合成生物学相关文章
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当前共找到 16 篇文献。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2024-08-05 |
Highly multiplexed, fast and accurate nanopore sequencing for verification of synthetic DNA constructs and sequence libraries
2019, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysz025
PMID:32995546
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研究论文 | 本文提出了一种利用纳米孔技术进行快速准确的DNA组装序列验证的工作流程。 | 介绍了一种新型的样本条形码系统和定制的数据分析算法，能够通过统计分析克服高错误率的问题，实现单碱基分辨率的准确序列分析。 | 研究中仍然依赖于定制的数据分析，可能对没有相关技术的实验室造成使用障碍。 | 旨在提供一种高效、低成本的DNA测序方法，以快速验证合成DNA构建。 | 处理576个DNA构建的序列验证。 | 合成生物学 | NA | 纳米孔测序 | NA | DNA序列 | 576个构建 |
| 2 | 2024-08-05 |
Optimization of ATP Synthase c-Rings for Oxygenic Photosynthesis
2019, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2019.01778
PMID:32082344
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研究论文 | 本文研究了光合ATP合成酶c-环的优化对光合光合作用的影响 | 提出了降低c-化学计量比可以提高光合作用的能量转化效率的假设 | 对环的大小变化进行数值动力学模拟，可能未考虑其他影响因素 | 探讨光合ATP合成酶的c-环对能量转化效率的影响 | 光合ATP合成酶及其原理 | 数字病理学 | NA | 数值动力学模拟 | NA | 能量存储和光化学反应中心数据 | NA |
| 3 | 2024-08-07 |
Bidirectional histone-gene promoters in Aspergillus: characterization and application for multi-gene expression
2019, Fungal biology and biotechnology
DOI:10.1186/s40694-019-0088-3
PMID:31867115
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研究论文 | 本研究对来自五个不同物种的曲霉菌中编码组蛋白H4.1和H3的基因间区域进行了表征，并展示了其在曲霉菌中的双向启动子功能。 | 发现了新的双向启动子Ph4h3，并展示了其在曲霉菌中的强组成性和多基因表达的应用潜力。 | NA | 研究曲霉菌中双向启动子的功能及其在多基因表达中的应用。 | 曲霉菌中编码组蛋白H4.1和H3的基因间区域。 | 合成生物学 | NA | NA | NA | DNA序列 | 85种曲霉菌 |
| 4 | 2024-08-07 |
Metabolic Engineering of Bacterial Respiration: High vs. Low P/O and the Case of Zymomonas mobilis
2019, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2019.00327
PMID:31781557
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研究论文 | 本文总结了当前代谢工程和合成生物学在细菌呼吸代谢中的应用，特别关注了乙醇发酵细菌的呼吸链 | 探讨了通过工程化呼吸改变能量生成效率和细胞内氧化还原状态的可能性 | NA | 分析通过代谢工程改善细菌呼吸效率及其对细胞产量、生产力和应激抵抗力的影响 | 细菌的呼吸链及其在能量和氧化还原平衡中的作用 | 代谢工程 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA |
| 5 | 2024-08-07 |
PARAGEN 1.0: A Standardized Synthetic Gene Library for Fast Cell-Free Bacteriocin Synthesis
2019, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2019.00213
PMID:31552239
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研究论文 | 本文介绍了PARAGEN 1.0，一个标准化的合成基因库，用于快速的无细胞 bacteriocin 合成 | PARAGEN 1.0是首个物理集合的bacteriocin库，允许对不同应用进行测试和比较 | NA | 开发一个用于快速无细胞bacteriocin合成的标准化合成基因库 | bacteriocin的合成及其抗菌活性 | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白合成技术 | NA | 基因序列 | 164种不同的bacteriocin |
| 6 | 2024-08-07 |
Systems and Synthetic Biology of Forest Trees: A Bioengineering Paradigm for Woody Biomass Feedstocks
2019, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2019.00775
PMID:31281326
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研究论文 | 本文探讨了利用系统生物学和合成生物学方法，对快速生长的森林种植园进行生物工程改造，以开发新一代木质生物质能源作物 | 本文提出了基于深入理解和合理设计生物部件、设备和集成系统的合成生物学和基因组编辑技术的新型生物工程方法 | 生物学的复杂性和相互作用的组件需要在大数据信息学、机器学习和直观可视化方面进行投资，以充分探索多维模式并识别生物系统的涌现属性 | 开发新一代木质生物质能源作物 | 快速生长的森林种植园及其生物化学生产平台和生物炼制厂 | 合成生物学 | NA | 多组学分析、系统建模、合成生物学、基因组编辑 | 系统遗传学模型 | 多组学数据 | 遗传变异丰富的分离树种群 |
| 7 | 2024-08-07 |
Synthetic Mutualism and the Intervention Dilemma
2019-Jan-28, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life9010015
PMID:30696090
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review | 本文综述了合成生物学在构建合成互利共生系统中的应用及其对生态系统的影响 | 探讨了合成生物学在改变特定互利共生关系中的潜力，并评估了其伦理和法律影响 | 文章主要基于理论模型和实验系统的结合，实际应用中的效果和影响可能存在不确定性 | 旨在理解合成生物学在生态系统中的应用及其对复杂关系的预测 | 合成互利共生系统和生态系统 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 8 | 2024-08-07 |
Moulding the mould: understanding and reprogramming filamentous fungal growth and morphogenesis for next generation cell factories
2019, Biotechnology for biofuels
IF:6.1Q2
DOI:10.1186/s13068-019-1400-4
PMID:30988699
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综述 | 本文综述了丝状真菌生长和形态发生与产品产量的多方面动态关系，并探讨了通过合成生物学工具进行理性菌株优化的策略 | 介绍了基于omics数据解锁关键基因以进行理性菌株优化的可能策略，并讨论了如何通过靶向遗传操作优化真菌形态以提高性能 | NA | 探讨丝状真菌生长和形态发生与产品产量的关系，以及如何通过合成生物学工具进行理性菌株优化 | 丝状真菌及其在工业应用中的生长和形态发生 | 合成生物学 | NA | 合成生物学工具 | NA | omics数据 | NA |
| 9 | 2024-08-07 |
Utilising datasheets for the informed automated design and build of a synthetic metabolic pathway
2019, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-019-0141-z
PMID:30675181
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研究论文 | 本文开发了一种自动化工作流程，用于设计和构建异源代谢途径，并展示了电子数据表在设计实验软件中的应用。 | 本文开发了软件工具，能够将数据表中的部件信息传输到设计实验软件JMP中，实现了信息在已表征信息和DoE软件之间的有效传递。 | NA | 旨在通过使用标准化和表征的生物部件，推动面向设计的合成生物学，实现异源表达系统的前向工程。 | 异源代谢途径的设计和构建。 | 合成生物学 | NA | 自动化工作流程 | NA | 数据表 | 随机样本来自番茄红素途径的设计空间 |
| 10 | 2024-08-07 |
Chasing bacterial chassis for metabolic engineering: a perspective review from classical to non-traditional microorganisms
2019-01, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.13292
PMID:29926529
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综述 | 本文综述了从传统到非传统微生物在代谢工程中作为底盘细胞的应用现状和发展前景 | 讨论了合成生物学在弥补细菌底盘基因工程工具缺乏方面的显著作用 | 目前仅有少数细菌被广泛应用于工业生物生产，且仅限于合成结构简单的化合物 | 探讨如何通过理性设计和构建稳健的细菌底盘细胞以促进代谢工程的发展 | 细菌底盘细胞及其在代谢工程中的应用 | 代谢工程 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 11 | 2024-08-07 |
Light-Controlled Mammalian Cells and Their Therapeutic Applications in Synthetic Biology
2019-Jan-09, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.201800952
PMID:30643713
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综述 | 本文综述了光控哺乳动物细胞及其在合成生物学中的治疗应用 | 结合光遗传学和治疗性合成生物学，实现了对设计细胞行为的精确非侵入性调控 | 讨论了当前光遗传学在合成生物学中的瓶颈和可能的解决方案 | 探讨光控治疗基因表达在哺乳动物细胞中的应用，以治疗疾病 | 光遗传学系统和其在哺乳动物细胞遗传编程中的应用 | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | NA | NA |
| 12 | 2024-08-07 |
Biosensor-based enzyme engineering approach applied to psicose biosynthesis
2019, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysz028
PMID:32995548
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研究论文 | 本研究探索了利用生物传感器基础的酶筛选方法来提高D-psicose（一种稀有且无毒的糖类甜味剂）的生物合成效率 | 开发了一种基于生物传感器的酶筛选方法，并创建了通用生物传感器底盘，以快速工程化任何基于转录因子的生物传感器 | NA | 提高D-psicose的生物合成效率，以满足大规模生产和成本效益的预期 | D-psicose的生物合成及其相关酶的筛选 | 生物工程 | 肥胖症，2型糖尿病 | 生物传感器，PCR | NA | 生物数据 | 七个基于先前未表征转录因子的psicose响应生物传感器，以及一系列D-psicose 3-epimerase突变体 |
| 13 | 2024-08-07 |
Functionalization of Bacterial Microcompartment Shell Proteins With Covalently Attached Heme
2019, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2019.00432
PMID:31993414
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研究论文 | 本研究利用细胞色素成熟系统I开发了一种简单方法，能够在目标蛋白质的主链中掺入血红素，特别是针对自组装的细菌微区室壳蛋白，并在蛋白质主链的多处位置插入功能性血红素 | 本研究报告了一种通用策略，用于从结构定义的蛋白质中生成电子传导细胞色素，并提供了关于血红素掺入如何与工程化蛋白质的天然组装特性相互作用的设计考虑 | 血红素结合的壳蛋白在形成更高阶壳体组装时，其大分子复合物的结构特征有时会改变 | 探索血红素在合成生物学和生物电子应用中的潜力，特别是通过在定义位置附着血红素以促进位置敏感过程如电子转移 | 细菌微区室壳蛋白及其血红素功能化 | 合成生物学 | NA | 细胞色素成熟系统I | NA | 蛋白质 | 多个位置的壳蛋白 |
| 14 | 2024-08-07 |
Isolation of Artemisia capillaris membrane-bound di-prenyltransferase for phenylpropanoids and redesign of artepillin C in yeast
2019, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-019-0630-0
PMID:31646187
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研究论文 | 本研究从艾蒿中分离出一种膜结合的双异戊二烯转移酶基因，该基因编码的酶能将两个异戊二烯残基逐步转移到咖啡酸上，生成阿特匹林C，并设计了一种酵母平台用于合成生物学中的阿特匹林C合成 | 首次鉴定出参与苯丙烷生物合成的异戊二烯转移酶，并发现了一种能够向天然底物引入多个异戊二烯残基的植物酶 | NA | 研究植物中异戊二烯化酚类代谢物的生物合成机制，并开发合成阿特匹林C的酵母平台 | 艾蒿中的膜结合双异戊二烯转移酶基因及其在阿特匹林C生物合成中的应用 | 生物技术 | NA | 异戊二烯转移酶 | NA | 基因 | NA |
| 15 | 2024-08-07 |
Polarized displacement by transcription activator-like effectors for regulatory circuits
2019-01, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-018-0163-8
PMID:30455466
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研究论文 | 本文展示了转录激活因子样效应物（TALE）能够以高度极化的方式从DNA上置换另一个TALE蛋白，仅置换3'端而非5'端重叠或相邻的TALE。 | 提出了基于TALE多部分DNA结合特性的极化置换机制，为基因表达的特异性调控、构建所有双输入布尔遗传逻辑电路、置换锌指转录因子及抑制Cas9-gRNA介导的基因组切割提供了新策略。 | NA | 探索DNA结合蛋白间相互作用在转录调控中的作用，提高设计调控电路的精确性和复杂性。 | 转录激活因子样效应物（TALE）及其在DNA上的极化置换行为。 | 合成生物学 | NA | 转录激活因子样效应物（TALE） | NA | DNA | NA |
| 16 | 2024-08-07 |
Combinatorial biosynthesis of small molecules in plants: Engineering strategies and tools
2019, Methods in enzymology
DOI:10.1016/bs.mie.2018.12.005
PMID:30784411
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研究论文 | 本文探讨了利用植物的生物合成能力生产小分子的组合策略和工具 | 本文利用合成生物学的基本原则，结合植物细胞的独特分隔和瞬时转化系统，探索了生产天然和新型定制化学品的组合方法 | NA | 研究如何利用植物作为生产高价值天然小分子的平台 | 植物的生物合成途径和相关酶类 | 合成生物学 | NA | 瞬时植物转化系统 | P450单加氧酶 | NA | NA |