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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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21 | 2024-08-07 |
Engineered Living Materials: Prospects and Challenges for Using Biological Systems to Direct the Assembly of Smart Materials
2018-May, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.201704847
PMID:29430725
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综述 | 本文综述了工程化活体材料(ELMs)的发展前景和挑战,重点介绍了利用生物系统指导智能材料组装的早期努力 | 探讨了利用合成生物学和自组装材料交叉领域的技术,通过生物纳米材料的力量生长复杂结构和物体 | NA | 开发具有自主性、适应性和自愈特性的先进材料,并具有设计的多尺度物理化学或机械性能 | 工程化活体材料(ELMs),特别是工程化细菌系统和活体复合材料 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
22 | 2024-08-07 |
Adhesion of Active Cytoskeletal Vesicles
2018-12-18, Biophysical journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.bpj.2018.10.013
PMID:30455042
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研究论文 | 研究通过合成生物学方法设计了一个最小实验模型,用于理解形状重塑在粘附过程中的作用,特别是通过调整细胞骨架囊泡的大小、体积和细胞骨架收缩性来实现强粘附。 | 首次展示了细胞骨架囊泡在主动重塑肌动蛋白皮质的情况下能够维持与固体基质的强粘附,并揭示了变形性和粘附强度之间的平衡是实现粘附的关键。 | NA | 理解形状重塑在粘附过程中的作用 | 细胞骨架囊泡的粘附机制 | 细胞生物学 | NA | 合成生物学 | NA | 囊泡 | 有限数量的构建块 |
23 | 2024-08-07 |
Gene editing technologies and applications for insects
2018-08, Current opinion in insect science
IF:5.8Q1
DOI:10.1016/j.cois.2018.05.006
PMID:30551769
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研究论文 | 本文探讨了基于CRISPR的基因编辑技术在昆虫中的应用和进展 | 介绍了基因编辑技术在昆虫中的多种应用,包括基因敲入、DNA碱基编辑、染色体易位和基因驱动等 | NA | 探索基因编辑技术在昆虫中的应用和进展 | 包括多种模型和非模型昆虫,如苍蝇、蜜蜂、甲虫、蝴蝶、飞蛾和蚱蜢等 | 基因编辑 | NA | CRISPR-based genome editing endonucleases | NA | 基因组数据 | 多种昆虫样本 |
24 | 2024-08-07 |
Engineered dCas9 with reduced toxicity in bacteria: implications for genetic circuit design
2018-11-16, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gky884
PMID:30289463
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研究论文 | 本文通过消除dCas9的PAM结合位点并恢复其DNA结合能力,构建了一种在细菌中低毒性的dCas9变体,用于遗传电路设计。 | 引入了一种非毒性的dCas9变体dCas9*_PhlF,通过R1335K突变消除PAM结合,并与PhlF抑制因子融合,从而在Escherichia coli中显著降低毒性。 | 同时使用多个sgRNA会导致抑制效果单调下降,当同时表达15个sgRNA时,动态范围小于10倍。 | 开发一种在细菌中低毒性的dCas9变体,以促进其在代谢工程和合成生物学中的应用。 | dCas9的毒性及其在遗传电路设计中的应用。 | 合成生物学 | NA | 基因编辑技术 | dCas9*_PhlF | 基因表达数据 | 30个正交sgRNA-启动子对 |
25 | 2024-08-07 |
Bayesian Phylogeography and Pathogenic Characterization of Smallpox Based on HA, ATI, and CrmB Genes
2018-11-01, Molecular biology and evolution
IF:11.0Q1
DOI:10.1093/molbev/msy153
PMID:30099520
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研究论文 | 本研究利用HA、ATI和CrmB基因进行贝叶斯离散特征系统地理学分析,以探索天花病毒的系统发育特征和历史国际传播情况 | 本研究展示了多基因模型在区分VARV Major和VARV Minor亚支中的应用,并提供了历史国际VARV传播的实证 | 当全基因组测序不可用时,基于HA、ATI和CrmB的系统地理学模型提供的传播估计可能存在不确定性 | 探索在全基因组测序不可用的情况下,使用HA、ATI和CrmB基因进行系统发育和系统地理学分析的可行性,以支持天花疫情响应 | 天花病毒的系统发育和系统地理学特征 | NA | 天花 | 贝叶斯离散特征系统地理学 | 多基因模型 | 基因序列 | 51个全基因组序列和20个部分序列的天花病毒分离株 |
26 | 2024-08-07 |
Bioelectronics communication: encoding yeast regulatory responses using nanostructured gallium nitride thin films
2018-Jun-21, Nanoscale
IF:5.8Q1
DOI:10.1039/c8nr03684e
PMID:29888776
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研究论文 | 研究展示了如何利用纳米结构的氮化镓薄膜编码酿酒酵母的生理反应 | 首次展示了氮化镓纳米结构薄膜在酵母细胞生理反应编码中的应用 | NA | 探索氮化镓纳米结构薄膜在酵母细胞生理反应编码中的应用 | 酿酒酵母的生理反应 | 生物电子学 | NA | 光电流测量、原子力显微镜和开尔文探针力显微镜 | NA | 纳米结构薄膜 | NA |
27 | 2024-08-07 |
Ultra-high throughput functional enrichment of large monoamine oxidase (MAO-N) libraries by fluorescence activated cell sorting
2018-Sep-24, The Analyst
DOI:10.1039/c8an00851e
PMID:30199078
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研究论文 | 本文介绍了一种优化的方法,用于在单个大肠杆菌细胞中敏感检测氧化酶活性,使用来自黑曲霉的单胺氧化酶MAO-N作为模型系统,并通过荧光激活细胞分选(FACS)对大型MAO-N库进行功能富集 | 首次展示了适用于大肠杆菌中FAD依赖氧化酶定向进化的超高吞吐量筛选方法 | 目前的方法涉及视觉、比色、菌落为基础的筛选,不适合非常大的库,并且不能量化变体的相对适应性 | 开发一种适用于大规模筛选氧化酶变体的新方法,以提高酶的特定应用性能 | 单胺氧化酶MAO-N及其在大肠杆菌中的活性 | 生物技术 | NA | 荧光激活细胞分选(FACS) | NA | 细胞 | 超过106个变体每天 |
28 | 2024-08-07 |
Systematic Engineering for Improved Carbon Economy in the Biosynthesis of Polyhydroxyalkanoates and Isoprenoids
2018-Jul-24, Materials (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/ma11081271
PMID:30042344
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综述 | 本文综述了通过合成生物学和代谢工程提高生物合成聚羟基烷酸酯和异戊二烯的碳经济性的系统工程策略 | 介绍了构建非天然碳途径的最新技术,这些技术显示出比天然途径更高的碳经济性 | NA | 探讨如何通过系统工程策略提高生物合成过程中的碳经济性,从而降低单位成本和资本投资 | 聚羟基烷酸酯和异戊二烯的生物合成 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA |
29 | 2024-08-07 |
Bioengineering Strategies for Protein-Based Nanoparticles
2018-Jul-23, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes9070370
PMID:30041491
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综述 | 本文综述了基于蛋白质的纳米颗粒(PNPs)在生物工程和生物偶联方面的最新进展,以及如何利用合成生物学概念来开发和增强PNPs的固有特性并赋予其新功能 | PNPs具有独特的自组装、高稳定性、生物相容性和可生物降解性,以及可通过化学或遗传策略操纵的外部组件和包封特性 | NA | 探讨基于蛋白质的纳米颗粒在药物递送、疫苗开发和生物催化等领域的应用潜力 | 基于蛋白质的纳米颗粒及其在纳米生物技术中的应用 | 生物工程 | NA | 生物偶联 | NA | NA | NA |
30 | 2024-08-07 |
Applications of Yeast Synthetic Biology Geared towards the Production of Biopharmaceuticals
2018-Jul-06, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes9070340
PMID:29986380
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综述 | 本文综述了合成生物学在酵母异源生物合成生物制药中的应用,并展示了酵母细胞工厂的潜力和能力 | 近年来,合成生物学和天然代谢途径的阐明推动了这一领域的新发展 | NA | 探讨合成生物学在酵母生物制药生产中的应用及其未来趋势 | 酵母作为生物制药的生产平台 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
31 | 2024-08-07 |
Noise control for molecular computing
2018-07, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2018.0199
PMID:29997258
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研究论文 | 本文开发了一种算法,用于在保持确定性动力学的同时,在基于质量作用动力学的反应网络中引入可控的状态依赖性噪声。 | 该算法能够在不改变确定性动力学的情况下,引入可控的噪声,从而在生物化学网络设计中起到重要作用。 | NA | 旨在开发一种方法,用于在生物化学网络设计中控制内在噪声。 | 生物化学反应网络 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
32 | 2024-08-07 |
Heterologous Production of Flavour and Aroma Compounds in Saccharomyces cerevisiae
2018-Jun-28, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes9070326
PMID:29958445
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review | 本文综述了利用酵母作为微生物细胞工厂生产风味和香气化合物的方法 | 利用合成生物学领域的进展,通过异源途径在酵母中生产通常稀有且昂贵的植物源化学品 | NA | 探讨酵母作为生产风味和香气化合物的可持续高效方法 | 风味和香气化合物 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
33 | 2024-08-07 |
Boosting Secondary Metabolite Production and Discovery through the Engineering of Novel Microbial Biosensors
2018, BioMed research international
IF:2.6Q3
DOI:10.1155/2018/7021826
PMID:30079350
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研究论文 | 本文介绍了通过工程化新型微生物生物传感器来促进细菌中次级代谢产物生产和发现的最新进展 | 开发了新型合成生物学方法,用于提高次级代谢产物的生产率和在异源宿主中挖掘及重建新的生物合成基因簇 | 讨论了当前开发方法的潜力和局限性,并指出了该领域可能的新方向 | 旨在通过工程化微生物生物传感器和合成启动子及表达系统,构建微生物细胞工厂以生产次级代谢产物 | 细菌中的次级代谢产物及其生物合成基因簇 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法 | NA | 基因簇 | NA |
34 | 2024-08-07 |
Auxotrophy to Xeno-DNA: an exploration of combinatorial mechanisms for a high-fidelity biosafety system for synthetic biology applications
2018, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-018-0105-8
PMID:30123321
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研究论文 | 本文探讨了合成生物学应用中用于提高生物安全性的多种组合机制,包括从营养缺陷型到最小基因组的方法 | 提出了使用Xeno-DNA和非经典氨基酸等方法来消除构建细胞的遗传信息,以及基于Xeno-DNA的无细胞系统的最终生物安全系统 | NA | 研究并改进合成生物学中的生物安全系统,特别是在iGEM竞赛的背景下 | 合成生物学中的生物安全系统,包括营养缺陷型、毒素-抗毒素系统、无细胞系统等 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
35 | 2024-08-07 |
Advances in bio-based production of dicarboxylic acids longer than C4
2018-Sep, Engineering in life sciences
IF:3.9Q2
DOI:10.1002/elsc.201800023
PMID:32624947
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综述 | 本文综述了利用生物方法特别是合成生物学技术生产C4以上直链二羧酸的最新进展 | 设计并验证了多种生产二羧酸的路径,包括C5至C15范围的二羧酸,并通过工程化微生物宿主和优化生物催化元件的性质来提高目标二羧酸的代谢通量 | 讨论了相关路径的当前优势和局限性,并提出了合成路径设计和优化以实现二羧酸超量生产的展望 | 探讨生物基生产化学品的方法,特别是二羧酸的生产 | C4以上直链二羧酸 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
36 | 2024-08-07 |
Who are the users of synthetic DNA? Using metaphors to activate microorganisms at the center of synthetic biology
2018-Jul-14, Life sciences, society and policy
DOI:10.1186/s40504-018-0080-3
PMID:30006902
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研究论文 | 本文探讨了合成生物学中微生物的角色,并通过比喻来强调其在研究过程中的主动参与性 | 提出了使用新的比喻来使微生物成为科学研究的主动参与者,而不仅仅是被动的平台或底盘 | NA | 探索微生物在合成生物学中的新角色,并重新定义人与微生物之间的关系 | 合成生物学中的微生物及其在研究中的作用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
37 | 2024-08-07 |
A critical juncture for synthetic biology: Lessons from nanotechnology could inform public discourse and further development of synthetic biology
2018-07, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.15252/embr.201846153
PMID:29895710
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
38 | 2024-08-07 |
Textile Dye Decolorizing Synechococcus PCC7942 Engineered With CotA Laccase
2018, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2018.00095
PMID:30050901
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研究论文 | 本研究通过合成生物学方法成功设计并构建了两种重组PCC7942菌株,用于异源表达工业相关的CotA漆酶,并评估了其在纺织染料脱色中的应用 | 成功构建了两种重组PCC7942菌株,其中PCC7942-NSII-CotA在生长速率和酶活性方面表现更优,表明PCC7942的两个传统中性位点在表达某些转基因时并非同等适合 | NA | 研究PCC7942菌株在异源表达CotA漆酶及其在纺织染料脱色中的应用 | PCC7942菌株及其异源表达的CotA漆酶 | 生物技术 | NA | 合成生物学 | NA | 基因组 | 两种重组PCC7942菌株 |
39 | 2024-08-07 |
Synthetic biology in the German press: how implications of metaphors shape representations of morality and responsibility
2018-Jun-24, Life sciences, society and policy
DOI:10.1186/s40504-018-0079-9
PMID:29936670
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研究论文 | 本文通过分析德国两家主要媒体在2000年至2010年间对合成生物学的隐喻表达,探讨了这些表达如何影响道德和责任的呈现 | 采用隐喻和共现分析的新颖组合,系统地考察了新闻报道中语言形象所固有的隐含道德意义 | NA | 旨在为合成生物学新闻报道的实证伦理分析做出贡献,并提供一种方法论,为科学和技术研究以及新技术伦理分析中关于负责任语言使用的文献增添内容 | 合成生物学在德国媒体的隐喻表达及其道德影响 | 生物技术 | NA | NA | NA | 文本 | 两家德国媒体(Die Frankfurter Allgemeine Zeitung 和 Der Spiegel)在2000年至2010年间的报道 |
40 | 2024-08-07 |
Genome scale analysis of Escherichia coli with a comprehensive prokaryotic sequence-based biophysical model of translation initiation and elongation
2018-Apr-01, DNA research : an international journal for rapid publication of reports on genes and genomes
IF:3.9Q1
DOI:10.1093/dnares/dsx049
PMID:29161365
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研究论文 | 本研究首次提供了一个计算模拟的生物物理模型,该模型涵盖了翻译起始和延伸的所有方面,并专注于大肠杆菌基因 | 本研究首次提出了一个全面的生物物理模型,能够基于转录序列预测mRNA翻译动力学,并考虑了翻译的所有基本方面 | NA | 开发一个全面的生物物理模型,用于预测和量化翻译过程中的各种动态变化 | 大肠杆菌的基因翻译过程 | 分子生物学 | NA | 计算模拟 | 生物物理模型 | 序列数据 | NA |