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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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1 | 2024-11-02 |
Variation in tropical reef symbiont metagenomes defined by secondary metabolism
2011-Mar-22, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0017897
PMID:21445351
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研究论文 | 研究了热带珊瑚礁共生体中次生代谢的基因组和化学多样性 | 发现了次生代谢基因簇在相同基因组位置上的随机存在或缺失,并观察到导致新化学物质的离散突变 | 研究对象仅限于Prochloron didemni这一种共生蓝藻 | 探讨次生代谢在生物学、药物开发和合成生物学中的复杂进化 | 24株未培养的Prochloron didemni蓝藻及其宿主热带海鞘 | 合成生物学 | NA | 基因组比较分析 | NA | 基因组数据 | 24株Prochloron didemni蓝藻 |
2 | 2024-08-07 |
Synonymous but not the same: the causes and consequences of codon bias
2011-Jan, Nature reviews. Genetics
DOI:10.1038/nrg2899
PMID:21102527
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研究论文 | 本文探讨了同义突变对细胞过程的影响及其在分子进化和生物技术领域的重要性 | 利用最新的测序和合成生物学技术,揭示了关于密码子偏倚的新模式,并提出了关于蛋白质合成的新假设 | NA | 理解密码子偏倚及其在自然同义变异和应用背景下的转基因设计中的作用 | 同义突变和密码子偏倚 | 分子进化 | NA | 测序技术,合成生物学 | NA | NA | NA |
3 | 2024-08-07 |
Programming microbial population dynamics by engineered cell-cell communication
2011-Jul, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.201100132
PMID:21681967
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review | 本文综述了通过工程化细胞间通信来编程微生物种群动态的最新进展 | 探讨了从单一物种到多物种、从单向到双向通信的工程化微生物生态系统中的细胞间通信 | NA | 旨在通过工程化基因电路编程细胞行为,特别是种群层面的细胞行为 | 工程化细胞间通信在微生物种群动态中的应用 | synthetic biology | NA | NA | NA | NA | NA |
4 | 2024-08-07 |
Complex function by design using spatially pre-structured synthetic microbial communities: degradation of pentachlorophenol in the presence of Hg(ii)
2011-Feb, Integrative biology : quantitative biosciences from nano to macro
IF:1.5Q4
DOI:10.1039/c0ib00019a
PMID:20717565
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研究论文 | 本文通过微流控层流技术构建了一种具有空间结构的合成微生物群落,以实现对五氯苯酚(PCP)和汞离子(Hg(ii))的共同降解。 | 利用空间结构设计合成微生物群落,保护对汞敏感的PCP降解菌,使其能在汞存在下有效降解PCP。 | 文章未提及具体的局限性。 | 研究空间结构在合成微生物群落中实现多重功能的作用。 | 五氯苯酚(PCP)和汞离子(Hg(ii))的降解。 | NA | NA | 微流控层流技术 | NA | 微生物群落 | 使用了Sphingobium chlorophenolicum和Ralstonia metallidurans两种微生物 |
5 | 2024-08-07 |
Targeted plasmid integration into the human genome by an engineered zinc-finger recombinase
2011-Sep-01, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkr421
PMID:21653554
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研究论文 | 本文介绍了一种利用工程化的锌指重组酶(ZFR)将质粒DNA特异性地整合到人类基因组中的新方法 | 开发了一种两步法,利用ZFR在人类和小鼠细胞系的随机分布目标位点上进行质粒DNA的特异性整合 | NA | 克服传统遗传工程策略的局限性,开发新的基因添加方法 | 人类和小鼠细胞系的基因组 | 基因工程 | NA | 锌指重组酶(ZFR) | NA | DNA | 人类和小鼠细胞系 |
6 | 2024-08-07 |
The ten grand challenges of synthetic life
