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当前共找到 5711 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-09-22 |
Menaquinone biosynthesis in Lactococcus lactis: Recent advances and future prospects
2026-Dec, Engineering microbiology
DOI:10.1016/j.engmic.2026.100304
PMID:42761602
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综述 | 本文综述了乳酸乳球菌中甲萘醌（维生素K2）生物合成途径、生理功能及其调控机制，并探讨了提高MK产量的策略 | 系统总结了乳酸乳球菌中MK生物合成途径及调控机制，并讨论了在乳酸乳球菌和大肠杆菌中实现MK高产方案 | 作为综述文章，未提供原创实验数据，且对乳酸乳球菌MK高产的代谢工程策略仍需进一步实验验证 | 总结乳酸乳球菌中甲萘醌生物合成的研究进展，并为开发乳酸乳球菌作为MK生产细胞工厂提供思路 | 乳酸乳球菌（Lactococcus lactis）及甲萘醌（维生素K2）生物合成途径 | 合成生物学 | 心血管疾病 | NA | NA | 文本 | NA | NA | 乳酸乳球菌, 大肠杆菌 | 甲萘醌生物合成代谢途径 | 医药, 食品 |
| 2 | 2026-09-22 |
Engineering a protein homodimer from a heterodimer: A chimeric DBHS protein
2026-Oct, Protein science : a publication of the Protein Society
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/pro.70799
PMID:42765842
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研究论文 | 本文设计并表征了一种嵌合DBHS蛋白，使其从异二聚体转变为同二聚体，并对其进行了生化和结构分析 | 首次设计出模拟DBHS异二聚体界面的嵌合同二聚体蛋白，即使存在偏好异二聚化的天然DBHS蛋白时仍保持同二聚体状态；揭示了核心色氨酸残基堆积最大化及界面疏水/极性互补性增加可能是决定DBHS配对偏好的关键因素 | 研究主要基于体外实验，未在细胞内或体内验证嵌合蛋白的功能；对DBHS配对偏好的分子决定因素仅提供了初步的结构解释 | 理解DBHS蛋白异二聚化偏好的分子决定因素，并设计一种稳定的同二聚体DBHS蛋白用于结构研究 | DBHS蛋白家族（SFPQ、NONO和PSPC1）及其设计的嵌合同二聚体蛋白 | 结构生物学 | NA | X射线晶体学、生化表征 | NA | 蛋白质结构数据 | NA | NA | NA | NA | 医学、合成生物学 |
| 3 | 2026-09-22 |
Synthetic Biology and Soft Robotics in Biohybrid Kidney Replacement: A Conceptual Framework and Translational Roadmap
2026-Sep-20, Artificial organs
IF:2.2Q3
DOI:10.1111/aor.70242
PMID:42764249
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综述 | 该文探讨了合成生物学与软机器人技术在生物混合肾脏替代疗法中的整合潜力，提出了半机械肾单位的概念框架和模块化肾脏辅助设备的设计，并评估了各组成部分的技术成熟度 | 首次提出半机械肾单位的概念，将活体肾细胞与血管细胞同顺应性机械和流体接口耦合，构建模块化肾脏辅助设备，并系统性地应用技术成熟度等级评估各组件 | 半机械肾单位仅为假设生成的研究框架，而非近期临床解决方案，多数关键组件仍处于临床前或概念阶段，存在血栓形成、氧输送、细胞成熟、遗传稳定性、机械疲劳、功率需求和网络安全等多重障碍 | 探索合成生物学与软机器人技术在生物混合肾脏替代疗法中的整合潜力，为慢性肾脏病提供更安全、更连续的治疗方案 | 慢性肾脏病患者、肾脏替代疗法、半机械肾单位、模块化肾脏辅助设备 | 合成生物学, 软机器人, 生物医学工程 | 慢性肾脏病 | 合成生物学, 软机器人技术, 细胞基肾脏生物反应器, 微生理模型, 内皮化血液接触表面, 被动膜, 软微泵, 无线传感, 自主肾脏基因回路 | NA | 文本 | NA | NA | NA | 自主肾脏基因回路, 闭环控制系统 | 医学 |
| 4 | 2026-09-22 |
In vitro enzymatic synthesis of long-acting therapeutic proteins and peptides
2026-Sep-18, Bioorganic chemistry
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.bioorg.2026.110521
PMID:42764007
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综述 | 本文综述了通过酶催化糖基化、脂化、PEG化和大环化四种绿色修饰策略合成长效治疗性蛋白和多肽的生物催化进展 | 系统总结了四种高效绿色酶催化修饰策略的催化机制、底物特异性和酶结构工程，并提出了AI驱动的生成式酶设计和合成生物学将拓宽生物催化方法范围的展望 | 当前生物催化存在瓶颈，如非天然聚合物的底物范围受限 | 综述治疗性蛋白和多肽的位点特异性功能化生物催化合成方法 | 治疗性蛋白和多肽 | 合成生物学 | NA | 酶催化生物偶联 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 5 | 2026-09-22 |
Programmable plant nutrition through synthetic transportome engineering
2026-Sep-16, Journal of plant physiology
IF:4.0Q1
DOI:10.1016/j.jplph.2026.154874
PMID:42763965
|
综述 | 本文提出了合成转运组这一以转运为中心的系统级框架，用于理性设计植物营养运输，实现可编程的养分利用。 | 将养分工程视为逆设计问题，从期望的养分通量和生理输出出发，选择和协调运输模块，而非描述性系统分析。 | 文中未提及具体实验验证或实施案例，框架仍停留在概念层面。 | 提出合成转运组工程的概念框架，实现定量可预测且环境稳健的植物营养工程。 | 植物养分转运系统，包括转运蛋白、调控回路和空间结构。 | 合成生物学 | NA | 多组学、机器学习、结构生物学、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 植物 | 调控回路、运输模块、空间架构 | 农业 |
| 6 | 2026-09-22 |
Artificial Intelligence in the Discovery of Bioactive Natural Products
2026-Sep-16, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
|
综述 | 本文综述了人工智能在生物活性天然产物发现中的应用，涵盖基因组挖掘、代谢组学、生物活性预测和虚拟筛选等AI驱动方法 | 系统整合了AI就绪数据库、BGC预测机器学习工具、代谢组学平台、NMR和MS光谱解析及转化开发，提出了AI作为整合性决策支持框架而非替代实验化学和药理学专业知识的观点 | 数据质量、可重复性、可解释性和伦理问题等关键挑战尚未完全解决 | 全面概述AI驱动的生物活性天然产物发现方法，探讨其与多组学技术、合成生物学和自动化实验的融合 | 生物活性天然产物、生物合成基因簇（BGC）、代谢组学数据、NMR和MS光谱数据 | 机器学习 | NA | 基因组挖掘, 代谢组学, 虚拟筛选, NMR光谱解析, MS光谱解析 | NA | 文本, 光谱数据, 组学数据 | NA | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 7 | 2026-09-22 |
Microbial partnerships and molecular mechanisms in plant stress physiology for climate-resilient and sustainable farming
2026-Sep-08, Planta
IF:3.6Q1
DOI:10.1007/s00425-026-05140-6
PMID:42709227
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综述 | 本文综述了植物-微生物互作及其分子机制在植物逆境生理中的作用，并探讨了利用多组学、人工智能和合成生物学设计微生物菌剂以实现气候适应型和可持续农业的潜力 | 将植物-微生物互作的生态、生理和分子视角相整合，提出结合人工智能、大数据分析和合成生物学精准设计靶向生物接种剂与合成微生物群落的新前沿 | 文章为综述性研究，未提供原始实验数据验证所提出的策略，且从实验室到田间规模化应用仍面临挑战 | 总结植物-微生物互作及分子机制在植物逆境生理中的研究进展，探索基于微生物组策略的气候适应型可持续农业发展路径 | 植物-微生物互作、植物相关微生物群落、根际微生物 | 机器学习 | NA | 多组学、人工智能、大数据分析、合成生物学 | NA | 文本 | NA | NA | 植物 | 合成微生物群落 | 农业 |
| 8 | 2026-09-22 |
Identification and catalytic optimization of pinene oxidases in paeoniflorin biosynthetic pathway
2026-Sep-01, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiag669
PMID:42740699
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研究论文 | 该研究确认芍药苷生物合成起源于α-蒎烯，鉴定出3个新型细胞色素P450酶催化蒎烯氧化，并通过蛋白质结构预测和定点突变优化了CYP71AN126的催化特异性 | 首次确认芍药苷生物合成起源于α-蒎烯，鉴定出3个新型P450酶（CYP71AN126和CYP76A225/226）催化蒎烯氧化，发现C4羟基化是芍药苷生物合成的关键限速步骤，并通过定点突变鉴定L493为调控CYP71AN126催化位点特异性和底物特异性的关键残基 | 芍药苷完整生物合成途径尚未完全阐明，仅确定了C4氧化为关键步骤，后续下游途径的酶和反应步骤仍未知 | 阐明芍药苷生物合成途径中蒎烯氧化步骤的酶学机制，为通过合成生物学方法高效生产芍药苷提供靶点 | 芍药苷生物合成途径、α-蒎烯、细胞色素P450酶（CYP71AN126、CYP76A225、CYP76A226） | 合成生物学 | NA | 病毒诱导基因沉默（VIGS）、蛋白质结构预测、定点突变、酶学分析 | NA | 文本、序列数据、结构数据 | NA | 定点突变 | NA | NA | 医药、工业生物技术 |
| 9 | 2026-09-22 |
Programmable Domestication: CRISPR, Pan-Genomics and System Level Engineering for Next-Generation Crops
2026-Aug-26, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70749
PMID:42643124
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综述 | 本综述系统总结了CRISPR基因组编辑、泛基因组学、合成生物学、AI辅助育种和预测表型组学在可编程作物驯化中的最新进展，并提出了一个包含适应性拯救、农艺改良和新底盘工程的三阶段框架 | 提出了从传统驯化向可编程驯化转变的系统框架，包括适应性拯救、农艺改良和新底盘工程三个演化路径，并整合了CRISPR多重编辑、泛基因组变异发现和AI驱动预测育种 | 未涉及具体实验验证，主要基于文献综述和理论框架构建；可编程驯化仍面临隐性遗传变异、上位效应、基因调控网络复杂性、基因型-表型可预测性、生物多样性保护和监管等挑战 | 综述可编程从头驯化的最新进展，探讨如何利用作物野生近缘种和未充分利用的种质资源，通过系统级工程开发适应气候变化、有韧性和可持续的下一代作物 | 作物野生近缘种、未充分利用的种质资源、主要农作物 | 农业基因组学 | NA | CRISPR基因组编辑、泛基因组学、合成生物学、AI辅助育种、预测表型组学 | NA | 文本 | NA | CRISPR-Cas9 | 植物 | NA | 农业 |
| 10 | 2026-09-22 |
Cell-free synthesis and characterization of Salmonella, Escherichia coli, and Shigella-specific bacteriophages
2026-Jun-30, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-026-03049-z
PMID:42380887
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研究论文 | 该研究利用大肠杆菌无细胞基因表达系统合成了七种不同的噬菌体，并对其感染性、稳定性及内毒素-free合成能力进行了表征 | 首次报道了五种噬菌体（LPST153、S16、SP6、Jbel、Alf5）在无细胞系统中的成功合成与表征，并证明可在内毒素-free系统及完全体外组装条件下合成具有感染性的噬菌体 | 无细胞合成噬菌体在不同宿主间的感染效率（EOP）存在显著差异，与宿主来源噬菌体的功能可比性尚未完全阐明 | 评估大肠杆菌无细胞表达平台合成多种食源性病原体相关噬菌体的通用性及功能可比性 | Salmonella、Escherichia coli和Shigella特异性噬菌体，共七种噬菌体（四个科） | 合成生物学 | 食源性疾病 | 无细胞基因表达（CFE）、PHEIGES工作流 | NA | NA | 七种噬菌体，涉及多种Salmonella、E. coli和Shigella宿主菌株 | NA | E. coli（包括ClearColi™菌株） | NA | 医学, 食品 |
| 11 | 2026-09-22 |
Mind Everywhere: A Framework for Conceptualizing Goal-Directedness in Biology and Other Domains-Part One
2026-Feb-01, Biological theory
IF:1.9Q1
DOI:10.1007/s13752-025-00523-6
PMID:42183019
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综述 | 本文是两部分文章的第一部分，回顾了生物学中目的论的历史争论，并提出了一个基于多元智能框架的新方法来理解目标导向性 | 提出了一种强调实证可检验性、发现新能力的丰产性、术语操作化以及人类目标导向性与单细胞起源连续性的新方法 | 本文为概念性框架文章，缺乏具体的实验验证；第二部分尚未发表，完整论证有待呈现 | 重新概念化生物学及其他领域中的目标导向性，超越还原论的限制，整合心智主义概念如智能、认知和意向性 | 生物学中的目标导向系统，包括进化、工程和混合系统；形态发生、合成生物学和生物电网络中的实验案例 | 机器学习 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 12 | 2026-09-22 |
Approaches to deorphanize secretome: Classical, computational, and next generation strategies to reveal ligand-receptor networks
2026, EXO : beyond the cell
DOI:10.70401/EXO.2026.0008
PMID:42181609
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综述 | 本文综述并评估了当前用于分泌蛋白去孤儿化的策略，包括生化方法、遗传筛选和计算框架，并展望了未来加速配体-受体鉴定的方向 | 系统性地整合了经典、计算和下一代去孤儿化策略，并提出了多路筛选、合成生物学工具和单细胞空间转录组整合等未来方向 | 许多分泌因子的同源受体和作用机制仍未知，低亲和力相互作用检测灵敏度不足，现有策略在规模化、上下文感知方面存在瓶颈 | 总结和评估分泌蛋白去孤儿化的现有策略，并展望加速配体-受体鉴定的未来方向 | 分泌蛋白及其同源受体 | 机器学习, 数字病理学 | NA | affinity purification-mass spectrometry, crosslinking-based receptor capture, RNA interference, CRISPR, AI-driven protein structure modeling, single-cell and spatial transcriptomics | AI-driven protein structure modeling | 文本, 蛋白质结构数据, 组学数据 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 医学 |
| 13 | 2026-09-22 |
From biological surfaces to engineered systems: how synthetic and systems biology enable biomimetic design
2026, Frontiers in systems biology
DOI:10.3389/fsysb.2026.1860815
PMID:42761473
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综述 | 该综述探讨了生物表面的结构与功能特性如何启发高级仿生系统的设计，通过整合系统生物学与合成生物学的框架，提炼关键设计原则并展示其在工程系统中的应用 | 采用整合系统生物学与合成生物学的框架，从生物表面的通讯、交换、防御和运动功能中提炼设计原则，而非仅关注制造方法，强调生物机制与工程设计的结合 | 作为综述文章，未涉及具体实验验证，且可能未全面覆盖所有生物表面类型或工程应用 | 探讨生物表面的结构与功能特性如何为先进仿生系统的设计提供信息，并建立跨学科的设计原则 | 生物表面（包括其通讯、分子交换、防御和运动相关的结构与功能）以及仿生工程系统 | 合成生物学 | NA | 系统生物学建模，合成生物学工程 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学，材料，工业生物技术 |
| 14 | 2026-09-22 |
Cell-type-specific alkaloid and terpenoid biosynthesis in glandular trichomes: single-cell and spatial transcriptomic perspectives
