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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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61 | 2024-08-07 |
Physicochemical considerations for bottom-up synthetic biology
2019-11-11, Emerging topics in life sciences
IF:3.4Q1
DOI:10.1042/ETLS20190017
PMID:33523159
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综述 | 文章综述了从分子组件构建合成细胞的挑战性研究领域,特别是生物系统在合成囊泡中限制的影响 | NA | NA | 探讨构建合成细胞所需的物理化学考虑 | 合成细胞的内部pH、离子强度、大分子拥挤、氧化还原状态及代谢能量守恒 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
62 | 2024-08-07 |
Modeling population dynamics in a microbial consortium under control of a synthetic pheromone-mediated communication system
2019-Jun, Engineering in life sciences
IF:3.9Q2
DOI:10.1002/elsc.201800107
PMID:32625018
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研究论文 | 本文通过合成生物学方法构建了一个由两种菌株组成的模型共生体,其中接收菌株的生长和荧光标记蛋白EGFP的表达受发射菌株产生的α-因子信息素浓度控制,并开发了一个定量的实验和理论框架来描述模型共生体中的种群动态 | 本文开发了一个定量的实验和理论框架,用于描述受合成信息素介导的通信系统控制的微生物共生体中的种群动态 | NA | 研究如何通过合成生物学方法控制微生物共生体的行为,以应用于复杂的生物转化过程 | 由两种菌株组成的模型共生体,其中一种菌株产生α-因子信息素,另一种菌株受信息素浓度控制生长和表达荧光标记蛋白EGFP | 合成生物学 | NA | 流式细胞术 | 数学模型 | 生物数据 | 两种菌株的共生体在不同培养条件下的实验数据 |
63 | 2024-08-07 |
Recent advances in natural products exploitation in Streptomyces via synthetic biology
2019-Jun, Engineering in life sciences
IF:3.9Q2
DOI:10.1002/elsc.201800137
PMID:32625022
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综述 | 本文综述了利用合成生物学在链霉菌中开发天然产物的新进展 | 合成生物学作为一种新的生物工程平台,被用于发现新的生物活性化合物并扩大生物活性天然产物的多样性和生产 | NA | 探讨合成生物学在天然产物开发中的应用 | 链霉菌中的天然产物 | 合成生物学 | NA | 合成生物学工具 | NA | NA | NA |
64 | 2024-08-07 |
Lignin valorization meets synthetic biology
2019-Jun, Engineering in life sciences
IF:3.9Q2
DOI:10.1002/elsc.201800133
PMID:32625023
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综述 | 本文综述了合成生物技术在木质素转化中的应用,特别是生产高价值产品如芳香化学品、环裂解化学品和生物活性物质 | 合成生物技术为木质素的高值化利用提供了新的潜在策略,包括优化木质素降解酶、构建新型人工转化途径和改进模型微生物底盘 | NA | 探讨合成生物技术在木质素转化中的应用,以实现木质素的高值化利用 | 木质素及其转化产物 | 合成生物学 | NA | 合成生物技术 | NA | NA | NA |
65 | 2024-08-07 |
Rapid in vitro production of single-stranded DNA
2019-12-16, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkz998
PMID:31713635
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研究论文 | 本文介绍了一种快速、高产且用户友好的体外生产高纯度单链DNA的方法 | 提出了一种新的方法,通过PCR和甲醇响应聚合物生成标记的扩增子,实现选择性沉淀修饰链,从而高效生产单链DNA | NA | 开发一种新的方法来生产高纯度、长链的单链DNA | 单链DNA的生产方法及其在合成生物学、生物成像和生物纳米技术中的应用 | 合成生物学 | NA | PCR | NA | DNA | NA |
66 | 2024-08-07 |
Rock-paper-scissors: Engineered population dynamics increase genetic stability
2019-09-06, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aaw0542
PMID:31488693
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研究论文 | 本文通过设计生态互动的循环种群控制策略,提高了细菌基因电路的稳定性 | 采用生态互动的循环种群控制策略,通过“石头-剪刀-布”动态,实现了基因电路功能的稳定性提升 | NA | 探索通过生态互动策略提高工程细菌基因稳定性的方法 | 设计的三种细菌株及其在微流控设备中的相互作用 | 合成生物学 | NA | 微流控技术 | NA | 细胞培养 | 三种细菌株 |
67 | 2024-08-07 |
Exploiting the Feedstock Flexibility of the Emergent Synthetic Biology Chassis Vibrio natriegens for Engineered Natural Product Production
2019-Nov-30, Marine drugs
IF:4.9Q1
DOI:10.3390/md17120679
PMID:31801279
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研究论文 | 研究利用新兴合成生物学底盘Vibrio natriegens的原料灵活性,进行异源天然产物生产 | 首次探索了Vibrio natriegens作为合成生物学底盘在多种工业相关原料下生产天然产物的能力 | NA | 评估Vibrio natriegens作为合成生物学底盘生产天然产物的潜力 | Vibrio natriegens的异源天然产物生产能力,特别是β-胡萝卜素和紫胶素 | 合成生物学 | NA | 基因表达 | NA | 生物数据 | NA |
68 | 2024-08-07 |
From Endogenous to Synthetic microRNA-Mediated Regulatory Circuits: An Overview
2019-11-29, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells8121540
PMID:31795372
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综述 | 本文综述了微小RNA(microRNA)在基因调控网络中的作用及其在合成生物学中的应用 | 介绍了人工合成电路在实验中测试microRNA调控任务的应用,并探讨了其在临床应用中的潜力 | NA | 综述microRNA介导的调控电路及其在合成生物学中的最新进展 | microRNA及其在生物网络中的作用和人工合成电路的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
69 | 2024-08-07 |
"Cell-Free Synthetic Biology": Synthetic Biology Meets Cell-Free Protein Synthesis
2019-Oct-08, Methods and protocols
IF:2.3Q3
DOI:10.3390/mps2040080
PMID:31597405
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review | 本文综述了细胞自由合成生物学的发展及其在多个领域的应用 | 细胞自由合成生物学结合了细胞自由蛋白合成与合成生物学,提供了一种强大且快速的工具来表征和工程化自然生物系统 | NA | 探讨细胞自由合成生物学的当前发展和应用 | 细胞自由合成生物学技术及其在生物网络调试、人工细胞构建、蛋白质库筛选等方面的应用 | 合成生物学 | NA | 细胞自由蛋白合成 (CFPS) | NA | 蛋白质 | NA |
70 | 2024-08-07 |
Functionalization of Bacterial Microcompartment Shell Proteins With Covalently Attached Heme
2019, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2019.00432
PMID:31993414
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研究论文 | 本研究利用细胞色素成熟系统I开发了一种简单方法,能够在目标蛋白质的主链中掺入血红素,特别是针对自组装的细菌微区室壳蛋白,并在蛋白质主链的多处位置插入功能性血红素 | 本研究报告了一种通用策略,用于从结构定义的蛋白质中生成电子传导细胞色素,并提供了关于血红素掺入如何与工程化蛋白质的天然组装特性相互作用的设计考虑 | 血红素结合的壳蛋白在形成更高阶壳体组装时,其大分子复合物的结构特征有时会改变 | 探索血红素在合成生物学和生物电子应用中的潜力,特别是通过在定义位置附着血红素以促进位置敏感过程如电子转移 | 细菌微区室壳蛋白及其血红素功能化 | 合成生物学 | NA | 细胞色素成熟系统I | NA | 蛋白质 | 多个位置的壳蛋白 |
71 | 2024-08-07 |
Two New Plasmid Post-segregational Killing Mechanisms for the Implementation of Synthetic Gene Networks in Escherichia coli
2019-Apr-26, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2019.03.019
PMID:30954530
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研究论文 | 本文展示了axe/txe毒素-抗毒素系统和微囊素-V细菌素系统在益生菌大肠杆菌Nissle 1917中的质粒稳定化能力,并证明它们可以超越常用的hok/sok系统 | 开发了两种新的质粒后分离杀伤机制,并应用贝叶斯统计方法量化了体外质粒稳定性 | NA | 探索和验证新的质粒稳定化机制,以应用于工业和合成生物学 | 大肠杆菌Nissle 1917中的质粒稳定性和其在体内外的表现 | 合成生物学 | NA | 自动化流式细胞分析,数学模型,贝叶斯统计 | NA | 细胞 | NA |
72 | 2024-08-07 |
Modulating Mistranslation Potential of tRNASer in Saccharomyces cerevisiae
2019-11, Genetics
IF:3.3Q2
DOI:10.1534/genetics.119.302525
PMID:31484688
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研究论文 | 研究通过引入次级突变调节tRNASer在酵母中的错译潜力 | 通过遗传选择识别出22种次级突变,这些突变主要位于单链区域或替换G:U碱基对为Watson-Crick对,允许非毒性错译 | 多数次级突变影响tRNA在细胞中的稳定性,且在低温下更具毒性 | 识别调节tRNA错译水平的次级位点替换 | tRNASer在Saccharomyces cerevisiae中的错译潜力 | NA | NA | 遗传选择 | NA | 蛋白质组分析 | NA |
73 | 2024-08-07 |
The Synthetic Biology Toolkit for Photosynthetic Microorganisms
2019-09, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1104/pp.19.00345
PMID:31262955
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
74 | 2024-08-07 |
Isolation of Artemisia capillaris membrane-bound di-prenyltransferase for phenylpropanoids and redesign of artepillin C in yeast
2019, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-019-0630-0
PMID:31646187
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研究论文 | 本研究从艾蒿中分离出一种膜结合的双异戊二烯转移酶基因,该基因编码的酶能将两个异戊二烯残基逐步转移到咖啡酸上,生成阿特匹林C,并设计了一种酵母平台用于合成生物学中的阿特匹林C合成 | 首次鉴定出参与苯丙烷生物合成的异戊二烯转移酶,并发现了一种能够向天然底物引入多个异戊二烯残基的植物酶 | NA | 研究植物中异戊二烯化酚类代谢物的生物合成机制,并开发合成阿特匹林C的酵母平台 | 艾蒿中的膜结合双异戊二烯转移酶基因及其在阿特匹林C生物合成中的应用 | 生物技术 | NA | 异戊二烯转移酶 | NA | 基因 | NA |
75 | 2024-08-07 |
A transient reporter for editing enrichment (TREE) in human cells
2019-11-04, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkz713
PMID:31428784
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研究论文 | 本研究开发了一种名为TREE的临时报告系统,用于在人类细胞中高效筛选经过碱基编辑的细胞群体 | TREE系统通过使用蓝色荧光蛋白(BFP)在C到T替换后转化为绿色荧光蛋白(GFP),直接报告细胞内的碱基编辑活性,显著提高了编辑效率 | NA | 优化碱基编辑转染参数和递送策略,并开发一种高效的临时报告系统用于筛选碱基编辑细胞 | 人类细胞和人类多能干细胞(hPSCs) | 合成生物学 | NA | 碱基编辑技术 | NA | 荧光信号 | 多个独立位点 |
76 | 2024-08-07 |
Polarized displacement by transcription activator-like effectors for regulatory circuits
2019-01, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-018-0163-8
PMID:30455466
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研究论文 | 本文展示了转录激活因子样效应物(TALE)能够以高度极化的方式从DNA上置换另一个TALE蛋白,仅置换3'端而非5'端重叠或相邻的TALE。 | 提出了基于TALE多部分DNA结合特性的极化置换机制,为基因表达的特异性调控、构建所有双输入布尔遗传逻辑电路、置换锌指转录因子及抑制Cas9-gRNA介导的基因组切割提供了新策略。 | NA | 探索DNA结合蛋白间相互作用在转录调控中的作用,提高设计调控电路的精确性和复杂性。 | 转录激活因子样效应物(TALE)及其在DNA上的极化置换行为。 | 合成生物学 | NA | 转录激活因子样效应物(TALE) | NA | DNA | NA |
77 | 2024-08-07 |
Optogenetic Repressors of Gene Expression in Yeasts Using Light-Controlled Nuclear Localization
2019-Oct, Cellular and molecular bioengineering
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s12195-019-00598-9
PMID:31719930
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研究论文 | 研究通过光控核定位技术在酵母中实现基因表达的光遗传抑制 | 开发了一种新的光遗传工具,通过光控核定位实现对酵母基因表达的抑制 | 目前仅在模型生物酵母中进行了测试,尚未在其他医学相关的真菌中应用 | 探索在酵母中通过光控核定位实现基因表达抑制的可能性 | 模型生物酵母Saccharomyces cerevisiae | 生物技术 | NA | 光遗传学 | dCas9 | 基因表达 | 多种酵母细胞组成的异质群体 |
78 | 2024-08-07 |
Communicating Structure and Function in Synthetic Biology Diagrams
2019-08-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.9b00139
PMID:31348656
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研究论文 | 本文描述了合成生物学中用于交流的图示标准SBOL Visual版本2,扩展了先前的图示标准,包括新的功能交互、分子物种类别、符号变体家族的支持以及模块化结构和系统元素之间映射的表示。 | SBOL Visual 2扩展了先前的标准,增加了新的功能交互、分子物种类别、符号变体家族的支持以及模块化结构和系统元素之间映射的表示,并澄清了多个要求和最佳实践,显著扩展了用于描述遗传特征的符号集合。 | NA | 旨在开发和描述合成生物学中用于交流的图示标准SBOL Visual版本2。 | 合成生物学中的图示标准及其在交流结构和功能方面的应用。 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 图示 | NA |
79 | 2024-08-07 |
SnoopLigase peptide-peptide conjugation enables modular vaccine assembly
2019-03-15, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-019-40985-w
PMID:30874593
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SnoopLigase的新型肽-肽连接方法,用于将抗原特异性和不可逆地耦合到寡聚化平台上,以开发广泛保护和可扩展的疫苗。 | SnoopLigase是一种从肺炎链球菌粘附素工程化的肽-肽连接方法,能够形成两个肽标签(DogTag和SnoopTagJr)之间的异肽键,为疫苗设计和合成生物学中的纳米结构构建提供了新的策略。 | NA | 开发一种新的平台和连接途径,将潜在的保护性抗原转化为广泛保护和可扩展的疫苗。 | SnoopLigase肽-肽连接方法及其在疫苗设计和合成生物学中的应用。 | 合成生物学 | 传染病 | SnoopLigase肽-肽连接 | NA | 肽和蛋白质 | 涉及两种血液期疟疾蛋白(来自PfEMP1或CyRPA)和一个与癌症免疫治疗相关的端粒酶肽。 |
80 | 2024-08-07 |
NextGen cell-based immunotherapies in cancer and other immune disorders
2019-08, Current opinion in immunology
IF:6.6Q1
DOI:10.1016/j.coi.2019.03.007
PMID:31071513
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综述 | 本文综述了工程化T细胞疗法在癌症和其他免疫疾病治疗中的当前进展及未来发展方向 | 结合合成生物学工具和细胞生物学及免疫学的基础知识,开发了增强细胞识别和安全有效治疗疾病能力的方法,以及使用CRISPR工程化细胞和制造通用‘即用型’细胞疗法的新策略 | NA | 探讨细胞疗法作为未来医学支柱的潜力 | T淋巴细胞和其他细胞疗法在癌症和其他免疫疾病中的应用 | NA | 癌症和其他免疫疾病 | CRISPR | NA | NA | NA |