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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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1 | 2024-10-04 |
Engineering Mycorrhizal Symbioses to Alter Plant Metabolism and Improve Crop Health
2017, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2017.01403
PMID:28785256
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综述 | 本文综述了菌根共生如何影响植物代谢并利用这种共生关系改善作物健康 | 本文探讨了利用合成生物学创建具有改进共生能力和潜在新功能的菌根菌株,以改善植物健康 | NA | 探讨菌根共生对植物代谢的影响及其在改善作物健康中的应用 | 菌根共生关系及其对植物代谢和作物健康的影响 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
2 | 2024-08-07 |
Engineering Therapeutic T Cells: From Synthetic Biology to Clinical Trials
2017-Jan-24, Annual review of pathology
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综述 | 本文综述了工程化T细胞疗法在治疗癌症、器官移植和自身免疫疾病中的临床试验现状及面临的挑战 | NA | 工程化T细胞疗法的设计和制造尚未标准化,且主要在学术环境中进行;需要开发可靠的方法来定义剂量和药代动力学 | 探讨工程化T细胞疗法的进一步发展所需的免疫学、合成生物学、制造过程和政府监管方面的进展 | 工程化T细胞疗法在临床应用中的挑战和病理学家在此领域的贡献 | NA | 癌症, 器官移植, 自身免疫疾病 | NA | NA | NA | NA |
3 | 2024-08-07 |
Positive-feedback, ratiometric biosensor expression improves high-throughput metabolite-producer screening efficiency in yeast
2017-Jan, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysw002
PMID:32995501
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研究论文 | 本文介绍了一种基于正反馈和比率型生物传感器的表达系统,用于提高酵母中高吞吐量代谢产物生产者筛选的效率 | 通过工程化正反馈表达转录调节因子及其目标启动子,显著增加了绿色荧光蛋白(GFP)表达对对羟基苯甲酸(PHBA)的动态响应范围,并通过在每个细胞中将GFP荧光与组成型表达的mCherry荧光归一化来控制群体水平上的GFP表达噪声 | NA | 提高酵母细胞中代谢产物生产者的高吞吐量筛选效率 | 酵母细胞中对羟基苯甲酸(PHBA)的生产 | 合成生物学 | NA | 绿色荧光蛋白(GFP)表达 | NA | 荧光 | 混合比例为1:10,000的生产者和非生产者细胞 |
4 | 2024-08-07 |
Chemical reaction networks for computing logarithm
2017-Jan, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysx002
PMID:32995503
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研究论文 | 本文研究如何利用化学反应网络(CRNs)实现对数计算 | 提出了一种新方法,通过调整设计参数,创建能够在CRNs中以少量化学反应准确计算对数的CRNs | CRNs无法精确计算对数,通常需要使用高阶近似,导致反应数量增加 | 研究如何在化学反应网络中实现对数计算 | 化学反应网络(CRNs)和对数计算 | 合成生物学 | NA | 化学反应网络(CRNs) | NA | NA | NA |
5 | 2024-08-07 |
Availability: A Metric for Nucleic Acid Strand Displacement Systems
2017-01-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5b00231
PMID:26875531
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研究论文 | 本文介绍了一种用于量化核酸链置换系统中泄漏影响的指标——可用性和相互可用性 | 提出了可用性和相互可用性的概念,用于分析网络并减少泄漏 | 需要进一步验证这些概念在实际合成生物学应用中的效果 | 量化核酸链置换系统中二级结构对泄漏的影响 | 核酸链置换系统中的泄漏问题 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
6 | 2024-08-07 |
Enzyme engineering: A synthetic biology approach for more effective library generation and automated high-throughput screening
2017, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0171741
PMID:28178357
