合成生物学相关文章
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当前共找到 82 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2024-11-19 |
Chimeric antigen receptor-modified T cells: CD19 and the road beyond
2018-06-14, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood-2018-01-785840
PMID:29728402
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综述 | 本文综述了嵌合抗原受体（CAR）T细胞疗法在血液恶性肿瘤中的现状、挑战和未来应用 | CAR T细胞疗法在难治性B细胞恶性肿瘤患者中显示出显著的抗肿瘤活性 | 研究重点在于理解不完全肿瘤消除的机制、减少毒性、防止抗原逃逸以及识别合适的靶点和策略 | 探讨CAR T细胞疗法在血液恶性肿瘤中的应用前景 | CAR T细胞疗法在血液恶性肿瘤中的机制、毒性、抗原逃逸及靶点识别 | 生物医学 | 血液恶性肿瘤 | 嵌合抗原受体（CAR）T细胞工程 | NA | NA | NA |
| 2 | 2024-11-15 |
Upgrading aminoacyl-tRNA synthetases for genetic code expansion
2018-10, Current opinion in chemical biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.cbpa.2018.07.014
PMID:30059834
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研究论文 | 本文总结了通过遗传密码扩展合成含有非标准氨基酸的蛋白质的进展和挑战 | 本文介绍了通过重新利用氨酰-tRNA合成酶将非标准氨基酸连接到工程化tRNA上的方法 | 当前研究面临的主要限制是同时掺入多种非标准氨基酸或与l-α-氨基酸结构不同的氨基酸（如d-氨基酸或β-氨基酸） | 开发更选择性和高效的氨酰-tRNA合成酶以实现遗传密码扩展 | 非标准氨基酸和工程化tRNA | 合成生物学 | NA | 遗传密码扩展 | NA | NA | NA |
| 3 | 2024-11-15 |
An in vitro synthetic biology platform for emerging industrial biomanufacturing: Bottom-up pathway design
2018-Sep, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2018.05.002
PMID:30345404
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研究论文 | 本文介绍了一种用于工业生物制造的体外合成生物学平台，通过自下而上的途径设计实现复杂生物化学反应 | 提出了基于BioBricks和模块的合成途径设计原则，为低成本生物制造开辟了新途径 | NA | 开发一种用于工业生物制造的合成生物学平台 | 合成生物学平台的设计和构建 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 4 | 2024-11-14 |
Directed evolution of Escherichia coli with lower-than-natural plasmid mutation rates
2018-09-28, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gky751
PMID:30137492
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研究论文 | 开发了一种定向进化策略，用于发现延长工程生物中负担性DNA序列功能的突变 | 提出了Periodic Reselection for Evolutionarily Reliable Variants (PResERV)方法，成功降低了大肠杆菌中ColE1型质粒的突变率 | NA | 开发一种定向进化策略，以提高工程生物中负担性DNA序列的遗传稳定性 | 大肠杆菌及其ColE1型质粒的突变率 | 合成生物学 | NA | 定向进化 | NA | DNA序列 | NA |
| 5 | 2024-11-14 |
Synthetic biology: Reframing cell therapy for cancer
2018-02-14, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/nchembio.2573
PMID:29443984
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6 | 2024-11-13 |
Synthetic switch-based baculovirus for transgene expression control and selective killing of hepatocellular carcinoma cells
2018-09-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gky447
PMID:29905834
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研究论文 | 本文开发了一种基于合成开关的杆状病毒，用于控制转基因表达并选择性杀死肝细胞癌（HCC）细胞 | 利用miR-196a和miR-126在HCC和正常细胞中的特异性表达，设计了一种基于miRNA传感器的合成开关，实现了在HCC细胞中开启转基因表达而在正常细胞中关闭转基因表达 | NA | 提高杆状病毒作为抗癌基因传递载体的安全性，实现对肝细胞癌（HCC）细胞的选择性杀伤 | 肝细胞癌（HCC）细胞和正常细胞 | NA | 肝细胞癌 | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 7 | 2024-11-13 |
Expanding the boundary of biocatalysis: design and optimization of in vitro tandem catalytic reactions for biochemical production
2018-04, Critical reviews in biochemistry and molecular biology
IF:6.2Q1
DOI:10.1080/10409238.2018.1431201
PMID:29411648
