶调控蛋白的作用及其对铵与氮气的响应 首次系统表征了Vibrio natriegens固氮酶的调控网络,发现NifA足以激活固氮酶基因表达且NtrBC并非必需但影响表达时序,同时揭示GlnB和GlnK对NtrBC的冗余抑制更类似于非固氮大肠杆菌 研究主要基于遗传和报告基因实验,未全面解析所有调控因子的分子机制及翻译后修饰水平 解析Vibrio natriegens固氮酶的调控机制,为利用廉价氮源生产铵提供理论基础 Vibrio natriegens的固氮酶调控蛋白及其调控网络 合成生物学 NA 功能基因组学, 靶向突变, 报告基因实验 NA NA NA NA Vibrio natriegens NA 工业生物技术
3 2026-09-27
Designing gene expression with MPRA and AI: A new paradigm for synthetic and therapeutic regulation
2026-Sep-22, Biotechnology advances IF:12.1Q1
综述 本文综述了条形码MPRA技术与深度学习模型相结合用于cis调控元件理性设计与基因表达调控的新范式 将条形码MPRA技术与AI驱动建模框架融合,实现数据高效且跨情境可泛化的CRE设计与预测 存在当前技术和概念上的局限,尚未完全实现安全、可编程且临床相关的调控控制系统 综合MPRA平台与AI建模在CRE理性工程中的最新进展,展望下一代cis调控工程与基因治疗路线图 cis调控元件、合成调控元件、基因表达调控系统 机器学习 NA MPRA、深度学习建模、条形码技术 深度学习模型 序列数据 NA NA 微生物、哺乳动物细胞 cis调控元件、合成调控元件 医学、工业生物技术
4 2026-09-27
Next-generation fermented foods from non-conventional proteins: Linking fermentation dynamics, flavor chemistry, and gut microbiome modulation
2026-Sep-19, International journal of food microbiology IF:5.0Q1
综述 该综述定义了下一代发酵食品(NGFFs),即通过理性发酵非常规蛋白质底物,实现优异感官、营养和肠道健康效果,并系统阐述了发酵动态、风味化学与肠道微生物调节之间的级联关系 提出下一代发酵食品(NGFFs)的明确定义,构建了过程-属性-健康(PPH)关联框架以理性设计NGFF,并探讨人工智能、合成生物学和生命周期评估加速其转化应用 人类证据仍然有限,存在持续的知识空白、文献中未解决的矛盾以及方法论局限性,当前理解多基于描述性案例研究而非预测性机制设计 系统综合受控发酵对非常规蛋白质底物的级联效应,连接发酵动态与风味化学及肠道微生物调节,提出NGFF的理性设计框架并指明优先研究方向 非常规蛋白质来源,包括昆虫、微藻、单细胞生物和新型植物 食品科学 NA NA NA 文本 NA NA NA NA 食品,医学
5 2026-09-27
Probiotics and Extracellular Vesicles as Redox Modulators in Wound Healing: From Microbial Therapeutics to Engineered Nanotherapeutic Strategies
2026-Sep-15, Antioxidants (Basel, Switzerland)
综述 本文综述了益生菌及其细胞外囊泡作为氧化还原调节剂在伤口愈合中的作用,从微生物治疗到工程化纳米治疗策略 系统整合了益生菌来源EVs在伤口愈合中调控氧化还原的机制证据,并提出工程化益生菌EVs作为可编程氧化还原纳米治疗平台的新概念,强调其相较传统抗氧化剂和哺乳动物EV系统的优势(无细胞、微生物组兼容、易于工程化) 多数机制关联来自通路标志物或间接实验,缺乏直接机制验证;益生菌来源EVs用于伤口愈合的证据主要处于临床前阶段,缺乏直接临床证据;EV标准化、生物安全性、生物分布、药代动力学及临床验证等关键问题尚未解决 综合评估益生菌、细胞外囊泡及益生菌来源工程化EVs在伤口愈合中作为氧化还原调节剂的治疗潜力,探索从微生物治疗向工程化纳米治疗策略的转化路径 益生菌、益生菌来源细胞外囊泡、工程化益生菌EVs、慢性伤口 再生医学、纳米医学 慢性伤口 结构化文献检索与证据筛选、合成生物学、货物装载、生物材料辅助递送系统、ROS响应平台 NA 文本 NA NA 益生菌 NA 医学
6 2026-09-27
Biobased Compounds and the Circular Economy: A Bibliometric Review of Waste Valorization and Environmental Sustainability
2026-Sep-15, Molecules (Basel, Switzerland)
综述 通过文献计量学与系统综述方法,绘制了生物基化合物与循环经济研究的知识结构图谱,识别了研究空白与优先领域 综合运用文献计量学与系统综述方法,首次系统识别了生物基化合物与循环经济领域的十大转型研究空白,并构建了研究优先级指数 理论基础薄弱及研究持续时间有限,机械性能与可再加工性面临额外的跨学科复杂性 绘制生物基化合物与循环经济研究的知识结构,识别研究优先领域与工业可扩展性差距 2010年至2026年发表的生物基化合物与循环经济相关同行评审文献 机器学习 NA 文献计量分析、系统综述、关键词共现网络分析、合著网络分析 NA 文本 1306篇同行评审文献(检索自Scopus,初始检索1350篇,经PRISMA筛选后纳入1306篇) NA NA NA 环境, 材料, 工业生物技术
7 2026-09-27
Fungal Biotechnology for Sustainable Biocomposites: From Mycelium Growth to Material Translation
2026-Sep-15, Molecules (Basel, Switzerland)
综述 系统评述真菌生物技术驱动的菌丝体基生物复合材料,涵盖真菌生物合成、底物转化、加工策略与材料性能之间的关系 从真菌生物合成到材料转化的全链条视角整合了合成生物学、先进材料化学与数字化生物制造,强调加工驱动的材料优化与多功能菌丝体基生物复合材料的可规模化设计 作为综述文章,未提供原始实验数据,对具体工艺参数、规模化生产的经济性与技术瓶颈缺乏定量分析 评估菌丝体基生物复合材料的研究进展,阐明真菌生物合成、底物转化、加工策略与材料性能之间的关系,并探讨未来发展方向 菌丝体基生物复合材料(MBCs),包括真菌菌丝、几丁质、壳聚糖、β-葡聚糖及聚合物底物 材料科学 NA NA NA 文本 NA NA 真菌 NA 材料, 环境, 包装, 建筑
8 2026-09-27
Predictive design of tissue-specific mammalian enhancers that function in the mouse embryo
2026-Sep, Nature genetics IF:31.7Q1
研究论文 该研究提出了一种设计组织特异性哺乳动物增强子的通用策略,通过深度学习模型预测设计的合成增强子在小鼠胚胎中可靠地驱动目标组织表达 首次证明仅从DNA序列即可可靠推断哺乳动物增强子功能,并在体内复杂调控环境中实现组织特异性合成增强子的从头设计 训练数据集规模有限,仅针对心脏、肢体和中枢神经系统设计并验证了15个合成增强子,未涵盖更多组织类型和其他哺乳动物物种 开发一种能够在哺乳动物体内可靠工作的组织特异性增强子预测设计框架 小鼠胚胎中的心脏、肢体和中枢神经系统组织特异性增强子 机器学习 NA 染色质可及性测序 CNN 序列 15个合成增强子,基于人类和小鼠的验证增强子数据训练 NA 小鼠 NA 医学, 工业生物技术
9 2026-09-27
Biosynthesis and Microbial Production of Carminic Acid: From Pathway Elucidation to Synthetic Biology
2026-Aug-22, Microorganisms IF:4.1Q2
综述 本文综述了胭脂红酸的生物合成途径解析及其在微生物细胞工厂中异源生产的进展 系统整合了III型聚酮合酶组装与昆虫相关修饰反应(尤其是C-糖基化)的途径解析,并提出了前体-途径重编程、AI辅助酶工程、生物传感器调控与过程优化相结合的综合策略 当前微生物生产仍面临产量低、酶表征不完整、宿主-途径不兼容以及可放大纯化困难等挑战,工业转化尚未成熟 总结胭脂红酸从途径解析到微生物合成的进展,并探讨其工业转化的关键挑战与解决策略 胭脂红酸生物合成途径、异源生产宿主(大肠杆菌、酵母等)及结构相关蒽醌色素 合成生物学 NA 途径解析、异源表达、代谢工程、酶工程 NA 文本 NA NA 大肠杆菌、酵母 前体供应途径、丙二酰辅酶A工程、动态调控、生物传感器调控 食品、化妆品、纺织、医药、工业生物技术
10 2026-09-27
Automated synthetic cell-based screening for designed proteins with emergent functions
2026-Aug-15, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文提出了一种自动化微流控平台PUREdrop,用于在皮升级合成细胞中封装和表达蛋白质文库,并通过延时成像筛选具有涌现功能的蛋白质 开发了PUREdrop平台,能够将蛋白质文库封装在数千个皮升级合成细胞中,并分配到96孔板中进行延时成像,实现表达动力学和涌现功能的并行定量分析,弥补了传统筛选方法缺乏时空分辨率和细胞样限域的不足 摘要中未提及 设计具有涌现功能(如时空自组织)的极简生物系统,并加速功能性蛋白质工程 细菌细胞分裂蛋白FtsZ的计算重设计变体以及FtsZ的通用蛋白质调节因子 合成生物学 NA 微流控、延时成像、无细胞蛋白质合成 NA 图像 每个构建体在数千个皮升级合成细胞中表达 NA NA NA 医学、工业生物技术
11 2026-09-27
De Novo Synthesis in Cancer Immunotherapy: Applications and Prospects
2026-Jul, MedComm IF:10.7Q1
综述 本文综述了从头蛋白质设计在癌症免疫治疗中的应用,包括免疫检查点调控、细胞因子工程、细胞治疗和信号通路重塑等方面 系统整合了理性设计原则(特异性、模块性和适应性)与从头蛋白质设计技术,用于癌症免疫治疗,并强调计算工具和合成生物学技术在优化免疫调节蛋白和细胞免疫治疗中的应用 领域内仍存在关键局限性尚未完全解决 探讨从头蛋白质设计在癌症免疫治疗中的应用前景和最新进展 从头设计的蛋白质及其在癌症免疫治疗中的应用 机器学习, 数字病理学 肺癌 从头蛋白质设计, 计算工具, 合成生物学技术 NA 文本 NA NA 哺乳动物细胞 嵌合抗原受体T细胞(CAR-T)构造, 双特异性抗体 医学
12 2026-09-27
Protein engineering: status report
2026-Jan-09, Protein engineering, design & selection : PEDS
综述 本文是蛋白质工程领域的现状报告,涵盖计算、分子生物学、结构引导、进化和合成方法等主题,强调机器学习和人工智能的影响 提供蛋白质工程领域的及时快照,强调机器学习和人工智能方法的增长影响,并指出该领域正进入黄金时代 设计、筛选和实际应用中仍存在重大挑战 提供蛋白质工程领域的现状报告,涵盖核心方法和主要应用领域 蛋白质工程领域 机器学习 NA 计算、分子生物学、结构引导、进化、合成方法 机器学习, 人工智能 文本 NA NA NA NA 医学, 工业生物技术, 材料, 环境
13 2026-09-27
Oncobiotics in urinary bladder cancer. A narrative review of living cancer therapeutics
2026, Frontiers in oncology IF:3.5Q2
综述 本文是一篇叙述性综述,系统梳理了活体癌症治疗(包括细菌、病毒和微生物组类肿瘤生物制剂)在膀胱尿路上皮癌中的机制、历史发展和转化进展 首次系统性地将膀胱尿路上皮癌中的活体癌症治疗归纳为五种相互关联的机制框架,涵盖了细菌定植与代谢剥夺、免疫调节、工程化药物递送与合成生物学、溶瘤病毒治疗以及微生物组驱动的免疫调节,并强调了膀胱作为活体治疗开发 favorable 部位的特殊优势 当前证据受限于小规模研究、异质性终点和缺乏长期随访,大多数工程化平台仍处于早期临床前或转化阶段,存在生物递送屏障、宿主免疫中和、患者间异质性、生物安全性问题、监管复杂性以及缺乏晚期随机临床试验数据等局限 描绘活体癌症治疗在膀胱尿路上皮癌中的机制全景、历史发展和转化进展,评估其未来在膀胱尿路上皮癌管理中的潜在角色 膀胱尿路上皮癌及其活体癌症治疗策略,包括细菌类、病毒类和微生物组类肿瘤生物制剂 肿瘤学,合成生物学,免疫治疗 膀胱癌 溶瘤病毒治疗,细菌介导的肿瘤治疗,微生物组调控,合成生物学工程,基因工程 NA 文本 NA 合成生物学,基因工程 细菌,病毒 可编程细菌载体,工程化溶瘤病毒,肿瘤限制性载荷释放系统 医学
14 2026-09-27
