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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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1 | 2024-08-05 |
Base Editors: Modular Tools for the Introduction of Point Mutations in Living Cells
2019-Nov, Emerging topics in life sciences
IF:3.4Q1
DOI:10.1042/etls20190088
PMID:32270050
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研究论文 | 该文章介绍了一种新型的基因组编辑工具——基础编辑器,用于在活细胞中引入点突变 | 文章强调了基础编辑器的模块化特性,并展示了不同ssDNA修饰酶和Cas蛋白的组合所产生的独特性质和潜在应用 | NA | 探讨基础编辑器在合成生物学和基因组合工程中的应用及其相对于其他技术的独特优势 | 目前已报告的多种基础编辑器 | NA | NA | CRISPR | NA | NA | NA |
2 | 2024-08-05 |
Model-Driven Engineering of N-Linked Glycosylation in Chinese Hamster Ovary Cells
2019-11-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.9b00215
PMID:31596566
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研究论文 | 本文描述了一种结合系统级动力学模型和合成生物学平台的方法,以理性调整N-链接糖基化 | 通过系统和合成生物学的结合,实现了快速假设测试和基因扰动的协同效应识别 | 未明确说明研究的具体局限性 | 增加分泌的免疫球蛋白G (IgG) 蛋白上的半乳糖纳入量 | CHO细胞和转基因细胞池 | 合成生物学 | NA | 系统动力学建模 | NA | NA | 共测试了23个转基因细胞池 |
3 | 2024-08-07 |
Development of a Split Esterase for Protein-Protein Interaction-Dependent Small-Molecule Activation
2019-Nov-27, ACS central science
IF:12.7Q1
DOI:10.1021/acscentsci.9b00567
PMID:31807678
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研究论文 | 本文开发了一种基于蛋白质相互作用依赖的小分子激活的分离酯酶系统 | 首次提出了一种基于蛋白质相互作用依赖的小分子激活的分离酯酶系统,该系统能够选择性地在相互作用依赖的方式下解除酯保护的小分子 | NA | 开发一种新的生物传感系统,用于在生物系统中基于测量输入信号生成目标小分子 | 分离酯酶系统及其在蛋白质相互作用检测和细胞杀伤中的应用 | 合成生物学 | NA | 分离酯酶系统 | NA | NA | NA |
4 | 2024-08-07 |
Structural organization of biocatalytic systems: the next dimension of synthetic metabolism
2019-Nov-11, Emerging topics in life sciences
IF:3.4Q1
DOI:10.1042/ETLS20190015
PMID:33523157
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综述 | 本文综述了体外合成代谢网络(SIVMNs)的结构组织及其在提高效率和生产力方面的重要性 | 探讨了如何通过结构组织优化合成代谢网络,以减少有害副反应、有效利用可再生能源并提高生产力 | NA | 探讨如何进一步发展体外合成代谢网络,通过结构组织优化其性能 | 体外合成代谢网络(SIVMNs)及其反应的结构组织 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
5 | 2024-08-07 |
Physicochemical considerations for bottom-up synthetic biology
2019-11-11, Emerging topics in life sciences
IF:3.4Q1
DOI:10.1042/ETLS20190017
PMID:33523159
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综述 | 文章综述了从分子组件构建合成细胞的挑战性研究领域,特别是生物系统在合成囊泡中限制的影响 | NA | NA | 探讨构建合成细胞所需的物理化学考虑 | 合成细胞的内部pH、离子强度、大分子拥挤、氧化还原状态及代谢能量守恒 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
6 | 2024-08-07 |
Exploiting the Feedstock Flexibility of the Emergent Synthetic Biology Chassis Vibrio natriegens for Engineered Natural Product Production
2019-Nov-30, Marine drugs
IF:4.9Q1
DOI:10.3390/md17120679
PMID:31801279
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研究论文 | 研究利用新兴合成生物学底盘Vibrio natriegens的原料灵活性,进行异源天然产物生产 | 首次探索了Vibrio natriegens作为合成生物学底盘在多种工业相关原料下生产天然产物的能力 | NA | 评估Vibrio natriegens作为合成生物学底盘生产天然产物的潜力 | Vibrio natriegens的异源天然产物生产能力,特别是β-胡萝卜素和紫胶素 | 合成生物学 | NA | 基因表达 | NA | 生物数据 | NA |
7 | 2024-08-07 |
From Endogenous to Synthetic microRNA-Mediated Regulatory Circuits: An Overview
2019-11-29, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells8121540
PMID:31795372
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综述 | 本文综述了微小RNA(microRNA)在基因调控网络中的作用及其在合成生物学中的应用 | 介绍了人工合成电路在实验中测试microRNA调控任务的应用,并探讨了其在临床应用中的潜力 | NA | 综述microRNA介导的调控电路及其在合成生物学中的最新进展 | microRNA及其在生物网络中的作用和人工合成电路的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
8 | 2024-08-07 |
Modulating Mistranslation Potential of tRNASer in Saccharomyces cerevisiae
2019-11, Genetics
IF:3.3Q2
DOI:10.1534/genetics.119.302525
PMID:31484688
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研究论文 | 研究通过引入次级突变调节tRNASer在酵母中的错译潜力 | 通过遗传选择识别出22种次级突变,这些突变主要位于单链区域或替换G:U碱基对为Watson-Crick对,允许非毒性错译 | 多数次级突变影响tRNA在细胞中的稳定性,且在低温下更具毒性 | 识别调节tRNA错译水平的次级位点替换 | tRNASer在Saccharomyces cerevisiae中的错译潜力 | NA | NA | 遗传选择 | NA | 蛋白质组分析 | NA |
9 | 2024-08-07 |
A transient reporter for editing enrichment (TREE) in human cells
2019-11-04, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkz713
PMID:31428784
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研究论文 | 本研究开发了一种名为TREE的临时报告系统,用于在人类细胞中高效筛选经过碱基编辑的细胞群体 | TREE系统通过使用蓝色荧光蛋白(BFP)在C到T替换后转化为绿色荧光蛋白(GFP),直接报告细胞内的碱基编辑活性,显著提高了编辑效率 | NA | 优化碱基编辑转染参数和递送策略,并开发一种高效的临时报告系统用于筛选碱基编辑细胞 | 人类细胞和人类多能干细胞(hPSCs) | 合成生物学 | NA | 碱基编辑技术 | NA | 荧光信号 | 多个独立位点 |
10 | 2024-08-07 |
Combined genome editing and transcriptional repression for metabolic pathway engineering in Corynebacterium glutamicum using a catalytically active Cas12a
2019-Nov, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-019-10118-4
PMID:31583448
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研究论文 | 本文设计了一种结合基因组编辑和转录抑制的双功能CRISPR系统(RE-CRISPR),使用具有催化活性的Cas12a在谷氨酸棒杆菌中进行代谢途径工程 | 开发了一种新的RE-CRISPR系统,能够同时实现基因组编辑和转录抑制,提高了代谢产物的生产效率 | NA | 设计一种能够在谷氨酸棒杆菌中同时进行基因组编辑和转录抑制的新工具,以优化代谢途径 | 谷氨酸棒杆菌的代谢和调控基因 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas12a | NA | 基因组数据 | NA |
11 | 2024-08-07 |
Simultaneous repression of multiple bacterial genes using nonrepetitive extra-long sgRNA arrays
2019-Nov, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-019-0286-9
PMID:31591552
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研究论文 | 本文通过使用非重复超长sgRNA阵列(ELSAs)同时抑制多个细菌基因,解决了CRISPR干扰中多sgRNA共表达引起的遗传不稳定性和表型丧失问题。 | 开发了非重复超长sgRNA阵列(ELSAs),通过结合非重复遗传部件和算法规则设计,实现了对多个基因的同时稳定调控。 | NA | 实现对多个细菌基因的同时稳定调控,以应用于代谢工程和合成生物学。 | 细菌基因的调控和细菌表型的工程化。 | 合成生物学 | NA | CRISPR干扰 | NA | DNA序列 | 22个sgRNAs,28个sgRNA handles |
12 | 2024-08-07 |
Simultaneous Visualization of Multiple Gene Expression in Single Cells Using an Engineered Multicolor Reporter Toolbox and Approach of Spectral Crosstalk Correction
2019-11-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.9b00223
PMID:31596563
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research paper | 本文设计并开发了一种多色荧光报告工具箱,用于同时监测单细胞中多个基因的活性,并通过线性解混算法解决了多荧光蛋白间的光谱串扰问题 | 本文创新性地开发了一种多色荧光报告工具箱,并采用线性解混算法实现了对基因表达的定量分析,从而实现了高置信度的真实信号分离 | NA | 开发一种新的工具和方法,用于在单细胞水平上同时监测多个基因的表达 | 单细胞中多个基因的活性监测 | synthetic biology | NA | 多色荧光报告工具箱,线性解混算法 | NA | image | NA |
13 | 2024-08-07 |
Isolating promoters from Corynebacterium ammoniagenes ATCC 6871 and application in CoA synthesis
2019-11-12, BMC biotechnology
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12896-019-0568-9
PMID:31718625
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研究论文 | 本研究从Corynebacterium ammoniagenes ATCC 6871中分离出20个潜在的DNA启动子和6个分子伴侣基因启动子,并评估了它们在代谢工程中的应用 | 成功分离出一系列具有不同活性的启动子,其中来自50S核糖体蛋白L21上游序列的片段显示出最强的活性,并应用于提高C. ammoniagenes中辅酶A的产量 | NA | 研究如何通过分离和应用不同活性的启动子来优化C. ammoniagenes的代谢途径,以提高工业应用中的产量 | Corynebacterium ammoniagenes ATCC 6871中的启动子和辅酶A的合成 | 代谢工程 | NA | 红荧光蛋白(RFP)作为报告基因 | NA | DNA序列 | 26个启动子 |