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研究论文 | 本文通过合成生物学方法,利用Golden Gate策略进行酶工程改造,生成更有效的生物催化剂库并进行自动化高通量筛选 | 本文展示了Golden Gate策略在酶工程中的优势应用,通过定向进化快速生成多样化的生物催化剂库 | NA | 开发一种有效的合成生物学方法,用于生成和筛选生物催化剂库 | Candida antarctica lipase A (Cal-A) 的酶工程改造 | 合成生物学 | NA | Golden Gate策略 | NA | DNA片段 | 三个不同的Candida antarctica lipase A基因片段 |
7 | 2024-08-07 |
Challenges and Advances for Genetic Engineering of Non-model Bacteria and Uses in Consolidated Bioprocessing
2017, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2017.02060
PMID:29123506
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综述 | 本文综述了非模式细菌遗传工程的挑战与进展,以及在整合生物加工中的应用 | 近年来,合成生物学、分子遗传工具开发、组学数据技术应用和计算工具的发展为非模式宿主的系统开发提供了前所未有的进展 | 非模式微生物的遗传操作仍然具有挑战性,因为生物体特定的细微差别阻碍了通用的分子遗传工具和可翻译的细胞内生化途径及调控机制的知识 | 探讨非模式微生物遗传工程的挑战与进展,以及在整合生物加工中的应用 | 非模式微生物的遗传工程及其在生物加工中的应用 | 合成生物学 | NA | CRISPR, 基因组规模代谢模型 | NA | 基因组数据 | NA |
8 | 2024-08-07 |
Novel directions in molecular systems design: The case of light-transducing synthetic cells
2017, Communicative & integrative biology
DOI:10.1080/19420889.2017.1365993
PMID:29260799
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comments | 本文评论了在构建光自养合成细胞方面的首个里程碑,展示了其合成生物学背景、未来步骤及可能实现该成就的实验方法 | 文章介绍了光自养合成细胞的研究进展,特别是光合反应中心在巨型脂质囊泡中的重建 | NA | 研究旨在构建能够从可用能源中产生自身生化能量的光自养合成细胞 | 光自养合成细胞及其在脂质囊泡中的光合反应中心重建 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
9 | 2024-08-07 |
Oligo- and dsDNA-mediated genome editing using a tetA dual selection system in Escherichia coli
2017, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0181501
PMID:28719630
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研究论文 | 本文报道了一种在Escherichia coli中使用优化后的tetA双选择盒进行精确基因编辑的方法 | 该方法能够进行快速且成功的基因工程操作,包括删除、插入、替换和点突变,且无需失活甲基导向错配修复系统或质粒克隆 | NA | 开发一种精确且无缝的基因组编辑技术,用于代谢工程和合成生物学领域 | Escherichia coli的基因组 | 合成生物学 | NA | 基因编辑 | NA | DNA | NA |
10 | 2024-08-07 |
Photoreceptor Mediated Plant Growth Responses: Implications for Photoreceptor Engineering toward Improved Performance in Crops
2017, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2017.01181
PMID:28744290
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研究论文 | 本文总结了光敏受体在作物生长过程中的重要作用,并探讨了通过基因编辑技术改良光敏受体以提高作物性能的潜力 | 提出了通过合成生物学方法设计新型光敏受体以改善作物农艺性状的潜在应用 | NA | 探讨光敏受体工程在提高作物性能中的应用 | 作物中的光敏受体及其对植物生长过程的影响 | NA | NA | 基因编辑技术 | NA | NA | NA |
11 | 2024-08-07 |
Engineering the Bacterial Microcompartment Domain for Molecular Scaffolding Applications
2017, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2017.01441
PMID:28824573
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综述 | 本文综述了细菌微区室壳蛋白的研究进展及其作为定制细胞内支架的潜在应用 | 探讨了利用细菌微区室壳蛋白作为模块化平台,构建多样化、可编程的细胞内结构,以提高代谢途径产量和隔离异源系统 | NA | 探索细菌微区室壳蛋白在细胞内空间组织控制中的应用 | 细菌微区室壳蛋白及其自组装机制 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
12 | 2024-08-07 |
Preparation of Giant Vesicles Encapsulating Microspheres by Centrifugation of a Water-in-oil Emulsion
2017-01-24, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/55282
PMID:28190062
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研究论文 | 本文描述了一种通过水油乳液离心法制备封装微球的大囊泡(GVs)的方法 | 提出了一种简单的水油乳液离心法制备封装微球的大囊泡的方法 | NA | 研究人工细胞的构建方法 | 大囊泡(GVs)封装微球 | 合成生物学 | NA | 水油乳液离心法 | NA | 囊泡 | NA |
13 | 2024-08-07 |
Functional photosystem I maintains proper energy balance during nitrogen depletion in Chlamydomonas reinhardtii, promoting triacylglycerol accumulation
2017, Biotechnology for biofuels
IF:6.1Q2
DOI:10.1186/s13068-017-0774-4
PMID:28413444
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研究论文 | 本文研究了在氮缺乏条件下,Chlamydomonas reinhardtii中功能性光系统I(PSI)如何维持能量平衡并促进三酰甘油(TAG)积累 | 揭示了PSI在调控细胞代谢和脂质/淀粉分配中的核心作用,以及其在氮缺乏条件下维持细胞氧化还原状态的机制 | 研究主要集中在tab2突变体和野生型在氮缺乏条件下的比较,未涉及其他可能的调控因素 | 探讨PSI在氮缺乏条件下对细胞代谢和能量平衡的影响 | Chlamydomonas reinhardtii中的tab2突变体和野生型 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
14 | 2024-08-07 |
Emergent Properties of Giant Vesicles Formed by a Polymerization-Induced Self-Assembly (PISA) Reaction
2017-01-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/srep41534
PMID:28128307
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研究论文 | 本研究展示了通过控制自由基聚合反应,在温和条件下形成巨型聚合物囊泡的方法 | 首次通过聚合诱导自组装(PISA)反应,在温和条件下形成直径大于10微米的巨型聚合物囊泡 | NA | 探索巨型囊泡的形成及其在自然科学和工程领域的应用潜力 | 巨型聚合物囊泡及其自组装过程 | NA | NA | 聚合诱导自组装(PISA) | NA | 图像 | NA |
15 | 2024-08-07 |
A Cas9-based toolkit to program gene expression in Saccharomyces cerevisiae
2017-Jan-09, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkw1023
PMID:27899650
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research paper | 本文利用CRISPR/Cas9技术构建了一个无需克隆的工具包,用于解决代谢工程中常见的障碍,如染色体整合位点选择、启动子选择以及蛋白质定位和溶解性问题 | 该工具包包括23个Cas9-sgRNA质粒、37个不同强度和时间表达特性的启动子以及10种蛋白质定位、降解和溶解性标签,并通过一个基于网络的工具自动化生成用于整合的DNA片段 | NA | 开发一个高效的基因表达编程工具包,用于酵母菌株工程 | 酵母菌株工程中的基因编辑和代谢工程 | synthetic biology | NA | CRISPR/Cas9 | NA | DNA | 23个Cas9-sgRNA质粒、37个启动子、10种蛋白质标签 |
16 | 2024-08-07 |
Development of SyneBrick Vectors As a Synthetic Biology Platform for Gene Expression in Synechococcus elongatus PCC 7942
2017, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2017.00293
PMID:28303150
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研究论文 | 本文开发了SyneBrick载体作为合成生物学平台,用于Synechococcus elongatus PCC 7942中的基因表达。 | SyneBrick载体提供了三种可诱导的表达系统和三个中性位点用于染色体整合,能够有效控制基因表达并加速代谢工程。 | 基因表达在光照下48小时后因aTc降解而减少。 | 开发合成生物学平台,用于蓝细菌中的基因表达和代谢途径重构。 | Synechococcus elongatus PCC 7942作为模型蓝细菌。 | 合成生物学 | NA | 基因表达调控技术 | NA | 基因表达数据 | NA |