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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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1 | 2024-09-17 |
Synthetic biology: tools to design, build, and optimize cellular processes
2010, Journal of biomedicine & biotechnology
DOI:10.1155/2010/130781
PMID:20150964
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综述 | 本文综述了合成生物学在设计、构建和优化细胞过程方面的工具和方法 | 本文提出了将合成生物学分为三个层次的框架,并探讨了在这些层次上控制细胞系统的努力 | 本文主要集中在综述现有进展,未涉及具体的实验数据或技术细节 | 探讨合成生物学在优化细胞过程方面的潜力和未来研究方向 | 细胞过程及其与环境的相互作用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
2 | 2024-09-17 |
Biology by design: from top to bottom and back
2010, Journal of biomedicine & biotechnology
DOI:10.1155/2010/232016
PMID:21052559
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研究论文 | 本文探讨了合成生物学中从“自下而上”和“自上而下”两个角度开发新型生物系统的概念模型 | 提出了一个结合“自下而上”和“自上而下”方法的概念模型,用于设计和构建新型生物系统 | 目前工程生物学仍依赖大量试错,缺乏将基本“部件”有效连接成高阶网络的有效方法 | 开发新型生物系统以满足社会紧迫需求 | 生物化学转化、细胞设备和治疗药物以及扩展生命化学的方法 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
3 | 2024-08-07 |
Synthetic biology: an RNP switch raises a roadblock
2010-Jan, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/nchembio.287
PMID:20016492
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
4 | 2024-08-07 |
Safe and effective synthetic biology
2010-Oct, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/nbt1010-1010
PMID:20944581
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
5 | 2024-08-07 |
Prokaryotic gene clusters: a rich toolbox for synthetic biology
2010-Dec, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.201000181
PMID:21154668
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综述 | 本文综述了与生物技术相关的多个基因簇的最新研究工作,并探讨了合成生物学在基因簇工程中的应用前景。 | 文章介绍了合成生物学在基因簇大规模自下而上工程中的进展,以及如何优化基因簇功能、激活隐秘基因簇或将基因簇在不同生物间转移。 | 基因簇的调控复杂性、多基因表达平衡的需求以及缺乏在此规模上设计和管理DNA的工具限制了基因簇工程的发展。 | 探讨基因簇在生物技术中的应用,并推动基因工程进入一个可以‘混合搭配’多功能的定制生物时代。 | 细菌基因簇及其在生物技术中的应用。 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
6 | 2024-08-07 |
Integration of transcriptional inputs at promoters of the arabinose catabolic pathway
2010-Jun-02, BMC systems biology
DOI:10.1186/1752-0509-4-75
PMID:20525212
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研究论文 | 本文通过合成生物学方法开发了一种能够在活体内实时测量转录因子活性的报告系统,并利用该系统研究了阿拉伯糖分解代谢途径中四个启动子的转录输入整合规则 | 本文采用合成生物学方法,开发了一种新的报告系统来测量活体内的转录因子活性,避免了传统方法中对细胞内浓度、结合亲和力和反应速率的测量需求 | NA | 研究转录因子在活体内的活性以及不同启动子如何整合共同的转录输入 | 阿拉伯糖分解代谢途径中的四个启动子 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法 | 简单模型 | 转录因子活性数据 | NA |
7 | 2024-08-07 |
How to make a minimal genome for synthetic minimal cell
2010-May, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1007/s13238-010-0064-4
PMID:21203957
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综述 | 本文综述了合成最小细胞的关键步骤——构建功能性最小基因组的历史、现状及主要方法,并讨论了最小基因组对人工细胞代谢和调控的影响 | 实验表明,基因组简化带来了意想不到的有益特性,如高电穿孔效率和重组基因及质粒的准确传播 | NA | 构建一个合成最小细胞,提供一个合适的底盘,以整合功能性的合成部件、设备和系统 | 合成最小细胞及其最小基因组 | 合成生物学 | NA | 生物信息学和分子生物学方法 | NA | 基因组数据 | NA |
