合成生物学相关文章
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当前共找到 177 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-10-18 |
Co-administration of tecovirimat and ACAM2000™ in non-human primates: Effect of tecovirimat treatment on ACAM2000 immunogenicity and efficacy versus lethal monkeypox virus challenge
2020-01-16, Vaccine
IF:4.5Q2
DOI:10.1016/j.vaccine.2019.10.049
PMID:31677948
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研究论文 | 研究在非人灵长类动物中同时接种ACAM2000天花疫苗和tecovirimat抗病毒药物的相互作用，评估疫苗免疫原性和对致死性猴痘病毒攻击的保护效果。 | 首次在非人灵长类动物模型中系统评估tecovirimat与ACAM2000疫苗联合使用的免疫原性和保护效力，揭示两者可能的相互作用。 | 仅在非人灵长类动物中进行，样本量有限，且三项研究结果不完全一致，第三项研究显示体液免疫降低，需要进一步研究确认。 | 了解天花疫苗ACAM2000与抗病毒药物tecovirimat联合使用时对疫苗免疫原性和保护效力的影响。 | 非人灵长类动物（猴子） | 传染病学、疫苗学 | 天花、猴痘 | 疫苗接种、病毒攻击实验、免疫学检测 | NA | 实验数据、免疫学数据、临床观察数据 | 三项研究中共涉及数十只猴子（具体数量未在摘要中明确列出） | NA | 非人灵长类动物 | NA | 医学、公共卫生 |
| 2 | 2026-10-12 |
Metagenomics Approaches in Discovery and Development of New Bioactive Compounds from Marine Actinomycetes
2020-Apr, Current microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00284-019-01698-5
PMID:31069462
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综述 | 本文综述了宏基因组学在海洋放线菌新型生物活性化合物发现与开发中的应用，包括基于序列和功能的筛选方法、相关技术进展及面临的挑战 | 系统总结了宏基因组学结合先进扩增与筛选技术（如φ29 DNA聚合酶、新一代测序、Cosmids）及新型生物信息学工具（如自动化基因组挖掘、anti-SMASH）在克服传统方法局限方面的潜力 | 宏基因组学存在偏好性分类、高质量DNA样本不易获取、异源表达及宿主选择等局限 | 探讨宏基因组学方法在海洋放线菌生物活性化合物发现与开发中的应用与前景 | 海洋放线菌及其宏基因组 | NA | NA | 宏基因组学、新一代测序、φ29 DNA聚合酶扩增、Cosmids、生物信息学工具（自动化基因组挖掘、anti-SMASH） | NA | 序列数据、功能筛选数据 | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 3 | 2026-10-12 |
CRISPR-associated nucleases: the Dawn of a new age of efficient crop improvement
2020-02, Transgenic research
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s11248-019-00181-y
PMID:31677059
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综述 | 本文综述了CRISPR相关核酸酶的发展历史及其在多种植物基因组编辑中的应用，并介绍了新报道的核酸酶工具 | 系统总结了新报道的多种CRISPR相关核酸酶，并探讨其通过不同DNA序列改变形式编辑植物特定基因的潜力，以及与合成生物学整合的前景 | 作为综述文章，未提供原始实验数据，且主要基于已有研究进行归纳 | 总结CRISPR相关核酸酶在作物改良中的应用及新型核酸酶工具的发展 | 多种植物物种的基因组编辑 | 农业生物技术 | NA | CRISPR相关核酸酶基因组编辑 | NA | 文本 | NA | CRISPR-Cas9 | 植物 | NA | 农业 |
| 4 | 2026-10-12 |
An update and perspectives on the use of promoters in plant genetic engineering
2020, Journal of biosciences
IF:2.1Q2
PMID:33097676
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综述 | 本文综述了植物基因工程中启动子的使用进展与前景，重点讨论了不同类型启动子（如组成型、诱导型、组织特异性启动子）在转基因表达调控中的作用、优缺点及其在合成生物学和基因组编辑中的应用 | 系统更新了目前已报道的各类启动子的重要性、当前前景及优缺点，并探讨了其在合成生物学和基因组编辑中的影响，为开发营养和农艺改良的转基因作物提供指导 | 作为综述，缺乏原始实验数据，主要基于已有文献的归纳和总结，未提供新的实验验证 | 总结植物基因工程中启动子的重要性和应用前景，帮助研究人员更好地利用启动子开发营养和农艺改良的转基因作物 | 植物基因工程中使用的各类启动子及其在转基因植物中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | 植物 | NA | 农业 |
| 5 | 2026-10-03 |
A Generative Neural Network for Maximizing Fitness and Diversity of Synthetic DNA and Protein Sequences
2020-07-22, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2020.05.007
PMID:32711843
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研究论文 | 本文开发了深度探索网络（DENs），一种激活最大化的生成模型，通过梯度下降最小化神经网络适应度预测器的成本，并基于相似性度量惩罚生成模式以最大化序列多样性，同时使用变分自编码器保持生成序列的似然比，应用于合成DNA和蛋白质序列设计 | 提出了深度探索网络（DENs），通过惩罚相似性度量显式最大化序列多样性，并整合变分自编码器避免预测器低置信区域，生成序列的多样性优于传统梯度上升方法 | 未在摘要中明确提及 | 设计具有特定功能特性的合成DNA和蛋白质序列 | 合成DNA序列（多聚腺苷酸化信号、剪接调控序列）和蛋白质序列 | 机器学习 | NA | 深度神经网络、梯度下降优化、变分自编码器 | 深度探索网络（DENs）、变分自编码器（VAE） | 序列数据 | NA | NA | NA | NA | 医学、工业生物技术 |
| 6 | 2026-09-30 |
Hijacking Translation Initiation for Synthetic Biology
2020-05-15, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202000017
PMID:32023356
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综述 | 本文综述了利用翻译起始机制进行遗传密码扩展的方法，以实现非经典氨基酸在蛋白质中的共翻译插入 | 提出将翻译起始位置纳入遗传密码扩展，可插入α-胺修饰或完全缺失的多种分子 | 未具体说明各方法的适用性和效率限制 | 探索在体外和体内用多种分子启动蛋白质合成的方法 | 蛋白质合成起始过程 | 合成生物学 | NA | 遗传密码扩展 | NA | 文本 | NA | NA | 多种宿主生物 | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 7 | 2026-09-29 |
Emerging Technologies in Algal Biotechnology: Toward the Establishment of a Sustainable, Algae-Based Bioeconomy
2020, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2020.00279
PMID:32256509
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综述 | 本文综述了藻类生物技术领域的技术进展、新应用领域和产品，探讨了合成生物学、高通量表型组学和物联网自动化等新兴技术如何推动基于藻类的生物经济的发展 | 系统性地整合了合成生物学、高通量表型组学和物联网自动化等新兴技术在藻类生物制造中的应用前景，提出了实现可持续藻类生物经济的综合技术路线 | 作为综述文章，未提供原始实验数据；对藻类基因操作的效率和稳定性等具体技术瓶颈讨论有限 | 回顾藻类生物技术的发展现状，阐明藻类作为高科技、低成本、环境友好型解决方案的潜力，并探讨新兴技术如何推动藻类生物经济的建立 | 微藻及藻类生物技术 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、高通量表型组学、物联网自动化 | NA | 文本 | NA | NA | 微藻 | NA | 医药, 农业, 能源, 食品, 工业生物技术 |
| 8 | 2026-09-28 |
Enabling protein-hosted organocatalytic transformations
2020-Apr-22, RSC advances
IF:3.9Q2
DOI:10.1039/d0ra01526a
PMID:33184588
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综述 | 本文综述了有机催化人工酶的发展，包括其制备方法、性能优化技术以及应用实例 | 强调了有机催化人工酶在提高有机催化生物相容性和扩展酶催化功能方面的创新 | 未具体说明，但综述讨论了挑战 | 讨论有机催化人工酶的发展 | 有机催化人工酶 | 蛋白质工程 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 化学, 合成生物学 |
| 9 | 2026-09-11 |
Point-of-Care Devices to Detect Zika and Other Emerging Viruses
2020-06-04, Annual review of biomedical engineering
IF:12.8Q1
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综述 | 本文综述了侧向层析免疫分析和基于合成生物学的诊断方法（包括基于CRISPR的诊断）在检测寨卡病毒及其他新发病毒中的应用 | 提出侧向层析免疫分析与合成生物学诊断工具联合或平行使用可能代表可扩展快速诊断的未来，并描述了功能化多色纳米颗粒与计算方法联用解卷积数据 | 未明确提及 | 探讨用于检测寨卡病毒和其他新发病毒的即时诊断设备的最佳方案 | 寨卡病毒及其他新发病毒 | 即时诊断 | 寨卡病毒感染 | 侧向层析免疫分析、合成生物学诊断、CRISPR诊断 | NA | NA | NA | CRISPR | NA | 合成基因回路 | 医学、公共卫生 |
| 10 | 2026-05-29 |
Recent advances in synthetic biology of cyanobacteria for improved chemicals production
2020-12, Bioengineered
IF:4.2Q2
DOI:10.1080/21655979.2020.1837458
PMID:33124500
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综述 | 总结蓝藻合成生物学在提高化学品生产方面最新进展 | 综述了蓝藻合成生物学工具箱的最新应用和进展 | 由于生物产品产量低，大规模应用仍是技术挑战 | 推动蓝藻生物技术中新型工具的应用和未来展望 | 蓝藻 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 蓝藻 | NA | 工业生物技术 |
| 11 | 2026-05-05 |
Levels of autonomy in synthetic biology engineering
2020-12, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.15252/msb.202010019
PMID:33331138
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综述 | 探讨合成生物学工程中的自主性层次，分析标准化与自动化在工程生物体中的应用现状与挑战 | 系统梳理其他工程领域标准化与自动化经验，对比分析合成生物学领域尚未实现全流程自动化的核心障碍 | 未提供具体实验数据或定量分析，属于概念性综述，缺乏对现有自主性层次划分的实证验证 | 评估合成生物学工程中自主性水平的现状与发展方向 | 合成生物学工程过程及自主化设计方法 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 12 | 2026-04-30 |
Budding yeast as a factory to engineer partial and complete microbial genomes
2020-Dec, Current opinion in systems biology
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.coisb.2020.09.003
PMID:33015421
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综述 | 该论文综述了利用芽殖酵母作为工厂来工程化部分和完整微生物基因组的最新进展 | 总结了酵母在合成生物学中作为宿主进行高效基因组编辑的新方法，以及快速合成、组装和修改病毒与细菌基因组以应对新兴病原体的潜力 | 大型DNA分子（超过2百万碱基对）难以克隆、细菌基因组的拯救困难，以及技术的双重用途潜力需谨慎考虑 | 探讨酵母细胞在微生物基因组工程中的应用及其生物学意义 | 芽殖酵母及微生物基因组（包括病毒和细菌基因组） | 合成生物学 | NA | 基因组编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 芽殖酵母 | 基因组合成与组装 | 医学、工业生物技术 |
| 13 | 2026-04-20 |
Development of a C18 Supercritical Fluid Chromatography-Tandem Mass Spectrometry Methodology for the Analysis of Very-Long-Chain Polyunsaturated Fatty Acid Lipid Matrices and Its Application to Fish Oil Substitutes Derived from Genetically Modified Oilseeds in the Aquaculture Sector
2020-Sep-08, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.0c02631
PMID:32923786
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研究论文 | 开发了一种基于C18超临界流体色谱-串联质谱的方法，用于分析含超长链多不饱和脂肪酸的复杂脂质基质，并将其应用于评估转基因油籽来源的鱼油替代品在鲑鱼养殖中的效果 | 首次将高强度的硅胶C18柱与超临界流体色谱-串联质谱联用，实现了对复杂脂质组中脂质类别的离散分离及同类别内异构体的选择性分析，特别适用于合成生物学改造产物的脂质组学研究 | 方法主要针对含超长链多不饱和脂肪酸的复杂脂质组，对于其他类型脂质基质的适用性未进行广泛验证 | 开发一种快速、环保且高效的脂质组学分析方法，用于评估转基因油籽来源的鱼油替代品在鲑鱼养殖中的营养效果 | 鲑鱼肉中的复杂脂质组，特别是含有18:3、20:5和22:6等超长链多不饱和脂肪酸的三酰甘油和磷脂 | NA | NA | 超临界流体色谱-串联质谱、主动扫描四极杆技术、数据非依赖性采集 | NA | 质谱数据 | 饲喂转基因油籽补充饲料的鲑鱼与对照饲料鲑鱼的肉质样本 | NA | 转基因油籽（陆地油籽作物） | NA | 农业、水产养殖、工业生物技术 |
| 14 | 2026-04-08 |
Mycoplasma pneumoniae Genome Editing Based on Oligo Recombineering and Cas9-Mediated Counterselection
2020-07-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.0c00022
PMID:32502342
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研究论文 | 本研究开发了一种基于寡核苷酸重组工程和CRISPR/Cas9反选择技术的支原体基因组编辑方法 | 首次在支原体中建立了基于GP35单链DNA重组酶的寡核苷酸重组工程系统，并结合CRISPR/Cas9反选择技术显著提高了编辑效率 | 基因删除效率随编辑片段增大而降低，对于超过1.8kb的染色体删除可能需要进一步优化 | 开发高效的支原体基因组编辑工具以推动其作为合成生物学底盘菌株的应用 | 肺炎支原体（Mycoplasma pneumoniae） | 合成生物学 | NA | 寡核苷酸重组工程、CRISPR/Cas9基因组编辑 | NA | 基因组序列数据 | NA | CRISPR-Cas9, GP35重组酶 | 肺炎支原体 | NA | 工业生物技术 |
| 15 | 2026-04-03 |
Multifunctional SEVA shuttle vectors for actinomycetes and Gram-negative bacteria
2020-06, MicrobiologyOpen
IF:3.9Q2
DOI:10.1002/mbo3.1024
PMID:32170856
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研究论文 | 本研究开发了23种遵循SEVA标准架构的多功能穿梭载体，用于放线菌和革兰氏阴性菌的基因工程 | 开发了结合革兰氏阴性菌和放线菌（特别是链霉菌）复制起点的多功能SEVA穿梭载体，并引入了新的安普霉素抗性选择标记 | 未明确说明载体在所有放线菌物种中的通用性测试范围，也未讨论长期遗传稳定性 | 扩大链霉菌及其他放线菌的遗传工具库，促进其作为合成生物学通用底盘的应用 | 链霉菌属（特别是Streptomyces albus J1074）及其他放线菌 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | SEVA (Standard European Vector Architecture), Gibson Assembly | Streptomyces albus J1074, Escherichia coli, 放线菌, 革兰氏阴性菌 | 穿梭载体（含整合型、低拷贝数、中高拷贝数复制起点），异源表达系统（用于GFP和芹菜素生产） | 工业生物技术 |
| 16 | 2026-03-29 |
Drivers of metabolic diversification: how dynamic genomic neighbourhoods generate new biosynthetic pathways in the Brassicaceae
2020-08, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.16338
PMID:31769874
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研究论文 | 本研究通过分析十字花科植物基因组，探讨了基因组动态邻域如何通过基因重排驱动三萜类生物合成途径的多样化进化 | 揭示了植物基因组通过动态基因组邻域重组核心酶基因库来产生新生物合成途径的进化机制，为植物代谢多样化提供了基因组学解释 | 研究仅基于13个已测序的十字花科基因组，功能验证仅针对三个代表性基因簇，可能未涵盖该家族的全部代谢多样性 | 探究植物新生物合成途径的进化机制，特别是三萜类代谢途径的多样化过程 | 十字花科植物的三萜类生物合成基因簇及其基因组邻域 | 植物基因组学与代谢工程 | NA | 基因组测序、系统发育分析、功能验证 | NA | 基因组序列数据 | 13个已测序的十字花科植物基因组，包含163个OSC基因 | NA | 十字花科植物 | NA | 合成生物学、代谢工程 |
| 17 | 2026-03-28 |
Design and Experimental Evaluation of a Minimal, Innocuous Watermarking Strategy to Distinguish Near-Identical DNA and RNA Sequences
2020-06-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.0c00045
PMID:32413257
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研究论文 | 本研究设计并实验验证了一种最小化、无害的水印策略，用于区分近似的DNA和RNA序列，以在合成生物学中区分合成与天然基因副本 | 开发了一种系统性的DNA水印策略，通过谨慎交换密码子实现，对酵母生理影响最小，并首次在糖利用途径的13个基因中同时应用水印，结合CRISPR/Cas技术实现选择性基因组编辑 | 研究仅针对酵母模型，水印策略对Gpm1基因有轻微影响，且未在其他生物系统中验证其普适性 | 旨在开发一种DNA水印策略，以区分合成与天然基因副本，支持合成生物学中的基因组改造 | 酵母（Saccharomyces cerevisiae）中的13个糖利用途径基因，包括糖酵解和酒精发酵相关蛋白 | 合成生物学 | NA | 密码子交换、CRISPR/Cas基因组编辑、转录组分析、蛋白质表达和活性检测 | NA | DNA序列、RNA转录本、蛋白质丰度和活性数据 | 酵母菌株，涉及13个水印基因 | CRISPR-Cas9, pathway swapping strategy | Saccharomyces cerevisiae | 水印策略应用于糖利用代谢途径，通过密码子修改设计合成基因变体 | 工业生物技术 |
| 18 | 2026-03-25 |
Machine learning predicts new anti-CRISPR proteins
2020-05-21, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaa219
PMID:32286628
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研究论文 | 本研究开发了一种基于机器学习的工具AcRanker，用于从蛋白质序列中直接预测新的抗CRISPR蛋白 | 首次提出基于XGBoost排序的机器学习方法，仅使用蛋白质序列信息即可预测抗CRISPR蛋白，成功发现两个新型抗CRISPR蛋白AcrIIA20和AcrIIA21 | 预测的候选抗CRISPR蛋白仍需实验验证其抑制活性，且模型性能受训练数据集限制 | 开发快速发现新型抗CRISPR蛋白的生物信息学工具 | 细菌前噬菌体区域中的潜在抗CRISPR蛋白 | 机器学习 | NA | 蛋白质序列分析，XGBoost机器学习 | XGBoost | 蛋白质序列数据 | 已知抗CRISPR蛋白训练集，从自靶向细菌基因组预测的前噬菌体区域筛选 | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 医学，农业，合成生物学 |
| 19 | 2026-03-25 |
A GoldenBraid cloning system for synthetic biology in social amoebae
2020-05-07, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaa185
PMID:32232356
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研究论文 | 本文介绍了GoldenBraid克隆系统在盘基网柄菌合成生物学中的应用，包括一个包含250个DNA部件和组件的库，以及一个概念验证菌株 | 首次将GoldenBraid克隆系统应用于盘基网柄菌，提供了一个模块化的合成生物学框架，并开发了一个包含250个DNA部件的库 | NA | 开发一个用于盘基网柄菌的快速、模块化和稳健的克隆系统，以促进合成生物学研究 | 盘基网柄菌（Dictyostelium amoebae） | 合成生物学 | NA | GoldenBraid克隆系统 | NA | NA | NA | GoldenBraid | 盘基网柄菌（Dictyostelium amoebae） | cAMP趋化性概念验证菌株，包含四个荧光报告基因编码于一个质粒 | 医学 |
| 20 | 2025-10-05 |
In situ chromatin interactomics using a chemical bait and trap approach
2020-06, Nature chemistry
IF:19.2Q1
DOI:10.1038/s41557-020-0474-8
PMID:32472103
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研究论文 | 开发了一种化学诱饵捕获方法用于研究染色质内组蛋白修饰的相互作用组 | 使用合成生物学方法在天然染色质中设置组蛋白修饰控制的光亲和陷阱，能够捕获瞬时相互作用因子 | NA | 探索表观遗传调控和失调的分子机制 | 组蛋白翻译后修饰的相互作用伙伴 | 表观遗传学 | 癌症 | 定量蛋白质组学、原位蛋白质组学、光亲和标记 | NA | 蛋白质组数据 | NA | 合成生物学方法 | NA | 组蛋白修饰控制的光亲和陷阱系统 | 医学 |