合成生物学相关文章
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当前共找到 73 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2024-12-13 |
Metabolic engineering for the production of plant isoquinoline alkaloids
2016-06, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.12494
PMID:26503307
|
研究论文 | 本文综述了通过代谢工程提高植物异喹啉生物碱（PIA）生产的研究进展 | 利用系统生物学和合成生物学方法，通过代谢工程和异源微生物培养提高PIA的生产 | 目前对PIA代谢途径的了解有限，限制了生产改进的努力 | 提高植物异喹啉生物碱的生产 | 植物异喹啉生物碱及其代谢途径 | 生物化学 | NA | 下一代测序技术，高通量蛋白质组学和代谢组学分析，生物信息学 | NA | 代谢数据 | NA |
| 2 | 2024-12-13 |
Transcript profiling of jasmonate-elicited Taxus cells reveals a β-phenylalanine-CoA ligase
2016-Jan, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.12359
PMID:25899320
|
研究论文 | 研究通过cDNA-AFLP技术分析茉莉酸诱导的紫杉细胞转录组，揭示了与紫杉醇侧链合成相关的β-苯丙氨酸-CoA连接酶基因 | 首次鉴定了与紫杉醇侧链合成相关的TB768基因，并验证了其在紫杉醇生物合成途径中的功能 | 研究主要集中在细胞培养水平，尚未在植物体内验证该基因的功能 | 揭示紫杉醇生物合成途径中未知步骤的相关基因 | 茉莉酸诱导的紫杉细胞及紫杉醇生物合成途径 | 代谢工程 | 癌症 | cDNA-AFLP | NA | 基因表达数据 | 紫杉细胞培养物 |
| 3 | 2024-11-22 |
Systems Metabolic Engineering of Escherichia coli
2016-05, EcoSal Plus
DOI:10.1128/ecosalplus.ESP-0010-2015
PMID:27223822
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综述 | 本文综述了系统代谢工程及其在埃希氏大肠杆菌中的应用 | 系统代谢工程结合了系统生物学、合成生物学和进化工程，使微生物能够系统性地生产超出其天然能力的化学品 | NA | 探讨系统代谢工程在埃希氏大肠杆菌中的策略和应用 | 埃希氏大肠杆菌及其在化学品生产中的应用 | 合成生物学 | NA | 系统代谢工程 | NA | NA | NA |
| 4 | 2024-10-09 |
Synthetic transitions: towards a new synthesis
2016-08-19, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2015.0438
PMID:27431516
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综述 | 本文综述了统计物理学、人工生命、合成生物学和进化机器人学交叉领域的进展 | 提出了将主要进化转变视为物理学中的相变，并探讨了建立自然和人工主要转变理论的一般框架的可能性 | NA | 理解生命进化中的主要创新及其成功条件 | 主要进化转变，包括细胞起源、遗传密码、多细胞性、非遗传信息、语言和意识等 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5 | 2024-10-09 |
Emergence of proto-organisms from bistable stochastic differentiation and adhesion
2016-Apr, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2016.0108
PMID:27053655
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研究论文 | 研究了在有限营养和有毒代谢物环境中，通过随机分化和差异粘附，细胞群如何发展成具有冲突调解机制和复杂内部结构的多细胞聚集体 | 揭示了在简单混合合作者和有形生物体之间存在巨大的生物复杂性潜力 | NA | 探讨早期生命进化中多细胞性的起源 | 多细胞聚集体的形成和内部结构 | 进化生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6 | 2024-10-08 |
A High-Throughput Microfluidic Platform for Mammalian Cell Transfection and Culturing
2016-Mar-31, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/srep23937
PMID:27030663
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研究论文 | 开发了一种高通量微流控平台，用于哺乳动物细胞转染和培养 | 设计了一种微流控芯片，能够以高达99%的效率进行280次独立的细胞转染，并支持共转染和基因电路优化 | 未提及 | 增强哺乳动物合成生物学研究 | 哺乳动物细胞的转染和培养 | 生物工程 | NA | 微流控技术 | NA | 细胞行为和蛋白质表达数据 | 280次独立转染 |
| 7 | 2024-10-04 |
Gas Fermentation-A Flexible Platform for Commercial Scale Production of Low-Carbon-Fuels and Chemicals from Waste and Renewable Feedstocks
2016, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2016.00694
PMID:27242719
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综述 | 本文综述了气体发酵技术在利用废物和可再生原料大规模生产低碳燃料和化学品方面的应用 | 介绍了合成生物学和气体发酵与其他过程耦合的策略，展示了其在扩大商业产品范围和提高效率方面的潜力 | NA | 探讨气体发酵技术在减少全球化石燃料消耗相关排放中的应用 | 气体发酵微生物及其在转化气体碳为燃料和化学品中的作用 | NA | NA | 气体发酵 | NA | NA | NA |