Transposon-derived genome editors in plants: from compact nucleases to large-fragment integration and regeneration strategies
2026, Engineering in life sciences IF:3.9Q2
综述 该综述系统分析了源自转座元件的新兴植物基因组编辑工具(OMEGA核酸酶、CAST、R2逆转座子系统),并探讨了其与植物再生策略的整合应用 系统梳理了转座元件衍生基因组编辑器的结构、进化起源及其相较于传统Cas9的优势(紧凑尺寸、简化向导RNA、交错DNA切割),并首次将TE编辑器与植物再生技术(如Cut-Dip-Budding)进行整合讨论 TE衍生编辑器在植物中的编辑效率、递送和特异性方面仍面临挑战,应用尚处于初期阶段 全面分析转座元件衍生的基因组编辑器在植物中的应用潜力,并探讨其与再生策略的整合以推动植物合成生物学和作物改良 OMEGA核酸酶(TnpB、IscB、Fanzor)、CRISPR关联转座酶(CASTs)、R2逆转座子衍生系统以及植物再生调控因子(BBM、WUS) 植物基因组编辑 NA CRISPR/Cas、OMEGA核酸酶、CAST、R2逆转座子系统 NA 文本 NA CRISPR-Cas9, CAST, OMEGA 植物 NA 农业, 医学
15 2026-09-27
Regulatory mechanisms and multidimensional applications of blueberry anthocyanins: a review of current gaps and future directions
2026, Engineering in life sciences IF:3.9Q2
综述 本文综述了蓝莓花青素的调控机制及其在食品、医药、化妆品等多领域的应用,并探讨了未来研究方向 系统整合了蓝莓花青素在酶促途径和遗传层面的调控机制,强调了光温等环境因子的作用,并提出了代谢工程、合成生物学和生物过程工程策略来提升花青素生物合成、稳定性和产量 蓝莓花青素产生的精确调控机制仍未完全阐明,现有研究存在不足 全面分析蓝莓花青素的调控机制、健康益处和多维应用,为未来研究提供框架 蓝莓花青素 机器学习 心血管疾病, 神经退行性疾病, 癌症 NA NA 文本 NA NA NA NA 食品, 医药, 化妆品, 纺织品, 智能包装
16 2026-09-26
Beyond direct pathway engineering: reprogramming Fusarium fujikuroi from a GA3 producer into a GA4+7 factory
2026-Dec, Bioresource technology IF:9.7Q1
研究论文 本研究提出了一种双干预范式,通过引入拟南芥来源的转运蛋白和过表达Ppt1实现转录后沉默,将藤仓镰刀菌从GA3生产者重编程为GA4+7工厂 提出了一种非传统的间接代谢重编程策略,不通过直接改造代谢途径,而是靶向膜转运瓶颈并利用假定的转录后沉默机制,实现了GA4+7的专一性生产 文中未明确提及研究局限性 将工业真菌藤仓镰刀菌从默认的GA3生产者重编程为高价值赤霉素GA4+7的专一性工厂 藤仓镰刀菌(Fusarium fujikuroi) 合成生物学 NA 代谢工程、发酵优化 NA NA NA NA 藤仓镰刀菌 通过引入拟南芥来源转运蛋白(Npfs和Sweets)构建热力学汇以消耗胞内GA3/GA4+7池,同时过表达Sfp型4'-磷酸泛酰巯基乙胺基转移酶Ppt1触发P450-3 mRNA的转录后沉默 工业生物技术、医药
17 2026-09-26
State-of-the-art lignin depolymerization and its routes to microbial valorization
2026-Dec, Bioresource technology IF:9.7Q1
综述 系统评估木质素解聚的最新技术(物理、化学、生物方法),并强调通过代谢工程、合成生物学和系统代谢工程将木质素衍生芳香化合物微生物升级为高附加值产品的集成策略 提出从解聚到增值的集成设计概念,强调将分子水平的解聚机制与代谢途径设计相连接,并重点关注构建稳健的微生物细胞工厂以提高碳汇聚效率和实现选择性产物生物合成 生物解聚在反应速率、底物异质性和可扩展性方面仍面临挑战,各解聚技术均有其固有局限性,集成策略尚处于起步阶段 评估木质素解聚的最新技术进展,并探讨解聚路线与下游生物转化的衔接,为构建经济可行、可扩展和可持续的木质素生物精炼厂提供理论基础 木质素(木质纤维素生物质的主要成分)及其解聚产物(酚类单体和低聚物),以及用于微生物增值的工程微生物细胞工厂 合成生物学, 代谢工程, 生物催化 NA 物理解聚, 化学催化解聚(催化、氧化、还原、溶剂解), 生物酶解聚, 代谢工程, 合成生物学, 系统代谢工程 NA 文本 NA NA NA 代谢途径工程(木质素衍生芳香化合物代谢途径), 碳汇聚途径 生物能源, 生物基材料, 工业生物技术, 环境
18 2026-09-26
Metabolic fermentation pathways of microalgae for the synthesis of high-value chemical products
2026-Dec, Bioresource technology IF:9.7Q1
综述 本文综述了微藻通过发酵途径(如酒精发酵、暗发酵和丙酮-丁醇-乙醇发酵)将碳水化合物和蛋白质转化为高价值有机代谢物(包括醇类、有机酸、醛、酮、酯和萜类/类异戊二烯)的生化多样性和酶学机制,并探讨了代谢工程优化微生物菌株(如酿酒酵母和梭菌)以提高产量的最新进展 系统整合了微藻生物质通过多种发酵途径转化为高价值化合物的生化机制,特别指出了富含类胡萝卜素的微藻(如杜氏藻和雨生红球藻)用于萜类/类异戊二烯发酵生产仍是科学空白,并提出了合成生物学和实时生物传感器在更稳健、灵活和工业化过程中的应用前景 富含类胡萝卜素的微藻(如杜氏藻和雨生红球藻)专门用于萜类/类异戊二烯生产的发酵研究仍存在空白,相关研究尚不充分 探讨微藻通过代谢发酵途径合成高价值化学产品的生化多样性和酶学机制,并综述代谢工程优化菌株以提高产量的研究进展 微藻生物质(小球藻、节旋藻、微拟球藻、栅藻、绿球藻、杜氏藻、雨生红球藻)及发酵微生物(酿酒酵母、梭菌) 合成生物学 NA 发酵工程、代谢工程、合成生物学 NA 文本 NA NA 酿酒酵母, 梭菌, 微藻 代谢途径(酒精发酵、暗发酵、丙酮-丁醇-乙醇发酵途径) 能源, 材料, 工业生物技术, 食品
19 2026-09-26
Mitochondria as programmable redox rheostats: Advancing from transplantation to bioengineered organelle therapeutics
2026-Oct, Redox biology IF:10.7Q1
综述 该综述讨论了线粒体从移植疗法向可编程生物工程细胞器疗法转变的最新进展,重点介绍了通过合成生物学、纳米医学和生物材料对线粒体进行改造以增强其ROS清除能力、稳定性和靶向递送。 提出将线粒体视为可编程治疗单元而非静态移植物的理念,并系统总结了表面功能化、基因调控及融合胶囊、光热纳米刀等先进递送平台等新兴改造策略。 线粒体移植面临靶向特异性差、递送动力学低、分离后功能衰退等转化障碍,线粒体工程化疗法距离临床精准、可规模化应用仍有距离。 探讨线粒体作为可编程氧化还原变阻器的治疗潜力,评估从线粒体移植到生物工程细胞器疗法的转变,分析提高疗效的关键策略与转化瓶颈。 线粒体、线粒体移植疗法、生物工程化线粒体。 合成生物学 缺血再灌注损伤、神经退行性疾病、代谢综合征、肺癌、前列腺癌、心血管疾病、老年疾病 NA NA 文本 NA NA NA NA 医学
20 2026-09-26
Engineering a protein homodimer from a heterodimer: A chimeric DBHS protein
2026-10, Protein science : a publication of the Protein Society IF:4.5Q1
研究论文 本研究设计并表征了一种嵌合DBHS蛋白,使其能够形成同源二聚体,模拟DBHS异源二聚体的界面 首次成功将偏好异源二聚化的DBHS蛋白工程化为稳定的同源二聚体,并证明其在高浓度天然DBHS蛋白存在下仍保持同源二聚体状态 研究未深入探讨该工程化同源二聚体在细胞内环境中的稳定性和功能,且对DBHS蛋白偏好性的分子决定因素仅提出了可能的机制 设计并表征一种嵌合同源二聚体DBHS蛋白,以理解DBHS蛋白二聚化偏好的分子基础 DBHS蛋白家族(包括SFPQ、NONO、PSPC1)及其嵌合体 结构生物学 NA X射线晶体学,生物化学表征 NA 结构数据,生化数据 NA NA NA NA 医学,合成生物学
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