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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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1 | 2024-08-07 |
Design of a hyperstable 60-subunit protein dodecahedron. [corrected]
2016-07-07, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/nature18010
PMID:27309817
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研究论文 | 本文描述了一种计算设计的25纳米十二面体纳米笼,该纳米笼由三聚体蛋白质构建块自组装而成 | 设计了一种高度稳定且可自组装的蛋白质十二面体结构,具有高度定制化的应用潜力 | NA | 开发新型蛋白质容器,用于靶向药物递送、疫苗设计和合成生物学 | 蛋白质十二面体纳米笼的设计与性能 | 生物技术 | NA | 电子显微镜 | NA | 蛋白质结构 | 60个亚基 |
2 | 2024-08-07 |
FlowCal: A User-Friendly, Open Source Software Tool for Automatically Converting Flow Cytometry Data from Arbitrary to Calibrated Units
2016-07-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5b00284
PMID:27110723
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研究论文 | 介绍了一种名为FlowCal的用户友好型开源软件工具,用于自动将流式细胞仪数据从任意单位转换为校准单位 | FlowCal提供了一个非专有的工具,可以通过直观的Microsoft Excel界面或可定制的Python脚本运行,自动进行数据校准和生成高质量图表 | 目前大多数研究者报告的数据仍使用任意单位,限制了解释的准确性 | 开发一种工具,以简化流式细胞仪数据的定量分析,并促进标准化荧光单位在合成生物学等领域的应用 | 流式细胞仪数据、校准颗粒、荧光探针和细胞类型 | 生物技术 | NA | 流式细胞术 | NA | 数据文件 | 10种不同的检测器灵敏度设置下的E. coli表达superfolder GFP (sfGFP)测量数据,以及S. cerevisiae Venus表达数据 |
3 | 2024-08-07 |
A de novo protein confers copper resistance in Escherichia coli
2016-07, Protein science : a publication of the Protein Society
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/pro.2871
PMID:26748884
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研究论文 | 本文通过合成生物学方法设计了一种全新的蛋白质,该蛋白质能够使大肠杆菌在铜浓度较高的环境中生存 | 首次证明生物系统能够利用非自然来源的全新蛋白质来增强在压力环境下的适应性 | NA | 探讨生物系统是否能利用非生物来源的蛋白质来增强在压力环境下的适应性 | 大肠杆菌及一种名为Construct K (ConK)的全新蛋白质 | 合成生物学 | NA | 蛋白质设计 | NA | DNA序列 | 约1.5 × 10(6)个二元模式的新蛋白质编码DNA序列 |
4 | 2024-08-07 |
A synthetic biology-based device prevents liver injury in mice
2016-07, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2016.03.020
PMID:27067456
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研究论文 | 本文介绍了一种基于合成生物学的装置,该装置通过检测血清胆酸水平并产生治疗性肝细胞生长因子,保护小鼠免受药物诱导的急性肝衰竭 | 本文创新性地设计了一个闭环合成信号网络,通过激活外源表达的TGR5与人工启动子控制的肝细胞生长因子转录相连接,实现了对肝损伤相关血清胆酸水平的自我调节和剂量依赖性响应 | NA | 开发一种新的预防、急性及慢性医疗保健的方法 | 小鼠的肝脏损伤 | 合成生物学 | 肝病 | 基因工程 | 合成基因电路 | NA | 小鼠 |
5 | 2024-08-07 |
A Combinatorial Algorithm for Microbial Consortia Synthetic Design
2016-07-04, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/srep29182
PMID:27373593
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研究论文 | 本文介绍了一种组合算法,用于设计微生物共生体的合成 | 提出了一种新的模型和方法,用于合成生产化合物的外源或内源微生物共生体 | 成功建立最佳共生体以生产特定化合物或其组合仍然是一个挑战 | 解决如何选择最佳共生体以合成生产特定化合物的问题 | 微生物共生体及其在化合物生产中的应用 | 合成生物学 | NA | 组合算法 | 初始模型 | NA | NA |
6 | 2024-08-07 |
Symbiotic Nitrogen Fixation and the Challenges to Its Extension to Nonlegumes
2016-07-01, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/AEM.01055-16
PMID:27084023
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综述 | 本文综述了生物固氮的原理及其在非豆科作物中扩展的挑战和前景 | 提出了利用合成生物学方法扩展生物固氮至更多作物种类的蓝图 | 生物固氮过程目前仅限于细菌和古菌,不适用于真核生物 | 探讨如何通过合成生物学方法将共生固氮扩展到非豆科作物,以减少对氮肥的依赖 | 生物固氮过程及其在农业中的应用 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
7 | 2024-08-07 |
Rapid and Efficient One-Step Metabolic Pathway Integration in E. coli
2016-Jul-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5b00187
PMID:27072506
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研究论文 | 本文介绍了一种基于CRISPR的策略,用于在Escherichia coli中高效、单步整合大型代谢途径 | 该策略允许在广泛的同源臂大小和基因组位置上进行高效率整合,效率范围从70%到100%,并在7个不同位点进行验证 | NA | 加速合成生物学和代谢工程应用 | 在Escherichia coli中快速测试基因和途径的稳定整合方法 | 合成生物学 | NA | CRISPR | NA | 基因组 | 7个不同基因组位点 |
8 | 2024-08-07 |
Multiplexed Targeted Genome Engineering Using a Universal Nuclease-Assisted Vector Integration System
2016-Jul-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6b00056
PMID:27159246
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研究论文 | 本研究开发了一种多重化和通用的核酸酶辅助载体整合系统,用于快速生成基因敲除 | 该系统无需定制靶向载体,降低了基因编辑的成本和时间,并能整合高达50kb的DNA,实现多基因敲除的快速生成和筛选 | NA | 开发一种高效的基因编辑工具,用于哺乳动物基因组工程 | 哺乳动物基因组的基因编辑 | 基因工程 | NA | 核酸酶辅助载体整合 | NA | DNA | NA |