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当前共找到 5620 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-09-02 |
Engineered bacterial therapeutics from synthetic biology to clinical translation: A multi-database scientometric analysis, 2000-2026
2026-Dec, Human vaccines & immunotherapeutics
IF:4.1Q2
DOI:10.1080/21645515.2026.2720162
PMID:42641146
|
研究论文 | 通过多数据库文献计量分析，描绘了工程细菌疗法从合成生物学到临床转化的知识结构、合作模式和转化方向 | 首次采用多数据库（Web of Science、Scopus、PubMed）结合多种文献计量工具（CiteSpace、VOSviewer、bibliometrix）综合分析工程细菌疗法领域2000至2026年的研究趋势和主题演变 | 仅包含英文文献，且2026年数据不完整；依赖数据库索引，可能遗漏未收录的相关研究 | 绘制工程细菌疗法领域的知识结构、合作模式和转化方向，以指导未来研究和临床转化 | 工程细菌疗法相关的出版物，包括研究论文和综述 | 合成生物学、文献计量学 | 癌症、肠道疾病（涉及） | 文献计量分析 | NA | 文献数据 | 1,730篇英文文章和综述 | NA | 细菌 | 生物电路设计（用于感应、递送、免疫调节等功能） | 医学、工业生物技术 |
| 2 | 2026-09-02 |
Sustainable Biocatalytic Cascades: A Versatile Tool in the Synthesis of Natural Products With Therapeutic Potential
2026-Sep-14, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.70492
PMID:42673276
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综述 | 本文综述了生物催化级联反应在合成具治疗潜力的天然产物中的应用，强调其作为可持续合成工具的优势。 | 强调生物催化级联反应结合蛋白质工程、定向进化、计算酶设计和合成生物学的最新进展，扩展了酶级联的应用范围，展示了其在复杂天然产物和药物合成中的变革潜力。 | 未提及具体局限性。 | 探讨生物催化级联反应在可持续合成具治疗潜力的天然产物中的作用，并展示其在现代合成和药物发现中的重要性。 | 生物催化级联反应、复杂聚酮化合物、生物活性生物碱、药物和活性药物成分（API）以及杂环支架。 | 合成生物学 | NA | 生物催化级联反应、蛋白质工程、定向进化、计算酶设计、合成生物学 | NA | NA | NA | 蛋白质工程、定向进化、计算酶设计 | NA | 生物催化级联反应（酶级联） | 药物发现、可持续化学制造 |
| 3 | 2026-09-02 |
Light governed plant-microbe interactions: the role of light in biotic stress resilience
2026-Sep, Physiology and molecular biology of plants : an international journal of functional plant biology
IF:3.4Q1
DOI:10.1007/s12298-026-01806-3
PMID:42676416
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综述 | 本文综述了光在植物-微生物互作及生物胁迫响应中的调控作用，探讨了光如何影响植物免疫、次级代谢和微生物群落行为，并提出了将光生物学与微生物组研究结合以开发抗病和气候智能作物的新策略。 | 将光生物学与微生物组研究相结合，提出利用光响应途径开发抗病和气候智能作物的新方法，为可持续农业提供新思路。 | 未提及具体局限性。 | 阐明光在植物-微生物互作和生物胁迫响应中的调控作用，并探讨其应用潜力。 | 植物、植物相关微生物组（有益微生物）、光信号通路 | 植物科学、微生物学、生物技术 | 植物病害（由植物病原体引起） | NA | NA | NA | NA | NA | 植物 | NA | 农业 |
| 4 | 2026-09-02 |
Recent discovery of new enzymes in plant natural product biosynthesis
2026-Aug-31, Current opinion in chemical biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.cbpa.2026.102752
PMID:42673660
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综述 | 本文综述了植物天然产物生物合成中新酶发现的最新进展，重点介绍了新兴的催化机制、途径解析策略和进化关系。 | 强调了植物来源酶催化挑战性化学转化（如氧化碳-碳键重排、非常规环加成、自由基介导偶联和迭代骨架重塑）的发现。 | 未提及具体局限性。 | 总结植物天然产物生物合成中酶发现的主要进展，并探讨其对合成生物学、代谢工程和可持续生产的影响。 | 植物天然产物生物合成中的新酶。 | 天然产物生物合成 | NA | 基因组学、代谢组学、蛋白质结构预测、异源途径重建 | NA | 基因组、代谢组、蛋白质结构数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、代谢工程、可持续生产 |
| 5 | 2026-09-02 |
Design of programmable molecular interfaces for synthetic biology and therapeutic applications
2026-Aug-31, Current opinion in chemical biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.cbpa.2026.102759
PMID:42673661
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综述 | 本文综述了从头蛋白质设计在合成生物学中的进展，特别是如何利用生成建模、序列设计和结构预测等方法创建可编程分子界面，以应用于治疗和生物学调控 | 强调从头设计蛋白质作为可编程组件，减少对自然蛋白的依赖，并利用生成模型和结构预测实现更精确的分子界面设计 | 在复杂环境中预测行为存在挑战，且难以平衡多个设计目标 | 探讨从头蛋白质设计在合成生物学中的当前状态和未来方向，以支持治疗应用和分子功能调控 | 从头设计的结合蛋白、可编程互动模块和高等组装结构 | 合成生物学 | NA | NA | 生成建模 | NA | NA | NA | NA | NA | 医学、工业生物技术 |
| 6 | 2026-09-02 |
Methylotrophic yeast engineering for secreted protein production via precision fermentation: food ingredient proteins and synthetic biology strategies
2026-Aug-29, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2026.102532
PMID:42668082
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综述 | 本文综述了甲基营养型酵母在精密发酵中用于生产食品蛋白质成分的工程化进展，重点关注Komagataella phaffii，并讨论了合成生物学和代谢工程策略。 | 系统梳理了甲基营养型酵母在食品蛋白生产中的应用，特别聚焦于基因组工程、基因表达工具、蛋白分泌途径工程和糖基化工程，以满足产量和质量的双重目标。 | 未提及具体实验数据或定量比较，可能缺乏对实际生产挑战的深入分析。 | 探讨甲基营养型酵母在食品蛋白生产中的工程化策略，以提升分泌效率和时空产量。 | 甲基营养型酵母，特别是Komagataella phaffii。 | 合成生物学 | NA | 基因组工程、基因表达工具 | NA | 文献数据、文本 | NA | NA | Komagataella phaffii | 蛋白分泌途径工程、糖基化工程 | 食品工业 |
| 7 | 2026-09-02 |
Navigating regulatory fragmentation in the convergence of synthetic biology, artificial intelligence, and automation
2026-Aug-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-77338-x
PMID:42668325
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研究论文 | 本文对合成生物学、人工智能和自动化融合领域的监管碎片化进行了跨司法管辖区的综合分析，并提出了一种实用框架以应对监管分歧。 | 首次提出SynBioxAI监管互操作性工具包（RIOT），这是一个七视角的制度框架，旨在帮助研究机构高效且透明地应对监管分歧。 | 未提供具体实验验证或案例研究来评估RIOT框架的实际应用效果。 | 分析合成生物学、人工智能和自动化融合领域的监管碎片化问题，并提出解决方案。 | 十六个国家的监管框架以及七个现实合作场景。 | 机器学习 | NA | NA | NA | 文本 | 十六个国家、七个合作场景 | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 8 | 2026-09-02 |
[Construction and practice of a talent training model for synthetic biology]
2026-Aug-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.260172
PMID:42638071
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研究论文 | 本文探讨了江南大学在合成生物学人才培养模式上的改革措施，包括课程体系、实践教育体系及数字化平台建设 | 创新性地提出了跨学科融合、工程实践导向和数字化智能化驱动的合成生物学人才培养范式 | 未提及具体局限性 | 总结江南大学合成生物学专业及人才培养模式的改革举措，为同类院校提供参考 | 江南大学合成生物学专业的人才培养体系 | 教育 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 教育 |
| 9 | 2026-09-02 |
Predictive design of tissue-specific mammalian enhancers that function in the mouse embryo
2026-Aug-25, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-026-02729-1
PMID:42642514
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研究论文 | 本研究利用深度学习训练紧凑卷积神经网络，并借助迁移学习微调，成功设计了在小鼠胚胎中具有组织特异性功能的人工增强子，所有合成增强子均在预定目标组织中活跃表达 | 提出一种通用策略，能够在哺乳动物体内复杂的调控环境中设计组织特异性增强子，并证明仅从DNA序列即可可靠推断哺乳动物增强子功能，实现从有限训练集进行预测性的从头设计 | 未明确提及，但可能受限于训练数据的规模以及体内验证的范围（仅限心脏、肢体和中枢神经系统） | 建立可泛化的框架，实现哺乳动物体内基因表达的编程控制，并探索深度学习在增强子设计中的应用 | 小鼠胚胎中的组织特异性增强子，涉及心脏、肢体和中枢神经系统 | 机器学习 | NA | 深度学习、染色质可及性分析 | 卷积神经网络（CNN） | 染色质可及性数据、已验证的增强子序列 | 设计并验证了15个合成增强子，分别用于心脏、肢体和中枢神经系统，但具体样本数量未提供 | NA | 小鼠 | NA | 医学、合成生物学、功能基因组学、基因治疗 |
| 10 | 2026-09-02 |
ERAD-level gene switches for on-demand protein secretion and rapidly controlled gene therapies
2026-Jul-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-76203-1
PMID:42669721
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研究论文 | 本研究开发了基于内质网相关降解（ERAD）的基因开关，通过口服小分子药物实现治疗蛋白分泌的诱导性、可调性和可逆性控制，并应用于心血管疾病和慢性疼痛的基因治疗。 | 首次采用ERAD中心的策略设计基因开关，无需复杂基因电路即可实现剂量和时间依赖的转基因活性控制，且与AAV基因递送系统高度兼容。 | 未提及具体局限性。 | 开发快速响应、可调控的基因开关，用于按需蛋白分泌和基因治疗中的远程控制。 | 治疗蛋白（POIs）及基因治疗相关疾病模型（心血管疾病和慢性疼痛）。 | 合成生物学 | 心血管疾病, 慢性疼痛 | AAV介导的基因递送 | NA | 实验数据 | 雄性小鼠（具体数量未说明） | NA | 小鼠 | 基于ERAD的诱导型基因开关 | 医学 |
| 11 | 2026-09-02 |
Engineering commensal microbes for host health
2026-Jul-08, Cell host & microbe
IF:20.6Q1
DOI:10.1016/j.chom.2026.05.025
PMID:42419270
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综述 | 本文综述了工程化活体生物治疗产品（eLBPs）在多种疾病适应症中的最新进展，包括炎症性疾病、代谢疾病、癌症和感染性疾病，并讨论了底盘选择、DNA递送方法、治疗表达调控和生物遏制等关键设计因素，提出了下一代eLBPs的理性设计框架 | 提出了一个将eLBP设计的关键因素整合并用于指导下一代产品开发的框架，涵盖底盘选择、DNA递送、表达调控和生物遏制等多个方面 | 早期临床研究显示安全性前景良好，但在实现可预测的定植、持久的治疗活性和体内稳健的生物遏制方面仍存在挑战 | 总结工程化活体生物治疗产品（eLBPs）的发展进展，并提供一个理性设计框架，以促进其从实验系统向临床应用的转化 | 工程化共生微生物（如细菌）作为活体生物治疗产品（eLBPs） | 合成生物学 | 炎症性疾病、代谢疾病、癌症、感染性疾病 | NA | NA | 文本 | NA | NA | 共生微生物（如细菌） | 生物传感器、治疗表达系统、生物遏制系统 | 医学 |
| 12 | 2026-09-02 |
Heterologous production of a plant biostimulant in Streptomyces albidoflavus
2026-Jun-20, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-026-13915-w
PMID:42322407
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研究论文 | 本文建立了在白色链霉菌中异源生产植物生物刺激素pteridic acids F和H的平台，通过基因簇克隆、CRISPR-Cas9基因组整合和启动子工程，结合基因组规模代谢模型指导的培养基优化，实现了产量超过20倍的提升 | 首次建立了PTA生物合成的功能性异源生产平台，结合合成生物学和基因组规模代谢建模来优化复杂植物有益聚酮化合物的生产 | 初始异源表达未产生PTA，且工程化后产量仍低于定量限，需进一步优化 | 建立pteridic acids的异源生产平台，提高其产量以支持农业应用 | pteridic acids F和H，以及白色链霉菌宿主 | 合成生物学 | NA | CAPTURE克隆、CRISPR-Cas9、基因组规模代谢模型 | 基因组规模代谢模型 | 基因组序列、发酵数据 | NA | CRISPR-Cas9、Cas12a、Cre-lox重组 | 白色链霉菌 | PTA生物合成基因簇 | 农业 |
| 13 | 2026-09-02 |
