合成生物学相关文章
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当前共找到 16 篇文献。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2024-08-07 |
Mobius Assembly: A versatile Golden-Gate framework towards universal DNA assembly
2018, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0189892
PMID:29293531
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Mobius Assembly的新型Golden Gate Assembly框架，结合了向量工具包的简单性和高克隆容量 | Mobius Assembly采用两级分层方法和低频切割器，减少了驯化需求，并实现了无成本的可视化克隆筛选 | NA | 开发一种通用的DNA组装框架，提高生物分子工程的预测性和设计构造的普适性 | Golden Gate Assembly技术及其在DNA组装中的应用 | 合成生物学 | NA | Golden Gate Assembly技术 | NA | DNA片段 | 成功组装了多达16个转录单元的各种色素基因 |
| 2 | 2024-08-07 |
Boosting Secondary Metabolite Production and Discovery through the Engineering of Novel Microbial Biosensors
2018, BioMed research international
IF:2.6Q3
DOI:10.1155/2018/7021826
PMID:30079350
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研究论文 | 本文介绍了通过工程化新型微生物生物传感器来促进细菌中次级代谢产物生产和发现的最新进展 | 开发了新型合成生物学方法，用于提高次级代谢产物的生产率和在异源宿主中挖掘及重建新的生物合成基因簇 | 讨论了当前开发方法的潜力和局限性，并指出了该领域可能的新方向 | 旨在通过工程化微生物生物传感器和合成启动子及表达系统，构建微生物细胞工厂以生产次级代谢产物 | 细菌中的次级代谢产物及其生物合成基因簇 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法 | NA | 基因簇 | NA |
| 3 | 2024-08-07 |
Auxotrophy to Xeno-DNA: an exploration of combinatorial mechanisms for a high-fidelity biosafety system for synthetic biology applications
2018, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-018-0105-8
PMID:30123321
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研究论文 | 本文探讨了合成生物学应用中用于提高生物安全性的多种组合机制，包括从营养缺陷型到最小基因组的方法 | 提出了使用Xeno-DNA和非经典氨基酸等方法来消除构建细胞的遗传信息，以及基于Xeno-DNA的无细胞系统的最终生物安全系统 | NA | 研究并改进合成生物学中的生物安全系统，特别是在iGEM竞赛的背景下 | 合成生物学中的生物安全系统，包括营养缺陷型、毒素-抗毒素系统、无细胞系统等 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4 | 2024-08-07 |
Textile Dye Decolorizing Synechococcus PCC7942 Engineered With CotA Laccase
2018, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2018.00095
PMID:30050901
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研究论文 | 本研究通过合成生物学方法成功设计并构建了两种重组PCC7942菌株，用于异源表达工业相关的CotA漆酶，并评估了其在纺织染料脱色中的应用 | 成功构建了两种重组PCC7942菌株，其中PCC7942-NSII-CotA在生长速率和酶活性方面表现更优，表明PCC7942的两个传统中性位点在表达某些转基因时并非同等适合 | NA | 研究PCC7942菌株在异源表达CotA漆酶及其在纺织染料脱色中的应用 | PCC7942菌株及其异源表达的CotA漆酶 | 生物技术 | NA | 合成生物学 | NA | 基因组 | 两种重组PCC7942菌株 |
| 5 | 2024-08-07 |
RNA Thermometers for the PURExpress System
2018-01-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.7b00294
PMID:29271642
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研究论文 | 本文描述了在PURExpress体外蛋白合成系统中实现温度依赖性翻译的合成RNA温度计 | 设计了位于Shine-Dalgarno序列和感兴趣基因内互补序列之间的发夹结构，使得温度计在体外系统中保留其功能 | NA | 开发新的工具，利用温度作为体外基因调控的快速外部触发器 | 合成RNA温度计及其在PURExpress系统中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | RNA | NA |
| 6 | 2024-08-07 |
Optimization-based synthesis of stochastic biocircuits with statistical specifications
2018-01, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2017.0709
PMID:29321266
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研究论文 | 本文提出了一种计算框架，用于系统地指定内在噪声水平，并基于统计规范设计高度异质性的生物电路 | 使用描述性统计作为随机生物电路的直观规范语言，并开发了一种基于优化的计算工具，探索满足设计要求的参数配置 | NA | 增强随机生物电路的设计过程 | 随机生物电路的设计和优化 | 合成生物学 | NA | 优化方法 | 凸优化程序 | 统计数据 | NA |
| 7 | 2024-08-07 |
Engineering bacterial motility towards hydrogen-peroxide
2018, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0196999
PMID:29750783
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研究论文 | 本文开发了一种遗传结构，用于控制和引导细菌向过氧化氢移动，利用oxyRS调节系统实现对非天然趋化剂过氧化氢的识别和移动。 | 首次成功利用遗传工程使细菌能够识别并朝向过氧化氢移动，为信号引导治疗提供了新的可能性。 | 研究主要集中在实验室条件下，尚未在实际疾病治疗环境中进行验证。 | 旨在创建能够自主治疗疾病的细胞，这些疾病通过过氧化氢的释放来信号化。 | 细菌的趋化性和对过氧化氢的响应。 | 合成生物学 | NA | 遗传工程 | NA | 细胞追踪数据 | 涉及不同浓度的过氧化氢（0-200 μM）和不同诱导时间的细菌样本。 |
| 8 | 2024-08-07 |
Cell-Free Protein Synthesis From Fast-Growing Vibrio natriegens
2018, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2018.01146
PMID:29910785
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研究论文 | 本文报道了一种基于快速生长的非致病性细菌Vibrio natriegens的细胞外蛋白质合成系统（CFPS）的开发 | 开发了一种新的基于Vibrio natriegens的细胞外蛋白质合成系统，并通过激活内源转录单元展示了其潜力 | 系统存在rRNA稳定性问题和关键底物消耗（如氨基酸）的限制 | 开发和优化基于Vibrio natriegens的细胞外蛋白质合成系统，以应用于生物技术和合成生物学 | Vibrio natriegens的细胞外蛋白质合成系统及其在生物技术中的应用 | 生物技术 | NA | 细胞外蛋白质合成 | NA | 代谢物分析 | 小规模批次反应 |
| 9 | 2024-08-07 |
P450s controlling metabolic bifurcations in plant terpene specialized metabolism
2018, Phytochemistry reviews : proceedings of the Phytochemical Society of Europe
IF:7.3Q1
DOI:10.1007/s11101-017-9530-4
PMID:29563859
|
综述 | 本文综述了植物中参与工业相关单萜、倍半萜、双萜和三萜生物合成的P450酶的最新发现和发展 | 强调了P450酶在控制代谢分支和最终产品化学多样性中的新兴作用 | NA | 探讨P450酶在植物特化代谢中的作用及其在合成生物学中的应用潜力 | 植物中的P450酶及其在萜类化合物生物合成中的作用 | 生物技术 | NA | 深度转录组学和全基因组发现 | NA | 基因组数据 | NA |
| 10 | 2024-08-07 |
Recent Developments of the Synthetic Biology Toolkit for Clostridium
2018, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2018.00154
PMID:29483900
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综述 | 本文综述了合成生物学工具包在梭菌属中的最新进展，特别是CRISPR工具的发展和基于梭菌的启动子及报告基因的现状与开发。 | 介绍了CRISPR工具在多个梭菌物种和菌株中的应用，提高了编辑的精确性、速度和效率。 | 尽管有进展，但低转化效率和缺乏合成生物学工具及遗传部件仍使梭菌属的代谢工程面临挑战。 | 旨在加速梭菌属菌株工程的发展，以便在工业上利用梭菌进行多种应用，包括生物生产多种商品产品。 | 梭菌属的合成生物学工具和遗传工程方法。 | 合成生物学 | NA | CRISPR | NA | NA | 多个梭菌物种和菌株 |
| 11 | 2024-08-07 |
Rewriting the Metabolic Blueprint: Advances in Pathway Diversification in Microorganisms
2018, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2018.00155
PMID:29483901
|
综述 | 本文综述了通过合成生物学和代谢工程技术，在微生物中重写代谢蓝图以开辟非天然生物合成途径，从而生产新型有价值化合物的最新策略 | 提出通过重写自然代谢蓝图来扩展微生物可生产的化学品种类，以满足工业对塑料前体和新抗生素等化合物的需求 | NA | 探讨如何通过重写自然代谢蓝图来扩展微生物的化学产品范围，以满足工业需求 | 微生物的代谢途径和生物合成能力 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA |
| 12 | 2024-08-07 |
Multiplexed sgRNA Expression Allows Versatile Single Nonrepetitive DNA Labeling and Endogenous Gene Regulation
2018-Jan-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.7b00268
PMID:28849913
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于合成生物学的方法，通过将多个sgRNA表达盒串联到一个单一质粒中，实现了高效的多个sgRNA表达，并探索了其在单个非重复基因组位点成像和活细胞中协同基因调控的应用 | 本文开发了一种无需载体的多sgRNA表达方法，提高了效率和可控性，并具有良好的扩展性 | NA | 探索CRISPR/Cas9系统在基因组编辑、基因调控和染色质研究中的应用 | 多重生物系统的研究 | 基因组学 | NA | CRISPR/Cas9系统 | NA | 基因组数据 | NA |
| 13 | 2024-08-07 |
Enhanced guide-RNA design and targeting analysis for precise CRISPR genome editing of single and consortia of industrially relevant and non-model organisms
2018-Jan-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btx564
PMID:28968798
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研究论文 | 本文开发了一种名为CASPER的新方法，用于增强CRISPR/Cas系统在不同生物中的基因组编辑能力，通过识别和分析非唯一（重复）目标，提高了目标和非目标预测的准确性 | CASPER方法在预测目标和非目标活动方面分别比传统方法提高了2.4%和30.2%，并支持多目标分析和多物种群体分析 | NA | 开发一种高效的基因组编辑工具，以实现非模式生物的快速菌株工程，用于合成生物学和代谢工程应用 | 非模式生物的基因组编辑 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas系统 | NA | 基因组数据 | 涉及多种工业相关生物的基因组 |
| 14 | 2024-08-07 |
Bacterial Genome Editing Strategy for Control of Transcription and Protein Stability
2018, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-4939-7295-1_3
PMID:29170951
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研究论文 | 本文描述了一种在埃希氏菌中标记基因的协议，允许对任何感兴趣的可溶性蛋白质进行诱导性降解和转录控制 | 利用CRISPRi和N端规则蛋白降解这两种跨界的工具，以及CRMAGE技术进行基因组编辑，并通过随机化翻译起始区域最小化标签插入的极性效应 | NA | 开发一种通用的合成生物学工具，用于控制蛋白质生产和稳定性 | 埃希氏菌中的基因和蛋白质 | 分子生物学 | NA | CRISPRi, N-end rule, CRMAGE | NA | 基因组 | NA |
| 15 | 2024-08-07 |
CRISPR-Cas9-Mediated Genome Editing and Transcriptional Control in Yarrowia lipolytica
2018, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-4939-7795-6_18
PMID:29754237
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研究论文 | 本文介绍了在工业重要的产油酵母Yarrowia lipolytica中使用CRISPR-Cas9系统进行基因编辑和转录调控的方法 | 开发了一套易于使用且有效的CRISPR-Cas9质粒载体，扩展了Yarrowia lipolytica的基因编辑和转录调控能力 | NA | 探索在Yarrowia lipolytica中使用CRISPR-Cas9系统进行基因编辑和转录调控的新方法 | Yarrowia lipolytica的基因编辑和转录调控 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | DNA | NA |
| 16 | 2024-08-07 |
Peripheral infrastructure vectors and an extended set of plant parts for the Modular Cloning system
2018, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0197185
PMID:29847550
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研究论文 | 本文开发了一套包含新DNA组装标准模块的工具包，旨在增强植物合成生物学中的模块化克隆系统的多功能性。 | 提供了约80个额外的植物砖模块，包括诱导表达系统、启动子或表位标签等，并开发了连接模块化克隆和Gateway克隆的DNA模块，以及用于直接在酵母双杂交或细菌感染实验中使用编码序列植物砖的载体。 | NA | 开发新的DNA组装标准模块，以增强植物合成生物学中的模块化克隆系统的多功能性。 | 植物合成生物学中的DNA组装策略和模块化克隆系统。 | 合成生物学 | NA | Golden Gate原理，Type IIs限制性内切酶 | NA | DNA | 约80个额外的植物砖模块 |