合成生物学相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
41	2024-08-07	RNA Thermometers for the PURExpress System 2018-01-19, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.7b00294 PMID:29271642	研究论文	本文描述了在PURExpress体外蛋白合成系统中实现温度依赖性翻译的合成RNA温度计	设计了位于Shine-Dalgarno序列和感兴趣基因内互补序列之间的发夹结构，使得温度计在体外系统中保留其功能	NA	开发新的工具，利用温度作为体外基因调控的快速外部触发器	合成RNA温度计及其在PURExpress系统中的应用	合成生物学	NA	NA	NA	RNA	NA
42	2024-08-07	Optimization-based synthesis of stochastic biocircuits with statistical specifications 2018-01, Journal of the Royal Society, Interface DOI:10.1098/rsif.2017.0709 PMID:29321266	研究论文	本文提出了一种计算框架，用于系统地指定内在噪声水平，并基于统计规范设计高度异质性的生物电路	使用描述性统计作为随机生物电路的直观规范语言，并开发了一种基于优化的计算工具，探索满足设计要求的参数配置	NA	增强随机生物电路的设计过程	随机生物电路的设计和优化	合成生物学	NA	优化方法	凸优化程序	统计数据	NA
43	2024-08-07	Engineering bacterial motility towards hydrogen-peroxide 2018, PloS one IF:2.9Q1 DOI:10.1371/journal.pone.0196999 PMID:29750783	研究论文	本文开发了一种遗传结构，用于控制和引导细菌向过氧化氢移动，利用oxyRS调节系统实现对非天然趋化剂过氧化氢的识别和移动。	首次成功利用遗传工程使细菌能够识别并朝向过氧化氢移动，为信号引导治疗提供了新的可能性。	研究主要集中在实验室条件下，尚未在实际疾病治疗环境中进行验证。	旨在创建能够自主治疗疾病的细胞，这些疾病通过过氧化氢的释放来信号化。	细菌的趋化性和对过氧化氢的响应。	合成生物学	NA	遗传工程	NA	细胞追踪数据	涉及不同浓度的过氧化氢（0-200 μM）和不同诱导时间的细菌样本。
44	2024-08-07	A Digitally Programmable Cytomorphic Chip for Simulation of Arbitrary Biochemical Reaction Networks 2018-04, IEEE transactions on biomedical circuits and systems IF:3.8Q2 DOI:10.1109/TBCAS.2017.2781253 PMID:29570063	研究论文	本文报道了一种数字可编程的0.35 μm BiCMOS模拟细胞形态芯片系统，能够精确模拟任意生化反应网络	提出了一种基于总变量和守恒定律的独特计算方法，解决了芯片制造过程中随机变化导致的偏差问题	NA	开发一种用于模拟任意大规模生物网络的设计、分析和仿真工具	数字可编程的细胞形态芯片及其在生化反应网络模拟中的应用	生物技术	NA	BiCMOS	细胞形态电路	电路模拟	NA
45	2024-08-07	HEx: A heterologous expression platform for the discovery of fungal natural products 2018-04, Science advances IF:11.7Q1 DOI:10.1126/sciadv.aar5459 PMID:29651464	研究论文	本文介绍了一种名为HEx的异源表达平台，用于快速发现真菌天然产物	HEx平台能够快速、可扩展地表达真菌生物合成基因及其编码的代谢物，特别是对于难以培养或基因转录沉默的真菌物种	NA	克服天然产物发现中的瓶颈，特别是针对难以培养或基因转录沉默的真菌物种	真菌生物合成基因簇及其编码的代谢物	合成生物学	NA	DNA测序	NA	基因组数据	41个来自世界各地不同真菌物种的生物合成基因簇，其中22个产生了可检测的化合物
46	2024-08-07	Machine metaphors and ethics in synthetic biology 2018-Jun-04, Life sciences, society and policy DOI:10.1186/s40504-018-0077-y PMID:29862436	研究论文	本文探讨了合成生物学中机器隐喻的使用及其伦理影响	分析了机器隐喻在合成生物学中的应用及其对伦理判断的影响	未提及	探讨机器隐喻在合成生物学中的应用及其伦理影响	合成生物学中的机器隐喻及其伦理含义	NA	NA	NA	NA	NA	NA
47	2024-08-07	Yeast 2.0-connecting the dots in the construction of the world's first functional synthetic eukaryotic genome 2018-06-01, FEMS yeast research IF:2.4Q3 DOI:10.1093/femsyr/foy032 PMID:29648592	研究论文	本文介绍了构建世界上第一个功能性合成真核基因组的研究进展，特别是在合成酵母基因组项目中的应用。	文章展示了如何利用先进的生物设计概念和合成生物学工具，通过国际合作网络推动科学进步，并为人类未来和可持续环境提供积极框架。	文章强调了在探索合成生物学等前沿科学时，需要关注生物安全、生物伦理和监管方面的挑战。	构建一个安全的模型生物中的合成真核基因组，并探讨其对未来生物经济的影响。	研究对象包括合成酵母基因组项目中的酵母细胞和相关生物设计工具。	合成生物学	NA	合成生物学工具	NA	基因组数据	涉及16个人造染色体的酵母细胞
