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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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1 | 2024-09-27 |
Engineering nucleic acid structures for programmable molecular circuitry and intracellular biocomputation
2017-11, Nature chemistry
IF:19.2Q1
DOI:10.1038/nchem.2852
PMID:29064489
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综述 | 本文综述了DNA/RNA纳米技术在活细胞和体内应用中的现状,并讨论了实现其全部潜力的关键问题 | 本文总结了DNA/RNA纳米技术在活细胞应用中的能力,并提出了如何整合相关新技术以构建基于核酸纳米结构的分子电路 | 本文未具体讨论DNA/RNA纳米技术在实际应用中的局限性 | 探讨DNA/RNA纳米技术在合成生物学中的应用潜力 | DNA/RNA纳米结构及其在活细胞和体内的应用 | 合成生物学 | NA | DNA/RNA纳米技术 | NA | NA | NA |
2 | 2024-08-07 |
Composing RNA Nanostructures from a Syntax of RNA Structural Modules
2017-11-08, Nano letters
IF:9.6Q1
DOI:10.1021/acs.nanolett.7b03842
PMID:29039189
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研究论文 | 本文通过借鉴语言学的概念,定义了一种扩展的RNA结构模块语法,用于编程RNA链以在热力学和动力学控制下组装成复杂的响应性纳米结构。 | 本文提出了一种新的RNA结构模块语法,用于设计和组装复杂的RNA纳米结构,展示了RNA作为信息媒介在合成生物学、纳米医学和纳米技术中的无限潜力。 | NA | 探索RNA作为信息媒介在设计和组装复杂纳米结构中的应用。 | RNA纳米结构的设计和组装。 | 纳米技术 | NA | NA | NA | RNA结构 | NA |
3 | 2024-08-07 |
Synthetic enhancer design by in silico compensatory evolution reveals flexibility and constraint in cis-regulation
2017-Nov-29, BMC systems biology
DOI:10.1186/s12918-017-0485-2
PMID:29187214
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研究论文 | 本文通过计算机模拟补偿进化设计合成增强子,揭示了顺式调控中的灵活性和约束 | 利用功能模型和计算机模拟补偿进化生成与自然增强子相似度不同的合成even-skipped stripe 2增强子,展示了增强子功能的多样性和复杂性 | 文章指出,尽管基因调控模型解释了大部分stripe 2增强子的功能,但表达偏离预测的情况表明可能存在未描述的因子调节表达 | 测试已知转录因子和它们之间的相互作用在多大程度上解释了果蝇even-skipped stripe 2增强子的活性 | 果蝇even-skipped stripe 2增强子的合成设计及其功能 | 合成生物学 | NA | 计算机模拟补偿进化 | 功能模型 | 序列数据 | 40个序列 |
4 | 2024-08-07 |
The Timing of Transcriptional Regulation in Synthetic Gene Circuits
2017-11-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.7b00118
PMID:28841307
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研究论文 | 本文研究了合成基因电路中转录调控的时间特性 | 首次测量了两种常用转录因子在埃希氏菌中的信号时间,并展示了信号时间的变化范围及其与表达速率的关系 | NA | 探讨合成转录基因电路在活细胞中的转录调控时间尺度 | 转录因子AraC和LacI在埃希氏菌中的信号时间 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 单细胞数据 | NA |
5 | 2024-08-07 |
A semi-synthetic organism that stores and retrieves increased genetic information
2017-11-29, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/nature24659
PMID:29189780
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研究论文 | 本文报道了一种半合成生物体,能够存储和检索增加的遗传信息 | 该研究通过引入两个额外的非天然碱基对,扩展了遗传信息的存储和检索方式 | 信息检索过程需要体内转录非天然碱基对为mRNA和tRNA,并涉及非标准氨基酸的氨基酸化及在核糖体中的有效解码 | 创造新的生命形式和功能 | 半合成生物体的DNA中包含两个额外的非天然碱基对 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
6 | 2024-08-07 |
Integration of Agrobacterium T-DNA into the Plant Genome
2017-11-27, Annual review of genetics
IF:8.7Q1
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review | 本文综述了Agrobacterium T-DNA整合到植物基因组的过程及其在基因编辑和合成生物学中的应用 | 提出了利用现有知识进行基因编辑和合成生物学操作的方法 | T-DNA整合到宿主基因组的分子过程仍未知,且整合是否依赖已知的DNA修复途径存在争议 | 探讨T-DNA整合机制及其在农业生物技术中的应用 | Agrobacterium T-DNA的整合过程及其对转基因表达的影响 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |