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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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21 | 2024-08-07 |
Cartoons on bacterial balloons: scientists' opinion on the popularization of synthetic biology
2014-Dec, Systems and synthetic biology
DOI:10.1007/s11693-014-9155-5
PMID:26396656
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研究论文 | 本文通过研究一组关于合成生物学的漫画,探讨科学家对合成生物学媒体覆盖的看法 | 通过漫画分类和国际调查,评估合成生物学研究群体对科学传播的看法 | 调查样本数量有限,可能影响结果的普遍性 | 了解科学家对合成生物学媒体传播的感知 | 合成生物学研究群体的科学传播看法 | NA | NA | NA | NA | NA | 101份回复 |
22 | 2024-08-07 |
Core concept: Synthetic biology-change, accelerated
2014-Dec-02, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1419688111
PMID:25468948
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
23 | 2024-08-07 |
Effective use of a horizontally-transferred pathway for dichloromethane catabolism requires post-transfer refinement
2014-Nov-24, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.04279
PMID:25418043
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研究论文 | 研究通过实验室进化模拟水平基因转移和精炼过程,展示了引入的二氯甲烷降解途径的有效使用需要细菌宿主发生特定的突变 | 构建了一个携带降解途径和氯离子出口蛋白的合成移动遗传元件,直接促进了在多种Methylobacterium环境分离株中有效降解二氯甲烷 | NA | 探讨水平基因转移后精炼过程的重要性及其在生物修复和合成生物学中的应用 | 水平基因转移后的基因和途径在微生物中的功能及进化精炼 | NA | NA | 实验室进化 | NA | 遗传元件 | 两种自然降解二氯甲烷的菌株及多种Methylobacterium环境分离株 |
24 | 2024-08-07 |
Synthetic biology outside the cell: linking computational tools to cell-free systems
2014, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2014.00066
PMID:25538941
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综述 | 本文探讨了生物化学网络的体内外模型,特别关注可应用于无细胞表达系统构建的工具 | 本文强调了将数学模型与无细胞系统结合的新一代仿生系统的开发 | NA | 探索生物化学网络模型,并应用于无细胞表达系统的构建 | 生物化学网络的体内外模型及无细胞表达系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
25 | 2024-08-07 |
Rule-based design of synthetic transcription factors in eukaryotes
2014-Oct-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/sb400134k
PMID:24933274
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研究论文 | 本文开发了一种用于设计真核细胞中合成转录因子(sTFs)的语法,并将其集成到GenoCAD软件中 | 提出了一个用于设计合成转录因子的语法,并将其应用于GenoCAD软件,以指导用户创建预期的设计转录因子 | NA | 开发一种语法来指导合成转录因子的设计,以实现更可靠、高效和自动化的合成细胞设计 | 合成转录因子(sTFs)的设计 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
26 | 2024-08-07 |
Synthetic biology and metabolic engineering for marine carotenoids: new opportunities and future prospects
2014-Sep-17, Marine drugs
IF:4.9Q1
DOI:10.3390/md12094810
PMID:25233369
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综述 | 本文综述了海洋类胡萝卜素合成途径、酶以及多种海洋类胡萝卜素的修饰方法,并讨论了代谢工程和合成生物学在类胡萝卜素生产中的进展 | NA | NA | 促进海洋类胡萝卜素的应用探索 | 海洋类胡萝卜素及其合成途径和酶 | NA | NA | 代谢工程和合成生物学 | NA | NA | NA |
27 | 2024-08-07 |
Engineering microorganisms based on molecular evolutionary analysis: a succinate production case study
2014-Sep, Evolutionary applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/eva.12186
PMID:25469170
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研究论文 | 本文通过分子进化分析方法,研究了从不同物种中选择合适基因以优化代谢途径的能力,特别是针对琥珀酸生产的研究 | 本文首次探讨了通过分子进化分析来选择不同物种中的基因,以优化代谢工程和合成生物学中的代谢途径 | NA | 研究如何通过分子进化分析选择合适的基因,以优化代谢途径 | 研究对象包括来自糖酵解的九个基因以及参与琥珀酸前体供应的三种基因 | 合成生物学 | NA | 分子进化分析 | NA | 基因数据 | 研究涉及九个基因和三种基因类型 |