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综述 | 本文综述了设计和优化体外串联催化反应的策略，并讨论了该领域的未来趋势 | 本文介绍了体外串联酶催化反应的发展，以及其在生物化学生产中的应用 | NA | 探讨体外串联催化反应的设计和优化策略 | 体外串联酶催化反应 | 生物化学 | NA | 合成生物学和代谢工程工具 | NA | NA | NA |
| 8 | 2024-08-05 |
Synthetic biology tools for engineering Yarrowia lipolytica
2018-12, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2018.10.004
PMID:30315870
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综述 | 该论文介绍了用于工程化Yarrowia lipolytica的合成生物学工具 | 介绍了最新开发的合成生物学工具，这些工具可以操作Y. lipolytica | 未提及具体局限性 | 探讨合成生物学工具在Y. lipolytica工程中的应用 | Yarrowia lipolytica | 合成生物学 | NA | DNA组装技术、基因组编辑技术、计算工具 | NA | NA | NA |
| 9 | 2024-08-07 |
Engineering the "Missing Link" in Biosynthetic (-)-Menthol Production: Bacterial Isopulegone Isomerase
2018-Mar-02, ACS catalysis
IF:11.3Q1
DOI:10.1021/acscatal.7b04115
PMID:29750129
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研究论文 | 研究通过合成生物学方法，利用细菌Δ5-3-酮甾体异构酶(KSI)作为异戊基异戊二烯异构酶(IPGI)，在微生物中生产(-)-薄荷醇 | 首次证明KSI可以作为IPGI，并通过半理性设计策略优化其活性，提高了4.3倍 | NA | 实现微生物中(-)-薄荷醇的生物合成 | 异戊基异戊二烯异构酶(IPGI)的基因鉴定及其在生物合成途径中的应用 | 合成生物学 | NA | 晶体结构生成，分子建模 | NA | 蛋白质结构 | 四种KSI变体 |
| 10 | 2024-08-07 |
Building a minimal and generalizable model of transcription factor-based biosensors: Showcasing flavonoids
2018-09, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.26726
PMID:29733444
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研究论文 | 本文开发了一种新型生物传感器，用于检测pinocembrin，基于转录调节因子FdeR与荧光报告蛋白的结合，并通过组合库改变其质粒拷贝数和生物传感器TF的浓度，记录并建模了不同的响应 | 首次明确考虑质粒拷贝数对生物传感器灵敏度的影响，使用基于Hill的正式方法，能够解释未表征系统的响应，无需对TF的属性有广泛了解 | NA | 开发一种新型转录因子基生物传感器，并建立其与被感知分子之间的定量关系模型 | 转录因子FdeR与pinocembrin的相互作用 | 合成生物学 | NA | 转录因子基生物传感器 | Hill-based formalism | 生物传感器响应数据 | 通过组合库改变质粒拷贝数和生物传感器TF的浓度，记录不同的响应 |
| 11 | 2024-08-07 |
How to do things with metaphors: engineering life as hodgepodge
2018-Sep-17, Life sciences, society and policy
DOI:10.1186/s40504-018-0084-z
PMID:30221313
|
研究论文 | 本文探讨了社会科学家与化学家合作，在合成生物学与纳米技术交叉领域中，如何通过隐喻理解新疗法开发的潜力 | 分析了'进化生命作为大杂烩'的隐喻在基因编辑技术和生物纳米技术中的应用 | NA | 探讨隐喻在生命科学及其基础设施中的递归关系，并分析其在合成生物学和生物纳米技术中的应用 | 基因编辑技术和生物纳米技术中的隐喻 | 合成生物学 | NA | 基因编辑技术 | NA | 文本 | NA |
| 12 | 2024-08-07 |
Towards an Aspect-Oriented Design and Modelling Framework for Synthetic Biology
2018-Sep-15, Processes (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/pr6090167
PMID:30568914
|
研究论文 | 本文提出了一种基于面向方面软件工程概念的合成生物学设计框架，以解决传统基于组件的系统构建方法在处理复杂应用时的问题 | 该框架通过引入面向方面的设计理念，能够将核心关注点与系统级属性分离，从而使设计过程更加模块化 | NA | 旨在为合成生物学提供一种新的设计框架，以实现更复杂应用的开发 | 合成生物学系统的设计与建模 | 合成生物学 | NA | 面向方面的软件工程 | NA | NA | NA |
| 13 | 2024-08-07 |
Tellurium: An extensible python-based modeling environment for systems and synthetic biology
2018-Sep, Bio Systems
DOI:10.1016/j.biosystems.2018.07.006
PMID:30053414
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research paper | 本文介绍了一个基于Python的建模环境Tellurium，用于系统生物学和合成生物学中的模型构建、模拟和分析 | Tellurium是一个模块化、跨平台、开源的模拟环境，集成了多个库、插件和专用模块，提供了一个统一但可扩展的生物建模和分析解决方案 | NA | 开发一个便于模型在系统生物学和合成生物学中可重复使用的建模环境 | 系统生物学和合成生物学中的模型构建、模拟和分析 | systems biology | NA | Python | libRoadRunner | model | NA |
| 14 | 2024-08-07 |
First characterization of a biphasic, switch-like DNA amplification
2018-Apr-16, The Analyst
DOI:10.1039/c8an00130h
PMID:29577124
