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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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21 | 2024-08-07 |
Metabolic Engineering of Bacterial Respiration: High vs. Low P/O and the Case of Zymomonas mobilis
2019, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2019.00327
PMID:31781557
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研究论文 | 本文总结了当前代谢工程和合成生物学在细菌呼吸代谢中的应用,特别关注了乙醇发酵细菌的呼吸链 | 探讨了通过工程化呼吸改变能量生成效率和细胞内氧化还原状态的可能性 | NA | 分析通过代谢工程改善细菌呼吸效率及其对细胞产量、生产力和应激抵抗力的影响 | 细菌的呼吸链及其在能量和氧化还原平衡中的作用 | 代谢工程 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA |
22 | 2024-08-07 |
Bioengineering tools for the production of pharmaceuticals: current perspective and future outlook
2019-12, Bioengineered
IF:4.2Q2
DOI:10.1080/21655979.2019.1682108
PMID:31656120
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综述 | 本文综述了生物工程工具在制药生物产品生产中的应用现状及未来展望 | 探讨了系统生物学和合成生物学以及转录组、蛋白质组、代谢组和纳米生物工程工具等先进技术在制药生物产品开发中的潜在影响 | NA | 旨在通过生物工程工具提高制药生产的成本效益 | 植物、动物和微生物生物工程工具及其在制药生产中的应用 | 生物工程 | NA | 转录组、蛋白质组、代谢组和纳米生物工程工具 | NA | NA | NA |
23 | 2024-08-07 |
Group A, B, C, and G Streptococcus Lancefield antigen biosynthesis is initiated by a conserved α-d-GlcNAc-β-1,4-l-rhamnosyltransferase
2019-10-18, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1074/jbc.RA119.009894
PMID:31506299
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研究论文 | 本研究通过分子生物学和合成生物学方法,结合生物化学、放射性标记技术以及NMR和MS分析,探讨了GacB在GAC生物合成途径中的作用,揭示了其在GAC致病因子生物合成中的关键作用及其在不同链球菌属中的保守性 | 首次鉴定出GacB作为α-d-GlcNAc-β-1,4-l-rhamnosyltransferase,在GAC生物合成途径中起关键作用,并发现其在不同链球菌属中的保守性 | NA | 探讨GacB在GAC生物合成途径中的作用及其在不同链球菌属中的保守性 | GacB在GAC生物合成途径中的作用及其在不同链球菌属中的保守性 | 生物化学 | NA | NMR, MS | NA | 生物分子 | 超过40种病原性链球菌属物种 |
24 | 2024-08-07 |
Drug Resistance and the Prevention Strategies in Food Borne Bacteria: An Update Review
2019-Aug, Advanced pharmaceutical bulletin
IF:3.1Q2
DOI:10.15171/apb.2019.041
PMID:31592430
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综述 | 本文综述了食品源性细菌的抗药性及其预防策略 | 探讨了多种替代传统抗生素的方法,如使用农业实践、天然抗生素、纳米抗生素、乳酸菌、细菌素、环肽、噬菌体、合成生物学和捕食性细菌 | NA | 探讨和更新食品源性细菌抗药性的预防策略 | 食品源性细菌的抗药性问题 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
25 | 2024-08-07 |
Specifications of Standards in Systems and Synthetic Biology: Status and Developments in 2019
2019-Jul-13, Journal of integrative bioinformatics
IF:1.5Q3
DOI:10.1515/jib-2019-0035
PMID:31301675
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review | 本文概述了COMBINE标准及其最新规范,涵盖了合成生物学和系统生物学中的计算模型表示格式 | 更新了SBGN、SBML、SBOL及其视觉版本的最新规范 | NA | 介绍合成生物学和系统生物学中标准规范的最新进展 | COMBINE标准及其在合成生物学和系统生物学中的应用 | systems biology | NA | NA | NA | NA | NA |
26 | 2024-08-07 |
PARAGEN 1.0: A Standardized Synthetic Gene Library for Fast Cell-Free Bacteriocin Synthesis
2019, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2019.00213
PMID:31552239
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研究论文 | 本文介绍了PARAGEN 1.0,一个标准化的合成基因库,用于快速的无细胞 bacteriocin 合成 | PARAGEN 1.0是首个物理集合的bacteriocin库,允许对不同应用进行测试和比较 | NA | 开发一个用于快速无细胞bacteriocin合成的标准化合成基因库 | bacteriocin的合成及其抗菌活性 | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白合成技术 | NA | 基因序列 | 164种不同的bacteriocin |
27 | 2024-08-07 |
De novo design of bioactive protein switches
2019-08, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-019-1432-8
PMID:31341284
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研究论文 | 本文探讨了从头设计可切换蛋白质系统的可能性,通过调节分子间和分子内相互作用来实现 | 本文设计了一种静态的五螺旋'笼'结构,具有单一界面,可以与终端'闩锁'螺旋或肽'钥匙'进行分子内或分子间相互作用,实现了功能性蛋白质开关的设计 | NA | 探索从头设计可切换蛋白质系统的可能性,并开发新的合成生物学和细胞工程方法 | 蛋白质功能的全局调控 | 生物工程 | NA | 蛋白质设计 | NA | 蛋白质结构 | NA |
28 | 2024-08-07 |
Engineered cell-to-cell signalling within growing bacterial cellulose pellicles
2019-07, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.13340
PMID:30461206
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研究论文 | 本文介绍了一种在细菌纤维素生产菌株中引入工程化细胞间通信的方法,以实现不同细胞在生长材料中检测其接近度并触发差异基因表达 | 首次在细菌纤维素生产菌株中引入工程化细胞间通信,为合成细胞间通信和工程化活体材料中的图案形成奠定了基础 | NA | 开发一种使细菌纤维素生产菌株能够响应不同位置的工具,以生长更复杂的结构化材料 | 细菌纤维素生产菌株Komagataeibacter rhaeticus | 生物技术 | NA | 合成生物学工具 | NA | NA | NA |
29 | 2024-08-07 |
Metabolic engineering of Bacillus subtilis for production of para-aminobenzoic acid - unexpected importance of carbon source is an advantage for space application
2019-07, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.13403
PMID:30980511
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研究论文 | 本文通过代谢工程改造枯草芽孢杆菌,以生产对氨基苯甲酸(pABA),并探讨了碳源在太空应用中的意外重要性 | 开发了一种融合蛋白酶(pabABC)用于碳通量的调控,并利用适应性进化创建了能代谢木糖的生产菌株 | 产品的毒性,尤其是与pH值密切相关的毒性,成为主要的限制因素 | 研究在偏远地区如火星上通过生物生产获取高强度聚合物的方法 | 对氨基苯甲酸(pABA)的生产及其在太空技术中的应用 | 生物技术 | NA | 代谢工程 | NA | NA | 在摇瓶中达到的最高产量为3.22 g/l,碳产量为12.4% [C-mol/C-mol] 来自一种氨基糖 |
30 | 2024-08-07 |
Stereoselective semi-synthesis of the neuroprotective natural product, serofendic acid
2019-Jun-01, MedChemComm
DOI:10.1039/c9md00145j
PMID:31303993
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研究论文 | 本文探讨了通过合成生物学方法半合成神经保护性天然产物serofendic酸的改进方法 | 通过使用替代还原剂、立体化学导向剂、反应顺序和产物回收,提高了C15和C16立体选择性的关键步骤 | NA | 改进serofendic酸的总合成方法 | serofendic酸的立体选择性合成 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
31 | 2024-08-07 |
Leveraging synthetic biology for producing bioactive polyketides and non-ribosomal peptides in bacterial heterologous hosts
2019-May-01, MedChemComm
DOI:10.1039/c9md00055k
PMID:31191858
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综述 | 本文综述了利用合成生物学在细菌异源宿主中生产生物活性聚酮和非核糖体肽的研究进展 | 探讨了使用合成生物学在异源宿主中生产未鉴定天然产物的新策略 | 缺乏用于优化基因簇表达和产物滴度的良好表征的遗传工具 | 探讨在异源宿主中表达天然产物基因簇的动机、理想宿主的特性、可用工具及近期进展 | 聚酮和非核糖体肽的生物活性天然产物 | 合成生物学 | NA | 下一代测序技术 | NA | 基因组序列 | NA |
32 | 2024-08-07 |
Systems and Synthetic Biology of Forest Trees: A Bioengineering Paradigm for Woody Biomass Feedstocks
2019, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2019.00775
PMID:31281326
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研究论文 | 本文探讨了利用系统生物学和合成生物学方法,对快速生长的森林种植园进行生物工程改造,以开发新一代木质生物质能源作物 | 本文提出了基于深入理解和合理设计生物部件、设备和集成系统的合成生物学和基因组编辑技术的新型生物工程方法 | 生物学的复杂性和相互作用的组件需要在大数据信息学、机器学习和直观可视化方面进行投资,以充分探索多维模式并识别生物系统的涌现属性 | 开发新一代木质生物质能源作物 | 快速生长的森林种植园及其生物化学生产平台和生物炼制厂 | 合成生物学 | NA | 多组学分析、系统建模、合成生物学、基因组编辑 | 系统遗传学模型 | 多组学数据 | 遗传变异丰富的分离树种群 |
33 | 2024-08-07 |
Modulation of Higher-order Behaviour in Model Protocell Communities by Artificial Phagocytosis
2019-05-06, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.201901469
PMID:30861271
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研究论文 | 研究通过人工吞噬作用调节模型原细胞群落的高阶行为 | 探索了合成原细胞混合群体中的集体行为,利用人工吞噬过程调节生物无机原细胞混合群体的功能和高阶行为 | NA | 研究合成原细胞群落中的集体行为及其通过人工吞噬作用的调节机制 | 酶负载的二氧化硅胶体粒子和磁性皮克林乳液(MPE)滴 | 合成生物学 | NA | 人工吞噬作用 | NA | 胶体粒子、乳液滴 | 具体数量未提及 |
34 | 2024-08-07 |
Adaptive Landscapes in the Age of Synthetic Biology
2019-05-01, Molecular biology and evolution
IF:11.0Q1
DOI:10.1093/molbev/msz004
PMID:30657938
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研究论文 | 本文重新定义了适应性景观,将其从描述性现象学转变为基于生物过程的概念,并探讨了其在预测适应过程和适应性效应分布中的应用。 | 本文将适应性景观从比喻转变为科学框架,使其能够用于测试因果假设。 | NA | 重新定义适应性景观,并探讨其在生物进化中的应用。 | 适应性景观及其在生物进化中的机制和应用。 | 生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
35 | 2024-08-07 |
Prediction and large-scale analysis of primary operons in plastids reveals unique genetic features in the evolution of chloroplasts
2019-04-23, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkz151
PMID:30828719
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研究论文 | 本文通过结合实验工具和预测模型,创建了一个针对叶绿体的操纵子数据库,并进行了大规模分析,揭示了叶绿体进化中的独特遗传特征 | 本文首次大规模分析了叶绿体中的操纵子,并利用随机森林分类器进行操纵子预测,准确率高达84% | NA | 研究叶绿体操纵子的基本特征,并利用这些特征进行操纵子预测,以促进叶绿体中的代谢工程和合成生物学 | 叶绿体中的操纵子 | 生物信息学 | NA | 逆转录聚合酶链反应(Reverse-Transcription-PCR) | 随机森林分类器 | 基因序列 | 213个基因对,来自四个进化上不同的叶绿体 |
36 | 2024-08-07 |
Direct sequencing of 2'-deoxy-2'-fluoroarabinonucleic acid (FANA) using nanopore-induced phase-shift sequencing (NIPSS)
2019-03-14, Chemical science
IF:7.6Q1
DOI:10.1039/c8sc05228j
PMID:30996894
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研究论文 | 本文首次展示了使用纳米孔诱导相移测序(NIPSS)直接测序2'-脱氧-2'-氟阿拉伯核酸(FANA)的方法 | 首次实现了糖修饰XNA的直接测序,并发现phi29 DNA聚合酶具有先前未知的FANA逆转录酶活性 | NA | 探索和验证FANA的直接测序方法 | 2'-脱氧-2'-氟阿拉伯核酸(FANA)及其测序技术 | 分子医学 | NA | 纳米孔诱导相移测序(NIPSS) | NA | NA | 不同FANA同聚物 |
37 | 2024-08-07 |
Towards control of cellular decision-making networks in the epithelial-to-mesenchymal transition
2019-03-07, Physical biology
IF:2.0Q3
DOI:10.1088/1478-3975/aaffa1
PMID:30654341
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综述 | 本文从实验/技术与理论两个角度综述了上皮-间质转化(EMT)的调控网络,并探讨了其在胚胎发育、伤口愈合和转移中的生理背景 | 介绍了新兴的合成生物技术以监测和控制细胞状态,并提出了如何驱动网络动态向所需动态吸引子(如上皮细胞状态)的理论 | NA | 旨在将关于EMT调控网络的理解转化为控制表型结果的方法,特别是在癌症治疗策略的背景下 | EMT的调控网络及其在不同生理环境中的作用 | NA | 癌症 | NA | NA | NA | NA |
38 | 2024-08-07 |
Challenges and opportunities for natural product discovery, production, and engineering in native producers versus heterologous hosts
2019-Mar, Journal of industrial microbiology & biotechnology
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10295-018-2094-5
PMID:30426283
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研究论文 | 本文探讨了天然产物发现、生产和工程化在原生生产者和异源宿主中的挑战与机遇 | 利用自然进化的力量,发现具有所需遗传适应性和更高目标天然产物产量的替代生产者,以及携带编码目标天然产物骨架进化优化同类物的基因簇的新菌株 | 在理解生物合成基因簇的沉默或激活方面仍存在许多挑战,包括关键生物合成和调节基因转录的变化 | 通过利用自然进化的力量,开发新的研究策略,填补知识空白 | 天然产物的发现、生产和工程化 | 合成生物学 | NA | 代谢途径工程 | NA | 基因簇 | NA |
39 | 2024-08-07 |
Synthetic Mutualism and the Intervention Dilemma
2019-Jan-28, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life9010015
PMID:30696090
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review | 本文综述了合成生物学在构建合成互利共生系统中的应用及其对生态系统的影响 | 探讨了合成生物学在改变特定互利共生关系中的潜力,并评估了其伦理和法律影响 | 文章主要基于理论模型和实验系统的结合,实际应用中的效果和影响可能存在不确定性 | 旨在理解合成生物学在生态系统中的应用及其对复杂关系的预测 | 合成互利共生系统和生态系统 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
40 | 2024-08-07 |
Moulding the mould: understanding and reprogramming filamentous fungal growth and morphogenesis for next generation cell factories
2019, Biotechnology for biofuels
IF:6.1Q2
DOI:10.1186/s13068-019-1400-4
PMID:30988699
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综述 | 本文综述了丝状真菌生长和形态发生与产品产量的多方面动态关系,并探讨了通过合成生物学工具进行理性菌株优化的策略 | 介绍了基于omics数据解锁关键基因以进行理性菌株优化的可能策略,并讨论了如何通过靶向遗传操作优化真菌形态以提高性能 | NA | 探讨丝状真菌生长和形态发生与产品产量的关系,以及如何通过合成生物学工具进行理性菌株优化 | 丝状真菌及其在工业应用中的生长和形态发生 | 合成生物学 | NA | 合成生物学工具 | NA | omics数据 | NA |