2011-Jun, Systems and synthetic biology
DOI:10.1007/s11693-011-9084-5
PMID:21949672
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research paper | 本文探讨了合成生物学时代构建人工生命的十大科学挑战 | 文章提出了构建第一个人工细胞的现实可能性,并探讨了其广泛的应用前景 | 文章指出,实现人工细胞的目标面临几个主要问题 | 探讨合成生物学中构建人工生命的挑战 | 人工细胞的构建及其应用 | 合成生物学 | NA | DNA合成 | NA | NA | NA |
7 | 2024-08-07 |
Emerging biomedical applications of synthetic biology
2011-Nov-29, Nature reviews. Genetics
DOI:10.1038/nrg3094
PMID:22124480
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综述 | 本文综述了合成生物学在生物医学应用中的影响和潜力 | 合成生物学通过创建具有新颖和有用功能的设备、系统和生物体,为理解疾病机制、提供新型诊断工具、实现药物的经济生产以及设计针对癌症、免疫疾病和代谢紊乱等多种疾病的新治疗策略做出了贡献 | NA | 探讨合成生物学在生物医学领域的应用及其潜力 | 合成生物学在疾病机制理解、诊断工具开发、药物生产和治疗策略设计中的应用 | NA | 癌症、免疫疾病、代谢紊乱(如糖尿病和痛风)以及多种传染病 | 合成生物学 | NA | NA | NA |
8 | 2024-08-07 |
Synthetic biology: an emerging research field in China
2011 Nov-Dec, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2011.06.008
PMID:21729747
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综述 | 本文综述了中国在合成生物学及其不同子领域的研究活动,包括遗传电路、最小基因组、化学合成生物学、原细胞和DNA合成等 | 合成生物学被认为是一个新兴的研究领域,将为生物技术带来新的机遇 | 合成生物学在中国仍处于早期发展阶段 | 探讨合成生物学在中国的研究现状及其未来发展潜力 | 遗传电路、最小基因组、化学合成生物学、原细胞和DNA合成等 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 文献综述和个人交流 | NA |
9 | 2024-08-07 |
Chemistry of nucleic acids: impacts in multiple fields
2011-Jul-07, Chemical communications (Cambridge, England)
DOI:10.1039/c1cc11021g
PMID:21483917
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review | 本文综述了过去十年中核酸研究在多个科学和技术领域的重要进展,特别强调了化学在这些发展中的作用和影响。 | NA | NA | 探讨化学在核酸研究中的影响及其在生物学、化学、生物技术、合成生物学、纳米结构和光学材料等领域的发展。 | DNA和RNA研究 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
10 | 2024-08-07 |
Microfluidic technologies for synthetic biology
2011, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms12063576
PMID:21747695
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综述 | 本文综述了微流控技术在合成生物学中的最新应用,强调其在基因表达/调控动态分析、代谢物的高灵敏度芯片内外检测以及全细胞分析中的潜力 | 微流控技术能够提供前所未有的手段,加速合成生物学的发展,特别是在高分辨率动态基因表达/调控分析和代谢物的高灵敏度检测方面 | NA | 探讨微流控技术如何加速合成生物学的发展,并提供新的生物部件和系统 | 微流控技术在合成生物学中的应用,包括基因表达/调控的动态分析、代谢物的检测和全细胞分析 | 合成生物学 | NA | 微流控技术 | NA | 生物和生化样本 | NA |
11 | 2024-08-07 |
Formation of droplet networks that function in aqueous environments
2011-Nov-06, Nature nanotechnology
IF:38.1Q1
DOI:10.1038/nnano.2011.183
PMID:22056724
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研究论文 | 本文介绍了在油中包裹水滴并通过界面双层连接形成的多体结构,这些结构能够在水环境中模拟简单组织并进行生物物理测量。 | 首次在生理环境中使用多体结构,通过改变周围溶液的pH或温度来释放水滴中的内容物。 | 目前尚未在生理环境中广泛应用。 | 开发一种新的生物物理测量技术,模拟组织结构并应用于合成生物学和医学。 | 水滴网络及其在生物物理测量和组织模拟中的应用。 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
12 | 2024-08-07 |
Automatic compilation from high-level biologically-oriented programming language to genetic regulatory networks
2011, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0022490
PMID:21850228
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研究论文 | 本文介绍了一种平台,该平台允许合成生物学家使用一种方便的高级生物导向编程语言Proto来表达所需行为,并通过基于调控基序的机制将其编译为基因网络,进行优化并转换为计算模拟以进行数值验证 | 本文的创新点在于提供了一个自动化设计复杂合成生物系统的平台,通过编译器优化可以显著减少基因数量和优化后的工程基因网络的延迟 | NA | 解决DNA合成与电路设计能力之间的差距 | 合成生物系统的自动化设计 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
13 | 2024-08-07 |
Production and single-step purification of EGFP and a biotinylated version of the Human Rhinovirus 14 3C protease
2011-Oct, Protein expression and purification
IF:1.4Q4
DOI:10.1016/j.pep.2011.05.003
PMID:21605680
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研究论文 | 本文介绍了一种一步法从谷胱甘肽-S-转移酶(GST)融合蛋白中分离增强绿色荧光蛋白(EGFP)的方法,并展示了使用我们构建的生物素化人鼻病毒14型3C蛋白酶从融合蛋白中释放EGFP蛋白的过程。 | 提出了一种单步法从GST融合蛋白中分离EGFP的新方法,并构建了生物素化的人鼻病毒14型3C蛋白酶用于释放EGFP。 | NA | 开发一种有效的方法来分离和纯化EGFP蛋白,并探索生物素化蛋白酶在生物纳米技术和合成生物学中的潜在应用。 | 增强绿色荧光蛋白(EGFP)和生物素化的人鼻病毒14型3C蛋白酶。 | 生物技术 | NA | 融合蛋白分离技术 | NA | 蛋白质 | NA |
14 | 2024-08-07 |
A modular cloning system for standardized assembly of multigene constructs
2011-Feb-18, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0016765
PMID:21364738
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研究论文 | 本文介绍了一种分级的模块化克隆系统,用于高效构建任何预定义排列的多基因构建体 | 该系统基于IIS型限制酶的能力,能够以定义的线性顺序组装多个DNA片段,实现了从验证的基本模块库中高效创建任何真核多基因构建体 | NA | 旨在通过设计具有新颖表型的生物体来革新生物技术领域 | 多基因构建体的标准化组装 | 合成生物学 | NA | 模块化克隆(MoClo) | NA | DNA | 构建了一个包含11个转录单元的33 kb DNA分子,由44个独立的基本模块组成 |
15 | 2024-08-07 |
GoldenBraid: an iterative cloning system for standardized assembly of reusable genetic modules
2011, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0021622
PMID:21750718
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研究论文 | 本文介绍了一种名为GoldenBraid的标准化组装系统,该系统基于IIS型限制酶,允许无限增长的可重复使用基因模块的构建。 | GoldenBraid系统通过IIS型限制酶的相对位置引入双环(“编织”)拓扑结构,实现了复合部件的无限增长和迭代组装步骤。 | NA | 提出GoldenBraid作为植物合成生物学的组装标准。 | GoldenBraid系统的标准化组装方法及其在植物合成生物学中的应用。 | 合成生物学 | NA | IIS型限制酶 | NA | DNA | 涉及多个基因模块和19个基本部件 |
16 | 2024-08-07 |
The bacterial nanorecorder: engineering E. coli to function as a chemical recording device
2011, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0027559
PMID:22132112
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研究论文 | 本文介绍了一种利用合成生物学技术,通过合成化学敏感的遗传开关激活荧光蛋白指示器和细胞分裂抑制剂,创造出一种新型的大肠杆菌菌株,该菌株可作为高度特异、简单且廉价的化学记录设备 | 开发了一种新型的大肠杆菌菌株,能够作为生物“纳米记录器”,用于确定化学暴露事件的类型和时间 | NA | 展示通过简易修改现有遗传开关,可以生成一种基于生物的“纳米记录器”,用于检测、响应和记录各种随时间和空间变化的化学刺激 | 大肠杆菌菌株及其在化学记录设备中的应用 | 合成生物学 | NA | 合成遗传构造 | 遗传开关 | 细胞长度 | NA |