合成生物学相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
21	2024-08-07	Synthetic Peptides as Protein Mimics 2015, Frontiers in bioengineering and biotechnology IF:4.3Q2 DOI:10.3389/fbioe.2015.00211 PMID:26835447	综述	本文综述了使用合成肽作为蛋白质模拟物以调节蛋白质功能和为合成生物学提供构建块的最新进展	合成肽可以精确复制蛋白质片段，并通过多种化学修饰（包括非蛋白质氨基酸的引入和肽骨架的修饰）来扩展其化学和结构多样性，从而提高其蛋白酶稳定性	NA	探索和调节蛋白质功能，通过控制分子间相互作用的干扰	合成肽作为蛋白质模拟物	NA	NA	合成肽技术	NA	NA	NA
22	2024-08-07	Analysis of the leakage of gene repression by an artificial TetR-regulated promoter in cyanobacteria 2015-Sep-19, BMC research notes IF:1.6Q2 DOI:10.1186/s13104-015-1425-0 PMID:26387086	研究论文	研究分析了在蓝细菌中人工TetR调控启动子L09的基因抑制泄漏原因	通过理论模拟DNA呼吸动力学和表面等离子体共振（SPR）生物传感器技术分析DNA-蛋白质相互作用的动态速率常数，揭示了L09启动子泄漏问题的原因	研究仅限于L09启动子与其他点突变启动子（L10、L11、L12）的比较，未涉及其他类型的启动子	识别和分析蓝细菌中人工TetR调控启动子L09的基因抑制泄漏原因	蓝细菌Synechocystis PCC 6803中的TetR调控启动子L09	合成生物学	NA	表面等离子体共振（SPR）生物传感器技术	非线性Peyrard-Bishop-Dauxois介观模型	DNA	涉及L09、L10、L11、L12四个启动子
23	2024-08-07	Transcriptome analysis of 20 taxonomically related benzylisoquinoline alkaloid-producing plants 2015-Sep-18, BMC plant biology IF:4.3Q1 DOI:10.1186/s12870-015-0596-0 PMID:26384972	研究论文	本研究对20种分类相关的苯并异喹啉生物碱生产植物进行了转录组分析	首次对非模式植物中的苯并异喹啉生物碱生物合成基因进行了全面挖掘和功能分析	NA	探索和发现苯并异喹啉生物碱代谢中的功能同源物和全新催化剂	20种分类相关的苯并异喹啉生物碱生产植物	植物生物化学	NA	转录组测序	NA	RNA	20种植物样本
24	2024-08-07	Xylonucleic acid: synthesis, structure, and orthogonal pairing properties 2015-Sep-03, Nucleic acids research IF:16.6Q1 DOI:10.1093/nar/gkv719 PMID:26175047	研究论文	本文首次报道了含有木糖（一种可能的原始木糖）的木糖核酸（XyloNA）的合成及其寡核苷酸的组装，并通过热UV熔解、圆二色谱和溶液态NMR光谱研究了其配对和结构特性。	XyloNA被证明是一种正交自配对系统，采用略微右旋的扩展螺旋几何结构，为合成生物学中的应用提供了潜在的正交遗传系统。	尽管XyloNA显示出正交自配对的特性，但其结构-功能（配对）特性相对于DNA/RNA较差，限制了其在原始环境中的信息聚合物选择。	研究木糖核酸（XyloNA）的合成、结构及其在合成生物学和生命起源领域的配对特性。	木糖核酸（XyloNA）及其寡核苷酸的合成与结构特性。	合成生物学	NA	热UV熔解、圆二色谱、溶液态NMR光谱	NA	NA	四个XyloNA核苷酸构建块及其寡核苷酸
25	2024-08-07	Towards a behavioral-matching based compilation of synthetic biology functions 2015-Sep, Acta biotheoretica IF:1.4Q4 DOI:10.1007/s10441-015-9265-9 PMID:26141968	research paper	本文探讨了合成生物学领域中基于行为匹配的编译合成生物学功能的高级语言设计问题	提出了Gubs语言，这是一种用于描述预期行为的规范语言，并通过编译器选择合适的组件以确保合成生物学功能的行为符合编程要求	NA	开发一个在计算机辅助设计环境中用于安全设计可靠新生物功能的工程框架	合成生物学中的高级语言设计	synthetic biology	NA	NA	NA	NA	NA
26	2024-08-07	Jump-starting life? Fundamental aspects of synthetic biology 2015-Aug-31, The Journal of cell biology IF:7.4Q1 DOI:10.1083/jcb.201506125 PMID:26323686	research paper	本文探讨了生命起源的基本问题以及合成生物学与定量科学结合可能提供的新概念和工具	提出合成生物学与定量科学结合可能为生命起源问题提供新的解决方案	NA	探讨生命起源问题	生命的起源及其最小单位——细胞	synthetic biology	NA	NA	NA	NA	NA
27	2024-08-07	Emerging concepts promising new horizons for marine biodiscovery and synthetic biology 2015-May-13, Marine drugs IF:4.9Q1 DOI:10.3390/md13052924 PMID:25984990	综述	本文综述了海洋生物活性肽的发现及其功能潜力，特别是lantibiotics、nanoantibiotics和peptidomimetics等，并探讨了其在细胞间通信中的作用及如何利用这些特性发现新的生物活性	结合生物信息学和合成生物学的最新进展，通过遗传和生化特性分析，为下一代社会解决方案的开发提供潜在途径	NA	探讨海洋生物活性肽的发现及其在生物技术和制药领域的应用潜力	海洋生物活性肽，包括lantibiotics、nanoantibiotics和peptidomimetics等	合成生物学	NA	生物信息学	NA	生物活性化合物	NA
28	2024-08-07	Assembly of RNA nanostructures on supported lipid bilayers 2015-Jan-14, Nanoscale IF:5.8Q1 DOI:10.1039/c4nr05968a PMID:25417592	研究论文	研究在流动脂质双层上自组装RNA构建块形成三维RNA结构的过程	首次探索了利用横向移动的脂质双层在表面控制RNA三维纳米结构形成的方法	NA	研究RNA纳米结构在脂质双层上的自组装过程及其调控机制	RNA纳米结构在流动脂质双层上的自组装	纳米技术	NA	NA	NA	NA	NA
29	2024-08-07	Metaphors in search of a target: the curious case of epigenetics 2015-Apr-03, New genetics and society IF:1.3Q4 DOI:10.1080/14636778.2015.1034849 PMID:26064079	研究论文	本文探讨了在表观遗传学背景下隐喻的产生，通过收集科学和流行写作中的隐喻例子以及对英国两家大报中使用的隐喻进行系统分析	分析了表观遗传学中隐喻的来源域和目标域的不确定性，揭示了科学界和社会对表观遗传学理解的挣扎	难以确定隐喻的目标域，这可能反映了科学界和社会对表观遗传学意义的争议	探讨表观遗传学中隐喻的产生及其在科学和公众沟通中的应用	表观遗传学中的隐喻及其在科学和公众沟通中的使用	NA	NA	NA	NA	文本	涉及两份英国大报中的隐喻使用
30	2024-08-07	Cooperativity to increase Turing pattern space for synthetic biology 2015-Feb-20, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/sb500233u PMID:25122550	研究论文	本文通过建模反应扩散系统，探讨了如何在合成生物学中增加图灵模式的参数空间	研究预测了陡峭的剂量-反应函数（由协同作用产生）对于图灵模式是必要的，这种陡峭性增加了参数空间并减少了激活剂和抑制剂之间差异扩散的需求	本文主要探讨了线性场景在反应扩散系统中的局限性	旨在理解和工程化图灵模式网络，以应用于合成生物学	研究对象为反应扩散系统中的两种形态发生素	合成生物学	NA	反应扩散系统建模	反应扩散模型	参数空间分析	NA
31	2024-08-07	Chassis organism from Corynebacterium glutamicum--a top-down approach to identify and delete irrelevant gene clusters 2015-Feb, Biotechnology journal IF:3.2Q2 DOI:10.1002/biot.201400041 PMID:25139579	研究论文	本研究采用自上而下的方法，从谷氨酸棒杆菌ATCC 13032中构建底盘生物，旨在识别并删除与在定义培养基上快速生长无关的基因簇	研究引入了相关基因的新概念，并展示了构建适用于生物技术应用底盘的一般策略	NA	通过删除无关基因簇，减少谷氨酸棒杆菌的基因组大小，以构建适用于生物技术应用的底盘生物	谷氨酸棒杆菌ATCC 13032的基因簇	合成生物学	NA	基因敲除	NA	基因组数据	41个基因簇，其中36个成功删除，10个基因组减少的菌株显示出生长速率受损
32	2024-08-07	Engineering living functional materials 2015-Jan-16, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/sb500113b PMID:25592034	研究论文	本文提出并验证了通过合成生物学工具，将活细胞与无机组件结合，创造出具有新型功能的'活功能材料'和'活材料合成平台'的概念	本文首次展示了通过合成基因电路在E. coli生物膜中实现化学诱导响应的电开关，并动态组织生物-无机材料，模板化金纳米棒、金纳米线和金属/半导体异质结构，以及合成半导体纳米颗粒	NA	探索通过合成生物学工具创造新型活功能材料和活材料合成平台的可能性	E. coli生物膜与无机材料的结合	合成生物学	NA	合成基因电路	NA	生物膜	NA
33	2024-08-07	When plants produce not enough or at all: metabolic engineering of flavonoids in microbial hosts 2015, Frontiers in plant science IF:4.1Q1 DOI:10.3389/fpls.2015.00007 PMID:25688249	综述	本文综述了通过生物技术生产天然或非天然黄酮类化合物的合理方法，分析了异源生物中农业/医药化合物组合生物合成的意义	利用微生物细胞培养作为生物工厂，通过代谢工程方法强化自然代谢途径，发现新的天然和非天然植物黄酮类化合物的生产方式	NA	探讨通过代谢工程和合成生物学方法优化黄酮类化合物的生产	黄酮类化合物的代谢工程和合成生物学应用	化学生物工程	NA	代谢工程	NA	基因组数据	NA
34	2024-08-07	Chimeric Antigen Receptor- and TCR-Modified T Cells Enter Main Street and Wall Street 2015-Aug-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950) DOI:10.4049/jimmunol.1500751 PMID:26188068	研究论文	本文讨论了嵌合抗原受体（CAR）和T细胞受体（TCR）工程化T细胞在过继细胞转移（ACT）领域的应用及其临床免疫治疗的前景	利用合成生物学、免疫学和遗传工程的进展，生成具有所需特异性和增强功能的工程化T细胞	NA	探讨ACT领域面临的挑战和机遇	工程化T细胞在癌症、慢性感染和自身免疫疾病中的应用	免疫学	白血病，淋巴瘤	遗传工程	NA	NA	临床试验涉及成人和儿童
35	2024-08-07	Implantable synthetic cytokine converter cells with AND-gate logic treat experimental psoriasis 2015-Dec-16, Science translational medicine IF:15.8Q1 DOI:10.1126/scitranslmed.aac4964 PMID:26676608	研究论文	本文设计了一种可植入的合成细胞因子转换器，通过AND门逻辑处理与银屑病相关的TNF和IL22水平，并触发抗炎/银屑病细胞因子IL4和IL10的表达，用于治疗实验性银屑病。	利用合成生物学基因电路，能够自主地将疾病生物标志物的检测与治疗蛋白的生产相结合，为复杂动态疾病如银屑病提供治疗方案。	NA	开发一种基于合成生物学的新型治疗方法，用于治疗银屑病等复杂动态疾病。	银屑病及其相关细胞因子的水平。	合成生物学	银屑病	合成生物学基因电路	AND门逻辑	细胞因子水平	涉及小鼠模型和银屑病患者血液样本
36	2024-08-07	Modulating secretory pathway pH by proton channel co-expression can increase recombinant protein stability in plants 2015-Sep, Biotechnology journal IF:3.2Q2 DOI:10.1002/biot.201500056 PMID:25914077	研究论文	本文研究了通过共表达质子通道调节植物分泌途径的pH值，以提高重组蛋白稳定性的方法	利用流感M2离子通道作为新工具来中和酸性亚细胞区室的pH值，通过共表达异源离子通道来稳定酸敏感蛋白和肽，这是一种提高植物及其他真核表达系统中分泌重组蛋白产量和质量的新方法	NA	探索通过调节植物分泌途径的pH值来提高重组蛋白稳定性的方法	植物中的重组蛋白稳定性	NA	NA	NA	NA	NA	使用烟草植物Nicotiana benthamiana作为实验对象
37	2024-08-07	Boosting riboswitch efficiency by RNA amplification 2015-May-26, Nucleic acids research IF:16.6Q1 DOI:10.1093/nar/gkv165 PMID:25824954	研究论文	本文设计了一种基于RNA扩增的系统，显著提高了核糖开关的效率	通过RNA扩增技术，增强了核糖开关在植物叶绿体中的诱导基因表达能力	NA	提高核糖开关在生物技术中的应用效率	核糖开关在植物叶绿体中的应用	合成生物学	NA	RNA扩增	NA	RNA	NA
38	2024-08-07	A library of synthetic transcription activator-like effector-activated promoters for coordinated orthogonal gene expression in plants 2015-May, The Plant journal : for cell and molecular biology DOI:10.1111/tpj.12843 PMID:25846505	研究论文	构建了一个包含单个设计转录激活因子样效应物（dTALE）结合位点的合成启动子库，并在烟草中进行了瞬时表达测试	开发了一种简单的启动子结构，具有广泛的应用潜力，特别是在植物合成生物学和代谢工程中	NA	展示这些启动子在植物代谢工程中的应用	合成启动子库及其在植物中的基因表达调控	合成生物学	NA	瞬时表达分析	NA	DNA序列	43个启动子在烟草中进行了测试
39	2024-08-07	Strategy of tuning gene expression ratio in prokaryotic cell from perspective of noise and correlation 2015-Jan-21, Journal of theoretical biology IF:1.9Q3 DOI:10.1016/j.jtbi.2014.11.002 PMID:25446713	研究论文	研究在原核细胞中通过调节转录或翻译水平来调整双顺反子操纵子中基因表达噪声和相关性的策略	首次分析了在不同类型启动子驱动下，通过转录终止或改变翻译速率调整基因表达噪声和相关性的效果	NA	探讨操纵子结构与基因网络生物功能之间的关系，并为合成生物学设计提供参考	原核细胞中的基因表达噪声和相关性	生物学	NA	NA	NA	NA	NA
40	2024-08-07	Using Spinach aptamer to correlate mRNA and protein levels in Escherichia coli 2015, Methods in enzymology DOI:10.1016/bs.mie.2014.10.047 PMID:25605386	研究论文	本文探讨了利用Spinach适配体和mRFP1红色荧光蛋白在活细胞成像和流式细胞术中同时测量大肠杆菌中的mRNA和蛋白质水平	引入Spinach适配体作为GFP的RNA模拟物，与mRFP1共同表达，实现mRNA和蛋白质的平行体内测量	NA	开发一种工具，用于合成生物学等领域中启动子和核糖体结合位点的表征	大肠杆菌中的mRNA和蛋白质水平	合成生物学	NA	活细胞成像、流式细胞术	NA	荧光信号	不同构建物中的大肠杆菌细胞