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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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21 | 2024-08-07 |
Enzymatic N- and C-Protection in Cyanobactin RiPP Natural Products
2017-03-01, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.6b12872
PMID:28195477
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研究论文 | 本文利用一种新型双功能酶AgeMTPT保护线性肽的自由N端和C端,通过结合其他模块化生物合成酶,实现了天然产物aeruginosamide B的完全合成和线性蓝细菌肽天然产物的生物合成 | 使用新型双功能酶AgeMTPT保护线性肽的N端和C端,并结合其他生物合成酶进行天然产物的合成 | NA | 探索和定义肽天然产物生物合成的酶机制 | 蓝细菌肽天然产物及其生物合成机制 | 生物化学 | NA | 生物合成酶 | NA | 肽 | NA |
22 | 2024-08-07 |
Availability: A Metric for Nucleic Acid Strand Displacement Systems
2017-01-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5b00231
PMID:26875531
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研究论文 | 本文介绍了一种用于量化核酸链置换系统中泄漏影响的指标——可用性和相互可用性 | 提出了可用性和相互可用性的概念,用于分析网络并减少泄漏 | 需要进一步验证这些概念在实际合成生物学应用中的效果 | 量化核酸链置换系统中二级结构对泄漏的影响 | 核酸链置换系统中的泄漏问题 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
23 | 2024-08-07 |
Enzyme engineering: A synthetic biology approach for more effective library generation and automated high-throughput screening
2017, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0171741
PMID:28178357
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研究论文 | 本文通过合成生物学方法,利用Golden Gate策略进行酶工程改造,生成更有效的生物催化剂库并进行自动化高通量筛选 | 本文展示了Golden Gate策略在酶工程中的优势应用,通过定向进化快速生成多样化的生物催化剂库 | NA | 开发一种有效的合成生物学方法,用于生成和筛选生物催化剂库 | Candida antarctica lipase A (Cal-A) 的酶工程改造 | 合成生物学 | NA | Golden Gate策略 | NA | DNA片段 | 三个不同的Candida antarctica lipase A基因片段 |
24 | 2024-08-07 |
Challenges and Advances for Genetic Engineering of Non-model Bacteria and Uses in Consolidated Bioprocessing
2017, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2017.02060
PMID:29123506
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综述 | 本文综述了非模式细菌遗传工程的挑战与进展,以及在整合生物加工中的应用 | 近年来,合成生物学、分子遗传工具开发、组学数据技术应用和计算工具的发展为非模式宿主的系统开发提供了前所未有的进展 | 非模式微生物的遗传操作仍然具有挑战性,因为生物体特定的细微差别阻碍了通用的分子遗传工具和可翻译的细胞内生化途径及调控机制的知识 | 探讨非模式微生物遗传工程的挑战与进展,以及在整合生物加工中的应用 | 非模式微生物的遗传工程及其在生物加工中的应用 | 合成生物学 | NA | CRISPR, 基因组规模代谢模型 | NA | 基因组数据 | NA |
25 | 2024-08-07 |
Novel directions in molecular systems design: The case of light-transducing synthetic cells
2017, Communicative & integrative biology
DOI:10.1080/19420889.2017.1365993
PMID:29260799
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comments | 本文评论了在构建光自养合成细胞方面的首个里程碑,展示了其合成生物学背景、未来步骤及可能实现该成就的实验方法 | 文章介绍了光自养合成细胞的研究进展,特别是光合反应中心在巨型脂质囊泡中的重建 | NA | 研究旨在构建能够从可用能源中产生自身生化能量的光自养合成细胞 | 光自养合成细胞及其在脂质囊泡中的光合反应中心重建 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
26 | 2024-08-07 |
Synthetic Botany
2017-Jul-05, Cold Spring Harbor perspectives in biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1101/cshperspect.a023887
PMID:28246181
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研究论文 | 本文探讨了利用合成生物学和代谢工程改造植物的潜力与挑战 | 强调了新的基于DNA的植物操作方法和先进的定量成像技术在简化植物模型中的应用 | 植物生长缓慢、生命周期长、需要特殊设施、遗传操作工具不足以及多细胞复杂性等问题限制了进展 | 旨在理解遗传网络、细胞群体和组织层面物理过程在不同尺度上的相互作用,并探索植物性状的理性工程化新方法 | 以植物为研究对象,特别是简化植物模型 | 合成生物学 | NA | DNA操作技术,定量成像技术 | NA | 图像 | 简化植物模型 |
27 | 2024-08-07 |
Cell-free synthetic biology for in vitro prototype engineering
2017-06-15, Biochemical Society transactions
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BST20170011
PMID:28620040
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研究论文 | 本文探讨了无细胞转录-翻译系统在合成生物学中的应用,作为快速原型设计平台 | 开发了新的无细胞系统,旨在解锁难以工程化的微生物宿主,并加速迭代设计周期 | NA | 探索无细胞合成生物学在体外原型工程中的应用 | 无细胞转录-翻译系统及其在合成生物学中的应用 | 合成生物学 | NA | 无细胞转录-翻译 | NA | NA | NA |
28 | 2024-08-07 |
Oligo- and dsDNA-mediated genome editing using a tetA dual selection system in Escherichia coli
2017, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0181501
PMID:28719630
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研究论文 | 本文报道了一种在Escherichia coli中使用优化后的tetA双选择盒进行精确基因编辑的方法 | 该方法能够进行快速且成功的基因工程操作,包括删除、插入、替换和点突变,且无需失活甲基导向错配修复系统或质粒克隆 | NA | 开发一种精确且无缝的基因组编辑技术,用于代谢工程和合成生物学领域 | Escherichia coli的基因组 | 合成生物学 | NA | 基因编辑 | NA | DNA | NA |
29 | 2024-08-07 |
Photoreceptor Mediated Plant Growth Responses: Implications for Photoreceptor Engineering toward Improved Performance in Crops
2017, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2017.01181
PMID:28744290
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研究论文 | 本文总结了光敏受体在作物生长过程中的重要作用,并探讨了通过基因编辑技术改良光敏受体以提高作物性能的潜力 | 提出了通过合成生物学方法设计新型光敏受体以改善作物农艺性状的潜在应用 | NA | 探讨光敏受体工程在提高作物性能中的应用 | 作物中的光敏受体及其对植物生长过程的影响 | NA | NA | 基因编辑技术 | NA | NA | NA |
30 | 2024-08-07 |
Engineering the Bacterial Microcompartment Domain for Molecular Scaffolding Applications
2017, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2017.01441
PMID:28824573
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综述 | 本文综述了细菌微区室壳蛋白的研究进展及其作为定制细胞内支架的潜在应用 | 探讨了利用细菌微区室壳蛋白作为模块化平台,构建多样化、可编程的细胞内结构,以提高代谢途径产量和隔离异源系统 | NA | 探索细菌微区室壳蛋白在细胞内空间组织控制中的应用 | 细菌微区室壳蛋白及其自组装机制 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
31 | 2024-08-07 |
Preparation of Giant Vesicles Encapsulating Microspheres by Centrifugation of a Water-in-oil Emulsion
2017-01-24, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/55282
PMID:28190062
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研究论文 | 本文描述了一种通过水油乳液离心法制备封装微球的大囊泡(GVs)的方法 | 提出了一种简单的水油乳液离心法制备封装微球的大囊泡的方法 | NA | 研究人工细胞的构建方法 | 大囊泡(GVs)封装微球 | 合成生物学 | NA | 水油乳液离心法 | NA | 囊泡 | NA |
32 | 2024-08-07 |
Functional photosystem I maintains proper energy balance during nitrogen depletion in Chlamydomonas reinhardtii, promoting triacylglycerol accumulation
2017, Biotechnology for biofuels
IF:6.1Q2
DOI:10.1186/s13068-017-0774-4
PMID:28413444
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研究论文 | 本文研究了在氮缺乏条件下,Chlamydomonas reinhardtii中功能性光系统I(PSI)如何维持能量平衡并促进三酰甘油(TAG)积累 | 揭示了PSI在调控细胞代谢和脂质/淀粉分配中的核心作用,以及其在氮缺乏条件下维持细胞氧化还原状态的机制 | 研究主要集中在tab2突变体和野生型在氮缺乏条件下的比较,未涉及其他可能的调控因素 | 探讨PSI在氮缺乏条件下对细胞代谢和能量平衡的影响 | Chlamydomonas reinhardtii中的tab2突变体和野生型 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
33 | 2024-08-07 |
Emergent Properties of Giant Vesicles Formed by a Polymerization-Induced Self-Assembly (PISA) Reaction
2017-01-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/srep41534
PMID:28128307
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研究论文 | 本研究展示了通过控制自由基聚合反应,在温和条件下形成巨型聚合物囊泡的方法 | 首次通过聚合诱导自组装(PISA)反应,在温和条件下形成直径大于10微米的巨型聚合物囊泡 | NA | 探索巨型囊泡的形成及其在自然科学和工程领域的应用潜力 | 巨型聚合物囊泡及其自组装过程 | NA | NA | 聚合诱导自组装(PISA) | NA | 图像 | NA |
34 | 2024-08-07 |
A Cas9-based toolkit to program gene expression in Saccharomyces cerevisiae
2017-Jan-09, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkw1023
