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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2024-08-07 |
Ecological perspectives on synthetic biology: insights from microbial population biology
2015, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2015.00143
PMID:25767468
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综述 | 本文综述了合成生物学领域中微生物群落生物学的生态视角,特别关注了微生物群落的稳定性和持久性问题 | 强调了在微生物群落设计中结合生态和进化原则的重要性,以及空间结构和生态相互作用对微生物群落持久性的影响 | 目前的模型实践主要考虑固定化学反应回路的相互作用,忽略了生态背景和进化变化的可能性 | 探讨如何通过结合生态和进化原则来设计稳定的微生物群落,以实现进化稳定和可持续的系统 | 微生物群落的稳定性和持久性 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 22 | 2024-08-07 |
Antibacterial Discovery and Development: From Gene to Product and Back
2015, BioMed research international
IF:2.6Q3
DOI:10.1155/2015/591349
PMID:26339625
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综述 | 本文综述了从基因到产品的抗菌发现与发展过程,并探讨了如何整合新旧方法以改进微生物产品的筛选、发酵和菌株改良 | 本文结合了微生物生态学、分析化学、基因组学、分子生物学和合成生物学等领域的进展,为微生物天然产物筛选和开发提供了新的视角 | NA | 探讨如何整合新旧方法以改进微生物产品的筛选、发酵和菌株改良 | Enterococcus faecium, Staphylococcus aureus, Klebsiella species, Clostridium difficile, Acinetobacter baumannii, Pseudomonas aeruginosa, Escherichia coli 等细菌 | NA | 感染性疾病 | 基因组学, 分子生物学, 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 23 | 2024-08-07 |
Rationally designed, heterologous S. cerevisiae transcripts expose novel expression determinants
2015, RNA biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1080/15476286.2015.1071762
PMID:26176266
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研究论文 | 本文通过合成生物学方法,系统地研究了不同转录区域对基因表达的影响,特别是在酵母中对病毒HRSVgp04基因ORF的383个基因变体的理性设计和分析。 | 发现了转录本中先前未探索区域的新因果效应,以及翻译调控与ORF不同部分折叠强度选择之间的关系。 | 研究主要集中在5'UTR和ORF下游120个核苷酸内的区域,对更远区域的探索有限。 | 揭示RNA转录特征与蛋白质表达谱之间的通用因果关系。 | 病毒HRSVgp04基因ORF的383个基因变体在酵母中的表达。 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法 | NA | 转录本 | 383个基因变体 | NA | NA | NA | NA |
| 24 | 2024-08-07 |
Salinity tolerance in plants. Quantitative approach to ion transport starting from halophytes and stepping to genetic and protein engineering for manipulating ion fluxes
2015, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2015.00873
PMID:26579140
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综述 | 本文从盐生植物和盐敏感植物之间的离子运输差异出发,重点讨论了通过遗传和蛋白质工程操纵离子通量以提高植物耐盐性的方法 | 本文介绍了通过过表达或敲除离子转运蛋白来改变耐盐性的成功尝试,并探讨了通过单点突变修改离子通道和转运蛋白以及合成生物学方法创建新的调控网络以提高耐盐性的潜在方向 | NA | 提高植物的耐盐性 | 植物的离子运输机制和相关蛋白质 | NA | NA | 遗传和蛋白质工程 | NA | 离子通量数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 25 | 2024-08-07 |
Synthetic Peptides as Protein Mimics
2015, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2015.00211
PMID:26835447
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综述 | 本文综述了使用合成肽作为蛋白质模拟物以调节蛋白质功能和为合成生物学提供构建块的最新进展 | 合成肽可以精确复制蛋白质片段,并通过多种化学修饰(包括非蛋白质氨基酸的引入和肽骨架的修饰)来扩展其化学和结构多样性,从而提高其蛋白酶稳定性 | NA | 探索和调节蛋白质功能,通过控制分子间相互作用的干扰 | 合成肽作为蛋白质模拟物 | NA | NA | 合成肽技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 26 | 2024-08-07 |
Analysis of the leakage of gene repression by an artificial TetR-regulated promoter in cyanobacteria
2015-Sep-19, BMC research notes
IF:1.6Q2
DOI:10.1186/s13104-015-1425-0
PMID:26387086
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研究论文 | 研究分析了在蓝细菌中人工TetR调控启动子L09的基因抑制泄漏原因 | 通过理论模拟DNA呼吸动力学和表面等离子体共振(SPR)生物传感器技术分析DNA-蛋白质相互作用的动态速率常数,揭示了L09启动子泄漏问题的原因 | 研究仅限于L09启动子与其他点突变启动子(L10、L11、L12)的比较,未涉及其他类型的启动子 | 识别和分析蓝细菌中人工TetR调控启动子L09的基因抑制泄漏原因 | 蓝细菌Synechocystis PCC 6803中的TetR调控启动子L09 | 合成生物学 | NA | 表面等离子体共振(SPR)生物传感器技术 | 非线性Peyrard-Bishop-Dauxois介观模型 | DNA | 涉及L09、L10、L11、L12四个启动子 | NA | NA | NA | NA |
| 27 | 2024-08-07 |
Transcriptome analysis of 20 taxonomically related benzylisoquinoline alkaloid-producing plants
2015-Sep-18, BMC plant biology
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12870-015-0596-0
PMID:26384972
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研究论文 | 本研究对20种分类相关的苯并异喹啉生物碱生产植物进行了转录组分析 | 首次对非模式植物中的苯并异喹啉生物碱生物合成基因进行了全面挖掘和功能分析 | NA | 探索和发现苯并异喹啉生物碱代谢中的功能同源物和全新催化剂 | 20种分类相关的苯并异喹啉生物碱生产植物 | 植物生物化学 | NA | 转录组测序 | NA | RNA | 20种植物样本 | NA | NA | NA | NA |
| 28 | 2024-08-07 |
Xylonucleic acid: synthesis, structure, and orthogonal pairing properties
2015-Sep-03, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkv719
PMID:26175047
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研究论文 | 本文首次报道了含有木糖(一种可能的原始木糖)的木糖核酸(XyloNA)的合成及其寡核苷酸的组装,并通过热UV熔解、圆二色谱和溶液态NMR光谱研究了其配对和结构特性。 | XyloNA被证明是一种正交自配对系统,采用略微右旋的扩展螺旋几何结构,为合成生物学中的应用提供了潜在的正交遗传系统。 | 尽管XyloNA显示出正交自配对的特性,但其结构-功能(配对)特性相对于DNA/RNA较差,限制了其在原始环境中的信息聚合物选择。 | 研究木糖核酸(XyloNA)的合成、结构及其在合成生物学和生命起源领域的配对特性。 | 木糖核酸(XyloNA)及其寡核苷酸的合成与结构特性。 | 合成生物学 | NA | 热UV熔解、圆二色谱、溶液态NMR光谱 | NA | NA | 四个XyloNA核苷酸构建块及其寡核苷酸 | NA | NA | NA | NA |
| 29 | 2024-08-07 |
Towards a behavioral-matching based compilation of synthetic biology functions
2015-Sep, Acta biotheoretica
IF:1.4Q4
DOI:10.1007/s10441-015-9265-9
PMID:26141968
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research paper | 本文探讨了合成生物学领域中基于行为匹配的编译合成生物学功能的高级语言设计问题 | 提出了Gubs语言,这是一种用于描述预期行为的规范语言,并通过编译器选择合适的组件以确保合成生物学功能的行为符合编程要求 | NA | 开发一个在计算机辅助设计环境中用于安全设计可靠新生物功能的工程框架 | 合成生物学中的高级语言设计 | synthetic biology | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 30 | 2024-08-07 |
Jump-starting life? Fundamental aspects of synthetic biology
2015-Aug-31, The Journal of cell biology
IF:7.4Q1
DOI:10.1083/jcb.201506125
PMID:26323686
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research paper | 本文探讨了生命起源的基本问题以及合成生物学与定量科学结合可能提供的新概念和工具 | 提出合成生物学与定量科学结合可能为生命起源问题提供新的解决方案 | NA | 探讨生命起源问题 | 生命的起源及其最小单位——细胞 | synthetic biology | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 31 | 2024-08-07 |
Emerging concepts promising new horizons for marine biodiscovery and synthetic biology
2015-May-13, Marine drugs
IF:4.9Q1
DOI:10.3390/md13052924
PMID:25984990
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综述 | 本文综述了海洋生物活性肽的发现及其功能潜力,特别是lantibiotics、nanoantibiotics和peptidomimetics等,并探讨了其在细胞间通信中的作用及如何利用这些特性发现新的生物活性 | 结合生物信息学和合成生物学的最新进展,通过遗传和生化特性分析,为下一代社会解决方案的开发提供潜在途径 | NA | 探讨海洋生物活性肽的发现及其在生物技术和制药领域的应用潜力 | 海洋生物活性肽,包括lantibiotics、nanoantibiotics和peptidomimetics等 | 合成生物学 | NA | 生物信息学 | NA | 生物活性化合物 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 32 | 2024-08-07 |
Assembly of RNA nanostructures on supported lipid bilayers
2015-Jan-14, Nanoscale
IF:5.8Q1
DOI:10.1039/c4nr05968a
PMID:25417592
|
研究论文 | 研究在流动脂质双层上自组装RNA构建块形成三维RNA结构的过程 | 首次探索了利用横向移动的脂质双层在表面控制RNA三维纳米结构形成的方法 | NA | 研究RNA纳米结构在脂质双层上的自组装过程及其调控机制 | RNA纳米结构在流动脂质双层上的自组装 | 纳米技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 33 | 2024-08-07 |
Metaphors in search of a target: the curious case of epigenetics
2015-Apr-03, New genetics and society
IF:1.3Q4
DOI:10.1080/14636778.2015.1034849
PMID:26064079
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研究论文 | 本文探讨了在表观遗传学背景下隐喻的产生,通过收集科学和流行写作中的隐喻例子以及对英国两家大报中使用的隐喻进行系统分析 | 分析了表观遗传学中隐喻的来源域和目标域的不确定性,揭示了科学界和社会对表观遗传学理解的挣扎 | 难以确定隐喻的目标域,这可能反映了科学界和社会对表观遗传学意义的争议 | 探讨表观遗传学中隐喻的产生及其在科学和公众沟通中的应用 | 表观遗传学中的隐喻及其在科学和公众沟通中的使用 | NA | NA | NA | NA | 文本 | 涉及两份英国大报中的隐喻使用 | NA | NA | NA | NA |
| 34 | 2024-08-07 |
Cooperativity to increase Turing pattern space for synthetic biology
2015-Feb-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/sb500233u
PMID:25122550
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研究论文 | 本文通过建模反应扩散系统,探讨了如何在合成生物学中增加图灵模式的参数空间 | 研究预测了陡峭的剂量-反应函数(由协同作用产生)对于图灵模式是必要的,这种陡峭性增加了参数空间并减少了激活剂和抑制剂之间差异扩散的需求 | 本文主要探讨了线性场景在反应扩散系统中的局限性 | 旨在理解和工程化图灵模式网络,以应用于合成生物学 | 研究对象为反应扩散系统中的两种形态发生素 | 合成生物学 | NA | 反应扩散系统建模 | 反应扩散模型 | 参数空间分析 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 35 | 2024-08-07 |
Chassis organism from Corynebacterium glutamicum--a top-down approach to identify and delete irrelevant gene clusters
2015-Feb, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.201400041
PMID:25139579
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研究论文 | 本研究采用自上而下的方法,从谷氨酸棒杆菌ATCC 13032中构建底盘生物,旨在识别并删除与在定义培养基上快速生长无关的基因簇 | 研究引入了相关基因的新概念,并展示了构建适用于生物技术应用底盘的一般策略 | NA | 通过删除无关基因簇,减少谷氨酸棒杆菌的基因组大小,以构建适用于生物技术应用的底盘生物 | 谷氨酸棒杆菌ATCC 13032的基因簇 | 合成生物学 | NA | 基因敲除 | NA | 基因组数据 | 41个基因簇,其中36个成功删除,10个基因组减少的菌株显示出生长速率受损 | NA | NA | NA | NA |
