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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2024-08-07 |
Development of a Split Esterase for Protein-Protein Interaction-Dependent Small-Molecule Activation
2019-Nov-27, ACS central science
IF:12.7Q1
DOI:10.1021/acscentsci.9b00567
PMID:31807678
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研究论文 | 本文开发了一种基于蛋白质相互作用依赖的小分子激活的分离酯酶系统 | 首次提出了一种基于蛋白质相互作用依赖的小分子激活的分离酯酶系统,该系统能够选择性地在相互作用依赖的方式下解除酯保护的小分子 | NA | 开发一种新的生物传感系统,用于在生物系统中基于测量输入信号生成目标小分子 | 分离酯酶系统及其在蛋白质相互作用检测和细胞杀伤中的应用 | 合成生物学 | NA | 分离酯酶系统 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 62 | 2024-08-07 |
Noise-reducing optogenetic negative-feedback gene circuits in human cells
2019-08-22, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkz556
PMID:31269201
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研究论文 | 本文通过在哺乳动物细胞中构建光遗传学基因回路,实现了通过遗传和体外负反馈来精确控制基因表达的噪声降低 | 开发了一种新的光遗传学工具集,称为噪声降低的光诱导调节器(LITer),通过融合TetR抑制子和Tet抑制肽(TIP)或降解标签,实现了高达5倍的噪声降低 | NA | 研究基因表达噪声降低及其在生物医学领域的应用 | 哺乳动物细胞中的基因表达控制 | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 63 | 2024-08-07 |
Rapid screening of engineered microbial therapies in a 3D multicellular model
2019-04-30, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1820824116
PMID:30996123
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研究论文 | 本文介绍了一种细菌-球状体共培养(BSCC)平台,用于在多细胞球状体中同时测试宿主物种、治疗有效载荷和工程细菌的合成基因回路,并在几周的时间尺度上进行长期监测。 | 该平台能够高吞吐量地筛选工程微生物疗法,并动态分析多种微生物物种及其在不同宿主细胞类型中的作用。 | NA | 加速合成生物学在临床应用中的发展,并深入理解疾病部位的宿主-微生物相互作用。 | 工程细菌的宿主物种、治疗有效载荷和合成基因回路。 | 合成生物学 | 炎症、感染、代谢紊乱、癌症 | NA | NA | 多细胞球状体 | 多种微生物物种和宿主细胞类型 | NA | NA | NA | NA |
| 64 | 2024-08-07 |
Biosensor-based enzyme engineering approach applied to psicose biosynthesis
2019, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysz028
PMID:32995548
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研究论文 | 本研究探索了利用生物传感器基础的酶筛选方法来提高D-psicose(一种稀有且无毒的糖类甜味剂)的生物合成效率 | 开发了一种基于生物传感器的酶筛选方法,并创建了通用生物传感器底盘,以快速工程化任何基于转录因子的生物传感器 | NA | 提高D-psicose的生物合成效率,以满足大规模生产和成本效益的预期 | D-psicose的生物合成及其相关酶的筛选 | 生物工程 | 肥胖症,2型糖尿病 | 生物传感器,PCR | NA | 生物数据 | 七个基于先前未表征转录因子的psicose响应生物传感器,以及一系列D-psicose 3-epimerase突变体 | NA | NA | NA | NA |
| 65 | 2024-08-07 |
Emerging Cellular Therapies for Cancer
2019-04-26, Annual review of immunology
IF:26.9Q1
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研究论文 | 本文探讨了基因工程改造的T细胞作为新型抗癌药物的潜力及其在癌症治疗中的应用 | 介绍了合成生物学方法在细胞工程中的应用,为免疫细胞编程提供了更广泛的工具集 | NA | 探索基因工程T细胞在癌症治疗中的应用及其潜在的扩展领域 | 基因工程T细胞及其在癌症、传染病、器官移植和自身免疫疾病中的应用 | NA | 癌症 | 基因编辑 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 66 | 2024-08-07 |
Structural organization of biocatalytic systems: the next dimension of synthetic metabolism
2019-Nov-11, Emerging topics in life sciences
IF:3.4Q1
DOI:10.1042/ETLS20190015
PMID:33523157
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综述 | 本文综述了体外合成代谢网络(SIVMNs)的结构组织及其在提高效率和生产力方面的重要性 | 探讨了如何通过结构组织优化合成代谢网络,以减少有害副反应、有效利用可再生能源并提高生产力 | NA | 探讨如何进一步发展体外合成代谢网络,通过结构组织优化其性能 | 体外合成代谢网络(SIVMNs)及其反应的结构组织 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 67 | 2024-08-07 |
Physicochemical considerations for bottom-up synthetic biology
2019-11-11, Emerging topics in life sciences
IF:3.4Q1
DOI:10.1042/ETLS20190017
PMID:33523159
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综述 | 文章综述了从分子组件构建合成细胞的挑战性研究领域,特别是生物系统在合成囊泡中限制的影响 | NA | NA | 探讨构建合成细胞所需的物理化学考虑 | 合成细胞的内部pH、离子强度、大分子拥挤、氧化还原状态及代谢能量守恒 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 68 | 2024-08-07 |
Modeling population dynamics in a microbial consortium under control of a synthetic pheromone-mediated communication system
2019-Jun, Engineering in life sciences
IF:3.9Q2
DOI:10.1002/elsc.201800107
PMID:32625018
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研究论文 | 本文通过合成生物学方法构建了一个由两种菌株组成的模型共生体,其中接收菌株的生长和荧光标记蛋白EGFP的表达受发射菌株产生的α-因子信息素浓度控制,并开发了一个定量的实验和理论框架来描述模型共生体中的种群动态 | 本文开发了一个定量的实验和理论框架,用于描述受合成信息素介导的通信系统控制的微生物共生体中的种群动态 | NA | 研究如何通过合成生物学方法控制微生物共生体的行为,以应用于复杂的生物转化过程 | 由两种菌株组成的模型共生体,其中一种菌株产生α-因子信息素,另一种菌株受信息素浓度控制生长和表达荧光标记蛋白EGFP | 合成生物学 | NA | 流式细胞术 | 数学模型 | 生物数据 | 两种菌株的共生体在不同培养条件下的实验数据 | NA | NA | NA | NA |
| 69 | 2024-08-07 |
Recent advances in natural products exploitation in Streptomyces via synthetic biology
2019-Jun, Engineering in life sciences
IF:3.9Q2
DOI:10.1002/elsc.201800137
PMID:32625022
|
综述 | 本文综述了利用合成生物学在链霉菌中开发天然产物的新进展 | 合成生物学作为一种新的生物工程平台,被用于发现新的生物活性化合物并扩大生物活性天然产物的多样性和生产 | NA | 探讨合成生物学在天然产物开发中的应用 | 链霉菌中的天然产物 | 合成生物学 | NA | 合成生物学工具 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 70 | 2024-08-07 |
Lignin valorization meets synthetic biology
2019-Jun, Engineering in life sciences
IF:3.9Q2
DOI:10.1002/elsc.201800133
PMID:32625023
|
综述 | 本文综述了合成生物技术在木质素转化中的应用,特别是生产高价值产品如芳香化学品、环裂解化学品和生物活性物质 | 合成生物技术为木质素的高值化利用提供了新的潜在策略,包括优化木质素降解酶、构建新型人工转化途径和改进模型微生物底盘 | NA | 探讨合成生物技术在木质素转化中的应用,以实现木质素的高值化利用 | 木质素及其转化产物 | 合成生物学 | NA | 合成生物技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 71 | 2024-08-07 |
Rapid in vitro production of single-stranded DNA
2019-12-16, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkz998
PMID:31713635
|
研究论文 | 本文介绍了一种快速、高产且用户友好的体外生产高纯度单链DNA的方法 | 提出了一种新的方法,通过PCR和甲醇响应聚合物生成标记的扩增子,实现选择性沉淀修饰链,从而高效生产单链DNA | NA | 开发一种新的方法来生产高纯度、长链的单链DNA | 单链DNA的生产方法及其在合成生物学、生物成像和生物纳米技术中的应用 | 合成生物学 | NA | PCR | NA | DNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 72 | 2024-08-07 |
Rock-paper-scissors: Engineered population dynamics increase genetic stability
2019-09-06, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aaw0542
PMID:31488693
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研究论文 | 本文通过设计生态互动的循环种群控制策略,提高了细菌基因电路的稳定性 | 采用生态互动的循环种群控制策略,通过“石头-剪刀-布”动态,实现了基因电路功能的稳定性提升 | NA | 探索通过生态互动策略提高工程细菌基因稳定性的方法 | 设计的三种细菌株及其在微流控设备中的相互作用 | 合成生物学 | NA | 微流控技术 | NA | 细胞培养 | 三种细菌株 | NA | NA | NA | NA |
| 73 | 2024-08-07 |
Exploiting the Feedstock Flexibility of the Emergent Synthetic Biology Chassis Vibrio natriegens for Engineered Natural Product Production
2019-Nov-30, Marine drugs
IF:4.9Q1
DOI:10.3390/md17120679
PMID:31801279
|
研究论文 | 研究利用新兴合成生物学底盘Vibrio natriegens的原料灵活性,进行异源天然产物生产 | 首次探索了Vibrio natriegens作为合成生物学底盘在多种工业相关原料下生产天然产物的能力 | NA | 评估Vibrio natriegens作为合成生物学底盘生产天然产物的潜力 | Vibrio natriegens的异源天然产物生产能力,特别是β-胡萝卜素和紫胶素 | 合成生物学 | NA | 基因表达 | NA | 生物数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 74 | 2024-08-07 |
From Endogenous to Synthetic microRNA-Mediated Regulatory Circuits: An Overview
2019-11-29, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells8121540
PMID:31795372
|
综述 | 本文综述了微小RNA(microRNA)在基因调控网络中的作用及其在合成生物学中的应用 | 介绍了人工合成电路在实验中测试microRNA调控任务的应用,并探讨了其在临床应用中的潜力 | NA | 综述microRNA介导的调控电路及其在合成生物学中的最新进展 | microRNA及其在生物网络中的作用和人工合成电路的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 75 | 2024-08-07 |
"Cell-Free Synthetic Biology": Synthetic Biology Meets Cell-Free Protein Synthesis
2019-Oct-08, Methods and protocols
IF:2.3Q3
DOI:10.3390/mps2040080
PMID:31597405
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review | 本文综述了细胞自由合成生物学的发展及其在多个领域的应用 | 细胞自由合成生物学结合了细胞自由蛋白合成与合成生物学,提供了一种强大且快速的工具来表征和工程化自然生物系统 | NA | 探讨细胞自由合成生物学的当前发展和应用 | 细胞自由合成生物学技术及其在生物网络调试、人工细胞构建、蛋白质库筛选等方面的应用 | 合成生物学 | NA | 细胞自由蛋白合成 (CFPS) | NA | 蛋白质 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 76 | 2024-08-07 |
Functionalization of Bacterial Microcompartment Shell Proteins With Covalently Attached Heme
2019, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2019.00432
PMID:31993414
|
研究论文 | 本研究利用细胞色素成熟系统I开发了一种简单方法,能够在目标蛋白质的主链中掺入血红素,特别是针对自组装的细菌微区室壳蛋白,并在蛋白质主链的多处位置插入功能性血红素 | 本研究报告了一种通用策略,用于从结构定义的蛋白质中生成电子传导细胞色素,并提供了关于血红素掺入如何与工程化蛋白质的天然组装特性相互作用的设计考虑 | 血红素结合的壳蛋白在形成更高阶壳体组装时,其大分子复合物的结构特征有时会改变 | 探索血红素在合成生物学和生物电子应用中的潜力,特别是通过在定义位置附着血红素以促进位置敏感过程如电子转移 | 细菌微区室壳蛋白及其血红素功能化 | 合成生物学 | NA | 细胞色素成熟系统I | NA | 蛋白质 | 多个位置的壳蛋白 | NA | NA | NA | NA |
| 77 | 2024-08-07 |
Two New Plasmid Post-segregational Killing Mechanisms for the Implementation of Synthetic Gene Networks in Escherichia coli
2019-Apr-26, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2019.03.019
PMID:30954530
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研究论文 | 本文展示了axe/txe毒素-抗毒素系统和微囊素-V细菌素系统在益生菌大肠杆菌Nissle 1917中的质粒稳定化能力,并证明它们可以超越常用的hok/sok系统 | 开发了两种新的质粒后分离杀伤机制,并应用贝叶斯统计方法量化了体外质粒稳定性 | NA | 探索和验证新的质粒稳定化机制,以应用于工业和合成生物学 | 大肠杆菌Nissle 1917中的质粒稳定性和其在体内外的表现 | 合成生物学 | NA | 自动化流式细胞分析,数学模型,贝叶斯统计 | NA | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 78 | 2024-08-07 |
Modulating Mistranslation Potential of tRNASer in Saccharomyces cerevisiae
2019-11, Genetics
IF:3.3Q2
DOI:10.1534/genetics.119.302525
PMID:31484688
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研究论文 | 研究通过引入次级突变调节tRNASer在酵母中的错译潜力 | 通过遗传选择识别出22种次级突变,这些突变主要位于单链区域或替换G:U碱基对为Watson-Crick对,允许非毒性错译 | 多数次级突变影响tRNA在细胞中的稳定性,且在低温下更具毒性 | 识别调节tRNA错译水平的次级位点替换 | tRNASer在Saccharomyces cerevisiae中的错译潜力 | NA | NA | 遗传选择 | NA | 蛋白质组分析 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 79 | 2024-08-07 |
The Synthetic Biology Toolkit for Photosynthetic Microorganisms
2019-09, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1104/pp.19.00345
PMID:31262955
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 80 | 2024-08-07 |
Isolation of Artemisia capillaris membrane-bound di-prenyltransferase for phenylpropanoids and redesign of artepillin C in yeast
2019, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-019-0630-0
PMID:31646187
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研究论文 | 本研究从艾蒿中分离出一种膜结合的双异戊二烯转移酶基因,该基因编码的酶能将两个异戊二烯残基逐步转移到咖啡酸上,生成阿特匹林C,并设计了一种酵母平台用于合成生物学中的阿特匹林C合成 | 首次鉴定出参与苯丙烷生物合成的异戊二烯转移酶,并发现了一种能够向天然底物引入多个异戊二烯残基的植物酶 | NA | 研究植物中异戊二烯化酚类代谢物的生物合成机制,并开发合成阿特匹林C的酵母平台 | 艾蒿中的膜结合双异戊二烯转移酶基因及其在阿特匹林C生物合成中的应用 | 生物技术 | NA | 异戊二烯转移酶 | NA | 基因 | NA | NA | NA | NA | NA |