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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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1 | 2024-11-13 |
Expanding the boundary of biocatalysis: design and optimization of in vitro tandem catalytic reactions for biochemical production
2018-04, Critical reviews in biochemistry and molecular biology
IF:6.2Q1
DOI:10.1080/10409238.2018.1431201
PMID:29411648
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综述 | 本文综述了设计和优化体外串联催化反应的策略,并讨论了该领域的未来趋势 | 本文介绍了体外串联酶催化反应的发展,以及其在生物化学生产中的应用 | NA | 探讨体外串联催化反应的设计和优化策略 | 体外串联酶催化反应 | 生物化学 | NA | 合成生物学和代谢工程工具 | NA | NA | NA |
2 | 2024-08-07 |
First characterization of a biphasic, switch-like DNA amplification
2018-Apr-16, The Analyst
DOI:10.1039/c8an00130h
PMID:29577124
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研究论文 | 本文首次报道了一种具有开关特性的双相DNA扩增化学反应 | 该化学反应具有双相特性,第一阶段后会出现前所未有的高增益产品寡核苷酸爆发的第二阶段,且第二阶段产品产量是第一阶段的10到100倍 | NA | 研究一种新型的双相DNA扩增化学反应及其应用潜力 | 双相DNA扩增化学反应的机制及其在不同领域的应用 | 合成生物学 | NA | DNA扩增 | NA | DNA | 约1 pM寡核苷酸触发剂 |
3 | 2024-08-07 |
Genome scale analysis of Escherichia coli with a comprehensive prokaryotic sequence-based biophysical model of translation initiation and elongation
2018-Apr-01, DNA research : an international journal for rapid publication of reports on genes and genomes
IF:3.9Q1
DOI:10.1093/dnares/dsx049
PMID:29161365
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研究论文 | 本研究首次提供了一个计算模拟的生物物理模型,该模型涵盖了翻译起始和延伸的所有方面,并专注于大肠杆菌基因 | 本研究首次提出了一个全面的生物物理模型,能够基于转录序列预测mRNA翻译动力学,并考虑了翻译的所有基本方面 | NA | 开发一个全面的生物物理模型,用于预测和量化翻译过程中的各种动态变化 | 大肠杆菌的基因翻译过程 | 分子生物学 | NA | 计算模拟 | 生物物理模型 | 序列数据 | NA |
4 | 2024-08-07 |
A Digitally Programmable Cytomorphic Chip for Simulation of Arbitrary Biochemical Reaction Networks
2018-04, IEEE transactions on biomedical circuits and systems
IF:3.8Q2
DOI:10.1109/TBCAS.2017.2781253
PMID:29570063
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研究论文 | 本文报道了一种数字可编程的0.35 μm BiCMOS模拟细胞形态芯片系统,能够精确模拟任意生化反应网络 | 提出了一种基于总变量和守恒定律的独特计算方法,解决了芯片制造过程中随机变化导致的偏差问题 | NA | 开发一种用于模拟任意大规模生物网络的设计、分析和仿真工具 | 数字可编程的细胞形态芯片及其在生化反应网络模拟中的应用 | 生物技术 | NA | BiCMOS | 细胞形态电路 | 电路模拟 | NA |
5 | 2024-08-07 |
HEx: A heterologous expression platform for the discovery of fungal natural products
2018-04, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aar5459
PMID:29651464
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研究论文 | 本文介绍了一种名为HEx的异源表达平台,用于快速发现真菌天然产物 | HEx平台能够快速、可扩展地表达真菌生物合成基因及其编码的代谢物,特别是对于难以培养或基因转录沉默的真菌物种 | NA | 克服天然产物发现中的瓶颈,特别是针对难以培养或基因转录沉默的真菌物种 | 真菌生物合成基因簇及其编码的代谢物 | 合成生物学 | NA | DNA测序 | NA | 基因组数据 | 41个来自世界各地不同真菌物种的生物合成基因簇,其中22个产生了可检测的化合物 |
6 | 2024-08-07 |
Gene repression via multiplex gRNA strategy in Y. lipolytica
2018-Apr-20, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-018-0909-8
PMID:29678175
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research paper | 本研究在Yarrowia lipolytica中建立了基于四种不同抑制子的CRISPRi系统,并开发了一种多重gRNA策略,用于高效地同时抑制多个目标基因和同一基因的不同位点。 | 开发了一种基于一步Golden-brick组装技术的多重gRNA策略,能够快速实现强基因抑制,无需预先筛选有效的gRNA位点。 | NA | 在Yarrowia lipolytica中建立和优化CRISPRi系统,以实现高效的基因表达调控。 | Yarrowia lipolytica中的基因表达调控。 | synthetic biology | NA | CRISPR interference (CRISPRi) | NA | NA | 使用了十种不同的gRNA,同时对gfp基因进行了三重gRNA的同时抑制。 |
7 | 2024-08-07 |
Model-based metabolism design: constraints for kinetic and stoichiometric models
2018-04-17, Biochemical Society transactions
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BST20170263
PMID:29472367
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研究论文 | 本文探讨了基于模型的代谢设计中,动力学和化学计量学模型的约束条件及其应用 | 提出了新的细胞分析方法,使得细胞大小、表面和资源平衡等约束条件的应用成为可能 | 文章指出了特定约束条件在动力学和化学计量学模型中的应用局限性 | 改进基于模型的代谢途径设计在生物体中的可行性 | 代谢工程和合成生物学中的模型设计 | 合成生物学 | NA | NA | 动力学和化学计量学模型 | NA | NA |
8 | 2024-08-07 |
A Novel Platform for Evaluating the Environmental Impacts on Bacterial Cellulose Production
2018-04-10, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-018-23701-y
PMID:29636541
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研究论文 | 本研究报告了一种新的分析平台,用于研究生产纤维素的细菌的生物学特性和优化其生长条件 | 该平台基于细菌的表面生长模式,能够确认细菌产生的纤维素微纤维在其趋化性中的关键作用,并能有效评估不同生长条件对纤维素生产的影响 | NA | 开发和优化用于大规模生产细菌纤维素的生物处理策略 | 细菌纤维素的生产及其生长条件 | 生物技术 | NA | 合成生物学 | NA | 生物数据 | NA |
9 | 2024-08-07 |
Peptide mimic for influenza vaccination using nonnatural combinatorial chemistry
2018-04-02, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI91512
PMID:29528337
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研究论文 | 本文开发了一种基于D-氨基酸组合化学的平台,用于设计一种完全人工的CD8+ T细胞激动剂,该激动剂模拟了流感病毒天然表位的免疫原性特征 | 使用非天然组合化学生成了高度稳定的抗原“模拟物”,这些模拟物在人体血清和胃酸中表现出高稳定性,并能刺激和扩展人类流感病毒特异性CD8+ T细胞 | NA | 探索合成生物学在疫苗设计和治疗递送方面的应用 | 开发一种新型的流感疫苗 | 合成生物学 | 流感 | D-氨基酸组合化学 | NA | NA | 在体外和体内实验中使用了人类和小鼠模型 |