| 36 | 2024-08-07 |
Engineering living functional materials
2015-Jan-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/sb500113b
PMID:25592034
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研究论文 | 本文提出并验证了通过合成生物学工具,将活细胞与无机组件结合,创造出具有新型功能的'活功能材料'和'活材料合成平台'的概念 | 本文首次展示了通过合成基因电路在E. coli生物膜中实现化学诱导响应的电开关,并动态组织生物-无机材料,模板化金纳米棒、金纳米线和金属/半导体异质结构,以及合成半导体纳米颗粒 | NA | 探索通过合成生物学工具创造新型活功能材料和活材料合成平台的可能性 | E. coli生物膜与无机材料的结合 | 合成生物学 | NA | 合成基因电路 | NA | 生物膜 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 37 | 2024-08-07 |
When plants produce not enough or at all: metabolic engineering of flavonoids in microbial hosts
2015, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2015.00007
PMID:25688249
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综述 | 本文综述了通过生物技术生产天然或非天然黄酮类化合物的合理方法,分析了异源生物中农业/医药化合物组合生物合成的意义 | 利用微生物细胞培养作为生物工厂,通过代谢工程方法强化自然代谢途径,发现新的天然和非天然植物黄酮类化合物的生产方式 | NA | 探讨通过代谢工程和合成生物学方法优化黄酮类化合物的生产 | 黄酮类化合物的代谢工程和合成生物学应用 | 化学生物工程 | NA | 代谢工程 | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 38 | 2024-08-07 |
Chimeric Antigen Receptor- and TCR-Modified T Cells Enter Main Street and Wall Street
2015-Aug-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.1500751
PMID:26188068
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研究论文 | 本文讨论了嵌合抗原受体(CAR)和T细胞受体(TCR)工程化T细胞在过继细胞转移(ACT)领域的应用及其临床免疫治疗的前景 | 利用合成生物学、免疫学和遗传工程的进展,生成具有所需特异性和增强功能的工程化T细胞 | NA | 探讨ACT领域面临的挑战和机遇 | 工程化T细胞在癌症、慢性感染和自身免疫疾病中的应用 | 免疫学 | 白血病,淋巴瘤 | 遗传工程 | NA | NA | 临床试验涉及成人和儿童 | NA | NA | NA | NA |
| 39 | 2024-08-07 |
Implantable synthetic cytokine converter cells with AND-gate logic treat experimental psoriasis
2015-Dec-16, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.aac4964
PMID:26676608
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研究论文 | 本文设计了一种可植入的合成细胞因子转换器,通过AND门逻辑处理与银屑病相关的TNF和IL22水平,并触发抗炎/银屑病细胞因子IL4和IL10的表达,用于治疗实验性银屑病。 | 利用合成生物学基因电路,能够自主地将疾病生物标志物的检测与治疗蛋白的生产相结合,为复杂动态疾病如银屑病提供治疗方案。 | NA | 开发一种基于合成生物学的新型治疗方法,用于治疗银屑病等复杂动态疾病。 | 银屑病及其相关细胞因子的水平。 | 合成生物学 | 银屑病 | 合成生物学基因电路 | AND门逻辑 | 细胞因子水平 | 涉及小鼠模型和银屑病患者血液样本 | NA | NA | NA | NA |
| 40 | 2024-08-07 |
Modulating secretory pathway pH by proton channel co-expression can increase recombinant protein stability in plants
2015-Sep, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.201500056
PMID:25914077
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研究论文 | 本文研究了通过共表达质子通道调节植物分泌途径的pH值,以提高重组蛋白稳定性的方法 | 利用流感M2离子通道作为新工具来中和酸性亚细胞区室的pH值,通过共表达异源离子通道来稳定酸敏感蛋白和肽,这是一种提高植物及其他真核表达系统中分泌重组蛋白产量和质量的新方法 | NA | 探索通过调节植物分泌途径的pH值来提高重组蛋白稳定性的方法 | 植物中的重组蛋白稳定性 | NA | NA | NA | NA | NA | 使用烟草植物Nicotiana benthamiana作为实验对象 | NA | NA | NA | NA |