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研究论文 | 本文首次报道了一种具有开关特性的双相DNA扩增化学反应 | 该化学反应具有双相特性，第一阶段后会出现前所未有的高增益产品寡核苷酸爆发的第二阶段，且第二阶段产品产量是第一阶段的10到100倍 | NA | 研究一种新型的双相DNA扩增化学反应及其应用潜力 | 双相DNA扩增化学反应的机制及其在不同领域的应用 | 合成生物学 | NA | DNA扩增 | NA | DNA | 约1 pM寡核苷酸触发剂 |
| 15 | 2024-08-07 |
Dissipative structures in biological systems: bistability, oscillations, spatial patterns and waves
2018-Jul-28, Philosophical transactions. Series A, Mathematical, physical, and engineering sciences
DOI:10.1098/rsta.2017.0376
PMID:29891498
|
综述 | 本文综述了耗散结构概念在理解生物系统非平衡自组织动态基础中的相关性及其在过去五十年中的应用 | NA | NA | 评估耗散结构概念在理解生物系统非平衡自组织动态基础中的相关性及其应用 | 生物系统中的耗散结构，包括多稳态、振荡、空间模式和波 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 16 | 2024-08-07 |
Antithetic proportional-integral feedback for reduced variance and improved control performance of stochastic reaction networks
2018-06, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2018.0079
PMID:29899158
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研究论文 | 本文探讨了通过结合反向积分反馈（AIF）和负反馈策略来减少随机反应网络的方差并提高控制性能的方法。 | 提出了一种结合AIF和负反馈策略的方法，以减少细胞间异质性或方差，并提高控制性能。 | 存在一个权衡，即较小的方差与较大的平均轨迹稳定时间相关。 | 展示通过结合AIF和负反馈策略来改善性能恶化的方法。 | 随机生物分子反应网络中的分子物种。 | 系统生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 17 | 2024-08-07 |
Model reduction enables Turing instability analysis of large reaction-diffusion models
2018-03, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2017.0805
PMID:29540540
|
研究论文 | 本文提出了一种通过移除非扩散物种来简化大型生化系统模型的方法，以促进图灵不稳定性的分析 | 本文提出的模型简化方法能够有效地减少生化系统的复杂性，使得分析大型反应扩散模型成为可能 | 该方法主要适用于包含多个不可移动物种的大型系统，对于其他类型的生化系统可能不适用 | 研究如何通过模型简化来分析大型反应扩散模型中的图灵不稳定性 | 生化系统中的图灵模式生成 | 合成生物学 | NA | 反应扩散模型 | NA | NA | 17个物种的生化模式系统 |
| 18 | 2024-08-07 |
Mobius Assembly: A versatile Golden-Gate framework towards universal DNA assembly
2018, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0189892
PMID:29293531
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Mobius Assembly的新型Golden Gate Assembly框架，结合了向量工具包的简单性和高克隆容量 | Mobius Assembly采用两级分层方法和低频切割器，减少了驯化需求，并实现了无成本的可视化克隆筛选 | NA | 开发一种通用的DNA组装框架，提高生物分子工程的预测性和设计构造的普适性 | Golden Gate Assembly技术及其在DNA组装中的应用 | 合成生物学 | NA | Golden Gate Assembly技术 | NA | DNA片段 | 成功组装了多达16个转录单元的各种色素基因 |
| 19 | 2024-08-07 |
Engineering microbes for targeted strikes against human pathogens
2018-Aug, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-018-2827-7
PMID:29736607
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综述 | 本文综述了利用合成生物学方法，通过工程化微生物实现对人类病原体的精准打击，以减少抗生素的非特异性使用和多药耐药性的发展 | 提出了一种基于合成生物学的新型抗菌疗法，通过赋予抗生素特异性，减少对宿主微生物群的附带损害 | NA | 探讨如何利用合成生物学和遗传工程工具开发针对特定病原体的精准抗菌策略 | 人类病原体及其耐药性问题 | 合成生物学 | NA | 遗传工程 | NA | NA | NA |
| 20 | 2024-08-07 |
Arabinose-Induced Catabolite Repression as a Mechanism for Pentose Hierarchy Control in Clostridium acetobutylicum ATCC 824
2018 Sep-Oct, mSystems
IF:5.0Q1
DOI:10.1128/mSystems.00064-18
PMID:30374459
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研究论文 | 本研究探讨了Clostridium acetobutylicum ATCC 824中阿拉伯糖诱导的分解代谢物阻遏作为戊糖利用层次控制机制的特性 | 揭示了通过预测的Crh进行转录调控的新机制，该机制控制碳水化合物利用的层次，对指导化学品生产的稳健遗传工程策略至关重要 | NA | 研究Clostridium acetobutylicum中戊糖利用层次的转录调控机制 | Clostridium acetobutylicum ATCC 824中的戊糖利用层次 | 生物工程 | NA | 转录组测序（RNA-Seq） | NA | 转录组数据 | NA |