48	2024-08-07	A living foundry for Synthetic Biological Materials: A synthetic biology roadmap to new advanced materials 2018-Jun, Synthetic and systems biotechnology IF:4.4Q1 DOI:10.1016/j.synbio.2018.04.002 PMID:29900423	研究论文	本文探讨了利用合成生物学发现和制造新型生物基材料的潜力和挑战	提出了一种新的合成生物学生物材料制造方法，涉及智能设计和预测、制造、评估和生产	文章未明确指出具体的限制	旨在识别和加速新一代合成生物材料的发展	新型合成生物材料及其制造方法	合成生物学	NA	合成生物学方法	NA	NA	NA
49	2024-08-07	Spatially organizing biochemistry: choosing a strategy to translate synthetic biology to the factory 2018-05-29, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-018-26399-0 PMID:29844460	研究论文	本文通过空间解析的动力学模型探讨了合成生物学中生物化学空间组织的基本设计选择	提出了灵活的设计空间分析方法，可适用于多种生物合成途径，并为合理选择生物合成组织策略奠定了基础	NA	探索生物合成途径的最佳组织策略	生物合成途径的空间组织策略	合成生物学	NA	空间解析的动力学模型	NA	NA	NA
50	2024-08-07	Cell-Free Protein Synthesis From Fast-Growing Vibrio natriegens 2018, Frontiers in microbiology IF:4.0Q2 DOI:10.3389/fmicb.2018.01146 PMID:29910785	研究论文	本文报道了一种基于快速生长的非致病性细菌Vibrio natriegens的细胞外蛋白质合成系统（CFPS）的开发	开发了一种新的基于Vibrio natriegens的细胞外蛋白质合成系统，并通过激活内源转录单元展示了其潜力	系统存在rRNA稳定性问题和关键底物消耗（如氨基酸）的限制	开发和优化基于Vibrio natriegens的细胞外蛋白质合成系统，以应用于生物技术和合成生物学	Vibrio natriegens的细胞外蛋白质合成系统及其在生物技术中的应用	生物技术	NA	细胞外蛋白质合成	NA	代谢物分析	小规模批次反应
51	2024-08-07	A multi-landing pad DNA integration platform for mammalian cell engineering 2018-05-04, Nucleic acids research IF:16.6Q1 DOI:10.1093/nar/gky216 PMID:29617873	研究论文	本文介绍了一种多着陆垫DNA整合平台，用于哺乳动物细胞工程，通过在CHO细胞中精确插入大量异源DNA，实现了稳定且可控的基因表达。	本文创新性地识别了21个新的基因组位点，支持稳定长期表达转基因，并构建了包含一个、两个或三个‘着陆垫’重组位点的细胞系，使用高效的BxB1重组酶和不同的选择标记，实现了异源DNA到选定位点的重组酶介导插入。	NA	开发一种可控且可重复的DNA插入技术，用于哺乳动物合成生物学、重组蛋白生产和生物制造。	哺乳动物细胞系，特别是CHO细胞。	生物工程	NA	重组酶介导的DNA插入技术	NA	基因组数据	21个新的基因组位点，以及包含一个、两个或三个‘着陆垫’重组位点的细胞系。
52	2024-08-07	Synthetic Biology and the Gut Microbiome 2018-May, Biotechnology journal IF:3.2Q2 DOI:10.1002/biot.201700159 PMID:28976641	综述	本文综述了合成生物学工具和方法如何应用于提高治疗性益生菌的效能，并探讨了未来的应用方向	介绍了在哺乳动物肠道中成功实施的简单设备，如双稳态开关和整合酶记忆阵列，并开发了该环境中的靶向递送模型	现有的合成益生菌较为简单，未能复制天然稳态机制的复杂性和适应性	探讨合成生物学在改善治疗性益生菌效能方面的应用及其未来发展	肠道微生物群及其在人类健康中的作用	合成生物学	NA	NA	NA	NA	NA
53	2024-08-07	Gene repression via multiplex gRNA strategy in Y. lipolytica 2018-Apr-20, Microbial cell factories IF:4.3Q1 DOI:10.1186/s12934-018-0909-8 PMID:29678175	research paper	本研究在Yarrowia lipolytica中建立了基于四种不同抑制子的CRISPRi系统，并开发了一种多重gRNA策略，用于高效地同时抑制多个目标基因和同一基因的不同位点。	开发了一种基于一步Golden-brick组装技术的多重gRNA策略，能够快速实现强基因抑制，无需预先筛选有效的gRNA位点。	NA	在Yarrowia lipolytica中建立和优化CRISPRi系统，以实现高效的基因表达调控。	Yarrowia lipolytica中的基因表达调控。	synthetic biology	NA	CRISPR interference (CRISPRi)	NA	NA	使用了十种不同的gRNA，同时对gfp基因进行了三重gRNA的同时抑制。
54	2024-08-07	Model-based metabolism design: constraints for kinetic and stoichiometric models 2018-04-17, Biochemical Society transactions IF:3.8Q2 DOI:10.1042/BST20170263 PMID:29472367	研究论文	本文探讨了基于模型的代谢设计中，动力学和化学计量学模型的约束条件及其应用	提出了新的细胞分析方法，使得细胞大小、表面和资源平衡等约束条件的应用成为可能	文章指出了特定约束条件在动力学和化学计量学模型中的应用局限性	改进基于模型的代谢途径设计在生物体中的可行性	代谢工程和合成生物学中的模型设计	合成生物学	NA	NA	动力学和化学计量学模型	NA	NA
55	2024-08-07	A Novel Platform for Evaluating the Environmental Impacts on Bacterial Cellulose Production 2018-04-10, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-018-23701-y PMID:29636541	研究论文	本研究报告了一种新的分析平台，用于研究生产纤维素的细菌的生物学特性和优化其生长条件	该平台基于细菌的表面生长模式，能够确认细菌产生的纤维素微纤维在其趋化性中的关键作用，并能有效评估不同生长条件对纤维素生产的影响	NA	开发和优化用于大规模生产细菌纤维素的生物处理策略	细菌纤维素的生产及其生长条件	生物技术	NA	合成生物学	NA	生物数据	NA
56	2024-08-07	Cell-Free Approaches in Synthetic Biology Utilizing Microfluidics 2018-Mar-06, Genes IF:2.8Q2 DOI:10.3390/genes9030144 PMID:29509709	综述	本文综述了利用微流控技术的无细胞合成生物学方法的最新进展	该方法通过绕过活细胞中复杂途径相互作用的复杂性，有助于发现新的基因、蛋白质和途径，并且具有成本和时间效率高的优点	尽管存在一些挑战，但无细胞合成生物学与微流控技术的结合为开发新的生物医学和诊断平台提供了开创性的方法	旨在通过创建类似形式来模拟复杂的生物系统	无细胞基因设计、蛋白质和细胞与微流控平台的集成	合成生物学	NA	微流控技术	NA	NA	NA
57	2024-08-07	The Who, Why, and How of Small-Molecule Production in Invertebrate Microbiomes: Basic Insights Fueling Drug Discovery 2018 Mar-Apr, mSystems IF:5.0Q1 DOI:10.1128/mSystems.00186-17 PMID:29556536	研究论文	本文探讨了无脊椎动物微生物组中小分子生产的机制及其在药物发现中的应用	文章提出了利用元基因组学和其他系统生物学方法来揭示小分子生物合成及其选择性压力的创新方法	需要更深入理解复杂微生物组中小分子的功能，并开发合理的合成生物学方法以在异源宿主中重建大型生物合成途径	探索无脊椎动物微生物组中小分子的生物合成机制，以促进药物发现	无脊椎动物微生物组中的小分子生物合成	合成生物学	NA	元基因组学	NA	NA	NA
58	2024-08-07	In a quest for engineering acidophiles for biomining applications: challenges and opportunities 2018-Feb-21, Genes IF:2.8Q2 DOI:10.3390/genes9020116 PMID:29466321	综述	本文综述了利用合成生物学工具改良嗜酸微生物以提高其在生物采矿中的耐受性和效率的研究进展	介绍了新的合成生物学工具，这些工具有可能改变生物采矿行业，并促进从现有生物采矿微生物无法处理的矿石和废物中提取价值	讨论了遗传改良嗜酸生物采矿微生物的现有工具及其局限性	探索提高嗜酸微生物在生物采矿中耐受性和效率的方法	嗜酸微生物及其在生物采矿中的应用	NA	NA	合成生物学	NA	NA	NA
59	2024-08-07	P450s controlling metabolic bifurcations in plant terpene specialized metabolism 2018, Phytochemistry reviews : proceedings of the Phytochemical Society of Europe IF:7.3Q1 DOI:10.1007/s11101-017-9530-4 PMID:29563859	综述	本文综述了植物中参与工业相关单萜、倍半萜、双萜和三萜生物合成的P450酶的最新发现和发展	强调了P450酶在控制代谢分支和最终产品化学多样性中的新兴作用	NA	探讨P450酶在植物特化代谢中的作用及其在合成生物学中的应用潜力	植物中的P450酶及其在萜类化合物生物合成中的作用	生物技术	NA	深度转录组学和全基因组发现	NA	基因组数据	NA
60	2024-08-07	Riboswitching with ciprofloxacin-development and characterization of a novel RNA regulator 2018-02-28, Nucleic acids research IF:16.6Q1 DOI:10.1093/nar/gkx1319 PMID:29346617	研究论文	本文描述了一种新型环丙沙星响应性核糖开关的体外筛选和下一代测序引导的细胞筛选的开发过程	该核糖开关能以低纳摩尔范围的KD识别小分子药物环丙沙星，并通过配体结合稳定假结折叠，有效干扰低等和高等真核生物中的基因表达	NA	开发一种新型的环丙沙星响应性核糖开关，并展示其在酵母细胞生存中的有效、可扩展和可编程控制	环丙沙星响应性核糖开关及其在细胞生存控制中的应用	合成生物学	NA	下一代测序	NA	RNA	NA