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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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21 | 2024-08-07 |
A de novo protein confers copper resistance in Escherichia coli
2016-07, Protein science : a publication of the Protein Society
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/pro.2871
PMID:26748884
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研究论文 | 本文通过合成生物学方法设计了一种全新的蛋白质,该蛋白质能够使大肠杆菌在铜浓度较高的环境中生存 | 首次证明生物系统能够利用非自然来源的全新蛋白质来增强在压力环境下的适应性 | NA | 探讨生物系统是否能利用非生物来源的蛋白质来增强在压力环境下的适应性 | 大肠杆菌及一种名为Construct K (ConK)的全新蛋白质 | 合成生物学 | NA | 蛋白质设计 | NA | DNA序列 | 约1.5 × 10(6)个二元模式的新蛋白质编码DNA序列 |
22 | 2024-08-07 |
The fed-batch principle for the molecular biology lab: controlled nutrient diets in ready-made media improve production of recombinant proteins in Escherichia coli
2016-Jun-17, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-016-0513-8
PMID:27317421
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综述 | 本文综述了在分子生物学和生物化学实验室中应用分批补料原理,通过预制的培养基实现对营养物质的控制,从而提高大肠杆菌中重组蛋白产量的最新进展和应用 | 介绍了新的预制生长培养基,通过生物催化释放葡萄糖从聚合物中,为摇瓶和摇板培养提供了一种简单的分批补料解决方案 | NA | 探讨分批补料技术在实验室规模重组蛋白生产中的应用及其对细胞密度和蛋白产量的影响 | 大肠杆菌中的重组蛋白生产 | 分子生物学 | NA | 分批补料技术 | NA | NA | NA |
23 | 2024-08-07 |
ssDNA and the Argonautes: The Quest for the Next Golden Editor
2016-06, Human gene therapy
IF:3.9Q2
DOI:10.1089/hum.2016.071
PMID:27230540
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研究论文 | 本文探讨了基于单链DNA(ssDNA)的Argonaute(NgAgo)在基因编辑中的应用 | NgAgo作为一种新的基因编辑工具,使用24碱基的5'磷酸化ssDNA进行DNA靶向,具有高特异性和潜在的更易获取的基因编辑系统 | NA | 探索和开发新的基因编辑工具 | Argonaute(NgAgo)及其在基因编辑中的应用 | 基因编辑 | NA | 基因编辑技术 | NA | DNA | NA |
24 | 2024-08-07 |
Characterizing Strain Variation in Engineered E. coli Using a Multi-Omics-Based Workflow
2016-05-25, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2016.04.004
PMID:27211860
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研究论文 | 本文介绍了一种整合代谢组学、蛋白质组学和基因组规模模型的流程,用于研究异源途径引入微生物宿主后的影响 | 该流程结合了计算系统生物学、代谢工程和合成生物学的互补方法,提供了宿主微环境因途径工程而变化的分子见解,并展示了如何利用与菌株变异相关的生物机制作为提高产品产量的工程策略 | NA | 理解异源和原生生化途径之间的复杂相互作用 | 研究异源途径引入微生物宿主后的影响 | 代谢工程 | NA | 代谢组学、蛋白质组学 | 基因组规模模型 | 代谢组学数据、蛋白质组学数据 | 分析了八种工程菌株,生产三种生物燃料:异戊二醇、柠檬烯和双环烯 |
25 | 2024-08-07 |
CRISPR-mediated control of the bacterial initiation of replication
2016-05-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkw214
PMID:27036863
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研究论文 | 本文开发了一种基于CRISPR/dCas9结合复制起始位点来控制细菌细胞周期的新系统 | 首次展示了CRISPR/dCas9结合复制起始位点可以精确控制细菌染色体的复制起始,并发现提高温度可以解除这种抑制作用 | NA | 开发一种简单且稳健的方法来控制细菌细胞周期,为合成生物学和DNA复制研究提供工具 | 细菌细胞周期和DNA复制 | 合成生物学 | NA | CRISPR/dCas9 | NA | NA | NA |
26 | 2024-08-07 |
Integrated (Meta) Genomic and Synthetic Biology Approaches to Develop New Biocatalysts
2016-Mar-21, Marine drugs
IF:4.9Q1
DOI:10.3390/md14030062
PMID:27007381
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综述 | 本文综述了利用(元)基因组学和合成生物学方法开发新型生物催化剂的研究进展 | 结合基因组学序列分析和合成分子生物学的发展,加速发现和改进新一代海洋生物催化剂 | NA | 探讨如何利用基因组学和合成生物学技术加速新型海洋生物催化剂的发现和改进 | 海洋环境中的生物活性化合物和生物催化剂 | 生物技术 | NA | 基因组学, 合成生物学 | NA | 序列数据 | NA |
27 | 2024-08-07 |
Smart DNA Fabrication Using Sound Waves: Applying Acoustic Dispensing Technologies to Synthetic Biology
2016-Feb, Journal of laboratory automation
DOI:10.1177/2211068215593754
PMID:26163567
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研究论文 | 本文首次将声波喷射技术应用于合成生物学领域,用于纳米级规模的DNA合成和组装 | 成功将PCR和流行的Golden Gate及Gibson组装方法从微升级别缩小到纳米级别,显著降低了试剂成本 | NA | 探索声波喷射技术在合成生物学中的应用,特别是在DNA合成和组装方面 | 声波喷射技术在DNA合成和组装中的应用 | 合成生物学 | NA | 声波喷射技术 | NA | NA | NA |
28 | 2024-08-07 |
Yeast-based assays for screening 11β-HSD1 inhibitors
2016-Mar-15, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-016-0450-6
PMID:26980090
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研究论文 | 本文介绍了基于酵母细胞的两种筛选11β-HSD1抑制剂的检测方法 | 开发了两种基于酵母细胞的检测方法,用于筛选新的11β-HSD1抑制剂,这些方法成本效益高且易于操作 | NA | 开发新的检测方法以筛选11β-HSD1抑制剂,用于治疗代谢综合征和抗皮肤老化 | 11β-HSD1酶的抑制剂 | NA | 代谢综合征 | 酵母细胞表达系统 | NA | 荧光信号 | NA |
29 | 2024-08-07 |
A synthetic biology-based device prevents liver injury in mice
2016-07, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2016.03.020
PMID:27067456
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研究论文 | 本文介绍了一种基于合成生物学的装置,该装置通过检测血清胆酸水平并产生治疗性肝细胞生长因子,保护小鼠免受药物诱导的急性肝衰竭 | 本文创新性地设计了一个闭环合成信号网络,通过激活外源表达的TGR5与人工启动子控制的肝细胞生长因子转录相连接,实现了对肝损伤相关血清胆酸水平的自我调节和剂量依赖性响应 | NA | 开发一种新的预防、急性及慢性医疗保健的方法 | 小鼠的肝脏损伤 | 合成生物学 | 肝病 | 基因工程 | 合成基因电路 | NA | 小鼠 |
30 | 2024-08-07 |
Introduction to provocative questions in left-right asymmetry
2016-12-19, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2015.0399
PMID:27821529
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研究论文 | 本文探讨了左右不对称现象的多个重要方面,涵盖细胞层面、生理学、遗传学、解剖学和进化生物学等多个领域 | 揭示了先前未被发现的多样性不对称机制,包括可能构成更普遍不对称发展基础的古老手性元素 | NA | 探讨左右不对称现象的机制及其在生物医学、发育、进化和合成生物学中的深远影响 | 从单细胞到无脊椎动物再到人类发育障碍的多种模型系统 | 发育生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
31 | 2024-08-07 |
Recent development on synthetic biological devices treating bladder cancer
2016-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2016.08.001
PMID:29062946
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综述 | 本文综述了合成生物学在膀胱癌治疗领域的最新进展 | 利用合成生物学工具,包括DNA、RNA和蛋白质生物部件,探索癌症研究中的多种问题,如机制阐明、诊断工具创新和治疗新方法的发明 | NA | 推动肿瘤合成生物学的基础研究成果向临床应用转化 | 合成生物学在膀胱癌治疗中的应用 | 生物技术 | 膀胱癌 | 合成生物学 | NA | NA | NA |
32 | 2024-08-07 |
Synthetic biology in China, UK and US
2016-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2016.10.002
PMID:29062945
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
33 | 2024-08-07 |
The Saccharomyces cerevisiae pheromone-response is a metabolically active stationary phase for bio-production
2016-Dec, Metabolic engineering communications
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.meteno.2016.05.001
PMID:29468120
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研究论文 | 研究了酵母菌的交配素反应作为生物生产代谢活跃静止期的潜力 | 首次探讨了交配素反应作为生物生产阶段的适宜性,并展示了其独特的代谢活性 | NA | 探索酵母菌交配素反应作为生物生产阶段的适宜性 | 酵母菌的交配素反应及其代谢特性 | 合成生物学 | NA | 转录组数据分析 | NA | 代谢物通量数据 | NA |
34 | 2024-08-07 |
The cellular Ising model: a framework for phase transitions in multicellular environments
2016-06, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2015.1092
PMID:27307510
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research paper | 本文基于Ising模型引入了一种基因调控网络,该网络能在多细胞环境中诱导相变,从而协调细胞群体的行为 | 设计了由所谓的切换开关与两个群体感应模块Las和Lux接口组成的构建块,展示了信号分子跨细胞膜运输速率变化时,细胞群体从个体切换表型到全局集体表型组织的自发对称性破缺 | NA | 探索多细胞系统中的相变现象及其在合成生物学领域的应用 | 基因调控网络在多细胞环境中的相变行为 | synthetic biology | NA | NA | Ising model | NA | NA |
35 | 2024-08-07 |
Kernel Architecture of the Genetic Circuitry of the Arabidopsis Circadian System
2016-Feb, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1004748
PMID:26828650
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研究论文 | 本文通过机制模拟研究了拟南芥昼夜节律系统的遗传电路核心结构,揭示了其核心反馈环路及其对昼夜节律分子特征的贡献 | 首次揭示了拟南芥昼夜节律系统中至少一半的调控交互作用对于表达野生型植物中观察到的昼夜节律分子特征是必不可少的,并提出了一个核心结构的概念 | NA | 探讨拟南芥昼夜节律系统中基因调控交互作用的重要性及其对昼夜节律维持的影响 | 拟南芥昼夜节律系统的遗传电路核心结构 | 生物学 | NA | 机制模拟 | NA | 分子特征 | NA |
36 | 2024-08-07 |
Environmental Factors Modulating the Stability and Enzymatic Activity of the Petrotoga mobilis Esterase (PmEst)
2016, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0158146
PMID:27351338
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研究论文 | 本研究通过计算机辅助识别和重组生产来自极端嗜热菌Petrotoga mobilis的酯酶PmEst,并使用同步辐射圆二色谱和荧光光谱技术进行生物化学、生物信息学和结构表征,以关联PmEst的稳定性和对不同底物的水解活性 | PmEst在有机溶剂中表现出增强的酶稳定性,这可能使其在合成生物学中具有新的应用 | NA | 研究Petrotoga mobilis酯酶PmEst的稳定性和酶活性,并探索其在工业过程中的应用潜力 | Petrotoga mobilis酯酶PmEst的稳定性和酶活性 | 生物技术 | NA | 同步辐射圆二色谱(SRCD)和荧光光谱 | NA | 光谱数据 | NA |
37 | 2024-08-07 |
Development and Application of a Synthetically-Derived Lead Biosensor Construct for Use in Gram-Negative Bacteria
2016-Dec-18, Sensors (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/s16122174
PMID:27999352
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研究论文 | 本研究利用合成生物学原理开发了一种基于质粒的全细胞细菌生物传感器,用于检测铅污染 | 开发了一种新型的合成来源的铅生物传感器构造,用于检测铅污染 | NA | 开发和应用一种合成来源的铅生物传感器,用于检测环境中的铅污染 | 铅生物传感器及其在检测铅污染中的应用 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | 包括多种实验室和环境分离株 |
38 | 2024-08-07 |
Modular modelling with Physiome standards
2016-12-01, The Journal of physiology
DOI:10.1113/JP272633
PMID:27353233
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research paper | 本文提出了一套基于Physiome标准建模协议CellML的复杂模型设计原则,并通过实例展示了这些原则在构建可扩展和可重用的模型中的应用 | 本文首次提出了一套设计原则,用于指导复杂模型的构建,这些原则使得模型不仅可扩展,而且适合在更大规模的模型中重用 | NA | 旨在为复杂模型的构建提供设计原则,以支持模型的可扩展性和重用性 | 复杂计算模型的设计原则及其在CellML中的应用 | NA | NA | CellML | NA | NA | NA |
39 | 2024-08-07 |
Bacterial genome engineering and synthetic biology: combating pathogens
2016-11-04, BMC microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.1186/s12866-016-0876-3
PMID:27814687
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综述 | 本文综述了细菌基因组工程和合成生物学工具在对抗多药耐药病原菌中的应用 | 介绍了重组工程、CRISPR和细菌细胞间信号传导机制等特定基因组工程和合成生物学方法在病原体靶向中的应用 | NA | 探讨如何利用新兴的细菌基因组工程和合成生物学工具来监测和治疗广泛存在的顽固性细菌感染 | 多药耐药病原菌及其耐药机制 | 合成生物学 | NA | 重组工程、CRISPR | NA | NA | NA |
40 | 2024-08-07 |
Design of nanoscale enzyme complexes based on various scaffolding materials for biomass conversion and immobilization
2016-Nov, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.201600039
PMID:27783468
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综述 | 本文综述了基于蛋白质、微生物和纳米材料的不同支架技术在酶固定化中的应用,以及这些技术对木质纤维素材料生物精炼的影响 | 介绍了智能应用各种支架与纳米尺度工程工具和代谢工程技术结合,可能为研究带来特定优势 | NA | 探讨支架技术在酶固定化和生物精炼领域的应用 | 酶固定化技术及其在生物精炼中的应用 | 生物技术 | NA | 酶固定化技术 | NA | NA | NA |