PMID:27899650
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research paper | 本文利用CRISPR/Cas9技术构建了一个无需克隆的工具包,用于解决代谢工程中常见的障碍,如染色体整合位点选择、启动子选择以及蛋白质定位和溶解性问题 | 该工具包包括23个Cas9-sgRNA质粒、37个不同强度和时间表达特性的启动子以及10种蛋白质定位、降解和溶解性标签,并通过一个基于网络的工具自动化生成用于整合的DNA片段 | NA | 开发一个高效的基因表达编程工具包,用于酵母菌株工程 | 酵母菌株工程中的基因编辑和代谢工程 | synthetic biology | NA | CRISPR/Cas9 | NA | DNA | 23个Cas9-sgRNA质粒、37个启动子、10种蛋白质标签 |
35 | 2024-08-07 |
Development of SyneBrick Vectors As a Synthetic Biology Platform for Gene Expression in Synechococcus elongatus PCC 7942
2017, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2017.00293
PMID:28303150
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研究论文 | 本文开发了SyneBrick载体作为合成生物学平台,用于Synechococcus elongatus PCC 7942中的基因表达。 | SyneBrick载体提供了三种可诱导的表达系统和三个中性位点用于染色体整合,能够有效控制基因表达并加速代谢工程。 | 基因表达在光照下48小时后因aTc降解而减少。 | 开发合成生物学平台,用于蓝细菌中的基因表达和代谢途径重构。 | Synechococcus elongatus PCC 7942作为模型蓝细菌。 | 合成生物学 | NA | 基因表达调控技术 | NA | 基因表达数据 | NA |
36 | 2024-08-07 |
The Timing of Transcriptional Regulation in Synthetic Gene Circuits
2017-11-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.7b00118
PMID:28841307
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研究论文 | 本文研究了合成基因电路中转录调控的时间特性 | 首次测量了两种常用转录因子在埃希氏菌中的信号时间,并展示了信号时间的变化范围及其与表达速率的关系 | NA | 探讨合成转录基因电路在活细胞中的转录调控时间尺度 | 转录因子AraC和LacI在埃希氏菌中的信号时间 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 单细胞数据 | NA |
37 | 2024-08-07 |
Advances in bacterial cancer therapies using synthetic biology
2017-Oct, Current opinion in systems biology
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.coisb.2017.05.009
PMID:29881788
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综述 | 本文综述了利用合成生物学工程细菌作为癌症治疗手段的进展 | 通过遗传修饰编程细菌的疗效、安全性和特异性特征 | 当前面临的挑战包括遗传稳定性等,这些是实现临床应用必须解决的问题 | 探讨合成生物学在细菌癌症治疗中的应用 | 细菌的肿瘤靶向、对肿瘤微环境的特定感知和响应、远程诱导方法及可控药物释放 | 合成生物学 | 癌症 | 遗传修饰 | NA | NA | NA |
38 | 2024-08-07 |
Control mechanisms for stochastic biochemical systems via computation of reachable sets
2017-Aug, Royal Society open science
IF:2.9Q1
DOI:10.1098/rsos.160790
PMID:28878957
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研究论文 | 本文提出了一种通过计算可达集来研究控制措施对分子交互模式影响的方法 | 本文引入了一种可达性分析形式,能够描述生物系统(自然进化或工程设计)的潜在行为,并提供一组关于其群体统计动态的界限 | NA | 通过理性引导分子过程来控制细胞行为 | 分子交互模式 | 合成生物学 | NA | 可达性分析 | NA | NA | NA |
39 | 2024-08-07 |
Insights into the Evolution and Function of Auxin Signaling F-Box Proteins in Arabidopsis thaliana Through Synthetic Analysis of Natural Variants
2017-10, Genetics
IF:3.3Q2
DOI:10.1534/genetics.117.300092
PMID:28760746
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研究论文 | 本文通过分析自然变异在拟南芥中的生长素受体F-box家族,研究了生长素信号传导蛋白的进化和功能 | 本文采用合成生物学方法与定量表型相结合,利用丰富的序列信息指导未来多样信号通路的工程化努力 | NA | 深入理解生长素信号传导蛋白的机制,以合理设计新型植物结构 | 拟南芥中的生长素信号传导F-box蛋白 | NA | NA | NA | NA | 序列信息 | 野生拟南芥种质的自然变异 |
40 | 2024-08-07 |
Production of anthocyanins in metabolically engineered microorganisms: Current status and perspectives
2017-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2017.10.005
PMID:29552650
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综述 | 本文综述了通过代谢工程改造的微生物生产花青素的最新进展,特别关注了系统工程改造,如选择和工程化生物合成酶、运输工程、UDP-葡萄糖供应的调控以及过程优化。 | 介绍了通过代谢工程和合成生物学在微生物中可持续生产花青素的创新方法。 | NA | 探讨通过代谢工程改造的微生物生产花青素的技术现状和未来展望。 | 花青素的生物合成及其在微生物中的生产。 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA |