本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['synthetic biology']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价9.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2024-08-07 |
Exploiting Day- and Night-Time Metabolism of Synechocystis sp. PCC 6803 for Fitness-Coupled Fumarate Production around the Clock
2019-10-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.9b00289
PMID:31553573
|
研究论文 | 研究利用蓝细菌Synechocystis sp. PCC 6803的昼夜代谢特性,实现与适应性相关的富马酸持续生产 | 提出了将生长耦合生产推广到适应性耦合的新概念,并构建了首个稳定的两种策略细胞工厂 | 研究主要在实验室条件下进行,工业应用的实际效果需进一步验证 | 探索蓝细菌作为可持续生产化合物的细胞工厂的潜力,并解决其在工业应用中的稳定性问题 | 蓝细菌Synechocystis sp. PCC 6803的代谢机制及富马酸生产 | 合成生物学 | NA | 合成生物学工具 | NA | 代谢数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 22 | 2024-08-07 |
Design of Sealable Custom-Shaped Cell Mimicries Based on Self-Assembled Monolayers on CYTOP Polymer
2019-Jun-19, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.9b05073
PMID:31136146
|
研究论文 | 本文开发了一种基于CYTOP聚合物的自组装单层膜的微图案化室,用于模拟细胞或细胞器的形状和表面功能,以研究蛋白质功能。 | 通过在CYTOP聚合物表面形成自组装脂质单层,显著提高了系统的生物相容性,并成功实现了无细胞蛋白质合成。 | NA | 提供一种模拟生物系统的反应空间,特别是细胞或细胞器形状的膜隔室,以研究蛋白质功能。 | 研究蛋白质在脂质界面上的功能,特别是大肠杆菌MinDE系统的极到极振荡。 | 合成生物学 | NA | 自组装单层膜 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 23 | 2024-08-07 |
Systematic Evaluation of Genetic and Environmental Factors Affecting Performance of Translational Riboswitches
2019-04-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.9b00017
PMID:30897329
|
研究论文 | 本文通过体内功能选择和优化侧翼编码及非编码序列,显著改进了先前开发的正交核糖开关的性能 | 成功提高了蛋白质表达水平8.2倍,动态范围提升至80倍,并将其整合到四个内源性应激启动子下游,实现了高达约650倍的蛋白质表达调控 | NA | 改进核糖开关的性能,以实现更精确的基因表达调控 | 正交核糖开关及其在不同生长和诱导条件下的行为 | 合成生物学 | NA | 体内功能选择和优化 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 24 | 2024-08-07 |
Plant Synthetic Biology: Quantifying the "Known Unknowns" and Discovering the "Unknown Unknowns"
2019-03, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1104/pp.18.01222
PMID:30630870
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 25 | 2024-08-07 |
Bidirectional histone-gene promoters in Aspergillus: characterization and application for multi-gene expression
2019, Fungal biology and biotechnology
DOI:10.1186/s40694-019-0088-3
PMID:31867115
|
研究论文 | 本研究对来自五个不同物种的曲霉菌中编码组蛋白H4.1和H3的基因间区域进行了表征,并展示了其在曲霉菌中的双向启动子功能。 | 发现了新的双向启动子Ph4h3,并展示了其在曲霉菌中的强组成性和多基因表达的应用潜力。 | NA | 研究曲霉菌中双向启动子的功能及其在多基因表达中的应用。 | 曲霉菌中编码组蛋白H4.1和H3的基因间区域。 | 合成生物学 | NA | NA | NA | DNA序列 | 85种曲霉菌 | NA | NA | NA | NA |
| 26 | 2024-08-07 |
Compartments for Synthetic Cells: Osmotically Assisted Separation of Oil from Double Emulsions in a Microfluidic Chip
2019-10-15, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.201900152
PMID:31090995
|
研究论文 | 本文研究了在微流控芯片中通过双乳液微流控生产脂质体,并利用渗透压驱动的收缩实现油滴分离,以自动化控制连续生产单分散脂质体 | 发现渗透压驱动的收缩可以导致油滴分离,实现了在微流控芯片内的自动化分离过程 | NA | 研究如何通过微流控技术高效生产脂质体并解决残留油问题 | 脂质体及其在合成生物学中的应用 | 合成生物学 | NA | 微流控技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 27 | 2024-08-07 |
Optimization of the Inverted Emulsion Method for High-Yield Production of Biomimetic Giant Unilamellar Vesicles
2019-10-15, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.201900529
PMID:31529570
|
研究论文 | 本文优化了反相乳化法以高产率生产仿生巨型单层囊泡 | 本文优化了反相乳化法的多种参数,以最大化巨型单层囊泡的生产,并探讨了影响囊泡形成的关键因素 | 目前对于影响生产产率的多种参数的理解不足,导致在膜生物学和自下而上合成生物学研究领域的应用稀少 | 优化反相乳化法以促进其在基础膜生物物理学研究和未来人工细胞开发中的应用 | 巨型单层囊泡的生产方法及其参数优化 | 合成生物学 | NA | 反相乳化法 | NA | 囊泡 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 28 | 2024-08-07 |
Unearthing fungal chemodiversity and prospects for drug discovery
2019-10, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2019.03.002
PMID:31071615
|
研究论文 | 本文综述了通过改进的异源表达平台、化学和生物信息学去重复技术以及新型生物信息学平台,在真菌次级代谢产物中发现新药物的进展 | 结合真菌基因组中大量未知的生物合成基因簇,这些进展为发现新药物带来了新的希望 | NA | 探索真菌化学多样性及其在药物发现中的前景 | 真菌次级代谢产物及其生物合成基因 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 合成生物学、遗传学、天然产物化学 | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 29 | 2024-08-07 |
A designed bacterial microcompartment shell with tunable composition and precision cargo loading
2019-07, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2019.04.011
PMID:31075444
|
研究论文 | 本文设计了一种具有可调节组成和精确货物装载功能的细菌微区室壳结构,并通过晶体结构分析验证了其合成壳蛋白构建块的倒置侧向性。 | 本文创新性地设计了一种合成壳蛋白构建块,其N端和C端残基相对于自然对应物具有倒置侧向性,能够将遗传融合的蛋白货物靶向到壳的腔内,并可使用诱导型四环素启动子控制荧光蛋白货物的封装量。 | NA | 旨在通过重新设计壳结构,重现这些复杂生物结构的组织和效率,以整合来自与生物技术相关途径的非天然酶。 | 细菌微区室(BMCs)的壳结构及其在生物技术中的应用。 | 生物工程 | NA | 晶体结构分析 | NA | 蛋白质结构 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 30 | 2024-08-07 |
Metabolic Engineering of Bacterial Respiration: High vs. Low P/O and the Case of Zymomonas mobilis
2019, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2019.00327
PMID:31781557
|
研究论文 | 本文总结了当前代谢工程和合成生物学在细菌呼吸代谢中的应用,特别关注了乙醇发酵细菌的呼吸链 | 探讨了通过工程化呼吸改变能量生成效率和细胞内氧化还原状态的可能性 | NA | 分析通过代谢工程改善细菌呼吸效率及其对细胞产量、生产力和应激抵抗力的影响 | 细菌的呼吸链及其在能量和氧化还原平衡中的作用 | 代谢工程 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 31 | 2024-08-07 |
Group A, B, C, and G Streptococcus Lancefield antigen biosynthesis is initiated by a conserved α-d-GlcNAc-β-1,4-l-rhamnosyltransferase
2019-10-18, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1074/jbc.RA119.009894
PMID:31506299
|
研究论文 | 本研究通过分子生物学和合成生物学方法,结合生物化学、放射性标记技术以及NMR和MS分析,探讨了GacB在GAC生物合成途径中的作用,揭示了其在GAC致病因子生物合成中的关键作用及其在不同链球菌属中的保守性 | 首次鉴定出GacB作为α-d-GlcNAc-β-1,4-l-rhamnosyltransferase,在GAC生物合成途径中起关键作用,并发现其在不同链球菌属中的保守性 | NA | 探讨GacB在GAC生物合成途径中的作用及其在不同链球菌属中的保守性 | GacB在GAC生物合成途径中的作用及其在不同链球菌属中的保守性 | 生物化学 | NA | NMR, MS | NA | 生物分子 | 超过40种病原性链球菌属物种 | NA | NA | NA | NA |
| 32 | 2024-08-07 |
Drug Resistance and the Prevention Strategies in Food Borne Bacteria: An Update Review
2019-Aug, Advanced pharmaceutical bulletin
IF:3.1Q2
DOI:10.15171/apb.2019.041
PMID:31592430
|
综述 | 本文综述了食品源性细菌的抗药性及其预防策略 | 探讨了多种替代传统抗生素的方法,如使用农业实践、天然抗生素、纳米抗生素、乳酸菌、细菌素、环肽、噬菌体、合成生物学和捕食性细菌 | NA | 探讨和更新食品源性细菌抗药性的预防策略 | 食品源性细菌的抗药性问题 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 33 | 2024-08-07 |
Specifications of Standards in Systems and Synthetic Biology: Status and Developments in 2019
2019-Jul-13, Journal of integrative bioinformatics
IF:1.5Q3
DOI:10.1515/jib-2019-0035
PMID:31301675
|
review | 本文概述了COMBINE标准及其最新规范,涵盖了合成生物学和系统生物学中的计算模型表示格式 | 更新了SBGN、SBML、SBOL及其视觉版本的最新规范 | NA | 介绍合成生物学和系统生物学中标准规范的最新进展 | COMBINE标准及其在合成生物学和系统生物学中的应用 | systems biology | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 34 | 2024-08-07 |
PARAGEN 1.0: A Standardized Synthetic Gene Library for Fast Cell-Free Bacteriocin Synthesis
2019, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2019.00213
PMID:31552239
|
研究论文 | 本文介绍了PARAGEN 1.0,一个标准化的合成基因库,用于快速的无细胞 bacteriocin 合成 | PARAGEN 1.0是首个物理集合的bacteriocin库,允许对不同应用进行测试和比较 | NA | 开发一个用于快速无细胞bacteriocin合成的标准化合成基因库 | bacteriocin的合成及其抗菌活性 | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白合成技术 | NA | 基因序列 | 164种不同的bacteriocin | NA | NA | NA | NA |
| 35 | 2024-08-07 |
De novo design of bioactive protein switches
2019-08, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-019-1432-8
PMID:31341284
|
研究论文 | 本文探讨了从头设计可切换蛋白质系统的可能性,通过调节分子间和分子内相互作用来实现 | 本文设计了一种静态的五螺旋'笼'结构,具有单一界面,可以与终端'闩锁'螺旋或肽'钥匙'进行分子内或分子间相互作用,实现了功能性蛋白质开关的设计 | NA | 探索从头设计可切换蛋白质系统的可能性,并开发新的合成生物学和细胞工程方法 | 蛋白质功能的全局调控 | 生物工程 | NA | 蛋白质设计 | NA | 蛋白质结构 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 36 | 2024-08-07 |
Engineered cell-to-cell signalling within growing bacterial cellulose pellicles
2019-07, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.13340
PMID:30461206
|
研究论文 | 本文介绍了一种在细菌纤维素生产菌株中引入工程化细胞间通信的方法,以实现不同细胞在生长材料中检测其接近度并触发差异基因表达 | 首次在细菌纤维素生产菌株中引入工程化细胞间通信,为合成细胞间通信和工程化活体材料中的图案形成奠定了基础 | NA | 开发一种使细菌纤维素生产菌株能够响应不同位置的工具,以生长更复杂的结构化材料 | 细菌纤维素生产菌株Komagataeibacter rhaeticus | 生物技术 | NA | 合成生物学工具 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 37 | 2024-08-07 |
Metabolic engineering of Bacillus subtilis for production of para-aminobenzoic acid - unexpected importance of carbon source is an advantage for space application
2019-07, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.13403
PMID:30980511
|
研究论文 | 本文通过代谢工程改造枯草芽孢杆菌,以生产对氨基苯甲酸(pABA),并探讨了碳源在太空应用中的意外重要性 | 开发了一种融合蛋白酶(pabABC)用于碳通量的调控,并利用适应性进化创建了能代谢木糖的生产菌株 | 产品的毒性,尤其是与pH值密切相关的毒性,成为主要的限制因素 | 研究在偏远地区如火星上通过生物生产获取高强度聚合物的方法 | 对氨基苯甲酸(pABA)的生产及其在太空技术中的应用 | 生物技术 | NA | 代谢工程 | NA | NA | 在摇瓶中达到的最高产量为3.22 g/l,碳产量为12.4% [C-mol/C-mol] 来自一种氨基糖 | NA | NA | NA | NA |
| 38 | 2024-08-07 |
Stereoselective semi-synthesis of the neuroprotective natural product, serofendic acid
2019-Jun-01, MedChemComm
DOI:10.1039/c9md00145j
PMID:31303993
|
研究论文 | 本文探讨了通过合成生物学方法半合成神经保护性天然产物serofendic酸的改进方法 | 通过使用替代还原剂、立体化学导向剂、反应顺序和产物回收,提高了C15和C16立体选择性的关键步骤 | NA | 改进serofendic酸的总合成方法 | serofendic酸的立体选择性合成 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 39 | 2024-08-07 |
Leveraging synthetic biology for producing bioactive polyketides and non-ribosomal peptides in bacterial heterologous hosts
2019-May-01, MedChemComm
DOI:10.1039/c9md00055k
PMID:31191858
|
综述 | 本文综述了利用合成生物学在细菌异源宿主中生产生物活性聚酮和非核糖体肽的研究进展 | 探讨了使用合成生物学在异源宿主中生产未鉴定天然产物的新策略 | 缺乏用于优化基因簇表达和产物滴度的良好表征的遗传工具 | 探讨在异源宿主中表达天然产物基因簇的动机、理想宿主的特性、可用工具及近期进展 | 聚酮和非核糖体肽的生物活性天然产物 | 合成生物学 | NA | 下一代测序技术 | NA | 基因组序列 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 40 | 2024-08-07 |
Systems and Synthetic Biology of Forest Trees: A Bioengineering Paradigm for Woody Biomass Feedstocks
2019, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2019.00775
PMID:31281326
|
研究论文 | 本文探讨了利用系统生物学和合成生物学方法,对快速生长的森林种植园进行生物工程改造,以开发新一代木质生物质能源作物 | 本文提出了基于深入理解和合理设计生物部件、设备和集成系统的合成生物学和基因组编辑技术的新型生物工程方法 | 生物学的复杂性和相互作用的组件需要在大数据信息学、机器学习和直观可视化方面进行投资,以充分探索多维模式并识别生物系统的涌现属性 | 开发新一代木质生物质能源作物 | 快速生长的森林种植园及其生物化学生产平台和生物炼制厂 | 合成生物学 | NA | 多组学分析、系统建模、合成生物学、基因组编辑 | 系统遗传学模型 | 多组学数据 | 遗传变异丰富的分离树种群 | NA | NA | NA | NA |