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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-02-11 |
Advances in synthetic biology for engineering methylotrophic microbial cell factories
2026-Feb-10, Journal of bacteriology
IF:2.7Q3
DOI:10.1128/jb.00383-25
PMID:41665342
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综述 | 本文综述了合成生物学在工程化甲基营养型微生物细胞工厂方面的最新进展,包括构建高效甲醇利用途径、优化氧化效率和氧化还原平衡等策略 | 总结了通过合成生物学和代谢工程策略提升甲醇同化效率的创新方法,如工程化甲醇脱氢酶和优化辅因子利用 | NA | 促进工业甲醇利用和可持续发展,通过设计高性能微生物平台 | 甲基营养型微生物细胞工厂 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、代谢工程、适应性实验室进化 | NA | NA | NA | NA | 甲基营养型微生物 | 高效甲醇利用途径、甲醇脱氢酶工程、氧化还原平衡优化 | 工业生物技术、能源、环境 |
| 2 | 2026-02-11 |
Self-assembling protein cages: from coiled-coil module to machine learning-driven de novo design of next-generation biomaterials
2026-Feb-09, Materials advances
IF:5.2Q2
DOI:10.1039/d5ma00792e
PMID:41446439
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综述 | 本文综述了基于卷曲螺旋或其他模块化蛋白结构域的工程化蛋白笼设计策略、功能化及其定制化应用前景 | 结合模块化蛋白设计、相互作用表面计算设计及基于机器学习的生成式蛋白设计,推动蛋白笼设计的革命性进展 | NA | 探讨自组装蛋白纳米笼的理性设计及其在合成生物学、生物技术和生物医学中的应用 | 自组装蛋白纳米笼 | 机器学习 | NA | 机器学习驱动的生成式蛋白设计 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 生物技术, 生物医学 |
| 3 | 2026-02-11 |
p-Benzoyl-l-phenylalanine as a Multifunctional Noncanonical Amino Acid in Synthetic Biology: Photoprobing, Photocatalysis, and Structural Programming for Biocontainment
2026-Feb-09, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202525502
PMID:41664298
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综述 | 本文综述了对苯甲酰-L-苯丙氨酸(pBzF)作为一种多功能非经典氨基酸在合成生物学中的应用,涵盖光探针、光催化和结构编程等领域 | 确立pBzF作为一种多功能光化学和结构基序,用于构建具有非天然、光响应和催化功能的蛋白质,并展示其在光驱动转化和人工光合系统中的应用 | NA | 探讨pBzF在合成生物学中的多功能应用,包括光化学、结构编程和生物控制 | 对苯甲酰-L-苯丙氨酸(pBzF)及其在蛋白质工程中的应用 | 合成生物学 | NA | 遗传编码、定向进化 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学、工业生物技术 |
| 4 | 2026-02-11 |
Metabolomics-guided engineering of drought-resilient crops: Integrating multi-omics and AI for climate-smart agriculture
2026-Feb-07, Plant science : an international journal of experimental plant biology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.plantsci.2026.113025
PMID:41662977
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综述 | 本文综述了代谢组学在指导工程化培育抗旱作物中的应用,并探讨了其与多组学、CRISPR基因编辑、合成生物学及人工智能等技术整合的转化框架 | 强调将代谢组学与CRISPR基因编辑、通路工程、合成生物学及人工智能等前沿技术整合,构建从实验室发现到田间应用的转化框架,推动代谢组学从诊断工具发展为预测与指导平台 | NA | 为应对干旱胁迫对全球粮食安全的威胁,建立一个整合多组学与人工智能的转化框架,以工程化培育抗旱作物,实现气候智能型农业 | 作物(特别是面临干旱胁迫的作物)及其代谢组 | NA | NA | 代谢组学,多组学整合,CRISPR基因编辑,通路工程,合成生物学,人工智能预测建模 | 人工智能驱动预测模型 | 代谢组学数据,多组学数据 | NA | CRISPR | 作物(植物) | 通路工程 | 农业 |
| 5 | 2026-02-11 |
Biotechnological advances in key regulatory genes of phenylpropanoid and terpenoid biosynthesis pathways in Panax ginseng: Current insights and future prospects
2026-Feb-07, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108840
PMID:41663015
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综述 | 本文综述了人参中苯丙烷类和萜类生物合成途径关键调控基因的生物技术研究进展,包括基因发现、功能表征及代谢工程应用 | 整合了基因组编辑、CRISPR调控、代谢工程和合成生物学等前沿技术,以重编程代谢流并增强人参皂苷等代谢物生产 | NA | 阐明和操纵人参中苯丙烷类和萜类生物合成途径的关键基因,以开发具有改善生物活性化合物谱的优良人参品种 | 人参(Panax ginseng)及其次级代谢产物(如黄酮类、多酚和人参皂苷) | 合成生物学 | NA | 基因组编辑、CRISPR调控、代谢工程、合成生物学、组学策略、系统生物学模型 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 人参(Panax ginseng)细胞或组织 | 代谢途径重编程以增强苯丙烷类和萜类(特别是人参皂苷)生物合成 | 医药 |
| 6 | 2026-02-11 |
Recent advances of engineered bacteria for therapeutic applications
2026-Feb-04, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2025.11.013
PMID:41234015
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综述 | 本文系统回顾了工程化细菌在治疗应用中的最新进展,重点关注其在疾病干预中的多功能生物治疗平台作用 | 通过合成生物学方法,结合计算建模和模块化基因电路设计,克服了细菌固有的功能限制,提高了治疗的时空精度、生物安全性和可扩展性 | NA | 探讨工程化细菌作为治疗策略的发展、测试及其在肿瘤治疗和代谢紊乱管理中的应用 | 工程化细菌系统 | 合成生物学 | 肿瘤、代谢紊乱 | 合成生物学、基因工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 细菌 | 模块化基因电路设计,如生物传感器、逻辑门 | 医学 |
| 7 | 2026-02-11 |
Engineering plasmids with synthetic origins of replication
2026-Feb-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68907-1
PMID:41629321
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研究论文 | 本文通过重构天然pMB1复制起点,开发了具有可定制拷贝数的合成复制起点(SynORI)质粒,并展示了其在微生物中的兼容性和模块化应用 | 首次创建了基于合成RNA调控器的可兼容复制起点,实现了独立拷贝控制和对环境信号的多重响应报告 | NA | 开发可调谐、兼容且模块化的合成质粒复制起点,以克服天然质粒在工程应用中的限制 | 质粒复制起点(pMB1)及其合成版本(SynORI) | 合成生物学 | NA | 合成生物学工程 | NA | NA | NA | 合成RNA调控器 | E. coli | 可调谐复制起点、合成RNA调控器、信号响应模块 | 工业生物技术 |
| 8 | 2026-02-11 |
Development of a Tool for High-Efficiency, Markerless and Iterative Genome Editing in Shouchella clausii
2026-Feb, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.70287
PMID:41662148
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研究论文 | 开发了一种用于Shouchella clausii的高效、无标记和迭代基因组编辑工具 | 开发了一种温度敏感型大肠杆菌-S. clausii穿梭载体,结合Golden Gate组装兼容性和两步整合策略,实现了高效、无标记的基因组编辑 | NA | 促进Shouchella clausii作为微生物底盘的发展,以应用于生物治疗、工业生物技术和环境领域 | Shouchella clausii和枯草芽孢杆菌 | 合成生物学 | NA | 超渗透电穿孔、Golden Gate组装、基因组编辑 | NA | NA | NA | Golden Gate Assembly | Shouchella clausii, Bacillus subtilis | NA | medicine, industrial biotechnology, environment |
| 9 | 2026-02-11 |
Microbial Systems Enhancing CAR-Based Therapies: A Synthetic Biology Paradigm for Next-Generation Cancer Immunotherapy
2025-Dec-27, Current microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00284-025-04679-z
PMID:41454921
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综述 | 本文系统综述了利用合成生物学方法改造微生物系统,以解决CAR免疫疗法在实体瘤应用中面临的挑战 | 提出将工程化益生菌株作为可编程工厂,用于合成抗原、递送共刺激域和调节肿瘤微环境,并通过CRISPR/Cas工程化遗传电路实现治疗载荷的精确时空控制 | 临床转化的主要障碍包括生物防护挑战、对肿瘤归巢特异性的机制理解不完整以及安全性验证要求 | 评估微生物系统作为创新平台,以解决CAR免疫疗法在实体瘤应用中的局限性,并推动临床转化 | 工程化微生物系统(如大肠杆菌Nissle 1917)及其在CAR-T细胞疗法中的应用 | 合成生物学 | 癌症 | CRISPR/Cas, 合成生物学方法 | NA | 文献数据(389篇同行评审研究) | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 遗传电路,用于精确时空控制治疗载荷 | 医学 |
| 10 | 2026-02-11 |
Application of Rational and Irrational Strategies in the Construction of Prokaryotic Cell Factories for the Bioproduction of Aromatic Amino Acid-Derived Chemicals
2025-Nov-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00711
PMID:41137187
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综述 | 本文综述了用于生物生产芳香族氨基酸衍生化学品的原核细胞工厂的挑战、构建策略及最新技术,特别关注了理性与非理性策略的应用 | 聚焦于原核细胞工厂在芳香族氨基酸衍生化学品生产中的独特优势,系统总结了结合理性与非理性策略的构建方法,并探讨了该领域的未来潜在方向 | 本文是一篇综述,不包含原始实验数据,主要基于现有文献进行总结和分析 | 为生产芳香族氨基酸衍生化学品的专用细胞工厂的构建与优化提供有价值的见解和指导 | 用于生物生产芳香族氨基酸衍生化学品的原核细胞工厂 | 合成生物学 | NA | 代谢工程,合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 原核细胞 | NA | 工业生物技术 |
| 11 | 2026-02-11 |
Engineering Plasmids with Synthetic Origins of Replication
2025-Feb-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.21.639468
PMID:40027650
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研究论文 | 本文通过重构天然pMB1复制起点,创建了具有可定制拷贝数的质粒,并利用合成RNA调控器实现独立拷贝控制,展示了合成复制起点(SynORI)的模块化工程应用 | 开发了合成复制起点(SynORI)技术,实现了质粒拷贝数的可定制化、兼容性和模块化调控,并创建了正交质粒库 | NA | 研究合成生物学中质粒复制起点的工程化改造,以提高其可调性、兼容性和模块化 | 质粒的复制起点和合成RNA调控器 | 合成生物学 | NA | 合成RNA调控器技术 | NA | NA | NA | 合成RNA调控器 | 大肠杆菌 | 合成复制起点(SynORI)和正交质粒库,用于实现可调拷贝数控制和环境信号的多重报告 | 工业生物技术 |
| 12 | 2026-02-10 |
Over-Expression of a Phycocyanin-Interferon Fusion and Differential Cleaving Efficiency in Cyanobacteria (Synechocystis sp. PCC 6803)
2026-Mar, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.70126
PMID:41388596
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研究论文 | 本研究在蓝藻Synechocystis sp. PCC 6803中过表达藻蓝蛋白-干扰素融合蛋白,并比较了TEV和HRV蛋白酶在切割融合蛋白以分离人干扰素α-2方面的效率 | 首次在蓝藻中稳定过表达功能性人干扰素α-2作为藻蓝蛋白融合体,并系统比较了TEV和HRV蛋白酶在切割效率上的差异,发现HRV蛋白酶优于TEV及其他近期测试的蛋白酶 | 研究仅针对特定蓝藻宿主和融合蛋白设计,未探索其他宿主或融合策略,且切割效率比较可能受实验条件限制 | 开发蓝藻作为重组蛋白生产的低成本平台,优化融合蛋白切割以分离功能性干扰素 | 蓝藻Synechocystis sp. PCC 6803作为宿主,以及藻蓝蛋白CpcB β-亚基与人干扰素α-2的融合蛋白 | 合成生物学 | NA | 重组蛋白表达、融合蛋白构建、蛋白酶切割分析 | NA | NA | NA | Tobacco Etch Virus (TEV) protease, Human Rhinovirus (HRV) 3C protease | 蓝藻Synechocystis sp. PCC 6803 | 藻蓝蛋白-干扰素融合蛋白,包含TEV或HRV蛋白酶切割位点 | 医药、工业生物技术 |
| 13 | 2026-02-10 |
[Design and synthesis of molecularly imprinted polymers and their applications in medical diagnosis and biocatalysis]
2026-Feb-08, Se pu = Chinese journal of chromatography
DOI:10.3724/SP.J.1123.2025.06013
PMID:41641521
|
综述 | 本文综述了分子印迹聚合物(MIPs)的理性设计、功能化制备及其在生物传感、生物催化和生物医学诊疗等领域的跨学科应用 | 提出了三维策略(高通量单体筛选、分子识别机制阐明和功能单元定向组装),开发了具有刺激响应特性的智能MIPs,并建立了从体外传感到体内精准干预的集成智能诊疗平台前沿方向 | 指出了MIPs在印迹层不均匀、模板残留、大分子印迹水相容性有限、工业可扩展性、识别机制不明确以及与微流控和人工智能等新兴领域融合不足等方面的挑战 | 推进分子印迹技术(MIT),开发高性能MIPs,并拓展其在生物医学诊断、生物催化等领域的应用 | 分子印迹聚合物(MIPs) | NA | 心力衰竭、癌症 | 分子印迹技术(MIT)、高通量单体筛选、分子动力学模拟、固相表面印迹法 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学、环境、制药 |
| 14 | 2026-02-10 |
Programming Next-Generation Synthetic Biosensors by Genetic Circuit Design
2026-Feb-08, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202524172
PMID:41655251
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综述 | 本文综述了基于遗传电路设计的下一代合成生物传感器的最新进展,包括其传感机制、设计和应用,并分析了设计原则、工具和工程策略 | 系统总结了遗传电路在合成生物传感器中的应用,并深入探讨了剂量-响应曲线的调谐方法,以及通过定制信号处理和输出模块扩展功能 | NA | 推动合成生物传感器从实验室向现场应用的转化,提升其灵敏度、特异性、速度、稳定性和生物安全性 | 合成生物传感器及其遗传电路设计 | 合成生物学 | NA | 遗传电路设计 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 大肠杆菌, 酿酒酵母, 枯草芽孢杆菌, 哺乳动物细胞, 植物 | 开关, 振荡器, 逻辑门, 生物传感器, 代谢途径 | 环境, 医学, 农业, 食品, 工业生物技术 |
| 15 | 2026-02-10 |
Preparation strategies and biomedical applications of DNA hydrogels
2026-Feb-06, Chemical science
IF:7.6Q1
DOI:10.1039/d5sc08190d
PMID:41657654
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综述 | 本文总结了DNA水凝胶的制备策略及其在细胞培养、药物递送和组织工程等生物医学领域的应用进展 | 系统性地总结了DNA水凝胶的制备策略,并强调了其高生物相容性、可编程响应性和特异性识别功能等应用优势 | 讨论了DNA水凝胶发展当前面临的挑战 | 总结DNA水凝胶的制备策略,分析其应用优势,并展望未来研究方向 | DNA水凝胶 | 材料科学 | NA | DNA纳米技术、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 16 | 2026-02-10 |
Genome Position Does Not Impact Transgene Expression Efficiency in the Ancient Red Alga Cyanidioschyzon merolae
2026-Jan-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.31.703004
PMID:41659391
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研究论文 | 本研究在原始红藻Cyanidioschyzon merolae中建立了核基因组工程的可重复框架,并发现基因组位置对转基因表达效率无显著影响 | 首次通过实验验证了该藻类中的中性整合位点,并建立了高通量转化方法,揭示了转基因表达在基因组不同位置的高度一致性 | NA | 系统研究基因组位置对转基因表达的影响,建立合成生物学底盘生物的基因组工程方法 | 嗜热嗜酸红藻Cyanidioschyzon merolae | 合成生物学 | NA | 生物信息学基因组分析、液体处理机器人技术、异源蛋白和代谢产物生产检测 | NA | 基因组数据、蛋白质表达数据、代谢产物数据 | 40个基因间候选位点(验证了38个),覆盖20条染色体中的16条 | 同源重组 | Cyanidioschyzon merolae(原始红藻) | 异源异戊二烯合酶表达系统 | 工业生物技术 |
| 17 | 2026-02-10 |
A programmable ribozyme for RNA signal transduction
2026-Jan-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-68175-5
PMID:41519779
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研究论文 | 本文报道了一种可编程的RNA触发激活双位点自切割核酶平台UNBAR,用于RNA信号转导 | 首次开发了一种通用方法,允许RNA触发器直接激活多种非编码RNA效应子,实现了RNA检测与功能转导的一体化 | NA | 开发一种可编程的RNA信号转导平台,用于合成生物学、诊断和基因调控 | RNA触发器、非编码RNA效应子(如sgRNA、shRNA、适配体) | 合成生物学 | NA | RNA工程、细胞自由传感、蛋白质自由扩增 | NA | RNA序列数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 斑马鱼胚胎、人类细胞 | 可编程双位点自切割核酶,具有模块化传感域和切割产物 | 医学、合成生物学、诊断 |
| 18 | 2026-02-10 |
Light force-powered cellular medical micromachines
2026, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2026.1746261
PMID:41658983
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综述 | 本文系统综述了光力驱动的细胞微机器(包括趋化细菌、光合微藻、红细胞、免疫细胞和亚细胞结构)的设计策略及其在靶向药物递送、微创手术和免疫治疗中的应用 | 提出将天然生物细胞与可编程光镊技术相结合,克服传统人工合成材料微机器在生物安全性和深部组织疗效方面的局限,实现细胞微机器的精确行为调控与组装 | 存在组织穿透深度有限、光毒性管理以及操作智能化不足等关键挑战 | 探讨光力驱动的细胞微机器在精准医疗中的应用潜力与发展方向 | 基于天然生物细胞(细菌、微藻、红细胞、免疫细胞等)构建的微机器 | 生物医学工程 | NA | 光镊技术、合成生物学、人工智能 | NA | NA | NA | NA | 细菌、微藻、哺乳动物细胞(红细胞、免疫细胞) | NA | 医学 |
| 19 | 2026-02-10 |
Harnessing semiochemicals for parasitoid-based biological control: from laboratory identification to field applications
2025-Nov-30, Crop health
DOI:10.1007/s44297-025-00061-4
PMID:41649713
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综述 | 本文综述了信息化学物质在调控寄生蜂行为中的作用,评估了行为操纵方法,并探讨了合成生物学与信息化学物质结合在可持续害虫管理中的潜力和局限性 | 通过合成生物学手段,利用植物和酵母的遗传与代谢工程释放关键信息化学物质,以操纵寄生蜂行为,这是生物防治领域的前沿创新点 | 合成生物学与信息化学物质结合的应用仍处于探索阶段,存在技术实施复杂性和生态安全性等潜在限制 | 研究信息化学物质在寄生蜂行为调控中的作用,并探索通过合成生物学手段增强生物防治效果的可持续害虫管理策略 | 寄生蜂(如Campoletis chlorideae)及其相关的信息化学物质(如性信息素、植物源协同素和寄主源利他素) | 农业生物技术 | NA | 气相色谱-触角电位检测(GC-EAD)、异位表达系统、遗传工程、代谢工程 | NA | 化学数据、行为数据 | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 植物, 酵母 | 生物传感器、代谢途径 | 农业 |
| 20 | 2026-02-10 |
Precision and efficacy of RNA-guided DNA integration in high-expressing muscle loci
2024-Dec-10, Molecular therapy. Nucleic acids
DOI:10.1016/j.omtn.2024.102320
PMID:39398225
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研究论文 | 本研究评估了利用CRISPR-Cas9和HITI技术在骨骼肌高表达位点进行RNA引导DNA整合的精确性和有效性,旨在实现长期治疗基因表达 | 通过劫持肌肉肌酸激酶和肌红蛋白启动子,在骨骼肌中实现高效治疗基因整合,为基于靶向整合的医学提供概念验证技术 | 研究基于小鼠模型,人类应用需进一步验证;长期安全性和免疫反应未全面评估 | 开发一种在骨骼肌中实现高水平治疗基因表达的靶向整合方法,用于基因替代疗法 | 小鼠成肌细胞和骨骼肌组织,使用GFP或人因子IX作为报告或治疗基因 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9, HITI, 基因组和转录组分析 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | 小鼠模型(具体数量未在摘要中明确) | CRISPR-Cas9 | 小鼠 | 利用内源启动子(肌肉肌酸激酶和肌红蛋白)驱动治疗基因表达的合成生物电路 | 医学 |