合成生物学相关文章
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当前共找到 56 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2024-11-09 |
Glucuronidated Flavonoids in Neurological Protection: Structural Analysis and Approaches for Chemical and Biological Synthesis
2017-Sep-06, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.7b02633
PMID:28789524
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研究论文 | 本文探讨了植物和哺乳动物细胞中葡萄糖醛酸转移酶催化黄酮类等多酚类物质的葡萄糖醛酸化过程，并介绍了葡萄糖醛酸化黄酮类化合物的结构分析和化学生物合成方法 | 本文介绍了葡萄糖醛酸化黄酮类化合物的最新分析和合成方法，包括标准有机合成、半合成、酶合成和利用异源酶在微生物平台生物中的合成生物学方法 | 许多这些化合物在商业上不可获得 | 研究植物提取物如何影响认知健康和心理弹性的机制 | 葡萄糖醛酸化黄酮类化合物及其在神经保护中的作用 | NA | NA | 葡萄糖醛酸转移酶 | NA | NA | NA |
| 2 | 2024-10-04 |
Engineering Mycorrhizal Symbioses to Alter Plant Metabolism and Improve Crop Health
2017, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2017.01403
PMID:28785256
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综述 | 本文综述了菌根共生如何影响植物代谢并利用这种共生关系改善作物健康 | 本文探讨了利用合成生物学创建具有改进共生能力和潜在新功能的菌根菌株，以改善植物健康 | NA | 探讨菌根共生对植物代谢的影响及其在改善作物健康中的应用 | 菌根共生关系及其对植物代谢和作物健康的影响 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3 | 2024-09-27 |
Engineering nucleic acid structures for programmable molecular circuitry and intracellular biocomputation
2017-11, Nature chemistry
IF:19.2Q1
DOI:10.1038/nchem.2852
PMID:29064489
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综述 | 本文综述了DNA/RNA纳米技术在活细胞和体内应用中的现状，并讨论了实现其全部潜力的关键问题 | 本文总结了DNA/RNA纳米技术在活细胞应用中的能力，并提出了如何整合相关新技术以构建基于核酸纳米结构的分子电路 | 本文未具体讨论DNA/RNA纳米技术在实际应用中的局限性 | 探讨DNA/RNA纳米技术在合成生物学中的应用潜力 | DNA/RNA纳米结构及其在活细胞和体内的应用 | 合成生物学 | NA | DNA/RNA纳米技术 | NA | NA | NA |
| 4 | 2024-08-07 |
Reconstitution of a minimal machinery capable of assembling periplasmic type IV pili
2017-06-20, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1618539114
PMID:28588140
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research paper | 研究通过合成生物学方法，在非原生异源宿主中重建了能够组装周质IV型菌毛的最小机制 | 研究展示了八个合成基因足以促进菌毛组装，并发现相应的蛋白质在细胞质膜上形成了一个大分子复合物 | NA | 提高对IV型菌毛组装分子机制的理解 | IV型菌毛及其组装机制 | NA | NA | 合成生物学 | NA | 蛋白质复合物 | NA |
| 5 | 2024-08-07 |
Rational design of inducible CRISPR guide RNAs for de novo assembly of transcriptional programs
2017-Mar-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/ncomms14633
PMID:28256578
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研究论文 | 本文报道了一种模块化和多功能框架，用于在哺乳动物细胞中快速实现可诱导的CRISPR-TRs | 该策略依赖于在单引导RNA（sgRNA）的5'端设计间隔区阻断发夹（SBH）结构，通过替换SBH环与配体控制的RNA切割单元，实现了对静默sgRNA的条件激活 | NA | 开发一种新的方法，用于在哺乳动物细胞中快速实现可诱导的CRISPR-TRs，以促进对天然基因回路的理解和细胞治疗策略的设计 | CRISPR-TRs在哺乳动物细胞中的应用 | 合成生物学 | NA | CRISPR | NA | RNA | NA |
| 6 | 2024-08-07 |
Composing RNA Nanostructures from a Syntax of RNA Structural Modules
2017-11-08, Nano letters
IF:9.6Q1
DOI:10.1021/acs.nanolett.7b03842
PMID:29039189
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研究论文 | 本文通过借鉴语言学的概念，定义了一种扩展的RNA结构模块语法，用于编程RNA链以在热力学和动力学控制下组装成复杂的响应性纳米结构。 | 本文提出了一种新的RNA结构模块语法，用于设计和组装复杂的RNA纳米结构，展示了RNA作为信息媒介在合成生物学、纳米医学和纳米技术中的无限潜力。 | NA | 探索RNA作为信息媒介在设计和组装复杂纳米结构中的应用。 | RNA纳米结构的设计和组装。 | 纳米技术 | NA | NA | NA | RNA结构 | NA |
| 7 | 2024-08-07 |
RNA-aptamers-in-droplets (RAPID) high-throughput screening for secretory phenotypes
2017-08-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-017-00425-7
PMID:28835641
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研究论文 | 本文介绍了一种名为RNA-aptamers-in-droplets（RAPID）的高通量筛选方法，用于检测微生物分泌的高价值化学品 | RAPID方法通过使用适配体将细胞外产物浓度转化为荧光信号，实现了对数百万变异体的高通量筛选 | 目前的高通量测试和筛选速度跟不上基因工程微生物库的生成速度 | 旨在通过高通量筛选技术提高微生物生产高价值化学品的能力 | 基因工程改造的微生物，特别是酿酒酵母 | 合成生物学 | NA | 滴液微流控技术 | NA | 荧光信号 | 数百万变异体 |
| 8 | 2024-08-07 |
RNA Polymerase Tags To Monitor Multidimensional Protein-Protein Interactions Reveal Pharmacological Engagement of Bcl-2 Proteins
2017-08-30, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.7b06152
PMID:28767232
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研究论文 | 本文报道了一种利用分裂RNA聚合酶（RNAP）标签监测活体哺乳动物细胞内多维蛋白质-蛋白质相互作用（PPIs）的新技术 | 该技术通过分裂RNAP标签监测PPIs，提供了多维度和敏感检测，利用核酸扩增和分析技术，改进了其他蛋白质片段互补（PFC）方法 | NA | 开发和验证一种新的监测Bcl-2家族蛋白质多维PPIs的方法 | Bcl-2家族蛋白质及其在细胞凋亡中的调节作用 | 生物技术 | 癌症 | 分裂RNA聚合酶（RNAP）标签 | NA | RNA信号 | 活体哺乳动物细胞 |
| 9 | 2024-08-07 |
Engineering genetic circuit interactions within and between synthetic minimal cells
2017-05, Nature chemistry
IF:19.2Q1
DOI:10.1038/nchem.2644
PMID:28430194
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research paper | 本文研究了如何在合成最小细胞（synells）中通过脂质体封装实现遗传电路和反应级联的模块化控制 | 本文首次展示了通过脂质体封装实现遗传电路和反应级联的模块化控制，并证明了这些级联可以通过外部信号和脂质体间通信进行控制而不会发生串扰 | NA | 研究如何最大化遗传电路和反应级联设计的模块性，以实现不同反应网络的集成及其可扩展性和灵活性的优化 | 遗传电路和反应级联的模块化设计 | 合成生物学 | NA | 脂质体封装 | NA | NA | NA |
| 10 | 2024-08-07 |
Heteroatom-Heteroatom Bond Formation in Natural Product Biosynthesis
2017-Apr-26, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.6b00621
PMID:28375000
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综述 | 本文综述了含有杂原子-杂原子键（X-X，其中X = N, O, S, P）的功能团在天然产物生物合成中的形成机制 | 阐明和表征生成X-X键的生物合成途径，为生物催化与合成生物学提供工具，并指导发现含有这些结构特征的新天然产物 | NA | 探讨含有X-X键的功能团在天然产物中的生物合成逻辑和酶化学 | 含有杂原子-杂原子键的天然产物及其生物合成途径 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 11 | 2024-08-07 |