28 | 2024-08-07 |
Protein localization analysis of essential genes in prokaryotes
2014-Aug-08, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/srep06001
PMID:25105358
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研究论文 | 本文对27种原核生物中的必需基因进行了全面的蛋白质定位分析 | 首次系统地从蛋白质定位的角度考察了必需基因 | NA | 深入理解必需基因的基本功能,并改进基因必需性预测 | 27种原核生物中的必需基因及其编码的蛋白质定位 | 生物信息学 | NA | 基因本体论(GO)分析 | NA | 基因组数据 | 27种原核生物,包括24种细菌、2种支原体和1种古菌 |
29 | 2024-08-07 |
Computational approaches to metabolic engineering utilizing systems biology and synthetic biology
2014-Aug, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2014.08.005
PMID:25379141
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综述 | 本文综述了利用系统生物学和合成生物学工具进行代谢工程的计算方法 | 文章探讨了利用计算工具进行前瞻性预测设计以实现预期结果的方法,以及通过组合实验工具进行经验性探索和筛选所需特性的替代方法 | NA | 探讨代谢工程中系统生物学和合成生物学的计算工具应用 | 代谢工程中的细胞功能和生物化学应用 | 系统生物学 | NA | 计算工具 | NA | NA | NA |
30 | 2024-08-07 |
Discovery of the lomaiviticin biosynthetic gene cluster in Salinispora pacifica
2014-Jul-08, Tetrahedron
IF:2.1Q2
DOI:10.1016/j.tet.2014.03.009
PMID:25045187
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研究论文 | 本文描述了在Salinispora pacifica菌株中鉴定出负责lomaiviticin生物合成的基因簇 | 通过分子方法和基因组测序鉴定了lomaiviticin生物合成的基因簇,并利用比较基因组学识别了几个不寻常的后修饰事件的候选酶 | NA | 阐明lomaiviticin的生物合成逻辑,并为生物催化合成生物学提供有用的分子工具 | lomaiviticin生物合成的基因簇及其相关酶 | 生物化学 | NA | 基因组测序 | NA | 基因组数据 | 涉及两个菌株DPJ-0016和DPJ-0019 |
31 | 2024-08-07 |
Transient expressions of synthetic biology in plants
2014-Jun, Current opinion in plant biology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.pbi.2014.02.003
PMID:24631883
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研究论文 | 本文探讨了植物中合成生物学瞬时表达方法的最新进展及其在生产大分子复合物和代谢途径分析与调控中的应用 | 瞬时表达方法使得在几天内高效传递和表达多个基因成为可能,并且可以微调载体以实现不同基因的差异表达 | NA | 研究瞬时表达技术在植物合成生物学中的应用 | 植物细胞中的基因表达 | 合成生物学 | NA | 瞬时表达方法 | NA | 基因表达数据 | 多种植物细胞 |
32 | 2024-08-07 |
Bacteriophage-based synthetic biology for the study of infectious diseases
2014-Jun, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2014.05.022
PMID:24997401
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研究论文 | 本文讨论了基于噬菌体的技术及其在研究传染病中的应用 | 提出了新的基因组工程策略,有望加速新型噬菌体疗法、诊断和工具的设计 | NA | 探讨噬菌体技术在传染病研究中的应用 | 噬菌体及其在分子生物学、遗传工程和合成生物学中的应用 | 分子生物学 | 传染病 | 合成生物学 | NA | NA | NA |
33 | 2024-08-07 |
Yeast synthetic biology platform generates novel chemical structures as scaffolds for drug discovery
2014-May-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/sb400177x
PMID:24742115
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research paper | 本文首次报道了使用面包酵母通过组合遗传学方法生成74种新型化合物,这些化合物作为药物发现的支架结构 | 本文引入了一种新的合成生物学方法,通过与目标蛋白质的“共进化”生成新型化合物,这些化合物具有良好的生物活性,且结构复杂性高于合成片段 | NA | 开发一种新的合成生物学平台,用于生成新型化学结构作为药物发现的支架 | 74种新型化合物及其生物活性和结构特性 | 合成生物学 | NA | 组合遗传学方法 | NA | 化合物 | 74种新型化合物 |
34 | 2024-08-07 |
Chimeric antigen receptor therapy for cancer
2014, Annual review of medicine
IF:15.1Q1
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research paper | 本文探讨了嵌合抗原受体(CAR)疗法在癌症治疗中的应用及其发展前景 | 该疗法结合了单克隆抗体的精确靶向特异性和细胞毒性T细胞的强大细胞毒性及长期持久性 | 该领域仍处于起步阶段,需要进一步优化肿瘤靶点和调控细胞及宿主相关因素以支持基因工程细胞在体内的扩增和持久性 | 旨在开发具有可接受短期和长期毒性的新型靶向癌症疗法 | 研究对象包括神经母细胞瘤、慢性淋巴细胞白血病和B细胞淋巴瘤等多种成人和儿童恶性肿瘤 | 细胞免疫学 | 癌症 | 嵌合抗原受体(CAR)疗法 | NA | NA | NA |
35 | 2024-08-07 |
Adaptive imaging cytometry to estimate parameters of gene networks models in systems and synthetic biology
2014, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0107087
PMID:25210731
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研究论文 | 本文介绍了一种名为GenoSIGHT的自适应成像平台,该平台能够在实验过程中实时处理图像并调整实验条件,以提高基因表达数据的重现性和基因网络参数估计的准确性 | 开发了一种自适应成像平台GenoSIGHT,能够在实验过程中实时处理图像并调整实验条件,从而提高实验效率和数据准确性 | 实验的成功与否只能在所有图像处理完成后才能知晓,可能导致时间和资源的浪费 | 开发一种自适应成像平台,以提高系统与合成生物学中基因表达研究的效率和准确性 | 研究对象为酵母细胞中通过半乳糖诱导表达的黄色荧光蛋白Venus | 系统与合成生物学 | NA | 微流控技术 | NA | 图像 | 涉及酵母细胞 |
36 | 2024-08-07 |
Unravelling the Triterpenoid Saponin Biosynthesis of the African Shrub Maesa lanceolata
2014-Oct-08, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1093/mp/ssu110
PMID:25296856
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研究论文 | 本研究通过转录组分析和异源表达技术,揭示了非洲灌木Maesa lanceolata中三萜皂苷生物合成的关键基因及其功能 | 首次鉴定并验证了Maesa lanceolata中三萜皂苷生物合成的三个关键酶基因,并发现CYP87D16的C-16α氧化酶活性在不同植物谱系中独立进化 | NA | 揭示Maesa lanceolata中三萜皂苷的生物合成途径 | Maesa lanceolata中的三萜皂苷生物合成基因 | NA | NA | 转录组分析,异源表达 | NA | 转录组数据 | NA |
37 | 2024-08-07 |
European do-it-yourself (DIY) biology: beyond the hope, hype and horror
2014-Jun, BioEssays : news and reviews in molecular, cellular and developmental biology
IF:3.2Q1
DOI:10.1002/bies.201300149
PMID:24782329
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研究论文 | 本文分析了欧洲业余生物学运动,探讨了其目标、特点及与美国团体的差异 | 探讨了欧洲DIY生物学运动与美国在监管环境和生物艺术方面的差异 | 受到实验室空间和设备的限制,以及基因改造法规的约束 | 研究欧洲业余生物学运动的特点和目标 | 欧洲的DIY生物学团体 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
38 | 2024-08-07 |
Arabidopsis thaliana and Pisum sativum models demonstrate that root colonization is an intrinsic trait of Burkholderia cepacia complex bacteria
2014-Feb, Microbiology (Reading, England)
DOI:10.1099/mic.0.074351-0
PMID:24327425
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研究论文 | 研究了26种不同种类的Burkholderia cepacia复合体(Bcc)细菌在Arabidopsis thaliana和Pisum sativum根部的定殖能力 | 发现Bcc细菌具有固有的根部定殖能力,不受其物种或来源的影响,且其第三染色体复制子不是根部定殖所必需的 | NA | 探究Bcc细菌在不同植物模型中的根部定殖能力及其与物种和来源的关系 | 26种Bcc细菌在Arabidopsis thaliana和Pisum sativum根部的定殖能力 | NA | NA | 扫描电子显微镜和生物发光成像 | NA | 图像 | 26种Bcc细菌 |
39 | 2024-08-07 |
Accelerating genome editing in CHO cells using CRISPR Cas9 and CRISPy, a web-based target finding tool
2014-Aug, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.25233
PMID:24827782
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研究论文 | 本文首次展示了CRISPR Cas9技术在CHO细胞中产生位点特异性基因破坏的有效性,并开发了一个名为CRISPy的生物信息学工具,用于快速识别CHO-K1基因组中的sgRNA靶序列。 | 首次在CHO细胞中验证了CRISPR Cas9技术的有效性,并开发了CRISPy工具,有助于加速CHO细胞的基因编辑和合成生物学研究。 | NA | 提高CHO细胞中复杂药物蛋白的生产质量和产量。 | CHO细胞中的COSMC和FUT8基因。 | 生物技术 | NA | CRISPR Cas9 | NA | 基因组数据 | 8个sgRNAs在CHO细胞中进行了测试。 |
40 | 2024-08-07 |
Multiplex engineering of industrial yeast genomes using CRISPRm
2014, Methods in enzymology
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research paper | 本文介绍了一种高效、无标记、高通量、多重化的基因编辑平台,用于工业酵母菌株的基因组编辑 | 开发了一种基于质粒表达CRISPR/Cas9核酸酶和多个核酶保护的单引导RNA的多重CRISPR(CRISPRm)系统 | NA | 开发适用于工业酵母菌株的高效基因编辑工具 | 工业酵母菌株Saccharomyces cerevisiae | synthetic biology | NA | CRISPR/Cas9 | NA | DNA | NA |