2026, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2026.1911787
PMID:42761523
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综述 | 本文系统总结了单细胞和空间组学技术在腺毛研究中的最新应用，重点关注生物碱和萜类生物合成途径，并展望了与合成生物学的深度融合 | 整合单细胞组学和空间组学技术，以更高分辨率解析腺毛中不同细胞类型的代谢生物合成和细胞间运输机制，并构建更精细的预测性代谢网络模型 | 传统宏观组学方法忽视组织内细胞异质性，难以解析腺毛中不同细胞类型的具体动态 | 阐明腺毛中不同细胞类型的次级代谢途径及其调控机制，并探索单细胞组学、空间组学与合成生物学的深度融合前景 | 腺毛，特别是（L.）G. Don、L.、L.、和等关键模式植物中的生物碱和萜类生物合成途径 | 单细胞组学, 空间组学 | NA | 单细胞组学, 空间组学 | NA | NA | NA | NA | 植物 | NA | 农业, 医学 |
| 15 | 2026-09-21 |
Harnessing bacterial biology and components for next-generation vaccine development
2026-Nov, Microbial pathogenesis
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.micpath.2026.108823
PMID:42705503
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综述 | 本文综述了利用细菌生物学及其组分（如类毒素、多糖、外膜囊泡、鞭毛蛋白、细菌影和乳酸菌等）作为下一代疫苗设计与递送平台的潜力 | 系统整合细菌组分作为抗原与内在佐剂的双重功能，并结合合成生物学实现针对新发病原体的多价疫苗设计策略 | 部分细菌疫苗平台仍处于研发阶段，尚未成熟；文中未涉及具体临床数据或大规模验证结果 | 探讨细菌生物学和组分在下一代疫苗开发中的应用，推动灵活、可扩展和多价疫苗平台的构建 | 细菌组分（类毒素、多糖、外膜囊泡、鞭毛蛋白、细菌影）及乳酸菌 | 免疫学 | 传染病 | NA | NA | 文本 | NA | NA | 乳酸菌, 细菌 | NA | 医学 |
| 16 | 2026-09-21 |
Beyond gene editing: the age of chromosome-scale genome engineering
2026-Sep-19, Trends in genetics : TIG
IF:13.6Q1
DOI:10.1016/j.tig.2026.08.010
PMID:42763238
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综述 | 这篇综述探讨了染色体尺度基因组工程的技术工具，包括染色体转移和靶向染色体消除，以及它们如何整合到染色体移植流程中 | 将染色体尺度操作确立为可操作的实验框架，并强调其在理解、构建和修复基因组方面的潜力 | 常规实施仍受限于分析需求和技术障碍 | 综述高等真核生物中染色体尺度操作的工具包，并讨论其在基因组工程中的应用前景 | 高等真核生物的染色体和大规模基因组区域 | 基因组工程 | NA | 染色体转移, 靶向染色体消除, 染色体移植, 大规模DNA组装, 合成生物学, 全基因组验证 | NA | 文本 | NA | NA | 高等真核生物 | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 17 | 2026-09-21 |
Cross incompatibility restricting genome exchange and diversification of primary gene pool in plants: challenges and opportunities
2026-Aug-25, TAG. Theoretical and applied genetics. Theoretische und angewandte Genetik
DOI:10.1007/s00122-026-05347-x
PMID:42642494
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综述 | 本文综述了植物种间杂交中存在的合子前和合子后障碍及其遗传因素，并探讨了体细胞杂交和胚胎拯救等生物技术手段以及合成生物学在克服杂交不亲和中的应用前景。 | 强调合成生物学可重新编程生殖障碍，把杂交不亲和转变为可控制的性状以促进杂交品种开发。 | 未提及具体的实验验证，侧重于理论综述与现有技术总结，缺乏原始数据支撑。 | 探索植物种间杂交不亲和的障碍机制，并总结克服这些障碍以利用作物野生近缘种遗传多样性的策略。 | 植物，尤其是作物野生近缘种与栽培作物的种间杂交。 | 植物遗传学与育种 | NA | 体细胞杂交、胚胎拯救、合成生物学 | NA | 文本 | NA | NA | 植物 | NA | 农业 |
| 18 | 2026-09-21 |
Fluorogenic RNA Aptamer-Based Activity Quantification of T7 RNA Polymerase
2026-Aug-18, Biochemistry
IF:2.9Q3
DOI:10.1021/acs.biochem.6c00336
PMID:42610739
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研究论文 | 本文开发了一种基于荧光RNA适配体的体外转录 assay，用于定量测定T7 RNA聚合酶的活性单位 | 使用Broccoli RNA适配体作为转录报告基因，以荧光信号替代传统放射性聚合 assay，实现简便且安全的T7 RNAP活性定量 | 未明确提及 | 开发一种荧光基的体外转录 assay，以简便、定量地测定T7 RNA聚合酶活性单位 | T7 RNA聚合酶及其工程化变体 | 合成生物学 | NA | 体外转录 assay, 荧光RNA适配体 | NA | 荧光信号 | NA | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 19 | 2026-09-21 |
From Design to Practice: A Comprehensive Tutorial for the Rapid Multiplex Engineering of Escherichia coli Using Antibiotic Resistance Markers
2026-Apr-20, Bio-protocol
IF:1.0Q3
DOI:10.21769/BioProtoc.5665
PMID:42037765
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研究方法教程 | 本文提供了一套利用抗生素抗性标记对大肠杆菌进行快速多重基因组工程改造的完整教程，涵盖实验方案、序列设计和DNA构建方法 | 提供了一套系统性的重组工程教程，整合了15种抗生素抗性盒用于多重编辑，可在三周内完成10-15个基因组修饰，并包含可供商业DNA合成的序列信息 | 该方法主要适用于易于操作的微生物如大肠杆菌，当需要无疤痕修饰时不具优势，且不适用于遗传难操作微生物 | 建立一套快速、高效的多重大肠杆菌基因组工程改造方法，简化合成生物学中的遗传设计原型构建流程 | 大肠杆菌（Escherichia coli） | 合成生物学 | NA | 重组工程、双链DNA供体介导的基因编辑 | NA | DNA序列、实验方案 | NA | 重组工程 | 大肠杆菌 | NA | 合成生物学、工业生物技术 |
| 20 | 2026-09-21 |
Modular Deep Learning for Direct RNA Sequence Design via Self-Contained RNA Units
2026-Apr-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.16.719021
PMID:42039474
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研究论文 | 该文提出将复杂RNA分解为自包含RNA单元（SCRU），构建了包含超过61,000个SCRU的数据库SCRU-DB，并开发了SCRU-Seq和SCRU-Diff两种深度学习模型用于直接RNA序列设计。 | 提出将RNA数据稀缺问题归因于可及性和粒度问题，构建了超过61,000个自包含RNA单元的SCRU-DB数据库，涵盖超过8,200个独特结构簇，并通过三级接触聚类严格定义SCRU为结构自主模块；SCRU-Seq实现O(1)直接预测，SCRU-Diff达到79.2%的最佳NSR。 | 摘要中未明确提及研究的局限性。 | 解决RNA序列设计中因高分辨率3D结构稀缺导致的训练数据不足问题，实现可扩展、物理基础的多样化且结构准确的RNA序列生成。 | RNA序列及其三维结构，特别是复杂RNA分子分解后的自包含RNA单元（SCRUs）。 | 合成生物学, 机器学习 | NA | 深度学习, 图神经网络, 扩散模型, 三级接触聚类 | GNN, 扩散模型 | RNA序列, 3D结构 | 超过61,000个自包含RNA单元（SCRUs），超过8,200个独特结构簇；使用set112基准数据集进行评估 | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |