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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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1 | 2024-08-07 |
Plant Synthetic Biology: Quantifying the "Known Unknowns" and Discovering the "Unknown Unknowns"
2019-03, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1104/pp.18.01222
PMID:30630870
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
2 | 2024-08-07 |
Direct sequencing of 2'-deoxy-2'-fluoroarabinonucleic acid (FANA) using nanopore-induced phase-shift sequencing (NIPSS)
2019-03-14, Chemical science
IF:7.6Q1
DOI:10.1039/c8sc05228j
PMID:30996894
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研究论文 | 本文首次展示了使用纳米孔诱导相移测序(NIPSS)直接测序2'-脱氧-2'-氟阿拉伯核酸(FANA)的方法 | 首次实现了糖修饰XNA的直接测序,并发现phi29 DNA聚合酶具有先前未知的FANA逆转录酶活性 | NA | 探索和验证FANA的直接测序方法 | 2'-脱氧-2'-氟阿拉伯核酸(FANA)及其测序技术 | 分子医学 | NA | 纳米孔诱导相移测序(NIPSS) | NA | NA | 不同FANA同聚物 |
3 | 2024-08-07 |
Towards control of cellular decision-making networks in the epithelial-to-mesenchymal transition
2019-03-07, Physical biology
IF:2.0Q3
DOI:10.1088/1478-3975/aaffa1
PMID:30654341
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综述 | 本文从实验/技术与理论两个角度综述了上皮-间质转化(EMT)的调控网络,并探讨了其在胚胎发育、伤口愈合和转移中的生理背景 | 介绍了新兴的合成生物技术以监测和控制细胞状态,并提出了如何驱动网络动态向所需动态吸引子(如上皮细胞状态)的理论 | NA | 旨在将关于EMT调控网络的理解转化为控制表型结果的方法,特别是在癌症治疗策略的背景下 | EMT的调控网络及其在不同生理环境中的作用 | NA | 癌症 | NA | NA | NA | NA |
4 | 2024-08-07 |
Challenges and opportunities for natural product discovery, production, and engineering in native producers versus heterologous hosts
2019-Mar, Journal of industrial microbiology & biotechnology
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10295-018-2094-5
PMID:30426283
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研究论文 | 本文探讨了天然产物发现、生产和工程化在原生生产者和异源宿主中的挑战与机遇 | 利用自然进化的力量,发现具有所需遗传适应性和更高目标天然产物产量的替代生产者,以及携带编码目标天然产物骨架进化优化同类物的基因簇的新菌株 | 在理解生物合成基因簇的沉默或激活方面仍存在许多挑战,包括关键生物合成和调节基因转录的变化 | 通过利用自然进化的力量,开发新的研究策略,填补知识空白 | 天然产物的发现、生产和工程化 | 合成生物学 | NA | 代谢途径工程 | NA | 基因簇 | NA |
5 | 2024-08-07 |
Comparative proteomic analysis of four biotechnological strains Lactococcus lactis through label-free quantitative proteomics
2019-03, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.13305
PMID:30341804
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研究论文 | 本研究通过无标记定量蛋白质组学分析了四种生物技术菌株Lactococcus lactis的核心蛋白质组 | 本研究首次通过无标记定量蛋白质组学技术,详细分析了四种Lactococcus lactis菌株的核心蛋白质组,并发现了与翻译过程相关的高丰度蛋白质以及特定亚种独有的保守蛋白质 | NA | 旨在深入理解Lactococcus lactis的细胞功能及其在合成生物学中的应用 | 四种生物技术菌株Lactococcus lactis的核心蛋白质组 | 生物技术 | NA | 无标记定量蛋白质组学 | NA | 蛋白质组数据 | 四种Lactococcus lactis菌株,包括L. lactis subsp. lactis NCDO2118, L. lactis subsp. lactis IL1403, L. lactis subsp. cremoris NZ9000和L. lactis subsp. cremoris MG1363 |
6 | 2024-08-07 |
Engineering and modification of microbial chassis for systems and synthetic biology
2019-Mar, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2018.12.001
PMID:30560208
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综述 | 本文综述了微生物底盘的工程化与改造,及其在系统生物学和合成生物学中的应用 | 介绍了通过基因组缩减和基因组合成的两种主要策略来构建微生物底盘,并举例说明了相关项目的成果 | NA | 探讨微生物底盘的工程化与改造,以揭示生命基本原理并增强其在多个工业领域的应用 | 微生物底盘及其在健康、医药、农业、兽医和食品行业的应用 | 合成生物学 | NA | 基因组缩减,基因组合成 | NA | NA | NA |
7 | 2024-08-07 |
Twenty-first-century chemical odyssey: fuels versus commodities and cell factories versus chemical plants
2019-03, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.13379
PMID:30793487
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综述 | 本文探讨了利用合成生物学开发新型生物合成途径,以替代传统工业方法合成化学品的潜力 | 提出了一种利用非食用木质纤维素作为可持续有机碳源的新型能源生物过程 | 目前基于淀粉或木质纤维素的工业过程数量仍然很少,需要更有效的植物材料分解方法和新的有用基因的识别 | 研究如何通过合成生物学实现工业向可再生能源的转变 | 非食用木质纤维素和合成生物学在化学品生物合成中的应用 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
8 | 2024-08-07 |
Omnipresent Maxwell's demons orchestrate information management in living cells
2019-03, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.13378
PMID:30806035
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研究论文 | 本文探讨了合成生物学中对生命细胞构建和运作至关重要的功能,特别是那些以非预期方式消耗能量的功能,并展示了这些功能如何作为信息管理的实体实现,类似于麦克斯韦妖(MxD)。 | 本文首次展示了生命细胞中的多种功能,如转运蛋白和核糖体构建机制,如何作为麦克斯韦妖的物质实现,以高效能的方式进行计算。 | NA | 旨在深入理解合成生物学中生命细胞构建和运作的关键功能。 | 研究对象包括生命细胞中的最小基因组编码的功能,特别是那些以非预期方式消耗能量的功能。 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
9 | 2024-08-07 |
SnoopLigase peptide-peptide conjugation enables modular vaccine assembly
2019-03-15, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-019-40985-w
PMID:30874593
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SnoopLigase的新型肽-肽连接方法,用于将抗原特异性和不可逆地耦合到寡聚化平台上,以开发广泛保护和可扩展的疫苗。 | SnoopLigase是一种从肺炎链球菌粘附素工程化的肽-肽连接方法,能够形成两个肽标签(DogTag和SnoopTagJr)之间的异肽键,为疫苗设计和合成生物学中的纳米结构构建提供了新的策略。 | NA | 开发一种新的平台和连接途径,将潜在的保护性抗原转化为广泛保护和可扩展的疫苗。 | SnoopLigase肽-肽连接方法及其在疫苗设计和合成生物学中的应用。 | 合成生物学 | 传染病 | SnoopLigase肽-肽连接 | NA | 肽和蛋白质 | 涉及两种血液期疟疾蛋白(来自PfEMP1或CyRPA)和一个与癌症免疫治疗相关的端粒酶肽。 |
10 | 2024-08-07 |
The Evolution of SlyA/RovA Transcription Factors from Repressors to Countersilencers in Enterobacteriaceae
2019-03-05, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mBio.00009-19
PMID:30837332
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研究论文 | 本文通过结构、功能和遗传分析,研究了SlyA/RovA这一MarR转录因子家族成员的进化过程,特别是它们从抑制因子到反沉默因子的转变 | SlyA和RovA获得了反沉默横向获得基因的能力,这极大地促进了通过横向基因转移的进化 | NA | 探讨转录因子在细菌进化中的作用及其对新兴病原体适应性的影响 | SlyA/RovA转录因子及其在细菌中的功能和进化 | NA | NA | 结构分析、功能分析、遗传分析 | NA | NA | NA |
11 | 2024-08-07 |
A gRNA-tRNA array for CRISPR-Cas9 based rapid multiplexed genome editing in Saccharomyces cerevisiae
2019-Mar-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-019-09005-3
PMID:30837474
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研究论文 | 报道了一种用于CRISPR-Cas9系统的gRNA-tRNA阵列(GTR-CRISPR),能够在酵母中进行多重基因编辑 | 开发了一种加速的Lightning GTR-CRISPR系统,避免了在E. coli中的克隆步骤,直接将Golden Gate反应混合物转化到酵母中,简化了酵母脂质网络,显著提高了游离脂肪酸的产量 | 使用未优化的gRNAs时效率较低 | 提高合成生物学中菌株工程的效率 | 酵母基因编辑和脂质网络简化 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 基因组数据 | 涉及8个基因的编辑 |
12 | 2024-08-07 |
Utilizing in vitro DNA assembly to engineer a synthetic T7 Nanoluc reporter phage for Escherichia coli detection
2019-Mar-01, Integrative biology : quantitative biosciences from nano to macro
IF:1.5Q4
DOI:10.1093/intbio/zyz005
PMID:30927414
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研究论文 | 本文介绍了一种利用体外DNA组装技术构建合成T7 Nanoluc报告噬菌体以检测大肠杆菌的方法 | 提出了一种简单的体外方法来工程化噬菌体,并成功构建了NRGp6报告噬菌体,用于高效检测低浓度的大肠杆菌 | NA | 开发新的检测方法和治疗手段以对抗细菌 | 大肠杆菌的检测 | 合成生物学 | NA | 体外DNA组装 | NA | NA | NA |