合成生物学相关文章
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当前共找到 104 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-03-15 |
NNTox: Gene Ontology-Based Protein Toxicity Prediction Using Neural Network
2019-11-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-019-54405-6
PMID:31784686
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研究论文 | 本文提出了一种基于基因本体（GO）的神经网络模型NNTox，用于预测蛋白质毒性，并分析了GO术语与蛋白质毒性之间的关系 | 将通用的蛋白质功能预测方法扩展应用于毒性预测，开发了基于神经网络的模型NNTox，能够预测蛋白质的毒性可能性及具体毒性类型 | 现有方法过于特定，限制了其应用范围；模型依赖于预测的GO术语，可能受预测准确性影响 | 预测蛋白质毒性，以减少合成生物学中潜在危害风险 | 蛋白质序列及其毒性 | 生物信息学 | NA | 神经网络 | 神经网络 | 蛋白质序列和GO术语 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 2 | 2026-03-15 |
The rise of bottom-up synthetic biology and cell-free biology
2019-05-07, Physical biology
IF:2.0Q3
DOI:10.1088/1478-3975/ab1bed
PMID:31018188
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3 | 2026-03-15 |
Towards control of cellular decision-making networks in the epithelial-to-mesenchymal transition
2019-03-07, Physical biology
IF:2.0Q3
DOI:10.1088/1478-3975/aaffa1
PMID:30654341
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综述 | 本文从实验/技术和理论两个角度探讨上皮-间质转化（EMT），综述其在胚胎发育、伤口愈合和转移等生理背景下的调控网络，并介绍相关数学模型和新兴合成生物学技术 | 结合实验与理论视角，强调网络基序（如耦合反馈环）在生成上皮与间质状态间中间杂交态中的作用，并提出通过驱动网络动态向期望吸引子（如上皮细胞状态）来控制表型结果的新兴方法 | NA | 理解EMT调控网络，以开发控制细胞表型结果的方法，特别是在癌症治疗策略中 | 上皮-间质转化（EMT）的调控网络及其在胚胎发育、伤口愈合和转移中的生理背景 | 合成生物学 | 癌症 | NA | 数学模型 | NA | NA | 合成生物学技术 | 细胞 | 网络基序如耦合反馈环 | 医学 |
| 4 | 2026-03-05 |
Regulostat Inferelator: a novel network biology platform to uncover molecular devices that predetermine cellular response phenotypes
2019-08-22, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkz417
PMID:31114928
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研究论文 | 本文提出了一种名为Regulostat Inferelator（RSI）的新型网络生物学算法，用于识别能够预先决定和微调细胞表型响应的基因调控网络 | 首次开发了能够从基础转录组数据中识别具有“调节器”功能的基因对的算法，并首次提供了癌症细胞中药物-调节器相互作用的证据 | 目前仅为概念验证研究，需要进一步的实验验证 | 开发识别预先决定细胞表型响应的分子调控网络的工具 | 基因表达模式、细胞表型响应、癌症细胞 | 网络生物学 | 癌症 | 转录组数据分析 | RSI算法 | 转录组数据 | NA | NA | NA | 调节器网络（具有类似变阻器合作模式的基因对） | 医学、生物工程 |
| 5 | 2026-03-01 |
Vesicle constriction by rings of Janus nanoparticles and aggregates of curved proteins
2019-Aug-23, Nanotechnology
IF:2.9Q2
DOI:10.1088/1361-6528/ab1ed5
PMID:31048566
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研究论文 | 本文研究了Janus纳米颗粒环和弯曲蛋白质聚集体对囊泡的机械收缩作用，通过模拟和实验揭示了膜收缩的机制 | 首次报道了Janus纳米颗粒环和弯曲蛋白质聚集体作为合成纳米结构模拟收缩蛋白和支架蛋白，诱导囊泡自发收缩，并揭示了高度弯曲F-BAR结构域在细胞分裂中的重要作用 | 研究基于模拟和理论模型，可能未完全覆盖实际生物系统中的复杂动态因素，且实验验证部分未在摘要中详细说明 | 探究膜收缩和分裂的机制，设计膜收缩纳米结构以应用于合成生物学 | 囊泡、Janus纳米颗粒环、弯曲蛋白质聚集体（如DNA折纸支架） | 合成生物学 | NA | Monte Carlo模拟、模拟退火、弹性膜模型 | NA | 模拟数据 | NA | DNA折纸 | NA | NA | 合成生物学 |
| 6 | 2025-10-05 |
Advances and opportunities in gene editing and gene regulation technology for Yarrowia lipolytica
2019-Nov-29, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-019-1259-x
PMID:31783869
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综述 | 本文总结了针对解脂耶氏酵母的基因编辑与基因调控技术进展及其在合成生物学和代谢工程中的应用 | 系统梳理了CRISPR-Cas9、转座子和TALENs等新型基因编辑工具在解脂耶氏酵母中的应用进展 | NA | 总结解脂耶氏酵母基因编辑工具的发展现状并展望未来研究方向 | 解脂耶氏酵母 | 合成生物学 | NA | 基因编辑、基因调控 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, 转座子 | 解脂耶氏酵母 | 代谢工程、合成生物学回路 | 能源, 饲料, 油脂化工, 营养品, 制药, 工业生物技术 |
| 7 | 2025-10-05 |
Metrics for regulated biochemical pathway systems
2019-06-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/bty942
PMID:30428007
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研究论文 | 提出适用于静态网络和动态系统的调整后度量指标，用于量化生化途径系统中调控的重要性 | 引入考虑调控信号的调整后度量指标，弥补了传统图度量忽略调控信息的不足 | NA | 开发能够量化生化途径系统中调控重要性的度量方法 | 生化途径系统和生物网络 | 计算生物学 | NA | 网络分析 | NA | 网络数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 代谢工程 |
| 8 | 2025-10-05 |
Bioengineering tools for the production of pharmaceuticals: current perspective and future outlook
2019-12, Bioengineered
IF:4.2Q2
DOI:10.1080/21655979.2019.1682108
PMID:31656120
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综述 | 本文综述了生物工程工具在药物生产中的应用现状与未来展望 | 系统分析了植物、动物和微生物生物工程工具的最新进展，并提出通过系统生物学和合成生物学结合纳米生物工程工具提升药物生产经济可行性的新途径 | NA | 探讨生物工程工具在药物生物制品生产中的当前应用和未来发展前景 | 植物、动物和微生物生物工程工具 | NA | NA | 转录组学、蛋白质组学、代谢组学、纳米生物工程 | NA | NA | NA | NA | 植物,动物,微生物 | NA | 医药 |
| 9 | 2025-10-05 |
A metagenomic strategy for harnessing the chemical repertoire of the human microbiome
2019-12-13, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aax9176
PMID:31582523
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研究论文 | 本研究开发了一种结合计算算法与合成生物学的宏基因组策略，用于挖掘人类微生物组编码的生物活性小分子 | 首次将新型计算算法与合成生物学相结合，直接从人类微生物组宏基因组测序数据中挖掘编码的生物活性小分子 | NA | 系统揭示人类微生物组编码的化学分子库，发现介导微生物组-宿主和微生物组-微生物组相互作用的分子介质 | 人类微生物组宏基因组测序数据及其编码的生物活性小分子 | 合成生物学 | NA | 宏基因组测序 | NA | 宏基因组测序数据 | NA | 合成生物学 | NA | NA | 医学 |
| 10 | 2024-10-02 |
Biosensors-Publication Trends and Knowledge Domain Visualization
2019-Jun-09, Sensors (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/s19112615
PMID:31181820
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研究论文 | 本文利用文献计量方法分析了生物传感器领域的出版趋势和知识领域可视化 | 通过文献计量方法提供了生物传感器领域的最新发展概述，并识别了新兴子领域和研究热点 | 主要基于文献计量数据，未深入探讨具体技术细节或实验结果 | 分析生物传感器领域的出版趋势和知识领域分布 | 生物传感器领域的学术出版物 | NA | NA | 文献计量方法 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 11 | 2024-08-05 |
Inducible asymmetric cell division and cell differentiation in a bacterium
2019-09, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-019-0340-4
PMID:31406376
|
研究论文 | 本文展示了一种工程化的基因电路，可诱导大肠杆菌的不对称细胞分裂和细胞分化 | 创新之处在于利用简单的基因电路实现了细胞类型的编程分化 | 该研究未探讨基因电路在复杂环境中的应用效果 | 研究目的在于实现大肠杆菌的可编程细胞分化 | 研究对象为大肠杆菌 | 合成生物学 | NA | 基因工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 12 | 2024-08-05 |
Highly multiplexed, fast and accurate nanopore sequencing for verification of synthetic DNA constructs and sequence libraries
2019, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysz025
PMID:32995546
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研究论文 | 本文提出了一种利用纳米孔技术进行快速准确的DNA组装序列验证的工作流程。 | 介绍了一种新型的样本条形码系统和定制的数据分析算法，能够通过统计分析克服高错误率的问题，实现单碱基分辨率的准确序列分析。 | 研究中仍然依赖于定制的数据分析，可能对没有相关技术的实验室造成使用障碍。 | 旨在提供一种高效、低成本的DNA测序方法，以快速验证合成DNA构建。 | 处理576个DNA构建的序列验证。 | 合成生物学 | NA | 纳米孔测序 | NA | DNA序列 | 576个构建 | NA | NA | NA | NA |
| 13 | 2024-08-05 |
Base Editors: Modular Tools for the Introduction of Point Mutations in Living Cells
2019-Nov, Emerging topics in life sciences
IF:3.4Q1
DOI:10.1042/etls20190088
PMID:32270050
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研究论文 | 该文章介绍了一种新型的基因组编辑工具——基础编辑器，用于在活细胞中引入点突变 | 文章强调了基础编辑器的模块化特性，并展示了不同ssDNA修饰酶和Cas蛋白的组合所产生的独特性质和潜在应用 | NA | 探讨基础编辑器在合成生物学和基因组合工程中的应用及其相对于其他技术的独特优势 | 目前已报告的多种基础编辑器 | NA | NA | CRISPR | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 14 | 2024-08-05 |
Synthetic biology for bioengineering virus-like particle vaccines
2019-04, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.26890
PMID:30597533
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综述 | 本文概述了合成生物学在病毒样颗粒疫苗工程中的应用 | 探讨了合成生物学如何重新设计和构建病毒样颗粒的功能与制造过程 | 文章中提到的挑战与行业转化的具体障碍未详细列出 | 研究合成生物学在疫苗供应和疾病应对中的技术机会 | 聚焦病毒样颗粒及其在疫苗开发中的应用 | 生物工程 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 15 | 2024-08-05 |
Decoupling a tandem-repeat protein: Impact of multiple loop insertions on a modular scaffold
2019-10-28, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-019-49905-4
PMID:31659184
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研究论文 | 这篇文章探讨了线性重复蛋白的多重环插入对其模块化支架的影响 | 首次结合多重和交替环插入来研究线性重复蛋白稳定性的上下文依赖性损失 | 没有提及具体的实验数据和样本规模 | 研究线性重复蛋白结构的稳定性及其功能化的潜力 | 探讨不同位置的环插入对重复蛋白稳定性的影响 | 合成生物学 | NA | 位点特异性突变 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 16 | 2024-08-05 |
Diversification of polyketide structures via synthase engineering
2019-Aug-01, MedChemComm
DOI:10.1039/c9md00141g
PMID:32180918
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综述 | 本综述探讨多聚酮结构多样化的策略及其对药物发现的启示 | 通过合成酶工程化的方法使多聚酮的结构多样化，并控制单体选择及其他因素 | 未提及特定的实验数据或样本规模 | 研究多聚酮结构多样化的当前进展和未来方向 | 多聚酮天然产物及其合成酶 | 数字病理学 | 抗癌 | 合成酶工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 17 | 2024-08-05 |
Overcoming the challenges of cancer drug resistance through bacterial-mediated therapy
2019-Dec, Chronic diseases and translational medicine
DOI:10.1016/j.cdtm.2019.11.001
PMID:32055785
|
综述 | 本文总结了癌症治疗的抗药性及其相关机制，并探讨了细菌介导的抗癌疗法。 | 创新点在于通过合成生物学复兴了细菌介导的癌症治疗，并强调其应对传统疗法抗药性机制的独特适应性。 | 本文主要为综述，缺乏具体的实验数据和临床研究支持。 | 研究癌症药物抗性及通过细菌介导疗法克服该问题。 | 涉及多种抗癌药物的抗药性机制及细菌介导的治疗方式。 | 肿瘤病理学 | 癌症 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 18 | 2024-08-05 |
Model-Driven Engineering of N-Linked Glycosylation in Chinese Hamster Ovary Cells
2019-11-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.9b00215
PMID:31596566
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研究论文 | 本文描述了一种结合系统级动力学模型和合成生物学平台的方法，以理性调整N-链接糖基化 | 通过系统和合成生物学的结合，实现了快速假设测试和基因扰动的协同效应识别 | 未明确说明研究的具体局限性 | 增加分泌的免疫球蛋白G (IgG) 蛋白上的半乳糖纳入量 | CHO细胞和转基因细胞池 | 合成生物学 | NA | 系统动力学建模 | NA | NA | 共测试了23个转基因细胞池 | NA | NA | NA | NA |
| 19 | 2024-08-05 |
Optimization of ATP Synthase c-Rings for Oxygenic Photosynthesis
2019, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2019.01778
PMID:32082344
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研究论文 | 本文研究了光合ATP合成酶c-环的优化对光合光合作用的影响 | 提出了降低c-化学计量比可以提高光合作用的能量转化效率的假设 | 对环的大小变化进行数值动力学模拟，可能未考虑其他影响因素 | 探讨光合ATP合成酶的c-环对能量转化效率的影响 | 光合ATP合成酶及其原理 | 数字病理学 | NA | 数值动力学模拟 | NA | 能量存储和光化学反应中心数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 20 | 2024-08-07 |
Loss of Single-Domain Function in a Modular Assembly Line Alters the Size and Shape of a Complex Polyketide
2019-12-09, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.201911315
PMID:31595618
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研究论文 | 本文研究了单个β-酮处理域功能在模块化装配线中的丧失如何改变复杂聚酮化合物的尺寸和形状 | 发现了酮还原酶域在不同生物合成途径中的开关作用，以及简单点突变在I型聚酮合酶中对代谢谱的显著影响 | NA | 阐明非共线性聚酮装配中的模块跳跃因素，并探讨其可能的进化场景 | 聚酮化合物的链长和支架结构 | 生物化学 | NA | 异源表达，突变，代谢物分析，体外生物转化 | NA | 代谢物 | NA | NA | NA | NA | NA |