Predictive design of tissue-specific mammalian enhancers that function in vivo in the mouse embryo
2025-Dec-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.22.695948
PMID:41497587
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研究论文 | 本文提出了一种利用深度学习设计在体内具有组织特异性功能的小鼠增强子的通用策略，并在小鼠胚胎中验证了其有效性 | 首次将深度学习与迁移学习结合，用于设计在体内哺乳动物组织中可靠发挥作用的组织特异性增强子，突破了以往仅在细胞系或无脊椎动物系统中的限制 | 文中未提及明显的局限性，但可能受限于设计增强子的数量（15个）和测试的组织类型（心脏、肢体和中枢神经系统） | 建立可泛化的框架，用于可编程控制哺乳动物基因表达，推动功能基因组学、合成生物学和基因治疗的发展 | 小鼠胚胎中的心脏、肢体和中枢神经系统组织特异性增强子 | 机器学习 | NA | 深度学习，染色质可及性测序，迁移学习 | 卷积神经网络（CNN） | 基因组染色质可及性数据及已验证的增强子序列 | 15个合成的增强子，在小鼠胚胎中测试 | NA | 小鼠 | 组织特异性增强子 | 医学, 合成生物学, 基因治疗 |
| 14 | 2026-09-02 |
Systematic discovery and engineering of synthetic immune receptors in plants
2025-09-04, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adx2508
PMID:40906849
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研究论文 | 通过生物信息学和合成生物学方法，系统表征了285种植物中的LRR-RLK-XII受体家族，发现并工程化了一种感知冷休克蛋白肽的受体SCORE，扩展了植物免疫受体的识别谱。 | 首次通过功能系统发育学和蛋白质结构预测，系统性发现并工程化植物免疫受体，展示了通过关键氨基酸残基替换实现病原识别多态性的潜力。 | 论文摘要未明确提及局限性。 | 系统发现和工程化植物中的合成免疫受体，以增强植物对病原体的识别能力。 | 植物中的LRR-RLK-XII受体家族及其SCORE受体。 | 机器学习 | 植物病害 | 生物信息学、合成生物学、蛋白质结构预测 | NA | 基因组序列数据 | 285种植物物种 | 合成生物学工具 | 植物 | 植物免疫受体工程 | 农业 |
| 15 | 2026-09-02 |
A structure-oriented kinetics dataset of enzyme-substrate interactions
2025-08-26, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-025-05829-5
PMID:40858593
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研究论文 | 本文介绍了SKiD，一个整合酶-底物相互作用动力学参数（k和K）与三维结构数据的综合结构化数据集，通过自动化程序整合现有生物信息学资源并辅以计算预测，手动解决数据错误，保留文献与实验条件元数据，提供酶-底物复合物的三维坐标。 | 首次将酶动力学参数与三维结构数据系统性地关联起来，形成一个结构化数据集，填补了功能与结构数据之间的空白，并通过自动化整合与计算预测增强数据，且手动处理错误数据。 | 未明确提及。 | 建立一个链接酶动力学参数与三维结构的综合数据集，以增强对酶功能结构性基础的理解，支持酶设计、合成生物学和代谢工程的应用。 | 酶与底物相互作用，具体为酶动力学参数k和K以及酶-底物复合物的三维结构。 | 生物信息学 | NA | 计算预测 | NA | 结构化数据、三维结构数据、动力学参数、元数据 | 未明确提及具体样本数量。 | NA | NA | NA | 酶设计、合成生物学、代谢工程 |
| 16 | 2026-09-02 |
Single-Cell Nanoencapsulation: Chemical Synthesis of Artificial Cell-in-Shell Spores
2025-07-09, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.4c00984
PMID:40403226
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综述 | 本文综述了通过单细胞纳米封装技术合成人工细胞-壳孢子的最新进展，重点介绍了有机、杂化及无机材料在保护细胞和增强功能方面的应用。 | 创新点在于系统分类和总结了单细胞纳米封装技术中不同材料类型（有机、杂化、无机）的应用，并强调了纳米壳在赋予细胞外源表型特性方面的多功能作用，为定制化人工孢子的设计提供了新方向。 | 本文未提及局限性，但可能因综述性质而缺乏对具体技术的深入实验验证。 | 旨在总结单细胞纳米封装技术的最新进展，并提出未来研究方向，以实现细胞内和周细胞水平的精细化学调控，构建定制化人工孢子。 | 人工细胞-壳结构，即通过化学合成方法制备的纳米封装细胞。 | 合成生物学、材料科学、生物医学工程 | NA | 单细胞纳米封装技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、生物化学、材料科学、生物医学工程 |
| 17 | 2026-09-02 |
Synthetic Biology in Natural Product Biosynthesis
2025-04-09, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.4c00567
PMID:40116601
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综述 | 本文回顾了合成生物学在天然产物生物合成领域的最新进展，涵盖生物信息学工具、异源表达和途径工程三个方面。 | 综述了将生物信息学、实验和分析工具整合到天然产物发现流程中的新方法，并讨论了异源表达和组合生物合成等创新策略。 | 未提及具体局限性。 | 总结合成生物学在天然产物生物合成中的应用进展，包括工具开发、异源表达和途径工程。 | 天然产物及其生物合成基因簇（BGCs），涉及细菌、真菌和植物宿主。 | 合成生物学 | NA | 生物信息学工具、异源表达、组合生物合成 | NA | 基因组数据、代谢产物数据 | NA | NA | 细菌、真菌、植物 | NA | 医药、工业生物技术 |
| 18 | 2026-09-02 |
Engineering highly active nuclease enzymes with machine learning and high-throughput screening
2025-03-19, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101236
PMID:40081373
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研究论文 | 该论文介绍了一种名为TeleProt的机器学习框架，该框架结合进化数据和实验数据来设计蛋白质库，并成功提高了降解慢性伤口生物膜的核酸酶催化活性，通过多轮高通量筛选获得了性能优于定向进化的酶变体 | 首次将进化与实验数据融合于机器学习框架中，设计了无需先验实验数据即可生成高性能初始库的方法，并发布了包含55,000个核酸酶变体的广泛基因型-表型活性数据集 | 未明确讨论在更新颖化学环境或不同酶类中的适用性，且依赖高通量实验成本，可能限制了在其他系统中的应用 | 优化酶在新型化学环境中的功能，特别是提高核酸酶降解慢性伤口生物膜的催化活性 | 核酸酶酶变体，以及慢性伤口生物膜 | 机器学习 | 慢性伤口感染（相关生物膜） | 高通量筛选 | 机器学习框架（TeleProt） | 基因型-表型数据（酶活性数据） | 55,000个核酸酶变体 | NA | NA | NA | 医学 |
| 19 | 2026-09-02 |
Interfacing bacterial microcompartment shell proteins with genetically encoded condensates
2025-03, Protein science : a publication of the Protein Society
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/pro.70061
PMID:39969154
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研究论文 | 本研究展示了来自Haliangium ochraceum的细菌微区室壳蛋白（BMC-H）在串联RGG-RGG结构域形成的蛋白质凝聚体表面组装成涂层，这些涂层受pH和蛋白质浓度影响，并能稳定存在，防止液滴融合，同时可选择性地富集折叠蛋白，为合成生物学提供了一种新的控制液-液相分离区室特性的方法 | 创新之处在于将细菌微区室壳蛋白与基因编码的凝聚体相结合，通过设计RGG截短融合的BMC-H变体，在凝聚体表面形成稳定的涂层，从而控制液滴的融合行为，这是全新的一步 | 摘要未明确提及局限性，但可能包括涂层形成的条件依赖性（如pH和蛋白质浓度）以及对实际应用的环境敏感性 | 研究目的是利用基因编码的蛋白质涂层来调控液-液相分离凝聚体的表面特性，以应用于合成生物学中合成细胞或细胞器的构建 | 研究对象为Haliangium ochraceum的BMC-H壳蛋白、RGG-RGG结构域及其工程变体，以及TEV蛋白酶等折叠蛋白 | 合成生物学、蛋白质工程 | 不适用 | 蛋白质工程、液-液相分离、共聚焦显微镜 | 不适用 | 图像（显微镜图像） | 不适用（未提及样本数量） | 蛋白质融合 | 不适用（体外实验） | 设计了一种化学诱导二聚化系统，用于蛋白质凝聚体和涂层形成的调控 | 合成生物学、医学（潜在）、工业生物技术 |
| 20 | 2026-09-02 |
Synthetic Lipid Biology
2025-02-26, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.4c00761
PMID:39805091
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综述 | 本文正式提出“合成脂质生物学”这一领域，整合了化学、生物学、物理学和工程学的研究方法，旨在通过构建、编辑、检测和分析脂质及生物膜来深入理解其性质和功能 | 首次将跨学科的脂质和膜研究统一为一个名为“合成脂质生物学”的新领域，强调理解与构建的紧密联系，并系统性地组织相关研究方法 | 作为综述，未提供具体的实验数据或验证结果，且该领域尚处于初期阶段，实际应用效果有待进一步验证 | 定义并推动合成脂质生物学领域的发展，通过构建和分析脂质及生物膜来增进对其生物学功能的理解 | 脂质分子及其形成的生物膜结构，包括其代谢、转运、相互作用和生物物理特性 | 合成生物学 | NA | 化学合成、化学酶合成、光遗传学、蛋白质工程、生物正交化学 | NA | 文献综述 | NA | 光遗传学、蛋白质工程 | NA | NA | 基础生物学、生物工程 |