合成生物学相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
81	2024-08-07	Harnessing synthetic biology for kelp forest conservation1 2019-Aug, Journal of phycology IF:2.8Q2 DOI:10.1111/jpy.12888 PMID:31152453	研究论文	本文讨论了合成生物学在海藻林保护中的潜在直接和间接应用	合成生物学作为快速发展和变革性的科学领域，提供了前所未有的解决方案来应对当前和新兴的环境问题	技术进步已经超过了对其使用的社会、伦理和实际考虑	探讨合成生物学在遏制或逆转全球海藻损失中的作用，并讨论挑战和研究路径	合成生物学在海藻林保护中的应用	NA	NA	合成生物学	NA	NA	NA
82	2024-08-07	Combined genome editing and transcriptional repression for metabolic pathway engineering in Corynebacterium glutamicum using a catalytically active Cas12a 2019-Nov, Applied microbiology and biotechnology IF:3.9Q2 DOI:10.1007/s00253-019-10118-4 PMID:31583448	研究论文	本文设计了一种结合基因组编辑和转录抑制的双功能CRISPR系统（RE-CRISPR），使用具有催化活性的Cas12a在谷氨酸棒杆菌中进行代谢途径工程	开发了一种新的RE-CRISPR系统，能够同时实现基因组编辑和转录抑制，提高了代谢产物的生产效率	NA	设计一种能够在谷氨酸棒杆菌中同时进行基因组编辑和转录抑制的新工具，以优化代谢途径	谷氨酸棒杆菌的代谢和调控基因	合成生物学	NA	CRISPR/Cas12a	NA	基因组数据	NA
83	2024-08-07	Simultaneous repression of multiple bacterial genes using nonrepetitive extra-long sgRNA arrays 2019-Nov, Nature biotechnology IF:33.1Q1 DOI:10.1038/s41587-019-0286-9 PMID:31591552	研究论文	本文通过使用非重复超长sgRNA阵列（ELSAs）同时抑制多个细菌基因，解决了CRISPR干扰中多sgRNA共表达引起的遗传不稳定性和表型丧失问题。	开发了非重复超长sgRNA阵列（ELSAs），通过结合非重复遗传部件和算法规则设计，实现了对多个基因的同时稳定调控。	NA	实现对多个细菌基因的同时稳定调控，以应用于代谢工程和合成生物学。	细菌基因的调控和细菌表型的工程化。	合成生物学	NA	CRISPR干扰	NA	DNA序列	22个sgRNAs，28个sgRNA handles
84	2024-08-07	Establishment and application of a CRISPR-Cas12a assisted genome-editing system in Zymomonas mobilis 2019-Oct-03, Microbial cell factories IF:4.3Q1 DOI:10.1186/s12934-019-1219-5 PMID:31581942	research paper	本研究在Zymomonas mobilis中建立了基于CRISPR-Cas12a的基因编辑系统，并展示了其在质粒清除、基因删除和插入以及核苷酸替换等方面的应用	首次在Zymomonas mobilis中应用CRISPR-Cas12a系统，实现了高效的基因编辑和代谢工程	NA	开发一种高效便捷的基因编辑工具，加速Zymomonas mobilis的基因组研究和菌株改良	Zymomonas mobilis菌株及其基因组	synthetic biology	NA	CRISPR-Cas12a	NA	DNA	涉及Zymomonas mobilis ZM4菌株及其原生质粒
85	2024-08-07	Engineered CRISPRa enables programmable eukaryote-like gene activation in bacteria 2019-Aug-26, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-019-11479-0 PMID:31451697	研究论文	本文报道了一种基于σ依赖型启动子的类真核细菌CRISPR激活（CRISPRa）系统，支持长距离和多输入调控	该系统在非模式细菌中激活σ依赖型启动子，支持正交基因调控，并能与dxCas9结合扩展DNA靶向灵活性	NA	开发一种新型的CRISPR激活系统，以提高基因表达调控的灵活性和效率	细菌中的基因表达调控	合成生物学	NA	CRISPR/Cas	NA	NA	NA
86	2024-08-07	Construction of a series of episomal plasmids and their application in the development of an efficient CRISPR/Cas9 system in Pichia pastoris 2019-May-27, World journal of microbiology & biotechnology IF:4.0Q2 DOI:10.1007/s11274-019-2654-5 PMID:31134410	研究论文	本研究构建了一系列质粒，并将其应用于开发高效的CRISPR/Cas9系统在毕赤酵母中	首次使用panARS序列开发了高效的CRISPR/Cas9基因编辑系统，相比传统系统提高了十倍以上的编辑效率	NA	开发高效的CRISPR/Cas9基因编辑系统在毕赤酵母中	毕赤酵母中的异源基因表达和基因组编辑	合成生物学	NA	CRISPR/Cas9	NA	质粒	五种不同来源的ARS序列
87	2024-08-07	A gRNA-tRNA array for CRISPR-Cas9 based rapid multiplexed genome editing in Saccharomyces cerevisiae 2019-Mar-05, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-019-09005-3 PMID:30837474	研究论文	报道了一种用于CRISPR-Cas9系统的gRNA-tRNA阵列（GTR-CRISPR），能够在酵母中进行多重基因编辑	开发了一种加速的Lightning GTR-CRISPR系统，避免了在E. coli中的克隆步骤，直接将Golden Gate反应混合物转化到酵母中，简化了酵母脂质网络，显著提高了游离脂肪酸的产量	使用未优化的gRNAs时效率较低	提高合成生物学中菌株工程的效率	酵母基因编辑和脂质网络简化	合成生物学	NA	CRISPR-Cas9	NA	基因组数据	涉及8个基因的编辑
88	2024-08-07	Engineering CRISPR guide RNA riboswitches for in vivo applications 2019-Feb, Current opinion in biotechnology IF:7.1Q1 DOI:10.1016/j.copbio.2018.08.007 PMID:30265865	研究论文	本文总结了CRISPR和riboswitch技术的最新进展，并推荐了新型功能化合成gRNA（sgRNA）设计，以实现对CRISPR基因编辑器的可诱导和时空调控	提出了新型功能化合成gRNA（sgRNA）设计，以实现对CRISPR基因编辑器的可诱导和时空调控	NA	实现对CRISPR基因编辑器的可诱导和时空调控	CRISPR和riboswitch技术	基因编辑	NA	CRISPR	NA	NA	NA
89	2024-08-07	Simultaneous Visualization of Multiple Gene Expression in Single Cells Using an Engineered Multicolor Reporter Toolbox and Approach of Spectral Crosstalk Correction 2019-11-15, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.9b00223 PMID:31596563	research paper	本文设计并开发了一种多色荧光报告工具箱，用于同时监测单细胞中多个基因的活性，并通过线性解混算法解决了多荧光蛋白间的光谱串扰问题	本文创新性地开发了一种多色荧光报告工具箱，并采用线性解混算法实现了对基因表达的定量分析，从而实现了高置信度的真实信号分离	NA	开发一种新的工具和方法，用于在单细胞水平上同时监测多个基因的表达	单细胞中多个基因的活性监测	synthetic biology	NA	多色荧光报告工具箱，线性解混算法	NA	image	NA
90	2024-08-07	Isolating promoters from Corynebacterium ammoniagenes ATCC 6871 and application in CoA synthesis 2019-11-12, BMC biotechnology IF:3.5Q2 DOI:10.1186/s12896-019-0568-9 PMID:31718625	研究论文	本研究从Corynebacterium ammoniagenes ATCC 6871中分离出20个潜在的DNA启动子和6个分子伴侣基因启动子，并评估了它们在代谢工程中的应用	成功分离出一系列具有不同活性的启动子，其中来自50S核糖体蛋白L21上游序列的片段显示出最强的活性，并应用于提高C. ammoniagenes中辅酶A的产量	NA	研究如何通过分离和应用不同活性的启动子来优化C. ammoniagenes的代谢途径，以提高工业应用中的产量	Corynebacterium ammoniagenes ATCC 6871中的启动子和辅酶A的合成	代谢工程	NA	红荧光蛋白(RFP)作为报告基因	NA	DNA序列	26个启动子
91	2024-08-07	Plant cell packs: a scalable platform for recombinant protein production and metabolic engineering 2019-08, Plant biotechnology journal IF:10.1Q1 DOI:10.1111/pbi.13081 PMID:30672078	研究论文	本文介绍了一种快速且多功能的表达系统，涉及将Agrobacterium tumefaciens注入无培养基的三维多孔植物细胞聚集体中，称为植物细胞包（PCPs），用于重组蛋白生产和代谢工程。	PCPs方法结合了植物瞬时表达的速度和微生物筛选系统的通量，提供了从高通量筛选到初始产品制备的可扩展性。	NA	开发一种可靠且可扩展的筛选方法，用于工业植物生物技术应用，如可持续燃料、复杂代谢物和重组蛋白的生产。	研究不同植物物种（如Nicotiana tabacum BY2、Nicotiana benthamiana和Daucus carota）中的重组蛋白表达和代谢工程。	生物技术	NA	Agrobacterium tumefaciens注入	NA	NA	涉及多种植物物种，包括Nicotiana tabacum BY2、Nicotiana benthamiana和Daucus carota。
92	2024-08-07	Towards semi-synthetic microbial communities: enhancing soy sauce fermentation properties in B. subtilis co-cultures 2019-Jun-03, Microbial cell factories IF:4.3Q1 DOI:10.1186/s12934-019-1149-2 PMID:31159886	研究论文	本文研究如何通过合成生物学方法改良B. subtilis共培养体系，以提升酱油发酵特性	提出了两种减少酱油'褐变'反应的工程策略：一是通过工程化消耗木糖，二是通过工程化降解黑色素，并展示了这两种策略在共培养中的协同效应	NA	改良酱油发酵过程，提升产品品质	B. subtilis共培养体系及酱油发酵过程中的褐变反应	合成生物学	NA	代谢工程	NA	NA	NA
93	2024-08-07	Characterization of a sesquiterpene cyclase from the glandular trichomes of Leucosceptrum canum for sole production of cedrol in Escherichia coli and Nicotiana benthamiana 2019-Jun, Phytochemistry IF:3.2Q2 DOI:10.1016/j.phytochem.2019.03.009 PMID:30884256	研究论文	研究报道了从Leucosceptrum canum植物的腺毛中克隆并功能性表征了一种cedrol合酶基因(Lc-CedS)，并展示了其在Escherichia coli和Nicotiana benthamiana中的生产应用	首次报道了Lc-CedS基因的克隆及其在E. coli和N. benthamiana中的cedrol单一产品生产	NA	探索cedrol的生物合成途径及其在工程菌中的生产	cedrol合酶基因Lc-CedS及其在E. coli和N. benthamiana中的表达	生物技术	NA	合成生物学	NA	基因序列	在E. coli中生产cedrol的浓度为363 μg/L，在N. benthamiana中为3.6 μg/g新鲜重量
94	2024-08-07	Redox-Based Synthetic Biology Enables Electrochemical Detection of the Herbicides Dicamba and Roundup via Rewired Escherichia coli 2019-05-24, ACS sensors IF:8.2Q1 DOI:10.1021/acssensors.9b00085 PMID:30990313	研究论文	本文展示了通过最小程度地重构细菌细胞的遗传调控，使其能够识别并报告化学除草剂，如用于清除花园和作物中杂草的草甘膦和草胺膦	利用基于氧化还原的合成生物学构建物，实现了生物化学系统与微电子之间的分子通信	环境因素，特别是葡萄糖的可用性，对除草剂的细胞检测有重要影响	展示合成生物学在创建能够检测和治疗疾病的‘智能’细菌方面的应用	细菌细胞对化学除草剂的识别和报告能力	合成生物学	NA	氧化还原反应	NA	生物化学信号	NA
95	2024-08-07	Utilizing in vitro DNA assembly to engineer a synthetic T7 Nanoluc reporter phage for Escherichia coli detection 2019-Mar-01, Integrative biology : quantitative biosciences from nano to macro IF:1.5Q4 DOI:10.1093/intbio/zyz005 PMID:30927414	研究论文	本文介绍了一种利用体外DNA组装技术构建合成T7 Nanoluc报告噬菌体以检测大肠杆菌的方法	提出了一种简单的体外方法来工程化噬菌体，并成功构建了NRGp6报告噬菌体，用于高效检测低浓度的大肠杆菌	NA	开发新的检测方法和治疗手段以对抗细菌	大肠杆菌的检测	合成生物学	NA	体外DNA组装	NA	NA	NA
96	2024-08-07	Cytosolic lipid droplets as engineered organelles for production and accumulation of terpenoid biomaterials in leaves 2019-02-20, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-019-08515-4 PMID:30787273	研究论文	本文报道了通过合成生物学方法，在植物叶片中与脂滴共同生产高价值的倍半萜或二萜类生物材料	通过增强瞬时烟草系统中脂滴的形成，并利用脂滴表面蛋白锚定不同的生物合成步骤，实现了高效生产萜类骨架和功能化萜类化合物	NA	探索在植物叶片中通过合成生物学方法共同生产高价值萜类化合物和脂滴	植物叶片中的脂滴和萜类化合物	合成生物学	NA	合成生物学方法	NA	生物材料	瞬时烟草系统 Nicotiana benthamiana
97	2024-08-07	Combinatorial biosynthesis of small molecules in plants: Engineering strategies and tools 2019, Methods in enzymology DOI:10.1016/bs.mie.2018.12.005 PMID:30784411	研究论文	本文探讨了利用植物的生物合成能力生产小分子的组合策略和工具	本文利用合成生物学的基本原则，结合植物细胞的独特分隔和瞬时转化系统，探索了生产天然和新型定制化学品的组合方法	NA	研究如何利用植物作为生产高价值天然小分子的平台	植物的生物合成途径和相关酶类	合成生物学	NA	瞬时植物转化系统	P450单加氧酶	NA	NA