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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-04-22 |
iFLinkC-EZ: A scalable and automatable method for the assembly of complex fusion proteins and multi-gene expression constructs based on the iFLinkC framework
2026-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2026.03.008
PMID:42006855
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研究论文 | 本文介绍了一种基于iFLinkC框架的可扩展且可自动化的方法iFLinkC-EZ,用于组装复杂融合蛋白和多基因表达构建体 | iFLinkC-EZ通过遗传手段纯化DNA组装产物,简化了组装过程并实现了机器人自动化兼容,克服了传统方法需要物理纯化DNA片段的限制 | NA | 开发一种标准化的DNA组装方法,用于合成生物学、生物技术和基础研究中的复杂融合蛋白和多基因表达构建体构建 | 融合蛋白编码序列和多基因表达构建体 | 合成生物学 | NA | 迭代功能连接子克隆(iFLinkC) | NA | NA | NA | Golden Gate Assembly | 酵母 | 合成蛋白开关、传感器、多酶复合物、遗传电路和代谢途径 | 生物技术 |
| 2 | 2026-04-22 |
From CRISPR functional genomics to synthetic interventions: engineering antiviral strategies
2026-Apr-21, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.00057-26
PMID:41910274
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综述 | 本文综述了CRISPR功能基因组学与合成生物学在抗病毒策略设计中的结合,从宿主依赖性图谱到可编程干预手段 | 将CRISPR筛选技术扩展至单细胞、成像、空间表型和类器官模型,推动从静态基因列表向上下文依赖性图谱的转变,并整合合成生物学设计可编程抗病毒干预策略 | 讨论了从筛选机制转化为有效且安全抗病毒策略的工程化约束,包括安全性和有效性限制 | 连接CRISPR功能基因组学与合成抗病毒设计,总结跨病毒家族的通用原则 | 病毒-宿主相互作用、宿主依赖性及限制性因子、抗病毒工程策略 | 合成生物学 | 病毒感染 | CRISPR扰动筛选、单细胞测序、成像、空间表型分析、类器官模型 | NA | 基因组学数据、表型数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 哺乳动物细胞、工程化免疫细胞 | 感染感应与定制响应耦合的基因回路、可调抗病毒功能的工程免疫细胞、条件性蛋白质耗竭系统 | 医学 |
| 3 | 2026-04-22 |
Epigenetic Control of Toehold-Mediated Strand Displacement for Programmable Molecular Circuit Regulation and Enhanced microRNA Detection
2026-Apr-21, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.6c01658
PMID:41952075
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研究论文 | 本研究开发了一种利用单碱基N-甲基腺苷修饰调控DNA链置换反应动力学的表观遗传调控系统,并应用于microRNA检测 | 首次将单碱基表观遗传修饰引入DNA链置换反应,实现了对分子电路动力学的可编程、可逆调控 | 未明确说明修饰位点密度与反应抑制程度的定量关系,以及系统在复杂生物环境中的长期稳定性 | 开发可编程调控的分子电路系统,提高microRNA检测的灵敏度和特异性 | DNA链置换反应、催化发夹组装电路、癌症相关microRNA-21 | 合成生物学 | 癌症 | 单碱基N-甲基腺苷修饰、去甲基化酶FTO调控、细胞内成像 | NA | 分子反应动力学数据、荧光成像数据 | NA | NA | NA | 表观遗传调控的DNA链置换电路、催化发夹组装电路 | 生物传感、分子计算、合成生物学 |
| 4 | 2026-04-22 |
A standardized workflow for kinetic metabolic model curation and dissemination
2026-Apr-20, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1014227
PMID:42008579
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研究论文 | 本文介绍了一种用于构建、注释、可视化和共享动力学代谢模型的标准化工作流程 | 整合社区标准和开源工具,确保模型的可重复性、互操作性和用户可访问性 | NA | 提高动力学代谢模型的再现性和实用性,支持合成生物学、代谢工程和系统生物学应用 | 动力学代谢模型 | 系统生物学 | NA | NA | 动力学代谢模型 | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 代谢工程, 系统生物学 |
| 5 | 2026-04-22 |
Plant-derived indole alkaloids in chronic inflammatory diseases: molecular mechanisms, therapeutic potential and translational challenges
2026-Apr-20, Inflammopharmacology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s10787-026-02244-z
PMID:42009998
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综述 | 本文综述了植物来源吲哚生物碱在慢性炎症性疾病中的分子机制、治疗潜力及转化挑战 | 系统整合了植物来源吲哚生物碱的化学、来源及作用机制,强调了其对NF-κB、JAK/STAT、MAPK、PI3K/AKT、NLRP3炎症小体和AhR信号通路等多靶点的调控作用,并指出了其在微生物群和器官选择性治疗方面的前景 | 主要基于临床前证据,临床证据不足,且存在转化障碍 | 评估植物来源吲哚生物碱作为多靶点支架在慢性炎症性疾病中的治疗潜力 | 植物来源的吲哚生物碱 | NA | 慢性炎症性疾病 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 6 | 2026-04-22 |
Synthetic control of implanted engineered liver tissue growth
2026-Apr-17, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adz8362
PMID:41996502
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研究论文 | 本文提出了一种通过合成生物学和工程组织技术,在体内植入后诱导小规模工程肝组织生长扩增的策略 | 整合合成生物学与组织工程工具,实现植入后按需驱动工程肝组织在体内扩增,通过YAP和生长因子信号轴控制 | NA | 解决工程组织植入物在治疗相关尺寸上的扩增障碍,促进临床转化 | 工程肝组织和人肝细胞 | 合成生物学 | 器官衰竭 | 合成生物学工具 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 人类肝细胞 | 通过YAP和生长因子信号轴控制组织扩增的合成生物电路 | 医学 |
| 7 | 2026-04-22 |
Biological Detoxification of Gossypol: Enzymatic Mechanisms, System Engineering, and Prospects for Green Valorization
2026-Apr-16, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c17645
PMID:41989489
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综述 | 本文综述了棉酚的生物解毒机制,包括酶学途径、系统工程策略以及绿色增值前景 | 将棉酚的互变异构和反应热点与可处理目标关联,整合微生物和混合培养途径,并将棉酚活性酶分类为四个模块,提出结合分析学、命运追踪、分层生物测定和毒代动力学的产品解析验证方法 | NA | 探讨棉酚的生物解毒策略,以降低其毒性并促进棉籽副产品的升级利用 | 棉酚及其解毒产物 | NA | NA | 酶工程、多酶级联设计、AI辅助酶/途径挖掘、合成生物学架构 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 微生物、混合培养物 | 功能基团修饰、芳香环裂解、增溶共轭、自由基介导环化等模块化酶途径 | 农业、工业生物技术 |
| 8 | 2026-04-22 |
Plant Synthetic Biology Takes Off: Bryophytes Onboard with New Tools, Systems, and Opportunities
2026-Apr-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00092
PMID:41984537
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综述 | 本文综述了植物合成生物学的最新进展,强调苔藓植物作为实验平台在工具开发和跨植物谱系生物工程方法中的重要性 | 将苔藓植物(包括苔藓、角苔和地钱)作为植物合成生物学的新兴模型系统,以克服被子植物系统的复杂性限制 | 目前大多数研究仍集中于被子植物,苔藓植物系统的应用潜力尚未充分开发 | 推动植物合成生物学领域的发展,通过简化系统实现更广泛的应用 | 苔藓植物(苔藓、角苔、地钱)作为合成生物学的实验平台 | 合成生物学 | NA | 模块化克隆、基因电路、基因组编辑、合成基因组学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 苔藓植物(苔藓、角苔、地钱) | 基因电路 | 农业, 环境, 工业生物技术 |
| 9 | 2026-04-22 |
Synthetic Biology Approaches to Enzymology in Food and Agriculture Systems
2026-Apr-10, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c16525
PMID:41962132
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综述 | 本文综述了合成生物学在食品和农业系统酶学中的应用,探讨了如何通过工程化酶来提升食品安全、生产效率和副产品价值 | 整合合成生物学与酶工程,提出创新且可持续的酶介导解决方案以应对全球粮食不安全问题,并探讨了跨行业技术向食品农业的转化 | 讨论了当前整合合成生物学到全球食品系统中的限制、法规挑战以及未来方向 | 通过合成生物学方法解决全球粮食不安全问题,提升食品系统的可持续性和效率 | 食品和农业系统中的酶学应用,包括酶工程、生物催化和计算设计 | 合成生物学 | NA | 酶工程、生物催化、计算设计 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业, 食品 |
| 10 | 2026-04-22 |
mRNA medicine for cardiovascular disease
2026-Apr, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-026-00804-8
PMID:41981145
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综述 | 本文综述了基于mRNA的生物技术在心血管疾病治疗中的进展,包括mRNA修饰、递送平台、基因组编辑及免疫细胞工程应用 | 整合mRNA技术、纳米技术、基因组编辑和RNA合成生物学,为心血管疾病提供创新治疗策略 | NA | 探讨mRNA技术在心血管疾病治疗中的应用潜力与挑战 | 心血管疾病,包括高胆固醇血症、动脉粥样硬化、缺血性心脏损伤、心脏纤维化和心脏淀粉样变性 | NA | 心血管疾病 | mRNA技术、纳米技术、基因组编辑、RNA合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 11 | 2026-04-22 |
Synthetic Control of Implanted Engineered Liver Tissue Growth
2026-Jan-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.10.693527
PMID:41427324
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研究论文 | 本文提出了一种通过合成生物学工具控制植入后工程肝组织生长的策略,以解决组织工程植入物规模扩大的临床转化难题 | 结合合成生物学和组织工程技术,首次实现植入后通过合成触发因子按需诱导工程肝组织生长 | NA | 开发一种通过植入后诱导生长来扩大工程组织规模的方法,以治疗器官衰竭 | 工程肝组织和人肝细胞 | 组织工程 | 器官衰竭 | 合成生物学工具、YAP和生长因子信号通路调控 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 人肝细胞 | 通过合成生物学工具控制YAP和生长因子信号轴,以驱动组织扩张 | 医学 |
| 12 | 2026-04-22 |
Recent advance in macrolactams: Structure, bioactivity, and biosynthesis
2025-06-01, Bioorganic chemistry
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.bioorg.2025.108406
PMID:40184666
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综述 | 本文系统综述了2004年至2023年间报道的105个大环内酰胺,涵盖其来源、结构、生物活性及17种已知生物合成途径,并深入分析了相关基因簇、关键酶机制及其在生物合成中的作用 | 首次系统讨论大环内酰胺家族的最新进展,特别关注结构-活性关系及偏离传统共线性规则的新生物合成途径 | NA | 为大环内酰胺的发现及其通过合成生物学方法的可持续生产提供参考 | 105种由微生物菌株产生的大环内酰胺,这些菌株分离自海洋沉积物、土壤、植物和动物等多样环境 | NA | NA | NA | NA | NA | 105种大环内酰胺 | NA | NA | NA | NA |
| 13 | 2026-04-22 |
A size filter at the Golgi regulates apical membrane protein sorting
2024-Oct, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-024-01500-0
PMID:39237743
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研究论文 | 本研究通过合成生物学方法探究高尔基体是否存在尺寸筛选机制,以调控顶端膜蛋白的排序 | 首次发现高尔基体存在尺寸筛选机制,并揭示Pals1蛋白的及时解离对Crb3正常分选的关键作用 | 研究主要基于三种代表性顶端蛋白(Crb3、Ace2、Muc1),尚未验证是否适用于所有顶端膜蛋白 | 探究顶端膜蛋白分选的分子机制,特别是细胞质结构域尺寸对分选的影响 | 上皮细胞膜蛋白(Crb3、Ace2、Muc1)及其与Pals1蛋白的相互作用 | 细胞生物学 | NA | 合成生物学方法、生物素触发释放系统、蛋白质定位追踪 | NA | 蛋白质定位图像、时间序列运输数据 | 三种代表性顶端膜蛋白(Crb3、Ace2、Muc1)及其修饰变体 | 链霉亲和素结合肽标记系统 | 哺乳动物细胞 | 内质网滞留-生物素触发释放系统,用于同步研究蛋白质从高尔基体到细胞皮层的运输 | 基础细胞生物学研究 |
| 14 | 2026-04-21 |
Functional identification of key enzymes in calycosin biosynthesis in Astragalus membranaceus and establishment of heterologous expression system
2026-Dec, Pharmaceutical science advances
DOI:10.1016/j.pscia.2026.100118
PMID:42005051
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研究论文 | 本研究鉴定了黄芪中毛蕊异黄酮生物合成的三个关键酶,并成功在酵母和烟草中建立了异源表达系统 | 揭示了毛蕊异黄酮的新型合成途径,发现AmOMT2的多功能性拓宽了AmIFS的底物范围 | NA | 阐明黄芪中毛蕊异黄酮的生物合成途径并建立异源生产系统 | 黄芪(Astragalus membranaceus)及其关键生物合成酶 | 合成生物学 | NA | 异源表达、组织特异性表达分析 | NA | NA | NA | 异源表达系统 | 酵母, 烟草 | 毛蕊异黄酮生物合成途径(涉及AmIFS、AmOMT2、AmI3'H三个关键酶) | 医药 |
| 15 | 2026-04-21 |
Deep learning revolutionizes protein research: Advances in structure prediction, functional annotation, and engineered design
2026-Jun, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2026.03.012
PMID:41839238
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综述 | 本文综述了深度学习如何通过连接结构预测、功能注释和理性设计,形成一个协同循环,从而彻底改变蛋白质研究 | 提出了一个统一的“预测-理解-创造”范式,展示了深度学习在蛋白质结构预测、功能注释和从头设计中的突破性进展,并阐述了这些领域如何相互促进,形成一个自我强化的循环 | 在数据稀缺性、模型可解释性以及分布外泛化方面仍存在挑战 | 阐述深度学习如何变革蛋白质研究,并展示结构预测、功能注释和理性设计之间的协同循环 | 蛋白质(特别是单域、球状蛋白质) | 机器学习 | NA | 深度学习,生成式AI,逆向折叠模型,混合实验-计算工作流(如与AI集成的冷冻电镜) | 端到端深度学习模型(如AlphaFold2),多模态模型,生成式AI | 序列数据,3D坐标,相互作用数据 | NA | NA | NA | NA | 药物开发,合成生物学 |
| 16 | 2026-04-21 |
Microbial lipids for a sustainable future: the growing potential of synthetic microbial engineering for consumer oils
2026-May, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2026.2615047
PMID:41692578
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综述 | 本文探讨了合成微生物工程在可持续生产消费油脂方面的潜力,以应对传统作物依赖带来的环境问题 | 利用合成生物学和自动化生物铸造技术,开发微生物作为可持续油脂来源的新方法 | NA | 推动消费油脂产业向可持续微生物生物制造经济转型 | 微生物油脂及其在食品、营养品、塑料、化妆品、燃料等产品中的应用 | 合成生物学 | NA | 合成酵母基因组学、自动化生物铸造 | NA | NA | NA | NA | 酵母 | NA | 食品, 营养品, 塑料, 动物饲料, 化妆品, 药品, 燃料 |
| 17 | 2026-04-21 |
Engineering non-ribosomal peptide synthesis: tuning the antibiotics engine of the microbial world
2026-May, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2026.2615819
PMID:41771683
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综述 | 本文综述了通过合成生物学方法工程化改造非核糖体肽合成酶以提高抗生素产量和生物活性的主要进展 | 系统总结了通过代谢工程、启动子调控和异源表达等合成生物学策略优化非核糖体肽生产的创新方法 | NA | 利用合成生物学技术优化非核糖体肽合成酶,以提高抗生素类肽的产量和生物活性 | 非核糖体肽合成酶及其产生的抗生素肽类 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、代谢工程、异源表达 | NA | NA | NA | 启动子工程、代谢通路重定向 | 微生物 | 生物合成基因簇、代谢通路工程 | 医药 |
| 18 | 2026-04-21 |
OptoChaperone─A Biohybrid Tool for Regulating Protein Condensates in Cells and In Vitro
2026-Apr-19, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.6c04074
PMID:42002974
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研究论文 | 本文介绍了一种名为OptoChaperone的光激活生物杂交系统,用于在体外和活细胞中精确、可逆地调控蛋白质凝聚体的形成与溶解 | 开发了一种基于光响应开关的生物杂交工具,实现了对蛋白质液-液相分离(LLPS)的可逆、时空控制,无需化学添加剂或客户蛋白的基因修饰 | NA | 研究蛋白质凝聚体的调控机制,开发新型工具以解析其在细胞生理和病理中的作用 | 疾病相关蛋白质凝聚体,如融合肉瘤蛋白、TAR DNA结合蛋白43和热休克因子1 | 合成生物学 | NA | 光激活分子系统 | NA | NA | NA | OptoChaperone | 活细胞 | 光响应开关系统,用于控制分子伴侣活性以调节蛋白质凝聚体 | 医学, 合成生物学, 生物分子工程 |
| 19 | 2026-04-21 |
High-performance bioimaging and biosensing via nucleobase-editing enzymes
2026-Apr-17, Chemical Society reviews
IF:40.4Q1
DOI:10.1039/d5cs00678c
PMID:41773995
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综述 | 本文综述了核苷碱基编辑酶在生物成像和生物传感中的高性能应用,包括其催化原理、集成模式以及未来发展方向 | 将核苷碱基编辑酶重新用作可编程执行器,实现高特异性、高效放大和生理条件兼容的敏感监测 | NA | 探讨核苷碱基编辑酶在生物传感和生物成像中的应用潜力 | 核苷碱基编辑酶(如脱氨酶、甲基转移酶/去甲基化酶和DNA糖基化酶)及其在核酸、蛋白质和细胞过程监测中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 诊断, 治疗监测, 合成生物学 |
| 20 | 2026-04-21 |
Rhodo-Box: A Synthetic Biology Toolbox to Facilitate Metabolic Engineering of Rhodobacter sphaeroides
2026-Apr-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00808
PMID:41832780
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研究论文 | 本文介绍了Rhodo-Box,一个为Rhodobacter sphaeroides设计的合成生物学工具箱,旨在促进其代谢工程应用 | 开发了Rhodo-Box工具箱,通过适应和扩展Zymo-Parts模块化克隆框架,为Rhodobacter sphaeroides提供了标准化的遗传元件和半自动化克隆方法 | NA | 促进Rhodobacter sphaeroides作为可持续生物制造底盘微生物的代谢工程应用 | Rhodobacter sphaeroides(一种紫色非硫α-变形菌) | 合成生物学 | NA | 模块化克隆、半自动化克隆 | NA | NA | NA | Zymo-Parts, Gibson Assembly | Rhodobacter sphaeroides | 包括复制起点、启动子、诱导表达系统、RBS和转录终止子在内的遗传元件集合 | 工业生物技术 |