| 8 | 2024-08-07 |
Genome-Editing Technologies: Principles and Applications
2016-Dec-01, Cold Spring Harbor perspectives in biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1101/cshperspect.a023754
PMID:27908936
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综述 | 本文综述了三种基础的基因编辑技术：CRISPR-Cas9、TALENs和ZFNs，并讨论了这些技术的工程进展及其在基因工程中的应用 | 介绍了这些技术在基因治疗和合成生物学中的新应用 | NA | 回顾基因编辑技术的发展及其在人类疾病研究和基因治疗中的应用 | 基因编辑技术及其在生物学和医学中的应用 | 基因编辑 | NA | CRISPR-Cas9, TALENs, ZFNs | NA | NA | NA |
| 9 | 2024-08-07 |
Engineering dynamical control of cell fate switching using synthetic phospho-regulons
2016-11-22, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1610973113
PMID:27821768
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研究论文 | 本文介绍了一种模块化方法，用于灵活地工程化磷酸化电路，通过设计磷酸化调节子（phospho-regulon）来控制细胞命运转换的动态过程 | 开发了一种新的模块化方法，通过磷酸化反馈与下游基于转录的双稳态开关相结合，构建了合成双时间尺度电路 | 目前主要集中在酵母细胞中进行实验，尚未广泛应用于其他类型的细胞 | 探索双时间尺度电路如何控制动态感知的设计原则，并开发新的合成生物学方法 | 细胞命运转换的动态控制 | 合成生物学 | NA | 磷酸化电路工程 | 双时间尺度电路 | NA | 酵母细胞 |
| 10 | 2024-08-07 |
Turing Patterning Using Gene Circuits with Gas-Induced Degradation of Quorum Sensing Molecules
2016, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0153679
PMID:27148743
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研究论文 | 本文研究了在特定基因回路中利用Turing不稳定性和气体诱导的群体感应分子降解来生成图灵模式 | 首次在合成生物学背景下利用Turing不稳定性生成空间模式，并通过调节信号参数控制不稳定波数的范围 | NA | 探索和优化基于熟悉的大肠杆菌启动子的基因表达空间模式 | 特定基因回路中的Turing不稳定性及其在合成和自然基因表达系统中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 11 | 2024-08-07 |
Advanced Multidimensional Separations in Mass Spectrometry: Navigating the Big Data Deluge
2016-Jun-12, Annual review of analytical chemistry (Palo Alto, Calif.)
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研究论文 | 本文描述了基于质谱的多维分离技术作为大数据驱动的技术，并回顾了从大规模数据集中挖掘信息的新兴策略 | 讨论了从不同数据层次比较中获得的独特信息，并总结了新兴的数据可视化策略 | NA | 探讨质谱多维分离技术在科学和医学中的应用及其在大数据处理中的作用 | 质谱多维分离技术及其在数据挖掘和可视化中的应用 | NA | NA | 质谱（MS） | NA | 大规模数据集 | NA |
| 12 | 2024-08-07 |
Design of a hyperstable 60-subunit protein dodecahedron. [corrected]
2016-07-07, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/nature18010
PMID:27309817
|
研究论文 | 本文描述了一种计算设计的25纳米十二面体纳米笼，该纳米笼由三聚体蛋白质构建块自组装而成 | 设计了一种高度稳定且可自组装的蛋白质十二面体结构，具有高度定制化的应用潜力 | NA | 开发新型蛋白质容器，用于靶向药物递送、疫苗设计和合成生物学 | 蛋白质十二面体纳米笼的设计与性能 | 生物技术 | NA | 电子显微镜 | NA | 蛋白质结构 | 60个亚基 |
| 13 | 2024-08-07 |
Quorum Sensing Communication Modules for Microbial Consortia
2016-09-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5b00286
PMID:27172092
|
研究论文 | 本文开发了微生物共生体的通信系统，以促进社区内不同成员之间的复杂社交行为 | 通过修改启动子和蛋白质，设计了两种新的群体感应系统（rpa和tra），并测试了它们与其他系统的交叉对话，发现了几个表现出有用正交性的系统对 | NA | 旨在克服单一微生物遗传改造的限制，通过工程化微生物共生体来实现复杂任务 | 微生物共生体的通信系统及其在复杂任务中的应用 | 合成生物学 | NA | 群体感应 | NA | NA | NA |
| 14 | 2024-08-07 |
FlowCal: A User-Friendly, Open Source Software Tool for Automatically Converting Flow Cytometry Data from Arbitrary to Calibrated Units
2016-07-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5b00284
PMID:27110723
|
研究论文 | 介绍了一种名为FlowCal的用户友好型开源软件工具，用于自动将流式细胞仪数据从任意单位转换为校准单位 | FlowCal提供了一个非专有的工具，可以通过直观的Microsoft Excel界面或可定制的Python脚本运行，自动进行数据校准和生成高质量图表 | 目前大多数研究者报告的数据仍使用任意单位，限制了解释的准确性 | 开发一种工具，以简化流式细胞仪数据的定量分析，并促进标准化荧光单位在合成生物学等领域的应用 | 流式细胞仪数据、校准颗粒、荧光探针和细胞类型 | 生物技术 | NA | 流式细胞术 | NA | 数据文件 | 10种不同的检测器灵敏度设置下的E. coli表达superfolder GFP (sfGFP)测量数据，以及S. cerevisiae Venus表达数据 |
| 15 | 2024-08-07 |
Bioinformatics for the synthetic biology of natural products: integrating across the Design-Build-Test cycle
2016-Aug-27, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/c6np00018e
PMID:27185383
|
综述 | 本文综述了生物信息学工具如何促进合成生物学中设计-构建-测试循环的整合，特别是针对天然产物发现和生产 | 强调了生物信息学工具在设计、构建和测试阶段的整合优势及其互操作性 | 文章未明确提及具体限制 | 探讨生物信息学工具在合成生物学中的应用，特别是在天然产物发现和生产中的整合 | 生物信息学工具在合成生物学设计-构建-测试循环中的应用 | 生物信息学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 16 | 2024-08-07 |
Computational genomic identification and functional reconstitution of plant natural product biosynthetic pathways
2016-Aug-27, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/c6np00035e
PMID:27321668
|
research paper | 本文讨论了四种计算驱动策略在识别植物天然产物生物合成途径中的应用，并展望了合成生物技术在功能重建候选途径中的潜力。 | 开发了四种计算驱动策略来识别植物天然产物生物合成途径，包括物理聚类、共表达、进化共现和表观基因组共调控。 | NA | 探讨如何利用计算方法发现植物生物合成途径，并展望合成生物技术在功能重建候选途径中的应用。 | 植物天然产物生物合成途径 | 生物信息学 | NA | 计算生物学 | NA | 基因组数据 | NA |
| 17 | 2024-08-07 |
Impact of donor-recipient phylogenetic distance on bacterial genome transplantation
2016-09-30, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkw688
PMID:27488189
|
研究论文 | 研究了供体与受体之间的系统发育距离对细菌基因组移植效率的影响 | 首次探讨了不同系统发育距离的细菌物种间基因组移植的效率，并发现了除系统发育距离外的其他物种特异性障碍 | 研究仅限于特定的细菌种类，且未完全阐明影响基因组移植的所有因素 | 探究影响基因组移植效率的细胞因素，以扩展现有的基因组兼容性限制 | Mycoplasma capricolum subsp. capricolum作为受体细胞，以及来自Spiroplasma系统发育组的六种细菌作为供体 | 合成生物学 | NA | 基因组移植 | NA | 基因组数据 | 六种细菌的基因组被移植到Mycoplasma capricolum subsp. capricolum中 |
| 18 | 2024-08-07 |
Mechanically activated artificial cell by using microfluidics
2016-09-09, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/srep32912
PMID:27610921
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研究论文 | 本文通过微流控技术开发了一种新型机械激活人工细胞的方法 | 开发了一种新型微流控装置，能够捕获双乳液滴并进行压缩和吸引，从而实现人工细胞的机械感应 | NA | 通过体外自下而上的重建工程机械敏感人工细胞，理解大分子混合物如何组装和组织成响应力的复杂系统 | 机械敏感人工细胞 | 生物工程 | NA | 微流控技术 | NA | 乳液滴 | NA |
| 19 | 2024-08-07 |
Bringing next-generation diagnostics to the clinic through synthetic biology
2016-09, EMBO molecular medicine
IF:9.0Q1
DOI:10.15252/emmm.201606541
PMID:27402339
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 20 | 2024-08-07 |
Standardization for natural product synthetic biology
2016-Aug-27, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/c6np00030d
PMID:27313083
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研究论文 | 本文讨论了标准化在天然产物合成生物学中的作用，特别是生物合成途径和基因簇数据的标准化，以及标准化在生物合成基因簇工程过程中的作用 | 强调了标准化部件和流程在区分合成生物学与传统遗传工程中的关键作用 | NA | 探讨标准化在天然产物合成生物学中的应用 | 生物合成途径、基因簇数据以及生物合成基因簇工程 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 基因簇数据 | NA |