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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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61 | 2024-08-07 |
Bacterially driven cadmium sulfide precipitation on porous membranes: Toward platforms for photocatalytic applications
2018-02-09, Biointerphases
IF:1.6Q4
DOI:10.1116/1.5008393
PMID:29426227
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研究论文 | 本文利用大肠杆菌在多孔聚碳酸酯膜上促进硫化镉纳米颗粒的合成,并展示了其在光催化应用中的潜力 | 通过微生物生物合成方法,减少了合成硫化镉纳米颗粒的能耗和有毒前体的使用浓度 | NA | 开发一种利用微生物进行材料制造的可行技术,以制造功能性设备 | 硫化镉纳米颗粒及其在光催化应用中的性能 | 材料工程 | NA | 能量色散光谱、扫描电子显微镜和透射电子显微镜 | NA | 图像 | NA |
62 | 2024-08-07 |
Recent Developments of the Synthetic Biology Toolkit for Clostridium
2018, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2018.00154
PMID:29483900
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综述 | 本文综述了合成生物学工具包在梭菌属中的最新进展,特别是CRISPR工具的发展和基于梭菌的启动子及报告基因的现状与开发。 | 介绍了CRISPR工具在多个梭菌物种和菌株中的应用,提高了编辑的精确性、速度和效率。 | 尽管有进展,但低转化效率和缺乏合成生物学工具及遗传部件仍使梭菌属的代谢工程面临挑战。 | 旨在加速梭菌属菌株工程的发展,以便在工业上利用梭菌进行多种应用,包括生物生产多种商品产品。 | 梭菌属的合成生物学工具和遗传工程方法。 | 合成生物学 | NA | CRISPR | NA | NA | 多个梭菌物种和菌株 |
63 | 2024-08-07 |
Rewriting the Metabolic Blueprint: Advances in Pathway Diversification in Microorganisms
2018, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2018.00155
PMID:29483901
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综述 | 本文综述了通过合成生物学和代谢工程技术,在微生物中重写代谢蓝图以开辟非天然生物合成途径,从而生产新型有价值化合物的最新策略 | 提出通过重写自然代谢蓝图来扩展微生物可生产的化学品种类,以满足工业对塑料前体和新抗生素等化合物的需求 | NA | 探讨如何通过重写自然代谢蓝图来扩展微生物的化学产品范围,以满足工业需求 | 微生物的代谢途径和生物合成能力 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA |
64 | 2024-08-07 |
Artificial Light Regulation of an Allosteric Bienzyme Complex by a Photosensitive Ligand
2018-May-29, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.201800219
PMID:29808949
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研究论文 | 本文利用光敏感的二芳基乙烯(DTE)作为竞争性抑制剂,通过光照调控异二聚酶复合物咪唑甘油磷酸合酶(ImGP-S)的催化活性和别构效应 | 首次展示了通过光敏感配体实现对多酶复合物催化活性和别构效应的光调控 | NA | 探索通过光敏感配体调控蛋白质活性的新方法 | 咪唑甘油磷酸合酶(ImGP-S)及其亚基HisF和HisH | 合成生物学 | NA | 光敏感配体结合UV光照 | NA | 酶活性数据 | NA |
65 | 2024-08-07 |
Synthetic biology approach for plant protection using dsRNA
2018-Feb-26, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.12904
PMID:29479789
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研究论文 | 本文利用噬菌体phi6的组件,在Pseudomonas syringae细菌中设计了一种稳定且准确的体内dsRNA生产系统,用于植物保护 | 该研究基于RNA依赖的RNA聚合酶的dsRNA复制机制,生产高质量、长链dsRNA分子,与传统的体外或体内dsRNA生产系统不同 | NA | 开发一种高效、灵活、非转基因且环保的方法,用于保护作物免受病毒和其他病原体的侵害 | Pseudomonas syringae细菌中的dsRNA生产系统 | 合成生物学 | NA | RNA干扰 | NA | NA | NA |
66 | 2024-08-07 |
Targeted m6A Reader Proteins To Study Epitranscriptomic Regulation of Single RNAs
2018-09-26, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.8b05012
PMID:30183280
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研究论文 | 本文报道了开发可编程的dPspCas13b-mA阅读器蛋白,用于研究活细胞中单个转录本的调控效应 | 开发了基于dPspCas13b的工具,用于研究内源性RNA的调控,并展示了这些工具在合成生物学中的应用潜力 | 目前对于mA的写入者、擦除者和阅读者之间的竞争性相互作用调控甲基化RNA转录本的研究尚不充分 | 研究RNA的转录后基因表达调控,特别是N-甲基腺苷(mA)修饰对RNA的影响 | 研究特定阅读器蛋白对单个转录本的调控效应 | 生物技术 | NA | RNA修饰分析 | dPspCas13b-mA阅读器蛋白 | RNA | 活细胞中的单个转录本 |
67 | 2024-08-07 |
MetQy-an R package to query metabolic functions of genes and genomes
2018-12-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/bty447
PMID:29878056
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research paper | 本文介绍了一个名为MetQy的R包,用于查询基因和基因组的代谢功能 | MetQy是一个开源的R包,专门设计用于基于查询的分析功能单元,并包含可视化和分析工具,便于KEGG的平面文件操作 | NA | 开发更好的工具以促进基因组和元基因组研究数据的分析 | 基因和基因组的代谢功能 | NA | NA | NA | NA | 基因组数据 | NA |
68 | 2024-08-07 |
Oligonucleotide conjugated multi-functional adeno-associated viruses
2018-02-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-018-21742-x
PMID:29483550
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研究论文 | 本文开发了一种多功能腺相关病毒(AAV),通过精确地将寡核苷酸连接到AAV表面,实现了一系列核酸可编程功能 | 通过遗传编码的不自然氨基酸(UAA)和点击化学,实现了寡核苷酸在AAV衣壳表面的位点特异性耦合 | NA | 开发一种新型的多功能AAV,用于提高基因传递的效率和特异性 | 腺相关病毒(AAV)及其在基因传递中的应用 | 合成生物学 | NA | 点击化学 | NA | DNA | NA |
69 | 2024-08-07 |
Peptide mimic for influenza vaccination using nonnatural combinatorial chemistry
2018-04-02, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI91512
PMID:29528337
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研究论文 | 本文开发了一种基于D-氨基酸组合化学的平台,用于设计一种完全人工的CD8+ T细胞激动剂,该激动剂模拟了流感病毒天然表位的免疫原性特征 | 使用非天然组合化学生成了高度稳定的抗原“模拟物”,这些模拟物在人体血清和胃酸中表现出高稳定性,并能刺激和扩展人类流感病毒特异性CD8+ T细胞 | NA | 探索合成生物学在疫苗设计和治疗递送方面的应用 | 开发一种新型的流感疫苗 | 合成生物学 | 流感 | D-氨基酸组合化学 | NA | NA | 在体外和体内实验中使用了人类和小鼠模型 |
70 | 2024-08-07 |
A Synthetic Microbial Operational Amplifier
2018-Sep-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.8b00138
PMID:30152993
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研究论文 | 本文展示了如何构建一个合成微生物操作放大器,该放大器包含三个阶段:快速CRISPR基础的差分输入推挽阶段、慢速转录和翻译放大阶段以及快速酶输出阶段 | 首次在生物分子部件中构建了类似于电子学中的操作放大器,提高了电路的预测性和稳定性 | NA | 改进细胞电路的预测性和稳定性 | 合成微生物操作放大器 | 合成生物学 | NA | CRISPR | NA | NA | 使用了5种蛋白质,包括dCas9 |
71 | 2024-08-07 |
Multiplexed sgRNA Expression Allows Versatile Single Nonrepetitive DNA Labeling and Endogenous Gene Regulation
2018-Jan-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.7b00268
PMID:28849913
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研究论文 | 本文介绍了一种基于合成生物学的方法,通过将多个sgRNA表达盒串联到一个单一质粒中,实现了高效的多个sgRNA表达,并探索了其在单个非重复基因组位点成像和活细胞中协同基因调控的应用 | 本文开发了一种无需载体的多sgRNA表达方法,提高了效率和可控性,并具有良好的扩展性 | NA | 探索CRISPR/Cas9系统在基因组编辑、基因调控和染色质研究中的应用 | 多重生物系统的研究 | 基因组学 | NA | CRISPR/Cas9系统 | NA | 基因组数据 | NA |
72 | 2024-08-07 |
Enhanced guide-RNA design and targeting analysis for precise CRISPR genome editing of single and consortia of industrially relevant and non-model organisms
2018-Jan-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btx564
PMID:28968798
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研究论文 | 本文开发了一种名为CASPER的新方法,用于增强CRISPR/Cas系统在不同生物中的基因组编辑能力,通过识别和分析非唯一(重复)目标,提高了目标和非目标预测的准确性 | CASPER方法在预测目标和非目标活动方面分别比传统方法提高了2.4%和30.2%,并支持多目标分析和多物种群体分析 | NA | 开发一种高效的基因组编辑工具,以实现非模式生物的快速菌株工程,用于合成生物学和代谢工程应用 | 非模式生物的基因组编辑 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas系统 | NA | 基因组数据 | 涉及多种工业相关生物的基因组 |
73 | 2024-08-07 |
Bacterial Genome Editing Strategy for Control of Transcription and Protein Stability
2018, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-4939-7295-1_3
PMID:29170951
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研究论文 | 本文描述了一种在埃希氏菌中标记基因的协议,允许对任何感兴趣的可溶性蛋白质进行诱导性降解和转录控制 | 利用CRISPRi和N端规则蛋白降解这两种跨界的工具,以及CRMAGE技术进行基因组编辑,并通过随机化翻译起始区域最小化标签插入的极性效应 | NA | 开发一种通用的合成生物学工具,用于控制蛋白质生产和稳定性 | 埃希氏菌中的基因和蛋白质 | 分子生物学 | NA | CRISPRi, N-end rule, CRMAGE | NA | 基因组 | NA |
74 | 2024-08-07 |
CRISPR-Cas9-Mediated Genome Editing and Transcriptional Control in Yarrowia lipolytica
2018, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-4939-7795-6_18
PMID:29754237
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研究论文 | 本文介绍了在工业重要的产油酵母Yarrowia lipolytica中使用CRISPR-Cas9系统进行基因编辑和转录调控的方法 | 开发了一套易于使用且有效的CRISPR-Cas9质粒载体,扩展了Yarrowia lipolytica的基因编辑和转录调控能力 | NA | 探索在Yarrowia lipolytica中使用CRISPR-Cas9系统进行基因编辑和转录调控的新方法 | Yarrowia lipolytica的基因编辑和转录调控 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | DNA | NA |
75 | 2024-08-07 |
Sampling molecular conformations and dynamics in a multiuser virtual reality framework
2018-06, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aat2731
PMID:29963636
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研究论文 | 本文介绍了一个在多用户虚拟现实(VR)环境中进行交互式分子动力学的框架 | 结合严格的云端原子物理模拟和商用VR硬件,使用户能够以原子级精度实时可视化和采样复杂分子结构及其动态,并在同一虚拟环境中与其他用户互动 | NA | 加速纳米尺度分子工程领域的进展,包括构象映射、药物开发、合成生物学和催化剂设计 | 复杂分子结构及其动态 | 计算机视觉 | NA | 虚拟现实(VR) | NA | 分子结构数据 | 一系列控制研究中的参与者 |
76 | 2024-08-07 |
Biotechnological approaches in glucosinolate production
2018-Dec, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.12705
PMID:30080309
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review | 本文综述了利用生物技术方法提高硫代葡萄糖苷(GLSs)产量的研究进展 | 探讨了通过优化GLS生产及其组成、合成生物学方法在异源宿主中的应用等创新技术 | NA | 旨在生成富含促进健康GLSs的资源 | 硫代葡萄糖苷(GLSs)及其在植物和微生物中的生产 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
77 | 2024-08-07 |
Modulation of the Aggregation of the Prion-like Protein RepA-WH1 by Chaperones in a Cell-Free Expression System and in Cytomimetic Lipid Vesicles
2018-09-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.8b00283
PMID:30125497
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研究论文 | 研究通过合成生物学方法,在无细胞表达系统和脂质囊泡中探讨了伴侣蛋白对类朊病毒蛋白RepA-WH1聚集的调节作用 | 首次在无细胞系统和脂质囊泡中观察到伴侣蛋白Hsp70及其辅助伴侣Hsp40和核苷酸交换因子对类朊病毒蛋白聚集的调节作用 | NA | 通过合成生物学方法解析与淀粉样蛋白病相关的分子机制 | 类朊病毒蛋白RepA-WH1及其在无细胞系统和脂质囊泡中的聚集行为 | 合成生物学 | 淀粉样蛋白病 | NA | NA | NA | NA |
78 | 2024-08-07 |
A Single-Component Optogenetic System Allows Stringent Switch of Gene Expression in Yeast Cells
2018-09-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.8b00180
PMID:30157641
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研究论文 | 本研究开发了一种名为yLightOn的单组分光控基因表达系统,用于酵母细胞 | 该系统不依赖外源辅因子,具有超过500倍的ON/OFF比率、极低的泄漏、快速的表达动力学和高空间分辨率 | NA | 研究光控基因表达系统在酵母细胞中的应用 | 酵母细胞的基因表达调控 | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | 基因表达 | NA |
79 | 2024-08-07 |
Macromolecular Crowding Induces Spatial Correlations That Control Gene Expression Bursting Patterns
2018-05-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.8b00139
PMID:29687993
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研究论文 | 本文通过在无细胞系统中同时测量mRNA和蛋白质报告分子,研究了高分子拥挤对基因表达爆发模式的影响 | 首次揭示了高分子拥挤环境如何通过创建不均匀的mRNA空间分布(空间噪声)来影响蛋白质生产的爆发大小和时间波动 | NA | 探讨高分子拥挤如何影响基因表达的爆发模式 | mRNA和蛋白质的表达模式 | 生物学 | NA | 超分辨率显微镜 | NA | mRNA和蛋白质数据 | NA |
80 | 2024-08-07 |
Peripheral infrastructure vectors and an extended set of plant parts for the Modular Cloning system
2018, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0197185
PMID:29847550
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研究论文 | 本文开发了一套包含新DNA组装标准模块的工具包,旨在增强植物合成生物学中的模块化克隆系统的多功能性。 | 提供了约80个额外的植物砖模块,包括诱导表达系统、启动子或表位标签等,并开发了连接模块化克隆和Gateway克隆的DNA模块,以及用于直接在酵母双杂交或细菌感染实验中使用编码序列植物砖的载体。 | NA | 开发新的DNA组装标准模块,以增强植物合成生物学中的模块化克隆系统的多功能性。 | 植物合成生物学中的DNA组装策略和模块化克隆系统。 | 合成生物学 | NA | Golden Gate原理,Type IIs限制性内切酶 | NA | DNA | 约80个额外的植物砖模块 |