A systematic comparison of error correction enzymes by next-generation sequencing
2017-Sep-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkx691
PMID:28911123
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研究论文 | 本文通过下一代测序技术对合成DNA中的错误进行量化，并系统比较了六种不同的错误校正酶在11种条件下的效果 | 开发了一种新的实验和计算流程，用于快速、可扩展和可扩展地分析基因组装中的错误，并评估错误校正方法 | NA | 量化合成DNA中的错误并比较不同错误校正酶的效果 | 六种不同的错误校正酶在基因组装中的效果 | 分子生物学 | NA | 下一代测序 | NA | DNA序列 | 11种条件下的模型基因组装 |
| 12 | 2024-08-07 |
Engineering Therapeutic T Cells: From Synthetic Biology to Clinical Trials
2017-Jan-24, Annual review of pathology
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综述 | 本文综述了工程化T细胞疗法在治疗癌症、器官移植和自身免疫疾病中的临床试验现状及面临的挑战 | NA | 工程化T细胞疗法的设计和制造尚未标准化，且主要在学术环境中进行；需要开发可靠的方法来定义剂量和药代动力学 | 探讨工程化T细胞疗法的进一步发展所需的免疫学、合成生物学、制造过程和政府监管方面的进展 | 工程化T细胞疗法在临床应用中的挑战和病理学家在此领域的贡献 | NA | 癌症, 器官移植, 自身免疫疾病 | NA | NA | NA | NA |
| 13 | 2024-08-07 |
Design Automation in Synthetic Biology
2017-Apr-03, Cold Spring Harbor perspectives in biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1101/cshperspect.a023978
PMID:28246188
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综述 | 本文综述了合成生物学中的生物设计自动化（BDA）工具，涵盖设计、构建、测试和学习等领域的软件工具，并详细介绍了这些工具的功能及其在合成遗传调控网络中的应用 | NA | NA | 探讨合成生物学中生物设计自动化工具的应用 | 生物设计自动化工具及其在合成遗传调控网络中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 14 | 2024-08-07 |
Positive-feedback, ratiometric biosensor expression improves high-throughput metabolite-producer screening efficiency in yeast
2017-Jan, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysw002
PMID:32995501
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研究论文 | 本文介绍了一种基于正反馈和比率型生物传感器的表达系统，用于提高酵母中高吞吐量代谢产物生产者筛选的效率 | 通过工程化正反馈表达转录调节因子及其目标启动子，显著增加了绿色荧光蛋白（GFP）表达对对羟基苯甲酸（PHBA）的动态响应范围，并通过在每个细胞中将GFP荧光与组成型表达的mCherry荧光归一化来控制群体水平上的GFP表达噪声 | NA | 提高酵母细胞中代谢产物生产者的高吞吐量筛选效率 | 酵母细胞中对羟基苯甲酸（PHBA）的生产 | 合成生物学 | NA | 绿色荧光蛋白（GFP）表达 | NA | 荧光 | 混合比例为1:10,000的生产者和非生产者细胞 |
| 15 | 2024-08-07 |
Chemical reaction networks for computing logarithm
2017-Jan, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysx002
PMID:32995503
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研究论文 | 本文研究如何利用化学反应网络（CRNs）实现对数计算 | 提出了一种新方法，通过调整设计参数，创建能够在CRNs中以少量化学反应准确计算对数的CRNs | CRNs无法精确计算对数，通常需要使用高阶近似，导致反应数量增加 | 研究如何在化学反应网络中实现对数计算 | 化学反应网络（CRNs）和对数计算 | 合成生物学 | NA | 化学反应网络（CRNs） | NA | NA | NA |
| 16 | 2024-08-07 |
Synthetic enhancer design by in silico compensatory evolution reveals flexibility and constraint in cis-regulation
2017-Nov-29, BMC systems biology
DOI:10.1186/s12918-017-0485-2
PMID:29187214
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研究论文 | 本文通过计算机模拟补偿进化设计合成增强子，揭示了顺式调控中的灵活性和约束 | 利用功能模型和计算机模拟补偿进化生成与自然增强子相似度不同的合成even-skipped stripe 2增强子，展示了增强子功能的多样性和复杂性 | 文章指出，尽管基因调控模型解释了大部分stripe 2增强子的功能，但表达偏离预测的情况表明可能存在未描述的因子调节表达 | 测试已知转录因子和它们之间的相互作用在多大程度上解释了果蝇even-skipped stripe 2增强子的活性 | 果蝇even-skipped stripe 2增强子的合成设计及其功能 | 合成生物学 | NA | 计算机模拟补偿进化 | 功能模型 | 序列数据 | 40个序列 |
| 17 | 2024-08-07 |
Parallel DNA Synthesis on Poly(ethylene terephthalate)
2017-10-05, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.201700321
PMID:28763573
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研究论文 | 本文描述了在氨基化处理的聚对苯二甲酸乙二醇酯（PET）薄片上直接制造DNA阵列的方法 | 使用氨基处理暴露PET薄片上的羟基，这些羟基可用于耦合磷酰胺和启动阵列合成，无需进一步的功能化步骤 | NA | 开发一种灵活且坚固的基质，以提高寡核苷酸合成的通量 | 在PET薄片上直接制造DNA阵列 | 合成生物学 | NA | DNA合成 | NA | NA | NA |
| 18 | 2024-08-07 |
Identification of Novel Growth Regulators in Plant Populations Expressing Random Peptides
2017-Oct, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1104/pp.17.00577
PMID:28807931
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研究论文 | 本文描述了一种结合化学基因组学和合成生物学的方法，通过在大量植物群体中表达随机合成的小肽，筛选出影响植物生长、发育和代谢的新型生长调节因子 | 该研究首次在大量植物群体中合成并筛选出影响植物生物学多个方面的随机小肽，为农业领域引入新一代生长调节剂、除草剂或防御化合物提供了新工具 | 目前研究主要集中在筛选和描述新型小肽对植物生物学的影响，尚未深入探讨这些小肽如何整合到生物化学过程中 | 旨在通过化学基因组学方法识别影响植物生长、发育和代谢的新型小分子 | 在大量植物群体中表达的随机合成小肽 | 合成生物学 | NA | 化学基因组学 | NA | 肽序列 | 超过2000株植物 |
| 19 | 2024-08-07 |
Block V RTX Domain of Adenylate Cyclase from Bordetella pertussis: A Conformationally Dynamic Scaffold for Protein Engineering Applications
2017-09-17, Toxins
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/toxins9090289
PMID:28926974
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综述 | 本文综述了来自百日咳博德特菌的腺苷酸环化酶的Block V RTX肽域在钙结合时可逆折叠成β-卷曲二级结构，并探讨了其构象动态性质在蛋白质工程中的应用 | RTX肽域的构象动态性质被用作切换机制，以介导不同的蛋白质功能和蛋白质-蛋白质相互作用 | NA | 探讨RTX肽域的构象动态性质在蛋白质工程中的应用 | RTX肽域的构象动态性质及其在蛋白质工程中的应用 | 生物工程 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 20 | 2024-08-07 |
Bacterial cell-free expression technology to in vitro systems engineering and optimization
2017-Jun, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2017.07.004
PMID:29062966
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研究论文 | 本文介绍了细菌无细胞表达技术在体外系统工程和优化中的应用 | 本文提出了机器学习实验来优化无细胞蛋白合成系统的蛋白产量，并介绍了使用脂质体作为动态容器合成最小细胞的实验 | NA | 探索无细胞表达系统在生物工程项目中的应用，如无细胞代谢工程、实验的进化设计及合成最小细胞构建 | 无细胞蛋白合成系统及其在合成生物学中的应用 | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白合成系统 | 机器学习 | 蛋白 | NA |