合成生物学相关文章
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当前共找到 51 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2024-08-07 |
Mechanism-Driven Metabolic Engineering for Bio-Based Production of Free R-Lipoic Acid in Saccharomyces cerevisiae Mitochondria
2020, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2020.00965
PMID:32974306
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研究论文 | 研究通过代谢工程改造酵母细胞，实现生物基R-硫辛酸的生产 | 首次报道了在酵母细胞中生物合成自由R-硫辛酸的方法 | NA | 开发基于合成生物学的方法，实现可持续的R-硫辛酸生产 | 酵母细胞中的硫辛酸生物合成机制及蛋白质脂酰化过程 | 生物工程 | 癌症 | LC-MS/MS | NA | 蛋白质 | NA |
| 22 | 2024-08-07 |
Genomics-enabled analysis of specialized metabolism in bioenergy crops: current progress and challenges
2020, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysaa005
PMID:32995549
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综述 | 本文综述了利用基因组学技术分析生物能源作物中特殊代谢的当前进展与挑战 | 介绍了DNA合成和合成生物学工具在加速植物特殊代谢中基因、酶和途径功能发现方面的应用 | 由于许多植物对遗传方法的抗性和缺乏研究特殊代谢中多样酶类的'用户友好'生化工具，使用系统性数据解码基因和酶功能的效率仍然有限 | 旨在阐述在生物能源作物中应用DNA合成和合成生物学工具加速植物特殊代谢中基因、酶和途径功能发现的当前进展与挑战 | 以生物能源作物中的萜类代谢为例，探讨植物特殊代谢的研究 | 基因组学 | NA | 基因组学技术 | NA | 基因组数据 | 涉及多种生态和经济上重要的植物物种 |
| 23 | 2024-08-07 |
Novel Tunable Spatio-Temporal Patterns From a Simple Genetic Oscillator Circuit
2020, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2020.00893
PMID:33014996
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研究论文 | 研究了抑制子环振荡器与细胞生长约束之间的耦合，展示了机械约束如何生成细胞生长速率不均匀的特征模式，并开发了一个一维模型来预测基因表达的行波模式。 | 提出了一个简单的方法，通过蛋白质稀释将抑制子环振荡器与生长速率模式耦合，生成可预测的时空模式，并验证了这些模式的关键特征与蛋白质降解和基因表达速率之间的关系。 | NA | 探索简单的遗传电路如何在多细胞尺度上编码复杂的多细胞行为，并为合成生物学的设计-构建-测试-学习循环提供可测试的预测。 | 抑制子环合成遗传环振荡器与细胞生长约束的耦合机制及其对细胞生长速率不均匀模式的影响。 | 合成生物学 | NA | NA | 一维模型 | 细胞殖民模拟 | NA |
| 24 | 2024-08-07 |
Efficient Selection Scheme for Incorporating Noncanonical Amino Acids Into Proteins in Saccharomyces cerevisiae
2020, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2020.569191
PMID:33042970
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研究论文 | 本研究开发了一种简化的选择方案，用于在酵母中高效地引入非经典氨基酸到蛋白质中 | 利用合成生物学中的逻辑门优化筛选程序，发现“与”门比“或”门更适合分离氨基酸tRNA合成酶，并成功证明了新选择方案的实用性和效率 | NA | 解决非经典氨基酸技术在蛋白质工程中应用的复杂选择方案问题 | 非经典氨基酸在蛋白质中的引入及其在酵母中的应用 | 蛋白质工程 | NA | 合成生物学逻辑门 | NA | NA | 几种新的OMeY-tRNA合成酶突变体在酵母和HEK293细胞中进行了测试 |
| 25 | 2024-08-07 |
Quantitative and Predictive Genetic Parts for Plant Synthetic Biology
2020, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2020.512526
PMID:33123175
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研究论文 | 本文描述了用于描述植物合成生物学中遗传组件定量特性的方法 | 提出了使用计算机选择最优组件以组装成功能设备的方法，如触发开关和正反馈电路 | 植物合成生物学仍处于早期阶段，植物细胞和组织的分化以及环境因素对遗传组件功能的影响带来了挑战 | 旨在生产可预测和可编程的遗传电路，以利用植物的自然能力并赋予其新用途 | 植物合成生物学中的遗传组件 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 26 | 2024-08-07 |
Design of a Transcriptional Biosensor for the Portable, On-Demand Detection of Cyanuric Acid
2020-01-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.9b00348
PMID:31825601
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研究论文 | 本文设计了一种用于快速检测氰尿酸（CYA）的便携式转录生物传感器 | 通过合理设计混合启动子，克服了LTTR在不同宿主间的移植挑战，并将其应用于全细胞生物传感器和冻干的无细胞系统中 | NA | 开发一种便携式、按需检测氰尿酸的转录生物传感器 | 氰尿酸（CYA） | 合成生物学 | NA | 转录调控 | LTTR | NA | 实验室和真实世界样本 |
| 27 | 2024-08-07 |
Resources to Discover and Use Short Linear Motifs in Viral Proteins
2020-01, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2019.07.004
PMID:31427097
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研究论文 | 本文探讨了病毒蛋白中短线性基序（SLiMs）的发现和应用，这些基序通过分子模拟逃避宿主免疫功能 | 本文介绍了SLiMs在合成生物学中的潜在应用，如更好的免疫原和疗法，并指出了其可能带来的生物安全挑战 | NA | 研究病毒蛋白中短线性基序的发现和应用 | 病毒蛋白中的短线性基序（SLiMs） | 生物信息学 | NA | NA | NA | 蛋白质序列 | NA |
| 28 | 2024-08-07 |
Establishing a Eukaryotic Pichia pastoris Cell-Free Protein Synthesis System
2020, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2020.00536
PMID:32626695
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研究论文 | 本文开发并优化了一种源自蛋白酶缺陷型SMD1163株的酵母无细胞蛋白合成系统 | 开发了一种新的酵母无细胞蛋白合成系统，适用于合成生物学应用和高产量的复杂蛋白生产 | NA | 扩展当前的无细胞蛋白合成系统，开发新的源自真核生物的无细胞蛋白合成系统 | 酵母无细胞蛋白合成系统及其在合成生物学和高产量复杂蛋白生产中的应用 | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白合成 | NA | 蛋白质 | 50.16 ± 7.49 μg/ml的sfGFP在5小时批次反应中 |
| 29 | 2024-08-07 |
Toward Engineering Biosystems With Emergent Collective Functions
2020, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2020.00705
PMID:32671054
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研究论文 | 本文探讨了如何利用多智能体建模作为合成生物学中的设计框架，以克服工程涌现集体功能面临的挑战 | 提出使用多智能体建模来捕捉复杂多尺度系统的核心特征，并提供对指导跨尺度涌现功能的基础机制的新见解 | NA | 探索如何通过多智能体建模在合成生物学中实现具有涌现集体功能的生物系统 | 复杂生物系统中的涌现集体功能 | 合成生物学 | NA | 多智能体建模 | 多智能体模型 | NA | NA |
| 30 | 2024-08-07 |
Synthetic Biology and Metabolic Engineering Employing Escherichia coli for C2-C6 Bioalcohol Production
2020, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2020.00710
PMID:32719784
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综述 | 本文综述了利用大肠杆菌进行C2-C6生物酒精生产的合成生物学和代谢工程研究进展 | 探讨了生物酒精作为替代化石燃料的潜力，特别是在减少温室气体排放方面的优势 | 分析了当前提高工业应用生产率的挑战 | 旨在增强生物酒精的生产，支持更环保的能源过程 | 利用大肠杆菌进行C2-C6生物酒精的生产 | 代谢工程 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 31 | 2024-08-07 |
Riboflow: Using Deep Learning to Classify Riboswitches With ∼99% Accuracy
2020, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2020.00808
PMID:32760712
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研究论文 | 本文使用深度学习框架，特别是卷积神经网络（CNN）和双向循环神经网络（RNN）与长短期记忆（LSTM），对32种配体类别的综合数据集进行分类，以高精度识别核糖开关的配体特异性 | 本文提出的双向LSTM RNN模型在识别核糖开关配体特异性方面表现出>0.99的准确率和0.96的宏平均F分数，且不需要预先的特征工程，模型具有动态更新功能以适应新发现的核糖开关 | NA | 解决核糖开关特性识别的计算难题，并推动合成生物学中遗传回路设计的精确翻译控制 | 核糖开关及其配体特异性 | 机器学习 | NA | 深度学习 | CNN, LSTM | 数据集 | 32种配体类别 |
| 32 | 2024-08-07 |
Cell-Free Systems: A Proving Ground for Rational Biodesign
2020, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2020.00788
PMID:32793570
|
观点 | 本文探讨了无细胞基因表达系统在合成生物学中的应用，并提出这些系统是测试理性生物设计策略的理想平台 | 无细胞基因表达系统利用非活体生物化学反应来控制生物基因表达，其开放性质使得所有组件可直接访问，便于模型构建和验证 | 这些系统存在反应寿命有限和缺乏稳态等独特困难 | 提出无细胞系统是测试理性生物设计策略的理想平台，并期望从这一方法中获得的进展有助于更可靠和系统地工程化无细胞及活细胞系统 | 无细胞基因表达系统及其在合成生物学中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 33 | 2024-08-07 |
Are Antisense Proteins in Prokaryotes Functional?
2020, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2020.00187
PMID:32923454
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研究论文 | 本文探讨了原核生物中反义蛋白的功能性问题 | 研究揭示了大量新发现的蛋白质对生物体有用，并提出了这些蛋白质应被添加到基因组注释中，以及预测它们的方法应标准化 | 确定这些蛋白质产品的功能部分仍需进一步研究，包括分子相互作用的研究和详细的进化分析 | 旨在揭示大量新型蛋白质，这些蛋白质具有极其多样化的潜在实际应用 | 原核生物中的反义蛋白 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 34 | 2024-08-07 |
Smallpox in the Post-Eradication Era
2020-Jan-24, Viruses
DOI:10.3390/v12020138
PMID:31991671
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review | 本文回顾了在根除天花后的时代中，天花病毒的现状及其潜在风险 | 探讨了合成生物学在重建天花病毒方面的进展 | NA | 旨在开发诊断测试、抗病毒药物和更安全的疫苗 | 天花病毒及其在现代社会中的潜在影响 | NA | 天花 | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 35 | 2024-08-07 |
Encapsulation mechanisms and structural studies of GRM2 bacterial microcompartment particles
2020-01-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-019-14205-y
PMID:31959751
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研究论文 | 本文研究了GRM2细菌微区室的封装机制及其结构 | 首次报道了从肺炎克雷伯菌GRM2位点分离和重组表达BMC结构基因，并探讨了核心酶的封装机制 | NA | 深入理解BMC壳体组装和封装过程，为合成生物学应用提供支持 | 细菌微区室（BMCs）的结构和封装机制 | NA | NA | 冷冻电镜（cryo-EM） | NA | 结构数据 | NA |
| 36 | 2024-08-07 |
Microfluidic techniques for separation of bacterial cells via taxis
2020-Jan-15, Microbial cell (Graz, Austria)
DOI:10.15698/mic2020.03.710
PMID:32161767
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研究论文 | 本文探讨了利用微流控技术通过趋化作用分离细菌细胞的方法 | 改进了微流控技术，实现了基于微小运动特性差异的细胞精细分离 | NA | 研究微生物运动性，并探索其在合成生物学、定向进化和应用医学微生物学中的应用 | 细菌细胞的分离 | NA | NA | 微流控技术 | NA | NA | NA |
| 37 | 2024-08-07 |
SEVA 3.0: an update of the Standard European Vector Architecture for enabling portability of genetic constructs among diverse bacterial hosts
2020-01-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkz1024
PMID:31740968
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研究论文 | 本文介绍了标准欧洲载体架构3.0数据库（SEVA-DB 3.0）的更新，该数据库是一个网络资源和遗传工具（主要是质粒）的物质存储库，用于分析、构建和部署复杂的细菌表型 | 更新包括更用户友好的网络界面、更多的质粒载体以及与先进生物信息学工具的新链接，提供直观的构建可视化和一系列以前不可能的DNA片段虚拟操作 | NA | 扩展合成生物学方法，使其适用于非标准细菌物种以及为一系列基础和生物技术努力编程新的原核底盘 | 细菌遗传工具和数据库 | 合成生物学 | NA | 生物信息学工具 | NA | 遗传工具（质粒） | NA |
| 38 | 2024-08-07 |
Bottom-Up Construction of Complex Biomolecular Systems With Cell-Free Synthetic Biology
2020, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2020.00213
PMID:32266240
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综述 | 本文综述了无细胞系统在工程生物学中的历史和最新进展，特别是在重组系统和粗提物系统中的发展，以及促进无细胞蛋白质合成反应通量、分区和空间控制的技术突破 | 通过掌握无细胞平台的控制，可以逐步构建更复杂的生物分子系统，并以自下而上的方式接近自然生物复杂性 | NA | 探讨无细胞系统在工程生物学中的应用及其技术进展 | 无细胞系统及其在蛋白质合成反应中的应用 | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白质合成 | NA | NA | NA |
| 39 | 2024-08-07 |
Editorial: Systems Biology and Synthetic Biology in Relation to Drought Tolerance or Avoidance in Plants
2020, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2020.00394
PMID:32328077
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 40 | 2024-08-07 |
Synthetic Biology Tools for Genome and Transcriptome Engineering of Solventogenic Clostridium
2020, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2020.00282
PMID:32363182
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综述 | 本文综述了用于溶剂产生梭菌基因组和转录组工程的合成生物学工具的最新进展 | 介绍了利用移动组II内含子、等位基因交换和CRISPR/Cas9等基因组工程工具，以及非翻译区（UTR）工程和合成sRNA技术等转录组工程工具 | NA | 探讨如何利用这些技术促进梭菌的代谢工程，开发具有所需功能特性的改良菌株，从而实现经济上可行的丁醇生产过程 | 溶剂产生梭菌的基因组和转录组工程 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9, 移动组II内含子, 等位基因交换, UTR工程, 合成sRNA技术 | NA | 基因组, 转录组 | NA |