合成生物学相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
1	2024-08-19	Towards the computational design of protein post-translational regulation 2015-Jun-15, Bioorganic & medicinal chemistry IF:3.3Q1 DOI:10.1016/j.bmc.2015.04.056 PMID:25956846	综述	本文综述了蛋白质翻译后修饰（PTMs）的功能确定方法、蛋白质变构控制以及PTM调控的理性设计实例	探讨了利用PTMs进行蛋白质功能调控的未开发潜力，为合成生物学的发展提供了新的机遇	NA	旨在探讨蛋白质翻译后修饰的计算设计	蛋白质翻译后修饰的功能、变构控制及理性设计	生物信息学	NA	NA	NA	NA	NA
2	2024-08-19	Molecular engineering of nonmetallic biosensors for CEST MRI 2015-May-15, ACS chemical biology IF:3.5Q2 DOI:10.1021/cb500923v PMID:25730583	研究论文	本文探讨了利用分子工程和合成生物学开发非金属生物传感器用于化学交换饱和转移（CEST）磁共振成像（MRI）的新方法	引入了一种新的化学交换饱和转移（CEST）对比机制，使得可以合理设计非金属生物传感器用于MRI	NA	开发新的非金属生物传感器，用于监测复杂的生物过程并通过非侵入性成像技术进行MRI	非金属生物传感器的设计与优化	生物技术	NA	化学交换饱和转移（CEST）MRI	NA	生物分子	NA
3	2024-08-07	Synthetic biology approaches to fluorinated polyketides 2015-03-17, Accounts of chemical research IF:16.4Q1 DOI:10.1021/ar500415c PMID:25719427	研究论文	本文通过合成生物学方法开发新的氟化学，以扩大生物合成可及的有机氟化物多样性	利用合成生物学方法，通过工程化生物合成机制将氟化构建块选择性引入复杂天然产物中，以扩展生物合成有机氟化物的多样性	生物系统中氟化学的范围有限，已识别的有机氟天然产物不到20种	开发新的氟化学方法，以扩展生物合成有机氟化物的多样性	研究酶活性位点和代谢途径如何进化以管理和选择氟化化合物，并设计工程化的有机氟酶、途径和宿主	合成生物学	NA	合成生物学方法	NA	NA	研究了土壤微生物Streptomyces cattleya，一种已知的有机氟生物合成天然宿主
4	2024-08-07	Direct Analysis of Gene Synthesis Reactions Using Solid-State Nanopores 2015-Dec-22, ACS nano IF:15.8Q1 DOI:10.1021/acsnano.5b05782 PMID:26580227	研究论文	本文利用固态纳米孔技术对基因合成反应中的分子进行分类，区分正确和错误的组装	提出了一种新的方法，通过固态纳米孔技术实时监测基因合成反应，提高了复杂性和降低了成本	NA	探索和优化基因合成反应，提高其效率和降低成本	基因合成反应中的分子分类	DNA纳米技术	NA	固态纳米孔技术	NA	分子	NA
5	2024-08-07	DNA Assembly in 3D Printed Fluidics 2015, PloS one IF:2.9Q1 DOI:10.1371/journal.pone.0143636 PMID:26716448	研究论文	本文展示了在3D打印流体设备中进行Golden Gate DNA组装的过程	利用3D打印技术制造微流控设备，降低了成本并提高了制造速度	3D打印微流控设备的操作可能需要专业知识	探索3D打印技术在合成生物学中的应用	3D打印的微流控设备及其在DNA组装中的应用	合成生物学	NA	3D打印	NA	流体设备	反应体积最小为490 nL，通道宽度精细至220微米
6	2024-08-07	The synthetic biology puzzle: a qualitative study on public reflections towards a governance framework 2015-Dec, Systems and synthetic biology DOI:10.1007/s11693-015-9182-x PMID:28392848	研究论文	本研究通过奥地利和德国公民的焦点小组研究，探讨了公众对合成生物学的辩论，并将分析的公众观点与政策报告和先前关于公众参与的实证研究内容相结合	本研究首次通过焦点小组研究深入探讨了公众对合成生物学的看法，并将其与政策报告和先前的研究内容相结合	研究仅限于奥地利和德国的公民，可能无法代表全球公众的观点	探索公众对合成生物学的辩论，并将其与政策报告和先前的研究内容相结合	公众对合成生物学的看法	NA	NA	NA	NA	NA	奥地利和德国的公民
7	2024-08-07	Controlling the Cyanobacterial Clock by Synthetically Rewiring Metabolism 2015-Dec-22, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2015.11.031 PMID:26686627	研究论文	本文通过合成生物学方法使蓝细菌能够在异源糖上生长，从而独立于光照和黑暗操纵代谢，研究代谢与生物钟的关系	本文首次证明代谢活动，无论其来源如何，是蓝细菌生物钟的主要驱动因素	NA	探讨代谢信号是否是影响生物钟的主要因素	蓝细菌的生物钟与代谢	合成生物学	NA	合成生物学	NA	NA	NA
8	2024-08-07	The Biosynthetic Pathways of Tanshinones and Phenolic Acids in Salvia miltiorrhiza 2015-Sep-08, Molecules (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/molecules200916235 PMID:26370949	综述	本文综述了丹参中丹参酮和酚酸的生物合成途径及其在合成生物学和代谢工程中的应用	系统总结了丹参酮和酚酸生物合成途径的最新进展，并探讨了这些途径在合成生物学和代谢工程中的应用	NA	旨在阐明丹参中丹参酮和酚酸的生物合成途径，并探讨这些途径在合成生物学和代谢工程中的应用	丹参中的丹参酮和酚酸的生物合成途径及其相关基因	NA	心血管疾病	高通量测序	NA	基因	NA
9	2024-08-07	A Delicate Nanoscale Motor Made by Nature-The Bacterial Flagellar Motor 2015-Sep, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.201500129 PMID:27980978	研究论文	本文研究了细菌鞭毛马达（BFM），一种直径约45纳米的分子复合体，它使几乎所有细菌能够游泳	BFM是进化的顶峰，为合成生物学新时代的纳米技术设计提供了信息和灵感	NA	研究细菌鞭毛马达的结构和功能	细菌鞭毛马达	NA	NA	NA	NA	NA	NA
10	2024-08-07	Towards self-assembled hybrid artificial cells: novel bottom-up approaches to functional synthetic membranes 2015-Sep-01, Chemistry (Weinheim an der Bergstrasse, Germany) DOI:10.1002/chem.201501229 PMID:26149747	研究论文	本文探讨了利用自下而上的方法开发合成细胞，特别是通过功能化合成膜与生物系统的整合来构建“混合”人工细胞的最新进展和现状	研究通过控制高度有序的膜结构的自组装，精确模拟活细胞的结构和/或功能，为合成生物学提供了新的合成底盘	NA	深入理解生命系统的本质，探索细胞生命的起源，并为合成生物学的发展提供新的合成底盘	混合人工细胞及其合成膜的构建和功能	合成生物学	NA	自组装	NA	膜结构	NA
11	2024-08-07	Synthetic biology for pharmaceutical drug discovery 2015, Drug design, development and therapy DOI:10.2147/DDDT.S58049 PMID:26673570	综述	本文综述了合成生物学在药物发现领域的最新进展	合成生物学通过基因操作微生物合成天然产物衍生物，为药物发现开辟了新的化学空间	文章未提及具体限制	探讨合成生物学在药物发现中的应用及其挑战	合成生物学技术、微生物、药物合成	NA	NA	基因操作	NA	NA	NA
12	2024-08-07	Quantitative and logic modelling of molecular and gene networks 2015-Mar, Nature reviews. Genetics DOI:10.1038/nrg3885 PMID:25645874	研究论文	本文探讨了定量和逻辑建模在分子和基因网络中的应用	提出了混合方法在合成生物学和虚拟生物体开发中的重要性	每种建模方法都有其固有的优势和弱点	旨在完全理解和精确工程化细胞功能	复杂生物分子系统的行为	NA	NA	定量建模和逻辑建模	NA	遗传或分子数据	NA
13	2024-08-07	Design and implementation of a biomolecular concentration tracker 2015-Feb-20, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/sb500024b PMID:24847683	研究论文	本文设计并实现了一种生物分子浓度跟踪器，利用合成蛋白质支架作为模块化和可调的负反馈机制，实现动态蛋白质浓度跟踪。	本文创新性地使用合成蛋白质支架作为模块化和可调的机制，通过负反馈实现生物分子浓度的动态跟踪。	NA	研究目的是开发一种动态和自适应的方法，以确保在活细胞中人工系统的恒定相对活性，不受内在和外在噪声的影响。	研究对象是合成蛋白质支架和其在生物分子浓度跟踪中的应用。	合成生物学	NA	NA	NA	NA	研究在Escherichia coli中进行，具体样本数量未提及。
14	2024-08-07	Sender-receiver systems and applying information theory for quantitative synthetic biology 2015-Feb, Current opinion in biotechnology IF:7.1Q1 DOI:10.1016/j.copbio.2014.08.005 PMID:25282688	研究论文	本文探讨了发送-接收（S-R）系统在生物学中的应用，并利用信息论进行定量分析，特别是在合成生物学领域。	结合信息论和合成生物学，提供了对人工S-R系统的定量控制，并探讨了如何最大化信号传递的鲁棒性。	需要进一步发展更复杂的电路设计，以解释生物学意义。	研究如何通过信息论和合成生物学的结合，推动合成生物学的发展。	自然遗传、酶促和神经网络中的S-R系统。	合成生物学	NA	信息论	NA	NA	NA
15	2024-08-07	Synthetic biology for the directed evolution of protein biocatalysts: navigating sequence space intelligently 2015-Mar-07, Chemical Society reviews IF:40.4Q1 DOI:10.1039/c4cs00351a PMID:25503938	综述	本文综述了利用合成生物学方法进行蛋白质生物催化剂定向进化的策略，重点探讨了如何智能地探索蛋白质序列空间以发现理想的活性和其他特性。	结合设计策略和经典定向进化方法，利用合成生物学技术，通过智能地探索蛋白质序列空间，开发新型高效且稳定的生物催化剂。	蛋白质的可能序列数量巨大，难以逐一测试，需要有效的方法来高效可靠地导航搜索空间。	探讨和开发利用定向进化改善酶特性的方法，特别是在快速时间尺度上超越自然进化的蛋白质改进机会。	蛋白质生物催化剂的序列、结构和功能。	合成生物学	NA	合成生物学技术	NA	蛋白质序列	NA
16	2024-08-07	Streamlined Construction of the Cyanobacterial CO2-Fixing Organelle via Protein Domain Fusions for Use in Plant Synthetic Biology 2015-Sep, The Plant cell DOI:10.1105/tpc.15.00329 PMID:26320224	研究论文	本文通过构建融合蛋白简化了蓝细菌CO2固定器官的组装过程，并探讨了其在植物合成生物学中的应用	通过设计基于蛋白域相互作用的融合蛋白，简化了蓝细菌CO2固定器官的组装过程，减少了遗传负荷	NA	开发一种新的方法来简化蓝细菌CO2固定器官的组装，并探索其在植物合成生物学中的应用	蓝细菌CO2固定器官的组装过程及其在植物合成生物学中的应用	合成生物学	NA	蛋白域融合	NA	NA	NA
17	2024-08-07	Ecological perspectives on synthetic biology: insights from microbial population biology 2015, Frontiers in microbiology IF:4.0Q2 DOI:10.3389/fmicb.2015.00143 PMID:25767468	综述	本文综述了合成生物学领域中微生物群落生物学的生态视角，特别关注了微生物群落的稳定性和持久性问题	强调了在微生物群落设计中结合生态和进化原则的重要性，以及空间结构和生态相互作用对微生物群落持久性的影响	目前的模型实践主要考虑固定化学反应回路的相互作用，忽略了生态背景和进化变化的可能性	探讨如何通过结合生态和进化原则来设计稳定的微生物群落，以实现进化稳定和可持续的系统	微生物群落的稳定性和持久性	合成生物学	NA	NA	NA	NA	NA
18	2024-08-07	Antibacterial Discovery and Development: From Gene to Product and Back 2015, BioMed research international IF:2.6Q3 DOI:10.1155/2015/591349 PMID:26339625	综述	本文综述了从基因到产品的抗菌发现与发展过程，并探讨了如何整合新旧方法以改进微生物产品的筛选、发酵和菌株改良	本文结合了微生物生态学、分析化学、基因组学、分子生物学和合成生物学等领域的进展，为微生物天然产物筛选和开发提供了新的视角	NA	探讨如何整合新旧方法以改进微生物产品的筛选、发酵和菌株改良	Enterococcus faecium, Staphylococcus aureus, Klebsiella species, Clostridium difficile, Acinetobacter baumannii, Pseudomonas aeruginosa, Escherichia coli 等细菌	NA	感染性疾病	基因组学, 分子生物学, 合成生物学	NA	NA	NA
19	2024-08-07	Rationally designed, heterologous S. cerevisiae transcripts expose novel expression determinants 2015, RNA biology IF:3.6Q2 DOI:10.1080/15476286.2015.1071762 PMID:26176266	研究论文	本文通过合成生物学方法，系统地研究了不同转录区域对基因表达的影响，特别是在酵母中对病毒HRSVgp04基因ORF的383个基因变体的理性设计和分析。	发现了转录本中先前未探索区域的新因果效应，以及翻译调控与ORF不同部分折叠强度选择之间的关系。	研究主要集中在5'UTR和ORF下游120个核苷酸内的区域，对更远区域的探索有限。	揭示RNA转录特征与蛋白质表达谱之间的通用因果关系。	病毒HRSVgp04基因ORF的383个基因变体在酵母中的表达。	合成生物学	NA	合成生物学方法	NA	转录本	383个基因变体
20	2024-08-07	Salinity tolerance in plants. Quantitative approach to ion transport starting from halophytes and stepping to genetic and protein engineering for manipulating ion fluxes 2015, Frontiers in plant science IF:4.1Q1 DOI:10.3389/fpls.2015.00873 PMID:26579140	综述	本文从盐生植物和盐敏感植物之间的离子运输差异出发，重点讨论了通过遗传和蛋白质工程操纵离子通量以提高植物耐盐性的方法	本文介绍了通过过表达或敲除离子转运蛋白来改变耐盐性的成功尝试，并探讨了通过单点突变修改离子通道和转运蛋白以及合成生物学方法创建新的调控网络以提高耐盐性的潜在方向	NA	提高植物的耐盐性	植物的离子运输机制和相关蛋白质	NA	NA	遗传和蛋白质工程	NA	离子通量数据	NA