8 | 2024-08-07 |
Introduction of customized inserts for s-treamlined assembly and optimization of BioBrick synthetic genetic circuits
2010-Dec-20, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/1754-1611-4-17
PMID:21172029
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研究论文 | 本文介绍了一种使用定制插入物快速生成合成生物电路的技术,并在大肠杆菌中展示了其应用 | 该技术使用了一种新型BioBrick部件(BioScaffold),可以在克隆载体中插入和切除,从而在克隆载体中留下一个间隙,用于放置其他DNA元素 | 标准组装过程不允许对已组装的生物电路进行修改,添加蛋白质标签到现有的BioBrick部件,或添加非BioBrick部件到组装中 | 简化并加速迭代设计-构建-测试过程,允许将不兼容BioBrick组装的序列整合到BioBrick电路中 | 合成生物电路的快速生成和优化 | 合成生物学 | NA | Type IIB限制酶 | NA | DNA序列 | 在大肠杆菌中进行了实验,表达绿色荧光蛋白(GFP)并添加N端标签 |
9 | 2024-08-07 |
Synthetic biology of minimal living cells: primitive cell models and semi-synthetic cells
2010-Sep, Systems and synthetic biology
DOI:10.1007/s11693-010-9054-3
PMID:21886680
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研究论文 | 本文总结了2009年ESF合成生物学会议上关于生命最小需求和生物学研究中建设性(合成)方法的概念贡献 | 定义了半合成最小细胞,这些人工制造的基于囊泡的系统由最少数量的基因、蛋白质和生物大分子组成,并可被定义为活的 | NA | 探讨生命最小需求和生物学研究中的合成方法 | 最小生命细胞模型和半合成细胞 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
10 | 2024-08-07 |
Computer-aided design of biological circuits using TinkerCell
2010 Jul-Aug, Bioengineered bugs
DOI:10.4161/bbug.1.4.12506
PMID:21327060
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研究论文 | 本文介绍了一种用于合成生物学中生物电路设计的计算机辅助设计工具TinkerCell | TinkerCell是一个灵活且可扩展的应用程序,能够适应合成生物学领域中的变化 | 由于合成生物学网络的建模和构建最佳实践尚未确立,TinkerCell的设计需要不断调整 | 开发一种有效的计算机辅助设计工具,用于合成生物学中的生物网络设计、分析和构建 | 合成生物学中的生物网络设计 | 合成生物学 | NA | 计算机辅助设计 (CAD) | NA | 生物网络 | NA |
11 | 2024-08-07 |
Synthetic biology and the ethics of knowledge
2010-Nov, Journal of medical ethics
IF:3.3Q1
DOI:10.1136/jme.2010.038232
PMID:20935316
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research paper | 本文探讨了合成生物学在伦理学上的重要性和潜在的滥用风险 | 提出合成生物学知识可能被滥用的风险,特别是在生物恐怖主义或战争中 | 未具体讨论合成生物学技术的实际应用和具体伦理问题 | 探讨合成生物学对生物伦理学家提出的要求 | 合成生物学及其伦理问题 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
12 | 2024-08-07 |
Design and analysis of synthetic carbon fixation pathways
2010-May-11, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.0907176107
PMID:20410460
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研究论文 | 研究通过计算方法设计并分析了合成碳固定途径,以提高碳固定效率 | 提出了新的合成碳固定途径,这些途径在动力学速率上可能比自然途径有显著优势 | 实施这些合成途径面临表达水平、活性、稳定性、定位和调控等挑战 | 旨在通过代谢工程和合成生物学提高食物和可再生燃料生产的可持续性 | 碳固定途径及其效率 | NA | NA | 计算方法 | NA | NA | 约5000种已知在自然界中存在的代谢酶 |
13 | 2024-08-07 |
The resurrection of life
2010-Apr, Origins of life and evolution of the biosphere : the journal of the International Society for the Study of the Origin of Life
DOI:10.1007/s11084-010-9197-y
PMID:20195774
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研究论文 | 本文重新探讨了生命本质的问题,并反驳了生命问题在生物学中无立足之地的观点 | 提出生命问题不应被排除在生物学之外,并指出生命问题的本质已从寻找生命原则转变为描述历史过程 | NA | 探讨生命本质问题在生物学中的地位和意义 | 生命本质及其在生物学中的地位 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |