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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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41 | 2024-08-07 |
Moulding the mould: understanding and reprogramming filamentous fungal growth and morphogenesis for next generation cell factories
2019, Biotechnology for biofuels
IF:6.1Q2
DOI:10.1186/s13068-019-1400-4
PMID:30988699
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综述 | 本文综述了丝状真菌生长和形态发生与产品产量的多方面动态关系,并探讨了通过合成生物学工具进行理性菌株优化的策略 | 介绍了基于omics数据解锁关键基因以进行理性菌株优化的可能策略,并讨论了如何通过靶向遗传操作优化真菌形态以提高性能 | NA | 探讨丝状真菌生长和形态发生与产品产量的关系,以及如何通过合成生物学工具进行理性菌株优化 | 丝状真菌及其在工业应用中的生长和形态发生 | 合成生物学 | NA | 合成生物学工具 | NA | omics数据 | NA |
42 | 2024-08-07 |
Glycan-decorated protocells: novel features for rebuilding cellular processes
2019-Apr-06, Interface focus
IF:3.6Q1
DOI:10.1098/rsfs.2018.0084
PMID:30842879
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综述 | 本文综述了在合成生物学中,如何利用脂质囊泡作为原细胞模型,特别是通过整合糖萼成分到脂质双层中,来研究细胞过程的新特性 | 本文首次介绍了将糖缀合物整合到巨型单层脂质囊泡(GUVs)的膜中,并探讨了这些最小膜系统在揭示细胞过程分子机制中的作用 | NA | 探讨糖基修饰的原细胞在研究细胞间相互作用(如粘附和通信)中的应用潜力 | 脂质囊泡、糖萼成分、糖脂质介导的内吞作用、原组织 | 合成生物学 | NA | 脂质囊泡制备、生物物理特性表征 | NA | NA | NA |
43 | 2024-08-07 |
Comparative proteomic analysis of four biotechnological strains Lactococcus lactis through label-free quantitative proteomics
2019-03, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.13305
PMID:30341804
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研究论文 | 本研究通过无标记定量蛋白质组学分析了四种生物技术菌株Lactococcus lactis的核心蛋白质组 | 本研究首次通过无标记定量蛋白质组学技术,详细分析了四种Lactococcus lactis菌株的核心蛋白质组,并发现了与翻译过程相关的高丰度蛋白质以及特定亚种独有的保守蛋白质 | NA | 旨在深入理解Lactococcus lactis的细胞功能及其在合成生物学中的应用 | 四种生物技术菌株Lactococcus lactis的核心蛋白质组 | 生物技术 | NA | 无标记定量蛋白质组学 | NA | 蛋白质组数据 | 四种Lactococcus lactis菌株,包括L. lactis subsp. lactis NCDO2118, L. lactis subsp. lactis IL1403, L. lactis subsp. cremoris NZ9000和L. lactis subsp. cremoris MG1363 |
44 | 2024-08-07 |
Engineering and modification of microbial chassis for systems and synthetic biology
2019-Mar, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2018.12.001
PMID:30560208
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综述 | 本文综述了微生物底盘的工程化与改造,及其在系统生物学和合成生物学中的应用 | 介绍了通过基因组缩减和基因组合成的两种主要策略来构建微生物底盘,并举例说明了相关项目的成果 | NA | 探讨微生物底盘的工程化与改造,以揭示生命基本原理并增强其在多个工业领域的应用 | 微生物底盘及其在健康、医药、农业、兽医和食品行业的应用 | 合成生物学 | NA | 基因组缩减,基因组合成 | NA | NA | NA |
45 | 2024-08-07 |
Twenty-first-century chemical odyssey: fuels versus commodities and cell factories versus chemical plants
2019-03, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.13379
PMID:30793487
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综述 | 本文探讨了利用合成生物学开发新型生物合成途径,以替代传统工业方法合成化学品的潜力 | 提出了一种利用非食用木质纤维素作为可持续有机碳源的新型能源生物过程 | 目前基于淀粉或木质纤维素的工业过程数量仍然很少,需要更有效的植物材料分解方法和新的有用基因的识别 | 研究如何通过合成生物学实现工业向可再生能源的转变 | 非食用木质纤维素和合成生物学在化学品生物合成中的应用 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
46 | 2024-08-07 |
Omnipresent Maxwell's demons orchestrate information management in living cells
2019-03, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.13378
PMID:30806035
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研究论文 | 本文探讨了合成生物学中对生命细胞构建和运作至关重要的功能,特别是那些以非预期方式消耗能量的功能,并展示了这些功能如何作为信息管理的实体实现,类似于麦克斯韦妖(MxD)。 | 本文首次展示了生命细胞中的多种功能,如转运蛋白和核糖体构建机制,如何作为麦克斯韦妖的物质实现,以高效能的方式进行计算。 | NA | 旨在深入理解合成生物学中生命细胞构建和运作的关键功能。 | 研究对象包括生命细胞中的最小基因组编码的功能,特别是那些以非预期方式消耗能量的功能。 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
47 | 2024-08-07 |
Anticipating governance challenges in synthetic biology: Insights from biosynthetic menthol
2019-Feb, Technological forecasting and social change
IF:12.9Q1
DOI:10.1016/j.techfore.2018.11.020
PMID:30774160
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研究论文 | 本文通过一个端到端的评估方法,探讨了合成生物学领域中生物合成薄荷醇的技术转变及其治理挑战 | 提出了一个预测性治理框架,用于研究新兴技术的潜在影响,并为其准备 | NA | 探讨合成生物学中生物合成薄荷醇的技术转变及其治理挑战 | 生物合成薄荷醇的技术及其社会技术转变 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | 文本 | NA |
48 | 2024-08-07 |
Standardizing Automated DNA Assembly: Best Practices, Metrics, and Protocols Using Robots
2019-06, SLAS technology
IF:2.5Q3
DOI:10.1177/2472630318825335
PMID:30768372
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研究论文 | 本文探讨了标准化自动化DNA组装的最佳实践、指标和协议,使用机器人进行高效和高通量的DNA片段组装 | 开发了一种新的DNA组装指标(Q-metric)和软件工具Puppeteer,用于评估自动化方法相对于传统手动操作的优势 | NA | 开发和测试协议、硬件和软件,以通过可量化的指标优化DNA组装 | DNA组装的标准化、高效和可重复的MoClo协议 | 合成生物学 | NA | 自动化DNA组装 | NA | DNA序列 | 多个不同的DNA组装配置 |
49 | 2024-08-07 |
Synthetic Biology Tools to Engineer Microbial Communities for Biotechnology
2019-02, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2018.11.002
PMID:30497870
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综述 | 本文综述了合成生物学工具和方法在工程化微生物群落中的最新进展 | 讨论了利用微生物群落进行各种生物技术应用的持续和新兴努力,并提出了未来的应用方向 | NA | 探讨合成生物学工具在微生物群落工程中的应用及其未来潜力 | 微生物群落及其在生物技术中的应用 | 合成生物学 | NA | 合成生物学工具 | NA | NA | NA |
50 | 2024-08-07 |
Utilising datasheets for the informed automated design and build of a synthetic metabolic pathway
2019, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-019-0141-z
PMID:30675181
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研究论文 | 本文开发了一种自动化工作流程,用于设计和构建异源代谢途径,并展示了电子数据表在设计实验软件中的应用。 | 本文开发了软件工具,能够将数据表中的部件信息传输到设计实验软件JMP中,实现了信息在已表征信息和DoE软件之间的有效传递。 | NA | 旨在通过使用标准化和表征的生物部件,推动面向设计的合成生物学,实现异源表达系统的前向工程。 | 异源代谢途径的设计和构建。 | 合成生物学 | NA | 自动化工作流程 | NA | 数据表 | 随机样本来自番茄红素途径的设计空间 |
51 | 2024-08-07 |
Chasing bacterial chassis for metabolic engineering: a perspective review from classical to non-traditional microorganisms
2019-01, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.13292
PMID:29926529
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综述 | 本文综述了从传统到非传统微生物在代谢工程中作为底盘细胞的应用现状和发展前景 | 讨论了合成生物学在弥补细菌底盘基因工程工具缺乏方面的显著作用 | 目前仅有少数细菌被广泛应用于工业生物生产,且仅限于合成结构简单的化合物 | 探讨如何通过理性设计和构建稳健的细菌底盘细胞以促进代谢工程的发展 | 细菌底盘细胞及其在代谢工程中的应用 | 代谢工程 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
52 | 2024-08-07 |
Light-Controlled Mammalian Cells and Their Therapeutic Applications in Synthetic Biology
2019-Jan-09, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.201800952
PMID:30643713
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综述 | 本文综述了光控哺乳动物细胞及其在合成生物学中的治疗应用 | 结合光遗传学和治疗性合成生物学,实现了对设计细胞行为的精确非侵入性调控 | 讨论了当前光遗传学在合成生物学中的瓶颈和可能的解决方案 | 探讨光控治疗基因表达在哺乳动物细胞中的应用,以治疗疾病 | 光遗传学系统和其在哺乳动物细胞遗传编程中的应用 | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | NA | NA |
53 | 2024-08-07 |
Modulation of miRNA function by natural and synthetic RNA-binding proteins in cancer
2019-Oct, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-019-03163-9
PMID:31165201
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研究论文 | 本文探讨了RNA结合蛋白(RBPs)和微小RNA(miRNAs)在癌症中的相互作用及其对mRNA稳定性和翻译的调控 | 文章介绍了人工RNA结合蛋白的最新发展,这有助于更深入地理解RBPs和miRNAs之间的功能相互作用,并可能用于治疗目的 | 文章指出,miRNAs和RNA结合蛋白之间的协同作用和拮抗作用的规则仍然不明确 | 研究RBPs和miRNAs在癌症发展中的调控机制及其相互作用 | 研究对象包括RBPs和miRNAs在细胞中的相互作用及其对mRNA稳定性和翻译的影响 | NA | 癌症 | NA | NA | NA | NA |
54 | 2024-08-07 |
Synthetic development: building mammalian multicellular structures with artificial genetic programs
2019-10, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2019.03.016
PMID:31128430
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研究论文 | 本文探讨了使用人工遗传程序构建哺乳动物多细胞结构的方法 | 介绍了合成发育程序在多细胞哺乳动物系统中的应用,利用工程化的细胞间通信、多细胞基因调控网络和效应基因 | NA | 探索合成生物学在发育生物学和组织发育领域的新应用 | 哺乳动物多细胞结构 | 合成生物学 | NA | 人工遗传程序 | NA | NA | NA |
55 | 2024-08-07 |
Development of a Split Esterase for Protein-Protein Interaction-Dependent Small-Molecule Activation
2019-Nov-27, ACS central science
IF:12.7Q1
DOI:10.1021/acscentsci.9b00567
PMID:31807678
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研究论文 | 本文开发了一种基于蛋白质相互作用依赖的小分子激活的分离酯酶系统 | 首次提出了一种基于蛋白质相互作用依赖的小分子激活的分离酯酶系统,该系统能够选择性地在相互作用依赖的方式下解除酯保护的小分子 | NA | 开发一种新的生物传感系统,用于在生物系统中基于测量输入信号生成目标小分子 | 分离酯酶系统及其在蛋白质相互作用检测和细胞杀伤中的应用 | 合成生物学 | NA | 分离酯酶系统 | NA | NA | NA |
56 | 2024-08-07 |
Noise-reducing optogenetic negative-feedback gene circuits in human cells
2019-08-22, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkz556
PMID:31269201
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研究论文 | 本文通过在哺乳动物细胞中构建光遗传学基因回路,实现了通过遗传和体外负反馈来精确控制基因表达的噪声降低 | 开发了一种新的光遗传学工具集,称为噪声降低的光诱导调节器(LITer),通过融合TetR抑制子和Tet抑制肽(TIP)或降解标签,实现了高达5倍的噪声降低 | NA | 研究基因表达噪声降低及其在生物医学领域的应用 | 哺乳动物细胞中的基因表达控制 | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | 基因表达数据 | NA |
57 | 2024-08-07 |
Rapid screening of engineered microbial therapies in a 3D multicellular model
2019-04-30, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1820824116
PMID:30996123
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研究论文 | 本文介绍了一种细菌-球状体共培养(BSCC)平台,用于在多细胞球状体中同时测试宿主物种、治疗有效载荷和工程细菌的合成基因回路,并在几周的时间尺度上进行长期监测。 | 该平台能够高吞吐量地筛选工程微生物疗法,并动态分析多种微生物物种及其在不同宿主细胞类型中的作用。 | NA | 加速合成生物学在临床应用中的发展,并深入理解疾病部位的宿主-微生物相互作用。 | 工程细菌的宿主物种、治疗有效载荷和合成基因回路。 | 合成生物学 | 炎症、感染、代谢紊乱、癌症 | NA | NA | 多细胞球状体 | 多种微生物物种和宿主细胞类型 |
58 | 2024-08-07 |
Biosensor-based enzyme engineering approach applied to psicose biosynthesis
2019, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysz028
PMID:32995548
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研究论文 | 本研究探索了利用生物传感器基础的酶筛选方法来提高D-psicose(一种稀有且无毒的糖类甜味剂)的生物合成效率 | 开发了一种基于生物传感器的酶筛选方法,并创建了通用生物传感器底盘,以快速工程化任何基于转录因子的生物传感器 | NA | 提高D-psicose的生物合成效率,以满足大规模生产和成本效益的预期 | D-psicose的生物合成及其相关酶的筛选 | 生物工程 | 肥胖症,2型糖尿病 | 生物传感器,PCR | NA | 生物数据 | 七个基于先前未表征转录因子的psicose响应生物传感器,以及一系列D-psicose 3-epimerase突变体 |
59 | 2024-08-07 |
Emerging Cellular Therapies for Cancer
2019-04-26, Annual review of immunology
IF:26.9Q1
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研究论文 | 本文探讨了基因工程改造的T细胞作为新型抗癌药物的潜力及其在癌症治疗中的应用 | 介绍了合成生物学方法在细胞工程中的应用,为免疫细胞编程提供了更广泛的工具集 | NA | 探索基因工程T细胞在癌症治疗中的应用及其潜在的扩展领域 | 基因工程T细胞及其在癌症、传染病、器官移植和自身免疫疾病中的应用 | NA | 癌症 | 基因编辑 | NA | NA | NA |
60 | 2024-08-07 |
Structural organization of biocatalytic systems: the next dimension of synthetic metabolism
2019-Nov-11, Emerging topics in life sciences
IF:3.4Q1
DOI:10.1042/ETLS20190015
PMID:33523157
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综述 | 本文综述了体外合成代谢网络(SIVMNs)的结构组织及其在提高效率和生产力方面的重要性 | 探讨了如何通过结构组织优化合成代谢网络,以减少有害副反应、有效利用可再生能源并提高生产力 | NA | 探讨如何进一步发展体外合成代谢网络,通过结构组织优化其性能 | 体外合成代谢网络(SIVMNs)及其反应的结构组织 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |