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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-02-04 |
Sustainable production of glutaric acid in microbial cell factories: Current advances and future prospects
2026-Sep, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2026.01.003
PMID:41631191
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综述 | 本文综述了微生物细胞工厂可持续生产戊二酸的最新进展与未来前景 | 系统总结了戊二酸生物合成途径的设计、代谢工程策略及系统生物学技术的应用,并指出了该领域的发展方向 | NA | 为戊二酸及相关精细化学品的可持续生产提供理论见解和技术指导 | 戊二酸的生物合成途径与工程菌株 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、系统生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物细胞工厂 | 戊二酸生物合成途径 | 化学工业、医药、生物材料 |
| 2 | 2026-02-04 |
A novel LPS-dependent outer membrane-anchoring mechanism for T9SS substrates enables engineered enzyme display and whole-cell PET degradation in Cytophaga hutchinsonii
2026-Sep, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2026.01.011
PMID:41631190
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研究论文 | 本文报道了一种新型的脂多糖依赖的T9SS底物外膜锚定机制,并基于此机制开发了用于革兰氏阴性菌的表面展示平台,成功实现了PET降解酶的展示与功能验证 | 首次揭示了T9SS底物通过脂多糖(LPS)依赖的机制锚定于外膜,并利用该机制构建了可编程的表面展示平台 | NA | 阐明T9SS底物在革兰氏阴性菌外膜的锚定机制,并开发基于该机制的表面展示平台 | Cytophaga hutchinsonii及其T9SS分泌的纤维素酶 | 合成生物学 | NA | LC-MS/MS蛋白质组学、生物信息学分析、基因敲除 | NA | 蛋白质组数据、序列数据 | NA | 基因融合表达 | Cytophaga hutchinsonii | 异源酶与T9SS底物CTD结构域的融合表达系统 | 环境、工业生物技术 |
| 3 | 2026-02-03 |
Identification of a group of UDP-glycosyltransferases catalyze emodin glycosylation in Rheum officinale with substrates promiscuity
2026-Apr, Phytochemistry
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.phytochem.2025.114763
PMID:41461342
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研究论文 | 本研究从药用植物掌叶大黄中鉴定并功能表征了六个催化大黄素糖基化的UDP-糖基转移酶,揭示了其底物混杂性及关键催化残基 | 首次系统鉴定并表征了掌叶大黄中负责大黄素糖基化的UGT酶家族,通过分子对接与定点突变揭示了底物识别的关键氨基酸残基 | 未在完整植物体系或代谢工程宿主中验证这些酶的体内功能,酶学特性研究局限于体外生化实验 | 解析掌叶大黄中蒽醌苷类活性成分的生物合成途径 | 掌叶大黄(Rheum officinale)中的UDP-糖基转移酶(UGTs) | 合成生物学 | NA | 生化分析、分子对接、定点突变 | NA | 酶学数据、分子结构数据 | 六个UGT酶(RoUGT1,2,4,5,6,8) | 定点突变 | NA | NA | 医药 |
| 4 | 2026-02-03 |
Solvent-Mediated Dewetting Principles for Cell-Sized Liposome Formation
2026-Feb-01, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202512610
PMID:41622818
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研究论文 | 本文研究了溶剂介导的去润湿原理,用于细胞尺寸脂质体的形成 | 揭示了溶剂介导的去润湿过程中同时涉及溶剂去除和机械刺激,并建立了脂质体去润湿的机制框架 | 未明确说明实验的具体样本量或重复次数 | 阐明溶剂介导的去润湿原理,以改进细胞尺寸脂质体的生成方法 | 脂质体、双乳液模板、溶剂介导的去润湿过程 | 合成生物学 | NA | 微流控生成、光学镊子 | NA | 实验数据 | NA | NA | NA | NA | 医学、工业生物技术 |
| 5 | 2026-02-03 |
Small RNAs, big potential: Engineering microRNA-based synthetic gene circuits
2026-Jan-31, Current opinion in chemical biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.cbpa.2026.102652
PMID:41621146
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综述 | 本文综述了基于microRNA的合成基因电路的设计、发展及其在诊断和治疗中的应用潜力 | 介绍了从早期miR-OFF系统到近期CRISPR关联系统及非相干前馈环架构的演进,实现了从被动感知到主动治疗的转变 | 存在泄漏、细胞资源竞争及递送效率等挑战 | 探讨利用microRNA构建合成基因电路以感知细胞状态并实现治疗干预 | microRNA及其合成的基因调控电路 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | CRISPR | NA | miR-OFF系统、miR-ON架构、基于逻辑的分类器、多层调控策略、非相干前馈环 | 医学 |
| 6 | 2026-02-03 |
Wheat Plasma Membrane Receptors: Orchestrating Immunity and Bridging to Crop Improvement
2025-Dec-19, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb48010002
PMID:41614833
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综述 | 本文综述了小麦质膜受体的多样性、分类、信号机制及其在植物免疫中的核心作用,并探讨了其在作物改良中的应用潜力 | 系统整合了小麦质膜受体在大型六倍体基因组背景下的功能特征化挑战,并首次详细阐述了其家族规模从10个到3424个成员的巨大差异,以及将基础研究与作物改良策略(如标记辅助选择、基因叠加和受体工程)相连接 | 小麦基因组庞大、基因重复和功能冗余阻碍了质膜受体的功能表征,且遗传冗余和多效性效应是主要障碍 | 阐明小麦质膜受体的功能、信号机制及其在免疫与作物抗病改良中的作用 | 小麦质膜受体,特别是受体样激酶家族 | 植物生物学/作物遗传改良 | 植物病害(如小麦叶锈病) | 多组学、系统生物学、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 小麦 | NA | 农业 |
| 7 | 2026-02-03 |
Cancer Reversion Therapy: Prospects, Progress and Future Directions
2025-Dec-15, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb47121049
PMID:41614813
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综述 | 本文综述了癌症逆转疗法的前景、进展和未来方向,这是一种通过重编程恶性细胞使其恢复为非恶性状态而非摧毁它们的新型治疗范式 | 系统性地整合了癌症逆转疗法的生物学基础、现有策略、新兴技术,并提出了未来发展的关键方向,强调从“摧毁”到“重编程”的范式转变 | 许多报道的“逆转”现象可能只是刺激依赖的可塑性或短暂生长停滞,而非稳定的表型正常化;真正的癌症逆转需要持久、可遗传的表型改变,这在实现上仍面临重大挑战 | 探讨将恶性细胞重编程为非恶性状态的癌症治疗新策略 | 癌症细胞及其微环境 | NA | 癌症 | 单细胞分析、CRISPR基因编辑、患者来源类器官、人工智能 | NA | NA | NA | CRISPR | NA | NA | 医学 |
| 8 | 2026-02-03 |
Crosslinking intermodular condensation in non-ribosomal peptide biosynthesis
2025-Feb, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08306-y
PMID:39663458
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研究论文 | 本研究开发了位点选择性交联探针,用于解析非核糖体肽合成酶中载体蛋白与酶结构域间的相互作用,并报告了高分辨率冷冻电镜结构 | 首次应用四嗪点击化学捕获载体蛋白底物在缩合结构域活性位点的交联,揭示了模块间识别事件和载体蛋白的进程性移动机制 | 研究聚焦于酪氨酸生物合成前两个模块的相互作用,可能未完全反映完整合成酶的动态特性 | 阐明非核糖体肽合成酶的分子作用机制,为合成生物学设计提供结构基础 | 酪氨酸生物合成途径中的载体蛋白与缩合结构域/差向异构化结构域复合物 | 结构生物学 | NA | 位点选择性交联、四嗪点击化学、冷冻电镜、X射线晶体学 | NA | 结构数据 | NA | NA | NA | NA | 医药生物技术 |
| 9 | 2026-02-03 |
From Knallgas Bacterium to Promising Biomanufacturing Host: The Evolution of Cupriavidus necator
2025, Advances in biochemical engineering/biotechnology
DOI:10.1007/10_2024_269
PMID:39363001
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综述 | 本文深入回顾了Cupriavidus necator在过去十年中在分子生物学工具、代谢工程和创新发酵策略方面的技术进步,并探讨了其作为可持续生物制造宿主的潜力 | 系统总结了C. necator从一种Knallgas细菌演变为有前景的生物制造宿主的过程,强调了其在推动可持续生物经济中的关键作用 | NA | 探讨C. necator作为多样化微生物底盘在合成生物学和可持续生物制造中的应用潜力 | Cupriavidus necator(一种多功能的微生物) | 合成生物学 | NA | 分子生物学工具、代谢工程、发酵策略 | NA | NA | NA | NA | Cupriavidus necator | NA | 工业生物技术 |
| 10 | 2026-02-03 |
Vibrio natriegens: Application of a Fast-Growing Halophilic Bacterium
2025, Advances in biochemical engineering/biotechnology
DOI:10.1007/10_2024_271
PMID:39527262
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综述 | 本文综述了快速生长的嗜盐细菌Vibrio natriegens在生物技术应用中的潜力,包括其生理学、合成生物学工具开发及代谢工程进展 | 总结了Vibrio natriegens作为非传统生物技术宿主的最新研究进展,包括其快速生长特性、遗传工程工具和代谢模型的应用 | NA | 探讨Vibrio natriegens在生物技术领域的应用潜力和未来挑战 | Vibrio natriegens细菌 | NA | NA | 遗传工程、代谢模型 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | Vibrio natriegens | 代谢途径、生物传感器 | 工业生物技术 |
| 11 | 2026-02-03 |
Photosynthesis 2.0: Realizing New-to-Nature CO2-Fixation to Overcome the Limits of Natural Metabolism
2024-02-01, Cold Spring Harbor perspectives in biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1101/cshperspect.a041669
PMID:37848245
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综述 | 本文探讨了合成生物学如何通过实现新型CO2固定代谢途径来克服自然光合作用的限制 | 提出了两种策略:一是通过工程化植物实现碳中性或碳负性的光呼吸代谢(如TaCo途径),二是完全替代自然光合作用(如CETCH循环),以显著提升CO2吸收率 | NA | 克服自然光合作用的限制,开发高效的CO2固定代谢途径以应对气候变化 | 工程化植物及其代谢途径 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | NA | NA | 植物 | TaCo途径和CETCH循环 | 农业, 环境 |
| 12 | 2026-02-03 |
From Farms to Pharma: A "Natural" History of Vaccine Production and Vaccine Skepticism
2024-02, American journal of public health
IF:9.6Q1
DOI:10.2105/AJPH.2023.307508
PMID:38175968
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评论 | 本文从历史视角探讨疫苗与“自然”概念的关系,聚焦19世纪牛痘疫苗的农场生产方式及其对公众信任的影响 | 通过历史案例(19世纪农场生产牛痘疫苗)分析当代疫苗怀疑论中“自然”话语的根源,揭示技术信任构建的长期性 | 研究主要基于历史文献分析,缺乏对当代疫苗技术的直接实证研究 | 分析疫苗生产中“自然”概念的历史演变及其对公众信任的影响 | 19世纪牛痘疫苗的生产技术与公众认知 | NA | 天花 | NA | NA | 历史文献 | NA | NA | 牛 | NA | 医学 |
| 13 | 2026-02-02 |
The Prebiotic and Techno-Functional Potential of Microbial Exopolysaccharides for Human Health and Food Systems
2026-Mar, Comprehensive reviews in food science and food safety
IF:12.0Q1
DOI:10.1111/1541-4337.70406
PMID:41619217
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综述 | 本文综述了微生物胞外多糖作为益生元候选物和食品技术功能添加剂的双重功能,探讨了其对人类健康和食品系统的潜在价值 | 系统区分了微生物胞外多糖作为益生元与生物活性物质的精确作用机制,并提出了“EPS-微生物群-宿主轴”概念,同时探讨了合成生物学在定制化多糖设计中的应用潜力 | 未提供具体的实验数据或案例研究,主要基于现有文献的归纳分析,且未详细讨论不同微生物来源EPS的具体生产工艺差异 | 阐明微生物胞外多糖在食品系统中作为功能性成分的双重角色(健康益处与技术功能),并探讨其产业化面临的挑战与解决方案 | 微生物胞外多糖(EPS) | 食品科学与生物技术 | 糖尿病、肥胖症 | 合成生物学 | NA | 文献数据 | NA | 合成生物学工具(未具体说明) | 微生物(未具体说明种类) | 定制化多糖的生物合成途径设计 | 食品、医药 |
| 14 | 2026-02-02 |
Repurposing nuclear receptors for ligand-responsive liquid condensate formation and gene regulation
2026-Jan-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69099-4
PMID:41620421
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研究论文 | 本文通过重新利用核受体配体结合域和共激活因子,开发了响应激素或临床批准药物的化学诱导二聚化系统,并设计了激素响应的液-液相分离凝聚体,用于基因调控和转录放大 | 创新点在于将核受体配体结合域与共激活因子结合,构建响应内源性激素或药物的化学诱导二聚化系统,并首次设计出激素响应的液-液相分离凝聚体,实现可调谐的转录控制 | NA | 研究目标是开发一种能与内源性信号整合的化学诱导二聚化系统,用于合成生物学和基因调控应用 | 研究对象包括核受体配体结合域(如TRβ、VDR、RARγ、ERβ、GR2)和TIF2共激活因子肽,以及相关的激素和药物 | 合成生物学 | NA | 化学诱导二聚化系统设计、液-液相分离技术 | NA | NA | NA | NA | NA | 两输入转录开关、激素响应的液-液相分离凝聚体 | 医学、基因电路、生物传感 |
| 15 | 2026-02-02 |
Synthetic Biology of Plants and Microbes for Agriculture, Environment, and Future Applications
2026-Jan-28, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.4c00687
PMID:41609588
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综述 | 本文综述了合成生物学在植物和微生物工程中的应用,以推动农业、环境及未来应用的发展 | 介绍了合成生物学如何通过新基因组构建工具、计算机辅助设计和人工智能改变传统植物育种和基因工程范式,实现“智能植物”和整体系统工程 | NA | 探讨合成生物学在农业、环境及未来应用中的先进技术,以驱动下一场农业革命 | 植物及其相关微生物(真菌、细菌、古菌) | NA | NA | 合成生物学、基因组构建工具、计算机辅助设计、人工智能 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 植物、真菌、细菌、古菌 | 响应环境变化、改变形态或应对威胁的电路,如生物传感器、逻辑门 | 农业、环境、制造、基础设施、传感、修复 |
| 16 | 2026-02-02 |
Synthetic biology for heparin biomanufacturing
2026-Jan-27, Bioresources and bioprocessing
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s40643-025-00999-x
PMID:41588187
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综述 | 本文全面讨论了肝素生物制造技术的最新进展、挑战和未来前景 | 通过酶工程、代谢工程和合成生物学方法系统优化肝素生物合成途径,探索体内/体外组合策略和从头生物合成作为替代生产方法 | NA | 探索肝素生物制造技术以替代动物源提取方法 | 肝素生物合成途径 | 合成生物学 | 炎症、癌症 | 酶工程、代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | 肝素生物合成途径 | 医药 |
| 17 | 2026-02-02 |
Exosome precision engineering: A comprehensive method for targeted gene and drug delivery
2026-Jan-26, Pathology, research and practice
DOI:10.1016/j.prp.2026.156369
PMID:41619536
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综述 | 本文综述了外泌体作为药物和基因递送载体的精准工程方法,包括表面修饰和装载策略,并探讨了其在精准医疗中的应用潜力与挑战 | 整合外泌体与合成生物学策略,开发新型工程化方法以增强靶向性和装载效率,特别是用于CRISPR/Cas9递送和癌症治疗 | 面临大规模生产、免疫安全性问题和监管审批等挑战 | 探索工程化外泌体作为多功能平台,用于精准药物和基因递送,以促进疾病治疗 | 外泌体作为细胞间通讯的囊泡载体 | NA | 癌症 | CRISPR/Cas9 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 医学 |
| 18 | 2026-02-02 |
PanForest: predicting genes in genomes using random forests
2026-Jan-02, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag005
PMID:41512299
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研究论文 | 本文介绍了PanForest,一种使用随机森林分类器根据基因组中其他基因的存在情况来预测基因存在或缺失的软件工具 | 开发了首个基于随机森林的基因共现与互斥模式预测工具,能够大规模分析泛基因组并量化每个基因对预测其他基因的重要性 | 未明确说明模型在非细菌基因组或其他复杂真核生物中的泛化能力,且分析依赖于现有基因注释的准确性 | 研究基因共现与互斥模式,以揭示基因组组织的基本原理,并应用于进化重建和合成基因组设计 | 大肠杆菌(Escherichia coli)基因组中的12,741个附属基因 | 生物信息学 | NA | 随机森林分类器 | 随机森林 | 基因存在/缺失数据 | 1000个大肠杆菌基因组 | NA | NA | NA | 生物医学科学、合成生物学、分子生态学 |
| 19 | 2026-02-02 |
Protein engineering strategies to optimise recombinant product synthesis and accumulation in Nicotiana benthamiana
2026-Jan, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70232
PMID:40577356
|
综述 | 本文综述了在植物分子农业中,通过蛋白质工程和亚细胞工程策略优化本氏烟草中重组产品合成与积累的方法 | 讨论了蛋白质工程与亚细胞工程策略的创新结合,以定制本氏烟草用于重组蛋白质、肽和小分子的生产,包括信号序列融合、多功能结构域应用和异源酶共表达 | NA | 优化本氏烟草中重组产品的合成与积累,提高植物分子农业的生产效率 | 本氏烟草中的重组蛋白质、肽和小分子 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、亚细胞工程、异源酶共表达 | NA | NA | NA | NA | 本氏烟草 | 合成细胞器、正交翻译后修饰途径 | 农业, 工业生物技术 |
| 20 | 2026-02-02 |
Complex engineering of Solanum alkaloids structural diversity in Nicotiana benthamiana
2026-Jan, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70213
PMID:40684353
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研究论文 | 本研究通过瞬时表达在Nicotiana benthamiana中工程化Solanum家族甾体生物碱和皂苷的生物合成途径,成功生产了多种高价值代谢物 | 发现并利用SlGAME2-NEW木糖基转移酶,首次在异源植物宿主中完整重构了番茄和茄子的甾体生物碱及皂苷生物合成途径 | NA | 应用合成生物学在异源植物宿主中生产高价值的甾体代谢物 | 番茄和茄子的甾体生物碱及皂苷,包括α-番茄碱、脱氢番茄碱及其立体异构体 | 合成生物学 | NA | 瞬时表达、基因工程 | NA | NA | NA | 基因组合表达 | Nicotiana benthamiana | 甾体生物碱和皂苷的生物合成途径,涉及9至15个基因的组合表达 | 医药 |